单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 36381 篇文献,本页显示第 41 - 60 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
41 2026-02-14
Thrombospondin-1-mediated macrophage efferocytosis dysfunction exacerbates intestinal pathology in Hirschsprung's disease
2026-Feb-11, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究探讨了血栓反应蛋白-1(THBS1)在赫希施普龙病(HSCR)中通过调控巨噬细胞胞葬功能障碍加剧肠道病理的机制 首次将基质特异性THBS1下调与HSCR中巨噬细胞功能失调联系起来,并揭示THBS1-CD36/Rac1信号轴在巨噬细胞胞葬和炎症消退中的关键作用 样本量较小(scRNA-seq仅3对样本,验证样本n=5),且体内验证依赖于DSS诱导的结肠炎模型,可能不完全反映HSCR的特定病理环境 阐明HSCR中肠道稳态破坏、持续炎症和进行性纤维化的细胞与分子机制 赫希施普龙病(HSCR)患者的结肠活检样本、骨髓来源巨噬细胞(BMDMs)及DSS诱导的结肠炎小鼠模型 单细胞组学与免疫学 儿科先天性疾病(赫希施普龙病) 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、免疫荧光、qRT-PCR、FRET生物传感器 NA 单细胞转录组数据、组织病理学图像、分子表达数据 scRNA-seq:3对HSCR病变与对照结肠活检;验证样本:5例HSCR样本;体外实验使用BMDMs NA 单细胞RNA测序 NA NA
42 2026-02-14
NGR-modified cancer-associated fibroblast-derived exosomes deliver resveratrol to inhibit CXCR2/NF-κB signaling in myeloid-derived suppressor cells and reverse immune suppression in liver cancer
2026-Feb-11, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究开发了一种NGR肽修饰的癌症相关成纤维细胞来源的外泌体,用于递送白藜芦醇,靶向肿瘤微环境中的髓源性抑制细胞,通过抑制CXCR2/NF-κB信号通路逆转免疫抑制并抑制肝癌进展 创新性地提出了一种靶向肿瘤相关髓源性抑制细胞而非直接杀伤肿瘤细胞的免疫治疗策略,并首次发现并验证了CXCR2是白藜芦醇在髓源性抑制细胞中的一个先前未被识别的功能靶点 NA 开发一种靶向递送系统,通过抑制CXCR2/NF-κB信号通路重编程髓源性抑制细胞功能,逆转肝癌中的免疫抑制 髓源性抑制细胞、CD8+ T细胞、肝癌微环境 肿瘤免疫学 肝癌 网络药理学、分子对接、单细胞RNA测序、Western blot、免疫荧光 NA 单细胞转录组数据、体外实验数据、体内实验数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
43 2026-02-14
A bone-derived hormone permits rapid visual escape via GPR37 receptor in a subpopulation of VTA GABAergic neurons
2026-Feb-11, Neuron IF:14.7Q1
研究论文 本文揭示了骨源性激素骨钙素通过GPR37受体调控VTA GABA能神经元兴奋性,从而促进快速视觉逃避行为的机制 首次发现骨钙素通过GPR37-cAMP-THIK-1通路增强VTA GABA能神经元兴奋性,介导快速视觉逃避,揭示了骨-脑代谢轴在生存行为调控中的新机制 NA 探究骨源性激素骨钙素在快速视觉逃避行为中的调控机制 小鼠的腹侧被盖区(VTA)GABA能和谷氨酸能神经元 神经科学 NA 单细胞转录组学、电生理学 NA 转录组数据、电生理记录 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
44 2026-02-14
Olfactomedin-4+ neutrophils exacerbate intestinal epithelial damage in Clostridioides difficile infection
2026-Feb-10, Infection and immunity IF:2.9Q2
研究论文 本研究探讨了表达Olfactomedin-4的中性粒细胞(OLFM4中性粒细胞)在艰难梭菌感染(CDI)中加剧肠道上皮细胞损伤的机制 首次揭示了OLFM4中性粒细胞通过高表达脱颗粒基因加剧CDI诱导的肠道上皮损伤,并发现血浆OLFM4水平在感染小鼠和患者中显著升高 机制研究可能尚未完全阐明OLFM4的具体作用通路,且样本量可能有限 探究中性粒细胞在艰难梭菌感染中加剧组织损伤的机制 感染艰难梭菌的小鼠和患者,以及OLFM4中性粒细胞 数字病理学 肠道感染 单细胞转录组学 NA 转录组数据 感染小鼠和患者样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
45 2026-02-14
Spatial transcriptomics reveals tumor microenvironment-driven subtypes of invasive lobular carcinoma
2026-Feb-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学技术分析了43例HR+/HER2-浸润性小叶癌(ILC)肿瘤,揭示了肿瘤微环境驱动的ILC亚型及其与临床预后的关联 首次将空间转录组学与组织形态学、单细胞反卷积整合,开发了基于肿瘤微环境架构的多模态ILC分类系统(ILC4TME),识别出四种新亚型,并验证了其在外部数据集中的可重复性和预后价值 研究样本量相对较小(43例),且仅针对HR+/HER2-亚型,可能无法代表所有ILC患者 揭示浸润性小叶癌的肿瘤微环境空间异质性,并开发基于微环境特征的新分类框架以改善风险分层和治疗靶向 43例激素受体阳性、HER2阴性浸润性小叶癌肿瘤组织 数字病理学 乳腺癌 空间转录组学,单细胞反卷积 空间聚类分析,多模态分类模型 空间基因表达数据,组织学图像,临床数据 43例HR+/HER2-浸润性小叶癌肿瘤样本 NA 空间转录组学 NA NA
46 2026-02-14
T cell receptors for antigen on intraepithelial cytolytic T lymphocytes in celiac disease engage enterocyte HLA-E and HLA-B
2026-Feb-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序等技术,比较了活动性乳糜泻与正常对照的十二指肠活检样本,揭示了乳糜泻中绒毛上皮内细胞毒性T淋巴细胞的激活机制及其与肠上皮细胞HLA-E和HLA-B的相互作用 首次在乳糜泻中同时使用单细胞RNA测序、循环免疫荧光、RNAScope和邻近连接实验,揭示了αβ和γδ T细胞受体与肠上皮细胞HLA-E和HLA-B的频繁结合,挑战了NKG2C作为替代激活触发器的观点 研究主要基于十二指肠活检样本,样本来源有限,且未涉及其他肠道区域或长期随访数据 探究乳糜泻中上皮内细胞毒性T淋巴细胞的激活机制及其与肠上皮细胞的相互作用 活动性乳糜泻患者和正常对照的十二指肠活检样本 数字病理学 乳糜泻 单细胞RNA测序, 循环免疫荧光, RNAScope, 邻近连接实验 NA RNA测序数据, 图像数据 未明确指定样本数量,但涉及乳糜泻患者和正常对照的十二指肠活检 NA 单细胞RNA-seq NA NA
47 2026-02-14
Evaluation of targeted and immune combination therapies in a rat model of hormone receptor-positive breast cancer
2026-Feb-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究利用大鼠激素受体阳性乳腺癌模型,评估了靶向治疗与免疫治疗的联合策略,并揭示了KMT5B/C抑制剂与抗PD-L1联合应用的潜在机制 首次在模拟人类ER阳性乳腺癌免疫逃逸机制的大鼠模型中,系统评估了基于“luminal growing”基因特征的靶向候选物(KMT5B/C和IKBKE)抑制剂与免疫检查点抑制剂的联合疗效,并通过单细胞RNA测序揭示了A-196诱导肿瘤上皮细胞发生腔面-基底表型转换并增强抗原呈递的机制 研究基于大鼠模型,其结论向人类临床转化的有效性仍需进一步验证;样本量相对有限,且未涵盖所有可能的联合治疗方案 评估激素受体阳性乳腺癌中靶向治疗与免疫检查点抑制剂联合治疗的疗效与机制,以克服该类肿瘤对免疫治疗反应有限的难题 硝基亚硝基脲诱导的远交系Sprague-Dawley大鼠乳腺肿瘤模型,模拟ER阳性乳腺癌的免疫逃逸和异质性 肿瘤免疫学 乳腺癌 单细胞RNA测序,多色流式细胞术 动物疾病模型 单细胞转录组数据,流式细胞数据 未明确提及具体样本数量,但基于大鼠肿瘤模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
48 2026-02-14
Single-cell transcriptomics of the Drosophila ring gland identifies the SoxN-Vvl complex as a key regulator of juvenile hormone biosynthesis
2026-Feb-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序解析了果蝇环腺的细胞类型特异性转录谱,并发现SoxN-Vvl复合体是调控保幼激素生物合成的关键转录因子 首次对果蝇幼虫环腺进行单细胞转录组测序,克服了以往将环腺视为单一组织的局限性,实现了对保幼激素生物合成细胞类型特异性调控的解析 研究仅基于果蝇模型,结果在其他昆虫中的普适性有待验证;单细胞测序样本量相对有限(7,919个细胞) 探究昆虫保幼激素生物合成的转录调控机制 果蝇幼虫环腺细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 7,919个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
49 2026-02-14
HSCs/MPPs as cells of origin with altered differentiation hierarchy impairing immunomicroenvironment in PML::RARA and CBFα/β fusion AML
2026-Feb-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,探讨了融合转录因子驱动的急性髓系白血病中白血病干细胞对免疫细胞分化的影响 揭示了融合转录因子在白血病母细胞及分化免疫细胞中的广泛表达,证实了造血干细胞或多能祖细胞作为白血病干细胞,并开发了基于配体-受体互作的风险评分模型 样本量相对较小(24例患者),且仅针对特定融合转录因子亚型,可能不适用于所有AML亚型 探究白血病干细胞在急性髓系白血病中对免疫微环境的调控机制 急性髓系白血病患者样本,特别是PML::RARA和CBFα/β融合亚型 数字病理学 白血病 单细胞RNA测序,DNA-FISH,靶向测序 配体-受体风险评分模型 单细胞转录组数据 24例初诊急性髓系白血病患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
50 2026-02-14
Single-cell RNA sequencing of human embryonic stem cells reveals immediate and deferred transcriptomic responses to retinoic acid-mediated effects across cell subpopulations
2026-Feb-10, Toxicology in vitro : an international journal published in association with BIBRA IF:2.6Q3
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了H9人胚胎干细胞在视黄酸处理下的转录组响应,揭示了跨细胞亚群的即时和延迟效应 通过单细胞分辨率揭示视黄酸在人胚胎干细胞中诱导的转录组变化,包括多能性维持和未定向分化过程中的细胞状态转变,为发育毒性筛选提供了新见解 研究仅基于H9细胞系,可能无法完全代表所有人类胚胎干细胞;视黄酸浓度和时间点有限,未覆盖更广泛的暴露条件 探究视黄酸作为发育形态发生素或毒性物质,在人胚胎干细胞中诱导的转录组特征,以支持未来发育毒性化学筛选的转录组生物标志物开发 H9人多能干细胞系 单细胞组学 发育毒性 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 H9细胞系在多种处理条件下的样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
51 2026-02-14
First Longitudinal Spatial Transcriptomics Analysis in Pulmonary Arterial Hypertension
2026-Feb-10, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
52 2026-02-14
Metabolic Reprogramming in Lacrimal Gland GVHD: Stage-Specific Shifts in Acinar Cells as Drivers of Disease Progression
2026-Feb-10, The ocular surface
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序技术,揭示了小鼠泪腺在急性和慢性移植物抗宿主病(oGVHD)阶段中腺泡细胞的代谢重编程及其在疾病进展中的驱动作用 首次在oGVHD中定义了阶段特异性机制,包括急性期的成纤维细胞-T细胞-上皮细胞三联体与慢性期的腺泡代谢重编程和髓系介导的上皮失调,并识别了新的配体-受体对如Gm-Sort1和Ptprc-Cd22 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类oGVHD,且样本量有限,需要进一步验证 阐明oGVHD发病机制中阶段特异性变化,以揭示疾病进展的驱动因素 小鼠泪腺组织,特别是在急性和慢性GVHD阶段的腺泡细胞、成纤维细胞、T细胞、髓系细胞等 单细胞组学 移植物抗宿主病 单细胞RNA测序 伪时间轨迹分析、细胞间通讯网络推断 单细胞转录组数据 小鼠泪腺在急性(7天)和慢性(28天)GVHD阶段的样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
53 2026-02-14
Epithelial HO-1 regulates iron availability and promotes colonic tumorigenesis in a context-dependent manner
2026-Feb-09, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究探讨了结肠上皮细胞中血红素加氧酶-1(HO-1)在结肠炎相关肿瘤发生中的双重作用,发现其在急性毒性中具有保护作用,但在慢性炎症中会促进铁依赖性氧化损伤和细胞增殖 揭示了上皮HO-1在结肠肿瘤发生中的背景依赖性调控机制,首次阐明其在急性与慢性炎症环境中的相反功能 研究主要基于小鼠模型和类器官,人类临床样本的直接验证有限,且具体信号通路细节有待进一步阐明 探究结肠上皮HO-1在结肠炎相关肿瘤发生过程中的作用机制 小鼠结肠上皮细胞、人类结肠上皮类器官、结肠肿瘤组织 分子病理学 结肠癌 单细胞RNA测序、类器官培养、基因敲除模型 基因敲除小鼠模型 基因表达数据、组织病理学图像、生化指标 未明确具体数量,但涉及基因敲除小鼠、野生型对照及人类类器官样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
54 2026-02-14
CD8+ T cells cross-restricted by HLA-B*57 and HLA-E*01 recognize HIV Gag with different functional profiles
2026-Feb-09, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究评估了针对HIV Gag表位KF11的CD8+ T细胞在HLA-E和HLA-B57限制下的功能特性差异 首次揭示了HIV特异性CD8+ T细胞可同时受HLA-B*57和HLA-E*01:03双重限制,并发现不同限制等位基因导致功能不同的免疫反应 样本量较小(仅8名HIV感染者),且仅针对单一Gag表位KF11进行研究 探究HIV特异性CD8+ T细胞在非经典HLA-E和经典HLA-B57限制下的功能差异 HIV感染者的CD8+ T细胞 免疫学 HIV感染 单细胞RNA测序,TCR测序,可溶性蛋白分析,HLA-I多聚体技术 NA 单细胞RNA测序数据,TCR序列数据,蛋白质表达数据 8名HIV感染者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
55 2026-02-14
Insights into KIF11 pathogenesis in microcephaly-lymphedema-chorioretinopathy syndrome from a lymphatic perspective
2026-Feb-09, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本文从淋巴系统角度探讨KIF11基因致病性变异在微头畸形-淋巴水肿-脉络膜视网膜病变综合征中的作用机制 首次揭示KIF11与淋巴管生成关键调控因子PROX1和VEGFR3之间的功能联系 患者样本量有限,部分发现仅基于单个病例的观察 阐明KIF11基因变异导致淋巴系统发育障碍的分子机制 患者来源的淋巴母细胞、人类和小鼠发育组织、斑马鱼内皮前体细胞、人类淋巴管内皮细胞 分子病理学 微头畸形-淋巴水肿-脉络膜视网膜病变综合征 单细胞RNA测序、淋巴闪烁扫描术、免疫荧光染色、细胞功能实验 NA 基因表达数据、影像数据、细胞功能数据 患者来源细胞样本及动物模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
56 2026-02-14
Intranasal booster drives class switching and homing of memory B cells for mucosal IgA response
2026-Feb-09, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过分析鼻内加强免疫后人体黏膜免疫反应,揭示了其诱导记忆B细胞发生IgA类别转换、归巢至黏膜并产生强效中和抗体的机制 首次结合质谱免疫球蛋白测序与单细胞B细胞受体测序技术,在人体内鉴定出42种黏膜特异性sIgA单克隆抗体,并发现其中和能力比单体IgG/IgA强100倍 研究样本量有限,未评估长期免疫保护效果,且机制研究主要基于相关分析 探究鼻内加强免疫如何诱导人体黏膜sIgA应答的机制 接种鼻内加强疫苗的个体黏膜B细胞与抗体 免疫学 呼吸道感染 液相色谱-串联质谱、单细胞B细胞受体测序、单细胞RNA测序 NA 蛋白质组数据、单细胞转录组数据、B细胞受体序列数据 未明确样本数量(基于接种鼻内加强疫苗的个体) NA 单细胞RNA-seq, 单细胞BCR-seq NA NA
57 2026-02-14
scII: Dual-Threshold Adaptive Integration of Single-Cell Multiomics Data Driven by Imputation
2026-Feb-09, Journal of chemical information and modeling IF:5.6Q1
研究论文 本文提出了一种名为scII的自适应框架,用于整合单细胞RNA测序和染色质可及性测序数据,通过双重阈值自适应选择机制和基于贝叶斯信息准则的优化来提高整合的准确性和可扩展性 scII引入了scRNA-seq引导的信号插补以增强scATAC-seq的信息完整性,采用带Maxout激活函数的多层感知器建模复杂非线性关系,并设计了动态双重阈值自适应选择机制和基于BIC的优化来自动确定高斯混合模型组件数量 NA 开发一种能够高效整合未配对的单细胞多组学数据并实现细胞类型注释准确转移的方法 单细胞多组学数据,特别是scRNA-seq和scATAC-seq数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 多层感知器,高斯混合模型 基因表达数据,染色质可及性数据 NA NA 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq NA NA
58 2026-02-14
First-in-child phase I trial of p-STAT3 inhibitor WP1066 in pediatric brain tumor patients
2026-Feb-09, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本文报告了p-STAT3抑制剂WP1066在儿童脑肿瘤患者中的首次儿童I期临床试验结果 首次在儿童脑肿瘤患者中评估口服p-STAT3抑制剂WP1066的安全性和耐受性,并确定了最大可行剂量 单中心、单臂、样本量较小(10名患者),且为I期试验,主要关注安全性而非疗效 评估WP1066在儿童脑肿瘤患者中的安全性、耐受性、最大耐受剂量/最大可行剂量,并探索其抗肿瘤免疫反应 儿童脑肿瘤患者(包括H3.3G34R/V突变的高级别胶质瘤患者) NA 脑肿瘤 单细胞RNA测序 NA 临床数据、单细胞RNA测序数据 10名参加I期试验的儿童脑肿瘤患者,外加3名同情用药的H3.3G34R/V突变高级别胶质瘤患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
59 2026-02-10
CiCLoDS: Joint cell clustering and gene selection for single-cell spatial transcriptomics
2026-Feb-09, Scientific reports IF:3.8Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
60 2026-02-14
Spatial transcriptomics identifies differentiation, lipid metabolism, and retinoid pathway alterations in acne vulgaris
2026-Feb-09, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学技术,分析了健康、非病变、粉刺性和脓疱性痤疮皮肤,揭示了痤疮中脂质代谢、视黄醇信号通路和角质形成细胞分化的关键变化 开发了专门的分割流程以改进在空间复杂的皮脂腺中的转录本分配,并识别了PPARG+过渡性基底细胞状态,以及不同痤疮亚型在皮脂生成基因表达上的差异 研究主要基于定制面板靶向特定通路,可能未覆盖痤疮发病机制的所有方面,且小鼠模型与人类疾病存在差异 探究痤疮(特别是炎症性和非炎症性病变)的基因表达、信号通路和皮脂腺参与的差异 健康、非病变、粉刺性和脓疱性痤疮皮肤样本 数字病理学 痤疮 空间转录组学 NA 空间转录组数据 未明确指定样本数量,但包括健康、非病变、粉刺性和脓疱性皮肤类型 NA 空间转录组学 NA NA
回到顶部