单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 29530 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-07-11 |
A visual-omics foundation model to bridge histopathology image with transcriptomics
2025-Apr-16, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5183775/v1
PMID:40321764
|
研究论文 | 开发了一个名为OmiCLIP的视觉-组学基础模型，用于连接组织病理学图像和转录组学数据 | 首次将组织病理学图像与转录组学数据整合到一个基础模型中，并开发了Loki平台提供多种功能 | 未明确提及具体局限性 | 整合组织病理学图像和转录组学数据，提升计算生物学分析能力 | 组织病理学图像和转录组学数据 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq, 空间转录组学(ST) | OmiCLIP | 图像, 转录组数据 | 220万对组织图像和转录组数据，涵盖32个器官 |
| 82 | 2025-07-11 |
The immune checkpoint regulator CD40 potentiates myocardial inflammation
2025-Apr, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-025-00633-1
PMID:40217124
|
research paper | 本文探讨了CD40激动剂如何通过激活CCR2巨噬细胞和招募效应记忆CD8 T细胞来重塑心脏免疫环境，从而促进心肌炎症 | 揭示了CD40激动剂通过CCR2巨噬细胞和CD8 T细胞之间的正反馈环路促进心肌炎症的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证 | 研究CD40激动剂对心肌炎症的潜在影响及其机制 | CD40激动剂对心脏免疫环境的影响 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞测序、细胞耗竭研究 | 遗传小鼠模型 | 基因表达数据、免疫细胞数据 | NA |
| 83 | 2025-07-11 |
Parenchymal and inflammatory responses to ozone exposure in the aging healthy and surfactant protein C mutant lung
2025-Mar-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00261.2024
PMID:39832482
|
研究论文 | 本研究探讨了臭氧暴露对健康老年小鼠和表面活性蛋白C突变小鼠肺部的结构和免疫反应的影响 | 结合年龄因素和基因突变，研究臭氧暴露对肺部的影响，并利用空间转录组学分析炎症和细胞外基质组织信号的变化 | 研究仅关注急性臭氧暴露的影响，未涉及长期暴露的效果 | 理解臭氧暴露在老年和基因突变个体中对肺部结构和免疫功能的影响 | 年轻、中年和老年小鼠，以及表面活性蛋白C突变小鼠 | 呼吸病理学 | 呼吸系统疾病 | 流式细胞术、空间转录组学 | NA | 生物学数据 | 不同年龄段的小鼠（年轻：8-14周，中年：44-52周，老年：>80周）和SP-C突变小鼠 |
| 84 | 2025-07-11 |
Effects of maternal edible THC consumption on offspring lung growth and function in a rhesus macaque model
2025-Mar-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00360.2024
PMID:39903192
|
研究论文 | 本研究通过恒河猴模型探讨了母体食用THC对后代肺生长和功能的影响 | 首次在恒河猴模型中系统评估产前THC暴露对后代肺发育和功能的长期影响，并揭示了表观遗传调控机制 | 样本量较小，且仅评估了单一剂量THC的影响 | 评估产前THC暴露对后代肺发育和功能的潜在危害 | 恒河猴及其后代 | 发育生物学 | 呼吸系统疾病 | MRI, RNAseq, 全基因组亚硫酸氢盐测序, 空间转录组学 | 恒河猴动物模型 | 影像数据、分子生物学数据 | 接受THC或安慰剂处理的怀孕恒河猴及其后代 |
| 85 | 2025-07-11 |
SeuratExtend: streamlining single-cell RNA-seq analysis through an integrated and intuitive framework
2025-Jan-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf076
PMID:40627366
|
research paper | 介绍了一个名为SeuratExtend的R包，旨在简化单细胞RNA测序数据分析 | SeuratExtend通过整合多种工具和数据库，提供了一个用户友好且直观的界面，用于执行包括功能富集、轨迹推断等多种分析 | 未明确提及具体的技术或应用限制 | 简化单细胞RNA测序数据分析流程，提高分析的可及性和效率 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 86 | 2025-07-11 |
Molecular insights into glioblastoma progression: role of CHCHD2P9 in tumor heterogeneity and prognosis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1581850
PMID:40630954
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和细胞实验探讨了CHCHD2P9在胶质母细胞瘤进展中的作用及其与预后的关系 | 发现CHCHD2P9作为胶质母细胞瘤终末亚群的关键标志物，并揭示其表达水平与临床预后不良相关 | 研究未明确CHCHD2P9调控胶质瘤细胞增殖和迁移的具体分子机制 | 探索胶质母细胞瘤进展中的分子特征和细胞间相互作用 | 胶质母细胞瘤亚群 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | RNA测序数据 | 未明确样本数量 |
| 87 | 2025-07-11 |
Immunogenic cell death-related biomarkers in heart failure probed by transcriptome and single-cell sequencing
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1560903
PMID:40630963
|
研究论文 | 本研究通过转录组和单细胞测序技术，识别并验证了与心力衰竭（HF）相关的免疫原性细胞死亡（ICD）生物标志物 | 首次识别并验证了CD163、FPR1和VSIG4作为HF的ICD相关生物标志物，为HF的临床诊断和治疗提供了新的理论基础 | 研究依赖于公共数据库的数据，可能受到样本量和数据质量的限制 | 识别HF患者中与ICD相关的生物标志物并探索其潜在机制 | 心力衰竭患者和动物模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 转录组测序、单细胞RNA测序、RT-qPCR | 机器学习方法、PPI网络、nomogram模型 | 基因表达数据 | 来自GSE57338、GSE3586和GSE5406数据集的数据，以及GSE183852单细胞数据集 |
| 88 | 2025-07-11 |
Taurine-mediated metabolic immune crosstalk indicates and promotes immunosuppression with anti-PD-1 resistance in bladder cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1618439
PMID:40630945
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量转录组分析，揭示了膀胱癌肿瘤微环境中牛磺酸代谢失调的分子机制及其在免疫抑制中的作用 | 开发了牛磺酸代谢失调指数（TMs）作为独立的预后生物标志物，并揭示了其在免疫治疗抵抗中的作用 | 研究主要基于计算分析和体外实验，需要进一步的体内实验验证 | 探索牛磺酸代谢在膀胱癌肿瘤微环境中的作用及其对免疫治疗的影响 | 膀胱癌（BLCA）患者样本和肿瘤微环境中的细胞亚群 | 肿瘤免疫学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学（ST）、批量转录组分析 | 机器学习方法 | 转录组数据 | TCGA队列中的膀胱癌患者样本 |
| 89 | 2025-07-11 |
Targeting mitophagy in diabetic retinopathy: novel insights into SQSTM1/BNIP3L pathway regulated by luteolin
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1593213
PMID:40635752
|
研究论文 | 本研究探讨了木犀草素通过SQSTM1/BNIP3L通路激活线粒体自噬在糖尿病视网膜病变中的治疗潜力 | 揭示了木犀草素通过SQSTM1/BNIP3L通路激活线粒体自噬的新机制，并建立了单核细胞活性与DR进展之间的新联系 | 木犀草素的具体分子机制仍未完全阐明 | 探索木犀草素在糖尿病视网膜病变中的治疗作用机制 | 糖尿病视网膜病变患者的外周血单核细胞和视网膜组织 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | scRNA-Seq, 分子对接模拟, DCFDA测定, H&E和PAS染色, ELISA, 免疫荧光, 免疫组化, Western blotting | NA | RNA测序数据, 蛋白质表达数据, 细胞图像数据 | 来自DR患者的外周血单核细胞和视网膜组织样本 |
| 90 | 2025-07-11 |
Integrated single-cell and bulk RNA dequencing to identify and validate prognostic genes related to T Cell senescence in acute myeloid leukemia
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1606284
PMID:40635996
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，探索T细胞衰老相关基因在急性髓系白血病（AML）进展中的作用，并构建和验证了一个新的AML风险模型 | 结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，识别与T细胞衰老相关的预后基因，并构建了一个新的AML风险预测模型 | 研究依赖于公共数据库的数据，可能受到样本量和数据质量的限制 | 探索T细胞衰老相关基因在AML进展中的作用，并构建预后预测模型 | 急性髓系白血病（AML）患者 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | scRNA-seq, RNA-seq, RT-qPCR | 风险模型 | RNA测序数据 | TCGA数据库中的AML队列（TCGA-LAML）及其他公共数据集（GSE116256, GSE114868, GSE71014） |
| 91 | 2025-07-11 |
Single-cell transcriptome and multi-omics integration reveal ferroptosis-driven immune microenvironment remodeling in knee osteoarthritis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1608378
PMID:40636124
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和多组学整合分析，揭示了铁死亡驱动的免疫微环境重塑在膝骨关节炎中的作用 | 首次在单细胞分辨率下探索铁死亡与免疫功能障碍的相互作用，并识别了KOA中的诊断生物标志物 | 样本量相对较小（单细胞数据n=11，批量RNA-seq数据分别为20/18和8/4） | 解析铁死亡驱动的免疫重塑并识别KOA诊断生物标志物 | 膝骨关节炎（KOA）患者的软骨细胞和免疫微环境 | 生物信息学 | 膝骨关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序（bulk RNA-seq） | LASSO-SVM诊断模型 | 转录组数据 | 单细胞数据11例，批量RNA-seq数据分别为20例KOA/18例对照和8例KOA/4例对照 |
| 92 | 2025-07-11 |
Investigating the role of tumor cell heterogeneity and angiogenesis genes in the prognosis of multiple myeloma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1610833
PMID:40636123
|
研究论文 | 本研究探讨了肿瘤细胞异质性和血管生成相关基因在多发性骨髓瘤(MM)预后中的作用 | 通过整合转录组数据和单细胞RNA测序数据，识别了MM患者肿瘤细胞中的显著基因组拷贝数变异，并构建了基于血管生成和转录因子的预后模型 | 研究主要依赖于公共数据库的回顾性数据，缺乏前瞻性临床验证 | 探索肿瘤细胞异质性和血管生成相关基因对MM预后的影响 | 多发性骨髓瘤患者 | 生物信息学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, 差异基因表达分析, 单细胞聚类, CNV分析, 转录因子分析, 细胞通讯分析, 免疫浸润分析 | 预后预测模型 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 来自Xena和GEO数据库的MM患者数据 |
| 93 | 2025-07-11 |
A bibliometric analysis of studies related to the nuclear factor kappa B signaling pathway in knee osteoarthritis between 2004 and 2023
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1572161
PMID:40636390
|
研究论文 | 本文通过文献计量学方法分析了2004年至2023年间关于核因子κB（NF-κB）信号通路在膝骨关节炎（KOA）中的研究趋势和热点 | 首次对NF-κB信号通路在KOA领域的研究进行系统的文献计量分析，揭示了主要研究趋势和热点 | 缺乏实时可视化NF-κB活性的体内成像技术 | 识别NF-κB信号通路在KOA中的主要研究领域和趋势 | 2004-2023年间发表的752篇关于NF-κB信号通路在KOA中的研究论文 | 文献计量学 | 膝骨关节炎 | 文献计量分析工具（CiteSpace、VOSviewer等） | NA | 文献数据 | 752篇研究论文 |
| 94 | 2025-07-11 |
Delineation of single-cell Altas provides new insights for development of coronary artery lesions in Kawasaki disease: bad and good signaling molecules
2025, Frontiers in pediatrics
IF:2.1Q2
DOI:10.3389/fped.2025.1596643
PMID:40636515
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析，揭示了川崎病冠状动脉病变发展中的关键信号分子 | 首次在单细胞水平上描绘了川崎病冠状动脉病变的细胞图谱，并鉴定出MCH-II和RESISTIN作为疾病发展的关键信号分子 | 样本量较小（每组仅3例患者），且仅分析了外周血单个核细胞 | 探究川崎病冠状动脉病变发展的分子机制 | 川崎病患者外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 川崎病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 12例样本（3例KD非CAL治疗前/后，3例CAL治疗前，3例CAL治疗后） |
| 95 | 2025-07-11 |
Identification of Shared Biomarkers in Chronic Kidney Disease and Diabetic Nephropathy Using Single-Cell Sequencing
2025, Diabetes, metabolic syndrome and obesity : targets and therapy
DOI:10.2147/DMSO.S514319
PMID:40636753
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术识别慢性肾病和糖尿病肾病的共同生物标志物 | 首次使用单细胞RNA测序技术比较慢性肾病和糖尿病肾病样本，识别出共享生物标志物并揭示其在不同免疫细胞中的表达模式 | 样本量较小(仅9例)，且仅分析了血液样本而未涉及肾脏组织 | 寻找慢性肾病和糖尿病肾病的共同诊断和治疗靶点 | 人类血液样本(3例对照、3例CKD患者、3例DN患者) | 生物信息学 | 慢性肾病/糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | STRING数据库(PPI网络构建) | 单细胞转录组数据 | 9例人类血液样本(3对照+3CKD+3DN) |
| 96 | 2025-07-11 |
Single-cell analysis with childhood and adult systemic lupus erythematosus
2024-12, Autoimmunity
IF:3.3Q3
DOI:10.1080/08916934.2023.2281228
PMID:38347676
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析儿童和成人系统性红斑狼疮(SLE)患者的外周血单个核细胞(PBMCs)组成和转录特征，揭示了两者之间的差异和潜在的治疗靶点 | 首次在单细胞水平比较儿童和成人SLE患者的PBMC组成和转录特征，并鉴定出潜在的治疗靶点 | 样本量可能有限，且未进行功能验证实验 | 探究儿童和成人SLE患者在PBMC组成和转录特征上的差异 | 儿童和成人SLE患者及健康对照者的PBMCs | 单细胞组学 | 系统性红斑狼疮 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 儿童和成人SLE患者及匹配的健康供体 |
| 97 | 2025-07-11 |
Evaluating the role of IER3+ macrophages in the prognosis of liver fibrosis by bulk and single-cell transcriptional analyses
2024-Dec, ILIVER..
DOI:10.1016/j.iliver.2024.100132
PMID:40635861
|
研究论文 | 通过批量RNA测序和单细胞RNA测序分析，评估IER3+巨噬细胞在肝纤维化预后中的作用 | 建立了一个包含四个基因（IER3、AKR1B10、ADCY1和PGM1）的肝纤维化相关预后模型FMSig，并通过单细胞RNA测序揭示了IER3在髓系细胞中的高表达及其功能 | 研究依赖于公开数据集，可能受到数据质量和样本量的限制 | 探索肝纤维化的复杂发病机制并识别能够预测肝纤维化预后的关键遗传标记 | 肝纤维化患者和健康对照的基因表达数据 | 数字病理学 | 肝纤维化 | 批量RNA测序和单细胞RNA测序（scRNA-seq） | FMSig（纤维化巨噬细胞相关预后特征） | 基因表达数据 | 数据集GSE84044、GSE130970和GSE15654 |
| 98 | 2025-07-11 |
Understanding disease-associated metabolic changes in human colon epithelial cells using i ColonEpithelium metabolic reconstruction
2024-Oct-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.22.619644
PMID:39484551
|
研究论文 | 本研究通过构建首个结肠上皮细胞特异性基因组尺度代谢模型iColonEpithelium，揭示了与炎症性肠病相关的代谢变化 | 首次构建了人类结肠上皮细胞的特异性基因组尺度代谢模型iColonEpithelium，并整合单细胞RNA测序数据预测疾病相关代谢特征 | 模型预测结果需要进一步实验验证，且目前仅关注结肠上皮细胞，未全面考虑其他细胞类型的影响 | 解析人类结肠上皮细胞的代谢活动及其在疾病状态下的变化 | 人类结肠上皮细胞及其在炎症性肠病(克罗恩病和溃疡性结肠炎)中的代谢特征 | 系统生物学 | 炎症性肠病(包括克罗恩病和溃疡性结肠炎) | 基因组尺度代谢模型(GEM)、单细胞RNA测序 | iColonEpithelium代谢网络模型 | 基因组数据、转录组数据 | NA |
| 99 | 2025-07-11 |
Identifying ADGRG1 as a specific marker for tumor-reactive T cells in acute myeloid leukemia
2024-Sep-06, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-024-00560-0
PMID:39243082
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和单细胞V(D)J测序技术，识别了ADGRG1作为急性髓系白血病(AML)中肿瘤反应性T细胞的特定标志物 | 首次将ADGRG1鉴定为AML中CD8+T肿瘤反应性T细胞的特定标志物，并通过小鼠模型和CAR-T系统验证其功能 | 研究样本仅限于RUNX1::RUNX1T1突变的AML患者，可能不适用于其他AML亚型 | 探索AML患者骨髓中肿瘤反应性T细胞的特性及其特异性标志物 | 新诊断的RUNX1::RUNX1T1突变AML患者的骨髓T细胞 | 肿瘤免疫学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, 单细胞V(D)J测序, STARTRAC-like算法 | Runx1; Mx1-Cre小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量的新诊断RUNX1::RUNX1T1突变AML患者骨髓样本 |
| 100 | 2025-07-11 |
Metabolic coordination between skin epithelium and type 17 immunity sustains chronic skin inflammation
2024-07-09, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.04.022
PMID:38772365
|
研究论文 | 本研究探讨了皮肤炎症中上皮细胞与17型免疫之间的代谢协调机制 | 揭示了HIF1α在IL-17信号下游驱动银屑病上皮重塑的作用，并发现糖酵解自主促进上皮病理和乳酸产生，进而增强γδ T17细胞反应 | 研究主要基于小鼠模型和体外人类银屑病病变，可能不完全反映人类体内复杂情况 | 探究炎症性上皮疾病中免疫和上皮细胞如何同时维持其高度代谢需求 | 皮肤上皮细胞和17型免疫细胞 | 免疫代谢 | 银屑病 | 单细胞转录组学、空间转录组学(ST)、免疫荧光 | 小鼠皮肤炎症模型 | 转录组数据、图像数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及人类银屑病病变和小鼠模型 |