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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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12321 | 2024-08-05 |
Comprehensive Analysis of the Immunosuppressive Function of Regulatory T Cells in Human Hepatocellular Carcinoma Tissues
2024 Jan-Dec, Cancer control : journal of the Moffitt Cancer Center
IF:2.5Q3
DOI:10.1177/10732748241251580
PMID:38712609
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研究论文 | 本文对人类肝细胞癌组织中的调节性T细胞的免疫抑制功能进行了综合分析 | 建立了一种基于Treg相关基因组的预后模型,并揭示了Tregs在HCC中的独特作用及其与其他免疫细胞的相互作用 | 研究主要基于现有的转录组数据,尚需更多临床验证 | 探讨调节性T细胞在肝细胞癌患者中的作用及其对治疗效果的影响 | 重点研究肝细胞癌患者组织中的调节性T细胞及其免疫调节机制 | 数字病理学 | 肝癌 | 多色荧光免疫组织化学(mIHC)和单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 组织样本和转录组数据 | 涉及肝细胞癌组织样本和相关数据集的多样本分析 |
12322 | 2024-08-04 |
Presence of immunogenic alternatively spliced insulin gene product in human pancreatic delta cells
2023-05, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-023-05882-y
PMID:36884057
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研究论文 | 本文研究人类胰腺δ细胞中免疫原性替代剪接胰岛素基因产物的表达 | 首次指出胰腺δ细胞中存在一种由替代剪接产生的胰岛素变体,并揭示其可能在胰岛素自身免疫和病理中发挥作用 | 未全面阐明这种替代剪接INS产物在其他细胞类型中的潜在作用 | 探讨人类胰腺内胰岛素基因的替代剪接及其在β细胞和其他内分泌细胞中的表达 | 人类胰腺中各种内分泌细胞(特别是δ细胞) | 数字病理学 | 糖尿病 | PCR分析、单细胞RNA-seq分析、免疫组化 | NA | RNA、蛋白序列 | 人类胰腺样本,具体样本数量未提及 |
12323 | 2024-08-05 |
Sortilin enhances fibrosis and calcification in aortic valve disease by inducing interstitial cell heterogeneity
2023-03-07, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehac818
PMID:36660854
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研究论文 | 本研究探讨了sortilin在钙化性主动脉瓣病(CAVD)病理生理中的作用及其对瓣膜间质细胞(VICs)转变的影响 | 首次识别sortilin作为钙化性主动脉瓣病中关键因素,并发现了一种新型的炎症肌成纤维细胞-成骨细胞混合表型(IMO-VIC) | 研究主要集中于小鼠模型,可能无法完全反映人类的疾病机制 | 阐明sortilin在主动脉瓣钙化中的作用及其潜在的治疗靶点 | 研究对象为主动脉瓣间质细胞(VICs)及其在钙化性主动脉瓣病中的转变 | 数字病理学 | 主动脉瓣疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 小鼠模型 | 生物样本(VICs) | 使用sortilin缺陷的小鼠模型和人类初级VIC样本,样本数量未具体说明 |
12324 | 2024-08-05 |
Probing regenerative heterogeneity of corticospinal neurons with scRNA-Seq
2023-Feb-21, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2588274/v1
PMID:36865182
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研究论文 | 这篇文章研究了皮层脊髓神经元的再生异质性 | 使用单细胞RNA测序探讨了皮层脊髓神经元的再生能力,揭示了抗氧化反应和线粒体生物生成的重要性 | 只能对少数再生的皮层脊髓神经元进行深度测序 | 探讨脊髓损伤后皮层脊髓通路的再生能力 | 皮层脊髓神经元的再生异质性 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 数百个表型识别的皮层脊髓神经元 |
12325 | 2024-08-05 |
Hepatocyte Smoothened Activity Controls Susceptibility to Insulin Resistance and Nonalcoholic Fatty Liver Disease
2023, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.12.008
PMID:36535507
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研究论文 | 本研究旨在探讨Smoothened (Smo) 在肝细胞代谢稳态及其对非酒精性脂肪肝病 (NASH) 易感性中的作用 | 发现肝细胞Smo的缺失通过激活mTORC1-SREBP1c信号通路,促进了脂肪生成并抑制了肝脏胰岛素信号 | 研究主要基于小鼠模型和已有的人类RNA-seq数据,可能无法完全反映所有人群的情况 | 明确Smoothened在肝细胞代谢调节和NASH易感性中的作用 | 健康饮食的小鼠肝细胞及两大人类队列的肝脏RNA-seq数据 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 在小鼠模型中进行了条件性Smo缺失,以及分析了两大人类队列的RNA-seq数据 |
12326 | 2024-08-05 |
A novel Oct4/Pou5f1-like non-coding RNA controls neural maturation and mediates developmental effects of ethanol
2021 Jan-Feb, Neurotoxicology and teratology
IF:2.6Q3
DOI:10.1016/j.ntt.2020.106943
PMID:33221301
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研究论文 | 这篇文章研究了一种新的非编码RNA如何影响神经元成熟和乙醇的发育效应。 | 发现了一种新的与Oct4/Pou5f1相关的非编码RNA mOct4pg9,它在神经干细胞的自我更新和乙醇暴露的影响中扮演了重要角色。 | 在研究中未详细阐述mOct4pg9的具体机制及其在不同发展阶段的作用 | 探讨乙醇暴露如何导致神经干细胞的丧失及其相关机制 | 小鼠胚胎皮质来源的神经干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | RNA | NA |
12327 | 2024-08-05 |
Single-Cell Allele-Specific Gene Expression Analysis
2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-9057-3_11
PMID:30758826
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研究论文 | 本文介绍了一种用于单细胞等位基因表达分析的生物信息学框架SCALE | SCALE框架能够在考虑技术偏差等因素的情况下,估计全基因组的等位基因爆发动力学 | 没有提到具体的局限性 | 研究等位基因在单细胞RNA测序中的表达特征 | 小鼠胚泡单细胞数据集 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞数据 | NA |
12328 | 2024-08-05 |
Revealing gene expression heterogeneity in a clonal population of Tetrahymena thermophila through single-cell RNA sequencing
2024-Jul, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2024.101720
PMID:38711548
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析克隆种群中的基因表达异质性 | 首次使用peaks2utr方法估算缺失的3'非翻译区,从而创建修订的注释文件用于分析 | 未提及样本来源的具体细节和外部验证 | 研究克隆种群中基因表达的可变性 | 对5000个Tetrahymena thermophila细胞进行单细胞RNA测序 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 5000个细胞 |
12329 | 2024-08-04 |
TIGIT Blockade Reshapes the Tumor Microenvironment Based on the Single-cell RNA-Sequencing Analysis
2024-Jun-01, Journal of immunotherapy (Hagerstown, Md. : 1997)
DOI:10.1097/CJI.0000000000000511
PMID:38545758
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研究论文 | 这篇文章研究了TIGIT阻断治疗对肿瘤微环境的影响。 | 文章提供了对TIGIT阻断后免疫微环境变化的新理解,并揭示了其在肿瘤免疫疗法中的潜力。 | 文章中没有提到具体的临床数据和长期疗效评估。 | 研究TIGIT阻断在肿瘤免疫治疗中的作用和机制。 | 小鼠在接受抗TIGIT治疗前后的单细胞RNA测序分析。 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞样本 | 在小鼠中进行的单细胞测序 |
12330 | 2024-08-05 |
Single-Cell Analysis Identifies NOTCH3-Mediated Interactions between Stromal Cells That Promote Microenvironment Remodeling and Invasion in Lung Adenocarcinoma
2024-May-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-1183
PMID:38335304
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了NOTCH3介导的间质细胞间相互作用在肺腺癌中的作用 | 首次揭示了NOTCH信号在肿瘤微环境重塑和细胞侵袭中的作用 | 尚未明确NOTCH3信号靶向治疗的临床应用前景 | 深入理解肺腺癌中的间质生物学 | 9名未接受治疗的肺腺癌患者的256,379个细胞 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 来自9名患者的256,379个细胞,包括13,857个间充质细胞 |
12331 | 2024-08-05 |
919 granules improve postpartum depression through the regulation of abnormal peripheral blood IL-1β
2024-May, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2024.116623
PMID:38643545
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研究论文 | 该文探讨919颗粒通过调节异常外周血IL-1β来改善产后抑郁症 | 首次揭示了产后抑郁症患者外周血cDC2和增殖B细胞的比例升高与IL-1β的显著相关性 | 研究中未提及样本的多样性和长期疗效验证 | 研究产后抑郁症的发病机制及919颗粒的治疗效果 | 健康产后女性和产后抑郁症患者的外周血样本 | 数字病理 | 产后抑郁症 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 动物模型 | 外周血样本 | 健康产后女性与产后抑郁症患者的外周血样本 |
12332 | 2024-08-04 |
[Spatial transcriptomics techniques and its applications in plant research]
2024-Apr-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.230662
PMID:38658142
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综述 | 本文探讨了空间转录组技术在植物研究中的应用 | 总结了空间转录组技术的发展过程及其在植物细胞研究中的进展 | 概述了空间转录组技术在植物应用中面临的挑战 | 探索空间转录组技术在植物中的应用 | 植物细胞的生长、分化、识别及抗逆性 | 数字病理学 | NA | 空间转录组技术 | NA | NA | NA |
12333 | 2024-08-05 |
Decoding the universal human chromatin landscape through teratoma-based profiling
2024-Apr-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae021
PMID:38281248
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研究论文 | 这项研究通过分析人类多能干细胞生成的畸胎瘤的表观基因组和转录组,探讨人类染色质的普遍特征。 | 文章提出了构建表观遗传特征矩阵的方法,以量化畸胎瘤中的多种细胞群体,并揭示染色质状态的独特特征。 | 研究的局限性未详细说明 | 本研究旨在分析畸胎瘤的表观基因组和转录组,以理解干细胞分化和发育过程。 | 本文的研究对象是人类多能干细胞产生的畸胎瘤。 | 数字病理学 | NA | RNA-Seq, scRNA-Seq, scATAC-Seq | NA | 转录组, 表观基因组 | NA |
12334 | 2024-08-05 |
ITGAM: A Pivotal Regulator in Macrophage Dynamics and Cardiac Function During Sepsis-Induced Cardiomyopathy
2024-Apr, Cureus
DOI:10.7759/cureus.59342
PMID:38711712
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研究论文 | 本研究揭示了在脓毒症诱导的心肌病中ITGAM在巨噬细胞动态和心脏功能中的调节作用 | 识别了ITGAM作为调节巨噬细胞功能的重要分子,并探讨了其在脓毒症诱导的心肌病中的双重作用 | 研究结果显示ITGAM中和抗体的使用虽然改善了心脏功能,但却增加了脓毒症后期的死亡率,反映出其复杂的作用 | 探讨脓毒症诱导的心肌病中的免疫细胞动态和其分子机制 | 主要研究巨噬细胞在脓毒症诱导的心肌病中的行为以及ITGAM和ICAM-1的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序 | NA | RNA-seq和单细胞RNA-seq数据 | NA |
12335 | 2024-08-04 |
Revealing cell-cell communication pathways with their spatially coupled gene programs
2024-Mar-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae202
PMID:38706319
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研究论文 | 本文提出了一种新方法IGAN,以推测细胞间通信及其上游/下游路径 | 首次能够估计两个特定单一空间相邻细胞之间的基因关联/网络 | 尚未说明此方法在多细胞系统中的应用限制 | 探索细胞间通信的机制和其相关的基因程序 | 针对单个相邻细胞的细胞间通信模式进行研究 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 公共数据集 | 多个人类细胞类型的数据集 |
12336 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing data imputation using bi-level feature propagation
2024-Mar-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae209
PMID:38706317
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研究论文 | 本研究提出了一种双层特征传播的单细胞RNA测序数据插补方法,旨在解决技术噪声和稀疏性问题 | 提出了双层特征传播(scBFP)方法,通过两步图形基础的特征传播,改善了单细胞RNA测序数据的插补和去噪效果 | 方法可能在特定的复杂情况下仍然受到噪声传播的影响 | 本研究的目标是提高单细胞RNA测序数据处理的准确性和有效性 | 研究对象为单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 图形基础模型 | 基因表达数据 | 大量单细胞RNA样本 |
12337 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics and Mendelian randomization reveal LUCAT1's role in right-sided colorectal cancer risk
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1357704
PMID:38711918
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研究论文 | 这项研究探讨了单细胞转录组学和孟德尔随机化对右侧结直肠癌风险中LUCAT1作用的研究 | 确认了LUCAT1与右侧结直肠癌风险之间的潜在因果关系 | 未提及限制性因素 | 研究右侧结直肠癌的病理机制 | 对左侧和右侧结直肠癌的细胞级差异进行分析 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学 | 孟德尔随机化 | 基因组数据 | NA |
12338 | 2024-08-05 |
Corrigendum: Integrated analysis of single-cell RNA-seq and chipset data unravels PANoptosis-related genes in sepsis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1415915
PMID:38715603
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更正 | 这篇文章更正了之前的研究内容 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
12339 | 2024-08-05 |
Unveiling novel insights in acute myeloid leukemia through single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1365330
PMID:38711849
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序技术在急性髓系白血病中的新发现 | 通过单细胞RNA测序技术洞察了急性髓系白血病的复杂性和异质性,以及AML细胞与免疫细胞和骨髓微环境之间的相互作用 | 文章强调了单细胞RNA测序在急性髓系白血病领域的当前局限性和未来方向 | 研究急性髓系白血病的病理机制和治疗潜力 | 急性髓系白血病细胞及其微环境中的免疫细胞 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
12340 | 2024-08-05 |
Single-cell genomics reveals new rozellid lineages and supports their sister relationship to Microsporidia
2023-12, Biology letters
IF:2.8Q2
DOI:10.1098/rsbl.2023.0398
PMID:38087939
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研究论文 | 本研究揭示了新发现的rozellid谱系,并支持其与微孢子虫的姐妹关系 | 首次通过单细胞测序提供三种新的rozellid谱系的基因组数据 | 目前尚未完全理解rozellids与微孢子虫之间的系统发育关系 | 探讨rozellid谱系的系统发育及其与微孢子虫的关系 | 新发现的三种rozellid谱系 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 来自环境样本的三个新rozellid谱系 |