单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 12301 - 12320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12301 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis of immune cell transcriptome during HIV-1 infection and therapy
2022-09-29, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-022-00523-2
PMID:36175869
|
研究论文 | 本研究对HIV-1感染和治疗期间免疫细胞转录组进行了单细胞分析 | 通过单细胞转录组测序，我们识别了HIV-1感染后免疫细胞中关键的分子通路和基因，揭示了HIV-1感染和疗法中的潜在治疗靶点 | 研究主要集中在特定的免疫细胞类型，可能无法全面反映所有免疫细胞的动态变化 | 理解HIV-1感染及其治疗过程中免疫细胞功能的变化 | 慢性未治疗HIV-1个体、接受ART的HIV-1感染者以及HIV-1阴性个体的外周血免疫细胞 | 数字病理学 | HIV感染 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 多个HIV-1感染者和健康供体的免疫细胞样本 |
| 12302 | 2024-08-05 |
Decoding the olfactory map through targeted transcriptomics links murine olfactory receptors to glomeruli
2022-09-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-32267-3
PMID:36050313
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研究论文 | 本研究探讨了小鼠嗅觉系统中嗅觉受体与嗅球小球之间的映射关系 | 采用了序列切片结合目标捕获富集测序的方法，成功克服了低丰度嗅觉受体表达的问题 | 过去低丰度的嗅觉受体表达限制了高通量映射的可能性 | 理解嗅觉受体如何映射到嗅球小球，以进一步探索嗅觉机制 | 小鼠的嗅觉受体及其在嗅球小球中的分布 | 数字病理学 | NA | 目标捕获富集测序 | NA | NA | 映射了86%的嗅觉受体 |
| 12303 | 2024-08-05 |
Spatial profiling of early primate gastrulation in utero
2022-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-04953-1
PMID:35709828
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研究论文 | 这篇文章展示了早期猕猴胚胎在体内的胚胎层化过程 | 首次使用空间转录组学概念揭示早期猕猴胚胎的发育过程 | 研究仅限于猕猴胚胎，可能无法完全推及人类发育 | 探讨早期胚胎发育中细胞多样性和轴向模式形成的分子机制 | 猕猴胚胎及其相关的干细胞模型 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 高斯过程回归模型 | 转录组数据 | 猕猴胚胎样本 |
| 12304 | 2024-08-05 |
Transcriptional variability accelerates preleukemia by cell diversification and perturbation of protein synthesis
2022-08-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abn4886
PMID:35921412
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研究论文 | 转录变异通过细胞多样化和蛋白质合成干扰促进了前白血病的发展 | 探讨了转录变异在前白血病进展中的作用，揭示了其通过影响细胞命运转变促进癌症演变的机制 | 主要研究集中在小鼠细胞模型中，尚未在人体细胞中验证 | 研究转录变异如何促进前癌症向癌症的进展 | 小鼠细胞中的转录变异和前白血病的形成 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 12305 | 2024-08-05 |
RNA-seq analysis of the human surfactant air-liquid interface culture reveals alveolar type II cell-like transcriptome
2022-Mar-10, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2021.11.006
PMID:34977273
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研究论文 | 该文章描述了一种基于H441细胞的空气-液体界面培养模型的转录组特征 | 提出了一种新的细胞培养平台SALI模型，能在长时间内维持多种生理特性，并与人类肺泡II型细胞相似 | 未提及研究模型的长期可持续性和实际应用中的局限性 | 旨在为研究和修正肺表面活性蛋白B缺乏症提供可靠的细胞培养模型 | 主要研究H441细胞在空气-液体界面培养下的转录组特征 | 数字病理学 | 间质性肺病 | RNA-seq | SALI培养模型 | 转录组数据 | 未提供具体样本数量 |
| 12306 | 2024-08-05 |
Salivary ZG16B expression loss follows exocrine gland dysfunction related to oral chronic graft-versus-host disease
2022-Jan-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.103592
PMID:35005541
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研究论文 | 本研究探讨了慢性移植物抗宿主病(cGVHD)与唾液腺功能障碍相关的唾液ZG16B表达损失 | 发现ZG16B在口腔cGVHD唾液中显著降低，并可能指示特定的cGVHD活动和唾液腺功能障碍 | 本文未使用切口活检，因此没有确诊口腔cGVHD的诊断测试 | 旨在发现口腔cGVHD的生物标志物，以改善早期诊断和治疗 | 研究对象为唾液和人类唾液腺中的蛋白质表达 | 数字病理学 | 慢性移植物抗宿主病 | 液相色谱-串联质谱 | 单细胞RNA测序 | 蛋白质数据 | 569种蛋白质，其中77种在丰度上显著变化 |
| 12307 | 2024-08-05 |
Virally encoded connectivity transgenic overlay RNA sequencing (VECTORseq) defines projection neurons involved in sensorimotor integration
2021-12-21, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.110131
PMID:34936877
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研究论文 | 本研究开发了一种新的RNA测序方法，用于定义参与感觉运动整合的投射神经元 | 提出了一种简便的、多重的RNA测序方法VECTORseq，能够高通量确定神经元亚型 | 现有的测序方法通量较低，操作复杂且成本高 | 定义不同脑区间连接的投射神经元的生理和行为角色 | 参与感觉运动整合的投射神经元 | 神经科学 | NA | RNA测序 | NA | 单细胞数据集 | NA |
| 12308 | 2024-08-05 |
Heterogeneity of human anti-viral immunity shaped by virus, tissue, age, and sex
2021-11-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.110071
PMID:34852222
|
研究论文 | 本文揭示了病毒、组织、年龄和性别如何影响抗病毒T细胞免疫的维持和功能 | 通过综合分析病毒特异性T细胞，首次揭示了多种因素对抗病毒免疫的异质性影响 | 研究主要基于器官捐献者的样本，可能未能全面代表所有人群 | 探讨影响抗病毒免疫的多种因素及其相互作用 | 针对流感和巨细胞病毒的特异性CD8 T细胞 | 免疫学 | NA | 流式细胞术、T细胞受体测序、单细胞转录组学和细胞因子分析 | NA | 血液、淋巴器官和粘膜组织的细胞样本 | 基于器官捐献者的综合样本 |
| 12309 | 2024-08-05 |
A single-cell RNA-seq atlas of Schistosoma mansoni identifies a key regulator of blood feeding
2020-09-25, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abb7709
PMID:32973030
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了血吸虫，并识别出一个关键的血液摄取调节因子 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定出68种不同的细胞群体以及维持血吸虫消化道的专门干细胞 | 尚未完全了解寄生虫不同组织在成功寄生中的功能 | 研究血吸虫的细胞特性和潜在治疗靶点 | 成人血吸虫的细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 43,642个细胞 |
| 12310 | 2024-08-05 |
Power in Numbers: Single-Cell RNA-Seq Strategies to Dissect Complex Tissues
2018-11-23, Annual review of genetics
IF:8.7Q1
|
研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序在解析复杂组织中的应用 | 单细胞RNA测序提供了以新的方式测量表型的机会，有助于基因功能的细化和多效性剖析 | NA | 研究单细胞RNA测序在机体解剖和发育动态分析中的潜力 | 复杂组织中的稀有细胞状态和发育轨迹 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据 | NA |
| 12311 | 2024-08-04 |
Cell communication pathway prognostic model identified detrimental neurodevelopmental pathways in neuroblastoma
2024-06, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2024.100997
PMID:38669760
|
研究论文 | 该文章开发了一种细胞通信通路预后模型，以识别神经母细胞瘤中的有害神经发育通路 | 文章提出了细胞通信通路预后模型（CCPPM），为研究细胞通信通路对疾病预后的影响提供了新的方法 | 由于样本量有限和单细胞RNA-seq数据的临床生存信息不完整，确定这些通信通路对预后的影响具有挑战性 | 研究细胞通信路径对神经母细胞瘤预后的影响 | 神经母细胞瘤的细胞通信通路 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA-seq和批量RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | NA |
| 12312 | 2024-08-05 |
Metaplastic regeneration in the mouse stomach requires a reactive oxygen species pathway
2024-May-06, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.03.002
PMID:38521055
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研究论文 | 本文研究了小鼠胃中的再生转化过程，强调了反应性氧种的重要性 | 通过单细胞RNA测序分析了损伤后小鼠胃中paligenosis机制的高分辨率过程 | 研究主要集中在小鼠模型中的机制，未在其他动物或人类样本中验证 | 探讨反应性氧种在小鼠胃黏膜再生过程中的作用 | 小鼠胃中的成熟胃主细胞和非典型再生细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 12313 | 2024-08-04 |
Airway injury induces alveolar epithelial and mesenchymal responses mediated by macrophages
2024-May-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.02.587596
PMID:38617297
|
研究论文 | 急性气道损伤激活局部前体细胞并刺激细胞间相互作用的变化以恢复稳态 | 本研究揭示了气道损伤对远端肺部反应的影响，特别是通过巨噬细胞介导的AT2前体细胞的增殖以及MANC2细胞的动态变化 | 未涉及更广泛的临床应用和长期效应的探讨 | 研究气道急性损伤后的肺组织反应及其细胞间相互作用变化 | 小鼠模型，重点关注气道特异性上皮损伤后的肺泡和免疫反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | 小鼠模型 |
| 12314 | 2024-08-04 |
Nitrogen sensing and regulatory networks: it's about time and space
2024-May-01, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koae038
PMID:38366121
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综述 | 本文探讨了植物对氮信号的感知与调控网络的时间和空间维度 | 揭示了氮感知/信号传导的时空系统生物学新方面，特别是在拟南芥模型中的应用 | 主要集中在拟南芥模型上，可能限制结果的普遍适用性 | 研究植物如何在不同细胞类型及长距离上整合氮的响应以确保实时协调 | 主要研究对象为植物，尤其是拟南芥中的氮感知和信号传导机制 | 植物生物学 | NA | 单细胞测序、轨迹推断、伪时间分析、机器学习 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 12315 | 2024-08-05 |
Characterization of the malignant cells and microenvironment of infantile fibrosarcoma via single-cell RNA sequencing
2024-Apr-30, Translational pediatrics
IF:1.5Q2
DOI:10.21037/tp-24-66
PMID:38715675
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序描绘了婴儿纤维肉瘤的恶性细胞及其微环境 | 揭示了婴儿纤维肉瘤的普遍转录特征，识别了潜在的新标记物和功能性恶性细胞亚型 | 样本量可能有限，仅来自四名患者，缺乏纵向跟踪数据 | 阐明婴儿纤维肉瘤的转录特征，并探索新的诊断和治疗靶点 | 收集四名患者的婴儿纤维肉瘤新鲜组织样本 | 数字病理学 | 婴儿纤维肉瘤 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 四个患者的组织样本 |
| 12316 | 2024-08-05 |
Quantitative Multiplexed Analysis of Indoleamine 2,3-Dioxygenase (IDO) and Arginase-1 (ARG1) Expression and Myeloid Cell Infiltration in Colorectal Cancer
2024-Apr, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2024.100450
PMID:38369188
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研究论文 | 本研究分析了结直肠癌中IDO和ARG1的表达及髓系细胞浸润特征 | 首次使用定制的10重免疫组化检测结合机器学习进行全面表征，揭示了IDO和ARG1在肿瘤微环境中的重要作用 | 对IDO和ARG1在结直肠癌微环境中表达模式的理解仍不完全 | 探讨IDO和ARG1在结直肠癌中的表达及其预后意义 | 对833名结直肠癌患者的髓系细胞和肿瘤细胞进行分析 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 10重免疫组化检测 | 监督学习 | 细胞RNA测序数据 | 分析了833名结直肠癌患者 |
| 12317 | 2024-08-05 |
AMPK signaling inhibits the differentiation of myofibroblasts: impact on age-related tissue fibrosis and degeneration
2024-Feb, Biogerontology
IF:4.4Q1
DOI:10.1007/s10522-023-10072-9
PMID:37917219
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研究论文 | 本研究探讨了AMPK信号通路对肌成纤维细胞分化的抑制作用以及其对与年龄相关的组织纤维化和退化的影响 | 提出AMPK信号通路作为肌成纤维细胞分化的有效抑制因子，揭示其在抗衰老和抑制纤维化作用中的重要性 | 没有明确讨论AMPK信号通路的所有潜在机制及其在不同类型组织中的适用性 | 研究AMPK信号通路在衰老相关的组织纤维化和退化过程中的作用 | 研究对象是肌成纤维细胞及其在组织纤维化过程中的分化 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组研究 | NA | 细胞 | NA |
| 12318 | 2024-08-05 |
Characterization of Cell Type Abundance and Gene Expression Timeline from Burned Skin Bulk Transcriptomics by Deconvolution
2024-01-05, Journal of burn care & research : official publication of the American Burn Association
IF:1.5Q3
DOI:10.1093/jbcr/irad178
PMID:37956340
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研究论文 | 本研究探讨了热损伤皮肤中细胞异质性及基因表达时间线。 | 提出了一种通过解卷积技术分析皮肤大规模转录组数据来识别不同细胞类型的丰度和基因表达的时间进程。 | 尚未建立热损伤皮肤细胞异质性的全面时间线。 | 研究热损伤后皮肤中细胞类型丰度及基因表达的变化。 | 重点分析了中性粒细胞、巨噬细胞、内皮细胞和其他皮肤细胞在烧伤后的表现。 | 数字病理学 | NA | CIBERSORTx解卷积 | NA | 转录组数据 | 使用了独立的正常皮肤和外周血单细胞RNA测序数据集 |
| 12319 | 2024-08-04 |
KHDRBS1 as a novel prognostic signaling biomarker influencing hepatocellular carcinoma cell proliferation, migration, immune microenvironment, and drug sensitivity
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1393801
PMID:38660302
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研究论文 | 本研究探讨了KHDRBS1在肝细胞癌发展中的作用及其作为预后信号生物标志物的潜力 | 发现KHDRBS1在肝细胞癌中的促肿瘤作用，并揭示了其在肿瘤进展中的临床意义 | 缺乏更广泛的临床试验数据来验证KHDRBS1作为治疗靶点的有效性 | 研究KHDRBS1在肝细胞癌中的表达模式及其对癌症细胞增殖和迁移的影响 | 针对肝细胞癌中的KHDRBS1阳性和阴性恶性细胞进行分析 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 多组学数据、临床样本 | 来自公共数据库的多队列数据和临床样本 |
| 12320 | 2024-08-04 |
Integration of bulk RNA-seq and single-cell RNA-seq constructs: a cancer-associated fibroblasts-related signature to predict prognosis and therapeutic response in clear cell renal cell carcinoma
2024, American journal of translational research
IF:1.7Q4
DOI:10.62347/VCCZ1477
PMID:38715811
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研究论文 | 本研究提出了一种与癌症相关的成纤维细胞特征，以预测透明细胞肾细胞癌的预后和治疗反应 | 文章创新性在于结合了大规模RNA测序和单细胞RNA测序，识别并验证了预测预后和治疗反应的成纤维细胞相关基因特征 | 文章未提供不同肿瘤类型间的比较，且需要在更大样本上验证CRG特征的有效性 | 研究透明细胞肾细胞癌患者的预后和治疗响应的预测方法 | 研究癌症相关成纤维细胞及其在透明细胞肾细胞癌中的作用 | 数字病理学 | 透明细胞肾细胞癌 | RNA-seq | 加权相关网络分析 | 基因表达数据 | 涉及TCGA肿瘤样本和ccRCC细胞系 |