单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 12221 - 12240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12221 | 2024-08-05 |
Characterization of Th17 tissue-resident memory cells in non-inflamed intestinal tissue of Crohn's disease patients
2024-May, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2024.103206
PMID:38554656
|
研究论文 | 本文研究了克罗恩病患者小肠中Th17组织驻留记忆细胞的特征及其与免疫细胞的相互作用 | 首次详细描述了克罗恩病小肠中Th17 Trm细胞的转录组特征及其功能特性 | 样本量相对较小，仅包括七名克罗恩病患者和四名对照患者 | 探索克罗恩病患者的小肠中Th17 Trm细胞的特征及其在疾病中的作用 | 七名克罗恩病患者及四名溃疡性结肠炎患者作为对照 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序和配对T细胞受体测序 | NA | 组织样本 | 七名克罗恩病患者和四名溃疡性结肠炎患者的组织样本 |
| 12222 | 2024-08-04 |
Identification of key molecules in the formation of portal vein tumor thrombus in hepatocellular carcinoma based on single cell transcriptomics and in vitro experiments
2024-Apr-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-23-1589
PMID:38737676
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研究论文 | 本研究探讨了肝细胞癌中门静脉肿瘤血栓形成的关键分子 | 通过单细胞转录组学技术和体外实验，识别了与肝细胞癌PVTT形成相关的关键基因和调控网络 | 研究可能存在样本量小或只依赖于生物信息学分析的局限性 | 探究肝细胞癌中门静脉肿瘤血栓形成的分子机制及其与免疫浸润的关联 | 识别与PVTT发展相关的基因及其调控miRNA和lncRNA | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序，hdWGCNA，高维基因共表达网络分析 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 12223 | 2024-08-04 |
Single-Cell Transcriptome Sequencing Reveals Molecular Expression Differences and Marker Genes in Testes during the Sexual Maturation of Mongolian Horses
2024-Apr-23, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani14091258
PMID:38731262
|
研究论文 | 本研究旨在调查蒙古马性成熟过程中睾丸组织形态、基因表达及标记基因的差异 | 通过单细胞转录组测序技术揭示了不同年龄组之间睾丸细胞的显著差异和潜在的性成熟标记基因 | NA | 探索蒙古马的生殖生理及识别性成熟潜在标记 | 对1岁（性未熟）和10岁（性成熟）蒙古马的睾丸组织进行了比较研究 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 2个年龄组的睾丸组织样本，分别为1岁和10岁 |
| 12224 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics in MI identify Slc25a4 as a new modulator of mitochondrial malfunction and apoptosis-associated cardiomyocyte subcluster
2024-04-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-59975-8
PMID:38654053
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析确定了Slc25a4作为心肌梗死相关线粒体功能障碍和细胞凋亡的调节因子 | 创新性地识别了与心肌梗死后心室重塑密切相关的心肌细胞新亚群C5，以及新标志基因Slc25a4 | 研究限制在于仅使用了GEO数据库中的单细胞数据，可能限制了结果的广泛适用性 | 研究的目的是确定心肌细胞的转录谱及其在缺氧条件下的异质性 | 研究对象为心肌梗死和假手术组的小鼠心脏中的心肌细胞 | 数字病理学 | 心肌梗死 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 12225 | 2024-08-05 |
Schwann cell derived pleiotrophin stimulates fibroblast for proliferation and excessive collagen deposition in plexiform neurofibroma
2024-Apr, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-024-00727-1
PMID:38302728
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研究论文 | 本研究探讨了施旺细胞源性多效素如何刺激成纤维细胞增殖和胶原沉积。 | 提出了PTN/NCL/PRAS40轴在施旺细胞与神经纤维瘤相关成纤维细胞之间相互作用的重要性，提供了新的分子机制见解。 | 本研究的样本基于人类pNF，可能限制了在其他类型神经肿瘤中的适用性。 | 研究施旺细胞与神经纤维瘤相关成纤维细胞之间的相互作用，及其对pNF发展的影响。 | 主要研究对象为来自pNF样本的人类施旺细胞和神经纤维瘤相关成纤维细胞。 | 数字病理学 | 神经纤维瘤病 | 单细胞RNA测序、功能性实验（如CCK8、EdU等） | NA | 转录组数据、细胞培养实验数据 | NA |
| 12226 | 2024-08-05 |
Single cell analysis reveals an antiviral network that controls Zika virus infection in human dendritic cells
2024-Jan-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.19.576293
PMID:38293140
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研究论文 | 本研究揭示了Zika病毒在人体树突细胞中的抗病毒网络 | 提出了一种新范式，通过单细胞基因表达与实验性蛋白相互作用数据相结合，评估特定病毒的抗病毒反应 | 未提及相关的限制 | 深入理解宿主对Zika病毒感染的反应 | 感染了Zika病毒的人类单核细胞来源的树突细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA |
| 12227 | 2024-08-04 |
Screening and validation of atherosclerosis PAN-apoptotic immune-related genes based on single-cell sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1297298
PMID:38736872
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研究论文 | 本文筛选并验证了与颈动脉粥样硬化相关的PAN-凋亡免疫相关基因 | 首次探索了与颈动脉粥样硬化有关的PAN-光体相关基因，并通过机器学习识别出四个诊断基因 | 研究的样本量和类型未详细提及 | 旨在筛选与颈动脉粥样硬化有关的PAN-光体相关诊断基因 | 主要研究对象是颈动脉粥样硬化相关的不同ially expressed genes | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | 机器学习模型 | 转录组数据 | NA |
| 12228 | 2024-08-04 |
Exploring the Relevance of Disulfidptosis to the Pathophysiology of Ulcerative Colitis by Bioinformatics Analysis
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S454668
PMID:38737111
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研究论文 | 本研究探讨了二硫键死亡与溃疡性结肠炎的相关性 | 首次识别了与二硫键死亡相关的溃疡性结肠炎亚型，并建立了高准确度的预测模型 | 样本来源于公共数据库，可能存在选择偏倚 | 探究二硫键死亡在溃疡性结肠炎中的相关性 | 溃疡性结肠炎患者的样本与二硫键死亡相关基因 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞测序分析，qRT-PCR | NA | 基因表达数据 | 180个溃疡性结肠炎样本 |
| 12229 | 2024-08-04 |
A lamprey neural cell type atlas illuminates the origins of the vertebrate brain
2023-Oct, Nature ecology & evolution
IF:13.9Q1
DOI:10.1038/s41559-023-02170-1
PMID:37710042
|
研究论文 | 这篇文章建立了盲鳗整个大脑的细胞类型图谱，探讨了脊椎动物大脑的起源 | 通过单细胞RNA-seq和在位测序数据，首次系统描绘了盲鳗大脑的细胞和分子起源 | 研究发现了在进化过程中出现的关键组织和细胞类型，可能限制了对所有脊椎动物特征的认识 | 追踪脊椎动物大脑的细胞和分子起源 | 盲鳗这一无颚类物种的整个大脑 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq和在位测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 12230 | 2024-08-04 |
A protocol to analyze single-cell RNA-seq data from Mycobacterium tuberculosis-infected mice lung
2023-Sep-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102544
PMID:37659083
|
研究论文 | 本文提出了一种对小鼠肺部的单细胞RNA测序数据进行深入评估的协议 | 创新之处在于提供了一种综合分析健康与结核分枝杆菌感染小鼠肺淋巴细胞群体的详细步骤 | 未提及具体的局限性 | 研究目的在于分析不同条件下的小鼠肺淋巴细胞群体 | 研究对象为健康及结核分枝杆菌感染的小鼠肺淋巴细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | NA |
| 12231 | 2024-08-05 |
MetaTiME integrates single-cell gene expression to characterize the meta-components of the tumor immune microenvironment
2023-05-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-38333-8
PMID:37149682
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研究论文 | MetaTiME整合单细胞基因表达以表征肿瘤免疫微环境的元组成部分 | 本研究开发了一个数据驱动框架MetaTiME，以克服手动标注已知基因标记所导致的分辨率和一致性局限性 | NA | 旨在通过集成多个scRNA-seq数据集来表征肿瘤微环境中的细胞类型和状态 | 使用数百万TME单细胞数据学习与癌症类型相关的独立基因表达组分 | 数字病理学 | 癌症免疫疗法 | 单细胞RNA测序 | 数据驱动模型 | 基因表达数据 | 数百万TME单细胞 |
| 12232 | 2024-08-05 |
Interspecies Single-Cell RNA-Seq Analysis Reveals the Novel Trajectory of Osteoclast Differentiation and Therapeutic Targets
2022-Jul, JBMR plus
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/jbm4.10631
PMID:35866155
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了破骨细胞分化的新轨迹及治疗靶点 | 首次建立了人类和小鼠破骨细胞发生的综合命运图谱，并识别了RAB38作为关键分子 | 样本数量和数据范围的限制可能影响结果的普遍适用性 | 探索破骨细胞分化的机制并识别骨疾病的治疗靶点 | 人类和小鼠的破骨细胞谱系细胞 | 数字病理学 | 骨疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类和小鼠的破骨细胞样本，具体数量未知 |
| 12233 | 2024-08-05 |
Mouse splenocyte enrichment strategies via negative selection for broadened single-cell transcriptomics
2022-06-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101402
PMID:35600930
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研究论文 | 本研究提出了一种通过负选择策略富集小鼠脾细胞的协议 | 该方法通过免疫磁性负去ple增强了稀有免疫细胞群体，为单细胞转录组学提供了更广阔的细胞景观 | 文章中未提及研究的具体局限性 | 研究的目的是开发一种高效的脾细胞富集策略以提高下游分析的准确性 | 研究对象为小鼠脾脏的免疫细胞群体 | 数字病理学 | NA | 免疫磁性负去ple | NA | 单细胞转录组数据 | 使用了小鼠的脾脏细胞样本 |
| 12234 | 2024-08-05 |
Clinicopathological role of Cyclin A2 in uterine corpus endometrial carcinoma: Integration of tissue microarrays and ScRNA-Seq
2024-Jun, The International journal of biological markers
DOI:10.1177/03936155241238759
PMID:38646803
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研究论文 | 研究Cyclin A2在子宫体内膜癌中的表达及其潜在分子作用 | 首次系统地评估Cyclin A2在子宫体内膜癌中的表达和预后意义，并结合了单细胞RNA测序分析 | Cyclin A2未被确认为子宫体内膜癌中的独立预后因子 | 探讨Cyclin A2在子宫体内膜癌中的表达特征及其与预后的关系 | 收集子宫体内膜癌及正常子宫内膜组织样本 | 数字病理学 | 子宫癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归模型 | 组织样本 | 共收集了32个内部子宫体内膜癌样本、30个正常子宫内膜样本、720个公共数据库中的子宫体内膜癌样本和165个对照样本 |
| 12235 | 2024-08-04 |
Integrating spatial and single-cell transcriptomics reveals tumor heterogeneity and intercellular networks in colorectal cancer
2024-May-10, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06598-6
PMID:38729966
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研究论文 | 本研究整合了空间转录组学和单细胞 RNA 测序，以揭示结直肠癌中的肿瘤异质性和细胞间网络 | 通过结合单细胞 RNA 测序与空间转录组测定，深入理解了肿瘤微环境中不同细胞组分之间的相互作用 | 该研究仅分析了来自三个结直肠癌肿瘤-正常-血液对的样本，可能限制了结果的普遍性 | 研究结直肠癌肿瘤微环境中的细胞相互作用及其异质性 | 分析来自三个结直肠癌患者的41,700个细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | scRNA-seq 和空间转录组学 | NA | 单细胞数据 | 41,700个细胞 |
| 12236 | 2024-08-04 |
A time-resolved multi-omics atlas of transcriptional regulation in response to high-altitude hypoxia across whole-body tissues
2024-May-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48261-w
PMID:38730227
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研究论文 | 本研究探讨了高海拔缺氧对整体生理调节的转录调控机制 | 通过生成多组学数据，揭示了不同组织对缺氧的转录响应及调控基因 | 研究主要基于绵羊模型，可能不完全适用于其他物种 | 澄清高海拔缺氧适应过程中的遗传机制 | 使用绵羊作为模型动物研究多组织的转录变化 | 数字病理学 | NA | 全基因组测序，RNA-Seq，ATAC-Seq，单细胞RNA-Seq | NA | 基因组数据，转录组数据，表型数据 | 20个生物指标的表型数据 |
| 12237 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomic analysis of decidual immune cell landscape in the occurrence of adverse pregnancy outcomes induced by Toxoplasma gondii infection
2024-May-10, Parasites & vectors
IF:3.0Q1
DOI:10.1186/s13071-024-06266-w
PMID:38730500
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析了Toxoplasma gondii感染下的母体-胎儿微环境中蜕膜免疫细胞的变化 | 首次揭示了在T. gondii感染后蜕膜免疫细胞中一些未知分子的变化 | 尚未探讨感染的具体机制和细胞间相互作用 | 研究T. gondii感染对母体-胎儿微环境中的蜕膜免疫细胞的影响 | 人类蜕膜免疫细胞 | 数字病理学 | 孕产相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 12238 | 2024-08-05 |
An atlas of spider development at single-cell resolution provides new insights into arthropod embryogenesis
2024-May-10, EvoDevo
IF:4.1Q1
DOI:10.1186/s13227-024-00224-4
PMID:38730509
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研究论文 | 本研究创建了一个蛛形纲动物发育单细胞解析图谱，为节肢动物胚胎发生提供新见解 | 首次对家蜘蛛的胚胎进行单细胞RNA测序，识别了20个细胞簇及其基因表达特征 | 尚未探讨所有基因的功能，可能无法全面反映细胞的所有命运 | 研究蜘蛛胚胎的细胞组成及其基因表达 | 常见家蜘蛛Parasteatoda tepidariorum的胚胎 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 18500个细胞 |
| 12239 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis defines highly specific leukemia-induced neutrophils and links MMP8 expression to recruitment of tumor associated neutrophils during FGFR1 driven leukemogenesis
2024-May-10, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-024-00514-6
PMID:38730491
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研究论文 | 该文章定义了特异性的白血病诱导中性粒细胞，并将MMP8表达与肿瘤相关中性粒细胞的招募联系起来 | 研究识别出基于独特基因表达谱的特定白血病响应中性粒细胞亚群，并探讨了MMP基因上调在中性粒细胞发育中的重要作用 | 缺乏对其他可能影响中性粒细胞表现的因素的分析 | 研究FGFR1驱动的白血病发病过程中免疫细胞组成的变化 | 小鼠模型中的白血病相关中性粒细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 基因表达数据 | NA |
| 12240 | 2024-08-04 |
Multimodal cortical neuronal cell type classification
2024-May, Pflugers Archiv : European journal of physiology
DOI:10.1007/s00424-024-02923-2
PMID:38376567
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研究论文 | 本文总结了近年来对皮层神经元细胞类型分类的新见解 | 提出可靠的皮层细胞类型并进行了分类，包括兴奋性和抑制性神经元的不同亚群 | 尚未明确哪些转录组细胞类型会转化为真实的细胞类型 | 深入理解皮层神经元细胞类型及其功能 | 兴奋性（谷氨酸能）和抑制性（GABA能）神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |