单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 12181 - 12200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12181 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing analysis of the retina under acute high intraocular pressure
2024-Nov-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/1673-5374.389363
PMID:38526288
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研究论文 | 本文分析了在急性高眼压下视网膜的单细胞RNA测序特征 | 首次揭示了高眼压下视网膜的分子变化和细胞间相互作用 | 未提及具体限制 | 探讨高眼压引起的视网膜损伤的分子机制 | 视网膜细胞，特别是视网膜神经节细胞 | 数字病理学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞基因表达数据 | 建立了急性高眼压的大鼠模型 |
| 12182 | 2024-08-04 |
Navigating colorectal cancer prognosis: A Treg-related signature discovered through single-cell and bulk transcriptomic approaches
2024-Jun, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24214
PMID:38459654
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研究论文 | 本研究通过单细胞和大规模转录组方法发现了与Treg相关的结直肠癌预后标志 | 本研究结合了单细胞异质性和大规模转录组数据，构建了基于Treg相关特征的预后模型 | 临床应用验证尚需进一步研究，以及样本量的限制可能影响结果的普适性 | 研究结直肠癌的预后及其与调节性T细胞的关系 | 结直肠癌患者的Treg细胞及其相关基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序和大规模转录组分析 | 生存分析模型 | 基因表达数据 | 分析了GSE132465和GSE188711中结直肠癌的单细胞和大规模数据集 |
| 12183 | 2024-08-04 |
Precision unveiled: Synergistic genomic landscapes in breast cancer-Integrating single-cell analysis and decoding drug toxicity for elite prognostication and tailored therapeutics
2024-Jun, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24205
PMID:38450906
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研究论文 | 本研究探索了与T细胞相关的基因与谷氨酰胺代谢之间的关系，以构建乳腺癌患者的预后分级指标 | 创新点在于开发了一种TRG_GM分类器，整合了临床指标，提高了乳腺癌的预后预测能力 | 缺少对多种指标结合的深入探索以揭示不同维度的预后表现 | 研究旨在通过分析基因与代谢的关系，提升乳腺癌的个性化治疗效果 | 研究对象为乳腺癌患者及其相关的生物标志物 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 机器学习，Cox分析，Lasso算法 | NA | 基因组数据，免疫特征数据 | NA |
| 12184 | 2024-08-05 |
Integrative analysis of bulk RNA-seq and scRNA-seq data indicates the prognostic and immunologic values of SERPINH1 in glioma
2024-Jun, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24192
PMID:38506564
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研究论文 | 本文章探讨了SERPINH1在胶质瘤中的预后和免疫学价值 | 本研究首次阐明了SERPINH1在胶质瘤中的表达及其作为独立预后因素的作用 | 仅使用了在线数据库的数据，未报告临床样本的多样性 | 研究SERPINH1在胶质瘤中的潜在价值 | 胶质瘤相关的RNA-seq和scRNA-seq数据 | 数字病理学 | 胶质瘤 | RNA-seq，qRT-PCR，免疫组织化学 | Cox回归分析 | RNA序列数据 | NA |
| 12185 | 2024-08-05 |
Exploring the causal relationship between antihypertensive drugs and glioblastoma by combining drug target Mendelian randomization study, eQTL colocalization, and single-cell RNA sequencing
2024-Jun, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24210
PMID:38450887
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研究论文 | 本研究评估了抗高血压药物对神经胶质母细胞瘤的潜在因果影响 | 本研究首次结合了药物靶点孟德尔随机化研究、eQTL共定位以及单细胞RNA测序，探讨了抗高血压药物与神经胶质母细胞瘤之间的因果关系 | 需要更多的研究来验证这些发现，并进一步揭示血压与神经胶质母细胞瘤之间的复杂关系 | 评估血压和抗高血压药物对神经胶质母细胞瘤的潜在因果影响 | 针对5种抗高血压药物的研究对象，包括β-受体拮抗剂等 | 数字病理学 | 神经胶质瘤 | 单细胞RNA测序、Mendelian随机化分析 | NA | 基因组数据、RNA测序数据 | 欧洲人群的基因组广泛关联研究（GWAS）总结统计信息 |
| 12186 | 2024-08-04 |
Single nucleus and spatial transcriptomic profiling of healthy human hamstring tendon
2024-May-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202300601RRR
PMID:38742770
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研究论文 | 本研究确定了健康人类腘绳肌肌腱中所有细胞类型的转录组和位置 | 首次在健康腘绳肌肌腱中识别了12种不同的细胞类型，包括先前未报告的不同骨骼肌细胞类型、卫星细胞、脂肪细胞和未知的神经系统细胞 | 研究只集中于四名健康供体，样本量有限 | 探讨健康腘绳肌肌腱的分子和细胞基础 | 四名健康供体的腘绳肌肌腱细胞 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | 四名健康供体的10,533个细胞核 |
| 12187 | 2024-08-04 |
Tracking in situ checkpoint inhibitor-bound target T cells in patients with checkpoint-induced colitis
2024-May-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.04.010
PMID:38744246
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研究论文 | 本文通过多模态单细胞和亚细胞空间转录组学跟踪了与检查点抑制剂结合的目标T细胞。 | 本研究揭示了检查点抑制剂诱导的结肠炎中T细胞的特定信号和转录梯度，并识别了因果通路。 | NA | 探讨和追踪检查点抑制剂诱导的T细胞在肠道组织中的行为。 | 主要研究与检查点抑制剂结合的CD4和CD8 T细胞。 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 12188 | 2024-08-05 |
Foxp2 deficiency impairs reproduction by modulating the hypothalamic-pituitary-gonadal axis in zebrafish†
2024-May-09, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioae019
PMID:38288660
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研究论文 | 本研究探讨了Foxp2在斑马鱼生殖中的作用 | 揭示了Foxp2在脊椎动物生殖调节中的新角色 | 研究主要集中在斑马鱼模型上，可能无法完全推广到其他物种 | 研究Foxp2在斑马鱼生殖中的功能 | Foxp2缺失的斑马鱼模型 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 成年雄性和雌性斑马鱼 |
| 12189 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-seq data analysis reveals functionally relevant biomarkers of early brain development and their regulatory footprints in human embryonic stem cells (hESCs)
2024-Mar-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae230
PMID:38739758
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析人类胚胎干细胞中的早期神经发育相关生物标志物及其调控网络 | 该文章揭示了539个差异表达基因及其在早期人脑发育中的功能角色，并构建了基因调控网络 | 研究中所使用的样本主要来自体外分化的胚胎干细胞，可能无法完全代表完整的生物体内发育过程 | 识别早期神经发育中的差异表达基因及其分子机制 | 人类胚胎干细胞在不同发育阶段的差异表达基因 | 数字病理学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 在hESC分化为神经元的体外实验中，共分析了26天（D26）和54天（D54）时的样本 |
| 12190 | 2024-08-05 |
Protocol for flow cytometry-assisted single-nucleus RNA sequencing of human and mouse adipose tissue with sample multiplexing
2024-Mar-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102893
PMID:38416649
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研究论文 | 本文介绍了一种针对人类和小鼠脂肪组织的流式细胞术辅助单核RNA测序的协议 | 该研究开发了一种新的工作流程，可以高效处理和标记单个脂肪组织样本的细胞核 | 单细胞RNA测序受到脂肪细胞大小和脆弱性以及商业试剂盒成本的限制 | 提出一种新的脂肪组织样本处理方法以提高测序效率 | 人类和小鼠的脂肪组织样本 | 数字病理学 | NA | 流式细胞术 | NA | RNA | NA |
| 12191 | 2024-08-04 |
Preparation of High-Viability Single-Cell Suspensions from African Turquoise Killifish Brain Tissue
2024-02-01, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.prot107829
PMID:36931736
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research paper | 本研究描述了如何从非洲蓝色杀鱼的脑组织中准备高活性的单细胞悬液 | 本研究创新性地提供了一种从新兴模型生物制备高活性单细胞悬液的协议 | 未提及该方法在其他物种或组织中的适用性 | 本研究的目的是为单细胞测序准备高活性的单细胞悬液 | 非洲蓝色杀鱼的脑组织 | NA | NA | 酶解与机械解离 | NA | NA | 研究成功用于非洲蓝色杀鱼的10× Genomics单细胞测序实验 |
| 12192 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveals a role for pancreatic duct cells as potential mediators of inflammation in diabetes mellitus
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1381319
PMID:38742118
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研究论文 | 本研究揭示了胰管细胞在糖尿病相关炎症中的潜在介导作用 | 首次识别出在炎症环境中胰管细胞亚群表现出独特的促炎症信号 | 研究未明确揭示胰管细胞与其他免疫细胞之间的具体相互作用 | 探索暴露于炎症环境中的原代人胰腺细胞的细胞类型特异性分子反应 | 原代人胰腺细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 12193 | 2024-08-05 |
A Strategy based on Bioinformatics and Machine Learning Algorithms Reveals Potential Mechanisms of Shelian Capsule against Hepatocellular Carcinoma
2024, Current pharmaceutical design
IF:2.6Q2
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研究论文 | 这项研究利用生物信息学方法揭示了Shelian胶囊对肝细胞癌的潜在机制 | 通过机器学习算法和网络分析确定了四个特征基因，提供了对Shelian胶囊潜在药理机制的初步见解 | 未在临床环境中直接验证所发现的机制 | 研究Shelian胶囊在治疗肝细胞癌中的潜在机制 | 肝细胞癌相关疾病基因和Shelian胶囊的生物活性成分 | 数字病理学 | 肝癌 | 机器学习算法，生物信息学 | NA | 基因表达数据 | 153种成分和170个候选靶点，494个HCC相关疾病基因 |
| 12194 | 2024-08-05 |
Single cell analysis of short-term dry eye induced changes in cornea immune cell populations
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1362336
PMID:38560382
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研究论文 | 本研究评估了干眼如何改变角膜免疫细胞群体的比例和转录特征 | 通过单细胞RNA测序揭示了干眼条件下角膜免疫细胞的转录谱变化 | 未提及具体的临床试验或长期跟踪研究 | 探究干眼对角膜免疫细胞影响的机制 | 角膜中的免疫细胞群体 | 数字病理学 | 干眼 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 十二种角膜免疫细胞群体 |
| 12195 | 2024-08-04 |
Anterior Pituitary Transcriptomics Following a High-Fat Diet: Impact of Oxidative Stress on Cell Metabolism
2023-Dec-23, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqad191
PMID:38103263
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研究论文 | 本研究探讨高脂饮食对前垂体转录组的影响，特别是氧化压力对细胞代谢的影响。 | 本研究首次比较了男女小鼠在高脂饮食下前垂体细胞对氧化压力的适应能力。 | 未能深入分析高脂饮食对前垂体基因表达长期影响的变化。 | 研究高脂饮食对前垂体功能及其转录组的影响。 | 使用FVB.129P小鼠探讨高脂饮食对男女前垂体细胞的影响。 | 数字病理学 | 肥胖相关病 | 单细胞RNA测序 | NA | 血清激素和细胞转录组数据 | 男性和女性FVB.129P小鼠，每组增加了20克体重 |
| 12196 | 2024-08-04 |
Single-Molecule Spatial Transcriptomics of Human Thoracic Aortic Aneurysms Uncovers Calcification-Related CARTPT-Expressing Smooth Muscle Cells
2023-12, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.319329
PMID:37823268
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研究论文 | 本研究揭示了人类胸主动脉瘤中与钙化相关的CARTPT表达的平滑肌细胞的稀有亚型 | 采用高分辨率单细胞转录组成像技术揭示了胸主动脉瘤组织样本中稀有平滑肌细胞类型 | 主要集中于男性TAA样本，可能限制了对其他人群的普遍适用性 | 揭示人类胸主动脉瘤中平滑肌细胞的异质性及其功能 | 人类胸主动脉瘤组织样本中的平滑肌细胞亚型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单分子空间转录组成像 | NA | 组织样本 | 140个基因的转录本在新鲜冷冻的TAA样本中分析 |
| 12197 | 2024-08-04 |
Mettl14-mediated m6A modification ensures the cell-cycle progression of late-born retinal progenitor cells
2023-06-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112596
PMID:37269288
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研究论文 | 该文章探讨了Mettl14介导的m6A修饰如何确保晚出生视网膜前体细胞的细胞周期进展 | 该研究揭示了m6A甲基化在调节晚出生视网膜前体细胞细胞周期中的重要作用 | 尚未探讨Mettl14缺失对出生前视网膜发育的其他潜在影响 | 旨在揭示神经前体细胞细胞周期进展的调控机制 | 晚出生的视网膜前体细胞 | 数字病理学 | NA | mA测序，单细胞转录组分析 | NA | mRNA | NA |
| 12198 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics of human-skin-equivalent organoids
2023-05-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112511
PMID:37195865
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研究论文 | 该研究利用单细胞转录组学比较人类皮肤等效类器官和自然皮肤的特征 | 该论文通过重建HSE角质形成细胞的分化轨迹，揭示了HSEs中的独特角质形成细胞状态及其与已知体内分化通路的相似性 | HSEs存在独特的角质形成细胞状态，并且终末分化受损 | 研究人类皮肤等效类器官的生物学特性及其分化过程 | 人类皮肤等效(organoid)培养物、异种移植物和体内表皮 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 12199 | 2024-08-05 |
Monocyte depletion enhances neutrophil influx and proneural to mesenchymal transition in glioblastoma
2023-04-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-37361-8
PMID:37012245
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研究论文 | 本文探讨了单核细胞耗竭如何增强神经元至间充质转变和中性粒细胞的涌入。 | 研究揭示了单核细胞和中性粒细胞在不同肿瘤类型和基因型中的入侵和功能差异，并强调了同时靶向这两类细胞对癌症治疗的重要性 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能限制了结果对人类癌症的直接应用 | 探讨单核细胞耗竭对胶质母细胞瘤中中性粒细胞行为的影响 | 利用CRISPR/Cas9基因编辑生成缺乏单核细胞趋化因子的小鼠模型 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | CRISPR/Cas9基因编辑 | 小鼠模型 | 单细胞RNA测序 | 使用了基因工程小鼠模型，包括PDGFB驱动的胶质母细胞瘤和肝细胞癌的多个样本 |
| 12200 | 2024-08-04 |
Transcriptional activation of Jun and Fos members of the AP-1 complex is a conserved signature of immune aging that contributes to inflammaging
2023-04, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.13792
PMID:36840360
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研究论文 | 该文章研究了AP-1复合体中Jun和Fos成员的转录激活在免疫衰老中的作用 | 发现AP-1复合体的转录激活在不同小鼠品系和组织中是一个保守的衰老特征 | 研究主要集中在小鼠模型，可能对人类应用的普遍性有限 | 探索免疫衰老中的转录激活机制及其对慢性炎症的影响 | 长寿和短寿小鼠品系的免疫细胞转录组和表观基因组 | 数字病理学 | 老年疾病 | ATAC-seq、单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 年轻和老年小鼠的免疫细胞样本 |