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当前共找到 38610 篇文献,本页显示第 101 - 120 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
101 2026-04-21
Identification of a lactylation-related model for predicting prognosis, tumor-infiltrating immune cells, and chemotherapy response in colorectal cancer
2026-Mar, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 本研究通过整合乳酸化相关基因表达谱与单细胞RNA测序,识别了五个关键基因(CALD1、S100A11、S100A6、LGALS1、CSRP2),构建了一个预测结直肠癌预后、肿瘤浸润免疫细胞和化疗反应的模型 首次将乳酸化相关基因与单细胞RNA测序结合,用于结直肠癌的分子亚型分型和预后预测,揭示了乳酸化在免疫调节和化疗耐药中的新作用 研究未详细说明样本的具体临床特征或外部验证队列,可能限制模型的泛化能力 提高结直肠癌的预后评估和治疗分层准确性 结直肠癌患者 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 预后风险模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
102 2026-04-21
Evaluating the toxicological effects of PET-MPs exposure on atherosclerosis through integrated network toxicology analysis and experimental validation
2026-Mar, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 本研究通过整合网络毒理学分析和实验验证,评估了PET微塑料暴露对动脉粥样硬化的毒理学效应 结合生物信息学与实验验证,首次系统探索PET微塑料诱导动脉粥样硬化的潜在毒理学机制,并识别了核心靶点 研究主要基于体外细胞实验和计算模拟,缺乏体内动物模型验证,且毒理学机制的全面性有待进一步证实 探究PET微塑料暴露导致动脉粥样硬化的毒理学机制 PET微塑料(PET-MPs)及其在动脉粥样硬化中的作用靶点 生物信息学 心血管疾病 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 分子对接, PCR NA 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
103 2026-04-21
Spatial-ZEDNet : a unified spatial transcriptomics framework for detecting differential gene activation and expression
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文提出了一种名为Spatial-ZEDNet的层次高斯随机场框架,用于联合检测空间差异表达基因和差异激活基因,并显式建模零膨胀问题 该框架首次在无需空间坐标匹配的情况下对齐不同条件下的生物信号,同时检测空间差异表达基因和差异激活基因,并显式处理单细胞基因表达数据中普遍存在的零膨胀问题 未明确说明方法在超大规模数据集上的计算效率或对特定组织类型的适用性限制 开发一个统计严谨、可解释的框架,用于整合跨环境和治疗暴露的空间转录组数据,推进对暴露诱导组织重塑的机制理解 空间转录组数据,特别是结肠炎和疟原虫感染数据集中的基因表达模式 空间转录组学 结肠炎、疟疾 空间转录组学 层次高斯随机场 空间基因表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
104 2026-04-21
AICellType: a large language model-based platform for accurate cell type annotation
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文介绍了一个基于大型语言模型的平台AICellType,用于准确注释单细胞和空间转录组学中的细胞类型 通过系统评估79个大型语言模型在1130个数据集上的性能,开发了首个结合本体结构和语义推理的评估框架,并推出了开源R包和网络平台 模型性能可能受限于训练数据的多样性和生物学背景的复杂性 开发一个准确、可扩展且高效的单细胞和空间转录组学细胞类型注释平台 单细胞和空间转录组学数据集 自然语言处理 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 大型语言模型 文本 1130个单细胞和空间转录组学数据集 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
105 2026-04-21
Spatial multi-omics integration by cross-modal graph contrastive learning
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文提出了一种基于图的框架CoMo,用于整合空间多组学数据,通过跨模态图对比学习实现特征融合和空间域识别 CoMo框架结合跨注意力机制和双重对比损失优化,有效处理多组学层间的技术偏差和生物复杂性,提升空间域识别性能 NA 开发一个计算工具以整合空间多组学数据,用于解析组织结构和细胞间通讯 空间多组学数据,包括空间转录组、空间蛋白质组和空间表观基因组 机器学习 NA 空间多组学技术 图神经网络,对比学习 空间多组学数据 NA NA 空间多组学 NA NA
106 2026-04-21
Causal modeling reveals cell-cell communication dynamics in the tumor microenvironment during anti-PD-1 therapy in breast cancer patients
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本研究提出了一种名为scIVCCC的因果推断框架,利用单细胞RNA-seq数据,通过将治疗作为工具变量,识别了乳腺癌患者在接受抗PD-1治疗期间肿瘤微环境中真实的细胞间通讯网络 开发了scIVCCC因果推断框架,利用治疗作为工具变量来区分真实的细胞间通讯信号与混淆关联,从而更准确地揭示治疗诱导的通讯动态 研究样本量相对较小(31名患者),且仅针对乳腺癌,可能限制了结果的普适性 揭示抗PD-1治疗如何通过细胞间通讯重塑乳腺癌肿瘤微环境,并识别潜在的联合治疗靶点 乳腺癌患者肿瘤微环境中的细胞,特别是耗竭T细胞和肿瘤相关巨噬细胞 单细胞组学 乳腺癌 单细胞RNA-seq 因果推断框架(scIVCCC) 单细胞RNA-seq数据 31名乳腺癌患者治疗前后的样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
107 2026-04-21
GALA: a unified landmark-free framework for coarse-to-fine spatial alignment across resolutions and modalities in spatial transcriptomics
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文提出了一个名为GALA的统一、无标记点框架,用于解决空间转录组学中跨分辨率和跨模态的空间对齐问题 GALA将全局仿射变换与局部微分同胚变形耦合在单一优化中,并通过模态感知栅格化将转录组和组学数据统一到共享网格中,实现了无标记点、跨分辨率与跨模态的对齐 NA 解决空间转录组学数据中因技术变异(如几何畸变、平台分辨率与模态差异)导致的空间对齐挑战 人类和小鼠的空间转录组学数据集 空间转录组学 NA 空间转录组学 遗传算法引导的大变形对齐(GALA) 空间转录组数据、组织学数据 多样的人类和小鼠数据集 NA 空间转录组学 NA NA
108 2026-04-21
Evaluating reference-mixture matching in cell-type deconvolution with single-cell RNA-seq references
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文系统评估了在单细胞RNA测序参考与目标批量样本匹配程度不同条件下,细胞类型去卷积方法的性能 首次系统性地评估了参考匹配程度对多种细胞类型去卷积算法性能的影响,并确定了方法选择比参考匹配更重要 研究主要基于模拟数据和单一PBMC数据集,可能无法完全代表其他组织或疾病类型 评估单细胞RNA测序参考匹配对细胞类型去卷积准确性的影响 外周血单个核细胞(PBMCs) 生物信息学 系统性红斑狼疮 单细胞RNA测序,批量RNA测序 CIBERSORTx, MuSiC2, InstaPrism, BLADE, DISSECT, Scaden RNA测序数据 来自狼疮患者和健康对照的PBMC单细胞数据集,包含20名狼疮患者、20名健康对照、10名狼疮患者+10名对照、20名狼疮患者+20名对照四种参考组合 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
109 2026-04-21
Single-Cell Transcriptomic Landscape of Right-Sided Colon Cancer Reveals Cellular and Molecular Features of Metastatic Potential
2026-Feb-28, Biomedicines IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析揭示了右侧结肠癌肝转移潜能的细胞和分子特征 首次在单细胞水平上比较了有和无肝转移的右侧结肠癌肿瘤,识别了与转移潜能相关的干细胞样肿瘤细胞状态、代谢可塑性和微环境重塑 研究基于公共数据集,样本量较小(仅8例患者),且缺乏功能验证实验 阐明右侧结肠癌肝转移潜能的细胞基础 右侧结肠癌原发性肿瘤(来自8例患者,其中5例有肝转移,3例无转移) 数字病理学 结肠癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 8例患者(5例有肝转移,3例无转移) NA 单细胞RNA-seq NA NA
110 2026-04-21
PreTSA: computationally efficient modeling of temporal and spatial gene expression patterns
2026-Feb-12, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 本文介绍了一种名为PreTSA的计算方法,用于高效建模大规模单细胞和空间转录组数据中的时间和空间基因表达模式 PreTSA在保持与现有最先进方法结果一致的同时,显著减少了计算时间,为研究超大规模数据集中的基因表达模式提供了独特解决方案 NA 开发一种计算高效的方法来建模大规模单细胞和空间转录组数据中的时间和空间基因表达模式 单细胞和空间转录组数据,包含数百万个细胞 计算生物学 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 PreTSA 基因表达数据 数百万个细胞 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
111 2026-04-21
A bone-derived hormone permits rapid visual escape via GPR37 receptor in a subpopulation of VTA GABAergic neurons
2026-Feb-11, Neuron IF:14.7Q1
研究论文 本研究揭示了骨源性激素骨钙素通过GPR37受体调控中脑腹侧被盖区GABA能神经元兴奋性,从而促进快速视觉逃逸行为的新机制 首次发现骨源性激素骨钙素通过GPR37-cAMP-THIK-1信号通路调控VTA GABA能神经元兴奋性,建立了骨-脑代谢轴调控生存行为的新范式 研究主要聚焦于VTA特定神经元亚群,其他脑区或神经元类型是否参与该调控机制尚不明确 探究快速视觉逃逸行为的神经调控机制 小鼠中脑腹侧被盖区GABA能和谷氨酸能神经元 神经科学 NA 单细胞转录组学、电生理记录 NA 基因表达数据、电生理信号 NA NA NA NA NA
112 2026-04-21
Hepatic Arterial Flow-Induced Portal Tract Fibrosis in Portal Hypertension: The Role of VCAM-1 and Osteopontin-Expressing Macrophages
2026-Jan-19, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究探讨了门脉高压中肝动脉血流增加如何通过VCAM-1和骨桥蛋白阳性巨噬细胞驱动门管区纤维化的分子机制 揭示了肝动脉缓冲反应中血流动力学变化通过VCAM-1介导的巨噬细胞募集和骨桥蛋白表达驱动门管区纤维化的新机制 研究主要基于大鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 阐明门脉高压中肝动脉血流增加诱导门管区纤维化的分子机制 Sprague-Dawley大鼠门脉高压模型 病理生理学 门脉高压 microCT、免疫细胞分析、血流动力学测量、转录组分析、单细胞RNA测序、RNA荧光原位杂交 NA 影像数据、血流动力学数据、转录组数据、单细胞测序数据 Sprague-Dawley大鼠门脉高压模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
113 2026-04-21
Gene editing and multi-omics approaches to study early embryogenesis in cattle
2026-Jan-09, Reproduction, fertility, and development
综述 本文综述了多组学分析和靶向分子功能工具在牛早期胚胎发育研究中的应用与进展 整合了单细胞多组学技术(如scRNA-seq、ATAC-seq)与基因编辑功能工具(如CRISPR-Cas9、碱基编辑),以高分辨率解析牛早期胚胎发育的复杂动态 NA 通过多组学与功能工具的结合,深入理解牛早期胚胎发育机制,以改善牛生育力 牛早期胚胎(第一周胚胎发育阶段) 多组学与发育生物学 生育力障碍 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、代谢组学、蛋白质组学、CRISPR-Cas9、RNA编辑、碱基编辑、Trim-Away NA 多组学数据(转录组、表观基因组、代谢组、蛋白质组) NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 代谢组学, 蛋白质组学 NA NA
114 2026-04-21
CD4+ Effector Memory T Cells Related Marker Gene Signatures in Osteoporosis and Aging: Insight From Single-Cell Analysis and Mendelian Randomization
2026, Combinatorial chemistry & high throughput screening IF:1.6Q3
研究论文 本研究通过整合单细胞数据、孟德尔随机化分析和动物实验,探讨了骨质疏松症与衰老之间的关系及共享分子机制,识别了CD4+效应记忆T细胞作为核心细胞亚群,并揭示了KLRB1、NR4A2和S100A4基因在骨质疏松症发生中的因果作用 首次结合单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析,系统性地识别了骨质疏松症和衰老共享的核心细胞亚群(CD4+效应记忆T细胞)及其关键基因(KLRB1、NR4A2、S100A4),并通过动物实验验证了NR4A2的下调,为骨质疏松症的分子靶向和免疫治疗提供了新见解 研究样本可能有限,单细胞数据仅来自外周血,未涉及骨组织或其他相关组织;孟德尔随机化分析依赖于公开的遗传数据,可能存在混杂因素;动物模型的结果需在人类中进一步验证 探讨骨质疏松症与衰老之间的关系及共享分子机制 骨质疏松症患者、衰老个体、健康对照者的外周血单细胞数据,以及大鼠骨质疏松模型 数字病理学 骨质疏松症 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、孟德尔随机化(MR)分析、RT-qPCR NA 单细胞RNA测序数据、遗传数据、基因表达数据 骨质疏松症患者、衰老个体和健康对照者的外周血单细胞数据(具体样本数未明确),以及大鼠骨质疏松模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
115 2026-04-21
Preliminary Study on GZMA- and GSDMB-Associated Pyroptosis and CD8+ T Cell-Mediated Immune Evasion in Skin Cutaneous Melanoma
2026, Current topics in medicinal chemistry IF:2.9Q3
研究论文 本研究基于皮肤黑色素瘤中的细胞焦亡特征,探讨了GZMA和GSDMB相关焦亡及CD8+ T细胞介导的免疫逃逸机制 结合单细胞和批量RNA-seq数据,首次揭示了GZMA在CD8+ T细胞中的特异性过表达及其通过CD99-CD99和HLA-C-KIR2DL3配体-受体对与黑色素细胞的相互作用,为肿瘤免疫逃逸提供了新见解 研究未检测到显著的焦亡相关差异表达基因,且焦亡通路在肿瘤组中未激活,样本来源依赖于公共数据库,实验验证仅限于体外细胞模型 揭示皮肤黑色素瘤基于焦亡特征的潜在发病机制,特别是免疫逃逸过程 皮肤黑色素瘤患者样本及细胞系 生物信息学 皮肤黑色素瘤 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, qRT-PCR, CCK-8, 伤口愈合实验, Transwell实验 NA RNA-seq数据, 临床信息 来自TCGA和GEO数据库的皮肤黑色素瘤患者数据 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
116 2026-04-21
Elucidating a Myofibroblast-dominated Fibrotic Niche in Crohn's Disease-associated Fibrostenosis Through High-resolution Spatial Transcriptomics
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究通过高分辨率空间转录组学技术,揭示了克罗恩病相关纤维狭窄中一个以肌成纤维细胞为主的纤维化微环境,并明确了其细胞来源和分子机制 首次在克罗恩病纤维狭窄中应用高分辨率空间转录组学,系统性地描绘了纤维化微环境的细胞组成和空间组织,并识别了肌成纤维细胞的起源及周细胞的表型重编程 研究仅分析了两个样本(一个非纤维化和一个纤维狭窄样本)进行空间转录组学,样本量较小,且主要基于回顾性数据和公共数据集进行验证 阐明克罗恩病相关纤维狭窄中纤维化微环境的细胞身份和分子机制,以寻找抗纤维化治疗的新靶点 克罗恩病患者的回肠组织,包括正常、非狭窄和狭窄病例 数字病理学 克罗恩病 高分辨率空间转录组学,单细胞RNA测序,免疫荧光,原代周细胞培养,定量聚合酶链反应 NA 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据,图像数据 空间转录组学分析2个样本(1个非纤维化,1个纤维狭窄),公共单细胞RNA测序数据集包含158个样本,组织学分析涉及104个病例(25正常,35非狭窄CD,44狭窄CD) NA 空间转录组学,单细胞RNA测序 NA NA
117 2026-04-21
DOCK10 Regulates Insulin Hypersecretion in Insulinoma and Serves as a Diagnostic and Therapeutic Target
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究揭示了DOCK10在胰岛素瘤中调控胰岛素过度分泌的分子机制,并评估了其作为诊断标志物和治疗靶点的潜力 首次发现DOCK10在胰岛素瘤的胰岛素分泌成分中特异性过表达,并揭示了DOCK10-Cdc42轴在调控胰岛素分泌中的新作用 研究主要基于体外细胞模型、小鼠异种移植模型和类器官,需要进一步在人体临床试验中验证DOCK10作为治疗靶点的有效性 阐明胰岛素瘤中胰岛素过度分泌的分子机制,并寻找新的诊断和治疗靶点 人胰岛素瘤手术标本、匹配的类器官、MIN6小鼠胰岛素瘤细胞 NA 胰岛素瘤 bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 定量PCR, 免疫组织化学 NA RNA测序数据, 基因表达数据, 组织图像 人胰岛素瘤手术标本及其匹配类器官组成的生物样本库 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
118 2026-04-21
Novel Acinar Metaplastic States Uncovered in Exocrine Pancreas Disease
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学分析,揭示了外分泌胰腺疾病中腺泡细胞向导管化生(ADM)的保守程序,并识别了新的化生状态,包括作为癌症前体病变的早期亚型 首次全面定义了不同胰腺疾病背景下ADM的共享化生程序,识别了先前未知的“门户”ADM群体和早期胰腺癌亚型(如经典样和基底样状态),并利用FixNCut方法在酶丰富组织中实现高质量转录组分析 研究主要基于小鼠模型,人类组织验证仅通过CosMx空间转录组学进行,样本规模可能有限,且未深入探讨化生状态转化的具体分子机制 全面定义临床相关外分泌胰腺疾病(如胰腺炎和癌前病变)中的化生反应,以理解癌症风险增加的机制 小鼠模型中的胰腺腺泡细胞及其微环境,涵盖急性、复发性和慢性胰腺炎以及致癌Kras突变背景,以及人类胰腺组织 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据 超过300,000个单细胞,来自多个小鼠疾病模型和人类组织 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA 使用了FixNCut方法以在酶丰富的外分泌胰腺中保持RNA完整性,以及CosMx空间转录组学进行人类组织验证
119 2026-04-21
Single-Cell Maps Reveal Novel Mechanisms of Ferroptosis and Biomarkers in Diabetic Nephropathy
2026, Current medicinal chemistry IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析糖尿病肾病小鼠肾脏组织,筛选了早期诊断生物标志物,并揭示了铁死亡在疾病发展中的新机制 首次在糖尿病肾病病理状态下发现系膜上皮细胞与移行上皮细胞间细胞通讯增强,并揭示了热休克蛋白家族成员通过调控GPX4促进铁死亡经典表型脂质过氧化的新机制 研究结果需要进一步的临床验证才能实现临床转化 在单细胞水平筛选糖尿病肾病的潜在生物标志物并揭示其新的分子发病机制 对照组和糖尿病肾病小鼠的肾脏组织 单细胞组学 糖尿病肾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 对照组和糖尿病肾病小鼠肾脏组织(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
120 2026-04-21
Construction of an E3 Ubiquitin Ligase Gene Model to Predict the Prognosis of Idiopathic Pulmonary Fibrosis Patients Using Integrated Bioinformatics Analysis
2026, Current medicinal chemistry IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过整合生物信息学分析,构建了一个基于E3泛素连接酶基因的风险特征模型,用于预测特发性肺纤维化患者的预后 首次开发了一个基于5个E3泛素连接酶基因(CDCA3、TRIM47、SH3RF1、SPAG16、LONRF3)的预后特征模型,并利用单细胞RNA-seq分析揭示了肺泡上皮细胞与巨噬细胞之间的强相互作用,以及这些基因在IPF中的潜在作用 研究依赖于公开的GEO数据库数据,样本量可能有限,且模型需要进一步在独立队列中进行验证 开发一个基于E3泛素连接酶基因的风险特征模型,以预测特发性肺纤维化患者的预后 特发性肺纤维化患者 生物信息学 特发性肺纤维化 生物信息学分析、LASSO回归、多变量Cox回归分析、功能富集分析、免疫细胞浸润分析、共识聚类分析、单细胞RNA-seq分析、Western blot 预后特征模型 基因表达数据 使用GSE70866数据集,具体样本数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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