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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-12-06 |
Prostaglandin E2-EP2/EP4 signaling induces the tumor-infiltrating Treg phenotype for tumor growth
2025-Dec-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2424251122
PMID:41343674
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研究论文 | 本研究揭示了前列腺素E2通过EP2/EP4信号通路诱导肿瘤浸润性调节性T细胞表型,从而促进肿瘤生长的核心机制 | 首次明确了肿瘤微环境中前列腺素E通过EP2/EP4-cAMP-PKA通路直接诱导Tregs获得肿瘤浸润表型,并证实该机制在不同物种和肿瘤类型中具有保守性 | 研究主要聚焦于PGE-EP2/EP4通路,可能存在其他未知的诱导机制;人类样本分析仅限于鼻咽癌患者 | 探究肿瘤微环境中诱导肿瘤浸润性调节性T细胞表型的分子机制 | 调节性T细胞(包括诱导型Tregs和天然Tregs)、Lewis肺癌小鼠模型、人类鼻咽癌患者样本 | 肿瘤免疫学 | 肺癌、鼻咽癌 | 单细胞RNA测序、基因表达分析、细胞功能实验 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 小鼠肿瘤模型、人类鼻咽癌患者单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 102 | 2025-12-06 |
YAP-Induced Glycolysis Drives Fibroinflammation and Disrupts Fibroblast Fidelity
2025-Dec-05, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326480
PMID:41165345
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研究论文 | 本研究揭示了YAP通过诱导糖酵解驱动心脏成纤维细胞的纤维炎症反应,并破坏其谱系保真性,从而促进心脏纤维化的机制 | 首次发现右心房成纤维细胞具有更高的糖酵解活性和YAP活性,并阐明了YAP通过激活糖酵解、诱导巨噬细胞扩增和IGF1信号通路,协同促进心脏纤维化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证有限,且未深入探讨其他心脏腔室特异性差异的临床意义 | 探究Hippo/YAP通路在心脏成纤维细胞代谢微环境调控及纤维炎症中的作用机制 | 心脏成纤维细胞、巨噬细胞、小鼠心脏组织、人类单核RNA测序数据 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序、单核ATAC测序、空间转录组学、代谢研究 | NA | 单细胞转录组数据、表观基因组数据、空间转录组数据、代谢数据 | 人类单核RNA测序数据及小鼠心脏组织样本 | NA | 单核RNA-seq, 单核ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 103 | 2025-12-06 |
Regenerative teeth induced by in vitro mesenchymal cells in mice via repressing BMP4 and activating retinoic acid/osteopontin
2025-Dec-05, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-025-00271-9
PMID:41345270
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研究论文 | 本研究开发了一种优化的N2B27培养基,能够在小鼠牙源性间充质细胞中维持长达14天的成牙潜能,并通过抑制BMP4信号和激活视黄酸/骨桥蛋白通路促进牙齿再生 | 开发了新型N2B27培养基,显著延长牙源性间充质细胞的体外成牙潜能维持时间,并揭示了BMP4抑制与骨桥蛋白/视黄酸激活在牙齿再生中的关键作用机制 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类细胞或临床环境中验证,且培养基优化可能不适用于所有牙源性细胞类型 | 探索维持牙源性间充质细胞体外成牙潜能的方法,以促进牙齿再生和组织工程应用 | 小鼠牙源性间充质细胞 | 组织工程与再生医学 | 牙齿缺失或牙科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量,但涉及小鼠牙源性间充质细胞的体外培养 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 104 | 2025-12-06 |
Single cell analysis identifies inflammatory and tissue remodeling tumor associated macrophages distinct from M1/M2 paradigm
2025-Dec-05, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiaf176
PMID:41347255
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析,识别了乳腺癌中与M1/M2范式不同的炎症和组织重塑肿瘤相关巨噬细胞亚群 | 发现了七个转录特征对应的TAM亚群,这些亚群与传统的M1/M2巨噬细胞极化分类不符,并揭示了它们与生存预后的关联 | 研究主要基于公开数据集,实验验证仅在小规模墨西哥患者队列中进行,可能受样本来源和数量限制 | 旨在更精确地描述乳腺癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性 | 乳腺癌患者和健康个体的血液、肿瘤及非肿瘤乳腺组织样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自公开数据集和墨西哥患者队列的样本,具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 105 | 2025-12-06 |
Resistance of endothelial cells to SARS-CoV-2 infection in vitro
2025-Dec-05, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01205-25
PMID:41347787
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研究论文 | 本研究通过体外实验和人类肺组织切片,证明了内皮细胞对SARS-CoV-2感染具有抵抗性 | 首次结合分离的内皮细胞培养物和活体人肺组织切片中的天然内皮细胞,利用单细胞RNA测序追踪病毒存在,系统性地证明了内皮细胞对SARS-CoV-2的直接感染性极低 | 研究主要在体外和离体组织中进行,体内环境的复杂性可能带来不同影响 | 重新评估内皮细胞对SARS-CoV-2的易感性,以阐明COVID-19血管并发症的机制 | 分离的内皮细胞(来自肺、主动脉和内皮祖细胞)、人肺组织切片中的天然内皮细胞、鼻上皮细胞 | 病毒学与细胞生物学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序、荧光成像、ELISA、RT-qPCR | NA | 基因表达数据、图像数据、蛋白质浓度数据 | 多种来源的内皮细胞及人肺组织切片 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 106 | 2025-12-06 |
Characteristics of cadmium's impact on lung cancer burden and its toxicological mechanisms
2025-Dec-05, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004439
PMID:41347937
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研究论文 | 本研究分析了镉对全球肺癌负担的影响特征及其毒理学机制 | 结合NHANES和GBD数据库分析镉与肺癌预后的关联及全球负担趋势,并利用网络毒理学和单细胞测序识别关键靶基因Bcl-2 | 研究基于观察性数据,可能存在未测量的混杂因素,且未来负担预测依赖于模型假设 | 评估镉暴露对肺癌负担的全球分布、趋势及毒理学机制,为公共卫生干预提供依据 | 肺癌患者及全球人群镉暴露数据 | 公共卫生与毒理学 | 肺癌 | 网络毒理学、单细胞测序、Kaplan-Meier分析、Cox回归、限制性立方样条曲线 | Cox回归模型、Nordpred预测模型 | 流行病学数据、基因表达数据 | 基于NHANES和GBD数据库的大规模人群数据 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 107 | 2025-12-06 |
Integrating multi-omics data to resolve patterns of ion channel regulation in melanoma and predict tumor treatment response
2025-Dec-05, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01866-x
PMID:41348242
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研究论文 | 本研究整合单细胞空间转录组和多组学数据,解析黑色素瘤中离子通道相关基因的调控模式,并预测肿瘤治疗反应 | 首次在黑色素瘤中系统评估离子通道相关基因的调控模式,构建ICRG评分系统以量化肿瘤特异性修饰模式,并利用空间转录组学验证CD8⁺ T细胞亚群与黑色素瘤细胞的共定位 | 研究可能受限于样本量或数据集的异质性,且ICRG评分系统需在更广泛的独立队列中进一步验证 | 解析黑色素瘤中离子通道相关基因的调控模式,以改善预后评估和治疗靶向策略 | 皮肤黑色素瘤样本及其肿瘤微环境细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞空间转录组学,多组学数据分析 | SCENIC分析,伪时间分析 | 单细胞空间转录组数据,多组学数据 | NA | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 108 | 2025-12-06 |
Human peripheral osteoclast-precursor-development patterns reveal the significance of RPS17-dependent ribosome synthesis to Ankylosing Spondylitis lesions
2025-Dec-04, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-025-00474-5
PMID:41345114
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了强直性脊柱炎(AS)患者外周血中破骨细胞前体(OCP)的发育模式及其紊乱机制,并发现RPS17依赖性核糖体合成在其中起关键作用 | 首次在AS患者外周血单核细胞中系统描绘了OCP的发育轨迹,并鉴定出RPS17依赖性核糖体合成是OCP发育的关键功能,同时证明了RPS17过表达的单核细胞OCP具有治疗AS外周病变的潜力 | 研究样本量相对有限,且主要基于外周血样本,未深入探究病变关节局部微环境的影响 | 阐明单核细胞向破骨细胞前体(OCP)的发育模式及其在强直性脊柱炎(AS)条件下的变化 | 健康供体和不同阶段(早期、加重期、缓解期)AS患者的外周血单个核细胞(PBMCs) | 单细胞转录组学 | 强直性脊柱炎 | 单细胞转录组测序 | 单细胞轨迹分析 | 单细胞RNA-seq数据 | 健康供体和AS患者(早期、加重期、缓解期)的外周血单个核细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 109 | 2025-12-06 |
In vivo CRISPR screen reveals regulation of macrophage states in neuroinflammation
2025-Dec-04, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-02151-6
PMID:41345278
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研究论文 | 本文建立了一种体内CRISPR筛选流程,用于解析多发性硬化症小鼠模型中巨噬细胞状态的调控机制 | 开发了一种基于可编辑祖细胞的体内CRISPR筛选方法,结合单细胞转录组学和生物传感器技术,实现了对巨噬细胞在神经炎症中调控的高分辨率分析 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本的验证可能有限,且筛选范围局限于100多个细胞因子受体和信号分子 | 探究巨噬细胞在神经炎症中的调控机制,特别是在多发性硬化症中的作用 | 小鼠模型中的巨噬细胞和中枢神经系统髓系细胞 | 单细胞组学 | 多发性硬化症 | CRISPR筛选,单细胞转录组学,Perturb-seq,生物传感器技术 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 110 | 2025-12-06 |
LIMD2 is associated with an exhausted CD8⁺ T cell state linked to ICI response in clear cell renal cell carcinoma
2025-Dec-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-27315-z
PMID:41345477
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研究论文 | 本研究探讨了LIMD2在透明细胞肾细胞癌中与CD8⁺ T细胞耗竭状态及免疫检查点抑制剂反应性的关联 | 首次将LIMD2鉴定为与CD8⁺ T细胞耗竭状态相关并与免疫检查点抑制剂反应性相关联的候选预测生物标志物 | 研究主要基于公开数据集和验证队列,可能需要进一步实验验证LIMD2的功能机制 | 阐明透明细胞肾细胞癌中CD8⁺ T细胞功能状态与免疫检查点抑制剂反应性的关系 | 透明细胞肾细胞癌患者中的肿瘤浸润CD8⁺ T细胞 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光 | NA | RNA测序数据, 单细胞转录组数据, 免疫荧光图像 | 六个公开数据集及独立机构验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 111 | 2025-12-06 |
Integrating single-cell RNA-Seq and machine learning to dissect a novel Palmitoylation-related prognostic signature of glioblastoma
2025-Dec-04, BMC neurology
IF:2.2Q3
DOI:10.1186/s12883-025-04551-4
PMID:41345585
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序与机器学习,揭示了胶质母细胞瘤中棕榈酰化的异质性,并构建了一个基于棕榈酰化相关基因的预后风险模型 | 首次在单细胞水平揭示了胶质母细胞瘤中棕榈酰化的异质性,并通过整合10种机器学习算法的101种组合筛选出三个核心预后基因 | NA | 探索基于棕榈酰化相关基因的胶质母细胞瘤预后生物标志物 | 胶质母细胞瘤 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 多种机器学习算法组合 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 112 | 2025-12-06 |
NEO1 modulates the A1 astrocyte polarization in subarachnoid hemorrhage through the cPLA2-MAVS signaling pathway
2025-Dec-04, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03643-9
PMID:41345945
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研究论文 | 本研究揭示了NEO1通过cPLA2-MAVS信号通路调控蛛网膜下腔出血后A1型星形胶质细胞极化的机制 | 首次发现NEO1在SAH后A1星形胶质细胞极化中的关键作用,并阐明其通过cPLA2-MAVS-NF-κB信号通路发挥功能的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证;体外实验使用原代星形胶质细胞,可能无法完全模拟体内复杂微环境 | 探究蛛网膜下腔出血后神经炎症的调控机制,寻找减轻神经炎症、促进神经功能恢复的治疗靶点 | 小鼠SAH模型、原代星形胶质细胞、星形胶质细胞特异性NEO1条件性敲除小鼠 | 神经科学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序、转录组测序、慢病毒载体过表达 | 条件性基因敲除小鼠模型、体外细胞模型 | 单细胞RNA测序数据、转录组测序数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及多组基因工程小鼠和细胞实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 113 | 2025-12-06 |
Integrated bulk and single-cell transcriptomics to develop an efferocytosis-related prognostic model for lung adenocarcinoma and validate the key gene LDHA
2025-Dec-04, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03622-z
PMID:41345972
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研究论文 | 本研究整合了批量转录组和单细胞转录组数据,构建了一个与胞葬作用相关的肺腺癌预后模型,并验证了关键基因LDHA的功能 | 首次整合批量与单细胞转录组数据,构建了基于胞葬作用相关基因的肺腺癌预后模型,并通过实验验证了LDHA基因在调控肿瘤相关巨噬细胞极化中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要进一步的前瞻性临床研究验证模型的预测效能 | 识别与肺腺癌预后相关的胞葬作用基因,并探索潜在的治疗靶点 | 肺腺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | LASSO-Cox回归模型 | 基因表达数据 | 来自UCSC Xena和GEO数据库的肺腺癌相关数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 114 | 2025-12-06 |
CD33 drives cutaneous melanoma: mendelian randomization confirms causality, multi-omics and in vitro experiments reveal M2 macrophage polarization-mediated progression
2025-Dec-04, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004100
PMID:41346267
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化、多组学分析和体外实验,揭示了CD33通过促进M2巨噬细胞极化驱动皮肤黑色素瘤发展的因果机制 | 首次整合孟德尔随机化、多组学转录组分析和体外实验验证,确认CD33与皮肤黑色素瘤的因果关系,并阐明其通过M2巨噬细胞极化介导肿瘤进展的新机制 | 研究主要基于观察性数据和体外实验,缺乏体内动物模型验证;样本主要来自欧洲人群,可能存在人群特异性限制 | 探索皮肤黑色素瘤的新型治疗靶点,改善患者预后和治疗效果 | 皮肤黑色素瘤患者样本、免疫细胞特征、CD33基因表达 | 生物信息学 | 皮肤黑色素瘤 | 孟德尔随机化、多组学转录组分析、单细胞转录组测序、体外细胞实验 | NA | 基因组数据、转录组数据、单细胞转录组数据、蛋白质定量性状位点数据 | FinnGen队列:皮肤黑色素瘤3194例/对照314193例,原位黑色素瘤980例/对照313899例,葡萄膜黑色素瘤293例/对照345118例;免疫细胞特征GWAS数据N=3757 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 115 | 2025-12-06 |
Microbial-triggered integrated stress response in sulcular and junctional keratinocytes exacerbates immunopathology in periodontitis
2025-Dec-03, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115965
PMID:41343941
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研究论文 | 本研究通过整合结构免疫理论、单细胞转录组学和多组学分析,揭示了牙周炎中微生物触发的整合应激反应在龈沟和结合上皮角质形成细胞中的作用及其加剧免疫病理的机制 | 首次将结构免疫理论与单细胞及多组学技术结合,系统阐明了牙周炎中龈沟和结合上皮角质形成细胞通过整合应激反应介导的结构免疫轴,驱动免疫微环境重塑和牙槽骨破坏的新机制 | 研究主要基于转录组学分析,缺乏蛋白质水平的功能验证;实验验证主要针对P. gingivalis感染,未涵盖牙菌斑中其他微生物的潜在影响 | 探究牙周炎中微生物-上皮-免疫细胞互作的分子机制,特别是整合应激反应在免疫病理中的作用 | 牙周炎患者的龈沟和结合上皮角质形成细胞、免疫细胞(如浆细胞和中性粒细胞)以及P. gingivalis微生物 | 数字病理 | 牙周炎 | 单细胞转录组学、多组学分析、加权基因共表达网络分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 116 | 2025-12-06 |
Loss of GNB2L1 promotes expansion of CD74+ dendritic cells and contributes to development of diabetic foot ulcers
2025-Dec-03, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2025.12.003
PMID:41344082
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现,GNB2L1缺失通过促进CD74+树突状细胞扩增并导致线粒体损伤,从而促进糖尿病足溃疡的发生发展 | 首次在糖尿病足溃疡中通过单细胞RNA测序鉴定出CD74+树突状细胞亚群,并揭示了GNB2L1通过调控线粒体功能影响该细胞亚群扩增的新机制 | 样本量相对较小(临床样本66例,动物模型使用db/db小鼠),且机制研究主要在细胞水平进行验证 | 探究GNB2L1在糖尿病足溃疡发生发展中的作用机制 | 糖尿病足溃疡患者皮肤组织、血液样本及db/db小鼠伤口模型 | 单细胞组学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据、临床样本 | 3例非DFU糖尿病患者+4例DFU患者(单细胞数据),36例DFU患者+30例非DFU糖尿病患者(临床验证),db/db小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 117 | 2025-12-06 |
Multi-omics analysis unveils tumor heterogeneity and immunotherapy predictive model in breast cancer for precision medicine and early detection
2025-Dec-03, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2025.101260
PMID:41344266
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和bulk RNA-seq反卷积,揭示了乳腺癌的肿瘤异质性,并开发了一个用于预测免疫治疗反应和患者生存的稳健预后模型 | 首次将单细胞RNA测序、空间转录组学和bulk RNA-seq反卷积相结合,系统描绘了乳腺癌的肿瘤亚群,并聚焦于基底样乳腺癌细胞在免疫逃逸和治疗抵抗中的核心作用,开发了基于CoxBoost+GBM算法的预后预测模型 | 研究主要依赖于公共数据库(TCGA和GEO)的回顾性数据,缺乏前瞻性临床队列的验证;模型在更广泛人群中的普适性有待进一步证实 | 阐明乳腺癌的肿瘤异质性及其对治疗抵抗和免疫逃逸的影响,开发精准的预后和免疫治疗预测工具 | 乳腺癌肿瘤组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk RNA-seq, 数据反卷积 | CoxBoost, GBM | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 整合了TCGA和GEO队列的数据,具体样本数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 118 | 2025-12-06 |
Eed controls craniofacial osteoblast differentiation and mesenchymal proliferation from the neural crest
2025-Dec-02, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.100159
PMID:41329158
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研究论文 | 本研究探讨了PRC2核心亚基Eed在神经嵴诱导后对颅面成骨细胞分化和间充质增殖的调控作用 | 通过整合小鼠遗传学、单细胞RNA测序和表观遗传分析,揭示了Eed在神经嵴细胞诱导后通过表观遗传调控转录因子程序驱动间充质分化和增殖的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,对人类罕见先天性综合征的直接应用仍需进一步验证 | 探究PRC2在神经嵴诱导后的胚胎、细胞和分子层面的功能 | 小鼠神经嵴细胞、颅面成骨细胞和间充质细胞 | 发育生物学 | 先天性颅面畸形 | 单细胞RNA测序、表观遗传分析 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 119 | 2025-12-06 |
Single-cell profiling reveals a shared proinflammatory macrophage signature across multiple organs in myopia
2025-Dec-02, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-025-00835-8
PMID:41330940
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了近视小鼠多个器官中巨噬细胞的促炎表型及其与缺氧通路的关联,并发现近视与多种眼外疾病存在相关性 | 首次在近视模型中构建跨器官(眼、脑、血、骨髓等11种组织)的单细胞转录组图谱,发现巨噬细胞在多个组织中呈现一致的促炎表型,并验证了缺氧通路在其中的调控作用及临床相关性 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证仅限于血液标志物;眼外疾病与近视的因果关系尚未完全阐明 | 探究近视发展过程中跨器官免疫通讯的机制及其与全身性疾病的关系 | 近视小鼠模型(涵盖眼、脑、血液、骨髓、脾脏等11种组织)及114,661例人类患者队列 | 数字病理学 | 近视 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据、临床队列数据 | 小鼠多组织单细胞数据 + 114,661例患者临床数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 120 | 2025-12-06 |
Pan-cancer gene set discovery via scRNA-seq for optimal deep learning based downstream tasks
2025-Dec-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-27296-z
PMID:41330999
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研究论文 | 本研究提出了一种通过整合scRNA-seq数据和高级分析技术来优化癌症基因组学特征选择的方法,用于提升癌症下游任务的预测准确性 | 利用scRNA-seq数据衍生的基因集在泛癌下游任务中优于基于bulk RNA-seq选择的基因集,并整合hdWGCNA和XGBoost进行特征选择 | NA | 优化泛癌研究中的特征选择,以提升下游机器学习任务的性能 | 13种癌症类型的181个肿瘤活检样本的scRNA-seq数据,以及TCGA泛癌RNA-seq数据 | 机器学习 | 泛癌 | scRNA-seq, bulk RNA-seq | 多层感知器(MLPs), 图神经网络(GNNs), XGBoost | 转录组测序数据 | 181个肿瘤活检样本(来自13种癌症类型) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |