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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-03-19 |
Spatial immune hubs defined by conserved activated dendritic cells are remodeled by immunotherapy
2026-Feb-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.10.703136
PMID:41726948
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研究论文 | 本研究通过整合跨物种的单细胞转录组数据和空间成像技术,揭示了肿瘤微环境中树突状细胞的保守激活状态及其空间组织,并展示了免疫疗法如何重塑这些细胞的空间生态位 | 首次构建了跨物种(小鼠和人类)的肿瘤浸润树突状细胞整合图谱,结合单细胞转录组学和空间多组学成像技术,揭示了两种保守的DC激活状态(CCR7 DCs和ISG DCs)及其在肿瘤微环境中的空间组织模式,并发现免疫疗法能重塑这些DC-T细胞生态位而无需改变DC的转录状态 | 研究主要基于已发表数据集和新生成的小鼠模型数据,人类样本的空间转录组分析可能受样本量限制;免疫疗法重塑机制的具体分子通路尚未完全阐明 | 阐明肿瘤微环境中树突状细胞的表型多样性、空间动态及其在免疫治疗中的重塑机制 | 小鼠肿瘤模型和人类癌症数据集中的肿瘤浸润树突状细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞转录组测序, 空间转录组学, 多重组织成像 | NA | 转录组数据, 空间成像数据 | 12项小鼠肿瘤研究 + 28个已发表人类癌症数据集 + 新生成的小鼠模型数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 102 | 2026-02-11 |
Mitochondrial DNA methylation predicts immunotherapy response and prognosis in lung adenocarcinoma: evidence from scRNA-Seq and machine learning
2026-Feb-10, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-15648-5
PMID:41663976
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 103 | 2026-02-12 |
Integrating single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq to identify hub pathways and diagnostic biomarkers in active pulmonary tuberculosis
2026-Feb-10, BMC infectious diseases
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12879-026-12805-w
PMID:41667975
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 104 | 2026-03-19 |
A novel integrative machine learning-based prognostic model reveals lactylation regulation in hepatocellular carcinoma progression
2026-Feb-10, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-026-04203-8
PMID:41668073
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研究论文 | 本研究构建了一个基于乳酸化相关代谢基因的预后模型,用于预测肝细胞癌的进展和治疗效果 | 首次开发了一个整合机器学习框架的代谢相关乳酸化指数(MRLI),并验证其在多个独立队列中的预后准确性,揭示了乳酸化在肿瘤微环境重塑中的作用 | 研究主要基于公共数据集和体外实验,需要进一步在更大规模的临床队列中进行验证 | 构建肝细胞癌的预后预测模型,并探索乳酸化在肿瘤进展中的调控机制 | 肝细胞癌(HCC)患者 | 机器学习 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 蛋白质组学, 单细胞分析, 空间转录组学 | 整合机器学习框架 | RNA-seq数据, 蛋白质组学数据, 单细胞数据, 空间转录组学数据 | 四个独立HCC队列,包括40个HCC样本的验证队列 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 105 | 2026-03-19 |
ICE: robust detection of cellular senescence from weak single-cell signatures using imputation-based marker refinement
2026-Feb-10, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-03997-0
PMID:41668152
|
研究论文 | 本文提出了一种名为ICE的计算框架,用于从单细胞RNA-seq数据中稳健检测衰老细胞 | 通过整合表达插补与标记物精炼,ICE能够改进对弱信号标记物的检测,从而更准确地识别衰老细胞 | 未在摘要中明确提及具体限制 | 开发一种计算工具以改善从单细胞RNA-seq数据中检测衰老细胞的准确性 | 胰腺β细胞和阿尔茨海默病样本中的小胶质细胞 | 自然语言处理 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 106 | 2026-03-19 |
Aerobic exercise facilitates p300 nuclear translocation via ADRB2-AMPKα signaling, leading to enhanced histone acetylation and mitigation of cognitive decline in APP/PS1 mice
2026-Feb-10, Alzheimer's research & therapy
DOI:10.1186/s13195-026-01983-z
PMID:41668187
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研究论文 | 本研究通过流行病学分析、孟德尔随机化和动物实验,揭示了有氧运动通过ADRB2-AMPKα-p300信号轴促进组蛋白乙酰化,从而缓解APP/PS1小鼠认知衰退的分子机制 | 首次发现ADRB2-p-AMPKα-p300轴在有氧运动诱导的神经保护中的作用,并阐明其通过促进p300核转位和组蛋白乙酰化来调控突触基因转录 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本的机制验证有限;AMPK抑制实验可能影响其他通路 | 探究有氧运动改善阿尔茨海默病认知功能的分子机制 | NHANES队列人类参与者、GEO数据集AD患者、APP/PS1转基因小鼠 | 表观遗传学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序、转录组分析、孟德尔随机化、行为测试、病理检查 | 动物模型(小鼠) | 基因表达数据、行为数据、病理图像 | 1,511名NHANES参与者、GEO数据集样本、APP/PS1小鼠(数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 107 | 2026-03-19 |
Single-cell RNA sequencing reveals multiple pathways involving pulmonary immune and epithelial cells through which aryl hydrocarbon receptor activation attenuates acute respiratory distress syndrome
2026-Feb-09, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf295
PMID:41182312
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了芳烃受体激活通过影响肺免疫和上皮细胞中的多个通路来减轻急性呼吸窘迫综合征 | 首次使用单细胞RNA测序技术全面解析芳烃受体激活在ARDS中对多种肺细胞类型转录组的影响,并识别出关键的下调通路如前列腺素信号和中性粒细胞趋化 | 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;且仅使用LPS诱导的ARDS模型,未涵盖其他病因如COVID-19直接验证 | 探究芳烃受体激活对LPS诱导的急性呼吸窘迫综合征的保护作用机制 | LPS诱导的ARDS小鼠模型中的肺组织细胞 | 数字病理学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量,但涉及小鼠肺组织的16个转录不同细胞簇 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 108 | 2026-03-19 |
DANST enables cell-type deconvolution in spatial transcriptomics using deep domain adversarial neural networks
2026-Feb-09, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09659-y
PMID:41663685
|
研究论文 | 本文提出了一种基于深度域对抗神经网络的细胞类型反卷积框架DANST,用于从空间转录组学数据中恢复细胞类型比例 | 首次将深度域对抗神经网络应用于空间转录组学反卷积,通过变分自编码器学习精细特征表示,并利用域对抗架构对齐伪空间数据与真实数据的特征分布 | NA | 开发高精度的空间转录组学细胞类型反卷积方法 | 人类和小鼠的空间转录组学数据 | 空间转录组学 | 肿瘤微环境分析 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间转录组学 | 深度域对抗神经网络,变分自编码器(VAE) | 基因表达数据,空间坐标数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 109 | 2026-03-19 |
GeoMx and RNAscope: A Comparative Assessment of Their Utility for Spatial mRNA Expression Profiling in Formalin-Fixed Breast Cancer Tissue
2026-Feb, Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology
DOI:10.1002/cyto.a.70020
PMID:41795633
|
研究论文 | 本研究比较了GeoMx Digital Spatial Profiler和RNAscope在福尔马林固定乳腺癌组织中进行空间mRNA表达谱分析的效用 | 首次系统比较了高复用空间转录组学技术GeoMx与成熟原位杂交方法RNAscope在乳腺癌组织中的定量表达评估 | PD-L1表达仅在一个样本中较高,无法进行相关性分析,且样本量相对有限 | 评估和比较两种空间mRNA表达分析技术在福尔马林固定乳腺癌组织中的性能 | 乳腺癌组织微阵列(TMA),包含三阴性乳腺癌(n=48)和不同ER/HER2状态乳腺癌(n=45) | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学,mRNA原位杂交 | NA | 空间mRNA表达数据 | 93个乳腺癌组织核心(来自两个TMA) | NanoString, ACD Bio | 空间转录组学,mRNA原位杂交 | GeoMx Digital Spatial Profiler,RNAscope | GeoMx Cancer Transcriptomics Atlas(覆盖约1,800个基因),RNAscope探针(针对GATA3、SOX10和PD-L1 mRNA) |
| 110 | 2026-03-19 |
Deletion of hepatic growth hormone receptor contributes to the pathogenesis of lean MAFLD by elevating CD36
2026-Feb, Life metabolism
DOI:10.1093/lifemeta/loaf037
PMID:41847434
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研究论文 | 本研究通过构建肝脏特异性生长激素受体敲除小鼠模型,揭示了肝GHR缺失通过上调CD36表达驱动非肥胖型MAFLD的发病机制,并利用单细胞RNA测序和人类遗传学分析验证了GH-IGF信号通路与MAFLD风险的因果关系 | 首次建立能准确模拟非肥胖型MAFLD的肝脏特异性GHR敲除小鼠模型,并通过单细胞测序揭示肝细胞特异性转录改变,结合孟德尔随机化等人类遗传学方法验证机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限;未深入探讨CD36上游调控机制 | 阐明肝脏生长激素受体在非肥胖型代谢功能障碍相关脂肪肝病发病中的作用机制 | 肝脏特异性GHR敲除小鼠模型、人类遗传数据 | 单细胞组学与代谢疾病研究 | 代谢功能障碍相关脂肪肝病 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化分析、全基因组关联研究、动物模型构建 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据、人类遗传数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 111 | 2026-03-19 |
ASB5 is a specific marker for muscle satellite cells but dispensable for skeletal muscle development and regeneration
2026-Jan-19, Skeletal muscle
IF:5.3Q2
DOI:10.1186/s13395-025-00409-y
PMID:41549311
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现ASB5是肌肉卫星细胞的特异性标记物,但通过基因敲除小鼠模型证实ASB5对骨骼肌发育和再生并非必需 | 首次通过单细胞RNA测序数据鉴定ASB5为肌肉卫星细胞特异性标记物,并系统评估了其在肌肉发育和再生中的功能 | 研究仅在正常生理条件下评估ASB5功能,未探索其在疾病或应激状态下的作用 | 鉴定新的肌肉卫星细胞分子标记物并阐明其在肌肉发育和再生中的功能 | 小鼠肌肉卫星细胞和骨骼肌组织 | 单细胞组学 | 肌肉疾病 | 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9基因编辑, 实时荧光定量PCR | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | 未明确样本数量,使用公共数据集Tabula Muris和GSE150366 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 112 | 2026-03-19 |
Whole genome sequence analysis of pulmonary function and COPD in 44,287 multi-ancestry participants
2026-Jan-15, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03921-y
PMID:41535900
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研究论文 | 本研究通过全基因组测序分析,在44,287名多族裔参与者中探索了肺功能和慢性阻塞性肺病的遗传关联 | 利用多族裔样本的全基因组测序数据,发现了与肺功能和COPD相关的低频或群体特异性遗传变异,并通过单细胞RNA-seq数据验证了候选基因的细胞类型特异性表达 | 研究可能受限于样本的多样性和规模,且功能验证主要在细胞系中进行,需进一步在体内模型确认 | 识别与肺功能和慢性阻塞性肺病相关的遗传变异,并提高精细定位的分辨率 | 44,287名多族裔参与者,包括肺功能测量和COPD病例对照状态 | 基因组学 | 慢性阻塞性肺病 | 全基因组测序,单细胞RNA-seq,CRISPR靶向 | NA | 基因组序列数据,基因表达数据 | 44,287名多族裔参与者 | NA | 全基因组测序,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 113 | 2026-03-19 |
Screening Co-Diagnostic Genes for Lung Adenocarcinoma and Myocardial Infarction and Analysis of the Molecular Functions and Drug Value of the Genes
2026, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析筛选了肺腺癌和心肌梗死的共同诊断基因,并分析了其分子功能和药物价值 | 首次将肺腺癌和心肌梗死两种疾病联系起来,通过多步骤生物信息学方法筛选出共同诊断基因MMP9,并揭示了其在炎症和免疫调节中的作用 | 研究主要基于公开数据库的转录组数据,缺乏实验验证,且样本来源可能存在异质性 | 发现肺腺癌和心肌梗死的共同诊断基因,分析其分子功能和潜在药物价值 | 肺腺癌和心肌梗死患者的基因表达数据 | 生物信息学 | 肺癌,心血管疾病 | 差异表达分析,WGCNA分析,功能富集分析,PPI网络分析,机器学习方法(LASSO,SVM-RFE),免疫浸润分析,药物预测,分子对接分析,单细胞测序分析 | LASSO,SVM-RFE | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 114 | 2026-03-19 |
Network toxicology and machine learning reveal the impact of acetyl tributyl citrate on erectile dysfunction and identify cathepsin S as a critical regulator
2026-01, Reproductive toxicology (Elmsford, N.Y.)
DOI:10.1016/j.reprotox.2025.109101
PMID:41187890
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研究论文 | 本研究利用网络毒理学和机器学习方法,探讨了乙酰柠檬酸三丁酯对勃起功能障碍的影响,并确定了组织蛋白酶S作为关键调控因子 | 首次结合网络毒理学、单细胞测序和多种机器学习算法,系统性地揭示了ATBC通过调控CTSS表达影响内皮功能并导致ED的分子机制 | 研究主要基于计算分析和体外实验,缺乏体内动物模型或临床样本的验证,且环境暴露的剂量效应关系未充分探讨 | 探究环境内分泌干扰物ATBC在勃起功能障碍中的具体作用和分子机制 | 乙酰柠檬酸三丁酯、勃起功能障碍、阴茎海绵体组织、内皮细胞 | 机器学习 | 勃起功能障碍 | 单细胞测序、分子对接、网络毒理学、富集分析 | 多种机器学习算法(未具体说明类型) | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 115 | 2026-03-19 |
Integrated Multiomics Analysis Reveals a Migrasome-Related Signature for Prognosis and Immunotherapy Response in Lung Adenocarcinoma
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/8778797
PMID:41523912
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据,揭示了迁移体相关基因在肺腺癌中的特征,并构建了一个预后和免疫治疗响应的预测模型 | 首次在肺腺癌中系统性地表征迁移体相关分子特征,并构建了首个基于迁移体的预后模型,为肿瘤-免疫相互作用提供了新的生物学见解 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证;模型在独立验证集中的AUC值(0.678)仍有提升空间 | 解析迁移体在肺腺癌中的分子特征及其临床意义,开发预后和免疫治疗响应的预测工具 | 肺腺癌(LUAD)患者样本 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 多组学整合分析,包括bulk转录组、单细胞RNA-seq、WGCNA、差异表达分析、机器学习 | Lasso-Cox回归模型,结合10种算法的机器学习框架 | 转录组数据(bulk和单细胞RNA-seq) | 541个LUAD样本(来自TCGA/GEO),加上单细胞RNA-seq数据集GSE156632 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 116 | 2026-03-19 |
Interrogation of imaging-based interspecies dynamics in the oral microbiome
2026, Journal of oral microbiology
IF:3.7Q2
DOI:10.1080/20002297.2026.2640344
PMID:41816705
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综述 | 本文综述了基于成像技术研究口腔微生物群落中物种间和界间关系的空间生物地理学,重点关注这些相互作用以及与健康和疾病相关的功能/代谢变化 | 整合实时成像、分辨率增强方法、空间多组学和AI辅助分析,以提供对口腔微生物群动态和功能的更全面理解 | AI生成的预测和基于成像的观察数据存在局限性 | 研究口腔微生物群落中物种间和界间关系的空间生物地理学及其与健康和疾病的关联 | 口腔微生物群落 | 数字病理学 | NA | 成像技术、多组学分析、AI驱动方法 | NA | 成像数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 117 | 2026-03-19 |
Multi-omics analysis identifies CCNB1 as a cell cycle factor driving glioblastoma progression and its inhibition by resveratrol
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0344872
PMID:41838760
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研究论文 | 本研究通过多组学分析发现CCNB1是驱动胶质母细胞瘤进展的关键细胞周期因子,并揭示了白藜芦醇通过抑制CCNB1及其相互作用基因PLK1来抑制肿瘤生长的潜在治疗策略 | 首次整合单细胞转录组、空间转录组和功能实验,系统阐明CCNB1在GBM中的促癌作用及白藜芦醇的靶向抑制机制 | 研究主要基于体外和动物模型,临床转化效果需进一步验证;白藜芦醇的具体作用靶点和药代动力学特性未深入探讨 | 探究细胞周期因子CCNB1在胶质母细胞瘤进展中的作用及靶向治疗策略 | 胶质母细胞瘤组织样本、肿瘤细胞系、动物模型 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学分析 | NA | 转录组数据、蛋白质表达数据、空间基因表达数据 | 未明确样本数量,包含GBM组织与正常组织对比、患者预后数据、体外细胞实验及体内动物实验 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 118 | 2026-03-19 |
Increased expression of CD36 and CD163 in clear cell renal cell carcinoma suggests an association between lipid transport and an "M2-like" macrophage phenotype
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1773666
PMID:41846920
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研究论文 | 本研究探讨了透明细胞肾细胞癌中脂质转运蛋白CD36和代谢调节因子CD147的表达与M2样巨噬细胞表型之间的关联 | 首次在ccRCC中揭示了CD36和CD147与M2样巨噬细胞表型及脂质积累的关联,并提出了代谢-免疫轴的概念 | 样本量较小(n=23),部分分析基于有限样本(如脂质组学n=5),且为观察性研究,因果关系需进一步验证 | 探究ccRCC中脂质代谢标志物与肿瘤相关巨噬细胞表型之间的关联及其对肿瘤免疫的影响 | 透明细胞肾细胞癌患者肿瘤样本 | 数字病理学 | 肾癌 | 免疫组织化学、流式细胞术、脂质组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 组织样本、RNA表达数据、单细胞RNA测序数据 | 23例ccRCC患者样本,5例用于脂质组学,TCGA数据集中533例用于验证 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 119 | 2026-03-19 |
Occupational silica exposure drives systemic immune dysregulation and tumor microenvironment susceptibility: evidence from a real-world study
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1775236
PMID:41846924
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研究论文 | 本研究通过整合机器学习、实验验证和多组学分析,揭示了职业性二氧化硅暴露通过巨噬细胞驱动的炎症信号促进早期癌胚抗原升高和肿瘤微环境重塑的分子机制 | 结合可解释机器学习模型(CatBoost)与SHAP值分析、体外实验验证以及单细胞RNA测序分析,构建了一个从职业暴露到肿瘤微环境变化的综合研究框架 | 研究基于特定地区(安徽省)的工业工人队列,可能限制了结果的普适性;体外实验使用THP-1单核细胞系,可能与体内巨噬细胞存在差异 | 探究职业性二氧化硅暴露如何通过免疫失调和肿瘤微环境变化增加癌症风险 | 5,482名安徽省工业工人(职业健康数据)、THP-1单核细胞系、结直肠癌细胞系、公共数据库(TCGA、GSE39582)的基因表达数据 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析、多组学整合分析 | CatBoost(机器学习算法) | 职业健康数据、血液免疫参数、基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 5,482名工业工人 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 120 | 2026-03-19 |
Macrophage-derived CCL20 promotes abdominal aortic aneurysm progression via lymphocytes CCR6
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1780720
PMID:41846931
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研究论文 | 本研究探讨了巨噬细胞来源的CCL20通过CCR6促进淋巴细胞募集,从而加剧腹主动脉瘤进展的机制 | 首次在腹主动脉瘤中系统揭示了CCL20-CCR6轴在巨噬细胞介导的免疫细胞招募和疾病进展中的关键作用,并提出了其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,在人体中的直接验证尚需进一步临床研究 | 阐明CCL20-CCR6轴在腹主动脉瘤形成和发展中的作用机制 | 腹主动脉瘤相关的免疫细胞(特别是巨噬细胞和淋巴细胞)及小鼠模型 | 单细胞组学与血管疾病研究 | 腹主动脉瘤 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,酶联免疫吸附试验,免疫荧光染色,CellChat分析 | 小鼠疾病模型 | 单细胞转录组数据,批量转录组数据,蛋白质检测数据,临床数据库数据 | 未明确具体样本数量,但使用了公开单细胞RNA测序数据集、bulk RNA测序数据集和UK Biobank数据库 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |