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当前共找到 39285 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-05-09 |
SpaTRACE: Spatiotemporal recurrent auto-encoder for reconstructing signaling and regulatory networks from spatiotemporal transcriptomics data
2026-Apr-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.20.689569
PMID:42039614
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研究论文 | 提出SpaTRACE框架，从空间转录组数据中联合推断细胞间信号传导和基因调控网络 | 利用时空递归自编码器同时重建转录因子-靶基因调控网络、配体-受体-靶基因信号通路及配体-受体结合关系，无需预定义配体-受体数据库 | 依赖伪时间轨迹采样，可能无法完全捕捉真实时间动态；模型复杂度高，需要较大数据集进行训练 | 从空间转录组数据中联合推断细胞间信号传导和基因调控网络，捕捉发育和再生过程中的动态调控机制 | 小鼠中脑发育和蝾螈脑再生过程中的空间转录组数据 | 计算机视觉, 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 自编码器, 注意力机制 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 102 | 2026-05-09 |
A Mouthful of Genomic Data: Single-Cell Insights into Salivary Gland Biology and Disease
2026-Apr-18, Biology
DOI:10.3390/biology15080641
PMID:42041920
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综述 | 综述单细胞RNA测序在唾液腺生物学与疾病研究中的应用，总结主要发现、局限性及方法学考虑 | 系统整合了唾液腺scRNA-seq研究的最新进展，聚焦于细胞类型发现、分子机制及数据质量问题 | 数据处理不一致和实验方法报告不完整影响可重复性，限制高质量数据集的识别 | 总结scRNA-seq在唾液腺研究中的发现，指导未来研究 | 唾液腺（大唾液腺和小唾液腺） | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 103 | 2026-05-09 |
Histotripsy-Initiated Immune Response Synergizes with Chemotherapy in a Neuroblastoma Murine Model
2026-Apr-15, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18081249
PMID:42073574
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研究论文 | 本研究探讨了组织切除术在神经母细胞瘤小鼠模型中诱导的免疫反应如何与化疗协同作用 | 首次展示了无创聚焦超声组织切除术通过机械性气泡云作用诱导系统性抗肿瘤免疫反应，增强化疗对转移性神经母细胞瘤的疗效 | 未提供具体局限性信息 | 验证组织切除术诱导的肿瘤微环境变化能否改善转移性神经母细胞瘤对化疗的应答 | 雌性A/J小鼠双侧胁部接种Neuro-2a细胞建立神经母细胞瘤模型 | 机器学习 | 神经母细胞瘤 | 组织切除术，单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 30只小鼠双侧肿瘤（单侧治疗），每组5-7天后评估 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 未提供具体平台配置信息 |
| 104 | 2026-05-09 |
Benchmarking scRNA-seq Copy Number Inference: A Comprehensive Evaluation and Practitioner's Guide
2026-Apr-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.12.718050
PMID:42039587
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研究论文 | 对12种从单细胞RNA测序数据推断拷贝数变异的方法在28个真实数据集和多种合成数据集上进行了全面基准测试，提供实践指南 | 首次对12种CNV推断方法进行大规模系统基准测试，覆盖超过10万个细胞，建立了基于恶性细胞分类准确性、CNV推断准确性、可扩展性和鲁棒性的综合评估框架，并提供标准化CNV档案公共资源库 | 基准测试主要依赖现有数据集和合成数据，可能未完全涵盖所有实际应用场景；部分方法的性能高度依赖于原始测序数据可用性和等位基因推断质量 | 系统评估单细胞RNA测序数据的拷贝数变异推断方法，为研究人员提供实践决策指南 | 12种CNV推断方法（包括Numbat、Clonalscope、CopyKAT、inferCNV、SCEVAN等） | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、等位基因数据 | 28个真实数据集（超过10万个细胞）及多种合成数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 105 | 2026-04-18 |
Sphingosine-1-Phosphate-derived 2-Hexadecenal is a central mediator of ocular neovascularization by inhibiting Sphingosine-1-Phosphate receptor 5
2026-04-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71792-3
PMID:41980976
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研究论文 | 本文揭示了S1P代谢产物2-HD通过抑制S1PR5破坏铁稳态并诱导铁死亡，从而在视网膜血管异常中发挥关键作用 | 首次发现S1P衍生的2-HD在血管功能中的作用，并揭示其通过直接与S1PR5相互作用诱导铁死亡的新机制 | 研究主要基于斑马鱼模型和体外分析，人类样本验证有限，且未深入探讨其他S1PRs在过程中的潜在作用 | 探究S1P代谢产物2-HD在血管生成和视网膜血管疾病中的功能及机制 | 斑马鱼视网膜血管、人类新生血管视网膜样本 | 分子生物学 | 糖尿病视网膜病变 | 多组学分析、单细胞RNA测序、RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | NA |
| 106 | 2026-05-09 |
Metabolic surgery mitigates early kidney injury in obese youth with diabetes by suppressing mTORC1/JAK/STAT signaling
2026-Apr-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI198545
PMID:41665972
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序等技术，探讨了代谢手术（袖状胃切除术）如何通过抑制mTORC1/JAK/STAT信号通路减轻肥胖青少年2型糖尿病患者的早期肾损伤 | 首次利用单细胞RNA测序结合循环蛋白质组学揭示代谢手术对青少年肥胖相关肾病的分子机制，特别是mTORC1/JAK/STAT信号通路的抑制作用 | 研究样本量较小（仅5例患者进行配对活检），且缺乏长期随访数据以验证肾损伤缓解的持久性 | 探索垂直袖状胃切除术对肥胖青少年2型糖尿病患者肾脏结构和分子变化的影响及其潜在机制 | 5名患有2型糖尿病和肥胖的青少年（IMPROVE-T2D队列），以及64名接受代谢手术的肥胖青少年（Teen-LABS队列） | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序, 循环蛋白质组学, 组织学评估 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组学数据, 临床代谢参数 | 5例配对肾活检样本（术前和术后12个月），64例独立队列的蛋白质组学样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 107 | 2026-05-09 |
Semi-parametric empirical bayes method for multiplet detection in snATAC-seq with probabilistic multi-omic integration
2026-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013653
PMID:42054434
|
研究论文 | 提出一种半参数经验贝叶斯方法SEBULA，用于snATAC-seq数据中的多细胞检测，并支持多模态证据整合 | 无需合成双细胞，直接从染色质可及性信号建模单细胞背景，实现假发现率控制；并扩展至多模态数据整合 | 标题与摘要未提及具体限制 | 开发高效的snATAC-seq多细胞检测方法 | snATAC-seq数据中的多细胞（双细胞） | 机器学习 | NA | snATAC-seq | 半参数经验贝叶斯模型 | 序列数据 | 多个多模态数据集与模拟数据 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 108 | 2026-05-09 |
Spatial multi-omics identifies a NOTCH3-mediated capillary-mCAF crosstalk driving immune exclusion in hepatocellular carcinoma
2026-Apr, iMeta
IF:23.7Q1
DOI:10.1002/imt2.70117
PMID:42099451
|
研究论文 | 通过空间多组学数据分析，发现NOTCH3介导的毛细血管-mCAF相互作用导致肝细胞癌免疫排斥 | 首次利用空间多组学结合泛癌单细胞测序数据，揭示NOTCH3信号通路在肝细胞癌中通过毛细血管与基质产生型癌相关成纤维细胞（mCAF）的相互作用，驱动免疫排斥微环境形成 | NA | 阐明肝细胞癌中纤维化介导的免疫排斥机制，探索NOTCH信号通路在癌相关成纤维细胞极化中的作用 | 肝细胞癌组织样本及小鼠模型 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 空间多组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 109 | 2026-05-09 |
Single-cell transcriptomics reveals cellular heterogeneity and phenotypic transitions of smooth muscle cells in aortic dissection
2026-Apr, iMeta
IF:23.7Q1
DOI:10.1002/imt2.70124
PMID:42099453
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 110 | 2026-05-09 |
IGSF9 drives malignant transformation and predicts early-stage lung adenocarcinoma in integrated transcriptomic analyses
2026-Mar-29, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04836-1
PMID:41904745
|
研究论文 | 通过整合转录组分析，发现IGSF9驱动恶性转化并可预测早期肺腺癌 | 首次发现IGSF9作为早期肺腺癌的诊断生物标志物，并揭示其在恶性转化中的多重作用，包括免疫逃逸、肿瘤细胞迁移和侵袭以及干细胞样AT2亚群向恶性状态的转化 | 未明确阐述研究样本数量、平台具体配置等细节，可能需要在更大规模队列中验证 | 阐明早期肺腺癌的分子机制并识别有效的诊断生物标志物 | 早期肺腺癌患者样本及肿瘤微环境中的肺泡细胞 | 机器学习和单细胞转录组学 | 肺腺癌 | scRNA-seq,机器学习 | 随机森林和LASSO | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 111 | 2026-03-28 |
Preterm birth skews the developmental trajectory of myeloid-derived suppressor cells in the first 48 hours of life: single-cell transcriptomics and inferred intercellular communication
2026-Mar-27, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-026-01459-8
PMID:41888646
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 112 | 2026-05-09 |
Analysis and validation of mast cells and enriched genes in colorectal cancer with liver metastasis by multi-omics data
2026-Mar-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04916-2
PMID:41894110
|
研究论文 | 通过多组学数据分析和验证结直肠癌肝转移中的肥大细胞及其富集基因的作用 | 首次结合批量测序和单细胞RNA测序数据，系统分析肥大细胞在结直肠癌肝转移中的比例变化，并构建基于三个富集基因（APOC1、SPP1、CLU）的预测模型 | 未明确提及样本来源或外部验证的局限性，可能缺少对不同亚型肥大细胞的深入功能验证 | 确定肥大细胞及富集基因在结直肠癌肝转移中的作用 | 结直肠癌患者的原发肿瘤和肝转移组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌、肝转移 | 批量测序、单细胞RNA测序、免疫组化 | 预测模型（基于基因表达） | 基因表达数据、组织样本图像 | 四个批量测序数据集共223个样本，一个单细胞RNA测序数据集，以及临床样本 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 113 | 2026-05-09 |
Transcriptional mechanisms of sex-biased gene expression and their connections to disease-associated variation
2026-Mar-23, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddag019
PMID:41934611
|
研究论文 | 利用单细胞RNA-seq分析480个淋巴母细胞系，发现1200个性别偏向表达基因及其与疾病关联的转录调控机制 | 首次大规模系统揭示性别偏向表达的转录调控机制，发现4个X染色体剂量调控的转录因子（FOSL1、ZNF730、ZFX、ZNF726）贡献了79%的性别偏向表达，并鉴定了2390个性别偏向eQTL及其在多种疾病中的富集 | 独立数据集的验证结果较为有限，且主要基于淋巴母细胞系数据，组织特异性验证仅部分覆盖 | 探究人类性别差异表达的转录调控机制及其与疾病遗传变异的关联 | 480个人类淋巴母细胞系（LCLs）以及来自GTEx项目的多种组织样本 | 机器学习 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA-seq | 线性模型 | 转录组 | 480个淋巴母细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 114 | 2026-03-23 |
crocketa: an automated Snakemake framework for integrated single-cell transcriptome and immune-repertoire analysis
2026-Mar-21, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-026-12767-y
PMID:41864892
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 115 | 2026-05-09 |
Spatial transcriptomics uncovers vasculature-centered cellular interactions driving Japanese encephalitis progression in a mouse model
2026-Mar-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70047-5
PMID:41844605
|
研究论文 | 利用空间转录组技术构建日本脑炎发病机制的综合时空图谱 | 首次同时原位捕获宿主和病毒转录组，构建日本脑炎发病的综合时空图谱，并揭示Ly6c2单核细胞和Ackr1内皮细胞在病毒传播和神经炎症中的关键作用 | 仅在小鼠模型中验证，需要进一步在人类样本中验证；未详细讨论其他细胞类型和信号的潜在贡献 | 研究日本脑炎病毒（JEV）感染引起的神经病理过程中的细胞互作机制 | 日本脑炎病毒感染的小鼠大脑 | 数字病理学 | 日本脑炎 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 雌性BALB/c小鼠，具体样本数量未提及 | 华大基因 | 空间转录组学 | Stereo-seq | Stereo-seq空间转录组技术 |
| 116 | 2026-05-09 |
A blueprint for local and distal invasion programs in glioblastoma
2026-Mar-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70470-8
PMID:41844611
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序、空间转录组学和多重复用成像技术，探讨胶质母细胞瘤的局部和远端侵袭程序 | 首次将单细胞RNA测序、空间转录组学和多重复用成像结合，系统解析胶质母细胞瘤的远端和局部侵袭潜力及其转录程序 | 研究主要基于异种移植小鼠模型，可能无法完全模拟人类胶质母细胞瘤的微环境 | 阐明胶质母细胞瘤侵袭的分子机制，区分侵袭潜力与侵袭过程相关的转录特征 | 20种患者来源的胶质瘤球体模型及小鼠原位异种移植模型 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多重复用成像 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、成像数据 | 20种患者来源的胶质瘤球体模型 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 117 | 2026-05-09 |
Multimodal imaging reveals a lysosomal drug reservoir that drives heterogeneous distribution of PARP inhibitors
2026-Mar-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70558-1
PMID:41844641
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研究论文 | 使用多模态成像揭示溶酶体药物储库导致PARP抑制剂在肿瘤内呈异质性分布 | 首次通过患者来源的外植体多模态成像管线，在单细胞水平上显示PARP抑制剂积累的高度异质性，并发现溶酶体作为弱碱性PARP抑制剂的药物储库影响核内药物浓度和疗效 | 未提及具体局限性 | 研究肿瘤异质性对药物分布和疗效的影响，特别是PARP抑制剂在高级别浆液性卵巢癌中的细胞内在积累差异 | 患者来源的外植体、高级别浆液性卵巢癌肿瘤组织 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 多模态成像、空间转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | 多个患者来源的外植体样本（具体数量未明确） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 118 | 2026-05-09 |
Local antibody feedback enforces a checkpoint on affinity maturation in the germinal center and promotes epitope spreading
2026-Mar-10, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2026.01.011
PMID:41690309
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研究论文 | 研究局部抗体反馈如何通过种系中心调节亲和力成熟并促进表位扩散 | 首次揭示局部表位特异性竞争通过抗体反馈回路直接影响种系中心反应，低亲和力B细胞在特定条件下比高亲和力B细胞更持久，并促进免疫反应向替代表位扩散 | 该研究基于小鼠模型，可能无法完全代表人类免疫系统的复杂性，且未深入探讨长期免疫记忆形成的影响 | 探究局部抗体反馈如何在种系中心中调控亲和力成熟的检查点并影响表位扩散 | 小鼠模型及携带特定亲和力B细胞受体的B细胞 | 机器学习 | 人类免疫缺陷病毒感染 | NA | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型，具体数量未提供 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 119 | 2026-05-09 |
Deep Learning Enabled 3D Multi-Omic Analysis Reveals Molecular Signatures of Heterogeneous Response to Chemotherapy in Pancreatic Cancer
2026-Mar-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.03.709150
PMID:41867770
|
研究论文 | 通过深度学习三维多组学分析揭示胰腺癌化疗异质性反应的分子特征 | 首次开发结合深度学习的三维分析流程，利用形态学特征自动分类敏感和持续性肿瘤细胞群体，并进行后续分子表征 | NA | 识别胰腺癌对化疗耐药的新机制 | 人类胰腺癌临床样本 | 计算机视觉 | 胰腺癌 | 空间蛋白质组学，空间转录组学 | 深度学习 | 图像 | 接受新辅助化疗的人类胰腺癌样本队列 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | NA |
| 120 | 2026-05-09 |
Acute Inflammation Drives Corneal Pathological Regeneration
2026-Mar-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.3.58
PMID:41910526
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序描绘急性炎症诱导的角膜病理再生过程中的转录组和表观遗传组图谱 | 首次提供炎症角膜的时间分辨单细胞转录组和表观遗传组综合图谱，揭示细胞类型特异性基因调控元件和顺式调控染色质相互作用 | 未明确说明局限性 | 表征急性炎症诱导的角膜转录组和表观遗传组重塑 | 脂多糖或PBS处理后第5天和第10天的角膜缘-角膜组织 | 数字病理学 | 角膜炎症性疾病 | scRNA-seq, scATAC-seq, 免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据 | 未明确说明样本量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序 |