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当前共找到 40432 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-06-13 |
Clu+ transitional alveolar epithelial cells promote lung injury repair and fibrosis progression
2026-Jun, British journal of pharmacology
IF:6.8Q1
DOI:10.1111/bph.70389
PMID:41797553
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序识别一种称为再生肺泡上皮细胞的中间亚群，该亚群在肺损伤后14天达到峰值，并在肺损伤修复和纤维化进展中发挥重要作用 | 首次鉴定出Clu+过渡性肺泡上皮细胞(RAEs)作为AT2和AT1细胞之间的中间状态，并揭示其通过与活化成纤维细胞相互作用调节细胞外基质分泌的机制 | 未提及具体研究局限性 | 研究过渡性细胞群在肺损伤炎症向纤维化进展过程中的作用 | 小鼠肺损伤模型和人类肺纤维化组织样本以及MRC-5细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、免疫印迹、苏木精-伊红染色、功能分析 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和人类肺纤维化组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 102 | 2026-06-13 |
Expression of CD25 in human lung mast cells and its regulation by IL-33
2026-Jun, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.03.003
PMID:41825599
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研究论文 | 研究IL-33对纯化的人肺肥大细胞中CD25表达的调控作用 | 首次揭示IL-33通过诱导CD25和CD132表达但不上调CD122，导致肥大细胞虽增强IL-2结合但缺乏IL-2介导的信号传导 | 仅关注IL-33对CD25的调控，未探讨其他可能调控因子；单细胞测序数据来自公开数据集，可能不完全匹配实验条件 | 探究IL-33对人肺肥大细胞中CD25表达的调控机制 | 纯化的人肺肥大细胞 | 机器学习 | 肺癌 | RNA测序, 实时定量PCR, 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据, 文本 | 多个纯化的人肺肥大细胞样本，具体数量未报告 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 103 | 2026-06-13 |
Single-cell transcriptomics reveals heterogeneity and immune microenvironment in lymphatic metastasis of head and neck squamous cell carcinoma
2026-Jun, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-026-00392-4
PMID:41839993
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析头颈部鳞状细胞癌淋巴转移中的异质性和免疫微环境 | 首次对头颈部鳞状细胞癌的淋巴结转移组织和正常淋巴结组织进行单细胞RNA测序比较分析，并构建了基于INHBA、SFRP2、SPP1和IFI27表达的预后模型 | 仅涉及7个淋巴结转移组织和5个非转移组织样本，样本量有限 | 研究头颈部鳞状细胞癌淋巴转移的细胞异质性和免疫微环境，并构建预后模型 | 头颈部鳞状细胞癌患者的淋巴结转移组织和正常淋巴结组织 | 机器学习 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 预后模型 | 基因表达数据 | 7个淋巴结转移组织和5个非转移组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 104 | 2026-06-13 |
Platelet hyperactivation drives oxidized mitochondrial DNA-induced neutrophil extracellular traps formation in biliary atresia
2026-Jun, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2026.101832
PMID:41856250
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研究论文 | 本研究揭示了血小板过度激活驱动胆道闭锁中氧化线粒体DNA诱导的中性粒细胞胞外陷阱形成及其机制 | 首次阐明血小板过度激活通过释放氧化线粒体DNA促进中性粒细胞胞外陷阱形成的免疫环路，并验证了靶向S100A8/A9的小分子抑制剂paquinimod在该疾病中的治疗潜力 | 未提及具体局限性 | 探讨血小板过度激活是否促进胆道闭锁中NET介导的炎症反应，并评估靶向S100A8/A9的治疗潜力 | 胆道闭锁患者外周血小板、中性粒细胞及RRV注射小鼠模型 | 数字病理学 | 胆道闭锁 | 单细胞RNA测序、细胞共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 435例胆道闭锁患者（其中236例血小板计数升高）及RRV注射小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'文库制备 |
| 105 | 2026-06-13 |
scResponse: A Rank-Based Method for Identifying Cell States That Contribute to Immunotherapy Response by Single-Cell Data
2026-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202524397
PMID:41869876
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研究论文 | 提出了一种基于秩的方法scResponse，通过单细胞数据识别对免疫治疗有响应的细胞状态 | 首次开发了能够量化单细胞水平免疫治疗响应的算法，并发现了乙醛酸和二羧酸代谢的免疫治疗敏化作用以及视黄醇代谢的抑制作用 | 结果未在更大规模或更多样化的数据集中验证，可能缺乏独立的外部验证 | 开发一种有效方法，将免疫治疗疗效映射到单细胞状态，以揭示机制见解并发现新的免疫治疗增敏靶点 | 肿瘤细胞、血管细胞、巨噬细胞、CD8 T细胞、成纤维细胞等不同细胞亚型和状态 | 单细胞分析 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多种癌症类型的整合分析，以及使用肿瘤-CD8 T细胞共培养实验和小鼠模型进行验证 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 106 | 2026-06-13 |
A single-cell atlas of the human airways from patients with allergic rhinitis comorbid with asthma
2026-Jun, Annals of allergy, asthma & immunology : official publication of the American College of Allergy, Asthma, & Immunology
DOI:10.1016/j.anai.2026.03.013
PMID:41887463
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析过敏鼻炎合并哮喘患者气道不同区域的细胞图谱 | 首次对过敏鼻炎合并哮喘患者上、下气道不同微解剖区域的刷检样本进行单细胞RNA图谱构建，揭示了慢性炎症下气道细胞谱的相似变化及GZMA-PARD3通路破坏气道上皮屏障的机制 | 未明确提及研究局限性，但可能包括样本量有限或体外实验的局限性 | 探究过敏鼻炎合并哮喘患者上、下气道细胞群体分布和转录变化 | 过敏鼻炎合并哮喘患者和健康志愿者的鼻和支气管刷检细胞 | 机器学习 | 过敏鼻炎, 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 过敏鼻炎合并哮喘患者和健康志愿者的鼻和支气管刷检细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 107 | 2026-06-13 |
Advances and limitations in angiogenesis assays: Integrating in vitro, in vivo, and emerging technologies
2026-Jun, Vascular pharmacology
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.vph.2026.107607
PMID:41985854
|
review | 综述了从经典到新兴的血管生成测定方法，包括体外、体内及整合人工智能与空间转录组学等前沿技术的应用 | 引入战略性决策矩阵和算法选择指南，平衡生理真实性、实验室限制与3R伦理原则，提供定制化实验设计框架 | 尚未具体评估各方法在实际应用中的定量性能差异 | 为血管生成研究提供系统化的测定方法选择工具 | 血管生成测定技术，包括体外模型、外植体系统、体内平台及AI图像分析、空间转录组学、CRISPR-Cas9筛选等 | 数字病理学 | 心血管疾病 | NA | NA | 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 108 | 2026-06-13 |
Spatial and single-cell characterization of human glioblastoma tumor microenvironment reveals malignant cellular communities
2026-Jun, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-026-02265-5
PMID:41992007
|
研究论文 | 整合多组学数据对100例原发性胶质母细胞瘤肿瘤微环境进行空间和单细胞表征，揭示了四种恶性细胞群落及其细胞间通讯 | 首次通过整合空间转录组学、单细胞RNA测序、单细胞ATAC-seq及切片测序等多平台数据，系统描绘了GBM肿瘤微环境中四种一致的恶性细胞群落，并验证了MES-Hyp和MES-Ast两种间充质样肿瘤细胞亚群的空间分布及配体-受体相互作用 | 未提供具体局限性信息 | 阐明人胶质母细胞瘤肿瘤微环境的复杂细胞和空间组织，以改善诊断和治疗 | 100例原发性胶质母细胞瘤患者的肿瘤组织 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、切片测序 | NA | 基因表达谱、染色质可及性数据、空间转录组数据 | 100名患者，包括121个空间转录组样本、单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq和切片测序数据 | 10x Genomics | 空间转录组学， 单细胞RNA测序， 单细胞ATAC测序 | 10x Visium, 10x Chromium | 10x Visium空间转录组学，10x Chromium单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序 |
| 109 | 2026-06-13 |
A velocity-informed framework for resolving functional stratification in rare human stem cells
2026-Jun, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-026-02956-9
PMID:42014860
|
研究论文 | 提出一个速度信息框架，通过整合单细胞RNA测序与动态RNA速度分析，解析超罕见人类干细胞（脐带血VSELs）中的转录分层和功能异质性 | 首次利用RNA速度动力学模型对超罕见静止态干细胞进行功能亚群辨识，突破了传统方法因细胞数量少和功能难以检测的限制 | 该方法仍依赖于单细胞RNA测序数据的分辨率，且需进一步在更多罕见干细胞类型中验证其通用性 | 开发一种可泛化的策略，用于解析罕见或存在争议的干细胞类型中的细胞异质性和状态转换 | 人类脐带血中的超小型胚胎样干细胞（VSELs） | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序、RNA速度分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 人脐带血来源的VSELs（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 110 | 2026-06-13 |
Pathway-level somatic mutation burden reflects diffuse genomic accumulation rather than selective transcriptional disruption in ovarian serous carcinoma: Evidence from bulk, spatial, and multi-region genomic analyses
2026-Jun, Gynecologic oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.ygyno.2026.04.010
PMID:42034009
|
研究论文 | 通过批量、空间和多区域基因组分析，揭示卵巢浆液性癌中肿瘤突变负荷（TMB）与转录通路活动无显著关联，并发现染色质重塑通路突变与TMB增加及上皮区室富集相关 | 系统性地结合CPTAC-GDC、空间转录组学（Gray Foundation GeoMx）和多区域基因组学（MSK SPECTRUM）三大数据集，首次明确卵巢浆液性癌中TMB并非通过选择性转录通路破坏发挥作用，而是反映弥漫性基因组积累，并发现染色质重塑通路是唯一与TMB显著相关的突变积累通路 | 研究在现有统计效力下未检测到TMB与转录通路活动间的关联；分析仅基于卵巢浆液性癌亚型，结果可能不适用于其他癌症类型 | 探究卵巢浆液性癌中肿瘤突变负荷（TMB）是否驱动选择性转录通路破坏或反映弥漫性基因组积累 | 卵巢浆液性癌患者样本（包括CPTAC-GDC队列84例、Gray Foundation GeoMx空间转录组学队列43例、MSK SPECTRUM多区域基因组学队列42例） | 生物信息学, 基因组学 | 卵巢癌 | 批量RNA测序, 空间转录组学, 多区域基因组测序 | 无 | 基因组数据, 转录组数据 | CPTAC-GDC队列84例，Gray Foundation GeoMx队列43例，MSK SPECTRUM队列42例 | 无 | 空间转录组学, 批量RNA-seq | GeoMx Digital Spatial Profiler, 无 | Gray Foundation GeoMx空间转录组学平台，无 |
| 111 | 2026-06-13 |
Resolving sensitivity, specificity and signal contamination in Xenium spatial transcriptomics
2026-Jun, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-026-03089-8
PMID:42062553
|
研究论文 | 系统分析Xenium空间转录组学技术的灵敏度、特异性和信号污染，并引入一种信号纯化方法SPLIT | 构建了迄今为止最全面的Xenium数据集之一，涵盖超过40个乳腺和肺肿瘤切片，并系统解析了技术噪声，包括转录本溢出、检测特异性、面板性能和分割策略；同时开发了SPLIT方法，通过解析混合转录信号提高信号纯度，揭示被掩盖的T细胞耗竭特征 | 未明确提及局限性，但可能受限于Xenium技术的固有缺陷和数据集规模 | 评估Xenium空间转录组学技术的性能，解决信号污染问题，并提高细胞类型分辨率 | 超过40个乳腺和肺肿瘤切片，使用不同基因面板进行检测 | 生物信息学 | 乳腺癌、肺癌 | Xenium空间转录组学、单细胞核RNA测序 | 不适用 | 空间转录组数据、单细胞核RNA测序数据 | 超过40个乳腺和肺肿瘤切片 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium空间转录组分析平台 |
| 112 | 2026-06-13 |
Elevation of liver elasticity following radiofrequency ablation reflects neutrophil-mediated abscopal effect in liver cancer
2026-Jun, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2026.101824
PMID:41881314
|
research paper | 本研究探讨了肝细胞癌射频消融后肝脏弹性值升高与中性粒细胞介导的远隔效应之间的关系 | 首次将射频消融后肝脏弹性值的动态变化与中性粒细胞免疫反应联系起来，并发现CD40激动剂可增强此免疫反应，为预防肝癌复发提供了新策略 | 未提及具体局限性 | 研究射频消融后肝脏弹性值变化与中性粒细胞反应的相关性，并探索潜在的辅助治疗策略 | 肝细胞癌患者和小鼠模型 | machine learning, digital pathology | liver cancer | RFA, SWE, scRNA-seq, multiplex immunofluorescence staining, flow cytometric analysis | NA | image, sequence data | 临床数据102例患者，小鼠模型每组4-6只 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 113 | 2026-06-13 |
anndataR improves interoperability between R and Python in single-cell transcriptomics
2026-Jun-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag288
PMID:42108549
|
研究论文 | anndataR软件包提升了单细胞转录组学中R和Python之间的互操作性 | 实现R原生读写H5AD文件，支持与SingleCellExperiment或Seurat对象的转换，并保证跨语言的长期兼容性 | 未提及具体限制 | 促进R和Python在单细胞转录组数据处理中的互操作性 | 单细胞转录组数据集 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | H5AD文件格式数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 114 | 2026-06-13 |
SLC39A1 promotes pancreatic cancer metastasis by elevating intracellular zinc and activating the Src/FAK signaling pathway
2026-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.152746
PMID:42208832
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研究论文 | 研究SLC39A1通过升高细胞内锌离子并激活Src/FAK信号通路促进胰腺癌转移的机制 | 首次揭示SLC39A1在胰腺癌转移中通过调控锌离子稳态激活Src/FAK通路的具体分子机制，并利用单细胞RNA测序分析验证锌离子和SLC39A1在转移灶上皮细胞中的富集 | 未明确SLC39A1上游调控因子及锌离子下游其他可能靶点，且动物模型仅验证肝转移能力 | 阐明锌离子稳态调控因子SLC39A1在胰腺癌转移中的作用及其分子机制 | 胰腺癌原发灶和转移灶的单细胞测序数据、胰腺癌细胞模型及小鼠模型 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、图像 | 从GEO数据库下载的原发性和转移性胰腺癌样本，以及小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 115 | 2026-06-13 |
Distinct cellular and subcellular distributions of the alpha and beta isoforms of Heat Shock Protein 90 in the mouse cerebral cortex
2026-Jun, Gene expression patterns : GEP
IF:1.0Q4
DOI:10.1016/j.gep.2026.119412
PMID:42218969
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研究论文 | 揭示了热休克蛋白90的α和β亚型在小鼠大脑皮层中的细胞和亚细胞分布差异 | 首次系统描述了HSP90α和HSP90β在小鼠大脑皮层不同细胞类型及亚细胞结构中的差异性分布 | 未深入探讨这两种亚型在功能上的具体差异机制 | 阐明HSP90α和HSP90β在成年和发育中大脑皮层的独特分布模式及其潜在功能差异 | 小鼠大脑皮层 | 神经科学 | NA | 免疫荧光染色、荧光原位杂交、单细胞RNA测序 | NA | 图像、基因表达数据 | 小鼠大脑皮层组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 116 | 2026-06-13 |
Challenges and progress in RNA velocity: Comparative analysis across multiple biological contexts
2026-Jun, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014303
PMID:42224352
|
研究论文 | 通过比较管道分析五种RNA速率方法在三个数据集上的表现，评估其在不同生物背景下的准确性和局限性 | 首次建立系统比较管道，从局部一致性、方法一致性、驱动基因识别和对测序深度的稳健性四个维度评估多种RNA速率方法 | 仅使用三个公开数据集评估，可能无法全面反映所有生物场景中的性能差异 | 比较不同RNA速率方法在多个生物背景下的性能，为科学家选择合适方法提供参考 | 三种不同数据集中的RNA速率方法性能 | 自然语言处理 | 不适用 | RNA-seq | 不适用 | 单细胞转录组数据 | 三个公开数据集 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 117 | 2026-06-13 |
CBLC-mediated ubiquitination stabilizes METTL1, enhances N7-methylguanosine modification of ESRRA, and promotes the progression of endometrial cancer
2026-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.152809
PMID:42217705
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研究论文 | 研究E3泛素连接酶CBLC通过泛素化稳定METTL1，增强ESRRA的m7G修饰，促进子宫内膜癌进展的机制 | 首次揭示CBLC通过泛素化稳定METTL1，进而调控m7G修饰影响ESRRA表达，形成全新信号级联通路促进子宫内膜癌进展 | 未提及具体局限 | 探究E3泛素连接酶CBLC在子宫内膜癌发展中的作用及其分子机制 | 子宫内膜癌细胞 | 机器学习 | 子宫内膜癌 | 单细胞测序，转录组分析 | NA | 单细胞测序数据，转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，批量转录组测序 | NA | NA |
| 118 | 2026-06-13 |
Chemical Reprogramming of Fibroblasts to Functional Mammary Epithelial Cells via a Single BMP Inhibitor
2026-Jun, Cell biology international
IF:3.3Q3
DOI:10.1002/cbin.70173
PMID:42244440
|
研究论文 | 本研究通过单一BMP通路小分子抑制剂LDN193189，在8天内将山羊耳成纤维细胞直接重编程为功能性乳腺上皮细胞 | 首次仅使用单一小分子化合物实现成纤维细胞向功能性乳腺上皮细胞的直接重编程，无需基因操作 | 仅使用山羊耳成纤维细胞，未验证其他物种或组织来源细胞的可行性 | 开发一种简单、化学成分明确的直接重编程方法，用于生成功能性乳腺上皮细胞 | 山羊耳成纤维细胞和化学诱导乳腺上皮细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 山羊耳成纤维细胞来源的细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 119 | 2026-06-13 |
Stress Responsive bZIP Transcription Factors ATF4 and BACH1 Cooperate With MAF-Family bZIP Protein NRL to Fine-Tune Rod Photoreceptor Gene Expression
2026-Jun-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.6.9
PMID:42246540
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研究论文 | 本研究鉴定出ATF4和BACH1两个bZIP转录因子与NRL相互作用，共同调控视杆细胞基因表达的精细调节 | 首次发现ATF4和BACH1作为NRL的bZIP蛋白相互作用因子，揭示其通过直接结合或间接作用调控视杆细胞基因表达的分子机制 | BACH1与NRL的相互作用可能需要额外因子；研究主要基于小鼠模型，人类视网膜中的机制有待验证 | 阐明bZIP转录因子NRL的相互作用蛋白及其对视杆细胞基因表达的调控机制 | 小鼠视网膜中的视杆细胞及NRL、ATF4、BACH1转录因子 | 计算机视觉 | 视网膜病变 | 酵母双杂交、免疫共沉淀、高分辨率显微镜、邻近连接技术、报告基因分析、CUT&Tag、单细胞RNA测序 | NA | 序列数据、图像数据、基因表达数据 | 小鼠视网膜样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于scRNA-seq分析 |
| 120 | 2026-06-13 |
Synergistic Interaction Between MALAT1/miR-30b-5p/BAFF Axis and Inflammatory Cytokines Underlies Rituximab-Refractory NMOSD
2026-Jun, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.70973
PMID:42253032
|
研究论文 | 探究MALAT1/miR-30b-5p/BAFF轴在单核细胞中的激活对NMOSD疾病发作和利妥昔单抗难治性复发的贡献 | 首次发现MALAT1/miR-30b-5p/BAFF轴在单核细胞中的激活是NMOSD发病和利妥昔单抗难治性复发的新机制 | 样本量较小，需进一步在更大队列中验证该轴的临床相关性 | 阐明导致NMOSD患者在利妥昔单抗治疗后仍出现突破性复发的分子机制 | NMOSD患者的外周血单个核细胞（PBMCs）和血清以及THP-1单核细胞系 | 数字病理学 | 视神经脊髓炎谱系疾病 | qPCR, ELISA, Western Blot, 双荧光素酶报告基因检测, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 单细胞转录组数据 | 发病组（PBMCs: n=10; 血清: n=23）、利妥昔单抗缓解组（n=26）、利妥昔单抗难治性复发组（n=13）和健康对照（n=15），以及6个PBMC样本用于scRNA-seq | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 用于单细胞RNA测序的10x Chromium平台 |