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当前共找到 42646 篇文献,本页显示第 101 - 120 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
101 2026-08-21
Quantifying the clusterness and trajectoriness of single-cell RNA-seq data
2024-02, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 提出多个评分来量化单细胞RNA-seq数据的“聚类性”和“轨迹性”,以指导分析选择 首次提出基于多种数学方法(如距离分布、持续同调、向量幅度、Ripley's K和连通度)的评分体系,客观评估数据更偏向聚类还是轨迹 评分在模拟和真实数据上验证,但未详细讨论对复杂或噪声数据的鲁棒性 开发量化单细胞RNA-seq数据聚类性和轨迹性的评分方法,帮助研究者选择更合适的分析策略 模拟数据集和真实单细胞RNA-seq数据集 机器学习 NA 单细胞RNA-seq NA 基因表达数据 未明确具体样本数量,包括模拟数据和真实单细胞RNA-seq数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
102 2026-08-21
A novel batch-effect correction method for scRNA-seq data based on Adversarial Information Factorization
2024-02, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 提出一种基于对抗信息分解的scRNA-seq数据批次效应校正方法,无需细胞类型先验或特定标准化策略,适用于多种下游分析。 提出Adversarial Information Factorization方法,不依赖细胞类型先验知识或特定标准化策略,在低信噪比、批次特异性细胞类型、多批次不均衡等场景中表现优于现有方法,且能最好地保留细胞类型间相对基因表达,提升差异表达分析结果。 摘要未提及明显的局限性。 开发一种鲁棒的批次效应校正方法,以消除scRNA-seq数据中的批次效应,支持聚合下游分析。 scRNA-seq数据集,包括模拟场景和白血病队列。 机器学习 白血病 scRNA-seq 对抗网络(Adversarial Network) 基因表达数据(单细胞RNA测序数据) 未明确提及具体样本数量,提及多个模拟场景和一个白血病队列。 NA scRNA-seq NA NA
103 2026-08-21
Interleukin 13 Promotes Maturation and Proliferation in Metaplastic Gastroids
2024, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究建立Meta1胃类器官模型,探究IL-13对化生性SPEM细胞成熟和增殖的促进作用及其分子机制 首次建立可靠的Meta1胃类器官模型,并揭示IL-13通过STAT6信号通路促进SPEM细胞成熟与增殖 未提及具体局限性 阐明IL-13在SPEM细胞成熟和增殖中的分子效应,并建立体外模型 Mist1-Kras转基因小鼠的化生胃类器官、IL-13-tdTomato报告小鼠的ILC2细胞、人类化生胃类器官 分子生物学 胃化生 单细胞RNA测序、细胞分选、三维共培养、空气-液体界面培养、STAT6抑制 类器官模型 基因表达数据、细胞图像 小鼠类器官及人类化生胃类器官,具体数量未提及 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 单细胞RNA测序平台,具体配置未提及
104 2026-08-21
Autophagy Contributes to Homeostasis in Esophageal Epithelium Where High Autophagic Vesicle Level Marks Basal Cells With Limited Proliferation and Enhanced Self-Renewal Potential
2024, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 通过遗传学手段抑制自噬和细胞分选分析,探究自噬在食管上皮稳态维持中的作用 首次揭示了高自噬囊泡水平的食管基底细胞具有有限增殖和增强自我更新能力,并利用单细胞RNA测序深入解析了其机制 未提供明确的局限性信息 明确自噬在食管上皮稳态中的作用 食管基底细胞和小鼠食管上皮组织 分子生物学 食管疾病 条件性基因敲除、流式细胞分选、RNA测序、单细胞RNA测序、三维类器官培养 NA 基因表达数据、图像数据 使用他莫昔芬诱导的鳞状上皮特异性Atg7条件敲除小鼠,以及分选的Cyto-IDHigh和Cyto-IDLow食管基底细胞 NA NA NA NA
105 2026-08-21
Single-cell RNA sequencing reveals different chondrocyte states in femoral cartilage between osteoarthritis and healthy individuals
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示了骨关节炎患者与健康个体股骨软骨中不同的软骨细胞状态 发现了两种新的软骨细胞亚型(METRNL+和PRG4+),并提出了新的软骨细胞亚型分类,同时揭示了细胞分化过程中的转录组特征和信号通路变化 未在摘要中明确提及局限性 比较健康与骨关节炎软骨细胞的类型差异,并探讨这些类型在软骨再生和骨关节炎进展中的作用 健康股骨远端软骨和骨关节炎股骨软骨 单细胞转录组学 骨关节炎 单细胞RNA测序、RNA速率分析、拟时间分析、SCENIC、免疫组化 NA 单细胞转录组数据 共包含75,104个细胞,分为19个簇和11个软骨细胞亚型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
106 2026-08-21
Autophagy contributes to homeostasis in esophageal epithelium where high autophagic vesicle content marks basal cells with limited proliferation and enhanced self-renewal potential
2023-Sep-22, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨自噬在食管上皮稳态中的作用,发现高自噬囊泡含量的基底细胞具有有限增殖和增强自我更新能力,有助于维持体内食管增殖-分化梯度 首次通过条件性敲除Atg7小鼠和基于Cyto-ID染色的细胞分选,揭示高自噬囊泡水平标记的食管基底细胞具有增强的自我更新潜力,并参与维持组织稳态 研究主要基于小鼠模型,可能不完全反映人类食管上皮的复杂性;未深入探讨自噬调控的具体分子机制 明确自噬在食管上皮稳态条件下的作用 食管上皮基底细胞、小鼠食管组织、3D类器官 分子生物学 食管疾病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 透射电子显微镜, 流式细胞术 条件性基因敲除小鼠模型, 3D类器官模型 基因表达数据, 图像数据, 细胞周期数据 小鼠模型及分选后的细胞样本,具体数量未提供 NA RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
107 2026-08-21
Single-cell RNA sequencing reveals in vivo osteoimmunology interactions between the immune and skeletal systems
2023, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2
研究论文 利用单细胞RNA测序数据,研究了人类股骨头中免疫细胞与成骨细胞谱系细胞之间的体内骨免疫相互作用,并探讨了外周血单核细胞对骨骼表型的影响 首次在单细胞分辨率下,揭示了体内骨微环境中免疫细胞与成骨细胞谱系细胞之间的配体-受体相互作用,并识别了与骨密度相关的单核细胞亚型特异子网络 未提供明确的局限性信息 探索免疫系统与骨骼系统在单细胞水平上的骨免疫相互作用,并分析外周血免疫细胞对骨骼表型的影响 人类股骨头中的免疫细胞和成骨细胞谱系细胞,以及外周血单核细胞 单细胞测序 骨质疏松 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 去卷积分析, 加权基因共表达网络分析(WGCNA), 细胞特异性网络(CSN), 最小绝对收缩和选择算子(LASSO) CellphoneDB, CellChat, WGCNA, LASSO 单细胞RNA测序数据 来自人类股骨头的scRNA-seq数据集和外周血单核细胞的scRNA-seq数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
108 2026-08-21
Protocol for the isolation of CD8+ tumor-infiltrating lymphocytes from human tumors and their characterization by single-cell immune profiling and multiome
2022-09-16, STAR protocols IF:1.3Q4
研究论文 本文提出了一种从人类肿瘤中分离CD8+肿瘤浸润淋巴细胞并进行单细胞免疫谱和多重组学表征的实验方案 建立了结合单细胞RNA测序、VDJ谱分析和染色质结构分析的综合方案,为CD8 TILs的表征提供了详细指导 未明确说明局限性 建立用于表征人类肿瘤中CD8 TILs异质性和免疫生物学的实验方案 人类肿瘤中的CD8+肿瘤浸润淋巴细胞 数字病理学 癌症 单细胞RNA测序、VDJ测序、染色质可及性分析 NA 单细胞测序数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序、单细胞VDJ测序、单细胞ATAC-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'、10x Chromium单细胞VDJ、10x Chromium单细胞ATAC
109 2026-08-21
Heterogeneity and transcriptome changes of human CD8+ T cells across nine decades of life
2022-09-01, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序研究人类CD8+ T细胞在九十年生命跨度的异质性和转录组变化,并开发预测细胞年龄的机器学习模型 首次结合横断面和纵向样本,全面描述CD8+ T细胞在九十年间的异质性变化,并揭示年龄相关基因表达变化的三种模式,开发出基于转录组特征预测细胞年龄的机器学习模型,并在HIV感染和CAR T细胞扩增两个独立情境中验证 摘要未提及明显局限性 阐明人类CD8+ T细胞在衰老过程中异质性和转录组变化及其机制,并建立预测模型 人类CD8+ T细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 机器学习模型(具体类型未指定) 单细胞转录组数据 横断面和纵向样本,具体数量未提及 未提及 单细胞RNA测序 未提及 未提及
110 2026-08-21
Sex Differences in Coronary Artery Disease and Diabetes Revealed by scRNA-Seq and CITE-Seq of Human CD4+ T Cells
2022-Aug-30, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序和CITE-Seq分析人类CD4+ T细胞,揭示了冠状动脉疾病和糖尿病中存在的性别差异及共同基因表达特征 首次将scRNA-Seq与CITE-Seq结合应用于冠状动脉疾病与糖尿病中CD4+ T细胞的研究,并系统评估性别和糖尿病状态对细胞比例及基因表达的影响 样本量相对较小,且研究为横断面设计,未能建立因果关系;仅聚焦于CD4+ T细胞,未涵盖其他免疫细胞类型 探究冠状动脉疾病与性别及糖尿病之间的关联,通过CD4+ T细胞的单细胞转录组和表面蛋白表达谱分析来理解其免疫机制 接受心导管检查的61名男性和女性的外周血单核细胞(PBMCs)中的CD4+ T细胞 数字病理学 冠状动脉疾病、糖尿病 单细胞RNA测序(scRNA-Seq)、CITE-Seq NA 转录组和表面蛋白表达数据 41,782个单CD4+ T细胞,来自61名受试者(16名女性,45名男性) 10x Genomics 单细胞RNA测序、CITE-Seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'文库制备,并结合49种表面标记物的CITE-Seq
111 2026-08-21
B7H3-dependent myeloid-derived suppressor cell recruitment and activation in pulmonary fibrosis
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究探讨了B7H3依赖性髓源性抑制细胞在肺纤维化中的募集与激活作用 首次揭示B7H3通过促进MDSC的扩增和募集,进而激活肌成纤维细胞分化,加重肺纤维化的机制 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床样本量有限,需进一步验证 探究MDSCs在特发性肺纤维化中的作用及其依赖B7H3的调控机制 特发性肺纤维化患者外周血样本及小鼠肺纤维化模型 数字病理学 肺纤维化 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 特发性肺纤维化患者外周血样本和小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序
112 2026-08-20
Hippocampal LANCL1 attenuates postoperative cognitive dysfunction via the SIRT1/PGC-1α-mediated mitochondrial biogenesis
2026-Nov, Experimental neurology IF:4.6Q1
研究论文 本研究探讨海马LANCL1通过SIRT1/PGC-1α介导的线粒体生物发生减轻术后认知功能障碍的作用 首次揭示LANCL1在术后认知功能障碍中的保护作用及其通过SIRT1/PGC-1α信号轴增强线粒体生物发生的机制 研究主要基于小鼠模型,未在人类样本中验证,且未探讨长期效应或潜在副作用 阐明LANCL1在术后认知功能障碍中的作用机制,并评估其治疗潜力 老年小鼠海马组织的LANCL1表达及其对术后认知功能的影响 神经科学 术后认知功能障碍 慢病毒载体介导的基因过表达、单细胞测序、线粒体功能分析、组织学分析 小鼠模型 基因表达数据、线粒体功能数据、组织学图像、单细胞测序数据 未明确样本量,使用老年小鼠(具体数量未提供) NA 单细胞测序 NA NA
113 2026-08-20
Targeting DYNC1I1 attenuates Parkinsonian neurodegeneration and α-synuclein accumulation in cellular and mouse models
2026-Oct-01, Brain research bulletin IF:3.5Q2
研究论文 本研究旨在探究靶向DYNC1I1在帕金森病细胞和小鼠模型中的神经保护作用及其机制 首次将DYNC1I1作为帕金森病干预靶点,结合单细胞转录组分析、细胞和动物模型验证,揭示其通过改善自噬-溶酶体通路和激活PI3K/AKT信号减轻α-突触核蛋白积累 仅基于单一scRNA-seq数据集和特定细胞系及小鼠模型,未进行人类临床样本验证或长期效应评估 评估靶向DYNC1I1对帕金森病相关表型的改善效果及其潜在分子机制 帕金森病患者黑质组织(源自GSE243639数据集)、SH-SY5Y细胞、雄性C57BL/6小鼠 数字病理学 帕金森病 单细胞RNA测序、siRNA基因沉默、腺相关病毒介导的基因干预、免疫印迹、免疫荧光 细胞模型(SH-SY5Y)和动物模型(小鼠) 单细胞转录组数据、荧光图像、行为学数据 未明确样本量;使用细胞系和小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
114 2026-08-20
Lgals3high macrophages orchestrate neuroinflammation and extracellular matrix remodelling via NF-κB pathway in acute spinal cord injury
2026-Oct-01, Brain research bulletin IF:3.5Q2
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序与体内外实验,揭示了Lgals3high巨噬细胞通过NF-κB通路在急性脊髓损伤中介导神经炎症和细胞外基质重塑,并验证了抑制剂GB1107的潜在治疗作用 首次鉴定出Lgals3high巨噬细胞(Mac-1)在急性脊髓损伤早期主导细胞外基质重塑,并阐明Lgals3/NF-κB/p65/Ccl2信号轴作为巨噬细胞极化的关键调控机制,提出“免疫-基质”双靶向治疗策略 研究主要基于小鼠和细胞模型,缺乏人类样本验证;未深入探讨其他信号通路或细胞类型在急性脊髓损伤中的潜在作用 阐明Lgals3high巨噬细胞在急性脊髓损伤中介导神经炎症和细胞外基质重塑的分子机制,并评估GB1107的治疗潜力 急性脊髓损伤大鼠模型,LPS+IFN-γ诱导的RAW264.7巨噬细胞,以及单细胞RNA测序数据 数字病理学 急性脊髓损伤 单细胞RNA测序、多重免疫组化、蛋白质印迹、实时定量PCR、SiRNA敲低、药理学抑制 无特定的深度学习模型,主要使用生物信息学分析和传统统计模型 基因表达数据、图像数据 SD大鼠急性脊髓损伤模型(具体数量未在摘要中提及)、RAW264.7巨噬细胞系 NA 单细胞RNA测序、多重免疫组化 NA NA
115 2026-08-20
NCTDA: Nearest Neighbor Gaussian Process-Based Cell Type-Specific Spatially Variable Gene Detection Analysis
2026-Oct, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology IF:1.4Q2
研究论文 提出了一种基于最近邻高斯过程的细胞类型特异性空间可变基因检测分析框架NCTDA NCTDA框架利用最近邻高斯过程模型,将细胞类型组成纳入基因表达的空间建模中,与大多数方法的立方级可扩展性相比,能够随空间点数量线性扩展,从而高效检测空间可变基因和细胞类型特异性空间可变基因 未在摘要中明确说明限制 旨在检测空间可变基因和细胞类型特异性空间可变基因,以更深入地理解基因空间表达特征和细胞功能异质性 空间转录组数据中的基因表达和细胞类型 空间转录组学 不适用 空间转录组学 最近邻高斯过程 空间转录组数据 未在摘要中明确说明 不适用 空间转录组学 不适用 不适用
116 2026-08-20
Multimodal characterization of age-dependent neurovascular phenotypes in Notch3R170C CADASIL mice by ultra-high-field MRI and histological analyses
2026-Oct-01, Brain research bulletin IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过超高场MRI、定量组织学和单细胞RNA测序,整合多尺度框架,表征Notch3R170C CADASIL小鼠模型中年龄依赖的神经血管表型 建立了一个整合超高场MRI、定量组织学和单细胞RNA测序的多尺度框架,首次将体内静息脑灌注成像与组织学和分子改变联系起来,提供了年龄分辨的神经血管表型表征 研究仅限于小鼠模型,可能无法完全反映人类CADASIL的复杂性;神经元和少突胶质细胞相关改变相对有限,可能未完全捕捉所有病理变化 整合多尺度方法,表征Notch3 CADASIL小鼠模型中年龄依赖的神经血管表型,并建立影像学发现与细胞和分子变化的关系 Notch3R170C CADASIL小鼠模型 神经影像学, 数字病理学 CADASIL(脑常染色体显性动脉病伴皮层下梗死和白质脑病) 超高场MRI, 定量组织学, 单细胞RNA测序 小鼠模型 影像数据, 组织学图像, 单细胞转录组数据 Notch3R170C小鼠(具体数量未在摘要中提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
117 2026-08-20
Urolithin B ameliorates depressive-like behavior and hippocampal neuronal damage in depressed rats via regulation of the SLP2/PINK1/Parkin signaling pathway
2026-Oct-01, Brain research bulletin IF:3.5Q2
研究论文 本研究探讨了尿石素B通过调控SLP2/PINK1/Parkin信号通路改善抑郁大鼠的抑郁样行为和海马神经元损伤 首次揭示尿石素B通过上调SLP2表达并调节PINK1/Parkin介导的线粒体自噬途径发挥抗抑郁和神经保护作用,为基于天然化合物的抑郁症治疗提供了新靶点 未在临床样本中验证尿石素B的效果,且其作用机制在其他脑区或长期效应尚需进一步研究 探究尿石素B对抑郁大鼠模型抑郁样行为及海马神经元损伤的影响及其潜在分子机制 慢性不可预见性轻度应激(CUMS)诱导的抑郁大鼠模型及其海马神经元 神经科学 抑郁症 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、ELISA、免疫荧光、组织病理学、行为学测试 大鼠模型(CUMS抑郁模型)及体外敲低/过表达实验 基因表达数据、行为学数据、病理图像 动物实验样本量未在摘要中明确;scRNA-seq数据来自GEO数据库 NA 单细胞RNA测序 NA NA
118 2026-08-20
Lactylation-related prognostic signature characterized in pancreatic ductal adenocarcinoma through public scRNA-seq dataset and machine learning algorithms: the TOP2A-H3K18la-NQO1 axis orchestrates malignant progression
2026-Sep, British journal of cancer IF:6.4Q1
研究论文 本研究基于公共单细胞RNA测序数据,利用机器学习算法构建了胰腺导管腺癌的乳酸化相关预后风险评分模型,并揭示了TOP2A-H3K18la-NQO1轴促进恶性进展的机制。 首次在胰腺导管腺癌中建立乳酸化相关风险评分模型,并揭示乳酸-TOP2A-H3K18la-NQO1正反馈环路,为靶向治疗提供了新基础。 摘要未提及局限性,但可能涉及样本量有限、缺乏多中心验证或机制研究深度不足。 探讨乳酸化在胰腺导管腺癌中的作用,并开发预后预测模型及揭示其分子机制。 胰腺导管腺癌患者样本及细胞系,包括来自公共数据库的转录组和单细胞数据。 机器学习 胰腺导管腺癌 单细胞RNA测序、CUT&Tag、CCK-8实验、集落形成实验、伤口愈合实验、Transwell迁移实验、Western blotting、qRT-PCR 机器学习算法 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、临床数据、实验数据 使用公共数据集(GSE154778、TCGA-PAAD、GSE57495、GSE79668)以及皮下异种移植模型,具体样本量未说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
119 2026-08-20
Cross-scale bioanalytical integration for decoding tumour regulatory plasticity in oncology
2026-Sep, Critical reviews in oncology/hematology
综述 本文综述了跨尺度生物分析整合技术在解码肿瘤调控可塑性中的应用,涵盖液体活检、单细胞与空间组学、质谱成像、多组学分析和AI计算框架,并讨论了其在精准肿瘤学中的前景与挑战 强调跨尺度生物分析技术整合,结合分子分辨率与空间和时间背景,以解码肿瘤调控可塑性,并推动多组学融合和临床可解释工具开发 面临跨尺度数据整合、动态疾病追踪和临床可解释分析工具开发等挑战 探讨先进生物分析方法在肿瘤生物学研究中的应用,以支持精准诊断、预后评估和个性化治疗 肿瘤细胞及其微环境,包括肿瘤免疫生态系统 计算生物学、多组学分析 癌症 液体活检、单细胞转录组学、单细胞染色质可及性分析、空间转录组学、多重成像、质谱成像、蛋白质组学、代谢组学、AI计算分析 NA 分子数据、成像数据、空间数据、时间序列数据 NA NA 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、空间转录组学、质谱成像、蛋白质组学、代谢组学 NA NA
120 2026-08-20
High salt supplementation of a MASH-inducing diet causes lean MASH phenotype with increased hepatic urea cycle activity and EIF5A hypusination
2026-Sep, Molecular metabolism IF:7.0Q1
研究论文 该研究建立了一种瘦型MASH饮食小鼠模型,并发现高盐补充饮食可通过调节尿素循环活性和EIF5A羟化来减少脂肪变性但加剧炎症和纤维化 首次建立了瘦型MASH的饮食诱导小鼠模型,并揭示了其与肥胖型MASH在肝尿素循环、线粒体蛋白合成和免疫细胞激活方面的差异 研究主要基于小鼠模型,其结论在人类中的适用性尚需验证;未深入探讨高盐影响免疫细胞的具体分子机制 探究瘦型MASH的环境诱因和分子机制,并建立合适的动物模型 小鼠(喂食WDF或HSWDF饮食) 数字病理学 肝脏疾病 单细胞测序 NA 图像 未明确 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
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