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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-05-15 |
Genetic susceptibility to PM2.5 exposure and transcriptional responses in pediatric asthma: insights from single-cell transcriptomics
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1644537
PMID:41710897
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研究论文 | 通过整合基因组和单细胞转录组分析,揭示PM2.5暴露遗传易感性在儿童哮喘中与TGF-β1-SMAD/MAPK信号轴的关联 | 首次利用多基因风险评分(sPRS)与单细胞RNA测序相结合,鉴定PM2.5敏感性的关键生物学通路和转录调控因子 | 样本量较小且富集分析为间接推断,结果尚需功能性验证 | 探究儿童哮喘对PM2.5敏感性的遗传变异是否汇聚于特定的生物学通路或转录调控因子 | 高、低PM2.5敏感多基因风险评分的儿童外周血单个核细胞(PBMCs) | 机器学习 | 儿科哮喘 | 单细胞RNA测序 | 负二项回归模型 | 单细胞转录组数据 | 少量高、低sPRS评分儿童外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 102 | 2026-05-15 |
Targeting the epithelium in pulmonary fibrosis
2026-Jan, European respiratory review : an official journal of the European Respiratory Society
IF:9.0Q1
DOI:10.1183/16000617.0225-2025
PMID:41881452
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综述 | 回顾新技术在肺纤维化中上皮细胞靶点的发现与验证 | 通过单细胞测序和空间图谱技术揭示新型疾病相关上皮细胞群体,并整合功能共培养研究及计算基因集富集分析 | 未提及具体局限性,但综述性质可能缺乏实验验证 | 评估尖端技术在鉴定肺纤维化治疗新上皮靶点中的作用 | 特发性肺纤维化患者肺组织中的上皮细胞群体 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 103 | 2026-05-15 |
Tumor suppressors LKB1 and SMARCA4 functionally interact to regulate gene expression across diverse biological processes in lung cancer
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1685342
PMID:41924094
|
研究论文 | 探索LKB1和SMARCA4在肺癌中协同调控基因表达的功能 | 首次揭示LKB1通过与SMARCA4-SWI/SNF复合物相互作用,连接代谢与基因表达调控 | 研究主要基于体外细胞系和有限的人类肿瘤样本,缺乏体内实验验证 | 阐明LKB1和SMARCA4在肺癌中如何协同调控基因表达 | 四种LKB1和SMARCA4表达状态不同的肺癌细胞系及人肺肿瘤样本 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 四种肺癌细胞系及人肺肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 104 | 2026-05-15 |
Attenuated crosstalk between urothelium and fibroblasts promotes ureteral stricture development
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1786116
PMID:41924262
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫组化验证,揭示尿路上皮细胞与成纤维细胞间的减弱交互作用促进输尿管狭窄发展 | 首次整合单细胞RNA测序与免疫组化验证,系统阐明输尿管狭窄中尿路上皮细胞-成纤维细胞交互作用的分子机制,并发现ANXA1-FPR2信号轴在维持成纤维细胞稳态中的关键作用 | 样本量较小(7例狭窄组织与8例正常组织),且机制研究主要基于转录组分析,缺乏功能实验直接验证因果关系 | 探究输尿管狭窄的分子和细胞机制,为预防和抗纤维化治疗提供新靶点 | 输尿管狭窄患者和正常人的输尿管组织 | 数字病理学 | 输尿管狭窄 | 单细胞RNA测序, 免疫组化, 免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据, 组织图像 | 7例输尿管狭窄组织和8例正常输尿管组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 105 | 2026-05-15 |
Integrative bioinformatic analysis prioritizes TIMP1 and FN1 as angiogenesis-related candidate genes in diabetic foot ulcers
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0348808
PMID:42127081
|
研究论文 | 通过整合生物信息学分析,优先识别出TIMP1和FN1作为糖尿病足溃疡中与血管生成相关的候选基因 | 结合批量转录组数据、机器学习基因优先排序和单细胞RNA测序,系统分析糖尿病足溃疡中血管生成损伤相关的分子特征,并构建了五基因特征 | 未说明明显局限性 | 探索糖尿病足溃疡中血管生成损伤相关的分子特征及候选基因 | 糖尿病足溃疡患者的转录组数据和单细胞数据 | 计算生物学 | 糖尿病足溃疡 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | LASSO逻辑回归模型 | 基因表达数据 | GSE199939和GSE134431数据集 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 106 | 2026-05-15 |
[Biomarkers for enhancing efficacy of CAR-T cell therapy]
2026, [Rinsho ketsueki] The Japanese journal of clinical hematology
DOI:10.11406/rinketsu.67.342
PMID:42128866
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综述 | 系统分类影响CAR-T疗法疗效的关键因素,包括肿瘤内在和T细胞内在因素,并探讨基于多组学技术的生物标志物预测模型 | 将影响CAR-T疗效的因素系统划分为肿瘤内在和T细胞内在两大类别,并结合单细胞RNA测序、蛋白质组学和机器学习等最新技术,提出整合多维生物标志物构建统一预测模型的新方向 | 未提供具体的生物标志物验证结果或临床数据支持,且未讨论不同预测模型间的比较和标准化问题 | 系统综述CAR-T细胞疗法疗效相关生物标志物,为优化患者分层和个体化治疗提供依据 | 接受CAR-T治疗的血液肿瘤患者,包括B细胞急性淋巴细胞白血病和淋巴瘤患者 | 机器学习 | 血液肿瘤 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、高维免疫表型分析 | 预测模型 | 组学数据、免疫表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 107 | 2026-05-15 |
Immunorepertoire-based characterization of adaptive immunity in human malignant pleural effusion
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1825360
PMID:42130624
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序和V(D)J测序全面表征了肺癌相关恶性胸腔积液中适应性免疫细胞的TCR和BCR库特征 | 首次通过单细胞V(D)J测序系统揭示恶性胸腔积液中TCR和BCR库的免疫特征,发现调节性T/B细胞偏好特定V(D)J基因片段、Th1/17细胞克隆扩增与代谢适应及效应功能增强相关,并强调了TCR互补决定区3在抗原识别中的功能重要性 | 未检测到BCR库显著的克隆型或功能性变化,且研究局限于肺腺癌相关MPE,样本类型单一 | 阐明人类恶性胸腔积液中适应性免疫系统的TCR和BCR库特征及免疫病理机制 | 肺腺癌相关恶性胸腔积液和匹配外周血样本中的适应性免疫细胞(包括T细胞和B细胞) | 单细胞组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、单细胞V(D)J测序 | NA | 单细胞转录组数据、单细胞免疫组库数据 | 恶性胸腔积液与外周血配对样本(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、单细胞V(D)J测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞5'基因表达与V(D)J测序平台 |
| 108 | 2026-05-15 |
Macrophage-derived long non-coding RNAs in cancer: pioneering targets for immune modulation and personalized therapy
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1711686
PMID:42131341
|
综述 | 本文详细探讨了源自巨噬细胞的长链非编码RNA在癌症免疫逃逸、微环境改变和治疗敏感性中的关键作用 | 系统总结了M1和M2巨噬细胞亚型来源的lncRNA在肿瘤进展中的不同调控作用,并强调单细胞RNA测序和CRISPR功能研究在发现新lncRNA靶点中的进展 | NA | 探讨巨噬细胞来源lncRNA在癌症免疫调控和个性化治疗中的潜力 | 巨噬细胞来源的长链非编码RNA及其在癌症免疫调节中的作用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, CRISPR | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 109 | 2026-05-15 |
Integrating single-cell and spatial transcriptomics reveals glycolysis heterogeneity and NEK6-mediated progression in colorectal cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1802329
PMID:42131349
|
研究论文 | 整合单细胞和空间转录组学揭示结直肠癌中糖酵解异质性和NEK6介导的进展 | 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组学与孟德尔随机化分析,揭示结直肠癌中糖酵解异质性的空间组织,并鉴定NEK6为高糖酵解表型的功能相关基因 | 需要进一步在更大样本和体内模型中验证NEK6作为治疗靶点的潜力 | 解析结直肠癌中糖酵解异质性的空间分布及维持恶性高糖酵解状态的分子驱动因素 | 结直肠癌肿瘤微环境中的恶性细胞亚型及其相互作用的免疫细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 孟德尔随机化分析 | 非负矩阵分解(NMF) | 基因表达数据, 空间转录数据, 全基因组关联研究数据 | 未明确说明样本量, 但整合了TCGA队列和GWAS数据 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 110 | 2026-05-15 |
Modulating hypertrophic scar formation by targeting endothelial transient receptor potential vanilloid-1/nuclear factor kappa-B/interleukin-6 axis to regulate angiogenesis
2026, Burns & trauma
IF:6.3Q1
DOI:10.1093/burnst/tkag009
PMID:42131490
|
研究论文 | 该研究探讨了通过靶向内皮细胞中的TRPV1/NF-κB/IL-6轴调控血管生成来调节增生性瘢痕形成 | 首次明确TRPV1通道激活通过NF-κB/IL-6轴调控血管内皮细胞功能促进增生性瘢痕形成的具体分子机制 | 研究主要在兔耳模型中验证,缺乏人体临床试验数据 | 阐明TRPV1激活对增生性瘢痕发病机制的贡献,特别是与异常血管生成的关系 | 增生性瘢痕中的血管内皮细胞 | 数字病理学 | 增生性瘢痕 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据, 组织学图像 | 正常皮肤和增生性瘢痕组织样本(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 111 | 2026-05-15 |
Tumor-Derived Exosomal PDLIM1 Promotes Angiogenesis and Tumor Progression in Papillary Thyroid Carcinoma: Insights From Integrated Single-Cell Transcriptomics and Exosomal Proteomics
2026, Cancer management and research
IF:2.5Q3
DOI:10.2147/CMAR.S589372
PMID:42131580
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研究论文 | 本研究整合单细胞转录组学和外泌体蛋白质组学,揭示肿瘤来源的外泌体PDLIM1在甲状腺乳头状癌中促进血管生成和肿瘤进展的作用 | 首次通过整合单细胞RNA测序和外泌体蛋白质组学数据,鉴定PDLIM1作为肿瘤来源外泌体中的关键蛋白,并揭示其在甲状腺乳头状癌血管生成中的作用 | 样本量较小(4名患者,12个样本),且需要更大规模队列验证和包括拯救实验在内的功能研究以评估靶向PDLIM1的治疗潜力 | 探究甲状腺乳头状癌转移过程中肿瘤来源外泌体介导的细胞间通讯机制,特别是外泌体蛋白在血管生成中的作用 | 甲状腺乳头状癌原发灶和转移灶组织、肿瘤细胞系、内皮细胞(HUVEC) | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序、外泌体蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据 | 4名患者的12个甲状腺乳头状癌样本(包括原发灶和转移灶) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台用于scRNA-seq分析 |
| 112 | 2026-05-15 |
Dysregulated fibroblast-immune crosstalk drives statin-associated erectile dysfunction: integrative evidence from pharmacovigilance and single-cell transcriptomics
2026, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2026.1787039
PMID:42131814
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研究论文 | 通过药物警戒和单细胞转录组学整合分析,揭示他汀类药物相关勃起功能障碍的成纤维细胞-免疫串扰失调机制 | 首次利用药物警戒大数据与单细胞转录组学相结合的策略,系统阐明他汀类药物(特别是阿托伐他汀和瑞舒伐他汀)导致勃起功能障碍的分子机制,并鉴定出成纤维细胞为中心的免疫纤维化微环境失调这一关键病理过程 | 未提及具体局限性信息 | 阐明他汀类药物相关勃起功能障碍的潜在分子和细胞机制,特别是成纤维细胞-免疫串扰在其中的作用 | 他汀类药物(阿托伐他汀和瑞舒伐他汀)与勃起功能障碍的关联及其分子机制 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、qPCR、分子对接、分子动力学模拟 | 蛋白质相互作用网络 | 文本、基因表达数据 | 未提及具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 113 | 2026-05-15 |
Strategic trimodal therapy enhances radiation-induced abscopal response in renal cancer
2025-Dec-02, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07518-8
PMID:41331947
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研究论文 | 提出一种三模态疗法(EY-L、局部放疗和IL-2)增强肾癌放疗后的远隔效应,并在两种小鼠肾癌模型中验证其效果和机制 | 首次将肿瘤靶向脂质体依维莫司/YM155、放疗与IL-2三者联合,协同增强远隔效应,并证明CD8+ T细胞浸润增加和CD163+巨噬细胞减少是关键机制 | 第二种肿瘤模型(LVRCC67)疗效较温和,可能与免疫响应差异有关,提示效果需在不同免疫背景中进一步验证 | 开发并评估一种新型联合治疗方案,以增强肾癌放疗后的远隔效应 | 两种小鼠肾癌细胞系(Renca和LVRCC67) | 机器学习 | 肾癌 | 空间转录组学、免疫组化、CD8+ T细胞耗竭实验 | NA | 图像、转录组数据 | 两种小鼠肾癌模型(Renca和LVRCC67) | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium FFPE空间转录组学 |
| 114 | 2026-05-15 |
An Integrated Single-Cell Atlas of the Mouse Ileum Links Nutrient Metabolism with Epithelial and Immune Crosstalk
2025-12, The Journal of nutrition
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.tjnut.2025.09.034
PMID:41033583
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研究论文 | 该研究生成首个小鼠回肠单细胞图谱,揭示上皮细胞与免疫细胞的营养代谢程序及相互作用 | 首次构建整合的小鼠回肠单细胞图谱,同时分析上皮和免疫细胞,发现维生素代谢相关肠细胞亚群及浆细胞样树突状细胞作为免疫-上皮相互作用的关键调节因子 | 研究仅基于小鼠模型,未涉及人类样本,且时间点单一,缺乏对动态过程的深入研究 | 绘制回肠细胞异质性图谱,定义上皮分化、营养代谢程序及与健康和疾病相关的上皮-免疫互作 | 8周龄雄性C57BL/6J小鼠回肠细胞 | 计算机视觉 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 32,076个回肠细胞,来自8周龄雄性C57BL/6J小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒 |
| 115 | 2026-05-15 |
Single-Cell Analysis Reveals a Critical Role for Macrophage Epsins in Regulating the Origin of Foam Cells in Atherosclerosis
2025-Nov, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.323288
PMID:40931837
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示巨噬细胞Epsin在调控动脉粥样硬化泡沫细胞起源中的关键作用 | 首次发现巨噬细胞特异性Epsin缺失可减少泡沫细胞形成,并揭示其对血管平滑肌细胞向巨噬细胞转化的抑制作用 | 未具体说明,但可能包括小鼠模型与人类的差异,需进一步在人体中验证 | 探究巨噬细胞Epsin在动脉粥样硬化中调控泡沫细胞起源的细胞与分子机制 | 巨噬细胞Epsin对动脉粥样硬化小鼠模型的泡沫细胞形成、血管平滑肌细胞和内皮细胞表型的影响 | 生物信息学 | 心血管疾病(动脉粥样硬化) | 单细胞RNA测序、代谢分析、qRT-PCR、免疫染色、共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据 | WT/Apoe-/-和LysM-DKO/Apoe-/-小鼠(每组3只?具体数量未明确) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 116 | 2026-05-15 |
scRNA-seq of Penaeus japonicus hemocytes under environmentally-induced restriction of sand-diving behavior
2025-11, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111125
PMID:41038398
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析日本对虾血细胞在环境诱导的沙潜行为限制下的分子响应 | 首次利用单细胞转录组技术研究日本对虾血细胞在底质缺失条件下的分子变化,识别出与沙潜行为调控相关的关键候选基因 | 关键候选基因(如trpa1、trpm和cut蛋白家族)的具体功能有待进一步验证 | 探究日本对虾在沙潜行为受限时的分子响应机制 | 日本对虾(Penaeus japonicus)血细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、qRT-PCR、RNA原位杂交 | NA | 基因表达数据 | 日本对虾血细胞样品,涉及三种培养系统(沙组、无沙组、无沙应激组) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 117 | 2026-05-15 |
ScASplicer: An interactive shiny/R application for alternative splicing analysis of single-cell sequencing
2025-11, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111116
PMID:41038402
|
研究论文 | 开发了一个名为ScASplicer的交互式Shiny/R应用程序,用于单细胞测序的可变剪接分析 | 通过开发Python包简化输入文件生成并扩展MARVEL至多细胞群体分析,首次提供无需编程的交互式单细胞可变剪接探索平台 | 未说明限制条件 | 为单细胞RNA测序的可变剪接分析提供一个通用且用户友好的网络应用程序 | 单细胞RNA测序数据中的可变剪接事件 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 118 | 2026-05-15 |
SerpinB2 promotes the proliferation of glioma cells by regulating the cell cycle through the Wnt/β-catenin signaling pathway
2025-11, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111148
PMID:41176096
|
研究论文 | 本文结合转录组测序和单细胞转录组分析,揭示了SerpinB2通过Wnt/β-catenin信号通路调控细胞周期促进胶质瘤细胞增殖的分子机制 | 首次利用转录组与单细胞转录组联合分析阐明SerpinB2在胶质瘤中的促增殖机制,并通过Wnt/β-catenin通路调控细胞周期S期 | 未提及具体局限性,可能包括样本量有限及动物模型与人类肿瘤的差异 | 阐明SerpinB2在胶质瘤细胞增殖中的分子机制 | 胶质瘤细胞及荷瘤小鼠模型 | 机器学习和数字病理学 | 胶质瘤 | 转录组测序、单细胞测序 | NA | 转录组序列数据、单细胞转录组数据 | CGGA和TISCH数据库中的胶质瘤样本及荷瘤小鼠 | NA | 单细胞转录组学、批量RNA测序 | NA | NA |
| 119 | 2026-05-15 |
A bioinformatics pipeline for identifying homoplasmic and heteroplasmic mitochondrial DNA SNVs in single-cell RNA-Seq datasets
2025-11, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111122
PMID:41061772
|
研究论文 | 开发了一个用于在单细胞RNA测序数据中鉴定同质和异质性线粒体DNA单核苷酸变异的生物信息学流程 | 该流程通过质控、比对到线粒体基因组、SNV识别和注释,并使用覆盖率阈值检测异质性,同时过滤测序错误和新颖的删除策略,包括链偏倚、RNA修饰错误和过度代表变异 | 未在本文中明确讨论,但可能依赖于scRNA-seq数据的质量和现有比对方法的准确性 | 提高从公共scRNA-seq数据中可靠检测mDNA SNV的能力,理解其机制和临床表现 | 单细胞RNA测序数据中的线粒体DNA同质和异质性单核苷酸变异 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 120 | 2025-10-31 |
Mapping disease-specific vascular cell populations responsible for obliterative arterial remodelling during the development of pulmonary arterial hypertension
2025-Oct-28, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf146
PMID:40875786
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别肺动脉高压发展中导致闭塞性动脉重构的疾病特异性血管细胞群 | 首次在肺动脉高压模型中通过多时间点单细胞转录组分析鉴定出两种疾病特异性内皮细胞群,并发现TM4SF1作为动脉重构的新治疗靶点 | 研究基于动物模型,在人类患者中的验证仍需进一步研究 | 阐明肺动脉高压发展中闭塞性动脉病变形成的细胞机制 | 肺动脉高压大鼠模型和PAH患者的肺组织细胞 | 单细胞组学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序,RNA velocity分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个时间点的肺动脉高压模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |