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当前共找到 35512 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-01-23 |
Microbial production of short-chain fatty acids attenuates long-term neurologic impairment after traumatic brain injury
2025-Dec-09, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03615-z
PMID:41366428
|
研究论文 | 本研究探讨了通过饮食促进微生物产生短链脂肪酸（SCFAs）如何减轻创伤性脑损伤（TBI）后的长期神经功能缺损 | 在TBI模型中，首次结合高产量SCFA饮食、纵向肠道微生物组分析和单细胞转录组学，系统揭示了SCFAs通过重塑肠道菌群、促进神经发生和诱导抗炎表型来发挥神经保护作用的机制 | 研究基于小鼠模型，结果向人类转化需进一步验证；观察期为6个月，更长时期的效应尚不清楚 | 探究SCFAs在TBI后长期神经功能缺损中的保护作用及其机制 | C57BL6/J小鼠 | 数字病理学 | 创伤性脑损伤 | 16S rRNA扩增子测序，宏基因组测序，单细胞RNA测序 | NA | 序列数据，基因表达数据 | 使用C57BL6/J小鼠，具体数量未在摘要中明确说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Genomics | 遵循10x Genomics协议进行单细胞RNA测序 |
| 102 | 2026-01-23 |
Single-cell RNA sequencing reveals genes relevant to periodontal therapy and periodontitis
2025-Dec-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，比较了健康与牙周炎状态下口腔黏膜和牙龈的基因表达模式及细胞间相互作用 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示了口腔黏膜与牙龈的分子差异，并发现了牙周炎中连接上皮细胞的抗氧化基因表达变化及成纤维细胞中普遍的自分泌信号 | 研究基于单细胞RNA测序数据，功能验证和机制研究尚待深入 | 探究口腔黏膜与牙龈的分子差异及牙周感染对组织间相互作用的影响 | 人类口腔黏膜和牙龈组织（健康与牙周炎状态） | 单细胞组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 103 | 2026-01-23 |
The Glutamine Metabolic Switch Influences the Response of Neonatal Intestinal Macrophages to Breast Milk
2025-Nov-29, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101683
PMID:41320153
|
研究论文 | 本研究探讨了谷氨酰胺和谷氨酸在新生儿坏死性小肠结肠炎（NEC）中对肠道巨噬细胞代谢重编程的双重作用 | 揭示了谷氨酰胺代谢开关在新生儿肠道巨噬细胞响应母乳中的关键作用，并发现其效果具有时间依赖性 | 研究主要基于大鼠模型和体外实验，人类数据仅来自已发表的scRNA-seq数据重分析，缺乏直接的人类干预实验验证 | 探究谷氨酰胺和谷氨酸如何影响新生儿肠道炎症及其机制 | 新生儿大鼠NEC模型、骨髓来源巨噬细胞（BMDMs）、回肠巨噬细胞 | NA | 坏死性小肠结肠炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据、流式细胞数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 104 | 2026-01-23 |
In vitro models to mimic tumor endothelial cell-mediated immune cell reprogramming in lung adenocarcinoma
2025-Nov-27, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03576-4
PMID:41310721
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研究论文 | 本研究通过体外模型探究了非小细胞肺癌中肿瘤内皮细胞如何调节免疫细胞，揭示了其在肿瘤微环境免疫抑制中的作用 | 利用2D和3D共培养模型结合单细胞RNA测序技术，首次在非小细胞肺癌中系统揭示了肿瘤内皮细胞的异质性及其通过MIF信号促进M2样巨噬细胞极化的机制 | 研究主要基于体外模型，可能无法完全模拟体内肿瘤微环境的复杂性 | 探究非小细胞肺癌中肿瘤内皮细胞对免疫细胞的重编程作用及其机制 | 非小细胞肺癌细胞、正常内皮细胞、免疫细胞（CD4 T细胞、CD8 T细胞、巨噬细胞） | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组、蛋白质组、激酶组数据 | 多种非小细胞肺癌细胞系及患者来源的肿瘤内皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 105 | 2026-01-23 |
CelLink: integrating single-cell multi-omics data with weak feature linkage and imbalanced cell populations
2025-Nov-26, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1270
PMID:41335468
|
研究论文 | 本文提出了一种名为CelLink的新型单细胞多组学数据整合方法，旨在解决特征弱关联和细胞群不平衡的挑战 | CelLink通过归一化和平滑特征谱来对齐数据集尺度，并采用多阶段流程迭代应用最优传输算法，动态优化细胞间对应关系，有效适应弱特征关联和不平衡细胞群 | 未在摘要中明确提及 | 开发一种高效整合单细胞多组学数据的方法，以克服特征弱关联和细胞群不平衡的问题 | 单细胞多组学数据，包括scRNA-seq、空间蛋白质组学和配对CITE-seq数据 | 机器学习 | NA | 单细胞多组学技术 | 最优传输算法 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间蛋白质组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 106 | 2026-01-23 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals the heterogeneity and functional characteristics of macrophage subpopulations in colon cancer
2025-Nov-23, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04002-z
PMID:41276730
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了结肠癌中巨噬细胞亚群的异质性和功能特征，并重点探讨了SPP1在巨噬细胞亚型中的作用 | 首次在结肠癌中利用单细胞RNA测序技术系统鉴定出五个巨噬细胞亚型，并发现Macrophages_SPP1亚型在肿瘤中显著富集，具有独特的代谢和免疫抑制功能，同时通过计算机模拟SPP1敲除揭示了其在免疫抑制肿瘤微环境形成中的关键作用 | 研究仅基于三名结肠癌患者的样本，样本量较小，且为观察性研究，缺乏体内实验验证 | 探究结肠癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其功能特征，特别是SPP1在巨噬细胞亚型中的作用 | 结肠癌患者的肿瘤组织和癌旁正常组织 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三名结肠癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 107 | 2026-01-23 |
Single-cell transcriptome atlas of adult male and female human hookworm Ancylostoma ceylanicum
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113846
PMID:41362773
|
研究论文 | 本研究构建了成年雄性和雌性锡兰钩虫的单细胞转录组图谱，揭示了性别特异性基因表达和细胞多样性 | 首次提供了锡兰钩虫的全面单细胞转录组图谱，揭示了性别间细胞类型差异和新的分子标记 | 未提及样本数量或技术重复的详细信息，可能限制统计分析的稳健性 | 推进对钩虫生物学的基本理解，为开发新的治疗或疫苗靶点提供基础 | 成年雄性和雌性锡兰钩虫（Ancylostoma ceylanicum） | 单细胞组学 | 钩虫病 | 单细胞RNA测序，共聚焦显微镜，RNA荧光原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据，显微镜图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 108 | 2026-01-23 |
Spatial transcriptomics in bone research: navigating hype and hurdles
2025-Nov-13, Pathology
IF:3.6Q1
DOI:10.1016/j.pathol.2025.10.003
PMID:41475999
|
综述 | 本文综述了空间转录组学在骨骼研究中的应用，探讨了其技术优势、组织处理挑战、平台限制及未来方向 | 系统总结了空间转录组学在骨骼研究中的独特应用挑战，如骨组织脱钙问题，并整合了平台比较与生物信息学分析考量 | 未提出具体的新实验数据或技术解决方案，主要基于现有文献综述，缺乏对新兴平台如Visium FFPE在骨骼中应用的深入评估 | 评估空间转录组学技术在骨骼研究中的适用性、挑战及未来潜力 | 骨骼组织样本、动物模型及肌肉骨骼系统 | 空间转录组学 | 肌肉骨骼疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达空间数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 109 | 2026-01-23 |
Gsx2 Regulates Oligodendrocyte Precursor Formation in the Zebrafish Spinal Cord
2025-Oct-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.18.683250
PMID:41279990
|
研究论文 | 本研究利用斑马鱼模型，通过单细胞RNA测序和单核ATAC测序数据，揭示了Gsx2在调控脊髓中少突胶质前体细胞形成时间中的作用 | 首次在斑马鱼脊髓中识别出pre-OPCs亚群，并发现Gsx2通过调控基因网络影响OPC形成的时机，而非分化过程 | 研究主要基于斑马鱼模型，结果在哺乳动物中的普适性需进一步验证，且基因调控网络的具体机制尚未完全阐明 | 探究脊髓神经前体细胞向少突胶质细胞谱系分化的分子机制，特别是Gsx2在OPC形成中的功能 | 斑马鱼脊髓中的神经前体细胞、pre-OPCs、少突胶质前体细胞及少突胶质细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 单核ATAC测序, CRISPR/Cas9基因组编辑 | NA | 单细胞转录组数据, 单核染色质可及性数据 | 斑马鱼胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核ATAC-seq | NA | NA |
| 110 | 2026-01-23 |
Human brain cell types shape host-rabies virus transcriptional interactions revealing a preexisting pro-viral astrocyte subpopulation
2025-Sep-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116159
PMID:40864551
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析人脑细胞共培养模型，揭示了狂犬病毒与宿主细胞类型之间的转录相互作用，并发现了一个预先存在的促病毒星形胶质细胞亚群 | 首次在人类脑细胞中利用单细胞RNA测序技术，比较野生型狂犬病毒与无法拮抗干扰素和NF-κB反应的突变体，揭示了细胞类型特异性的病毒-宿主转录相互作用，并意外发现了一个独立的促病毒星形胶质细胞亚群 | 研究基于体外共培养模型，可能无法完全模拟体内脑环境的复杂性；样本规模可能有限，且未涉及其他神经病毒或更广泛的细胞类型 | 探究病毒-宿主细胞相互作用和先天免疫拮抗如何影响狂犬病毒在不同脑细胞类型中的感染动态 | 人脑细胞共培养模型中的狂犬病毒及其突变体，以及包括星形胶质细胞和小胶质细胞在内的多种脑细胞类型 | 单细胞转录组学 | 狂犬病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量，但涉及人脑细胞共培养 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 111 | 2026-01-23 |
Single-cell atlas of human liver and blood immune cells across fatty liver disease stages reveals distinct signatures linked to liver dysfunction and fibrogenesis
2025-Sep, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02255-y
PMID:40883571
|
研究论文 | 本文提供了一个跨越MASLD/MASH疾病阶段的人类肝脏和血液免疫细胞的单细胞图谱，揭示了与肝功能障碍和纤维化相关的独特免疫特征 | 首次在完整谱系MASLD/MASH人类队列中，通过配对外周血和肝脏细针穿刺样本构建单细胞RNA测序图谱，识别了疾病进展中的阶段特异性免疫调控程序 | 研究依赖于有限的人类肝脏样本获取，且缺乏跨MASLD/MASH阶段的广泛研究，可能影响目标识别的全面性 | 揭示MASLD/MASH疾病进展中免疫细胞的作用机制，识别阶段特异性免疫靶点 | 人类肝脏和血液免疫细胞，包括调节性T细胞、单核髓源性抑制细胞、TREM2S100A9巨噬细胞和S100HLA 2型常规树突状细胞等 | 数字病理学 | 脂肪肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 来自完整谱系MASLD/MASH人类队列的配对外周血和肝脏细针穿刺样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 112 | 2026-01-23 |
Decoding Cellular Stress States for Toxicology Using Single-Cell Transcriptomics
2025-Aug-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.10.657506
PMID:40766395
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术解码HepaRG细胞在多种化学物质暴露下的应激状态 | 采用TempO-LINC平台生成单细胞转录组图谱，系统分析多种应激反应通路，并利用文献来源的基因特征对单个细胞进行评分和聚类，揭示细胞应激状态的动态变化 | 研究仅针对HepaRG细胞系，未涉及其他细胞类型或体内模型，且化学暴露时间固定为24小时，可能未捕捉到更早期或更晚期的应激响应 | 解码细胞在毒理学相关化学物质暴露下的应激状态，以理解细胞适应性反应与终末结局之间的转换 | HepaRG细胞（人类肝细胞系） | 单细胞转录组学 | 毒理学 | 单细胞转录组测序（SCTr） | NA | 单细胞转录组数据 | 约40,000个HepaRG细胞，暴露于7种化学物质（依托泊苷、布雷菲德菌素A、环己酰亚胺、鱼藤酮、tBHQ、曲格列酮、衣霉素）的三种浓度下24小时 | NA | 单细胞RNA-seq | TempO-LINC | TempO-LINC平台用于生成单细胞转录组图谱 |
| 113 | 2026-01-23 |
Segger: Fast and accurate cell segmentation of imaging-based spatial transcriptomics data
2025-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.14.643160
PMID:40161614
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为segger的快速准确细胞分割方法，用于成像空间转录组学数据 | 提出了一种基于异构图表示和图神经网络的细胞分割方法，将细胞分割视为转录本到细胞的链接预测任务，并利用单细胞RNA-seq信息改进转录本分配 | NA | 解决成像空间转录组学中转录本准确分配到细胞的问题 | 成像空间转录组学数据 | 计算机视觉 | NA | 成像空间转录组学 | 图神经网络 | 图像 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | NA |
| 114 | 2026-01-23 |
Smoothie: Efficient Inference of Spatial Co-expression Networks from Denoised Spatial Transcriptomics Data
2025-Mar-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.26.640406
PMID:40060619
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Smoothie的方法，用于从去噪的空间转录组学数据中高效推断空间共表达网络 | Smoothie通过高斯平滑去噪空间转录组学数据，并构建和整合全基因组共表达网络，利用隐式和显式并行化技术，可扩展到超过1亿个空间解析点，具有快速运行时间和低内存使用 | NA | 从高分辨率空间转录组学数据中提取深度生物学见解，包括基因模块检测、功能注释、基因表达与基因组结构关联以及多样本比较 | 空间转录组学数据中的基因表达相关性 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 115 | 2026-01-23 |
Novel Meningoencephalomyelitis Associated With Vimentin IgG Autoantibodies
2025-Mar-01, JAMA neurology
IF:20.4Q1
DOI:10.1001/jamaneurol.2024.4763
PMID:39836414
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研究论文 | 本研究鉴定了一种与波形蛋白IgG自身抗体相关的新型脑膜脑脊髓炎综合征 | 首次发现并描述了靶向星形胶质细胞中间丝蛋白波形蛋白的自身抗体与一种独特的脑膜脑脊髓炎综合征的关联 | 研究为回顾性病例系列，样本量较小（14例患者），且随访时间中位数仅为23个月 | 表征一种与未知星形胶质细胞自身抗体相关的脑膜脑脊髓炎综合征 | 患有未明确中枢神经系统自身免疫性疾病且具有相似临床和影像学特征的患者 | NA | 脑膜脑脊髓炎 | 单细胞RNA测序，基于细胞的测定，基于组织的测定 | NA | RNA序列数据，临床数据，影像学数据 | 14名候选患者（其中2名索引患者进行了scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 116 | 2026-01-23 |
LST1: a novel biomarker for efferocytosis in the co-occurrence of type 2 diabetes mellitus and clear cell renal cell carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1737749
PMID:41488617
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，识别出LST1是2型糖尿病与肾透明细胞癌共病的关键调控基因，并验证了其在巨噬细胞介导的胞葬作用及免疫调控中的核心作用 | 首次发现LST1作为T2DM与ccRCC共病的关键调控因子，揭示了其在连接两种疾病的免疫调控通路中的新作用，为研究糖尿病与恶性肿瘤共存的免疫机制提供了新框架 | 研究主要基于公共数据库的单细胞转录组数据，虽然进行了体内外验证，但样本来源和数量可能有限，且具体分子机制有待进一步深入探索 | 识别T2DM与ccRCC共病的共同分子通路和新型生物标志物 | 2型糖尿病和肾透明细胞癌的共病模型 | 生物信息学 | 肾透明细胞癌, 2型糖尿病 | 单细胞转录组测序, 机器学习算法, GSEA算法, 体内外实验验证 | 机器学习算法（未指定具体模型） | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 117 | 2026-01-23 |
High-resolution single-cell RNA sequencing using canFam4 reveals novel immune subsets and checkpoint programs in healthy dogs
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1680437
PMID:41488614
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研究论文 | 本研究利用10x Genomics平台和canFam4基因组，构建了健康小型犬外周血白细胞的单细胞转录组图谱，揭示了新的免疫亚群和检查点程序 | 首次使用canFam4基因组进行高分辨率单细胞RNA测序，在健康犬中识别出51个独特的免疫亚群，包括在canFam3.1研究中未被充分代表的细胞类型，并揭示了免疫检查点机制 | 研究仅基于六只健康小型犬，样本量有限，可能无法完全代表所有犬种或健康状况 | 旨在通过单细胞RNA测序高分辨率解析健康犬的免疫异质性，并识别新的免疫亚群和功能特征 | 六只健康小型犬的外周血白细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 六只健康小型犬 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics平台用于单细胞RNA测序 |
| 118 | 2026-01-23 |
scVAR: integrating genomics and transcriptomics from single-cell RNA-seq -insights from leukemia case studies
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1604484
PMID:41555915
|
研究论文 | 本文介绍了scVAR，一种利用变分自编码器从单细胞RNA测序数据中学习和整合遗传变异的计算框架，应用于白血病案例研究 | 开发了基于交叉注意力融合层的编码器-解码器架构，将转录组和变异信息整合到统一潜在表示中，增强了在噪声和稀疏条件下检测细微细胞差异的能力 | 由于使用3' scRNA-seq，变异检测仅限于捕获区域 | 整合单细胞RNA测序中的基因组和转录组信息，以更好地表征细胞状态和疾病过程 | 急性髓系白血病（AML）和急性淋巴细胞白血病（ALL） | 机器学习 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 变分自编码器（VAE） | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 119 | 2026-01-23 |
Integration of single cell and bulk transcriptomic analyses identifies FAM189A2 as a key prognostic gene in lung cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1701806
PMID:41567189
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组分析，识别出FAM189A2作为肺癌的关键预后基因 | 结合单细胞RNA测序与批量转录组数据，构建了一个八基因LASSO-Cox风险模型，并在多个独立队列中验证，同时通过功能实验证实FAM189A2的肿瘤抑制功能 | 研究样本量相对较小（13个原发肿瘤），且主要基于回顾性数据，需要前瞻性研究进一步验证 | 探究肺癌中恶性细胞状态与患者预后及治疗脆弱性的关联 | 肺癌肿瘤微环境中的细胞群体，特别是恶性上皮细胞亚群 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序 | LASSO-Cox风险模型 | 转录组数据 | 13个原发肺癌肿瘤及匹配的正常肺组织（共48,149个细胞），外加多个外部验证队列（TCGA-LUAD，GSE131907，GSE30219，GSE31210） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 120 | 2026-01-23 |
Decoding HSP90AA1-driven inflammatory signaling in the uveal melanoma microenvironment: an integrated analysis at single-cell resolution
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1730622
PMID:41567202
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研究论文 | 本研究通过整合计算生物学筛选和单细胞分辨率分析，解码了HSP90AA1在葡萄膜黑色素瘤（UVM）肿瘤微环境中的关键调控作用，并验证其作为治疗靶点的潜力 | 首次在单细胞分辨率下整合网络计算筛选与scRNA-seq分析，系统识别并验证HSP90AA1作为UVM炎症和免疫微环境的核心调控因子，揭示其通过NF-κB和STAT3等信号通路影响肿瘤进展的新机制 | 研究主要基于计算分析和体外/体内实验验证，未涉及大规模临床队列验证，且未探讨HSP90AA1抑制剂在人体中的具体疗效和安全性 | 解码UVM肿瘤微环境中的关键调控因子，以理解疾病进展并开发新的免疫治疗策略 | 葡萄膜黑色素瘤（UVM）的肿瘤微环境，特别是恶性细胞、CD8+ T细胞和巨噬细胞等细胞类型 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），siRNA介导的敲低，体外功能实验，体内异种移植模型 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |