单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 36532 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	平台公司	平台技术	具体产品	平台详情
101	2026-02-19	Systemic CSF1R Targeting Depletes Pathogenic MPS Bubs and Ameliorates Psoriasis via PPARα-mediated Resolution 2026, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.128248 PMID:41695464	研究论文	本研究通过整合人类单细胞与空间转录组学数据及小鼠模型，揭示了CSF1R-PPARα轴在银屑病发病机制中的关键作用，并证明系统性靶向CSF1R可有效清除致病性MPS细胞群并缓解疾病	首次定义了致病性CSF1R MPS细胞亚群，阐明了其通过配体驱动扩增和抑制PPARα来维持炎症的机制，并证明系统性CSF1R靶向治疗比局部阻断更有效	研究主要基于小鼠模型，人类数据的验证仍需进一步深入	识别致病性CSF1R MPS细胞亚群，阐明其配体-受体环路，并定义CSF1R-PPARα轴在疾病发病机制中的作用	人类银屑病患者样本及小鼠咪喹莫特诱导的银屑病模型	单细胞组学	银屑病	单细胞转录组测序，空间转录组学	小鼠疾病模型	单细胞RNA测序数据，空间转录组数据	未明确说明具体样本数量	NA	单细胞RNA-seq，空间转录组学	NA	NA
102	2026-02-19	JGR-NMF: joint graph-regularized non-negative matrix factorization for spatial domain identification 2026, PeerJ IF:2.3Q2 DOI:10.7717/peerj.20585 PMID:41695707	研究论文	提出一种联合图正则化非负矩阵分解方法，用于空间转录组学中的空间域识别	引入自适应邻域图构建策略，通过幂变换优化邻域大小，并整合自适应kNN图与空间邻接矩阵	NA	提高空间转录组学中空间域识别的准确性和鲁棒性	乳腺癌数据集、小鼠肾脏数据集和小鼠胚胎数据集	空间转录组学	乳腺癌	空间转录组学	非负矩阵分解	空间转录组数据	两个乳腺癌数据集、一个小鼠肾脏数据集和一个小鼠胚胎数据集	NA	空间转录组学	NA	NA
103	2026-02-19	Comprehensive spatial and immune profiling of metastatic mismatch repair-deficient colorectal cancer reveals response to immunotherapy 2026, Immunotherapy advances IF:4.1Q2 DOI:10.1093/immadv/ltag001 PMID:41696450	研究论文	本研究通过综合空间和免疫分析，探索了转移性错配修复缺陷结直肠癌对免疫检查点抑制剂的响应机制	结合bulk和单细胞RNA测序与多重免疫组化，首次在dMMR CRC患者中系统分析了多个转移灶的空间免疫微环境异质性	研究仅基于单个患者样本，样本量有限，结果需在更大队列中验证	探究dMMR结直肠癌对免疫治疗响应异性的分子和空间决定因素	转移性错配修复缺陷结直肠癌患者的多个转移灶组织	数字病理学	结直肠癌	单细胞RNA测序, 多重免疫组化	NA	RNA测序数据, 图像数据	1例患者的5个转移灶（结肠、肝脏、腹膜、左卵巢、右卵巢）	NA	单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq	NA	NA
104	2026-02-19	Identification of CXCL12 as a key gene of trophoblast and endometrial stromal cell decidualization in pregnancy via scRNA-seq and experimental validation 2026, Frontiers in molecular biosciences IF:3.9Q2 DOI:10.3389/fmolb.2026.1768015 PMID:41696581	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和实验验证，探讨了CXCL12在复发性流产中母胎界面的作用及其机制	利用单细胞RNA测序技术构建正常与复发性流产样本的母胎界面单细胞图谱，并首次系统验证CXCL12在滋养层细胞增殖、迁移、侵袭及子宫内膜基质细胞蜕膜化中的关键作用	研究主要基于体外细胞实验，缺乏体内动物模型验证；样本量可能有限，需进一步扩大以增强统计效力	探究CXCL12在复发性流产发病机制中的作用，为潜在诊断和治疗策略提供实验依据	正常与复发性流产妊娠早期的母胎界面细胞，包括滋养层细胞和子宫内膜基质细胞	数字病理学	复发性流产	单细胞RNA测序，MTT测定，细胞划痕实验，Transwell侵袭实验	NA	单细胞RNA测序数据，细胞实验数据	正常与复发性流产样本的母胎界面细胞	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
105	2026-02-19	The immunopathological crosstalk of diabetic periodontitis: Single-cell insights into monocyte dysregulation 2026, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0341333 PMID:41701724	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了糖尿病牙周炎中单核细胞的免疫病理学交互作用及其功能异质性	首次通过单细胞RNA测序系统表征了糖尿病牙周炎患者外周血单核细胞亚群的动态变化和功能失调，并识别了关键的转录因子和信号通路	研究样本量有限，且仅关注了外周血单核细胞，未直接分析牙周组织中的免疫细胞	探究糖尿病与牙周炎之间的免疫病理学交互机制，特别是单核细胞在其中的作用	健康对照者、牙周炎患者以及糖尿病牙周炎患者的外周血单核细胞	数字病理学	牙周炎与2型糖尿病	单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	来自健康对照、牙周炎患者和糖尿病牙周炎患者的外周血单核细胞样本	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
106	2026-02-19	Aging-related CD8+ T cell alterations and calcium/calmodulin dependent protein kinase 1D activation in the pathogenesis of diabetic kidney disease 2026, PeerJ IF:2.3Q2 DOI:10.7717/peerj.20762 PMID:41704234	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析，揭示了CD8+ T细胞在糖尿病肾病和衰老过程中的变化，并发现CAMK1D作为连接衰老与糖尿病肾损伤的关键分子风险因子	首次结合单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析，系统揭示了CD8+ T细胞在糖尿病肾病和衰老过程中的动态变化，并鉴定出CAMK1D作为关键的共享分子风险因子	研究样本量未明确说明，且机制验证主要基于相关性分析，需要进一步的实验验证	探究衰老、免疫浸润与糖尿病肾病之间的细胞和分子机制	年轻个体、老年个体和糖尿病肾病患者的免疫细胞，特别是CD8+ T细胞	单细胞组学	糖尿病肾病	单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, 免疫荧光染色	NA	单细胞RNA测序数据, 基因表达数据	NA	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
107	2026-02-19	Macrophage-Mediated Cellular Communication Networks in Lung Squamous Cell Carcinoma and Adenocarcinoma Revealed by Single-Cell Sequencing 2026, Mediators of inflammation IF:4.4Q2 DOI:10.1155/mi/9934067 PMID:41704746	研究论文	本研究通过单细胞测序揭示了肺鳞状细胞癌和肺腺癌中巨噬细胞介导的细胞通讯网络，识别了亚型特异性上皮特征和关键信号通路	首次利用单细胞RNA测序数据系统比较了LUSC和LUAD的肿瘤微环境特征，发现了亚型特异性的上皮细胞特征（S3和S4）及其与免疫细胞（如巨噬细胞和中性粒细胞）的独特通讯网络，并确定了新的潜在治疗靶点（如CD44和CD74）	研究依赖于公开可用的单细胞测序数据集，可能受到批次效应和数据异质性的影响；样本量相对有限，且未进行实验验证	探索肺鳞状细胞癌和肺腺癌的肿瘤微环境特征、细胞间相互作用及潜在治疗靶点	肺鳞状细胞癌和肺腺癌患者肿瘤组织中的细胞	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据、批量RNA测序数据	基于三个公开scRNA-seq数据集（GSE200972、GSE117570、GSE127465）和TCGA批量RNA-seq数据	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
108	2026-02-19	Single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomic analysis reveal a distinct population of G6PD+ cells with aberrant bile acid metabolism in hepatocellular carcinoma 2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2026.1739293 PMID:41705236	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析，揭示了肝细胞癌中一群具有异常胆汁酸代谢的G6PD+细胞的独特作用及其与肿瘤进展的关系	首次整合单细胞和空间转录组数据，构建了胆汁酸代谢评分系统，并鉴定出G6PD+恶性细胞亚群在肿瘤边界富集，揭示了胆汁酸代谢通过促进血管网络形成和免疫抑制微环境驱动肝癌进展的新机制	研究主要基于转录组数据，功能验证主要在体外进行，缺乏体内动物模型的深入验证	探究胆汁酸代谢在肝细胞癌进展中的生物学功能、临床意义及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力	肝细胞癌患者样本中的肿瘤细胞、巨噬细胞和内皮细胞	数字病理学	肝癌	单细胞RNA测序, 空间转录组学	机器学习算法	转录组数据	67名肝细胞癌患者	NA	单细胞RNA-seq, 空间转录组学	NA	NA
109	2026-02-19	Complement activation and M2-like macrophage accumulation in anti-MDA5 monoclonal antibody-induced hepatic injury in mice 2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2026.1707202 PMID:41705237	研究论文	本研究探讨了抗MDA5单克隆抗体诱导的小鼠肝损伤中补体激活和M2样巨噬细胞积累的作用	首次在抗MDA5抗体阳性皮肌炎相关的肝损伤模型中，揭示了补体激活和M2样巨噬细胞积累的机制，并利用C3缺陷小鼠验证了补体的关键作用	研究样本量较小（5例尸检样本），且为小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证	阐明抗MDA5抗体阳性皮肌炎患者肝损伤的病理机制	抗MDA5抗体阳性皮肌炎患者的尸检肝组织、人MDA5转基因小鼠	数字病理学	皮肌炎	免疫组化、Western blotting、单细胞RNA测序	NA	图像、蛋白质印迹数据、单细胞RNA测序数据	5例尸检肝组织样本、人MDA5转基因小鼠（野生型和C3缺陷型）	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
110	2026-02-19	METTL14 modulates the nasopharyngeal carcinoma microenvironment via m6A-modified YWHAH identified through single-cell and machine learning analyses 2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2026.1717039 PMID:41705255	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和机器学习分析，揭示了METTL14通过m6A修饰调控YWHAH在鼻咽癌微环境中的关键作用	整合单细胞RNA测序、机器学习算法和MeRIP-seq数据，首次鉴定出YWHAH作为METTL14调控的关键m6A修饰基因，并阐明了其在鼻咽癌免疫微环境中的调控机制	研究主要基于公共数据库的测序数据，实验验证主要在细胞水平进行，缺乏体内动物模型或临床样本的进一步验证	探究m6A甲基化修饰在鼻咽癌肿瘤微环境中的作用机制	鼻咽癌肿瘤微环境中的细胞类型，包括B细胞、上皮细胞和髓系细胞	机器学习	鼻咽癌	单细胞RNA测序，批量RNA测序，MeRIP-seq	机器学习算法	RNA测序数据	NA	NA	单细胞RNA-seq，批量RNA-seq	NA	NA
111	2026-02-19	Solute carrier inhibitors in kidney disease therapy: mechanisms and clinical implications 2025-Dec-22, Diabetes research and clinical practice IF:6.1Q1 DOI:10.1016/j.diabres.2025.113071 PMID:41443301	综述	本文系统综述了靶向五种溶质载体（SLCs）的抑制剂在肾脏疾病治疗中的药理机制、生理病理作用及临床应用前景	基于最新的单细胞测序证据，系统性地聚焦于五种已被验证为治疗靶点的SLCs，并综述其选择性抑制剂的开发与应用	NA	探讨溶质载体（SLCs）抑制剂在肾脏疾病治疗中的作用机制与临床潜力	五种特定的溶质载体（SLC5A2, SLC7A11, SLC12A3, SLC22A12, SLC47A1）及其抑制剂	NA	慢性肾病、糖尿病肾病、急性肾损伤	单细胞测序	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
112	2026-02-19	Proteome-Wide Mendelian Randomization Implicates Shared Necroptosis-Ferroptosis Effectors in Causal Pathways of Multiple Sclerosis Susceptibility 2025-Dec-12, Annals of the New York Academy of Sciences IF:4.1Q1 DOI:10.1111/nyas.70162 PMID:41387240	研究论文	本研究采用全蛋白质组孟德尔随机化方法，揭示了铁死亡和坏死性凋亡通路在多重硬化症易感性中的因果作用，并识别出关键效应蛋白如TNFAIP3和IFNA4	首次在全蛋白质组水平上应用孟德尔随机化验证了铁死亡和坏死性凋亡通路与多重硬化症易感性的因果关联，并发现了新的治疗靶点	研究主要基于遗传工具变量，需要进一步实验验证这些蛋白在疾病机制中的具体功能	探究铁死亡和坏死性凋亡通路及其上游调节因子与多重硬化症风险之间的因果联系	多重硬化症相关的蛋白质、基因表达数据及免疫特征	生物信息学	多重硬化症	孟德尔随机化、RNA-seq、单细胞RNA-seq	NA	蛋白质组数据、转录组数据	NA	NA	单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq	NA	NA
113	2026-02-19	Expression of ACTR3 in cervical cancer and impact on immune cell infiltration and prognosis: A comprehensive analysis based on bulk RNA-Seq and single-cell RNA-Seq 2025-Dec-05, Medicine IF:1.3Q2 DOI:10.1097/MD.0000000000046316 PMID:41366959	研究论文	本研究通过整合bulk RNA-Seq和单细胞RNA-Seq数据，分析了ACTR3在宫颈癌中的表达及其对免疫细胞浸润和预后的影响	首次将PI3K/Akt/mTOR通路基因ACTR3与宫颈癌免疫微环境及预后联系起来，并整合单细胞数据解析ACTR3表达的免疫细胞亚群	研究主要基于生物信息学分析，需要更多实验验证ACTR3的功能机制	探究ACTR3过表达是否影响宫颈癌生存及其对肿瘤免疫微环境的影响	宫颈鳞状细胞癌和宫颈内膜腺癌	生物信息学	宫颈癌	RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 免疫组化	LASSO Cox回归, 预后模型, 列线图	基因表达数据, 单细胞数据, 临床数据	未明确具体样本数量	NA	bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq	NA	NA
114	2026-02-19	Ligustrazine attenuates ferroptosis in proximal straight tubule cells via IGF2BP1-Odc1 regulation in a CKD model 2025-Dec-03, International journal of surgery (London, England) DOI:10.1097/JS9.0000000000004073 PMID:41342566	研究论文	本研究探讨了川芎嗪通过调控IGF2BP1-Odc1通路减轻慢性肾病模型中近端直小管细胞铁死亡的作用机制	首次发现川芎嗪通过干扰IGF2BP1与m6A修饰的Odc1 mRNA结合，缩短Odc1 mRNA半衰期，从而抑制铁死亡，为慢性肾病治疗提供了新靶点	研究主要基于大鼠模型和原代细胞实验，临床转化效果需进一步验证；机制研究集中于IGF2BP1-Odc1轴，可能存在其他调控通路	评估川芎嗪治疗慢性肾病的有效性并阐明其分子机制	慢性肾病大鼠模型、原代近端直小管细胞	分子生物学与病理生理学	慢性肾病	LC-MS/MS分析、单细胞测序、基因过表达与敲低、细胞与动物实验	NA	测序数据、质谱数据、蛋白与mRNA表达数据	大鼠模型（对照组、CKD组、川芎嗪干预组）及原代细胞	NA	单细胞测序	NA	NA
115	2026-02-19	Integrated single-cell multi-omics profiling reveals a senescence-associated hematopoietic landscape and regulatory network in aging bone marrow 2025-Nov-24, Biogerontology IF:4.4Q1 DOI:10.1007/s10522-025-10352-6 PMID:41284112	研究论文	本研究通过整合单细胞多组学分析，揭示了衰老骨髓中与衰老相关的造血景观和调控网络	识别了一个新的造血亚群，激活细胞衰老通路，并通过NMU信号增强与CD8⁺ T细胞的炎症串扰，同时发现CAPN1-MAP2K1-JUND模块作为衰老的潜在预测标志物	样本量较小（仅6个年轻和衰老骨髓样本），且依赖独立队列进行验证，可能限制结果的普遍性	表征骨髓中与年龄相关的变化并识别关键驱动因素	年轻和衰老的骨髓样本	数字病理学	老年疾病	scRNA-seq, 蛋白质组学, 伪批量转录组学, WGCNA, CellChat分析, 差异表达分析, Cox回归模型, ROC曲线分析, 免疫组化, Western blot, 分子对接	Cox回归模型	单细胞RNA-seq数据, 蛋白质组数据, 批量RNA-seq数据	6个年轻和衰老骨髓样本，以及两个独立批量RNA队列（n=58）	NA	单细胞RNA-seq, 单细胞多组学, 批量RNA-seq	NA	NA
116	2026-02-19	Novel GABAAR antagonists target networked gene hubs at the leading edge in high-grade gliomas 2025-Nov-01, Neuro-oncology IF:16.4Q1 DOI:10.1093/neuonc/noaf143 PMID:40497637	研究论文	本研究通过基因共表达网络分析识别高级别胶质瘤前沿的关键离子通道基因，并验证GABAAR拮抗剂在抑制肿瘤进展中的作用	首次通过加权基因共表达网络分析结合单细胞和空间转录组学，系统识别高级别胶质瘤前沿的离子通道基因枢纽，并发现GABAAR拮抗剂能有效抑制肿瘤侵袭和增殖	研究主要基于体外胶质瘤类器官模型，未在体内动物模型中进行充分验证，且样本量相对有限	确定高级别胶质瘤中离子通道基因的网络化表达，并验证靶向这些通道的药物对肿瘤进展的抑制作用	弥漫性中线胶质瘤和胶质母细胞瘤患者肿瘤样本及患者来源的胶质母细胞瘤外植类器官	数字病理学	胶质瘤	RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 免疫组织化学	加权基因共表达网络分析	基因表达数据, 图像数据	未明确指定样本数量，但涉及患者肿瘤样本和类器官模型	NA	单细胞RNA-seq, 空间转录组学	NA	NA
117	2026-02-19	CAF-derived LRRC15 orchestrates macrophage polarization and limits PD-1 immunotherapy efficacy in glioblastoma 2025-Nov-01, Neuro-oncology IF:16.4Q1 DOI:10.1093/neuonc/noaf157 PMID:40569145	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析，揭示了癌症相关成纤维细胞（CAFs）中LRRC15表达在胶质母细胞瘤抗PD-1治疗非应答者中的关键作用，并阐明了其通过调控巨噬细胞极化和免疫抑制微环境限制免疫治疗效果的分子机制	首次在胶质母细胞瘤中鉴定出LRRC15高表达的CAFs亚群，并揭示了其通过FAK/SRC/NF-κB通路促进IL8表达，进而驱动巨噬细胞M2极化的新机制，同时发现巨噬细胞通过TGF-β/SMAD2通路反馈调节LRRC15表达的双向调控环路	研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人类患者中进行大规模临床验证；LRRC15靶向治疗的具体药物开发和安全评估仍需进一步研究	探究胶质母细胞瘤免疫抑制微环境中CAFs调控巨噬细胞极化并影响PD-1免疫治疗疗效的分子机制	胶质母细胞瘤组织、癌症相关成纤维细胞（CAFs）、巨噬细胞、小鼠肿瘤模型	数字病理学	胶质母细胞瘤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学（stRNA-seq）、生物信息学分析、体外功能验证、体内动物实验	NA	单细胞转录组数据、空间转录组数据、基因表达数据	未明确说明具体样本数量，但涉及抗PD-1治疗应答者与非应答者的临床样本比较	NA	单细胞RNA测序, 空间转录组学	NA	NA
118	2026-02-19	Plasmablast-like lymphoma cells as a distinct subpopulation confer multidrug resistance in PCNSL 2025-Nov-01, Neuro-oncology IF:16.4Q1 DOI:10.1093/neuonc/noaf154 PMID:40580931	研究论文	本研究通过单细胞转录组学和B细胞受体测序等方法，揭示了原发性中枢神经系统淋巴瘤（PCNSL）中浆母细胞样淋巴瘤细胞（PBLCs）作为一个独特的恶性B细胞亚群，与多药耐药和不良预后相关	首次在PCNSL中识别出PBLCs这一独特的恶性B细胞亚群，并阐明了其通过上调XBP1和PRDM1等转录因子、下调CD20、Bruton酪氨酸激酶和FAS表达，导致多药耐药和免疫逃逸的分子机制	样本量相对较小（56例患者），且为回顾性研究，需要更大规模的前瞻性研究验证PBLCs的临床意义和靶向治疗策略	探究PCNSL的分子特征和耐药机制，以改善治疗策略	56例新诊断的PCNSL患者的肿瘤活检标本	数字病理学	淋巴瘤	单细胞转录组学，B细胞受体测序，转录组信息多重免疫组化，离体药物反应实验	NA	单细胞RNA-seq数据，免疫组化图像，药物反应数据	56例新诊断的PCNSL患者	NA	单细胞RNA-seq，空间转录组学	NA	NA
119	2026-02-19	Proneural-mesenchymal hybrid glioblastoma cells are resistant to therapy and dependent on nuclear import 2025-Nov-01, Neuro-oncology IF:16.4Q1 DOI:10.1093/neuonc/noaf160 PMID:40627673	研究论文	本研究探讨了胶质母细胞瘤中前神经-间充质杂交细胞的特性及其在治疗抵抗中的作用	首次实时监测胶质母细胞瘤细胞可塑性，并揭示了杂交细胞在治疗抵抗中的关键作用及其分子机制	研究主要基于患者来源的细胞系和动物模型，临床转化仍需进一步验证	探究胶质母细胞瘤细胞可塑性的分子机制及治疗抵抗的原因	胶质母细胞瘤细胞，特别是前神经-间充质杂交细胞	数字病理学	胶质母细胞瘤	RNA测序，单细胞RNA测序，单细胞ChIP测序，核蛋白质组学，高分辨率成像	NA	基因表达数据，蛋白质数据，图像数据	多个患者来源的细胞系	NA	单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq	NA	NA
120	2026-02-19	ZiPo: A Deep Neural Network to De-Noise Single-Cell RNA Sequencing Data 2025 Nov-Dec, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics DOI:10.1109/TCBBIO.2025.3572783 PMID:40811273	研究论文	本文介绍了一种名为ZiPo的深度人工神经网络，用于去噪单细胞RNA测序数据，通过估计率和预测文库大小来处理测量丢失问题	ZiPo引入了可调节的零膨胀分布来捕获丢失事件，并采用尺度不变损失项使权重稀疏，从而提高模型的生物可解释性	NA	改进单细胞RNA测序数据分析，减少测量丢失对结果的影响	单细胞RNA测序数据	机器学习	NA	单细胞RNA测序	深度人工神经网络，深度自编码器	基因表达数据	三个数据集	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA