单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 37744 篇文献,本页显示第 101 - 120 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
101 2026-03-25
Mapping T cell dynamics to molecular profiles through behavior-guided transcriptomics
2025-09, Nature protocols IF:13.1Q1
研究论文 本文介绍了一种名为行为引导转录组学(BGT)的扩展协议,用于整合T细胞活体成像数据与单细胞转录组学,以分析动态T细胞行为相关的基因程序 BGT协议通过结合BEHAV3D活体成像平台和scRNA-seq,首次实现了T细胞动态行为与分子谱的时空关联分析,揭示了高效和无效T细胞的新生物标志物 该协议需要用户具备基本的细胞培养、成像和编程技能,且实验周期长达一个月,可能限制了其广泛适用性 旨在开发一种整合T细胞活体成像与单细胞转录组学的方法,以研究T细胞在肿瘤靶向过程中的行为与分子驱动因素 患者来源的肿瘤类器官(PDO)与工程化T细胞的共培养体系中的T细胞 数字病理学 癌症 单细胞RNA测序(scRNA-seq),荧光激活细胞分选(FACS),活体成像 NA 图像,转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
102 2026-03-25
SWIFT-seq enables comprehensive single-cell transcriptomic profiling of circulating tumor cells in multiple myeloma and its precursors
2025-Sep, Nature cancer IF:23.5Q1
研究论文 本研究开发了一种名为SWIFT-seq的单细胞测序工作流程,用于对多发性骨髓瘤及其前体疾病患者的循环肿瘤细胞进行全面的单细胞转录组分析 开发了SWIFT-seq工作流程,首次实现了对少量循环肿瘤细胞的单细胞RNA测序和B细胞受体测序,并建立了基于测序的CTC计数策略和分类器以推断细胞遗传学异常 未明确提及具体的技术局限性,但暗示了传统骨髓活检存在技术限制和不确定性 开发非侵入性血液检测方法,用于多发性骨髓瘤的诊断、监测和预后评估,并揭示肿瘤扩散的生物学机制 多发性骨髓瘤患者及其前体疾病患者的循环肿瘤细胞和配对骨髓样本 数字病理学 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序, B细胞受体测序 分类器, 循环动力学模型 单细胞转录组数据, B细胞受体序列数据 101名患者和健康供体的配对骨髓和循环肿瘤细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
103 2026-03-25
A Benchmark of Semi-Supervised scRNA-seq Integration Methods in Real-World Scenarios
2025-Aug-27, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究首次在真实场景下系统性地评估了五种半监督单细胞RNA测序整合方法,并与五种无监督基线方法进行了比较 首次在多种真实标注场景下系统评估半监督单细胞RNA测序整合方法,揭示了这些方法在实际应用中的局限性 研究仅评估了五种半监督方法,可能未涵盖所有相关算法;评估数据集数量有限 评估半监督单细胞RNA测序整合方法在真实世界场景下的性能表现 单细胞RNA测序数据整合方法 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 scANVI, scGEN, ssSTACAS, scDREAMER, ItClust, scCRAFT 单细胞RNA测序数据 六个不同数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
104 2026-03-25
Single-cell RNA sequencing reveals hemocyte heterogeneity, differentiation trajectories, and viral tropism in shrimp (Macrobrachium rosenbergii) infected with decapodiridovirus litopenaeus1
2025-08-19, Journal of virology IF:4.0Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了罗氏沼虾在感染十足目虹彩病毒1(DIV1)后血细胞的异质性、分化轨迹及病毒嗜性 首次在单细胞分辨率下构建了DIV1感染下虾类血细胞的转录图谱,揭示了血细胞亚群的转录异质性、分化动态及特定细胞簇对病毒的易感性与抗性 研究主要基于转录组数据,功能验证实验相对有限,且样本可能未覆盖所有感染阶段或环境条件 探究虾类血细胞在DIV1病毒感染下的转录异质性、分化轨迹及免疫反应机制 罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)的血细胞 单细胞组学 病毒感染 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确指定样本数量,但涉及感染前后的血细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
105 2026-03-25
Spatial transcriptomic profiling uncovers the molecular effects of the neurotoxicant polychlorinated biphenyls (PCBs) in the brains of adult mice
2025-Jul-26, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过空间转录组学技术,探究了多氯联苯(PCBs)暴露对成年小鼠大脑功能和认知的分子影响 首次结合行为学测试与空间转录组学分析,系统揭示了PCB暴露导致小鼠长期空间记忆缺陷的分子机制,并发现其与血脑屏障完整性受损相关 研究仅使用雄性小鼠,未考虑性别差异;暴露时间为7周,长期效应尚不明确;分子机制需进一步实验验证 评估与人类相关的PCB混合物如何影响大脑功能和认知 成年雄性C57BL/6J小鼠 空间转录组学 神经退行性疾病 空间转录组学 NA 空间基因表达数据 未明确样本数量的小鼠脑组织(五个脑区:海马体、新皮层、丘脑、尾壳核、纤维束) NA 空间转录组学 NA NA
106 2026-03-25
Molecular mechanism of potently neutralizing human monoclonal antibodies against severe fever with thrombocytopenia virus infection
2025-07-22, Journal of virology IF:4.0Q2
研究论文 本文通过单细胞RNA-seq从SFTS幸存者中分离出单克隆抗体,评估其中和活性与动物保护效果,并通过X射线晶体学解析抗体与病毒糖蛋白的复合结构 首次从SFTS幸存者中通过单细胞RNA-seq获得高效中和单克隆抗体,并解析了抗体与SFTSV-Gn糖蛋白的共晶结构,揭示了保守抗原表位 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证,且抗体保护效果在不同病毒基因型中的普适性需进一步评估 开发针对严重发热伴血小板减少综合征病毒(SFTSV)的特异性抗病毒疗法 SFTSV病毒及其糖蛋白Gn,以及从SFTS幸存者中分离的单克隆抗体 自然语言处理 NA 单细胞RNA-seq, X射线晶体学 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
107 2026-03-25
spRefine Denoises and Imputes Spatial Transcriptomics with a Reference-Free Framework Powered by Genomic Language Model
2025-Jul-07, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种名为spRefine的深度学习框架,利用基因组语言模型对空间转录组数据进行联合去噪和插补 开发了首个基于基因组语言模型的无参考框架,能够同时处理空间转录组数据的高噪声和基因测量缺失问题,并发现新的衰老相关生物学信号 未明确说明框架的计算复杂度、对特定组织类型的适用性限制,以及与其他方法的详细比较 解决空间转录组数据分析中的噪声和缺失值问题,提高数据质量和下游分析准确性 空间转录组数据 空间转录组学 衰老相关疾病 空间转录组技术 深度学习框架、基因组语言模型 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
108 2026-03-25
Unraveling the cross-talk between a highly virulent PEDV strain and the host via single-cell transcriptomic analysis
2025-06-17, Journal of virology IF:4.0Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析揭示了一种高毒力猪流行性腹泻病毒(PEDV)毒株与宿主之间的相互作用机制 首次利用单细胞测序技术全面解析PEDV感染后宿主肠道细胞的组成、基因表达和细胞间通讯变化,并发现病毒可在B和T淋巴细胞中启动复制但无法产生感染性子代 研究仅针对一种PEDV毒株,样本量相对有限,且未深入探讨病毒在不同细胞类型中的长期感染动态 探究PEDV与宿主的相互作用机制,以理解病毒致病性和宿主免疫反应 感染PEDV的仔猪空肠细胞,包括上皮细胞、干细胞、免疫细胞等 数字病理学 猪流行性腹泻 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 19,612个空肠细胞,来自PEDV感染和对照仔猪 NA 单细胞RNA-seq NA NA
109 2026-03-25
Primitive Hepatoblasts Driving Early Liver Development
2025-Jun-08, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究识别并表征了早期肝脏发育中一种先前未被认识的原始肝母细胞群,揭示了其在肝发生过程中的起源、分子特征和功能作用 发现并命名了源自腹侧前肠内胚层CDX2+FOXA2+祖细胞的一种新型原始肝母细胞群,揭示了其独特的分子标记和发育贡献,并阐明了WNT抑制和RA许可在此过程中的调控机制 原始肝母细胞在晚期胎儿和出生后发育中的贡献逐渐减少,其长期命运和功能转换的具体机制仍需进一步研究 探究早期肝脏发育过程中肝母细胞的异质性、起源和调控机制 小鼠和人类早期肝脏发育过程中的肝母细胞及前肠内胚层祖细胞 发育生物学 NA 单细胞转录组测序、谱系追踪、表观遗传学和功能扰动研究 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
110 2026-03-25
Tissue signatures of human macrophages during homeostasis and activation
2025-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用多模态单细胞测序技术,定义了来自不同组织(肺、小肠、脾脏、骨髓和淋巴结)的人类巨噬细胞在稳态和激活状态下的组织特异性特征 首次系统性地描绘了人类黏膜和淋巴器官中巨噬细胞在稳态和激活状态下的组织特异性转录和蛋白特征,并揭示了这些特征在极化刺激下仍能保持 研究样本来源于器官捐献者,可能无法完全代表所有生理或病理状态;未涵盖所有人体组织 阐明人类巨噬细胞在不同组织(特别是黏膜和淋巴器官)中的身份如何与其定居部位耦合,并在激活和极化过程中维持 从个体器官捐献者分离的肺、小肠、脾脏、骨髓和淋巴结组织中的巨噬细胞和单核细胞 单细胞组学 NA 多模态单细胞测序,刺激实验 NA 单细胞转录组数据,蛋白数据 来自个体器官捐献者的多个组织样本(肺、小肠、脾脏、骨髓、淋巴结) NA 单细胞多组学 NA NA
111 2026-03-25
Integrated single-cell and spatial analysis identifies context-dependent myeloid-T cell interactions in head and neck cancer immune checkpoint blockade response
2025-Mar-28, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过整合单细胞和空间分析,揭示了头颈癌免疫检查点阻断治疗中髓系细胞与T细胞相互作用的上下文依赖性 结合10X Visium和Nanostring CosMx空间组学技术,首次系统性地描述了头颈癌免疫检查点阻断治疗中免疫细胞的空间特征和细胞间相互作用 研究样本量相对有限,且主要依赖生物信息学分析,需要进一步的实验验证和临床前动物模型研究 探究头颈癌免疫检查点阻断治疗中免疫细胞的空间相互作用及其与治疗反应的关系 头颈鳞状细胞癌患者,包括对免疫检查点阻断治疗有反应和无反应的患者 数字病理学 头颈癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 空间蛋白质组学 NA 单细胞RNA测序数据, 空间转录组学数据, 空间蛋白质组学数据 26名患者的522,399个单细胞,以及8名接受免疫检查点阻断治疗患者的空间RNA测序数据 10x Genomics, Nanostring 空间转录组学, 单细胞空间组学 10x Visium, Nanostring CosMx 10X Visium基于点的空间转录组学,Nanostring CosMx单细胞空间组学(包含435个配体和受体的RNA基因面板)
112 2026-03-25
Single-cell transcriptomics reveals a compartmentalized antiviral interferon response in the nasal epithelium of mice
2025-03-18, Journal of virology IF:4.0Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组学分析,揭示了小鼠鼻上皮中抗病毒干扰素反应的细胞类型特异性分区 首次在单细胞水平上展示了上呼吸道上皮细胞中I型和III型干扰素抗病毒反应的细胞类型异质性和分区现象 研究仅基于小鼠模型,人类鼻上皮中的干扰素反应可能有所不同 探究上呼吸道不同上皮细胞亚型对I型和III型干扰素的抗病毒反应差异 小鼠鼻上皮细胞,包括嗅觉上皮和呼吸上皮的多种细胞类型 单细胞转录组学 呼吸道病毒感染 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确指定样本数量,但分析了小鼠鼻上皮的多种细胞类型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
113 2026-03-25
Conventional and antibody-enhanced DENV infection of human macrophages induces differential immunotranscriptomic profiles
2025-03-18, Journal of virology IF:4.0Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,比较了人类巨噬细胞在抗体依赖性增强(ADE)和常规感染条件下感染登革病毒后的转录组差异 首次在单细胞分辨率下揭示了ADE感染与常规感染登革病毒后,宿主细胞转录组反应的质性差异,并发现这些变化与细胞内病毒RNA载量无关 研究仅针对DENV-2血清型和人单核来源巨噬细胞,未涵盖其他血清型或体内其他靶细胞类型 阐明抗体依赖性增强(ADE)感染登革病毒的细胞内在分子机制及其在疾病发病中的作用 人类单核细胞来源的巨噬细胞 单细胞转录组学 登革热 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量,但涉及感染和未感染的异质性细胞培养物 NA 单细胞RNA-seq NA NA
114 2026-03-25
Loss of mucin 2 and MHC II molecules causes rare resistance to murine RV infection
2025-02-25, Journal of virology IF:4.0Q2
研究论文 本文通过条件性敲除小鼠模型,揭示了分泌细胞(特别是杯状细胞)及其产物MUC2和MHC II分子在轮状病毒感染中的关键作用,发现其缺失导致罕见的抗感染表型 首次发现MUC2和MHC II分子的缺失与轮状病毒感染的罕见抗性相关,揭示了分泌细胞产物与免疫分子在肠道病毒感染中的新联系 研究基于小鼠模型,结果在人类中的适用性需进一步验证;单细胞RNA测序样本的具体技术细节未详细说明 探究分泌细胞在轮状病毒感染发病机制中的作用 Atoh1条件性敲除小鼠、MHC II缺陷小鼠及肠道上皮细胞 单细胞组学 肠道病毒感染 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确指定样本数量,涉及基因敲除小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
115 2026-03-25
High fat diet-induced loss of pituitary plasticity in aging female mice with ablated leptin signaling in somatotropes
2025, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2
研究论文 本研究探讨高脂饮食对缺乏生长激素细胞中瘦素受体的老年雌性小鼠垂体转录组功能的影响 首次揭示高脂饮食通过下调翻译调控通路和减少多潜能细胞表达,损害老年小鼠垂体可塑性,尤其在瘦素受体缺失突变体中更显著 研究仅基于小鼠模型,未涉及人类样本;样本量相对较小;未深入探讨高脂饮食诱导的氧化应激具体分子机制 探究高脂饮食如何影响缺乏生长激素细胞瘦素受体的老年雌性小鼠垂体转录组功能 10月龄缺乏生长激素细胞瘦素受体的雌性突变小鼠及其同窝对照小鼠 单细胞转录组学 肥胖相关代谢疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、生物信息学分析、葡萄糖耐量测试、代谢笼监测 NA 单细胞转录组数据、血清激素和细胞因子数据 老年雌性突变小鼠和对照小鼠,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
116 2026-03-25
MFSD12 promotes proliferation, metastasis and invasion of hepatocellular carcinoma cells and its potential correlation with HAVCR2/LGALS9 immune checkpoint axis
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究探讨了MFSD12在肝细胞癌(LIHC)进展中的潜在作用,发现其高表达与不良预后相关,并可能通过促进肿瘤细胞增殖、迁移和侵袭,以及与HAVCR2/LGALS9免疫检查点轴相互作用来调节肿瘤免疫微环境 首次在泛癌分析中揭示MFSD12在LIHC中的特异性高表达,并通过单细胞RNA测序和功能实验验证其在肿瘤细胞和先天淋巴样细胞中的表达,以及通过MFSD12-siRNA调控HAVCR2/LGALS9免疫检查点轴的新机制 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内模型验证,且MFSD12与HAVCR2/LGALS9轴的具体相互作用机制尚未完全阐明 探究MFSD12在肝细胞癌进展中的潜在作用及其与免疫检查点轴的相关性 肝细胞癌(LIHC)细胞及肿瘤微环境中的免疫细胞 数字病理学 肝癌 单细胞RNA测序,免疫组化分析,生物信息学分析 NA 基因表达数据,单细胞RNA测序数据,临床数据 基于TCGA、GEO和ArrayExpress数据库的泛癌数据集,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
117 2026-03-25
A Multi-Faceted Approach to Explore the Role of Inflammatory CAFs, Providing Prognostic Value and Therapeutic Implications in Lung Adenocarcinoma
2025, International journal of genomics IF:2.6Q2
研究论文 本研究通过整合批量RNA数据和单细胞RNA测序数据,识别了肺腺癌中的炎性癌症相关成纤维细胞亚型,并开发了一个基于iCAF的预后特征,用于预测患者临床结局、免疫景观和治疗反应 首次在肺腺癌中系统性地识别并表征了iCAF亚型,并利用机器学习算法筛选出四个关键基因构建了ICAFBS预后特征,同时通过功能研究验证了PFN2作为潜在治疗靶点 研究主要基于公共数据库数据,缺乏前瞻性临床验证,且功能研究仅限于细胞系水平,未涉及动物模型或临床试验 探索肺腺癌中炎性癌症相关成纤维细胞的特征及其临床意义,开发预后预测模型并寻找潜在治疗靶点 肺腺癌患者样本数据及肺腺癌细胞系 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序,批量RNA测序,机器学习算法 机器学习算法(未指定具体模型) RNA测序数据 多个公共数据库中的肺腺癌样本数据,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
118 2026-03-25
Comprehensive Single-Cell Characterization of LDL in the Ovarian Cancer Microenvironment and Its Prognostic Implications
2025, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析,系统揭示了低密度脂蛋白在卵巢癌微环境中的分布、功能通路及预后价值,并构建了一个有效的预后预测模型 首次在单细胞水平上全面表征LDL在卵巢癌微环境中的分布和功能,并构建了基于多队列验证的LDL相关卵巢癌预后特征模型 研究主要基于转录组数据,缺乏对LDL蛋白水平或代谢功能的直接验证 阐明LDL在卵巢癌肿瘤微环境中的具体作用机制及其预后意义 卵巢癌患者的单细胞转录组数据及八个队列的批量RNA-seq数据 数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA测序,批量RNA测序 机器学习模型 转录组数据 涉及多个队列的卵巢癌患者样本,具体数量未在摘要中明确 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
119 2026-03-25
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals an Inflammatory Antigen-Presenting Macrophages Subtype Drive Vitiligo Pathogenesis Through STAT1-Mediated Dual Mechanisms
2025, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析揭示了白癜风中一种未表征的炎症性抗原呈递巨噬细胞亚型,通过STAT1介导的双重机制驱动疾病发病 首次在白癜风中鉴定出一种新的炎症性抗原呈递巨噬细胞亚型(Mac-InflamAP),并阐明其通过STAT1介导的直接抑制黑素细胞和增强T细胞活化的双重机制 研究主要基于单细胞转录组数据和实验验证,但样本量可能有限,且体内外实验的转化应用需进一步验证 阐明巨噬细胞在白癜风发病机制中的异质性和功能,特别是通过STAT1介导的机制 健康与白癜风患者的皮肤组织,包括巨噬细胞、T细胞和黑素细胞 数字病理学 白癜风 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
120 2026-03-25
Integrative Genomic and Single-Cell Insights Into Efferocytosis-Mediated Immune Regulation in Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2025, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 本文通过整合基因组学和单细胞技术,探讨了efferocytosis在透明细胞肾细胞癌中的免疫调节作用及其预后意义 首次在ccRCC中系统量化efferocytosis通路活性,并构建了基于岭回归的预后模型,结合多组学整合和单细胞空间转录组学鉴定出RAC1作为关键风险基因 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限,且样本来源和平台可能引入偏差 阐明efferocytosis在ccRCC中的预后价值和分子机制,以发现潜在生物标志物和治疗靶点 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者样本 生物信息学 肾细胞癌 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 免疫组化, 基因组学分析 岭回归模型 基因组数据, 转录组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据, 蛋白质数据 未明确指定样本数量,但使用了多个独立数据集 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
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