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当前共找到 38727 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-04-24 |
Perivascular mesenchymal cells instruct ST2+ reparative macrophages to promote endovascular injury-induced neointimal hyperplasia in mice
2026-Mar-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68587-x
PMID:41794821
|
研究论文 | 本研究利用小鼠内皮损伤模型，揭示血管周围间充质基质细胞通过IL33-ST2-OPN轴引导ST2+修复性巨噬细胞，促进新生内膜增生 | 首次发现IL33-ST2-OPN轴作为血管周围间充质基质细胞与修复性巨噬细胞之间的功能性串扰机制，并证明局部递送siRNA靶向Il33或Spp1可有效缓解损伤诱导的新生内膜增生，为预防再狭窄提供潜在治疗策略 | 未提及与人类疾病的相关性或长期治疗效果评估 | 探索血管损伤后间充质基质细胞与免疫细胞的相互作用机制，特别是在新生内膜增生中的作用 | 小鼠内皮损伤模型中的血管周围间充质基质细胞、ST2+修复性巨噬细胞和血管平滑肌细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序、siRNA递送 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠内皮损伤模型（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 102 | 2026-04-24 |
Selective weakening of population-coupled synaptic activity in vivo in a mouse model of amyloid-beta pathology
2026-Mar-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69866-3
PMID:41794826
|
研究论文 | 在一项关于β-淀粉样蛋白病理小鼠模型的研究中，发现阿尔茨海默病早期突触功能障碍主要发生在与群体活动强烈耦合的突触上 | 通过体内突触结构与功能成像，首次揭示早期阿尔茨海默病相关突触病理集中在与群体活动强耦合的GABAergic轴突末梢和兴奋性树突棘上，而非广泛发生 | 结果仅基于App小鼠模型，其与人类阿尔茨海默病的相关性需进一步验证，且早期阶段的具体分子机制尚未完全阐明 | 探究阿尔茨海默病早期淀粉样变性模型中突触功能障碍的发生机制及其定位特征 | App小鼠模型中β-淀粉样蛋白病理相关的突触活动变化 | 神经科学， 分子生物学 | 阿尔茨海默病 | 钙成像， 空间转录组学， 体内双光子成像 | NA | 图像数据， 基因表达数据 | App转基因小鼠（具体数量未在摘要中说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 103 | 2026-04-24 |
AI-enabled single-cell dissection of the palmitoylation landscape identifies a multicellular prognostic program in gastric cancer
2026-Mar-07, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01359-4
PMID:41794921
|
研究论文 | 利用AI单细胞技术解析棕榈酰化图谱，揭示胃癌中多细胞预后程序 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘胃癌中蛋白S-棕榈酰化对肿瘤生态系统的影响，并鉴定出一个由87个基因组成的多细胞棕榈酰化特征用于风险分层 | 未提及具体限制，但可能包括需要更多外部队列验证及功能机制深入探究 | 阐明蛋白S-棕榈酰化如何塑造胃癌肿瘤生态系统及临床预后 | 胃癌肿瘤组织中的恶性细胞、免疫细胞和基质细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、批量队列数据 | 来自25个胃肿瘤的119,931个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 单细胞RNA测序使用10x Chromium平台，空间转录组学使用10x Visium平台 |
| 104 | 2026-04-24 |
Combining AI to reveal CCDC3-mediated pathways of colorectal cancer liver metastasis
2026-Mar-07, NPJ digital medicine
IF:12.4Q1
DOI:10.1038/s41746-026-02457-0
PMID:41792471
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序、加权基因共表达网络分析和非负矩阵分解构建染色体不稳定性指数，揭示CCDC3介导的结直肠癌肝转移通路 | 发现CAF来源的CCDC3通过CXCR3/STAT3/CDT1信号轴促进结直肠癌染色体不稳定性和肝转移的新机制，并使用人工智能生物知识图分析进行核心调控解析 | 未提及研究的局限性 | 揭示结直肠癌肝转移中染色体不稳定性的调控机制及潜在治疗靶点 | 结直肠癌肝转移患者样本及小鼠模型中的肿瘤细胞和癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 105 | 2026-04-24 |
Cuproptosis-associated PDHA1 promotes sarcoma progression and immunotherapy responsiveness via the E2F1-PD-L1 axis: a multi-omics and clinical validation study
2026-Mar-06, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01298-0
PMID:41792370
|
研究论文 | 通过多组学、功能与临床分析，确定铜死亡相关代谢基因PDHA1在肉瘤进展和免疫逃逸中的驱动作用，并验证其作为免疫检查点阻断疗法响应预测标志物的潜力 | 首次揭示铜死亡相关代谢基因PDHA1通过E2F1-PD-L1轴驱动肉瘤进展和免疫逃逸，并发现其可作为免疫检查点阻断疗法响应预测标志物 | 研究主要基于公共数据库和体外/体内模型，缺乏大规模前瞻性临床验证队列 | 探索铜死亡相关代谢基因PDHA1在肉瘤进展和免疫治疗响应中的功能与机制 | 肉瘤患者样本及细胞系 | 机器学习 | 肉瘤 | 多组学分析、单细胞RNA测序、功能实验 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | TCGA/GEO/ICGC队列中的肉瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 106 | 2026-04-24 |
Early cAMP signaling orchestrates single-cell synchronicity throughout Dictyostelium development
2026-Mar-06, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09806-5
PMID:41792273
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示早期cAMP信号在盘基网柄菌发育过程中协调单细胞同步性的机制 | 首次利用单细胞RNA测序量化分析盘基网柄菌发育过程中单个细胞间的转录组同步性，并证明早期cAMP信号是建立和维持同步性的关键 | 未提及具体局限性 | 研究早期cAMP信号在盘基网柄菌发育过程中协调单细胞同步性的作用 | 盘基网柄菌（Dictyostelium discoideum）的单个细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 盘基网柄菌发育过程中的单个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 107 | 2026-04-24 |
AI-based phenotyping of hepatic fiber morphology to inform molecular alterations in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease
2026-Mar-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001360
PMID:40262132
|
研究论文 | 通过AI量化肝纤维形态表型，揭示代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD）的分子改变 | 首次利用人工智能算法FibroNest定量分析MASLD肝活检中的纤维形态表型，并结合多组学分析（转录组、空间单细胞转录组）揭示纤维形态与分子改变的关联 | 样本量较小（94例肝活检），且仅12例合并肝细胞癌，可能限制发现的普遍性 | 全面表征MASLD中肝纤维形态表型及其相关的分子改变，探索纤维形态对疾病进展和潜在机制的指示作用 | 94例MASLD患者的肝活检样本（其中12例合并肝细胞癌） | 计算机视觉、机器学习、数字病理 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病、肝细胞癌 | 转录组测序、空间单细胞转录组 | FibroNest算法 | 图像、转录组数据、空间基因表达数据 | 94例MASLD患者肝活检样本，其中12例合并肝细胞癌 | PharmaNest, CosMx | 数字病理、空间转录组学 | FibroNest, CosMx | FibroNest用于肝纤维形态量化，CosMx用于空间单细胞转录组分析 |
| 108 | 2026-04-24 |
Immune landscape in liver of neonatal mice with phlebotomy-induced anemia
2026-Mar, Pediatric research
IF:3.1Q1
DOI:10.1038/s41390-025-04361-x
PMID:40962864
|
research paper | 本研究利用新生小鼠放血诱导贫血模型，通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析了贫血小鼠肝脏的免疫细胞图谱 | 首次描绘了新生小鼠放血诱导贫血后肝脏的免疫细胞图谱变化，揭示了单核细胞和红系细胞的增加以及淋巴细胞的减少 | 基于小鼠模型，结果向人类早产儿的临床转化需要进一步验证 | 研究新生小鼠放血诱导贫血对肝脏免疫细胞组成和功能的影响 | 新生C57BL/6小鼠的肝脏免疫细胞 | 数字病理学 | 贫血 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 新生C57BL/6小鼠，具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 109 | 2026-04-24 |
Single-Cell Multimodal Profiling Highlights Persistent Aortic Smooth Muscle Cell Changes in Diabetic Mice Despite Glycemic Control
2026-Mar, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.324012
PMID:41641545
|
研究论文 | 利用单细胞多组学技术，揭示尽管血糖控制良好，但糖尿病小鼠主动脉平滑肌细胞仍存在持续的转录组和表观基因组变化 | 首次通过单细胞多组学（scRNA-seq、scATAC-seq和空间转录组学Xenium）全面分析血糖控制对糖尿病小鼠血管平滑肌细胞表型转变的影响，并发现表观遗传学变化的不可逆性 | 未明确说明，但可推断样本量较小，仅使用db/db小鼠模型，且治疗时间有限（6周），可能无法完全反映长期效应 | 研究血糖正常化对2型糖尿病小鼠主动脉平滑肌细胞表型转变相关的转录组和表观基因组变化的影响 | 2型糖尿病小鼠（db/db）及其非糖尿病对照（db/+）的主动脉组织 | 单细胞组学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞ATAC测序（scATAC-seq）、空间转录组学（Xenium） | NA | 单细胞基因表达数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 | db/db小鼠（达格列净治疗组和载体对照组）和db/+小鼠（载体对照组），每组各若干只，具体数量未详述；主动脉样本用于多组学分析 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Xenium | 10x Chromium用于单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序，10x Xenium用于空间转录组学 |
| 110 | 2026-04-24 |
Increased CD44 Expression in Endothelial Cells Induced by Advanced Glycation End Products Leads to Insufficient Maturation of Angiogenesis
2026-Mar, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71088
PMID:41840419
|
研究论文 | 本研究揭示了晚期糖基化终末产物通过β-catenin/TCF4信号通路上调内皮细胞CD44表达，进而促进MMP9介导的基底膜过度降解，导致病理性血管生成中血管成熟不足 | 首次阐明AGEs通过β-catenin/TCF4信号通路调控CD44表达，并揭示CD44-MMP9轴在基底膜结构紊乱和血管成熟障碍中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，缺乏人体临床样本验证；未深入探讨其他可能参与基底膜降解的蛋白酶或信号通路 | 探究AGEs诱导的糖尿病血管并发症中血管基底膜结构变化及其分子机制 | 氧诱导视网膜病变小鼠模型、视网膜组织、内皮细胞、周细胞 | 数字病理学 | 糖尿病血管并发症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 氧诱导视网膜病变小鼠模型（具体样本量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 111 | 2026-03-19 |
Correction to 'Integrating Bulk RNA and Single-Cell RNA Sequencing Identifies and Validates Lactylation-Related Signatures for Intervertebral Disc Degeneration'
2026-Mar, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71061
PMID:41845558
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 112 | 2026-04-24 |
Old Blood, Young Bones: Identification of Middle-Aged Myeloid Cells That Limit Cortical Bone Loss
2026-Mar, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71094
PMID:41873045
|
研究论文 | 通过骨髓移植实验和单细胞RNA测序，发现中年小鼠的CD11B+CD36+髓系细胞通过分泌Wnt配体增强皮质骨形成，限制年龄相关的骨丢失 | 首次鉴定出中年阶段特有的CD11B+CD36+髓系细胞群，发现其通过Wnt6信号通路具有促骨合成作用，并证实该细胞群在人类骨髓中也存在 | 未明确这些髓系细胞在更老龄化阶段的长期作用，且Wnt信号对骨形成的精确调控机制需进一步研究 | 探究中年阶段骨髓细胞变化对皮质骨丢失的影响及机制 | 8周龄和40周龄小鼠的骨髓细胞，以及人类骨髓样本 | 数字病理学 | 老年性疾病 | 骨髓移植、显微CT、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 图像、文本、测序数据 | 8周龄和40周龄小鼠（具体数量未提及），以及人类骨髓样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于比较性单细胞转录组分析 |
| 113 | 2026-04-24 |
Spatial-ZEDNet : a unified spatial transcriptomics framework for detecting differential gene activation and expression
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag166
PMID:42001470
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研究论文 | 提出Spatial-ZEDNet框架，用于在空间转录组学中检测差异表达基因和差异激活基因，并处理零膨胀问题 | 首次联合检测空间差异表达基因和差异激活基因，显式建模零膨胀，且无需空间坐标匹配即可对齐不同条件下的生物信号 | 文本未明确提及局限性，但可能受限于层次高斯随机场模型的计算复杂性及对大规模数据集的可扩展性 | 开发一种统计严谨的空间转录组学方法，以准确量化暴露引起的组织重塑中的基因调控变化 | 模拟数据及结肠炎和疟原虫感染数据集中的空间基因表达 | 机器学习 | 结肠炎 | 空间转录组学 | 层次高斯随机场 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 114 | 2026-04-24 |
AICellType: a large language model-based platform for accurate cell type annotation
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag151
PMID:42001469
|
研究论文 | 提出AICellType平台，利用大语言模型实现单细胞和空间转录组数据的准确细胞类型注释 | 系统评估了79种大语言模型在1130个单细胞和空间转录组数据集上的性能，并结合本体结构和语义推理构建评估框架，开发了集成多种模型部署方式的免费开源平台 | 文本未明确说明具体局限性，但可能涉及对罕见细胞类型或低质量数据的处理能力有限 | 开发一种基于大语言模型的细胞类型注释工具，解决现有方法依赖静态基因标记导致适应性不足的问题 | 单细胞和空间转录组数据集中的细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学，空间转录组学 | 大语言模型 | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 1130个单细胞和空间转录组数据集 | NA | 单细胞转录组学，空间转录组学 | NA | NA |
| 115 | 2026-04-24 |
Spatial multi-omics integration by cross-modal graph contrastive learning
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag192
PMID:42001472
|
研究论文 | 提出了一种基于图的跨模态对比学习框架CoMo，用于整合分析空间多组学数据，包括空间转录组、蛋白质组和表观基因组 | 首次通过交叉注意力机制和双重对比损失（邻域感知对比损失和聚类感知对比损失）实现空间多组学特征融合与空间域识别 | 未提及潜在局限性 | 开发一种计算工具，用于空间多组学数据的集成分析和空间域识别 | 五种空间组学数据集 | 机器学习 | NA | 空间多组学 | 图神经网络, 交叉注意力机制 | 空间组学数据 | 五种数据集 | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 空间表观基因组学 | NA | NA |
| 116 | 2026-04-24 |
Causal modeling reveals cell-cell communication dynamics in the tumor microenvironment during anti-PD-1 therapy in breast cancer patients
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag139
PMID:42001468
|
研究论文 | 提出因果推断框架scIVCCC，利用单细胞数据分析抗PD-1治疗前后乳腺癌肿瘤微环境中的细胞间通讯动态 | 创新性地使用治疗作为工具变量，构建因果推断框架scIVCCC，避免传统相关性方法中的混杂关联，从单细胞数据中准确识别基因信号转导的因果网络 | 该框架可能受限于工具变量假设的满足程度（如治疗随机性），且仅基于单细胞RNA-seq数据，未整合其他组学或空间信息 | 阐明抗PD-1免疫检查点阻断治疗如何通过细胞间通讯重塑乳腺癌肿瘤微环境，并识别可靶向的联合治疗候选受体 | 31名乳腺癌患者在抗PD-1治疗前后的肿瘤组织单细胞RNA-seq数据 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA-seq | 因果推断模型（工具变量方法） | 单细胞转录组数据 | 31名乳腺癌患者，治疗前后配对样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 117 | 2026-04-24 |
GALA: a unified landmark-free framework for coarse-to-fine spatial alignment across resolutions and modalities in spatial transcriptomics
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag181
PMID:42007518
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研究论文 | 提出一个名为GALA的统一无地标框架，用于解决空间转录组学中跨分辨率和模态的粗细粒度空间对齐问题 | 创新地将全局仿射变换与局部微分同胚变形集成在单一优化中，实现无需地标的多模态对齐，并利用模态感知栅格化统一转录组和组织学数据 | 未明确提及局限性 | 开发一个高效、准确且生物学可解释的框架，以克服空间转录组学数据对齐中的技术变异和复杂场景 | 人类和小鼠的空间转录组学及组织学数据集 | 计算机视觉 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像、文本 | 多样化的人类和小鼠数据集（未提供具体数量） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 118 | 2026-04-24 |
Evaluating reference-mixture matching in cell-type deconvolution with single-cell RNA-seq references
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag184
PMID:42007519
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研究论文 | 系统评估单细胞RNA-seq参考数据在细胞类型解卷积中的匹配效果对解卷积性能的影响 | 首次系统地比较不同单细胞RNA-seq参考匹配条件（匹配、不匹配和混合）对七种细胞类型解卷积算法性能的影响，并提出方法选择比参考匹配更为关键 | 仅使用了来自系统性红斑狼疮患者和健康对照的外周血单核细胞数据集，可能限制了向其他组织或疾病类型的推广 | 评估在各种参考匹配条件下，不同细胞类型解卷积方法的准确性 | 系统性红斑狼疮患者和健康对照的外周血单核细胞样本 | 机器学习 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | CIBERSORTx, MuSiC2, InstaPrism, BLADE, DISSECT, Scaden | 基因表达数据 | 40名系统性红斑狼疮患者和40名健康对照的PBMC样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | 使用scRNA-seq数据构建参考，并模拟批量RNA-seq混合物 |
| 119 | 2026-04-24 |
CD8+ T cells cross-restricted by HLA-B*57 and HLA-E*01 recognize HIV Gag with different functional profiles
2026-Feb-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.189909
PMID:41411059
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研究论文 | 本研究评估了由HLA-E或HLA-B57限制的针对HIV Gag表位KF11的CD8+ T细胞的功能特征 | 首次揭示HIV特异性CD8+ T细胞可被HLA-B*57和HLA-E*01:03双重限制，且产生功能不同的免疫反应 | 样本量较小（仅8名HIV感染者），且未深入探讨双重限制T细胞在病毒控制中的具体机制 | 探究非经典HLA-E限制的HIV特异性CD8+ T细胞的功能特征及其与HLA-B57限制的差异 | 8名HIV感染者的CD8+ T细胞 | 免疫学，单细胞组学 | 艾滋病 | 单细胞RNA测序，TCR测序，细胞因子分析，多聚体筛选 | NA | 单细胞基因表达，TCR序列，细胞因子数据 | 8例HIV感染者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 120 | 2026-04-24 |
Spatial multi-omics unveils the monoclonal origin, neuroendocrine plasticity, and microenvironment niches in combined small cell lung cancer
2026-Feb-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.31.702982
PMID:41684943
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研究论文 | 通过空间多组学揭示了联合性小细胞肺癌的单克隆起源、神经内分泌可塑性和微环境生态位 | 首次对联合性小细胞肺癌进行空间全外显子测序、空间转录组学和单核RNA测序的多组学分析，发现其单克隆起源和神经内分泌可塑性，并开发了基于突变的诊断检测方法 | 未明确说明，但从研究设计推断可能受限于样本量（19例）和单一肿瘤类型 | 探究联合性小细胞肺癌的分子特征、谱系可塑性和肿瘤微环境 | 联合性小细胞肺癌患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间全外显子测序、空间转录组学、单核RNA测序 | NA | 基因表达、突变、拷贝数变异数据 | 19 例未经治疗的联合性小细胞肺癌肿瘤 | Illumina, 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq, 10x Visium, 10x Chromium | 10x Visium 用于空间转录组学, 10x Chromium 用于单核RNA测序 |