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当前共找到 44127 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-10-07 |
Multi-omics insights into uric acid metabolism in cardiometabolic disease: from genetics to metabolomics
2026-May-25, Biomedical journal
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.bj.2026.100997
PMID:42190810
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综述 | 从多组学视角总结尿酸代谢在心血管代谢疾病中的机制研究进展，涵盖基因组学、表观基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学，并探讨生物标志物发现与治疗靶点 | 系统整合基因组学、表观基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学等多组学层面，结合eQTL映射、因果建模、网络生物学和AI分析，全面阐述尿酸代谢在心血管代谢疾病中的分子机制 | 作为综述文章，未提供原始实验数据，且多组学整合在临床应用中的标准化和验证仍面临挑战 | 从多组学角度总结尿酸代谢在心血管代谢疾病中的最新研究进展，并展望风险评伀、生物标志物发现、治疗靶向和个体化预防策略的新机遇 | 高尿酸血症与心血管代谢疾病（包括高血压、2型糖尿病、慢性肾脏病、代谢综合征和动脉粥样硬化性心血管疾病） | 多组学 | 心血管疾病 | 全基因组关联研究、表观基因组学、转录组学、单细胞RNA测序、代谢组学、蛋白质组学、eQTL映射、因果建模、网络生物学、AI分析 | NA | 文本 | NA | NA | 全基因组关联研究, 单细胞RNA测序, 代谢组学, 蛋白质组学, 表观基因组学 | NA | NA |
| 102 | 2026-10-07 |
Once yearly cell-based therapy for sustained and dose tunable delivery of monoclonal antibodies
2026-May-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.19.726224
PMID:42239463
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研究论文 | 该研究开发了一种免疫调节封装细胞为基础的生物制剂工厂，能够在单次给药后持续一年产生治疗性单克隆抗体，并通过可回收宏观装置实现剂量可调 | 开发了免疫调节海藻酸盐配方克服了抗体不稳定性、免疫原性和纤维化异物反应，实现了单次给药持续一年产生单克隆抗体，并整合可回收宏观装置实现按需终止和剂量成比例调节 | 研究主要在免疫活性小鼠和非人灵长类中进行，尚未进行人体临床试验，长期安全性和有效性仍需进一步验证 | 开发一种可临床转化的平台，用单次给药疗法替代频繁注射，实现持续且剂量可调的单克隆抗体递送 | 免疫活性小鼠和非人灵长类 | 机器学习 | 艾滋病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 103 | 2026-10-07 |
Single-cell insights: Mosquito Toll activation enhances granulocyte differentiation and immune surveillance via Notch suppression
2026-Apr-14, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2531951123
PMID:41941624
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研究论文 | 该研究利用单细胞转录组学探究蚊子免疫信号通路如何调控血细胞分化与功能 | 首次在医学相关蚊种中构建了大规模血细胞单细胞图谱，发现了新的绛色细胞和粒细胞亚群，并揭示Toll和JNK激活通过转录抑制Notch信号驱动粒细胞终末分化及巨细胞扩增，同时减少绛色细胞 | 摘要中未提及研究局限性 | 探究Toll、IMD、JNK和STAT免疫信号通路如何调控蚊子血细胞谱系决定、分化与成熟 | 蚊子血细胞（37,529个血细胞） | 单细胞转录组学 | 疟疾 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 37,529个血细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 104 | 2026-10-07 |
A uniquely leptin sensitive hypothalamic neuron population limits hyperphagia and weight gain in diet-induced obesity
2026-Mar-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.26.714161
PMID:41929083
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研究论文 | 结合空间转录组学和单核RNA测序，在小鼠饮食诱导肥胖模型中揭示了一群独特的瘦素敏感下丘脑神经元群体，该群体限制暴食和体重增加 | 首次发现由GLP-1受体共表达定义的单一神经元群体在肥胖中保持瘦素敏感性，并揭示其通过抑制促食欲神经元和调节小胶质细胞激活来限制暴食和体重增加 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证；未详细探讨该神经元群体在长期肥胖中的动态变化 | 探究在肥胖中仍保持瘦素敏感性并介导瘦素抑制摄食效应的神经基础 | 饮食诱导肥胖（DIO）小鼠的下丘脑神经元 | 神经科学 | 肥胖 | 空间转录组学，单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学，单核RNA测序 | NA | NA |
| 105 | 2026-10-07 |
DAESC + : high-performance, integrated software for single-cell allele-specific expression data
2026-Mar-18, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-026-06426-y
PMID:41851619
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研究论文 | 该文章介绍了DAESC+，一个用于单细胞等位基因特异性表达数据处理和分析的双模块端到端软件包。 | 开发了专用计算工具DAESC+，其中DAESC-P是一个用户友好的生物信息学管道，用于从多重scRNA-seq数据中获取ASE计数，且比现有SALSA管道更准确；DAESC-GPU是一个基于GPU的可扩展差异ASE分析工具，比之前的方法DAESC快数十倍，可扩展至超过一百万细胞。 | 摘要中未提及。 | 解决单细胞等位基因特异性表达（ASE）缺乏专用计算工具的问题，提供高性能、集成的软件用于单细胞ASE数据处理和差异分析。 | 多重scRNA-seq数据中的单细胞等位基因特异性表达；OneK1K队列中的CD4+ T细胞和B细胞。 | 机器学习, 生物信息学 | NA | scRNA-seq, 等位基因特异性表达分析 | NA | 文本, 基因表达数据 | OneK1K队列的一个子集 | NA | scRNA-seq | NA | NA |
| 106 | 2026-10-07 |
scDesignPop generates realistic population-scale single-cell RNA-seq for power analysis, benchmarking, and privacy protection
2026-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.23.707578
PMID:41808987
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研究论文 | 该文章介绍了 scDesignPop，一种用于生成具有遗传效应的真实群体规模单细胞 RNA 测序数据的统计模拟器 | scDesignPop 能够模拟细胞和个体水平协变量、细胞类型特异性 eQTL 以及真实或合成基因型，比现有模拟器 splatPop 更好地保留 eQTL 效应和细胞类型内的基因-基因依赖关系 | 未明确提及 | 解决群体规模单细胞 RNA 测序数据生成成本高、分析方法选择缺乏共识以及数据共享隐私风险等问题 | 单细胞 RNA 测序数据、遗传效应、eQTL | 机器学习 | NA | 单细胞 RNA 测序 | 统计模拟器 | 文本 | OneK1K 和 CLUES 队列 | NA | 单细胞 RNA 测序 | NA | NA |
| 107 | 2026-10-07 |
Single-cell Sequencing and Machine Learning Identify Amino Acid Metabolism-related Biomarkers and Regulatory Mechanisms in Diabetic Foot Ulcers
2026, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
|
研究论文 | 结合单细胞RNA测序与机器学习，鉴定糖尿病足溃疡中与氨基酸代谢相关的生物标志物及角质形成细胞亚群的调控机制 | 首次将单细胞测序与机器学习整合，揭示Kera1角质形成细胞亚群通过CDH1-CDH1自分泌钙黏蛋白信号驱动DFU非愈合，并鉴定五个氨基酸代谢相关诊断基因及ODC1作为Eflornithine潜在治疗靶点 | 研究主要基于公共数据集（GSE165816和GSE134431）和临床样本qPCR验证，样本量有限，缺乏体内功能实验验证，分子对接结果需进一步实验证实 | 探索糖尿病足溃疡中角质形成细胞异质性及氨基酸代谢相关生物标志物，为临床诊断和靶向治疗提供分子机制框架 | 糖尿病足溃疡患者样本及公共单细胞和bulk RNA测序数据集 | 数字病理学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, qPCR, 分子对接 | 机器学习 | 图像, 文本 | 单细胞数据集GSE165816和bulk RNA数据集GSE134431，以及临床样本用于qPCR验证 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 108 | 2026-10-07 |
Evolution, disciplinary integration, and frontiers of multi-omics and single-cell technologies in periodontology: a bibliometric analysis (2000-2025) with an early-2026 frontier update
2026, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2026.1875551
PMID:42806964
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文献计量分析 | 本文通过文献计量学和科学计量学方法，分析了2000至2025年间多组学和单细胞技术在牙周病学中的演化轨迹与前沿方向 | 首次基于Web of Science核心合集对牙周病学中多组学与单细胞技术进行系统性文献计量分析，采用LDA主题建模提取研究主题，并纳入2026年初记录作为前沿探索性更新 | 仅基于Web of Science核心合集索引文献，可能遗漏其他数据库的重要研究；2026年初记录仅作为探索性前沿更新，样本量有限；文献计量分析无法深入评估研究质量 | 绘制多组学和单细胞技术在牙周病学研究中的演化轨迹与新兴前沿，为未来精准诊断和再生研究提供知识图谱参考 | 2000至2025年间Web of Science核心合集中收录的牙周病学领域多组学与单细胞技术相关文献 | 文献计量学 | 牙周病 | 多组学、单细胞RNA测序 | LDA主题模型 | 文本 | 559篇符合条件的文献 | NA | NA | VOSviewer, CiteSpace, R-bibliometrix | Web of Science核心合集（WoSCC）用于文献检索，VOSviewer和CiteSpace用于数据可视化与网络分析，R-bibliometrix包用于文献计量分析 |
| 109 | 2026-10-07 |
Endothelial-to-Mesenchymal Transition in Chronic Kidney Disease: Mechanisms and Therapeutic Targets
2026, Kidney & blood pressure research
IF:2.3Q2
DOI:10.1159/kbr/adjag001
PMID:42520000
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综述 | 本文综述了慢性肾脏病中内皮-间充质转化（EndMT）的细胞与分子机制、主要调控通路之间的相互作用，以及抑制EndMT、保护肾脏微血管完整性和减轻纤维化的新兴药理策略 | 系统整合了TGF-β经典Smad依赖与非经典Smad非依赖通路以及Wnt/β-catenin、Notch、Hedgehog、炎症细胞因子、自噬失调、氧化应激和代谢重编程等多条通路在EndMT中的调控作用，并探讨了以EndMT为靶点的治疗策略 | EndMT对人类肾脏纤维化的定量贡献、部分性或混合性EndMT状态的生物学意义以及最有效的治疗靶向方法仍未完全明确 | 总结慢性肾脏病中EndMT的细胞和分子机制，阐明主要调控通路间的相互作用，并讨论抑制EndMT、保护肾脏微血管完整性和减轻纤维生成的新兴药理策略 | 慢性肾脏病中的内皮-间充质转化（EndMT）及相关调控通路 | 医学综述 | 慢性肾脏病 | 谱系追踪, 单细胞转录组学, 空间转录组学, 生物标志物开发 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 110 | 2026-10-07 |
Identification of Shared Targets of Ginseng and Angelica sinensis in Premature Ovarian Failure: Network Pharmacology and Mendelian Randomization Analysis
2026, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
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研究论文 | 本研究通过整合网络药理学与转录组数据，并结合孟德尔随机化分析，识别了人参和当归在早发性卵巢功能不全中的共享靶点 | 首次结合网络药理学、转录组学、机器学习和孟德尔随机化分析，系统识别了人参和当归在早发性卵巢功能不全中的共享关键靶点（HSD17B1、MAPK14和CDC7），并揭示了其与女性不孕风险的因果关联 | 研究主要基于生物信息学分析和遗传学关联，缺乏体外和体内实验验证，靶点的具体分子机制尚未通过功能实验证实 | 识别人参和当归在早发性卵巢功能不全中的关键靶点，并探索这些靶点与早发性卵巢功能不全的潜在因果关联 | 人参和当归的药用靶点、早发性卵巢功能不全相关的转录组数据和遗传数据 | 机器学习 | 早发性卵巢功能不全 | 网络药理学、转录组分析、机器学习、孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、基因集富集分析、免疫浸润分析 | NA | 文本、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、转录组分析 | NA | NA |
| 111 | 2026-10-07 |
Integrated Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Reveals Inflammatory Microenvironment and Glycolysis-Driven Epithelial Proliferation in Benign Prostatic Hyperplasia
2026, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S636515
PMID:42830901
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研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序，揭示良性前列腺增生中炎症微环境与糖酵解驱动的上皮细胞增殖机制，并验证糖酵解抑制剂的治疗效果 | 首次整合单细胞RNA测序与空间转录组学系统刻画良性前列腺增生的炎症微环境与代谢特征，发现基底上皮细胞的糖酵解介导增殖是疾病进展的关键机制，并通过体内实验验证2-脱氧-D-葡萄糖靶向糖酵解的治疗潜力 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 探究良性前列腺增生中炎症微环境与代谢改变之间的相互作用，阐明疾病进展的分子机制并寻找潜在治疗靶点 | 良性前列腺增生患者的前列腺组织样本及良性前列腺增生大鼠模型的前列腺组织 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序 | CellChat、CytoTRACE、Monocle、SCENIC、CARD算法 | 图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序 | NA | NA |
| 112 | 2026-10-07 |
Identification of SARS-CoV-2-specific cytotoxic lymphocytes in cerebrospinal fluid of a patient with cerebral demyelination Post mRNA vaccination
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1920061
PMID:42834940
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和免疫组库分析，研究一例mRNA疫苗接种后发生脑脱髓鞘患者脑脊液中SARS-CoV-2特异性细胞毒性淋巴细胞的免疫学特征 | 首次在mRNA疫苗接种后脑脱髓鞘患者的脑脊液中鉴定出针对SARS-CoV-2刺突蛋白肽段的效应CD8+ T细胞，并揭示其细胞毒性增强及激素治疗后外周血比例下降与临床改善相关 | 仅基于单例患者，无法确定疫苗接种与脱髓鞘之间的直接因果关系，样本量极小，结论需更大规模研究验证 | 阐明疫苗接种后激活的免疫细胞及抗原特异性淋巴细胞在中枢神经系统脱髓鞘病变中的具体作用 | 一例接种SARS-CoV-2 mRNA疫苗后出现右手笨拙并诊断为瘤样脑脱髓鞘的患者 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫组库分析, 淋巴细胞刺激实验 | NA | 文本 | 1例患者的脑脊液和外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 113 | 2026-10-07 |
LGALS3 marks a pro-inflammatory, efferocytosis-low hepatic macrophage state and promotes hepatic stellate cell activation through the candidate receptor ANXA2 in liver cirrhosis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1891906
PMID:42835012
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研究论文 | 该研究通过批量RNA测序和单细胞RNA测序分析，识别出LGALS3是肝硬化的关键胞葬作用相关基因，并揭示其标记促炎、低胞葬能力的肝脏巨噬细胞状态，通过候选受体ANXA2促进肝星状细胞活化 | 首次将LGALS3鉴定为肝硬化中胞葬作用相关的中枢基因，揭示其标记促炎、低胞葬能力的肝脏巨噬细胞亚群，并发现ANXA2是介导LGALS3促肝星状细胞活化的候选受体 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验验证，缺乏体内动物模型和临床队列的进一步验证；ANXA2作为受体介导LGALS3信号的具体分子机制尚未完全阐明 | 识别和验证与肝硬化相关的胞葬作用相关基因，并探究其在肝硬化发病机制中的潜在作用 | 肝硬化组织样本、肝脏巨噬细胞、肝星状细胞（JS1细胞系） | 机器学习 | 肝硬化 | bulk RNA-seq、scRNA-seq、免疫组化、免疫荧光、蛋白质印迹、siRNA基因沉默、Transwell共培养、分子动力学模拟 | 机器学习模型、SHAP分析、NicheNet分析 | 基因表达数据、图像 | NA | NA | bulk RNA-seq、scRNA-seq | NA | NA |
| 114 | 2026-10-07 |
Isobavachalcone attenuates experimental periodontitis by suppressing PTGS2-associated macrophage ferroptosis and restoring periodontal immune homeostasis
2026, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2026.1913548
PMID:42835099
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研究论文 | 该研究探讨了异补骨脂查尔酮（IBC）通过靶向PTGS2抑制巨噬细胞铁死亡并恢复牙周免疫稳态，从而缓解实验性牙周炎的作用及机制 | 首次揭示IBC通过直接结合PTGS2、阻断JNK/p38 MAPK磷酸化级联、打破ROS放大环路并稳定GPX4，进而抑制巨噬细胞铁死亡，为牙周炎治疗提供了新的天然化合物候选药物及分子靶点 | 主要基于大鼠模型和RAW264.7细胞系，缺乏更接近人类牙周微环境的多物种验证；IBC的药代动力学特性、长期安全性及临床转化可行性尚未系统评估 | 探究IBC对牙周炎的治疗效果及其潜在分子靶点，重点关注巨噬细胞铁死亡和免疫代谢调控 | 实验性牙周炎大鼠模型、RAW264.7巨噬细胞、人牙周临床样本及单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序、网络药理学、分子动力学模拟、细胞热位移分析、微量热泳动 | NA | 图像、文本、单细胞表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 115 | 2026-10-07 |
BDE-47 and male infertility: integrated network toxicology, single-cell transcriptomics, and in vitro evidence of GSTM1 downregulation and ferroptosis-related molecular remodeling in Leydig cells
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1956997
PMID:42835125
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研究论文 | 该研究整合网络毒理学、单细胞转录组学和体外实验，揭示BDE-47暴露与男性不育相关，并发现GSTM1下调及Leydig细胞中铁死亡相关分子重塑 | 首次整合网络毒理学、单细胞转录组学和体外实验，将BDE-47暴露与人类NOA的分子汇聚点定位到Leydig细胞中的GSTM1和铁死亡相关特征，并采用SHAP分析等多算法筛选候选基因 | 观察结果仅具有假设生成性质，未能建立直接结合、GSTM1介导效应、铁死亡细胞死亡或BDE-47暴露与人类NOA之间的因果关系 | 探究BDE-47男性生殖毒性的关键睾丸细胞群体和分子基础，并寻找与人类特发性非梗阻性无精症（NOA）相关的分子汇聚点 | BDE-47暴露的小鼠睾丸、人类特发性非梗阻性无精症（NOA）样本以及TM3小鼠Leydig细胞系 | 数字病理学 | 男性不育 | 单细胞转录组学, 网络毒理学, bulk转录组学, 分子对接, 分子动力学模拟 | 高维加权基因共表达网络分析, 基于元细胞的SHAP特征优先排序, 铁死亡驱动基因特征评分, 免疫去卷积 | 文本, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 116 | 2026-10-07 |
Myeloid EGR1 contributes to Th17/Treg imbalance during acute liver allograft rejection in a rat model
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1901189
PMID:42835148
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研究论文 | 本研究利用大鼠原位肝移植模型，探究EGR1在缺血再灌注损伤和急性排斥反应阶段的时空表达及其通过髓系抗原提呈细胞调控Th17/Treg平衡的机制 | 首次系统揭示EGR1在大鼠肝移植后不同阶段（IRI与AR）的时空表达差异，并证明髓系EGR1通过调控抗原提呈细胞活化及Th17/Treg平衡参与急性排斥反应 | 研究基于大鼠模型，结论向人体临床转化尚需进一步验证；机制研究主要依赖体外共培养和公共scRNA-seq数据，缺乏体内基因敲除或过表达的直接功能验证 | 阐明EGR1在肝移植后缺血再灌注损伤和急性排斥反应中的细胞分布、时空表达及其对适应性同种免疫的调控作用 | 大鼠原位肝移植模型中的肝移植物、骨髓来源树突状细胞及CD4+ T细胞 | 移植免疫学 | 肝移植排斥反应 | 单细胞RNA测序、虚拟基因敲除分析、体外细胞共培养 | 大鼠原位肝移植模型、EGR1过表达BMDC与CD4+ T细胞共培养模型 | 基因表达数据、图像、文本 | 大鼠原位肝移植模型（同基因和异基因移植组，观察时间点为IRI 6-24小时及AR 5-10天）、公共scRNA-seq数据、体外共培养的BMDC与CD4+ T细胞 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 117 | 2026-10-07 |
Single-cell virtual knockout network perturbation prioritizes candidate regulators of beta-cell functional failure in type 2 diabetes
2026, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2026.1924512
PMID:42835153
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研究论文 | 该研究结合人类胰岛单细胞RNA测序、β细胞功能状态建模、候选基因评分、scTenifoldKnk虚拟敲除网络分析及外部验证，优先筛选与2型糖尿病相关β细胞功能衰竭的调控因子 | 将无先验的全基因组筛选与独立的scTenifoldKnk网络证据分析相结合，并采用匹配表达、检测及网络强度的随机面板进行固定14基因面板的显著性检验，同时系统评估了网络规模和细胞数量对结果稳定性的影响 | 单个候选基因的证据存在差异，且没有任何一个基因在14个基因的多重校正后仍然显著；网络推断结果受细胞数量和网络数量影响较大 | 优先筛选与2型糖尿病相关β细胞功能衰竭的候选调控因子 | 人类胰岛β细胞，涵盖2型糖尿病和正常供体 | 机器学习, 单细胞转录组学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序, 虚拟敲除网络分析, 伪批量分析 | scTenifoldKnk, 基因调控网络 | 单细胞转录组数据, 文本 | 48个供体用于伪批量分析；网络规模实验每组网络包含200、500或1,000个细胞，并额外评估了2,000个细胞的设置；GSE221156包含26,164个表达基因，其中17,989个通过伪批量过滤 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 118 | 2026-10-07 |
Integrated single-cell and multi-cohort analyses reveal CTCF as a key regulator of chemo-immunotherapy resistance in lung adenocarcinoma
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1922944
PMID:42835157
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研究论文 | 该研究通过整合单细胞RNA测序与多队列分析，揭示了CTCF是肺腺癌化疗免疫治疗耐药的关键调控因子，并阐明CTCF-RRM2/CD276轴连接肿瘤内在耐药与免疫逃逸 | 首次通过单细胞分析与多队列整合鉴定出稳定疾病患者中富集的耐药相关恶性上皮细胞亚群，并发现CTCF作为化疗免疫治疗耐药的关键调控因子，揭示CTCF通过直接上调RRM2和CD276分别介导化疗耐药和免疫抑制的新机制 | 未在摘要中明确说明 | 探究非小细胞肺癌化疗免疫治疗耐药的肿瘤细胞状态及分子机制 | 接受化疗免疫治疗的NSCLC患者的单细胞RNA测序数据、公共转录组队列及原位肺癌小鼠模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，转录组分析 | 预后模型 | 单细胞RNA测序数据，转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 119 | 2026-10-07 |
A single-cell atlas and Shiny-based framework for murine lung injury and remodeling
2026, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2026.1886929
PMID:42835183
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研究论文 | 该研究构建了一套模块化、可交互的单细胞RNA测序数据分析与可视化平台，并以免疫富集的小鼠肺损伤与重塑数据集为案例，系统评估了细胞类型注释、数据预处理与整合以及细胞间通讯分析策略 | 开发了基于Shiny的模块化交互式分析平台；以人工注释作为金标准，系统评估了基于Tabula Muris Senis和LungMAP参考图谱的自动注释在损伤诱导细胞状态上的局限；对比了Log-normalization与SCTransform、FastMNN等预处理与整合组合在批次校正与生物学身份保留间的平衡；在LIANA框架下评估了8种推断算法和18种参考资源用于细胞间通讯分析 | 自动化的基于参考的注释方法难以解析参考图谱中缺失的细胞状态，尤其是损伤诱导的单核细胞来源巨噬细胞和嗜酸性粒细胞；研究结论基于单一小鼠肺损伤数据集，其普适性仍需在更多数据集中验证 | 针对肺部急慢性损伤单细胞RNA测序分析缺乏数据驱动分析框架的问题，构建可重复、可交互的分析平台，并系统评估注释、整合与细胞通讯分析策略 | 免疫富集的小鼠肺组织单细胞RNA测序数据，涵盖对照、炎症与重塑、纤维化、臭氧暴露的纤维化肺四种条件及不同批次样本 | 机器学习 | 肺损伤与肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本（单细胞基因表达计数矩阵） | 包含四个条件（对照、炎症与重塑、纤维化、臭氧暴露纤维化肺）及不同批次的小鼠肺样本，共鉴定出36个不同细胞群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 120 | 2026-10-07 |
AI-guided ethnopharmacology for cardiovascular drug discovery: from biomedical data to experimental validation
2026, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2026.1962508
PMID:42836037
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综述 | 本文综述了支持AI引导民族药理学的心血管药物发现的主要生物医学数据资源、计算方法，并提出了化合物优先和疾病优先两种AI引导发现框架，最后讨论了心血管疾病中的应用前景与挑战 | 提出了两种互补的AI引导发现框架：化合物优先策略预测植物药物的药理活性，疾病优先策略识别能够逆转疾病相关分子和细胞状态的天然产物，并强调AI与单细胞图谱、疾病状态预测、机制研究和实验验证的整合 | 数据标准化不足、模型鲁棒性有限、可解释性欠缺以及缺乏前瞻性验证 | 探讨如何利用AI系统性地研究植物药物，加速心血管植物药物发现，促进民族医药知识向现代精准治疗转化 | 植物药物（ botanical drugs）、天然产物、民族医药知识、心血管疾病 | 机器学习 | 心血管疾病 | 多组学、单细胞和空间转录组学 | 基础模型迁移学习 | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |