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当前共找到 32961 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-11-23 |
scGPD: single-cell informed gene panel design for targeted spatial transcriptomics
2025-Oct-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.02.680117
PMID:41256660
|
研究论文 | 提出一种基于深度学习的单细胞RNA测序数据驱动的基因panel设计框架scGPD，用于优化靶向空间转录组学研究 | 采用基因-基因相关性感知的门控机制，从数据中提取信息特征，促进所选基因的多样性并消除冗余 | NA | 为靶向空间转录组学设计紧凑、非冗余的基因panel | 单细胞RNA测序数据和空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 102 | 2025-11-23 |
A single-cell transcriptomic atlas of inner ear morphogenesis in zebrafish
2025-Sep-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.30.679639
PMID:41256471
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了斑马鱼内耳形态发生的转录组图谱 | 首次提供了发育中内耳最全面的转录组分析，发现了半规管发生区的最早标记物、内淋巴囊中组织收缩相关基因、神经丘与耳部感觉斑块的平行基因集，以及在耳道和囊中细胞周期暂停的保守作用 | 研究仅使用斑马鱼胚胎模型，结果在哺乳动物中的适用性需要进一步验证 | 揭示内耳发育过程中不同细胞状态的建立机制 | 野生型和突变型斑马鱼胚胎的内耳组织 | 单细胞转录组学 | 内耳发育异常 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼胚胎（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 103 | 2025-11-23 |
Low Dose GLP-1 Therapy Attenuates Pathological Cardiac and Hepatic Remodelling in HFpEF Independent of Weight Loss
2025-Sep-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.26.678829
PMID:41256540
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研究论文 | 本研究探讨低剂量GLP-1受体激动剂在保留射血分数心衰模型中的心脏和肝脏保护作用 | 首次证明低剂量GLP-1受体激动剂在不依赖体重减轻的情况下改善HFpEF的心脏和肝脏病理重构 | 研究使用啮齿类动物模型，结果需在人类临床试验中验证 | 探究低剂量GLP-1受体激动剂在HFpEF中的非体重减轻依赖性治疗机制 | 自发性HFpEF的ZSF1肥胖大鼠 | 心血管疾病研究 | 心力衰竭 | 单细胞RNA测序，蛋白质组学，二维超声心动图，有创血流动力学检测 | 动物模型 | 多组学数据，生理参数，组织学数据 | 6只接受低剂量索马鲁肽治疗的ZSF1肥胖大鼠 | NA | 单细胞RNA测序，蛋白质组学 | NA | NA |
| 104 | 2025-11-23 |
The Integrated Stress Response Pathway Improves Aged Murine Muscle Stem Cell Activation and in vivo Regeneration
2025-Sep-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.26.678822
PMID:41256688
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研究论文 | 本研究揭示整合应激反应通路在调控衰老肌肉干细胞激活和再生功能中的关键作用 | 首次发现整合应激反应通路是调控肌肉干细胞状态转变的关键分子调节器，并证明其药理激活可改善衰老肌肉干细胞功能 | 研究主要基于小鼠模型，人类肌肉干细胞中的适用性仍需验证 | 探究衰老过程中肌肉干细胞激活和再生功能的分子调控机制 | 成年和衰老小鼠的肌肉干细胞 | 单细胞生物学 | 衰老相关肌肉疾病 | 单细胞RNA测序, Cell Painting, 异质运动性分析 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据, 表型数据 | 成年和衰老小鼠肌肉干细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 105 | 2025-11-23 |
A Single-Cell Atlas of Transcriptome Changes in the Intestinal Epithelium at the Suckling-to-Weaning Transition in Male Rabbits
2025-Sep-02, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101628
PMID:40907661
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了雄性兔子肠道上皮在哺乳到断奶过渡期的转录组变化 | 提供了首个兔子肠道上皮单细胞图谱，发现兔子是研究BEST4+上皮细胞的理想模型（该细胞在小鼠中缺失） | 研究仅针对雄性兔子，未包含雌性样本；研究时间点有限，未覆盖整个断奶过程 | 识别固体食物摄入诱导的肠道上皮各细胞类型的转录组变化 | 雄性兔子肠道上皮细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 年龄匹配的同窝哺乳期雄性兔子 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 106 | 2025-11-23 |
SCAN-ACT: adoptive T cell therapy target discovery through single-cell transcriptomics
2025-Aug-14, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01514-9
PMID:40814001
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研究论文 | 开发了名为SCAN-ACT的计算流程，通过单细胞转录组学发现过继性T细胞疗法靶点 | 首次提出整合单细胞RNA测序和多组学数据的计算流程，可同时提名CAR-T和TCR-T细胞靶点，包括单特异性靶点和双特异性布尔逻辑门控CAR-T靶点对 | 主要针对实体瘤，特别是在罕见癌症亚型中的应用仍需进一步验证 | 加速实体瘤过继性T细胞疗法的靶点发现 | 软组织肉瘤和胶质母细胞瘤 | 生物信息学 | 软组织肉瘤，胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，多组学数据分析 | 计算分析流程 | 单细胞转录组数据，多组学数据 | 986,749个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq，多组学 | NA | NA |
| 107 | 2025-11-23 |
Heterochronic parabiosis uncovers AdipoR1 as a critical player in retinal rejuvenation
2025-Jul-18, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adv6642
PMID:40668916
|
研究论文 | 本研究通过异时联体共生模型结合单细胞RNA测序，揭示了AdipoR1在视网膜年轻化中的关键作用 | 首次将异时联体共生与单细胞RNA测序相结合，系统鉴定AdipoR1-AMPK信号通路在视网膜年轻化中的核心机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类视网膜中验证 | 探索视网膜衰老的分子驱动因素并识别抗衰老靶点 | 小鼠视网膜组织 | 单细胞转录组学 | 视网膜衰老 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻、年老和异时联体共生配对小鼠的视网膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 108 | 2025-11-23 |
Spatial transcriptomics defines the cell-specific RNA landscape of equine dorsal root ganglia
2025-Jul, Veterinary pathology
IF:2.3Q1
DOI:10.1177/03009858241312623
PMID:39916473
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术绘制了马背根神经节细胞特异性RNA景观 | 首次将人类细胞标记物成功应用于马背根神经节的空间转录组分析，并验证了其跨物种适用性 | 研究仅针对健康成年马匹，尚未应用于疾病状态 | 定义健康成年马背根神经节的空间转录组景观 | 马背根神经节 | 空间转录组学 | 神经退行性疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 健康成年马背根神经节样本 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiling | GeoMx数字空间分析系统 |
| 109 | 2025-11-23 |
Scalable spatial transcriptomics through computational array reconstruction
2025-Apr-03, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-025-02612-0
PMID:40181168
|
研究论文 | 提出一种无需成像的空间转录组学方法，通过分子扩散和降维技术重建空间条形码位置 | 开发不依赖专业成像设备的空间转录组学方法，利用计算重建实现厘米级组织的空间基因表达定位 | NA | 提高空间转录组学的可及性和通量，实现大规模组织研究 | 组织样本中的空间基因表达模式 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，分子扩散分析，降维技术 | NA | 基因表达数据，空间位置信息 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 110 | 2025-11-23 |
Investigating pulmonary neutrophil responses to inflammation in mice via flow cytometry
2025-Mar-14, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae189
PMID:39212489
|
研究论文 | 本文详细介绍了通过流式细胞术评估小鼠肺部中性粒细胞表型的实验方案 | 提供了从肺组织和气道分离单细胞并进行全面染色技术的详细流程，适用于中性粒细胞异质性分析 | NA | 探索中性粒细胞在肺部生理和病理条件下的复杂功能 | 小鼠肺部中性粒细胞 | NA | 肺部炎症 | 流式细胞术 | NA | 流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 111 | 2025-11-23 |
Single Cell Spatial Transcriptomics Reveals Immunotherapy-Driven Bone Marrow Niche Remodeling in AML
2025-Jan-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.24.634753
PMID:39975227
|
研究论文 | 本研究利用单细胞空间转录组学技术揭示了免疫治疗对急性髓系白血病患者骨髓微环境的重塑作用 | 整合单细胞RNA测序与单细胞分辨率空间转录组数据，通过深度学习细胞分割模型实现精确的转录本定位和细胞间距离分析 | 存在测序深度限制，需要通过数据整合来克服 | 研究免疫治疗对急性髓系白血病患者骨髓微环境中白血病细胞与免疫细胞时空相互作用的影响 | 难治性或复发性急性髓系白血病患者的骨髓样本 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 深度学习图像分析 | 细胞分割模型, 深度学习 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 112 | 2025-11-23 |
Comparison of imaging-based single-cell resolution spatial transcriptomics profiling platforms using formalin-fixed, paraffin-embedded tumor samples
2025-Jan-17, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5656204/v1
PMID:39877088
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研究论文 | 本研究使用福尔马林固定石蜡包埋肿瘤样本系统比较了三种成像型单细胞分辨率空间转录组学平台的性能 | 首次使用严格对照实验系统评估商业空间转录组平台的性能，并引入像素级手动评估方法进行病理学意义比较 | 研究仅使用肺癌和胸膜间皮瘤样本，样本类型相对有限 | 比较不同空间转录组学平台在肿瘤研究中的性能差异 | 福尔马林固定石蜡包埋的肺腺癌和胸膜间皮瘤手术切除样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学，RNA测序，多重免疫荧光，HE染色 | NA | 空间转录组数据，图像数据 | 肺腺癌和胸膜间皮瘤组织芯片样本 | Nanostring, Vizgen, 10x Genomics | 单细胞空间转录组学，空间多组学 | CosMx, MERFISH, Xenium, GeoMx Digital Spatial Profiler | CosMx空间分子成像平台，MERFISH多重误差鲁棒荧光原位杂交，Xenium单细胞/多模态空间分析平台 |
| 113 | 2025-11-23 |
Deciphering oligomeric proanthocyanidins' dual osteoprotective mechanisms at single-cell resolution: NR4A1-mediated PTGS2 suppression and β-catenin-Runx2 activation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1679987
PMID:41262236
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示寡聚原花青素治疗骨质疏松的双重机制 | 首次在单细胞分辨率下发现C2 NR4A1+ MSCs亚型，并阐明OPC通过NR4A1介导的PTGS2抑制和β-catenin-Runx2激活的双重机制治疗骨质疏松 | NA | 阐明寡聚原花青素治疗骨质疏松的多靶点作用机制 | 骨质疏松小鼠模型中的间充质干细胞亚型 | 单细胞转录组学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序,网络药理学,细胞实验,动物模型 | Seurat,Monocle,Slingshot,CellChat | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 114 | 2025-11-23 |
Dermal fibroblast cultures recapitulate differences between deermice and mice in their responses to a Toll-like receptor agonist
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1666789
PMID:41262241
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研究论文 | 本研究通过皮肤成纤维细胞培养比较了白足鼠和小鼠对TLR2激动剂的免疫反应差异 | 首次在皮肤成纤维细胞培养模型中揭示白足鼠和小鼠在先天免疫反应、ERV/TE激活和细胞稳定性方面的种间差异 | 研究仅关注皮肤成纤维细胞，未涉及其他细胞类型；体外培养环境可能与体内实际情况存在差异 | 评估哺乳动物免疫反应的种间差异，建立适用于实验室和野外研究的体外模型 | 白足鼠(Peromyscus leucopus)和小鼠(Mus musculus)的原代皮肤成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 传染病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两种鼠类的原代皮肤成纤维细胞培养物 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 115 | 2025-11-23 |
Athero-oncology perspective: identifying hub genes for atherosclerosis diagnosis using machine learning
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1616096
PMID:41262249
|
研究论文 | 本研究通过整合癌症基因集和机器学习方法识别与动脉粥样硬化相关的关键枢纽基因，并构建诊断模型 | 首次从动脉粥样硬化-肿瘤学角度整合癌症基因集识别动脉粥样硬化关键基因，并构建基于IRF7、FHOD1和TNF的诊断列线图 | 分子机制仍需进一步深入研究 | 识别动脉粥样硬化诊断相关的关键枢纽基因并探索其免疫分子机制 | 平滑肌细胞、人类和小鼠模型的动脉粥样硬化样本 | 机器学习 | 心血管疾病 | 生物信息学分析、单细胞RNA测序 | SVM-RFE、LASSO回归、随机森林 | 基因表达数据 | GEO数据库数据集、人类颈动脉斑块和小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 116 | 2025-11-23 |
Cellf-deception: human microglia clone 3 (HMC3) cells exhibit more astrocyte-like than microglia-like gene expression
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1681811
PMID:41262332
|
研究论文 | 本研究通过基因表达分析发现HMC3细胞系更类似星形胶质细胞而非小胶质细胞 | 首次使用基因对比例方法揭示HMC3细胞系的真实细胞类型特征 | 研究基于基因表达数据，未进行功能验证实验 | 评估HMC3细胞系作为人类小胶质细胞模型的可靠性 | 人类小胶质细胞克隆3（HMC3）细胞系 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | bulk RNA-seq, scRNA-seq | 预测模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 117 | 2025-11-23 |
Neutrophil-Fibroblast Crosstalk Drives Immunofibrosis in Sequelae of Pelvic Inflammatory Disease Through Neutrophil Extracellular Traps
2025, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/3113542
PMID:41262541
|
研究论文 | 本研究探讨中性粒细胞与子宫成纤维细胞通过中性粒细胞胞外诱捕网在盆腔炎性疾病后遗症免疫纤维化中的相互作用机制 | 首次揭示自噬促进NETs生成并通过NETs-成纤维细胞相互作用驱动盆腔组织纤维化的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外细胞实验，临床样本验证不足 | 阐明盆腔炎性疾病后遗症组织纤维化的发病机制 | SPID大鼠模型、HL-60来源的中性粒细胞样细胞、子宫成纤维细胞 | 单细胞测序 | 盆腔炎性疾病 | 单细胞RNA测序、细胞共培养、动物模型构建 | 大鼠疾病模型、dHL-60细胞模型 | 单细胞测序数据、体外实验数据 | 公共数据库GSE223639单细胞数据、实验动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 118 | 2025-11-23 |
Single-Cell Transcriptomics Uncover EEF1A1-Driven Ubiquitination Dysregulation in T Cell Exhaustion and SLE Pathogenesis via STAT1-Mediated Th1/Th2 Imbalance
2025, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/3708640
PMID:41262540
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了EEF1A1通过STAT1介导的Th1/Th2失衡在T细胞耗竭和系统性红斑狼疮发病机制中的作用 | 首次发现EEF1A1作为泛素化相关枢纽基因通过STAT1磷酸化调控T细胞功能失调和Th1/Th2失衡 | 研究主要基于GSE135779数据集和MRL/lpr小鼠模型，需要更多临床样本验证 | 探究EEF1A1在系统性红斑狼疮发病机制中的作用机制 | 系统性红斑狼疮患者T细胞和MRL/lpr小鼠模型 | 单细胞转录组学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, hdWGCNA, LASSO回归, 功能验证实验 | NA | 单细胞RNA测序数据 | GSE135779数据集中的SLE样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 119 | 2025-11-23 |
BCL6, DUSP3, and IL6R Are Identified as Shared Druggable Immune-Regulatory Axis in Atrial Fibrillation and Atherosclerosis Through Integrative In Silico and In Vitro Analysis
2025, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/7388320
PMID:41262879
|
研究论文 | 通过整合计算分析和体外实验鉴定BCL6、DUSP3和IL6R作为心房颤动和动脉粥样硬化共有的免疫调节枢纽基因 | 首次通过多平台转录组学分析识别出AF和ATH共有的免疫调节枢纽基因，并通过体外实验验证其致病机制 | 研究主要基于公共数据库和体外细胞模型，缺乏体内实验验证 | 探索心房颤动和动脉粥样硬化的共同免疫炎症分子机制 | 心房颤动和动脉粥样硬化患者转录组数据、小鼠心脏成纤维细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 微阵列转录组分析、单细胞RNA测序、siRNA基因敲降、RT-qPCR、蛋白质印迹 | LASSO回归、转录调控网络建模、细胞通讯分析 | 转录组数据、基因表达数据 | 来自公共数据库的多个微阵列数据集 | Thermo Fisher | 单细胞RNA-seq | NA | Thermo Fisher验证的试剂盒和试剂 |
| 120 | 2025-11-23 |
Single-cell RNA sequencing reveals the role of immunoinflammatory cells in the progression of renal tubulointerstitial fibrosis
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0337092
PMID:41269996
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示免疫炎症细胞在肾小管间质纤维化进展中的作用 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统描绘UUO模型中免疫炎症细胞的动态变化及其与成纤维细胞的相互作用网络 | 研究仅基于小鼠UUO模型，未在人类样本中验证 | 阐明免疫炎症细胞在肾小管间质纤维化进展中的具体作用机制 | UUO模型小鼠肾脏组织中的免疫炎症细胞和成纤维细胞 | 单细胞测序分析 | 慢性肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | UUO模型小鼠（3天、7天、14天时间点）和假手术组小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |