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当前共找到 39123 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-05-05 |
A transcriptomic axis aligns with in vivo functional dynamics in hippocampal inhibitory circuits
2026-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.07.716935
PMID:41993541
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研究论文 | 通过细胞分辨双光子成像和空间转录组学，将小鼠海马体抑制性回路的分子身份与体内功能动态直接关联 | 建立端到端流程，结合双光子钙成像与空间转录组学，揭示转录组轴与神经元功能动态的对应关系，并证明仅凭生理特征即可恢复转录组分类 | 研究仅限于小鼠海马体CA1区，且虚拟现实导航行为的复杂性可能限制生理反应分类的普适性 | 在单细胞分辨率下桥接神经元分子身份与功能动态的关系 | 小鼠海马体CA1区的抑制性中间神经元 | 数字病理学， 机器学习 | NA | 空间转录组学， 双光子钙成像 | 分类器 | 基因表达数据， 成像数据 | 小鼠海马体CA1区的抑制性中间神经元（具体数量未提及） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 102 | 2026-05-05 |
Longitudinal Single-Cell RNA-seq Profiling of Lung Cell Phenotypes, Signaling, and Cross-talk During Fibrosis Resolution
2026-Apr-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.06.716772
PMID:41993271
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研究论文 | 通过纵向单细胞RNA测序分析肺纤维化消退过程中的细胞表型、信号通路和细胞间通讯变化 | 首次在自发消退的肺纤维化小鼠模型中进行纵向单细胞RNA测序，系统描绘了纤维化消退过程中免疫、间质和上皮细胞的动态变化，并发现cAMP、HGF/MET和TWEAK等潜在抗纤维化通路 | 研究仅限于小鼠模型，可能无法完全反映人类肺纤维化消退机制；单细胞测序缺乏空间信息，无法提供细胞在组织中的位置分布 | 阐明肺纤维化自发消退过程中涉及的信号通路、细胞间通讯和表型变化，为治疗肺纤维化发现内源性通路 | 小鼠全肺细胞 | 单细胞基因组学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 自发消退纤维化小鼠模型的纵向样本，具体数量未说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 103 | 2026-05-05 |
STDrug enables spatially informed personalized drug repurposing from spatial transcriptomics
2026-Apr-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.03.715101
PMID:41993522
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研究论文 | STDrug是一个空间感知的计算框架，整合空间转录组学、图建模和多模态学习，实现患者特异性的药物重定位 | 首次将空间转录组学与药物重定位结合，通过图卷积网络和相干点漂移技术对齐疾病与对照空间域，并融合多模态学习进行药物优先排序 | 需要利用空间转录组数据，可能对数据质量和可用性有较高要求；且仅通过肝细胞癌和前列腺癌数据集验证，泛化性有待进一步测试 | 利用空间转录组学实现患者特异性的药物重定位 | 肝细胞癌和前列腺癌患者的空间转录组数据 | 机器学习 | 肝细胞癌, 前列腺癌 | 空间转录组学 | 图卷积网络, 机器学习框架 | 空间转录组数据 | 肝细胞癌和前列腺癌数据集（具体样本数未提供） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 104 | 2026-05-05 |
Gain-of-function mutation in SKAP2 leads to type 1 diabetes and broader autoimmunity through hyperactive integrin signaling in myeloid cells
2026-Apr-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.02.716136
PMID:41993266
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研究论文 | 本文发现SKAP2基因的功能获得性突变通过髓系细胞中过度活跃的整合素信号通路导致1型糖尿病和更广泛的自身免疫 | 首次鉴定出SKAP2基因功能获得性突变与1型糖尿病相关，并通过整合素信号过度激活解释机制 | 研究主要基于小鼠模型，突变对人类的直接作用需进一步验证 | 阐明SKAP2基因突变导致1型糖尿病和自身免疫的机制 | 携带SKAP2 p.G153R突变的小鼠（NOD和C57BL/6J遗传背景） | 机器学习 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 携带突变的SKAP2小鼠（雌性和雄性）与对照小鼠 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 105 | 2026-05-05 |
Halo: a pretrained model for whole-cell segmentation from nuclei images in spatial transcriptomics
2026-Apr-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.02.716237
PMID:41993456
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研究论文 | 介绍Halo，一种基于核形态与RNA转录本空间分布整合的全细胞分割预训练模型，用于空间转录组学中从细胞核图像重建全细胞边界 | 提出Halo模型，直接整合原子核形态与RNA转录本的空间分布，无需特定数据集训练即可应用于新数据集，且在多种组织中优于传统核扩张策略 | NA | 开发一种通用且可规模化的全细胞分割模型，提高图像空间转录组学中细胞边界推断的准确性和可重复性 | 空间转录组学中的细胞核图像和RNA转录本坐标 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | Cellpose-SAM | 图像 | 12种组织类型的Xenium多模态数据 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | NA |
| 106 | 2026-05-05 |
Comparative single cell analysis of wound and cancer identifies the metabolic dialogues between tumor initiating stem cells and macrophages
2026-Apr-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.02.716187
PMID:41993506
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研究论文 | 通过比较单细胞分析揭示伤口愈合与癌症中肿瘤起始干细胞与巨噬细胞之间的代谢对话 | 首次通过比较单细胞RNA测序揭示伤口相关巨噬细胞与肿瘤相关巨噬细胞的差异，发现失调的脂质代谢是TAMs的独特特征，并识别SOX2肿瘤起始干细胞为调控TAMs脂质代谢和细胞状态的关键协调者 | NA | 探究伤口相关巨噬细胞与肿瘤相关巨噬细胞的分子和功能差异，以及肿瘤起始干细胞如何调节TAMs的代谢对话 | 皮肤伤口愈合和皮肤鳞状细胞癌进展过程中的巨噬细胞和SOX2肿瘤起始干细胞 | 机器学习 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 107 | 2026-05-05 |
Mapping whole-organism genetic comorbidities across model Species using unified ontologies
2026-04-04, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyag038
PMID:41664592
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研究论文 | 利用统一本体论跨物种绘制全生物体遗传合并症图谱 | 首次开发了跨物种表型本体整合框架，结合新构建的生殖表型本体与标准化全身体表型类别，实现了小鼠、斑马鱼、果蝇、线虫和人类之间的直接跨物种比较 | 仅分析了与无梗阻性无精症相关的基因，且跨物种表型比较依赖于现有数据库的完备性和注释质量 | 识别与无梗阻性无精症相关基因在全生物体层面的合并症模式，揭示男性不育与系统性疾病之间的共享遗传基础 | 204个小鼠生精失败相关基因及其在人、小鼠、斑马鱼、果蝇、线虫中的直系同源基因和表型注释 | 机器学习 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序、基因本体注释 | 聚类分析 | 基因型-表型关联数据、单细胞RNA测序数据、全身体基因表达数据 | 204个小鼠基因，涵盖多种跨物种模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 108 | 2026-05-05 |
Single-cell, clonal and spatial atlases of cranial placodes illuminate their specification and evolution
2026-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.01.715621
PMID:41959073
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研究论文 | 整合单细胞、克隆和空间图谱揭示颅窝的发育和进化机制 | 首次将单细胞RNA测序、空间转录组学和高分辨率克隆追踪整合，构建颅窝发育的综合性图谱，揭示前体细胞连续转录景观及竞争性谱系分离模型 | 未明确提及研究局限性，可能包括样本量有限或跨物种比较的潜在偏差 | 解析颅窝前体细胞的谱系分化动态和进化起源 | 脊椎动物颅窝及其前体细胞 | 生物信息学, 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 克隆追踪 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据, 克隆谱系数据 | 涉及多个脊椎动物样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 109 | 2026-05-05 |
Single-cell transcriptomics of acetaminophen-induced responses in human 2D and 3D liver microtissues
2026-04, Archives of toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1007/s00204-025-04296-6
PMID:41535591
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术比较对乙酰氨基酚在人类2D单层和3D肝微组织中的细胞反应，揭示氧气可用性与药物代谢之间的相互作用 | 首次在人源2D和3D肝细胞培养模型中，通过单细胞转录组学系统比较对乙酰氨基酚诱导的细胞反应差异，特别是氧气张力对代谢活性和药物解毒途径的影响 | 2D培养仅使用低剂量暴露，未进行高剂量对比；研究仅在体外模型中进行，缺乏体内验证 | 评估人源2D和3D肝细胞培养模型在药物性肝损伤研究中的生理相关性，了解氧气微环境对对乙酰氨基酚代谢和毒性的影响 | 原代人肝细胞、库普弗细胞和肝内皮细胞组成的2D单层和3D球体培养物 | 数字病理学 | 肝损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 2D和3D肝细胞培养物，暴露于低浓度（350µM）和高浓度（2687µM）对乙酰氨基酚，2D仅接受低剂量 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 110 | 2026-05-05 |
Human hippocampal neurogenesis in adulthood, ageing and Alzheimer's disease
2026-Apr, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-026-10169-4
PMID:41741649
|
研究论文 | 通过多组学单细胞测序技术，研究了人类海马神经发生在成年期、衰老和阿尔茨海默病中的变化及其分子机制 | 首次利用多组学单细胞测序（单细胞核RNA测序和单细胞核ATAC测序）分析大规模海马样本，揭示了神经发生失调与染色质可及性变化的关联，并识别了SuperAgers中的‘韧性特征’ | 研究仅基于死后人体样本，样本量有限，且未直接验证神经发生在认知功能中的因果关系 | 探索人类海马神经发生是否存在，以及其在衰老和阿尔茨海默病中的调控机制和认知影响 | 来自不同队列的人类死后海马样本，包括记忆完整的年轻成人、无认知障碍的老年人、有非凡记忆能力的老年人（SuperAgers）、临床前中间病理成人及阿尔茨海默病患者 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞核RNA测序、单细胞核ATAC测序 | NA | 单细胞测序数据 | 355,997个海马样本的单细胞核 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞核RNA测序和单细胞核ATAC测序 |
| 111 | 2026-05-05 |
Prosta-omics: machine learning-driven TPSA prediction and molecular modeling of ASPM-inhibitors for prostate cancer treatment
2026-Apr, Molecular diversity
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11030-026-11470-0
PMID:41781783
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研究论文 | 提出Prosta-Omics整合流程，将单细胞转录组学、化学信息学和机器学习结合，用于前列腺癌生物标志物发现和药物筛选 | 首次将单细胞RNA测序、机器学习预测拓扑极性表面积与分子对接相结合，构建从组学到治疗的全链条精准医学平台 | 未进行体外或体内实验验证预测化合物的实际疗效 | 开发整合组学与机器学习的前列腺癌精准治疗策略，筛选新型治疗靶点和候选药物 | 前列腺癌组织样本中的恶性及非恶性细胞群体 | 机器学习 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序，分子对接，分子动力学模拟，ADMET分析 | 随机森林 | 单细胞转录组数据，分子SMILES数据 | 前列腺癌组织样本（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 112 | 2026-05-05 |
Maternal obesity induces activator protein 1-mediated inflammatory response to impair embryonic neurogenesis
2026-04, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP289326
PMID:41823327
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研究论文 | 母体肥胖通过激活蛋白1介导的炎症反应损害胚胎神经发生 | 首次通过单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序揭示母体肥胖通过激活蛋白1转录因子增强炎症基因染色质可及性，从而抑制胚胎神经发生 | 未说明 | 探讨母体肥胖影响胚胎神经发育的分子机制 | 母鼠及其胚胎（E11.5和E13.5） | 单细胞组学 | 母体肥胖、神经发育障碍 | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞基因表达数据、单细胞染色质可及性数据 | 对照组和高脂饮食组母鼠胚胎（E11.5和E13.5） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序 |
| 113 | 2026-05-05 |
Cell-Type-Resolved Acetylation Regulator Atlas Defines Immune Endotypes and Druggable Vulnerabilities in Psoriasis
2026-Apr-01, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14040804
PMID:42072343
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研究论文 | 通过对银屑病皮肤转录组和单细胞数据的整合分析，构建了细胞类型分辨的乙酰化调控因子图谱，并定义了免疫内型和可药物靶点 | 首次在银屑病中构建了细胞类型特异性的乙酰化调控因子图谱，揭示了不同免疫细胞亚群中乙酰化模块的差异表达及其与IL-17相关炎症程序的关联，并通过无监督聚类定义了两种具有不同通路状态的乙酰化内型 | 未提及 | 探索银屑病中赖氨酸乙酰化调控因子的细胞类型特异性图谱及其临床分层价值 | 银屑病患者和健康对照的皮肤样本，以及咪喹莫特诱导的银屑病小鼠模型 | 机器学习 | 银屑病 | RNA-seq, scRNA-seq, qRT-PCR | 无监督聚类 | 基因表达数据 | 746例银屑病患者和515例对照的皮肤样本（4个批量转录组队列），以及2个公共皮肤scRNA-seq数据集 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 114 | 2026-05-05 |
FURIN Stimulates NOTCH2 and NOTCH3 Pathways, Leading to Return of Function in Aged Cells
2026-Apr-01, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life16040588
PMID:42073398
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研究论文 | 本文研究了FURIN通过刺激NOTCH2和NOTCH3通路恢复衰老细胞功能的作用机制 | 首次揭示FURIN在衰老肌肉细胞中通过调控NOTCH2/3信号通路恢复肌源性分化能力，并鉴定FURIN为肌肉再生能力的潜在调控因子 | 未明确FURIN过表达在体内模型中的作用，且仅使用C2C12细胞系作为体外模型，可能无法完全代表人类肌肉衰老过程 | 探究年龄相关的FURIN下调是否导致NOTCH2/3信号通路受损及肌源性功能障碍 | GTEx公共单细胞RNA测序数据和C2C12成肌细胞 | 自然语言处理 | 老年疾病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | GTEx数据集中的多个组织样本及C2C12细胞系（早代和晚代） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 115 | 2026-05-05 |
How to efficiently establish animal models of cholangiocarcinoma: challenges and inspiration
2026-Apr, Medical review (2021)
DOI:10.1515/mr-2025-0081
PMID:42078198
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综述 | 本文综述了胆管癌动物模型建立的方法、挑战与启示，重点讨论了原发性胆管癌模型在临床前研究中的应用及其局限性 | 强调单细胞测序技术在癌症模型研究中的创新应用和巨大潜力，并系统分析了肝内外胆管发育差异对模型构建的影响 | 原生胆管癌模型存在固有局限性，需要进一步改进和优化 | 为建立更先进、更具临床相关性的胆管癌模型提供建议和推荐 | 胆管癌动物模型（包括原发性胆管癌模型、胆管癌类器官等） | 机器学习 | 胆管癌 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 116 | 2026-05-05 |
Cardiac Fibrosis: Mechanobiology, Epigenetics, and the Path to Precision Therapy
2026-Apr, Cellular and molecular bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s12195-026-00896-z
PMID:42080143
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综述 | 本文整合单细胞和空间转录组学、生物力学研究及表观遗传图谱数据，阐述心脏纤维化的细胞异质性和分子机制，并讨论精准治疗策略 | 首次将机械生物学、表观遗传学与精准治疗相结合，系统性提出通过CRISPR基因编辑、FAP靶向CAR-T免疫疗法及患者来源心脏类器官等手段逆转心脏纤维化的转化路线图 | 主要基于现有文献整合，缺乏原创性实验验证；精准治疗策略的临床转化效果有待进一步评估 | 阐明心脏纤维化的机械生物学和表观遗传机制，探索精准抗纤维化治疗的转化路径 | 心脏纤维化中的成纤维细胞、心肌细胞、细胞外基质及微环境细胞群 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，CRISPR基因编辑，CAR-T免疫疗法，RNA纳米递送 | NA | 转录组数据，图像，文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium FFPE |
| 117 | 2026-05-05 |
Lineage-Specific Sex-Biased Transcriptional Programs in Healthy Human Truncal Skin Revealed by Single-Cell Transcriptomics
2026-Mar-31, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17040415
PMID:42074533
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示健康人类躯干皮肤中谱系特异性性别偏向的转录程序 | 首次构建了性别解析的健康人类躯干皮肤单细胞转录组图谱，并揭示了性别偏倚基因的谱系特异性而非广泛的组成变化 | 未在摘要中说明 | 以单细胞分辨率定义健康成人躯干皮肤中细胞组成和基因表达的性别相关差异 | 健康人类躯干皮肤样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 12名捐赠者（5名男性，7名女性），107,967个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 118 | 2026-05-05 |
Lactylation-Associated Immune Metabolic Reprogramming Identifies S100A2 and S100A14 as Candidate Diagnostic Biomarkers in Primary Open-Angle Glaucoma: An Integrated Bulk and Single-Cell Transcriptomic Analysis
2026-Mar-31, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17040403
PMID:42074521
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研究论文 | 整合批量转录组和单细胞转录组分析，鉴定S100A2和S100A14作为原发性开角型青光眼中乳酸化相关免疫代谢重编程的候选诊断生物标志物 | 首次结合乳酸化修饰与免疫代谢重编程，利用多数据集机器学习和单细胞分析，系统鉴定POAG的候选诊断标志物S100A2和S100A14 | 研究基于公共数据库的回顾性分析，缺乏独立外部队列验证；生物标志物与免疫代谢调控的因果关系尚需实验证实 | 探索POAG中乳酸化相关免疫代谢重编程的调控网络并鉴定可靠的诊断生物标志物 | 原发性开角型青光眼患者的小梁网组织样本 | 机器学习 | 青光眼 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 机器学习分类模型 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的批量转录组和单细胞RNA测序数据集 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 119 | 2026-05-05 |
Single-Cell Multi-Omics Reveal Gene Regulatory Mechanisms Underlying Cardiac Embryonic Development
2026-Mar-31, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17040414
PMID:42074532
|
综述 | 系统总结单细胞多组学技术在揭示心脏胚胎发育基因调控机制中的应用及其对先天性心脏病研究的启示 | 首次全面整合单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、空间转录组学及整合多组学分析在心脏胚胎发育研究中的进展，构建高分辨率心脏细胞图谱 | 综述主要基于现有文献，可能遗漏最新未发表的研究成果 | 阐明单细胞多组学技术如何揭示心脏胚胎发育过程中的基因调控机制 | 心脏胚胎发育过程中的细胞异质性和谱系特化 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学, 整合多组学分析 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3'用于单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序, 10x Visium用于空间转录组学 |
| 120 | 2026-05-05 |
Integrated Multi-Omics and Machine Learning Framework Identifies Diagnostic Signatures and Druggable Targets in Breast Cancer
2026-Mar-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17040396
PMID:42074514
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研究论文 | 通过整合多组学数据和机器学习框架，识别乳腺癌诊断标志物和潜在药物靶点 | 首次运用127种机器学习算法组合结合SHAP分析、单细胞转录组验证及AI辅助虚拟筛选，系统性识别CHEK1作为乳腺癌关键诊断基因并发现候选化合物 | 研究结果属于计算机模拟预测，所有发现均需进一步的实验验证才能得出治疗性结论 | 识别乳腺癌的高灵敏度和特异度诊断标志物，并发现可用于靶向治疗的分子靶点 | 乳腺癌 | 机器学习 | 乳腺癌 | RNA-seq、单细胞转录组测序、差异表达分析、WGCNA、PPI网络分析、SHAP分析、SMR分析、分子对接 | 集成机器学习框架（包含127种算法组合） | 转录组数据（包括批量RNA-seq和单细胞RNA-seq）、miRNA调控网络数据 | 1231例乳腺癌样本（来自7个GEO数据集和TCGA-BRCA队列） | NA | NA | NA | NA |