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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-10-28 |
Ganoderma lucidum Sporoderm-Broken Spore Powder (GLSP) Remodels the Gut Microbiota and Promotes Tryptophan-Derived Indole Metabolites to Maintain Intestinal Homeostasis
2026-Oct-07, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14102280
PMID:42943521
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序、16S rRNA测序和代谢组学,揭示灵芝孢子粉(GLSP)通过重塑肠道菌群和促进色氨酸衍生的吲哚代谢物来维持肠道稳态 | 首次综合运用scRNA-seq、16S rRNA测序和代谢组学多组学整合,发现GLSP富集产SCFA菌属并识别出新的微生物代谢物(如indole-2-carboxylic acid、3-Methyloxindole、4-hydroxyindole),揭示其通过色氨酸-吲哚代谢通路维持肠道稳态的机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中验证;具体分子机制和信号通路仍有待进一步阐明 | 探究膳食GLSP对肠道上皮动力学和屏障功能的影响及其通过肠道菌群和代谢物维持肠道稳态的机制 | 小鼠模型(包括生理稳态和DSS诱导肠道损伤模型)、抗生素处理小鼠、粪菌移植受体小鼠 | 微生物组学 | 肠道损伤 | 单细胞RNA测序, 16S rRNA测序, 代谢组学, 粪菌移植 | NA | 基因表达数据, 微生物组数据, 代谢组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, 16S rRNA sequencing, metabolomics | NA | NA |
| 102 | 2026-10-28 |
Spatial Transcriptomic Profiling of the Human Placenta in Congenital Cytomegalovirus Infection: A Broad Antiviral Response with Concurrent Suppression of Trophoblast and Vascular Programs
2026-Oct-03, Viruses
DOI:10.3390/v18101095
PMID:42944015
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研究论文 | 该研究利用Visium CytAssist空间转录组技术分析先天性巨细胞病毒感染人类胎盘,揭示了抗病毒免疫反应与滋养层及血管程序抑制并存的细胞类型分辨转录特征 | 首次在细胞类型分辨率下对先天性CMV感染胎盘进行空间转录组分析,揭示了母胎界面协调性转变:广泛的干扰素驱动免疫反应伴随滋养层发育和血管程序的抑制 | 样本量小(仅2例感染和2例未感染胎盘),未来需要在更大队列中验证这些发现 | 在细胞类型分辨率下定义先天性巨细胞病毒感染胎盘的细胞组织应答,建立胎盘CMV传播的细胞类型参考 | 人类晚期妊娠胎盘组织(2例CMV感染和2例未感染) | 空间转录组学 | 先天性巨细胞病毒感染 | 空间转录组测序 | NA | 空间转录组数据、图像 | 4例胎盘组织(2例CMV感染和2例未感染),共分析16,074个空间点 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium CytAssist | Visium CytAssist空间转录组平台,应用于福尔马林固定组织,基于参考的标签转移方法注释母体和胎儿主要细胞群体 |
| 103 | 2026-10-28 |
Multi-layer network biology combined with single-cell evidence reveals core regulatory nodes in atherosclerotic plaques and potential drug-targeting directions
2026-Oct, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05672-4
PMID:42410224
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研究论文 | 结合批量转录组和单细胞转录组数据,通过多层网络生物学分析识别动脉粥样硬化斑块中的核心调控基因,并预测和验证潜在靶向药物 | 将WGCNA、多种Cytoscape枢纽基因算法、单基因GSEA、单细胞转录组解析与分子对接及体外实验验证相结合,系统识别AS斑块枢纽基因网络并以槲皮素进行多靶点治疗潜力验证 | 枢纽基因识别依赖公共数据库数据集,样本量有限;体外oxLDL模型不能完全模拟体内复杂斑块微环境;槲皮素的多靶点作用机制仍需体内实验和临床研究进一步验证 | 揭示动脉粥样硬化斑块形成的核心调控网络和可干预靶点,并探索潜在药物靶向方向 | 动脉粥样硬化斑块组织(颈动脉晚期斑块与远端早期病变组织)、单细胞转录组数据中的斑块细胞、oxLDL诱导的体外细胞模型 | 数字病理学、机器学习、生物信息学 | 心血管疾病、动脉粥样硬化 | 批量RNA-seq、单细胞RNA-seq、WGCNA、PPI网络分析、GO/KEGG富集分析、免疫浸润分析、单基因GSEA、分子对接、CCK-8、ROS染色、Western blotting、qRT-PCR | WGCNA、Cytoscape枢纽基因算法(MCC、EPC、Stress、Degree)、分子对接 | 基因表达数据、文本、图像 | 32例患者的配对颈动脉晚期斑块与远端早期病变组织(GSE43292),以及一个10x scRNA-seq数据集(GSE159677) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞转录组平台;批量转录组数据来自GSE43292,单细胞数据来自GSE159677 |
| 104 | 2026-10-28 |
Multi-omics Mendelian randomization and experimental validation identify PRKAB1 as a regulator of phosphatidylcholine metabolism in IBD
2026-Oct, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05685-z
PMID:42443636
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研究论文 | 该文整合多组学数据与孟德尔随机化及实验验证,识别PRKAB1为IBD中磷脂酰胆碱代谢的调控因子 | 首次结合多组学孟德尔随机化、遗传共定位、单细胞RNA测序及功能敲低实验,将PRKAB1鉴定为IBD中磷脂酰胆碱代谢的调控因子,并通过药物预测和分子对接提示二甲双胍和槲皮素可能靶向PRKAB1 | 研究主要基于遗传关联和体外功能验证,缺乏体内动物模型或临床干预实验的直接证据,药物预测结果仍需实验验证 | 解析磷脂酰胆碱代谢相关基因与IBD之间的因果遗传关联,并识别调控磷脂酰胆碱代谢的关键基因 | 炎症性肠病(IBD)及溃疡性结肠炎(UC)相关的磷脂酰胆碱代谢通路和候选基因 | 多组学与遗传流行病学 | 炎症性肠病 | 孟德尔随机化、遗传共定位、多组学QTL分析、单细胞RNA测序、qRT-PCR、基因敲低 | NA | 遗传关联数据、DNA甲基化、基因表达、蛋白质丰度、单细胞转录组、文本 | 发现阶段使用FinnGen研究数据,复制阶段使用IBD Genetics Consortium数据;分析78种脂质(5种溶血磷脂酰胆碱、46种磷脂酰胆碱、27种磷脂酰胆碱醚);并纳入GEO数据和scRNA-seq数据 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 105 | 2026-10-28 |
Integrative multi-omics analysis identifies LIPA as a prognostic hub and ferroptosis regulator in lung adenocarcinoma
2026-Oct, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-026-05741-5
PMID:42762413
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研究论文 | 该研究通过整合多组学分析与实验验证,识别了肺腺癌中脂质代谢相关基因的失调,并构建了预后特征,重点揭示了枢纽基因LIPA通过铁死亡途径调控肿瘤生长和免疫微环境 | 首次将LIPA鉴定为肺腺癌中连接脂质代谢、铁死亡和免疫调节的关键枢纽,并发现Castanospermine可作为LIPA的潜在激活剂 | 研究主要基于生物信息学分析和临床前模型,LIPA作为治疗靶点的临床转化潜力仍需进一步验证 | 识别肺腺癌中基于代谢重编程的生物标志物和治疗靶点 | 肺腺癌患者样本及肿瘤细胞系和动物模型 | 多组学分析 | 肺癌 | 多组学分析、LASSO回归、单细胞转录组测序、空间转录组学、功能实验、虚拟筛选 | LASSO回归 | 基因表达数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据、图像 | NA | NA | 单细胞转录组测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 106 | 2026-10-28 |
Decreased Endothelial Cell Retinoic Acid Signaling Accelerates Progression of Single Ventricle Pulmonary Vascular Malformations
2026-Oct, JACC. Basic to translational science
DOI:10.1016/j.jacbts.2026.101676
PMID:42785207
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研究论文 | 本研究利用Glenn循环大鼠模型和单细胞RNA测序,发现单心室肺血管畸形中内皮细胞全反式维甲酸信号降低,并与遗传性出血性毛细血管扩张症动静脉畸形共享部分病理机制 | 首次在Glenn术后单心室肺血管畸形模型中开展全肺单细胞RNA测序,发现内皮细胞全反式维甲酸信号降低,并揭示其与遗传性出血性毛细血管扩张症动静脉畸形共享约17%的差异表达基因及病理机制 | 研究基于大鼠手术模型,尚需在人类患者中验证;饮食维生素A干预的分子机制和临床转化潜力仍需进一步研究 | 探究单心室肺血管畸形的发病机制,特别是Glenn术后肺血管畸形的分子病理变化 | Glenn循环大鼠模型的全肺组织及肺血管内皮细胞 | 数字病理, 单细胞组学 | 单心室先天性心脏病, 肺血管畸形, 遗传性出血性毛细血管扩张症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 107 | 2026-10-28 |
Single-Cell Reference Mapping and Transcriptomic Analysis Identify Fibroblast-Related ECM Remodeling During Electroacupuncture Treatment for Tendon Repair
2026-Oct, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.71774
PMID:42836413
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研究论文 | 整合公共单细胞RNA测序数据与小鼠跟腱病模型的bulk转录组数据,构建肌腱细胞参考图谱,分析电针治疗肌腱修复过程中成纤维细胞相关ECM重塑状态 | 首次将单细胞参考映射与bulk转录组分析相结合,揭示电针治疗肌腱修复过程中与MMP2成纤维细胞相关ECM重塑状态(High_ECM和Low_ECM程序)重叠的分子程序 | 基于公共单细胞数据集的参考映射,缺乏实验验证;样本来自小鼠模型,向临床转化需进一步研究 | 阐明电针治疗肌腱修复的细胞机制,特别是成纤维细胞亚群在ECM重塑中的功能分层 | 小鼠跟腱病模型及公共单细胞RNA测序数据集中的肌腱细胞 | 单细胞转录组学 | 肌腱病 | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据, bulk转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 108 | 2026-10-28 |
Multi-gene biomarkers reveal spatial organization and subpopulation-specific damage response in biliary epithelial cells
2026-Oct-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.205690
PMID:42765126
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和荧光原位杂交技术,揭示了胆管上皮细胞的异质性,定义了四个亚群及其空间组织和损伤响应 | 利用最小基因组合(元基因)作为生物标志物,实现了胆管上皮细胞亚群的原位空间定位,并发现了胆管结扎后出现的增殖性亚群 | 研究基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;体外培养可能无法完全模拟体内微环境 | 定义胆管上皮细胞的异质性,并探究其在损伤后的变化 | Sox9EGFP+小鼠肝脏上皮细胞 | 单细胞转录组学 | 胆管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、杂交链式反应荧光原位杂交(HCR-FISH) | NA | 基因表达数据、图像数据 | 小鼠胆管结扎(BDL)组和假手术对照组(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 109 | 2026-10-28 |
Osteoclasts intercept meningeal lymphatic paths for dural metastasis
2026-Oct, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-026-11082-6
PMID:42816624
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研究论文 | 本研究揭示了脑膜淋巴功能障碍在硬脑膜转移病理生理中的新作用,并通过靶向骨破骨细胞恢复脑膜淋巴功能以增强抗肿瘤免疫 | 首次发现脑膜淋巴功能障碍在硬脑膜转移中的作用,揭示了癌症相关骨破骨细胞(OCs)驱动免疫抑制的新机制,并发现大型OCs定位于颅骨-肿瘤界面、小型OCs渗透瘤内区域的空间异质性,提出通过选择性靶向OCs恢复脑膜淋巴功能的新治疗策略 | 研究主要基于新建立的小鼠硬脑膜转移模型,临床转化仍需进一步验证;单细胞RNA测序分析的样本规模和深度未在摘要中明确说明 | 探究脑膜淋巴功能障碍在硬脑膜转移中的作用机制,并探索通过靶向骨破骨细胞恢复脑膜淋巴功能以增强抗肿瘤免疫的治疗策略 | 硬脑膜转移(DM)小鼠模型及乳腺癌和肺癌等晚期恶性肿瘤的硬脑膜转移病变 | 数字病理学,肿瘤免疫学 | 肺癌,乳腺癌,硬脑膜转移 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床影像,单细胞RNA测序数据,小鼠模型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 110 | 2026-10-28 |
Medulloblastoma Spatial Transcriptomics Reveals Tumor Microenvironment Heterogeneity With High-Density Progenitor Cell Regions Correlating With High-Risk Disease
2026-Oct, JCO precision oncology
IF:5.3Q1
DOI:10.1200/PO-25-01195
PMID:42868339
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研究论文 | 该研究对18例儿童髓母细胞瘤样本进行空间转录组测序,揭示了肿瘤微环境的空间异质性,并发现高密度静息祖细胞样肿瘤细胞区域与高风险疾病相关 | 首次在空间背景下系统刻画髓母细胞瘤肿瘤微环境的细胞组成与空间结构,发现与高风险特征相关的静息祖细胞样细胞密集区域,以及复发后星形胶质细胞、巨噬细胞和血管内皮的变化 | 样本量较小(18例),仅有两对匹配的诊断-复发样本,研究结果需在更大队列中验证,且空间转录组数据未与单细胞测序等多组学数据整合 | 探究髓母细胞瘤肿瘤微环境的空间结构对肿瘤进展和治疗结局的影响,寻找与高风险疾病相关的空间特征 | 18例儿童髓母细胞瘤诊断样本,包括两对匹配的诊断-复发样本,并按高风险和标准风险分层 | 空间转录组学 | 髓母细胞瘤 | 空间转录组测序、免疫组织化学 | NA | 空间转录组数据、图像 | 18例儿童髓母细胞瘤样本(包括2对诊断-复发配对样本) | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 111 | 2026-10-28 |
Fibrotic Rewiring of CD8+ T Cells by Doxorubicin Drives Pathological Remodeling of Cardiac Extracellular Matrix
2026-Oct, JACC. CardioOncology
DOI:10.1016/j.jaccao.2026.09.001
PMID:42904623
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研究论文 | 该研究发现阿霉素诱导CD8+ T细胞产生促纤维化特征(mxT细胞),通过HIF1α-P53信号通路和自分泌TGFβ1增强LOX活性,导致心脏细胞外基质交联、纤维化和心脏重构 | 首次揭示阿霉素在CD8+ T细胞中印记一种新的内在促纤维化功能,定义了“基质重塑T细胞”(mxT细胞)这一新概念,并阐明T细胞通过LOX活性直接使心脏ECM变硬的分子机制 | 未明确说明样本量细节;机制研究主要在鼠源原代T细胞中进行,人体数据仅为外周血CD8+ T细胞的bulk RNA测序,缺乏人体心脏组织层面的验证;未涉及长期临床结局或干预试验 | 探究阿霉素治疗后T细胞影响不良心脏重构的分子机制,特别是T细胞诱导纤维化和心脏重构的直接作用 | 接受蒽环类化疗的患者外周血CD8+ T细胞、阿霉素或PBS处理小鼠的心脏CD8+ T细胞、体外培养的原代鼠源T细胞以及心脏细胞外基质 | 心血管疾病、免疫学、转录组学 | 心血管疾病、心力衰竭、心脏毒性 | bulk RNA测序、单细胞RNA测序、体外细胞实验、离体力学测试 | NA | 转录组数据、文本、力学测试数据 | NA | NA | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 112 | 2026-10-28 |
Integrated bulk and single-cell transcriptomic analyses and experimental validation reveal the pathogenic role of chondrocyte pyroptosis in osteoarthritis and the therapeutic potential of curcumin via its targeted modulation
2026-Oct, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05721-y
PMID:42474760
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研究论文 | 该研究整合 bulk 和单细胞转录组分析及体外实验,揭示软骨细胞焦亡在骨关节炎中的致病作用,并发现姜黄素可通过靶向焦亡相关通路发挥治疗潜力 | 首次结合 bulk RNA-seq、单细胞 RNA-seq 和体外实验验证,系统揭示软骨细胞焦亡在骨关节炎中的作用,并通过药物预测发现姜黄素靶向 CASP1、IL1B、IL18 和 NLRP3 抑制焦亡 | 研究主要基于公共数据集分析和体外细胞实验,缺乏动物模型体内验证和临床样本验证 | 探究软骨细胞焦亡在骨关节炎发病中的分子机制,并寻找潜在治疗药物 | 骨关节炎相关的软骨细胞及公共转录组数据集 | 转录组学 | 骨关节炎 | bulk RNA-seq, 单细胞 RNA-seq | NA | 文本 | 3 个公共数据集(GSE114007、GSE254844、GSE169454)及原代人正常和骨关节炎软骨细胞 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞 RNA-seq | NA | NA |
| 113 | 2026-10-28 |
Machine Learning-Based Single-Cell RNA-seq Analysis in Drug Response: A Hybrid Multi-Stage Gene Selection and Soft Voting Approach
2026-Oct-01, Asian Pacific journal of cancer prevention : APJCP
DOI:10.31557/APJCP.2026.27.10.3709
PMID:42935062
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研究论文 | 该研究结合单细胞RNA测序与机器学习,构建混合多阶段基因选择框架和软投票分类器,在单细胞水平预测口腔鳞状细胞癌对顺铂的药物反应 | 提出混合多阶段基因选择框架结合软投票分类器,整合大规模 bulk 细胞系数据,在单细胞水平预测顺铂反应,并利用100个基因特征实现高精度预测 | 摘要中未明确说明研究局限性 | 利用机器学习和单细胞RNA测序解决口腔鳞状细胞癌顺铂耐药预测问题,推动精准医疗和治疗决策 | 口腔鳞状细胞癌患者来源细胞及大规模 bulk 细胞系数据 | 机器学习 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 软投票分类器 | 基因表达数据 | 摘要中未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 114 | 2026-10-28 |
Deciphering Vascular Smooth Muscle Cell Phenotype Switching via Integrated Single-Cell Transcriptomics and Machine Learning: CX3CR1 and COL1A1 as Novel Diagnostic Biomarkers for Atherosclerosis
2026-Oct-01, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo16100742
PMID:42941217
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研究论文 | 该研究整合单细胞转录组学与机器学习,解析动脉粥样硬化中血管平滑肌细胞表型转换,并鉴定出CX3CR1和COL1A1等作为诊断生物标志物 | 结合单细胞RNA测序与bulk组织转录组数据,利用LASSO、随机森林和SVM-RFE三种机器学习方法交叉筛选共识基因,并在99,027个细胞中验证基因的细胞来源 | 这些基因应被解释为斑块相关组织标志物和机制候选物,而非经验证的非侵入性诊断生物标志物或明确的VSMC谱系标志物 | 解析动脉粥样硬化中血管平滑肌细胞表型转换的分子机制,并筛选诊断生物标志物 | 人颈动脉斑块组织及动脉组织样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq | LASSO,随机森林,SVM-RFE | 基因表达数据,文本 | 99,027个细胞来自12名供体,以及多个bulk数据集(GSE100927、GSE57691、GSE28829) | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 115 | 2026-10-28 |
CellDiffusion: Enhancing scRNA-seq data integration with accurate inference of cell-cell association
2026-Sep-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.28.577667
PMID:42856193
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研究论文 | 提出CellDiffusion,一种基于图的无监督模型,通过扩散过程传播细胞特征以增强细胞间关联,实现scRNA-seq数据整合 | 利用扩散过程传播细胞特征,学习细胞间注意力网络自适应识别跨批次对应细胞群,进行细胞特异性校正,在保留细胞类型和发育轨迹的同时对齐跨批次细胞 | 摘要未明确说明局限性 | 解决单细胞转录组数据整合中细胞类型特异性批次效应和异质性生物组成带来的挑战 | 单细胞转录组数据集,包括人类子宫内膜等组织 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图神经网络 | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 116 | 2026-10-28 |
Integrated Analysis of Serotonin-Related Biomarkers in Thoracic Aortic Aneurysm Based on Machine Learning and Single-Cell Sequencing Data
2026-Sep-30, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14102218
PMID:42940024
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研究论文 | 该研究基于机器学习和单细胞测序数据,识别并验证了胸主动脉瘤中与5-羟色胺相关的生物标志物CD300A和CLU | 首次整合机器学习算法和单细胞测序数据分析胸主动脉瘤中5-羟色胺相关生物标志物,并通过模拟基因敲除和RT-qPCR进行功能验证 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏直接的体内外功能实验验证,未来需要更多实验支持治疗开发 | 全面分析并识别胸主动脉瘤中与5-羟色胺相关的生物标志物,阐明其潜在分子机制 | 胸主动脉瘤患者样本及相关基因表达数据和单细胞测序数据 | 机器学习, 单细胞测序, 生物信息学 | 胸主动脉瘤 | 差异表达分析, 加权基因共表达网络分析, 机器学习算法, 单细胞测序分析, 伪时间分析, RT-qPCR | 机器学习算法(具体模型未指定) | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 117 | 2026-10-28 |
HPV6/11 Persistence and Treatment-Associated Immune Remodeling in Recurrent Respiratory Papillomatosis: A Cross-Cohort Transcriptomic Analysis
2026-Sep-30, Viruses
DOI:10.3390/v18101080
PMID:42944000
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研究论文 | 该文通过跨队列转录组分析,重新分析了三个数据集,探讨HPV6/11持续性复发性呼吸道乳头状瘤病(RRP)的免疫特征及INO-3107治疗相关的免疫重塑 | 首次使用相同的预定义免疫基因程序对三个独立转录组数据集进行跨队列分析,揭示了RRP中局部免疫反应不同组分非平行变化,并提出了选择性治疗相关免疫重塑模型 | 单细胞比较在多重检验校正后无显著差异;样本量较小;未进行功能验证实验 | 探究复发性呼吸道乳头状瘤病中HPV6/11持续存在的免疫机制以及DNA免疫治疗INO-3107相关的免疫重塑 | RRP患者乳头状瘤组织和自体喉黏膜、对照咽腭黏膜,以及INO-3107治疗前后的配对乳头状瘤样本 | 转录组学、免疫学 | 复发性呼吸道乳头状瘤病、HPV感染 | 转录组测序、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、单细胞转录组数据 | 12例患者的配对乳头状瘤和自体喉黏膜;4例RRP供者的乳头状瘤和3例对照的咽腭黏膜(单细胞RNA测序);17例患者INO-3107治疗前后的配对乳头状瘤样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 118 | 2026-10-28 |
The Venification of the Artery: Insights from Single-Cell Transcriptomics of a Porcine Arteriovenous Fistula Model
2026-Sep-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.09.23.753931
PMID:42856133
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学首次构建猪动静脉瘘(AVF)模型的时间序列细胞图谱,揭示动脉在吻合后发生“静脉化”而不仅是静脉动脉化的互补重塑过程 | 首次提供猪AVF模型的时间序列单细胞图谱,挑战了传统认为仅静脉发生动脉化的范式,提出动脉静脉化的互补过程 | 研究基于猪模型,样本量有限(6只猪),结论向人类临床转化仍需验证 | 探究自体动静脉瘘成熟过程中流入动脉的适应机制,填补动脉重塑机制研究的空白 | 猪动静脉瘘模型中的动脉和静脉组织 | 单细胞转录组学、血管生物学 | 心血管疾病、动静脉瘘 | 单细胞RNA测序、组织学、免疫组化 | NA | 单细胞转录组数据、图像 | 6只约克夏猪的动静脉瘘模型动脉和静脉组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 基于液滴法的单细胞RNA测序 |
| 119 | 2026-10-28 |
NINJ1 Defines a Hyperinflammatory Monocyte State Associated with Severe COVID-19
2026-Sep-29, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14102203
PMID:42940009
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研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序与临床验证,揭示NINJ1定义的高炎症单核细胞状态与重症COVID-19的关联 | 首次将NINJ1鉴定为COVID-19中一个独特的高炎症单核细胞状态的标志物,并证明其血清水平对院内死亡具有显著预测价值 | 摘要中未明确说明研究的具体局限性 | 探究NINJ1在COVID-19相关免疫失调中的作用 | COVID-19患者和健康对照者的外周血单核细胞及血清样本 | 数字病理学/单细胞免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、临床数据 | 99例COVID-19患者和51例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 120 | 2026-10-28 |
SCO2, LYN, and FGR as Mitochondria-Associated Immune-Inflammatory Candidate Signatures Across PMOS and MCI Datasets
2026-Sep-29, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14102205
PMID:42940011
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研究论文 | 该文通过生物信息学与体外实验,在PMOS和MCI数据集中识别出SCO2、LYN和FGR作为线粒体相关的免疫炎症候选标志物 | 首次系统性地揭示PMOS与MCI之间共享的线粒体相关免疫炎症分子特征,并识别出SCO2、LYN和FGR三个候选标志基因 | 缺乏PMOS-MCI共病队列和功能扰动实验,研究结果仅为假设生成性,标志物和因果机制尚未验证 | 探究PMOS与MCI之间共享的线粒体功能障碍和免疫失调相关分子特征 | PMOS颗粒细胞样本和MCI外周血样本 | 机器学习, 数字病理学, 生物信息学 | 多内分泌代谢性卵巢综合征, 轻度认知障碍 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 机器学习, 体外实验 | 机器学习特征排序模型, 伪时间分析 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 图像, 文本 | PMOS颗粒细胞样本16例,MCI外周血样本243例 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |