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当前共找到 43756 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-09-28 |
Single-cell transcriptomic characterization of the immunosuppressive tumor immune microenvironment in hepatocellular carcinoma: implications for SBRT-based radio-immunotherapy
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1928725
PMID:42798509
|
研究论文 | 该研究通过单细胞转录组测序分析了肝细胞癌的免疫抑制性肿瘤免疫微环境，并探讨了其对SBRT放射免疫治疗的影响 | 首次利用单细胞转录组学系统描绘了肝细胞癌原发灶及门静脉癌栓的免疫抑制微环境图谱，揭示了髓系细胞优势扩增和多检查点T细胞耗竭的特征，并通过体外实验证实了M2型巨噬细胞条件培养基可上调免疫抑制因子并减弱放疗诱导的免疫原性细胞死亡 | 单细胞测序数据仅来自单一患者（HCC07），样本量有限，结论的普适性需更大规模队列验证；体外实验仅使用HepG2和Huh-7细胞系，无法完全反映体内复杂微环境 | 解析肝细胞癌肿瘤免疫微环境的单细胞架构，阐明免疫抑制机制及其对SBRT放射免疫治疗疗效的影响，为联合治疗策略提供机制依据 | 肝细胞癌患者（HCC07，IIIB期）的正常肝脏组织、原发肿瘤组织和门静脉癌栓组织，以及HepG2和Huh-7肝细胞癌细胞系 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RT-qPCR、ELISA | NA | 图像、文本 | 1例肝细胞癌患者的3种组织样本（正常肝脏、原发肿瘤、门静脉癌栓）用于scRNA-seq分析，2种肝癌细胞系（HepG2和Huh-7）用于体外验证 | Illumina | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 102 | 2026-09-28 |
MAFF as a potential novel protective factor against Parkinson's disease: evidence from Mendelian randomization and single-cell RNA sequencing
2026, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2026.1759121
PMID:42798606
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序等多种方法，探讨了MAFF基因在帕金森病中的潜在保护作用及分子机制 | 首次综合运用孟德尔随机化、单细胞RNA测序、分子对接和免疫浸润分析等多种方法系统研究MAFF在帕金森病中的作用，并通过RT-qPCR和ELISA在动物和临床样本中验证了MAFF的表达 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究MAFF在帕金森病中的潜在机制并识别新的治疗靶点 | 帕金森病患者样本、小鼠模型及公共数据库中的帕金森病相关数据集 | 机器学习 | 帕金森病 | 孟德尔随机化、单细胞RNA测序、RT-qPCR、ELISA、分子对接 | NA | 基因表达数据、图像 | 多个公共数据库数据集及小鼠和临床血清样本，具体数量未在摘要中说明 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 103 | 2026-09-28 |
Single-cell and bulk transcriptomic analyses define an IFI27-centered interferon-response epithelial state in bladder cancer and its transcriptional response to irradiation
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1920354
PMID:42798643
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研究论文 | 该研究通过单细胞和批量转录组分析，在膀胱癌中定义了一个以IFI27为中心的干扰素应答上皮细胞状态，并探究了其免疫背景及对体外电离辐射的转录响应 | 通过重复非负矩阵分解（NMF）在单细胞数据中可重复地鉴定出一个以IFI27为中心的干扰素应答上皮细胞程序，并揭示该程序在患者间存在显著差异但所有肿瘤中均可检测到；结合患者区组化差异表达分析、免疫特征评分、平衡CellChat分析和TCGA-BLCA验证，系统刻画了该上皮状态的免疫上下文；通过体外辐射实验证明该程序的转录组分具有治疗响应性 | 研究主要基于转录组数据，缺乏空间转录组学、蛋白质水平和功能验证；CD274在单细胞水平检测稀疏，与连续评分无稳定关联；辐射实验仅使用T24细胞系和qRT-PCR验证，未进行全转录组或蛋白质水平分析；结果属于假设生成性质，需进一步验证 | 解析膀胱癌中可重复的上皮干扰素应答状态，表征其免疫背景，并确定其转录组分是否对体外电离辐射产生响应 | 膀胱癌肿瘤上皮细胞、膀胱癌患者样本、T24膀胱癌细胞系 | 数字病理学, 机器学习 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, qRT-PCR | 非负矩阵分解（NMF） | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据, 图像 | 7例原发性膀胱肿瘤和1例癌旁正常样本（共39,224个细胞，其中29,777个身份门控的肿瘤上皮细胞）；T24膀胱癌细胞系接受0、2、4、8 Gy辐射处理 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 104 | 2026-09-28 |
Integrative single-cell and bulk transcriptomics uncovers a lipid metabolism-related lncRNA signature alongside the ELFN1-AS1/LYPLA1 axis driving osteosarcoma progression
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1945005
PMID:42798652
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研究论文 | 该研究整合单细胞和批量转录组数据，构建了骨肉瘤脂质代谢相关lncRNA预后模型，并揭示ELFN1-AS1/LYPLA1轴驱动骨肉瘤进展的机制 | 首次整合单细胞RNA测序和批量转录组数据构建骨肉瘤脂质代谢相关lncRNA预后特征，并通过虚拟敲除筛选结合体内外实验验证，揭示ELFN1-AS1通过LYPLA1依赖性脂质积累驱动骨肉瘤进展的新机制 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 阐明脂质代谢相关长链非编码RNA在骨肉瘤中的预后意义和分子调控功能，构建预后分层模型并鉴定潜在治疗靶点 | 骨肉瘤患者样本及骨肉瘤细胞系 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序，WGCNA，LASSO回归，Cox回归，虚拟敲除筛选 | LASSO，Cox回归，scTenifoldKnk | 基因表达数据，临床数据 | 单细胞RNA测序数据来自GSE152048，批量转录组和临床数据来自TARGET-OS | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 105 | 2026-09-28 |
Crosstalk between innate immune signaling pathways and integrated TLR, NLRP3 inflammasome, cGAS-STING, and NF-κB networks in sepsis
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1935200
PMID:42798827
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综述 | 本文全面综述了脓毒症中先天免疫信号通路之间的交互作用，重点探讨了TLR、NLRP3炎症小体、cGAS-STING和NF-κB信号网络的分子结构、动态相互作用及其在脓毒症发病机制中的作用 | 将经典和新兴信号通路整合到一个统一的分子框架中，强调信号网络之间的广泛交互而非单一通路的独立激活，并结合单细胞转录组学、空间多组学和系统生物学方法提供网络层面的免疫失调理解 | 作为综述文章，缺乏原始实验数据验证；所讨论的交互机制主要基于现有文献的整合分析，可能未涵盖所有相关通路 | 全面审视TLR、NLRP3炎症小体、cGAS-STING和NF-κB信号网络之间的分子结构和动态相互作用，探讨其在脓毒症发病机制中的作用，并总结当前和新兴的靶向免疫调节治疗策略 | 脓毒症中的先天免疫信号通路及其交互网络 | 机器学习 | 脓毒症 | 单细胞转录组学、空间多组学、系统生物学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞转录组学、空间多组学 | NA | NA |
| 106 | 2026-09-28 |
Poly pipeline: a polyvalent spatial transcriptomics workflow validated across polyploid and diploid organisms
2026, GigaByte (Hong Kong, China)
DOI:10.46471/gigabyte.190
PMID:42798842
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研究论文 | 该文章介绍了一种名为Poly Pipeline的多功能空间转录组学工作流程，旨在解决数据标准化、稀疏性及多倍体植物复杂基因组分析的问题 | 提出了一个通用且稳健的生物信息学工作流程Poly Pipeline，集成了专有格式转换器、聚类算法和hdWGCNA共表达网络，能够间接保留低表达重复基因的表达特征，并首次在多倍体和二倍体生物中进行了验证 | 摘要中未明确提及该研究的局限性 | 开发一个统一且可重复的空间转录组学分析框架，以解决基因组冗余（尤其是多倍体相关）分析中的关键空白，并推动FAIR数据原则在更广泛科学界中的应用 | 小麦、水稻和小鼠的空间转录组学数据集 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | hdWGCNA共表达网络 | 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 107 | 2026-09-28 |
Single-cell RNA sequencing data processing using cloud-based serverless computing
2026, GigaByte (Hong Kong, China)
DOI:10.46471/gigabyte.191
PMID:42798834
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研究论文 | 本文提出了一种利用无服务器云计算加速单细胞RNA测序数据分析的新方法，并在多个数据集上验证了其性能提升 | 首次将无服务器云函数作为按需“超级计算机”用于单细胞RNA测序工作流的加速，实现了计算资源的自动配置和弹性扩展 | 未提及具体限制，可能包括对云服务提供商的依赖、冷启动延迟、数据传输成本等 | 利用无服务器云计算优化单细胞RNA测序数据分析工作流，减少执行时间 | 外周血单核细胞数据集和人类胰腺分化敲除数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 三个数据集：两个公开的PBMC数据集和一个450 GB的人类scRNA-seq敲除数据集（包含13个样本） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 108 | 2026-09-28 |
Multi-omics characterization of anoikis-related hub genes and macrophage-centered immune persistence with validation of HAVCR2 in atherosclerosis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1918938
PMID:42798870
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研究论文 | 该研究通过整合两个公共转录组数据集，结合WGCNA、LASSO回归和随机森林算法，鉴定出八个与失巢凋亡相关的动脉粥样硬化核心枢纽基因，并通过免疫浸润分析和单细胞转录组测序揭示其以巨噬细胞为中心的免疫特征，最终在体内外实验中验证了HAVCR2的表达 | 首次系统性地将失巢凋亡相关基因与动脉粥样硬化的免疫细胞持续性联系起来，通过多组学整合分析鉴定了八个核心枢纽基因，并揭示了以巨噬细胞为中心的失巢凋亡相关免疫特征，同时首次在动脉粥样硬化中验证了HAVCR2与脂质诱导的巨噬细胞活化的关联 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据，样本量有限；缺乏大规模临床队列验证；HAVCR2的具体分子机制尚未完全阐明；未进行功能获得或缺失实验来验证因果关系 | 探究失巢凋亡相关基因在动脉粥样硬化免疫细胞持续性和斑块进展中的作用，鉴定潜在的诊断生物标志物和治疗靶点 | 动脉粥样硬化患者血管组织样本、oxLDL刺激的THP-1来源巨噬细胞、高脂饮食喂养的ApoE-/-小鼠 | 机器学习 | 心血管疾病 | 批量RNA-seq、单细胞RNA-seq | LASSO回归、随机森林、WGCNA、CIBERSORT | 基因表达数据、图像 | 两个公共数据集（GSE100927和GSE28829）及单细胞RNA测序数据，具体样本量未在摘要中明确说明 | NA | bulk RNA-seq、single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 109 | 2026-09-28 |
Fibroblast-centered mechanisms of chronic inflammation and airway remodeling in allergic bronchopulmonary aspergillosis
2026, Frontiers in allergy
IF:3.3Q2
DOI:10.3389/falgy.2026.1952768
PMID:42798922
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综述 | 本文提出以成纤维细胞为中心的机制框架，系统阐述成纤维细胞在过敏性支气管肺曲霉病（ABPA）慢性炎症和气道重塑中的作用 | 提出以成纤维细胞为中心的机制框架，整合ABPA、真菌相关气道疾病和肺纤维化的证据，揭示成纤维细胞通过招募嗜酸性粒细胞建立正反馈环路驱动慢性炎症和气道重塑的新机制 | 作为综述文章，缺乏原始实验数据验证所提出的机制框架；单细胞转录组学、空间组学等技术的整合应用尚处于展望阶段 | 系统阐明成纤维细胞在ABPA慢性炎症和气道重塑中的机制，并提出未来研究方向 | 过敏性支气管肺曲霉病（ABPA）相关的成纤维细胞、嗜酸性粒细胞、上皮细胞及细胞因子 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组学、空间组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 110 | 2026-09-28 |
Integrative identification and preliminary validation of senescence-associated secretory phenotype-related candidate biomarkers in type 2 diabetes
2026, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.21729
PMID:42799503
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研究论文 | 通过多队列整合分析筛选和验证2型糖尿病中衰老相关分泌表型（SASP）相关的候选生物标志物CCL8和MMP9 | 首次采用标准化衰老特征评分结合多队列独立验证策略，系统筛选并验证T2DM中SASP相关血液候选标志物，并通过CIBERSORT调整排除免疫细胞比例干扰 | RT-qPCR验证仅在小队列中提供探索性支持，缺乏更大规模实验验证；机制研究尚不深入 | 系统筛选和验证2型糖尿病中SASP相关的候选生物标志物 | 2型糖尿病患者外周血样本及公共基因表达数据集 | 机器学习 | 2型糖尿病 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, RT-qPCR | 机器学习 | 基因表达数据 | 多个队列包括GSE184050和GSE280401，以及一个小型RT-qPCR验证队列，具体样本量未在摘要中提供 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 111 | 2026-09-28 |
Spatially varying gene regulation network inference from spatial transcriptomics
2026, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbag230
PMID:42801027
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研究论文 | 提出了一种名为SVGRN的深度学习框架，用于从空间转录组数据中推断空间变化的高分辨率基因调控网络 | 将基因表达、调控相互作用和空间坐标整合到结构方程建模框架中，通过条件变分自编码器以无监督方式学习非线性、空间变化的调控程序，并利用目标位置和邻域信息将组织级调控细化为spot或细胞特异性GRN | 未明确说明 | 从空间转录组数据中推断空间变化的高分辨率基因调控网络 | 模拟数据集、seqFISH小鼠胚胎数据、Visium人类皮肤鳞状细胞癌和输卵管数据集 | 空间转录组学，基因调控网络推断，深度学习 | 皮肤鳞状细胞癌 | 空间转录组学，seqFISH，Visium | 条件变分自编码器，结构方程模型 | 空间转录组数据，基因表达数据，空间坐标数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组技术 |
| 112 | 2026-09-28 |
Liposomal-Mitoxantrone Overcomes Acquired Resistance and Enhances Venetoclax Synergy in AML-Mechanistic Insights and Preliminary Clinical Evidence
2026, International journal of nanomedicine
IF:6.6Q1
DOI:10.2147/IJN.S634276
PMID:42801107
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研究论文 | 该研究比较了脂质体米托蒽醌与游离米托蒽醌在急性髓系白血病中的抗白血病活性、血液学毒性、耐药性演变及细胞死亡通路，并结合初步临床观察 | 首次系统揭示脂质体重制剂可从根本上重塑米托蒽醌的治疗反应和耐药演化，通过单细胞RNA测序阐明脂质体米托蒽醌保留增殖状态并减少转录异质性，同时增强与维奈克拉的协同效应 | 临床证据仅来自四例患者的探索性观察，样本量有限，机制研究主要基于MLL-AF9驱动的小鼠模型和MOLM13细胞系，尚需更大规模的临床验证 | 探究脂质体重制剂是否能从根本上改变治疗反应和耐药演化，并比较脂质体米托蒽醌与游离米托蒽醌的抗白血病效果 | MLL-AF9驱动的急性髓系白血病小鼠模型、MOLM13细胞系及四例接受脂质体米托蒽醌联合维奈克拉治疗的患者 | 机器学习 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本, 图像 | MLL-AF9驱动的小鼠模型、MOLM13细胞系及四例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 113 | 2026-09-28 |
Integrated Multi-Omics Analyses Identify TYMP as a Candidate Protective Immunoregulatory Marker in CD4⁺ T Cells During Sepsis
2026, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S632459
PMID:42801117
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研究论文 | 该研究通过整合多组学分析（sc-eQTL孟德尔随机化、批量转录组、遗传共定位、单细胞RNA测序及前瞻性临床队列），鉴定出TYMP是脓毒症中CD4⁺T细胞相关的候选保护性免疫调节标志物。 | 首次通过整合sc-eQTL MR、遗传共定位、批量转录组、单细胞测序及前瞻性临床队列的多组学策略，将TYMP鉴定为脓毒症中CD4⁺T细胞相关的遗传支持的候选保护性免疫调节标志物。 | 前瞻性验证队列样本量较小（仅30例）；TYMP的机制作用仍需进一步功能实验验证；研究基于公共数据库和有限临床队列，可能存在选择偏倚。 | 通过整合多组学分析，鉴定与脓毒症相关的、遗传支持的候选免疫遗传调控因子。 | 脓毒症患者、公开多组学数据集（FinnGen脓毒症GWAS、OneK1K sc-eQTL、GSE65682批量转录组、GSE167363和GSE151263单细胞RNA测序数据）及前瞻性临床队列中的30例脓毒症成人患者。 | 机器学习, 数字病理学 | 脓毒症 | sc-eQTL孟德尔随机化, 批量转录组分析, 遗传共定位, 单细胞RNA测序, ELISA | 孟德尔随机化模型, 共定位分析模型 | 基因型数据, 转录组数据, 单细胞数据, 临床数据 | 公开数据集（FinnGen脓毒症GWAS、OneK1K sc-eQTL、GSE65682批量转录组、GSE167363和GSE151263单细胞RNA测序数据集）及30例前瞻性脓毒症患者 | Illumina | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 基因分型 | NA | NA |
| 114 | 2026-09-28 |
ScGeo reveals non-canonical trajectories beyond RNA velocity in radiation-induced hematopoietic recovery
2026, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbag266
PMID:42801126
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研究论文 | 该文提出ScGeo框架，将单细胞RNA测序的低维嵌入视为定量对象，评估几何位移、样本不确定性、局部几何保持、跨表示稳定性等指标，并在辐射诱导造血恢复等数据集中验证其可审计的下游分析能力。 | 提出表示感知的ScGeo框架，将嵌入作为定量对象而非仅做视觉解释，综合报告稳健状态位移、生物样本不确定性、局部几何保持、跨表示稳定性、分布变化及几何位移与独立动力学估计的一致性，并能区分稳定、中性、覆盖不足和表示敏感四类解释。 | 预设合成基准显示，细粒度定位局部畸变仍然有限；GSE132188胰腺发育流程仅提供描述性几何-动力学验证；GSE249479因缺少生物重复身份而只能保持描述性；GSE211713中早期17 Gy效应对表示敏感。 | 建立一个可审计的下游分析层，用于评估单细胞RNA测序嵌入空间中扰动相关几何的稳健性，并避免将时间点混合等视觉现象误判为有效整合。 | 辐射后造血恢复、胰腺发育、肺辐射分析等单细胞RNA测序数据集及其嵌入表示 | 机器学习 | 肺癌, 其他 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 115 | 2026-09-28 |
Integrated Transcriptomic and Machine Learning Analyses Identify KCNN3 and TLR10 as Candidate Cell-Type-Associated Molecules in Idiopathic Membranous Nephropathy
2026, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S633417
PMID:42801211
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研究论文 | 该研究整合批量RNA测序、机器学习和单细胞RNA测序分析，筛选并初步验证特发性膜性肾病中的关键分子 | 首次通过整合批量RNA测序、机器学习和单细胞RNA测序分析，鉴定出KCNN3和TLR10作为特发性膜性肾病的细胞类型相关候选分子，并揭示足细胞与树突状细胞之间可能通过CXCL12-CXCR4轴存在相互作用 | 外部验证集中KCNN3和TLR10的表达趋势不完全一致，联合诊断模型在两个验证集中的AUC分别为0.705和0.748，相较于单基因模型无显著提升 | 筛选并初步验证驱动特发性膜性肾病进展的关键分子 | 特发性膜性肾病患者 | 机器学习 | 特发性膜性肾病 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 免疫荧光 | 机器学习 | 转录组数据, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 116 | 2026-09-28 |
A phenotypic brain organoid atlas and biobank for neurodevelopmental disorders
2025-12-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.10.006
PMID:41187745
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研究论文 | 本文构建了一个包含352个患者来源iPSC的神经发育障碍生物样本库，并对超过6000个脑类器官进行组织学和单细胞转录组分析，揭示了不同疾病类别相关的细胞缺陷 | 首次建立了由CIRM发起的神经发育障碍iPSC生物样本库，结合临床、影像和基因组数据，并通过大规模脑类器官图谱揭示了疾病类别特异性的保守和 divergent 表型 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 填补神经发育障碍机制和治疗靶点的空白，通过脑类器官图谱连接基因型与表型，支持未来疾病建模和治疗研究 | 352名神经发育障碍患者来源的iPSC，其中35名代表性患者的脑类器官，以及10名神经正常个体的类器官库 | 数字病理学 | 神经发育障碍 | 单细胞转录组学 | NA | 图像，文本 | 352个患者来源iPSC，超过6000个脑类器官，10个神经正常个体类器官库 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 117 | 2026-09-28 |
The cervicovaginal microbiome associates with spatially restricted host transcriptional signatures throughout the human ectocervical epithelium and submucosa
2025-11, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013677
PMID:41218071
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研究论文 | 该研究通过空间转录组学分析了不同宫颈阴道微生物组类型对宫颈上皮和黏膜下层的宿主转录特征的影响 | 首次利用空间转录组学揭示宫颈阴道微生物组与宫颈组织转录景观的空间关联，发现微生物组影响贯穿整个黏膜层而非仅局限于管腔表面 | 样本量较小（n=21），仅来自肯尼亚女性性工作者群体，可能限制结果的普适性 | 探究宫颈阴道微生物组对宫颈外口上皮和黏膜下层转录景观的影响 | 肯尼亚女性性工作者的宫颈组织样本 | 空间转录组学 | HIV感染 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 21例宫颈组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 118 | 2025-08-08 |
Single-cell sequencing technologies: a multiomics toolbox for investigating HIV-1 persistence
2025-Sep-01, Current opinion in HIV and AIDS
IF:4.5Q1
DOI:10.1097/COH.0000000000000966
PMID:40772512
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 119 | 2026-09-28 |
Morphogenic, molecular and cellular adaptations for unidirectional airflow in the chicken lung
2025-04-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204346
PMID:40177910
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研究论文 | 通过多尺度3D成像和单细胞转录组学，研究鸡肺单向气流的形态发生、分子和细胞适应机制 | 发现了鸡特有的第三种肺泡细胞类型（表达KRT14的管腔细胞），揭示了肺泡发生的径向模式及SOX9-SOX2转变的停止机制，并利用Stereo-seq空间转录组学展示了肺泡细胞在同心区域的分布 | 研究主要基于鸡的发育过程，未进行功能验证实验来确认所发现的遗传决定因素的作用；样本仅来自鸡，可能无法完全代表其他鸟类 | 探究鸟类肺单向气流的发育过程及其与哺乳动物双向肺的差异 | 鸡肺发育过程中的关键阶段 | 空间转录组学, 单细胞转录组学, 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 多尺度3D成像 | NA | 图像, 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium, Stereo-seq | NA |
| 120 | 2026-09-28 |
Single-Cell Analyses Reveal a Functionally Heterogeneous Exhausted CD8+ T-cell Subpopulation That Is Correlated with Response to Checkpoint Therapy in Melanoma
2025-04-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3918
PMID:40042995
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序分析黑色素瘤中CD8+肿瘤浸润淋巴细胞的异质性，发现PD-1和CTLA4共表达的CPHi TIL亚群与免疫检查点治疗响应相关 | 发现PD-1+CTLA4+共表达的CD8+ TIL（CPHi TIL）比例≥20%的晚期黑色素瘤患者对PD-1单药治疗有更好的客观缓解率和生存率；揭示CPHi TIL是一个功能异质性的亚群混合体，包括增殖型、终末耗竭型、细胞毒性型、驻留记忆型和糖酵解富集型TEX亚群，而TPEX样细胞仅占少数 | 摘要中未明确提及研究的具体局限性 | 寻找能够预测免疫检查点治疗响应的生物标志物，特别是鉴定具有预后价值的CD8+ TIL亚群，以区分治疗响应者和非响应者 | 晚期黑色素瘤患者的CD8+肿瘤浸润淋巴细胞（TIL） | 数字病理学, 机器学习 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 文本, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |