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当前共找到 33528 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-12-03 |
Infiltration of CXCL9+ macrophages confers a favorable prognosis in breast cancer: Insights from an integrated single-cell RNA and bulk RNA sequencing study
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0337175
PMID:41325308
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序，揭示了CXCL9+巨噬细胞在乳腺癌中的浸润与患者良好预后相关，并构建了基于相关基因的生存风险模型 | 首次通过整合单细胞和bulk RNA测序数据，系统性地识别了CXCL9+巨噬细胞作为乳腺癌预后良好的关键细胞亚群，并通过实验验证了其抑制癌细胞活性的功能 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏体内实验验证和临床样本的深入机制探索 | 探究乳腺癌肿瘤微环境中细胞异质性及其与患者生存预后的关系，特别关注CXCL9+巨噬细胞的作用 | 乳腺癌肿瘤组织中的细胞亚群，特别是CXCL9+巨噬细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 去卷积算法, WGCNA, 体外实验 | 生存风险模型 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 102 | 2025-12-03 |
Integrated multi-omics analysis reveals necroptosis-related biomarker BIRC3 for early diagnosis and therapeutic targeting in preeclampsia
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0337546
PMID:41325315
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析，揭示了与坏死性凋亡相关的生物标志物BIRC3，可用于子痫前期的早期诊断和治疗靶向 | 首次将坏死性凋亡机制与子痫前期发病联系起来，并通过多组学数据验证了BIRC3作为新型诊断生物标志物和治疗靶点的潜力 | 研究主要基于公共数据集进行生物信息学分析，缺乏实验验证；样本量有限且依赖于现有数据库 | 识别子痫前期相关的坏死性凋亡生物标志物，并探索潜在的治疗性天然化合物 | 子痫前期患者的胎盘组织基因表达数据 | 生物信息学 | 子痫前期 | 单细胞RNA测序，机器学习，分子对接 | 随机森林 | 基因表达数据 | 使用三个公共数据集（GSE66273、GSE44711、GSE173193），具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 103 | 2025-12-03 |
Integrated single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq analysis to investigate key adipogenesis genes in adipose-derived stem cells
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0335152
PMID:41325391
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA-seq和批量RNA-seq数据，探究了脂肪来源干细胞（ADSCs）成脂分化过程中的关键基因及其调控网络 | 整合了单细胞和批量RNA-seq数据，识别了ADSC成脂分化早期和晚期的阶段特异性调控基因，并构建了ceRNA调控网络 | 研究主要基于转录组数据，未深入验证蛋白质水平或功能实验，且样本来源和时间点可能有限 | 探究ADSC成脂分化的转录调控网络，识别关键调控基因 | 脂肪来源干细胞（ADSCs） | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, qPCR | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 104 | 2025-12-03 |
ER Stress-Related Biomarkers in Chronic Obstructive Pulmonary Disease: A Comprehensive Transcriptome, Mendelian Randomization, and Machine-Learning Analysis
2025, International journal of chronic obstructive pulmonary disease
IF:2.7Q2
DOI:10.2147/COPD.S548160
PMID:41328289
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研究论文 | 本研究通过转录组学、孟德尔随机化和机器学习分析，探讨了内质网应激相关基因DNAJB1在慢性阻塞性肺疾病（COPD）中的风险作用及其临床价值 | 首次将DNAJB1识别为COPD的风险基因，并结合单细胞测序、孟德尔随机化和机器学习方法，构建了一个包含DNAJB1在内的诊断性基因标记组合 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证；样本来源和具体数据细节未在摘要中明确说明 | 识别与COPD发病和进展相关的遗传变异及新型生物标志物，以改善临床预后 | 慢性阻塞性肺疾病（COPD）患者及相关基因数据 | 机器学习 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞测序、微阵列数据分析 | 机器学习分析 | 转录组数据、微阵列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 105 | 2025-12-03 |
Single-cell RNA-seq combined with bulk RNA-seq explores shared gene signatures between thyroid and breast cancers
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1609189
PMID:41328437
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA-seq和bulk RNA-seq数据，探索了甲状腺癌和乳腺癌之间的共享基因特征，以识别共同的诊断和预后生物标志物及治疗靶点 | 结合单细胞和bulk转录组数据，应用细胞反卷积和WGCNA方法，首次系统性地揭示了两种癌症在转录网络和单核细胞浸润方面的相似性，并识别出关键的共享hub基因 | 研究主要基于转录组数据，功能验证和机制研究相对有限，临床样本量可能不足，且未涉及其他癌症类型的比较 | 识别乳腺癌和甲状腺癌之间的共享关键基因和共同治疗靶点 | 乳腺癌和甲状腺癌患者的肿瘤及癌旁组织 | 生物信息学 | 乳腺癌, 甲状腺癌 | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, RT-qPCR, 免疫组化 | 机器学习方法 | 转录组数据, 单细胞数据 | 未明确指定样本数量，但涉及临床患者组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 106 | 2025-12-03 |
Potential marker genes for psoriasis revealed based on single-cell sequencing and Mendelian randomization analysis
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1634874
PMID:41328434
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析，识别了与银屑病风险相关的七个候选基因，并探讨了它们在CD4+ T细胞中的表达及免疫相关通路的作用 | 首次结合单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析来识别银屑病的潜在标志基因，并揭示了这些基因在CD4+ T细胞中的特异性表达及免疫通路关联 | 研究依赖于公开数据库数据，样本量相对有限，且未进行实验验证 | 探究银屑病的分子机制，识别潜在生物标志物和治疗靶点 | 银屑病患者和健康对照者的皮肤样本 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析 | NA | 转录组数据 | 174个皮肤样本（92个银屑病患者，82个健康对照） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 107 | 2025-12-03 |
Transcriptomic Evaluation of a Stress Vulnerability Network Using Single-Cell RNA Sequencing in Mouse Prefrontal Cortex
2024-Dec-01, Biological psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1016/j.biopsych.2024.05.023
PMID:38866174
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序评估小鼠前额叶皮层中的应激脆弱性网络，揭示了与应激脆弱性相关的细胞类型和基因表达差异 | 首次结合多点在体神经生理学和单细胞RNA测序技术，识别出大脑中潜在应激脆弱性状态涉及的细胞类型和基因 | 研究仅基于小鼠模型，样本量较小（n=12），且性别仅限于C57BL/6品系，可能限制对人类应激脆弱性的直接推广 | 探究应激脆弱性的分子机制，以理解情绪障碍如重度抑郁症的风险因素 | 雄性及雌性C57BL/6小鼠的前额叶皮层细胞 | 神经科学 | 情绪障碍 | 单细胞RNA测序，多点在体神经生理学 | NA | 转录组数据，电生理数据 | 12只C57BL/6小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 108 | 2025-12-03 |
Nonepithelial Gene Expression Correlates With Symptom Severity in Adults With Eosinophilic Esophagitis
2024-Dec, The journal of allergy and clinical immunology. In practice
DOI:10.1016/j.jaip.2024.05.015
PMID:38768900
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研究论文 | 本研究探讨了嗜酸性粒细胞性食管炎（EoE）患者症状严重程度与非上皮细胞基因表达之间的相关性 | 首次将患者报告的症状指标（EEsAI）与食管非上皮细胞基因表达关联，揭示了成纤维细胞等非上皮细胞在EoE症状严重性中的潜在作用 | 样本量相对有限（146名成人），且仅基于回顾性数据分析，未进行实验验证 | 揭示EoE症状变异的分子机制，探索症状严重程度与食管基因表达的关系 | 146名成人EoE患者，根据食管扩张史分组 | 生物信息学 | 嗜酸性粒细胞性食管炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 146名成人EoE患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 109 | 2025-12-03 |
Spatial Transcriptomics Unravel the Tissue Complexity of Oral Pathogenesis
2024-Dec, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345241271934
PMID:39382116
|
综述 | 本文综述了空间转录组学在口腔疾病组织复杂性研究中的应用，包括其工作流程、数据分析方法以及在颅面发育和疾病中的具体案例 | 空间转录组学作为一种前沿方法，首次在口腔疾病领域系统性地整合了基因表达与空间信息，揭示了传统方法无法观察到的细胞区域间复杂相互作用 | 本文为综述性文章，未涉及原始实验数据，且空间转录组学技术本身可能存在分辨率限制和数据分析复杂性等挑战 | 探讨空间转录组学在理解口腔疾病组织复杂性和发病机制中的应用潜力 | 颅面区域组织（如颅骨、腭部、唾液腺、舌头、口腔底部、口咽部和牙周组织）以及相关疾病状态（如Sjögren病、口腔鳞状细胞癌、HPV感染、牙周病） | 数字病理学 | 口腔疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 110 | 2025-12-03 |
Targeting GSDME-mediated macrophage polarization for enhanced antitumor immunity in hepatocellular carcinoma
2024-Dec, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-024-01231-0
PMID:39496854
|
研究论文 | 本研究通过分析肝癌患者样本，发现GSDME通过调控巨噬细胞极化影响抗PD1治疗耐药性，并探索了Eliprodil与抗PD1联合治疗的潜力 | 首次揭示GSDME在肿瘤相关巨噬细胞中通过PDPK1/PI3K-AKT通路促进M2样极化，并发现小分子Eliprodil可阻断该通路，为联合免疫治疗提供新靶点 | 样本量较小（仅9例患者），临床前模型结果需在更大规模临床试验中验证 | 探索肝细胞癌抗PD1治疗耐药机制并开发联合免疫治疗新策略 | 肝细胞癌患者肿瘤组织、肿瘤相关巨噬细胞、CD8+T细胞及小鼠肝癌模型 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | RNA测序、单细胞测序、流式细胞术 | NA | 转录组数据、单细胞数据 | 9例接受抗PD1单药治疗的肝细胞癌患者肿瘤组织 | NA | RNA-seq, 单细胞测序 | NA | NA |
| 111 | 2025-12-03 |
Splicing the Difference: Harnessing the Complexity of the Transcriptome in Hematopoiesis
2024-Dec, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2024.104655
PMID:39393608
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综述 | 本文综述了转录组复杂性在造血过程中的作用，重点关注可变剪接、相关调控因子及其在血液系统恶性肿瘤中的意义 | 整合了多色流式细胞分选与批量及单细胞测序等前沿技术，系统阐述了可变剪接在造血及血液疾病中的调控机制 | 作为一篇综述文章，未提供原始实验数据，主要基于现有文献进行总结和展望 | 更新关于可变剪接在造血过程中作用的研究进展，阐明剪接因子突变如何导致血液恶性肿瘤 | 造血系统，包括造血干细胞、祖细胞、成熟血细胞及相关血液疾病（如骨髓增生异常综合征） | 自然语言处理 | 血液系统恶性肿瘤 | 多色流式细胞分选，批量测序，单细胞测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 112 | 2025-12-03 |
Nanomaterial-Mediated Reprogramming of Macrophages to Inhibit Refractory Muscle Fibrosis
2024-Dec, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202410368
PMID:39548911
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研究论文 | 本研究开发了一种功能化纳米材料，通过调控巨噬细胞极化来抑制难治性肌肉纤维化 | 利用聚乙烯亚胺功能化的纳米材料捕获细胞游离核酸，通过TLR7/9-NF-κB信号通路调控巨噬细胞表型，从而改变纤维-脂肪生成祖细胞的亚群平衡 | 研究主要关注口面部肌肉纤维化，在其他肌肉类型或组织中的适用性需进一步验证 | 开发治疗难治性肌肉纤维化的新策略 | 巨噬细胞和纤维-脂肪生成祖细胞 | NA | 肌肉纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 113 | 2025-12-03 |
Age-Related ECM Stiffness Mediates TRAIL Activation in Muscle Stem Cell Differentiation
2024-Dec, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400334
PMID:39601528
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研究论文 | 本研究探讨了年龄相关的细胞外基质（ECM）硬化如何通过TRAIL通路影响肌肉干细胞（MuSC）的分化，揭示了其在肌肉再生障碍中的作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序和体外基质工程，系统分析了年龄和ECM硬度对MuSC分化的协同影响，并识别出TRAIL通路在年龄相关纤维化群体中的关键作用 | 研究主要基于体外模型和动物实验，人类样本的验证不足；BAPN的长期治疗效果和副作用未充分评估 | 探究年龄相关ECM硬化如何通过分子机制影响肌肉干细胞的分化和功能，以阐明肌肉再生障碍的成因 | 年轻和年老小鼠的肌肉干细胞（MuSCs） | 单细胞组学 | 老年性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），免疫染色 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 年轻和年老MuSCs在软硬不同基质条件下的四组实验样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 114 | 2025-12-03 |
Scalable spatial single-cell transcriptomics and translatomics in 3D thick tissue blocks
2024-Aug-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.05.606553
PMID:39149316
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研究论文 | 本文开发了Deep-STARmap和Deep-RIBOmap技术，用于在200微米厚的组织块中实现单细胞转录组和翻译组的三维空间定量分析 | 首次实现了在厚组织块中进行单细胞转录和翻译活动的三维空间量化，突破了现有技术局限于薄切片的限制 | NA | 揭示基因在健康和疾病状态下如何塑造组织结构与功能 | 小鼠脑组织和人皮肤癌组织 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 空间转录组学，翻译组学 | NA | 图像，基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 115 | 2025-12-03 |
GSK3β and UCHL3 govern RIPK4 homeostasis via deubiquitination to enhance tumor metastasis in ovarian cancer
2024-06, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-024-03040-1
PMID:38664501
|
研究论文 | 本研究揭示了GSK3β和UCHL3通过去泛素化调控RIPK4稳定性，从而促进卵巢癌转移的新机制 | 首次发现UCHL3作为关键去泛素酶调控RIPK4稳定性，并阐明GSK3β介导的磷酸化增强RIPK4与UCHL3互作，形成促进卵巢癌转移的新通路 | NA | 探究卵巢癌中RIPK4稳定性的调控机制及其在肿瘤转移中的作用 | 卵巢癌组织、细胞系及动物模型 | 肿瘤生物学 | 卵巢癌 | 单细胞测序、去泛素化分析、磷酸化修饰研究 | NA | 测序数据、蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 116 | 2025-12-03 |
ScRNA-seq of gastric cancer tissues reveals differences in the immune microenvironment of primary tumors and metastases
2024-05, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-024-03012-5
PMID:38555278
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析胃癌组织，揭示了原发肿瘤与转移灶之间免疫微环境的差异 | 首次在单细胞分辨率上系统比较了胃癌原发灶与转移灶的免疫微环境差异，并发现ApoE表达巨噬细胞与不良预后的关联 | 样本量相对有限（46例组织），且未进行长期临床随访验证功能机制 | 探究胃癌原发肿瘤与转移灶之间免疫微环境的差异及其对疾病进展的影响 | 胃癌患者的原发肿瘤组织、癌旁非肿瘤组织及转移灶组织 | 单细胞组学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 46例胃癌组织（包括原发灶、癌旁组织和转移灶） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 117 | 2025-12-03 |
ZEB1 controls a lineage-specific transcriptional program essential for melanoma cell state transitions
2024-05, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-024-03010-7
PMID:38519642
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研究论文 | 本研究通过全基因组分析揭示了转录因子ZEB1在黑色素瘤细胞状态转换中的关键调控作用 | 首次在全基因组层面鉴定ZEB1在黑色素瘤中的转录靶点，并设计了黑色素瘤特异的ZEB1调控网络，结合单细胞空间多组学分析验证其在肿瘤异质性中的作用 | 研究主要基于黑色素瘤模型，在乳腺癌细胞中的比较分析显示谱系特异性，可能限制了结论在其他癌症类型的普适性 | 阐明黑色素瘤细胞可塑性和肿瘤异质性的转录调控机制 | 黑色素瘤细胞模型和人类黑色素瘤样本 | 计算生物学 | 黑色素瘤 | ChIP测序，RNA测序，单细胞RNA测序，空间多组学分析 | NA | 基因组测序数据，转录组数据，单细胞数据 | 未明确具体样本数量，包括黑色素瘤模型和人类黑色素瘤样本 | NA | ChIP-seq，RNA-seq，scRNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 118 | 2025-12-03 |
LPCAT2 inhibits colorectal cancer progression via the PRMT1/SLC7A11 axis
2024-05, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-024-02996-4
PMID:38605214
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现LPCAT2+肿瘤细胞群恶性程度较低，并阐明LPCAT2通过PRMT1/SLC7A11轴诱导铁死亡抑制结直肠癌进展的分子机制 | 首次在结直肠癌中鉴定出LPCAT2+低恶性细胞群，并揭示LPCAT2通过调控PRMT1乙酰化抑制其核转位，进而下调SLC7A11表达诱导铁死亡的新通路 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类临床样本验证相对有限，且未深入探讨LPCAT2表达异质性的调控机制 | 探究LPCAT2在结直肠癌进展中的功能及分子机制，寻找潜在治疗靶点 | 人类和小鼠结直肠癌组织、结直肠癌细胞系、LPCAT2基因敲除小鼠 | 单细胞组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类和小鼠结直肠癌组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 119 | 2025-12-03 |
scATAnno: Automated Cell Type Annotation for single-cell ATAC Sequencing Data
2024-Mar-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.01.543296
PMID:37333088
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研究论文 | 本文介绍了scATAnno，一个用于自动注释单细胞ATAC测序数据的Python软件包 | 开发了基于大规模scATAC-seq参考图谱的自动注释工具，无需使用scRNA-seq数据，并整合了KNN和加权距离不确定性评分以提高准确性 | NA | 开发一种自动化工具，用于单细胞ATAC测序数据的细胞类型注释 | 单细胞ATAC测序数据 | 生物信息学 | 三阴性乳腺癌、基底细胞癌 | 单细胞ATAC测序 | KNN | 表观遗传数据 | 多个数据集，包括外周血单核细胞、三阴性乳腺癌和基底细胞癌样本 | NA | 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 120 | 2025-12-03 |
Regorafenib plus nivolumab in unresectable hepatocellular carcinoma: the phase 2 RENOBATE trial
2024-03, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-024-02824-y
PMID:38374347
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研究论文 | 本研究是一项多中心、单臂、II期临床试验，评估了瑞戈非尼联合纳武利尤单抗作为不可切除肝细胞癌一线治疗的疗效和安全性 | 首次在II期临床试验中评估瑞戈非尼联合纳武利尤单抗作为uHCC一线治疗的疗效，并通过单细胞RNA测序探索了长期应答者的免疫生物标志物 | 研究为单臂设计，缺乏对照组，样本量较小（42例患者） | 评估瑞戈非尼联合纳武利尤单抗作为不可切除肝细胞癌一线治疗的疗效和安全性，并探索免疫应答的生物标志物 | 不可切除肝细胞癌患者 | NA | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据，单细胞RNA测序数据 | 42例患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |