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当前共找到 41493 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-07-15 |
CXCL13-CXCR5 Signaling in CD8+ T Cell Recruitment and Lymphoid Immune Organization in Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2026-May-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.04.722710
PMID:42146336
|
研究论文 | 本文研究了CXCL13-CXCR5信号通路在透明细胞肾细胞癌中调控CD8+ T细胞募集和淋巴免疫组织的机制 | 首次揭示CXCL13-CXCR5轴在ccRCC中调控CD8 T细胞募集、分化和免疫组织形成的作用，并发现肿瘤源性CXCL13可抑制肿瘤生长并增加CD8 T细胞浸润 | 未明确提及 | 探究CXCL13-CXCR5轴在透明细胞肾细胞癌中调控CD8 T细胞募集、分化和免疫组织形成的作用 | 人类肿瘤、血浆和匹配的邻近肾组织样本，以及同基因小鼠模型 | 机器学习和数字病理学 | 透明细胞肾细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学、多重免疫荧光、ELISA、定量PCR、迁移实验、微生理系统（MPS）分析 | NA | 图像和基因表达数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 102 | 2026-07-15 |
Nested co-expression network analysis identifies compact gene clusters in a black box
2026-May-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag167
PMID:41934621
|
研究论文 | 提出一种名为Nested-WGCNA的两阶段无监督网络分析算法，用于在转录组数据中识别嵌套的基因模块 | 首次实现从粗粒度到细粒度的多层次基因模块识别，解决现有方法忽略紧凑基因集的局限性 | 对单细胞RNA-Seq数据的验证仅作为注释参考，未直接优化用于单细胞数据 | 开发能够识别嵌套基因模块的网络分析方法，揭示复杂生物过程中的功能异质性 | 组织样本的bulk RNA-Seq数据和免疫治疗反应数据集 | 机器学习 | NA | RNA-seq | 加权基因共表达网络分析 | 转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 103 | 2026-07-15 |
Identification of high-risk cells in single-cell spatially resolved transcriptomics data using Diagnostic Evidence GAuge of Single-cells with spatial smoothing
2026-May-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag098
PMID:41934088
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研究论文 | 提出DEGAS方法，利用单细胞空间分辨转录组数据识别高风险细胞和区域 | DEGAS通过潜在基因表达表征和域自适应技术将患者疾病属性转移到单个细胞，解决了现有方法无法关联单细胞与疾病属性的问题 | 未提及具体限制 | 开发并评估DEGAS方法在单细胞空间分辨转录组平台上的适用性及高风险细胞区域识别能力 | 肝细胞癌、皮肤黑色素瘤及II型糖尿病的组织样本 | 机器学习 | 肝细胞癌, 皮肤黑色素瘤, II型糖尿病 | 单细胞空间转录组学 | DEGAS（基于域自适应的潜在表征模型） | 基因表达数据 | 包含肝细胞癌、皮肤黑色素瘤及II型糖尿病Xenium数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Xenium | 10x Xenium平台用于II型糖尿病数据生成 |
| 104 | 2026-07-15 |
Nanoplastics target lung monocytes, disrupting immune dynamics
2026-May-01, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2026.141961
PMID:41934838
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研究论文 | 通过全身荧光成像、流式细胞术和单细胞RNA测序，研究了纳米塑料在雌性小鼠体内的生物分布及对免疫动力学的影响 | 首次揭示纳米塑料在体内主要靶向肺部，并特异性地被非经典单核细胞和CD206+间质巨噬细胞摄取，进而扰乱单核细胞向巨噬细胞的分化过程 | 未明确说明局限性 | 探究纳米塑料在全身暴露后的生物分布及其对肺部免疫系统的直接影响 | 雌性小鼠 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序、流式细胞术、全身荧光成像 | NA | 单细胞基因表达数据 | 雌性小鼠（具体数量未提供） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 105 | 2026-07-15 |
Deciphering functional intra-tumoral heterogeneity in BRAFV600E-driven mouse thyroid cancer reveals EMT trajectory and metabolic remodeling
2026-May, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-026-03742-8
PMID:41935217
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析BRAFV600E驱动小鼠甲状腺癌的功能性瘤内异质性，揭示EMT轨迹和代谢重塑 | 首次在成年发病的BRAF驱动自体小鼠PTC模型中揭示恶性甲状腺细胞的转录异质性和层级轨迹，并发现EMT轨迹及相关基因模块对人类PTC具有预测价值 | 未提及明确限制 | 探究BRAF驱动PTC中肿瘤细胞的功能性异质性，为EMT靶向治疗提供理论基础 | BRAFV600E驱动小鼠甲状腺癌模型中的恶性甲状腺细胞 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 序列数据 | 成年发病自体小鼠PTC模型，具体样本量未提及 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 106 | 2026-07-15 |
COVARE for modeling latent random effect correlations to detect genes with specific spatial expression patterns
2026-05, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2026.111242
PMID:41941898
|
研究论文 | 提出COVARE方法，基于线性混合效应模型检测具有特定空间表达模式的基因 | COVARE能够整合多种预设生物信息并考虑协变量间的潜在交互作用，克服现有方法忽略细胞微环境中协变量交互效应的局限 | 未提及 | 解决现有方法在检测空间变异基因时忽视协变量交互效应的问题 | 空间转录组学数据中的基因表达模式 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 线性混合效应模型 | 基因表达数据 | 基于模拟数据集和公共数据集进行验证 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 107 | 2026-07-15 |
OMICX: An AI-powered web platform for integrative analysis of multi-condition single-cell transcriptomics data
2026-05, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2026.111243
PMID:41941899
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研究论文 | 介绍OMICX，一个由大型语言模型辅助的无代码网络平台，用于多条件单细胞转录组数据的整合分析 | 首次提出一个代码免费的网络平台，结合LLM助手OMICX-Agent，支持通过自然语言对话进行复杂的单细胞数据分析，并能整合批量RNA-seq或GWAS统计数据 | 未明确提及局限性 | 开发一个用户友好、可再现的AI驱动平台，简化多条件单细胞转录组数据的整合分析，减少对编程技能的需求 | 单细胞RNA-seq数据、批量RNA-seq数据、GWAS汇总统计数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序，GWAS | 大型语言模型 | 文本、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 108 | 2026-07-15 |
PEDF Prevents Corneal Endothelial Dysfunction of Fuchs Endothelial Corneal Dystrophy
2026-05-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.5.2
PMID:42080792
|
研究论文 | 探讨色素上皮衍生因子对Fuchs角膜内皮营养不良角膜内皮功能障碍的保护作用 | 首次发现PEDF在FECD患者房水中水平显著降低，并通过抑制p53、TGF-β和Hippo信号通路预防角膜内皮损伤 | NA | 评估PEDF对FECD角膜内皮的保护潜力 | FECD患者的房水、人角膜内皮细胞、UVA诱导的FECD小鼠模型 | 数字病理学 | Fuchs角膜内皮营养不良 | 酶联免疫吸附测定、免疫荧光染色、单细胞RNA测序、RNA测序、定量PCR、自动简单蛋白质印迹法 | NA | 图像、序列数据 | FECD患者房水样本（数量未明确）、UVA诱导FECD小鼠模型（数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 109 | 2026-07-15 |
Single-cell transcriptomics reveal PRRC1 as a malignant cell enriched driver of DNA repair and therapy resistance in glioblastoma
2026-05, DNA repair
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.dnarep.2026.103934
PMID:41932066
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学和多组学分析发现PRRC1是胶质母细胞瘤中DNA修复和治疗抵抗的恶性细胞富集驱动因子 | 首次鉴定PRRC1在胶质母细胞瘤中的功能角色，证明其通过调控染色质组织和细胞周期参与DNA损伤反应，并揭示其为潜在治疗靶点 | 未提及具体局限性 | 探索胶质母细胞瘤恶性细胞中调控DNA损伤反应相关细胞状态的未知因子，并评估PRRC1作为治疗靶点的潜力 | 胶质母细胞瘤细胞及患者来源的肿瘤细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、批量转录组分析、TCGA DNA甲基化数据、功能验证 | NA | 单细胞转录组数据、批量转录组数据、DNA甲基化数据 | 包括TCGA和GDSC数据集以及患者来源的胶质母细胞瘤细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 110 | 2026-07-15 |
Single-Cell Computational Frameworks for Quantifying BET Bromodomain Inhibitor Resistance and Screening Re-Sensitizer Drugs in Triple-Negative Breast Cancer
2026-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202513246
PMID:41933924
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序数据，开发量化BET溴结构域抑制剂耐药性及筛选再敏化药物的计算框架 | 提出了两个计算框架FR20和D-FR20，分别用于在单细胞分辨率下量化BET溴结构域抑制剂耐药性和筛选潜在再敏化药物，并揭示了铁死亡在耐药性演化中的作用 | 未在更广泛的临床样本中验证框架的泛化能力，且对铁死亡抑制机制的研究可能不够深入 | 针对三阴性乳腺癌中BET溴结构域抑制剂耐药性问题，开发计算工具以量化耐药性并筛选再敏化药物 | 三阴性乳腺癌细胞 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 计算框架 | 基因表达数据 | 九个独立数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 111 | 2026-07-15 |
Benchmarking alignment methods for spatial transcriptomics data
2026-May, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-026-00977-z
PMID:41933187
|
研究论文 | 系统比较多种空间转录组数据对齐方法的性能 | 首次对空间转录组数据对齐方法进行大规模系统基准测试，共执行295项任务，提出并验证缓解当前工具局限性的策略 | 未提及具体局限性 | 评估空间转录组切片对齐方法的准确性、效率、易用性和鲁棒性，并为研究者提供方法选择指南 | 多种空间转录组数据集和切片对齐方法 | 数字病理学 | 不适用 | 空间转录组学 | 不适用 | 空间坐标和基因表达谱 | 未提及具体样本数量 | 不适用 | 空间转录组学 | 不适用 | 不适用 |
| 112 | 2026-07-15 |
Single-nucleus and spatial transcriptomics analyses reveal interplay between evolutionary dynamics and energy metabolism in primary cardiac lymphoma
2026-May, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-026-01031-w
PMID:42174190
|
研究论文 | 通过单核和空间转录组学分析揭示原发心脏淋巴瘤的进化动力学与能量代谢的相互作用 | 首次结合单核RNA测序和空间转录组学分析原发心脏淋巴瘤的代谢和免疫景观，发现染色体不稳定性可能驱动疾病进展，并鉴定出富含脂肪酸代谢-MAPK信号的恶性B细胞亚群B3 | 样本量较小（仅两名患者），研究结果需要更大样本验证 | 阐明原发心脏淋巴瘤的分子基础，探索其进化动力学和代谢适应机制 | 两名原发心脏淋巴瘤患者 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 2名患者 | 10x Genomics | 单核RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, Visium CytAssist | 10x Chromium用于单核RNA测序，Visium CytAssist用于空间转录组学 |
| 113 | 2026-07-15 |
Integrated bioinformatics analysis of the shared molecular mechanisms between Parkinson's disease and COVID-19
2026-Apr-28, mSphere
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/msphere.00908-25
PMID:41930954
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研究论文 | 通过整合生物信息学分析和单细胞RNA测序，探究帕金森病与COVID-19之间的共享分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示CHI3L1表达的星形胶质细胞在COVID-19中显著增加，并发现星形胶质细胞通过多种信号分子与神经元和免疫细胞相互作用，可能加剧帕金森病症状 | 需要更大规模的研究进一步验证CHI3L1的病理相关性和功能意义 | 探究帕金森病与COVID-19之间的共享分子机制以及潜在的治疗靶点 | COVID-19患者脑组织样本和帕金森病样本中的基因表达数据 | 机器学习 | 帕金森病, COVID-19 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | COVID-19样本和帕金森病样本的批量RNA-seq数据及COVID-19患者脑组织单细胞RNA-seq数据 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 114 | 2026-07-15 |
Single-Cell Sequencing Analysis-Driven Nanomedicine Design for Mimicking Endogenous Immune Repair in Myocardial Infarction
2026-Apr-21, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.6c01251
PMID:41934404
|
研究论文 | 利用单细胞测序分析驱动纳米医学设计，通过模拟内源性免疫修复过程来治疗心肌梗死 | 首次提出数据驱动的仿生策略，通过顺序递送免疫细胞模拟纳米颗粒来复制自然免疫修复机制，并基于单细胞RNA测序揭示了巨噬细胞亚型在心肌梗死后不同阶段的动态分布及作用 | 未提及具体局限性 | 设计并验证一种模拟内源性免疫修复的纳米医学策略用于心肌梗死治疗 | 心肌梗死小鼠模型中的免疫细胞（重点为巨噬细胞亚型M2a、M2b、M2c） | 数字病理学 | 心血管疾病（心肌梗死） | 单细胞RNA测序 | 纳米颗粒递送系统 | 单细胞转录组数据 | 心肌梗死小鼠模型（具体样本数未明确） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3'测序平台 |
| 115 | 2026-07-15 |
Single-cell RNA sequencing and Mendelian randomization identify context-dependent LIPA-associated classical monocyte states in sepsis and breast cancer
2026-Apr-17, Breast cancer research and treatment
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s10549-026-07965-x
PMID:41991741
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析，鉴定败血症和乳腺癌中与LIPA相关的经典单核细胞状态及其环境依赖性 | 首次结合单细胞RNA测序与孟德尔随机化方法，揭示LIPA基因在败血症和乳腺癌两种疾病环境中对经典单核细胞状态的差异调控作用 | 研究结果仅作为假设生成，需要未来配对样本、机制性和实验性研究来验证LIPA在免疫调节和乳腺癌中的功能相关性 | 探究LIPA基因在败血症和乳腺癌中与经典单核细胞状态的环境依赖性关联 | 败血症和乳腺癌患者的外周血单核细胞及肿瘤微环境中的经典单核细胞 | 单细胞转录组学、基因组学 | 乳腺癌、败血症 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化 | NA | 单细胞转录组数据 | 乳腺癌和败血症的单细胞RNA测序数据集，以及独立验证的乳腺癌患者外周血单核细胞数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 116 | 2026-07-15 |
Deciphering oxidative stress-related heterogeneity and developing a prognostic signature for colorectal cancer
2026-Apr-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-46560-4
PMID:41935137
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研究论文 | 通过单细胞和批量RNA-seq数据解析氧化应激相关异质性，构建结直肠癌预后风险评分模型 | 创新性地结合单细胞和批量转录组数据解析氧化应激在结直肠癌肿瘤微环境中的异质性，并构建了12基因的氧化应激相关风险评分（OSRRS）模型 | 未明确说明局限性 | 揭示氧化应激对结直肠癌肿瘤微环境的影响，并开发OS相关风险评分模型 | 结直肠癌恶性肿瘤细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA-seq, qRT-PCR, IHC | LASSO Cox | 转录组数据 | 单细胞RNA-seq数据集GSE132465、TCGA-CRC批量RNA-seq数据集、GSE39582和GSE17538验证队列 | NA | NA | NA | NA |
| 117 | 2026-07-15 |
New perspectives on the mechanisms and treatment of valvular heart disease: Mendelian randomization and systematic analysis based on plasma proteins
2026-Apr-03, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000048210
PMID:41931316
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研究论文 | 本研究利用孟德尔随机化和整合分析方法，识别心脏瓣膜病的分子靶点和潜在治疗药物 | 首次将孟德尔随机化、药物重定位与单细胞RNA测序结合，系统分析心脏瓣膜病的分子机制和候选药物 | 仅基于公共GWAS数据，缺乏实验验证, 且药物预测需进一步临床检验 | 识别心脏瓣膜病的关键分子靶点和潜在治疗候选物 | 心脏瓣膜病患者及其相关基因和蛋白质 | 机器学习 | 心血管疾病 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | 基于公共GWAS数据集，未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 118 | 2026-07-15 |
Transcriptome data combined with two-sample Mendelian randomization reveal IRF1 and PRKD1 as UPR-related key regulators in intervertebral disc degeneration
2026-Apr-03, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000048213
PMID:41931350
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研究论文 | 通过整合转录组数据与双样本孟德尔随机化分析，发现IRF1和PRKD1是椎间盘退变中UPR相关的关键调控因子 | 首次结合双样本孟德尔随机化与单细胞RNA测序数据，证实IRF1和PRKD1与椎间盘退变风险的因果关系，并揭示其在免疫浸润中的角色 | 基于公共数据库的样本量有限，且未进行体外或体内实验验证因果关系的机制 | 探索内质网应激与未折叠蛋白反应在椎间盘退变中的分子调控机制 | 人类髓核组织样本中的差异表达基因、免疫细胞浸润及转录因子靶点 | 机器学习 | 椎间盘退变 | 转录组学、孟德尔随机化、单细胞RNA测序 | 孟德尔随机化模型 | 基因表达数据 | 包含GSE70362和GSE56081两个转录组数据集，以及独立验证数据集和单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 119 | 2026-07-15 |
Regulation of mitochondrial ROS by C15ORF48 in a basal cell subpopulation contributes to chemotherapy resistance in TNBC
2026-Apr-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aec8684
PMID:41931605
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示在TNBC中C15ORF48在基底细胞亚群中调控线粒体ROS导致化疗耐药的机制 | 首次发现C15ORF48作为线粒体细胞色素c氧化酶相关亚基FA4的旁系同源物，在基底细胞亚群中上调并通过抑制ROS积累诱导化疗耐药，为克服TNBC耐药提供新靶点 | NA | 阐明三阴性乳腺癌对标准化疗（阿霉素和环磷酰胺）耐药的分子机制 | 三阴性乳腺癌患者来源的异种移植模型中的肿瘤上皮细胞 | 机器学习 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒 |
| 120 | 2026-07-15 |
TMBIM6 enhances dopaminergic neuron survival by modulating the IRE1a pathway in Parkinson's disease
2026-Apr-03, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08391-5
PMID:41932887
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研究论文 | 该研究揭示了TMBIM6通过调控IRE1a通路增强帕金森病中多巴胺能神经元存活的机制 | 首次发现TMBIM6在帕金森病中通过直接结合IRE1a调控未折叠蛋白反应，并证明TMBIM6/IRE1a轴可作为潜在治疗靶点 | 文章未明确提及研究局限性，但可能包括动物模型与人类疾病的差异以及机制验证的深度限制 | 探究TMBIM6在帕金森病多巴胺能神经元变性中的作用及其分子机制 | 帕金森病细胞模型、原代神经元、果蝇模型和小鼠模型 | 机器学习 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | 未提及 | 基因表达数据 | 包括细胞模型、原代神经元、果蝇和小鼠样本，具体数量未提及 | 未提及 | 单细胞RNA测序 | 未提及 | 未提及 |