单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 40969 篇文献,本页显示第 101 - 120 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
101 2026-06-26
FastGxC: Fast and powerful context-specific eQTL mapping in bulk and single-cell data
2026-Jun-10, Cell genomics IF:11.1Q1
研究论文 提出FastGxC方法,在组织和单细胞水平上高效映射上下文特异性表达数量性状位点(eQTLs),提高检测功率和速度 利用多重组织批量及单细胞RNA测序数据的相关结构,实现比现有方法高9倍功效和10倍速度的上下文特异性eQTL映射 模拟中设定条件理想;实际应用中可能受数据质量或样本量限制 开发高效且强大的上下文特异性eQTL映射方法,阐明复杂性状的基因调控机制 人源多组织批量RNA测序(n=698)和外周血单核细胞(PBMC)单细胞RNA测序数据集(n=1,218) 自然语言处理 NA RNA-seq, eQTL分析 NA 文本 多组织批量RNA测序698个样本,PBMC单细胞RNA测序1,218个样本 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
102 2026-06-26
From DNA to drug discovery AI models for cardiovascular precision medicine
2026-Jun-10, Journal of cardiology IF:2.5Q2
综述 本文综述了人工智能模型在心血管精准医学中从DNA到药物发现的五类关键应用,包括序列-表达模型、结构感知模型、细胞背景模型、生成化学模型和表型反应模型 将多种人工智能基础模型(如Enformer、AlphaFold3、scNET等)整合为从基因型到表型再到治疗干预的完整流程,并提出了跨模态互操作性和湿实验验证相结合的策略 当前仍缺乏无缝的端到端系统,未来需要高质量数据集、多模态互操作性、外部验证和临床整合 探索人工智能如何弥补遗传变异与临床结局之间的分子机制鸿沟,推动心血管精准医学发展 心血管疾病相关的遗传变异、基因调控、蛋白质结构、单细胞转录组、药物分子及药物反应 机器学习 心血管疾病 NA Enformer, Evo2, AlphaFold3, ESM-2, scNET, DeepTalk, DeepDTAGen, PMDM, PRnet, TranSiGen 基因组数据、蛋白质结构数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据、药物分子数据 NA NA NA NA NA
103 2026-06-26
Cerebrovascular vulnerability and fibrosis in human brain aneurysms
2026-Jun-10, Nature neuroscience IF:21.2Q1
研究论文 该文章通过单细胞转录组学和空间转录组学绘制人脑动脉瘤图谱,揭示脑血管脆弱性和纤维化的细胞机制 首次揭示了脑动脉瘤中脑血管重构伴随平滑肌细胞丢失和活化成纤维细胞出现,并发现纤维化与髓系炎症之间的相互作用 未说明 探究人脑动脉瘤形成和破裂的细胞特异性分子病理机制 人脑动脉瘤和对照血管组织 数字病理学 脑血管疾病 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 14个成人脑动脉瘤和11个对照血管,共227,663个神经血管细胞(其中52,946个动脉瘤细胞) 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium scRNA-seq, 10x Visium空间转录组学
104 2026-06-26
Imaging-Based Spatial Transcriptomics: Data Interpretation Methods and Biomedical Applications
2026-Jun-08, Biology
综述 综述了基于成像的空间转录组学在数据解析方法和生物医学应用方面的进展 系统性地从数据解析和应用角度审视了不同成像平台,强调计算生物学问题的共性和挑战 仅关注成像类空间转录组技术,未涵盖基于测序的方法的综合比较 综述成像类空间转录组学的数据解析框架和生物医学应用 成像类空间转录组学数据及分析流程 计算生物学, 空间转录组学 NA 成像空间转录组学, 单分子荧光原位杂交, 多重成像, 原位测序 NA 图像, 转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
105 2026-06-26
Integrated Single-Cell RNA-Seq and Machine Learning to Construct an EMT Infiltration Scoring Model for Prostate Cancer
2026-Jun-02, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 整合单细胞RNA测序与机器学习构建前列腺癌上皮-间充质转化浸润评分模型 首次在单细胞水平系统描绘前列腺癌中上皮-间充质转化的细胞异质性,并基于关键基因构建浸润评分模型,结合分子对接预测靶向治疗药物 未提及明显局限性 构建上皮-间充质转化浸润评分模型,用于前列腺癌预后预测和治疗指导 前列腺癌患者的单细胞转录组数据和批量转录组数据 机器学习 前列腺癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 LASSO, AUCell 基因表达数据 未明确提及样本量 未明确提及 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 未明确提及 NA
106 2026-06-26
A Multiresolution Breast Cancer CIBERSORTx Resource Validated for Accuracy, Interpretive Limits, and Biological and Clinical Coherence in Tumor Microenvironment Deconvolution
2026-Jun-02, Methods and protocols IF:2.3Q3
研究论文 基于单细胞RNA测序数据开发了乳腺癌特异性多分辨率CIBERSORTx签名矩阵,并系统评估了其在肿瘤微环境反卷积中的准确性、解释性限制及生物学和临床一致性 首次构建乳腺癌特异性多分辨率CIBERSORTx签名矩阵,涵盖主要、次要和亚群级别,并系统评估了不同分辨率下的性能特征 细分辨率子集表现出非经典模式,可能反映谱系内权衡或依赖上下文的转录状态;反卷积性能在细分辨率下下降,且谱系级反卷积虽减少溢出但持续降低准确性 开发和验证用于乳腺癌肿瘤微环境反卷积的多分辨率CIBERSORTx资源,并阐明其性能特征和局限性 乳腺癌肿瘤微环境中的各类免疫和基质细胞群体 机器学习 乳腺癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 CIBERSORTx 基因表达数据 TCGA-BRCA和I-SPY2队列中的批量RNA测序样本 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
107 2026-06-26
Transcriptional Heterogeneity of Oligodendrocytes: Molecular Basis of Diversity Across Development, Brain Regions, and Neurological Diseases
2026-Jun-02, Neurology international IF:3.2Q2
综述 综合阐述了少突胶质细胞在发育、脑区和疾病状态下的转录异质性,重点分析了疾病相关少突胶质细胞的分子特征及调控网络 系统整合了单细胞RNA测序揭示的少突胶质细胞异质性,首次归纳了疾病相关少突胶质细胞的转录调控网络(STAT/IRF、YY1/NF-κB、SOX9/SOX10) 未提供定量比较不同研究间细胞亚群分类标准差异,且空间转录组与单细胞数据的整合方法尚待验证 揭示少突胶质细胞在发育、脑区和疾病中的异质性机制,为靶向髓鞘修复治疗提供理论基础 小鼠体感皮层、海马CA1区、十个CNS区域;人类多发性硬化、阿尔茨海默病和脊髓损伤样本 数字病理学 多发性硬化、阿尔茨海默病、脊髓损伤 单细胞RNA测序、单细胞核RNA测序、空间转录组学 NA 转录组数据 涵盖小鼠十种脑区及人类神经系统疾病多组样本 10x Genomics 单细胞RNA测序、空间转录组学 10x Chromium、10x Visium 10x Chromium 单细胞3'测序、10x Visium 空间基因表达分析
108 2026-06-26
LMO7 Suppresses Tumor-Associated Macrophage Phagocytosis of Tumor Cells Through Degradation of LRP1
2026-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究揭示了LMO7通过促进LRP1的泛素化降解来抑制肿瘤相关巨噬细胞对肿瘤细胞的吞噬作用 首次发现LMO7在肿瘤相关巨噬细胞中通过泛素-蛋白酶体系统降解吞噬受体LRP1,从而抑制巨噬细胞吞噬功能,并证明联合靶向LMO7和SIRPα具有协同抗肿瘤效果 未提及具体局限性 探究LMO7在肿瘤相关巨噬细胞吞噬功能中的作用及其分子机制 肿瘤相关巨噬细胞 机器学习 肿瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
109 2026-06-26
IgA-Producing B Cells Exert Regulatory Function through Granzyme B in Kidney Allograft Tolerance
2026-Jun-01, Kidney360 IF:3.2Q1
研究论文 该论文研究了肾脏移植耐受中产生IgA的B细胞通过颗粒酶B发挥调节功能 首次发现耐受性肾移植患者中IgA+ B细胞高表达颗粒酶B并发挥调节功能,揭示了IgA与颗粒酶B表达Breg之间的强关联 未在标题和摘要中明确提及局限性 探讨IgA与颗粒酶B表达B细胞在肾移植耐受中的关联及调节机制 健康志愿者和肾移植患者,包括稳定功能、抗体介导排斥和耐受患者 数字病理学 肾脏移植相关疾病 单细胞RNA测序、多参数光谱流式细胞术、ELISA、Western blot NA 基因表达数据、流式细胞术数据、血清免疫球蛋白数据 45名健康志愿者和31名肾移植患者 NA 单细胞RNA-seq NA 各平台详细信息未在标题和摘要中提供
110 2026-06-26
Generation of CCR4/CD7 Bispecific CAR-T Cells Resistant to Fratricide and Exhaustion
2026-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 开发了一种抗自相残杀和耗竭的CCR4/CD7双特异性CAR-T细胞,并进行了体内外验证 通过简单的单步CD7耗竭和携带c-Jun的CAR结构设计,解决了CAR-T细胞治疗T细胞恶性肿瘤中的自相残杀和功能耗竭问题,并发现了一个独特的AQP3+ CD4+ T细胞亚群 未提及临床试验结果,仅基于体外和体内模型 开发抗自相残杀和耗竭的CCR4/CD7双特异性CAR-T细胞,用于T细胞恶性肿瘤治疗 恶性T细胞系及CD7耗竭的T细胞 计算机视觉 T细胞恶性肿瘤 慢病毒转导, scRNA-seq NA 单细胞RNA测序数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
111 2026-06-26
Vorinostat Potentiates Chemoimmunotherapy in Immune-Enriched Pancreatic Cancer
2026-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过整合体外药物筛选和计算机敏感性预测,发现HDAC抑制剂伏立诺他可特异性增敏免疫富集型胰腺导管腺癌的化学免疫治疗,并通过T细胞-类器官共培养和人源化小鼠模型验证其机制及疗效 首次发现伏立诺他通过抑制FASN和PARP9双重靶点,破坏免疫富集型胰腺癌中的“代谢陷阱”,并联合化疗和免疫检查点抑制剂重塑肿瘤微环境 研究主要基于体外实验和动物模型,临床转化尚需大规模临床试验验证 探索免疫富集型胰腺导管腺癌对化学免疫治疗增敏的机制,并鉴定有效疗法 免疫富集型胰腺导管腺癌细胞、T细胞-类器官共培养体系、人源化小鼠模型及临床患者样本 机器学习 胰腺癌 单细胞RNA测序、药物敏感性预测、类器官共培养、患者来源异种移植 NA 基因表达数据、药物敏感性数据、单细胞转录组数据 临床患者数据(具体数量未提及)、体外细胞系及类器官模型 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'转录组测序
112 2026-06-26
Monocyte-derived IL-1β predicts and promotes HBsAg decline in chronic hepatitis B patients under nucleoside analogue therapy
2026-Jun-01, Hepatology communications IF:5.6Q1
研究论文 本研究揭示单核细胞来源的IL-1β可预测并促进核苷类似物治疗的慢性乙型肝炎患者的HBsAg下降 首次通过单细胞RNA测序揭示CD14+CD16-经典单核细胞中IL-1β高表达与HBsAg下降相关,并证实IL-1β可作为预测标志物和潜在治疗靶点 未提及具体限制,但可能包括验证队列规模有限、机制研究需进一步体内验证 探索慢性乙型肝炎患者接受核苷类似物治疗后HBsAg下降的免疫相关因素 核苷类似物治疗的慢性乙型肝炎患者的PBMC及血清 数字病理学 慢性乙型肝炎 单细胞RNA测序、转录组分析、功能检测 单细胞转录组数据、血清IL-1β水平 探索队列:scRNA-seq样本数不详;验证队列:多中心独立队列;回顾性队列:长期随访队列 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
113 2026-06-26
Multi-omics reveals a novel Cxcr4+ subpopulation of alveolar macrophages and therapeutic effect of AMD3100 in mice with advanced silicosis
2026-Jun, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 通过多组学发现晚期矽肺小鼠中一种新型Cxcr4+肺泡巨噬细胞亚群及AMD3100的治疗效果 首次利用单细胞RNA测序与空间转录组学整合分析,识别Cxcr4+巨噬细胞和Cxcl12+成纤维细胞在矽肺纤维化进程中的空间共定位模式,并揭示Cxcr4/Cxcl12正反馈回路的致病机制 研究基于小鼠模型,结果需在人类样本中验证;未深入探讨Cxcr4+亚群与其他免疫细胞的互作关系 阐明矽肺纤维化进展中巨噬细胞异质性与Cxcr4/Cxcl12信号轴的作用,评估AMD3100的治疗潜力 小鼠肺组织及肺泡巨噬细胞系MH-S 数字病理学 矽肺 单细胞RNA测序、空间转录组学 机器学习算法(Robust Cell Type Decomposition) 基因表达数据、空间转录组数据 矽肺小鼠模型肺组织样本 未注明 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
114 2026-06-26
Abnormal Stress Reduced miR-330 Supplementation Alleviates Osteoarthritis Progression by Suppressing Osteochondral Catabolism
2026-Jun, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 本研究揭示miR-330在异常机械应力下表达降低,并通过抑制软骨细胞和破骨细胞的分解代谢及炎症因子来减轻骨关节炎进展 首次发现miR-330是一种机械响应性、骨关节炎保护性microRNA,并证明其在颞下颌关节和膝关节骨关节炎中的诊断和治疗潜力 未在文中明确提及研究局限性 探索miR-330在异常机械应力诱导的骨关节炎中的作用及其分子机制 骨关节炎患者滑液、软骨和软骨下骨组织以及动物模型 NA 骨关节炎 single-cell RNA sequencing NA 基因表达数据 96例颞下颌关节紊乱患者滑液样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
115 2026-06-26
Glutathione peroxidase 3 preserves hepatocyte mitochondrial quality control to enhance macrophage pro-regenerative phenotype during liver regeneration
2026-Jun, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本研究揭示了谷胱甘肽过氧化物酶3(GPX3)在肝再生过程中通过抑制VDAC1寡聚化维持线粒体质量控制、调节巨噬细胞表型的关键分子机制 首次发现GPX3通过其A2结构域直接结合VDAC1并抑制其寡聚化,从而维持线粒体钙稳态和质量控制;阐明了GPX3缺失导致线粒体DNA释放激活巨噬细胞cGAS-STING通路的具体机制 未说明具体局限性(摘要中未提及实验样本量、模型转换到临床的障碍等) 探究肝细胞来源的GPX3在肝脏再生中的调控作用及分子机制 接受70%部分肝切除术的小鼠肝脏组织及肝细胞 机器学习和数字病理 肝脏疾病 单细胞RNA测序、免疫共沉淀质谱、MitoCarta3.0分析、免疫染色 NA 基因表达数据和图像数据 使用70%部分肝切除模型小鼠,具体样本量未明确 NA 单细胞RNA测序 NA NA
116 2026-06-26
Beta-Glucan modulates monocyte plasticity and differentiation capacity to mitigate DSS-induced colitis
2026-Jun-01, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究揭示β-葡聚糖通过训练免疫调节单核细胞可塑性和分化能力,减轻DSS诱导的小鼠结肠炎 首次证明β-葡聚糖诱导的训练免疫可通过重编程骨髓造血祖细胞和外周单核细胞,促进修复性Cx3cr1巨噬细胞扩增,从而减轻结肠炎症状,且这种保护效应可通过细胞转移传递 研究仅限于小鼠模型,未涉及人类样本或临床验证;DSS诱导模型不能完全模拟人类IBD复杂性 探究训练免疫在IBD发病机制中的作用及其作为治疗策略的潜力 β-葡聚糖训练的小鼠骨髓造血祖细胞和外周单核细胞 机器学习 炎症性肠病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确说明 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
117 2026-06-26
ScSpTITH: a rank-correlation framework for robust quantification of multi-dimensional tumor heterogeneity
2026-Jun-01, Human genetics IF:3.8Q2
研究论文 提出了一种名为ScSpTITH的秩相关计算框架,用于稳健量化单细胞和空间转录组数据中的肿瘤异质性 基于Spearman秩相关的策略,对单细胞RNA测序中高达70-95%的dropout伪影具有内在鲁棒性,能够在多维度(空间区域、细胞群体、治疗条件)上量化肿瘤异质性 依赖高度可变基因选择步骤,可能忽略部分低表达但重要的生物学特征 开发一个统一且稳健的计算框架,用于解剖单细胞和空间转录组研究中的多维度肿瘤异质性 肿瘤组织和发育过程中的细胞群体 机器学习 肿瘤 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 基因表达数据 多个癌症和发育数据集的公共数据 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
118 2026-06-26
Elucidating disease pathogenesis using formalin-fixed paraffin-embedded samples: Integrating genomics, spatial transcriptomics, and histology - A focus on vascular anomalies
2026-Jun, Journal of oral biosciences IF:2.6Q1
综述 综述了利用福尔马林固定石蜡包埋样本整合基因组学、空间转录组学和组织学来阐明疾病发病机制,重点关注血管异常 强调利用FFPE样本整合NGS基因组突变分析和空间转录组学,构建多层病理研究统一工作流程,以揭示疾病机制和推动个性化治疗 FFPE样本核酸降解和实验室间差异性问题尚未完全克服,统一工作流程尚未建立 综述基于FFPE样本的NGS基因组突变分析和空间转录组学整合方法,以阐明疾病机制并提升诊断准确性和个性化治疗 血管异常等疾病的FFPE样本 数字病理学 血管疾病 NGS, 空间转录组学 NA 基因组数据, 空间转录组数据, 组织学图像 NA Illumina 空间转录组学, 基因组测序 NA 基于NGS的空间转录组学和基因组突变分析平台
119 2026-06-26
Temporal single-cell transcriptional dynamics of murine pancreatic islet remodeling during hyperglycaemia progression
2026-Jun-01, Molecular metabolism IF:7.0Q1
研究论文 通过纵向单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序,构建了小鼠胰岛在高血糖进展过程中的高分辨率转录组图谱,揭示了胰岛细胞的动态重塑机制 首次在单细胞分辨率下纵向解析了高脂饮食诱导胰岛素抵抗过程中小鼠胰岛内分泌和非内分泌细胞的全面转录组动态变化,发现了CCL27a趋化因子信号在β细胞与M1巨噬细胞相互作用中的新角色 未提及具体限制 探究肥胖诱导胰岛素抵抗过程中胰腺胰岛的细胞重塑和转录组动态变化 高脂饮食喂养8、16、24周的C57BL/6小鼠胰岛细胞 单细胞组学 2型糖尿病 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 NA 单细胞转录组数据,单细胞染色质可及性数据 高脂饮食组和常规饮食对照组小鼠,每个时间点多个样本 10x Genomics 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞测序平台
120 2026-06-26
scTACL: a multitask topology-aware contrastive learning approach for single-cell transcriptomics analysis
2026-Jun-01, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 开发了一种名为scTACL的拓扑感知对比学习方法,用于单细胞转录组学分析,以提升数据填补、聚类、批次效应校正和细胞-细胞相互作用等任务的表现 首次将拓扑感知对比学习与ZINB分布结合,无需空间位置信息即可有效区分上皮和间充质区域,并通过细胞间通讯分析识别到关键信号通路 NA 开发新型计算方法以应对单细胞RNA测序数据中的噪声和缺失事件,提高下游分析准确性 单细胞RNA测序数据及空间转录组数据中的细胞群体 机器学习 肺癌, 肝癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学 对比学习 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
回到顶部