单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 36081 篇文献,本页显示第 101 - 120 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
101 2026-02-07
Osteopontin attenuates microglia-mediated neuroinflammation and blood-brain barrier damage after pontine infarction
2026-Feb-05, Neural regeneration research IF:5.9Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组学、多组学分析、动物模型和患者样本,揭示了骨桥蛋白在脑桥梗死后调节小胶质细胞激活和血脑屏障完整性的关键作用 首次通过单细胞RNA测序和多组学分析,系统性地识别骨桥蛋白作为脑桥梗死后神经炎症和血脑屏障损伤的关键调节因子,并验证其通过调节嘌呤代谢和增强腺苷信号发挥神经保护作用的机制 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,人类患者样本的验证相对有限,且未深入探讨骨桥蛋白在其他类型脑卒中中的普适性 探究脑桥梗死的病理机制,并寻找潜在的治疗靶点 脑桥梗死小鼠模型、BV2小胶质细胞系、脑桥梗死患者血清样本 数字病理学 脑卒中 单细胞RNA测序、免疫荧光、Western blotting、多组学分析 动物模型(小鼠)、细胞模型(BV2) 基因表达数据、蛋白质数据、临床数据 未明确指定具体样本数量,但涉及小鼠模型、细胞系和患者血清样本 NA 单细胞RNA测序, 多组学分析 NA NA
102 2026-02-07
Breast Cancer Brain Metastases: Current Understanding and Future Directions
2026-Feb-05, Current oncology reports IF:4.7Q1
综述 本文回顾了乳腺癌脑转移(BCBM)的最新研究进展,重点探讨了转移机制、肿瘤微环境相互作用、原发肿瘤与脑转移灶之间的受体不一致性、诊断创新以及治疗策略 整合了JAK-STAT信号、同源重组缺陷、c-MYC、PI3K/AKT/mTOR和RET在BCBM进展中的作用,并强调了神经元模拟、代谢重编程及与星形胶质细胞和小胶质细胞相互作用等肿瘤适应机制 机器学习在预后和影像解读中的应用外部验证有限,未来研究需标准化诊断平台并在前瞻性试验中验证受体重新评估对生存的影响 阐明乳腺癌脑转移的分子机制和临床管理策略,以指导精准治疗并确定未来研究方向 乳腺癌脑转移的生物学过程、诊断工具及治疗方法 数字病理学 乳腺癌 液体活检、空间转录组学、放射组学、机器学习 机器学习 分子谱数据、空间映射数据、影像数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
103 2026-02-07
TMEM158-mediated TGF-β signaling pathway modulates the sensitivity of TP53-deficient osteosarcoma to USP14 inhibitors
2026-Feb-05, Molecular and cellular biochemistry IF:3.5Q3
研究论文 本研究揭示了TMEM158介导的TGF-β信号通路在调节TP53缺陷型骨肉瘤对USP14抑制剂敏感性中的核心作用 首次发现TMEM158是TP53缺陷型骨肉瘤对USP14抑制剂敏感性的关键调节因子,并阐明了其通过TGF-β信号通路发挥作用的分子机制 研究主要基于细胞系和小鼠模型,临床转化仍需进一步验证;单细胞测序数据的分析深度和样本量有限 探究TP53缺陷型骨肉瘤对USP14抑制剂敏感性的分子机制,寻找精准治疗靶点 TP53缺陷型骨肉瘤细胞(原代细胞、SAOS-2、U-2OS)、临床骨肉瘤数据库、TP53缺陷型骨肉瘤小鼠模型 计算生物学 骨肉瘤 生物信息学分析(聚类分析、差异表达分析、功能富集分析)、qPCR、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 多个细胞系(原代TP53缺陷型骨肉瘤细胞、SAOS-2、U-2OS)、临床数据库、小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
104 2026-02-07
Adenosine A2B Receptor Promotes Tumor Progression and Metastases in Undifferentiated Pleomorphic Sarcoma
2026-Feb-05, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 本研究通过多组学分析发现腺苷A2B受体(ADORA2B)是未分化多形性肉瘤(UPS)转移进展的关键驱动因子,并验证了其作为治疗靶点的潜力 首次在UPS中系统揭示了ADORA2B通过调控缺氧、上皮-间质转化和免疫抑制通路驱动转移的分子机制,并进行了功能验证 样本量相对较小(13例患者),且主要基于相关性分析和临床前模型,需要更大规模临床研究进一步验证 探究未分化多形性肉瘤(UPS)转移的分子机制并寻找潜在治疗靶点 未分化多形性肉瘤(UPS)患者的配对原发和转移肿瘤样本、CRISPR-Cas9敲除的UPS细胞系、体内动物模型 数字病理 软组织肉瘤 空间转录组学、bulk RNA测序、反卷积分析、CRISPR-Cas9基因敲除 NA 转录组数据、空间转录组数据 13例UPS患者的配对原发和转移肿瘤样本 NA 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
105 2026-02-07
Targeting HSP90 as a therapeutic approach for endometriosis: insights from proteomic analysis
2026-Feb-05, Reproduction (Cambridge, England)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析,发现热休克蛋白90(HSP90)在子宫内膜异位症中上调,并验证了其抑制剂17-AAG在体外和体内模型中的治疗效果 首次在子宫内膜异位症中通过单细胞RNA测序识别HSP90作为潜在治疗靶点,并利用蛋白质组学揭示了其抑制后的下游分子网络变化 研究主要基于细胞和小鼠模型,尚未进行人体临床试验;样本来源相对有限 探索子宫内膜异位症的非激素治疗新靶点 子宫内膜异位症患者月经流出物、原代子宫内膜基质细胞、小鼠子宫内膜异位症模型 单细胞组学 子宫内膜异位症 单细胞RNA测序, 蛋白质组学分析 NA 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据 数据集GSE203191(患者月经流出物),原代细胞及小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
106 2026-02-07
FLASH-MM: fast and scalable single-cell differential expression analysis using linear mixed-effects models
2026-Feb-05, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文开发了一种名为FLASH-MM的快速、可扩展的线性混合效应模型估计算法,用于解决单细胞RNA测序数据中样本相关性、个体差异和可扩展性等挑战 通过重新设计线性混合模型估计过程,降低计算复杂度和内存使用,实现了快速且可扩展的单细胞差异表达分析 NA 开发一种快速、可扩展的算法,以解决单细胞差异表达分析中的样本相关性、个体变异和可扩展性问题 单细胞RNA测序数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 线性混合效应模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
107 2026-02-07
Integrating single-nucleus barcoding with spatial transcriptomics via Stamp-seq to reveal immunotherapy response-enhancing functional modules in NSCLC
2026-Feb-05, Cell discovery IF:13.0Q1
研究论文 本文开发了一种名为Stamp-seq的方法,通过整合单核条形码与空间转录组学,以揭示非小细胞肺癌中增强免疫治疗响应的功能模块 Stamp-seq方法利用定制高密度DNA测序芯片,以1.6 μm密度分布空间条形码,实现单细胞分辨率、精确亚型分类和空间映射,并降低了成本,首次应用于空间解析BCR克隆型 空间条形码的定位误差平均为4 μm,可能影响细胞边界的精确推断 研究非小细胞肺癌中免疫治疗响应的空间细胞生态系统 非小细胞肺癌组织中的单核细胞 空间转录组学 肺癌 单核条形码与空间转录组学整合技术 NA 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 定制高密度DNA测序芯片 Stamp-seq芯片,空间条形码密度为1.6 μm
108 2026-02-07
Single cell atlas decodes the molecular dynamics of scar repair after human rotator cuff tear
2026-Feb-05, Bone research IF:14.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序解析了人类肩袖撕裂后疤痕修复的细胞与分子动态,揭示了纤维化疤痕微环境的异质性细胞亚群及其关键驱动信号通路 首次在人类肩袖撕裂样本中应用单细胞RNA测序技术,系统解析了纤维化疤痕微环境的细胞异质性,并鉴定出SOX9驱动的促纤维化巨噬细胞、经历内皮-间质转化的内皮细胞等新型促纤维化亚群 样本量相对有限,且为横断面研究,难以完全捕捉疤痕形成的动态过程;研究主要关注分子机制,缺乏长期功能恢复的临床数据验证 揭示人类肩袖撕裂后不可逆纤维化疤痕形成的细胞与分子机制,并探索潜在的治疗靶点 肩袖撕裂患者的肌腱残端组织 单细胞组学 运动系统疾病/肩袖损伤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 患者肩袖撕裂样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
109 2026-02-07
Tumour-intrinsic features shape T cell differentiation through precursor to symptomatic multiple myeloma
2026-Feb-05, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析多发性骨髓瘤及其前驱状态患者的骨髓和血液样本,揭示了肿瘤内在特征如何影响T细胞分化,并预测疾病进展 首次在多发性骨髓瘤中证明T细胞分化由抗原驱动的终末记忆分化主导,而非传统T细胞耗竭,并识别了肿瘤负荷和抗原呈递基因表达等肿瘤内在特征的关键作用 研究主要基于观察性数据,机制性验证有限;样本来源可能受限于特定患者群体 探究多发性骨髓瘤中T细胞分化的机制及其在疾病进展中的作用 多发性骨髓瘤患者、前驱状态患者及非癌症对照者的骨髓和血液样本 数字病理学 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 大型数据集,包括多发性骨髓瘤、前驱状态和非癌症对照患者的骨髓和血液样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
110 2026-02-07
Dextrorotatory kynurenine suppresses acute rejection through inhibiting M1 macrophage-mediated inflammation
2026-Feb-05, EMBO molecular medicine IF:9.0Q1
研究论文 本文发现右旋犬尿氨酸(D-Kyn)通过抑制M1巨噬细胞介导的炎症,在预防肾移植急性排斥反应中具有免疫抑制作用 首次揭示了右旋氨基酸(D-AAs)在免疫抑制中的作用,并鉴定出D-Kyn通过PHGDH/TLR4/Caspase-1通路抑制M1巨噬细胞炎症活性,为移植排斥治疗提供了新的候选药物 研究主要基于小鼠模型和患者血清分析,未来需要更多临床研究验证D-Kyn在人体中的疗效和安全性 探究右旋氨基酸在肾移植急性排斥反应中的作用及其免疫抑制机制 肾移植受者血清样本、小鼠皮肤和肾脏移植模型、M1巨噬细胞 免疫学 肾移植急性排斥反应 离子淌度质谱(IM-MS)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 质谱数据、单细胞转录组数据 肾移植受者血清样本(具体数量未明确)、小鼠移植模型 NA 单细胞RNA-seq NA GSE109564数据集
111 2026-02-07
Safety, immunogenicity, and baseline immune correlates of vaccine JNJ-0535 in participants with or without CHB
2026-Feb-05, NPJ vaccines IF:6.9Q1
研究论文 本研究评估了治疗性DNA疫苗JNJ-0535在慢性乙型肝炎患者和健康志愿者中的安全性、耐受性和免疫原性,并探索了与疫苗反应相关的免疫生物标志物 首次在CHB患者中评估了通过电穿孔肌肉注射给药的HBV特异性治疗性DNA疫苗JNJ-0535,并采用单细胞RNA测序和血清蛋白质组学探索了疫苗反应的免疫相关性 研究样本量有限,发现的免疫生物标志物差异需要未来更大规模的研究进一步确认 评估JNJ-0535疫苗的安全性和免疫原性,并探索与疫苗反应相关的基线免疫特征 慢性乙型肝炎患者和健康志愿者 免疫学 慢性乙型肝炎 单细胞RNA测序, 血清蛋白质组学, ELISpot, 细胞内细胞因子染色 NA 基因表达数据, 蛋白质组学数据, 免疫反应数据 涉及两项I期临床试验的参与者(具体人数未明确说明) Olink 单细胞RNA-seq, 血清蛋白质组学 Olink Explore 3072 Olink Explore 3072蛋白质组学平台用于分析3072种蛋白质生物标志物
112 2026-02-07
Single-cell transcriptomic profiling of peripheral blood mononuclear cells reveals monocyte heterogeneity in patients with Moyamoya disease
2026-Feb-05, Orphanet journal of rare diseases IF:3.4Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了烟雾病患者外周血单个核细胞的转录组图谱,揭示了单细胞异质性及其在疾病中的作用 首次在烟雾病中应用单细胞RNA测序技术,鉴定了中间单核细胞亚群的增加,并发现了两个潜在生物标志物基因RETN和TGFBR2 样本量较小(仅6名患者和3名对照),且仅分析了外周血免疫细胞,未涉及脑组织或血管病变部位 探究烟雾病患者外周免疫细胞的转录组特征,以识别潜在的生物标志物和疾病机制 烟雾病患者的外周血单个核细胞 数字病理学 脑血管疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 6名烟雾病患者和3名对照 NA 单细胞RNA-seq NA NA
113 2026-02-07
Lactylation-related gene signature as a prognostic biomarker for neuroblastoma: insights into tumor progression and immune modulation
2026-Feb-05, Cell & bioscience
研究论文 本研究通过构建一个基于乳酸化相关基因的七基因预后模型,揭示了乳酸化在神经母细胞瘤进展和免疫调节中的关键作用,并识别出KLHL32作为潜在的治疗靶点 首次在神经母细胞瘤中系统研究乳酸化修饰的预后价值,构建了首个基于乳酸化相关基因的预后模型,并发现KLHL32通过调节PI3K/AKT通路和乳酸产生影响肿瘤免疫微环境 研究主要基于生物信息学分析和体外功能实验,缺乏体内动物模型验证;样本量可能有限,需要更大规模的前瞻性研究进一步验证模型的临床适用性 探究乳酸化修饰在神经母细胞瘤进展和免疫调节中的作用,并开发预后预测工具 神经母细胞瘤组织样本、单细胞RNA测序数据、神经母细胞瘤细胞系 生物信息学 神经母细胞瘤 免疫组化分析、单细胞RNA测序、Cox回归分析、LASSO分析、AUCell算法 Cox回归模型、LASSO回归模型 基因表达数据、临床数据、单细胞测序数据 未明确具体样本数量,但使用了多个独立数据集进行验证 NA 单细胞RNA测序 NA NA
114 2026-02-07
Obesity- and tumor-derived signals drive cancer-associated state transitions in breast mesenchymal stromal/stem cells reprogrammed by IL1RA or JAK inhibition
2026-Feb-05, Experimental hematology & oncology IF:9.4Q1
研究论文 本研究揭示了肥胖和肿瘤信号如何通过IL1/JAK通路驱动乳腺癌间充质基质/干细胞的状态转变,并提出了靶向该通路以重编程肿瘤微环境的治疗策略 首次系统阐明了肥胖状态如何通过TGFβ和IL1/JAK信号通路分别诱导乳腺癌间充质基质/干细胞向myCAF和iCAF表型转变,并发现IL1受体阻断或JAK抑制可逆转这些促癌表型 研究主要基于体外实验和单细胞RNA-seq数据分析,缺乏体内模型验证;样本来源限于乳腺癌患者,未涵盖其他癌症类型 探究肥胖和肿瘤微环境信号对乳腺癌间充质基质/干细胞表型可塑性的调控机制及潜在治疗靶点 乳腺癌患者的肿瘤邻近和肿瘤远处脂肪组织来源的间充质基质/干细胞 肿瘤微环境研究 乳腺癌 单细胞RNA测序、细胞表型分析、信号通路抑制实验 NA 单细胞RNA-seq数据、细胞功能实验数据 来自乳腺癌患者(伴或不伴肥胖)的原代bASC样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
115 2026-02-07
transFusion: a Novel Comprehensive Platform for integration Analysis of Single-Cell and Spatial Transcriptomics
2026-Feb-05, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文介绍了transFusion,一个用于整合分析单细胞RNA测序和10X Visium空间转录组数据的新型网络平台 开发了首个专注于全面整合scRNA-seq和10X Visium数据的网络平台,提供12项关键功能,包括细胞间依赖性分析、配体-受体共表达识别和空间多模态梯度变异模式分析 平台主要针对10X Visium数据,可能不适用于其他空间转录组技术;且需要用户具备一定的计算和统计知识,尽管设计上力求简化 解决空间转录组数据整合分析中的挑战,特别是针对10X Visium数据的低分辨率和多模态数据集复杂性 单细胞RNA测序数据和10X Visium空间转录组数据 数字病理学 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 基因表达数据,空间数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA-seq,空间转录组学 10x Visium 10X Genomics Visium空间转录组技术
116 2026-02-07
Crohn's lymphoid aggregates with endothelial clusters colocalise with submucosal fibrosis in fibrostenosing Crohn's disease
2026-Feb-05, The Journal of pathology IF:5.6Q1
研究论文 本研究通过分析克罗恩病纤维狭窄病变的切除样本,结合单细胞RNA测序,揭示了克罗恩淋巴聚集物与内皮细胞簇在黏膜下层纤维化中的共定位及其潜在的细胞间信号相互作用 首次在克罗恩病纤维狭窄病变中系统量化了各肠层的病理变化,并利用单细胞RNA测序验证了内皮细胞、淋巴细胞、巨噬细胞和肌成纤维细胞之间通过GAS、SELL、SELPLG等多条通路进行的配体-受体相互作用,明确了克罗恩淋巴聚集物与内皮细胞簇在黏膜下层纤维化中的共定位关系 研究基于手术切除样本,可能无法完全反映疾病早期或活动期的动态过程;样本量未明确说明;功能验证实验有待进一步开展 探究克罗恩病纤维狭窄病变的局部病理特征、细胞组成及细胞间相互作用,以识别潜在的可靶向通路 克罗恩病纤维狭窄病变患者的回肠切除样本 数字病理学 克罗恩病 单细胞RNA测序 NA 组织样本、单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
117 2026-02-07
ACSL1-Dependent Microglial Lipoimmunometabolic Reprogramming Underlies Cognitive Deficits in Alcohol Use Disorder
2026-Feb-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究揭示了酒精使用障碍(AUD)中认知缺陷的核心机制,即ACSL1介导的小胶质细胞脂质免疫代谢重编程,并提出了一种新型靶向治疗策略 通过单细胞RNA测序数据重分析,首次将ACSL1确定为AUD中微胶质细胞脂质代谢异常和神经炎症激活的核心调控因子,并开发了针对微胶质细胞特异性ACSL1沉默的双靶向脂质纳米颗粒系统 研究主要基于动物和细胞模型,在AUD患者中的直接验证有限;ACSL1抑制的长期安全性和疗效需进一步评估 探究酒精使用障碍导致认知缺陷的细胞和分子机制,特别是微胶质细胞的作用 酒精使用障碍患者、动物模型(小鼠)、细胞模型(微胶质细胞) 神经科学 酒精使用障碍 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
118 2026-02-07
Single-cell transcriptomics of X-ray irradiated Drosophila wing discs reveals heterogeneity related to cell-cycle status and cell location
2026-Feb-04, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术分析X射线辐射对果蝇翅盘组织的影响,揭示了细胞周期状态和细胞位置相关的异质性 采用单细胞转录组学结合赫芬达尔-赫希曼指数量化基因表达异质性,并识别出辐射响应中区域性和细胞周期依赖的亚群 研究仅针对果蝇翅盘这一相对简单的上皮组织,可能无法完全代表更复杂组织或哺乳动物系统的辐射响应 探究X射线辐射下组织细胞响应的异质性机制 果蝇翅盘组织中的细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确指定样本数量,但涉及辐射和未辐射的果蝇翅盘细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
119 2026-02-07
Molecular architecture of human dermal sleeping nociceptors
2026-Feb-04, Cell IF:45.5Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组学、电生理学表征和空间转录组学数据,揭示了人类皮肤中休眠伤害感受器的分子标记物 首次结合Patch-seq方法,在猪感觉神经元中功能性地识别了CMis,并发现了OSMR和SST作为其标记基因,为神经性疼痛的靶向治疗提供了新框架 研究主要基于猪模型和人类志愿者注射实验,样本规模有限,且需进一步验证在人类患者中的直接应用 探索人类皮肤中休眠伤害感受器的分子结构,以寻找神经性疼痛的靶向治疗策略 人类皮肤休眠伤害感受器(CMis)、猪感觉神经元、健康人类志愿者 神经科学 神经性疼痛 单细胞转录组学、电生理学表征(膜片钳)、空间转录组学、跨物种转录组数据整合 NA 转录组数据、电生理数据 涉及猪感觉神经元和健康人类志愿者,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学 NA NA
120 2026-02-07
Heterogeneous responses of IM19 anti-CD19 CAR T-cell therapy in refractory systemic lupus erythematosus: an open-label pilot study and a mini-review
2026-Feb-04, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1
研究论文 本研究评估了IM19抗CD19 CAR T细胞疗法在难治性系统性红斑狼疮(SLE)患者中的疗效和安全性,特别关注狼疮性肾炎(LN) 首次在难治性SLE患者中评估IM19 CAR T细胞疗法的临床效果,并结合单细胞RNA测序分析B细胞重建情况 研究为单臂开放标签试验,样本量较小(仅6例患者),且缺乏长期随访数据 评估CAR T细胞疗法在难治性SLE及LN中的疗效和安全性 难治性系统性红斑狼疮伴肾脏受累的患者 NA 系统性红斑狼疮 单细胞RNA测序 NA 临床数据、单细胞RNA测序数据 6例患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部