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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-09-23 |
A dish-to-biobank framework links β-cell nutrient-stress programs to genetic and dietary risk for Type 2 Diabetes
2026-Jun-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.12.731989
PMID:42367913
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研究论文 | 该研究建立了一个从培养皿到生物样本库的框架,通过血浆蛋白质组将受控的β细胞扰动与群体规模的疾病遗传学联系起来,并应用于2型糖尿病研究 | 开发了从培养皿到生物样本库的框架,将受控的β细胞扰动通过循环血浆蛋白质组与群体规模疾病遗传学联系起来;发现糖脂毒性上调基因独特地富集了2型糖尿病遗传力、单基因糖尿病基因和罕见变异负荷信号;定义了个体可遗传的应激特征 | 研究主要基于英国生物样本库的欧洲白人参与者,可能限制结论在其他种族群体中的推广性 | 探究遗传易感性和慢性代谢应激是否在人群中汇聚于共享的分子程序,建立受控细胞扰动与人群疾病遗传学之间的联系框架 | 人类干细胞来源的胰岛、SC-β细胞、英国生物样本库参与者 | 机器学习 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序、CRISPR敲除、血浆蛋白质组学 | NA | 图像、文本 | 45,956名英国生物样本库白人英国参与者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 102 | 2026-09-23 |
An intraocular oxygenated emulsion suppresses retinal fibrosis by inhibiting hypoxia-driven bioenergetic shifts and mesenchymal transformation
2026-Jun-12, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9888803/v1
PMID:42326539
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和开放性眼球损伤模型,揭示了缺氧是视网膜纤维化的关键驱动因素,并证明玻璃体内注射过饱和氧乳剂可抑制缺氧驱动的生物能量转变和间充质转化,从而减轻视网膜纤维化 | 首次通过单细胞RNA测序揭示人PVR膜中主要细胞群体缺氧响应程序的汇聚激活;利用分子探针在开放性眼球损伤模型中直接验证了空间和时间上的缺氧;提出玻璃体内局部氧合(过饱和氧乳剂)作为预防纤维化视力丧失的可行治疗策略 | 摘要中未明确提及研究的具体局限性 | 探索缺氧在视网膜纤维化中的作用机制,并评估局部眼内氧合作为预防纤维化视力丧失治疗策略的可行性 | 人PVR膜、开放性眼球损伤模型、人视网膜色素上皮细胞、原代人PVR细胞培养物 | 数字病理学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 103 | 2026-09-23 |
Adiposity-Associated Monocyte Costimulatory Programming in Rheumatoid Arthritis Identified by Single-Cell Transcriptomics
2026-Jun-12, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.06.09.26355275
PMID:42326774
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研究论文 | 该研究利用单细胞转录组学分析了类风湿关节炎患者及非RA对照者的循环单核细胞,发现肥胖与RA中单核细胞T细胞共刺激通路的富集增强相关 | 首次在供体水平上证明肥胖特异性增强RA患者单核细胞的T细胞共刺激编程,而非单纯由RA状态引起 | 样本量较小(31名供体),仅分析循环单核细胞,未涉及关节组织,且为横断面研究无法确定因果关系 | 探究肥胖是否增强RA中单核细胞的共刺激编程从而促进适应性免疫激活 | 31名供体的纯化循环单核细胞,包括16名符合2010 ACR/EULAR分类标准的RA患者和15名非RA对照 | 数字病理学、机器学习 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本、图像 | 31名供体(16名RA患者和15名非RA对照),约135,599个单核细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Genomics Flex | 10x Genomics Flex平台用于纯化循环单核细胞的单细胞RNA测序 |
| 104 | 2026-09-23 |
Genome-wide association and multi-omics functional screens reveal the genetic architecture of foveal development
2026-Jun-12, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.06.11.26355452
PMID:42326794
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研究论文 | 通过全基因组关联研究、多组学功能筛选和斑马鱼模型,揭示了中央凹发育的遗传结构。 | 首次对中央凹发育不全进行全基因组关联研究,结合多组学功能筛选和斑马鱼模型,建立了首个脊椎动物疾病模型,并整合人类胎儿单细胞和空间转录组学。 | 未明确提及 | 揭示中央凹发育的遗传结构,并建立可操作的中央凹疾病模型。 | 中央凹发育不全患者、斑马鱼、人类胎儿组织 | 机器学习 | 眼科疾病 | 全基因组关联研究, 多组学功能筛选, CRISPR敲除, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 图像数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 105 | 2026-09-23 |
MipSScs: Artificial neural network-based data integration of 2D/3D single-cell spatial RNA sequence data from virus-infected human cerebral organoids
2026-Jun-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.08.727881
PMID:42327098
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研究论文 | 该文章利用人工神经网络(多层感知机)整合2D和3D单细胞空间RNA测序数据,研究病毒感染的人脑类器官,以推断阿尔茨海默病相关的转录组效应 | 首次使用多层感知机(MLP)进行2D/3D单细胞空间转录组数据的跨平台整合,并以交叉2D/3D平台比较作为基准评估人工神经网络模型,成功将脑类器官细胞类型映射到成人死后脑细胞类型 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 利用人工神经网络进行2D/3D单细胞空间RNA测序数据的整合,以推断与阿尔茨海默病相关的病毒感染引起的转录组效应 | HSV-1感染的2D解离人脑类器官细胞(dcOrgs)和HSV-1感染的3D人脑类器官(cOrgs),以及人胎儿脑和成人死后脑的单细胞非空间RNA测序数据 | 数字病理学, 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞非空间RNA测序, 单细胞空间RNA测序 | 多层感知机(MLP) | RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 106 | 2026-09-23 |
Single-cell transcriptomics reveals differences between chorionic and basal plate cytotrophoblasts and 2D-cultured trophoblast stem cells
2026-Jun-10, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10460-0
PMID:42270938
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组测序和空间转录组技术,揭示了早孕期胎盘不同区域细胞滋养层细胞(CTB)的转录异质性,并将绒毛膜板与基底板CTB及2D培养的滋养层干细胞(TSC)进行了比较 | 首次发现早孕期胎盘基底板和绒毛膜板的CTB存在转录差异,基底板CTB富集具有EVT倾向的祖细胞,而绒毛膜板CTB具有STB前体特征;揭示了TSC在体外培养过程中丢失体内'初始状态'标记(如PAGE4),并证明TSC最接近ITGA5阳性近端柱EVT前体细胞 | 研究仅基于转录组数据,缺乏蛋白水平和功能验证;TSC细胞系数量有限(3株用于scRNA-seq,6株用于流式验证);未明确ITGA5阴性CTB的分子特征 | 探究早孕期胎盘不同区域(基底板与绒毛膜板)CTB的转录多样性,并鉴定TSC的细胞来源及其与体内CTB的对应关系 | 早孕期(6-8周和12-14周)胎盘绒毛组织、基底板和绒毛膜板CTB、以及体外培养的滋养层干细胞(TSC) | 单细胞转录组学 | NA | scRNA-seq, 空间转录组 | NA | 转录组数据、图像 | 早期(6-8周)和晚期(12-14周)早孕期胎盘绒毛组织,3株TSC细胞系用于scRNA-seq,6株TSC细胞系用于流式验证 | 10x Genomics, NanoString | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | 10x Chromium, GeoMx | 10x Chromium Single Cell 3', GeoMx Digital Spatial Profiler |
| 107 | 2026-09-23 |
Perturbation of genes linked to common schizophrenia risk variants identifies cilia programs
2026-Jun-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.09.731172
PMID:42327190
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研究论文 | 该研究在小鼠新皮质中利用CRISPR droplet测序(CROP-seq)扰动12个与精神分裂症风险变异相关的基因,并结合单细胞RNA测序,发现纤毛转录程序是汇聚的下游机制 | 首次对精神分裂症常见变异架构的功能后果进行表征,并揭示纤毛功能障碍是汇聚的下游机制 | 研究基于小鼠模型,可能无法完全反映人类精神分裂症的复杂性;仅扰动了12个风险基因 | 探究精神分裂症风险变异通过哪些靶基因、生物学通路和细胞类型发挥作用 | 出生后小鼠新皮质 | 机器学习 | 精神分裂症 | CROP-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 12个精神分裂症风险基因的扰动实验 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 108 | 2026-09-23 |
Wnt/β-catenin signaling regulates fibrotic atrophy of intra-articular adipose tissue in post-traumatic osteoarthritis
2026-Jun-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.08.730865
PMID:42327266
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研究论文 | 该研究利用二维组织形态计量学、空间转录组学和三维锇酸增强微计算机断层扫描技术,全面分析了创伤后骨关节炎小鼠模型中关节内脂肪组织的时空、结构和转录重塑,揭示了Wnt/β-catenin信号通路和异常机械负荷在驱动关节内脂肪组织纤维化萎缩中的关键作用 | 首次综合运用空间转录组学和三维成像技术系统描绘了创伤后骨关节炎中关节内脂肪组织的动态重塑过程;发现了关节脂肪组织具有区别于皮下白色脂肪组织的独特转录特征;证明了Wnt/β-catenin信号通路的慢性激活足以独立于关节损伤而驱动脂肪组织向纤维化表型转变 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类骨关节炎样本中验证;Wnt/β-catenin信号通路与其他信号通路的交互作用尚未完全阐明;三维成像和空间转录组学的样本量可能有限 | 全面定义创伤后骨关节炎中关节内脂肪组织的时空、结构和转录重塑,并阐明驱动关节脂肪纤维化萎缩的分子机制 | 创伤后骨关节炎小鼠模型中的关节内脂肪组织、滑膜关节脂肪垫及关节来源的基质细胞 | 空间转录组学, 数字病理学 | 骨关节炎 | 空间转录组学, 二维组织形态计量学, 三维锇酸增强微计算机断层扫描 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 109 | 2026-09-23 |
Deep learning based individualized cross-platform molecular subtype classification of B-lineage acute lymphoblastic leukemia
2026-Jun-10, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01556-1
PMID:42265190
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研究论文 | 该研究开发了一个名为BALL6的深度学习框架,用于跨平台的B细胞急性淋巴细胞白血病(B-ALL)分子亚型分类 | BALL6采用基于秩变换的特征基因表达值训练循环神经网络,并引入基于秩的数据增强框架,能够处理数据有限或不平衡的数据集,同时对缺失值具有鲁棒性,实现跨平台应用 | 未明确提及 | 开发一个准确、稳健且跨平台的B-ALL分子亚型分类方法,以应对快速涌现的亚型和复杂多组学诊断在敏感性、成本和周转时间方面的挑战 | B细胞急性淋巴细胞白血病(B-ALL)患者样本 | 机器学习 | 白血病 | NA | 循环神经网络(RNN) | 基因表达数据 | 多个独立数据集(具体数量未提供) | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | 基于基因表达谱,包括scRNA-seq数据的稀疏基因表达谱 |
| 110 | 2026-09-23 |
P-STAT3-dependent SPP1 transcription in cholangiocytes drives hepatic stellate cells activation in congenital hepatic fibrosis
2026-Jun-09, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10476-6
PMID:42265280
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9小鼠模型和共培养实验,揭示了先天性肝纤维化中胆管细胞通过p-STAT3依赖的SPP1转录激活肝星状细胞的机制 | 首次发现PKHD1缺陷导致胆管细胞中SPP1上调,并通过SPP1-整合素α8β1轴介导胆管细胞与肝星状细胞间的通讯;证实p-STAT3是SPP1的直接转录激活因子;通过AAV8介导的胆管细胞特异性Spp1敲低可减轻肝纤维化 | 仅基于一例CHF患者的单细胞RNA测序数据,样本量有限;未在更多患者样本中验证SPP1-整合素α8β1轴的普遍性;AAV8靶向治疗在人类中的安全性和有效性尚需进一步研究 | 探究先天性肝纤维化中胆管细胞与肝星状细胞相互作用的分子机制,并寻找潜在治疗靶点 | 先天性肝纤维化患者样本和Pkhd1基因敲除小鼠模型 | 单细胞组学 | 先天性肝纤维化 | 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9基因编辑, 共培养实验, AAV8介导基因敲低 | Pkhd1敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 图像数据, 文本数据 | 1例先天性肝纤维化患者和Pkhd1敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 111 | 2026-09-23 |
Optineurin restrains IL-17-associated neuroinflammation in trigeminal ganglia to preserve sensory function after ocular HSV-1 infection
2026-Jun-07, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkag161
PMID:42400459
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研究论文 | 利用小鼠眼部HSV-1感染模型,发现OPTN通过抑制三叉神经节中IL-17相关神经炎症来保护感觉功能 | 首次将OPTN鉴定为神经免疫检查点,通过单细胞RNA测序揭示OPTN缺失导致三叉神经节中趋化因子/NF-κB和Th17/IL-17信号通路富集,并证明OPTN缺陷可作为HSV相关神经营养性角膜炎的可操作实验模型 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类临床样本中验证OPTN与神经营养性角膜炎的关联 | 探究宿主程序如何决定HSV-1感染后三叉神经节是恢复还是退化,以及建立忠实再现NK样神经免疫病理的实验模型 | 小鼠眼部HSV-1感染模型中的三叉神经节、角膜和引流淋巴结 | 数字病理学 | 神经营养性角膜炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 基于液滴的单细胞RNA测序 |
| 112 | 2026-09-23 |
A transient epithelial plasticity state defines the developmental window for uterine gland specification
2026-Jun-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.03.729801
PMID:42282591
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研究论文 | 本文通过整合单细胞和空间转录组学与类器官培养、谱系追踪及遗传和激素扰动模型,定义了出生后子宫上皮分化的调控机制 | 识别了一个发育受限的上皮可塑性状态,该状态先于管腔和腺体细胞谱系分离,并伴随子宫分化过程中基质-上皮通讯的动态重组 | NA | 理解子宫腺体发育和功能,特别是调控腺体命运规范的上皮细胞状态和信号相互作用 | 出生后子宫上皮细胞 | 单细胞和空间转录组学 | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 类器官培养, 谱系追踪 | NA | 转录组数据, 空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 113 | 2026-09-23 |
Galectin and Myc enable cochlear progenitor expansion in vitro and in vivo
2026-Jun-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.03.729765
PMID:42282633
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组学分析小鼠耳蜗大上皮嵴细胞来源的类器官,发现半乳糖凝集素-1和Myc是类器官生长的必要且充分条件,并能在体内外促进耳蜗祖细胞扩增。 | 首次揭示半乳糖凝集素-1和Myc在耳蜗祖细胞扩增中的关键作用,并证明Myc过表达可延长再生能力的时间窗口。 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类耳蜗细胞中验证,且长期安全性和调控机制需进一步研究。 | 探究耳蜗大上皮嵴细胞再生能力的分子机制,并寻找促进耳蜗祖细胞扩增的方法。 | 小鼠耳蜗大上皮嵴细胞及耳蜗上皮细胞。 | 单细胞转录组学 | 听力损失 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 114 | 2026-09-23 |
Autoantibodies Drive Fcγ Receptor-Dependent Colon Inflammation During Immune Checkpoint Blockade
2026-Jun-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.03.729692
PMID:42282671
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研究论文 | 该研究揭示内源性自身抗体通过Fcγ受体依赖途径促进免疫检查点抑制剂相关结肠炎 | 首次证明内源性自身抗体可通过Fcγ受体依赖途径促进ICI相关结肠炎,并利用人源化FcγR小鼠模型和单细胞RNA测序揭示了IgG调控的炎症网络 | 研究主要基于小鼠模型和体外血清分析,人类临床验证仍需进一步开展 | 探究免疫检查点抑制剂治疗中自身抗体驱动结肠炎的机制 | 接受派姆单抗、纳武单抗或伊匹单抗治疗的黑色素瘤患者的IgG以及野生型和人源化FcγR小鼠 | 免疫学 | 黑色素瘤、结肠炎 | 单细胞RNA测序、自身抗体谱分析 | 人源化FcγR小鼠模型 | 序列数据、血清抗体谱数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 115 | 2026-09-23 |
Atlas-Level Single-Cell and Spatial Transcriptomics Data Integration via PRIME
2026-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.20.726698
PMID:42239079
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研究论文 | 该论文提出了PRIME(基于流形嵌入的投影鲁棒集成)框架,通过随机投影共识锚定、图拉普拉斯校正和可选的空域邻域正则化,实现图谱级单细胞RNA测序和空间转录组学数据的整合 | 1. 提出集成整合框架PRIME,结合随机投影共识锚定和图拉普拉斯校正,通过共识投票保留重复匹配的细胞对,减少投影特异性扭曲导致的假锚点;2. 原生支持空间转录组数据,将表达锚定图与坐标衍生的空间邻域图耦合在统一图拉普拉斯目标中,具有闭式解;3. 能够同时处理跨批次对齐和局部空间一致性;4. 在大规模数据(超过100万个细胞)上保持计算可处理性 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 解决图谱级单细胞和空间转录组数据整合中面临的异质性和层次嵌套批次效应问题,同时保留微妙的生物学变异,并在数百万细胞规模上保持计算可行性 | 单细胞RNA测序数据和空间转录组学数据,包括人类造血基准数据集(8个供体约33,000个细胞)、背外侧前额叶皮层切片ST数据集、以及超过100万个细胞的扰动图谱 | 计算生物学、生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学(ST) | 基于流形嵌入的集成整合框架(PRIME)、图拉普拉斯方法、随机投影 | 基因表达数据、空间坐标数据 | 人类造血基准数据集包含8个供体约33,000个细胞;扰动图谱包含超过100万个细胞;背外侧前额叶皮层ST数据集 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 116 | 2026-09-23 |
Transcriptomic characters of cochlear vascular cells with pericyte-driven angiogenetic activity
2026-06-04, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-026-10060-w
PMID:42240743
|
研究论文 | 该研究利用单细胞RNA测序技术,解析了成年小鼠耳蜗内皮细胞和周细胞的转录组特征,揭示了其高血管生成潜能及周细胞驱动的血管新生机制 | 首次定义了耳蜗血管系统的分子特征,发现了两种周细胞亚类(Type 1和Type 2),并首次证明周细胞在出芽过程中表现出尖端相关表型可塑性,可见NG2/PECAM-1在出芽前沿的重叠表达 | 研究基于小鼠模型,尚未在人类耳蜗中验证;周细胞尖端相关状态的来源(现有细胞或血管龛内祖细胞)尚未完全明确 | 探索耳蜗血管系统的遗传和分子特征,特别是内皮细胞和周细胞的转录组特征及其在血管生成中的角色,以寻找促进血管再生的靶点 | 成年小鼠耳蜗中的内皮细胞和周细胞 | 单细胞转录组学 | 听力障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 成年小鼠耳蜗血管细胞(内皮细胞和周细胞),具体数量未在摘要中说明 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 117 | 2026-09-23 |
Spatial Gene Set Enrichment Analysis with Applications to Spatially Resolved Transcriptomic Data
2026-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.01.729158
PMID:42282725
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研究论文 | 本文提出了一种名为spaGSE的贝叶斯层次模型,用于空间基因集富集分析,通过整合空间表达分析的基因级统计量和预定义基因集注释来识别空间组织的通路。 | 首次将空间依赖性纳入基因集富集分析,采用贝叶斯层次模型结合高斯混合框架和逻辑回归,并引入spike-and-slab先验进行稳健推断。 | 未明确说明模型对基因集大小、空间分辨率或不同组织类型的敏感性,且仅基于四个公共数据集进行验证。 | 解决现有基因集富集分析方法忽略空间依赖性、降低检测空间组织通路的能力和可解释性的问题。 | 空间分辨转录组数据中的基因集和通路。 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学 | 贝叶斯层次模型 | 空间基因表达数据 | 四个公共空间分辨转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 118 | 2026-09-23 |
The HuBMAP Framework for Advancing Data FAIRness
2026-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.01.728946
PMID:42282748
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研究论文 | 本文介绍了HuBMAP联盟为实现数据FAIR化而开发的元数据报告标准及其端到端工作流程,涵盖超过10,000个数据集和50多种检测类型 | 提出了跨多种检测类型统一的元数据报告标准和模式,结合技术手段确保合规性,并在HIPAA合规前提下实现数据的可查找、可访问、可互操作和可重用 | 摘要中未明确提及该框架的具体局限性 | 在科学研究工作流程中实现FAIR指导原则,建立标准化的元数据报告体系以最大化多样化数据集的价值 | 来自40多个机构的超过10,000个数据集,涵盖50多种检测类型,包括单细胞测序技术和2D/3D空间组学 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序,2D和3D空间组学 | NA | 图像,文本 | 超过10,000个数据集,来自40多个机构,涵盖50多种检测类型 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 119 | 2026-09-23 |
Scalable in vivo cardiac functional genomics with compressed AAV-Perturb-seq reveals a common mitochondrial response to perturbation
2026-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.01.729445
PMID:42282780
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研究论文 | 该研究结合AAV递送的体内Perturb-seq与压缩感知统计框架,开发了压缩AAV-Perturb-seq方法,用于在目标器官中进行高通量、细胞自主的功能基因组学筛选,并应用于研究585个基因敲除对心肌细胞转录组的影响 | 首次将压缩感知Perturb-seq与AAV递送结合,实现体内目标器官的高通量功能基因组学筛选;发现线粒体转录组改变是遗传扰动的常见响应,并在不同物种和扰动模式中独立验证;尽管观察到频繁的组合效应,但协同扰动极少 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 开发一种可扩展的体内功能基因组学平台,直接在目标器官中建立基因型与表型的联系,以促进人类疾病治疗靶点的发现 | 心肌细胞 | 功能基因组学 | 心血管疾病 | Perturb-seq, 单细胞RNA测序, CRISPR筛选 | NA | 文本 | 585个基因敲除 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 120 | 2026-09-23 |
BTK inhibition enhances immunovirotherapy in glioblastoma via tertiary lymphoid structure modulation
2026-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.01.729275
PMID:42282778
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研究论文 | 本研究发现BTK在GBM浸润髓系细胞中高表达,oHSV治疗会激活髓系细胞中的BTK从而限制病毒复制,联合BTK抑制剂ibrutinib可增强oHSV抗肿瘤疗效并促进三级淋巴结构形成 | 首次揭示BTK抑制可通过调控肿瘤浸润髓系细胞增强oHSV溶瘤病毒治疗的抗肿瘤效果,并发现BTK抑制联合IDO抑制可促进肿瘤浸润三级淋巴结构(TLS)的形成,从而重塑T细胞、NKT细胞和单核-巨噬细胞群体 | 研究主要基于GBM12异种移植和GSC005同源小鼠模型,尚未在临床试验中验证;TLS形成的具体分子机制尚需进一步阐明 | 探究BTK抑制增强oHSV溶瘤病毒治疗胶质母细胞瘤疗效的机制,特别是通过调控三级淋巴结构来改善免疫抑制性肿瘤微环境 | 胶质母细胞瘤(GBM),包括人GBM12异种移植模型和同源小鼠GSC005模型 | digital pathology | lung cancer | scRNA-seq | NA | text | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |