本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-08-31 |
Evolution of artificial intelligence in breast cancer pathology: a bibliometric analysis
2026-Jun-18, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05388-0
PMID:42313316
|
研究论文 | 对乳腺癌病理学中人工智能应用的文献进行文献计量学分析,以描绘研究格局、识别关键趋势并突出新兴方向 | 结合文献计量学工具(VOSviewer、CiteSpace)与BERTopic主题建模,识别出14个研究主题,并揭示从单一模态图像分析向多模态“病理组学”和跨学科领域的转变 | 仅依赖Web of Science数据库,可能遗漏其他来源的文献;文献计量分析本身受限于已发表文献的质量和覆盖范围 | 对乳腺癌病理学中人工智能的文献进行计量学分析,以绘制研究格局、识别趋势并指出未来方向 | 2011年至2025年间Web of Science数据库中关于乳腺癌病理学人工智能的1089篇相关出版物 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 文献计量分析、主题建模 | BERTopic | 文本(文献摘要和元数据) | 1089篇出版物 | NA | NA | NA | NA |
| 102 | 2026-08-31 |
A causal reinforcement learning framework for reliable gene regulatory network inference
2026-Jun-18, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-026-06511-2
PMID:42316003
|
研究论文 | 提出了一种基于因果强化学习的基因调控网络推断方法,以提高推断准确性、结构稀疏性和生物学合理性 | 将因果推断与强化学习相结合,实现大规模基因调控网络的全局优化,增强结构可解释性和因果合理性 | 未明确提及局限性,可能涉及对超参数敏感或计算资源需求较高 | 开发一种能准确识别基因间因果关系且结构可解释的基因调控网络推断方法,适用于大规模基因表达数据 | 基因调控网络,基于DREAM5数据集和BEELINE的六种细胞类型的单细胞RNA测序数据 | 机器学习和系统生物学 | NA | 因果强化学习 | 强化学习模型(未指定具体如DQN、PPO等,故为通用强化学习) | 基因表达数据(单细胞RNA测序数据和微阵列数据) | DREAM5数据集和六种细胞类型的scRNA-seq数据集(具体样本数未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 103 | 2026-08-31 |
Pan-cancer and single-cell analysis identifies MAGI2-AS3 as an immune regulator and prognostic biomarker with a focus on colorectal cancer
2026-Jun-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05447-6
PMID:42310233
|
研究论文 | 通过泛癌和单细胞分析,识别MAGI2-AS3作为免疫调节因子和预后生物标志物,重点关注其在结直肠癌中的作用 | 首次在泛癌水平结合单细胞RNA-seq数据,揭示MAGI2-AS3在结直肠癌中的基质和髓系细胞富集模式,并发现其高表达与免疫抑制微环境和免疫检查点阻断疗效降低相关,具有诊断和预后双重价值 | MAGI2-AS3的机制研究仍需进一步实验验证,且泛癌分析中样本异质性可能影响结论的普适性 | 评估MAGI2-AS3在多种癌症中的表达模式和临床意义,并深入探讨其在结直肠癌中的免疫调节和预后作用 | 多种癌症组织样本及结直肠癌配对组织,包括10对CRC组织用于RT-qPCR验证 | 生物信息学、癌症基因组学 | 结直肠癌及其他多种癌症 | RNA-seq、单细胞RNA-seq、RT-qPCR | Cox回归模型、Kaplan-Meier生存分析 | 基因表达数据、临床数据、单细胞转录组数据 | TCGA和GTEx中的多种癌症样本,以及10对结直肠癌组织 | NA | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 104 | 2026-08-31 |
SP-printer: reconstruction of tumor stage-specific microenvironments via phenotype-integrated spatial transcriptomics
2026-06-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08425-2
PMID:42310765
|
研究论文 | 提出SP-printer方法,整合表型与空间数据,重建肿瘤阶段特异性微环境 | 首次将表型指数(如恶性状态)整合到空间转录组分析中,通过S-score策略和增强映射,实现像素级阶段特异性恶性水平量化 | 未明确提及局限性 | 开发统一框架,提高肿瘤微环境分析的精度,支持临床决策 | 肿瘤组织样本,包括原发性肝癌和肝转移 | 空间转录组学 | 肝癌 | 空间转录组测序、批量RNA测序 | S-score策略、信息增强映射 | 空间转录组数据、批量RNA测序数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 空间转录组学、批量RNA测序 | NA | NA |
| 105 | 2026-08-31 |
Construction of a diagnostic model for nasopharyngeal carcinoma using a consensus machine learning approach and study of immune infiltration characteristics
2026-Jun-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05443-w
PMID:42303913
|
研究论文 | 本研究利用共识机器学习方法构建了鼻咽癌的诊断模型,并探讨了免疫浸润特征。 | 结合单细胞RNA测序、批量RNA测序和WGCNA分析,采用四种机器学习算法筛选核心基因,开发了高精度的四基因诊断模型,并构建了交互式网页应用。 | 未提及。 | 构建可靠的鼻咽癌诊断生物标志物模型,并研究其免疫浸润特征。 | 鼻咽癌组织和对照组织的单细胞及批量转录组数据。 | 机器学习 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 机器学习算法(LASSO, SVM-RFE, Boruta, XGBoost) | 基因表达数据 | 67,535个细胞(来自鼻咽癌和对照组织) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 106 | 2026-08-31 |
CXCL9/SPP1-polarized tumor-associated macrophages exert dual roles in regulating anti-tumor immunity in lung adenocarcinoma
2026-Jun-16, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-026-04456-2
PMID:42301510
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验,揭示了CXCL9/SPP1极性在肺腺癌肿瘤相关巨噬细胞中的双重作用及其调控机制,为免疫治疗提供新靶点 | 首次阐明CS极性(CXCL9/SPP1互斥表达)通过p38/MAPK-MEF2C-HPGDS轴调控TAM极化及其抗肿瘤功能,并直接验证了MEF2C对HPGDS启动子的转录调控 | 研究主要基于体外细胞模型和裸鼠皮下移植瘤模型,可能无法完全模拟人类肺腺癌微环境的复杂性;临床样本验证有限 | 定义CXCL9/SPP1极性的分子基础及其在肺腺癌进展中的作用,为基于巨噬细胞重编程的免疫治疗提供理论依据 | 肺腺癌细胞系(THP-1细胞和LUAD细胞)和肺腺癌组织样本,以及裸鼠皮下移植瘤模型 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | 无特定模型 | 基因表达数据 | 未提供具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 107 | 2026-08-31 |
Identification of TBXAS1 as a candidate biomarker and potential microglia-associated inflammatory regulator in Parkinson's disease
2026-Jun-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-55954-3
PMID:42288542
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和批量转录组数据,识别帕金森病中与炎症相关的基因TBXAS1,并验证其作为生物标志物和微胶质细胞相关炎症调节因子的潜力 | 首次将scRNA-seq与批量转录组数据及WGCNA结合,识别出TBXAS1作为帕金森病的新候选生物标志物,并揭示其通过调节微胶质细胞促炎因子分泌影响神经元增殖和凋亡的机制 | 研究主要基于数据分析和体外实验,缺乏体内验证,且样本量可能有限,需进一步临床验证 | 识别帕金森病中与炎症相关的生物标志物,并探讨其潜在机制,以促进早期检测和治疗策略开发 | 帕金森病患者的外周血样本和微胶质细胞 | 机器学习 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序、批量转录组测序、WGCNA、逻辑回归、LASSO | 逻辑回归、LASSO | 基因表达数据、图像(细胞实验) | NA | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 108 | 2026-08-31 |
SPP1-positive myeloid cell subpopulations associated with resistance to PD-1/L1 immunotherapy in lung adenocarcinoma
2026-Jun-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-57503-4
PMID:42288622
|
研究论文 | 本研究识别了与肺腺癌PD-1/PD-L1免疫治疗耐药相关的SPP1阳性髓系细胞亚群 | 首次通过单细胞RNA测序和空间转录组学结合临床数据,精确定位SPP1+髓系细胞亚群与肺腺癌免疫治疗耐药相关,并验证其作为潜在生物标志物 | 样本量较小,仅6例新鲜肿瘤组织用于单细胞测序,且功能验证尚不充分,有待进一步实验探索 | 识别与肺腺癌免疫治疗耐药相关的关键细胞亚群,探索其作为预测生物标志物的潜能 | 肺腺癌患者肿瘤组织中的髓系细胞亚群,特别是SPP1阳性细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、免疫组织化学、免疫荧光 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、病理图像 | 197例患者临床数据(其中79例有响应,118例耐药),每组3例患者的新鲜肿瘤组织用于单细胞测序,每组1例用于空间转录组学 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞RNA测序,10x Visium空间转录组学 |
| 109 | 2026-08-31 |
System for study of diverse cellular composition in alveolar rhabdomyosarcoma
2026-Jun-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-57841-3
PMID:42288657
|
研究论文 | 利用基因工程小鼠模型和单细胞RNA测序,表征了腺泡状横纹肌肉瘤的肿瘤组成和细胞状态,并揭示了免疫微环境影响肿瘤细胞组成 | 首次使用基因工程小鼠模型结合单细胞RNA测序详细描述了ARMS中不同的恶性亚群及其转录程序,并通过异体移植和谱系报告基因证实了免疫环境对细胞组成的影响 | 未提及 | 研究腺泡状横纹肌肉瘤的细胞异质性及其微环境的影响 | 腺泡状横纹肌肉瘤小鼠模型中的肿瘤细胞和微环境细胞 | 数字病理学 | 横纹肌肉瘤 | 单细胞RNA测序 | 未提及 | 单细胞转录组数据 | 未提及具体样本数 | 未提及 | 单细胞RNA测序 | 未提及 | 未提及 |
| 110 | 2026-08-31 |
Identification and experimental validation of biomarkers associated with exercise in intervertebral disc degeneration through bulk RNA and single-cell RNA sequencing analysis
2026-Jun-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-57855-x
PMID:42288692
|
研究论文 | 通过批量RNA和单细胞RNA测序分析,识别并验证与运动相关的椎间盘退变生物标志物 | 结合多种生物信息学方法(差异表达分析、WGCNA、PPI网络、机器学习)和实验验证,首次识别出运动相关基因TNFAIP6和CHI3L1作为椎间盘退变的生物标志物 | 未提及具体局限性 | 识别和验证与运动相关的椎间盘退变生物标志物,为靶向治疗提供指导 | 椎间盘退变相关数据集和运动相关基因 | 生物信息学 | 椎间盘退变 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 反转录定量PCR | 机器学习 | 基因表达数据 | 未提及具体样本量 | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 111 | 2026-08-31 |
Cutting-edge advances in endocrine therapy for breast cancer (Review)
2026-Jun, Oncology letters
IF:2.5Q3
DOI:10.3892/ol.2026.15569
PMID:42003934
|
综述 | 本文综述了乳腺癌内分泌治疗的最新进展,包括新一代SERDs、ER拮抗剂/降解剂和SERMs,以及联合小分子抑制剂和前沿技术带来的精准化治疗前景 | 创新点在于概述了新一代SERDs、ER拮抗剂/降解剂和SERMs等新型药物,并强调单细胞测序和类器官模型在治疗监测和个性化治疗中的应用,以及人工智能和大数据驱动的精准医疗平台 | 限制可能包括未提供具体临床数据或实验结果,主要基于文献综述,且对新兴技术的讨论可能缺乏深度验证 | 旨在总结乳腺癌内分泌治疗的最新进展,探讨克服耐药性的联合策略和前沿技术,并展望未来精准化治疗方向 | 研究对象为ER阳性乳腺癌的内分泌治疗策略及相关技术和模型 | 自然语言处理 | 乳腺癌 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 112 | 2026-08-31 |
Praxis-BGM: clustering of omics data using semi-supervised transfer learning for Gaussian mixture models via natural-gradient variational inference
2026-Jun-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag395
PMID:42308558
|
研究论文 | 开发了一种名为Praxis-BGM的框架,利用自然梯度变分推断和高斯混合模型进行半监督迁移学习,以改善小样本组学数据的聚类分析。 | 提出了基于自然梯度变分推断的Praxis-BGM框架,实现半监督迁移学习,能够从大规模参考数据中估计先验高斯混合模型,并利用变分推断更新目标数据,以提高小样本条件下的聚类性能。 | 未明确提及局限性,但可推测其对先验数据的依赖性和部分不匹配时的稳健性问题。 | 解决高维组学数据在小样本情况下基于模型的聚类方法不稳定和泛化能力差的问题。 | 包含乳腺癌bulk转录组数据和单细胞转录组数据。 | 机器学习 | 乳腺癌 | 转录组测序 | 高斯混合模型 | 表达数据 | 未提供具体样本量 | NA | bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 113 | 2026-08-31 |
From Molecular Visualization to Spatial Landscapes: Engineering the Next Generation of In Situ Hybridization
2026-05-29, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17060616
PMID:42353773
|
综述 | 本文综述了原位杂交技术从低通量组织学染色方法发展为现代高灵敏、高特异、多重检测及图像型空间转录组学核心技术的演变过程 | 系统梳理了现代ISH方法的分子与工程原理,涵盖杂交链式反应、分支DNA扩增、SABER-FISH、滚环扩增法、seqFISH、MERFISH、RAEFISH及商业实现,并讨论其实际应用中的权衡与标准化努力 | 未全面综述基于测序的空间捕获平台,仅比较以阐明空间分辨率、转录组覆盖度、组织面积等权衡 | 阐述ISH技术从靶向分子可视化扩展到原位检测和空间分辨转录组分析的广泛方法学框架 | RNA分子在完整细胞和组织中的检测及空间分布 | 空间转录组学 | 癌症、神经科学、发育生物学等 | 原位杂交(ISH)、杂交链式反应、分支DNA扩增、滚环扩增、seqFISH、MERFISH、RAEFISH | NA | 图像 | NA | NA | 图像型空间转录组学 | NA | NA |
| 114 | 2026-08-31 |
Pan-cancer spatial atlas of tertiary lymphoid structures
2026-05-28, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adz2742
PMID:42207882
|
研究论文 | 构建了跨越12种癌症类型的三级淋巴结构(TLS)泛癌空间图谱,并表征了TLS的空间结构和成熟状态 | 首次构建泛癌TLS空间图谱,并利用超高多重单细胞空间分析揭示TLS成熟伴随的生态位细胞重编程和距离依赖性肿瘤程序梯度,同时开发了基于AI的框架直接从H&E染色图像预测TLS成熟状态,以及提出能更好分层患者的成熟感知复合评分 | 未明确说明 | 系统刻画肿瘤中三级淋巴结构的空间组织、成熟状态及其临床相关性 | 12种癌症类型的空间转录组数据及相应的H&E染色图像 | 数字病理学 | 泛癌(包括多种癌症类型) | 空间转录组学、超高多重单细胞空间分析、人工智能图像分析 | AI框架(具体未说明,可能基于CNN等) | 图像和转录组数据 | 12种癌症类型的样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 115 | 2026-08-31 |
PALINCODE: Recording cell lineage with ternary palindromic CRISPR bits
2026-Apr-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.16.718941
PMID:42039399
|
研究论文 | 介绍了一种利用三态回文CRISPR位点(cBits)进行细胞谱系记录的新系统PALINCODE,并通过模拟和实验验证了其在体外和体内的高效谱系重建能力 | 利用三态回文CRISPR位点,将每个位点的信息容量从传统的二态提升至三态,理论编码容量高达10^25位,显著提高了谱系记录的密度和深度 | 文章未明确提及局限性,但可能包括CRISPR编辑的随机性和潜在脱靶效应,以及编码容量在实际应用中的限制 | 开发并验证一种高密度的CRISPR-based细胞谱系记录系统,以实现更深的谱系重建(32个细胞分裂深度)和体内克隆演化分析 | 293T细胞系和体内黑色素瘤模型中的肿瘤克隆群体 | 基因组学 | 黑色素瘤 | CRISPR编辑、单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 未明确样本数量,涉及细胞系和体内肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 116 | 2026-08-31 |
Deciphering immune and cellular reprogramming during the progression from inflammatory bowel disease to colorectal cancer using multi-omics single-cell and spatial transcriptomics
2026-04-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08158-2
PMID:42001187
|
研究论文 | 通过多组学单细胞和空间转录组分析,揭示炎症性肠病向结直肠癌进展过程中的免疫和细胞重编程机制 | 整合1436名患者的转录组和血清学数据,首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学,鉴定CEACAM5作为连接IBD和CRC的关键分子标记 | 样本数量有限,部分分析依赖公共数据集,且未进行功能验证实验 | 阐明IBD发病机制中的免疫异质性和分子机制,并探索其与结直肠癌进展的联系 | 炎症性肠病(克罗恩病和溃疡性结肠炎)及结直肠癌患者 | 数字病理学 | 炎症性肠病、结直肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据、空间转录组数据、血清学数据 | 436个转录组样本(415个bulk RNA-seq,18个单细胞RNA-seq,3个空间转录组),1000名患者血清CEA水平 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞RNA测序,10x Visium空间转录组学 |
| 117 | 2026-08-31 |
Mapping breast cancer lineage in radiation and immunotherapy using the REMAP mouse
2026-Apr-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.15.718689
PMID:42039427
|
研究论文 | 本文介绍了REMAP小鼠模型,该模型整合了诱导型CRISPR记录与MMTV-PyMT乳腺癌模型,用于追踪肿瘤克隆演化并评估放疗联合抗PD1免疫治疗的效果 | 开发了REMAP小鼠模型,将诱导型CRISPR记录与MMTV-PyMT模型结合,实现克隆谱系追踪,首次揭示转移克隆的遗传性EMT程序及治疗驱动的克隆扩增 | 文章未提及局限性 | 探究乳腺癌在放射和免疫治疗下的克隆演化及肿瘤微环境重塑 | REMAP小鼠模型中的HR+乳腺癌肿瘤及肿瘤微环境 | 癌症基因组学 | 乳腺癌 | CRISPR基因编辑、单细胞RNA测序 | REMAP小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确具体数量,涉及多个肿瘤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 118 | 2026-08-31 |
Integrated transcriptomic and metabolomic profiling reveals immune-metabolic crosstalk and predictive biomarkers of ligustrazine treatment response in idiopathic pulmonary fibrosis
2026-04-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08142-w
PMID:42001075
|
研究论文 | 整合转录组和代谢组分析揭示特发性肺纤维化中免疫-代谢串扰及川芎嗪治疗反应的预测性生物标志物 | 首次整合批量、单细胞转录组及非靶向代谢组数据,系统性描绘IPF中免疫-代谢串扰,并构建基于关键基因和免疫细胞亚群的诊断列线图,具有高预测效能(AUC=0.970) | 摘要未提及具体局限性 | 阐明川芎嗪治疗特发性肺纤维化的免疫-代谢相互作用机制,并识别预测性分子生物标志物,以支持精准医学 | 大鼠模型和人类数据,包括批量及单细胞转录组数据(GSE150910、GSE32537、GSE122960)和非靶向代谢组学数据 | 多组学分析、免疫代谢、转录组学、代谢组学 | 特发性肺纤维化 | 转录组测序(批量及单细胞)、非靶向代谢组学 | 一致性聚类、ssGSEA、GSEA、miRNA和转录因子网络预测、列线图、ROC分析 | 转录组数据、代谢组数据 | 基于三个公共数据集及代谢组分析,具体样本量未在摘要中提供 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 非靶向代谢组学 | NA | NA |
| 119 | 2026-08-31 |
Midkine as a novel prognostic and therapeutic target in meningioma: insights from single-cell analysis and organoid-based drug validation
2026-04-14, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08068-3
PMID:41981656
|
研究论文 | 利用单细胞分析和类器官药物验证,揭示Midkine(MDK)作为脑膜瘤预后及治疗靶点的重要作用 | 首次通过单细胞RNA测序结合Scissor算法识别出与脑膜瘤复发相关的关键基因MDK,并利用类器官进行药物验证,探索其免疫抑制机制及治疗潜力 | 未提供明确的局限性信息 | 识别复发性脑膜瘤的新型预后生物标志物和治疗靶点,并验证MDK的临床意义及治疗潜力 | 脑膜瘤患者样本及IOMM-Lee和CH157脑膜瘤细胞系、脑膜瘤类器官 | 数字病理学, 机器学习 | 脑膜瘤 | 单细胞RNA测序, 批量转录组分析, Western blot, ELISA, 免疫组化, 多重免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据, 蛋白质表达数据, 图像数据 | 未提供具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 120 | 2026-08-31 |
Dissecting molecular heterogeneity in primary gastric cancer by IGFBP7-related analysis
2026-04-14, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08110-4
PMID:41981670
|
研究论文 | 本研究通过整合批量转录组数据、单细胞RNA测序和空间转录组学,比较了肠型胃癌和弥漫型胃癌的分子异质性,并定义了EGR1–IGFBP7/VCAM1轴在弥漫型胃癌中的作用。 | 首次系统揭示了EGR1–IGFBP7/VCAM1轴在胃癌亚型中的差异性作用,特别是在弥漫型胃癌中介导内皮-间质转化、异常血管生成和免疫排斥。 | 研究主要依赖公开数据及体内外实验,临床样本验证有限,且IGFBP7在肠型胃癌中的潜在抑制作用机制未完全阐明。 | 探究肠型胃癌和弥漫型胃癌之间的分子异质性及潜在治疗靶点。 | 胃癌亚型,包括肠型胃癌和弥漫型胃癌的肿瘤微环境及肿瘤细胞。 | 机器学习, 数字病理学 | 胃癌 | 批量转录组测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 未明确,但整合了公开数据集和实验样本 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq | 未明确具体配置,但涉及10x单细胞和空间转录组平台及Illumina测序平台 |