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当前共找到 37826 篇文献,本页显示第 101 - 120 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
101 2026-03-28
A comprehensive evaluation of long-read de novo transcriptome assembly
2026-Feb-18, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 本文对长读长从头转录组组装工具RATTLE、RNA-Bloom2和isONform进行了全面评估,并与短读长组装工具Trinity进行比较,旨在为无参考基因组情况下的长读长转录组组装和差异表达分析提供指导 首次系统评估长读长从头转录组组装工具在多种数据集(包括模拟数据、人类和豌豆样本)中的性能,并分析组装选择对差异基因和转录本表达检测的下游影响 与参考引导方法相比,长读长组装在准确性和冗余度方面仍存在局限,且评估主要基于特定工具和数据集 评估长读长从头转录组组装工具的性能,为无高质量参考基因组情况下的长读长差异表达分析提供策略选择指导 长读长从头转录组组装工具(RATTLE、RNA-Bloom2、isONform)和短读长组装工具Trinity 自然语言处理 NA 长读长测序、短读长测序、差异表达分析 NA 模拟数据、真实测序数据(人类和豌豆样本) 多种数据集,覆盖6至6000万读长深度,包括人类和豌豆样本 Oxford Nanopore Technologies, Pacific Biosciences 长读长测序、单细胞测序 ONT cDNA, ONT direct RNA, PacBio 10× single-cell sequencing Oxford Nanopore Technologies cDNA测序、直接RNA测序,以及Pacific Biosciences 10×单细胞测序
102 2026-03-28
Dipeptidylpeptidase 4 inhibition attenuates gestational pathologies via immune homeostasis restoration in the pulmonary-uterine axis
2026-Feb-17, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究揭示了呼吸道病毒感染通过肺-子宫免疫轴影响妊娠的机制,并发现DPP4抑制剂西格列汀可通过恢复免疫稳态来减轻妊娠并发症 首次揭示了呼吸道病毒感染通过肺-子宫免疫轴影响妊娠的机制,并发现DPP4抑制剂可作为针对双器官的治疗策略 NA 探究呼吸道病毒感染如何影响妊娠,并寻找潜在的治疗策略 妊娠期呼吸道病毒感染模型 NA 妊娠并发症 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
103 2026-03-28
STING-induced blood-brain barrier opening combined with radiotherapy potentiates antitumor response in a high-grade glioma model
2026-Feb-16, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究探讨了STING激动剂8803联合放疗在高等级胶质瘤模型中的抗肿瘤效应及其机制,发现该组合能重塑血脑屏障并诱导独特的抗肿瘤免疫反应 首次揭示了STING激动剂8803能通过改变内皮细胞Pecam和Cd147通路实现双侧血脑屏障开放,并利用[18F]-FLT PET成像纵向可视化STING激活过程 研究仅在两种小鼠胶质瘤模型(CT-2A和QPP8v)中进行,其中辐射抗性QPP8v模型未显示长期生存获益,且临床转化效果需进一步验证 评估STING激动剂8803联合放疗治疗高级别胶质瘤的疗效,并阐明其作用机制 携带颅内CT-2A或QPP8v胶质瘤的C57BL/6J小鼠 肿瘤免疫治疗 胶质母细胞瘤/高级别胶质瘤 单细胞RNA测序,PET成像,基因敲除模型 动物模型(小鼠) 基因表达数据,影像数据 未明确样本数量的小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
104 2026-03-28
Lactate-Driven Reprogramming of Monocyte Bridges Bone Loss in Inflammatory Comorbidities
2026-02-14, Biomolecules IF:4.8Q1
研究论文 本研究揭示了乳酸驱动的单核细胞重编程在牙周炎和类风湿关节炎等炎症共病中连接免疫激活与骨吸收加剧的分子机制 首次将乳酸代谢与炎症共病(牙周炎和类风湿关节炎)的骨丢失联系起来,并鉴定出SAT1、TET2和HIF1A作为核心乳酸相关基因和潜在生物标志物 研究主要基于小鼠模型和单细胞测序数据,需要在更大规模的人类队列中进行验证 揭示炎症共病中骨破坏的分子驱动机制 牙周炎和类风湿关节炎作为炎症疾病共病的临床相关模型 生物信息学 牙周炎, 类风湿关节炎 单细胞RNA测序 多种机器学习方法 基因表达数据 PD和RA队列的单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
105 2026-03-28
Aging-induced decrease in progenitor B cells enhances the osteoclastogenesis of bone marrow macrophages via ROS-activated Fos/CCL3 signaling‌ pathway
2026-Feb-10, Immunity & ageing : I & A IF:5.2Q1
研究论文 本研究揭示了衰老过程中骨髓微环境内ROS水平升高导致B淋巴细胞免疫衰老,进而通过激活Fos/CCL3信号通路促进破骨细胞生成,从而加剧老年性骨质疏松的机制 首次通过单细胞RNA测序等多组学整合策略,系统阐明了衰老骨髓微环境中B淋巴细胞减少,特别是祖B细胞耗竭,通过ROS激活的Fos/CCL3信号轴促进破骨细胞生成的新机制 研究主要基于SAMP6小鼠模型,其结论在人类老年性骨质疏松中的普适性有待进一步验证;体外细胞实验(BaF3和RAW 264.7细胞系)可能无法完全模拟体内复杂的骨髓微环境 探究免疫细胞(特别是B淋巴细胞)改变在老年性骨质疏松发病机制中的作用 衰老加速小鼠模型SAMP6及其对照SAMR1小鼠的骨髓细胞、BaF3细胞系(模拟祖B细胞)、RAW 264.7细胞系(巨噬细胞/破骨前体细胞) NA 老年性骨质疏松 单细胞RNA测序、转录组测序、流式细胞术、多色免疫荧光、多重细胞因子分析、micro-CT、分子生物学、组织学技术 NA 单细胞RNA测序数据、转录组数据、流式细胞数据、影像数据(micro-CT)、荧光图像、细胞因子数据 SAMP6和SAMR1小鼠模型(具体数量未明确说明),以及BaF3和RAW 264.7细胞系 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
106 2026-03-28
Neonatal Hyperoxia Induces Metabolic Reprogramming in Senescent Alveolar Macrophages, Leading to Persistent Lung Injury
2026-Feb-10, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
研究论文 本研究通过分析单细胞RNA测序数据,揭示了新生小鼠高氧暴露诱导衰老肺泡巨噬细胞的代谢重编程,并证明靶向代谢或清除衰老细胞可减轻持续性肺损伤 首次在新生小鼠高氧模型中,利用单细胞RNA测序技术系统描绘了衰老肺泡巨噬细胞的异质性、代谢重编程特征及其在持续性肺损伤中的作用机制 研究主要基于小鼠模型,其结论在人类早产儿支气管肺发育不良中的直接适用性仍需进一步验证 探究新生儿高氧暴露诱导的衰老肺泡巨噬细胞的分子与功能特征,及其在持续性肺损伤发生发展中的作用 新生小鼠的肺组织,特别是高氧暴露后分离的衰老肺细胞(以巨噬细胞为主) 数字病理学 肺损伤/支气管肺发育不良 单细胞RNA测序,免疫荧光,通路富集分析 NA 单细胞RNA测序数据,图像数据 数据集GSE207866中的样本,包括高氧暴露后第7天(SD7)、年龄匹配的空气暴露对照(AirD7)及未富集衰老细胞的高氧暴露组(O2D7)小鼠肺细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
107 2026-03-28
Interferon stimulation and NKG2D expression drive enhanced natural killer cell antibody-dependent cellular cytotoxicity against viral infections
2026-Feb-09, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2
研究论文 本研究结合功能ADCC实验与单细胞转录组学,揭示了COVID-19患者自然杀伤细胞抗体依赖性细胞毒性的分子决定因素 首次通过单细胞转录组学揭示ADCC反应中NK细胞的内在转录程序差异,并发现干扰素刺激与NKG2D表达的关键作用及抗体介导ADCC的调节检查点机制 研究样本仅限于COVID-19患者,未涵盖其他病毒感染或健康对照,且机制验证主要在体外进行 探究NK细胞抗体依赖性细胞毒性在抗病毒免疫中的分子机制 COVID-19患者的自然杀伤细胞 单细胞转录组学 COVID-19 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 COVID-19参与者的外周NK细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
108 2026-03-28
Integration of imaging-based and sequencing-based spatial omics mapping on the same tissue section via DBiTplus
2026-Jan-15, Nature methods IF:36.1Q1
研究论文 本文介绍了一种名为DBiTplus的新型整合多模态空间组学方法,可在同一组织切片上结合测序型空间转录组学与多重蛋白成像技术 开发了DBiTplus整合工作流程,首次实现同一组织切片上测序型空间转录组与多重蛋白成像的同步分析,并采用RNase H介导的cDNA回收技术以保留组织架构 方法在极具挑战性的临床样本(如FFPE组织)中的全面性能仍需进一步验证 开发一种整合成像与测序的空间组学映射技术,以在单细胞分辨率下探索细胞异质性和功能 冷冻小鼠胚胎、福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)的人体淋巴结及淋巴瘤组织 空间组学 淋巴瘤 空间条形码技术、RNase H介导的cDNA回收、多重蛋白成像、空间转录组学 NA 空间转录组数据、蛋白成像数据 多种样本类型,包括小鼠胚胎和人类淋巴组织 NA 空间转录组学, 多重蛋白成像 DBiTplus DBiTplus整合工作流程,支持测序型空间转录组学与成像型蛋白分析在同一组织切片上进行
109 2026-03-28
Syntaxin 4 protects islet β-cells from cytokine-induced senescence
2026, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2
研究论文 本研究探讨了Syntaxin 4(STX4)在保护胰岛β细胞免受细胞因子诱导的衰老中的作用 首次揭示了STX4通过抑制衰老相关转录程序和重塑β细胞分泌组来保护β细胞免受衰老影响 研究主要基于体外细胞模型和NOD小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 探究STX4是否能够减轻糖尿病应激下β细胞的衰老 MIN6细胞、人类胰岛、小鼠胰岛以及非肥胖糖尿病(NOD)小鼠 细胞生物学 1型糖尿病 单细胞RNA测序、条件培养基蛋白质组学 NA 基因表达数据、蛋白质组数据 MIN6细胞、人类胰岛、小鼠胰岛及NOD小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
110 2026-03-28
Targeting the epithelium in pulmonary fibrosis
2026-Jan, European respiratory review : an official journal of the European Respiratory Society IF:9.0Q1
综述 本文综述了特发性肺纤维化(IPF)研究中的最新进展,重点探讨了上皮细胞群在疾病中的作用及作为治疗靶点的潜力 整合了单细胞测序、空间转录组学等前沿技术,揭示了IPF中新型疾病相关上皮细胞群,并强调了细胞间通讯在疾病机制中的重要性 作为综述文章,未提供原始实验数据,且部分新技术(如空间分析)的应用仍处于早期阶段 探讨IPF的病理生物学机制,特别是上皮细胞的作用,以寻找新的治疗靶点 特发性肺纤维化(IPF)患者肺组织及相关的上皮细胞群 数字病理学 肺纤维化 单细胞测序, 空间转录组学, 功能共培养研究, 计算基因集富集分析 NA 基因组数据, 转录组数据, 空间数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
111 2026-03-28
Exploring hub genes related to adipocytokines in keloids: a combined analysis integrating single-cell, Mendelian randomization and bulk transcriptome data with experimental verification
2026, Frontiers in molecular biosciences IF:3.9Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、孟德尔随机化和批量转录组数据分析,结合实验验证,探索了与脂肪细胞因子相关的枢纽基因在瘢痕疙瘩发病机制中的作用 首次结合单细胞RNA测序、孟德尔随机化和批量转录组数据进行综合分析,识别出PIK3R3和ANGPTL5作为与脂肪细胞因子相关的潜在枢纽基因,并验证了PIK3R3在瘢痕疙瘩中的因果作用 ANGPTL5的表达验证结果不一致,可能受样本限制影响,且研究主要基于现有公开转录组数据的再分析 识别瘢痕疙瘩形成的潜在治疗靶点,并阐明与脂肪细胞因子相关的病理机制 瘢痕疙瘩组织及相关基因表达 生物信息学 皮肤纤维增生性疾病 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 批量转录组分析, RT-qPCR 机器学习 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
112 2026-03-28
CCS-mediated mechanistic link between gestational diabetes mellitus and carpal tunnel syndrome: a multi-omics MR framework
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过多组学孟德尔随机化框架,揭示了妊娠期糖尿病与腕管综合征之间的因果关联及CCS基因介导的分子机制 首次整合遗传相关分析、孟德尔随机化、多组学数据(eQTL、pQTL)、单细胞RNA测序及分子对接,系统阐明GDM通过CCS介导的氧化、免疫和纤维化通路导致CTS的因果机制 研究主要基于欧洲人群的遗传数据,可能限制其跨人群普适性;动物模型和分子对接结果需进一步实验验证 探究妊娠期糖尿病是否因果增加腕管综合征风险及其分子通路 妊娠期糖尿病与腕管综合征的遗传关联、CCS基因的介导作用及相关分子通路 生物信息学与遗传流行病学 妊娠期糖尿病与腕管综合征 连锁不平衡评分回归、双样本孟德尔随机化、全血cis-eQTL分析、血浆蛋白QTL分析、批量RNA测序、单细胞RNA测序、组织学、免疫荧光、分子对接 孟德尔随机化模型、贝叶斯共定位分析 遗传数据、转录组数据、蛋白质组数据、单细胞数据、组织图像数据 基于FinnGen和UK Biobank的大规模人群遗传数据,涉及GDM和CTS病例及对照 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
113 2026-03-28
A lactylation modification-related prediction model for the diagnosis of ulcerative colitis based on machine learning
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过机器学习方法分析溃疡性结肠炎(UC)相关数据集,识别了与乳酸化修饰相关的核心基因,并构建了一个高预测性能的诊断模型 首次将乳酸化修饰与溃疡性结肠炎的诊断模型结合,利用三种机器学习方法识别核心基因,并通过单细胞RNA测序数据探索了乳酸化在免疫细胞中的分布 研究基于公开数据集,样本来源可能有限,且体外验证的基因表达变化需进一步在临床样本中确认 开发一个基于乳酸化修饰相关基因的溃疡性结肠炎诊断预测模型 溃疡性结肠炎患者的数据集(GSE206285、GSE75214、GSE87466)及相关的乳酸化修饰基因 机器学习 溃疡性结肠炎 RNA测序、单细胞RNA测序 机器学习模型(具体方法未指定) 基因表达数据 三个UC相关数据集,具体样本数量未在摘要中提供 NA 单细胞RNA-seq NA NA
114 2026-03-28
Comprehensive management of hematopoietic stem cell transplantation complications: from infection prevention to immune microenvironment reconstruction
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文系统综述了造血干细胞移植(HSCT)关键并发症(包括感染、移植物抗宿主病和肝窦阻塞综合征)的管理策略,并探讨了新兴技术在构建全程风险管理模型中的应用 整合了从感染预防到免疫微环境重建的综合管理视角,并强调了单细胞测序、微生物组分析和人工智能等新兴技术在构建全程风险管理模型中的应用潜力 作为一篇综述文章,未报告原始研究数据或进行新的临床试验 系统回顾并探讨造血干细胞移植并发症的管理策略及未来研究方向 造血干细胞移植患者及其并发症(感染、GVHD、VOD/SOS) NA 造血干细胞移植相关并发症 单细胞测序,微生物组分析,人工智能 NA NA NA NA NA NA NA
115 2026-03-28
Renshen-Baidu-San restores epithelial-immune crosstalk and drives type 2 immune repair in ulcerative colitis: an integrated multi-omics study
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合多组学方法,揭示了人参败毒散通过调节代谢通路、恢复上皮-免疫细胞间通讯并驱动2型免疫修复来治疗溃疡性结肠炎的多重生物学机制 首次结合血清代谢组学、网络药理学、分子对接和单细胞RNA测序,系统阐明了人参败毒散在溃疡性结肠炎中恢复上皮-免疫串扰并驱动2型免疫修复的整合机制 研究基于DSS诱导的小鼠溃疡性结肠炎模型,其病理机制与人类疾病可能存在差异;临床样本验证有待补充 阐明人参败毒散治疗溃疡性结肠炎的潜在治疗机制 DSS诱导的溃疡性结肠炎小鼠模型及结肠类器官 多组学整合分析 溃疡性结肠炎 血清代谢组学, 网络药理学, 分子对接, 单细胞RNA测序, 结肠类器官实验, 组织病理学, 免疫组织化学, 免疫荧光, 定量RT-PCR, ELISA, 流式细胞术 DSS诱导的溃疡性结肠炎小鼠模型 代谢组数据, 转录组数据, 图像数据, 分子相互作用数据 未明确说明具体样本数量,但使用了DSS诱导的UC小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
116 2026-03-28
M2-type tumor-associated macrophages promote invasion of canine breast cancer through ADAM9 upregulation
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过犬乳腺肿瘤模型结合人类转录组数据集,揭示了ADAM9作为M2型肿瘤相关巨噬细胞促进肿瘤侵袭的关键效应分子 首次在跨物种(犬与人类)水平上证实ADAM9在M2极化TAMs中的特异性富集,并阐明其通过ECM降解和细胞骨架重塑介导肿瘤侵袭的分子机制 研究主要基于体外模型和转录组分析,缺乏体内实验验证;犬类模型向人类临床转化的直接证据尚需进一步探索 探究肿瘤相关巨噬细胞驱动肿瘤侵袭的分子介质,特别关注ADAM9在TAM促侵袭功能中的作用 犬乳腺肿瘤模型、人类转录组数据集、IL-4诱导的M2巨噬细胞、肿瘤球体模型 肿瘤免疫学 乳腺癌 单细胞RNA测序、转录组分析、基因敲低、条件培养基实验 NA 转录组数据、单细胞RNA测序数据、体外功能实验数据 未明确说明具体样本数量,涉及犬类数据集和公共人类转录组数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
117 2026-03-28
Sparse dimensionality reduction for analyzing single-cell-resolved interactions
2026, Bioinformatics advances IF:2.4Q2
研究论文 本文提出了一种针对单细胞细胞间相互作用数据的端到端降维工作流程,旨在简化细胞对间相互作用模式的分析 采用稀疏降维方法(特别是Boosting Autoencoder)来精确定位与细胞对簇相关的特定配体-受体相互作用,并提供了包含结果可视化的完整工作流程 NA 增强单细胞转录组学数据中细胞间相互作用的下游分析 单细胞细胞间相互作用数据,特别是基于已知配体-受体相互作用的细胞对 机器学习 NA 单细胞转录组学 Boosting Autoencoder 单细胞转录组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
118 2026-03-28
Model-based dimensionality reduction for single-cell RNA-seq using generalized bilinear models
2025-12-31, Biostatistics (Oxford, England)
研究论文 本文提出了一种名为scGBM的新方法,用于单细胞RNA-seq数据的基于模型的降维,通过泊松双线性模型改进标准降维方法 开发了scGBM方法,使用泊松双线性模型直接建模计数数据,引入快速估计算法以处理大规模数据集,并量化细胞潜在位置的不确定性 NA 解决单细胞RNA-seq数据降维中标准方法可能诱导虚假异质性和掩盖真实生物变异性的问题 单细胞RNA-seq数据 机器学习 NA 单细胞RNA-seq 泊松双线性模型 计数矩阵 数百万细胞的数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
119 2026-03-28
Protocol for decoding immune predictors of response to immunotherapy through pan-cancer multiomics analysis
2025-Dec-19, STAR protocols IF:1.3Q4
研究论文 本文提出了一种通过单细胞RNA测序、单细胞免疫分析和质谱流式细胞术分析多种癌症中T细胞动态的方案 整合了单细胞多组学技术和基因调控网络分析,以识别与免疫检查点阻断反应相关的T细胞亚群和预测性生物标志物 NA 解码免疫治疗响应的免疫预测因子 多种癌症中的T细胞 数字病理学 多种癌症 单细胞RNA测序, 单细胞免疫分析, 质谱流式细胞术 NA 单细胞RNA测序数据, 免疫分析数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 NA NA
120 2026-03-28
Protocol for preparation of mouse synovium for flow cytometry and RNA-seq
2025-Dec-19, STAR protocols IF:1.3Q4
研究论文 本文介绍了一种从小鼠滑膜制备单细胞悬浮液用于流式细胞术和RNA-seq分析的实验方案 该方案整合了关节炎诱导、细胞收获和单细胞悬浮液制备,支持稳态或炎症状态下的分析,并可选血管内标记 NA 开发一种标准化的小鼠滑膜单细胞悬浮液制备方法,以模拟类风湿关节炎和骨关节炎中的无菌炎症 小鼠滑膜组织 数字病理学 骨关节炎 RNA-seq NA 单细胞悬浮液 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
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