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当前共找到 39972 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-06-02 |
Single-cell RNA sequencing offers opportunities to explore the depth of physiology, adaptation, and biochemistry in non-model organisms exposed to pollution
2024-12, Comparative biochemistry and physiology. Part D, Genomics & proteomics
DOI:10.1016/j.cbd.2024.101339
PMID:39393164
|
综述 | 本短篇综述强调了单细胞RNA测序在揭示基因型-表型关系中的关键作用，特别是在非模式生物对环境污染反应中的应用潜力 | 将单细胞RNA测序的应用范围从典型疾病研究扩展到非模式生物对环境污染物的反应，提供了对细胞异质性的全面理解 | 未详细讨论单细胞RNA测序在非模式生物中应用的技术挑战或数据分析难点 | 通过分析已发表文章，说明单细胞RNA测序在生物学领域的最新进展，并探讨其在非模式生物对环境污染反应研究中的潜力 | 单细胞RNA测序应用相关的已发表文章 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 102 | 2026-06-02 |
Batch effects correction in scRNA-seq based on biological-noise decoupling autoencoder and central-cross loss
2024-12, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 提出基于生物噪声解耦自编码器和中心交叉损失的BDACL模型，用于消除单细胞RNA测序数据的批次效应 | 通过自编码器重构数据和层次聚类树逐步合并小簇，引入中心交叉损失以无监督方式消除批次效应，同时保留稀有细胞类型 | 未提及具体局限性 | 解决单细胞RNA测序数据中批次效应导致稀有细胞类型信息丢失的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 自编码器 | 基因表达数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 103 | 2026-06-02 |
CopyMix: Mixture model based single-cell clustering and copy number profiling using variational inference
2024-12, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 提出CopyMix模型，通过变分推断同时进行单细胞聚类和拷贝数变异分析，以研究肿瘤异质性 | 首次通过变分推断联合推断细胞聚类及其拷贝数谱，避免了传统分步处理中引入的人为聚类伪影 | 未明确说明局限性 | 开发一种能同时进行单细胞聚类和拷贝数谱推断的方法，以更好地研究肿瘤异质性 | 肿瘤细胞亚群 | 机器学习 | 肿瘤 | 单细胞DNA测序 | 混合隐马尔可夫模型 | 拷贝数数据 | NA | NA | 单细胞DNA测序 | NA | NA |
| 104 | 2026-06-02 |
Deconvolution of cell-type-associated markers predictive of response to neoadjuvant radiotherapy
2024-12, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序数据，对直肠癌新辅助放疗前样本进行细胞类型解卷积，识别预测放疗反应的细胞类型相关标记 | 首次通过整合单细胞和批量转录组数据，系统解析了直肠癌新辅助放疗响应的细胞类型特异性标记及其相互作用网络 | 未明确说明具体局限性 | 揭示直肠癌放疗后耐药和复发的细胞来源分子标记及治疗靶点 | 直肠癌患者新辅助放疗前的肿瘤样本 | 数字病理学, 机器学习 | 直肠癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 批量转录组数据 | 三个独立数据集（GSE119409、GSE35452、GSE45404） | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 105 | 2026-06-02 |
Single-cell RNA sequencing reveals myeloid and T cell co-stimulation mediated by IL-7 anti-cancer immunotherapy
2024-05, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02617-7
PMID:38424167
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示IL-7抗癌免疫疗法介导的髓系细胞和T细胞共刺激作用 | 首次发现IL-7受体在T细胞、巨噬细胞和树突状细胞上的多效性表达，并证明重组IL-7疗法通过激活T细胞和促炎性髓系细胞诱导抗肿瘤免疫 | 检查点抑制剂的靶点缺乏表达和免疫抑制细胞的持续存在限制了其普遍疗效 | 探索IL-7疗法作为替代方法共刺激T细胞和免疫微环境以克服检查点抑制剂的局限性 | 多种人类癌症和鼠肿瘤移植模型的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多种人类癌症样本和鼠肿瘤移植模型样本（具体数量未提供） | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 106 | 2026-06-02 |
Single-Cell RNA Sequencing Identifies Response of Renal Lymphatic Endothelial Cells to Acute Kidney Injury
2024-05-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000325
PMID:38506705
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序表征小鼠肾淋巴内皮细胞在静息和顺铂损伤肾中的反应，首次描述肾淋巴内皮细胞异质性并揭示其调节AKI局部免疫反应的分子通路 | 首次描述肾淋巴内皮细胞异质性并揭示其调节AKI局部免疫反应的新分子通路，为AKI治疗提供潜在靶点 | 仅使用小鼠模型，未在人类样本中验证；仅分析了顺铂损伤后72小时时间点，未涵盖AKI全病程 | 探究肾淋巴内皮细胞在急性肾损伤中的反应及其免疫调节作用 | 小鼠肾淋巴内皮细胞（顺铂损伤和缺血再灌注损伤模型）及体外培养人淋巴内皮细胞 | 单细胞基因组学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | Seurat | 单细胞转录组数据 | 小鼠肾脏样本（顺铂损伤组和对照组） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 107 | 2026-06-02 |
Tissue niches and immunopathology through the lens of spatial tissue profiling techniques
2024-02, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350484
PMID:37985207
|
综述 | 本综述通过空间组织分析技术探讨了组织微环境与免疫病理学的关系，强调了多组学组织学和空间转录组学在研究免疫反应中的重要性 | 综合讨论了空间组织分析技术相较于传统组织病理学研究的优势，并指出了其在疾病诊断和治疗中的革命性潜力 | 承认了空间组织分析技术存在挑战和局限性 | 探讨空间组织分析技术如何揭示组织微环境调控区域免疫的机制，及其在组织免疫病理学中的相关性 | 组织微环境、免疫反应、空间组织分析技术 | 计算机视觉, 机器学习 | 癌症, 自身免疫性疾病, 感染性疾病 | 空间转录组学, 多重组织学 | NA | 图像 | NA | NA | 空间转录组学, 多重组织学 | NA | NA |
| 108 | 2026-06-02 |
Distinct immune escape and microenvironment between RG-like and pri-OPC-like glioma revealed by single-cell RNA-seq analysis
2024-Feb, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-023-1017-7
PMID:37955814
|
研究论文 | 通过单细胞RNA-seq分析揭示RG样和pri-OPC样胶质瘤之间不同的免疫逃逸和微环境特征 | 首次将胶质瘤分为原始少突胶质前体细胞样和放射状胶质样亚型，并发现它们在免疫逃逸机制上的显著差异，尤其是pri-OPC样肿瘤中MHC-I基因下调以及肿瘤浸润淋巴细胞中特定基因表达与免疫检查点和不良预后的关联 | 样本量较小，仅基于26例胶质瘤的单细胞RNA-seq分析，且结论主要依赖公共数据库验证，可能缺乏广泛的临床代表性 | 研究神经发生和胶质发生与胶质瘤的关系，揭示不同胶质瘤亚型的免疫逃逸机制 | 26例胶质瘤样本及其肿瘤浸润淋巴细胞 | 单细胞转录组学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组表达数据 | 26例胶质瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 109 | 2026-06-02 |
Tumor-derived exosomes induce initial activation by exosomal CD19 antigen but impair the function of CD19-specific CAR T-cells via TGF-β signaling
2024-Feb, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-023-1010-1
PMID:37870681
|
研究论文 | 研究了肿瘤来源外泌体通过外泌体CD19抗原诱导初始激活，但通过TGF-β信号损害CD19特异性CAR-T细胞功能 | 首次揭示了B细胞淋巴瘤来源外泌体对CD19-CAR T细胞的双重作用：初始激活与后续抑制，并发现TGF-β抑制剂可逆转抑制作用 | 未明确外泌体诱导CAR-T细胞凋亡和功能损害的具体分子机制细节 | 探究淋巴瘤来源外泌体对CD19-CAR T细胞功能的影响及其机制 | B细胞淋巴瘤来源外泌体、CD19-CAR T细胞、淋巴瘤患者血浆外泌体 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 研究对象包括来自淋巴瘤患者的血浆外泌体及CD19-CAR T细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 110 | 2026-06-02 |
Underrepresentation of activating KIR gene expression in single-cell RNA-seq data is due to KIR gene misassignment
2024-01, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350590
PMID:37944995
|
研究论文 | 研究指出标准单细胞RNA测序比对流程易将杀伤细胞免疫球蛋白样受体（KIR）转录本错误分配，导致活化型KIR基因表达被低估 | 首次揭示单细胞RNA-seq数据中KIR基因错误分配是导致激活型KIR表达被低估的根本原因 | 未提供具体解决方案或替代比对算法来纠正KIR基因错误分配问题 | 阐明单细胞RNA-seq数据中KIR基因表达低估的机制原因 | KIR基因转录本及单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 111 | 2026-06-02 |
Macrophage heterogeneity in atherosclerosis: A matter of context
2024-01, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350464
PMID:37943053
|
综述 | 探讨动脉粥样硬化中巨噬细胞的异质性与功能特化及其与微环境的关系 | 强调巨噬细胞在动脉粥样硬化中具有高度异质性和功能特化，并指出传统炎症/抗炎范式不足以解释其复杂致病机制，提出空间多组学方法的重要性 | 对局部微环境在动脉粥样硬化中塑造巨噬细胞表型和功能的作用仍大多未被描述 | 综述巨噬细胞在动脉粥样硬化中的起源、功能特化、表型多样性及微环境的影响 | 巨噬细胞亚群（小鼠和人类动脉粥样硬化模型中的斑块巨噬细胞） | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞3' |
| 112 | 2026-06-02 |
Two distinct molecular faces of preeclampsia revealed by single-cell transcriptomics
2023-10-13, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2023.07.005
PMID:37572658
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示先兆子痫的两种不同分子面孔 | 首次通过单细胞和单核转录组学分析，系统揭示了早发型和晚发型先兆子痫在胎盘各细胞类型中的分子差异，发现早发型先兆子痫存在广泛的基因表达失调，而晚发型则影响极小；并鉴定了胎儿来源的Hofbauer细胞和母体来源的TREM2巨噬细胞作为炎症的关键角色 | 未明确说明，但研究主要基于胎盘样本，可能未涵盖全身其他组织的分子变化 | 解析早发型和晚发型先兆子痫中胎盘不同细胞类型的功能变化，提供两种疾病的分子证据 | 早发型和晚发型先兆子痫患者与孕周匹配对照组的胎盘样本 | 数字病理学 | 先兆子痫 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | 早发型和晚发型先兆子痫及对照组的胎盘单细胞和单核样本，具体数量未明确 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium Single Cell 3' 和单核测序，Illumina NovaSeq测序平台 |
| 113 | 2026-06-02 |
Single-cell RNA sequencing identifies response of renal lymphatic endothelial cells to acute kidney injury
2023-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.09.544380
PMID:37333313
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序鉴定肾脏淋巴管内皮细胞对急性肾损伤的反应 | 首次通过单细胞RNA测序表征小鼠肾脏淋巴管内皮细胞亚群及其在顺铂急性肾损伤中的变化，并发现以往研究未描述的肾淋巴管内皮细胞及其淋巴管血管作用 | 未明确说明局限性 | 探索肾脏淋巴管内皮细胞对急性肾损伤的反应及其在肾脏疾病进展中的潜在作用 | 小鼠肾脏淋巴管内皮细胞 | 单细胞转录组学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠肾脏细胞样本（具体数量未说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 114 | 2026-06-02 |
BASiCS workflow: a step-by-step analysis of expression variability using single cell RNA sequencing data
2022, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.74416.2
PMID:38779464
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研究论文 | 提供使用BASiCS Bioconductor包对单细胞RNA测序数据进行表达变异分析的逐步计算流程 | 集成框架同时处理数据标准化、技术噪声量化和下游分析，并通过概率决策规则识别细胞群间表达变异的变化，避免技术噪声和整体丰度差异的混淆效应 | 需要用户熟悉R语言和Bioconductor生态，且依赖Docker镜像确保可重复性，可能对非计算背景用户存在门槛 | 开发并指导用户使用BASiCS方法稳健量化单细胞RNA测序数据中的表达变异性 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达变异性 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 概率模型 | 基因表达数据 | 使用公开数据集作为示例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 115 | 2026-06-02 |
Transfer learning between preclinical models and human tumors identifies a conserved NK cell activation signature in anti-CTLA-4 responsive tumors
2021-08-11, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-021-00944-5
PMID:34376232
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研究论文 | 通过迁移学习比较临床前模型与人类肿瘤，发现抗CTLA-4响应肿瘤中保守的NK细胞激活特征 | 首次利用迁移学习方法（projectR）鉴定出抗CTLA-4治疗中保守的NK细胞激活特征，该特征与患者生存期延长和对ipilimumab治疗的响应性相关 | 临床前模型中的治疗机制未能完全转化为人类疾病，限制了提高免疫检查点抑制剂疗效的转化研究 | 识别肿瘤微环境中免疫细胞状态对免疫检查点抑制剂响应的保守转录变化，以发现新的作用机制并提高疗效 | 小鼠和人类肿瘤中的NK细胞、T细胞及其他免疫细胞 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、质谱流式细胞术 | 迁移学习算法（projectR） | 单细胞转录组数据、bulk转录组数据、质谱流式细胞数据 | 涉及小鼠模型和人类转移性黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 116 | 2026-06-02 |
Spinal Inhibitory Interneurons: Gatekeepers of Sensorimotor Pathways
2021-Mar-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22052667
PMID:33800863
|
综述 | 综述脊髓抑制性中间神经元在感觉运动通路中的门控作用及其在疾病中的潜在治疗靶点 | 通过转基因操作、神经化学分析和单细胞转录组学等方法，识别出构成功能性微环路的抑制性中间神经元的不同亚群 | 未提及具体局限性 | 理解抑制性中间神经元在脊髓中的组织方式和功能，为治疗感觉和运动障碍提供潜在靶点 | 脊髓抑制性中间神经元 | 神经科学 | 感觉障碍、运动障碍 | 单细胞转录组学、转基因操作 | NA | 文献综述 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 117 | 2026-06-01 |
Airway-derived emphysema-specific alveolar type II cells exhibit impaired regenerative potential in COPD
2024-Dec, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.02071-2023
PMID:39147413
|
研究论文 | 发现了一种位于肺泡远端囊泡中的特异性ATII细胞亚群（asATII细胞），该细胞在COPD中表现出再生潜力受损，并可能成为新的治疗靶点 | 首次发现并描述了一种同时表达肺泡标记物表面活性蛋白C和club细胞标记物SCGB3A2的肺气肿特异性ATII细胞亚群（asATII细胞），并在小鼠模型中证实其来源于club细胞 | 未提及具体研究局限，但基于摘要可推断可能包括：研究主要在体外类器官模型中进行，缺乏体内功能验证；样本量及临床相关性有待进一步确认 | 探究COPD肺气肿中组织再生受损的驱动因素，特别是肺上皮祖细胞异常 | COPD患者和健康对照的肺泡II型（ATII）细胞及气道club细胞 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序、谱系标记 | NA | 基因表达数据 | 人及小鼠样本（具体数量未提供） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 118 | 2026-06-01 |
Graph attention automatic encoder based on contrastive learning for domain recognition of spatial transcriptomics
2024-10-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07037-0
PMID:39424696
|
研究论文 | 提出了一种基于图注意力自动编码器和对比学习的空间转录组数据域识别方法GAAEST | 引入自监督对比学习从局部、全局和上下文三个层次捕捉空间信息，显著提升空间域识别性能 | 未明确讨论方法的计算开销或对大规模数据集的扩展性 | 从空间转录组数据中准确识别空间域 | 空间转录组数据的空间域识别 | 机器学习, 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 图注意力自动编码器 (GAAEST) | 基因表达数据，空间位置信息 | 基于多个数据集进行实验 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 119 | 2026-06-01 |
Insights into the molecular characteristics of embryonic cranial neural crest cells and their derived mesenchymal cell pools
2024-10-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07056-x
PMID:39424998
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析，揭示胚胎颅神经嵴细胞及其衍生间充质细胞池的分子特征 | 首次发现鹿茸源性祖细胞与牙髓间充质细胞在转录组特征上的惊人相似性，并揭示全基因组DNA甲基化分析中再生性鹿茸骨膜中CNCC衍生特征基因的低甲基化现象 | 未明确提及 | 研究颅神经嵴细胞衍生间充质细胞的分子特征及其再生潜力 | 鹿的牙齿和鹿茸组织中的颅神经嵴衍生间充质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、全基因组DNA甲基化分析 | NA | 基因表达数据、DNA甲基化数据 | 未明确说明样本数量，涉及鹿的牙齿和鹿茸组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 120 | 2026-06-01 |
scRNA-Explorer: An End-user Online Tool for Single Cell RNA-seq Data Analysis Featuring Gene Correlation and Data Filtering
2024-09-01, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2024.168654
PMID:39237193
|
研究论文 | 提出了面向最终用户的单细胞RNA-seq数据在线分析工具scRNA-Explorer，支持基因相关性分析和数据过滤 | 开发了交互式在线工具，整合基因相关性分析、生物学重要性评估和基因富集分析，简化了单细胞RNA-seq数据的下游分析 | NA | 简化单细胞RNA-seq数据分析流程，提供面向非专业用户的交互式在线分析工具 | 单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |