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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-05-16 |
Single-cell RNA sequencing identifies M2-like macrophage polarization associated with mesenchymal stem cell treatment in a murine sepsis model
2026-Feb-20, Biomolecules & biomedicine
DOI:10.17305/bb.2026.13517
PMID:41718721
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析间充质干细胞治疗对脓毒症小鼠模型免疫细胞的影响 | 首次利用单细胞RNA测序技术揭示间充质干细胞治疗通过促进M2样巨噬细胞极化改善脓毒症存活的机制 | 小鼠模型与临床转化的差距以及仅分析了术后6小时的单时间点数据 | 阐明间充质干细胞在脓毒症病理中与免疫细胞互作的具体机制 | 脓毒症小鼠模型中的CD45阳性免疫细胞 | 机器学习 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 脓毒症小鼠模型中分离的CD45阳性免疫细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒用于CD45阳性免疫细胞测序 |
| 102 | 2026-05-16 |
Microglia and Myeloid Cell Populations of the Developing Mouse Retina
2026-02, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.70115
PMID:41388751
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研究论文 | 本研究通过单细胞和单核RNA测序揭示了发育中小鼠视网膜中独特的髓系细胞群及其解剖位置和功能 | 首次在视网膜发育过程中识别出由Spp1和Hmox1基因标记的两种密切相关的小胶质细胞亚群,并发现Hmox1小胶质细胞在视网膜血管生成过程中特异性定位于发育中血管的前缘,提示血管生成相关事件调节NRF2活性驱动小胶质细胞状态转换 | 研究仅限于小鼠模型,未在人体中进行验证;部分发育特异性髓系细胞群在脑scRNA-seq数据集中已有描述但未在体内验证 | 阐明小胶质细胞和髓系细胞群在视网膜发育过程中的作用机制和分子特征 | 发育中的小鼠视网膜髓系细胞和小胶质细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 组织学染色 | NA | 基因表达数据 | 多个时间点的发育中小鼠视网膜样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 103 | 2026-05-16 |
Charting immune variation through genetics and single-cell genomics
2026-01-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf161
PMID:41467452
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研究论文 | 通过多组学单细胞方法分析428名健康中国成人的免疫细胞,构建免疫多组学图谱 | 整合单细胞RNA测序和染色质可及性测序,识别73个免疫细胞亚群并构建细胞类型特异性基因调控网络,扩展了祖先多样性和数据模态 | NA | 研究人类免疫变异,通过遗传学和单细胞基因组学绘制免疫细胞图谱 | 428名健康中国成人的免疫细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞染色质可及性测序 | NA | 单细胞转录组和表观基因组数据 | 428名健康中国成人,超过1000万免疫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 104 | 2026-05-16 |
SpaceBF: spatial coexpression analysis using Bayesian fused approaches in spatial omics datasets
2026-01-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag006
PMID:41556565
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研究论文 | 提出SpaceBF,一种用于空间组学数据中空间共表达分析的贝叶斯融合模型 | 通过融合马靴先验在预定义空间邻接图边上实现空间平滑,允许大边缘差异逃脱收缩而保留整体结构 | 未提供具体限制信息 | 开发稳健方法识别空间组学数据中分子对间的空间变异共表达 | 空间组学数据集(空间转录组学、质谱成像蛋白质组学) | 机器学习 | NA | 空间转录组学, 质谱成像, 贝叶斯建模 | 贝叶斯融合模型 | 空间表达数据(基因、肽、脂质、N-聚糖) | NA | NA | 空间转录组学, 质谱成像 | NA | NA |
| 105 | 2026-05-16 |
Efficient stem cell-derived mouse embryo models for environmental studies
2026-Jan-14, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.08.004
PMID:40882624
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研究论文 | 通过模块化聚集三种小鼠干细胞类型,高效生成囊胚样结构(iG4-囊胚),用于环境因素影响胚胎发育的研究 | 开发了一种模块化方法,通过聚集三种小鼠干细胞(ESC、iG4-ESC和TSC)高效生成具有约80%效率的囊胚样结构,并首次用于研究环境因素(如咖啡因、酒精、尼古丁)对胚胎发生的影响 | 未提及具体局限性,但可能包括模型与天然胚胎的差异和体外培养条件的限制 | 开发高效的干细胞衍生小鼠胚胎模型,用于研究环境因素对胚胎发育的影响 | 三种小鼠干细胞类型:胚胎干细胞(ESC)、可诱导GATA4表达的ESC(iG4-ESC)和滋养层干细胞(TSC) | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约80%效率的iG4-囊胚结构,其中约12%经历体外植入后形态发生 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 106 | 2026-05-16 |
Integrative Single-Cell RNA Sequencing and Spatial Transcriptomics Uncover Distinct Fibroblast-Macrophage Crosstalk in Human Hip Synovium Between Patients With Femoroacetabular Impingement and Osteoarthritis
2026-Jan-12, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70033
PMID:41524472
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研究论文 | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学揭示股骨髋臼撞击症与骨关节炎患者髋关节滑膜中成纤维细胞-巨噬细胞的不同相互作用 | 首次通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学,比较股骨髋臼撞击症与髋关节骨关节炎患者的滑膜细胞组成、转录组特征及细胞间相互作用,发现EREG+成纤维细胞样滑膜细胞在骨关节炎中显著增加,并鉴定出FGF2-SDC4信号通路介导的成纤维细胞-巨噬细胞相互作用 | 样本量较小,每组仅6例患者;仅分析了髋关节滑膜组织,未涉及其他关节部位;细胞间相互作用的验证可能需要进一步的功能实验 | 研究股骨髋臼撞击症和髋关节骨关节炎患者的滑膜细胞组成、转录组谱及细胞-细胞相互作用的差异 | 股骨髋臼撞击症和髋关节骨关节炎患者的髋关节滑膜组织 | 单细胞基因组学 | 骨关节炎, 股骨髋臼撞击症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 伪时间分析 | 基因表达数据 | 12例患者(每组6例) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium用于单细胞RNA测序,10x Visium用于空间转录组学 |
| 107 | 2026-05-16 |
Altered Inflammatory Signature in a C9ORF72 -ALS iPSC-Derived Motor Neuron and Microglia Coculture Model
2026-01, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.70084
PMID:40952044
|
研究论文 | 利用C9ORF72相关ALS患者iPSC来源的运动神经元与小胶质细胞共培养模型,揭示了小胶质细胞介导的神经炎症特征改变 | 首次在iPSC来源的运动神经元与小胶质细胞共培养体系中,通过单细胞RNA测序发现C9ORF72突变导致LPS响应性小胶质细胞亚群缺失并削弱炎症反应 | 未明确共培养模型中细胞间相互作用的完整分子机制,且仅使用了C9ORF72一种基因变异模型 | 阐明C9ORF72突变对ALS中小胶质细胞介导的神经炎症的影响机制 | 人iPSC来源的运动神经元和小胶质细胞 | 数字病理学 | 肌萎缩侧索硬化症 | iPSC分化、单细胞RNA测序 | 共培养模型 | 单细胞基因表达数据 | 多个iPSC系,包括C9ORF72 HRE患者系和C9ORF72敲除系 | 未提及 | 单细胞RNA测序 | 未提及 | 未提及 |
| 108 | 2026-05-16 |
S100A4-lineage cells contribute modestly to angiotensin II-mediated thoracic aortic aneurysms through angiotensin II type 1a receptor in mice
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0348111
PMID:42118772
|
研究论文 | 研究S100A4谱系细胞通过血管紧张素II 1a型受体参与小鼠胸主动脉瘤形成的作用 | 首次揭示S100A4谱系细胞通过AT1aR受体部分介导AngII诱导的胸主动脉瘤形成 | S100A4谱系细胞贡献程度中等,可能存在其他细胞类型协同作用 | 探究S100A4谱系细胞是否通过AT1aR参与AngII介导的胸主动脉瘤形成 | 小鼠主动脉壁中的S100A4谱系细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 蛋白质组学、批量RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白丰度数据 | 小鼠模型,具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 109 | 2026-05-16 |
Genetic insights into drug targets for alzheimer's disease: integrative multi-omics analysis
2025-12-05, Alzheimer's research & therapy
DOI:10.1186/s13195-025-01901-9
PMID:41350740
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研究论文 | 整合多组学孟德尔随机化分析识别阿尔茨海默病药物靶点 | 通过大规模多组学数据整合(包括50多个GWAS数据集、蛋白质组QTL、单细胞RNA测序和蛋白质互作网络),建立了一个全面的阿尔茨海默病靶点图谱,并验证了六个最高置信度靶点 | 未明确说明,但可能包括依赖现有数据库的质量和样本量,以及孟德尔随机化方法的固有局限性 | 识别阿尔茨海默病的稳健治疗靶点,建立从机制到安全性的临床可操作框架 | 阿尔茨海默病的潜在药物靶点 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 全基因组关联研究、蛋白质组定量性状位点分析、孟德尔随机化、贝叶斯共定位、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、蛋白质组数据、单细胞转录组数据 | 涉及超过50个GWAS数据集及大规模蛋白质组学研究数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 110 | 2026-05-16 |
An Integrated Single-Cell Atlas of the Mouse Ileum Links Nutrient Metabolism with Epithelial and Immune Crosstalk
2025-12, The Journal of nutrition
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.tjnut.2025.09.034
PMID:41033583
|
研究论文 | 构建小鼠回肠综合单细胞图谱,揭示营养代谢与上皮-免疫细胞互作机制 | 首次整合小鼠回肠单细胞转录组图谱,同时覆盖上皮和免疫细胞群体,发现Bco2-Il18在多种细胞类型中的共表达以及非经典杯状细胞的高表达特征 | 研究仅基于雄性C57BL/6J小鼠,未考虑性别和遗传背景差异;缺乏功能验证实验 | 构建回肠细胞异质性图谱,解析上皮分化、营养代谢程序及上皮-免疫互作在健康与疾病中的作用 | 8周龄雄性C57BL/6J小鼠的回肠细胞 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 32,076个回肠细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 使用Seurat软件进行基因表达聚类分析,结合伪时间轨迹、细胞间通讯和通路富集分析 |
| 111 | 2026-05-16 |
Oxidative Stress and Pyroptosis Mediated by CEBPB/HMGB1 Signaling in Sepsis-Exacerbated Coronary Atherosclerosis
2025-12, Antioxidants & redox signaling
IF:5.9Q1
DOI:10.1177/15230864251380263
PMID:41167615
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研究论文 | 本研究探讨了CEBPB/HMGB1/VCAM1信号轴在脓毒症加重冠状动脉粥样硬化中介导氧化应激和细胞焦亡的作用 | 首次揭示了CEBPB/HMGB1/VCAM1信号轴在脓毒症加重冠心病中的分子机制,为心血管并发症的预防提供了新靶点 | 研究主要在动物模型和细胞实验中进行,尚需更大规模临床样本验证 | 阐明脓毒症加重冠状动脉疾病的氧化应激和炎症信号通路机制 | 雄性ApoE小鼠模型和THP-1来源巨噬细胞及人主动脉内皮细胞 | 数字病理学 | 冠状动脉疾病 | 单细胞RNA测序, 批量转录组学, 染色质免疫沉淀, 双荧光素酶报告基因检测, 酶联免疫吸附测定, 活性氧检测, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 分子生物学数据 | 使用ApoE小鼠模型(样本量未明确报告),以及THP-1来源巨噬细胞和人主动脉内皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 112 | 2026-05-16 |
Gene-metabolite interactions in aortic dissection: Insights from metabolic and single-cell analyses
2025-Nov-21, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000045846
PMID:41305697
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研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序、代谢组学、机器学习和孟德尔随机化方法,探讨主动脉夹层中平滑肌细胞变化及基因-代谢物相互作用 | 首次构建主动脉夹层的基因-代谢物网络,明确APOE和PLTP通过调节胆固醇酯和甘油三酯影响平滑肌细胞功能及疾病进展 | 样本量较小(9个代谢组学样本),且未提供功能验证实验 | 探索主动脉夹层的发病机制,寻找潜在治疗靶点 | 主动脉夹层组织样本中的平滑肌细胞及代谢物 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、代谢组学、机器学习、孟德尔随机化 | Seurat、Monocle2、机器学习模型 | 单细胞基因表达数据、代谢组学数据 | 9个样本(6个主动脉夹层,3个对照) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 113 | 2026-05-16 |
Pan-cancer NK cell-related immunotherapy signatures for predicting PD-1 treatment response
2025-Nov-21, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000045753
PMID:41305714
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研究论文 | 利用机器学习和单细胞RNA测序数据构建泛癌自然杀伤细胞免疫治疗预测模型(NKCIPM),用于预测PD-1治疗反应 | 首次通过整合多种癌症类型的单细胞RNA-seq和批量RNA-seq数据,结合机器学习算法,建立泛癌水平的NK细胞免疫治疗预测模型,并鉴定出APOE作为关键枢纽基因 | NK细胞在癌症中的全面研究仍有限,尤其是对免疫治疗反应的影响 | 建立泛癌NK细胞免疫治疗预测模型,评估免疫治疗反应并指导临床决策 | 自然杀伤细胞及其在肿瘤微环境中的特征基因 | 机器学习 | 泛癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据、批量RNA测序数据 | 164份样本(6种癌症类型) | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 114 | 2026-05-16 |
S100A12 as a key biomarker in a neutrophil-associated gene prediction model for sepsis diagnosis
2025-Nov-21, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000046140
PMID:41305822
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序和机器学习框架构建败血症诊断模型,并识别S100A12为关键生物标志物 | 通过113种机器学习框架结合SHAP分析,从单细胞数据中筛选出4个中性粒细胞相关基因构建最优诊断模型,并首次强调S100A12作为关键驱动基因和潜在治疗靶点 | 未提及具体局限性,可能包括样本来源单一、缺乏多中心验证或模型泛化性待评估 | 开发败血症诊断模型并识别关键驱动生物标志物 | 败血症患者和健康对照者的外周血样本 | 机器学习 | 败血症 | 单细胞RNA测序 | 随机森林(RF)模型 | 单细胞基因表达数据 | 来自GEO数据库的公开数据,具体规模未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 115 | 2026-05-16 |
Brain tumors induce widespread disruption of calvarial bone and alteration of skull marrow immune landscape
2025-Nov, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-02064-4
PMID:41044343
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研究论文 | 脑肿瘤(胶质母细胞瘤)会导致颅骨异常和颅骨骨髓免疫景观改变 | 首次揭示胶质母细胞瘤对颅骨和颅骨骨髓免疫环境的影响,并发现抑制骨吸收会促进肿瘤进展并削弱免疫治疗效果 | 未在文中明确提及 | 探究脑肿瘤(胶质母细胞瘤)对颅骨和颅骨骨髓免疫景观的影响 | 小鼠模型和胶质母细胞瘤患者 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 小鼠模型和胶质母细胞瘤患者(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 116 | 2026-05-16 |
Redox Regulation of Microvascular Physiology and Pathophysiology: Insights into Therapeutic Strategies and Limitations
2025-10, Antioxidants & redox signaling
IF:5.9Q1
DOI:10.1177/15230864251372607
PMID:41020442
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综述 | 探讨氧化还原调控在微血管生理和病理中的作用,以及相关治疗策略和局限性 | 强调微血管与大血管对氧化还原反应的差异,提出基于单细胞RNA测序的血管床特异性基因特征,呼吁开发靶向微血管的氧化还原治疗药物 | 技术挑战限制了可靠关联活性氧/活性氮水平与微血管结果;缺乏有效的靶向治疗药物 | 综述氧化还原机制在微血管功能与功能障碍中的研究现状,指出未来研究方向 | 微血管中的活性氧和活性氮物种及其调控机制 | 机器学习和数字病理学 | 心血管疾病、自身免疫性疾病、感染性疾病、血红蛋白病、炎症性疾病、血管炎、代谢性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 117 | 2025-10-05 |
Plasma proteome correlations with liver stiffness in pediatric cholestasis implicate epithelial to mesenchymal transition
2025-Oct-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000796
PMID:41021277
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研究论文 | 本研究通过血浆蛋白质组学分析探索儿童胆汁淤积性肝病中肝脏硬度与蛋白质表达的相关性 | 首次在多种儿童胆汁淤积性疾病中系统分析血浆蛋白质组与肝脏硬度的疾病特异性相关性,并发现上皮间质转化通路在所有三种疾病中均显著富集 | 研究为横断面分析,无法确定因果关系;样本量相对有限 | 探究儿童胆汁淤积性肝病中血浆蛋白质组与肝脏硬度的相关性及其生物学意义 | 187名儿童(93例胆道闭锁、31例α-1抗胰蛋白酶缺乏症、46例Alagille综合征患者及17名健康对照) | 蛋白质组学 | 肝胆疾病 | 慢解离速率修饰适体扫描分析、振动控制弹性成像、单细胞转录组学、机器学习 | 弹性网络模型 | 蛋白质组数据、临床参数、转录组数据 | 187名儿童(93例BA、31例A1AT、46例ALGS、17名健康对照) | NA | 血浆蛋白质组分析、单细胞转录组学 | NA | 慢解离速率修饰适体扫描分析技术检测7000多种血浆蛋白质 |
| 118 | 2026-05-16 |
Role of Hydrogen Sulfide Regulation of Programmed Cell Death: Implications for Cardiovascular Diseases
2025-10, Antioxidants & redox signaling
IF:5.9Q1
DOI:10.1177/15230864251386449
PMID:41137369
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综述 | 总结硫化氢在心血管疾病中对程序性细胞死亡调控的作用及其机制 | 系统综述硫化氢在不同程序性细胞死亡模式(如NETosis、凋亡、坏死性凋亡、焦亡、铁死亡和铜死亡)中的调控作用,并探讨其在多种心血管疾病中的差异影响 | 硫化氢对不同细胞类型中程序性细胞死亡模式的差异性作用机制尚需进一步证据支持,且其在疾病条件下是否充当不同程序性细胞死亡通路之间的开关仍需确定 | 阐明硫化氢在心血管疾病中调控程序性细胞死亡的分子机制,以理解其病理生理作用 | 硫化氢及程序性细胞死亡相关信号通路在心血管疾病(如糖尿病心肌病、心肌肥厚与纤维化、高血压、心力衰竭、动脉粥样硬化和心肌缺血/再灌注损伤)患者中的作用 | 生物信息学 | 心血管疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 119 | 2026-05-16 |
Crosstalk between the microbiota and intestinal dendritic cells in IBD
2025-Sep-30, Seminars in immunopathology
IF:7.9Q1
DOI:10.1007/s00281-025-01062-9
PMID:41028655
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综述 | 总结肠道中传统树突状细胞的功能、其在炎症性肠病中的作用以及微生物群对树突状细胞生物学的影响 | 结合单细胞测序技术的新进展,探讨了微生物群如何影响树突状细胞在炎症性肠病中的功能,并提出了研究树突状细胞- T细胞体内通讯的新方法 | 树突状细胞数量有限及其与其他骨髓细胞表型重叠的特性限制了研究;树突状细胞在炎症性肠病中的确切作用仍不明确 | 综述肠道传统树突状细胞的功能及其在炎症性肠病中的作用,并探讨微生物群对树突状细胞功能的影响 | 肠道传统树突状细胞、微生物群 | 机器学 | 炎症性肠病 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 120 | 2026-05-16 |
Global transcriptome characterization of peripheral blood mononuclear cells in individuals with chronic HIV infection
2025-09, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111082
PMID:40639496
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研究论文 | 采用RNA-seq和单细胞测序技术探究慢性HIV感染者外周血单个核细胞的全局转录组特征及其免疫代谢差异 | 首次系统比较不同HIV感染状态组(免疫应答者、免疫无应答者、典型进展者和精英控制者)的免疫代谢谱差异,并发现在CD8+ T细胞亚群中存在的代谢通路变异 | 样本量较小(仅18例),且未对代谢通路差异进行深入的功能验证 | 探索不同HIV感染群体中是否存在独特的免疫代谢特征 | HIV感染者的外周血单个核细胞(PBMCs) | 数字病理学 | 艾滋病 | RNA-seq,单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 18例,包括4例免疫应答者、5例免疫无应答者、5例典型进展者和4例精英控制者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |