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当前共找到 36072 篇文献,本页显示第 101 - 120 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
101 2026-02-07
Nephron-associated Support Cell Transcriptional Plasticity Expands in Hypertension
2026-Jan-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析高血压小鼠肾脏中的肾单位相关支持细胞,揭示了其在高血压条件下的转录可塑性增强及抗炎和促再生特性 首次在高血压模型中系统鉴定肾单位相关支持细胞的转录组变化,发现其相比淋巴内皮细胞对炎症诱导变化更具抵抗力,并调控干细胞抑制与增殖相关基因 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;单细胞测序样本量有限;机制研究仍需进一步实验验证 探究高血压条件下肾脏支持细胞的转录可塑性及其在组织稳态中的作用 高血压小鼠肾脏中的CD31+和podoplanin+细胞(包括肾单位相关支持细胞和淋巴内皮细胞) 单细胞转录组学 高血压 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 来自两种高血压小鼠模型的肾脏细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
102 2026-02-07
Imaging spatial transcriptomics reveals molecular patterns underlying accumulation of p-Ser129 α-synuclein in a transgenic mouse model
2026-Jan-16, NPJ Parkinson's disease
研究论文 本研究利用成像空间转录组学结合免疫荧光技术,在转基因小鼠模型中揭示了p-Ser129 α-突触核蛋白积累的分子模式 首次将成像空间转录组学与下游免疫荧光技术结合,在同一组织切片中识别出易积累pSyn的神经元亚型,并揭示了Plk2和hSNCA表达在pSyn形成中的关键作用 研究基于转基因小鼠模型,可能无法完全模拟人类帕金森病或路易体痴呆的复杂性 探究帕金森病和路易体痴呆中α-突触核蛋白选择性积累的分子机制 转基因过表达人α-突触核蛋白的小鼠皮层和海马神经元 数字病理学 帕金森病 成像空间转录组学,免疫荧光 NA 空间转录组数据,图像数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
103 2026-02-07
Identifying Crucial Genes Associated with Pyroptosis in Lupus Nephritis
2026-Jan-16, Inflammation IF:4.5Q2
研究论文 本研究通过生物信息学分析和细胞实验,识别了狼疮性肾炎中与细胞焦亡相关的关键基因GBP2和EIF2AK2,并探讨了其作为治疗靶点的潜力 首次在狼疮性肾炎中系统识别与细胞焦亡相关的关键基因,构建了高诊断准确性的基因模型,并通过细胞实验验证了GBP2和EIF2AK2在调控细胞焦亡中的作用 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,细胞实验模型可能无法完全模拟体内复杂的病理环境 识别狼疮性肾炎中与细胞焦亡相关的关键基因,并探索其作为治疗靶点的潜力 狼疮性肾炎患者的肾小球、肾小管间质和全肾组织样本 生物信息学 狼疮性肾炎 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、基因表达谱分析 LASSO回归模型、WGCNA网络分析 基因表达数据 来自GEO数据库的狼疮性肾炎患者组织样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
104 2026-02-07
Macrophage Niche Reconstitution Reveals Dynamic Transcriptional and Communication Networks Renal Macrophage-Epithelial Communication
2026-Jan-16, Research square
研究论文 本研究通过诱导性hCD59 ILY消融系统结合纵向单细胞RNA测序,揭示了肾脏驻留巨噬细胞在急性耗竭后再生过程中的转录组和细胞间通讯网络 首次利用诱导性消融系统结合纵向scRNA-seq,系统解析了肾脏巨噬细胞再生过程中的动态转录组和细胞间通讯网络,并识别了上皮细胞来源的CX3CL1在巨噬细胞招募中的关键作用 研究主要基于小鼠模型,人类肾脏中的巨噬细胞再生机制可能有所不同;且scRNA-seq技术本身存在技术噪音和细胞捕获偏差 探究肾脏驻留巨噬细胞在急性耗竭后再生过程中的细胞和分子机制,特别是上皮-免疫相互作用的协调作用 小鼠肾脏驻留巨噬细胞和上皮细胞 单细胞组学 肾脏疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 基线及消融后第1、3、7天的小鼠肾脏样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
105 2026-02-07
Uniform pre-processing of bacterial single-cell RNA-seq
2026-Jan-16, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种针对细菌单细胞RNA测序的统一预处理方法,通过改进kallisto-bustools工具套件以适应细菌转录组特征 将原本用于真核生物的kallisto-bustools工具套件进行改进,使其能够处理细菌特有的操纵子结构和更短的基因长度分布,实现了细菌scRNA-seq数据的统一高效预处理 未明确说明该方法在具体细菌物种或实验条件下的性能局限性,也未与其他预处理工具进行系统比较 开发适用于细菌单细胞RNA测序数据的统一预处理流程,解决现有方法分散且定制化的问题 细菌单细胞RNA测序数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 NA 测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
106 2026-02-07
4D multimodal wound healing atlas reveals organ-level controls of repair phase transitions
2026-Jan-16, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过构建器官级伤口愈合图谱,揭示了修复阶段转换的分子控制机制 首次创建了4D多模态器官级伤口愈合图谱,整合了单核RNA测序、单细胞RNA测序、CITE测序和高清空间转录组学,克服了传统方法的局限性,发现了新的基底IV角质形成细胞亚群及其在协调修复中的关键作用 研究主要基于小鼠模型,人类数据验证有限;传统单细胞RNA测序方法可能因解离伪影而遗漏关键细胞亚群 解码哺乳动物伤口愈合的系统级原理,揭示器官尺度损伤反应的分子逻辑 小鼠皮肤伤口愈合过程中的细胞状态和组织系统 数字病理学 伤口愈合障碍 snRNA-seq, scRNA-seq, CITE-seq, 空间转录组学 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 超过725,000个小鼠单细胞和空间转录组 NA 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, CITE-seq, 空间转录组学 NA NA
107 2026-02-07
Dual Lineage Tracing Identifies Cellular Mechanisms Underlying Radiation-Associated Changes in Atherosclerotic Lesion Composition
2026-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究开发了一种双谱系示踪小鼠模型,用于同时追踪动脉粥样硬化斑块中平滑肌细胞和内皮细胞的命运,揭示了辐射如何通过改变这两种细胞的动态变化来影响斑块组成和稳定性 开发了首个能够同时示踪平滑肌细胞和内皮细胞命运的双谱系示踪小鼠模型,克服了传统单谱系示踪方法无法在同一病变中同时追踪两种细胞类型的局限性 研究基于小鼠模型,其发现向人类临床的转化需要进一步验证;研究主要关注辐射这一特定血管应激源,其他应激条件下的细胞动态可能不同 探究辐射条件下平滑肌细胞和内皮细胞在动脉粥样硬化斑块中的命运变化及其对斑块稳定性的影响机制 Apoe缺陷小鼠的平滑肌细胞和内皮细胞 心血管疾病研究 心血管疾病 谱系示踪、免疫染色、单细胞RNA测序 双谱系示踪小鼠模型 基因表达数据、成像数据 未明确说明具体样本数量,但涉及双谱系示踪Apoe缺陷小鼠群体 NA 单细胞RNA测序 NA NA
108 2026-02-07
Ovarian hormone deficiency enhances wood smoke-induced immune dysfunction via transcriptomic and metabolic alterations
2026-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,探究了卵巢激素缺乏如何加剧木材烟雾暴露诱导的骨髓免疫功能障碍,揭示了相关的转录组和代谢改变 首次在卵巢激素缺乏背景下,结合单细胞RNA测序和功能验证,阐明了木材烟雾暴露通过诱导巨噬细胞代谢重编程和免疫通路抑制导致免疫毒性的新机制 研究主要聚焦于卵巢切除小鼠模型,未涵盖其他激素缺乏状态或更广泛的空气污染物类型 探究卵巢激素缺乏作为易感因素,如何影响木材烟雾暴露诱导的骨髓免疫功能障碍 卵巢切除(OVX)小鼠和假手术(Sham)小鼠的骨髓免疫细胞及骨髓来源巨噬细胞(BMDMs) 单细胞组学 免疫功能障碍 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 卵巢切除和假手术小鼠的骨髓免疫细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
109 2026-02-07
Integrative Single-cell and Spatial Transcriptomic Analysis of Osteosarcoma Reveals Conserved and Distinct Ecosystems Across Sites and Species
2026-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过整合单细胞和空间转录组学分析,揭示了骨肉瘤在跨物种和不同部位间保守且独特的生态系统 构建了首个跨物种骨肉瘤单细胞转录组数据集,涵盖人类、犬类、PDX和同基因小鼠模型,并识别了保守的肿瘤细胞状态和肿瘤相关细胞群的重编程特征 研究依赖于转录组数据,可能未完全捕捉蛋白质水平或表观遗传变化,且样本来源的多样性可能引入批次效应 探究骨肉瘤的肿瘤微环境异质性及其在跨物种和不同解剖部位的保守与差异 人类、犬类骨肉瘤标本、患者来源异种移植(PDX)、同基因小鼠模型的原发(骨)和转移(肺)部位细胞 数字病理学 骨肉瘤 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA 转录组数据 超过一百万个细胞/核,来自多物种和多部位样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
110 2026-02-07
Decoding the Role of H19 in Cholestatic Liver Injury Using snRNA-seq, Spatial Transcriptomics, and Machine Learning-Based Disease Prediction
2026-Jan-14, Research square
研究论文 本研究通过结合单核RNA测序、空间转录组学和机器学习,揭示了长链非编码RNA H19在胆汁淤积性肝损伤中的作用机制 首次整合单核RNA测序、空间转录组学和多种机器学习模型,系统解析了H19在细胞类型特异性和空间分辨率上对胆汁淤积性肝损伤的调控作用,并发现了新的疾病标志物 研究主要基于小鼠模型,人类数据验证仅使用了一个公开数据集,需要更多临床样本进一步验证 阐明长链非编码RNA H19在原发性硬化性胆管炎(PSC)进展中的细胞类型特异性机制和空间调控作用 野生型、H19敲除、Mdr2敲除及双敲除小鼠的肝组织,以及公开的人类数据集GSE243981 数字病理学 肝胆疾病 单核RNA测序, 空间转录组学, 机器学习 逻辑回归, XGBoost, 神经网络, 随机森林 基因表达数据, 空间转录组数据 年龄和性别匹配的四种基因型小鼠(具体数量未明确说明),以及公开人类数据集GSE243981 NanoString 单核RNA测序, 空间转录组学 NanoString GeoMx NanoString GeoMx空间转录组学平台
111 2026-02-07
3D reconstruction of spatial transcriptomics with spatial pattern enhanced graph convolutional neural network
2026-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种名为Spa3D的方法,利用反泄漏傅里叶变换和图卷积神经网络模型,从多个二维空间转录组切片重建三维空间结构,以提升空间域识别、细胞间通讯分析、器官级时空发育模式建模和三维空间轨迹注释的准确性 Spa3D首次通过结合反泄漏傅里叶变换和图卷积神经网络,从二维空间转录组数据重建三维空间结构,克服了现有方法仅依赖二维坐标的限制,在三维空间域识别、细胞通讯、发育模式和轨迹分析方面优于现有技术 NA 开发一种能够从二维空间转录组数据重建三维空间结构的方法,以更准确地分析空间域、基因表达、细胞通讯和发育轨迹 空间解析转录组学数据,包括多个二维切片 数字病理学 NA 空间解析转录组学 图卷积神经网络 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
112 2026-02-07
Intranasal Human NSC-Derived EVs Therapy Can Restrain Inflammatory Microglial Transcriptome, and NLRP3 and cGAS-STING Signaling, in Aged Hippocampus
2026-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了人诱导多能干细胞来源的神经干细胞外泌体通过鼻内给药,抑制老年小鼠海马神经炎症并改善认知功能的机制 首次证明hiPSC-NSC-EVs中的特定miRNA(miRNA-30e-3p和miRNA-181a-5p)能分别抑制NLRP3炎症小体和STING通路激活,并通过单细胞RNA测序揭示了其对小胶质细胞转录组的广泛调控作用 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证;长期安全性和疗效需进一步评估;机制研究主要基于体外细胞实验 探究hiPSC-NSC-EVs疗法对老年海马神经炎症的抑制作用及其分子机制 18月龄C57BL6/J雄性和雌性小鼠的海马组织,以及基因工程RAW细胞 神经科学 老年疾病 单细胞RNA测序,体外细胞实验,蛋白质和基因表达分析 动物模型(小鼠),细胞模型 基因表达数据,蛋白质数据,行为数据 18月龄C57BL6/J雄性和雌性小鼠,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
113 2026-02-07
Defects in tissue-resident macrophages lead to smaller eardrums and abnormal neurovascular networks with increased middle-ear infection
2026-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了组织驻留巨噬细胞在鼓膜发育和神经血管网络成熟中的关键作用,并探讨了其缺陷如何导致鼓膜变小、神经血管网络异常及中耳感染风险增加 首次发现出生后鼓膜中的组织驻留巨噬细胞具有异质性,主要来源于胚胎髓系谱系,并逐渐增加来自出生后单核祖细胞的贡献;通过单细胞RNA测序鉴定了对血管和神经元发育至关重要的基因特征 未详细探讨巨噬细胞耗竭的具体机制或长期影响,也未涉及人类样本验证 探究组织驻留巨噬细胞在出生后鼓膜发育和神经血管网络成熟中的作用,以及其缺陷如何影响中耳感染风险 小鼠鼓膜中的组织驻留巨噬细胞、神经血管网络及中耳感染模型 免疫学与发育生物学 中耳感染 命运图谱分析、单细胞RNA测序、巨噬细胞耗竭 NA 单细胞RNA测序数据、组织学图像 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
114 2026-02-07
Benchmarking cell type deconvolution in spatial transcriptomics and application to cancer immunotherapy
2026-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一个用于评估空间转录组学中细胞类型反卷积方法的基准测试框架,并将其应用于癌症免疫治疗研究 提出了一个结合空间和转录复杂性的现实模拟基准测试框架,发现简单的标记基因签名评分方法在性能上具有竞争力,尤其适用于稀有细胞类型 基准测试主要基于模拟数据,可能无法完全反映真实生物样本的复杂性;方法在缺乏匹配单细胞参考数据时的适用性仍需进一步验证 评估和比较空间转录组学中细胞类型反卷积方法的准确性和一致性,并应用于癌症免疫治疗响应分析 空间转录组学数据,包括模拟数据集和真实小鼠癌症模型中的肿瘤及引流淋巴结样本 空间转录组学 癌症 空间转录组学 标记基因签名评分方法 空间转录组学数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
115 2026-02-07
A supervised ontology-aware cell annotation method for single-cell transcriptomic data
2026-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出一种基于监督学习和本体论的细胞注释方法SOCAM,用于单细胞转录组数据,通过概率传播策略确保细胞类型分类的层次一致性 引入概率传播策略以强制本体一致性,无需重新训练现有模型即可提升性能,并提出了基于跳数的F1评分用于本体感知评估 NA 开发一种快速、可解释且本体一致的细胞注释方法,以改进单细胞RNA-seq数据的细胞类型分类 人类单细胞转录组数据 数字病理学 NA 单细胞RNA-seq 逻辑回归 单细胞转录组数据 4200万个人类细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
116 2026-02-07
Microbiome-Derived Metabolites Shape CD4⁺ T-Cell Differentiation and Immune Aging in Chronic HIV-1 Infection
2026-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了芳香族肠道来源细菌代谢物(GDBMs)在慢性HIV-1感染中如何影响CD4⁺ T细胞分化和免疫衰老 首次将细胞相关GDBMs(特别是p-甲酚硫酸盐)与CD4⁺ T细胞代谢状态、功能受损和HIV-1病毒库持久性联系起来,揭示了微生物组通过代谢物重塑免疫细胞命运的新机制 研究主要基于体外和离体实验,体内直接因果关系的证据有限,且样本可能来自特定人群,限制了普遍性 探究肠道微生物代谢物在HIV-1感染中如何调控CD4⁺ T细胞的免疫代谢和衰老过程 HIV-1感染者(PLWH)的CD4⁺ T细胞 免疫代谢学 HIV感染 代谢组学分析、流式细胞术、单细胞RNA测序、转录组学、蛋白质组学 NA 代谢物数据、单细胞RNA-seq数据、转录组数据、蛋白质组数据 来自HIV-1感染者的配对血浆和CD4⁺ T细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
117 2026-02-07
MIF-mediated reprogramming of myeloid lineage within the glioma tumor microenvironment impacts the efficacy of immune stimulatory gene therapy
2026-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序揭示了IDH1突变型胶质瘤中单核细胞来源的肿瘤相关巨噬细胞减少及MIF表达降低的现象,并证实靶向MIF-CD74轴可增强免疫刺激基因疗法在野生型IDH1胶质瘤模型中的疗效 首次在单细胞层面系统比较了IDH1突变型与野生型胶质瘤的免疫微环境差异,揭示了MIF-CD74轴通过表观遗传重编程调控髓系细胞的关键机制,并创新性地将MIF抑制与TK/Flt3L基因疗法联合应用 研究主要基于小鼠模型,临床转化仍需验证;未深入探讨其他免疫细胞亚群的作用;表观遗传重编程的具体分子机制有待进一步阐明 探究IDH1突变状态对胶质瘤免疫微环境的影响,并开发针对MIF-CD74轴的联合免疫治疗策略 野生型与突变型IDH1胶质瘤的肿瘤微环境,特别是髓系细胞群体 单细胞组学 胶质瘤 单细胞RNA测序,基因敲除小鼠模型 NA 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量,涉及wtIDH1与mIDH1胶质瘤样本及基因敲除小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
118 2026-02-07
From glycolytic signatures to patients: A translational roadmap for reproducible, equitable deployment of multi-omics and AI in colorectal cancer
2026-Jan-13, Medical oncology (Northwood, London, England)
综述 本文提出一个基于多组学和人工智能的可重复、公平部署的路线图,用于结直肠癌的精准肿瘤学 整合国际公认框架(TRIPOD+AI、PROBAST+AI、DECIDE-AI)以确保透明度、校准和分阶段临床评估,并强调使用代谢成像和光谱学进行正交验证 未具体说明数据样本量或模型类型,主要关注方法论和路线图,缺乏实证研究细节 为结直肠癌中多组学和人工智能的可重复、公平临床工具开发提供结构化路线图 结直肠癌的糖酵解异质性及相关生物标志物 机器学习 结直肠癌 批量转录组学、单细胞转录组学、代谢成像、光谱学 NA 转录组数据、成像数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
119 2026-02-07
Nuclear receptor co-factor TBL1X/TBL1XR1 T cell activity protects against atherosclerosis
2026-Jan-13, Molecular metabolism IF:7.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序发现核受体共因子TBL1X/TBL1XR1在人类颈动脉斑块CD4 T细胞中高表达,其缺失会促进炎症反应和动脉粥样硬化斑块形成 首次揭示TBL1X/TBL1XR1在CD4 T细胞中的保护作用,并证明其表达降低与人类不稳定斑块相关,提出了新的治疗靶点 研究主要基于小鼠模型和人类组织样本,需要进一步验证在人类中的直接机制和临床转化潜力 探究TBL1X/TBL1XR1在动脉粥样硬化发展中的作用机制 人类颈动脉斑块、CD4 T细胞、基因敲除小鼠模型 单细胞组学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 人类颈动脉斑块样本(稳定与不稳定斑块及健康对照)、基因敲除小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
120 2026-02-07
NR4A1 limits CD8⁺ T Cell effector responses and protection in tuberculosis
2026-Jan-13, Research square
研究论文 本文通过小鼠、猕猴和人类数据验证,发现核受体NR4A1是结核病中CD8⁺ T细胞免疫的关键抑制因子,并揭示了NR4A1-NKG7轴作为新的宿主导向治疗靶点 首次将NR4A1鉴定为结核病中CD8⁺ T细胞免疫的负调控因子,并提出了NR4A1-NKG7轴作为新型治疗靶点 研究主要基于小鼠模型,尽管在猕猴和人类数据中进行了验证,但临床转化仍需进一步研究 探究结核病中CD8⁺ T细胞功能障碍的分子机制,并寻找潜在的治疗靶点 小鼠、猕猴和人类数据集中的CD8⁺ T细胞 免疫学 结核病 RNA测序、单细胞RNA测序、空间分析、ChIP-qPCR NA 基因表达数据、空间定位数据 涉及小鼠、猕猴和人类数据集,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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