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当前共找到 36228 篇文献,本页显示第 101 - 120 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
101 2026-02-12
Single cell atlas of the comorbidity mechanism between chronic obstructive pulmonary disease and lung adenocarcinoma: a study of multi-omics combined analysis
2026, PeerJ IF:2.3Q2
研究论文 本研究通过多组学联合分析,揭示了慢性阻塞性肺疾病与肺腺癌共病机制中的关键基因和通路 结合孟德尔随机化、单细胞RNA测序和多组学分析,首次系统性地识别了连接COPD和LUAD的炎症相关关键基因FCRLA、GREM1和MMP9,并探索了其在特定免疫细胞中的表达及潜在治疗靶点 研究主要基于公共数据库和有限的患者血液样本验证,需要更大规模的临床队列和功能实验进一步证实 揭示COPD与LUAD共病的分子机制,识别共享的关键基因、通路、生物标志物和治疗靶点 慢性阻塞性肺疾病和肺腺癌患者的相关基因表达数据及患者血液样本 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序, qPCR, 全基因组关联研究, 孟德尔随机化, 差异表达分析, LASSO回归, 富集分析, 免疫细胞浸润分析, RNA修饰分析, ceRNA网络构建, 药物敏感性预测 LASSO回归 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 使用了多个公共数据集(GSE76925, GSE116959, GSE270667, GSE189357)并进行了患者血液样本的qPCR验证 NA 单细胞RNA-seq, 多组学分析 NA NA
102 2026-02-12
Distinct immune landscapes between murine and human periodontitis
2025-Dec-19, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序比较了人类牙周炎与小鼠结扎模型的免疫景观差异,并评估了Pg补充对模型可转化性的影响 首次系统性地比较了人类牙周炎与小鼠结扎模型的单细胞免疫景观,揭示了B/浆细胞和巨噬细胞在比例和激活状态上的显著差异 Pg补充未能减少小鼠与人类之间的免疫学差异,模型的可转化性有限 评估小鼠结扎模型作为人类牙周炎研究模型的适用性 人类牙周炎患者和小鼠结扎模型的牙龈组织 单细胞组学 牙周炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 小鼠结扎、结扎+Pg和对照组牙龈组织,整合人类数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
103 2026-02-12
[Expression Characteristics and Prognostic Study of PPP1R13L in Brain Metastases 
of Lung Adenocarcinoma]
2025-Nov-20, Zhongguo fei ai za zhi = Chinese journal of lung cancer
研究论文 本研究通过单细胞测序和临床样本分析,探讨了PPP1R13L基因编码的iASPP蛋白在肺腺癌脑转移组织中的表达特征及其临床意义 首次在肺腺癌脑转移的肿瘤微环境中,结合单细胞测序和临床样本,揭示了PPP1R13L作为上调差异基因在特定上皮细胞亚群中的高表达,并发现其阳性细胞与成纤维细胞之间的相互作用通过COL1A1-CD44配体-受体对激活细胞-基质粘附相关通路 单细胞测序样本量较小(仅4例肺腺癌脑转移和2例少突胶质细胞瘤组织),且临床样本来自单一医院,可能存在选择偏倚 分析肺腺癌脑转移患者的肿瘤微环境特征,并探索PPP1R13L在脑转移组织中的表达及其临床意义 肺腺癌脑转移患者的脑组织、临床样本及公共数据库中的肺腺癌和正常肺组织单细胞测序数据 数字病理学 肺癌 单细胞测序, 免疫组织化学 NA 单细胞测序数据, 临床病理数据, 图像数据 单细胞测序:4例肺腺癌脑转移和2例少突胶质细胞瘤组织;临床分析:50例肺腺癌脑转移患者的石蜡切片和临床数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
104 2026-02-12
Atlas-Guided Discovery of Transcription Factors for T Cell Programming
2025-Nov-02, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文通过整合转录组和表观遗传数据,构建了CD8+ T细胞状态的综合图谱,并利用CRISPR筛选与单细胞RNA测序技术,鉴定了调控T细胞分化的关键转录因子 开发了一个综合图谱平台,结合了转录和表观遗传数据,并首次通过体内Perturb-seq技术系统性地识别了调控T细胞状态的转录因子,包括新发现的ZSCAN20和JDP2 研究主要基于小鼠模型,人类T细胞验证数据有限,且未涵盖所有可能的T细胞状态或疾病环境 系统定义驱动CD8+ T细胞不同状态的转录因子,以优化免疫疗法设计 CD8+ T细胞,特别是终末耗竭T细胞(TEXterm)和组织驻留记忆T细胞(TRM) 免疫学 癌症和慢性感染 单细胞RNA测序(scRNA-seq),CRISPR筛选,表观遗传分析 NA 转录组数据,表观遗传数据 涉及九个CD8+ T细胞状态,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
105 2026-02-12
Bile acids engage the SIPR-STAT3 signaling axis to modulate regulatory T cell responses in fibrosing cholangiopathies
2025-Nov, Journal of hepatology IF:26.8Q1
研究论文 本研究探讨了胆汁酸如何通过S1PR-STAT3信号轴调节调节性T细胞在纤维化胆管病中的反应 首次揭示了胆汁酸通过S1PR-STAT3信号轴抑制Treg功能并促进Th17样表型,为纤维化胆管病提供了新的治疗靶点 研究主要基于小鼠模型,人类样本仅来自胆道闭锁婴儿,可能无法完全代表其他纤维化胆管病如PSC 探究胆汁酸在纤维化胆管病中如何影响调节性T细胞的功能和反应 小鼠模型中的调节性T细胞、胆道闭锁婴儿的肝组织样本 单细胞基因组学 纤维化胆管病 单细胞RNA测序、ATAC-seq NA 单细胞转录组数据、表观基因组数据 130名胆道闭锁婴儿的肝组织样本、多个小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
106 2026-02-12
Divergence between neural and retinal lineage specification during human brain development by signal transduction
2025-Oct-22, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究利用基因工程人类胚胎干细胞衍生的脑类器官,探讨了p70 S6激酶1(S6K1)在人类大脑发育中的作用 首次在人类脑类器官模型中揭示S6K1信号通路在神经元与视网膜谱系分化中的精细调控作用,并区分了细胞自主与非自主功能 研究基于体外类器官模型,可能无法完全模拟体内大脑发育的复杂性 阐明S6K1在人类大脑发育过程中的功能机制 S6K1缺失的人类胚胎干细胞衍生的背侧前脑类器官 发育生物学 NA 单细胞RNA测序,ATAC测序 脑类器官模型 基因表达数据,染色质可及性数据 早期(5周)和晚期(14周)阶段的脑类器官 NA 单细胞RNA-seq,ATAC-seq NA NA
107 2026-02-12
VISTA Uncovers Missing Gene Expression and Spatial-induced Information for Spatial Transcriptomic Data Analysis
2025-Oct-07, Research square
研究论文 本文介绍了一种名为VISTA的新方法,用于预测空间转录组学数据中未观测基因的表达水平 VISTA结合变分推理和几何深度学习,联合建模单细胞RNA-seq数据和空间转录组学数据,并引入不确定性量化,以解决空间转录组学技术中基因数量有限的问题 NA 旨在通过预测未观测基因的表达,增强空间转录组学数据的分析能力,以更好地理解空间诱导的细胞状态和特征 空间转录组学数据和单细胞RNA-seq数据 空间转录组学 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 变分推理, 几何深度学习 基因表达数据 四个空间转录组学数据集 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
108 2026-02-12
Variational inference of single cell time series
2025-Sep-09, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种名为SNOW的深度学习算法,用于解卷积单细胞时间序列数据,以分离时间依赖和独立成分 提出SNOW算法,能够构建有生物学意义的潜在空间、去除批次效应并生成真实的单细胞时间序列 NA 解决单细胞RNA测序时间序列数据分析中的挑战,如时间与细胞类型贡献的解卷积、区分真实动态与批次效应 单细胞RNA测序时间序列数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 深度学习 RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
109 2026-02-12
The transcription factor HHEX maintains glucocorticoid levels and protects adrenals from androgen-induced lipid depletion
2025-Apr-15, Research square
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序解析了肾上腺皮质类固醇生成谱系的转录组,并发现转录因子HHEX在维持糖皮质激素水平和保护肾上腺免受雄激素诱导的脂质耗竭中起关键作用 首次通过单细胞RNA测序技术识别HHEX为糖皮质激素生成细胞中最富集的转录因子,并揭示其在肾上腺性别二态性和脂质代谢调控中的多功能作用 研究主要基于小鼠模型,人类肾上腺中的具体机制尚未完全阐明 探究维持肾上腺皮质细胞差异响应能力的分子机制 肾上腺皮质糖皮质激素生成细胞(zona fasciculata) 单细胞组学 肾上腺功能障碍 scRNA-seq NA 单细胞转录组数据 使用报告基因小鼠的肾上腺样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
110 2026-02-12
VISTA Uncovers Missing Gene Expression and Spatial-induced Information for Spatial Transcriptomic Data Analysis
2025-Mar-18, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种名为VISTA的新方法,用于预测空间转录组学数据中未观测基因的表达水平,以解决现有技术基因覆盖限制的问题 VISTA结合变分推断和几何深度学习,联合建模单细胞RNA-seq和空间转录组学数据,并引入不确定性量化,实现了对未观测基因表达的高效预测 方法依赖于单细胞RNA-seq和空间转录组学数据的联合可用性,且性能可能受数据质量和整合难度的影响 开发一种能够预测空间转录组学数据中未观测基因表达水平的方法,以增强空间诱导细胞状态和特征的分析能力 单细胞RNA-seq数据和亚细胞空间转录组学数据 空间转录组学 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 变分推断, 几何深度学习 基因表达数据, 空间数据 四个空间转录组学数据集 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
111 2026-02-12
MRGPRX2-expressing mast cells are increased in the GI tract of individuals with active inflammatory bowel disease and hereditary α-tryptasemia
2025, Frontiers in allergy IF:3.3Q2
研究论文 本研究探讨了遗传性α-类胰蛋白酶血症(HαT)患者胃肠道中MRGPRX2表达肥大细胞的增加及其在炎症性肠病(IBD)中的作用 首次在HαT背景下,结合空间转录组学和质谱流式细胞术,揭示了胃肠道肥大细胞表型改变及MRGPRX2表达上调与IBD活动的关联 样本量较小(空间转录组学n=8,质谱流式n=14),且仅针对特定肠道部位(降结肠和小肠)进行分析,可能限制结果的普适性 阐明HαT对胃肠道肥大细胞表型及MRGPRX2表达的影响,探索其在IBD症状发生中的潜在机制 遗传性α-类胰蛋白酶血症(HαT)患者及匹配的非HαT对照者的肠道组织样本 空间转录组学 炎症性肠病 空间转录组分析、质谱流式细胞术(CyTOF)、微滴数字PCR(ddPCR)、基因分型 NA 组织样本、转录组数据、蛋白质表达数据 854份生物样本库IBD样本进行基因分型;空间转录组分析8例(HαT=4,对照=4);质谱流式分析14例(HαT=5,对照=9) NA 空间转录组学、单细胞蛋白质组学 NA NA
112 2026-02-12
Multi-omics integration and machine learning-driven construction of an immunogenic cell death prognostic model for colon cancer and functional validation of FCGR2A
2025, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 本研究通过多组学整合与机器学习构建了一个基于免疫原性细胞死亡(ICD)相关基因的结肠癌预后模型,并验证了关键基因FCGR2A的功能 首次系统性地利用ICD相关基因构建结肠癌预后模型,结合单细胞RNA-seq数据解析T细胞状态,并通过大量机器学习模型组合优化特征选择 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏前瞻性临床队列验证;体外功能实验仅针对单个基因(FCGR2A) 开发基于免疫原性细胞死亡的预后模型,探索其与肿瘤免疫微环境及治疗敏感性的关联 结肠腺癌(COAD)患者 机器学习 结肠癌 转录组学分析、单细胞RNA-seq、机器学习模型构建 随机生存森林(Random Survival Forest) 转录组数据、临床数据、单细胞RNA-seq数据 TCGA和GTEx的结肠腺癌患者数据,以及GSE17538和GSE38832作为外部验证队列 NA 单细胞RNA-seq NA NA
113 2026-02-12
Multi-omics characterization of RNF157 expression patterns in hepatocellular carcinoma and development of an RNF157-associated prognostic signature
2025, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 本研究通过整合多组学和单细胞分析,表征了肝细胞癌中E3泛素连接酶RNF157的表达模式,开发了一个RNF157相关的预后特征,并探讨了其与肿瘤微环境的关系 在单细胞分辨率下表征RNF157在肝细胞癌中的异质性表达模式,并基于此开发了一个新的预后特征模型 预后模型的预测性能中等,需要独立验证才能临床应用 表征RNF157在肝细胞癌中的表达模式,开发预后特征,并探索其与肿瘤微环境的关系 肝细胞癌患者样本 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序, 多组学分析, 流式细胞术 预后特征模型 RNA表达数据, 单细胞RNA测序数据 来自TCGA、GEO数据库和scRNA-seq数据集(GSE149614)的临床和RNA表达数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
114 2026-02-12
Integrative multi-omics and experimental analyses implicate PTK2 as a lorazepam-associated biomarker and potential therapeutic target in ovarian cancer
2025, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 本研究通过整合多组学分析和实验验证,发现PTK2是劳拉西泮与卵巢癌之间的潜在生物标志物和治疗靶点 首次将神经活性药物劳拉西泮与卵巢癌的分子靶点联系起来,并通过空间转录组学揭示了PTK2在肿瘤微环境中的特异性分布 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证和临床样本的直接药效学证据 识别和验证劳拉西泮与卵巢癌共有的分子靶点,以发现新的生物标志物和治疗机制 卵巢癌相关基因与劳拉西泮潜在靶点的交集基因,特别是PTK2基因 计算生物学 卵巢癌 qPCR, CCK-8, 克隆形成, 伤口愈合, 流式细胞术, 单细胞转录组学, 空间转录组学 Lasso-Cox模型 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 NA NA 单细胞转录组学, 空间转录组学 NA NA
115 2026-02-12
Single-cell RNA-seq reveals a key role for Vibrio cholerae Mak toxins in Tetrahymena pyriformis killing and bacterial survival
2025, Frontiers in microbiology IF:4.0Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA-seq技术揭示了霍乱弧菌Mak毒素在杀死四膜虫和细菌在EFVs中存活的关键作用 首次利用单细胞转录组学分析霍乱弧菌暴露于四膜虫时的异质性基因表达,并识别出Mak毒素作为抵抗原生动物捕食和EFVs内存活的关键介质 研究仅关注霍乱弧菌和四膜虫的相互作用,分子机制细节仍需进一步探索 探究霍乱弧菌抵抗原生动物捕食的分子机制及其在EFVs中的存活策略 霍乱弧菌和四膜虫 单细胞转录组学 霍乱 单细胞RNA-seq NA 单细胞转录组数据 5,344个细菌细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
116 2026-02-12
BMP and NODAL paracrine signalling regulate the totipotent-like cell state in embryonic stem cells
2025, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和计算框架,探讨了细胞间通讯如何调控胚胎干细胞中的全能样细胞状态,揭示了BMP和NODAL信号通路的关键作用 首次结合单细胞RNA测序和计算建模,系统分析胚胎干细胞中配体-受体相互作用,并功能验证BMP和NODAL信号在调控全能样细胞状态中的核心角色 研究主要基于体外培养系统,可能无法完全模拟体内胚胎发育的复杂环境,且信号通路的调控机制仍需进一步在体内验证 探究细胞间通讯在调控胚胎干细胞命运转变中的作用,特别是针对全能样细胞状态 异质性胚胎干细胞群体,尤其是模拟两细胞期胚胎的全能样细胞 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 计算框架(用于建模配体-受体相互作用和下游调控效应) 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
117 2026-02-12
Single-cell transcriptomics reveals keratinocyte dynamic processes associated with S100a4 expression in psoriasiform dermatitis
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学揭示了S100a4表达在银屑病样皮炎中与角质形成细胞动态过程相关的机制 首次结合CRISPR/Cas9基因敲除小鼠模型和单细胞RNA测序技术,系统解析了S100A4在银屑病发病中的细胞特异性转录景观和调控机制,特别是发现了Klf9介导的Krt15转录失调作为角化过度关键驱动因素的新机制 研究基于小鼠模型,结果向人类银屑病的直接转化需进一步验证;单细胞测序样本量相对有限,可能未完全捕获所有细胞亚群异质性 探究S100A4在银屑病发病中的具体功能及相关分子机制 S100a4基因敲除小鼠的皮肤组织及角质形成细胞 数字病理学 银屑病 单细胞RNA测序(scRNA-seq),CRISPR/Cas9基因编辑,生物信息学分析 NA 单细胞转录组数据 未明确具体样本数量,但涉及不同处理组的小鼠皮肤组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
118 2026-02-12
SLC12A7 serves as a prognostic and immunotherapeutic biomarker identified by multi-omics analysis
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过多组学分析,发现SLC12A7可作为多种癌症的预后和免疫治疗生物标志物 首次对SLC12A7进行泛癌分析,揭示其在肿瘤微环境中的异质性及与免疫细胞浸润和免疫检查点基因表达的关联 研究主要基于公共数据库和体外实验,缺乏体内实验验证和临床样本的直接验证 阐明SLC12A7在癌症中的潜在致癌作用,并评估其作为预后和免疫治疗靶点的临床相关性 多种癌症类型,特别是肝细胞癌 生物信息学 肝细胞癌 转录组学分析、单细胞RNA测序、体外功能实验 NA 转录组数据、临床数据、单细胞RNA测序数据 来自TCGA、GTEx、cBioPortal、TIMER 2.0和GEO数据库的多个癌症数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
119 2026-02-12
Integrated single-cell and spatial transcriptomics combined with whole-exome sequencing reveal key hub genes and epithelial heterogeneity in bladder cancer
2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞、空间转录组和全外显子组测序数据,揭示了膀胱癌中的上皮细胞异质性,并识别出与肿瘤突变负荷相关的关键枢纽基因 首次整合单细胞RNA-seq、空间转录组和全外显子组测序数据,结合Ro/e算法识别出与肿瘤突变负荷(TMB)相关的关键上皮细胞亚群Epi14,并从中鉴定出枢纽基因ABRACL和ARPC3 样本量相对有限(13个单细胞样本,30个WES样本),且为回顾性分析,需要进一步的功能实验和更大规模的前瞻性队列验证 阐明膀胱癌上皮细胞的异质性及其功能状态,以改善未来的诊断和治疗策略 膀胱癌(BLCA)患者样本中的细胞,特别是癌症相关上皮细胞 数字病理学 膀胱癌 单细胞RNA-seq,全外显子组测序(WES),空间转录组学,qPCR,Western blot 随机生存森林(RSF),CellChat,CytoTRACE,Monocle2,spacexr,PROGENy 单细胞转录组数据,批量转录组数据,外显子组测序数据,空间转录组数据 13个单细胞RNA-seq样本,514个批量转录组样本,30个全外显子组测序样本,共77,263个细胞 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学,全外显子组测序 NA NA
120 2026-02-12
Characterization of Endothelial Cell Subclusters in Localized Scleroderma Skin with Single-Cell RNA Sequencing Identifies NOTCH Signaling Pathway
2024-Sep-28, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,对局限性硬皮病皮肤中的内皮细胞亚群进行了表征,并识别出NOTCH信号通路在疾病中的作用 首次在局限性硬皮病皮肤中应用单细胞RNA测序技术详细研究内皮细胞亚群,揭示了NOTCH信号通路的激活及其在疾病进展中的潜在作用 研究样本量相对有限(27名患者和17名健康对照),且主要关注内皮细胞,可能未全面覆盖其他细胞类型在疾病中的作用 探究局限性硬皮病皮肤中内皮细胞的分子机制及其在疾病发病机制中的作用 局限性硬皮病患者和健康对照者的皮肤分离细胞 数字病理学 硬皮病 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 27名局限性硬皮病患者(包括儿童和成人)和17名健康对照者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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