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当前共找到 39154 篇文献,本页显示第 101 - 120 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
101 2026-05-06
Eosinophilic esophagitis drives tissue fibroblast regenerative programs toward pathologic dysfunction
2025-Apr, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1
研究论文 该研究利用单细胞RNA测序等技术,揭示嗜酸性食管炎如何驱动组织成纤维细胞从再生程序转变为病理功能障碍 首次通过单细胞RNA测序结合功能实验,发现EoE成纤维细胞保留软骨细胞等硬细胞再生程序但失去脂肪细胞等软细胞分化能力,并揭示CD73和ATP代谢异常在致病机制中的关键作用 文中未明确提及局限性 探究慢性嗜酸性食管炎炎症诱导病理性成纤维细胞及其功能障碍的分子机制 嗜酸性食管炎患者和健康对照的食管成纤维细胞 数字病理学 嗜酸性食管炎 单细胞RNA测序、荧光激活细胞分选、成纤维细胞分化与迁移实验 NA 单细胞转录组数据、免疫染色图像、流式细胞数据 EoE患者与健康对照的活检样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
102 2026-05-06
Esophageal epithelial Ikkβ deletion promotes eosinophilic esophagitis in experimental allergy mouse model
2025-Apr, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1
研究论文 本研究利用条件性敲除食管上皮细胞中Ikkβ的小鼠模型,探讨上皮IKKβ/NF-κB信号在嗜酸性食管炎发病机制中的作用 首次证明食管上皮Ikkβ缺失会促进实验性过敏小鼠模型中嗜酸性食管炎的发展,并建立了更接近人类EoE的小鼠模型 未提及具体局限性 阐明上皮IKKβ/NF-κB信号在嗜酸性食管炎发病机制中的作用 条件性敲除食管上皮细胞中Ikkβ的小鼠(IkkβEEC-KO小鼠) 数字病理学 嗜酸性食管炎 单细胞RNA测序, RNA测序 NA 基因表达数据, 转录组数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
103 2026-05-06
Thymic and T-cell intrinsic critical roles associated with severe combined immunodeficiency and Omenn syndrome due to a heterozygous variant (G201R) in PSMB10
2025-Apr, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1
研究论文 该论文报告了一例由PSMB10基因杂合变异(G201R)导致的严重联合免疫缺陷和Omenn综合征,并揭示了该变异在胸腺和T细胞内在中的关键作用 首次阐明PSMB10 G201R杂合变异通过显性负效应降低免疫蛋白酶体表达,影响CD8 T细胞阳性选择、T细胞受体库多样性和自身反应性T细胞的阴性选择,并证明胸腺植入可能带来治疗益处 仅基于单个患者及其家族研究,样本量有限;未进行更广泛的队列验证或动物模型实验来进一步证实机制 对携带PSMB10杂合变异的婴儿进行免疫学和分子特征描述,以理解该变异导致严重联合免疫缺陷和Omenn综合征的机制 一名携带PSMB10 p.G201R杂合变异的婴儿及其父母 机器学习 免疫缺陷病 流式细胞术、免疫印迹、人工胸腺类器官T细胞发育、单细胞RNA测序 NA 生物数据 1名患者及其父母的外周血单核细胞、EB病毒转化B细胞、成纤维细胞和CD34+细胞;人类胸腺组织用于单细胞测序 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium平台用于人类胸腺单细胞RNA测序
104 2026-05-06
Endothelial FOSL1 drives angiotensin II-induced myocardial injury via AT1R-upregulated MYH9
2025-Apr, Acta pharmacologica Sinica IF:6.9Q1
研究论文 本研究揭示了FOSL1通过上调MYH9促进血管紧张素II诱导的心肌损伤的分子机制 首次发现FOSL1直接结合MYH9启动子并激活其转录,以及FOSL1/MYH9轴在Ang II诱导的血管重塑中的关键作用 未说明样本大小和人类验证实验 探究血管紧张素II诱导心肌损伤后血管重塑的分子机制 小鼠心脏内皮细胞和人脐静脉内皮细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞测序, 双荧光素酶报告基因, 染色质免疫沉淀 NA 基因表达数据, 序列数据 小鼠和细胞样本,具体数量未说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
105 2026-05-06
Meta-analyses of mouse and human prostate single-cell transcriptomes reveal widespread epithelial plasticity in tissue regression, regeneration, and cancer
2025-01-17, Genome medicine IF:10.4Q1
研究论文 通过对小鼠和人类前列腺单细胞转录组进行荟萃分析,揭示组织退化、再生和癌症中广泛的上皮可塑性 利用随机矩阵理论去噪并建立参考细胞类型分类,通过最优传输比较跨物种上皮细胞群体的转录组相似性,以及结合拷贝数变异分析揭示前列腺癌进展中的转录程序 未提及具体限制 研究前列腺上皮细胞在组织稳态、退化、再生及癌症中的动态变化和可塑性 小鼠和人类前列腺组织中的上皮细胞群体 数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序 随机矩阵理论, 最优传输 单细胞转录组数据 新生成和已发表的多个小鼠和人类前列腺单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
106 2026-05-06
SenPred: a single-cell RNA sequencing-based machine learning pipeline to classify deeply senescent dermal fibroblast cells for the detection of an in vivo senescent cell burden
2025-01-14, Genome medicine IF:10.4Q1
研究论文 基于单细胞RNA测序的机器学习管道SenPred,用于分类深层衰老的真皮成纤维细胞,以检测体内衰老细胞负荷 首次利用2D和3D培养的深层衰老成纤维细胞的单细胞转录组数据,构建机器学习模型预测衰老;发现3D模型比2D更准确检测体内衰老细胞 目前仅为概念验证,仅针对特定细胞类型(真皮成纤维细胞)和衰老触发条件,无法推广到其他组织(如肺成纤维细胞) 开发一个基于单细胞RNA测序的机器学习管道,以精准检测体内衰老成纤维细胞,助力衰老相关疾病研究 人类真皮成纤维细胞(2D和3D培养的深层衰老细胞,以及体内皮肤组织) 机器学习 老年疾病 单细胞RNA测序 机器学习管道(未指定具体模型类型,如CNN等,故输出NA) 单细胞转录组数据 未明确提及样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
107 2026-05-06
Single-Cell Transcriptomics Reveals Evolutionary Reconfiguration of Embryonic Cell Fate Specification in the Sea Urchin Heliocidaris erythrogramma
2025-01-06, Genome biology and evolution IF:3.2Q2
研究论文 利用单细胞转录组学揭示了海胆物种Heliocidaris erythrogramma胚胎细胞命运决定的进化重构 首次通过跨物种单细胞转录组时间序列分析,识别出海洋无脊椎动物发育调控网络的进化变化,发现主要生命史转变中细胞命运决定的时空分离 主要基于表达相关性推断调控相互作用,缺乏直接的实验验证,且仅比较了两个物种的祖先和衍生状态 研究胚胎发育中细胞命运决定的进化变化及其与表型多样性的关联 两种海胆:Heliocidaris erythrogramma(衍生状态)和Lytechinus variegatus(祖先状态)的胚胎细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 两种海胆物种的多个发育时间点单细胞样本 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA NA
108 2026-05-06
Spatial transcriptome profiling identifies DTX3L and BST2 as key biomarkers in esophageal squamous cell carcinoma tumorigenesis
2024-12-18, Genome medicine IF:10.4Q1
研究论文 通过空间转录组分析鉴定DTX3L和BST2为食管鳞癌肿瘤发生的关键生物标志物 首次利用数字空间分析和单细胞空间转录组技术(CosMx SMI)系统描绘了食管鳞癌从正常组织到癌变的分子和免疫变化全景,并发现DTX3L和BST2作为潜在生物标志物 样本量较小(11例DSP患者和4例SMI患者),且局限于早期食管鳞癌(pT1期),可能无法完全代表所有阶段的肿瘤异质性 揭示食管鳞癌恶性转化过程中的转录和免疫变化,并鉴定具有临床意义的生物标志物 早期食管鳞癌(pT1)患者的组织样本,包括正常组织、低度和高度不典型增生及癌组织 数字病理学 食管鳞癌 数字空间分析(DSP)、单细胞空间转录组学(CosMx SMI)、免疫组化(IHC)、批量RNA测序、单细胞RNA测序 NA 空间转录组数据、单细胞转录组数据、图像(IHC) 11例pT1 ESCC患者用于DSP,4例用于SMI,20例用于IHC NanoString, 10x Genomics 空间转录组学, 单细胞RNA测序 CosMx Spatial Molecular Imaging (SMI)系统, 10x Chromium CosMx SMI用于单细胞空间转录组分析,10x Chromium用于单细胞RNA测序
109 2026-05-06
Interactions between polycyclic aromatic hydrocarbons and genetic variants in the cGAS-STING pathway affect the risk of colorectal cancer
2024-12, Archives of toxicology IF:4.8Q1
研究论文 探究多环芳烃与cGAS-STING通路遗传变异对结直肠癌风险的交互作用 首次发现cGAS-STING通路中TRAF2基因的rs3750511位点与多环芳烃暴露存在负交互作用,影响结直肠癌风险 因果关系需进一步验证,且未涉及其他环境因素或更大样本量的验证 研究cGAS-STING通路遗传变异与多环芳烃暴露的交互作用对结直肠癌风险的影响 结直肠癌患者和正常对照组织样本及细胞系 机器学习 结直肠癌 RNA-seq NA RNA-seq数据 未明确说明样本量 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
110 2026-05-06
Integrated analyses of multi-omic data derived from paired primary lung cancer and brain metastasis reveal the metabolic vulnerability as a novel therapeutic target
2024-11-26, Genome medicine IF:10.4Q1
研究论文 对配对的原发性肺癌和脑转移样本进行多组学整合分析,揭示代谢脆弱性作为新型治疗靶点 整合基因组、转录组、蛋白质组、代谢组和单细胞RNA测序数据,发现脑转移瘤中线粒体特异性代谢激活而免疫微环境抑制,并提出氧化磷酸化靶向联合免疫治疗的新策略 未提及明显局限性,但样本规模有限且主要基于回顾性队列 揭示肺癌脑转移的分子机制和肿瘤微环境,寻找新的治疗靶点 154名患者的配对和未配对原发性肺癌及脑转移样本,涵盖四个已发表和两个新生成的队列 数字病理学 肺癌 NGS, RNA-seq, 蛋白质组学, 代谢组学, 单细胞RNA测序 NA 基因组、转录组、蛋白质组、代谢组、单细胞RNA测序数据 154名患者的配对和未配对样本 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
111 2026-05-06
Integrated single-cell analysis reveals distinct epigenetic-regulated cancer cell states and a heterogeneity-guided core signature in tamoxifen-resistant breast cancer
2024-11-18, Genome medicine IF:10.4Q1
研究论文 通过整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序分析,揭示了他莫昔芬耐药乳腺癌中表观遗传调控的癌细胞状态和异质性核心特征 首次整合单细胞转录组和染色质可及性分析,全面描绘他莫昔芬耐药乳腺癌的肿瘤异质性,并定义了特定癌细胞状态和异质性核心特征 未提及明显的局限性信息 探索他莫昔芬耐药乳腺癌中肿瘤异质性的表观遗传调控机制 他莫昔芬耐药乳腺癌患者肿瘤组织及正常乳腺组织 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 整合分析 NA 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据 超过80,000个乳腺组织细胞,来自2个正常组织、3个原发性肿瘤和3个他莫昔芬治疗后复发肿瘤 10x Genomics 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3', 10x Chromium Single Cell ATAC
112 2026-05-06
Efficacy and safety of novel multiple-chain DAP-CAR-T cells targeting mesothelin in ovarian cancer and mesothelioma: a single-arm, open-label and first-in-human study
2024-11-15, Genome medicine IF:10.4Q1
研究论文 本研究评估了靶向间皮素的新型多链DAP-CAR-T细胞在卵巢癌和间皮瘤中的安全性和有效性,并进行了首次人体临床试验 首次在人体中验证多链DAP-CAR结构(结合NK细胞免疫球蛋白样受体截短体和DAP12)可增强CAR-T细胞对实体瘤的安全性和疗效,并通过单细胞测序揭示治疗过程中免疫细胞动态变化 单臂、开放标签设计可能导致偏倚;样本量较小(仅8例患者);未设对照组;长期疗效和毒性数据尚不充分 评估靶向MSLN的多链DAP-CAR-T细胞疗法在MSLN阳性实体瘤(卵巢癌和间皮瘤)中的安全性和抗肿瘤疗效 间皮素阳性卵巢癌和间皮瘤患者 细胞治疗、肿瘤免疫学 卵巢癌、间皮瘤 CAR-T细胞治疗、单细胞测序 DAP-CAR-T细胞(多链结构) 单细胞转录组数据、临床疗效数据 8例MSLN表达阳性的患者 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台用于分析患者治疗过程中免疫细胞动态
113 2026-05-06
Multidimensional profiling of human T cells reveals high CD38 expression, marking recent thymic emigrants and age-related naive T cell remodeling
2024-10-08, Immunity IF:25.5Q1
研究论文 通过多维分析人类T细胞,揭示CD38高表达标志着近期胸腺迁出细胞和与年龄相关的初始T细胞重塑 首次通过单细胞RNA-seq/ATAC-seq数据结合CD38蛋白表达精确定义人类近期胸腺迁出细胞(RTE),并揭示CD38作为通用表面标志物的作用 未说明 明确人类近期胸腺迁出细胞的精确定义及其表面标志物,并研究初始T细胞随年龄的动态变化 人类T细胞,包括CD8和CD4近期胸腺迁出细胞及成熟细胞 机器学习 未指定 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 光谱细胞术 未指定 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据, 免疫表型数据 158名个体的队列 未说明 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq 未说明 未说明
114 2026-05-06
Spatial multiomics reveals a subpopulation of fibroblasts associated with cancer stemness in human hepatocellular carcinoma
2024-08-13, Genome medicine IF:10.4Q1
研究论文 本研究结合空间多组学技术,鉴定出一种与肝癌干细胞性相关的新型成纤维细胞亚群F5-CAF,并揭示了其在肿瘤微环境中的空间分布及促癌机制 首次通过空间转录组学、多区域蛋白质组学和多重成像技术联合分析,鉴定出与肝癌干细胞性相关的新型CAF亚群F5-CAF,并揭示了其在肿瘤巢内及周围的定位及与干细胞性肿瘤细胞的共定位关系 未提及 揭示癌症相关成纤维细胞在肝细胞癌肿瘤微环境中如何通过空间协调其他细胞群体促进癌症进展 肝细胞癌患者肿瘤组织中的成纤维细胞亚群 数字病理学 肝细胞癌 空间转录组学, 蛋白质组学, 多重成像 NA 空间转录组数据, 蛋白质组数据, 多重成像数据 6名患者24个样本用于蛋白质组学,11名患者25个样本用于空间转录组学,92名患者264个样本用于多重成像,5名患者用于细胞分离和功能验证 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Genomics Visium空间转录组学平台
115 2026-05-06
Microglial heterogeneity in the ischemic stroke mouse brain of both sexes
2024-08-02, Genome medicine IF:10.4Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析,揭示了缺血性中风小鼠大脑中小胶质细胞的异质性,并识别出七种潜在的中风相关小胶质细胞亚群 首次系统描述了缺血性中风后小胶质细胞的异质性,发现了可能代表长期寻找的中风诱导小胶质细胞亚群的巨噬细胞样簇,并证明了靶向STAT1信号通路可改善长期中风结局 未提及具体局限性 剖析永久性中风对小胶质细胞的影响,识别中风相关小胶质细胞亚群并探索潜在治疗靶点 年轻雄性和雌性小鼠的小胶质细胞 机器学习 缺血性中风 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 来自荧光报告小鼠的细胞,经pMCAO或假手术处理,具体样本量未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
116 2026-05-06
West Nile Virus-Induced Expression of Senescent Gene Lgals3bp Regulates Microglial Phenotype within Cerebral Cortex
2024-07-08, Biomolecules IF:4.8Q1
研究论文 研究西尼罗病毒感染后大脑皮层内衰老基因Lgals3bp的表达如何调控小胶质细胞表型 首次揭示西尼罗病毒感染激活的小胶质细胞与衰老小胶质细胞共享转录特征,并发现LGALS3BP在调节神经炎症和小胶质细胞活化中的新作用 NA 研究西尼罗病毒感染与小胶质细胞衰老之间的关系,重点关注LGALS3BP的作用 成年和老年小鼠的西尼罗病毒脑炎恢复期大脑皮层及Lgals3bp基因敲除小鼠 数字病理学 西尼罗病毒脑炎 空间转录组学、RNA测序、流式细胞术 NA 基因表达数据 成年和老年小鼠及Lgals3bp基因敲除小鼠 NA 空间转录组学 NA NA
117 2026-05-06
Single-cell transcriptomics reveals evolutionary reconfiguration of embryonic cell fate specification in the sea urchin Heliocidaris erythrogramma
2024-May-01, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过单细胞转录组分析揭示了海胆物种Heliocidaris erythrogramma在胚胎细胞命运决定过程中的进化重组 利用海胆发育进化中的自然实验,通过比较单细胞RNA测序发育时间序列,揭示了胚胎模式化中广泛的进化变化,包括细胞命运决定和信号中心在空间和时间上的分离 未提及具体局限性 识别发育机制中的进化变化,特别是与生活史转变相关的胚胎模式化改变 海胆物种Heliocidaris erythrogramma及其近缘种(代表衍生和祖先状态) 机器学习 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 多个发育时间点的海胆胚胎细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
118 2026-05-06
Single-cell multi-omic analysis of the vestibular schwannoma ecosystem uncovers a nerve injury-like state
2024-01-12, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过单细胞多组学分析揭示了前庭神经鞘瘤生态系统中的神经损伤样状态 首次描绘了前庭神经鞘瘤的细胞异质性和肿瘤微环境景观,发现了修复样和MHC-II抗原呈递施万细胞与髓系细胞浸润的关联,提出了神经损伤样过程的机制 样本量有限,且单细胞ATAC-seq和全外显子组测序的配对样本较少 探究前庭神经鞘瘤的细胞异质性和肿瘤微环境如何影响其发病机制 前庭神经鞘瘤肿瘤组织及其中的施万细胞、基质细胞和免疫细胞 数字病理学 前庭神经鞘瘤 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 全外显子组测序 NA 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据, 外显子组数据 15个前庭神经鞘瘤样本,其中6个有配对单细胞ATAC-seq数据,12个有全外显子组测序数据,另有175个肿瘤的RNA表达数据用于去卷积分析 NA 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 NA NA
119 2026-05-06
Investigating cellular similarities and differences between upper tract urothelial carcinoma and bladder urothelial carcinoma using single-cell sequencing
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 利用单细胞测序探究上尿路尿路上皮癌与膀胱尿路上皮癌的细胞相似性和差异 首次利用单细胞RNA测序综合分析上尿路尿路上皮癌与膀胱尿路上皮癌微环境中不同细胞亚群的转录差异,揭示两者在免疫景观和细胞功能表型上的显著差异,并发现MARCKS促进上尿路尿路上皮癌进展 样本量较小(仅3例上尿路尿路上皮癌和4例正常输尿管组织),且依赖公开数据集进行比较,可能影响结果的普适性 探索上尿路尿路上皮癌的分子过程,并鉴定其与膀胱尿路上皮癌之间的生物学差异 上尿路尿路上皮癌和膀胱尿路上皮癌的肿瘤组织及正常输尿管组织 数字病理学 泌尿系统癌症 单细胞RNA测序, RNA测序, 免疫组织化学 NA 单细胞转录组数据, 转录组数据, 图像 3例上尿路尿路上皮癌和4例正常输尿管组织 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
120 2026-05-06
Screening and validation of atherosclerosis PAN-apoptotic immune-related genes based on single-cell sequencing
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 基于单细胞测序筛选并验证动脉粥样硬化PAN-凋亡免疫相关基因 首次在单细胞水平筛选出与颈动脉粥样硬化(CAS)相关的PAN-凋亡小体诊断基因,并构建诊断模型 未提及明确局限性 筛选与颈动脉粥样硬化相关的PAN-凋亡小体诊断基因 颈动脉粥样硬化患者样本及正常对照样本 机器学习 动脉粥样硬化 单细胞测序, RT-qPCR LASSO回归, 随机森林 转录组数据, 单细胞核测序数据 未明确说明具体样本量 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞核测序 NA NA
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