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当前共找到 33163 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-11-26 |
Rapid canalization of chromosome conformation-transcription fingerprints during embryogenesis revealed by fully-automated cell identity decoding with CeSCALE
2025-Oct-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.22.684035
PMID:41279329
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研究论文 | 开发了CeSCALE算法结合单细胞基因组学，揭示胚胎发育过程中染色体构象-转录指纹的快速稳定遗传机制 | 基于最优传输理论开发了首个全自动细胞谱系识别算法CeSCALE，结合单分子染色体追踪技术发现局部构象-转录指纹沿细胞谱系稳定遗传 | 研究主要聚焦胚胎发育早期阶段，尚未验证在其他发育阶段或疾病状态下的普适性 | 探究胚胎发育过程中染色体构象与转录活性关系的遗传机制 | 胚胎发育过程中的细胞谱系和单细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞基因组学, 单分子染色体追踪, 单细胞转录组学 | 最优传输理论, CeSCALE算法 | 基因组构象数据, 转录组数据 | 胚胎发育过程中的多个细胞谱系 | NA | 单细胞基因组学, 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 102 | 2025-11-26 |
Cardiomyocyte-specific plakophilin-2 loss is sufficient to induce aging and senescence of nonmyocytes. Relevance to arrhythmogenic cardiomyopathy
2025-Oct-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.22.682160
PMID:41279511
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研究论文 | 本研究通过心肌细胞特异性PKP2敲除模型，首次证实仅心肌细胞中plakophilin-2缺失足以诱导非心肌细胞衰老和心脏整体早衰 | 首次将细胞衰老和早衰机制与桥粒性心律失常心肌病相关联，揭示了心肌细胞基因缺陷通过旁分泌机制引发非心肌细胞衰老的新路径 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证；衰老机制的具体信号通路尚未完全阐明 | 探究PKP2缺陷是否仅通过心肌细胞即可引发非心肌细胞衰老和心脏早衰 | 心肌细胞特异性PKP2敲除小鼠模型中的心肌细胞和非心肌细胞 | 心血管疾病研究 | 心律失常性心肌病 | 多重成像、细胞因子阵列、表观遗传时钟、空间转录组学、扩展显微镜、结构照明显微镜 | 基因敲除小鼠模型 | 图像、转录组、蛋白质组、表观遗传数据 | PKP2cKO小鼠模型，具体数量未明确说明 | NA | 空间转录组学、多重免疫组化 | NA | NA |
| 103 | 2025-11-26 |
Epithelial-Mesenchymal Transition is Associated with Altered Immune Composition and Cytotoxic Function in Triple-Negative Breast Cancer
2025-Oct-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.22.683714
PMID:41280107
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析三阴性乳腺癌中上皮-间质转化与肿瘤免疫微环境的关系 | 首次系统揭示了EMT谱系与免疫细胞组成和功能的梯度变化关系，特别是中间EMT状态的免疫特征 | 研究基于小鼠4T1肿瘤细胞系，需要在人类肿瘤样本中进一步验证 | 探索三阴性乳腺癌中上皮-间质转化状态与肿瘤免疫微环境的关联 | 从4T1小鼠乳腺肿瘤细胞系建立的五个单细胞克隆群体及其衍生的肿瘤 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 五个单细胞克隆群体及其衍生的肿瘤 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 104 | 2025-11-26 |
Glutamine synthetase loss in β-catenin-mutant hepatocellular carcinoma promotes tumor burden through macrophage metabolic reprogramming
2025-Oct-23, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001591
PMID:41129335
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研究论文 | 本研究探讨β-连环蛋白突变肝细胞癌中谷氨酰胺合成酶缺失如何通过巨噬细胞代谢重编程促进肿瘤负荷 | 首次揭示肿瘤细胞GS缺失后巨噬细胞通过代谢适应维持mTOR激活的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证仍需进一步研究 | 阐明β-连环蛋白突变肝癌中谷氨酰胺合成酶缺失对肿瘤进展的影响机制 | 肝细胞癌小鼠模型和TCGA数据库中的肝癌患者数据 | 癌症代谢研究 | 肝细胞癌 | 单细胞空间转录组学，基因条件性敲除，巨噬细胞清除 | 基因工程小鼠模型 | 转录组数据，组织学数据 | TCGA数据库中的CTNNB1突变肝癌患者和小鼠肿瘤模型 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 105 | 2025-11-26 |
Exploring microRNAs, One Cell at a Time
2025-Oct-22, Non-coding RNA
IF:3.6Q2
DOI:10.3390/ncrna11060073
PMID:41283328
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研究论文 | 本文探讨了单细胞水平下microRNA的分析方法和计算工具 | 开发了用于分析细胞特异性miRNA丰度的实验工具和计算方法 | NA | 揭示miRNA生物学的复杂性并增进对生命科学和疾病的理解 | microRNAs (miRNAs) | 生物信息学 | NA | 单细胞测序, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 106 | 2025-11-26 |
Transcriptomic Profiling of Bronchial Epithelium Reveals Dysregulated Interferon and Inflammatory Responses to Rhinovirus in Exacerbation-Prone Pediatric Asthma
2025-Oct-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.19.683298
PMID:41279354
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研究论文 | 本研究通过转录组分析揭示了易急性加重儿科哮喘患者支气管上皮对鼻病毒的干扰素和炎症反应失调机制 | 首次在器官型支气管上皮培养模型中结合bulk和单细胞转录组学，揭示了易急性加重哮喘儿童存在基线干扰素水平低下和细胞类型特异性反应异常 | 研究样本量有限，且为体外器官型培养模型，需在更大队列和体内模型中验证 | 阐明鼻病毒诱发哮喘急性加重的宿主易感性机制 | 哮喘儿童和健康儿童的支气管上皮细胞 | 转录组学 | 哮喘 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 靶向蛋白分析 | NA | 转录组数据, 蛋白质数据 | 特征明确的哮喘儿童和健康儿童的支气管上皮样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 107 | 2025-11-26 |
Modeling Alzheimer's Disease with APOE4 Neuron-Glial Brain Assembloids Reveals IGFBPs as Therapeutic Targets
2025-Oct-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.17.683162
PMID:41279729
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研究论文 | 本研究开发了一种模拟阿尔茨海默病的3D脑类组装体模型，揭示了IGFBP通路在疾病进展中的新作用 | 首次创建包含神经元、星形胶质细胞和小胶质细胞的3D类组装体模型，能够完整模拟阿尔茨海默病病理特征 | 模型仍需进一步验证其与人类疾病进展的完全一致性 | 开发能够准确模拟阿尔茨海默病进展的人类遗传背景模型，并探索治疗靶点 | iPSC来源的神经元、星形胶质细胞和小胶质细胞 | 疾病建模 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序，iPSC分化技术 | 3D类组装体模型 | 基因表达数据 | APOE4/4和同基因对照细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 108 | 2025-11-26 |
Gsx2 Regulates Oligodendrocyte Precursor Formation in the Zebrafish Spinal Cord
2025-Oct-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.18.683250
PMID:41279990
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术发现Gsx2基因在斑马鱼脊髓中调控少突胶质前体细胞形成的时间节点 | 首次在斑马鱼脊髓中发现pre-OPCs亚群，并揭示Gsx2通过调控基因网络控制OPC形成时机的新机制 | 研究局限于斑马鱼模型，在哺乳动物中的适用性需要进一步验证 | 探究Gsx2基因在斑马鱼脊髓少突胶质前体细胞形成中的调控机制 | 斑马鱼脊髓神经前体细胞和少突胶质前体细胞 | 发育生物学 | 神经系统发育疾病 | 单细胞RNA测序, 单核ATAC测序, CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据 | 斑马鱼胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 109 | 2025-11-26 |
Clinical Interventions and Inflammatory Signaling Shape the Transcriptional and Cellular Architecture of the Early Postnatal Lung
2025-Oct-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.17.683116
PMID:41278997
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序构建了早期出生后人类肺部的细胞图谱，揭示了肺泡2型细胞的两种新转录状态及其与炎症信号和临床干预的关联 | 发现了肺泡2型细胞两种先前未知且互斥的转录状态，建立了炎症信号与肺泡上皮转录状态转变的直接联系 | 样本数量有限（23例），仅涵盖0-2岁年龄段，组织样本均为组织学正常标本 | 探索早期出生后人类肺部的细胞结构和转录特征 | 人类早期出生后肺部组织（0-2岁） | 单细胞生物学 | 肺部疾病 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 23个个体的组织学正常肺部标本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 110 | 2025-11-26 |
Psychological stress and social support are associated with opposing single-cell pro-inflammatory gene regulatory mechanisms in adults
2025-Oct-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.14.682318
PMID:41278935
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术探索心理压力和社会支持对免疫细胞基因调控的影响机制 | 首次在单细胞水平揭示心理压力和社会支持对免疫细胞基因调控的相反作用机制 | 样本仅包含165名非裔美国成年人，年龄范围50-89岁，结果可能不适用于其他人群 | 探究心理压力和社会支持影响慢性炎症的分子机制 | 165名自报非裔美国成年人（50-89岁）的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 慢性炎症 | 单细胞RNA测序, 单细胞染色质可及性测序 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 165名成年人 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 111 | 2025-11-26 |
Activated fatty acid synthesis pathway in macrophages propagates pathogenic fibroblast expansion after myocardial infarction
2025-Oct-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.10.681697
PMID:41279812
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研究论文 | 本研究揭示心肌梗死后巨噬细胞中脂肪酸合成通路通过ACLY和FASN促进致病性成纤维细胞扩增的机制 | 首次发现心脏巨噬细胞通过脂肪酸合成通路调控成纤维细胞扩增，并阐明ACLY通过乙酰化调控促纤维化细胞因子IL-33产生的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究巨噬细胞脂肪酸合成通路在心肌梗死后炎症和心脏重塑中的作用 | 心肌梗死小鼠模型和人类心脏样本中的巨噬细胞与成纤维细胞 | 代谢组学与单细胞生物学 | 心血管疾病 | 空间代谢组学,CUT&RUN,RNA测序,单细胞RNA测序,空间多组学 | 基因敲除小鼠模型 | 代谢组数据,基因组数据,转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序,空间多组学 | NA | NA |
| 112 | 2025-11-26 |
ST2HE: A Cross-Platform Framework for Virtual Histology and Annotation of High-Resolution Spatial Transcriptomics Data
2025-Oct-13, ArXiv
PMID:41281202
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研究论文 | 提出ST2HE跨平台生成框架，能够从高分辨率空间转录组数据直接合成虚拟H&E图像 | 首次开发了基于一步扩散模型的跨平台框架，整合细胞核形态和空间转录坐标生成组织学忠实的虚拟H&E图像 | NA | 为高分辨率空间转录组数据开发标准化的组织学注释框架 | 乳腺癌、非小细胞肺癌和卡波西肉瘤组织样本 | 计算病理学 | 多种癌症 | 空间转录组学 | 扩散模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 高分辨率空间转录组学 | NA | NA |
| 113 | 2025-11-26 |
Innovations in spinal cord cell type heterogeneity across vertebrate evolution
2025-Oct-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.09.680955
PMID:41279330
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研究论文 | 比较鱼类、青蛙、小鼠和人类脊髓细胞类型在4.5亿年进化过程中的异同 | 首次系统比较脊椎动物脊髓细胞类型进化，发现发育阶段细胞类型高度保守而成年阶段兴奋性神经元亚群选择性分化的新规律 | 非哺乳动物脊髓高分辨率图谱数据相对缺乏 | 探究脊椎动物脊髓细胞类型异质性的进化起源和物种差异 | 鱼类、青蛙、小鼠和人类的脊髓组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 涵盖鱼类、青蛙、小鼠和人类多个物种的脊髓样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 114 | 2025-11-26 |
Transposable Elements and Homotypic Niches Drive Immune Dynamics and Resistance in Melanoma Epigenetic-based immunotherapy
2025-Oct-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.09.679175
PMID:41278906
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学和高分辨率空间转录组学分析，揭示了表观遗传免疫疗法如何重塑黑色素瘤生态系统 | 发现转座子元件激活和同型生态位驱动免疫动态，识别NFATC2作为神经嵴样表型的主调控因子和耐药促进因子 | 样本来源于单一临床试验队列，需要更大规模验证 | 探索表观遗传免疫疗法对黑色素瘤生态系统重塑的机制 | 黑色素瘤患者纵向活检样本 | 空间转录组学 | 黑色素瘤 | 单细胞多组学，空间转录组学 | 空间建模 | 单细胞多组学数据，空间转录组数据 | NIBIT-M4临床试验患者纵向活检样本 | NA | 单细胞多组学，空间转录组学 | NA | NA |
| 115 | 2025-11-26 |
Integrated single-cell whole genome sequencing and spatial transcriptomics reveal latent intra-tumoral heterogeneity in ovarian cancer
2025-Oct-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.08.676897
PMID:41279090
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞全基因组测序和空间转录组学技术，揭示了卵巢癌中潜在的瘤内异质性 | 首次将单细胞全基因组测序与空间转录组学相结合，在细胞水平鉴定出与恶性细胞群匹配的假二倍体细胞，并揭示了克隆进化过程中的基因组加倍和拷贝数变异 | 研究仅包含5例上皮性卵巢癌样本，样本量较小 | 探索卵巢癌瘤内异质性及其与疾病复发和治疗失败的关系 | 5例上皮性卵巢癌样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞全基因组测序,空间转录组学 | NA | 基因组测序数据,空间基因表达数据 | 5例卵巢癌样本 | NA | 单细胞全基因组测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 116 | 2025-11-26 |
Nutritional hyperketonemia by dietary medium-chain fatty acids is driven by the liver without contribution from the intestine
2025-Oct-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.08.681190
PMID:41279942
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研究论文 | 本研究通过基因敲除小鼠模型和细胞实验证明膳食中链脂肪酸诱导的营养性高酮血症主要由肝脏介导，肠道几乎不参与此过程 | 首次明确区分肝脏和肠道在膳食中链脂肪酸诱导酮体生成中的具体作用，挑战了通过门静脉代谢物测量推断肠道贡献的常规做法 | 研究主要聚焦于C8:0中链脂肪酸，其他类型中链脂肪酸的作用尚未验证；细胞实验可能无法完全模拟体内复杂环境 | 阐明膳食中链脂肪酸诱导营养性高酮血症的主要器官来源 | 基因敲除小鼠、原代肝细胞、人和小鼠肠道细胞系 | 代谢研究 | 代谢疾病 | RNA测序、细胞培养、代谢物测量 | 基因敲除动物模型 | 基因表达数据、代谢物浓度数据 | 多种基因型小鼠、原代细胞和细胞系 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 117 | 2025-11-26 |
A Single-Cell Atlas of Transcriptional and Immunoglobulin Repertoire Evolution in Early B Cell Development
2025-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.08.681095
PMID:41278878
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建早期B细胞发育过程中转录组和免疫球蛋白库演化的单细胞图谱 | 首次在pro-B细胞发育阶段发现每次重组事件后的增殖爆发，并详细描述了重链CDR3缩短和V/D/J基因使用变化等库特征演变 | 仅包含6名健康供体的样本，样本量相对有限 | 研究早期B细胞发育过程中转录组和免疫球蛋白库的演化规律 | 人类骨髓中的B细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序，NGS，生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 6名健康供体的65,110个B细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 118 | 2025-11-26 |
Optimal Gene Panel Selection for Targeted Spatial Transcriptomics Experiments
2025-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.08.681071
PMID:41279853
|
研究论文 | 提出了一种名为ReconST的新方法，用于自动设计空间转录组学分析中的最优基因面板 | 首次利用门控自编码器从scRNA-seq数据中自动选择最优基因子集，显著提升了空间转录组分析的效用 | 方法验证主要基于小鼠脑部MERFISH数据集，在其他组织和物种中的适用性需要进一步验证 | 解决空间转录组学实验中基因面板优化设计的挑战 | 基因面板选择和空间转录组分析 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 门控自编码器 | 基因表达数据，空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | MERFISH | 小鼠脑部高覆盖度MERFISH数据集 |
| 119 | 2025-11-26 |
Accelerating scRNA-seq Analysis: Automated cell type annotation using representation learning and vector search
2025-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.06.680787
PMID:41279915
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研究论文 | 提出一种基于表示学习和向量搜索的自动化单细胞RNA测序细胞类型注释服务 | 避免依赖预定义标记基因或组织特异性参考，通过反向搜索和向量相似性比较实现自动化细胞类型注释 | NA | 加速单细胞RNA测序数据分析中的细胞类型注释过程 | 10x Genomics单细胞基因表达样本中的细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 表示学习，向量搜索 | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞基因表达样本 |
| 120 | 2025-11-26 |
SpaDiff: Denoising for Sequence-based Spatial Transcriptomics via Diffusion Process
2025-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.07.681011
PMID:41280001
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研究论文 | 提出一种基于扩散过程的去噪方法SpaDiff，用于解决序列空间转录组学中的点交换噪声问题 | 首次将点交换噪声建模为扩散过程，通过模拟RNA分子位移并逆向还原其原始空间分布 | NA | 提高空间转录组数据的空间特异性和数据完整性 | 空间转录组数据中的RNA分子空间分布 | 空间转录组学 | NA | 扩散过程模型 | 扩散模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |