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当前共找到 35858 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-02-03 |
Single-Cell RNA Profiling of Ocular Adnexal Sebaceous Carcinoma Reveals a Complex Tumor Microenvironment and Identifies New Biomarkers
2025-Feb, American journal of ophthalmology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.ajo.2024.10.001
PMID:39393421
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研究论文 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术深入分析了眼附件皮脂腺癌的转录组特征，揭示了其复杂的肿瘤微环境，并鉴定了CALML5作为敏感的诊断标志物 | 首次在单细胞分辨率下对眼附件皮脂腺癌进行转录组分析，揭示了肿瘤微环境的细胞组成和分子通路变化，并发现CALML5作为新的生物标志物 | 样本量较小（仅6例患者标本），且为回顾性观察性病例系列研究，可能限制结果的普遍性 | 探究眼附件皮脂腺癌的肿瘤组成、转录特征及潜在治疗靶点，以推动医疗进展 | 眼附件皮脂腺癌患者标本（包括原发性肿瘤、Paget样扩散肿瘤及正常组织） | 数字病理学 | 眼附件皮脂腺癌 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据，免疫组织化学图像数据 | 6例患者标本（3例原发性肿瘤，2例Paget样扩散肿瘤，1例正常组织），共29,219个细胞；另加存档队列（28例OaSC，25例鳞状细胞癌和OSSN，12例基底细胞癌） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 102 | 2026-02-03 |
The critical role of endoplasmic reticulum stress and the stimulator of interferon genes (STING) pathway in kidney fibrosis
2025-Feb, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2024.10.021
PMID:39566842
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研究论文 | 本研究探讨了内质网应激和STING通路在肾脏纤维化中的关键作用 | 揭示了STING作为内质网应激的上游激活因子，并发现STING与PERK的物理相互作用，以及STING激动剂诱导PERK激活的新机制 | 内质网应激在肾脏疾病中的精确激活机制仍不完全清楚 | 研究内质网应激在肾脏疾病中的激活机制及其在肾脏纤维化中的作用 | 慢性肾脏病患者、小鼠急性及慢性肾损伤模型（顺铂、单侧输尿管梗阻、叶酸和TFAM敲除小鼠） | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 转录组学分析、空间转录组学 | NA | 转录组数据、空间转录组数据 | 慢性肾脏病患者及多种小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 103 | 2026-02-03 |
Single-Cell Transcriptomics Identifies Selective Lineage-Specific Regulation of Genes in Aortic Smooth Muscle Cells in Mice
2025-Feb, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.321482
PMID:39744838
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术，识别了小鼠主动脉平滑肌细胞中第二心场和心脏神经嵴谱系特异性基因的差异表达 | 首次在对照主动脉中探索了两种谱系来源的平滑肌细胞之间的转录组差异，并识别了谱系特异性上调基因 | 研究仅基于14周龄雄性小鼠，样本量有限，且未涉及疾病模型 | 探究主动脉平滑肌细胞中谱系特异性基因调控的差异 | 小鼠主动脉根部和升主动脉的平滑肌细胞 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 单核转座酶可及染色质测序, RNA原位杂交 | NA | 单细胞RNA测序数据, 染色质可及性数据, 空间表达数据 | 14只14周龄雄性小鼠（SHF追踪和CNC追踪各半） | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 104 | 2026-02-03 |
Opportunities and challenges in the application of single-cell transcriptomics in plant tissue research
2025-Feb, Physiology and molecular biology of plants : an international journal of functional plant biology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s12298-025-01558-6
PMID:40070535
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在植物组织研究中的应用、挑战及整合多源单细胞多模态数据的方法 | 总结了整合多源单细胞RNA测序和单细胞多模态数据的方法，以构建全面的细胞图谱并探索跨模态的因果关系和基因调控机制 | 单细胞RNA测序实验通常无法全面捕获所有细胞和基因，且单模态数据不足以解释细胞状态和系统变化 | 探讨单细胞转录组学在植物组织研究中的机遇与挑战，以及整合方法在揭示生物变化中的应用和价值 | 植物组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多模态 | NA | NA |
| 105 | 2026-02-03 |
A regularized Bayesian Dirichlet-multinomial regression model for integrating single-cell-level omics and patient-level clinical study data
2025-Jan-07, Biometrics
IF:1.4Q2
DOI:10.1093/biomtc/ujaf005
PMID:39887052
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研究论文 | 提出一种正则化贝叶斯狄利克雷-多项式回归框架，用于整合单细胞RNA测序数据与患者临床数据，以探究细胞类型丰度与临床变量之间的关系 | 引入新型分层树结构以识别不同细胞类型水平上的关联，并首次将正则化贝叶斯狄利克雷-多项式回归应用于单细胞与临床数据的整合分析 | 未明确说明模型对数据规模和质量的敏感性，且仅在三类疾病中验证，普适性有待进一步验证 | 开发一种整合单细胞组学数据与患者临床数据的方法，以揭示细胞类型丰度与临床变量之间的关联 | 肺纤维化、COVID-19和非小细胞肺癌患者的单细胞RNA测序数据及临床数据 | 单细胞组学 | 肺纤维化, COVID-19, 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序 | 正则化贝叶斯狄利克雷-多项式回归模型 | 单细胞RNA测序数据, 临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 106 | 2026-02-03 |
Analysis of head and neck cancer scRNA-seq data identified PRDM6 promotes tumor progression by modulating immune gene expression
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1596916
PMID:40936897
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据和IRIS3平台分析头颈鳞状细胞癌，发现PRDM6通过调节免疫基因表达促进肿瘤进展 | 首次发现组蛋白甲基转移酶PRDM6在肿瘤细胞增殖中的新作用，并揭示其通过诱导免疫应答基因表达促进肿瘤进展，同时建立了PRDM6与HPV阳性HNSCC的关联 | 未明确说明样本数量、具体技术平台细节以及实验验证的完整范围 | 探究头颈鳞状细胞癌的免疫机制，特别是HPV相关肿瘤中转录因子-免疫应答基因网络的作用 | 头颈鳞状细胞癌患者样本 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序 | IRIS3（细胞类型特异性调控网络推断工具） | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 107 | 2026-02-03 |
Lactylation-related gene AKR1A1 contributes to osteoporosis via metabolic-immune regulation: evidence from multi-omics integration, single-cell transcriptomics, and in vitro validation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1680305
PMID:41246341
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据、单细胞转录组学和体外验证，系统鉴定了与骨质疏松症中赖氨酸乳酰化相关的关键差异表达基因，并探讨了其在代谢-免疫调控轴中的潜在作用 | 首次将乳酰化修饰与骨质疏松症的代谢-免疫调控轴联系起来，并通过多组学整合、单细胞转录组学和体外实验验证，揭示了AKR1A1基因在疾病中的关键作用及其通过SPP1-CD44信号通路介导免疫细胞间通讯的新机制 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，体外实验仅使用了RAW264.7巨噬细胞系，缺乏体内动物模型验证和临床样本的直接验证 | 系统识别骨质疏松症中与赖氨酸乳酰化相关的关键差异表达基因，并探索其在疾病发病机制中的代谢和免疫调控作用 | 骨质疏松症相关的基因表达数据、乳酰化相关基因、RAW264.7巨噬细胞 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | 基因表达微阵列、单细胞RNA测序、qPCR、Western blot、免疫共沉淀 | 机器学习模型（113种组合） | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 五个骨质疏松症相关基因表达微阵列数据集和一个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 108 | 2026-02-03 |
Improved characterization of single-cell RNA-seq libraries with paired-end avidity sequencing
2024-Jul-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.10.602909
PMID:39026715
|
研究论文 | 本研究评估了Element Biosciences的亲和碱基化学测序技术在单细胞RNA-seq文库中准确测序通过同聚物引物区域的能力，并分析了其对读段比对和多聚腺苷酸化位点精确定量的影响 | 首次系统评估了Element Aviti平台的亲和碱基化学测序技术对单细胞RNA-seq中同聚物T区域的测序准确性，并开发了改进的接头修剪和比对流程 | 与单端比对相比，配对端比对并未持续提高读段映射率，且未排除其他新兴平台可能具有的类似性能 | 改进单细胞RNA-seq文库的特征分析，特别是多聚腺苷酸化位点的精确鉴定 | 单细胞RNA-seq文库 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA-seq, DNA测序 | NA | 测序数据 | NA | Element Biosciences, Illumina | 单细胞RNA-seq | Element Aviti | Element Aviti平台采用亲和碱基化学测序技术 |
| 109 | 2026-02-03 |
Single-cell RNA sequencing comparison of the human metastatic prostate spine tumor microenvironment
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102805
PMID:38341849
|
研究论文 | 本文提出了一种从前列腺癌患者临床样本中，从手术室到实验台进行单细胞处理的方案，并比较了人类转移性前列腺脊柱肿瘤的微环境 | 针对脊柱肿瘤组织异质性高、难以处理的特点，开发了从手术室到实验台的单细胞处理方案，用于骨性脊柱转移瘤的研究 | NA | 开发用于临床样本单细胞组学研究的方案，以识别预后标志物和治疗靶点 | 前列腺癌患者的脊柱转移瘤临床样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 110 | 2026-02-03 |
A deep learning adversarial autoencoder with dynamic batching displays high performance in denoising and ordering scRNA-seq data
2024-Mar-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109027
PMID:38361616
|
研究论文 | 本文提出了一种名为动态批处理对抗自编码器（DB-AAE）的深度神经网络生成框架，用于有效去噪和排序单细胞RNA测序数据 | DB-AAE直接捕获输入数据中的最优特征，增强特征保留能力，包括细胞类型特异性基因表达模式，并在去噪准确性和生物信号保留方面优于其他方法 | NA | 提高单细胞RNA测序数据的去噪质量和下游分析的可靠性 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 对抗自编码器 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 111 | 2026-02-03 |
Exercise mitigates flow recirculation and activates metabolic transducer SCD1 to catalyze vascular protective metabolites
2024-02-16, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj7481
PMID:38354249
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研究论文 | 本研究探讨了运动如何通过减少血流再循环并激活内皮SCD1酶来催化保护性脂质代谢物，从而改善血管健康 | 首次揭示了运动通过调节血流动力学（如减少主动脉弓小弯处的血流再循环）并激活内皮SCD1酶，催化产生抗炎脂质代谢物（油酸和棕榈油酸），为血管保护提供新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证；且SCD1的具体信号通路和长期效应需进一步探索 | 探究运动如何通过代谢转换器SCD1介导血管保护作用，并阐明其与血流动力学变化的关联 | 野生型小鼠、内皮特异性SCD1敲除小鼠、高脂饮食小鼠以及主动脉内皮细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 非靶向代谢组学分析、单细胞转录组学、计算机模拟分析、腺病毒转染 | NA | 代谢组数据、转录组数据、血流动力学模拟数据 | 小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 112 | 2026-02-03 |
Benchmarking algorithms for joint integration of unpaired and paired single-cell RNA-seq and ATAC-seq data
2023-10-24, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03073-x
PMID:37875977
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研究论文 | 本文对九种单细胞多组学数据整合方法进行了基准测试，评估了多组学数据在分析单模态数据中的指导作用以及从单模态数据中揭示峰-基因关联的能力 | 首次系统性地比较了现有单细胞多组学数据整合方法在整合未配对和配对的scRNA-seq与snATAC-seq数据方面的性能，并强调了多组学数据中足够细胞核数量对准确细胞类型注释的重要性 | 研究仅基于现有九种方法进行基准测试，可能未涵盖所有新兴整合方法；同时，结论可能受特定数据集和评估指标的限制 | 评估单细胞多组学数据整合方法在整合未配对和配对的scRNA-seq与snATAC-seq数据时的性能，以提供全面的细胞复杂性视图 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据、单核ATAC测序（snATAC-seq）数据以及配对的多组学数据 | 单细胞多组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单核ATAC测序（snATAC-seq）、多组学测序 | NA | 单细胞基因表达数据、染色质可及性数据、多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 113 | 2026-02-03 |
Immune disease risk variants regulate gene expression dynamics during CD4+ T cell activation
2022-06, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01066-3
PMID:35618845
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，探索了CD4+ T细胞激活过程中基因表达的遗传调控机制及其与免疫疾病风险变异的关联 | 首次在单细胞水平上系统性地绘制了CD4+ T细胞激活过程中基因表达的动态遗传调控图谱，并揭示了免疫疾病风险变异如何调控激活过程中的基因表达变化 | 研究仅针对健康个体，未直接验证疾病状态下的调控机制；样本量相对有限（119人），可能影响罕见变异的检测 | 探究遗传变异如何调控CD4+ T细胞激活过程中的基因表达动态变化，以解释免疫疾病的遗传易感性机制 | CD4+ T细胞 | 单细胞转录组学 | 免疫介导疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 119名健康个体的655,349个CD4+ T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 114 | 2026-02-02 |
A single cell transcriptomics-based analysis provides mechanistic insights into the chronic low-concentration effects on hematopoietic disruption in zebrafish(Danio rerio) by Antinomy
2026-Mar-01, Chemico-biological interactions
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.cbi.2025.111892
PMID:41519218
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了低浓度锑暴露对斑马鱼造血功能的慢性影响及其机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统解析低浓度锑暴露下斑马鱼造血细胞群体的变化，并阐明IL-17通路介导的炎症反应在锑毒性中的作用 | 研究仅基于斑马鱼模型，结果外推至哺乳动物或人类需谨慎；未探讨长期暴露后的恢复潜力 | 探究低浓度锑暴露对造血功能的慢性毒性效应及分子机制 | 斑马鱼（Danio rerio） | 单细胞组学 | 造血功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼暴露于0、5、50、500和5000 μg/L锑浓度28天 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 115 | 2026-02-02 |
Single-cell sequencing: accurate disease detection
2026-Feb, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04007-8
PMID:40819160
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在疾病检测中的应用，特别是在神经系统疾病早期诊断中的潜力 | 突破了传统测序的局限，能在单细胞水平分析基因组和转录组，清晰展示细胞间异质性 | 面临数据处理复杂和检测成本高的挑战 | 探讨单细胞测序技术如何实现疾病的早期和准确检测 | 神经系统疾病中的神经细胞 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 116 | 2026-02-02 |
Multi-omics characterization of cachexia-related genes reveals prognostic signatures and immune landscape in breast cancer
2026-Feb, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04025-6
PMID:40880013
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了恶病质相关基因在乳腺癌中的预后和免疫学意义，并构建了一个基于11个基因的预后模型 | 首次构建了一个基于恶病质相关基因的乳腺癌预后风险评分模型（CRSBC），并通过单细胞RNA-seq分析揭示了HCCS基因在乳腺癌细胞和巨噬细胞招募中的关键作用 | 研究主要基于TCGA等公共数据库数据，缺乏外部实验验证，且样本来源和临床特征可能存在异质性 | 探究恶病质相关基因在乳腺癌中的预后价值和免疫微环境中的作用 | 乳腺癌患者及其相关的恶病质相关基因 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 差异表达分析，加权基因共表达网络分析（WGCNA），LASSO-Cox回归，单细胞RNA-seq分析 | LASSO-Cox回归模型 | 基因表达数据，单细胞RNA-seq数据 | 基于TCGA-BRCA队列数据，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 117 | 2026-02-02 |
Immunomodulatory Mechanism of Baiyaojian Decoction on Periodontitis: Network Pharmacology, Single-Cell RNA Sequencing and Molecular Docking
2026-Feb, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71034
PMID:41605874
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研究论文 | 本研究通过网络药理学、单细胞RNA测序和分子对接，探讨了白药煎剂治疗牙周炎的免疫调节机制 | 首次整合网络药理学、单细胞RNA测序和分子对接技术，系统揭示白药煎剂治疗牙周炎的多成分、多靶点免疫调节机制 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验验证，缺乏体内动物模型或临床试验的进一步验证 | 探究白药煎剂治疗牙周炎的分子机制和免疫调节作用 | 牙周炎患者组织样本（来自GEO数据库的RNA-seq数据）及白药煎剂的活性成分 | 生物信息学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、分子对接、qRT-PCR、流式细胞术、ELISA | 网络药理学分析、细胞间通讯网络分析（CellChat）、细胞分化轨迹分析（monocle3） | 基因表达数据、分子结构数据 | 包含GSE16134（批量RNA-seq）、GSE152042和GSE171213（单细胞RNA-seq）等多个公共数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 118 | 2026-02-02 |
A Glucose-Responsive Intelligent Antibacterial and Oxygen-Producing Hydrogel Promotes the Healing of Diabetic Wounds by Regulating Cellular Heterogeneity
2026-Jan-31, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202517028
PMID:41619261
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研究论文 | 本研究开发了一种葡萄糖响应型智能抗菌产氧水凝胶CF-CPGaMPN，用于促进糖尿病感染伤口的愈合 | 通过结合PVP@CaO纳米颗粒、过氧化氢酶和GaMPN纳米颗粒，实现了葡萄糖触发的按需药物释放，并利用单细胞RNA测序分析了伤口周围的多细胞生态系统 | NA | 开发一种智能水凝胶以促进糖尿病感染伤口的愈合 | 糖尿病感染伤口及其周围的多细胞生态系统 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 119 | 2026-02-02 |
COL14A1 drives ischemic cardiac injury in PCOS: an artificial intelligence-identified biomarker
2026-Jan-31, QJM : monthly journal of the Association of Physicians
DOI:10.1093/qjmed/hcag033
PMID:41619759
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据与人工智能方法，鉴定出COL14A1是多囊卵巢综合征与缺血性心肌病共享的关键生物标志物，并揭示了其在免疫-纤维化轴中的作用机制 | 首次通过整合多组学数据与105种机器学习模型组合，系统鉴定出连接PCOS与缺血性心脏损伤的共享生物标志物COL14A1，并利用单细胞及空间转录组学解析其细胞特异性与组织定位 | 研究结论主要基于生物信息学分析与体外数据，缺乏体内实验验证；候选药物罗非昔布的疗效尚未经过临床验证 | 鉴定PCOS与缺血性心肌病之间的共享诊断生物标志物并阐明其生物学基础 | 多囊卵巢综合征患者与缺血性心肌病患者的转录组数据 | 机器学习 | 心血管疾病 | 转录组测序，单细胞RNA测序，空间转录组学，分子对接 | Elastic Net | 基因表达数据 | 来自多个GEO队列的PCOS与ICM转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 120 | 2026-02-02 |
A spectral dimension reduction technique that improves pattern detection in multivariate spatial data
2026-Jan-31, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag052
PMID:41619788
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研究论文 | 本文介绍了一种用于多变量空间转录组学数据模式识别的统计方法，通过构建低维特征空间投影来最大化空间依赖性度量Moran's I | 提出了一种无需参数调优的算法，能有效减少非空间变异并优于主成分分析预处理，同时提供校准的空间基因表达测试 | NA | 提高多变量空间数据中模式检测的准确性 | 多变量空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 统计降维算法 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |