单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 38991 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-05-02 |
Tumor-infiltrating natural killer cell profiling for therapeutic stratification in patients with resectable non-small cell lung cancer
2026-Mar-04, The Journal of thoracic and cardiovascular surgery
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.jtcvs.2026.02.030
PMID:41791482
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析肿瘤浸润自然杀伤细胞亚群，为可切除非小细胞肺癌患者提供治疗分层策略 | 首次识别出与吸烟和慢性阻塞性肺疾病严重程度相关的两种自然杀伤细胞亚群（应激响应型和适应性免疫调节型），并揭示其在不同治疗策略中的预后预测价值 | NA | 识别与吸烟相关的免疫细胞决定因素，以指导可切除非小细胞肺癌患者的治疗策略 | 非小细胞肺癌患者肿瘤组织及免疫微环境中的自然杀伤细胞 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 61例肺组织用于单细胞测序，19例浸润性肺腺癌用于验证，102例和24例非小细胞肺癌患者用于批量RNA测序分析 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 102 | 2026-05-02 |
Inhibition of 5αR2 promotes postoperative wound repair in BPH patients after TURP by alleviating fibrosis and inflammation
2026-03-01, Asian journal of andrology
IF:3.0Q1
DOI:10.4103/aja202561
PMID:41147439
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研究论文 | 探究5αR2抑制剂促进良性前列腺增生患者经尿道前列腺切除术后伤口修复的机制，通过减轻纤维化和炎症 | 首次结合临床试验和动物模型，从单细胞层面揭示5αR2抑制通过减少炎症、抑制纤维化和促进尿路上皮再生来加速术后修复 | 临床试验样本量较小（87例），动物模型为12只比格犬，且分子标志物分析依赖特定技术（如单细胞RNA测序），结果可能缺乏普适性 | 评估5αR2抑制剂对良性前列腺增生患者TURP术后伤口愈合、炎症控制和纤维化减少的影响 | 良性前列腺增生患者及比格犬模型 | 机器学习 | 良性前列腺增生 | 单细胞RNA测序、酶联免疫吸附测定（ELISA）、组织学分析 | NA | 基因表达数据、组织学图像 | 87例患者（47例治疗组、42例安慰剂组）和12只比格犬 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 103 | 2026-05-02 |
stGrads: decoding spatial gene expression gradients through proximity-driven analysis in complex tissues
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag201
PMID:42061906
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研究论文 | 提出stGrads计算框架，通过空间邻近分析和衰减信号传播，解码复杂组织中基因表达的空间梯度 | 首次将空间邻近建模与衰减信号传播相结合，同时分析基因表达和细胞组成层面的空间梯度，并识别梯度相关基因 | NA | 开发通用计算工具以量化特定细胞类型对组织微环境的空间影响 | 空间转录组数据中的基因表达梯度与细胞组成变化 | 计算生物学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 多个空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 104 | 2026-05-02 |
Loss of miR-29a/b1 cluster reprograms the tumor microenvironment and contributes to immunosuppression in lung cancer
2026-Feb-25, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-1060
PMID:41739590
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研究论文 | 发现miR-29a/b1簇缺失会重塑肺癌肿瘤微环境并导致免疫抑制 | 首次揭示miR-29家族通过调控ATX及其他靶基因影响抗PD-1治疗耐药性，并证明恢复miR-29表达可重编程肿瘤免疫微环境 | 基于小鼠模型和公共数据分析，缺乏大规模临床验证 | 探究肺癌抗PD-1治疗耐药的分子机制 | Kras/p53驱动的肺癌小鼠模型及肺癌患者肿瘤样本 | 癌症免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Kras/p53驱动的肺癌小鼠模型及肺癌患者肿瘤公共数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 105 | 2026-05-02 |
Temporal and Spatial Gene Expression Dynamics in Neonatal HI Hippocampus with Focus on Arginase
2026-Jan-28, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15030253
PMID:41677619
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研究论文 | 利用空间单细胞转录组学分析新生小鼠缺氧缺血后海马中与精氨酸酶相关的时间与空间基因表达动态 | 首次在新生小鼠缺氧缺血模型中通过空间分辨单细胞转录组学（seqFISH）揭示微胶质细胞从早期效应吞噬到晚期的纤维化重塑转变，并发现精氨酸酶-1（ARG1）相关信号通路的关键调控作用 | 未提及 | 表征新生小鼠缺氧缺血后微胶质细胞中精氨酸酶-1相关的通路，识别不同阶段的效应吞噬和纤维化进程 | 新生小鼠（P9）海马组织 | 空间转录组学, 计算生物学 | 缺氧缺血性脑损伤 | seqFISH（空间分辨单细胞转录组学） | NA | 基因表达数据 | 新生小鼠（P9）脑样本，评估时间点为缺氧缺血后24小时（D1）和5天（D5） | NA | 单细胞RNA测序（空间转录组学） | NA | NA |
| 106 | 2026-05-02 |
Tumor-infiltrating natural killer cell profiling for therapeutic stratification in patients with resectable non-small cell lung cancer
2026-Jan-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.01.696292
PMID:41509400
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research paper | 通过对肿瘤浸润自然杀伤细胞的单细胞RNA测序分析，研究吸烟相关的免疫细胞特征在可切除非小细胞肺癌患者治疗分层中的作用 | 首次鉴定出两种与吸烟和慢性阻塞性肺病严重程度相关的自然杀伤细胞亚型（应激反应性NK细胞和适应性免疫调节NK细胞），并揭示它们在不同治疗策略中的预测价值 | 样本量相对较小，且为回顾性研究，需要前瞻性队列验证；此外，未明确NK细胞亚型的功能机制 | 寻找吸烟相关的免疫细胞决定因素，以指导非小细胞肺癌患者的治疗策略优化 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤组织和免疫细胞 | machine learning | lung cancer | single-cell RNA sequencing, bulk RNA sequencing | NA | sequencing data | 61份肺组织用于单细胞RNA测序，19份浸润性肺腺癌样本用于验证，102份手术切除的非小细胞肺癌和24例新辅助化疗免疫治疗患者样本用于反卷积和结果分析 | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 107 | 2026-05-02 |
Single-Cell Transcriptomics and Integrated Bioinformatic Analysis Reveal Critical Biomarkers and Immune Infiltration Characteristics in Osteoarthritis
2026, Genetics research
IF:1.4Q4
DOI:10.1155/genr/1174568
PMID:41502501
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学和生物信息学分析揭示骨关节炎的关键生物标志物和免疫浸润特征 | 首次结合单细胞RNA测序和综合生物信息学分析，鉴定出NR4A2、BMP1和AVPR1A等关键基因作为骨关节炎的诊断标志物和治疗靶点，并通过分子对接发现贝沙罗汀具有潜在的结合亲和力 | 研究主要基于公共数据集，样本来源有限，且分子对接结果需要进一步的实验验证 | 探究骨关节炎的细胞异质性和分子机制，发现新的生物标志物和治疗靶点 | 骨关节炎患者和正常个体的软骨样本 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序、生物信息学分析、分子对接 | NA | 基因表达数据 | 从公共数据集中获取的软骨样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 108 | 2026-05-02 |
Integrated Mendelian Randomization and Single-Cell RNA Sequencing Analyses Reveal Lactate Metabolism as a Key Pathway in COVID-19-Induced Pulmonary Fibrosis
2026, Canadian respiratory journal
IF:2.1Q3
DOI:10.1155/carj/1049336
PMID:41532065
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研究论文 | 本研究整合孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序技术，揭示乳酸代谢是COVID-19诱发肺纤维化的关键通路 | 首次通过MR和scRNA-seq联合分析揭示乳酸代谢在COVID-19相关肺纤维化中的中介作用，并鉴定SLC16A4为关键乳酸转运基因 | 未明确提及具体局限性，但可能包括样本量有限、因果推断需进一步验证等常见限制 | 探究COVID-19诱发肺纤维化的分子机制及潜在治疗靶点 | COVID-19患者与特发性肺纤维化(IPF)的因果关系及肺上皮细胞中的乳酸代谢机制 | 机器学习 | 肺纤维化 | 孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 109 | 2026-05-02 |
Research Progress of Interstitial Lung Disease Based on Single-Cell Sequencing Technology
2026, Canadian respiratory journal
IF:2.1Q3
DOI:10.1155/carj/8863968
PMID:41641446
|
综述 | 基于单细胞测序技术的间质性肺疾病研究进展综述 | 利用单细胞测序技术揭示间质性肺疾病发生发展的复杂机制，为传统研究方法无法完全解析的领域提供新思路 | NA | 总结单细胞测序技术在特发性肺纤维化、尘肺病和结缔组织病相关间质性肺疾病中的最新研究进展，并概述未来研究重点 | 间质性肺疾病，包括特发性肺纤维化、尘肺病和结缔组织病相关间质性肺疾病 | 机器学习 | 间质性肺疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 110 | 2026-05-02 |
The Evolution of Gene Sequencing Technologies: Unveiling Genetic Architecture of Nonsyndromic Orofacial Clefts
2026, Genetics research
IF:1.4Q4
DOI:10.1155/genr/3754674
PMID:42017915
|
综述 | 综述了测序技术发展历程中非综合征性口面部裂的遗传易感基因和位点识别进展 | 系统梳理了从Sanger测序到新兴多组学整合技术对非综合征性口面部裂遗传研究范式的转变，强调从易感性定位向机制解析的转变 | 未提及具体研究限制，但综述性质本身不涉及直接实证研究 | 综述非综合征性口面部裂遗传易感基因与位点的识别进展 | 非综合征性口面部裂的遗传因素 | 自然语言处理 | 儿科疾病 | Sanger测序, 二代测序, 三代测序, 表观基因组学, 单细胞测序, 空间组学, 多组学整合 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 111 | 2026-05-02 |
Role of dual specificity phosphatase 1 in influencing inflammatory pathways in macrophages modulated by Borrelia burgdorferi lipoproteins
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1766756
PMID:42023246
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研究论文 | 本研究利用多组学方法揭示了博氏疏螺旋体脂蛋白通过调节双特异性磷酸酶1影响巨噬细胞炎症通路的机制 | 首次整合单细胞RNA测序和蛋白质组学方法系统解析博氏疏螺旋体脂蛋白诱导的巨噬细胞信号网络，并发现DUSP1是脂蛋白驱动先天免疫反应的关键调节因子 | 研究仅使用了纯化脂蛋白刺激的鼠源骨髓来源巨噬细胞，未考虑完整病原体感染的复杂性 | 阐明博氏疏螺旋体脂蛋白在巨噬细胞中激活的信号通路及其调控机制 | 鼠源骨髓来源巨噬细胞 | 机器学习和数字病理学 | 莱姆病 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、药理学抑制、海马细胞外通量分析 | NA | 基因表达数据和蛋白质组数据 | 不同浓度脂蛋白处理的鼠源骨髓来源巨噬细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium平台用于单细胞RNA测序建库 |
| 112 | 2026-05-02 |
Single-cell transcriptomics of bronchoalveolar lavage reveals divergent macrophage subpopulations and trajectories in interstitial lung disease
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0347852
PMID:42054404
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学分析支气管肺泡灌洗液，揭示间质性肺疾病中不同的巨噬细胞亚群及其分化轨迹 | 首次在单细胞分辨率下全面表征了不同间质性肺疾病亚型的支气管肺泡灌洗液免疫细胞组成，并揭示了与端粒长度相关的巨噬细胞亚群变化 | 样本量较小（24例男性患者），且仅包括男性，可能限制结果的普适性 | 表征不同间质性肺疾病中支气管肺泡灌洗液的免疫细胞群体，并探究外周血白细胞端粒长度缩短对免疫谱的影响 | 来自间质性肺疾病患者的支气管肺泡灌洗液样本 | 单细胞转录组学 | 间质性肺疾病（包括特发性肺纤维化、过敏性肺炎、结节病和矽肺） | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 24例男性患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 113 | 2026-05-02 |
The Role of Chemokine-Related Genes in Diffuse Large B-Cell Lymphoma Prognosis and Tumor Microenvironment Characteristics
2026, Analytical cellular pathology (Amsterdam)
DOI:10.1155/ancp/6659091
PMID:42060374
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research paper | 本研究探讨了趋化因子相关基因在弥漫性大B细胞淋巴瘤预后和肿瘤微环境特征中的作用，并构建了一个预后风险模型 | 首次利用趋化因子相关基因构建DLBCL预后风险模型，并结合单细胞测序分析其与免疫细胞类型的关联 | NA | 探索趋化因子相关基因对DLBCL预后和免疫微环境的影响 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者 | machine learning | diffuse large B-cell lymphoma | Lasso-Cox回归分析、单细胞测序 | Lasso-Cox回归风险模型 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 114 | 2026-05-02 |
Single-cell RNA sequencing of healthy and diseased rat temporomandibular joint condyle cartilage
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0348175
PMID:42060618
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析健康和骨关节炎大鼠颞下颌关节髁突软骨的细胞组成及变化 | 首次揭示TMJ软骨中纤维细胞和软骨细胞亚群的异质性，并发现多效蛋白在增殖区软骨细胞祖细胞中的独特表达 | 研究仅限于大鼠模型，结果需在人类样本中验证 | 探索颞下颌关节骨关节炎的细胞病理变化 | 成年大鼠颞下颌关节髁突软骨 | 机器学习和生物信息学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 健康和OA诱导的成年大鼠若干（具体未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 115 | 2026-05-02 |
From Raw Data to Biological Insights: A Practical Guide for Spatial Transcriptomics Analysis in R and Python
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5027-1_12
PMID:42062686
|
综述 | 介绍从原始数据到生物学洞察的空间转录组学分析实用指南，涵盖R和Python中的数据处理与下游分析 | 系统整合了空间转录组学数据的R和Python分析对象类，提供从数据管理到生物学洞察的完整工作流程 | 未提及特定局限性，可能缺乏对最新方法或特定平台配置的详细比较 | 为空间转录组学分析提供实用指南，支持研究者从原始数据高效提取生物学洞察 | 空间转录组学数据及其相关的分析流程和工具 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 116 | 2026-05-02 |
Mapping the Tumor Microenvironment with Integrative Single-Cell RNA Sequencing and Spatial Proteomics: Uncovering Mechanisms of Disease and Therapeutic Resistance
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5027-1_8
PMID:42062682
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研究论文 | 整合单细胞RNA测序和空间蛋白质组学构建肿瘤微环境图谱，揭示疾病机制和治疗耐药性 | 提出将单细胞RNA测序与空间蛋白质组学数据统一为基于图的联合表示框架，实现疾病病理的精准预测并揭示关键细胞间相互作用 | 未提及具体数据规模及验证实验，可能需进一步验证框架的泛化能力 | 通过整合scRNA-seq和空间蛋白质组学数据解析肿瘤微环境中的疾病机制和治疗耐药性 | 肿瘤微环境中的单细胞转录状态和空间蛋白质表达数据 | 计算机视觉, 机器学习, 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学 | 图神经网络 | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 空间数据 | 未明确提及 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'测序与空间蛋白质组学联合分析框架 |
| 117 | 2026-05-02 |
A Protocol for Spatial Transcriptomics Using the 10× Genomics Visium Platform
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5027-1_10
PMID:42062684
|
研究论文 | 描述了利用10× Genomics Visium平台进行空间转录组学的优化协议 | 对10× Visium空间转录组学协议进行了进一步优化，能够从新鲜冷冻和FFPE组织中保留原生空间信息并解卷积异质组织 | NA | 提供一种优化的空间转录组学方法，以研究肿瘤微环境中不同组织区室和免疫细胞间的细胞相互作用及其对肿瘤发生或疾病进展的影响 | 新鲜冷冻和FFPE组织样本 | 数字病理学 | 肺癌、黑色素瘤、子宫内膜癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学协议，用于新鲜冷冻和FFPE组织样本 |
| 118 | 2026-05-02 |
Highly Multiplexed Single-Cell In Situ RNA and DNA Analysis by Consecutive Hybridization
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5027-1_11
PMID:42062685
|
研究论文 | 提出一种通过连续杂交实现高多重原位单细胞RNA和DNA分析的方法，用于空间转录组和基因组分析 | 利用连续荧光原位杂交循环生成独特颜色序列作为核酸条形码，实现万级转录本或基因组位点的原位单细胞精确分析 | NA | 开发高多重原位杂交方法，以克服荧光成像方法可定量核酸种类数量的限制 | 单细胞中的RNA和DNA分子 | NA | NA | 荧光原位杂交 | NA | 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 连续荧光原位杂交循环 |
| 119 | 2026-05-02 |
Engineering of functional auditory neurons from human induced pluripotent stem cells
2026, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1016/j.mmr.2026.100008
PMID:42063462
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研究论文 | 利用人诱导多能干细胞工程化功能性听觉神经元 | 首次建立从人诱导多能干细胞高效生成功能成熟螺旋神经节样神经元的方案，并验证其与小鼠毛细胞和耳蜗核神经元形成功能性突触连接 | 尚未在体内模型中验证移植后的长期存活和听力恢复效果 | 为人类听觉发育研究、疾病建模、药物筛选及听力恢复细胞治疗提供平台 | 人诱导多能干细胞来源的螺旋神经节样神经元 | 数字病理学 | 听力损伤 | 单细胞RNA测序、免疫细胞化学、全细胞膜片钳电生理、共培养实验、钙离子成像 | NA | 图像、文本、电生理数据 | 未明确提及样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 120 | 2026-05-02 |
Integrated multi-omics and single-cell transcriptomic analysis reveals shared molecular mechanisms and cell-cell communication signatures in gout and metabolic syndrome
2026, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2026.1749788
PMID:42063773
|
研究论文 | 整合多组学与单细胞转录组分析揭示痛风和代谢综合征共享的分子机制与细胞间通讯信号 | 首次通过整合多组学与单细胞转录组分析系统揭示痛风和代谢综合征共享的分子机制和细胞间通讯特征，并实验验证关键调控基因和信号通路 | 未提及具体局限性 | 探索痛风和代谢综合征共享的分子机制和细胞间通讯信号，识别并验证关键调控基因与通路 | 痛风、代谢综合征患者及体外细胞模型 | 生物信息学、单细胞转录组学 | 痛风、代谢综合征 | RNA-seq、单细胞RNA-seq、qPCR、Western blot | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 主要基于公共数据库数据集及体外细胞模型 | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |