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当前共找到 38125 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-04-06 |
The role of disulfidptosis-driven tumor microenvironment remodeling in pancreatic cancer progression
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1747560
PMID:41884834
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研究论文 | 本研究开发并验证了一个基于13个关键基因的二硫死亡相关预后特征，用于胰腺导管腺癌患者的风险分层，并通过多组学分析揭示了二硫死亡与免疫抑制性肿瘤微环境之间的关联 | 首次在胰腺癌中开发了基于二硫死亡相关基因的预后特征，并通过整合多组学方法（包括单细胞转录组学和空间转录组学）系统性地揭示了二硫死亡在肿瘤免疫调节中的作用 | 研究主要基于生物信息学分析和体外功能实验，缺乏体内实验验证；UBASH3B在免疫调节中的具体机制仍需进一步研究 | 探究二硫死亡在胰腺癌进展和肿瘤免疫中的作用，并开发基于二硫死亡相关基因的预后模型 | 胰腺导管腺癌患者 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 功能实验 | 预后特征模型 | 转录组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | 多个独立队列的胰腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 102 | 2026-04-06 |
Plasma PFDN2 suppresses head and neck squamous cell carcinoma progression by restricting CD64 on monocyte-driven inflammatory microenvironments
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1791776
PMID:41884853
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研究论文 | 本研究通过多样本孟德尔随机化分析，发现血浆蛋白PFDN2通过抑制单核细胞上的CD64来限制头颈部鳞状细胞癌的进展 | 首次将血浆蛋白PFDN2与HNSC风险通过单核细胞CD64介导的免疫微环境联系起来，并利用虚拟敲除和分子模拟验证其相互作用 | 研究主要基于遗传关联和计算模拟，需要更多实验验证PFDN2-CD64轴的功能机制 | 探究血浆蛋白对头颈部鳞状细胞癌免疫微环境的因果调控作用 | 头颈部鳞状细胞癌患者样本、血浆蛋白质组、免疫细胞表型 | 生物信息学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 孟德尔随机化、单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟、免疫荧光染色 | scTenifoldKnk虚拟敲除模型 | 蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据、组织病理数据 | 大规模血浆蛋白质组和HNSC样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 103 | 2026-04-06 |
Whole-cortex in situ sequencing reveals input-dependent area identity
2025-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07221-6
PMID:38658747
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研究论文 | 本研究使用BARseq高通量原位测序技术，在小鼠前脑半球中分析了104个细胞类型标记基因的表达，揭示了皮层区域的转录组特征及其与发育输入的关系 | 首次在全皮层尺度应用高通量原位测序，结合大规模细胞分析，揭示了转录组类型组成与皮层区域身份之间的预测关系，并发现外周输入在塑造皮层模块内转录组身份中的作用 | 研究仅基于小鼠模型，结果可能无法直接推广到其他物种；且基因面板限于104个标记基因，可能未覆盖所有相关转录组特征 | 探究大脑皮层神经元转录组特征的空间组织及其在发育中的建立机制 | 小鼠前脑半球中的皮层神经元 | 神经科学 | NA | 原位测序 | NA | 基因表达数据 | 超过1030万个细胞，包括4,194,658个皮层神经元，覆盖9个小鼠前脑半球 | NA | 原位测序 | BARseq | 高通量原位测序技术，用于细胞分辨率下的基因表达分析 |
| 104 | 2026-04-06 |
stImage: a versatile framework for optimizing spatial transcriptomic analysis through customizable deep histology and location informed integration
2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf429
PMID:40905789
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研究论文 | 本文介绍了一个名为stImage的开源R包，该框架通过整合深度学习提取的组织学特征、基因表达数据和空间坐标，为空间转录组学分析提供了一个灵活且全面的解决方案 | 首次在一个统一框架内完全整合基因表达、组织学特征和精确空间坐标，并提供54种集成策略供用户选择，通过诊断图指导用户选择最合适的整合方法 | 论文未明确说明该方法在不同组织类型或实验平台上的通用性限制，也未讨论计算资源需求或处理大规模数据时的可扩展性 | 优化空间转录组学分析，通过整合多模态数据提高对组织生物学的理解 | 空间转录组学数据（包含基因表达、组织学图像和空间坐标信息） | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学技术 | 深度学习模型 | 基因表达数据、组织学图像、空间坐标 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 105 | 2026-04-06 |
The Dual Molecular Identity of Vestibular Kinocilia: Bridging Structural and Functional Traits of Primary and Motile Cilia
2025-Jun-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.16.647417
PMID:40568142
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫染色揭示了前庭毛细胞中动纤毛的双重分子身份，结合了初级纤毛和运动纤毛的结构与功能特征 | 首次发现前庭动纤毛具有初级纤毛和运动纤毛的双重分子特征，并证实其作为主动力生成元件在毛束中的作用 | NA | 阐明前庭动纤毛的结构、分子组成和功能特性 | 前庭毛细胞和耳蜗毛细胞，包括牛蛙、小鼠、斑马鱼和人类样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，免疫染色，活体成像 | NA | RNA序列数据，图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 106 | 2026-04-06 |
Macrophages protect against sensory axon loss in peripheral neuropathy
2025-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08535-1
PMID:39939762
|
研究论文 | 本研究探讨了巨噬细胞在肥胖前驱糖尿病小鼠模型中对周围神经病变中感觉轴突丢失的保护作用 | 首次揭示了CCR2巨噬细胞在肥胖前驱糖尿病诱导的周围神经病变早期浸润神经并发挥神经保护作用，通过galectin 3延缓轴突退化 | 研究基于小鼠模型，结果在人类患者中的适用性尚需验证，且未详细探讨巨噬细胞保护作用的具体分子机制 | 研究肥胖前驱糖尿病条件下周围神经病变的发病机制及免疫细胞的作用 | 高脂高果糖饮食诱导的肥胖前驱糖尿病小鼠模型 | NA | 周围神经病变 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 107 | 2026-04-06 |
Creatine promotes endometriosis progression by inducing M2 polarization of peritoneal macrophages
2025-03-01, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1530/REP-24-0278
PMID:39679878
|
研究论文 | 本研究揭示了肌酸通过诱导腹膜巨噬细胞M2极化，促进子宫内膜异位症的血管生成、纤维化和病变进展 | 首次发现肌酸在子宫内膜异位症中通过重编程巨噬细胞M2极化发挥关键免疫调节作用 | 研究主要基于体外实验和单细胞测序数据分析，缺乏体内模型的直接验证 | 探讨肌酸在子宫内膜异位症发病机制中的作用 | 子宫内膜异位症患者的腹膜巨噬细胞、子宫内膜基质细胞和HUVECs | 单细胞测序 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | 单细胞测序数据, RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 108 | 2026-04-06 |
Transcriptome and DNA methylation profiling during the NSN to SN transition in mouse oocytes
2025-Jan-03, BMC molecular and cell biology
IF:2.4Q4
DOI:10.1186/s12860-024-00527-3
PMID:39754059
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和DNA甲基化分析，表征了小鼠卵母细胞从非环绕核仁到环绕核仁阶段的转录组和DNA甲基化变化 | 开发了一种基于转录组数据的分类器，可用于推断单细胞或批量RNA-seq数据中的染色质状态，并识别了与异常染色质修饰组合相关的晚期甲基化区域 | 研究仅基于小鼠模型，可能不直接适用于其他物种，且单细胞技术可能存在技术变异 | 探究小鼠卵母细胞在NSN到SN过渡期间的转录组和DNA甲基化动态变化 | 小鼠卵母细胞，特别是GV期卵母细胞，根据核染色分为NSN和SN阶段 | 表观遗传学 | NA | 单细胞M&T-seq（scM&T-seq）、scRNA-seq、sc-bisulphite-seq（scBS-seq）、Hoechst染色、染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq） | 分类器（基于转录组数据） | 单细胞转录组数据、DNA甲基化数据、染色质修饰数据 | 未明确指定样本数量，但涉及多个已发表数据集的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq、单细胞DNA甲基化测序 | NA | NA |
| 109 | 2026-04-06 |
CD206+ Trem2+ macrophage accumulation in the murine knee joint after injury is associated with protection against post-traumatic osteoarthritis in MRL/MpJ mice
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0312587
PMID:39752388
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了小鼠膝关节损伤后免疫细胞变化与创伤后骨关节炎（PTOA）易感性之间的关系 | 首次在PTOA易感性和抵抗性小鼠模型中，通过单细胞RNA测序揭示了CD206+ Trem2+巨噬细胞在关节损伤后的积累与保护作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证，且样本量相对较小 | 探究创伤后骨关节炎（PTOA）发展或缓解的分子机制 | PTOA易感的C57BL/6J（B6）小鼠和PTOA抵抗的MRL/MpJ（MRL）小鼠的滑膜关节 | 单细胞转录组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两种小鼠品系（B6和MRL）的膝关节样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 110 | 2026-04-06 |
Dissecting the molecular mechanisms of T cell infiltration in psoriatic lesions via cell-cell communication and regulatory network analysis
2025, Open life sciences
IF:1.7Q3
DOI:10.1515/biol-2025-1231
PMID:41883387
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和细胞间通讯分析，揭示了银屑病皮损中T细胞浸润的分子机制，并发现姜黄素类似物CuE通过抑制IL-6-STAT3-MDK信号轴缓解症状 | 首次结合单细胞RNA测序、假时间分析、细胞间通讯分析和调控网络分析，系统解析了银屑病中成纤维细胞通过MDK信号介导T细胞募集的机制，并验证了CuE通过靶向该信号轴的治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型和体外分析，人体组织样本的验证可能有限；信号通路的上下游调控细节有待进一步阐明 | 阐明银屑病皮损中T细胞浸润的细胞间通讯机制和调控网络，并探索潜在的治疗靶点 | 银屑病皮肤组织（小鼠模型及可能的人体样本）、T细胞、成纤维细胞、内皮细胞、黑色素细胞 | 单细胞组学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 111 | 2026-04-06 |
Rhythmic IL-17 production by γδ T cells maintains adipose de novo lipogenesis
2024-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08131-3
PMID:39478228
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研究论文 | 本研究揭示了γδ T细胞通过昼夜节律性产生IL-17来维持脂肪组织从头脂肪生成，从而影响全身代谢稳态 | 首次发现IL-17产生的γδ T细胞依赖分子钟维持脂肪组织稳态，并揭示IL-17在全身代谢节律中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性尚需进一步验证 | 探究免疫系统昼夜节律在组织稳态中的作用，特别是IL-17产生细胞对脂肪代谢的影响 | 小鼠的γδ T细胞、iNKT细胞、MAIT细胞及脂肪组织 | 免疫学与代谢研究 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序、分子钟报告基因、遗传操作、全身代谢分析 | NA | RNA测序数据、代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 112 | 2026-04-06 |
CRISPRi-based screens in iAssembloids to elucidate neuron-glia interactions
2024-Nov-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.26.538498
PMID:37163077
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研究论文 | 本文开发了一种名为iAssembloids的3D共培养系统，结合CRISPRi筛选技术，用于研究神经元与胶质细胞之间的相互作用机制 | 首次将iAssembloids系统与大规模CRISPRi筛选结合，揭示了在3D共培养环境中GSK3β抑制NRF2介导的氧化应激反应的新机制，这在2D单培养神经元筛选中未被发现 | 研究基于体外3D模型，可能无法完全模拟体内大脑的复杂环境，且样本规模可能有限 | 阐明神经元与胶质细胞在脑健康和疾病中的相互作用机制 | 神经元和胶质细胞（包括星形胶质细胞） | 单细胞组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学、CRISPRi筛选、免疫组织化学 | iAssembloids（诱导多谱系组装体） | 单细胞转录组数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 113 | 2026-04-06 |
aKNNO: single-cell and spatial transcriptomics clustering with an optimized adaptive k-nearest neighbor graph
2024-Aug-01, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03339-y
PMID:39090647
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研究论文 | 本文介绍了一种名为aKNNO的新方法，用于单细胞和空间转录组学数据聚类，通过优化的自适应k近邻图同时识别丰富和稀有细胞类型 | aKNNO通过自适应k近邻图优化，克服了传统方法在识别稀有细胞类型时性能下降的问题，实现了对丰富和稀有细胞类型的准确同时识别 | NA | 开发一种能同时准确识别丰富和稀有细胞类型的单细胞和空间转录组学聚类方法 | 单细胞和空间转录组学数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 自适应k近邻图 | 基因表达数据 | 38个模拟数据集和20个单细胞及空间转录组学数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 114 | 2026-04-06 |
PAGER-scFGA: unveiling cell functions and molecular mechanisms in cell trajectories through single-cell functional genomics analysis
2024, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2024.1336135
PMID:38690527
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研究论文 | 本文介绍了PAGER-scFGA工具，用于通过单细胞功能基因组学分析揭示细胞轨迹中的细胞功能和分子机制 | 开发了PAGER-scFGA工具，整合细胞功能注释和基因集富集分析到单细胞分析流程中，支持细胞轨迹的功能探索和基因网络构建 | NA | 促进细胞群的功能注释和细胞轨迹分子机制的表征 | 小鼠自然杀伤细胞 | 单细胞功能基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 115 | 2026-04-06 |
Canine peripheral blood TCRαβ T cell atlas: Identification of diverse subsets including CD8A+ MAIT-like cells by combined single-cell transcriptome and V(D)J repertoire analysis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1123366
PMID:36911660
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫组库测序技术，首次构建了健康犬外周血TCRαβ T细胞的详细图谱，并鉴定了包括CD8A+ MAIT样细胞在内的多种新亚群 | 首次在犬中结合单细胞转录组和V(D)J组库分析，揭示了犬T细胞多样性，特别是发现了犬黏膜相关恒定T细胞（MAIT）样细胞等先前未描述的亚群 | 研究仅基于健康犬外周血样本，未涉及疾病状态或其他组织，且犬特异性抗体的缺乏限制了传统流式细胞术验证 | 生成健康犬外周血TCRαβ T细胞的详细图谱，以增进对犬T细胞多样性的理解，并为人类疾病模型研究提供参考 | 健康犬的外周血TCRαβ T细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq），免疫组库测序 | NA | 单细胞转录组数据，V(D)J序列数据 | 未明确指定样本数量，但基于健康犬外周血 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 116 | 2026-04-06 |
Estrogen receptor alpha in the brain mediates tamoxifen-induced changes in physiology in mice
2021-03-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.63333
PMID:33647234
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了雌激素受体α（ERα）在小鼠下丘脑和前视区介导他莫昔芬治疗引起的生理变化 | 首次利用单细胞RNA测序技术揭示他莫昔芬对下丘脑-前视区基因表达的影响，并证明ERα在此过程中的关键介导作用 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探究他莫昔芬治疗引起的副作用机制 | 小鼠 | 单细胞测序 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 117 | 2026-04-06 |
Whole-body senescent cell clearance alleviates age-related brain inflammation and cognitive impairment in mice
2021-02, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.13296
PMID:33470505
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研究论文 | 本研究通过清除老年小鼠体内的衰老细胞，减轻了大脑炎症并改善了认知功能 | 首次证明在正常衰老过程中清除衰老细胞可以改善认知功能障碍，并发现衰老细胞在小胶质细胞和少突胶质前体细胞中显著增加 | 研究仅在INK-ATTAC转基因小鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探究清除衰老细胞是否能缓解衰老过程中的认知功能障碍 | 年轻和老年小鼠的海马体组织 | 单细胞组学 | 老年疾病 | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序 | INK-ATTAC转基因小鼠模型 | RNA测序数据 | 年轻和老年小鼠的海马体组织 | NA | 单核RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 118 | 2026-04-06 |
Beta-Poisson model for single-cell RNA-seq data analyses
2016-07-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btw202
PMID:27153638
|
研究论文 | 本文提出了一种用于单细胞RNA-seq数据分析的beta-Poisson混合模型，以捕捉基因表达的双峰分布特征 | 引入beta-Poisson混合模型来捕捉单细胞RNA-seq数据中的双峰分布，优于传统的gamma-Poisson模型 | 未明确说明模型在处理大规模数据集或复杂实验设计时的计算效率限制 | 开发一种适用于单细胞RNA-seq数据的统计模型，以改进差异表达分析 | 单细胞RNA-seq数据中的基因表达分布 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | beta-Poisson混合模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 119 | 2026-04-05 |
MLRR-ATV: A Robust Manifold Nonnegative Low-Rank Representation With Adaptive Total-Variation Regularization for scRNA-seq Data Clustering
2026 Mar-Apr, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2024.3432740
PMID:39046863
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研究论文 | 本文提出了一种名为MLRR-ATV的新型单细胞RNA测序数据聚类方法，通过自适应全变分正则化和流形学习来减少噪声影响并保留数据结构 | 将自适应全变分正则化引入低秩表示模型，通过梯度学习减少噪声，并同时学习线性和非线性流形结构 | 模型是非凸的，需要采用交替方向乘子法进行优化，可能影响计算效率 | 开发一种鲁棒的单细胞RNA测序数据聚类方法，以改善基因表达数据的分析 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 低秩表示模型 | 基因表达数据 | 八个真实scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 120 | 2026-04-05 |
Deep Imputation Bi-Stochastic Graph Regularized Matrix Factorization for Clustering Single-Cell RNA-Sequencing Data
2026 Mar-Apr, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2024.3387911
PMID:38607719
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研究论文 | 提出一种基于深度矩阵分解和双随机图正则化的单细胞RNA测序数据聚类新方法 | 结合特征选择、缺失值填补、降维处理和双随机图正则化的深度矩阵分解框架 | 未明确说明方法在超大规模数据集上的计算效率及对特定细胞类型的适用性 | 开发单细胞RNA测序数据的聚类算法以揭示细胞异质性 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度矩阵分解 | 基因表达矩阵 | 九个数据集（未指定具体样本量） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |