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当前共找到 36146 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-02-10 |
Molecular signatures and signaling interactions of the hair follicle stem cell niche
2025-Dec-15, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.11.021
PMID:41407191
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研究论文 | 本研究通过高灵敏度单细胞转录组分析，定义了毛囊干细胞及其微环境中多种细胞类型的转录组特征，并揭示了细胞间通讯网络 | 首次通过流式分选结合高灵敏度转录组测序，对毛囊微环境中四种相邻区域的六种细胞群体进行系统分析，实现了前所未有的基因检测灵敏度 | 研究基于小鼠背部皮肤样本，人类数据的验证仍需进一步研究 | 揭示毛囊干细胞及其微环境的分子特征和信号相互作用机制 | 小鼠背部皮肤中的毛囊乳头细胞、隆突干细胞、毛胚干细胞、表皮细胞、毛囊上皮细胞和真皮成纤维细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序、流式细胞分选 | NA | 转录组数据 | 从小鼠背部4个相邻区域分选的6种细胞群体，共56个全转录组测量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 102 | 2026-02-10 |
Lifting regenerative barriers promotes epithelial cell fate plasticity supporting lineage conversion
2025-Nov-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66446-9
PMID:41309646
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研究论文 | 本研究探讨了成年上皮细胞在再生过程中命运可塑性的调控机制，揭示了HIF1a-SOX9轴作为限制细胞身份转换的关键屏障 | 首次发现HIF1a-SOX9轴作为上皮细胞命运可塑性的关键调节因子，并证明解除再生屏障可促进食管细胞向皮肤细胞的谱系转换 | 研究基于3D再生培养系统，可能无法完全模拟体内复杂环境；谱系转换效率较低，机制仍需进一步验证 | 探究成年上皮细胞命运可塑性的调控机制及再生过程中的谱系转换限制因素 | 成年食管上皮细胞与真皮基质细胞 | 再生医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 103 | 2026-02-10 |
Trypanosoma brucei cattle infections contain cryptic transmission-adapted bloodstream forms at low parasitaemia
2025-Nov-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64750-y
PMID:41193429
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和显微镜技术，揭示了牛感染布氏锥虫时存在隐秘的传播适应性血流形式，挑战了基于啮齿动物模型的传统假设 | 首次在牛的低寄生虫血症水平下，通过单细胞转录组学识别出具有细长型和粗短型相关转录组的混合寄生虫群体，揭示了宿主特异性差异 | 研究主要基于牛和鼠类感染模型，可能未完全覆盖所有自然宿主或环境条件下的寄生虫行为，且形态学标记蛋白表达未在粗短型样寄生虫中检测到 | 探究布氏锥虫在自然宿主（牛）中的发育和传播机制，特别是低寄生虫血症条件下的形式分化 | 布氏锥虫在牛和鼠类感染中的寄生虫群体，包括其转录组和形态特征 | 寄生虫学与传染病学 | 非洲动物锥虫病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、显微镜观察 | NA | 转录组数据、图像数据 | 牛和鼠类感染样本，具体数量未在摘要中指定 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 104 | 2026-02-10 |
Heterochronic transcription factor expression drives cone-dominant retina development in 13-lined ground squirrels
2025-Oct-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.25.650540
PMID:40654702
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和染色质可及性测序，揭示了十三纹地松鼠视锥细胞优势视网膜发育的调控机制 | 发现了视锥细胞不仅来源于早期神经祖细胞，还来源于晚期神经祖细胞，这种延长生成期由转录因子表达的异时性转变驱动 | 未明确说明样本数量，且机制验证主要在基因表达层面，缺乏更深入的体内功能验证 | 探究地松鼠视锥细胞优势视网膜发育的分子调控机制 | 十三纹地松鼠的视网膜发育过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 105 | 2026-02-10 |
Single-Cell Multiome Impact of Prenatal Heavy Metal Exposure on Early Airway Development
2025-Jul-30, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0563OC
PMID:40737448
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学测序和高分辨率代谢组学，揭示了产前镉和砷暴露对小鼠早期胚胎肺发育的多层面分子和细胞破坏机制 | 首次结合单细胞多组学测序（scATAC-seq+scRNA-seq）和高分辨率代谢组学，系统描绘了产前重金属暴露对早期气道发育的多层面影响，并整合RNA剪接和染色质动力学进行细胞命运轨迹分析 | 研究仅针对小鼠E12胚胎肺，且暴露剂量为固定浓度，未涵盖更广泛的发育时间点或剂量效应关系 | 探究产前镉和砷暴露对早期肺发育的细胞类型特异性机制和分子调控网络 | 产前暴露于镉和砷的小鼠胚胎肺组织（E12、E14.5、E17） | 单细胞多组学 | 肺发育障碍 | 单细胞多组学测序（scATAC-seq+scRNA-seq）、高分辨率代谢组学、基因调控网络分析、细胞命运轨迹分析 | NA | 单细胞多组学数据（RNA-seq、ATAC-seq）、代谢组学数据 | 小鼠胚胎肺组织（对照组和处理组，具体数量未明确说明） | NA | 单细胞多组学测序（scATAC-seq+scRNA-seq） | NA | NA |
| 106 | 2026-02-10 |
TrAGEDy-trajectory alignment of gene expression dynamics
2025-Mar-04, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf073
PMID:40065693
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为TrAGEDy的新方法，用于对齐单细胞转录组学中的独立轨迹，避免错误整合步骤 | TrAGEDy能够处理不对称生物过程的轨迹对齐，优于现有工具，在模拟和真实数据中均表现更优 | NA | 开发一种方法以对齐单细胞转录组学中的独立轨迹，用于比较不同生物过程 | T细胞和布氏锥虫血流形式的基因表达动态 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 107 | 2026-02-10 |
Hepatic Arterial Flow-Induced Portal Tract Fibrosis in Portal Hypertension: The Role of VCAM-1 and Osteopontin-Expressing Macrophages
2025-Feb-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.31.634947
PMID:39975181
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研究论文 | 本研究探讨了门脉高压中肝动脉血流增加通过VCAM-1和表达骨桥蛋白的巨噬细胞驱动门管区纤维化的分子机制 | 揭示了肝动脉缓冲反应诱导的动脉血流增加通过VCAM-1介导的巨噬细胞招募和Spp1+巨噬细胞驱动纤维化的新机制 | 研究基于大鼠模型，结果在人类中的适用性需进一步验证；未涉及长期疾病进展或治疗干预的评估 | 探究门脉高压中肝动脉血流增加导致门管区纤维化的分子机制 | Sprague-Dawley大鼠门脉高压模型中的肝脏组织、巨噬细胞和门脉成纤维细胞 | NA | 门脉高压 | 单细胞RNA测序、RNA-FISH、微CT、免疫细胞分析、转录组分析 | NA | 图像数据、转录组数据、血流动力学数据 | Sprague-Dawley大鼠门脉高压模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 108 | 2026-02-10 |
Multi-omics integration and machine learning-driven construction of an immunogenic cell death prognostic model for colon cancer and functional validation of FCGR2A
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1746907
PMID:41657770
|
研究论文 | 本研究通过多组学整合与机器学习构建了一个基于免疫原性细胞死亡（ICD）相关基因的结肠癌预后模型，并验证了关键基因FCGR2A的功能 | 首次系统性地利用单细胞RNA-seq数据表征ICD相关的T细胞状态，并通过117种机器学习模型组合筛选出最优的15基因预后特征，构建了具有高预测性能的ICD相关预后模型 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，需要前瞻性临床队列进一步验证模型的普适性 | 开发基于免疫原性细胞死亡的结肠癌预后模型，并探索其与肿瘤免疫微环境及治疗敏感性的关联 | 结肠腺癌患者 | 机器学习 | 结肠癌 | 单细胞RNA-seq, 转录组分析 | 随机生存森林 | 转录组数据, 临床数据 | TCGA和GTEx数据库的结肠腺癌患者数据，以及GSE17538和GSE38832作为外部验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 109 | 2026-02-10 |
Multi-omics characterization of RNF157 expression patterns in hepatocellular carcinoma and development of an RNF157-associated prognostic signature
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1738424
PMID:41657776
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学和单细胞分析，表征了肝细胞癌中E3泛素连接酶RNF157的表达模式，并开发了RNF157相关的预后特征 | 首次在单细胞分辨率下揭示了RNF157在肝细胞癌肿瘤微环境中的异质性表达模式，并基于此构建了预后模型 | 预后模型的预测性能中等（AUC: 0.65-0.78），需要独立验证才能临床应用 | 表征RNF157在肝细胞癌中的表达模式，开发预后特征并探索其与肿瘤微环境的关系 | 肝细胞癌（HCC）患者样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），流式细胞术 | 预后模型 | RNA表达数据，临床数据，单细胞测序数据 | 来自TCGA、GEO数据库和scRNA-seq数据集（GSE149614）的样本，实验包括三个独立生物学重复 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 110 | 2026-02-10 |
Integrative multi-omics and experimental analyses implicate PTK2 as a lorazepam-associated biomarker and potential therapeutic target in ovarian cancer
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1744802
PMID:41657774
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研究论文 | 本研究通过整合多组学和实验分析，揭示了PTK2是劳拉西泮相关生物标志物，并作为卵巢癌的潜在治疗靶点 | 首次将神经活性药物劳拉西泮与卵巢癌的分子靶点联系起来，通过多组学方法鉴定出PTK2作为关键枢纽基因，并进行了实验验证 | 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞实验，缺乏体内动物模型验证和临床样本的直接验证 | 识别并验证劳拉西泮与卵巢癌共有的分子靶点，发现新的生物标志物和治疗机制 | 卵巢癌相关基因与劳拉西泮潜在靶点的交集基因 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 多组学分析，包括单细胞转录组学、空间转录组学、qPCR、CCK-8、集落形成、伤口愈合和流式细胞术 | Lasso-Cox模型 | 基因表达数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞转录组学，空间转录组学 | NA | NA |
| 111 | 2026-02-10 |
Single-cell RNA-seq reveals a key role for Vibrio cholerae Mak toxins in Tetrahymena pyriformis killing and bacterial survival
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1729243
PMID:41657991
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA-seq技术揭示了霍乱弧菌的Mak毒素在杀死梨形四膜虫和细菌在排出食物泡内存活中的关键作用 | 首次在单细胞分辨率下揭示了霍乱弧菌抵抗原生动物捕食的分子机制，并确定了Mak毒素在细菌环境生存和毒力中的双重作用 | 研究主要关注梨形四膜虫这一种原生动物模型，结果在其他原生动物捕食者中的普适性有待验证 | 探究霍乱弧菌抵抗原生动物捕食的分子机制及其与环境生存和细菌毒力的关联 | 霍乱弧菌（Vibrio cholerae）和梨形四膜虫（Tetrahymena pyriformis） | 单细胞转录组学 | 霍乱 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5,344个细菌细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 112 | 2026-02-10 |
BMP and NODAL paracrine signalling regulate the totipotent-like cell state in embryonic stem cells
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1720355
PMID:41660012
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研究论文 | 本研究探讨了细胞间通讯如何通过BMP和NODAL信号通路调控胚胎干细胞中全能样细胞状态 | 首次结合单细胞RNA测序与计算框架，系统绘制了异质性胚胎干细胞群体中配体-受体互作图谱，并功能验证了BMP和NODAL信号在调控全能样细胞状态中的关键作用 | 研究主要基于体外培养系统，体内生理环境中的信号调控机制仍需进一步验证 | 揭示细胞间通讯信号通路在干细胞状态调控中的作用机制 | 小鼠胚胎干细胞（特别是模拟2细胞期胚胎的全能样细胞） | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 计算互作网络模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量（异质性胚胎干细胞群体） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 113 | 2026-02-10 |
Single-cell transcriptomics reveals keratinocyte dynamic processes associated with S100a4 expression in psoriasiform dermatitis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1744860
PMID:41660613
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了S100a4表达在银屑病样皮炎中与角质形成细胞动态过程相关的潜在致病机制 | 首次结合CRISPR/Cas9基因敲除小鼠模型与单细胞RNA测序技术，系统揭示了S100A4在银屑病发病中的细胞特异性转录调控网络和分子机制，特别是发现了Klf9介导的Krt15转录失调是角化过度的关键驱动因素 | 研究主要基于小鼠模型，其结论在人类银屑病中的直接适用性仍需进一步验证；单细胞测序分析未能涵盖所有细胞类型或空间信息 | 探究S100A4在银屑病发病中的具体功能及相关分子机制 | S100a4基因敲除小鼠及其诱导的银屑病样皮炎模型 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），CRISPR/Cas9基因编辑，生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | S100a4基因敲除小鼠及对照小鼠（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 114 | 2026-02-10 |
Interleukin-1β Drives Disease Progression in Arrhythmogenic Cardiomyopathy
2024-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.11.628020
PMID:39763850
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序和空间转录组学分析，揭示了心律失常性心肌病（ACM）中白细胞介素-1β（IL-1β）在疾病进展中的关键作用，并探索了靶向IL-1β的治疗潜力 | 首次在ACM患者心肌样本中结合单核RNA测序和空间转录组学，识别出炎症-纤维化空间微环境，并验证了IL-1β作为治疗靶点 | 研究样本量有限，且主要基于小鼠模型验证，人类临床试验尚未进行 | 探究ACM疾病进展的分子机制，并评估靶向IL-1β的治疗策略 | ACM患者心肌样本和Desmoglein-2突变小鼠模型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序（snRNAseq），空间转录组学 | NA | RNA测序数据，空间转录组数据 | ACM患者和对照捐赠者的心肌样本，具体数量未明确 | NA | 单核RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 115 | 2026-02-10 |
Identification of kidney cell types in scRNA-seq and snRNA-seq data using machine learning algorithms
2024-Oct-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38567
PMID:39403515
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研究论文 | 本文评估了五种监督机器学习算法在自动注释肾脏单细胞和单核RNA测序数据中细胞类型的性能 | 首次系统比较了五种监督分类方法在肾脏scRNA-seq和snRNA-seq数据中的细胞类型注释性能，并展示了跨数据集和测序技术的高准确性 | 研究样本数量有限，且当模型主要在scRNA-seq数据上训练并测试于snRNA-seq数据时，性能有所下降 | 开发自动细胞类型注释方法以替代耗时的手动注释，促进肾脏疾病细胞机制研究 | 肾脏细胞 | 机器学习 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | 支持向量机, 随机森林, 多层感知器, k近邻, 极端梯度提升 | RNA测序数据 | 79个肾脏活检样本中的62,120个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 116 | 2026-02-10 |
Improved characterization of single-cell RNA-seq libraries with paired-end avidity sequencing
2024-Jul-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.10.602909
PMID:39026715
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研究论文 | 本文评估了Element Biosciences的亲和碱基化学DNA测序技术在单细胞RNA-seq文库中准确测序通过同聚物引物位点的能力，并探讨了其对读段比对和多聚腺苷酸化位点使用精确量化的影响 | 利用Element Aviti仪器的亲和碱基化学测序技术，首次实现了在单细胞RNA-seq文库中准确测序通过胸腺嘧啶同聚物进入cDNA序列，从而直接独立地将读段分配给多聚腺苷酸化位点，避免了传统方法的复杂性 | 尽管亲和测序在多聚腺苷酸化位点分析中表现优异，但与单端比对相比，并未一致提高读段映射率，且存在低水平伪影，需要调整适配器修剪和比对工作流程 | 评估亲和碱基化学DNA测序技术在单细胞RNA-seq文库中测序同聚物引物位点的准确性，并优化比对流程以提高数据质量 | 单细胞RNA-seq文库中的cDNA片段，特别是包含多聚腺苷酸化位点的序列 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA-seq, 亲和碱基化学DNA测序 | NA | 序列数据 | NA | Element Biosciences, Illumina | 单细胞RNA-seq | Element Aviti, Illumina测序平台 | Element Aviti仪器用于亲和碱基化学测序，Illumina平台用于常规测序比较 |
| 117 | 2026-02-10 |
Marine Invertebrates One Cell at A Time: Insights from Single-Cell Analysis
2023-12-12, Integrative and comparative biology
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/icb/icad034
PMID:37188638
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在海洋无脊椎动物研究中的应用、关键发现及未来挑战 | 首次系统性地综合了海洋无脊椎动物单细胞RNA测序研究的文献，提供了关于细胞类型组成、动态过程响应及细胞类型进化等方面的关键见解，并讨论了跨实验和跨物种数据比较的挑战 | 本文为综述性文章，不涉及原始数据分析，主要基于现有文献进行综合评述，未提出新的实验方法或模型 | 综述海洋无脊椎动物单细胞RNA测序研究的现状、关键发现、挑战及未来方向 | 海洋无脊椎动物 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 118 | 2026-02-10 |
The developmental hierarchy and scarcity of replicative slender trypanosomes in blood challenges their role in infection maintenance
2023-10-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2306848120
PMID:37824530
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研究论文 | 本文通过实验证明，在小鼠急性和慢性感染中，布氏锥虫的发育性细胞周期停滞是不可逆的，并揭示了细胞周期停滞和可逆性粗短样转录组出现的时间层次，同时发现感染建立后血液中增殖寄生虫异常稀少 | 首次实验证实布氏锥虫发育性细胞周期停滞在血液中不可逆，揭示细胞周期停滞与转录组变化的时间层次，并挑战了血液中增殖寄生虫在维持感染中的作用 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类或其他哺乳动物宿主中的情况；单细胞转录组分析可能受技术限制影响 | 探究布氏锥虫在哺乳动物宿主中的发育动态、细胞周期停滞的不可逆性及其在感染维持中的作用 | 布氏锥虫（Trypanosoma brucei）在血液中的不同形态阶段（细长型和粗短型） | 寄生虫学 | 锥虫病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 小鼠感染模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 119 | 2026-02-10 |
Profiling the bloodstream form and procyclic form Trypanosoma brucei cell cycle using single-cell transcriptomics
2023-05-11, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.86325
PMID:37166108
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，对布氏锥虫的血液期和原循环期细胞周期进行了高分辨率转录组分析 | 首次在无需细胞分选或同步化的情况下，通过单细胞转录组学获得了两种生命形式的高分辨率细胞周期调控转录组；开发了适用于冷冻保存样本的高效冻融方案 | 研究主要基于转录组层面，蛋白质功能验证和调控机制研究有待深入 | 解析布氏锥虫不同生命阶段的细胞周期调控机制 | 布氏锥虫的血液期和原循环期细胞 | 单细胞组学 | 寄生虫感染（锥虫病） | 单细胞转录组学 | 周期性伪时间推断计算模型 | 单细胞转录组数据 | 未同步化的细胞群体（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 120 | 2026-02-10 |
Single-cell transcriptomic analysis of bloodstream Trypanosoma brucei reconstructs cell cycle progression and developmental quorum sensing
2021-09-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25607-2
PMID:34489460
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，分析了布氏锥虫从增殖型细长体向传播型粗短体发育过程中的转录组动态变化，并重建了细胞周期进程和发育群体感应机制 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘了布氏锥虫血液期发育的转录组图谱，明确了细胞周期退出发生在G1早期并进入G0状态，并鉴定了发育调控因子ZC3H20的功能节点 | 研究基于体外寡肽诱导分化模型，可能与体内自然发育过程存在差异；单细胞测序样本量（8,599个寄生虫）虽具代表性，但可能未覆盖所有稀有细胞状态 | 解析布氏锥虫血液期发育分化的分子机制和细胞周期调控网络 | 布氏锥虫（Trypanosoma brucei）的血液期寄生虫 | 单细胞组学 | 寄生虫感染（锥虫病） | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 8,599个寄生虫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |