单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 32645 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-11-16 |
Single-Cell RNA-Seq Identifies Immune Remodeling in Lungs of β-Carotene Oxygenase 2 Knockout Mice with Improved Antiviral Response
2025-Oct-23, Nutrients
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/nu17213329
PMID:41228402
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了β-胡萝卜素加氧酶2敲除小鼠肺部免疫重塑与抗病毒反应增强的机制 | 首次发现BCO2缺失通过重塑肺部免疫细胞组成和细胞状态编程增强抗病毒反应 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类样本中验证 | 探究BCO2酶在肺部免疫结构和抗病毒反应中的作用 | BCO2敲除小鼠和C57BL/6J野生型小鼠的肺部组织 | 单细胞组学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序, 免疫印迹, 基因集变异分析 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质数据 | BCO2-KO和WT小鼠肺部样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 102 | 2025-11-16 |
Identification of two distinct uveal melanoma subtypes based on the immune cell infiltration of the primary tumour
2025-Oct-23, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04198-7
PMID:41128887
|
研究论文 | 本研究基于原发性葡萄膜黑色素瘤的免疫细胞浸润特征，识别出两种不同的肿瘤亚型 | 首次在单细胞水平揭示葡萄膜黑色素瘤的免疫异质性，发现具有特定染色体变异和信号通路活性的侵袭性黑色素细胞亚群 | 样本量有限（8例肿瘤活检），仅使用二次数据分析 | 表征葡萄膜黑色素瘤肿瘤微环境的细胞组成和免疫特征 | 原发性葡萄膜黑色素瘤肿瘤样本 | 单细胞组学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据，流式细胞数据 | 8例原发性葡萄膜黑色素瘤活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 103 | 2025-11-16 |
High-resolution spatial mapping of cell state and lineage dynamics in vivo with PEtracer
2025-Oct-16, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adx3800
PMID:40705858
|
研究论文 | 开发了一种基于基因编辑的空间谱系追踪技术PEtracer，用于在体研究细胞状态和谱系动态 | 首次将基因编辑技术与空间转录组分析结合，实现高分辨率空间映射的细胞谱系追踪 | NA | 研究发育和疾病过程中细胞命运决定的时空动态 | 小鼠肿瘤转移模型中的细胞 | 空间生物学 | 肿瘤转移 | 基因编辑, 空间转录组 | NA | 空间转录组数据, 成像数据 | NA | NA | 单细胞测序, 空间转录组, 多模态成像 | NA | MERFISH空间转录组分析 |
| 104 | 2025-11-16 |
Mapping early human blood cell differentiation using single-cell proteomics and transcriptomics
2025-Oct-16, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adr8785
PMID:40839704
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞蛋白质组学和转录组学技术，绘制了人类早期血细胞分化图谱 | 首次将单细胞质谱蛋白质组学与单细胞RNA测序整合，揭示了mRNA无法反映的干细胞功能相关蛋白质，并建立了推断细胞分化进程的翻译动态模型 | 研究仅针对CD34+造血干细胞和祖细胞，样本类型相对有限 | 解析人类早期血细胞分化过程中的分子机制 | 人类CD34+造血干细胞和祖细胞 | 单细胞多组学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞质谱蛋白质组学 | 翻译动态模型 | 单细胞蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | 超过2500个人类CD34+造血干细胞和祖细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞蛋白质组学 | NA | NA |
| 105 | 2025-11-16 |
Tumor-draining lymph nodes respond to immune checkpoint inhibition and orchestrate tumor immune remodeling
2025-Oct-06, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04187-w
PMID:41051631
|
研究论文 | 本研究揭示了肿瘤引流淋巴结在免疫检查点抑制剂治疗中对肿瘤免疫微环境的调控机制 | 首次通过单细胞测序技术系统阐明肿瘤引流淋巴结在免疫检查点抑制剂治疗中的具体作用机制，发现其作为肿瘤特异性T细胞的来源地 | 研究样本仅限于结直肠癌患者，需要进一步验证在其他癌症类型中的普适性 | 阐明肿瘤引流淋巴结在免疫检查点抑制剂治疗中的响应机制及其对肿瘤微环境的调控作用 | 结直肠癌患者的肿瘤引流淋巴结和肿瘤组织 | 单细胞生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | 结直肠癌患者的肿瘤引流淋巴结和肿瘤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | NA | NA |
| 106 | 2025-11-16 |
Single-cell RNA-sequencing reveals adventitial fibroblast alterations during mouse atherosclerosis
2025-Oct-03, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示小鼠动脉粥样硬化过程中外膜成纤维细胞的动态变化 | 首次在动脉粥样硬化发生过程中对外膜细胞进行单细胞RNA测序分析，并发现SERPINH1基因在成纤维细胞中的差异表达及其功能影响 | 研究仅使用雄性Ldlr-/-小鼠模型，样本量较小（每组两个样本，每个样本来自三只小鼠的混合） | 探究外膜细胞在动脉粥样硬化中的作用及其潜在治疗靶点 | 雄性Ldlr-/-小鼠的主动脉外膜细胞和人类外膜成纤维细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, GWAS分析, 体外验证 | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 | 雄性Ldlr-/-小鼠，每组两个样本（每个样本由三只小鼠混合组成） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 107 | 2025-11-16 |
TGFB1/SMAD3-driven macrophage-myofibroblast transition promotes fibrosis progression in endometriosis
2025-Oct-02, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaaf051
PMID:41056423
|
研究论文 | 本研究揭示TGFB1/SMAD3信号通路驱动的巨噬细胞-肌成纤维细胞转化是子宫内膜异位症纤维化的新机制 | 首次发现巨噬细胞-肌成纤维细胞转化是子宫内膜异位症中肌成纤维细胞的新来源，并阐明TGFB1/SMAD3信号通路的调控作用 | NA | 探究子宫内膜异位症纤维化进展的细胞来源和调控机制 | 人类子宫内膜样本和子宫内膜异位症小鼠模型 | 单细胞生物学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序，免疫荧光，组织学分析，超微结构分析 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 人类子宫内膜样本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 108 | 2025-11-16 |
Unlocking novel T cell-based immunotherapy for hepatocellular carcinoma through neoantigen-driven T cell receptor isolation
2025-Jun-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-334148
PMID:39832892
|
研究论文 | 本研究通过分离肝细胞癌患者中对新抗原反应的T细胞及其T细胞受体，探索基于T细胞的免疫治疗新策略 | 首次系统分析肝细胞癌微环境中新抗原反应性T细胞的功能特征，并发现肝灌洗液和淋巴结是反应性T细胞的重要来源 | 研究样本量较小（7名患者），需要在更大队列中验证结果 | 评估晚期肝细胞癌患者的T细胞反应，识别可用于免疫治疗的T细胞群体 | 肝细胞癌患者的肿瘤组织、肝灌洗液和肝引流淋巴结 | 免疫肿瘤学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，T细胞受体测序，生物信息学分析 | NA | 转录组数据，蛋白质组数据，测序数据 | 7名肝细胞癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 109 | 2025-11-16 |
Upregulated haptoglobin in classical monocytes serves as a diagnostic and immunological biomarker in myocardial infarction: a cross-sectional multi-omics study
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1707912
PMID:41229424
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析发现结合珠蛋白(HP)在心肌梗死中显著上调，特别是在经典单核细胞中高表达，具有诊断价值 | 首次发现HP在心肌梗死患者经典单核细胞中特异性高表达，并证实其作为诊断生物标志物的价值 | 横断面研究设计，无法确定因果关系；样本量有限 | 寻找心肌梗死的可靠诊断生物标志物并了解其在免疫微环境中的作用 | 心肌梗死患者 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，qPCR，蛋白质组学，生物信息学分析 | WGCNA，免疫细胞浸润分析 | 基因表达数据，蛋白质组数据，临床样本 | 多个GEO数据集(GSE141512，GSE95368，GSE269269)和TCGA数据，外加独立验证队列(GSE66360等) | NA | 单细胞RNA-seq，蛋白质组学 | NA | NA |
| 110 | 2025-11-16 |
Uterine NK Cell Polarization Associates with Chronic Endometritis and Predisposition to Recurrent Implantation Failure
2025, International journal of women's health
DOI:10.2147/IJWH.S554069
PMID:41230044
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据揭示了子宫自然杀伤细胞极化与慢性子宫内膜炎及复发性种植失败的关联机制 | 首次通过单细胞RNA测序识别出两种功能不同的uNK细胞亚型，并建立了基于uNK2/uNK3特征比值的诊断模型 | 需要在前瞻性临床队列和功能实验中进一步验证临床效用 | 探究子宫内膜免疫微环境中uNK细胞极化与生殖健康障碍的关联机制 | 子宫内膜免疫细胞，特别是子宫自然杀伤细胞亚型 | 单细胞基因组学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 逻辑回归模型 | 基因表达数据 | 51例子宫内膜样本（18例CE患者和33例正常对照） | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 111 | 2025-11-16 |
Single-cell transcriptomics reveals the brain evolution of web-building spiders
2023-12, Nature ecology & evolution
IF:13.9Q1
DOI:10.1038/s41559-023-02238-y
PMID:37919396
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示结网蜘蛛大脑进化机制 | 首次构建结网蜘蛛大脑单细胞图谱，发现蘑菇体样神经元中正选择基因与学习记忆行为的关联 | 仅分析一种结网蜘蛛物种，未涵盖所有蜘蛛多样性 | 探究蜘蛛神经系统如何进化以适应结网捕食策略 | 结网蜘蛛(Hylyphantes graminicola)和两种原始穴居蜘蛛 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序,基因组测序,基因富集分析,RNA干扰实验 | NA | 单细胞转录组数据,基因组数据 | 超过30,000个单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq,全基因组测序 | NA | NA |
| 112 | 2025-11-16 |
Single-cell RNA sequencing unveils Lrg1's role in cerebral ischemia‒reperfusion injury by modulating various cells
2023-Nov-30, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-023-02941-4
PMID:38037097
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了Lrg1在脑缺血再灌注损伤中通过调节多种细胞功能状态的作用机制 | 首次在单细胞水平揭示Lrg1通过调节多种细胞类型功能状态参与脑缺血再灌注损伤的机制，发现Lrg1敲除能增强血脑屏障功能并促进抗炎和组织修复表型 | 研究仅使用小鼠模型，尚未在人类样本中验证；机制研究仍需进一步深入 | 探究Lrg1在脑缺血再灌注损伤中的具体作用机制 | 野生型和Lrg1敲除小鼠的脑组织 | 单细胞测序分析 | 脑缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序，免疫荧光，微血管白蛋白渗漏测试 | NA | 单细胞转录组数据，组织染色图像 | 野生型和Lrg1敲除小鼠脑组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 113 | 2025-11-16 |
Mouse gingival single-cell transcriptomic atlas identified a novel fibroblast subpopulation activated to guide oral barrier immunity in periodontitis
2023-11-28, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.88183
PMID:38015204
|
研究论文 | 通过小鼠牙龈单细胞转录组图谱发现新型成纤维细胞亚群在牙周炎中引导口腔屏障免疫 | 首次识别出AG成纤维细胞亚群及其与中性粒细胞、ILC3细胞形成的免疫轴机制 | 研究基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 阐明牙周炎中口腔屏障免疫异常启动机制 | 小鼠牙周炎模型的牙龈组织细胞 | 单细胞转录组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠牙周炎模型牙龈组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 114 | 2025-11-16 |
Single-cell RNA sequencing unravels the transcriptional network underlying zebrafish retina regeneration
2023-11-21, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.86507
PMID:37988404
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示斑马鱼视网膜再生过程中穆勒胶质细胞的转录网络和命运决定机制 | 发现了损伤诱导的穆勒胶质细胞分化轨迹，识别出具有穆勒胶质细胞和祖细胞混合身份特征的细胞群体 | 研究仅限于斑马鱼模型，未直接验证在人类视网膜疾病中的适用性 | 研究穆勒胶质细胞反应性与祖细胞产生和神经元分化的分子机制 | 斑马鱼视网膜中的穆勒胶质细胞、祖细胞和再生后代细胞 | 单细胞基因组学 | 视网膜营养不良 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未损伤和光损伤视网膜样本中的穆勒胶质细胞、祖细胞及再生后代 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 115 | 2025-11-16 |
Mouse gingival single-cell transcriptomic atlas: An activated fibroblast subpopulation guides oral barrier immunity in periodontitis
2023-Jul-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.13.536751
PMID:37546811
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建小鼠牙龈细胞图谱，发现一种激活的成纤维细胞亚群在牙周炎中引导口腔屏障免疫反应 | 首次识别出AG成纤维细胞亚群，并揭示其通过AG成纤维细胞-中性粒细胞-ILC3轴启动牙龈炎症的新机制 | 研究基于小鼠模型，人类中的适用性需要进一步验证 | 阐明牙周炎中异常口腔屏障免疫的启动机制 | 小鼠牙龈组织细胞 | 单细胞转录组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠牙周炎模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 116 | 2025-11-16 |
Mechanisms of stretch-mediated skin expansion at single-cell resolution
2020-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2555-7
PMID:32728211
|
研究论文 | 本研究通过开发小鼠模型，在单细胞分辨率下探究了拉伸如何通过调控表皮干细胞和基底祖细胞的活性来介导皮肤扩张 | 首次在单细胞分辨率下揭示拉伸诱导皮肤扩张的机制，结合克隆分析、定量建模和单细胞RNA测序的多学科方法 | 研究基于小鼠模型，在人类皮肤中的适用性需要进一步验证 | 阐明机械力在体内对表皮细胞行为的影响机制 | 小鼠皮肤表皮细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序、克隆分析、定量建模、转录组分析、染色质分析 | 小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据、转录组数据、染色质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 117 | 2025-11-15 |
Introduction to Oral Immunity
2026, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-032-03176-1_1
PMID:41225090
|
综述 | 本章全面概述口腔免疫系统的组成与功能，强调其在维持共生微生物耐受与病原体防御中的双重作用 | 整合单细胞RNA测序、空间转录组学等新技术在口腔免疫研究中的应用前景 | NA | 阐明口腔免疫机制在健康与炎症状态下的作用及其与全身免疫的关联 | 口腔免疫系统组分（上皮屏障、唾液抗菌因子、免疫细胞）及共生微生物 | NA | 口腔炎症性疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 宏基因组学, 多组学整合 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 118 | 2025-11-15 |
Inflammatory Mediators in Peri-Implantitis: From Pathophysiology to Therapeutic Targets
2026, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-032-03176-1_21
PMID:41225110
|
综述 | 本文系统探讨种植体周围炎的炎症介质特征及其从病理机制到治疗靶点的转化价值 | 整合基因多态性、蛋白质组学和单细胞RNA测序技术揭示种植体周围炎特有的细胞互作网络与炎症通路 | 未明确说明纳入研究的样本规模与实验方法的具体局限性 | 阐明种植体周围炎的发病机制并探索精准医疗策略 | 种植体周围炎相关的炎症介质与分子标志物 | 数字病理学 | 牙科种植体疾病 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 基因多态性分析 | NA | 唾液样本, 种植体周沟液, 基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 119 | 2025-11-15 |
Microbiota shape the colon epithelium controlling inter-crypt absorptive goblet cells via butyrate-GP R109A signalling
2025-Dec-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2573045
PMID:41208257
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了肠道微生物通过丁酸盐-GPR109A信号通路调控结肠上皮细胞身份和功能的机制 | 发现了微生物通过丁酸盐-GPR109A信号通路调控具有吸收和分泌双重特征的非常规隐窝间杯状细胞的新机制 | NA | 阐明微生物来源信号如何影响结肠上皮细胞身份和功能 | 小鼠结肠上皮细胞和人类样本 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 使用无菌小鼠、抗生素处理小鼠和定植实验小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 120 | 2025-11-15 |
GPR91 mediates low shear stress-induced endothelial ferroptosis via EGR1-dependent GPX4 repression
2025-Dec, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112127
PMID:40939914
|
研究论文 | 本研究揭示低剪切应力通过GPR91/EGR1/GPX4信号轴诱导血管内皮细胞铁死亡的分子机制 | 首次发现GPR91作为机械敏感受体连接低剪切应力与铁死亡信号通路，并阐明EGR1介导的GPX4转录抑制机制 | 研究主要基于体外细胞实验，需要进一步在体实验验证 | 探究低剪切应力诱导内皮细胞铁死亡的分子机制 | 血管内皮细胞、HEK293T细胞、动脉粥样硬化斑块 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、ChIP-qPCR、RNA测序、平行板流动腔系统 | NA | 基因表达数据、表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |