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当前共找到 40677 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-06-19 |
Hypoxia and lactate metabolism-related gene COL5A3 promotes triple negative breast cancer progression via DDR1/FAK/PI3K/AKT pathway
2026-Jun-17, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-026-00872-7
PMID:42310796
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研究论文 | 本研究鉴定了一个与缺氧和乳酸代谢相关的基因特征，并发现核心基因COL5A3通过DDR1/FAK/PI3K/AKT通路促进三阴性乳腺癌进展 | 首次建立了结合缺氧和乳酸代谢相关基因的预后模型，并阐明了COL5A3通过DDR1/FAK/PI3K/AKT通路促进TNBC进展的机制 | 需要进一步研究这些基因在TNBC中的生物学作用以优化治疗方法 | 探索缺氧和乳酸代谢相关基因在三阴性乳腺癌中的预后意义及作用机制 | 三阴性乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | 基因表达谱分析、单细胞转录组测序 | LASSO回归、Cox回归 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 来自在线数据库的TNBC患者数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 102 | 2026-06-19 |
Cardiac immunity and heart repair: Mechanism, challenge, and future direction
2026-Jun-17, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000004078
PMID:42311068
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综述 | 本文综述了心脏免疫信号在心脏生物学中的核心调控作用，包括胚胎发育、心肌损伤修复及再生过程中的免疫细胞功能，并探讨了基于单细胞和空间转录组学的最新发现以及针对免疫通路的治疗策略 | 整合了发育免疫学、心脏损伤模型和再生医学的研究进展，从分子、细胞和系统层面揭示了心脏-免疫相互作用的统一视图，为精准治疗提供了新方向 | 未提及具体局限性 | 阐明免疫系统在心脏发育、损伤修复和再生中的作用机制，并探讨靶向免疫通路以调节炎症、促进修复和恢复心脏功能的治疗潜力 | 心脏免疫细胞（包括巨噬细胞、T细胞等）及其在心脏发育和心肌损伤修复中的功能 | 机器学习和数字病理学（涵盖单细胞和空间转录组学分析） | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium FFPE |
| 103 | 2026-06-19 |
Functional and dysfunctional T regulatory cell states in human tissues in RA and other autoimmune arthritic diseases
2026-Jun-16, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-026-02540-4
PMID:42304100
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析类风湿关节炎及其他自身免疫性关节炎患者滑膜组织中的调节性T细胞，发现了两种主要的功能性和功能障碍性T细胞状态 | 首次在滑膜组织中鉴定出CD25CXCR6和CD25AREG两种不同的T细胞亚群，并揭示了成纤维细胞激活的皮质醇驱动AREG表达导致功能损伤，以及TNFR2信号通路在维持T细胞功能中的作用 | 未明确说明 | 探究类风湿关节炎及其他自身免疫性关节炎患者组织中调节性T细胞的功能和功能障碍状态 | 类风湿关节炎、青少年特发性关节炎等自身免疫性关节炎患者的滑膜组织和血液中的T细胞 | 机器学习 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 104 | 2026-06-19 |
Integrated Multi-Omics Analysis and Experimental Validation Identify BCAT1 as a Critical Driver of Hepatocyte Pyroptosis in Acute-On-Chronic Liver Failure
2026-Jun-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202600199RR
PMID:42258325
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研究论文 | 通过整合多组学分析和实验验证，发现BCAT1是慢加急性肝衰竭中肝细胞焦亡的关键驱动因子 | 首次结合WGCNA、三种机器学习算法和单细胞RNA-seq，系统鉴定出BCAT1作为肝细胞特异性焦亡调控因子，并揭示其通过GSDMD/Caspase-1通路驱动肝损伤的机制 | 具体局限性未在摘要中提及，可能包括样本量有限、动物模型与人类ACLF的差异、以及BCAT1在其他肝细胞类型中的功能未充分探讨 | 探索氨基酸代谢相关基因在慢加急性肝衰竭（ACLF）发病机制中的关键作用，并鉴定诊断和治疗靶点 | ACLF患者的转录组数据和肝细胞，以及APAP诱导的ACLF小鼠模型 | 机器学习 | 慢加急性肝衰竭 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 加权基因共表达网络分析 | 随机森林, SVM-RFE, Boruta | 转录组数据, 单细胞测序数据 | 未在摘要中明确提及，但包括ACLF患者的转录组数据和单细胞RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 105 | 2026-06-19 |
Plasmodium falciparum leucine-rich repeat 5 disruption alters the transcription progression during asexual and sexual stage development
2026-Jun-15, mSphere
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/msphere.00186-26
PMID:42294623
|
研究论文 | 研究了恶性疟原虫富含亮氨酸重复蛋白LRR5（PF3D7_1432400）在无性和有性阶段发育中对转录进程的影响 | 利用优化的单细胞RNA测序方法分析非同步培养的寄生虫，首次揭示LRR5破坏如何改变寄生虫的转录异质性、压力反应途径和配子体形成的早期激活 | 未提供具体局限性信息 | 探索LRR5蛋白在寄生虫发育应激反应和配子体形成中的作用 | 恶性疟原虫的野生型NF54品系和等基因LRR5突变体（LRR5pB） | 数字病理学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 非同步培养的寄生虫样本，涉及野生型和突变体群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 优化的单细胞RNA测序方法 |
| 106 | 2026-06-19 |
Systematic characterization of pyroptosis-related gene patterns identifies potential prognostic inflammatory phenotypes in sepsis
2026-Jun-13, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-026-01913-0
PMID:42286183
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研究论文 | 基于焦亡相关基因特征系统分析脓毒症预后炎症表型 | 首次构建了7基因焦亡相关基因评分模型，该模型在多个独立队列中验证了良好的短期死亡预测性能，并结合单细胞RNA测序揭示了基因评分在存活与非存活患者中的动态变化 | 研究基于公共数据集，样本量有限，临床推广应用需进一步前瞻性验证 | 探索焦亡相关基因在脓毒症中的分子亚型分型及预后预测价值 | 脓毒症患者及脓毒性休克患者 | 机器学习 | 脓毒症 | 转录组测序, 单细胞RNA测序 | LASSO回归, Cox回归 | 基因表达数据 | 主队列GSE65682（有明确定义），独立队列GSE95233（脓毒性休克），单细胞数据GSE167363（需进一步说明具体样本量） | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 107 | 2026-06-14 |
Ophiopogon japonicus alleviates pulmonary fibrosis through modulation of HIF1A/TUBB3 axis-associated M2 macrophage polarization and arginine metabolic alterations
2026-Jun-12, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.122015
PMID:42285238
|
研究论文 | 通过多组学整合分析揭示麦冬水提物通过调控HIF1A/TUBB3轴介导的M2型巨噬细胞极化和精氨酸代谢异常缓解肺纤维化的作用机制 | 首次整合转录组学、代谢组学、单细胞转录组学与虚拟敲除分析，系统阐明麦冬水提物通过HIF1A/TUBB3轴调节M2型巨噬细胞极化和精氨酸代谢缓解肺纤维化，并发现麦冬皂苷D可能为关键活性成分 | 研究基于小鼠模型，尚需临床验证；关键靶点HIF1A与TUBB3上下游关系基于预测网络分析，需进一步功能实验确认 | 评估麦冬水提物对肺纤维化的保护作用及其抗纤维化机制是否与HIF1A/TUBB3轴相关的M2型巨噬细胞极化和精氨酸代谢调控有关 | 麦冬水提物的活性成分及博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型 | 机器学习 | 肺纤维化 | UHPLC-Q Exactive Orbitrap-HRMS, 组学分析 | 机器学习模型（具体未明确） | 转录组数据, 代谢组数据, 单细胞转录组数据 | 小鼠模型（具体样本量未明确提及） | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序, 代谢组学 | NA | NA |
| 108 | 2026-06-19 |
Qishen Yiqi dripping pills alleviate myocardial ischemia-reperfusion-induced fibrotic injury by inhibiting fibroblast activation via the transforming growth factor-beta/Periostin pathway
2026-Jun-10, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.122012
PMID:42269799
|
研究论文 | 通过多组学分析与实验验证，揭示芪参益气滴丸通过抑制TGF-β/Periostin通路减轻心肌缺血再灌注诱导的纤维化损伤 | 首次整合单细胞测序、转录组学、网络药理学和分子动力学模拟，系统阐明芪参益气滴丸通过靶向TGF-β/Periostin轴逆转成纤维细胞激活的机制 | 未明确说明研究局限性 | 探究芪参益气滴丸是否通过调控TGF-β/Periostin信号通路抑制成纤维细胞激活，从而减轻心肌缺血再灌注后的纤维化重塑 | 心肌缺血再灌注损伤后的纤维化修复过程 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞测序, 转录组学, 网络药理学, 分子动力学模拟 | NA | 基因表达数据 | 小鼠（C57BL/6N品系） | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 109 | 2026-06-19 |
REGγ Links Inflammation to Fibrosis in Post-Necrotizing Enterocolitis Intestinal Strictures by Activating Transforming Growth Factor-β/Smad3 Signaling
2026-Jun-10, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2026.05.003
PMID:42270073
|
研究论文 | 研究表明REGγ通过激活TGF-β/Smad3信号通路，在坏死性小肠结肠炎后肠狭窄中连接炎症与纤维化 | 首次揭示REGγ作为炎症-纤维化串扰的关键介质，并通过单细胞RNA测序确认其在成纤维细胞中的富集，为治疗提供新靶点 | 无法从标题和摘要中明确获取 | 阐明坏死性小肠结肠炎后肠狭窄中炎症驱动纤维化的分子机制 | 人类NEC肠狭窄标本、小鼠模型和成纤维细胞 | NA | 坏死性小肠结肠炎 | 单细胞RNA测序、免疫荧光 | NA | 基因表达数据、组织图像 | 人类标本（数量未指定）和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 110 | 2026-06-19 |
Dynamic urinary proteomics integrates single-cell and spatial transcriptomics to reveal tumour microenvironment and predict immunotherapy response in biliary tract cancer
2026-Jun-09, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-335513
PMID:41151791
|
研究论文 | 该研究通过动态尿液蛋白质组学整合单细胞和空间转录组学，揭示了胆道癌的肿瘤微环境并预测免疫治疗反应 | 首次将尿液蛋白质组学应用于免疫肿瘤学，建立无创预测免疫检查点抑制剂反应的工具，并整合单细胞和空间转录组学探索肿瘤微环境机制 | 未提及具体局限性，但样本量相对较小（97名患者）且验证队列仅24名，可能影响普适性 | 建立尿液蛋白质组学作为胆道癌免疫检查点抑制剂反应的预测工具，并阐明其与肿瘤动态和肿瘤微环境重塑的关系 | 97名接受免疫检查点抑制剂治疗的初治胆道癌患者的211份尿液样本以及11份肿瘤活检样本 | 机器学习 | 胆道癌 | 质谱（MS）、单细胞转录组学、空间转录组学 | 机器学习模型 | 蛋白质组数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 97名患者的211份尿液样本和11份肿瘤活检样本 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 111 | 2026-06-19 |
SpaVGMC: A Unified Representation Learning Framework via Structural and Semantic Alignment in Spatial Transcriptomics
2026-Jun-08, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.6c01121
PMID:42253102
|
研究论文 | 提出SpaVGMC，一种统一表征学习框架，通过结构与语义对齐实现空间转录组学中的空间域识别 | 首次将结构变分表征学习、结构信息对齐和语义对齐结合到统一框架中，无需数据增强即可利用分布感知对比学习捕捉全局转录组织 | 可能对高噪声或超稀疏数据敏感，未详细说明计算资源需求 | 解决空间转录组学中局部过平滑、拓扑保真度受损及全局语义结构建模不足的问题 | 多种空间转录组学数据集中的组织切片空间域 | 计算机视觉 | 不适用 | 空间转录组学 | 结构变分自编码器 | 空间转录组数据 | 不适用（提及多种数据集，未给出具体样本量） | 不适用 | 空间转录组学 | 不适用 | 不适用 |
| 112 | 2026-06-19 |
The embryonic origins of site-specific arthritis
2026-Jun-08, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-026-02542-2
PMID:42260300
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序、影像学和X射线断层扫描，研究了人类手指关节中近端指间关节易受炎症性关节炎影响而远端指间关节不受影响的细胞基础，发现PI16成纤维细胞在炎症易感性中起关键作用 | 首次揭示胎儿发育期间不同指间关节的细胞组成差异，特别是PI16成纤维细胞在近端指间关节的富集及其与炎症易感性的关联，提出间充质细胞化学计量差异是组织炎症易感性的普遍原则 | 仅关注胎儿发育期，未涉及成人关节的验证；未明确PI16成纤维细胞在炎症发生过程中的具体机制 | 探究特定解剖部位炎症易感性的细胞基础 | 人类胎儿手指关节（近端指间关节和远端指间关节） | 单细胞生物学 | 关节炎 | 单细胞RNA测序，影像学，X射线断层扫描 | NA | 单细胞转录组数据，影像数据 | 人类胎儿手指关节样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 113 | 2026-06-19 |
Neutrophil-Mimetic MRI Enables Ultra-Early Detection of Vascular Inflammation After Stroke
2026-Jun-08, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.71325
PMID:42260622
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研究论文 | 开发一种模拟中性粒细胞的磁共振成像探针，用于超早期检测中风后血管炎症 | 利用单细胞RNA测序数据分析发现E-selectin是早期激活内皮细胞的标志，并据此设计模拟中性粒细胞粘附的铁氧化物微粒作为MRI探针，实现超早期（中风后4小时）的炎症成像 | 未提及研究限制 | 开发一种超早期检测中风后血管炎症的磁共振成像方法，以识别可能受益于免疫调节治疗的患者 | 脑组织中的E-selectin表达和中性粒细胞粘附过程 | 计算机视觉, 机器学习 | 中风 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 114 | 2026-06-19 |
scParadise: tunable, highly accurate multi-level cell type annotation, unknown cell type identification, and modality imputation
2026-Jun-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag612
PMID:42312491
|
研究论文 | scParadise是一个可调谐、高准确度的多层级细胞类型注释、未知细胞类型识别及模态插补工具，用于单细胞RNA测序数据分析 | 提出scParadise综合框架，包含三个集成工具（scAdam、scEve和scNoah），能够实现多层级细胞类型注释、未知细胞类型识别、跨组织模态插补以及标准化基准测试，并发现三个新的自然杀伤T细胞亚群 | NA | 开发一种新型计算方法，解决单细胞RNA测序数据在细胞类型注释和模态插补方面的挑战 | 单细胞RNA测序数据、Tabula Muris Senis图谱、人类内脏脂肪组织中的免疫细胞 | 机器学习 | 肥胖相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | Tabula Muris Senis图谱及人类内脏脂肪组织样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 115 | 2026-06-19 |
Multi-omics profiling identifies ACP2 as a lysosome-associated biomarker linked to immune dynamics and clinical outcomes in glioma
2026-Jun-07, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 通过多组学分析鉴定ACP2作为胶质瘤中与免疫动态和临床结局相关的溶酶体生物标志物 | 首次系统揭示溶酶体酸性磷酸酶2（ACP2）在胶质瘤中的表达模式、预后价值及免疫关联，并整合多组学数据构建其功能网络 | 未对ACP2的功能机制进行实验验证，且基于公共数据库的分析可能存在样本异质性和偏倚 | 明确ACP2在胶质瘤恶性进展和免疫微环境重塑中的作用，评估其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 胶质瘤患者样本及多组学数据（包括TCGA和CGGA的bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq及单核RNA-seq数据） | 机器学 | 胶质瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 蛋白质-蛋白质相互作用分析, 分子对接 | NA | 转录组数据, 蛋白质相互作用数据, 药物基因组学数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 116 | 2026-06-19 |
Mitochondrial potential reflects T cell fitness and function during cancer immunotherapy
2026-Jun-07, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkag120
PMID:42310166
|
研究论文 | 研究线粒体膜电位作为T细胞适应性和免疫治疗反应指标的潜力 | 首次将线粒体膜电位与T细胞耗竭样转录状态及免疫治疗反应不佳相关联 | 未提及具体局限性 | 探究线粒体膜电位作为T细胞表型和免疫治疗反应指标的作用 | 非小细胞肺癌和透明细胞肾细胞癌患者的肿瘤相关T细胞 | 机器学习 | 肺癌, 肾癌 | 单细胞RNA测序, TCRβ测序 | NA | 基因表达数据 | 非小细胞肺癌和透明细胞肾细胞癌患者的外周血单核细胞和原发肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 117 | 2026-06-19 |
Integrating Radiomics and Computational Pathology to Predict Early Recurrence of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma and Uncover Its Biological Basis in Tumor Microenvironment
2026-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202523985
PMID:41969272
|
research paper | 结合影像组学和计算病理学预测胰腺导管腺癌早期复发并揭示其肿瘤微环境中的生物学基础 | 首次将影像组学与计算病理学特征整合，构建多模态预测模型，并通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示模型背后的细胞和分子机制 | 回顾性研究设计和有限的样本量可能需要前瞻性验证来确认结果 | 开发并验证整合影像组学与病理组学的模型用于预测胰腺导管腺癌术后早期复发，并阐明其潜在的生物学机制 | 接受R0切除的225名胰腺导管腺癌患者 | 计算机视觉, 数字病理学 | 胰腺癌 | 影像组学, 计算病理学, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 多种机器学习模型（11种） | CT影像, 全切片图像, 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 225名患者（回顾性队列），前瞻性收集标本用于单细胞和空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 118 | 2026-06-19 |
Integrated multi-omics strategies for identifying novel therapies in psoriasis
2026-Jun-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag347
PMID:42209436
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研究论文 | 通过整合多组学策略识别银屑病新型治疗方法，优先筛选出29个高置信度蛋白靶点 | 首次将全蛋白质组孟德尔随机化与单细胞RNA测序、共定位分析等多种方法整合，系统性地优先排序银屑病治疗靶点，发现13个新候选靶点 | 未明确提及具体局限性，但可能涉及样本规模、验证范围或功能验证不足等常见问题 | 识别银屑病的潜在治疗靶点，为药物开发提供基础 | 银屑病患者及银屑病关节炎患者 | 计算机视觉, 自然语言处理, 机器学习, 数字病理学 | 银屑病 | MR, RNA-seq, scRNA-seq | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据 | 多个独立数据集（具体数量未在摘要中说明） | 10x Genomics, Illumina | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | NA |
| 119 | 2026-06-19 |
The role of stem cells in pituitary tumour formation
2026-Jun-01, Endocrine-related cancer
IF:4.1Q2
DOI:10.1530/ERC-26-0171
PMID:42227347
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综述 | 总结干细胞在垂体肿瘤形成中的作用，包括肿瘤起始、维持和进展的潜在角色 | 整合了当前关于垂体干细胞和肿瘤干细胞样群体在垂体肿瘤生物学中的证据，提出了未来基因组分析框架 | 未提及具体研究限制，可能受限于现有证据的不足 | 探讨垂体干细胞在垂体肿瘤形成中的作用 | 垂体干细胞和肿瘤干细胞样群体 | 机器学习 | 垂体肿瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 120 | 2026-06-19 |
CIPHER: An end-to-end framework for designing optimized aggregated spatial transcriptomics experiments
2026-Jun, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014362
PMID:42241464
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研究论文 | 提出一个名为CIPHER的端到端框架，用于优化聚合空间转录组实验的设计 | 将实验编码矩阵与下游细胞嵌入联合优化，直接整合成像实验的物理限制到损失函数中 | 该研究未提及具体局限性 | 优化聚合空间转录组实验中基因到特征的编码方式，提升解码准确性和实验可测量性 | 基于小鼠大脑单细胞RNA测序参考数据的聚合空间转录组实验 | 自然语言处理 | NA | 空间转录组学 | 神经网络 | 转录组数据 | 大规模小鼠脑单细胞RNA测序参考数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |