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当前共找到 45073 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-10-31 |
Integration of bulk RNA-seq data with single-cell RNA-seq data to identify urinary biomarkers derived from prostate tumor tissues
2026-Aug-03, BMC urology
IF:1.7Q3
DOI:10.1186/s12894-026-02295-y
PMID:42958227
|
研究论文 | 该研究整合bulk RNA-seq与单细胞RNA-seq数据，筛选并验证来源于前列腺肿瘤组织的尿液生物标志物MARCKSL1用于前列腺癌诊断 | 首次通过整合链特异性捕获bulk RNA-seq与单细胞RNA-seq数据系统筛选来源于前列腺肿瘤细胞的尿液mRNA生物标志物，并发现MARCKSL1可高特异性区分前列腺癌及临床显著前列腺癌 | qPCR验证样本量较小（63例尿液样本），体外敲低实验仅初步探索生物学功能，仍需更大规模前瞻性队列验证MARCKSL1的临床诊断效能 | 筛选来源于前列腺肿瘤细胞的尿液mRNA生物标志物，用于前列腺癌及临床显著前列腺癌的无创诊断和风险分层 | 前列腺癌患者肿瘤及癌旁正常前列腺组织、前列腺癌患者尿液样本、年龄匹配的无癌健康男性尿液样本 | 数字病理学, 转录组学 | 前列腺癌 | 链特异性捕获RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qPCR, 基因敲低实验 | NA | RNA-seq数据, 单细胞转录组数据, qPCR数据 | 5对肿瘤及癌旁正常前列腺组织，10例尿液样本（发现阶段），63例尿液样本（验证阶段，含33例前列腺癌患者和30例健康男性），3例正常前列腺组织和13例前列腺癌组织的scRNA-seq数据 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 102 | 2026-10-31 |
The VASN-YAP-MYL9 axis drives M2-like macrophage polarization and immune evasion in colorectal cancer
2026-Aug-03, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08741-7
PMID:42958563
|
研究论文 | 本文揭示了VASN-YAP-MYL9轴驱动结直肠癌中M2样巨噬细胞极化和免疫逃逸的机制 | 首次发现VASN通过激活Hippo-YAP通路促进YAP/TEAD4复合物直接激活MYL9转录，进而通过IL-4和IL-13的旁分泌分泌驱动巨噬细胞向M2样表型极化，介导免疫逃逸 | 摘要中未明确说明研究的具体局限性 | 探究VASN在结直肠癌肿瘤免疫微环境调控中的具体作用及其分子机制 | 结直肠癌患者组织样本及同系小鼠模型 | 肿瘤免疫学、分子生物学 | 结直肠癌 | TCGA转录组分析、单细胞转录组测序、免疫组化、免疫荧光、Transwell共培养、ELISA、染色质免疫沉淀(ChIP)、双荧光素酶报告基因实验、遗传拯救策略 | NA | 转录组数据、图像、文本 | NA | NA | 单细胞转录组测序、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 103 | 2026-10-31 |
Targeting monocyte dysregulation in ovarian cancer: insights from single-cell genomics and Mendelian randomization
2026-Aug-01, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-026-02217-4
PMID:42958425
|
研究论文 | 该研究整合单细胞转录组学与孟德尔随机化，识别与卵巢癌风险存在因果关联的单核细胞相关基因，并验证SGK1在免疫抑制性巨噬细胞极化中的作用 | 首次将单细胞基因组学与孟德尔随机化相结合，从因果关系层面揭示单核细胞在卵巢癌发病中的参与，并鉴定出SGK1作为精准治疗靶点 | 摘要中未明确提及研究局限性，因果推断依赖遗传工具变量假设，体外验证仍需体内实验进一步证实 | 探究单核细胞在卵巢癌发病机制中的因果参与及其在肿瘤免疫微环境中的作用 | 卵巢癌患者单核细胞及健康对照、卵巢癌GWAS数据及eQTLGen统计数据集 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, eQTL分析, 孟德尔随机化, qRT-PCR, Western blot | NA | 单细胞转录组数据, 基因组关联数据, 图像 | eQTLGen统计n=31,684，卵巢癌GWAS 1,588例病例，另含GEO与TISCH单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 104 | 2026-10-31 |
Bletilla striata-derived extracellular vesicles armed probiotic by supramolecular assembly ameliorates colitis via macrophage modulation and microbiota restoration
2026-Aug-01, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04866-5
PMID:42958511
|
研究论文 | 该研究通过超分子组装将白及来源的细胞外囊泡与益生菌大肠杆菌Nissle 1917结合，构建纳米生物治疗剂，用于改善结肠炎 | 首次利用超分子组装将白及来源细胞外囊泡与益生菌EcN结合，实现跨物种协作的纳米生物治疗，兼具益生菌递送增强、直接抗炎、菌群恢复和黏膜免疫重编程的多重机制 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 开发新型纳米生物治疗策略，促进黏膜修复和恢复免疫平衡，用于炎症性肠病治疗 | 结肠炎模型（炎症性肠病） | 纳米医学、微生物组学、单细胞组学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、INVADE-seq、超分子组装 | NA | 基因表达数据、微生物组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 105 | 2026-10-31 |
SELENOP-LRP8-mediated macrophage-endothelial cell interaction promotes breast cancer vascular invasion by inducing metabolic reprogramming in endothelial cells
2026-Jul-31, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-026-06359-y
PMID:42946865
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和空间转录组等技术，揭示了SELENOP+巨噬细胞通过SELENOP-LRP8轴与内皮细胞相互作用，诱导内皮细胞代谢重编程，从而促进乳腺癌血管侵犯 | 首次鉴定出与乳腺癌血管侵犯相关的SELENOP+巨噬细胞亚群，并阐明SELENOP-LRP8轴通过诱导内皮细胞胆固醇代谢重编程和Hedgehog通路激活促进血管侵犯的新机制，提出抗血管生成联合胆固醇通路靶向治疗的策略 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床样本量有限，SELENOP-LRP8轴在人体中的确切作用及联合治疗策略的临床转化仍需进一步验证 | 鉴定与乳腺癌血管侵犯相关的巨噬细胞亚群，并探究其如何影响内皮细胞行为及驱动血管侵犯的分子机制 | 乳腺癌标本（按血管侵犯特征分组）、SELENOP+巨噬细胞、内皮细胞、Selenop条件性敲除小鼠（Selenopf/f; Lyz2Cre）及E0771同种移植瘤模型 | 肿瘤生物学、单细胞组学、空间转录组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组、多重免疫荧光、共培养实验、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、分子对接、免疫共沉淀 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、图像、文本 | 乳腺癌标本（按血管侵犯特征分组，具体数量未在摘要中说明）、小鼠E0771同种移植瘤模型 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 106 | 2026-10-31 |
Endothelial regulators in the infrapatellar fat pad of osteoarthritis revealed by integrative multi-omics and genetic causal inference
2026-Jul-31, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-026-06365-0
PMID:42957875
|
研究论文 | 该研究整合单核RNA测序、空间转录组学和孟德尔随机化分析，揭示骨关节炎髌下脂肪垫中内皮细胞的关键调控基因FAM241A和TK2 | 首次结合snRNA-seq、空间转录组学与孟德尔随机化因果推断，鉴定出FAM241A和TK2作为骨关节炎髌下脂肪垫内皮细胞特异性因果调控基因，并揭示其时空调控转录程序 | 摘要未明确说明样本量及实验验证的局限性，因果推断基于遗传工具变量，仍需进一步功能实验验证 | 解析骨关节炎髌下脂肪垫的细胞和分子图谱，鉴定内皮细胞特异性因果调控基因 | 骨关节炎患者的髌下脂肪垫组织 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 孟德尔随机化, eQTL, pQTL, GWAS | NA | 基因表达数据, 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 107 | 2026-10-31 |
Chromogranin B promotes EMT-associated stem-like properties and chemoresistance in HNSCC
2026-Jul-30, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08729-3
PMID:42947227
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研究论文 | 该研究揭示CHGB通过PI3K/AKT/ZEB1轴促进HNSCC的EMT相关干性和化疗耐药，并作为预后生物标志物和治疗靶点 | 首次发现CHGB作为上游调控因子协调HNSCC中EMT相关干性和化疗耐药，并阐明其通过PI3K/AKT/ZEB1信号轴发挥作用的分子机制 | 研究主要基于体外细胞实验和动物模型，缺乏大规模临床队列验证；CHGB调控PI3K/AKT的具体上游机制尚未完全阐明 | 探究CHGB在HNSCC中调控EMT相关干性和化疗耐药的作用及分子机制 | 头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）细胞系、异种移植小鼠模型及公共数据库中的HNSCC患者样本 | 肿瘤生物学、分子病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序、转录组分析、基因集富集分析、加权基因共表达网络分析、Cox回归分析 | NA | 文本（基因表达数据）、图像（组织学数据） | NA | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 108 | 2026-10-31 |
Identification of glutathione metabolism-related biomarkers in non-alcoholic fatty liver disease based on single-cell and bulk RNA sequencing
2026-Jul-29, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-026-02444-0
PMID:42958345
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研究论文 | 该研究通过单细胞和批量RNA测序分析，识别非酒精性脂肪性肝病中谷胱甘肽代谢相关的生物标志物 | 首次将单细胞RNA测序与五种算法结合评估谷胱甘肽代谢相关基因评分，识别出胆管细胞为关键细胞类型，并发现DDAH2为核心生物标志物 | 研究基于公共数据库的转录组数据，体外验证仅使用HepG2细胞系，需要进一步实验验证 | 探究谷胱甘肽代谢在非酒精性脂肪性肝病发展中的分子机制并识别相关生物标志物 | 非酒精性脂肪性肝病患者样本及棕榈酸诱导的HepG2细胞 | 转录组学 | 非酒精性脂肪性肝病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, RT-qPCR, 蛋白质印迹 | NA | 基因表达数据, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 109 | 2026-10-31 |
Quercetin attenuates maternal respiratory virus-induced fetal neuroimmune dysregulation
2026-Jul-28, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-026-03983-0
PMID:42947203
|
研究论文 | 该研究利用小鼠孕期流感模型，揭示母体NK细胞来源的颗粒酶B驱动胎儿神经免疫紊乱，并证明槲皮素可双效改善母体免疫失调与胎儿神经炎症 | 首次将母体NK细胞来源的颗粒酶B确定为呼吸道病毒感染诱导胎儿神经免疫紊乱的核心驱动因素，并发现槲皮素通过降低NK源性颗粒酶B、增强蜕膜Serpina3n等妊娠支持程序发挥双重免疫调节作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据仅限于体外蜕膜NK细胞刺激实验，结论向人类临床转化仍需进一步验证 | 探究孕期母体呼吸道病毒感染破坏胎儿神经免疫稳态的因果免疫机制，并评估槲皮素的干预效果 | 孕鼠（H1N1 PR8株感染模型）、胎鼠脑组织及子代、人蜕膜NK细胞 | 神经免疫学、生殖免疫学 | 神经发育障碍、自闭症谱系障碍、流感病毒感染 | 单细胞RNA测序、免疫染色、定量分析、蜕膜转录组分析、体外细胞刺激实验 | 小鼠孕期H1N1感染模型、NK细胞清除模型、Gzmb基因敲除模型 | 图像、文本（转录组数据） | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 110 | 2026-10-31 |
Siderophore sharing protects clonal Pseudomonas aeruginosa biofilms from colistin
2026-07-22, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00588-26
PMID:42307240
|
研究论文 | 该研究利用单细胞转录组学分析克隆铜绿假单胞菌PAO1生物膜对黏菌素的响应，揭示铁载体共享介导亚群间交叉保护 | 首次在单细胞水平揭示克隆细菌群体中铁载体生产特化与接收普遍化的社会分工模式，将公共物品理论扩展到克隆群体，并发现铁载体共享介导遗传相同亚群间的交叉保护 | 研究仅针对铜绿假单胞菌PAO1单一菌株的克隆生物膜，未涉及多物种群落或临床分离株的验证 | 探究克隆细菌群体内是否存在社会角色分化及铁载体共享如何介导黏菌素保护 | 铜绿假单胞菌PAO1克隆生物膜 | 微生物学 | 细菌感染 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 111 | 2026-10-31 |
High-resolution mri guided whole mouse brain neuronal cell type atlas using deep learning
2026-Jul-07, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10608-y
PMID:42414549
|
研究论文 | 该研究通过整合高分辨率扩散磁共振成像（dMRI）和三维光片显微镜数据，利用深度学习生成全脑神经元细胞类型图谱 | 开发了一个多模态框架，将高分辨率dMRI与三维光片显微镜数据通过配准到Allen小鼠脑共同坐标框架进行整合，并利用深度学习生成10微米各向同性分辨率的全脑神经元细胞类型图谱，揭示了dMRI预测细胞类型的能力 | 研究仅针对成年小鼠大脑，未涉及发育或疾病模型；dMRI与空间转录组学衍生细胞类型之间的相关性仍需进一步验证；深度学习模型的泛化能力未在其它物种或成像条件下评估 | 探究dMRI预测细胞类型的能力，并建立高效的高分辨率脑神经元图谱生成策略 | 成年小鼠大脑 | 数字病理学, 神经影像学 | NA | 扩散磁共振成像（dMRI）, 三维光片显微镜, 空间转录组学 | 深度学习 | 图像, 文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 112 | 2026-10-31 |
Dissection of mammary cell landscape in ruminal dysbiosis-induced mastitis by single-cell RNA sequencing
2026-Jul-07, NPJ biofilms and microbiomes
IF:7.8Q1
DOI:10.1038/s41522-026-01076-7
PMID:42414278
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序等技术，分析了瘤胃菌群失调诱导的乳腺炎（RDIM）奶山羊乳腺细胞图谱，并结合瘤胃宏基因组和非靶向代谢组学揭示相关机制 | 首次利用单细胞转录组学构建了RDIM奶山羊乳腺细胞图谱，并结合瘤胃宏基因组和血清/瘤胃液代谢组学，揭示了微生物色氨酸代谢和次级胆汁酸合成减少与AHR和GPBAR1信号通路下调的关联 | 摘要中未明确说明研究局限性 | 解析瘤胃菌群失调诱导的乳腺炎中乳腺局部细胞变化及其与瘤胃微生物和代谢物的关系，以增进对乳腺炎发病机制的理解 | 患有瘤胃菌群失调诱导的乳腺炎的奶山羊 | 单细胞转录组学 | 乳腺炎 | 单细胞RNA测序、宏基因组测序、非靶向代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据、宏基因组数据、代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、宏基因组测序、非靶向代谢组学 | NA | NA |
| 113 | 2026-10-31 |
Age-associated niche remodeling drives dental pulp progenitor dysfunction and fibrosis
2026-Jul-07, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10632-y
PMID:42414546
|
研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序、空间转录组学、谱系追踪和功能实验，揭示衰老相关微环境重塑通过代谢重编程驱动牙髓祖细胞功能障碍和纤维化 | 鉴定出对衰老特别脆弱的Lypd1成纤维祖细胞群体，发现衰老优先影响Lypd1祖细胞而非Sfrp2干细胞，揭示巨噬细胞来源的PDGFB通过P38 MAPK信号诱导11β-HSD2上调，增强醛固酮介导的MR信号促进纤维化转化，并证明体内抑制PDGF/P38/11β-HSD2轴可减轻衰老相关牙髓纤维化 | 主要基于小鼠切牙模型，人类数据仅为MACS分离的LYPD1细胞的支持性证据，机制发现的临床转化仍需进一步验证 | 探究衰老相关牙髓微环境重塑驱动祖细胞功能障碍和纤维化的机制 | 小鼠切牙牙髓组织及MACS分离的人LYPD1细胞 | 单细胞组学、空间转录组学、再生医学 | 牙髓纤维化、衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、谱系追踪、MACS细胞分离、功能实验 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 114 | 2026-10-31 |
Loss of endothelial ZEB1 enhances neovascularisation during choroidal neovascularisation
2026-Jul-07, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10630-0
PMID:42414674
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析实验性脉络膜新生血管（CNV）病变，发现血管生成内皮细胞中Zeb1上调，并利用内皮特异性Zeb1敲除小鼠模型探究其在CNV中的功能作用 | 首次揭示内皮细胞ZEB1在CNV中协调血管生成与炎症反应的双重作用，发现其缺失可增强新生血管形成而不促进炎症，提示其作为wAMD治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人类临床样本中验证，且ZEB1调控血管生成与炎症的具体分子机制尚需进一步阐明 | 探究内皮细胞ZEB1在脉络膜新生血管形成中的功能作用及其对血管生成和炎症的调控机制 | 实验性CNV病变组织、内皮特异性Zeb1敲除小鼠、人内皮细胞 | 数字病理学，单细胞转录组学 | 湿性/新生血管性年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序，转录组分析，免疫组织化学，荧光素血管造影 | NA | 图像，文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 115 | 2026-10-31 |
Hypoxia Induces Adaptive Lymphangiogenesis via Cd74 and Vegfr3 to Modulate Pulmonary Hypertension
2026-Jul-06, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.126.326822
PMID:42233213
|
研究论文 | 本研究揭示了缺氧诱导的适应性淋巴管生成通过CD74-VEGFR3信号轴调节肺动脉高压的作用机制 | 首次发现淋巴管内皮细胞中CD74-VEGFR3信号轴在肺动脉高压中的保护作用，揭示了肺淋巴管在PAH发病机制中被忽视的重要角色 | 研究主要基于动物模型，人体IPAH样本分析有限，CD74-VEGFR3信号轴的具体分子机制仍需进一步阐明 | 探究肺淋巴管在肺动脉高压发病机制和血管重塑中的作用，以及缺氧诱导淋巴管生成的分子机制 | 小鼠（Prox1-CreERT2::Rosa26-LSL-tdT和Prox1-CreERT2::Vegfr3fl/fl）、Sprague-Dawley大鼠、IPAH患者肺组织样本 | 心血管疾病研究 | 肺动脉高压 | 免疫荧光染色、单细胞RNA测序数据分析、超声心动图、基因敲除小鼠模型 | NA | 图像、文本（单细胞RNA测序数据） | 多个时间点的缺氧诱导小鼠模型（1、2、3、6周）、MCT诱导大鼠模型、公开的人IPAH和小鼠PH单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 116 | 2026-10-31 |
Entamoeba histolytica Gal/GalNAc lectin intermediate subunit as a potential driver of inflammation and epithelial damage in intestinal amebiasis
2026-Jul-06, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10631-z
PMID:42410252
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研究论文 | 该研究通过C3H/HeNCrl小鼠盲肠感染模型进行单细胞RNA测序，揭示了溶组织内阿米巴Gal/GalNAc凝集素中间亚基Igl通过TLR4/MD2/NF-κB通路驱动巨噬细胞炎症并间接导致肠上皮损伤的机制 | 首次在阿米巴病研究领域报道宿主单细胞图谱，提出Igl通过阿米巴细胞外囊泡扩散并结合TLR4共受体MD2的C3区域激活炎症信号通路的新机制 | 研究基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证；Igl与MD2结合的分子细节及细胞外囊泡介导的递送机制仍需进一步实验证实 | 阐明溶组织内阿米巴感染过程中肠道黏膜免疫系统的炎症形成机制及上皮损伤机制，为鉴定潜在药物靶点提供线索 | C3H/HeNCrl小鼠及溶组织内阿米巴 | 单细胞转录组学，感染免疫学 | 肠道阿米巴病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 117 | 2026-10-31 |
Macrophage heterogeneity in breast cancer microenvironment and development of a prognostic model: exploring TFF1 as a novel therapeutic target
2026-Jul-04, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-026-04354-7
PMID:42400645
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序数据识别乳腺癌中巨噬细胞相关基因，构建基于机器学习的预后模型，并验证TFF1作为新的治疗靶点 | 结合单细胞RNA测序和机器学习构建基于巨噬细胞亚群相关基因的预后模型，并首次将TFF1确定为乳腺癌的潜在治疗靶点 | 仅基于公共数据库（GEO和TCGA）数据，缺乏独立前瞻性队列验证；实验验证仅限于体外实验，需进一步体内和临床研究 | 阐明乳腺癌肿瘤微环境中的细胞异质性，识别潜在治疗靶点，实现个体化治疗 | 乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 机器学习, ELISA, CCK-8, 流式细胞术, Western blotting, 免疫沉淀 | XGBoost, LightGBM | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据, 临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 118 | 2026-10-31 |
Identification and functional validation of lactylation-related hub genes in idiopathic pulmonary fibrosis based on multi-omics analysis
2026-Jul-04, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-026-03783-3
PMID:42400038
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研究论文 | 基于多组学分析识别特发性肺纤维化中乳酸化相关核心基因，并进行功能验证和药物结合评估 | 首次通过多组学整合分析识别IPF中乳酸化相关核心基因DDX3X、BCLAF1和NCL，揭示其细胞特异性表达模式及在EMT和成纤维细胞活化中的作用，并评估临床药物与这些基因编码蛋白的结合亲和力 | 研究主要基于生物信息学分析和初步功能验证，缺乏更深入的分子机制探讨和临床样本的大规模验证 | 识别IPF中乳酸化相关核心基因，探索其治疗潜力，并评估其与临床药物的结合亲和力 | 特发性肺纤维化患者和健康对照者的肺组织样本 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 转录组测序, 单细胞测序, 免疫组化, Western blot, 基因敲低, 分子对接 | WGCNA, PPI网络分析, Seurat, UMAP聚类, CIBERSORT | 基因表达数据, 图像, 文本 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 119 | 2026-10-31 |
Integrating morphology and gene expression of neural cells in unpaired single-cell data using GeoAdvAE
2026-Jun-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.19.689368
PMID:42427640
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研究论文 | 本文提出了一种几何感知的对抗自编码器GeoAdvAE，用于非配对单细胞形态与转录组数据的对角整合 | 提出GeoAdvAE，结合模态特异性变分自编码器、Gromov-Wasserstein正则化和对抗判别器，在无特征对应且测量于不同细胞的形态与转录组之间实现几何保持的共享潜在空间嵌入 | 依赖于patch-seq联合测量数据作为ground truth进行评估，方法在非配对数据上的验证主要限于小鼠阿尔茨海默病模型，泛化能力有待进一步验证 | 解决单细胞形态与基因表达之间缺乏特征对应且通常在不同细胞中测量的问题，实现非配对单细胞形态与转录组数据的整合 | patch-seq神经元、CAJAL量化的微胶质细胞形态（98个）和5xFAD阿尔茨海默病模型的小鼠单细胞转录组（31,948个） | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序、patch-seq、CAJAL形态量化 | 变分自编码器、对抗自编码器、Gromov-Wasserstein | 图像、文本（基因表达矩阵） | 98个CAJAL量化的微胶质细胞形态和31,948个单细胞转录组，以及patch-seq神经元联合形态-RNA测量数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 120 | 2026-10-31 |
An Ad5-vectored platform generating self-assembling VLPs elicits potent mucosal immunity against influenza A virus and SARS-CoV-2
2026-May-05, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2519857123
PMID:42054358
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研究论文 | 本文开发了一种基于Ad5载体的嵌合腺病毒平台Ad5-Envp-VLP，可在体内自组装展示包膜蛋白的病毒样颗粒，经鼻内给药可诱导强效黏膜免疫，抵御甲型流感病毒和SARS-CoV-2 | 利用EABR招募ESCRT机制实现体内自组装展示包膜蛋白的VLP，经鼻内单剂给药即可同时诱导体液、黏膜和细胞免疫，并实现流感与SARS-CoV-2双价黏膜疫苗 | 研究主要在小鼠、犬和猫模型中进行，尚未在人体临床试验中验证其安全性和有效性 | 开发一种通用、多功能的黏膜疫苗平台，通过肺内递送编码体内自组装VLP的载体，同时诱导强效黏膜和全身免疫以对抗多种呼吸道病原体 | 小鼠、犬和猫模型，以及甲型流感病毒、SARS-CoV-2和狂犬病病毒 | 疫苗学、免疫学 | 流感、COVID-19、狂犬病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 文本、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |