单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 39284 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	平台公司	平台技术	具体产品	平台详情
101	2026-05-09	Epidermal Loss of PRMT5 Leads to the Emergence of an Atypical Basal Keratinocyte-Like Cell Population and Defective Epidermal Stratification 2025-Dec, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1 DOI:10.1016/j.jid.2025.04.008 PMID:40339790	研究论文	本研究通过条件性敲除小鼠模型，发现PRMT5缺失导致基底角质细胞样异常细胞群出现和表皮分层缺陷	首次揭示PRMT5通过抑制Cdkn1a表达来阻止基底角质细胞衰老，为先天性皮肤病的表观遗传调控提供新见解	NA	探究PRMT5在体内维持角质细胞干细胞表型的作用及其机制	条件性敲除Prmt5的小鼠表皮	机器学习	先天性皮肤病	单细胞RNA测序、转座酶可及染色质高通量测序	NA	单细胞转录组数据、染色质可及性数据	条件性敲除Prmt5小鼠及其对照	10x Genomics	单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序	10x Chromium	NA
102	2026-05-09	High Shear Stress-Induced Endothelial Piezo1 Downregulation Promotes Intracranial Aneurysm Formation via the PDGF-BB/PDGFRβ Paracrine Signaling Pathway 2025-Dec, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1 DOI:10.1002/cns.70715 PMID:41457305	研究论文	本研究揭示了高剪切应力通过下调内皮细胞Piezo1表达，激活YAP/β-catenin通路促进PDGF-BB分泌，进而诱导血管平滑肌细胞表型转化并促进颅内动脉瘤形成的机制	首次阐明内皮Piezo1通过PDGF-BB/PDGFRβ旁分泌信号通路介导高剪切应力与颅内动脉瘤形成的机械生物学耦合机制	未提及具体局限性	探究高剪切应力下内皮Piezo1调控颅内动脉瘤形成的机械生物学机制	人类颅内动脉瘤标本、内皮细胞、血管平滑肌细胞、Piezo1基因敲除小鼠颅内动脉瘤模型	机器学习和数字病理学未涉及，属于基础医学研究	颅内动脉瘤	CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序、细胞间通讯分析	NA	基因表达数据、组织样本	人类颅内动脉瘤样本、小鼠模型（8周龄雄性Piezo1flox/flox小鼠）	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
103	2026-05-09	Single Cell and Spatial Transcriptomics Identify Novel Immune-Stromal Interactions in Cardiac Allograft Vasculopathy 2025-Nov-21, Research square DOI:10.21203/rs.3.rs-7812112/v1 PMID:41333445	研究论文	利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术，表征心脏同种异体移植血管病变（CAV）中独特的免疫-基质细胞相互作用，并发现潜在治疗靶点	首次通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学，全面解析CAV新生内膜微环境中调节性血管平滑肌细胞和巨噬细胞亚群的相互作用，并确定干扰素信号通路为关键致病机制	未说明具体局限性，但可能包括动物模型与人体研究的差异、样本量有限等	阐明心脏同种异体移植血管病变（CAV）的细胞和分子机制，寻找新的治疗靶点	人类冠状动脉组织（CAV vs 动脉粥样硬化性冠状动脉疾病 vs 非疾病对照）及小鼠CAV模型	数字病理学	心血管疾病	单细胞RNA测序，空间转录组学，RNA-seq	NA	基因表达数据	人类冠状动脉样本（具体数量未明确）和小鼠模型样本	10x Genomics	单细胞RNA测序，空间转录组学	10x Chromium, 10x Visium	10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium Spatial Gene Expression
104	2026-05-09	Three-dimensional cell spheroid technology: Recent advances and emerging strategies in cartilage regeneration 2025-11, Acta biomaterialia IF:9.4Q1 DOI:10.1016/j.actbio.2025.10.001 PMID:41046113	综述	本文综述了三维细胞球体技术在软骨再生中的最新进展和新兴策略，重点讨论了其形成机制、工程策略和临床应用，并分析了大规模生产和免疫安全等关键挑战	系统总结了三维细胞球体技术在软骨再生中的优势，包括模拟体内微环境、增强细胞间相互作用、促进细胞外基质生成，同时提出结合智能生物材料和机器学习等新兴解决方案以实现个性化标准化生产	临床转化受限于细胞球体的长期稳定性有限、大规模生产困难和体内植入后的免疫排斥反应	总结三维细胞球体技术在软骨再生领域的最新发展和未来方向，促进临床转化应用	三维细胞球体技术及其在软骨损伤修复、骨关节炎模型构建、药物筛选平台开发中的应用	数字病理学	骨关节炎	三维细胞球体技术、单细胞RNA测序	机器学习	NA	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
105	2026-05-09	Molecular and spatial analysis of ganglion cells on retinal flatmounts identifies perivascular neurons resilient to glaucoma 2025-Oct-15, Neuron IF:14.7Q1 DOI:10.1016/j.neuron.2025.07.025 PMID:40840447	研究论文	优化了基于成像的空间转录组学（MERFISH）与免疫染色的工作流程，分析了视网膜平铺片上神经节细胞的空间分布，发现血管周围神经元对青光眼具有抵抗力	首次在视网膜平铺片上结合MERFISH和免疫染色，创建了全面的RGC类型空间图谱，揭示了血管周围微环境在神经保护中的作用	未提及	研究小鼠视网膜神经节细胞的空间分布及其局部微环境对功能的影响，探索青光眼模型中神经元的差异脆弱性	小鼠视网膜神经节细胞（RGCs）	数字病理学	青光眼	MERFISH, 免疫染色	NA	图像	小鼠视网膜平铺片（具体样本数未提及）	NA	空间转录组学, 多重荧光原位杂交	MERFISH	成像型空间转录组学结合免疫染色
106	2026-05-09	A multimodal atlas of COVID-19 severity identifies hallmarks of dysregulated immunity 2025-Sep-21, medRxiv : the preprint server for health sciences DOI:10.1101/2025.09.19.25334095 PMID:41332837	research paper	利用多模式单细胞图谱研究COVID-19严重程度的免疫失调特征	首次在单细胞分辨率下整合多数据类型（单细胞RNA-seq、CITE-seq、TCR和BCR测序、病毒载量、中和试验、75种自身抗体、HLA基因型和1463种血清蛋白组学）并纳入托珠单抗治疗和康复期样本，提供对COVID-19严重程度免疫特征的最全面视图	未明确说明局限性（文中未提及）	研究COVID-19严重程度相关的免疫失调标志物，包括托珠单抗治疗和康复期的影响	428名患者的2.5百万循环免疫细胞（840份PBMC样本），涵盖急性感染（5个WHO严重度等级）、托珠单抗治疗和康复期（感染后3个月）	machine learning	COVID-19	单细胞RNA-seq, CITE-seq, TCR测序, BCR测序, 血清蛋白质组学	线性建模	单细胞转录组数据, 蛋白质组数据, 病毒载量数据, 自身抗体数据, HLA基因型数据	428名患者，840份PBMC样本（2.5百万细胞）	NA	单细胞RNA-seq, CITE-seq	NA	NA
107	2026-05-09	Selective Depletion of CCR8+Treg Cells Enhances the Antitumor Immunity of Cytotoxic T Cells in Lung Cancer by Dendritic Cells 2025-08, Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer IF:21.0Q1 DOI:10.1016/j.jtho.2025.02.029 PMID:40056978	研究论文	该研究探讨了在非小细胞肺癌中通过选择性清除CCR8+调节性T细胞增强细胞毒性T细胞的抗肿瘤免疫作用	首次揭示抗CCR8疗法与PD1抑制剂联用通过破坏CCR8+Treg-CCL5+树突状细胞相互作用重塑肿瘤微环境，并明确JAK-STAT通路激活诱导IL-12分泌增强CD8+ T细胞杀伤活性的分子机制	研究主要基于小鼠模型，临床样本量有限且仅观察了晚期非小细胞肺癌患者联合治疗潜力，尚未开展大规模随机临床试验验证安全性与有效性	评估抗CCR8单药及联合PD1抑制剂在非小细胞肺癌中的治疗效果及分子机制	非小细胞肺癌小鼠模型及晚期患者	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序、单细胞T细胞受体测序、流式细胞术、多色免疫荧光、Luminex检测	NA	基因表达数据、免疫表型数据	四种非小细胞肺癌小鼠模型及部分晚期非小细胞肺癌患者	NA	单细胞RNA测序、单细胞T细胞受体测序	NA	NA
108	2025-10-06	Single-cell RNA sequencing indicates AP-1 as a potential therapeutic target for autoimmune uveitis 2025-07, Biochemical pharmacology IF:5.3Q1 DOI:10.1016/j.bcp.2025.116945 PMID:40228638	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析自身免疫性葡萄膜炎小鼠模型，发现AP-1是疾病关键分子并验证其作为治疗靶点的潜力	首次通过单细胞RNA测序揭示AP-1在自身免疫性葡萄膜炎发病机制中的关键作用，并发现其通过GM-CSF/IL-23反馈环路支持Th17细胞致病性	研究仅使用小鼠模型，尚未在人类患者中验证	探索自身免疫性葡萄膜炎的发病机制并寻找新的治疗靶点	实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠的脾脏和颈引流淋巴结细胞	单细胞组学	自身免疫性葡萄膜炎	单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	正常和EAU小鼠的脾脏及颈引流淋巴结	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
109	2026-05-09	Female-biased vascular smooth muscle cell gene regulatory networks predict MYH9 as a key regulator of fibrous plaque phenotype 2025-Apr-02, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.03.28.645955 PMID:40236025	研究论文	利用性别特异性基因调控网络揭示了MYH9作为女性斑块中调节纤维斑块表型的关键因子	首次通过性别特异性基因调控网络分析，发现MYH9在女性血管平滑肌细胞中调控纤维斑块形成	研究样本量有限（119名男性和32名女性），可能影响结果的普遍性	探究动脉粥样硬化中纤维斑块的性别差异分子机制	来自心脏移植供体的血管平滑肌细胞和颈动脉斑块	机器学	心血管疾病	RNA-seq, 单细胞RNA测序	贝叶斯网络	基因表达数据, 单细胞转录组数据	151名心脏移植供体（119名男性和32名女性）的血管平滑肌细胞样本	Illumina	bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq	Illumina NovaSeq	NA
110	2025-10-07	A Unique Signature for Cancer-Associated Fibroblasts in Melanoma Metastases 2025-03, Pigment cell & melanoma research IF:3.9Q2 DOI:10.1111/pcmr.70002 PMID:39924882	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析黑色素瘤原发灶和肺转移灶中的癌症相关成纤维细胞，揭示了转移灶特异性CAF的独特特征	首次系统比较黑色素瘤原发灶和转移灶中CAF的转录特征，发现转移灶特异性CAF亚群及其与中性粒细胞的肿瘤依赖性串扰机制	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限	探索黑色素瘤转移过程中癌症相关成纤维细胞的异质性和功能特征	小鼠黑色素瘤原发灶和肺转移灶中的癌症相关成纤维细胞，以及人类黑色素瘤转移样本	单细胞生物学	黑色素瘤	单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	约8400个CAF和正常成纤维细胞	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
111	2026-05-09	ProBac-seq, a bacterial single-cell RNA sequencing methodology using droplet microfluidics and large oligonucleotide probe sets 2024-10, Nature protocols IF:13.1Q1 DOI:10.1038/s41596-024-01002-1 PMID:38769144	研究论文	介绍ProBac-seq这一利用液滴微流控和大寡核苷酸探针集的细菌单细胞RNA测序方法	通过使用mRNA特异性探针克服细菌mRNA无poly-A尾、转录本不稳定及细菌形态与现有技术不兼容的问题，实现高质量单细胞基因表达数据	未明确提及局限性，但方法依赖探针设计和大规模寡核苷酸合成，可能成本较高	提供一种适用于细菌的单细胞RNA测序方法，以研究细菌细胞异质性和基因表达状态	细菌细胞，如大肠杆菌或其他可通过原位杂交分析的单细胞生物	单细胞测序技术	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	数千个细菌细胞	NA	单细胞RNA-seq, 液滴微流控	NA	基于液滴微流控的细菌单细胞RNA测序平台
112	2026-05-09	Muscle-resident mesenchymal progenitors sense and repair peripheral nerve injury via the GDNF-BDNF axis 2024-Sep-26, eLife IF:6.4Q1 DOI:10.7554/eLife.97662 PMID:39324575	研究论文	发现肌肉驻留间充质祖细胞（FAPs）通过GDNF-BDNF轴感知并修复周围神经损伤	首次揭示FAPs在周围神经再生中的新作用及其响应神经损伤的分子机制，即GDNF-BDNF轴	具体局限性未在摘要中提及	探究FAPs如何感知解剖上远端的周围神经损伤及其是否直接促进神经再生	肌肉驻留间充质祖细胞（FAPs）、施万细胞、周围神经损伤小鼠模型	NA	周围神经损伤	单细胞转录组学	NA	单细胞转录组数据	使用小鼠模型（包括正常和老年小鼠）	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
113	2026-05-09	The transcriptome of CD14 + CD163 - HLA-DR low monocytes predicts mortality in Idiopathic Pulmonary Fibrosis 2024-Sep-11, medRxiv : the preprint server for health sciences DOI:10.1101/2024.08.07.24311386 PMID:39211854	研究论文	通过单细胞RNA测序分析外周血单核细胞中CD14+CD163-HLA-DRlow单核细胞的转录组，发现其能够预测特发性肺纤维化患者的死亡率	首次发现CD14+CD163-HLA-DRlow单核细胞的230个基因表达特征可独立预测IPF死亡率，并验证了T细胞共刺激基因的低表达与高风险相关	样本量相对较小，且研究主要基于外周血和支气管肺泡灌洗液，未全面探索肺组织中其他免疫细胞的贡献	确定与特发性肺纤维化（IPF）死亡率相关的免疫细胞特异性转录组特征	416例IPF患者来自六个队列，外加一个独立验证队列（38例），包括外周血、支气管肺泡灌洗液和肺组织样本	机器学习	特发性肺纤维化	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	Cox回归模型	基因表达数据（单细胞RNA测序数据）	初始队列18例（包括IPF、COVID-19、COVID-19后间质性肺病和对照组），验证队列416例来自六个队列，独立验证38例	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
114	2026-05-09	The aminophospholipid transporter, ATP8B3, as a potential biomarker and target for enhancing the therapeutic effect of PD-L1 blockade in colon adenocarcinoma 2024-09, Genomics IF:3.4Q2 DOI:10.1016/j.ygeno.2024.110907 PMID:39074670	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析，发现ATP8B3在结肠腺癌中可作为潜在生物标志物，抑制ATP8B3可降低PD-L1表达并增强免疫治疗效果	首次揭示ATP8B3在结肠腺癌中调控PD-L1表达及免疫抑制微环境的作用，并提出联合ATP8B3抑制剂与免疫疗法的新策略	由于MSS亚型微环境中缺乏免疫杀伤细胞，ATP8B3高表达未能增加该类患者对PD-L1抑制剂的敏感性	探究ATP8B3作为结肠腺癌潜在生物标志物及增强PD-L1阻断治疗效果的靶点	结肠腺癌患者及细胞系	机器学习, 数字病理学	结肠腺癌	单细胞RNA测序, 批量RNA测序, siRNA, shRNA, 蛋白质印迹分析, 流式细胞术	NA	基因表达数据, 免疫浸润数据	TCGA和GEO数据库中的结肠腺癌样本	NA	单细胞RNA测序, 批量RNA测序	NA	NA
115	2026-05-09	Multi-omics analysis reveals a pericyte-associated gene expression signature for predicting prognosis and therapeutic responses in solid cancers 2024-09, Genomics IF:3.4Q2 DOI:10.1016/j.ygeno.2024.110942 PMID:39326641	研究论文	通过多组学分析揭示周细胞相关基因表达特征，用于预测实体癌预后和治疗反应	首次识别肿瘤来源周细胞中的51个差异表达基因，并基于其中5个关键基因构建预后风险模型，可准确预测肝癌和肺癌的预后及治疗反应	仅验证了肝癌和肺癌中的发现，未在其他实体瘤中进行广泛验证	探究肿瘤微环境中血管周细胞对癌症进展的影响，并构建基于周细胞的预后预测模型	实体癌（肝癌和肺癌）患者	机器学习	肝癌, 肺癌	转录组测序, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 免疫染色	预后风险模型	转录组数据, 蛋白质组数据, 单细胞RNA测序数据	TCGA及GEO数据库中的多个样本集（具体数量未在摘要中说明）	NA	NA	NA	NA
116	2026-05-09	Convergent alterations in the tumor microenvironment of MYC-driven human and murine prostate cancer 2024-08-28, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-51450-2 PMID:39198404	研究论文	通过单细胞RNA测序和分子病理学比较人类前列腺癌与基因工程小鼠模型，揭示MYC驱动的肿瘤微环境变化	首次利用单细胞RNA测序结合基因工程小鼠模型，揭示MYC信号激活如何直接或间接重编程肿瘤微环境，以及人类与小鼠模型之间的平行变化	未提及具体局限性	研究MYC驱动前列腺癌进展中肿瘤微环境的重编程机制	人类前列腺癌组织和基因工程小鼠模型的前列腺癌样本	数字病理学	前列腺癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	人类前列腺癌组织样本和基因工程小鼠模型样本	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
117	2026-05-09	Innate immune responses against mRNA vaccine promote cellular immunity through IFN-β at the injection site 2024-08-27, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-51411-9 PMID:39191748	研究论文	通过生成综合的单细胞转录组图谱，研究mRNA疫苗在小鼠注射部位引发的先天免疫反应，特别是IFN-β信号在促进细胞免疫中的作用	首次揭示注射部位成纤维细胞在mRNA疫苗免疫反应中的关键作用，发现成纤维细胞特异性对mRNA组分响应产生IFN-β，并证明IFN-β信号对增强抗原特异性细胞免疫至关重要	研究仅基于雌性BALB/c小鼠模型，未在人类或其他动物模型中验证；未深入探讨IFN-β信号的持续时间及长期免疫效果	阐明mRNA疫苗注射部位早期免疫反应的分子机制，特别是先天免疫与适应性免疫的衔接过程	雌性BALB/c小鼠注射部位组织及引流淋巴结	数字病理学	新型冠状病毒肺炎（COVID-19）	单细胞转录组测序	NA	单细胞转录组数据	雌性BALB/c小鼠注射部位及引流淋巴结样本	10x Genomics	单细胞RNA测序	10x Chromium	10x Chromium单细胞3‘测序平台
118	2026-05-09	Plasma proteomics of acute tubular injury 2024-08-27, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-51304-x PMID:39191768	研究论文	利用SomaScan蛋白质组学平台鉴定急性肾小管损伤的血浆生物标志物，并结合多组学分析验证	首次在经活检确诊的肾病患者中系统鉴定与急性肾小管损伤严重程度相关的156种血浆蛋白，并阐明骨桥蛋白等关键标志物的生物学通路	可能缺乏外部验证队列中差异人群的普适性分析，且单细胞测序与血浆蛋白的相关性需进一步功能验证	发现与急性肾小管损伤相关的非侵入性血浆生物标志物	急性肾小管损伤患者及对照人群的血浆样本	蛋白质组学	肾脏疾病	SomaScan蛋白质组学、区域转录组学、单细胞RNA测序	NA	蛋白质组学数据、转录组数据、临床队列数据	434例活检确诊肾病患者（发现队列）、44例（KPMP验证）、4610例（ARIC验证）、268例（CHROME验证）	SomaLogic	蛋白质组学	SomaScan	SomaScan蛋白质组学平台用于血浆蛋白定量分析
119	2026-05-09	Single-cell transcriptomics reveal transcriptional programs underlying male and female cell fate during Plasmodium falciparum gametocytogenesis 2024-08-26, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-51201-3 PMID:39187486	研究论文	通过单细胞转录组学揭示恶性疟原虫配子体形成过程中雄性和雌性细胞命运的转录程序	首次利用单细胞RNA-seq解析恶性疟原虫在缺乏性染色体情况下的雄性和雌性配子体分化机制，预测了候选驱动基因，并发现AP2-G5转录因子特异性调控雄性发育	未明确提及实验重复次数及统计方法，且结果依赖于报告基因系，可能无法完全反映自然感染条件下的细胞状态	阐明恶性疟原虫雄性和雌性配子体分化的转录程序及调控机制	恶性疟原虫配子体报告基因系细胞	单细胞转录组学	疟疾（恶性疟原虫感染）	单细胞RNA-seq	基因调控网络分析	单细胞转录组数据	基于FACS富集的恶性疟原虫配子体细胞（具体细胞数量未在摘要中说明）	未明确提及	单细胞RNA-seq	未明确提及	基于FACS的细胞富集后进行单细胞RNA-seq
120	2026-05-09	Nephron progenitors rhythmically alternate between renewal and differentiation phases that synchronize with kidney branching morphogenesis 2024-Jan-13, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.11.21.568157 PMID:38045273	研究论文	该文章结合空间转录组数据与分支形态发生的生命周期，发现肾单位祖细胞在Wnt、Hippo-Yap、维甲酸等通路的调控下，节奏性地交替更新与分化阶段，并与肾脏分支形态发生同步	首次通过空间转录组学揭示肾单位祖细胞在微环境中节奏性交替更新与分化相，并阐明了Wnt/β-catenin与YAP信号时间重叠将分化信号转化为更新信号的机制	未详细说明样本量及体内验证的局限性	探究肾单位祖细胞如何协调自我更新与分化以匹配肾脏分支形态发生的节奏	小鼠肾脏发育中的肾单位祖细胞及人干细胞衍生的肾单位祖细胞类器官	数字病理学	肾脏疾病	空间转录组学	NA	空间转录组数据	NA	NA	空间转录组学	NA	NA