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当前共找到 42055 篇文献,本页显示第 101 - 120 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
101 2026-08-03
Enhanced BCMA Antigen Density Increases Trogocytosis and Attenuates CAR T cell Function
2026-Jul-16, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了γ-分泌酶抑制剂提高BCMA抗原密度对CAR T细胞功能的影响,发现其增强细胞毒性但促进吞噬作用,导致CAR T细胞功能受损和耗竭 首次揭示了GSI驱动的BCMA抗原密度增加对CAR T细胞吞噬作用和功能的影响,通过多组学方法深入分析吞噬阳性CAR T细胞的表型和功能特征,并利用临床I期试验样本进行验证 研究主要基于体外共培养系统和临床样本,可能无法完全反映体内复杂环境;样本量有限,可能影响统计效力 探究γ-分泌酶抑制剂提高BCMA密度对CAR T细胞吞噬作用、功能和治疗结果的影响,以优化多发性骨髓瘤的CAR T细胞治疗策略 多发性骨髓瘤细胞系、CAR T细胞、来自两个临床I期试验的患者样本 数字病理学 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序、T细胞受体测序、蛋白质组学分析、流式细胞术、共聚焦显微镜、细胞毒性实验 CAR T细胞模型 图像、文本、测序数据 使用多种骨髓瘤细胞系和CAR T细胞,以及来自两个临床I期试验的患者样本,具体数量未在摘要中提供 NA 单细胞RNA测序 NA NA
102 2026-08-03
Reference Regulatory Element-Guided Gene Expression Analysis for Mechanistic Inference of Gene Regulatory Networks
2026-Jul-16, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出REGA框架,利用参考调控元件目录从基因表达数据中推断转录因子-调控元件-基因程序,实现可扩展且可解释的基因调控网络分析 创新性地利用参考调控元件目录指导基因表达分析,无需额外多组学数据即可推断机制性基因调控网络,并在多个基准测试中优于现有方法 依赖参考调控元件目录的质量和覆盖度,可能限制在非模式生物或特定组织中的应用 弥合调控基因组学中深度与广度的差距,实现从大规模表达数据中进行机制性基因调控网络推断 基因表达数据,包括bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq及空间转录组数据 生物信息学、机器学习 神经精神疾病(如PsychENCODE相关) 基因表达分析、ChIP-seq、Hi-C、eQTL、snRNA-seq、空间转录组、Perturb-seq NA 基因表达数据(bulk、单细胞、空间) NA NA bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组 NA NA
103 2026-08-03
AI-driven discovery of GPNMB CAR T cells as a multi-cancer therapy
2026-Jun-25, Cell IF:45.5Q1
研究论文 开发了一种基于人工智能的CAR T细胞靶点发现方法,通过整合单细胞RNA测序数据,识别出GPNMB作为多癌种治疗靶点,并验证了其疗效 首次将人工智能驱动的方法(包括单细胞数据整合和大型语言模型)应用于CAR T细胞靶点发现,并成功识别出GPNMB作为多癌种治疗靶点 未提供具体局限性信息 开发一种人工智能驱动的CAR T细胞靶点发现流程,以解决靶点识别这一主要瓶颈,并验证新靶点的治疗潜力 人类皮肤癌和健康组织的单细胞RNA测序数据,以及单核细胞白血病、黑色素瘤和结直肠腺癌的小鼠模型 机器学习 皮肤癌、白血病、黑色素瘤、结直肠癌 单细胞RNA测序 大型语言模型 单细胞基因表达数据 人类皮肤癌和健康组织样本,以及多种小鼠肿瘤模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
104 2026-08-03
Aging reprograms microglia toward an inflammasome-linked response to traumatic brain injury
2026-06-15, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
评论 该文章评论了Lu等人的研究,该研究结合单细胞转录组学、代谢组学和染色质分析,揭示了衰老如何将小胶质细胞重编程为与炎症小体相关的反应,并确定了可药物干预的靶点 将年龄从临床风险因素转化为一组可药物干预的小胶质细胞靶点,通过连接NLRP3炎症小体主导性、ELF1驱动的转录和糖酵解重编程与保护性Lyz2+反应的丧失 主要基于小鼠模型,人类验证有限 理解衰老如何加剧创伤性脑损伤的脆弱性,并确定可药物干预的靶点 小鼠模型和人类创伤性脑损伤组织中的小胶质细胞 转录组学 创伤性脑损伤 单细胞转录组学、代谢组学、染色质分析 NA 单细胞转录组数据、代谢组数据、染色质数据 小鼠模型和人类创伤性脑损伤组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
105 2026-08-03
Bidirectional integrin β1 activation synergizes neurovascular coupling and enhances bone regeneration
2026-Jun-12, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 开发了一种功能性支架(PTPG),通过双向激活整合素β1协同神经血管耦合,促进大段骨缺损的修复和骨再生 利用REDV-IKVAV肽与Talin1质粒同时激活整合素β1的“由外向内”和“由内向外”信号通路,实现血管生成、神经发生和成骨的协同调控 未在长期动物模型中评估支架的降解和长期安全性,且对信号通路的具体分子机制探讨尚浅 开发一种能同时促进血管生成、神经发生和成骨的功能支架,以重建大段骨缺损 大鼠股骨大段骨缺损模型中的内皮细胞、施万细胞和骨组织 组织工程与再生医学 大段骨缺损 单细胞RNA测序 支架材料(非深度模型) 单细胞转录组数据 未明确,通常涉及实验组和对照组,具体样本量未在摘要中提供 NA 单细胞RNA测序 NA NA
106 2026-08-03
scZGA: a novel model based on ZINB distribution and graph attention for scRNA-seq data clustering
2026-May-29, BMC bioinformatics IF:2.9Q1
研究论文 提出了一种基于零膨胀负二项分布和图注意力网络的单细胞RNA测序数据聚类模型scZGA 结合ZINB分布与图注意力网络,利用残差连接图自编码器保留拓扑结构,并通过自优化嵌入算法进行深度聚类 信息不足,输出NA 解决scRNA-seq数据中高丢失率和复杂细胞间关系导致的聚类挑战 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA scRNA-seq 图注意力网络、图自编码器、ZINB模型 基因表达数据 六个scRNA-seq数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
107 2026-08-03
Decoding the role of H19 in cholestatic liver injury using snRNA-seq, spatial transcriptomics, and machine learning-based disease prediction
2026-May-29, Cell & bioscience
研究论文 本研究利用单核RNA测序和空间转录组学技术,结合机器学习模型,解析了长链非编码RNA H19在胆汁淤积性肝损伤中的作用机制 首次结合snRNA-seq、空间转录组学和机器学习预测模型,系统性揭示了H19缺失通过抑制致病性胆管细胞状态和Spp1信号通路来缓解胆汁淤积性肝损伤的机制,并开发了跨物种验证的细胞类型特异性基因预测特征 研究主要基于小鼠模型,人类数据集的验证仅限于一个公开数据集,可能限制结论的泛化性;此外,未深入探讨H19在其他细胞类型中的潜在作用 阐明H19在原发性硬化性胆管炎(PSC)相关胆汁淤积性肝损伤中的细胞和分子机制,并开发疾病预测模型 小鼠肝组织(野生型、H19敲除、Mdr2敲除、双敲除)及人类患者数据集GSE243981 数字病理学 肝胆疾病 单核RNA测序(snRNA-seq)、空间转录组学(GeoMx)、机器学习 机器学习预测模型 基因表达数据、空间转录组数据 小鼠模型:4种基因型(WT、H19KO、Mdr2KO、DKO)的肝组织;人类数据集:GSE243981 NanoString 单核RNA测序 NA NA
108 2026-08-03
Identification of RPL4 as a biomarker associated with disulfidptosis and arachidonic acid metabolism in breast cancer
2026-May-07, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞测序、加权基因共表达网络分析和转录组差异表达分析,建立乳腺癌中与二硫下垂和花生四烯酸代谢相关的预后模型,并鉴定RPL4作为潜在生物标志物 首次探讨二硫下垂与花生四烯酸代谢在乳腺癌中的关联,并基于此构建预后模型,发现RPL4作为关键候选基因,结合分子对接预测阿昔替尼与RPL4的结合关系 研究基于公共数据库和计算分析,缺乏实验验证;RPL4作为治疗靶点需要进一步的临床前和临床验证 建立乳腺癌中二硫下垂和花生四烯酸代谢相关的预后模型,并探索其潜在机制 乳腺癌患者样本及基因表达数据 机器学习 乳腺癌 scRNA-seq, WGNA, 转录组差异表达分析 Cox回归, Lasso回归 单细胞测序数据, 转录组数据, 临床数据 未明确 NA 单细胞RNA测序, 转录组测序 NA NA
109 2026-08-03
Modern Mining: The Role of Single-cell RNA Sequencing in Advancing Neuroscience Research
2026-May, BioEssays : news and reviews in molecular, cellular and developmental biology IF:3.2Q1
综述 本文综述了单细胞RNA测序技术在神经科学研究中的重要作用,强调其如何推动对大脑细胞多样性和发育程序的理解 系统性地总结了scRNA-seq在多种模式生物和人类中揭示神经细胞类型及发育轨迹方面的最新进展 未具体说明局限性 探讨scRNA-seq如何推进神经科学研究,包括理解细胞类型多样性和神经疾病机制 神经细胞和胶质细胞类型,以及斑马鱼、果蝇、小鼠和人类等模式生物 基因组学 神经系统疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未具体说明样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
110 2026-08-03
Single-cell atlas of Exopalaemon carinicauda gills provides insights into pillar cell-mediated responses to low-salinity stress in crustaceans
2026-Mar-18, Zoological research IF:4.0Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和超微结构分析,构建脊尾白虾鳃的单细胞图谱,揭示柱细胞在低盐胁迫下介导的离子和酸碱平衡调节机制 首次整合超微结构表征与单细胞RNA测序,解析甲壳动物鳃组织对低盐胁迫的细胞异质性响应,并识别柱细胞作为关键调节细胞及其分化轨迹 摘要未提及研究的局限性信息 阐明甲壳动物鳃组织在低盐胁迫下的细胞适应机制,特别是柱细胞介导的渗透调节和酸碱平衡调控 脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)的鳃组织细胞 单细胞转录组学 不适用 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 不适用(未提及具体模型) 单细胞转录组数据,超微结构图像 未在标题和摘要中明确说明样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
111 2026-08-03
Integrative single-cell RNA-seq and ATAC-seq profiling identifies NTN5 +LSAMP + myoblasts as mediators of impaired embryonic myogenesis
2026-Mar-18, Zoological research IF:4.0Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA-seq和ATAC-seq分析,识别出NTN5+LSAMP+成肌细胞作为生长受限胚胎肌生成受损的介导者 首次整合单细胞转录组和染色质可及性分析,揭示生长受限胚胎中一种独特的致病性成肌细胞群体,并阐明其分化阻滞的表观遗传和代谢机制 未提供明确的局限性信息 阐明生长受限胚胎肌生成受损的调控机制,并为治疗干预和畜牧生产优化提供候选靶点 生长受限和正常的猪胚胎体节中的成肌细胞 单细胞多组学 胎儿生长受限 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA 基因表达和染色质可及性数据 生长受限和正常的猪胚胎体节样本(具体数量未提供) NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
112 2026-08-03
scSHEFT enables multiomics label transfer from scRNA-seq to scATAC-seq through dual alignment
2026-02-03, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 提出scSHEFT工具,通过双对齐策略实现从scRNA-seq到scATAC-seq的多组学标签转移 提出了双对齐策略,结合锚点对齐和对比学习,同时考虑基因表达计数、峰计数和基因活性分数,以桥接异质特征并保留原始信息 未提及明显的局限性 开发一种新的标签转移工具,以解决scRNA-seq和scATAC-seq之间的异质性挑战,并促进细胞类型注释和新型细胞类型的发现 单细胞多组学数据,包括scRNA-seq和scATAC-seq数据 机器学习 NA scRNA-seq, scATAC-seq 锚点对齐和对比学习模型 基因表达计数数据、峰计数数据、基因活性分数 7个数据集,具体样本数未说明 NA 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 NA NA
113 2026-08-03
Leveraging expression quantitative trait loci information in single-cell resolution to identify cell-specific genes for gestational diabetes
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究整合GWAS与单细胞eQTL数据,通过scTWAS分析识别妊娠期糖尿病相关的细胞特异性基因 利用单细胞分辨率下的表达数量性状位点信息,首次在免疫细胞类型层面识别妊娠期糖尿病的关联基因,克服了bulk组织分析的局限性 未提及明显的局限性,但可能受限于单细胞eQTL数据的细胞类型覆盖和样本来源 识别妊娠期糖尿病相关的细胞特异性基因,揭示其遗传 architecture 在免疫细胞中的表现 12种免疫细胞类型中的基因表达与妊娠期糖尿病的关联 机器学习 妊娠期糖尿病 scTWAS、GWAS、eQTL分析、基因本体富集分析 OTTERS框架、ACAT-O检验 基因型数据、单细胞表达数据、GWAS汇总统计 GDM病例12,332例,对照131,109例,来自OneK1K队列的12种免疫细胞类型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
114 2026-08-03
Integrative multi-omics and machine learning identify CHRNA1 putative circadian-immune hub in COPD
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过整合公共转录组数据和多组学分析,结合机器学习方法,鉴定了慢性阻塞性肺疾病(COPD)中与昼夜节律相关的生物标志物CHRNA1,并探讨了其诊断价值、免疫相关性及治疗潜力 首次通过整合多组学数据和机器学习算法,识别出CHRNA1作为COPD中假定的昼夜节律-免疫枢纽基因,并利用单细胞RNA测序定位其在肺B细胞中的表达,预测了潜在治疗药物和调控网络 研究依赖于公共数据库的转录组数据,缺乏独立的大规模前瞻性验证;风险分层模型为探索性,需进一步临床验证;昼夜节律与COPD的因果关系未直接证明 识别COPD中与昼夜节律相关的生物标志物,探索其诊断价值、免疫相关性及治疗潜力 来自公共GEO数据库的四个人肺转录组数据集(GSE151052、GSE38974、GSE76925和GSE47460)以及COPD患者和健康对照的外周血样本 机器学习和多组学 慢性阻塞性肺疾病 转录组测序、单细胞RNA测序、qRT-PCR 多元逻辑回归、机器学习算法(具体未指定) 基因表达数据、单细胞转录组数据、临床样本数据 四个公共数据集(发现集和验证集)以及少量外周血样本(具体数量未提及) NA NA NA NA
115 2026-08-03
Integrated Multi-Omics Analysis Identifies PDK4 and ACOT1 as Metabolic Hub Genes Associated With Myocardial Fibrosis in Diabetic Cardiomyopathy
2026, Journal of diabetes research IF:3.6Q2
研究论文 通过整合多组学分析,识别PDK4和ACOT1作为糖尿病心肌病心肌纤维化的代谢枢纽基因 首次将体内外实验与生物信息学结合,发现PDK4和ACOT1在心肌成纤维细胞中的上调,并提出“代谢-纤维化轴”概念 仅通过分子对接预测PDK4和ACOT1的相互作用,缺乏实验验证 阐明糖尿病心肌病中代谢失调与心肌纤维化之间的分子网络,寻找潜在治疗靶点 高脂饮食诱导的糖尿病心肌纤维化小鼠模型、两个独立DCM数据集、人原代心肌成纤维细胞 生物信息学 糖尿病心肌病 转录组测序,单细胞RNA测序,分子对接 NA 基因表达数据,单细胞转录组数据 小鼠模型(数量未明确),两个独立DCM数据集,人原代心肌成纤维细胞 NA 单细胞RNA测序,转录组测序 NA NA
116 2026-08-03
Spatial transcriptomic analysis of kidney biopsies identifies activation of complement and SPP1 networks in Staphylococcus infection-associated glomerulonephritis
2026, Frontiers in nephrology
研究论文 利用单细胞空间转录组学分析金黄色葡萄球菌感染相关性肾小球肾炎(SAGN)的肾活检组织,发现补体激活和SPP1信号网络在疾病发病机制中起关键作用 首次将单细胞空间转录组学应用于SAGN肾活检组织,揭示了SPP1和补体信号网络在疾病中的特异性激活及保护性信号抑制 样本量小(仅3例SAGN和1例正常对照),且缺乏动物模型验证 阐明SAGN的分子病理机制,寻找潜在治疗靶点 3例SAGN患者和1例正常对照的肾活检组织 数字病理学 感染相关性肾小球肾炎 单细胞空间转录组学 NA 基因表达数据 3例SAGN肾活检组织,1例正常对照肾组织,共3,993个细胞转录组 NA 单细胞空间转录组学 NA NA
117 2026-08-03
Single-cell-derived ferroptosis signature predicts prognosis and therapy response in esophageal squamous cell carcinoma
2026, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序和转录组数据,构建了食管鳞状细胞癌的铁死亡相关预后模型,并验证了其预后和治疗反应预测价值 首次利用单细胞分辨率下的铁死亡基因特征构建食管鳞状细胞癌预后模型,并通过体外实验和临床样本验证,为铁死亡靶向治疗提供基础 未提及 开发食管鳞状细胞癌的铁死亡相关预后模型,并探讨其与免疫浸润、治疗反应及药物敏感性的关联 食管鳞状细胞癌患者及其肿瘤微环境中的细胞亚群,以及ESCC细胞系 机器学习 食管鳞状细胞癌 单细胞RNA测序和批量转录组测序 LASSO-Cox回归 基因表达数据 多个独立队列(TCGA和GEO)及临床组织样本,具体数量未提供 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
118 2026-08-03
Case Report: Schwann cell reprogramming and PDGF-driven nerve hypertrophy in an NF1 patient with CIDP-like autoimmunity
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
病例报告 报道一例NF1缺失患者伴有CIDP样自身免疫,通过单细胞RNA测序揭示施万细胞重编程和PDGF驱动的神经肥大机制 首次在NF1患者中揭示自身免疫触发的施万细胞重编程和PDGF双轴信号网络驱动神经肥大,提出PDGF通路作为难治性肥厚性神经病的潜在治疗靶点 初步评估,样本量有限,需进一步验证 阐明NF1患者周围神经肥大的内膜纤维化机制,重点关注施万细胞与成纤维细胞之间的信号网络 一名NF1缺失且伴有CIDP样自身免疫的患者腓肠神经活检样本 数字病理学 神经纤维瘤病1型(NF1)、慢性炎性脱髓鞘性多发性神经病(CIDP) 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 1例患者腓肠神经活检样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
119 2026-08-03
Divergent cytotoxic and inflammatory functions of intratumoral Vδ2+ γδ T cells in renal cell carcinoma
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过流式细胞术和单细胞转录组分析,全面表征了肾细胞癌患者外周血和肿瘤组织中Vδ2 γδ T细胞的功能异质性,揭示了CD16阳性和阴性亚群分别具有细胞毒性和炎症性效应功能 首次在肾细胞癌中系统解析了肿瘤浸润Vδ2 γδ T细胞的异质性,确定了CD16表达区分细胞毒性与炎症性亚群,并揭示其分化轨迹及空间分布特征 样本量有限,未进行功能验证实验或体内研究,且未探讨Vδ2 γδ T细胞亚群在肾细胞癌预后中的临床意义 探究肾细胞癌中肿瘤浸润Vδ2 γδ T细胞的功能异质性及其抗肿瘤或促肿瘤作用 肾细胞癌患者的外周血和肿瘤组织中的Vδ2 γδ T细胞 单细胞转录组学 肾细胞癌 流式细胞术,单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据,流式细胞术数据 肾细胞癌患者的外周血和肿瘤配对样本(具体数量未在摘要中提供) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台,用于肿瘤浸润Vδ2 γδ T细胞的单细胞转录组分析
120 2026-08-03
Cross-scale modeling reveals a TFRC-driven immunosuppressive macrophage niche in cervical cancer
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过跨尺度建模,在宫颈癌中建立了一个以肿瘤相关巨噬细胞极化为核心的预后模型,并揭示了TFRC驱动的免疫抑制性巨噬细胞生态位及其机制 创新性地将批量转录组与单细胞RNA测序数据结合,通过加权基因共表达网络分析和多算法机器学习框架构建了可解释的预后模型,并首次鉴定TFRC为连接肿瘤内在铁代谢与免疫抑制性巨噬细胞极化的关键节点 体外实验基于细胞系共培养系统,可能无法完全模拟体内复杂的肿瘤微环境,且临床验证样本量较小(n=39),需要更大规模的前瞻性研究进一步验证 建立以巨噬细胞极化为中心的预后模型,并阐明宫颈癌中肿瘤-免疫相互作用的机制 宫颈癌肿瘤相关巨噬细胞及其极化状态,以及肿瘤内在因子TFRC在免疫抑制微环境中的作用 机器学习, 数字病理学 宫颈癌 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 多重免疫荧光, 实时荧光定量PCR, 蛋白质印迹, 酶联免疫吸附测定, 流式细胞术 加权基因共表达网络分析, 多算法机器学习框架, 预后签名模型 转录组数据, 单细胞表达数据, 蛋白质表达数据, 临床病理数据 TCGA批量转录组数据, GSE208653单细胞数据, GSE52903验证队列, 39例配对临床样本, 40例临床标本 NA 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 NA NA
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