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当前共找到 38610 篇文献,本页显示第 101 - 120 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
101 2026-04-21
A uniquely leptin sensitive hypothalamic neuron population limits hyperphagia and weight gain in diet-induced obesity
2026-Mar-29, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过结合空间转录组学和单核RNA测序技术,在小鼠饮食诱导肥胖模型中鉴定出一个独特的、对瘦素保持敏感的下丘脑神经元亚群,该亚群通过限制摄食行为来调控体重增加 首次在肥胖状态下,识别出一个通过共表达GLP-1受体而保持瘦素敏感性的特定下丘脑神经元亚群,并揭示了其在抑制过度摄食和体重增加中的关键作用 研究基于小鼠模型,其在人类中的直接相关性尚需验证;研究聚焦于特定神经元亚群,其他可能参与瘦素信号通路的细胞类型未被全面探讨 探究在肥胖状态下,哪些神经基质仍保持对瘦素的敏感性并介导其对摄食行为的抑制作用 饮食诱导肥胖(DIO)小鼠模型中的下丘脑神经元 神经科学,代谢研究 肥胖症 空间转录组学,单核RNA测序 NA 空间转录组数据,单核RNA测序数据 NA NA 空间转录组学,单核RNA测序 NA NA
102 2026-04-21
Same-Slide Spatial Multi-Omics Integration with IN-DEPTH Reveals Tumor Virus-Linked Spatial Reorganization of the Tumor Microenvironment
2026-Mar-24, Cancer discovery IF:29.7Q1
研究论文 本文介绍了一种名为IN-DEPTH的新型空间多组学整合工作流程,结合SGCC分析方法,用于揭示弥漫性大B细胞淋巴瘤中EBV相关的肿瘤微环境空间重组 开发了IN-DEPTH工作流程,实现同一切片上的空间蛋白质组学和转录组学整合,避免了RNA信号损失,并创建了SGCC框架来解析细胞群体间的空间协调功能状态变化 NA 开发并应用空间多组学技术来研究肿瘤微环境的空间组织和功能机制 弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)组织样本,包括EBV阳性和EBV阴性肿瘤 数字病理学 淋巴瘤 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 单细胞空间蛋白质组学成像 NA 图像, 转录组数据, 蛋白质组数据 NA NA 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 单细胞多组学 NA NA
103 2026-04-21
Single cell RNA analysis of murine osteosarcoma uncovers Skp2 function in metastasis, genomic instability and immune activation and reveals additional target pathway
2026-Mar-24, Cancer research communications IF:2.0Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析小鼠骨肉瘤,揭示了Skp2在转移、基因组不稳定性和免疫激活中的功能,并发现了额外的靶向通路 首次在免疫活性小鼠骨肉瘤模型中应用单细胞RNA测序,系统揭示了Skp2缺失如何影响肿瘤异质性、微环境复杂性、T细胞耗竭、干扰素信号传导以及转移相关基因表达,同时识别了肿瘤逃逸Skp2靶向的潜在机制 研究基于小鼠模型,可能不完全反映人类骨肉瘤的复杂性;单细胞测序数据虽全面,但功能验证仍需进一步实验支持 探究骨肉瘤中Skp2的功能及其在肿瘤进展、转移和免疫调节中的作用,以识别新的治疗靶点 小鼠骨肉瘤模型(Osx-Cre条件性Rb1/Trp53敲除小鼠)及其Skp2敲除或Skp2-p27相互作用破坏的变体 数字病理学 骨肉瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq),蛋白质组学分析 NA 单细胞RNA测序数据,蛋白质组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
104 2026-04-21
Integrated single-cell and spatial mapping coupled with machine learning unveils core stemness landscapes and regulatory drivers in triple-negative breast cancer
2026-Mar-23, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量转录组数据,结合机器学习方法,揭示了三阴性乳腺癌中的核心干性景观和调控驱动因子 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学和机器学习算法(如XGBoost)来识别三阴性乳腺癌中的高干性细胞群体,并构建了基于五个核心基因的预测模型,同时通过虚拟敲除实验验证了核心基因在维持干性中的作用 研究主要基于计算分析和体外实验验证,缺乏体内实验或临床样本的直接功能验证,且样本量可能有限 阐明三阴性乳腺癌中癌症干细胞相关的干性特征与肿瘤进展之间的分子调控机制 三阴性乳腺癌细胞,特别是高干性细胞亚群 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量转录组测序 XGBoost, hdWGCNA, Monocle3, scTour, CellChat, SHAP 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,批量转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
105 2026-04-21
Spatial Distribution of K13-Positive Airway Epithelial Cells in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2026-Mar-23, Biomedicines IF:3.9Q1
研究论文 本研究探讨了K13阳性气道上皮细胞在特发性肺纤维化(IPF)中的空间分布及其在疾病进展中的作用 首次揭示了K13阳性hillock细胞在IPF远端气道中异常激活并驱动近端化表型转变,通过单细胞分析鉴定了相关的促纤维化亚群和信号通路 研究主要基于组织样本的空间分析和单细胞数据重分析,缺乏直接的体内功能验证实验 阐明特发性肺纤维化(IPF)中远端气道重塑的细胞机制,特别是上皮干细胞的作用 IPF患者和对照组的肺组织样本,重点关注K13阳性气道上皮细胞 数字病理学 特发性肺纤维化 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间免疫荧光,多重染色,体外培养实验 CellChat(用于细胞间通讯推断) 空间成像数据,单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量,涉及IPF和对照肺组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
106 2026-04-21
RBX1+ CAFs Drives Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Progression Through Tenascin C Overexpression
2026-Mar-22, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 本研究揭示了RBX1+癌症相关成纤维细胞通过上调Tenascin C表达驱动胰腺导管腺癌进展的机制 首次在单细胞水平上鉴定出RBX1在CAF亚群中的特异性表达,并阐明其通过调控Tenascin C促进PDAC进展的新机制 研究样本主要来自单一医疗中心,缺乏多中心验证;体内实验仅使用异种移植模型,未涉及基因工程小鼠模型 探究E3泛素连接酶在胰腺癌基质成纤维细胞中的作用及其对肿瘤进展的影响 胰腺导管腺癌组织样本、癌症相关成纤维细胞、PAAD细胞系 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序、RT-PCR、Western blotting、假时间分析、细胞通讯分析 NA 单细胞转录组数据、基因表达数据、蛋白质数据 来自哈尔滨医科大学第一附属医院的胰腺组织样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
107 2026-04-21
Modern Pathology-Driven Strategies in Neoadjuvant Immunotherapy for Head and Neck Squamous Cell Carcinoma: From Residual Tumor Quantification to Spatial and AI-Based Biomarkers
2026-Mar-21, Cancers IF:4.5Q1
综述 本文综述了头颈部鳞状细胞癌新辅助免疫治疗中基于病理学的策略,包括残留肿瘤量化、空间分析和人工智能生物标志物 整合了数字病理学和人工智能辅助图像分析,以增强病理反应评估的可重复性,并实现高分辨率映射,同时强调从解剖学分期向生物学驱动反应分层的转变 作为叙述性综述,可能未涵盖所有相关研究,且依赖于现有文献,缺乏原始数据分析 探讨头颈部鳞状细胞癌新辅助免疫治疗中病理学驱动的反应评估策略及其在指导治疗和临床试验设计中的应用 头颈部鳞状细胞癌患者的新辅助治疗标本 数字病理学 头颈部鳞状细胞癌 单细胞测序、空间转录组学、多重免疫分析 人工智能辅助图像分析 图像、文本 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
108 2026-04-21
Mixed Lymphocyte Reaction: Functional Immune Profiling in Transplantation and Beyond
2026-Mar-20, Diagnostics (Basel, Switzerland)
综述 本文是一篇关于混合淋巴细胞反应(MLR)的叙述性综述,旨在提供该领域的实用、非系统性综合,涵盖MLR的设计、读出方法及转化应用,并强调新技术如何将其从批量增殖扩展为多维免疫分析 强调MLR作为一种功能性兼容性探针在HLA分型之外的持续价值,并整合了如scRNA-seq和TCR测序等下一代技术,以提升其分辨率和应用范围 本文为叙述性、非系统性综述,可能未全面涵盖所有相关研究,且依赖于现有文献,缺乏原始数据分析 提供MLR的现代实践导向综合,以改进其在移植、免疫治疗和免疫调节研究中的可重复性和转化准备度 混合淋巴细胞反应(MLR)作为一种体外功能测定,用于模拟应答T细胞与同种异体抗原呈递细胞(APCs)之间的相互作用 免疫学 移植相关疾病 混合淋巴细胞反应(MLR)、流式细胞术、scRNA-seq、TCR测序 NA 功能测定数据、增殖数据、细胞因子/趋化因子谱、细胞毒性数据 NA NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA NA
109 2026-04-21
Causal Effects of a Hepatic Senescence Gene Set on MASLD Fibrosis: A Mendelian Randomization Study and Quercetin Molecular Docking Analysis
2026-Mar-17, Biomedicines IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过孟德尔随机化分析探讨了肝脏衰老相关基因集与MASLD肝纤维化之间的因果关系,并结合分子对接分析了槲皮素的潜在干预作用 首次将孟德尔随机化、免疫浸润分析、单细胞RNA测序和分子对接技术结合,系统揭示了GBP2基因在肝纤维化和胆管癌中的双重作用,并提出了槲皮素通过IRF1间接调控GBP2的新机制 研究主要基于遗传关联和计算模拟,缺乏体内外实验验证;样本来源和数量在部分分析中可能有限;分子对接结果需要进一步实验确认 探究肝脏衰老相关基因集与代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)肝纤维化之间的因果关系及潜在治疗靶点 肝脏衰老相关基因集(SHGS)、GBP2基因、肝纤维化、胆管癌、槲皮素 生物信息学 肝病 孟德尔随机化(MR)、CIBERSORT算法、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、分子对接 NA 基因组数据、转录组数据、单细胞数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
110 2026-04-21
Patient-Derived Organoids from Multiple Sites of a Single Tumor Recapitulates Intratumoral Heterogeneity in Patients with Gastric Cancer
2026-03-15, Gut and liver IF:3.4Q2
研究论文 本研究利用单细胞转录组学分析来自单个胃癌肿瘤不同部位的病人来源类器官,以评估其反映肿瘤内异质性的能力 首次通过单细胞转录组学分析来自同一肿瘤多个部位的PDOs,揭示了其在基因表达上的相似性和差异性,并验证了神经内分泌肿瘤标志物的上调 PDOs在反映肿瘤内异质性方面存在挑战,需要更全面的评估 评估病人来源类器官在捕捉胃癌肿瘤内异质性方面的临床效用 胃癌患者肿瘤不同部位的病人来源类器官 数字病理学 胃癌 单细胞转录组学,免疫组织化学染色 NA 单细胞转录组数据,图像数据 来自单个胃癌肿瘤不同部位的多个PDOs样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
111 2026-04-21
Bridging the Precision Gap in Rheumatoid Arthritis: Spatial Transcriptomics, Spatial Proteomics, and Artificial Intelligence in Precision Health
2026-Mar-14, Biomedicines IF:3.9Q1
综述 本文综述了空间转录组学、空间蛋白质组学与人工智能如何共同推动类风湿关节炎的精准医疗发展 整合空间组学技术与人工智能,以解决类风湿关节炎治疗中的精准性差距,实现个体化分子和空间疾病图谱的匹配 NA 探讨空间组学与人工智能在类风湿关节炎精准医疗中的应用,以缩小治疗策略与个体疾病特征之间的差距 类风湿关节炎的免疫微环境和组织异质性 数字病理学 类风湿关节炎 空间转录组学, 空间蛋白质组学 NA 空间分子数据 NA NA 空间转录组学, 空间蛋白质组学 NA NA
112 2026-04-21
Proliferative Tumor States and Immunogenic Ecosystems Predict Neoadjuvant Chemotherapy Response in Triple-Negative Breast Cancer
2026-Mar-12, Biomedicines IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过整合公共大块转录组数据和探索性单细胞多组学数据,旨在识别与三阴性乳腺癌新辅助化疗反应相关的肿瘤和免疫特征 首次将大块队列数据与仅来自5名患者的探索性单细胞多组学数据集整合,以识别与化疗反应相关的肿瘤和免疫特征,并提出了TIGIT-NECTIN2作为潜在的免疫检查点轴 单细胞队列样本量小(n=5),候选生物标志物和通路需要在更大的独立队列中进行验证,临床转化尚不成熟 识别与三阴性乳腺癌新辅助化疗反应相关的肿瘤和免疫相关特征 三阴性乳腺癌患者 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序,T细胞和B细胞受体测序,单细胞ATAC测序,糖基化标签分析 NA 转录组数据,表观基因组数据,免疫受体数据 两个公共乳腺癌队列(GSE76275和GSE25065)以及一个5名三阴性乳腺癌患者的单细胞队列(4名应答者,1名无应答者) NA 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq,单细胞多组学 NA NA
113 2026-04-21
Systematic clustering alignment and feature characterization for single-cell omics using ACE-OF-Clust
2026-Mar-12, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种名为ACE-OF-Clust的工具,用于解决单细胞组学数据聚类分析中的对齐与特征表征问题 提出了一个四步工作流程(多重聚类、聚类对齐、模型比较、特征识别),首次系统解决单细胞聚类中的对齐问题,并支持跨组学聚类变异性量化 未明确说明算法在超大规模数据集上的计算效率,也未提及对特定噪声数据的鲁棒性评估 提高单细胞聚类分析的可解释性、灵活性和鲁棒性,以研究细胞异质性和基因表达动态 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、多组学单细胞数据 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学分析 混合隶属度聚类模型 转录组数据、空间表达数据、多组学数据 PBMC单细胞RNA-seq数据、乳腺癌空间转录组数据 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 NA NA
114 2026-04-21
Pericytes and mesenchymal stromal cells converge toward pro-tumor phenotypes in the tumor microenvironment
2026-Mar-11, Discover oncology IF:2.8Q2
综述 本文综述了间充质基质细胞(MSCs)和周细胞在肿瘤微环境中如何趋同于促肿瘤表型,并探讨了它们在癌症进展、转移和治疗反应中的作用 通过单细胞RNA测序分析揭示了MSCs和周细胞在肿瘤微环境中功能趋同,模糊了传统分类界限,并提出了一个分类“MSC-周细胞状态”的实用框架 NA 探讨MSCs和周细胞在肿瘤微环境中的趋同表型及其对癌症进展和治疗的影响 间充质基质细胞(MSCs)和周细胞在肿瘤微环境中的行为 肿瘤生物学 结直肠癌、血液恶性肿瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
115 2026-04-21
Neutrophil extracellular traps-associated candidate genes in IgA vasculitis: an exploratory multi-omics analysis integrating transcriptomics and Mendelian randomization
2026-Mar-05, Pediatric rheumatology online journal
研究论文 本研究通过整合转录组学和孟德尔随机化分析,探索了IgA血管炎中与中性粒细胞胞外陷阱相关的候选基因 采用多组学整合方法,结合转录组差异表达、基因集富集分析、孟德尔随机化和单细胞RNA测序,首次系统识别了IgA血管炎中NET相关的候选基因及其在免疫细胞中的特异性表达 这是一项探索性研究,样本量有限,结果需在更大队列和功能研究中进一步验证 识别与IgA血管炎相关的NET相关候选基因,并探索其在免疫细胞中的特异性表达 IgA血管炎患者和健康对照的外周血转录组数据 生物信息学 IgA血管炎 转录组测序, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析 基因集富集分析, 基因集变异分析, 孟德尔随机化 转录组数据 NA NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
116 2026-04-21
Identification of a lactylation-related model for predicting prognosis, tumor-infiltrating immune cells, and chemotherapy response in colorectal cancer
2026-Mar, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 本研究通过整合乳酸化相关基因表达谱与单细胞RNA测序,识别了五个关键基因(CALD1、S100A11、S100A6、LGALS1、CSRP2),构建了一个预测结直肠癌预后、肿瘤浸润免疫细胞和化疗反应的模型 首次将乳酸化相关基因与单细胞RNA测序结合,用于结直肠癌的分子亚型分型和预后预测,揭示了乳酸化在免疫调节和化疗耐药中的新作用 研究未详细说明样本的具体临床特征或外部验证队列,可能限制模型的泛化能力 提高结直肠癌的预后评估和治疗分层准确性 结直肠癌患者 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 预后风险模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
117 2026-04-21
Evaluating the toxicological effects of PET-MPs exposure on atherosclerosis through integrated network toxicology analysis and experimental validation
2026-Mar, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 本研究通过整合网络毒理学分析和实验验证,评估了PET微塑料暴露对动脉粥样硬化的毒理学效应 结合生物信息学与实验验证,首次系统探索PET微塑料诱导动脉粥样硬化的潜在毒理学机制,并识别了核心靶点 研究主要基于体外细胞实验和计算模拟,缺乏体内动物模型验证,且毒理学机制的全面性有待进一步证实 探究PET微塑料暴露导致动脉粥样硬化的毒理学机制 PET微塑料(PET-MPs)及其在动脉粥样硬化中的作用靶点 生物信息学 心血管疾病 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 分子对接, PCR NA 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
118 2026-04-21
Spatial-ZEDNet : a unified spatial transcriptomics framework for detecting differential gene activation and expression
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文提出了一种名为Spatial-ZEDNet的层次高斯随机场框架,用于联合检测空间差异表达基因和差异激活基因,并显式建模零膨胀问题 该框架首次在无需空间坐标匹配的情况下对齐不同条件下的生物信号,同时检测空间差异表达基因和差异激活基因,并显式处理单细胞基因表达数据中普遍存在的零膨胀问题 未明确说明方法在超大规模数据集上的计算效率或对特定组织类型的适用性限制 开发一个统计严谨、可解释的框架,用于整合跨环境和治疗暴露的空间转录组数据,推进对暴露诱导组织重塑的机制理解 空间转录组数据,特别是结肠炎和疟原虫感染数据集中的基因表达模式 空间转录组学 结肠炎、疟疾 空间转录组学 层次高斯随机场 空间基因表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
119 2026-04-21
AICellType: a large language model-based platform for accurate cell type annotation
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文介绍了一个基于大型语言模型的平台AICellType,用于准确注释单细胞和空间转录组学中的细胞类型 通过系统评估79个大型语言模型在1130个数据集上的性能,开发了首个结合本体结构和语义推理的评估框架,并推出了开源R包和网络平台 模型性能可能受限于训练数据的多样性和生物学背景的复杂性 开发一个准确、可扩展且高效的单细胞和空间转录组学细胞类型注释平台 单细胞和空间转录组学数据集 自然语言处理 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 大型语言模型 文本 1130个单细胞和空间转录组学数据集 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
120 2026-04-21
Spatial multi-omics integration by cross-modal graph contrastive learning
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文提出了一种基于图的框架CoMo,用于整合空间多组学数据,通过跨模态图对比学习实现特征融合和空间域识别 CoMo框架结合跨注意力机制和双重对比损失优化,有效处理多组学层间的技术偏差和生物复杂性,提升空间域识别性能 NA 开发一个计算工具以整合空间多组学数据,用于解析组织结构和细胞间通讯 空间多组学数据,包括空间转录组、空间蛋白质组和空间表观基因组 机器学习 NA 空间多组学技术 图神经网络,对比学习 空间多组学数据 NA NA 空间多组学 NA NA
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