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当前共找到 34490 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-12-25 |
Phylogenomic Analysis of Deep-Branching Telonemid
2025-Nov-28, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evaf202
PMID:41157959
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序和系统基因组分析，探讨了Telonemia门中TEL2亚群新物种对真核生物超群演化关系的影响 | 首次从太平洋远洋中分离出Telonemia门TEL2亚群的单细胞，并利用单细胞转录组测序数据填补了该门系统基因组数据的空白 | 贝叶斯分析未能收敛于特定拓扑结构，且不同数据子集分析结果存在不一致性，表明演化关系仍不稳定 | 研究Telonemia门与SAR超群及其他稀疏采样真核生物超群（如Hemimastigophora、Provora、Haptista）的演化关系 | Telonemia门中的TEL2亚群单细胞样本 | 系统基因组学 | NA | 单细胞转录组测序、系统基因组分析、最大似然法、贝叶斯分析 | NA | 转录组序列数据 | 1个从太平洋远洋分离的Telonemia门TEL2亚群单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 102 | 2025-12-25 |
Comparing great apes reveals human-specific ZEB2 roles in neural development
2025-Nov-28, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msaf318
PMID:41340546
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研究论文 | 本研究通过比较人类、黑猩猩和猩猩的ZEB2转录因子调控差异，揭示了人类特异性ZEB2在神经发育中的独特作用 | 首次在可控细胞系统中检测到ZEB2调控的物种差异，并在神经背景下验证，揭示了人类特异性ZEB2靶基因富集于非编码基因，表明调控网络的扩展和重连 | 研究基于B淋巴母细胞系作为实验模型，可能无法完全反映体内神经发育的复杂性 | 探索ZEB2转录因子在人类与其他灵长类动物间的调控差异，以理解人类特异性神经发育的进化机制 | 人类、黑猩猩和猩猩的B淋巴母细胞系，以及单细胞RNA测序和脑类器官数据 | 自然语言处理 | NA | 转录组分析，单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 三种大猿物种的B淋巴母细胞系生物重复样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 103 | 2025-12-25 |
Tumor microenvironment-mediated immune evasion and resistance in prostate cancer: mechanisms, cross-talk, and therapeutic opportunities
2025-Nov-26, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01944-0
PMID:41296089
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综述 | 本文全面分析了前列腺癌中免疫抑制性肿瘤微环境的组成、机制及其在治疗抵抗中的作用，并探讨了基于这些机制的精准治疗策略 | 利用单细胞RNA测序、空间多组学和高维成像技术等先进方法，重新定义了肿瘤-免疫-基质相互作用的认知，并提出了整合多组学技术与生物标志物驱动的临床试验设计的新方向 | 作为一篇综述文章，未涉及原始实验数据，主要基于现有文献进行总结和分析 | 探讨前列腺癌中肿瘤微环境介导的免疫逃逸和耐药机制，并寻找治疗机会 | 前列腺癌及其免疫抑制性肿瘤微环境 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间多组学, 高维成像 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间多组学 | NA | NA |
| 104 | 2025-12-25 |
Vascular dementia increases levels of methylenetetrahydrofolate reductase and cystathionine β-synthase in female patients and changes gene expression of acetylcholine and glutamate clathrin-sculpted transport vesicles
2025-Nov-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.21.689865
PMID:41394563
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研究论文 | 本研究通过分析血管性痴呆患者尸检脑组织，探究一碳代谢相关酶水平变化及其与性别的关系，并利用空间转录组学揭示了谷氨酸和乙酰胆碱囊泡转运相关基因表达的改变 | 首次在人类血管性痴呆患者中系统比较了性别对一碳代谢酶水平的影响，并结合空间转录组学技术发现了与神经递质转运相关的特异性基因表达变化 | 样本量有限（空间转录组学仅4个样本），仅使用皮层组织，未探索其他脑区变化 | 阐明血管性痴呆中一碳代谢的分子特征及其潜在机制 | 血管性痴呆患者及对照的尸检皮层组织 | 空间转录组学 | 血管性痴呆 | 空间转录组学，免疫标记 | NA | 组织切片图像，基因表达数据 | 未明确总样本数，空间转录组学分析4个样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 105 | 2025-12-25 |
Transcriptomic plasticity of cholinergic adipose macrophages in the acute thermogenic response
2025-Nov-07, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110925
PMID:41207622
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了胆碱能脂肪巨噬细胞在急性冷暴露下的转录组可塑性及其混合起源 | 首次在单细胞水平上详细描述了胆碱能脂肪巨噬细胞的转录组动态变化，并揭示了其混合起源（来自成年骨髓和胚胎），为代谢疾病的治疗提供了新靶点 | 研究仅基于小鼠模型，未在人类样本中进行验证，且未深入探讨胆碱能脂肪巨噬细胞的具体功能机制 | 探究胆碱能脂肪巨噬细胞在急性产热反应中的转录组可塑性、细胞亚群特征及其起源 | 小鼠皮下白色脂肪组织中的ChAT-eGFP+细胞（表达胆碱乙酰转移酶） | 单细胞转录组学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自热中性或急性冷暴露小鼠的皮下白色脂肪组织细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 106 | 2025-12-25 |
Injury-induced connexin 43 expression regulates endothelial wound healing
2025-Nov-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00153.2025
PMID:41060772
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研究论文 | 本研究揭示了机械损伤诱导连接蛋白43（Cx43）上调，并通过间隙连接介导的细胞间通讯促进内皮细胞迁移和增殖，从而加速血管损伤后的伤口愈合 | 首次证明大动脉内皮机械损伤可诱导间隙连接蛋白Cx43表达，并阐明其磷酸化依赖的调控机制在内皮愈合中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类血管组织中得到验证；单细胞测序样本量相对有限（10,829个细胞） | 探究Cx43在血管内皮损伤修复中的分子机制 | 小鼠颈动脉内皮细胞 | 分子生物学 | 血管疾病 | RNA-seq，单细胞RNA-seq | 基因敲除小鼠模型，点突变小鼠模型 | 基因表达数据 | 10,829个细胞（来自野生型和Cx43敲除小鼠的损伤颈动脉） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 107 | 2025-12-25 |
How to drug a leukemic stem cell: deciphering heterogeneity for better specificity
2025-Nov, Blood neoplasia
DOI:10.1016/j.bneo.2025.100146
PMID:41424935
|
综述 | 本文综述了白血病干细胞（LSCs）的独特生物学特性，探讨了其异质性对药物靶点发现的影响以及单细胞测序等技术如何帮助解决这一问题 | 通过整合全球和亚型特异性特征，系统总结了LSCs的生物学特性，并强调了单细胞测序等技术在解析异质性、推动LSC特异性治疗方面的创新应用 | 作为一篇综述，本文未涉及原始实验数据，主要基于现有文献进行总结，可能无法涵盖所有最新研究进展 | 探讨如何针对白血病干细胞（LSCs）开发特异性治疗方法，以预防或治疗急性髓系白血病（AML）的复发 | 白血病干细胞（LSCs），特别是其在急性髓系白血病（AML）复发中的作用 | NA | 白血病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 108 | 2025-12-25 |
Discovery of disease-associated cellular states using ResidPCA in single-cell RNA and ATAC sequencing data
2025-Oct-27, HGG advances
DOI:10.1016/j.xhgg.2025.100538
PMID:41157948
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为ResidPCA的稳健方法，用于从单细胞RNA和ATAC测序数据中识别疾病相关的细胞状态 | ResidPCA通过显式建模细胞类型异质性，在检测跨多种细胞类型表达的状态时，比传统PCA和非负矩阵分解方法具有更高的准确性 | NA | 推进对单细胞测序数据中疾病细胞异质性的理解 | 小鼠视觉皮层细胞和阿尔茨海默病队列的单核数据集 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 单核ATAC测序 | PCA, NMF, ResidPCA | 单细胞RNA测序数据, 单核ATAC测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单核ATAC-seq | NA | NA |
| 109 | 2025-12-25 |
CMV-specific clonal expansion of Th1, GZMK+ CD8+, and TEMRA T cells revealed by human PBMC single cell profiling
2025-Oct-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.24.661167
PMID:40666903
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序等技术系统揭示了人类巨细胞病毒（CMV）感染引起的免疫细胞克隆性扩增特征 | 首次发现GZMK+ CD8+ T细胞和Th1细胞是CMV特异性克隆扩增的新组分，并开发了CMVerify预测模型 | 研究主要基于外周血样本，未直接检测组织驻留免疫细胞；队列样本量相对有限 | 系统解析CMV感染引起的免疫系统重塑特征 | 人类外周血单个核细胞（PBMC） | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序，T细胞受体测序，流式细胞术 | 预测模型（CMVerify） | 单细胞转录组数据，TCR序列数据，蛋白质表达数据 | 六个独立人类队列（包含两个新建队列） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 110 | 2025-12-25 |
Innate immunity and the NF-κB pathway control prostate stem cell plasticity, reprogramming and tumor initiation
2025-Sep, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-025-00994-3
PMID:40550901
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研究论文 | 本研究探讨了Pten缺失如何通过先天免疫和NF-κB通路调控前列腺基底细胞的可塑性、重编程和肿瘤起始 | 揭示了Pten缺失导致基底细胞以区域特异性方式重编程为hillock样状态，并发现先天免疫激活（如IL-1、JAK-STAT和NF-κB通路）在此过程中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类前列腺癌中的直接应用尚需验证 | 探究前列腺基底细胞可塑性和肿瘤起始的分子机制 | 前列腺基底细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq | NA | RNA测序数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 111 | 2025-12-25 |
Epigenomic subtypes of late-onset Alzheimer's disease reveal distinct microglial signatures
2025-Aug-04, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7232080/v1
PMID:40799738
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研究论文 | 本研究通过分析死后脑组织的全基因组DNA甲基化数据，识别了晚发性阿尔茨海默病的两种表观基因组亚型，并揭示了它们与特定小胶质细胞特征和功能通路的关联 | 首次在晚发性阿尔茨海默病中识别出两种一致的表观基因组亚型，并深入揭示了它们与特定小胶质细胞炎症状态和功能通路的关联，为疾病异质性提供了新的分子机制见解 | 研究基于死后脑组织样本，可能无法完全反映疾病早期或活体状态下的表观遗传变化，且样本量相对有限 | 识别晚发性阿尔茨海默病的表观基因组亚型，并探索其与细胞类型特异性甲基化、基因表达以及临床病理特征的关系 | 晚发性阿尔茨海默病患者的死后脑组织样本 | 表观基因组学 | 阿尔茨海默病 | 全基因组DNA甲基化分析、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | 无监督聚类方法 | DNA甲基化数据、RNA-seq数据 | 831个死后脑组织样本，来自三个独立队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 112 | 2025-12-25 |
Identifying Combinatorial Regulatory Genes for Cell Fate Decision via Reparameterizable Subset Explanations
2025-Aug, KDD : proceedings. International Conference on Knowledge Discovery & Data Mining
DOI:10.1145/3711896.3737000
PMID:41426294
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研究论文 | 本文提出了一种名为MetaVelo的全局特征解释框架，用于识别影响细胞命运转变的关键调控基因组合 | 通过将问题重新参数化为可控数据生成过程，克服了细胞命运动力学的不可微性挑战，并能够区分独立与协同调控基因 | 未在摘要中明确说明 | 识别调控细胞命运决定的组合基因 | 细胞命运决定过程 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经常微分方程 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 113 | 2025-12-25 |
Multiplexed single-cell transcriptomics reveals diverse phenotypic outcomes for pathogenic SHP2 variants
2025-Jul-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.30.662374
PMID:40631144
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研究论文 | 本研究结合单细胞转录组学、蛋白质生物化学、结构分析和细胞生物学，揭示了致病性SHP2变异如何失调信号传导，并阐明了不同突变类型对细胞状态的多样化影响 | 首次在单细胞水平系统比较了临床多样性SHP2变异对基因表达的影响，发现催化活性丧失并不等同于基因敲除的表型，揭示了不同突变机制可能产生趋同表型效应，而同一热点残基的不同突变可导致截然不同的细胞状态 | 研究主要基于体外细胞模型，尚未在动物模型或临床样本中全面验证；单细胞转录组分析可能未完全捕捉蛋白质水平和功能层面的变化 | 阐明致病性SHP2变异如何通过结构扰动影响细胞信号传导和基因表达，从而理解其与人类疾病的关联 | 表达临床多样性SHP2变异（包括增强催化活性、失活型和影响蛋白质相互作用的突变）的细胞 | 单细胞组学 | 发育障碍（如努南综合征）和多种癌症 | 单细胞转录组测序、蛋白质生物化学、结构分析、细胞生物学 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质结构数据、细胞表型数据 | 未明确说明具体细胞数量，但涉及表达多种临床SHP2变异的细胞群体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 114 | 2025-12-25 |
Stem Cell Niche: iPSC-Based Assembloids for Modeling Human Hematopoiesis
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2025_629
PMID:40459837
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研究论文 | 本文介绍了一种基于iPSC生成患者特异性3D骨髓模拟组装体的协议，用于建模人类造血过程 | 开发了可精确控制细胞组成和遗传背景的患者特异性3D骨髓模拟组装体，成功重现了骨髓增生性肿瘤的关键特征 | NA | 研究造血调控机制和骨髓微环境重塑，为生理和肿瘤性骨髓微环境建模提供工具 | 诱导多能干细胞（iPSCs）、人类原代间充质基质细胞（MSCs）、骨髓模拟3D组装体 | 数字病理学 | 骨髓增生性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 115 | 2025-12-25 |
SPP1+ macrophages in tumor immunosuppression: mechanisms and therapeutic implications
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1711015
PMID:41425545
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综述 | 本文综述了SPP1+巨噬细胞在肿瘤免疫抑制中的作用机制及其治疗意义 | 系统总结了SPP1+巨噬细胞作为跨多种癌症类型的关键免疫抑制性细胞亚群的最新研究进展，并强调了靶向该亚群作为新兴治疗策略的潜力 | 本文为综述性文章，主要基于现有文献进行总结，未提供新的原始实验数据 | 阐明SPP1+巨噬细胞在肿瘤微环境中的分化机制、免疫抑制功能及作为治疗靶点的潜力 | SPP1+巨噬细胞及其在多种人类恶性肿瘤中的作用 | 肿瘤免疫学 | 多种癌症类型 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 116 | 2025-12-25 |
Neutrophil-mediated immune dysregulation in recurrent miscarriage: implications of APP-CD74 signaling and CXCL1 as diagnostic biomarkers
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1707497
PMID:41425547
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研究论文 | 本研究通过整合转录组数据和单细胞RNA测序，揭示了中性粒细胞在复发性流产中的免疫失调作用，并识别了APP-CD74信号轴和CXCL1作为潜在诊断生物标志物 | 首次深入探索中性粒细胞在复发性流产中的先天免疫角色，并识别了TNF-α驱动的极化表型及APP-CD74信号轴作为关键通路 | 研究主要基于转录组和单细胞数据，实验验证主要在滋养层细胞中进行，缺乏体内模型验证 | 探究复发性流产中中性粒细胞介导的免疫失调机制，并寻找诊断生物标志物 | 复发性流产患者、自身免疫疾病数据、蜕膜组织单细胞数据、滋养层细胞 | 数字病理学 | 复发性流产 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 117 | 2025-12-25 |
Histone-related gene WDR77 promotes tumor progression through cell cycle regulation in skin cutaneous melanoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1611112
PMID:41425556
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和机器学习方法，识别了组蛋白相关基因WDR77作为皮肤黑色素瘤的关键预后生物标志物和功能调节因子 | 首次整合10种机器学习算法构建了101个预后模型，并识别出WDR77作为皮肤黑色素瘤中与细胞周期失调相关的关键组蛋白修饰基因 | 研究主要基于生物信息学分析，体外实验验证有限，缺乏体内模型和临床样本的进一步验证 | 探索组蛋白相关基因在皮肤黑色素瘤中的预后价值和功能机制 | 皮肤黑色素瘤（SKCM）患者样本和细胞系 | 机器学习 | 皮肤黑色素瘤 | 转录组测序，单细胞转录组学，空间转录组学 | 随机森林，多种机器学习算法集成 | 转录组数据，单细胞数据，空间转录组数据 | TCGA-SKCM数据集和五个GEO数据集中的样本 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 118 | 2025-12-25 |
Integration of single-cell and bulk RNA-seq via machine learning to reveal ferroptosis- and lipid metabolism-driven immune landscape heterogeneity and predict immunotherapy response in colon cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1699079
PMID:41425595
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA-seq数据，利用机器学习揭示了结肠癌中铁死亡和脂质代谢驱动的免疫景观异质性，并预测了免疫治疗反应 | 首次整合单细胞和批量RNA-seq数据，结合铁死亡和脂质代谢相关基因，通过多种机器学习算法构建预后模型，并预测免疫治疗反应 | 研究依赖于公共数据库数据，需要进一步实验验证模型在临床中的实际应用效果 | 探索结肠癌中铁死亡与脂质代谢的相互作用，建立预后模型以阐明免疫微环境异质性，并评估免疫治疗前景 | 结肠癌患者 | 机器学习 | 结肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 免疫组化 | 支持向量机, 随机森林, 极端梯度提升, LASSO回归 | 转录组测序数据, 单细胞转录组数据 | 来自TCGA和GEO数据库的转录组和单细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 119 | 2025-12-25 |
Identification of a ubiquitin-binding domain protein, CD2AP, in predicting the prognosis and treatment of lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1726531
PMID:41425578
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研究论文 | 本研究通过多组学数据分析与实验验证，识别出CD2AP作为肺腺癌的关键预后生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次系统性地将CD2AP鉴定为肺腺癌中与泛素化相关的关键致癌蛋白，并揭示了其通过调节肿瘤细胞与单核/巨噬细胞间通讯影响肿瘤进展的新机制 | 研究主要基于公共数据库和细胞系实验，缺乏大规模临床队列验证和体内动物模型实验 | 识别肺腺癌中关键的泛素化相关调控因子并探究其临床意义 | 肺腺癌组织样本、A549细胞系 | 生物信息学 | 肺癌 | 转录组测序、蛋白质组学、单细胞RNA测序、qPCR、Western Blot、免疫荧光 | 分子对接模型 | 转录组数据、蛋白质组数据、单细胞测序数据 | TCGA和GEO数据库的肺腺癌样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 120 | 2025-12-25 |
Advancing breast cancer biomarkers: a centromere-related gene signature integrated with single-cell analysis for prognostic prediction
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1678603
PMID:41425594
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研究论文 | 本研究整合多组学数据，首次建立了一个基于着丝粒蛋白（CENP）的乳腺癌预后模型，用于风险分层并识别新的生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次建立基于CENP家族的乳腺癌预后模型，结合单细胞RNA测序分析揭示了CENPA高表达亚群与增殖性肿瘤细胞及免疫抑制微环境的关联 | NA | 开发一个基于着丝粒相关基因特征的预后预测模型，以改善乳腺癌（特别是三阴性乳腺癌）的分子分层和个性化治疗 | 乳腺癌患者，重点关注三阴性乳腺癌亚型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA转录组分析，单细胞RNA测序，加权基因共表达网络分析，Cox回归，LASSO算法 | 预后风险模型（基于Cox回归和LASSO） | RNA转录组数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |