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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-11-13 |
Prophylactic low-dose liver irradiation reprograms the pre-metastatic immune niche and suppresses NSCLC liver metastasis
2026-Sep-05, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08883-8
PMID:43015826
|
研究论文 | 该研究在小鼠非小细胞肺癌肝转移模型中,探讨预防性低剂量肝脏照射对转移前免疫微环境的重塑及抑制肝转移的作用机制 | 首次揭示预防性低剂量肝脏照射可通过诱导肝细胞来源的SAA1,激活炎性单核细胞TLR2-NF-κB/RELA通路并上调SLC7A11,促进CXCL10分泌及CD8+ T细胞招募,从而重塑转移前免疫微环境并抑制NSCLC肝转移 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在临床人群中验证;机制的完整性和长期安全性仍需进一步研究 | 探究预防性低剂量肝脏照射对非小细胞肺癌肝转移前微环境形成及转移定植的影响及其免疫调控机制 | 非小细胞肺癌肝转移小鼠模型及肝脏免疫微环境 | 肿瘤免疫学、放射生物学 | 肺癌、非小细胞肺癌、肝转移 | bulk RNA测序、单细胞RNA测序、体外功能实验、体内CXCL10中和实验 | NA | RNA测序数据、图像、文本 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 102 | 2026-11-13 |
Microglia drive demyelination via multiple sclerosis antibodies and BTK signaling
2026-Aug-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.08.25.747169
PMID:42996180
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研究论文 | 该研究通过将患者来源的靶向髓鞘抗体应用于小鼠皮层,建立局灶性脱髓鞘的多发性硬化模型,揭示小胶质细胞通过BTK信号驱动髓鞘破坏 | 首次直接证明小胶质细胞并非仅清除髓鞘碎片,而是主动吞噬完整髓鞘导致脱髓鞘;发现MS患者自身抗体可通过Fcγ受体和补体结合诱导小胶质细胞吞噬髓鞘;鉴定出脱髓鞘相关的小胶质细胞转录特征;证明BTK抑制剂可阻止小胶质细胞包裹后的髓鞘丢失 | 摘要中未明确说明研究的具体局限性 | 探究多发性硬化中发现的致病性自身抗体是否能诱导小胶质细胞对髓鞘的吞噬性破坏,以及BTK信号在其中的作用 | 小鼠皮层模型、多发性硬化患者来源的靶向髓鞘抗体、人MS病灶、小胶质细胞 | 神经免疫学 | 多发性硬化 | 双光子显微镜活体成像、单细胞RNA测序 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 103 | 2026-11-13 |
EEF1G promotes cancer-associated fibroblast activation and drives lung cancer metastasis
2026-Aug-17, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-026-01276-5
PMID:43015520
|
研究论文 | 该研究揭示EEF1G通过外泌体介导的肿瘤-基质相互作用促进CAF活化和肺癌转移的机制 | 首次阐明EEF1G通过外泌体从肿瘤细胞转移至成纤维细胞,激活NF-κB/ROS/IL-6通路诱导CAF转化,并形成CAF来源IL-6外泌体反向激活肿瘤细胞STAT3的双向促癌反馈网络 | 摘要中未明确说明研究局限性 | 探究EEF1G通过外泌体诱导CAF活化在肺癌转移中的作用机制 | 肺癌细胞、成纤维细胞、CAF、外泌体、肺癌组织 | 肿瘤生物学、单细胞组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、生物信息学分析、外泌体分离、Western blot、qRT-PCR、免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据、图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 104 | 2026-11-13 |
TREM2 regulates continual efferocytosis of apoptotic neurons by monocyte-derived macrophages via AKT-PFKFB2-mediated glycolytic reprogramming after acute ischemic stroke
2026-Aug-15, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-026-03148-9
PMID:43004346
|
研究论文 | 该文揭示TREM2通过SYK依赖的AKT-PFKFB2介导的糖酵解重编程促进单核细胞来源巨噬细胞对凋亡神经元的持续胞葬作用,从而促进急性缺血性卒中后修复 | 首次阐明TREM2调控浸润MDM持续(而非首轮)胞葬的机制,即通过SYK-AKT-PFKFB2轴介导胞葬后糖酵解重编程,维持MERTK和LRP1表达及乳酸可用性,并验证TREM2激动抗体AL002c在人巨噬细胞中的转化潜力 | 摘要未明确说明,推测机制主要在小鼠模型和体外细胞中验证,人体数据仅为相关性分析,缺乏临床干预证据 | 探究TREM2是否及如何调控急性缺血性卒中后浸润单核细胞来源巨噬细胞的修复性胞葬功能 | 急性缺血性卒中患者、MCAO/R小鼠模型、骨髓单核细胞来源巨噬细胞(BMDMs)、人单核细胞来源巨噬细胞(HMDMs) | 免疫学、神经科学、代谢组学、单细胞转录组学 | 急性缺血性卒中、脑血管疾病 | 流式细胞术、免疫荧光、CCR2-GFP示踪、过继转移、单细胞RNA测序、代谢组学、功能实验 | MCAO/R小鼠模型、体外巨噬细胞模型 | 单细胞转录组数据、代谢组数据、图像、临床指标数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、代谢组学 | NA | NA |
| 105 | 2026-11-13 |
A de novo IKZF4 Variant Underlies Hypogammaglobulinemia and Increased Infection Susceptibility through Downregulating the NF-κB Pathway
2026-Aug-15, Journal of clinical immunology
IF:7.2Q1
DOI:10.1007/s10875-026-02055-5
PMID:43015517
|
研究论文 | 该研究通过对一例IEI患者进行全外显子测序,发现IKZF4基因的新发变异c.1472delG,并通过细胞和小鼠模型揭示该变异通过下调NF-κB通路导致低丙种球蛋白血症和感染易感性增加 | 首次将IKZF4变异鉴定为人类先天性免疫缺陷(IEI)的新型候选致病基因,扩展了IKZF家族在IEI中的已知作用,并揭示了EOS蛋白通过NF-κB通路调控免疫球蛋白产生和边缘区B细胞分化的新机制 | 研究仅基于单个患者及小鼠模型,样本量有限,缺乏更大规模的患者队列验证;对EOS调控NF-κB通路的具体分子机制尚未完全阐明 | 鉴定IKZF4作为IEI新型候选基因的致病性及其潜在分子机制 | 一名11个月大的反复发热和惊厥的IEI患者及其携带Ikzf4对应变异的小鼠模型 | 医学遗传学、免疫学 | 先天性免疫缺陷(IEI)、低丙种球蛋白血症 | 全外显子测序、Western blotting、定量PCR、免疫染色、免疫共沉淀、流式细胞术、Luminex assays、单细胞RNA测序 | NA | 基因序列、蛋白质表达数据、图像、文本 | 1例患者及相应小鼠模型 | NA | 全外显子测序、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 106 | 2026-11-13 |
Analyzing per- and polyfluoroalkyl substances (PFAS) in triple-negative breast cancer (TNBC): an integrative transcriptomic and computational study
2026-Aug-14, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-026-10250-8
PMID:43009672
|
研究论文 | 该研究整合转录组学和计算方法分析PFAS在TNBC中的分子关联,构建预后基因特征 | 首次将PFAS计算靶点预测与TNBC多组学数据整合,构建6基因预后特征并进行分子对接和动力学模拟验证 | 公共队列和组织样本缺乏实测PFAS暴露数据,DEG集较宽松且疾病-基因来源异质,2年AUC 0.999可能过于乐观,PLAU的RT-qPCR结果不显著,分子对接未证明细胞内靶点结合 | 探索PFAS暴露与三阴性乳腺癌之间的分子关联,构建预后基因特征并提出可检验的计算假说 | 三阴性乳腺癌患者队列数据及15对TNBC与癌旁组织标本 | 计算生物学、转录组学 | 三阴性乳腺癌 | bulk转录组测序、微阵列、单细胞RNA测序、空间转录组学、RT-qPCR、分子对接、分子动力学模拟、网络分析 | 预后风险模型、超几何检验、网络分析 | 转录组数据、微阵列数据、单细胞RNA-seq数据、空间转录组数据、图像 | 15对TNBC与癌旁组织标本,以及多个公共患者队列 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 微阵列 | NA | NA |
| 107 | 2026-11-13 |
CD39-associated myeloid-T-cell coordination within an immunoregulatory neighborhood linked to treatment resistance in triple-negative breast cancer
2026-Aug-14, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-026-02375-9
PMID:43010016
|
研究论文 | 该研究通过重新分析单细胞RNA测序数据并结合空间转录组学、多重免疫荧光和免疫组织化学,揭示了三阴性乳腺癌中CD39相关的髓系-T细胞协调免疫调节微环境及其与治疗耐药和不良生存的关联 | 首次系统刻画了TNBC中ENTPD1/CD39在巨噬细胞和CD4+CD39+ Treg等多种免疫状态中的分布,发现了髓系细胞与CD4+CD39+ T细胞之间的优先相互作用及LT信号在非应答者中升高,并构建了TC、EDI和TRI三个基于signed-R2的汇总指标来量化治疗相关免疫动态 | 研究主要基于对已有scRNA-seq数据集的再分析,样本量有限(14例患者的27个样本),且为观察性关联分析,CD39相关免疫状态与治疗耐药之间的因果关系仍需进一步功能实验验证 | 探究TNBC肿瘤微环境中ENTPD1/CD39在髓系和T细胞状态间的分布与协调机制,及其与抗PD-L1联合化疗耐药和患者生存的关系 | 三阴性乳腺癌患者的肿瘤和转移样本中的免疫细胞及肿瘤组织 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫荧光, 免疫组织化学 | NicheNet, 轨迹分析, 细胞间通讯分析, Kaplan-Meier分析, 多因素Cox比例风险回归 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 图像, 文本 | 156120个免疫细胞来自14例TNBC患者的27个肿瘤和转移样本;独立IHC验证队列112例TNBC患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | CosMx | CosMx空间转录组学平台 |
| 108 | 2026-11-13 |
Live brain biopsy during CSF shunt surgery for precision diagnostics and multi-omic research
2026-Aug-12, Alzheimer's research & therapy
DOI:10.1186/s13195-026-02150-0
PMID:43000458
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综述 | 综述在iNPH脑脊液分流手术中获取活体脑活检样本用于神经退行性疾病精准诊断和多组学研究的方法与经验 | 提出利用iNPH患者脑脊液分流手术这一伦理可持续的机会获取活体人脑组织,用于衰老大脑研究、阿尔茨海默病相关机制探索及多组学分析,并分享团队在样本获取、切片、保存方面的完整方案 | 本文为综述性质,主要基于团队经验总结,缺乏大规模系统性验证数据 | 探讨活体皮层脑活检在神经退行性疾病研究和诊断中的应用价值,并建立标准化的样本获取、处理与保存流程 | 特发性正常压力脑积水(iNPH)患者的小块皮层脑活检组织 | 神经科学 | 阿尔茨海默病, 特发性正常压力脑积水, 神经退行性疾病 | 单细胞测序, 空间分析, 转录组学, 蛋白质组学, 电生理学, 组织培养 | NA | 组织样本, 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量转录组学 | NA | NA |
| 109 | 2026-11-13 |
Large language models advance single-cell transcriptomics in major depressive disorder
2026-Aug-12, Translational psychiatry
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41398-026-04279-w
PMID:43003831
|
综述 | 本文综述了大型语言模型如何推动单细胞转录组学在重性抑郁症研究中的应用 | 系统性地整合了大型语言模型与单细胞转录组学技术,提出用于重性抑郁症细胞层面精准假设生成的框架 | 数据异质性、模型可解释性、计算规模及数据使用的伦理问题仍待解决,患者层面的临床效用尚需前瞻性验证 | 探讨大型语言模型在重性抑郁症单细胞转录组学分析中的应用与前景 | 重性抑郁症相关的神经元和免疫细胞群体 | 自然语言处理, 机器学习, 单细胞组学 | 重性抑郁症 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 代谢组学, 表观基因组学, 空间转录组学 | 大型语言模型 | 文本, 单细胞转录组数据, 多组学数据, 空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 110 | 2026-11-13 |
Dual roles of ANXA7 in the early diagnosis and prognostic prediction of colorectal cancer: insights from serum exosome proteomics and single-cell transcriptomics
2026-Aug-12, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04915-z
PMID:43004430
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研究论文 | 该研究整合血清外泌体蛋白质组学与单细胞转录组学,揭示ANXA7在结直肠癌早期诊断和预后预测中的双重作用 | 采用EXODUS快速sEV分离技术与4D-DIA定量蛋白质组学,在健康对照、晚期腺瘤、早期结直肠癌和晚期结直肠癌四个序贯队列中筛选外泌体标志物;首次将外泌体蛋白质组学与单细胞转录组学结合以追溯标志物的细胞起源并构建配对诊断-预后模型;发现ANXA7⁺上皮祖细胞亚群及其通过CD8A-CEACAM5配体-受体与T细胞互作介导免疫逃逸的机制 | 摘要中未明确说明研究局限性 | 寻找能够检测癌前病变并预测患者预后的非侵入性生物标志物,并构建配对诊断-预后模型 | 健康对照、晚期腺瘤患者、早期结直肠癌患者和晚期结直肠癌患者的血清样本及公共结直肠癌单细胞转录组数据集,以及HCT116和SW480结直肠癌细胞系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | EXODUS快速sEV分离技术、4D-DIA定量蛋白质组学、蛋白质印迹、ELISA、组织免疫组化、单细胞转录组学、ROC曲线分析、CellChat分析、CCK-8和EdU功能实验、LASSO回归 | LASSO | 蛋白质组数据、单细胞转录组数据、图像、文本 | 四个序贯队列(健康对照、晚期腺瘤、早期结直肠癌、晚期结直肠癌)的血清样本,具体数量未在摘要中说明;公共结直肠癌单细胞转录组数据集;HCT116和SW480细胞系;TCGA训练队列和独立GEO验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq、蛋白质组学 | NA | NA |
| 111 | 2026-11-13 |
Keratin 17 drives endometrial cancer aggressiveness via epithelial-mesenchymal transition: a single-cell transcriptomic and integrative bioinformatics study
2026-Aug-12, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-026-06561-2
PMID:43009697
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组和整合生物信息学分析,揭示角蛋白17(KRT17)通过上皮-间质转化(EMT)驱动子宫内膜癌的侵袭性 | 首次结合单细胞转录组学与生物信息学系统阐明KRT17在子宫内膜癌恶性上皮细胞中的分布和表达谱,并通过体内外实验证实KRT17通过EMT通路促进肿瘤进展 | 摘要未明确说明具体样本量及单细胞测序平台,体内外功能实验的分子机制细节有待进一步验证 | 探究KRT17在子宫内膜癌中的表达、预后意义及功能机制 | 子宫内膜癌组织及细胞 | 数字病理学,生物信息学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析,差异表达分析,通路富集分析 | NA | 单细胞转录组数据,文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 112 | 2026-11-13 |
Impact of data quality on deep learning prediction of spatial transcriptomics from histology images
2026-Aug-11, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04236-2
PMID:43000368
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研究论文 | 研究数据和图像质量差异如何影响从组织学图像深度学习预测空间转录组基因表达的性能 | 首次系统探究空间转录组技术和图像数据质量对深度学习基因表达预测的影响,通过计算机模拟消融和拯救实验证明数据质量改进是独立于模型架构调优的正交策略 | 通过插补进行的计算机模拟拯救实验仅提供有限改进且无法在测试集外泛化 | 探究分子和图像数据质量变化对基于组织学图像深度学习预测空间基因表达性能的影响 | 空间转录组数据与H&E染色组织学图像 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学、H&E染色组织学成像 | 深度学习模型(多种模型架构) | 图像、基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 113 | 2026-11-13 |
An ICAM1⁺ inflammatory fibroblast state in atrial fibrillation and metabolic-stress-associated atrial remodeling
2026-Aug-11, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-026-00932-y
PMID:43000393
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研究论文 | 通过重新分析人类左心房单细胞RNA测序数据并结合饮食诱导肥胖小鼠模型,鉴定出一种在房颤中富集的ICAM1⁺炎症性成纤维细胞状态,并将其与炎症和基质重塑程序相关联 | 首次在房颤心房成纤维细胞异质性中鉴定出ICAM1⁺炎症性成纤维细胞状态,该状态在窦性心律样本中未检出,并揭示了ICAM1与TNXB相关基质蛋白表达及成纤维细胞迁移的关联 | 研究主要为关联性分析,缺乏成纤维细胞特异性及临床注释研究来明确因果关系和转化意义;动物模型样本量较小 | 探究连接房颤炎症与纤维化心房重塑的成纤维细胞状态,明确ICAM1在心房成纤维细胞异质性中的细胞状态背景 | 人类左心房单细胞RNA测序数据、饮食诱导肥胖小鼠、原代人类心脏成纤维细胞 | 数字病理学, 单细胞组学 | 心血管疾病, 房颤, 肥胖代谢应激 | 单细胞RNA测序, RNA荧光原位杂交, 轨迹推断, 通路富集分析, 共表达网络分析, 慢病毒过表达, 基因敲低 | NA | 单细胞转录组数据, 图像, 文本 | 人类左心房scRNA-seq数据集;饮食诱导肥胖小鼠8只 vs 正常饮食对照8只;原代人类心脏成纤维细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 114 | 2026-11-13 |
JUND-DNAJB1-p21 axis drives fibroblast senescence to recruit CD4⁺ T cells in salivary gland pathogenesis of Sjögren's disease
2026-Aug-11, Immunity & ageing : I & A
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12979-026-00590-8
PMID:43000445
|
研究论文 | 该研究揭示JUND-DNAJB1-p21轴驱动唾液腺成纤维细胞衰老,进而招募CD4⁺ T细胞参与原发性干燥综合征的发病机制 | 首次鉴定出DNAJB1高表达的衰老成纤维细胞亚群,并阐明IFN-γ通过JUND上调DNAJB1、经p21介导衰老及CD4⁺ T细胞招募的JUND-DNAJB1-p21分子轴,同时验证senolytic药物组合的治疗潜力 | 机制验证主要依赖NOD小鼠模型和体外实验,缺乏更大规模人类队列验证;senolytic治疗的长期安全性和临床转化效果尚未评估 | 探究原发性干燥综合征中成纤维细胞衰老的机制及其治疗潜力 | 原发性干燥综合征患者唾液腺组织、原代唾液腺成纤维细胞(SGFs)、非肥胖糖尿病(NOD)小鼠 | 数字病理学 | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序、免疫组化、多重免疫荧光、轨迹推断、基因调控网络推断、衰老相关β-半乳糖苷酶染色、活性氧检测、siRNA敲低、免疫共沉淀、双荧光素酶报告基因、transwell迁移实验 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 115 | 2026-11-13 |
Single-cell immune landscape of cerebrospinal fluid in non-HIV cryptococcal meningitis
2026-Aug-10, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-05142-x
PMID:43000315
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和TCR测序描绘了非HIV隐球菌脑膜炎患者脑脊液的免疫图谱 | 首次在单细胞水平揭示未治疗隐球菌脑膜炎患者脑脊液中代谢高度活化的Macrophages_MRC1和耗竭型CD4+ Temra_KLRB1细胞的扩增,并发现CCL3/4-CCR5信号通路可能是隐球菌特异性免疫反应的关键机制 | 样本量较小,仅纳入5例配对治疗前后患者和8例非中枢神经系统炎症疾病对照,未对CCR5信号通路进行功能验证 | 探究隐球菌脑膜炎疾病严重程度与宿主免疫反应之间的复杂关系,特别是驱动疾病进展的免疫反应机制 | 非HIV隐球菌脑膜炎患者的脑脊液样本 | 单细胞免疫学 | 隐球菌脑膜炎 | 单细胞RNA测序, TCR测序 | NA | 单细胞转录组数据, TCR序列数据 | 5例配对未治疗和治疗后隐球菌脑膜炎患者及8例非中枢神经系统炎症疾病对照的脑脊液样本 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq, single-cell TCR-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞5'转录组和TCR测序 |
| 116 | 2026-11-13 |
Agrimoniin combines with erlotinib to inhibit the proliferation of pancreatic cancer cells by suppressing signal interactions in the tumor microenvironment and disrupting two positive feedback loops involving lactic acid production
2026-Aug-10, Cellular & molecular biology letters
IF:9.2Q1
DOI:10.1186/s11658-026-01000-z
PMID:43009796
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研究论文 | 该研究探讨了仙鹤草素与厄洛替尼联合抑制胰腺癌细胞增殖的作用机制,包括抑制肿瘤微环境中的信号相互作用和破坏涉及乳酸产生的两个正反馈环路 | 提出了PI3K/AKT/HIF-1α/HK2和MEK/ERK/HIF-1α/HK2信号通路与乳酸产生之间的两个新型正反馈环路,并揭示了仙鹤草素作为厄洛替尼增敏剂或耐药逆转剂的潜力 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探索仙鹤草素与厄洛替尼联合治疗胰腺癌的协同效应及其对肿瘤微环境和有氧糖酵解的调控机制 | 胰腺癌细胞及皮下移植瘤模型 | 肿瘤生物学、药物组合治疗 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、生物信息学分析、Western blot、乳酸检测、信号通路抑制剂/激动剂实验 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质表达数据、代谢物定量数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 117 | 2026-11-13 |
An integrated bioinformatics analysis reveals that targeted activation of IL7R may reduce influenza A virus infection risk in patients with depression
2026-Aug-08, Virology journal
IF:4.0Q2
DOI:10.1186/s12985-026-03272-5
PMID:43004330
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研究论文 | 该文通过整合生物信息学分析、孟德尔随机化、单细胞测序和分子对接等方法,揭示抑郁症增加甲型流感病毒感染风险的机制,并发现IL7R是关键靶点及 sanguinarine 为潜在治疗化合物 | 首次通过整合多组学与计算生物学方法揭示IL7R作为抑郁症合并甲型流感感染的关键基因,并筛选出sanguinarine作为靶向IL7R的潜在化合物,结合虚拟敲除与分子动力学模拟验证 | 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证和临床样本的直接证据,且sanguinarine的疗效和安全性需进一步实验确认 | 探究抑郁症与甲型流感病毒感染易感性之间的因果关系及分子机制,并筛选潜在治疗靶点和化合物 | 抑郁症患者、甲型流感病毒感染相关的基因表达数据集、IAV感染的Jurkat T细胞 | 生物信息学、机器学习 | 抑郁症、流感 | 孟德尔随机化分析、差异表达基因分析、蛋白互作分析、GO和KEGG富集分析、ROC曲线分析、免疫浸润分析、单细胞RNA测序、虚拟敲除模拟、分子对接、分子动力学模拟、体外实验 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 118 | 2026-11-13 |
FABP5 regulates an immunosuppressive microenvironment in hepatocellular carcinoma through the NF-κB/PD-L1 axis
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0356359
PMID:42809798
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研究论文 | 该文探讨FABP5通过NF-κB/PD-L1轴调控肝细胞癌免疫抑制微环境的机制,并筛选靶向FABP5的潜在化合物 | 首次系统揭示FABP5通过NF-κB/PD-L1轴驱动肝细胞癌免疫抑制微环境,并结合单细胞分析、分子对接、分子动力学模拟和药物筛选鉴定CZS-241为潜在FABP5靶向化合物 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内动物模型验证和临床样本验证 | 阐明FABP5在肝细胞癌肿瘤免疫微环境中的调控作用及其分子机制,并筛选靶向FABP5的治疗化合物 | 肝细胞癌细胞及肝细胞癌公共数据集(TCGA、CCLE、单细胞RNA-seq数据) | 肿瘤免疫学、生物信息学 | 肝癌 | bulk RNA-seq、single-cell RNA-seq、分子对接、分子动力学模拟、药物筛选、体外实验 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据、文本 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 119 | 2026-11-13 |
Seeing Chemistry in Context: Mass Spectrometry Imaging for Biomedical Research and Multi-Omic Integration
2026, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-032-29437-1_7
PMID:42907627
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综述 | 本章综述了质谱成像(MSI)的基本原理、实验设计、样本制备及多组学整合策略,并展示了其在生物医学研究中的应用 | 强调MSI提供其他空间方法无法获取的组学信息,并系统讨论如何将MSI与bulk分析和空间转录组学等多组学层进行整合 | 作为综述章节,未提供原始实验数据,且仅涵盖部分电离方法 | 介绍MSI实验基础、设计思路与样本制备,并探讨多组学整合在机制生物学和转化研究中的应用 | 质谱成像实验及其在生物医学研究中的多组学整合应用 | 空间多组学 | NA | 质谱成像,MALDI MSI,空间转录组学 | NA | 图像,质谱数据,组学数据 | NA | NA | 质谱成像,空间转录组学,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 120 | 2026-11-13 |
Viruses in the tumor immune microenvironment: implications for immunotherapy
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1958538
PMID:42985438
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综述 | 系统综述病毒与肿瘤免疫微环境(TIME)的相互作用及其对免疫治疗的影响 | 整合单细胞组学、空间转录组学和临床研究的最新进展,系统阐明病毒-TIME相互作用的核心机制,并强调病毒相关抗原作为免疫靶点及病毒诱导免疫逃逸的机制 | 作为综述文章,未提供原始实验数据,缺乏对具体机制的定量验证 | 阐明病毒感染如何通过改变肿瘤浸润淋巴细胞、细胞因子谱和免疫检查点表达来影响TIME,并探讨病毒相关抗原的免疫靶点作用及病毒诱导免疫逃逸机制 | 病毒感染与肿瘤免疫微环境的相互作用 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞组学,空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞组学,空间转录组学 | NA | NA |