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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-02-22 |
The clinical significance of the Mediterranean fever gene MEFV variants in Castleman disease
2026-Jan-29, Communications medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1038/s43856-026-01392-1
PMID:41611845
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研究论文 | 本研究探讨了地中海热基因MEFV变异在Castleman病(CD)中的临床意义,特别是在iMCD-TAFRO亚型中的作用 | 首次在较大队列中揭示MEFV变异在CD中的高流行率,并通过体外实验和单细胞RNA测序阐明了MEFV表达与IL-6通路激活的关联 | 样本量较小(37例患者),且为回顾性研究,可能限制结果的普遍性 | 阐明MEFV基因变异在Castleman病发病机制中的作用,特别是对iMCD-TAFRO亚型的影响 | Castleman病患者(包括iMCD-TAFRO亚型)及其血液/淋巴结活检样本 | 单细胞组学 | Castleman病 | 全外显子测序, 单细胞RNA测序, 定量PCR, Luminex细胞因子检测 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 临床数据 | 37例CD患者,包括一名青少年TAFRO患者及其无症状父母和健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 102 | 2026-02-22 |
MicroRNAs as potential prognostic biomarkers in acute lymphoblastic leukemia: a systematic review, meta-analysis, and bioinformatics study
2026-Jan-29, Systematic reviews
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s13643-026-03083-3
PMID:41612480
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系统综述与荟萃分析 | 本文通过系统综述、荟萃分析和生物信息学方法,评估了microRNAs作为急性淋巴细胞白血病预后生物标志物的潜力 | 结合了系统综述、荟萃分析、ceRNA网络构建和单细胞RNA测序分析,全面评估miRNA在ALL中的预后价值及其调控机制 | 需要大型多中心试验进一步确认miRNA的预后作用,现有研究样本量和异质性可能存在限制 | 评估microRNAs作为急性淋巴细胞白血病预后生物标志物的有效性,并探索其调控机制 | 急性淋巴细胞白血病患者,涉及1974名患者的数据 | 生物信息学 | 急性淋巴细胞白血病 | 系统综述、荟萃分析、ceRNA网络分析、单细胞RNA测序 | NA | 文献数据、基因表达数据 | 22项研究,共1974名患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 103 | 2026-02-22 |
Substantial unannotated noncoding transcripts in tumors may transcriptionally regulate cancer-related genes
2026-Jan-28, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-026-02524-8
PMID:41606598
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研究论文 | 本研究通过泛癌分析识别未注释的非编码转录本(UNTs),并利用CRISPR/Cas9技术验证其在肿瘤中转录调控基因的潜在功能 | 首次系统性地在多种肿瘤中识别未注释的非编码转录本,并通过实验验证其通过DNA结合域直接调控基因转录的机制 | 研究仅针对三种特定UNTs进行功能验证,未涵盖所有已识别的UNTs,且机制探索可能受限于现有预测方法 | 探究肿瘤中未注释非编码转录本的转录调控功能及其在癌症中的特异性作用 | 四种肿瘤的细胞系和组织样本,包括两种癌细胞系(用于CRISPR/Cas9实验) | 生物信息学 | 癌症 | RNA-seq, scRNA-seq, CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | 转录组数据 | 未明确指定具体样本数量,但包括四种肿瘤的细胞系和组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 104 | 2026-02-22 |
stGCL: a versatile cross-modality fusion method based on multi-modal graph contrastive learning for spatial transcriptomics
2026-Jan-28, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03896-w
PMID:41606649
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 105 | 2026-02-22 |
Machine learning identifies disulfidptosis-related gene signature for pancreatic cancer prognosis and immune infiltration
2026-Jan-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04463-w
PMID:41591656
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研究论文 | 本研究通过生物信息学和单细胞分析,探索了与胰腺癌预后和免疫浸润相关的二硫死亡相关基因特征 | 首次将新型细胞死亡方式——二硫死亡相关基因特征应用于胰腺癌预后模型的构建,并结合单细胞RNA测序揭示了关键基因在肿瘤微环境中的表达模式 | 外部验证集的模型性能中等(C-index=0.6),表明模型有待进一步优化 | 识别胰腺癌的预后生物标志物和免疫浸润模式 | 胰腺癌患者 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | 随机生存森林,StepCox | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 106 | 2026-02-22 |
Exploring the key molecular mechanisms and immune microenvironment of oxidative stress-related pathways in pancreatic neuroendocrine tumor combining scRNA-seq and bulk RNA
2026-Jan-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04515-1
PMID:41591671
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,系统探索了氧化应激相关通路在胰腺神经内分泌肿瘤中的关键分子机制和免疫微环境 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据,系统阐明氧化应激通路通过BCL2L1和PHGDH等关键基因调控pNET进展的分子机制和免疫微环境相互作用 | 研究主要基于公共数据集的分析,缺乏实验验证;单细胞数据样本量相对有限(20个样本) | 阐明氧化应激相关通路如何驱动胰腺神经内分泌肿瘤进展的分子机制及其与肿瘤微环境的相互作用 | 胰腺神经内分泌肿瘤(pNET)样本 | 生物信息学 | 胰腺神经内分泌肿瘤 | scRNA-seq, bulk RNA-seq, 差异表达分析, WGCNA, GO/KEGG富集分析, PPI网络, CIBERSORTx免疫浸润分析, ceRNA网络构建, 转录因子预测, 药物预测, 分子对接 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA), 蛋白质-蛋白质相互作用网络, 预后列线图模型, ROC分析 | 基因表达数据(RNA-seq) | 批量RNA-seq数据集GSE73338包含63个pNET样本和5个对照样本;单细胞RNA-seq数据集GSE256136包含20个样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 107 | 2026-02-22 |
Unveiling the early defense response dynamics in grapevines against Plasmopara viticola by single-cell transcriptomics
2026-Jan-27, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03904-z
PMID:41593733
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间RNA测序技术,首次构建了葡萄叶片在霜霉病菌感染期间的单细胞转录组图谱,揭示了植物细胞在感染早期的动态防御响应 | 首次在单细胞水平上解析葡萄对霜霉病菌感染的防御响应,结合scRNA-seq和spRNA-seq技术,发现了保卫细胞转录组被病原体重编程以促进入侵的新机制 | 研究主要关注早期感染阶段,可能未覆盖整个感染过程的动态变化;样本数量虽大,但仅针对特定葡萄品种和感染条件 | 揭示葡萄在单细胞水平上对霜霉病菌感染的早期防御响应动态 | 葡萄叶片细胞在Plasmopara viticola感染下的转录组变化 | 数字病理学 | 植物病害 | 单细胞RNA测序, 空间RNA测序 | NA | 转录组数据 | 约100,000个单个细胞(约89,000个来自scRNA-seq,约11,000个来自spRNA-seq) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 108 | 2026-02-22 |
SCITO-seq2: ultra-high-throughput single-cell transcriptome and epitope sequencing
2026-Jan-27, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-03954-x
PMID:41593779
|
研究论文 | 本文介绍了SCITO-seq2,一种增强型单细胞转录组和表位测序平台,能够同时量化超过10万个细胞的转录本和表面蛋白 | SCITO-seq2整合了基于探针的RNA检测与超高通量蛋白质分析,采用共享池条形码策略确保分子谱的精确匹配,并兼容细胞哈希技术以实现高效样本多重分析 | NA | 开发一个可扩展、简化且成本效益高的下一代单细胞多组学工作流程 | 自身免疫性疾病,包括儿童系统性红斑狼疮和CTLA4单倍体不足伴自身免疫浸润 | 单细胞测序 | 自身免疫性疾病 | 单细胞转录组测序,表位测序 | NA | RNA序列数据,蛋白质表达数据 | 超过100,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞多组学 | SCITO-seq2 | 整合探针RNA检测与超高通量蛋白质分析,采用共享池条形码策略和细胞哈希技术 |
| 109 | 2026-02-22 |
Deciphering stromal cell interactions in osteosarcoma highlights CDKN2A and MMP14 as novel diagnostic and therapeutic biomarkers
2026-Jan-27, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-026-03902-2
PMID:41593799
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和转录组分析,揭示了骨肉瘤中基质细胞网络,并识别了CDKN2A和MMP14作为新型诊断标志物和治疗靶点 | 首次结合单细胞RNA测序和转录组数据集,利用hdWGCNA分析基质细胞基因模块,并识别出CDKN2A和MMP14作为骨肉瘤的潜在生物标志物,同时通过分子对接验证了白藜芦醇作为MMP14的候选治疗分子 | 研究主要基于公共数据库(GEO)数据,缺乏大规模临床样本验证,且功能实验仅限于骨肉瘤细胞系,未涉及体内模型 | 解析骨肉瘤中基质细胞相互作用网络,识别新的诊断标志物和治疗靶点 | 骨肉瘤(OS)及其基质微环境中的细胞亚群,包括巨噬细胞、基质细胞、T细胞等 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq)、转录组分析、WGCNA、DESeq2差异表达分析、分子对接 | Seurat、CellChat、hdWGCNA | 单细胞转录组数据、转录组数据集 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 110 | 2026-02-22 |
KIF5B-driven unfolded protein response reprograms breast cancer immunosuppressive microenvironment for single-cell guided therapeutic targeting
2026-Jan-26, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04526-y
PMID:41587002
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA-seq数据,揭示了KIF5B在乳腺癌中作为预后生物标志物和治疗靶点的作用,并探讨了其对肿瘤免疫微环境的影响 | 首次通过多模态数据分析,将KIF5B与未折叠蛋白反应、免疫浸润和药物敏感性联系起来,为乳腺癌的精准治疗提供了新见解 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;数据来源于多个数据集,可能存在批次效应 | 探究KIF5B在乳腺癌预后、肿瘤微环境和治疗反应中的综合作用 | 乳腺癌患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | hdWGCNA, 共识聚类 | RNA-seq数据 | 多个数据集的样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 111 | 2026-02-22 |
Exosome RAB10 inhibits JAK1/STAT1 to hinder macrophage M1 polarization and promote tumor immune escape
2026-Jan-26, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-026-02681-x
PMID:41588435
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研究论文 | 本研究揭示了乳腺癌细胞通过外泌体递送RAB10蛋白,抑制巨噬细胞M1极化并促进其M2极化,从而促进肿瘤免疫逃逸的机制 | 首次发现外泌体RAB10通过与干扰素受体IFNAR1结合,抑制JAK1/STAT1通路磷酸化,从而调控巨噬细胞极化,并证明联合靶向RAB10和PD-L1具有协同抗肿瘤效应 | 研究主要基于乳腺癌模型,其他肿瘤类型中的普适性有待验证;临床样本验证相对有限 | 探究外泌体RAB10在调控巨噬细胞极化及肿瘤免疫逃逸中的作用机制 | 乳腺癌细胞、巨噬细胞、肿瘤微环境、CD8⁺ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、体外实验、动物模型 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 112 | 2026-02-22 |
SAMSN1 restrains NK cell mediated anti-tumor immunity in hepatocellular carcinoma
2026-Jan-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68661-4
PMID:41565668
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研究论文 | 本文发现SAMSN1作为肝癌中NK细胞功能的新型免疫检查点,抑制其活性并影响抗肿瘤免疫 | 首次识别SAMSN1为肝癌中NK细胞功能的关键调节因子,并证明其特异性缺失可增强抗肿瘤免疫 | 研究主要基于小鼠模型和单细胞测序数据,人类样本验证和临床转化仍需进一步探索 | 探究SAMSN1在肝癌微环境中对NK细胞功能的调控机制及其作为免疫治疗靶点的潜力 | 肝癌患者样本、小鼠肝癌模型(Hepa1-6)及NK细胞 | 免疫学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 肝癌患者样本及小鼠模型,具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 113 | 2026-02-22 |
Intermittent fasting inhibits Tp53-driven glioma through gut microbiota-mediated methionine-m6A regulation
2026-Jan-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68512-2
PMID:41559043
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研究论文 | 本研究揭示了间歇性禁食(IF)通过肠道菌群介导的甲硫氨酸-m6A调控途径抑制Tp53驱动型胶质瘤的分子机制 | 首次发现IF的抗肿瘤效果与胶质母细胞瘤(GBM)亚型(Tp53型 vs CDKN2A型)相关,并通过多组学技术系统阐明了肠道菌群-甲硫氨酸-m6A修饰-TGF-β信号轴在其中的作用机制 | 研究主要基于小鼠模型,人体临床验证尚需开展;对CDKN2A亚型GBM中IF效果不显著的机制未深入探讨 | 探究间歇性禁食抑制胶质母细胞瘤的亚型特异性机制 | Tp53驱动型和Cdkn2a驱动型胶质母细胞瘤小鼠模型 | 肿瘤生物学 | 胶质母细胞瘤 | 多组学测序(空间转录组、空间代谢组、单细胞转录组、单细胞RNA甲基化、代谢组、微生物组) | 小鼠肿瘤模型 | 多组学数据 | 未明确说明 | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学, 单细胞转录组学, 单细胞RNA甲基化, 代谢组学, 微生物组学 | NA | NA |
| 114 | 2026-02-22 |
Single-cell transcriptomics reveals diversity and conservation of chicken lymphocytes
2026-Jan-18, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2026.106475
PMID:41719991
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研究论文 | 本研究构建了鸡三个主要免疫器官的高分辨率单细胞转录组图谱,揭示了鸡淋巴细胞的多样性和保守性 | 首次构建了鸡免疫器官的单细胞转录组图谱,识别了24种免疫和基质细胞类型,并揭示了性二态性免疫成熟和跨物种保守的免疫调控回路 | 研究仅基于三个主要免疫器官,可能未覆盖所有免疫细胞类型;样本量有限,需进一步验证 | 旨在全面解析鸡免疫系统的细胞组成和功能,为禽类免疫防御、抗病育种和脊椎动物免疫进化提供基础框架 | 家鸡(Gallus gallus)的三个主要免疫器官:胸腺、法氏囊和脾脏 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三个主要免疫器官的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 115 | 2026-02-22 |
Robust and interpretable prediction of gene markers and cell types from spatial transcriptomics data
2026-Jan-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68487-0
PMID:41545411
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研究论文 | 本文介绍了一个名为STimage的综合模型套件,用于直接从标准H&E图像预测空间基因表达和分类细胞类型 | 通过估计基因表达分布并使用集成方法量化数据驱动和模型不确定性,增强了模型的鲁棒性;通过单细胞分辨率的归因分析结合组织病理学注释、功能基因和潜在表示,提高了可解释性 | NA | 提高空间转录组学数据中基因标记和细胞类型预测的鲁棒性和可解释性 | 空间转录组学数据中的基因表达和细胞类型 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 深度学习模型,集成方法 | 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 116 | 2026-02-22 |
huSA: a comprehensive database for multi-dimensional resolution of bulk, single cell and spatial transcription profiles in skin diseases
2026-Jan-15, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baag009
PMID:41719583
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研究论文 | 本文介绍了人类皮肤图谱(huSA)数据库的构建,该数据库整合了多种皮肤疾病的转录组数据,包括单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序数据,以支持系统性的皮肤疾病研究 | 开发了一个全面、集成且用户友好的皮肤转录组数据图谱,首次整合了17种皮肤疾病的多种转录组数据类型,并提供标准化分析和交互式可视化工具 | 数据库可能受限于现有数据的质量和覆盖范围,且分析流程的标准化可能无法完全适应所有新兴技术或疾病类型 | 构建一个综合性的皮肤转录组数据库,以促进皮肤疾病的分子机制研究和转化医学应用 | 皮肤疾病相关的转录组数据,包括单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序样本 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学、批量RNA测序(bulk RNA-seq) | NA | 转录组数据 | 1,434个scRNA-seq样本、63个空间转录组学样本、1,502个批量RNA-seq样本,总计来自63个独立数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 117 | 2026-02-22 |
Electrocorticographic, astrocytic and transcriptomic signatures in the triple transgenic mouse model of Alzheimer's disease submitted to stearoyl-CoA desaturase inhibition
2026-Jan-13, Neuropharmacology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.neuropharm.2026.110835
PMID:41539386
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研究论文 | 本研究探讨了在阿尔茨海默病三重转基因小鼠模型中,抑制硬脂酰辅酶A去饱和酶对睡眠、脑电图活动、星形胶质细胞功能、脂质代谢及转录组的影响 | 首次在3xTg-AD小鼠模型中,结合脑电图记录、星形胶质细胞标记、脂滴染色和空间转录组学,系统评估SCD抑制对睡眠障碍、神经电活动、细胞病理及基因表达的多维度影响 | 研究仅使用雌性小鼠,未涵盖性别差异;SCD抑制未能恢复3xTg-AD小鼠的睡眠时间异常,表明睡眠障碍可能涉及更复杂的机制 | 探究SCD抑制是否能够改善阿尔茨海默病模型小鼠的睡眠障碍,并分析其与脂质代谢、星形胶质细胞功能及转录组变化的关系 | 野生型和3xTg-AD雌性小鼠 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 脑电图记录、免疫组织化学染色、空间转录组学 | NA | 电生理信号、图像、转录组数据 | 野生型和3xTg-AD雌性小鼠,具体数量未明确说明 | NA | NA | NA | NA |
| 118 | 2026-02-22 |
Biologically interpretable deep learning-derived MRI phenotypes reveal lymph node involvement and neoadjuvant therapy response in intrahepatic cholangiocarcinoma
2026-Jan-12, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001671
PMID:41525512
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研究论文 | 本研究开发了一个名为SwinU-CliRad的深度学习模型,用于对肝内胆管癌的淋巴结受累风险进行分层,并评估其对新辅助治疗反应的预测能力 | 整合了基于Swin UNETR的MRI衍生输出与临床放射学特征,构建了可解释的深度学习模型,并探索了模型输出与肿瘤多组学特征的相关性 | 研究涉及多个队列,但外部验证队列样本量相对较小(n=88),且模型性能仍需在更广泛的多中心数据中进一步验证 | 开发一个模型以改进肝内胆管癌的淋巴结受累分层,并为治疗决策提供信息 | 肝内胆管癌患者 | 计算机视觉 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序,多组学分析 | Swin UNETR,SwinU-CliRad框架 | 磁共振成像,临床放射学特征 | 发现队列682例,内部测试队列204例,外部多中心队列88例,新辅助治疗队列145例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 119 | 2026-01-14 |
Decoding the tumor microenvironment remodeling orchestrated by CLEC3B+ inflammatory cancer-associated fibroblasts in lung adenocarcinoma immunotherapy: elucidation from pan-cancer spatially single-cell transcriptomics landscape
2026-Jan-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07677-2
PMID:41526921
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 120 | 2026-02-22 |
Single-cell multimodal analysis reveals the dynamic immunopathogenesis of HBV-ACLF progression
2026-Jan-08, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-333308
PMID:40841166
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析揭示了HBV相关慢加急性肝衰竭(HBV-ACLF)进展中的动态免疫发病机制 | 首次结合单细胞RNA测序和单细胞蛋白质组学,纵向描绘了HBV-ACLF疾病过程中免疫反应的动态轨迹,并识别出与疾病进展相关的关键免疫细胞模块 | 样本量相对有限(45个样本),且主要基于外周血单核细胞,可能未完全反映肝脏局部免疫环境 | 全面描绘HBV-ACLF疾病过程中免疫反应的动态轨迹,以揭示其免疫发病机制 | HBV相关慢加急性肝衰竭(HBV-ACLF)患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序, 单细胞蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 | 45个样本(来自17名住院患者和15名对照受试者) | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |