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当前共找到 38241 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-04-11 |
TWIST1-Mediated Induction of AEBP1 in Fibroblast-Like Synoviocytes Activates Transforming Growth Factor β Signaling to Drive Angiogenesis and Promote Rheumatoid Arthritis
2026-Mar-05, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70124
PMID:41787682
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据，揭示了在类风湿关节炎中，位于滑膜下层的POSTN+成纤维样滑膜细胞亚群通过TWIST1-AEBP1-POSTN轴驱动疾病进展的机制 | 识别了致病性POSTN+ FLS亚群，并阐明了TWIST1-AEBP1-POSTN轴在调控该亚群激活、细胞外基质重塑和血管生成中的关键作用 | 研究主要基于小鼠胶原诱导性关节炎模型，人类样本的验证可能有限，且药理抑制TWIST1的长期效果和安全性需进一步评估 | 旨在识别导致滑膜增生、ECM重塑和血管翳形成的致病性FLS亚群，阐明其分子调控机制，并探索靶向治疗策略 | 类风湿关节炎患者的滑膜组织、成纤维样滑膜细胞以及胶原诱导性关节炎小鼠模型 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | bulk RNA测序、蛋白质组学、单细胞转录组学 | NA | RNA测序数据、蛋白质组数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 102 | 2026-04-11 |
iAODE for benchmarking and continuum modeling of single-cell chromatin accessibility
2026-Mar-03, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09768-8
PMID:41775921
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研究论文 | 本文介绍了一种名为iAODE的变分自编码器，用于单细胞染色质可及性数据的基准测试和连续建模 | iAODE结合了零膨胀负二项似然、潜在神经ODE、低权重KL正则化和可解释重构瓶颈，以学习生成性、时间连续的潜在空间 | NA | 开发一种用于单细胞染色质可及性数据连续建模和基准测试的方法 | 单细胞染色质可及性数据和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | scATAC-seq, scRNA-seq | 变分自编码器, 神经ODE | 单细胞测序数据 | 248个scATAC-seq数据集和123个scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 103 | 2026-04-11 |
Pharmacological stabilization of hypoxia-inducible factor 1-α dampens the interferon response and promotes glycolysis in Aicardi-Goutières syndrome
2026-Mar-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69979-9
PMID:41776196
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和靶向代谢组学分析Aicardi-Goutières综合征（AGS）患者外周血样本，发现单核细胞和树突状细胞中HIF-1α表达和活性降低导致代谢转向氧化磷酸化，并通过药物稳定HIF-1α逆转代谢异常并减轻干扰素反应 | 首次在AGS患者免疫细胞中发现HIF-1α介导的代谢转换现象，并提出通过药物稳定HIF-1α作为潜在治疗策略 | 研究主要基于体外细胞模型，需要进一步体内实验验证；样本量相对有限 | 探究AGS疾病中代谢异常与慢性炎症的关联机制，并寻找潜在治疗靶点 | 携带ADAR1、RNASEH2B或SAMHD1基因突变的Aicardi-Goutières综合征患者外周血样本 | 单细胞组学 | 遗传性自身免疫疾病 | 单细胞转录组学、靶向代谢组学、机器学习、差异基因表达分析 | 机器学习方法 | 单细胞转录组数据、代谢组数据 | AGS患者外周血样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 104 | 2026-04-11 |
Single cell and multi-omics analysis reveal senescence-related molecular subtypes and a prognostic signature in clear cell renal cell carcinoma
2026-Mar-02, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04674-1
PMID:41770477
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据，揭示了透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中细胞衰老相关的分子亚型，并构建了一个基于衰老相关基因的预后风险评分模型 | 首次在ccRCC中系统地表征了细胞衰老特征，定义了两种基于衰老相关基因表达的分子亚型，并识别了ALDH18A1作为一个关键的预后生物标志物和潜在治疗靶点 | 研究主要基于转录组数据，需要进一步的实验验证来阐明衰老相关基因在ccRCC中的具体分子机制 | 阐明细胞衰老在ccRCC中的特征、临床意义及预后价值 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）患者组织样本 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量转录组测序 | 随机生存森林（RSF） | 转录组数据 | 多个队列总计超过700个样本（包括TCGA-KIRC 537例，E-MTAB-1980 101例，CPTAC-ccRCC 105例，以及单细胞数据集GSE222703和GSE210042） | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 105 | 2026-04-11 |
Epitope-spanning antigenic variation reprograms immunodominance and broadens immunity in sequential influenza vaccination
2026-Mar-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70202-y
PMID:41771913
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研究论文 | 本研究通过靶向改变流感疫苗血凝素头部多个位点，重塑了免疫优势表位层次，从而拓宽了免疫应答的广度与保护效果 | 提出“表位层次重塑”新概念，证明通过靶向抗原变异可重编程免疫记忆，将回忆应答导向保守表位 | 研究基于雪貂模型，人类免疫系统的实际反应可能存在差异；未评估长期免疫持久性 | 克服流感疫苗接种中免疫印记对保护广度和持久性的限制 | A(H3N2)流感病毒血凝素蛋白的免疫表位 | 免疫学 | 流感 | 单细胞转录组测序、ELISpot检测、表位作图、结构分析 | 雪貂动物模型 | 转录组数据、免疫学检测数据、结构生物学数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 106 | 2026-04-11 |
M[Formula: see text]DGAT: Multi-view multi-scale dynamic graph attention network(GAT) based prediction of Parkinson's disease(PD) progression using whole-blood RNA sequencing data
2026-Mar-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-40636-x
PMID:41771960
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研究论文 | 本研究提出了一种基于全血RNA测序数据的多视图多尺度动态图注意力网络（M[Formula: see text]DGAT），用于预测帕金森病（PD）的进展轨迹 | 结合多视图（时空视图）和多尺度结构，利用动态图注意力网络（DGAT）和计数草图双线性（CSB）融合策略，从全血RNA测序数据中构建联合视图表示，以预测疾病阶段和认知评分 | 仅基于全血RNA测序数据，可能未充分利用其他生物标志物或临床信息；方法在复杂人脑疾病分析中的泛化能力有待进一步验证 | 预测帕金森病（PD）等神经退行性疾病的进展轨迹 | 帕金森病患者 | 机器学习 | 帕金森病 | RNA测序 | 动态图注意力网络（DGAT） | RNA测序数据 | PPMI和PDBP队列数据（具体样本数未明确） | NA | 全血RNA测序 | NA | NA |
| 107 | 2026-04-11 |
Computational framework for therapeutic target discovery via perturbation simulation: application to cystic fibrosis airway disease
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag129
PMID:41883030
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研究论文 | 提出一个整合单细胞转录组学、加权基因共表达网络分析和计算扰动模拟的计算框架，用于系统发现新的治疗靶点，并以囊性纤维化气道疾病为例进行应用 | 开发了一个结合多尺度生物数据和系统级扰动模拟的新型计算框架，能够高效、系统地发现高新颖性治疗靶点 | 未在论文摘要中明确说明 | 开发一个用于系统级治疗靶点发现的计算方法 | 囊性纤维化气道疾病 | 计算生物学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序，加权基因共表达网络分析，计算扰动模拟 | 知识图谱，扰动模拟算法 | 单细胞转录组数据 | 38名患者的51,415个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 108 | 2026-04-11 |
BEASTsim-a benchmarking and analysis platform for spatial transcriptomics simulations
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag144
PMID:41947420
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为BEASTsim的综合性基准测试平台，用于评估空间转录组学模拟方法 | BEASTsim平台不仅评估模拟方法在数据属性分布和生物信号保留方面的表现，还通过相似性指标确保模拟引入有意义的生物变异，而非简单复制输入数据 | NA | 开发一个基准测试和分析平台，以标准化评估空间转录组学模拟方法，促进空间转录组学与单细胞RNA测序数据的整合 | 空间转录组学模拟方法 | 计算生物学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 决策树 | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 109 | 2026-04-11 |
Therapeutic strategy for cervical gastric-type adenocarcinoma by targeting CLU to relieve CLU-associated stress and sensitize chemotherapy
2026-Mar, Precision clinical medicine
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/pcmedi/pbag003
PMID:41878236
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研究论文 | 本研究探索了宫颈胃型腺癌的致癌机制，并验证了靶向CLU联合化疗的治疗策略 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了CLU相关热应激在GAS恶性微环境中的作用，并构建了GAS来源的类器官模型用于药物测试 | 样本量较小（单细胞测序仅5例样本），且类器官模型仍需进一步验证其临床相关性 | 探索宫颈胃型腺癌的致癌机制并寻找有效治疗靶点 | 宫颈非HPV相关腺癌患者组织样本及GAS来源的类器官 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序，T细胞受体测序，免疫组化染色 | 类器官模型 | 单细胞转录组数据，组织图像数据 | 临床队列172例患者，单细胞测序5例，免疫组化50例，类器官实验未明确数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 110 | 2026-04-11 |
SpaJoint: a transfer learning method for spatial transcriptomics deconvolution
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag158
PMID:41955028
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研究论文 | 本文提出了一种基于迁移学习的空间转录组学去卷积方法SpaJoint，用于预测空间点的细胞类型组成和识别细胞类型的空间区域 | SpaJoint方法整合了单细胞RNA测序和空间转录组学的基因表达数据，并考虑了不同点之间的空间相关性，在计算效率和超参数鲁棒性方面具有显著优势 | NA | 解决空间转录组学技术中单细胞分辨率不足的问题，解析组织中不同细胞类型的空间分布 | 空间转录组学数据和单细胞RNA测序数据 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 迁移学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 111 | 2026-04-11 |
Role of CTGF-LRP1 in impaired healing of cesarean section incisions
2026-Feb-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69747-9
PMID:41764198
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了剖宫产切口愈合不良（niche）的细胞微环境，揭示了成纤维细胞中LRP1缺陷导致细胞外基质合成减少的机制 | 首次在单细胞分辨率下描绘了剖宫产切口愈合不良的细胞图谱，并确定了成纤维细胞亚群中LRP1缺陷是导致愈合障碍的关键因素 | 样本量相对有限，且动物模型与人类病理可能存在差异 | 探究剖宫产切口愈合不良（niche）的分子机制和细胞基础 | 剖宫产术后患者的子宫肌层组织（包括切口愈合不良组织、邻近组织及愈合良好组织） | 数字病理学 | 产科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 135,793个单细胞（来自48,587个邻近组织细胞、47,653个愈合良好组织细胞、39,553个愈合不良组织细胞） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 112 | 2026-04-11 |
Sinusoidal cell-derived biomarker scores predict diagnosis and prognosis in chronic liver disease
2026-Feb-28, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-04733-y
PMID:41764477
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研究论文 | 本研究开发了基于肝窦细胞特异性基因特征的生物标志物评分，用于慢性肝病的诊断和预后预测 | 首次整合肝窦内皮细胞、肝星状细胞和巨噬细胞的单细胞转录组特征，构建了反映细胞去分化状态的综合评分系统 | 评分系统基于回顾性数据推导，需要在前瞻性研究中进一步验证 | 开发用于慢性肝病诊断和预后的肝窦细胞特异性生物标志物 | 慢性肝病患者 | 数字病理学 | 慢性肝病 | 单细胞RNA测序 | 生物标志物评分系统 | 基因表达数据 | 内部队列108例，三个独立验证队列总计1008例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 113 | 2026-04-11 |
Integrated Single-Cell Profiling Reveals Dichotomous NK Cell Populations Associated with Immunosuppression in Solid Tumors
2026-Feb-27, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-1229
PMID:41758966
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了实体瘤中NK细胞存在由IFNG或TGFB1表达驱动的二分表型和功能景观，并发现组织驻留适应性NK细胞与免疫检查点阻断反应相关 | 首次系统揭示了实体瘤中NK细胞存在由内在信号程序驱动的二分功能亚群，并发现组织驻留适应性NK细胞与免疫治疗反应和生存期延长相关 | 研究主要基于单细胞转录组数据，功能验证和机制研究仍需进一步深入 | 探究实体瘤中NK细胞异质性对免疫应答和临床结局的影响 | 实体瘤中的自然杀伤细胞 | 单细胞组学 | 实体瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 114 | 2026-04-11 |
Reconstructing single-cell resolution from spatial transcriptomics with CellRefiner
2026-Feb-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70090-2
PMID:41760664
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研究论文 | 本文介绍了一种基于物理模型的方法CellRefiner，用于从空间转录组数据中重建单细胞分辨率 | 提出了一种整合单细胞数据集与配对空间数据集的方法，通过建模细胞为粒子并优化其位置，结合空间邻近约束、基因表达相似性和配体-受体相互作用，以恢复单细胞分辨率 | 未明确提及具体局限性，但可能依赖于配对数据的质量和可用性 | 开发一种方法以从非单细胞分辨率空间数据中重建单细胞分辨率，支持下游空间依赖分析 | 空间转录组数据，包括Visium、MERFISH、seqFISH、Slide-seqV2和STARmap数据集，应用于小鼠皮层和淋巴结组织 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 物理模型 | 空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 多种模拟和真实数据集，具体样本数量未明确 | 10x Genomics, Vizgen, SeqFISH, Slide-seq, STARmap | 空间转录组学、单细胞RNA-seq | Visium, MERFISH, seqFISH, Slide-seqV2, STARmap | 包括10x Visium、MERFISH技术、seqFISH技术、Slide-seqV2平台和STARmap平台 |
| 115 | 2026-04-11 |
CD14 Plays a Critical Role in Pain and Inflammation Across Multiple Models of Post-traumatic Osteoarthritis
2026-Feb-24, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70100
PMID:41735778
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研究论文 | 本研究通过基因敲除和抗体阻断方法，探讨了CD14在多种创伤后骨关节炎模型中对疼痛和炎症的调控作用 | 首次在多种严重程度不同的创伤后骨关节炎模型中系统验证CD14抑制对滑膜炎症和疼痛的保护作用，并采用单细胞转录组学和空间蛋白质组学等新技术分析炎症机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本分析仅限于相关性研究，缺乏直接干预验证 | 验证CD14抑制能否减轻骨关节炎进展中的滑膜炎症和相关疼痛 | 人类骨关节炎滑液样本、多种创伤后骨关节炎小鼠模型（包括不同性别和肥胖因素） | 骨关节炎研究 | 骨关节炎 | 流式细胞术、单细胞转录组学、空间蛋白质组学、基因敲除、抗体阻断 | 动物疾病模型 | 蛋白质组数据、转录组数据、行为学数据、组织学数据 | 人类滑液样本及多种小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞转录组学、空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 116 | 2026-04-11 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Macaque LGN Neurons Reveals Novel Subpopulations
2026-Feb-18, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-05361-y
PMID:41703343
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研究论文 | 本研究通过分析猕猴外侧膝状体核（LGN）的单细胞转录组数据，揭示了LGN神经元中新的亚群，超越了传统的M、P、K细胞类型分类 | 利用公开数据库的单细胞转录组数据，在灵长类LGN中发现了新的神经元亚群，表明LGN处理过程比经典三细胞类型观点更为复杂 | 研究主要基于转录组数据分析，缺乏功能评估的结合，且数据来源于公开数据库，可能受限于原始实验设计 | 探索猕猴LGN神经元的异质性，以更全面地理解视觉系统的工作原理 | 猕猴外侧膝状体核（LGN）的神经元 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 117 | 2026-04-11 |
Deep-Learning Tool ScVital Enables Species-Agnostic Integration of Cancer Cell States
2026-Feb-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-4889
PMID:41223329
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研究论文 | 本研究开发了一种名为scVital的深度学习工具，用于跨物种整合单细胞RNA测序数据，以识别癌症细胞状态 | scVital利用变分自编码器和判别器将scRNA-seq数据嵌入到物种无关的潜在空间中，克服了批次效应，并开发了潜在空间相似性评分作为评估批次校正准确性的新指标 | NA | 开发一种计算工具以增强小鼠模型在癌症研究中的转化能力，通过跨物种识别保守的细胞状态 | 遗传工程小鼠模型和原发性患者样本中的癌症细胞状态 | 机器学习 | 胰腺导管腺癌, 肺腺癌, 未分化多形性肉瘤 | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 118 | 2026-04-11 |
TCRγ constant usage tunes human γδ T cell antigen sensitivity, thymic programming, and peripheral function
2026-Feb-13, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adr7167
PMID:41686911
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研究论文 | 本文揭示了人类γδ T细胞受体中γ恒定结构域如何独立于可变区抗原识别来调节激活强度，并影响细胞表型和功能 | 首次证明γδ T细胞受体的γ恒定结构域（Cγ1和Cγ2）能独立于可变区抗原识别来调节激活强度，为γδ T细胞功能调控提供了新机制 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，未深入探讨Cγ结构域调节激活的具体分子机制，且功能验证可能有限 | 探究人类γδ T细胞受体中γ恒定结构域对细胞激活、表型和功能的影响 | 人类γδ T细胞及其受体 | 免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 119 | 2026-04-11 |
scChat: A Large Language Model-Powered Co-Pilot for Contextualized Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2026-Feb-11, AIChE journal. American Institute of Chemical Engineers
DOI:10.1002/aic.70285
PMID:41959856
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研究论文 | 本文介绍了scChat，一个基于大语言模型的交互式助手，用于情境化的单细胞RNA测序分析 | 结合大语言模型与检索增强生成及多智能体架构，支持假设验证、机制解释和实验设计，超越了传统数据驱动方法的局限 | 未在摘要中明确提及 | 开发一个能够整合研究背景、提升单细胞RNA测序分析可解释性和影响力的交互式工具 | 单细胞RNA测序数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 大语言模型 | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 120 | 2026-04-11 |
Joint modeling of cellular heterogeneity and condition effects with scPCA in single-cell RNA-seq
2026-Feb-04, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09651-6
PMID:41639368
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scPCA的灵活降维框架，用于联合建模单细胞RNA测序数据中的细胞异质性和条件效应 | scPCA能够在线性降维框架中整合研究协变量，恢复集成的因子表示，并揭示跨条件和分解组分的转录变化 | NA | 开发一种能够同时处理细胞异质性和条件效应的降维方法，以更好地分析多条件实验中的单细胞RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据，包括未刺激和IFNß处理的外周血单个核细胞、啮齿动物肺细胞群、去极化视觉皮层神经元以及CRISPR-Cas9 chordin敲除斑马鱼数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | PCA | 基因表达谱 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |