单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 36381 篇文献,本页显示第 121 - 140 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
121 2026-02-14
Immune dysregulation triggered by inflammatory cytokines in patients with severe respiratory infections
2026-Jan-15, Respiratory research IF:4.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析,揭示了重症呼吸道感染患者中由炎症细胞因子触发的免疫失调机制,并评估了高剂量重组蛋白疫苗的潜在保护作用 构建了包含299,527个PBMCs的高分辨率免疫细胞图谱,首次系统性地描绘了COVID-19不同严重程度(中度、重度、危重、恢复期)患者的免疫特征,并发现高剂量重组蛋白疫苗可抑制单细胞炎症反应、增强保护性免疫 样本量相对较小(17例患者),且为观察性研究,需要更大规模的前瞻性研究验证结论 探究重症呼吸道病毒感染中免疫失调的潜在机制,并评估疫苗接种对免疫反应的影响 17例不同严重程度(中度、重度、危重、恢复期)的COVID-19患者的外周血单个核细胞(PBMCs) 单细胞组学 呼吸道感染(COVID-19) 单细胞转录组测序 NA 单细胞RNA测序数据 17例COVID-19患者(包括中度、重度、危重及恢复期病例)的PBMCs,共299,527个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
122 2026-02-14
Activating KRAS mutations mark premalignant cystic structures in congenital pulmonary airway malformations
2026-Jan-15, Respiratory research IF:4.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,探讨了先天性肺气道畸形中KRAS突变作为恶性转化风险因子的作用 首次在先天性肺气道畸形中利用单细胞RNA测序结合气道类器官模型,系统比较KRAS突变与非突变区域的细胞组成和基因表达差异,揭示了KRAS突变与肺癌相似的转录组特征 样本量较小(n=3),可能限制统计功效和结论的普适性;研究基于类器官模型,可能与体内实际情况存在差异 评估KRAS突变作为先天性肺气道畸形恶性转化风险标志物的潜力,以指导临床治疗策略 先天性肺气道畸形患者的切除肺组织,包括病变区域(囊肿)和非病变区域(对照) 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序,免疫荧光染色,类器官培养 气道类器官模型 单细胞转录组数据,图像数据 3例患者(KRAS突变与非突变对比) NA 单细胞RNA-seq NA NA
123 2026-02-14
Spatiotemporal transcriptomic mapping reveals region-specific glial activation and astrocyte shifts in epileptogenesis beyond the hippocampus
2026-Jan-15, Acta neuropathologica communications IF:6.2Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学技术,绘制了癫痫发生过程中大鼠脑内基因表达的时空动态图谱,揭示了海马以外区域的胶质细胞激活和星形胶质细胞功能亚型转变 首次在癫痫发生模型中应用Visium空间转录组学技术,系统性地揭示了癫痫发生过程中海马以外区域(如白质束和多个丘脑核团)的胶质细胞激活和星形胶质细胞功能亚型转变,挑战了传统上以海马为中心的癫痫发生观点 研究基于锂-毛果芸香碱诱导的癫痫持续状态大鼠模型,其结果在人类颞叶癫痫中的普适性有待验证;样本量相对较小(n=16);空间转录组学技术本身的分辨率限制 探究颞叶癫痫发生过程中,大脑不同区域在分子和细胞水平上的动态变化,特别是胶质细胞的激活模式和星形胶质细胞的功能转变 锂-毛果芸香碱诱导的癫痫持续状态大鼠模型(实验组)和对照组大鼠的冠状脑切片 空间转录组学 颞叶癫痫 空间转录组学 NA 空间基因表达数据 16只大鼠(包括实验组和对照组) 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium Visium空间基因表达技术
124 2026-02-14
Analysis of cranial tenocyte heterogeneity reveals a role for Wnt signaling in tendon attachments
2026-Jan-15, Development (Cambridge, England)
研究论文 通过单细胞RNA测序分析斑马鱼胚胎头部结缔组织,揭示肌腱细胞的空间和功能异质性,并发现Wnt信号在肌腱附着点形成中的作用 首次在胚胎发育中识别出肌腱细胞和韧带细胞的亚群,并揭示其空间转录特征与肌腱/韧带类型及位置的关联,同时定义了Wnt信号在肌腱附着点模式化和形态发生中的新角色 研究基于斑马鱼胚胎模型,结果在人类或其他哺乳动物中的适用性需进一步验证,且样本规模可能有限 探索肌腱和韧带发育的遗传机制,特别是肌腱细胞异性和附着点形成过程 斑马鱼胚胎头部的结缔组织,包括肌腱细胞和韧带细胞 单细胞转录组学 肌腱和韧带损伤 单细胞RNA测序(scRNA-seq),组合原位分析,遗传和药理学操作 NA 单细胞RNA测序数据,空间表达数据 斑马鱼胚胎头部结缔组织样本(具体数量未在摘要中指定) NA 单细胞RNA测序 NA NA
125 2026-02-14
Single-cell and immune-context integration identifies basement-membrane/metastasis signatures that sharpen bladder-cancer diagnosis and prognosis
2026-Jan-14, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究开发了一个基于转移-基底膜相关基因(MBRGs)的可解释预后模型,用于改善膀胱癌的临床和个性化治疗策略 通过整合单细胞和免疫背景分析,识别出基底膜/转移相关基因特征,并构建了一个六基因风险模型,该模型在TCGA和GEO队列中显示出良好的预后预测能力,并利用SHAP分析量化了特征贡献 模型在TCGA和GEO队列中的AUC值范围较宽(0.602-0.742),表明预测性能有待进一步优化,且研究主要基于公共数据库数据,缺乏前瞻性临床验证 增强膀胱癌的临床诊断和预后预测,并探索个性化治疗策略 膀胱癌患者 数字病理学 膀胱癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组化, 功能富集分析 LASSO回归, Cox回归, 风险模型 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 TCGA和GEO队列中的膀胱癌患者样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
126 2026-02-14
Integrating single-cell and bulk transcriptomes with machine learning reveals a CAF signature for immunotherapy response in dMMR endometrial cancer
2026-Jan-14, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据,结合机器学习方法,构建了一个基于Wnt相关癌症相关成纤维细胞(CAF)的风险特征模型,用于预测错配修复缺陷子宫内膜癌(dMMR EC)的预后和免疫治疗反应 首次在dMMR EC中系统识别Wnt相关CAF亚群,并应用包含10种算法和101种组合的机器学习框架筛选最优基因特征,构建了结合临床病理特征和风险评分的列线图模型 研究主要基于公共数据库数据,缺乏独立的前瞻性临床队列验证,且CAF功能机制需进一步实验验证 探索CAF在dMMR EC预后和免疫治疗反应中的作用,并构建预测模型 错配修复缺陷子宫内膜癌(dMMR EC)患者 机器学习 子宫内膜癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),批量RNA测序(bulk RNA-seq),拷贝数变异(CNV)分析 CoxBoost+Enet [alpha=0.6] 模型,列线图(nomogram) 转录组数据 单细胞数据包含9,682个肿瘤细胞和5,476个正常细胞(具体患者样本数未明确说明) NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
127 2026-02-14
Microbiome-Derived Metabolites Shape CD4+ T-Cell Differentiation and Immune Aging in Chronic HIV-1 Infection
2026-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了肠道菌群衍生的芳香族代谢物(如p-甲酚硫酸盐)如何影响HIV-1感染者CD4+ T细胞的代谢、分化和免疫衰老,并揭示了这些代谢物与HIV-1病毒库持久性的潜在关联 首次将细胞相关肠道菌群代谢物(而非系统性水平)与CD4+ T细胞的代谢功能状态及HIV-1病毒库大小联系起来,并深入研究了p-甲酚硫酸盐作为机制原型的作用 研究主要基于体外实验和HIV-1感染者样本,因果关系和普遍性需进一步验证 探究肠道菌群代谢物在慢性HIV-1感染中对CD4+ T细胞免疫代谢和衰老的影响 HIV-1感染者(PLWH)的配对血浆和CD4 T细胞 免疫代谢学 HIV-1感染 代谢组学分析、流式细胞术、单细胞RNA测序、转录组学、蛋白质组学 NA 代谢物数据、细胞表型数据、基因表达数据 HIV-1感染者的配对血浆和CD4 T细胞样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
128 2026-02-14
MIF-mediated reprogramming of myeloid lineage within the glioma tumor microenvironment impacts the efficacy of immune stimulatory gene therapy
2026-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析野生型和突变型IDH1胶质瘤的细胞异质性,揭示MIF-CD74轴在调控胶质瘤免疫微环境中的关键作用,并探索其与免疫刺激基因疗法联合的治疗潜力 首次在单细胞水平上比较wtIDH1和mIDH1胶质瘤的髓系细胞异质性,发现MIF表达降低与表观遗传重编程相关,并验证MIF-CD74轴调控肿瘤免疫微环境,联合免疫刺激基因疗法可显著延长生存期 研究主要基于小鼠模型,临床转化需进一步验证;单细胞测序样本量可能有限,未涵盖所有胶质瘤亚型 探究胶质瘤肿瘤微环境中髓系细胞的重编程机制及其对免疫治疗疗效的影响 野生型IDH1和突变型IDH1胶质瘤的肿瘤微环境,特别是髓系细胞群 数字病理学 胶质瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确指定样本数量,但涉及wtIDH1和mIDH1胶质瘤的小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
129 2026-02-14
Advances in Adipose Tissue Biology
2026-Jan-13, Endocrine reviews IF:22.0Q1
综述 本文综述了脂肪组织生物学的最新进展,强调了其在人类生理学中的核心调节作用及其在肥胖相关疾病中的关键角色 强调了脂肪组织从被视为惰性组织到被认可为动态、响应性细胞的观念转变,以及单细胞RNA测序等技术在揭示脂肪库特异性机制方面的潜力 NA 回顾脂肪组织在健康和疾病中的关键作用,并突出该领域的重大科学进展 脂肪组织及其在不同发育阶段、性别和衰老过程中的功能 NA 2型糖尿病,心血管疾病,肝病,多种癌症 单细胞RNA测序 NA NA NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
130 2026-02-14
Single-cell and spatial transcriptomic profiling of cardiac fibroblasts following myocardial infarction
2026-Jan-13, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞和空间转录组学技术,揭示了心肌梗死后心脏成纤维细胞的转录动态和修复性亚群的出现过程 结合了bulk RNA测序、RNAscope原位杂交和空间转录组学,首次在解剖和时间维度上映射了心脏成纤维细胞向修复性亚群转变的基因表达变化 研究主要关注心肌梗死早期阶段,长期动态和功能验证可能不足 探究心肌梗死后心脏成纤维细胞的异质性及修复性途径 心脏成纤维细胞,特别是修复性心脏成纤维细胞亚群 单细胞生物学 心血管疾病 单细胞RNA测序,空间转录组学,RNAscope原位杂交,bulk RNA测序 NA 转录组数据,空间表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq NA NA
131 2026-02-14
Combined Vibrio and nanoplastics stress promotes nanoplastic accumulation while reducing bacterial lethality in shrimp
2026-Jan-13, NPJ science of food IF:6.3Q1
研究论文 本研究首次揭示了副溶血弧菌能捕获纳米塑料并促进其在凡纳滨对虾体内的转运,同时纳米塑料通过降低病原体毒力影响感染过程 首次证明细菌可作为纳米塑料载体影响其生物转运,并发现纳米塑料能通过激活宿主能量代谢和免疫通路增强抗病能力 研究仅针对单一虾种和特定病原体,自然环境中的多因素交互作用未充分探讨 探究纳米塑料与病原细菌对水生生物的交互影响机制 凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)及其病原体副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus) 环境毒理学 细菌感染 单细胞转录组学分析 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
132 2026-02-14
Unveiling a novel function of Aconitase-2: attenuating lung ischemia-reperfusion injury via inhibition of pulmonary endothelial apoptosis
2026-Jan-12, Redox biology IF:10.7Q1
研究论文 本研究揭示了线粒体乌头酸酶-2(ACO2)通过抑制肺血管内皮细胞凋亡来减轻肺缺血再灌注损伤的新功能 首次发现ACO2在肺缺血再灌注损伤中通过维持线粒体功能和抑制细胞凋亡发挥保护作用,并明确了其下游代谢物4-辛基衣康酸(4-OI)的关键作用 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,临床样本量相对有限(113例),且ACO2的具体作用机制通路有待进一步阐明 探究ACO2在肺缺血再灌注损伤中的功能及其潜在治疗价值 肺缺血再灌注损伤患者、健康捐赠者、小鼠模型、原代肺血管内皮细胞 数字病理学 肺缺血再灌注损伤 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 NA RNA测序数据、临床数据、实验数据 临床队列:65名健康捐赠者和48名肺缺血再灌注损伤患者;动物模型:小鼠;细胞实验:原代肺血管内皮细胞 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
133 2026-02-14
Using Spatial Transcriptomics to Identify a Diagnostic Molecular Signature Associated with Reversible Dental Pulpitis
2026-Jan-12, Research square
研究论文 本研究利用空间转录组学技术分析牙髓炎样本,旨在识别与可逆性牙髓炎相关的诊断性分子特征,以改进牙髓状态的分类和诊断 首次应用空间转录组学(Visium-CytAssist-V2)技术于牙髓组织,揭示了可逆与不可逆牙髓炎之间的共享分子特征,并提出了基于免疫-成纤维细胞相互作用的诊断新视角 样本量较小(仅4个牙髓组织),且仅针对特定临床特征(如深龋、叩诊敏感)的样本,可能限制结果的普遍适用性 研究牙髓炎的转录组特征,识别炎症亚型,并改进传统的可逆/不可逆分类框架 人类牙髓组织,包括健康牙髓、可逆性牙髓炎和不可逆性牙髓炎样本 数字病理学 牙髓炎 空间转录组学 NA 空间转录组数据 4个牙髓组织样本 10x Genomics 空间转录组学 Visium Visium-CytAssist-V2
134 2026-02-14
The transcription factor HHEX maintains glucocorticoid levels and protects adrenals from androgen-induced lipid depletion
2026-Jan-11, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了转录因子HHEX在维持肾上腺糖皮质激素水平和保护肾上腺免受雄激素诱导的脂质耗竭中的关键作用 首次通过单细胞RNA测序解析类固醇生成谱系的转录组,并发现HHEX是糖皮质激素生成细胞中最富集的转录因子,揭示了其在肾上腺性别二态性和脂质稳态中的新功能 研究主要基于小鼠模型,人类肾上腺中的机制尚未验证;性别差异仅关注了雄性动物,雌性动物的具体影响需进一步探究 探究维持肾上腺皮质糖皮质激素生成细胞差异反应性的分子机制 小鼠肾上腺皮质中的类固醇生成细胞谱系 单细胞转录组学 肾上腺功能障碍 单细胞RNA测序 遗传小鼠模型 单细胞转录组数据 使用Sf1-Cre; Rosa报告小鼠 NA 单细胞RNA-seq NA NA
135 2026-02-14
Genital herpes shedding episodes associate with altered spatial organization and activation of mucosal immune cells
2026-Jan-09, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究探讨了HSV-2感染期间病毒脱落对宫颈阴道黏膜免疫细胞空间组织和活化的影响 首次结合空间转录组学、流式细胞术和免疫荧光成像,系统揭示了活动性HSV-2脱落期间阴道黏膜免疫细胞的空间重编程和激活状态变化 研究为横断面设计,无法确定观察到的免疫变化与病毒脱落之间的因果关系;样本量虽较大但可能未涵盖所有临床亚群 探究HSV-2感染对宫颈阴道黏膜免疫的影响机制 HSV-2血清阳性和阴性参与者的宫颈阴道组织和血液样本 空间转录组学 生殖器疱疹 流式细胞术、免疫荧光成像、可溶性免疫因子分析、空间转录组学 NA 组织样本、血液样本、空间转录组数据、免疫表型数据 232名参与者(包括HSV-2血清阳性和阴性个体) NA 空间转录组学 NA NA
136 2026-02-14
Fecal microbiota transplantation promotes type 2 mucosal immune responses with colonic epithelium proliferation in patients with recurrent Clostridioides difficile
2026-Jan-09, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究探讨了粪菌移植(FMT)在复发性艰难梭菌感染(rCDI)患者中通过促进结肠上皮增殖和2型黏膜免疫反应的作用机制 首次结合空间转录组学和单细胞基因集分析,揭示了FMT后结肠上皮局部增殖和2型免疫通路(如IL-33和amphiregulin)上调的机制 样本量较小(n=16),且未长期追踪复发情况,机制研究主要基于相关性分析 阐明粪菌移植治疗复发性艰难梭菌感染的分子和免疫机制 复发性艰难梭菌感染患者(n=16)和健康对照的结肠活检、血浆、PBMCs及粪便样本 数字病理学 艰难梭菌感染 高通量测序、流式细胞术免疫分析、空间转录组学 NA 基因表达数据、免疫表型数据、微生物组数据 16名rCDI患者及健康对照 NA 空间转录组学, 单细胞基因集分析 NA NA
137 2026-02-14
Cannabidiol exerts antiinflammatory effects but maintains T effector memory cell differentiation in humans
2026-Jan-09, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究在单细胞水平上评估了稳态下口服大麻二酚(CBD)联合他克莫司治疗对人体免疫细胞的调节作用 首次在稳态CBD浓度下,结合他克莫司治疗,利用单细胞RNA测序等技术在单细胞水平系统评估了CBD对人体免疫细胞的混合免疫调节作用 研究为体外实验,样本量相对较小(23名参与者),且CBD剂量和疗程固定,可能无法完全反映体内长期或不同剂量下的复杂免疫反应 阐明CBD在人体内的免疫调节作用,特别是对移植受者等免疫抑制人群疼痛管理的临床安全性 23名口服CBD(Epidiolex)参与者的外周血单个核细胞(PBMCs) NA NA 单细胞RNA测序,单核RNA测序,细胞增殖检测,细胞因子测定,流式细胞术,串联质谱 NA RNA测序数据,细胞增殖数据,细胞因子蛋白水平数据,流式细胞术数据,质谱浓度数据 23名参与者 NA 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq NA NA
138 2026-02-14
Spatial transcriptomics reveals immune-stromal crosstalk within the synovium of patients with juvenile idiopathic arthritis
2026-Jan-09, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究利用亚细胞分辨率空间转录组学技术,解析了活动性幼年特发性关节炎患者滑膜组织的空间分子特征和细胞间相互作用 开发了新的空间共定位分析流程,首次在JIA滑膜中揭示了NOTCH信号介导的内皮-成纤维细胞相互作用、CXCL9/CXCR3信号轴以及三级淋巴结构等微解剖结构 研究样本量有限,且主要针对活动期患者,缺乏对疾病不同阶段或治疗反应的纵向分析 阐明幼年特发性关节炎滑膜组织的空间细胞组成和细胞间通讯网络 活动性幼年特发性关节炎患者的滑膜组织 空间转录组学 幼年特发性关节炎 空间转录组学 空间共定位分析流程 空间转录组数据 活动性JIA患者的滑膜组织样本(具体数量未明确说明) NA 空间转录组学 NA 亚细胞分辨率空间转录组分析
139 2026-02-14
Single-cell immune transcriptomics reveals an inflammatory-inhibitory set-point spectrum in autoimmune diabetes
2026-Jan-09, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞免疫转录组学揭示了自身免疫性糖尿病中炎症-抑制设定点的连续谱,并识别了潜在的免疫治疗靶点 首次在单细胞水平上比较了LADA和T1D的免疫特征,定义了NF-κB/EGFR-JAK/STAT梯度和HLA-C-KIR轴作为关键调控机制 样本量相对有限,且仅基于外周血单核细胞,未直接分析胰腺组织中的免疫细胞 探究自身免疫性糖尿病(包括T1D和LADA)中决定不同炎症状态的免疫学机制 LADA患者、新诊断T1D患者和健康对照者的外周血单核细胞 单细胞组学 自身免疫性糖尿病 单细胞RNA测序,配对T和B细胞受体分析 NA 单细胞转录组数据,V(D)J序列数据 超过400,000个PBMCs NA 单细胞RNA-seq NA NA
140 2026-02-14
Cellular immune endophenotypes separating early and late-onset myasthenia gravis
2026-Jan-09, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过多模态技术分析早期和晚发型重症肌无力患者的细胞免疫表型,识别出三种主要淋巴细胞群作为区分两种亚型的关键免疫标志物 首次应用深度光谱流式细胞术和单细胞测序技术,揭示了早期和晚发型重症肌无力在黏膜相关恒定T细胞、初始CD8+ T细胞和经典NK细胞频率上的显著差异,并建立了基于这三种细胞群频率的亚型预测模型,准确率达90% 研究仅基于两个独立队列,样本量可能有限;未深入探讨这些免疫细胞差异背后的具体分子机制 区分早期和晚发型重症肌无力的细胞免疫内表型,以改进临床分类 重症肌无力患者,特别是早期(50岁前发病)和晚发型(50岁后发病)亚型 免疫学 重症肌无力 深度光谱流式细胞术,单细胞测序 NA 细胞免疫表型数据,单细胞测序数据 两个独立队列的重症肌无力患者 NA 单细胞测序 NA NA
回到顶部