单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 11501 - 11520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11501 | 2024-08-04 |
Smoking-induced CCNA2 expression promotes lung adenocarcinoma tumorigenesis by boosting AT2/AT2-like cell differentiation
2024-Jun-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216922
PMID:38704137
|
研究论文 | 该论文探讨了吸烟诱导的CCNA2表达如何通过促进AT2/AT2样细胞的分化来促进肺腺癌肿瘤发生 | 揭示了吸烟诱导的CCNA2过表达及其对WNT/β-catenin信号通路的抑制作为控制AT2细胞分化和肺腺癌肿瘤发生的新机制 | 研究中没有探讨其他可能影响CCNA2表达和肿瘤发生的因素 | 本研究旨在探讨吸烟如何影响与肺腺癌相关的AT2细胞分化机制 | 研究对象为肺腺癌及其相关细胞，特别关注AT2细胞及其转变为AT2样细胞的过程 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 包含147个差异表达基因的分析 |
| 11502 | 2024-08-05 |
Adipocyte Progenitor Pools Composition and Cellular Niches Affect Adipogenesis Divergence in Porcine Subcutaneous and Intramuscular Fat
2024-Jun-07, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c01044
PMID:38848240
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研究论文 | 本研究探讨了猪的皮下脂肪和内脏脂肪在脂肪生成过程中的差异 | 揭示了猪的皮下脂肪和内脏脂肪在脂肪生成的内在和微环境机制上的新发现 | 研究可能未涵盖所有脂肪细胞类型的差异 | 深入理解猪的皮下脂肪和内脏脂肪间的脂肪生成差异 | 研究对象为猪的皮下脂肪和内脏脂肪细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 未具体提到样本量 |
| 11503 | 2024-08-04 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal a high glycolysis B cell and tumor-associated macrophages cluster correlated with poor prognosis and exhausted immune microenvironment in diffuse large B-cell lymphoma
2024-Jun-05, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00605-w
PMID:38840205
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研究论文 | 这项研究揭示了与差生大B细胞淋巴瘤相关的高糖酵解B细胞和肿瘤相关巨噬细胞群体的代谢特征。 | 创新点在于首次利用单细胞转录组学和空间转录组学揭示糖酵解在DLBCL进展中的作用及其与免疫微环境的关系。 | 样本量相对有限，可能影响结果的普遍性和推广性。 | 研究DLBCL进展中的代谢特征，为个性化治疗提供依据。 | 研究对象包括高度恶性DLBCL细胞及其相关的肿瘤相关巨噬细胞。 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞转录组学、空间转录组学、免疫组化、免疫荧光 | NA | 多组学数据 | 5个单细胞转录组样本，966个总体转录组样本，10个空间转录组样本，34个免疫组化样本和20个免疫荧光样本 |
| 11504 | 2024-08-04 |
HyperGCN: an effective deep representation learning framework for the integrative analysis of spatial transcriptomics data
2024-Jun-05, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10469-x
PMID:38840049
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研究论文 | 本文提出了HyperGCN框架用于空间转录组数据的综合分析 | HyperGCN利用超图引导的图卷积网络处理高几何复杂度的组织，提升了空间转录组数据的分析能力 | NA | 研究空间转录组数据的综合分析方法 | 来自不同组织和技术的数据集，包括人类前额叶皮层、人类乳腺肿瘤等 | 数字病理学 | 乳腺癌 | NA | 超图卷积网络 | 转录组数据 | 四个真实数据集，包括不同组织和技术 |
| 11505 | 2024-08-07 |
Author Correction: Multiplexed bulk and single-cell RNA-seq hybrid enables cost-efficient disease modeling with chimeric organoids
2024-Jun-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48984-w
PMID:38839746
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11506 | 2024-08-05 |
Integrative bioinformatics approach yields a novel gene expression risk model for prognosis and progression prediction in prostate cancer
2024-Jun, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18405
PMID:38842134
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研究论文 | 本文构建了一个基于基因表达的新型前列腺癌预后和进展预测风险模型 | 开发了一个整合多种数据集的风险模型，并鉴定出八个独立预后因子 | 模型的验证仅通过一个独立数据集进行，可能限制了其广泛适用性 | 旨在建立一个有效的前列腺癌进展预测模型 | 前列腺癌患者，重点分析基因表达与无进展生存期之间的关系 | 数字病理 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了两例去势相关前列腺癌和两例激素相关前列腺癌样本 |
| 11507 | 2024-08-04 |
Mapping the Cellular Biogeography of Human Bone Marrow Niches Using Single-Cell Transcriptomics and Proteomic Imaging
2024-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.14.585083
PMID:38559168
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研究论文 | 本文使用单细胞转录组学和蛋白质组成像绘制了人类骨髓微环境的细胞生物地理学 | 首次全面构建了人类骨髓的空间分辨多组学图谱 | 研究主要集中于较小的样本量，可能无法代表所有人群 | 探索人类骨髓中非造血细胞的空间组织及其功能 | 29,325个富集的非造血骨髓细胞及18例个体的样品 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) 和CO-检测通过索引 (CODEX) 多重成像 | NA | 图像和转录组数据 | 29,325个非造血骨髓细胞和18个个体样本 |
| 11508 | 2024-08-05 |
CD4+ T cell heterogeneity in gestational age and preeclampsia using single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1401738
PMID:38774869
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研究论文 | 本研究探讨了妊娠期和子痫前期中CD4+ T细胞的异质性。 | 文章首次通过单细胞RNA测序和T细胞受体组分析揭示了妊娠年龄对决策性CD4 T细胞亚群的多样性和克隆性的重要性。 | 未提及具体的样本数量和方法的局限性。 | 研究CD4+ T细胞在妊娠期和子痫前期中的异质性及其对母胎耐受的影响。 | 决策性CD4 T细胞亚群及其在子痫前期中的表达变化。 | 数字病理学 | 子痫前期 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 11509 | 2024-08-04 |
Cardiac pericytes mediate the remodeling response to myocardial infarction
2023-05-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI162188
PMID:37183820
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研究论文 | 这篇文章探讨了心脏周细胞在心肌梗死后的重塑反应中的作用 | 首次揭示了心脏周细胞在急性缺血损伤后调控血管稳态和纤维化反应的关键角色 | 未详细探讨心脏周细胞的全部作用机制 | 旨在阐明心脏周细胞在缺血性重塑中的角色 | 心脏周细胞与心肌梗死后的纤维化及血管通透性变化 | 数字病理学 | 心脏病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 多个来源的心脏周细胞样本 |
| 11510 | 2024-08-04 |
Regulation of human salt-sensitivite hypertension by myeloid cell renin-angiotensin-aldosterone system
2023, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2023.1208270
PMID:37534363
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研究论文 | 本研究探讨了饮食盐对人类单核细胞免疫细胞中肾素-血管紧张素-醛固酮系统基因表达的影响及其在盐敏感性高血压中的作用 | 揭示了饮食盐摄入对人类单核细胞中RAAS表达的调控机制与系统性RAAS的不同 | 未探讨盐敏感高血压的长期影响和其他潜在的影响因素 | 研究盐敏感高血压中免疫细胞对饮食盐影响的机理 | 人类的单核细胞免疫细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | bulk和单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了高盐处理的人类免疫细胞 |
| 11511 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing identifies a paracrine interaction that may drive oncogenic notch signaling in human adenoid cystic carcinoma
2022-11-29, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111743
PMID:36450256
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析人类腮腺腺样囊性癌中的肿瘤细胞间相互作用 | 首次揭示了腺样囊性癌中肿瘤细胞表达的异质性及其在Notch信号通路中的潜在作用 | 研究仍缺乏对人类肿瘤中MYB和Notch信号的完整体内描述 | 探索腺样囊性癌的病理生理学及其细胞信号传递机制 | 腺样囊性癌的原发肿瘤及其匹配的局部复发样本 | 数字病理学 | 腺样囊性癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包含有腺样囊性癌的多个样本及三个已发表患者组 |
| 11512 | 2024-08-05 |
PRDM16 Is a Compact Myocardium-Enriched Transcription Factor Required to Maintain Compact Myocardial Cardiomyocyte Identity in Left Ventricle
2022-02-22, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 研究表明PRDM16是维持左心室紧凑型心肌细胞身份所需的转录因子。 | 建立了心肌特异性Prdm16基因敲除小鼠模型，该模型能够完全再现患者的左心室非紧凑型心肌病表型，揭示了PRDM16的作用机制。 | 目前尚不清楚PRDM16缺失如何导致左心室非紧凑型心肌病的具体分子机制。 | 探讨PRDM16在左心室非紧凑型心肌病中的作用和机制。 | 使用心肌细胞特异性Prdm16基因敲除小鼠及相关技术进行分析。 | 数字病理学 | 心脏病 | RNA测序，染色质免疫沉淀深度测序，单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因组数据 | 生成并分析了心肌细胞特异性Prdm16基因敲除小鼠模型 |
| 11513 | 2024-08-05 |
Matters of the heart: Cellular sex differences
2021-11, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2021.04.010
PMID:34166708
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研究论文 | 本文探讨了心脏中男性和女性细胞的差异，特别是非肌肉细胞类型 | 探讨了细胞性别在心脏健康和疾病中的差异，强调了微环境对细胞表型的影响 | 许多研究未报告细胞的性别，且多数研究使用的细胞来自男性 | 研究心脏中细胞性别差异及其对心脏健康和疾病的影响 | 哺乳动物心脏的男性和女性细胞，包括非肌肉细胞族群 | 数字病理 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | NA |
| 11514 | 2024-08-05 |
Dissection of molecular mechanisms of liver injury induced by microcystin-leucine arginine via single-cell RNA-sequencing
2024-Nov, Journal of environmental sciences (China)
DOI:10.1016/j.jes.2023.08.032
PMID:38844317
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研究论文 | 这篇文章探讨了微囊藻毒素-亮氨酸精氨酸（MC-LR）引起的肝损伤的分子机制 | 首次建立了小鼠肝脏对MC-LR反应的单细胞图谱，提供了对MC-LR诱导肝毒性的深入见解 | 文章未提及具体的样本量和可重复性等限制 | 研究微囊藻毒素MC-LR引起的肝毒性分子机制 | 以小鼠为研究对象，分析MC-LR诱导的肝脏损伤 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 小鼠的肝脏样本 |
| 11515 | 2024-08-05 |
Type 17 immune response promotes oral epithelial cell proliferation in periodontitis
2024-Aug, Archives of oral biology
IF:2.2Q2
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研究论文 | 本研究探讨了17型免疫反应对牙周炎中口腔上皮细胞增殖的影响 | 揭示了17型免疫反应在牙周炎中对口腔上皮细胞增殖的促进作用 | 研究的样本仅限于小鼠模型和初步的人类细胞实验，可能无法完全代表临床情况 | 研究17型免疫反应对牙周炎患者口腔上皮细胞增殖的影响 | 牙周炎小鼠模型及人类正常口腔角质形成细胞 | 数字病理学 | 牙周炎 | 免疫组织化学、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 细胞、基因表达数据 | 小鼠模型及相关的单细胞RNA测序数据 |
| 11516 | 2024-08-05 |
3D model of mouse embryonic pancreas and endocrine compartment using stem cell-derived mesoderm and pancreatic progenitors
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109959
PMID:38832019
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研究论文 | 本研究旨在通过将小鼠胚胎干细胞分化为中胚层祖细胞和胰腺祖细胞来生成胰腺聚集体 | 该工作使用干细胞衍生的中胚层和胰腺前体生成胰腺模型，且不使用Matrigel，首次展示了PP与MP聚集的效果 | 该研究可能在组织的形态和功能复现方面存在局限性，未考虑其他可能影响胰腺发育的因素 | 研究小鼠胰腺的发育及其内分泌腺的形成机制 | 小鼠胚胎干细胞及其衍生的中胚层祖细胞和胰腺祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 11517 | 2024-08-05 |
Molecular maps of synovial cells in inflammatory arthritis using an optimized synovial tissue dissociation protocol
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109707
PMID:38832018
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研究论文 | 本研究优化了滑膜组织活检的解离方法，为单细胞组学研究创建了人类滑膜在炎症性关节炎中的单细胞图谱 | 提出了一种有效的滑膜解离方法，并建立了包含多种滑膜细胞亚群的新型单细胞RNA-seq图谱 | 研究中仅涉及了25个滑膜组织样本，可能限制结果的普适性 | 优化滑膜组织解离协议，以提升单细胞组学研究的效率 | 来自25个患有炎症性关节炎的滑膜组织的单细胞 | 数字病理学 | 炎症性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 涉及25个滑膜组织样本，包含超过100,000个未分拣的滑膜细胞 |
| 11518 | 2024-08-05 |
Qi Lang formula relieves constipation via targeting SCF/c-kit signaling pathway: An integrated study of network pharmacology and experimental validation
2024-Jun-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e31860
PMID:38841509
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研究论文 | 本研究探讨了Qi Lang公式（QLF）通过靶向SCF/c-kit信号通路在缓解便秘中的作用 | 阐明了QLF在促进ICC增殖以及恢复神经递质水平的机制 | 本研究仅在大鼠模型中进行，可能限制了其临床应用的普遍性 | 揭示Qi Lang公式缓解便秘的潜在机制 | 通过分析QLF及其靶点来研究与ICC相关的便秘 | 数字病理学 | 便秘 | UPLC-MS/MS, scRNA-seq, ELISA, Western blot, 免疫荧光 | NA | NA | 使用大鼠模型进行实验，具体样本数量未说明 |
| 11519 | 2024-08-05 |
Single-Cell Analysis Uncovers Striking Cellular Heterogeneity of Lung-Infiltrating Regulatory T Cells during Eosinophilic versus Neutrophilic Allergic Airway Inflammation
2024-Jun-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300646
PMID:38647384
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研究论文 | 这篇文章揭示了肺内浸润的调节性T细胞在不同类型的过敏性气道炎症中的显著细胞异质性 | 提出了一种新机制，表明不同类型的炎症可能导致表型独特的肺驻留调节性T细胞的形成 | 未探讨不同的过敏气道炎症反应是否影响浸润的调节性T细胞异质性或肺驻留特征 | 研究不同类型的过敏性气道炎症中肺浸润调节性T细胞的异质性 | 肺内浸润的调节性T细胞，重点关注嗜酸性和中性粒细胞介导的炎症模型 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | N/A | N/A | N/A |
| 11520 | 2024-08-04 |
Single-cell and bulk RNA-seq unveils the immune infiltration landscape associated with cuproptosis in cerebral cavernous malformations
2024-Jun-05, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00603-y
PMID:38835051
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研究论文 | 该研究揭示了与杯死亡相关的分子特征在脑海绵状血管畸形中的作用 | 首次展示了杯死亡与脑海绵状血管畸形病理之间的分子联系以及新识别的三个关键基因 | 研究中的样本数量较小，可能影响结果的广泛适用性 | 探讨与脑海绵状血管畸形发展相关的杯死亡分子特征 | 分析了15例脑海绵状血管畸形样本和6例对照样本 | 数字病理学 | 脑海绵状血管畸形 | RNA测序 | 机器学习模型（LASSO和随机森林） | 基因表达数据 | 15例脑海绵状血管畸形样本和6例对照样本 |