单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 11561 - 11580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11561 | 2024-08-05 |
Recent advances in genomic DNA sequencing of microbial species from single cells
2014-Sep, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/nrg3785
PMID:25091868
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研究论文 | 本文讨论了通过单细胞测序对微生物物种的基因组DNA进行测序的最新进展 | 揭示了通过单细胞测序技术填补未培养物种的基因组序列空白的潜力 | 对微生物物种的研究仍然受到技术和样本可得性的限制 | 研究未培养微生物的基本生物学、分类和进化 | 未培养的微生物物种及其基因组 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组DNA | NA |
| 11562 | 2024-08-05 |
Quantitative assessment of single-cell RNA-sequencing methods
2014-Jan, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.2694
PMID:24141493
|
研究论文 | 该文章比较了不同的单细胞RNA扩增方法的敏感性和准确性 | 系统评估了多种单细胞RNA-seq方法的性能，并显示出在较小的测序读取数下仍能准确测量单细胞转录组 | 未提及具体的限制 | 探讨单细胞转录组分析的有效性 | 比较不同的单细胞RNA扩增方法 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | RNA序列 | 使用了不同数量的单细胞样本 |
| 11563 | 2024-08-05 |
A tripartite transcription factor network regulates primordial germ cell specification in mice
2013-Aug, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/ncb2798
PMID:23851488
|
研究论文 | 本文探讨了三种转录因子网络在小鼠原始生殖细胞(PGC)特定中的调控作用 | 揭示了BLIMP1、AP2γ和PRDM14之间相互依赖的转录网络对PGC特异性命运的影响 | 未提及具体的实验范围或潜在的不确定性 | 研究转录因子如何调控原始生殖细胞的规范化 | 研究小鼠的原始生殖细胞 | NA | NA | 转录组分析和染色质免疫沉淀测序 | NA | NA | 使用了正常和突变的PGC的单细胞转录组数据 |
| 11564 | 2024-08-05 |
Development and applications of single-cell transcriptome analysis
2011-Apr, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.1557
PMID:21451510
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评论 | 本文回顾了单细胞转录组分析的历史、进展、潜在应用和未来发展 | 结合活细胞成像和谱系追踪的方法，能够揭示个体细胞的基因表达网络 | NA | 探讨基因型与表型之间的关系 | 单细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | NA | NA |
| 11565 | 2024-08-04 |
Somatic mutations associate with clonal expansion of CD8+ T cells
2024-Jun-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj0787
PMID:38848368
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研究论文 | 本文研究了CD8+ T细胞中的体细胞突变与克隆扩增之间的关系 | 揭示了非恶性T细胞中的突变谱，并首次确认CD8细胞中的非同义变异频率高于同义变异 | 未明确提及对样本选择和其他T细胞类型的影响 | 了解体细胞突变对CD8 T细胞扩增的影响 | 来自90位血液和免疫疾病患者的CD8和CD4 T细胞 | 数字病理学 | 免疫疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 90名患者的T细胞 |
| 11566 | 2024-08-05 |
Prediction of Clinically Significant Prostate Cancer by a Specific Collagen-related Transcriptome, Proteome, and Urinome Signature
2024-Jun-07, European urology oncology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.euo.2024.05.014
PMID:38851995
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研究论文 | 该文章分析了与胶原相关的转录组、蛋白组和尿液组的变化，以检测临床显著性前列腺癌 | 通过胶原相关转录组、蛋白组和尿液组的特征建立了机器学习模型，显著优于传统的前列腺特异抗原 (PSA) 方法 | 本研究的一个局限性是其回顾性特征 | 研究胶原在前列腺癌检测中的作用 | 涉及临床显著性前列腺癌患者的转录组、蛋白组和尿液组数据 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序，机器学习 | 机器学习模型 | 转录组数据，蛋白组数据，尿液组数据 | 转录组1393个，蛋白组104个，尿液组923个 |
| 11567 | 2024-08-05 |
Remodeling ceramide homeostasis promotes functional maturation of human pluripotent stem cell-derived β cells
2024-Jun-06, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.04.010
PMID:38697109
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研究论文 | 该研究探讨了人类多能干细胞来源的β细胞的功能成熟过程 | 揭示了蜕膜代谢重塑，尤其是对神经酰胺代谢活动的下调对β细胞成熟的重要性 | 研究中具体的细胞标志物和环境因素对成熟过程的影响未深入探讨 | 研究人类胰腺β细胞的成熟机制及其功能获得 | 人类多能干细胞来源的β细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和单细胞转座酶易接触染色质测序 (scATAC-seq) | NA | NA | NA |
| 11568 | 2024-08-05 |
Neuronal cell populations in circumoral nerve ring of sea cucumber Apostichopus japonicus: Ultrastructure and transcriptional profile
2024-Jun-05, Comparative biochemistry and physiology. Part D, Genomics & proteomics
DOI:10.1016/j.cbd.2024.101263
PMID:38850626
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研究论文 | 本文观察了海参Apostichopus japonicus中环口神经环内神经细胞的超微结构和转录特征 | 首次应用单细胞RNA测序研究海参中神经细胞的转录特征并识别了六种神经细胞类型 | 缺乏对神经细胞功能及其在生态系统中作用的进一步研究 | 研究海参神经细胞的超微结构以及其转录特征 | 海参Apostichopus japonicus的环口神经环中的神经细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 六种神经细胞类型 |
| 11569 | 2024-08-05 |
A cell atlas of the adult female Aedes aegypti midgut revealed by single-cell RNA sequencing
2024-Jun-05, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03432-8
PMID:38839790
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序建立了成蚊Aedes aegypti中肠细胞图谱 | 首次建立了Aedes aegypti中肠单细胞RNA测序的分离和测序协议 | 缺乏对已知转录组的重复性验证和其他中肠细胞的功能研究 | 研究Aedes aegypti中肠细胞类型及其在arbovirus感染中的作用 | Aedes aegypti成虫的中肠细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞类型 | NA |
| 11570 | 2024-08-04 |
Modifications of lipid pathways restrict SARS-CoV-2 propagation in human induced pluripotent stem cell-derived 3D airway organoids
2024-Jun, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2023.08.005
PMID:37557954
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研究论文 | 本研究探讨了脂质代谢修改如何限制SARS-CoV-2在类人气道器官中的传播 | 通过建立人诱导多能干细胞衍生的气道类器官，首次揭示了脂质通路修改对SARS-CoV-2传播的限制作用 | 本研究主要基于体外模型，尚需进一步验证在真实生物体中的效果 | 揭示脂质代谢在COVID-19病毒感染中的作用机制 | 人诱导多能干细胞衍生的气道类器官，主要关注SARS-CoV-2的感染和传播 | 数字病理学 | 新冠病毒感染 | 单细胞测序（ScRNAseq） | 气道类器官（iPSC-AOs） | 细胞与分子生物数据 | NA |
| 11571 | 2024-08-05 |
Status of single-cell RNA sequencing for reproductive toxicology in zebrafish and the transcriptomic trade-off
2024-Jun, Current opinion in toxicology
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.cotox.2024.100463
PMID:38846809
|
评论 | 本文回顾了单细胞RNA测序在斑马鱼生殖毒理学中的应用和转录组权衡。 | 提出了单细胞RNA测序(scRNA-seq)作为一种创新且尚未充分利用的技术，提供了独特的细胞层面转录组分析视角。 | 需要考虑传统方法与scRNA-seq之间的权衡。 | 探讨单细胞RNA测序在生殖毒理学中的应用及其对毒性物质暴露的响应。 | 主要研究斑马鱼的个体细胞基因表达谱。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 11572 | 2024-08-05 |
Hypoxia-Inducible Factor-1α in SM22α-Expressing Cells Modulates Alveolarization
2023-10, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2023-0045OC
PMID:37290124
|
研究论文 | 本文研究了HIF-1α在SM22α表达细胞中的作用对肺泡化的影响 | 文章创新性地探讨了HIF-1α在特定间充质细胞亚群中调节出生后肺泡化的机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，可能无法完全推及人类 | 研究HIF-1α在SM22α表达细胞中的功能及其对肺发育的影响 | 以SM22α-表达细胞为对象，分析其在肺泡化中的作用 | 数字病理学 | 慢性肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | 使用了小鼠模型和早产儿样本 |
| 11573 | 2024-08-05 |
Advances in preclinical assessment of therapeutic targets for bladder cancer precision medicine
2024-Jul-01, Current opinion in urology
IF:2.1Q2
DOI:10.1097/MOU.0000000000001177
PMID:38602053
|
review | 该综述重点介绍了膀胱癌患者的新靶点、进展和治疗方法 | 结合抗体药物偶联物（ADC）与免疫疗法的成功被视为膀胱癌治疗的重大突破，并探讨了其他ADC作为治疗选项的兴趣 | 该文献没有明确提及局限性 | 旨在阐明膀胱癌的治疗靶点，以改善患者特异性的护理和治疗结果 | 膀胱癌患者及其治疗相关的新靶点和方法 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 11574 | 2024-08-05 |
Recent contributions of single-cell and spatial profiling to the understanding of bladder cancer
2024-Jul-01, Current opinion in urology
IF:2.1Q2
DOI:10.1097/MOU.0000000000001183
PMID:38650456
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review | 这篇综述总结了单细胞和空间组学在理解膀胱癌生物学中的最新进展 | 介绍了单细胞RNA测序和空间组学技术在肿瘤微环境、膀胱癌异质性、癌症干性和细胞可塑性方面的创新应用 | 在将研究结果转化为临床实践和实施个体化治疗策略方面仍存在挑战 | 探讨单细胞和空间组学在膀胱癌中的应用及其对新治疗策略发展的影响 | 研究膀胱癌中肿瘤微环境和细胞异质性 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序和空间组学技术 | NA | NA | NA |
| 11575 | 2024-08-04 |
Smoking-induced CCNA2 expression promotes lung adenocarcinoma tumorigenesis by boosting AT2/AT2-like cell differentiation
2024-Jun-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216922
PMID:38704137
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研究论文 | 该论文探讨了吸烟诱导的CCNA2表达如何通过促进AT2/AT2样细胞的分化来促进肺腺癌肿瘤发生 | 揭示了吸烟诱导的CCNA2过表达及其对WNT/β-catenin信号通路的抑制作为控制AT2细胞分化和肺腺癌肿瘤发生的新机制 | 研究中没有探讨其他可能影响CCNA2表达和肿瘤发生的因素 | 本研究旨在探讨吸烟如何影响与肺腺癌相关的AT2细胞分化机制 | 研究对象为肺腺癌及其相关细胞，特别关注AT2细胞及其转变为AT2样细胞的过程 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 包含147个差异表达基因的分析 |
| 11576 | 2024-08-05 |
Adipocyte Progenitor Pools Composition and Cellular Niches Affect Adipogenesis Divergence in Porcine Subcutaneous and Intramuscular Fat
2024-Jun-07, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c01044
PMID:38848240
|
研究论文 | 本研究探讨了猪的皮下脂肪和内脏脂肪在脂肪生成过程中的差异 | 揭示了猪的皮下脂肪和内脏脂肪在脂肪生成的内在和微环境机制上的新发现 | 研究可能未涵盖所有脂肪细胞类型的差异 | 深入理解猪的皮下脂肪和内脏脂肪间的脂肪生成差异 | 研究对象为猪的皮下脂肪和内脏脂肪细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 未具体提到样本量 |
| 11577 | 2024-08-04 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal a high glycolysis B cell and tumor-associated macrophages cluster correlated with poor prognosis and exhausted immune microenvironment in diffuse large B-cell lymphoma
2024-Jun-05, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00605-w
PMID:38840205
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研究论文 | 这项研究揭示了与差生大B细胞淋巴瘤相关的高糖酵解B细胞和肿瘤相关巨噬细胞群体的代谢特征。 | 创新点在于首次利用单细胞转录组学和空间转录组学揭示糖酵解在DLBCL进展中的作用及其与免疫微环境的关系。 | 样本量相对有限，可能影响结果的普遍性和推广性。 | 研究DLBCL进展中的代谢特征，为个性化治疗提供依据。 | 研究对象包括高度恶性DLBCL细胞及其相关的肿瘤相关巨噬细胞。 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞转录组学、空间转录组学、免疫组化、免疫荧光 | NA | 多组学数据 | 5个单细胞转录组样本，966个总体转录组样本，10个空间转录组样本，34个免疫组化样本和20个免疫荧光样本 |
| 11578 | 2024-08-04 |
HyperGCN: an effective deep representation learning framework for the integrative analysis of spatial transcriptomics data
2024-Jun-05, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10469-x
PMID:38840049
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研究论文 | 本文提出了HyperGCN框架用于空间转录组数据的综合分析 | HyperGCN利用超图引导的图卷积网络处理高几何复杂度的组织，提升了空间转录组数据的分析能力 | NA | 研究空间转录组数据的综合分析方法 | 来自不同组织和技术的数据集，包括人类前额叶皮层、人类乳腺肿瘤等 | 数字病理学 | 乳腺癌 | NA | 超图卷积网络 | 转录组数据 | 四个真实数据集，包括不同组织和技术 |
| 11579 | 2024-08-07 |
Author Correction: Multiplexed bulk and single-cell RNA-seq hybrid enables cost-efficient disease modeling with chimeric organoids
2024-Jun-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48984-w
PMID:38839746
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11580 | 2024-08-05 |
Integrative bioinformatics approach yields a novel gene expression risk model for prognosis and progression prediction in prostate cancer
2024-Jun, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18405
PMID:38842134
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研究论文 | 本文构建了一个基于基因表达的新型前列腺癌预后和进展预测风险模型 | 开发了一个整合多种数据集的风险模型，并鉴定出八个独立预后因子 | 模型的验证仅通过一个独立数据集进行，可能限制了其广泛适用性 | 旨在建立一个有效的前列腺癌进展预测模型 | 前列腺癌患者，重点分析基因表达与无进展生存期之间的关系 | 数字病理 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了两例去势相关前列腺癌和两例激素相关前列腺癌样本 |