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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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11161 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA transcriptomic reveal the mechanism of MSC derived small extracellular vesicles against DKD fibrosis
2024-Jun-18, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-024-02613-2
PMID:38890734
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研究论文 | 该研究使用单细胞RNA测序分析MSC来源的小外泌体在糖尿病肾病纤维化中的机制 | 发现了与纤维化相关的新型TGF-βArg1巨噬细胞亚群,并揭示了MSC-sEV对肾间质纤维化的独特治疗机制 | 研究未提及样本数量和临床有效性验证 | 探讨MSC-sEV在糖尿病肾病纤维化中的作用机制 | 分析32724个肾脏单细胞以研究巨噬细胞和肾小管细胞的变化 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 分析了32724个细胞 |
11162 | 2024-08-04 |
Clinically unfavorable transcriptome subtypes of non-WNT/non-SHH medulloblastomas are associated with a predominance in proliferating and progenitor-like cell subpopulations
2024-06-07, Acta neuropathologica
IF:9.3Q1
DOI:10.1007/s00401-024-02746-6
PMID:38847845
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研究论文 | 本研究探讨了非WNT/非SHH髓母细胞瘤中临床不良转录组亚型与细胞群体特征之间的关系。 | 识别出不同次级群体中具有独特基因表达特征和信号通路的预后相关转录组亚型。 | 缺乏对每个SGS MB分别应用单细胞技术的验证。 | 旨在探索非WNT/非SHH髓母细胞瘤中细胞组成与临床预后的关系。 | 研究对象为非WNT/非SHH髓母细胞瘤的不同转录组亚型及其细胞亚群体。 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA-seq | NA | RNA序列数据 | 包括多个次级群体(SGS I-VIII)的样本 |
11163 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis uncovers high-proliferative tumour cell subtypes and their interactions in the microenvironment of gastric cancer
2024-Jun, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18373
PMID:38894657
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现胃癌微环境中的高增殖肿瘤细胞亚群及其相互作用 | 首次识别了胃癌中高度增殖的C2 UBE2C+肿瘤细胞亚群,并建立了基于UBE2C相关基因的预后评分模型 | 研究对象仅限于27名胃癌患者,数据来源单一,可能影响研究结果的广泛适用性 | 揭示胃癌快速进展的分子生物学机制 | 对胃癌患者的肿瘤微环境及其细胞亚群进行分析 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 27名胃癌患者的38个样本 |
11164 | 2024-08-05 |
Single-Cell Dissection of the Immune Response After Acute Myocardial Infarction
2024-Jun, Circulation. Genomic and precision medicine
DOI:10.1161/CIRCGEN.123.004374
PMID:38752343
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研究论文 | 本研究揭示了急性心肌梗死后免疫反应的细胞类型和疾病阶段。 | 通过单细胞RNA测序和血浆蛋白表达分析,识别了急性心肌梗死影响的免疫途径和细胞类型,提供了针对抗炎疗法受益患者的见解。 | 该研究的样本规模较小,仅包括38名患者和38名对照,可能限制结果的广泛适用性。 | 研究急性心肌梗死后免疫系统的反应及其对未来治疗的影响。 | 38名急性心肌梗死患者与38名对照参与者。 | 心血管疾病 | 心肌梗死 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 血液样本 | 38名急性心肌梗死患者和38名对照,共计95,995个病变外周血单核细胞和33,878个对照外周血单核细胞 |
11165 | 2024-08-05 |
Human-like adrenal features in Chinese tree shrews revealed by multi-omics analysis of adrenal cell populations and steroid synthesis
2024-May-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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研究论文 | 本文通过多组学分析揭示了中国树鼩的肾上腺细胞群和类固醇合成中的人类样特征 | 首次使用单细胞RNA测序和空间转录组分析系统性映射了中国树鼩肾上腺细胞类型和类固醇代谢通路 | 研究主要集中在树鼩的肾上腺细胞类型及其与人类的比较,其他模型的比较可能有限 | 研究树鼩中肾上腺类固醇合成的细胞类型及其功能 | 中国树鼩的肾上腺细胞群和类固醇合成机制 | 数字病理学 | 多囊卵巢综合症,原发性醛固酮增多症,高血压 | 单细胞RNA测序,空间转录组分析,质谱,免疫组化 | NA | RNA序列,代谢数据 | 多种细胞类型的样本,包括树鼩,人类,猕猴和小鼠的比较 |
11166 | 2024-08-05 |
Applications of single-cell RNA sequencing in spermatogenesis and molecular evolution
2024-May-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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评论 | 本文综述了单细胞RNA测序在精子发生和分子演化中的应用 | 该文章创新性地探索了单细胞转录组测序技术在揭示精子发生细胞异质性及其分子演化过程中的作用 | 文章主要为综述,缺乏实验数据支持 | 阐明单细胞RNA测序在哺乳动物精子发生中的调控机制 | 精子发生细胞及其生态位细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
11167 | 2024-08-05 |
Meiotic transcriptional reprogramming mediated by cell-cell communications in humans and mice revealed by scATAC-seq and scRNA-seq
2024-May-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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研究论文 | 本研究通过scATAC-seq和scRNA-seq揭示了人类和小鼠中的减数分裂转录重编程受到细胞间通讯的介导 | 首次展示了精原细胞在减数分裂早期阶段重编程的转录变化以及Sertoli细胞与生殖细胞之间信号的角色 | 对减数分裂调控机制的深入了解仍然有限,需要更多研究来确认发现 | 研究减数分裂过程中转录重编程的机制及其与生殖细胞功能的关系 | 人类和小鼠的精巢组织中的减数分裂细胞 | 数字病理学 | 无阻塞性无精症 | scATAC-seq和scRNA-seq | NA | 细胞数据 | 人类和小鼠的精巢组织样本 |
11168 | 2024-08-04 |
Clinically relevant molecular hallmarks of PFA ependymomas display intratumoral heterogeneity and correlate with tumor morphology
2024-01-24, Acta neuropathologica
IF:9.3Q1
DOI:10.1007/s00401-023-02682-x
PMID:38265527
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研究论文 | 本文探讨了后颅窝A型(PF-EPN-A)ependymoma的分子特征及其肿瘤内部异质性与肿瘤形态之间的关联。 | 研究揭示了PF-EPN-A肿瘤内部的异质性以及其与肿瘤形态的临床相关性,尤其在细胞密度及其不同区域的DNA甲基化差异方面。 | 研究主要集中在113个样本,可能无法全面代表所有PF-EPN-A病例的分子特征。 | 识别PFA ependymomas中形态不同区域的分子差异及其临床意义。 | 分析113个PF-EPN-A样本以及40个相关复发样本。 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、拷贝数分析和原位荧光杂交(FISH) | NA | 组织样本 | 113个PF-EPN-A样本,包括40个复发样本 |
11169 | 2024-08-05 |
Novel lissencephaly-associated NDEL1 variant reveals distinct roles of NDE1 and NDEL1 in nucleokinesis and human cortical malformations
2024-01-09, Acta neuropathologica
IF:9.3Q1
DOI:10.1007/s00401-023-02665-y
PMID:38194050
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研究论文 | 该研究识别了第一个与大脑皮层发育不良相关的NDEL1变异,并阐明了NDE1和NDEL1在细胞核运动和人类皮层畸形中的不同作用 | 首次识别了与大脑皮层回归症相关的NDEL1变异,揭示了NDE1和NDEL1在细胞核运动中的独特角色 | 未涉及NDEL1变异在其他类型发育不良中的潜在作用 | 研究NDE1和NDEL1在神经细胞迁移和皮层畸形发病机制中的作用 | 两个携带相同de novo体细胞马赛克NDEL1变异的患者 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和空间转录组分析 | NA | NA | 两个患者 |
11170 | 2024-08-04 |
A pan-cancer single-cell transcriptional analysis of antigen-presenting cancer-associated fibroblasts in the tumor microenvironment
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1372432
PMID:38903527
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析肿瘤微环境中的抗原呈递癌相关成纤维细胞(apCAFs) | 首次深入解析了apCAFs在不同实体肿瘤类型中的作用及其与抗肿瘤效应的关系 | 研究主要依赖公共数据库的数据,可能存在数据的偏倚或不完整 | 探讨apCAFs在肿瘤微环境中的作用及其对免疫治疗的潜在影响 | 不同类型实体肿瘤中的抗原呈递癌相关成纤维细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 9种不同类型的实体肿瘤数据集 |
11171 | 2024-08-04 |
Investigating cellular similarities and differences between upper tract urothelial carcinoma and bladder urothelial carcinoma using single-cell sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1298087
PMID:38903524
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析了上尿路尿路上皮癌(UTUC)和膀胱尿路上皮癌(BLCA)之间的细胞相似性和差异 | 发现了UTUC和BLCA在细胞身份、免疫微环境和MARCKS表达模式方面的明显差异 | 样本量较小,仅分析了三例UTUC病例和四个正常输尿管组织 | 探讨UTUC的分子过程,识别UTUC与BLCA之间的生物学差异 | 上尿路尿路上皮癌和膀胱尿路上皮癌的细胞及其微环境 | 数字病理学 | 尿路癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 三例UTUC病例和四个正常输尿管组织 |
11172 | 2024-08-05 |
Retinal ganglion cell type-specific expression of synuclein family members revealed by scRNA-sequencing
2024, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.95598
PMID:38903914
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析探讨了视网膜神经节细胞中突触素家族成员的表达模式和作用 | 利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析视网膜细胞中突触素的表达,专注于视网膜神经节细胞亚型 | 对于突触素家族成员在视网膜中的确切位置和作用仍缺乏全面理解 | 研究突触素家族成员在视网膜神经节细胞中的表达模式 | 健康和受伤视网膜中的视网膜神经节细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 人类、鼠和鸡的视网膜样本 |
11173 | 2024-08-05 |
Immune cell related signature predicts prognosis in esophageal squamous cell carcinoma based on single-cell and bulk-RNA sequencing
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1370801
PMID:38903709
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研究论文 | 该文章探讨了免疫细胞相关基因在食管鳞状细胞癌中的预后作用。 | 文章创新性地提出了一个由免疫相关基因构成的预后模型,识别出CTSC、ALOX12和RMND5B作为与预后相关的基因。 | 文章没有详细说明样本的多样性和选择偏倚的可能性。 | 研究食管鳞状细胞癌中免疫细胞相关基因的作用及其对预后的影响。 | 主要研究对象为食管鳞状细胞癌患者的免疫细胞相关基因。 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞转录组测序与大规模RNA测序 | Cox模型 | 基因表达数据 | 数据来源于多个公共数据库,总计分析了3915个DEGs |
11174 | 2024-08-04 |
Mapping visual functions onto molecular cell types in the mouse superior colliculus
2023-06-21, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2023.03.036
PMID:37086721
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研究论文 | 本研究揭示了小鼠上丘的不同神经元亚型及其在视觉功能中的角色 | 研究首次通过单细胞转录组学识别了28种神经元亚型,并提出小鼠上丘内抑制性神经元分子亚型的功能组织逻辑 | 研究主要集中在小鼠模型上,结果可能不适用于其他物种 | 探讨小鼠上丘神经元在视觉处理中的分子功能 | 成年小鼠的上丘神经元亚型及其对应的标记基因 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因转录数据 | 数万个成年小鼠上丘神经元 |
11175 | 2024-08-04 |
Dysregulation of phosphoenolpyruvate carboxykinase in cancers: A comprehensive analysis
2024-Aug, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111198
PMID:38697449
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研究论文 | 这篇文章全面分析了磷酸烯醇丙酮酸羧化酶在癌症中的失调及其潜在机制 | 本研究揭示了PEPCK在不同癌症类型中的表达与临床预后、基因突变及免疫细胞浸润的相关性,并确定了可能的预测生物标志物 | 尚未深入探讨PEPCK的机制以及在所有癌种中的具体功能 | 研究PEPCK在不同癌症类型中的表达模式及其与临床相关性的关系 | 涉及33种不同类型癌症的PEPCK基因表达分析 | 数字病理学 | NA | TCGA数据分析、单细胞测序 | NA | 基因表达数据、临床数据 | 33种不同类型癌症的数据集 |
11176 | 2024-08-04 |
Blocking the MIR155HG/miR-155 axis reduces CTGF-induced inflammatory cytokine production and α-SMA expression via upregulating AZGP1 in hypertrophic scar fibroblasts
2024-Aug, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111202
PMID:38729323
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研究论文 | 本文探讨了MIR155HG/miR-155轴在增生性瘢痕成纤维细胞中调节细胞因子和α-SMA表达的机制 | 发现MIR155HG在增生性瘢痕组织中由于DNA甲基化降低而上调,并通过调控miR-155-5p/-3p及AZGP1影响细胞因子产生 | 研究主要集中在体外模型,可能无法完全反映体内的复杂生理环境 | 探讨MIR155HG在增生性瘢痕中的作用及其潜在的机制 | 增生性瘢痕成纤维细胞(HSFBs)及其在细胞因子产生中的作用 | 数字病理学 | NA | qRT-PCR, 西方印迹法, ELISA | NA | RNA测序数据 | 使用临床样本和各种细胞类型的单细胞测序数据 |
11177 | 2024-08-05 |
CXCR4-mediated neutrophil dynamics in periodontitis
2024-Aug, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111212
PMID:38719020
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研究论文 | 本研究旨在通过生物信息学方法识别与免疫相关的致病基因,并分析牙周炎中的免疫细胞浸润与功能 | 首次证明了CXCR4在牙周炎中的重要致病作用,以及其在调节中性粒细胞动态中的潜在功能 | 研究中主要依赖于生物信息学分析和动物模型,临床应用效果仍需进一步验证 | 识别与牙周炎相关的关键免疫致病基因 | 牙周炎中的中性粒细胞及其相关的免疫反应 | 数字病理学 | 牙周炎 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 临床样本和小鼠牙周炎模型 |
11178 | 2024-08-05 |
Ultrasound Neuromodulation of an Anti-Inflammatory Pathway at the Spleen Improves Experimental Pulmonary Hypertension
2024-Jun-21, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.323679
PMID:38712557
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研究论文 | 研究进行了脾脏的非侵入性聚焦超声刺激对实验性肺动脉高血压的影响 | 首次探讨了通过超声神经调节抑制脾脏的抗炎途径来改善实验性肺动脉高血压的潜力 | 主要在动物模型中进行,结果是否适用于人类尚需进一步验证 | 旨在探索非侵入性超声刺激对肺动脉高血压的治疗潜力 | 大鼠实验模型,包括Sugen/hypoxia模型和单克痕模型 | 数字病理学 | 肺动脉高血压 | 聚焦超声刺激 | NA | 组织学、免疫组化、流式细胞术、单细胞RNA测序 | 大鼠样本,具体数量未提供 |
11179 | 2024-08-05 |
3D reconstruction of the mouse cochlea from scRNA-seq data suggests morphogen-based principles in apex-to-base specification
2024-Jun-17, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.03.028
PMID:38593801
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研究论文 | 本文探讨了小鼠耳蜗的三维重建,并提出了形态发生因子在耳蜗自顶到基底特征中的作用 | 创新之处在于通过scRNA-seq数据重建耳蜗,揭示了形态发生因子在空间身份赋予中的重要作用 | 无法完全明确调控小鼠耳蜗音调基因表达的分子机制 | 研究小鼠耳蜗中音调基因表达的分子机制 | 小鼠耳蜗的发育和相关的基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | E12.5和E14.5时间点的数据 |
11180 | 2024-08-05 |
Identification and characterization of intermediate states in mammalian neural crest cell epithelial to mesenchymal transition and delamination
2024-Jun-14, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.92844
PMID:38873887
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研究论文 | 该文章研究了哺乳动物神经脊细胞的上皮-间质转化及分层过程中的中间状态 | 首次通过单细胞RNA测序识别了神经脊细胞的中间状态,并在体内定位 | 目前对于中间状态在发育上皮-间质转化中的存在尚不清楚 | 探讨神经脊细胞上皮-间质转化过程中是否存在中间状态 | 小鼠胚胎中的神经脊细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠胚胎 |