单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 10941 - 10960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10941 | 2024-08-04 |
Characterizing hub biomarkers for post-transplant renal fibrosis and unveiling their immunological functions through RNA sequencing and advanced machine learning techniques
2024-02-20, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-04971-9
PMID:38378674
|
研究论文 | 本文探讨了肾移植后肾纤维化的中心生物标志物及其免疫功能 | 识别了与肾纤维化相关的四个核心基因及其潜在的有效小分子，提出了新的研究思路 | 缺乏临床数据验证所识别生物标志物的实用性 | 研究肾移植后肾纤维化的生物标志物及其机制 | 聚焦于肾纤维化患者的基因组数据和小鼠模型 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | RNA测序、单细胞测序、加权基因共表达网络分析 (WGCNA) | NA | 转录组数据 | 从NCBI基因表达综合体 (GEO) 获取的多名患者的数据和小鼠模型 |
| 10942 | 2024-08-04 |
Senescent fibroblast facilitates re-epithelization and collagen deposition in radiation-induced skin injury through IL-33-mediated macrophage polarization
2024-02-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-04972-8
PMID:38369466
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研究论文 | 这篇文章探讨了衰老成纤维细胞在辐射诱导的皮肤损伤中的作用 | 本研究揭示了p16表达的衰老成纤维细胞通过分泌IL-33促进辐射诱导的皮肤愈合的机制 | 本研究的限制在于未完全阐明所有潜在的细胞机制和其他因素 | 研究衰老细胞在辐射诱导的皮肤损伤中的作用及其机制 | 辐射诱导的皮肤损伤中的衰老成纤维细胞及其对愈合过程的影响 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序, 转录组测序 | NA | 单细胞数据, 组学数据 | NA |
| 10943 | 2024-08-05 |
Diffuse large B-cell lymphoma: the significance of CD8+ tumor-infiltrating lymphocytes exhaustion mediated by TIM3/Galectin-9 pathway
2024-02-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05002-3
PMID:38369502
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研究论文 | 本研究探讨了TIM3/Galectin-9通路在弥漫大B细胞淋巴瘤中对CD8+肿瘤浸润淋巴细胞疲惫的意义 | 首次揭示了TIM3/Galectin-9通路在CD8+肿瘤浸润淋巴细胞疲惫及免疫逃逸中的关键作用 | 对TIM3介导的CD8+TILs疲惫机制的理解仍然较为有限 | 明确TIM3介导的CD8+TILs疲惫的潜在通路及其在弥漫大B细胞淋巴瘤中的重要性 | 研究对象为弥漫大B细胞淋巴瘤中的CD8+肿瘤浸润淋巴细胞 | 数字病理学 | 弥漫大B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序，RNA测序 | NA | RNA，免疫组化 | NA |
| 10944 | 2024-08-05 |
Potential crosstalk between SPP1 + TAMs and CD8 + exhausted T cells promotes an immunosuppressive environment in gastric metastatic cancer
2024-02-16, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04688-1
PMID:38365757
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研究论文 | 本文研究了SPP1+ TAM与CD8+衰竭T细胞在胃癌转移中的相互作用及其免疫抑制环境的影响 | 首次揭示了SPP1+ TAMs与CD8+衰竭T细胞之间的相互作用及其在胃癌转移中的免疫抑制作用 | 研究主要依赖于动物模型，可能存在物种间差异 | 探讨SPP1+ TAM在胃癌转移中的作用 | SPP1+ TAM和CD8+衰竭T细胞的相互作用 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞转录组分析和动物模型 | NA | 转录组数据 | NA |
| 10945 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome analysis reveals immunosuppressive landscape in overweight and obese colorectal cancer
2024-02-04, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-04921-5
PMID:38311726
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研究论文 | 本研究探讨了超重和肥胖结直肠癌（CRC）的免疫抑制环境和代谢特征 | 首次在单细胞层面揭示了超重和肥胖CRC的免疫抑制微环境和特定代谢重编程 | 样本量相对较小，仅包括15名超重/肥胖及15名正常体重CRC患者 | 深入理解超重和肥胖CRC的肿瘤特征以推动更有效的治疗方案 | 超重/肥胖及正常体重的结直肠癌患者的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞转录组数据 | 192,785个细胞，来自30名CRC患者的样本 |
| 10946 | 2024-08-05 |
A fast, scalable and versatile tool for analysis of single-cell omics data
2024-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-02139-9
PMID:38191932
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研究论文 | 本文介绍了一种用于单细胞组学数据分析的非线性降维算法SnapATAC2 | 该算法在提高单细胞组学数据异质性捕捉精度的同时，确保了运行时和内存使用的高效性 | 传统降维技术在计算效率和生物多样性描述上仍面临挑战 | 研究单细胞组学数据的降维与细胞异质性分析 | 多种单细胞组学数据集，包括单细胞RNA测序等 | 数字病理 | NA | 单细胞组学技术 | 非线性降维算法 | 组学数据 | 多个单细胞组学数据集 |
| 10947 | 2024-08-05 |
Prognostic and predictive value of super-enhancer-derived signatures for survival and lung metastasis in osteosarcoma
2024-01-22, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-04902-8
PMID:38254188
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研究论文 | 本研究探讨了超增强子衍生签名在骨肉瘤生存和肺转移中的预后和预测价值 | 该研究开发了基于超增强子的预后签名，显著提高了骨肉瘤患者的预后准确性 | 本研究仅基于回顾性分析，缺乏前瞻性验证 | 提高骨肉瘤患者的预后评估准确性 | 研究对象为212名接受标准治疗的骨肉瘤患者 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | RNA-seq | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 212名骨肉瘤患者的样本 |
| 10948 | 2024-08-05 |
The role of immune cells in different stages of atherosclerosis
2024, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.94570
PMID:38774746
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综述 | 本文探讨了免疫细胞在动脉粥样硬化不同阶段的作用 | 强调了免疫细胞亚型的多样性及其在动脉粥样硬化进展中的适应性 | 未详细探讨临床应用的具体策略 | 理解免疫细胞及其亚型如何影响动脉粥样硬化的发展 | 关注动脉粥样硬化病变内的免疫细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 高维质谱和单细胞RNA测序 | NA | 细胞、组织样本 | 利用动脉粥样硬化病变中的白血球样本 |
| 10949 | 2024-08-04 |
Hofbauer cells and fetal brain microglia share transcriptional profiles and responses to maternal diet-induced obesity
2023-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.16.571680
PMID:38187648
|
研究论文 | 本研究探讨了母体饮食诱导肥胖对胎儿大脑小胶质细胞和霍夫鲍尔细胞的转录组影响 | 首次证明霍夫鲍尔细胞可以作为胎儿大脑小胶质细胞发育的非侵入性生物标志物 | 研究主要基于小鼠模型，尚需在其他动物模型或人类中验证 | 识别反映胎儿大脑小胶质细胞程序的非侵入性生物标志物以支持干预 | 小鼠模型中的胎儿大脑小胶质细胞和胎盘霍夫鲍尔细胞 | 数字病理学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用小鼠模型进行的实验，样本数量未详细说明 |
| 10950 | 2024-08-05 |
Single-cell profiling reveals the impact of genetic alterations on the differentiation of inflammation-induced colon tumors
2023-Dec-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.30.569463
PMID:38077052
|
研究论文 | 这篇文章揭示了遗传改变对炎症诱导的结肠肿瘤分化的影响 | 首次使用单细胞RNA测序分析了不同遗传突变在结肠肿瘤细胞分化中的作用 | 研究仅基于小鼠模型，可能无法完全反映人类结肠癌的形成机制 | 探索炎症诱导的结肠肿瘤中遗传突变与细胞分化之间的关系 | 使用小鼠模型研究具有不同遗传突变的结肠肿瘤 | 数字病理学 | 结肠癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 不同突变类型的结肠肿瘤样本 |
| 10951 | 2024-08-05 |
Neural stem cells persist to generate new neurons in the hippocampus of adult and aged human brain - Fiction or accurate?
2023-12, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2023.102133
PMID:38000512
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综述 | 该综述讨论了成人神经发生的主要发现，强调了在理解脑部可塑性和相关疾病机制方面的重要发现和争议 | 文章总结了过去四十年关于成人神经发生的研究进展和方法论改进，揭示了其在学习、记忆和情绪中的作用 | 尚未确认成人和老年人类海马体内的强神经发生，且需要更多大规模研究来验证其存在及在不同神经疾病中的作用 | 旨在深入了解成人神经发生及其在认知功能和神经疾病中的角色 | 成人及老年人类的海马神经发生 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序、单细胞核RNA测序、空间转录组学 | NA | NA | 大规模研究的海马组织样本 |
| 10952 | 2024-08-05 |
Genomic and transcriptomic advances in amyotrophic lateral sclerosis
2023-12, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2023.102126
PMID:37972860
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研究论文 | 本文综述了基因组学、表观基因组学、转录组学和微RNA在肌萎缩侧索硬化症(ALS)研究中的应用 | 提出了微RNA作为潜在生物标志物和分子干预的有前景工具 | 至今尚缺乏有效的ALS治疗方法 | 深入探讨ALS的发展和维持的分子机制 | 与ALS发病机制相关的主要基因及其表观修饰 | 数字病理学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 高通量测序技术 | 体外及体内模型 | 基因组数据，转录组数据 | NA |
| 10953 | 2024-08-05 |
Development of a Nanoparticle-Based Tendon-Targeting Drug Delivery System to Pharmacologically Modulate Tendon Healing
2023-Nov-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.29.569204
PMID:38076889
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研究论文 | 该文章讨论了一种基于纳米颗粒的药物递送系统，旨在靶向促进腱的愈合 | 创新地利用TRAP结合肽功能化纳米颗粒，实现了对腱的靶向药物递送 | 目前仅在小鼠模型中测试，临床应用的可行性尚未确定 | 研究旨在提高腱愈合过程中的药物递送效率 | 研究对象为腱损伤后的愈合过程 | 数字病理学 | NA | 纳米颗粒药物递送系统 | NA | 实验数据 | 小鼠模型 |
| 10954 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis characterizes PLK1 as a catalyst of an immunosuppressive tumor microenvironment in LUAD
2023-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.02.551692
PMID:37577553
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研究论文 | 这篇文章揭示了PLK1在肺腺癌中作为免疫抑制肿瘤微环境的催化剂的作用 | 本文首次阐明了PLK1在调控肿瘤免疫和肿瘤微环境中的新作用 | 对PLK1与肿瘤微环境之间复杂相互作用的理解仍不完整 | 研究PLK1在肺腺癌中的作用及其对免疫微环境的影响 | 使用基因工程小鼠模型和单细胞RNA测序分析探索PLK1的功能 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA-seq | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据 | NA |
| 10955 | 2024-08-05 |
Tumor gene signatures that correlate with release of extracellular vesicles shape the immune landscape in head and neck squamous cell carcinoma
2023-07-05, Clinical and experimental immunology
IF:3.4Q3
DOI:10.1093/cei/uxad019
PMID:36752300
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研究论文 | 这项研究评估了与肿瘤释放的细胞外小泡相关的基因特征对抗肿瘤免疫反应的临床相关性和影响 | 研究揭示了肿瘤基因特征与细胞外小泡产生之间的关系，及其如何影响免疫细胞浸润和抗肿瘤免疫 | 样本来源限制于单一的癌症基因组图谱和几个小型数据集，可能影响结果的广泛适用性 | 探讨头颈鳞状细胞癌中基因特征与细胞外小泡释放的相关性及其对免疫反应的影响 | 头颈鳞状细胞癌患者的基因表达和免疫细胞浸润 | 数字病理学 | 头颈癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 522名患者（癌症基因组图谱），250名患者（GSE65858数据集），18名患者（单细胞RNA测序数据集） |
| 10956 | 2024-08-04 |
Polymorphic KIR3DL3 expression modulates tissue-resident and innate-like T cells
2023-06-30, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.ade5343
PMID:37390222
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研究论文 | 本研究探讨了多态性KIR3DL3的表达对组织驻留和类固有T细胞的调节作用 | 首次揭示了KIR3DL3在γδ和CD8 T细胞中的高表达及其抑制T细胞受体刺激的功能 | 未能检测到KIR3DL3多态性对配体结合的影响 | 研究KIR3DL3的表达特征及其生物学功能 | 主要对象是KIR3DL3表达的γδ和CD8 T细胞 | 免疫学 | NA | 高分辨率流式细胞术和单细胞转录组测序 | NA | 细胞 | 涉及少量的KIR3DL3表达细胞 |
| 10957 | 2024-08-05 |
Basement membrane proteins in extracellular matrix characterize NF1 neurofibroma development and response to MEK inhibitor
2023-06-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI168227
PMID:37140985
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研究论文 | 本研究系统调查了在神经纤维瘤发展过程中的细胞外基质(ECM)的富集情况 | 发现基底膜(BM)蛋白是上调的ECM成分，而非主要胶原亚型，并且确定了TGF-β1信号在ECM动态中的作用 | 关于神经纤维瘤发展和治疗反应过程中ECM沉积机制的了解仍然有限 | 研究NF1神经纤维瘤中ECM的变化及其对MEK抑制剂治疗的反应 | 以神经纤维瘤的发育和MEK抑制剂的响应为研究对象 | 数字病理学 | 神经纤维瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组学数据 | NA |
| 10958 | 2024-08-05 |
Regionally distinct progenitor cells in the lower airway give rise to neuroendocrine and multiciliated cells in the developing human lung
2023-06-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2210113120
PMID:37279279
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研究论文 | 本文描述了在发育中的人类肺部下气道中富集的一种细胞 | 通过单细胞条形码谱系追踪方法，揭示了该细胞与基底细胞的不同分化潜能 | 研究未明确指出具体的局限性 | 研究下气道中细胞的分化潜力及其在上皮多样性中的作用 | 发育中的人类肺部下气道细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和显微镜 | NA | 细胞 | NA |
| 10959 | 2024-08-05 |
Improving head and neck cancer therapies by immunomodulation of the tumour microenvironment
2023-03, Nature reviews. Cancer
DOI:10.1038/s41568-022-00531-9
PMID:36456755
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研究论文 | 本文探讨了通过免疫调节肿瘤微环境改善头颈部癌症治疗的策略 | 文章创新性在于全面分析了头颈部鳞状细胞癌的肿瘤微环境，包括免疫与非免疫细胞的相互作用 | 研究中可能存在样本选择的影响，以及对于小规模的不同TME特征的个体化分析不足 | 研究目的是提高头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤特异性T细胞反应 | 研究对象为头颈部鳞状细胞癌患者及其TME | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序，高维流式细胞术，空间多光谱成像 | NA | 数据集 | 利用了癌症基因组图谱等丰富的数据资源进行分析 |
| 10960 | 2024-08-05 |
A robust model for cell type-specific interindividual variation in single-cell RNA sequencing data
2023-Feb-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.24.529987
PMID:36909553
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研究论文 | 本研究开发了一个新的模型CTMM，以检测和量化个体间的细胞类型特异性变异 | 创新点在于提出了CTMM模型，可以在单细胞RNA测序数据中识别个体之间的细胞类型特异性变异 | 样本规模较小可能会对结果的普适性产生影响 | 研究的目的是提高统计能力，以识别细胞类型特异性的生物学特征 | 研究对象为人类诱导多能干细胞中的转录组变异 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | CTMM | 转录组数据 | NA |