单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 10921 - 10940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10921 | 2024-08-05 |
deMULTIplex2: robust sample demultiplexing for scRNA-seq
2023-Apr-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.11.536275
PMID:37090649
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研究论文 | 本文介绍了deMULTIplex2，这是一种针对scRNA-seq数据的强健样本去重技术 | deMULTIplex2引入了一种机制指导的分类算法，在各种具有挑战性的数据集上能够恢复更多的细胞 | 未提及特定的局限性 | 研究开发一种高效的样本去重算法以提高单细胞RNA测序的准确性 | 针对单细胞RNA测序的多重样本数据集 | 数字病理学 | NA | 随机化分位数残差 | 广义线性模型与期望最大化 | 数据集 | 使用了模拟和真实数据集进行基准分析 |
| 10922 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics unveils xylem cell development and evolution
2023-01-09, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02845-1
PMID:36624504
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研究论文 | 该研究揭示了木质部细胞在不同植物物种中的发育谱系和进化关系 | 通过单细胞转录组学和激光捕获微切割技术，首次解析了多个木本被子植物的木质部细胞发育谱系 | 研究主要集中在有限数量的木本被子植物上，可能无法全面代表所有植物的木质部细胞发展 | 探索不同植物的木质部细胞类型的发育和进化过程 | 四种不同的木本被子植物的木质部细胞类型 | 数字植物学 | NA | 单细胞转录组分析，激光捕获微切割 | NA | 转录组数据 | 四种木本被子植物的多个样本 |
| 10923 | 2024-08-05 |
H2-O deficiency promotes regulatory T cell differentiation and CD4 T cell hyperactivity
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1304798
PMID:38250071
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研究论文 | 本研究揭示了H2-O缺乏如何增强胸腺调节性T细胞的分化及CD4 T细胞的活性 | 首次提供了H2-O在胸腺调节性T细胞发育中的直接证据 | 缺乏对其他潜在机制的综合考虑 | 深入理解H2-O缺乏对自体免疫性疾病的影响 | 主要研究胸腺调节性T细胞及外周CD4 T细胞 | 免疫学 | 自体免疫疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA数据 | NA |
| 10924 | 2024-08-05 |
A new gene set identifies senescent cells and predicts senescence-associated pathways across tissues
2022-08-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-32552-1
PMID:35974106
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研究论文 | 本研究生成了一组基因集(SenMayo)，用于识别衰老细胞并预测组织中的衰老相关通路 | 该基因集能在不同组织和物种中高效识别衰老细胞，具有重要的临床应用潜力 | 尚未讨论SenMayo在其他组织类型的识别能力 | 研究衰老细胞的识别和衰老相关通路的预测 | 研究对象包括人类和小鼠的骨髓及骨组织的衰老细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因数据 | 来自两个老年人类队列的骨组织活检和小鼠的基因样本 |
| 10925 | 2024-08-05 |
Spatial Transcriptomics and In Situ Sequencing to Study Alzheimer's Disease
2020-08-20, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.06.038
PMID:32702314
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研究论文 | 本文研究了阿尔茨海默病小鼠模型中，淀粉样斑块周围的转录变化 | 提供了一种前所未有的方法，通过空间转录组学分析解开阿尔茨海默病及其他脑部疾病致病标志物附近的失调细胞网络 | 该研究主要基于小鼠模型，临床应用可能受限 | 探讨阿尔茨海默病相关的分子变化和细胞相互作用 | 以阿尔茨海默病小鼠模型为研究对象 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学和原位测序 | NA | 组织样本 | 涉及小鼠和人类脑切片 |
| 10926 | 2024-08-05 |
Efficient Generation and Transcriptomic Profiling of Human iPSC-Derived Pulmonary Neuroendocrine Cells
2020-May-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101083
PMID:32380423
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研究论文 | 本研究展示了如何通过诱导性多能干细胞生成肺神经内分泌细胞，并进行了转录组特征分析 | 本研究首次利用诱导性多能干细胞生成并表征肺神经内分泌细胞，提供了全新的细胞模型 | 该研究未在临床样本中验证生成的细胞功能 | 研究肺神经内分泌细胞的发生和其在肺部疾病中的作用 | 诱导性多能干细胞衍生的肺神经内分泌细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | iPNECs | 转录组数据 | NA |
| 10927 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing reveals the correlation of aggrephagy signaling and multiple myeloma immune microenvironment composition
2024-Jul, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3712
PMID:38949072
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研究论文 | 本研究揭示了聚合自噬信号与多发性骨髓瘤免疫微环境成分之间的相关性 | 首次揭示了聚合自噬在多发性骨髓瘤中的作用以及其与免疫微环境和疾病预后的关系 | 尚未全面证明聚合自噬在多发性骨髓瘤中的所有作用 | 研究聚合自噬信号与多发性骨髓瘤免疫微环境的相关性及其对疾病预后的影响 | 包含来自七个多发性骨髓瘤骨髓样本和七个健康骨髓样本的12,187个单细胞的RNA-seq数据 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 12,187个单细胞样本 |
| 10928 | 2024-08-05 |
Activated Clec4nhi Neutrophils Aggravate Lung Injury in an Endothelial IGFBP7-Dependent Manner
2024-Jul, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0017OC
PMID:38574235
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研究论文 | 本研究探讨了内皮细胞亚型在急性肺损伤中的作用，尤其是IGFBP7在调节炎症反应和屏障功能中的影响 | 揭示了IGFBP7在不同类型内皮细胞中的差异表达及其在急性肺损伤中引发的炎症和屏障功能障碍 | 具体亚型的内皮细胞在临床上的作用仍需进一步研究 | 研究IGFBP7在急性肺损伤中的角色及其潜在的治疗靶点 | 急性肺损伤模型中的内皮细胞和炎症细胞 | 数字病理学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 用脂多糖建立的急性肺损伤模型小鼠 |
| 10929 | 2024-08-05 |
Vagus nerve modulates acute-on-chronic liver failure progression via CXCL9
2024-Jun-28, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003104
PMID:38945689
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研究论文 | 本研究探讨迷走神经如何通过CXCL9调节急性慢性肝衰竭的进展。 | 本研究首次揭示了迷走神经-巨噬细胞-CXCL9轴在急性慢性肝衰竭发展中的作用。 | 本研究的局限性在于缺乏对人类样本的广泛验证。 | 研究迷走神经在急性慢性肝衰竭中的神经免疫交互作用。 | 急性慢性肝衰竭模型小鼠和人类患者。 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), CRISPR/Cas9技术 | NA | 蛋白质组学数据 | ACLF模型小鼠和患者样本 |
| 10930 | 2024-08-05 |
Cellular and transcriptional profiles of peripheral blood mononuclear cells pre-vaccination predict immune response to preventative MUC1 vaccine
2024-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.14.598031
PMID:38948837
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研究论文 | 这项研究探讨了预接种外周血单核细胞的细胞和转录组特征，以预测对MUC1疫苗的免疫反应 | 首次揭示了在恶性前期环境中，免疫系统可能已经受到抑制，并确定了预测免疫反应的潜在生物标志物 | 样本量较小，且仅在特定人群中进行研究，可能不具普遍适用性 | 研究MUC1肿瘤抗原疫苗的免疫反应预测因子 | 来自16名免疫反应者和16名非响应者的预接种外周血单核细胞样本 | 数字病理学 | 大肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞生物学数据 | 32个样本（16名免疫响应者和16名非响应者） |
| 10931 | 2024-08-05 |
Hypoxia inducible factor 2α promotes tolerogenic macrophage development during cardiac transplantation through transcriptional regulation of colony stimulating factor 1 receptor
2024-Jun-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2319623121
PMID:38889142
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研究论文 | 这篇文章探讨了低氧诱导因子2α(HIF-2α)在心脏移植过程中促进耐受性巨噬细胞发育的机制 | 文章首次揭示了HIF-2α作为耐受性单核细胞的关键转录因子，并与CSF1R的表达调控相联系 | 研究中使用的小鼠模型可能限制了结果在临床转化中的适用性 | 探讨介导移植耐受的不同因素 | 急性排斥或耐受性的心脏同种异体移植物 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及急性拒绝或耐受心脏同种异体移植物的样本数量未指定 |
| 10932 | 2024-08-04 |
Development of a nanoparticle-based tendon-targeting drug delivery system to pharmacologically modulate tendon healing
2024-Jun-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn2332
PMID:38896625
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研究论文 | 开发了一种基于纳米粒子的肌腱靶向药物传递系统以药理调节肌腱愈合 | 首次利用TRAP结合肽功能化的纳米粒子药物传递系统改善肌腱的药物靶向性 | 研究主要基于实验室数据，临床应用效果尚待进一步验证 | 提高肌腱愈合过程中的药物传递效率 | 急性肌腱损伤后的愈合过程 | 数字病理学 | NA | 纳米粒子药物传递系统 | NA | NA | NA |
| 10933 | 2024-08-05 |
A single-cell atlas of the murine pancreatic ductal tree identifies novel cell populations with potential implications in pancreas regeneration and exocrine pathogenesis
2024-Jun-20, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.06.008
PMID:38908487
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研究论文 | 本研究构建了小鼠胰腺导管树的单细胞图谱，识别了具有潜在胰腺再生和外分泌病理学影响的新细胞群体 | 首次识别出15种新型胰腺导管细胞群体及其在胰腺再生和外分泌病理中的潜在作用 | 尚未在体内进一步验证这些新细胞群体的特定功能 | 旨在全面表征小鼠胰腺导管的单细胞异质性及其在再生和病理中的作用 | 研究对象包括小鼠胰腺的导管细胞和胰腺肿瘤样本 | 数字病理学 | 胰腺疾病 | scRNA-seq | NA | 细胞 | 包括健康胰腺、慢性胰腺炎和肿瘤样本的多个细胞群体 |
| 10934 | 2024-08-05 |
A robust model for cell type-specific interindividual variation in single-cell RNA sequencing data
2024-Jun-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49242-9
PMID:38898015
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研究论文 | 本研究开发了一种新模型CTMM，用于检测和量化单细胞RNA测序中的细胞类型特异性个体间变异 | 提出了一种新的细胞类型特异性线性混合模型CTMM，用于深入理解细胞类型特异性的生物学 | 样本量有限可能影响细胞类型特异性个体间变异的检测精度 | 阐明细胞类型特异性生物学，并识别与复杂性状相关的基因和细胞类型 | 人诱导多能干细胞中细胞分化为内胚层时的转录组变异 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 细胞类型特异性线性混合模型 (CTMM) | 转录组数据 | 使用人诱导多能干细胞的有限样本进行研究 |
| 10935 | 2024-08-05 |
Patho-transcriptomic analysis of invasive mucinous adenocarcinoma of the lung (IMA): comparison with lung adenocarcinoma with signet ring cell features (SRCC)
2024-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.13.598839
PMID:38948839
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研究论文 | 该论文分析了侵袭性粘液腺癌（IMA）与具有印戒细胞特征的肺腺癌（SRCC）之间的病理转录组学比较。 | 通过Visium空间转录组学方法揭示了IMA和SRCC中存在的六种不同细胞簇，并识别了各自特征性基因的表达差异。 | 缺乏有效治疗IMA的措施，且在无法进行手术切除的情况下，研究重点可能受限于分子机制的完整性。 | 研究侵袭性粘液腺癌的分子机制及其与印戒细胞特征肺腺癌的差异。 | 侵袭性粘液腺癌（IMA）和具有印戒细胞特征的肺腺癌（SRCC）。 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 分析了两种腺癌类型的不同细胞群体，具体样本数量未提供 |
| 10936 | 2024-08-05 |
Gene Regulatory Programs that Specify Age-Related Differences during Thymocyte Development
2024-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.14.599011
PMID:38948840
|
研究论文 | 本研究构建了新生和成年小鼠T细胞发育程序的转录和表观遗传图谱 | 揭示了与年龄相关的不同基因调控程序的发生学，并识别出一个随年龄发散的基因模块 | 研究中可能未涵盖所有影响T细胞发育的因素 | 探讨年龄如何影响T细胞的发展 | 新生小鼠和成年小鼠的T细胞发育程序 | 数字病理学 | NA | CRISPR和单细胞RNA测序 | NA | 转录组和表观遗传数据 | 新生小鼠和成年小鼠的多样本 |
| 10937 | 2024-08-05 |
Tissue fibroblasts are versatile immune regulators: An evaluation of their impact on the aging process
2024-06, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2024.102296
PMID:38588867
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research paper | 本文章探讨了成纤维细胞作为免疫调节剂在老化过程中的作用 | 揭示了成纤维细胞在组织免疫和炎症中的多种功能及其在老化过程中的重要性 | 未明确提及具体的实验数据和样本量 | 探究成纤维细胞与免疫细胞在衰老过程中的相互作用 | 老化组织中分离的成纤维细胞 | 免疫学 | 衰老相关疾病 | 单细胞转录组研究 | NA | 基因表达数据 | 来自老化组织的成纤维细胞 |
| 10938 | 2024-08-05 |
Single-Cell Profiling Reveals the Impact of Genetic Alterations on the Differentiation of Inflammation-Induced Murine Colon Tumors
2024-May-28, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16112040
PMID:38893159
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研究论文 | 该研究揭示了基因突变如何影响炎症诱导的鼠类结肠肿瘤细胞分化 | 本研究首次明确了在炎症诱导的结肠肿瘤中，BLM和MSH2KO突变对肿瘤细胞分化的不同影响 | 研究主要基于鼠类模型，可能无法完全代表人类结肠癌的复杂性 | 探讨基因突变对炎症诱导的结肠肿瘤细胞分化的影响 | 以炎症诱导的鼠类结肠肿瘤为研究对象 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包含多种突变的鼠类肿瘤样本 |
| 10939 | 2024-08-04 |
Critical view on oligo(dT)-based RNA-seq: bias arising, modeling, and mitigating
2024-03-06, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyad190
PMID:37857456
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研究论文 | 本文探讨了基于oligo(dT)的RNA测序中存在的偏差及其缓解方法。 | 本研究识别了两个新的未被考虑的偏差，并发展出一种普适的缓解方法以减少这些偏差的影响。 | 研究可能未涵盖所有类型的RNA测序偏差，且其通用性需进一步验证。 | 研究的目的是理解和解决基于oligo(dT)的RNA测序数据中的偏差。 | 研究主要集中在单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据集及其分析上。 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 数据集 | NA |
| 10940 | 2024-08-05 |
ACC1-mediated fatty acid biosynthesis intrinsically controls thymic iNKT cell development
2024-Feb-21, International immunology
IF:4.8Q2
DOI:10.1093/intimm/dxad049
PMID:38041796
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研究论文 | 本研究发现ACC1在胸腺iNKT细胞发育中起关键作用 | 首次揭示了ACC1通过控制细胞生存来调控胸腺iNKT细胞发育的新功能 | 在小鼠模型中进行，可能不完全适用于人类 | 探讨代谢通路在iNKT细胞发育中的作用 | 小鼠模型中缺乏T细胞特异性ACC1的情况 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 小鼠模型（数量未具体说明） |