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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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10861 | 2024-08-05 |
Comprehensive transcriptional atlas of human adenomyosis deciphered by the integration of single-cell RNA-sequencing and spatial transcriptomics
2024-Jul-01, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwae012
PMID:38486356
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研究论文 | 本研究揭示了人类腺肌症的转录组特征,整合了单细胞RNA测序和空间转录组学 | 首次识别腺肌症病灶中的独特上皮和侵袭性基质亚群体,支持病因学中的‘内陷’与‘化生’理论的复杂相互作用 | 对腺肌症的研究仍处于起步阶段,相关理论存在争议 | 揭示腺肌症的转录组变化,为准确诊断与治疗策略的发展提供基础 | 研究了正常内膜、病灶及内膜-肌层交界处的转录组变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | RNA测序数据 | NA |
10862 | 2024-08-05 |
Deficiency of Secreted Phosphoprotein 1 Alleviates Hyperoxia-induced Bronchopulmonary Dysplasia in Neonatal Mice
2024-Jun-29, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-024-02088-1
PMID:38951356
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研究论文 | 该研究探讨了分泌型磷蛋白1(SPP1)在缺氧诱导的支气管肺发育不良(BPD)中的作用 | 研究首次揭示了SPP1在BPD进展中的重要作用,表明其可能作为新的治疗靶标 | 没有具体提到研究的样本量限制或实验条件的详细限制 | 探索SPP1在缺氧诱导的支气管肺发育不良中的作用及其机制 | 新生小鼠以及在不同氧气条件下的肺组织和细胞 | 数字病理 | 肺部疾病 | scRNA-seq | 小鼠模型 | 组织样本 | 新生小鼠及人类BPD患者组织样本 |
10863 | 2024-08-05 |
Mesenchymal stem cells-extracellular vesicles alleviate pulmonary fibrosis by regulating immunomodulators
2024-Jun-26, World journal of stem cells
IF:3.6Q3
DOI:10.4252/wjsc.v16.i6.670
PMID:38948098
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研究论文 | 本研究探讨了间充质干细胞外泌体(MSC-EVs)在减轻肺纤维化中的治疗潜力 | 本研究首次系统评估了MSC-EVs对肺纤维化、氧化应激和免疫炎症的影响 | 研究中未明确描述MSC-EVs的具体分子机制和长期效果 | 研究MSC-EVs在治疗肺纤维化及其相关病理过程中的潜力 | 研究对象包括A549细胞和致肺纤维化的小鼠模型 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞和小鼠肺组织样本 | 使用A549细胞和致肺纤维化的小鼠模型 |
10864 | 2024-08-05 |
Microglia-astrocyte crosstalk in the amyloid plaque niche of an Alzheimer's disease mouse model, as revealed by spatial transcriptomics
2024-Jun-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114216
PMID:38819990
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研究论文 | 本文探讨了阿尔茨海默病小鼠模型中淀粉样斑块环境下小胶质细胞与星形胶质细胞的相互作用 | 本文利用高分辨率空间转录组学平台揭示了淀粉样斑块环境的细胞组成和信号扰动的异质性 | 研究仅限于小鼠模型,尚需在人类样本中验证 | 研究淀粉样斑块环境中小胶质细胞与星形胶质细胞的相互作用及其对神经元信号的影响 | 阿尔茨海默病小鼠模型中的小胶质细胞和星形胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
10865 | 2024-08-05 |
Immunotherapeutic targeting of surfaceome heterogeneity in AML
2024-Jun-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114260
PMID:38838225
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研究论文 | 本文分析急性髓性白血病(AML)原发性人类样本的表面蛋白组,识别潜在的免疫治疗靶点 | 成功识别众多特异性表达于初级AML细胞的抗原和标记物,揭示了AML的表面组异质性 | 未提及具体的医学临床试验数据来验证识别的抗原和标记物的治疗效果 | 识别AML免疫治疗干预的潜在靶点 | 分析100个遗传多样性的原发性人类AML标本的表面蛋白组 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞转录组分析 | NA | 蛋白组数据 | 100个原发性人类AML样本 |
10866 | 2024-08-05 |
Single-cell-resolved interspecies comparison shows a shared inflammatory axis and a dominant neutrophil-endothelial program in severe COVID-19
2024-Jun-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114328
PMID:38861386
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据探讨了严重COVID-19中的共享炎症轴和以中性粒细胞-内皮细胞为主的程序 | 通过比较不同种类的仓鼠在COVID-19感染中的反应,本研究揭示了不同种类仓鼠在免疫反应上的差异,为COVID-19的病理机制提供了新的见解 | 该研究依赖于仓鼠模型,可能无法完全代表人类COVID-19的所有特征 | 研究COVID-19的发病机制及其免疫反应的差异 | 健康和严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)感染的叙利亚和罗波罗斯基仓鼠 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 利用了多种仓鼠样本,与人类COVID-19的研究数据进行了比较 |
10867 | 2024-08-05 |
Decoding heterogeneous and coordinated tissue architecture in glioblastoma using spatial transcriptomics
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110064
PMID:38947514
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术探讨胶质母细胞瘤中的基因表达异质性 | 首次揭示了胶质母细胞瘤中组织干细胞特征在坏死和肿瘤周边区域的富集 | 缺乏对空间复杂性的深入探讨 | 探讨胶质母细胞瘤的基因表达异质性及其空间分布 | 临床胶质母细胞瘤样本 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 临床胶质母细胞瘤标本(具体数量未提供) |
10868 | 2024-08-05 |
Generation and characterization of inducible KRAB-dCas9 iPSCs from primates for cross-species CRISPRi
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110090
PMID:38947524
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研究论文 | 本论文生成并验证了来自灵长类动物的可诱导KRAB-dCas9 iPS细胞系。 | 提供了灵长类动物iPS细胞系的独特资源,以便于跨物种的CRISPR干扰研究。 | 尽管在不同细胞系中KRAB-dCas9的表达水平不同,但对目标基因的下调效果相似,可能限制了结果的普遍性。 | 研究灵长类动物的分子表型比较,为理解人类生物学和进化提供信息。 | 三个人类、三种大猩猩和两种猕猴iPS细胞系。 | 数字病理学 | NA | CRISPR干扰(CRISPRi) | NA | 单细胞RNA测序 | 八个iPS细胞系 |
10869 | 2024-08-05 |
Isolation of Human Bone Marrow Non-hematopoietic Cells for Single-cell RNA Sequencing
2024-Jun-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5020
PMID:38948257
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研究论文 | 本文介绍了一种精确分离人类骨髓非造血细胞以进行单细胞RNA测序的方法 | 提出了一种新的分离协议,特别强调了从人类骨髓中获得高质量骨髓间充质细胞的准确性 | 对非造血细胞表型的理解仍然有限,研究领域内的相关研究较少 | 旨在改善对人类骨髓造血微环境的理解,尤其是非造血细胞的特性 | 人类骨髓中的非造血细胞,特别是骨髓间充质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
10870 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis of the survival mechanisms of fratricidal CAR-T targeting of T cell malignancies
2024-Jun-11, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2024.102225
PMID:38948332
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析探讨了针对T细胞恶性肿瘤的兄弟相杀CAR-T细胞的生存机制 | 首次介绍了兄弟相杀CAR-T细胞的生存机制及其相关分子 | 尚未完全揭示所有介导CAR-T细胞生存的机制 | 研究兄弟相杀CAR-T产品的生存机制和调控因子 | 针对T细胞的CD26 CAR-T和CD44v6 CAR-T,以及控制的CD19 CAR-T | 数字病理学 | T细胞肿瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 来自同一供体的多个CAR-T细胞样本 |
10871 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics dissecting the development and evolution of nervous system in insects
2024-06, Current opinion in insect science
IF:5.8Q1
DOI:10.1016/j.cois.2024.101201
PMID:38608931
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综述 | 本文探讨了单细胞转录组学在昆虫神经系统分解中的成就 | 本文创新性在于将单细胞转录组学应用于揭示昆虫神经系统的发展和进化 | 研究限制在于主要聚焦于代表性昆虫,可能无法涵盖所有昆虫的神经系统 | 研究昆虫神经系统在发展和进化过程中的分子和细胞架构 | 代表性的昆虫神经系统 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
10872 | 2024-08-05 |
Enoyl coenzyme a hydratase 1 attenuates aortic valve calcification by suppressing Runx2 via Wnt5a/Ca2+ pathway
2024-Jun, Journal of cell communication and signaling
IF:3.6Q3
DOI:10.1002/ccs3.12038
PMID:38946717
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研究论文 | 本研究探讨了Enoyl辅酶A水合酶1在钙化主动脉瓣疾病中的作用及其机制 | 发现ECH1通过抑制Wnt信号通路调节Runx2,揭示了ECH1-Wnt5a/Ca在CAVD中的新机制 | 研究主要通过体外和体内实验进行,缺乏临床试验数据 | 探讨ECH1在钙化主动脉瓣疾病中的治疗潜力和机制 | 研究对象为主动脉瓣间质细胞及ApoE小鼠模型 | 数字病理 | 钙化主动脉瓣 | 单细胞测序 | ApoE小鼠模型 | 生物样本数据 | NA |
10873 | 2024-08-05 |
Tumour-associated myeloid cells expressing IL-10R2/IL-22R1 as a potential biomarker for diagnosis and recurrence of pancreatic ductal adenocarcinoma
2024-Jun, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02676-w
PMID:38643339
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研究论文 | 本研究探讨了与胰腺导管腺癌(PDAC)相关的IL-10R2+/IL-22R1+髓系细胞作为早期预后生物标志物的潜力 | 发现IL-10R2+/IL-22R1+髓系细胞在PDAC及外周血中的存在,并且其与肿瘤进展有正相关,可能成为早期预后标志物 | 未明确讨论IL-10R2+/IL-22R1+细胞对其他类型肿瘤的普遍性应用 | 旨在评估IL-10R2+/IL-22R1+髓系细胞在胰腺导管腺癌中的作用及其作为生物标志物的潜力 | 重点研究IL-10R2+/IL-22R1+髓系细胞在PDAC患者血液中的表达及其功能 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 血液样本(细胞) | 涉及小鼠模型及人类髓系细胞培养的样本,具体样本大小未明确 |
10874 | 2024-08-05 |
Single-cell 3D genome structure reveals distinct human pluripotent states
2024-05-13, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03268-w
PMID:38741214
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研究论文 | 研究揭示了人类多能性胚胎干细胞的三维基因组结构与其多能状态之间的关系 | 首次通过单细胞高分辨率3D基因组结构分析展示了不同多能状态的特征性基因组重塑 | 未深入探讨多能性状态的调控机制和其他潜在的外部影响因素 | 探讨多能性胚胎干细胞的转录特征及其与基因组结构的关系 | 人类多能性胚胎干细胞(hESCs)在不同多能性状态下的特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序,三维基因组结构分析 | NA | 基因组数据 | NA |
10875 | 2024-08-04 |
Single Cell Atlas: a single-cell multi-omics human cell encyclopedia
2024-04-19, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03246-2
PMID:38641842
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研究论文 | 构建了一个包含人类组织的单细胞多组学地图 | 首次整合五种单细胞组学、空间转录组学和两种体积组学的数据,形成全面的单细胞多组学图谱 | 未提及特定的局限性 | 旨在深入探索健康成人和胎儿组织中的异质细胞群体 | 涉及125个健康成人和胎儿组织的细胞样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 组学数据 | 125个健康成人和胎儿组织 |
10876 | 2024-08-04 |
spVC for the detection and interpretation of spatial gene expression variation
2024-04-19, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03245-3
PMID:38641849
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研究论文 | 提出了一种基于广义泊松模型的统计方法spVC,用于检测和解释空间基因表达的变异性 | spVC集成了常量和空间变化的协变量效应,克服了现有方法的局限性 | 当前研究未提及样本多样性或样本大小的限制 | 旨在提高对空间基因表达变异性理解的深度和准确性 | 研究针对空间基因表达变异性 | 数字病理学 | NA | 转录组学 | 广义泊松模型 | NA | NA |
10877 | 2024-08-04 |
Powerful and accurate detection of temporal gene expression patterns from multi-sample multi-stage single-cell transcriptomics data with TDEseq
2024-04-15, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03237-3
PMID:38622747
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研究论文 | 本研究提出了一种名为TDEseq的非参数统计方法,旨在从单细胞转录组数据中检测时间基因表达模式 | TDEseq利用平滑样条基函数和分层结构线性加性混合模型,增强了对时间点相关性的处理能力 | NA | 提高在单细胞转录组研究中识别时间基因表达模式的准确性和能力 | 特定细胞类型中的时间表达模式 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | 分层结构线性加性混合模型 | 转录组数据 | 分析了四个已发布的scRNA-seq数据集 |
10878 | 2024-08-05 |
Demuxafy: improvement in droplet assignment by integrating multiple single-cell demultiplexing and doublet detection methods
2024-04-15, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03224-8
PMID:38622708
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研究论文 | 本研究开发了Demuxafy框架,通过整合多种单细胞去重和双细胞检测方法,提升了单细胞RNA测序中的供体分配和双细胞去除的准确性 | Demuxafy框架通过多个去重和双细胞检测方法的共识交集,显著提高了液滴分配的准确性 | NA | 提高单细胞RNA测序中液滴分配和双细胞去除的准确性 | 液滴,单细胞RNA测序样本 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 液滴 | NA |
10879 | 2024-08-05 |
Merit of integrating in situ transcriptomics and anatomical information for cell annotation and lineage construction in single-cell analyses of Populus
2024-04-03, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03227-5
PMID:38570851
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研究论文 | 本文强调结合原位转录组学和解剖信息以构建波普勒斯(Populus)单细胞分析中的细胞注释和谱系构建模型的必要性 | 提出了采用原位转录组和解剖信息来改进细胞类型注释和谱系构建的方法 | NA | 研究波普勒斯的单细胞RNA测序中的细胞类型注释和谱系构建 | 四个关于分化木质部分的单细胞RNA测序研究 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA转录组 | NA |
10880 | 2024-08-05 |
Advances in the role of circulating tumor cell heterogeneity in metastatic small cell lung cancer
2024-Apr, Cancer innovation
DOI:10.1002/cai2.98
PMID:38946931
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研究论文 | 本文深入探讨了小细胞肺癌中循环肿瘤细胞的异质性及其在诊断和预后中的价值 | 讨论了旋转肿瘤细胞的表型分析如何预测转移性肿瘤的新潜在靶标的诊断意义 | 当前小细胞肺癌的治疗方式变化有限,免疫检查点抑制剂对大多数患者的疗效低 | 研究循环肿瘤细胞在小细胞肺癌转移中的作用及其对患者预后的影响 | 循环肿瘤细胞在小细胞肺癌患者中的异质性 | 数字病理学 | 小细胞肺癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |