单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
10781 2024-08-05
The Rhesus Macaque Serves As a Model for Human Lateral Branch Nephrogenesis
2021-05-03, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1
研究论文 本研究表明猕猴是人类侧支肾发生的有效模型。 首次确认猕猴作为真实侧支肾发生的模型,促进了对人类晚期妊娠肾发生的分子研究。 该研究未能详细探讨不同妊娠阶段的细胞变化。 研究大三分支肾发生的分子机制。 129-131天妊娠期的猕猴胎儿肾脏。 数字病理学 慢性肾病 单细胞RNA测序 NA RNA数据 4个猕猴胎儿肾脏样本
10782 2024-08-05
Complex Autoinflammatory Syndrome Unveils Fundamental Principles of JAK1 Kinase Transcriptional and Biochemical Function
2020-09-15, Immunity IF:25.5Q1
研究论文 本文描述了一种患者的罕见自炎症综合症及其与JAK1激酶突变的关联 提出了突变'转录型'的概念,展示了S703I突变的独特功能 研究主要基于单个病例,缺乏更大样本的验证 探索JAK1在自炎症疾病中的转录和生化功能 一名因JAK1突变出现多脏器免疫失调的患者 数字病理学 自炎症疾病 单细胞RNA测序 NA NA 1名患者
10783 2024-08-05
cellHarmony: cell-level matching and holistic comparison of single-cell transcriptomes
2019-12-02, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本文介绍了cellHarmony,一个用于单细胞转录组分析和比较的新工具 cellHarmony采用社区聚类和对齐策略有效匹配单细胞转录组,能够揭示细胞特异的基因表达差异 NA 研究目的在于定义疾病相关细胞群体内外的变化,理解人类疾病的分子发病机制 研究对象为正常和疾病状态下的单细胞转录组 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 潜在涉及数十个细胞群体
10784 2024-08-05
The Transcriptional Landscape of Pericytes in Acute Ischemic Stroke
2024-Aug, Translational stroke research IF:3.8Q2
研究论文 本研究探讨了急性缺血性中风中周细胞的转录组特征 首次揭示了缺血性中风后周细胞特有的转录变化和潜在的治疗靶点 研究仅基于小鼠模型,可能无法完全代表人类缺血性中风的复杂性 改善缺血性中风的治疗效果,寻找新的治疗靶点 急性缺血性中风中的周细胞 数字病理学 缺血性中风 单细胞RNA测序 小鼠模型 转录组数据 通过中动脉闭塞模型获得的样本在1小时、12小时和24小时后进行分析
10785 2024-08-05
Generating Neuroimmune Assembloids Using Human Induced Pluripotent Stem Cell (iPSC)-Derived Cortical Organoids and Microglia
2024-Jul-09, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 本研究提出了一种新方法,通过人诱导多能干细胞(iPSC)衍生的皮层类器官和小胶质细胞生成神经免疫组合体 创新点在于将小胶质细胞整合到皮层类器官模型中,以反映神经免疫交互作用 研究中没有提及样本的广泛性或不同类型的小胶质细胞对结果的影响 研究旨在开发一种能够更好地模拟神经发育和神经疾病中神经细胞与免疫细胞相互作用的体外模型 研究对象为人诱导多能干细胞衍生的皮层类器官和小胶质细胞 数字病理学 神经疾病 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) NA NA NA
10786 2024-08-04
Re-analysis of single-cell RNA-seq data reveals the origin and roles of cycling myeloid cells
2024-Jul-08, Stem cells (Dayton, Ohio)
研究论文 本研究首次揭示了循环髓系细胞(CMCs)的起源、分化和在生理过程中的作用 首次对循环髓系细胞的研究价值进行了系统分析,并确定了其特定类型的亚群 本研究的具体样本大小和实验条件未详细说明 研究循环髓系细胞在生理和病理过程中的起源和功能 循环髓系细胞,特别是亚群a的特征 数字病理学 癌症 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA数据 NA
10787 2024-08-04
Establishment of an ovarian cancer exhausted CD8+T cells-related genes model by integrated analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq
2024-Jul-05, European journal of medical research IF:2.8Q2
研究论文 建立了一种与卵巢癌耗竭CD8+T细胞相关的基因模型 首次识别了与耗竭的CD8+T细胞相关的基因,并提出了其在卵巢癌中的预后意义 模型的临床适用性需要在更多样本上进行进一步验证 识别与卵巢癌中耗竭CD8+T细胞相关的基因及其预后意义 卵巢癌患者的肿瘤样本及相关基因表达数据 数字病理学 卵巢癌 RNA-seq, scRNA-seq Cox回归模型 基因表达数据 TCGA和GEO数据库中的大样本
10788 2024-08-05
Deciphering lineage specification during early embryogenesis in mouse gastruloids using multilayered proteomics
2024-Jul-05, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 本研究利用多层质谱技术研究了小鼠胃胚体早期发育中的蛋白质表达动态 首次使用多层质谱技术对小鼠胃胚体发育中的蛋白质进行全面分析,发现了各个胚层特有的时间性表达模式 缺乏对早期哺乳动物胚胎发育的蛋白质组学研究,现有研究较为稀缺 探讨小鼠胃胚体发育过程中胚层特异性蛋白质的表达和功能 小鼠胃胚体和发育过程中相关的蛋白质 数字病理学 NA 质谱 NA 蛋白质组数据 研究涉及的小鼠胃胚体样本数量NA
10789 2024-08-07
Author Correction: The shaky foundations of simulating single-cell RNA sequencing data
2024-Jul-05, Genome biology IF:10.1Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
10790 2024-08-05
Harnessing Single-Cell Technologies in the Search for New Therapies for Diamond-Blackfan Anemia Syndrome
2024-Jul, Experimental hematology IF:2.5Q3
综述 本文讨论了单细胞技术在钻石-黑凡贫血综合症(DBA)新疗法研究中的应用。 该文章创新性地探索了单细胞研究对理解DBA病理机制及新疗法开发的启示。 本文主要为综述,具体的实验数据和结果较为有限。 研究DBA的病理机制及其新疗法的潜在开发。 钻石-黑凡贫血综合症及其相关的单细胞技术研究。 数字病理学 其他血液疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 荧光激活细胞分选(FACS), 克隆细胞培养测定 NA NA NA
10791 2024-08-05
Distinct pulmonary and systemic effects of dexamethasone in severe COVID-19
2024-Jun-28, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究探讨了地塞米松在重症COVID-19患者中对肺部和全身免疫细胞的影响 揭示了地塞米松在不同细胞区室中的特异性作用及其潜在机制 未提及特定的限制条件NA 研究地塞米松在重症COVID-19患者中的免疫学效应及机制 重症COVID-19患者的下呼吸道和血液样本 数字病理学 COVID-19 RNA测序 血液样本和下呼吸道样本 NA
10792 2024-08-05
Engrailed transcription factors direct excitatory cerebellar neuron diversity and survival
2024-Jun-24, Development (Cambridge, England)
研究论文 该研究定义了胚胎eCNm的分子亚域并揭示了EN1/2在小脑兴奋性神经元中的保守作用 首次使用scRNA-seq和空间表达分析定义了胚胎eCNm的分子亚域,并描述了它们的发育过程 未涉及其他小脑核团的发育机制和影响 研究胚胎小脑兴奋性神经元的分子多样性及其生存机制 胚胎小脑中间核的兴奋性神经元及其分子亚域 数字病理 NA scRNA-seq NA NA NA
10793 2024-08-05
Single-Cell RNA Sequencing of Mutant Whole Mouse Embryos: From the Epiblast to the End of Gastrulation
2024-Jun-14, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 本文介绍了一种针对小鼠胎儿突变体的单细胞RNA测序管道,涵盖了从外胚层到胃肠发育结束的过程 提出了一种新方法,以克服对突变体胚胎进行单细胞分析的技术限制 此研究依然受到胚胎基因分型及其数量限制的影响 研究突变如何影响胃肠发展的细胞景观 小鼠胚胎突变体,特别是在胃肠形成期间的细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 细胞数据 涉及多个人工妊娠的突变体小鼠胚胎
10794 2024-08-05
Machine learning integrative approaches to advance computational immunology
2024-06-11, Genome medicine IF:10.4Q1
评论 这篇文章讨论了机器学习整合方法在计算免疫学中的应用。 文章强调了现代机器学习技术在整合多种‘组学’数据方面的创新能力,尤其是在单细胞和空间分析中的应用。 文章提到了一些整体方法的挑战,但具体的限制未详细说明 探讨机器学习整合技术如何推动免疫学研究的发展。 聚焦于免疫学领域内多层次数据集的整合分析。 计算免疫学 NA 单细胞RNA测序 机器学习 多组学数据 NA
10795 2024-08-05
Mitochondrial Oxidative Stress Regulates FOXP3+ T-Cell Activity and CD4-Mediated Inflammation in Older Adults with Frailty
2024-Jun-05, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究阐明了衰弱老年人CD4/Treg轴的复杂免疫动力学 首次揭示了衰弱老年人Treg细胞亚群及其转录组特征与CD4 T细胞反应失调之间的关系 当前研究主要比较年轻和老年人群,未充分考虑健康老年人与经历病理衰老者之间的差异 研究衰弱老年人中CD4/Treg轴的免疫调节机制 衰弱老年人及其与同龄健康老年人的比较 数字病理学 衰弱 RNA测序和单细胞RNA测序 NA RNA数据 使用公开的外周血单核细胞数据进行分析
10796 2024-08-05
Tumor suppressive role of the epigenetic master regulator BRD3 in colorectal cancer
2024-Jun, Cancer science IF:4.5Q1
研究论文 本研究探讨了BET家族蛋白BRD3在结直肠癌中的肿瘤抑制作用 首次展示了BRD3通过诱导p21表达抑制细胞周期并抑制肿瘤生长的作用 未讨论BRD3以外的其他BET家族成员在结直肠癌中的作用 研究BRD3在结直肠癌(CRC)中的功能角色 结直肠癌细胞及临床样本 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序,免疫组化分析 NA 组织样本 NA
10797 2024-08-05
Mutant U2AF1-Induced Mis-Splicing of mRNA Translation Genes Confers Resistance to Chemotherapy in Acute Myeloid Leukemia
2024-May-15, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 该文章探讨了U2AF1突变导致的mRNA翻译基因误剪接与急性髓性白血病化疗耐药之间的关系 本研究首次揭示了U2AF1突变如何通过影响mRNA剪接和翻译过程来促成急性髓性白血病的化疗耐药 本研究为回顾性分析,可能存在数据整合和样本选择偏差的局限性 探讨急性髓性白血病患者对诱导化疗的耐药机制 超过1500例急性髓性白血病患者的多组学数据 数字病理学 急性髓性白血病 单细胞RNA测序 NA 多组学数据 超过1500例急性髓性白血病患者
10798 2024-08-05
Striking the Balance with a PD-L1×4-1BB Bispecific Antibody
2024-May-15, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本文介绍了一种新型PD-L1×4-1BB双特异性抗体ATG-101用于癌症免疫疗法 ATG-101在降低4-1BB亲和力的同时,具有高亲和力的PD-L1,从而减轻肝毒性 尽管ATG-101具有良好的抗肿瘤活性,但其长期安全性和效力仍需进一步验证 研究ATG-101的潜力,以改善癌症免疫治疗中的肝毒性问题 研究对象为肿瘤微环境中的T细胞和免疫细胞群体 免疫治疗 癌症 单细胞RNA测序 NA NA 在非人灵长类动物中进行了ATG-101治疗,且未给出样本具体数量
10799 2024-08-05
ATG-101 Is a Tetravalent PD-L1×4-1BB Bispecific Antibody That Stimulates Antitumor Immunity through PD-L1 Blockade and PD-L1-Directed 4-1BB Activation
2024-May-15, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 ATG-101是一种四价PD-L1×4-1BB双特异性抗体,通过PD-L1阻断和PD-L1导向的4-1BB激活刺激抗肿瘤免疫 本研究工程化了ATG-101,发现其能够同时与PD-L1和4-1BB结合,并能有效激活T细胞,显示出在ICIs抗性肿瘤中的潜在抗肿瘤活性 虽然ATG-101表现出良好的耐受性,但在临床试验中仍需进一步评估其长期安全性和有效性 本研究旨在开发一种新的抗肿瘤免疫疗法,以克服现有免疫检查点抑制剂的耐药性 研究对象为ATG-101抗体及其对4-1BB+ T细胞和肿瘤微环境的影响 免疫肿瘤学 肿瘤 单细胞RNA测序 NA 生物样本 多个体内肿瘤模型
10800 2024-08-05
Single-cell RNA sequencing of mutant whole mouse embryos: from the epiblast to the end of gastrulation
2024-May-01, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究设计了一种强大的单细胞分析流程,以研究小鼠胚胎在内胚层形成过程中的基因表达动态 提出了一种方法以克服在单细胞分析突变小鼠胚胎中的技术限制 突变胚胎的单细胞分析仍然稀少,且通常仅限于FACS分选的群体 探索突变如何影响胚胎在胃肠发育阶段的细胞景观 突变的小鼠胚胎,从E6.5到E8的发育阶段 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 细胞 NA
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