单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 10761 - 10780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10761 | 2024-08-05 |
Pan-Cancer Single-Cell and Spatial-Resolved Profiling Reveals the Immunosuppressive Role of APOE+ Macrophages in Immune Checkpoint Inhibitor Therapy
2024-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202401061
PMID:38569519
|
研究论文 | 本研究探讨了APOE+巨噬细胞在免疫检查点抑制剂（ICI）治疗中的免疫抑制作用 | 结合单细胞RNA测序和机器学习方法，构建了M.Sig模型用于预测ICI反应，揭示了APOE巨噬细胞在ICI治疗中的重要作用 | 本研究可能缺乏对其他类型巨噬细胞的全面比较，未涵盖所有癌症类型 | 研究APOE+巨噬细胞在癌症免疫治疗中的作用与机制 | APOE+巨噬细胞以及与之互动的CD8+耗竭T细胞 | 数字病理学 | 泛癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和机器学习 | M.Sig模型 | RNA数据 | 使用了4T1肿瘤-bearing小鼠模型和真实世界免疫治疗数据 |
| 10762 | 2024-08-04 |
Transcriptional programs mediating neuronal toxicity and altered glial-neuronal signaling in a Drosophila knock-in tauopathy model
2024-05-15, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278576.123
PMID:38599684
|
研究论文 | 本文描述了利用CRISPR-Cas基因编辑技术构建的前额颞叶痴呆果蝇模型。 | 创造了与人类前额颞叶痴呆相关的正交突变，并且展示了非细胞自主变更在胶质细胞中的潜在作用。 | 研究可能受到模型局限性的影响，虽然模型重现了人类疾病的某些特征，但依然无法完全模拟人类遗传背景。 | 揭示TAU P301L突变引起的神经元功能障碍和死亡的分子事件。 | 研究对象为携带Tau P251L突变的果蝇及其对照品。 | 数字病理学 | 前额颞叶痴呆 | CRISPR-Cas基因编辑 | 果蝇模型 | 单细胞RNA测序数据 | 约130,000个细胞 |
| 10763 | 2024-08-05 |
FlyBase: updates to the Drosophila genes and genomes database
2024-05-07, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyad211
PMID:38301657
|
研究论文 | 本文描述了FlyBase关于果蝇基因和基因组数据库的最新进展和更新 | 引入了单细胞RNA测序数据，改善了功能信息的内容和显示，更新了同源性流程，增加了新的化学报告，并增强了宣传资源 | NA | 介绍FlyBase的最新开发和更新 | 果蝇基因组和基因信息 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 10764 | 2024-08-04 |
Spatially resolved transcriptome of the aging mouse brain
2024-05, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14109
PMID:38372175
|
研究论文 | 本文生成了小鼠大脑老化的空间转录组图谱。 | 建立了老化小鼠大脑的空间分子图谱，揭示了特定大脑区域的基因表达变化。 | 研究中对人脑老化的理解可能不适用于所有哺乳动物，数据主要来源于小鼠。 | 探讨老化小鼠大脑的基因表达及细胞类型在空间组织中的变化。 | 年轻和老年小鼠的大脑空间转录组图谱及其基因表达特征。 | 数字病理学 | 老年疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 年轻和老年小鼠的大脑样本 |
| 10765 | 2024-08-05 |
Systematic mapping of TF-mediated cell fate changes by a pooled induction coupled with scRNA-seq and multi-omics approaches
2024-04-25, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.277926.123
PMID:38580401
|
研究论文 | 本文介绍了一种新方法iTF-seq，用于识别可以诱导细胞命运改变的转录因子 | 创新点在于引入了iTF-seq方法，能够在单细胞水平上监测转录组变化并识别影响细胞命运的转录因子 | 对多个转录因子在可诱导方式下的命运转换潜力的理解仍然有限 | 探索转录因子介导的细胞命运变化机制 | 小鼠胚胎干细胞 | 数字病理学 | NA | 多组学方法 | NA | 转录组数据 | 小鼠胚胎干细胞 |
| 10766 | 2024-08-07 |
Corrigendum: A statistical learning method for simultaneous copy number estimation and subclone clustering with single-cell sequencing data
2024-Apr-25, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279293.124
PMID:38664005
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10767 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome characteristics of testicular terminal epithelium lineages during aging in the Drosophila
2024-03, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14057
PMID:38044573
|
研究论文 | 本研究对果蝇睾丸终末上皮细胞在衰老过程中的转录组特征进行了单细胞RNA测序分析 | 首次定义了以金属硫蛋白A为标志物的终末上皮群体，并细分为六个新的亚细胞群体 | 关于终末上皮的功能多样性和调控机制仍然了解不足 | 探讨衰老过程中果蝇睾丸终末上皮细胞的转录组特征及其功能 | 果蝇睾丸终末上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 2天、10天和40天的果蝇样本 |
| 10768 | 2024-08-04 |
A statistical learning method for simultaneous copy number estimation and subclone clustering with single-cell sequencing data
2024-02-07, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278098.123
PMID:38290978
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于融合套索模型的亚克隆聚类方法FLCNA，旨在同时检测单细胞DNA测序数据中的拷贝数异常(CNA) | FLCNA方法通过融合套索模型实现了同时检测CNA和亚克隆聚类，克服了现有方法可能产生的错误结果 | 未提及具体的限制 | 研究旨在改善在复杂细胞群体中亚克隆识别的准确性 | 研究对象为乳腺癌的单细胞DNA测序数据集 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞DNA测序（scDNA-seq） | 融合套索模型 | 基因组数据 | 未提及具体样本量 |
| 10769 | 2024-08-04 |
A Bayesian framework to study tumor subclone-specific expression by combining bulk DNA and single-cell RNA sequencing data
2024-02-07, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278234.123
PMID:38195207
|
研究论文 | 本研究开发了一种Bayesian框架scBayes，以结合肿瘤亚克隆特定的基因表达和基因组数据。 | 提出了一种新方法，通过结合bulk DNA测序和单细胞RNA测序数据，填补了肿瘤亚克隆结构与转录组异质性之间的缺口。 | 使用了模拟数据及生物学数据集进行验证，但缺乏更广泛的临床数据。 | 研究肿瘤亚克隆特定的基因表达，为癌症的演化和耐药机制提供新的见解。 | 针对来自同一肿瘤的bulk DNA和单细胞RNA测序数据进行分析。 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序，bulk DNA测序 | Bayesian模型 | 基因组数据和RNA测序数据 | 使用生物数据集和模拟数据集进行验证，具体样本规模未明确说明 |
| 10770 | 2024-08-05 |
Data integration and inference of gene regulation using single-cell temporal multimodal data with scTIE
2024-02-07, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.277960.123
PMID:38190633
|
研究论文 | 本研究提出scTIE，一种整合时间多模态数据并推测基因调控关系的方法 | scTIE通过使用自编码器和迭代最优传输，联合分析不同时间点的细胞数据，提供了对细胞转态变化的预测 | 该研究主要集中在单细胞数据集的整合上，可能对其他类型的数据整合不适用 | 旨在通过整合和推断基因调控关系，理解细胞状态变化的机制 | 研究对象为不同时间点的单细胞样本 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq 和 scATAC-seq | 自编码器 | 时间序列的多模态数据 | 使用多种合成和真实的时间多模态数据集进行验证 |
| 10771 | 2024-08-05 |
Transcriptional programs mediating neuronal toxicity and altered glial-neuronal signaling in a Drosophila knock-in tauopathy model
2024-Feb-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.02.578624
PMID:38352559
|
研究论文 | 本研究通过CRISPR-Cas基因编辑技术构建了前额叶痴呆的果蝇模型，并探讨了神经元功能障碍和死亡的分子机制 | 该研究使用自有基因编辑方法忠实地重现了人类疾病的遗传背景与表型特征 | 该研究使用的模型可能无法完全代表人类疾病的所有复杂性 | 研究前额叶痴呆中tau蛋白突变导致的神经元毒性及胶质细胞-神经元信号改变的分子机制 | 进行单细胞RNA测序分析的果蝇，具体包括tau P251L突变体和对照果蝇 | 数字病理 | 前额叶痴呆 | CRISPR-Cas基因编辑 | 突变体模型 | 单细胞RNA测序数据 | 约130,000个细胞 |
| 10772 | 2024-08-04 |
Integrating single-cell and spatial transcriptomic analysis to unveil heterogeneity in high-grade serous ovarian cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1420847
PMID:38975339
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组分析揭示高等级浆液性卵巢癌的异质性 | 该研究首次揭示了HGSOC的特定细胞特征与不良结果的相关性，并提出了代谢通路的治疗靶点 | 本研究主要集中在HGSOC的特定特征上，可能限制了其他类型卵巢癌的适用性 | 研究HGSOC的复杂机制并识别其异质性 | HGSOC的肿瘤细胞及其微环境 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞和空间转录组学 | NA | 肿瘤组织样本 | 包括转移样本在内的多种HGSOC样本 |
| 10773 | 2024-08-05 |
An age-and sex-matched postoperative therapy should be required in thyroid papillary carcinoma
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1339191
PMID:38974575
|
研究论文 | 本研究探讨了甲状腺乳头状癌（PTC）的淋巴结转移风险因素并提出了差异化治疗方案。 | 首次指出性别和年龄对PTC术后治疗的影响，并建议在治疗中考虑这些因素。 | 未能明确TSH对PTC行为的影响，且部分临床数据可能存在偏差。 | 研究PTC术后淋巴结转移的风险因素，并开发针对PTC的差异化治疗。 | 分析2073例PTC患者的临床信息及基因表达数据。 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 临床数据、基因表达数据 | 2073例 |
| 10774 | 2024-08-05 |
A comprehensive exploration of the heterogeneity of immune cells in Han and Zang systemic lupus erythematosus patients via single-cell RNA sequencing
2024-01, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2023.110770
PMID:38128704
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索汉族和藏族系统性红斑狼疮患者免疫细胞的异质性 | 首次揭示汉族和藏族SLE患者免疫细胞的异质性 | 可能样本量有限，未包括其他民族的比较 | 揭示SLE患者免疫细胞的异质性 | 汉族和藏族的系统性红斑狼疮患者 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 10775 | 2024-08-05 |
De novo identification of expressed cancer somatic mutations from single-cell RNA sequencing data
2023-12-18, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-023-01269-1
PMID:38111063
|
研究论文 | 提出了一种计算框架RESA用于从单细胞RNA测序数据中识别表达的肿瘤体细胞突变 | RESA提供了一种新的方法来进行表达的肿瘤体细胞突变分析，并在现有方法中表现优异 | 没有提及具体的局限性 | 旨在提高从单细胞RNA测序数据中识别表达肿瘤突变的准确性 | 针对黑色素瘤药物耐药性数据集分析肿瘤内突变异质性 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 数据集 | 19个数据集 |
| 10776 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals characteristics of myeloid cells in pulmonary post-acute sequelae of SARS-CoV-2
2023-Aug-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.31.551349
PMID:37577518
|
研究论文 | 本文揭示了SARS-CoV-2后肺病症状患者中骨髓来源细胞的特征。 | 通过单细胞RNA测序，首次详细描绘了与COVID-19后急性并发症相关的免疫细胞特征和代谢变化。 | 样本大小和控制组的选择可能限制了结果的普遍适用性。 | 研究COVID-19后急性并发症患者中免疫反应的特点。 | 与SARS-CoV-2病毒感染后的慢性肺部症状相关的外周血单核细胞。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 分析了34,139个外周血单核细胞样本 |
| 10777 | 2024-08-05 |
Cross-species scRNA-seq reveals the cellular landscape of retina and early alterations in type 2 diabetes mice
2023-07, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2023.110644
PMID:37279838
|
研究论文 | 本研究揭示了2型糖尿病小鼠视网膜的细胞景观和早期病理变化 | 首次通过跨物种的单细胞RNA测序详细描述了视网膜细胞图谱，并发现了新的视网膜双极细胞亚型 | 该研究仅基于小鼠和人类的数据，未涵盖其他物种的视网膜变化 | 探索2型糖尿病对视网膜的早期影响 | 人类和小鼠的视网膜细胞 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 276,402个细胞 |
| 10778 | 2024-08-05 |
Activation of Angiopoietin-Tie2 Signaling Protects the Kidney from Ischemic Injury by Modulation of Endothelial-Specific Pathways
2023-06-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000098
PMID:36787763
|
研究论文 | 本研究探讨了激活Angiopoietin-Tie2信号通路如何通过调节内皮特异性途径来保护肾脏免受缺血损伤。 | 引入了Hepta-ANG1作为一种新的治疗生物药物，并提供了Tie2激活保护肾脏的分子机制依据。 | 本研究的局限性未在摘要中提到 | 研究缺血再灌注急性肾损伤（IR-AKI）中Tie2信号的激活及其保护作用。 | 使用VE-PTP小鼠和C57BL/6J小鼠进行实验，研究其在肾脏缺血再灌注损伤中的作用。 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织活检, RNA测序 | 使用VE-PTP野生型和敲除小鼠及C57BL/6J小鼠的样本 |
| 10779 | 2024-08-04 |
Accurate integration of multiple heterogeneous single-cell RNA-seq data sets by learning contrastive biological variation
2023-05, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.277522.122
PMID:37308294
|
研究论文 | 本文介绍了一个新的单细胞RNA测序数据集整合方法 scInt | scInt通过构建精确、稳健的细胞间相似性并学习统一的对比生物变异，从多个数据集中进行有效整合，超越了现有的十种 cutting-edge 方法 | 针对复杂实验设计的整合效果仍需进一步验证 | 实现多种异质单细胞RNA测序数据集的有效整合 | 不同生物条件下的单细胞异质样本及其功能性亚群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集 | 涉及多种生物条件的多个模拟和真实数据集 |
| 10780 | 2024-08-05 |
Understanding the cellular interactome of non-alcoholic fatty liver disease
2022-Aug, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2022.100524
PMID:35845296
|
综述 | 本文主要描述了非酒精性脂肪肝疾病的细胞相互作用网络。 | 介绍了快速发展的技术如何改变我们对NAFLD/NASH中细胞相互作用网络的理解，并利用这些信息开发新疗法。 | 未提及具体的实验数据和结果，只是综述现有的研究和技术。 | 探讨非酒精性脂肪肝疾病中的细胞相互作用及其对病理的影响。 | 主要关注非酒精性脂肪肝疾病（NAFLD）及其相关病理。 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝疾病 | 单细胞基因组学、空间转录组学、单细胞配体-受体分析 | NA | NA | NA |