单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 10721 - 10740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10721 | 2024-08-05 |
Van Gogh-like 2 is essential for the architectural patterning of the mammalian biliary tree
2024-Jul, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.02.030
PMID:38460794
|
研究论文 | 本文探讨了平面细胞极性在哺乳动物胆道结构模式中的作用 | 阐明了平面细胞极性蛋白VANGL2在胆管细胞间接触形成中的模式化作用 | 尚不清楚这些生化信号与胆管模式化之间的具体联系 | 定义胆管板从简单上皮细胞层过渡为复杂连接胆管的机制 | 胚胎小鼠肝脏中的双向表皮祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 组织器模型 | RNA数据 | 胚胎小鼠肝脏的单细胞样本 |
| 10722 | 2024-08-07 |
Response to Comment on Hu et al. Single-Cell Transcriptomics Reveals Novel Role of Microglia in Fibrovascular Membrane of Proliferative Diabetic Retinopathy. Diabetes 2022;71:762-773
2024-Jul-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/dbi24-0024
PMID:38900952
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10723 | 2024-08-04 |
scHolography: a computational method for single-cell spatial neighborhood reconstruction and analysis
2024-06-24, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03299-3
PMID:38915088
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scHolography的方法，该方法用于重建单细胞空间邻域并进行分析 | 提出了一种基于机器学习的方法，用于重构单细胞的空间邻域并促进3D组织可视化 | NA | 旨在提高对组织复杂性，特别是在单细胞分辨率下的组织结构分析 | 研究对象包括人类和小鼠的空间转录组学数据 | 数字病理学 | 肿瘤免疫微环境 | 空间转录组测序和单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 基因组数据 | 人类和小鼠的数据集 |
| 10724 | 2024-08-05 |
MOXD1 is a lineage-specific gene and a tumor suppressor in neuroblastoma
2024-Jun-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ado1583
PMID:38905335
|
研究论文 | 本研究分析了神经母细胞瘤样本的RNA测序数据，以探讨MOXD1基因在肿瘤发展中的作用 | 发现MOXD1作为一种谱系特异性的肿瘤抑制基因，在神经母细胞瘤中具有重要作用 | 对早期肿瘤驱动事件的深入研究有限，模型缺乏 | 研究神经母细胞瘤的胚胎起源及早期肿瘤发展事件 | 人类神经母细胞瘤细胞及胎儿肾上腺的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | RNA测序 | 斑马鱼，雏鸡，小鼠 | RNA测序数据 | 人类神经母细胞瘤样本和胎儿肾上腺细胞 |
| 10725 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics analysis identifies a tumor-promoting function of the meningeal stroma in melanoma leptomeningeal disease
2024-Jun-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101606
PMID:38866016
|
研究论文 | 该文章研究了脑膜病中的肿瘤微环境，揭示了脑膜基质在黑色素瘤脑膜病中的肿瘤促进作用 | 文章创新性地确定了脑膜基质在黑色素瘤脑膜病中的肿瘤促进作用，并提供了克服微环境介导的药物抵抗的机制 | 样本数量有限，仅包含两个患者的九个临床标本 | 探讨黑色素瘤脑膜病的肿瘤微环境及其与基质的相互作用 | 研究对象为黑色素瘤脑膜病及与之匹配的额外颅外转移组织 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学 | NA | 组织样本 | 两名患者的九个组织样本 |
| 10726 | 2024-08-04 |
Glycoengineering-based anti-PD-1-iRGD peptide conjugate boosts antitumor efficacy through T cell engagement
2024-Jun-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101590
PMID:38843844
|
研究论文 | 该文章介绍了一种通过糖工程方法合成的抗PD-1-iRGD肽共轭物，能够增强抗肿瘤效能 | 通过双重靶向同时激活肿瘤细胞和PD-1 T细胞，实现肿瘤特异性T细胞激活和增殖，具有创新性 | 在研究中没有提及具体的临床应用或长期安全性评估 | 研究目标是提升肿瘤免疫治疗的效果 | 主要研究对象为抗PD-1-iRGD肽共轭物及其在小鼠模型中的应用 | 肿瘤学 | 癌症 | 糖工程 | NA | 流式细胞术和单细胞RNA-seq数据 | 在多个同系小鼠模型中进行了实验 |
| 10727 | 2024-08-04 |
Single-cell multiomics profiling reveals heterogeneous transcriptional programs and microenvironment in DSRCTs
2024-Jun-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101582
PMID:38781959
|
研究论文 | 本研究揭示了DSRCT肿瘤细胞的异质转录程序和微环境特征 | 首次利用单细胞多组学分析展示了DSRCT细胞在转录程序上的多样性及其与微环境的关系 | 样本数量有限，仅研究了五位患者的12个样本，可能影响结果的广泛适用性 | 探讨DSRCT肿瘤细胞的转录程序多样性及其微环境影响 | 对DSRCT患者的肿瘤细胞进行单细胞多组学分析 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞多组学 | NA | 转录组数据 | 来自五位患者的12个肿瘤样本 |
| 10728 | 2024-08-04 |
Distinctive multicellular immunosuppressive hubs confer different intervention strategies for left- and right-sided colon cancers
2024-Jun-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101589
PMID:38806057
|
研究论文 | 本文探讨了左侧和右侧结肠癌的免疫抑制特征和干预策略的差异 | 提出了左侧和右侧结肠癌特定的转录组表达元程序，揭示了其独特的细胞相互作用 | 研究可能未考虑所有潜在的肿瘤微环境因素的影响 | 研究左侧和右侧结肠癌在临床和分子特征上的差异 | 分析了来自105名结肠癌患者的426,863个单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 来自105名结肠癌患者的426,863个单细胞 |
| 10729 | 2024-08-05 |
Venetoclax acts as an immunometabolic modulator to potentiate adoptive NK cell immunotherapy against leukemia
2024-Jun-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101580
PMID:38776913
|
研究论文 | 这篇文章报告了venetoclax作为免疫代谢调节剂的作用，通过增强NK细胞对急性髓性白血病的细胞毒性来提升NK细胞免疫疗法的效果 | 发现venetoclax不仅抑制BCL-2，还能激活NK细胞并提高其对AML细胞的亲和力 | 未足够探讨venetoclax在不同类型肿瘤中的应用和长期效果 | 研究venetoclax如何通过调节NK细胞功能来增强癌症免疫疗法的效果 | NK细胞和急性髓性白血病(AML)细胞 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | bulk和单细胞RNA测序，亲和力测量和功能测试 | NA | 细胞 | NA |
| 10730 | 2024-08-05 |
scRank infers drug-responsive cell types from untreated scRNA-seq data using a target-perturbed gene regulatory network
2024-Jun-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101568
PMID:38754419
|
研究论文 | 本文介绍了scRank，它通过未处理的单细胞转录组数据推断药物响应性细胞类型 | 创新性地采用目标扰动基因调控网络，通过 in silico 药物扰动排名药物响应性细胞群体 | 未提及具体的模型限制 | 旨在识别药物响应性细胞群体以阐明药物作用机制 | 药物响应性细胞类型以及其在不同疾病中的作用 | 数字病理学 | 脑瘤，重度抑郁障碍，心肌梗死 | 单细胞转录组测序 | NA | 未处理的单细胞转录组数据 | 模拟数据集和真实数据集，包括脑瘤和重度抑郁障碍的样本 |
| 10731 | 2024-08-05 |
Single-cell signatures identify microenvironment factors in tumors associated with patient outcomes
2024-Jun-17, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100799
PMID:38889686
|
研究论文 | 本文介绍了一种工具scBeacon，通过单细胞RNA测序数据识别肿瘤微环境因素与患者结果的关系 | 创新点在于通过整合和聚类多个单细胞RNA测序数据集提取细胞类型特征，进而解构无关肿瘤数据集 | 本文未提及具体的局限性 | 研究肿瘤及其微环境在患者生存和治疗反应中的作用 | 重点研究TCGA（癌症基因组图谱）队列中的肿瘤样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 多个单细胞RNA测序数据集 |
| 10732 | 2024-08-05 |
GENIX enables comparative network analysis of single-cell RNA sequencing to reveal signatures of therapeutic interventions
2024-Jun-17, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100794
PMID:38861988
|
研究论文 | 该文章介绍了GENIX，这一计算框架超越了差异表达分析，能够构建基因关联网络并识别拓扑特征基因 | GENIX能够识别经典差异表达分析遗漏的特征基因，扩展了精准医疗中的目标基因发现范围 | 可能未提及具体的算法细节和真实数据集限制 | 研究单细胞RNA测序对治疗干预的细胞反应的理解 | 利用GENIX分析合成和实验数据集，包括从康复COVID-19患者的外周血单核细胞中分析流感疫苗诱导的免疫反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 网络模型 | 数据集 | 使用合成和实验数据集 |
| 10733 | 2024-08-04 |
Characterizing efficient feature selection for single-cell expression analysis
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae317
PMID:38975891
|
研究论文 | 本文系统地比较了11种特征选择方法在单细胞RNA-seq数据分析中的表现 | 提出了使用细胞聚类准确性作为特征选择方法评估的标准，并发现低表达基因在高性能方法中往往被排除 | 未具体提及研究的局限性 | 评估不同特征选择方法在单细胞表达分析中的有效性 | 对比11种特征选择方法的性能 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 10734 | 2024-08-04 |
Cell specification and functional interactions in the pig blastocyst inferred from single-cell transcriptomics and uterine fluids proteomics
2024-03, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2023.110780
PMID:38211822
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组学和子宫液体蛋白组学探讨了猪囊胚的细胞特征和功能相互作用 | 发现了两种之前未知的滋养外胚层亚群，包括可能代表祖细胞的LRP2表达细胞和与Rauber层相关的表达凋亡标志物的细胞 | 目前未提及本文的具体局限性 | 旨在深入理解猪囊胚在早期和孵化阶段的生物学特性 | 研究对象为早期和孵化的囊胚、球形和卵形胚胎及对应的子宫液体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和蛋白质组学 | NA | RNA和蛋白质数据 | 大规模单细胞RNAseq数据集和对应的蛋白质组学数据集 |
| 10735 | 2024-08-05 |
A risk-reward examination of sample multiplexing reagents for single cell RNA-Seq
2024-03, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2024.110793
PMID:38220132
|
研究论文 | 本研究比较了不同的样本复用试剂对单细胞RNA测序的影响 | 提出通过优化实验室工作流程和选择合适的复用试剂提升单细胞RNA测序的性能 | 研究中不同样本类型的信噪比问题影响了数据质量 | 旨在提高单细胞RNA测序实验的准确性和成本效益 | 研究对象包括人外周血单核细胞、鼠胚胎脑和患者来源的异种移植物 | 数字病理学 | NA | RNA-Seq | NA | NA | 包括人PBMC、鼠脑和患者来源的异种移植物等多种样本类型 |
| 10736 | 2024-08-05 |
A single-cell atlas of the murine pancreatic ductal tree identifies novel cell populations with potential implications in pancreas regeneration and exocrine pathogenesis
2024-Feb-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.26.582044
PMID:38463969
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序全面描述了小鼠胰腺导管的异质性，识别了新的细胞群体，可能对胰腺再生和外分泌病理有重要影响 | 识别出15个胰腺健康状态下共存的导管细胞群体，并揭示了其在组织形成和内分泌分化中的潜力 | 主要研究集中在小鼠模型上，可能无法完全反映人类胰腺的复杂特征 | 研究胰腺导管细胞的异质性及其在胰腺再生和外分泌病理中的作用 | 小鼠胰腺导管的不同细胞群体 | 数字病理学 | 胰腺癌 | scRNA-seq | NA | 单细胞数据 | 使用胰腺伤害模型、胰腺肿瘤样本，以及健康胰腺样本 |
| 10737 | 2024-08-04 |
Cuproptosis-Related Genes as Prognostic Biomarkers for Sepsis: Insights into Immune Function and Personalized Immunotherapy
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S461766
PMID:38979432
|
研究论文 | 本研究旨在通过分析新型细胞死亡过程cuproptosis，发现败血症免疫治疗的诊断和预后生物标志物 | 首次将cuproptosis相关基因与败血症的免疫功能和个性化免疫疗法联系起来 | 研究可能受到样本量和群体分类的限制 | 探讨cuproptosis相关基因在败血症预后中的作用 | 败血症患者的转录组数据以及cuproptosis相关基因 | 数字病理学 | 败血症 | 转录组测序，单细胞测序，实时定量PCR | 预测模型 | 转录组数据 | 涉及败血症患者和健康对照的样本 |
| 10738 | 2024-08-04 |
Deciphering head and neck cancer microenvironment: Single-cell and spatial transcriptomics reveals human papillomavirus-associated differences
2024-01, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.29386
PMID:38235919
|
研究论文 | 本文研究了人乳头瘤病毒（HPV）相关的头颈癌微环境的分子特征 | 通过单细胞和空间转录组学分析，发现了HPV感染与癌症干细胞特性之间的关键基因PKM2及其在转移肿瘤中的作用 | 样本数量有限，仅包括8个单细胞RNA样本和6个空间转录组样本 | 探讨HPV在头颈鳞状细胞癌中的微环境作用及其对转移的影响 | 主要研究基于HPV状态的原发肿瘤和淋巴结转移肿瘤的分子特征 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 8个单细胞RNA样本和6个空间转录组样本 |
| 10739 | 2024-08-04 |
Integrated analysis of single-cell sequencing and machine learning identifies a signature based on monocyte/macrophage hub genes to analyze the intracranial aneurysm associated immune microenvironment
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1397475
PMID:38979407
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习分析识别与颅内动脉瘤相关的单核细胞/巨噬细胞基因特征，以阐明其与免疫微环境的关系 | 结合六种机器学习算法识别出与单核细胞/巨噬细胞相关的关键基因，并开发了多层感知机神经模型用于颅内动脉瘤的诊断 | 尽管研究揭示了单核细胞浸润的分子特征，但在针对颅内动脉瘤的靶向治疗方面的有效性仍需进一步验证 | 识别单核细胞/巨噬细胞相关的基因特征，以阐明其在颅内动脉瘤发病机制和免疫微环境中的作用 | 主要研究对象为颅内动脉瘤中的单核细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 颅内动脉瘤 | 单细胞RNA测序 | 多层感知机（MLP） | 基因数据 | NA |
| 10740 | 2024-08-05 |
A single-cell atlas of the aging mouse ovary
2024-Jan, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-023-00552-5
PMID:38200272
|
研究论文 | 本研究绘制了小鼠卵巢衰老的单细胞转录组图谱 | 首次提供了衰老小鼠卵巢的全面细胞图谱，揭示了早期卵巢衰退的驱动因素 | 该研究主要集中在小鼠模型上，可能无法完全转化到人类卵巢衰老 | 研究小鼠卵巢衰老过程中的转录组变化 | 对3个月和9个月小鼠卵巢组织进行单细胞RNA测序 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 小鼠卵巢组织，3个月和9个月各一组 |