单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 10701 - 10720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10701 | 2024-08-05 |
Identifying high-impact variants and genes in exomes of Ashkenazi Jewish inflammatory bowel disease patients
2023-04-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-37849-3
PMID:37080976
|
研究论文 | 本文鉴定了犹太人在炎症性肠病（IBD）中高影响的变异和基因 | 识别出8个新型且合理的导致IBD的基因，展现了与早发IBD遗传学的显著重叠 | 遗传病因尚不完全清楚，未展示病例对照组的详细特征 | 研究Ashkenazi犹太人中IBD的遗传影响 | 4453名经过基因鉴定的Ashkenazi犹太人IBD患者及对照者 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 大规模和单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 4453名样本（1734名IBD患者和2719名对照者） |
| 10702 | 2024-08-04 |
Compressed phenotypic screens for complex multicellular models and high-content assays
2023-Jan-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.23.525189
PMID:36747859
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研究论文 | 本文提出了一种通过压缩筛选法来提高复杂多细胞模型的高通量表型筛选效率 | 文章创新性在于通过对生化干预进行汇总并运用计算解卷积，建立了压缩筛选的专门方法 | 未明确提及具体的局限性 | 研究旨在提高复杂多细胞模型中的表型筛选效率，以促进药物发现 | 研究对象为患者衍生的胰腺癌类器官以及与肿瘤微环境（TME）相关的重组蛋白配体库 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 高内容成像 | 使用了高度生物活性的化合物库进行受控基准测试 |
| 10703 | 2024-08-05 |
Single Cell Transcriptomics Identifies Distinct Choroid Cell Populations Involved in Visually Guided Eye Growth
2023, Frontiers in ophthalmology
DOI:10.3389/fopht.2023.1245891
PMID:38390290
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析了参与视觉引导眼睛生长的不同脉络膜细胞群体 | 首次提供了主要脉络膜细胞类型及其在调节眼睛生长中的基因表达变化的全面概况 | 大部分显著的基因表达变化相对较小，并且仅在一种罕见细胞群体中观察到最高的变化 | 阐明脉络膜在后天眼球生长中的作用 | 小鸡脉络膜细胞群体及其基因表达变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 小鸡脉络膜的24个细胞群体 |
| 10704 | 2024-08-05 |
RNA-binding proteins that are highly expressed and enriched in healthy cartilage but suppressed in osteoarthritis
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1208315
PMID:37457300
|
研究论文 | 本研究揭示了在健康软骨中高度表达且富集的RNA结合蛋白在骨关节炎中的表达变化。 | 研究首次绘制了健康软骨中RNA结合蛋白的全球表达图谱，并发现TIPARP作为骨关节炎的新型介导因子和潜在治疗靶点。 | 本研究主要依赖于已有的RNA测序数据，缺乏临床样本的验证。 | 探讨RNA结合蛋白在健康软骨与骨关节炎中的表达及其潜在作用。 | 主要集中在健康 cartilage 和骨关节炎 cartilage 中的RNA结合蛋白。 | 数字病理学 | 骨关节炎 | RNA测序 | NA | 基因组数据 | 健康和骨关节炎人类软骨的RNA测序数据，包含1542个RNA结合蛋白 |
| 10705 | 2024-08-07 |
Author Correction: A yeast-optimized single-cell transcriptomics platform elucidates how mycophenolic acid and guanine alter global mRNA levels
2021-Jul-13, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-021-02420-7
PMID:34257405
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10706 | 2024-08-05 |
Heterogeneous groups of alveolar type II cells in lung homeostasis and repair
2020-12-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00341.2020
PMID:32903031
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mini review | 本文讨论了不同亚群的肺泡II型细胞及其在稳态、损伤后和病理条件下的功能 | 发现了不同亚型的肺泡II型细胞具有不同的自我更新和分化能力 | 研究未深入探讨所有可能的AT2细胞亚群及其功能 | 探讨肺泡II型细胞在肺部稳态和修复中的作用及其异质性 | 肺泡II型细胞的不同亚群及其在不同环境中的功能 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | NA | NA |
| 10707 | 2024-08-04 |
Interfacial delivery of carbon monoxide via smart titanium implant coating for enhanced soft tissue integration with switchable antibacterial and immunomodulatory properties
2024-Oct, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2024.06.010
PMID:38978805
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研究论文 | 本文探讨了一种用于增强钛植入物周围软组织集成的双功能涂层。 | 开发了一种在近红外照射下能控释一氧化碳的智能钛植入物涂层，因而具有抗菌和免疫调节的创新特性。 | 模型主要在大鼠上进行，可能无法完全代表人类的生理和免疫反应。 | 增强钛植入物周围软组织的集成，改善钛植入物的长期成功率。 | 研究对象为钛植入物及其周围软组织，重点关注一氧化碳的释放及其生物作用。 | 数字病理学 | NA | 近红外照射 | NA | 单细胞测序 | 大鼠植入模型 |
| 10708 | 2024-08-04 |
Identification of key genes and immune infiltration in peripheral blood biomarker analysis of delayed cerebral ischemia: Valproic acid as a potential therapeutic drug
2024-Aug-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112408
PMID:38897129
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研究论文 | 本研究开发了一种基于外周血生物标志物的预测模型，用于延迟性脑缺血的关键基因和免疫浸润的分析 | 该研究通过多种生物信息学分析方法识别出与延迟性脑缺血相关的关键基因，并提出了丙戊酸作为潜在的治疗药物 | 未提及具体的实验样本数量和潜在的研究局限性 | 研究延迟性脑缺血（DCI）的病因和开发新的治疗方法 | 通过外周血生物标志物分析识别与DCI相关的关键基因 | 数字病理学 | 心脑血管疾病 | 基因表达谱分析 | 机器学习算法 | 生物标志物数据 | 涉及六个数据集与小鼠单细胞RNA-seq数据 |
| 10709 | 2024-08-04 |
Transcriptional switches in melanoma T Cells: Facilitating polarizing into regulatory T cells
2024-Aug-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112484
PMID:38885605
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研究论文 | 本研究揭示了黑色素瘤T细胞中的转录开关，助力于调节性T细胞的极化。 | 首次识别了与黑色素瘤Treg相关的新的功能分子，并通过SERS技术实现了疾病监测的新方法。 | 尚未明确转录因子在调节性T细胞功能中的具体作用机制。 | 研究调节性T细胞在黑色素瘤中的作用及其自我维持机制。 | 研究黑色素瘤患者的调节性T细胞及其相关转录因子。 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | SERS技术 | NA | 临床样本 | 验证在大量临床样本中 |
| 10710 | 2024-08-05 |
The significance of CD8+ tumor-infiltrating lymphocytes exhaustion heterogeneity and its underlying mechanism in diffuse large B-cell lymphoma
2024-Aug-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112447
PMID:38909497
|
研究论文 | 这篇文章探讨了CD8+肿瘤浸润淋巴细胞的耗竭异质性及其机制在弥漫大B细胞淋巴瘤中的临床意义 | 研究揭示了CD8+ TILs的耗竭状态存在异质性，并指出CD39/A2AR相关信号通路可能促进其转变 | 样本量相对较小，尤其是单细胞RNA测序仅有7个样本 | 研究CD8+ TILs的耗竭异质性及其在弥漫大B细胞淋巴瘤中的作用 | CD8+ TILs在弥漫大B细胞淋巴瘤中的不同耗竭状态 | 数字病理学 | 弥漫大B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序、整体RNA测序、免疫组化、逆转录定量聚合酶链反应 | NA | RNA数据 | 7个单细胞样本，3300个整体RNA样本，116个免疫组化样本，95个逆转录定量PCR样本，48个肿瘤细胞的体细胞突变数据 |
| 10711 | 2024-08-05 |
Three-gene signature revealing the dynamics of lymphocyte infiltration in subchondral bone during osteoarthritis progression
2024-Aug-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112431
PMID:38897125
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研究论文 | 本研究揭示了在骨关节炎进展过程中，次软骨骨中的淋巴细胞浸润动态的三基因特征 | 识别出三种基因作为骨关节炎早期阶段的潜在生物标志物，并揭示了淋巴细胞浸润的主要特征 | 该研究的结果可能受限于所使用的数据集以及样本大小的影响 | 研究骨关节炎的免疫浸润变化及其相关生物标志物 | 关注早期和晚期骨关节炎次软骨骨中的免疫相关基因 | 数字病理学 | 骨关节炎 | LASSO回归, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用GSE515188数据集的样本 |
| 10712 | 2024-08-05 |
DNA damage response-related signatures characterize the immune landscape and predict the prognosis of HCC via integrating single-cell and bulk RNA-sequencing
2024-Aug-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112475
PMID:38909498
|
研究论文 | 本文探讨了与DNA损伤反应相关的标志物如何影响肝细胞癌（HCC）的免疫特征和预后 | 创新性地整合了单细胞RNA测序和大规模RNA测序，构建了与DNA损伤反应相关的预后模型 | NA | 探讨与DNA损伤反应相关的生物标记，以帮助预测HCC的预后和免疫特征 | 肝细胞癌患者的肿瘤和正常样本 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序 | Cox和LASSO回归模型 | 基因表达数据 | 使用了单细胞RNA测序数据集GSE242889以及对应的肝细胞癌样本 |
| 10713 | 2024-08-05 |
Identification of oxidative stress signatures of lung adenocarcinoma and prediction of patient prognosis or treatment response with single-cell RNA sequencing and bulk RNA sequencing data
2024-Aug-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112495
PMID:38901238
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研究论文 | 本研究系统地调查了肺腺癌中的氧化应激调控模式和其与肿瘤微环境的关系 | 首次全面分析了肺腺癌中的氧化应激，建立了预后相关的预测模型 | 没有涉及氧化应激对其他肺癌亚型的影响 | 探讨肺腺癌中的氧化应激信号及其对患者预后或治疗反应的预测能力 | 针对肺腺癌患者的氧化应激相关基因进行研究 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序和总体RNA测序 | Cox回归分析 | 基因表达数据 | NA |
| 10714 | 2024-08-05 |
Machine learning algorithms integrate bulk and single-cell RNA data to unveil oxidative stress following intracerebral hemorrhage
2024-Aug-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112449
PMID:38865753
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研究论文 | 本研究通过机器学习算法整合了大规模和单细胞RNA数据，以揭示脑内出血后氧化应激的变化 | 首次结合单细胞RNA测序数据和机器学习算法，以识别与脑内出血后的氧化应激相关的核心基因 | 研究主要基于动物实验，可能限制结果在临床上的推广性 | 识别与脑内出血后氧化应激相关的最佳基因，增强对该过程的理解 | 研究了氧化应激在脑内出血后在不同细胞层中的异质性 | 机器学习 | 脑内出血 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 机器学习算法（如极端梯度提升、Boruta、随机森林、最小绝对收缩和选择算子） | RNA数据 | 涉及脑内出血动物实验的样本 |
| 10715 | 2024-08-04 |
Identifying the Pattern Characteristics of Anoikis-Related Genes in Keloid
2024-Jul-10, Advances in wound care
IF:5.8Q1
DOI:10.1089/wound.2024.0027
PMID:38775414
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研究论文 | 本研究首次全面分析了与细胞脱落相关基因在瘢痕疙瘩中的作用 | 识别了六个重要的ARGs并探讨了它们与免疫细胞浸润水平的显著相关性 | 仅使用了GEO数据库的RNA-seq数据，可能有限于特定样本 | 研究细胞脱落相关基因在瘢痕疙瘩发病机制中的作用 | 瘢痕疙瘩的成纤维细胞及相关的细胞脱落基因 | 数字病理学 | 瘢痕疙瘩 | RNA测序 | LASSO-Cox回归模型 | 基因表达数据 | 三个瘢痕疙瘩成纤维细胞的RNA测序数据集 |
| 10716 | 2024-08-04 |
HEARTSVG: a fast and accurate method for identifying spatially variable genes in large-scale spatial transcriptomics
2024-Jul-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49846-1
PMID:38972896
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研究论文 | 本文提出了一种新的方法HEARTSVG，用于快速准确地识别大规模空间转录组中的空间变异基因 | HEARTSVG是一种无分布假设的基于检验的方法，能够以更高的准确性和计算效率识别空间变异基因 | 未提及具体的局限性 | 理解疾病和组织结构的时空特征，识别空间变异基因 | 大规模空间转录组数据中的空间变异基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组技术 | NA | 真实数据集 | 分析了来自不同空间转录组技术的十二个真实数据集 |
| 10717 | 2024-08-04 |
Genomic structural variation contributes to evolved changes in gene expression in high-altitude Tibetan sheep
2024-Jul-02, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2322291121
PMID:38913905
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研究论文 | 本研究探讨了基因组结构变异对高原藏羊基因表达变化的影响 | 首次表征了区分藏羊和低海拔胡羊的基因组结构变异，并揭示了与心脏功能和循环相关基因的表达差异 | 未详细探讨每种基因变异对功能表型的直接影响 | 研究高海拔适应的遗传机制 | 高原藏羊与低海拔胡羊 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 462个基因的高频结构变异 |
| 10718 | 2024-08-04 |
Single-cell landscape of functionally cured chronic hepatitis B patients reveals activation of innate and altered CD4-CTL-driven adaptive immunity
2024-Jul, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.02.017
PMID:38423478
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研究论文 | 本研究探讨了慢性乙型肝炎患者功能治愈后的免疫病理特征，揭示了免疫系统的激活状态 | 本研究首次从单细胞水平深入解析了慢性乙型肝炎治愈机制中的免疫病理特征，并发现了CD4细胞毒性T淋巴细胞的变化以及肝脏中天然杀伤细胞的激活 | 研究没有涉及功能治愈后长期随访的影响和机制 | 旨在揭示慢性乙型肝炎功能治愈后免疫病理的基础机制 | 研究对象为慢性乙型肝炎患者及其功能治愈后的样本 | 数字病理学 | 慢性肝炎 | 单细胞RNA测序, 多参数流式细胞术, 多重免疫荧光 | NA | 细胞样本, 血液样本 | NA |
| 10719 | 2024-08-04 |
Endothelial POFUT1 controls injury-induced liver fibrosis by repressing fibrinogen synthesis
2024-Jul, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.02.032
PMID:38460791
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研究论文 | POFUT1通过抑制纤维蛋白原的合成调控损伤诱导的肝纤维化 | 揭示了POFUT1在肝脏内皮细胞中作为纤维蛋白原表达下调的关键调节因子，进而影响肝纤维化进程 | 本研究主要基于小鼠模型，临床数据的验证仍需进一步展开 | 探讨LSEC表达的POFUT1在肝纤维化中的作用及其机制 | 重点研究了LSEC及其与肝星状细胞之间的信号传导 | 数字病理学 | 肝纤维化 | RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 多组小鼠及肝硬化患者的单细胞RNA测序数据 |
| 10720 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis of Microglia Dissected the Energy Metabolism and Revealed Potential Biomarkers in Amyotrophic Lateral Sclerosis
2024-Jul, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-023-03806-w
PMID:38102515
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研究论文 | 该研究分析了肌萎缩侧索硬化症患者小胶质细胞的RNA测序，揭示了能量代谢的作用及潜在生物标志物 | 首次探讨了ALS患者非神经元细胞中差异表达基因的能量代谢功能及其与小胶质细胞的相互作用 | 本研究仅限于小样本规模，可能无法全面代表ALS的病理特征 | 研究ALS的发病机制、早期诊断及潜在治疗策略 | ALS患者的非神经元细胞、SOD1突变ALS小鼠的脑干及ALS患者的全血组织 | 数字病理学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括ALS患者和ALS小鼠的多个样本 |