单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 10661 - 10680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10661 | 2024-08-04 |
Characterization of tumor endothelial cells (TEC) in gastric cancer and development of a TEC-based risk signature using single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq data
2024-06-12, Aging
DOI:10.18632/aging.205928
PMID:38870270
|
研究论文 | 本研究旨在阐明胃癌中的肿瘤内皮细胞（TEC）特征，并构建基于TEC的预后风险模型以预测患者的临床结果 | 本研究首次发现了胃癌中的5个TEC簇，并构建了一个包含8个基因的风险标记，与肿瘤免疫细胞浸润相关联 | 研究未阐明该风险标记在其他类型癌症中的适用性 | 探讨胃癌中肿瘤内皮细胞的特征及其在预后中的重要性 | 胃癌患者的肿瘤内皮细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和总体RNA测序（bulk RNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 3302个不同表达基因（DEGs） |
| 10662 | 2024-08-04 |
ST-CellSeg: Cell segmentation for imaging-based spatial transcriptomics using multi-scale manifold learning
2024-Jun, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012254
PMID:38935799
|
研究论文 | 提出了一种基于影像的机器学习方法ST-CellSeg，用于空间转录组的细胞分割 | ST-CellSeg在多尺度信息的考虑上具有创新性，利用流形进行细胞分割 | 尚未提及具体的局限性 | 研究空间转录组数据中的细胞分割问题 | 针对具有不同形状的空间转录组细胞进行分割 | 数字病理学 | NA | 机器学习 | NA | 影像 | 在选定数据集中明显优于基线模型的算法评估 |
| 10663 | 2024-08-04 |
Somatic PDGFRB activating variants promote smooth muscle cell phenotype modulation in intracranial fusiform aneurysm
2024-May-13, Journal of biomedical science
IF:9.0Q1
DOI:10.1186/s12929-024-01040-7
PMID:38741091
|
研究论文 | 本研究探讨了PDGFRB体细胞变异在脑内梭形动脉瘤中对平滑肌细胞表型调节的作用。 | 该文章揭示了PDGFRB体细胞突变如何影响脑内梭形动脉瘤中平滑肌细胞表型，并探索了相关细胞信号通路及治疗干预。 | 本研究的样本量较小，且研究主要集中在单细胞水平，未能全面揭示所有可能的分子机制。 | 研究PDGFRB体细胞突变对梭形动脉瘤平滑肌细胞表型调节的影响及其潜在的治疗方案。 | 研究对象为脑内梭形动脉瘤的平滑肌细胞及相关基因突变。 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞测序、全外显子测序、免疫荧光 | 斑马鱼模型 | 生物样本 | 七个脑动脉瘤样本（六个梭形和一个囊性） |
| 10664 | 2024-08-04 |
Integrating population genetics, stem cell biology and cellular genomics to study complex human diseases
2024-May, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01731-9
PMID:38741017
|
研究论文 | 探讨了如何将种群遗传学、干细胞生物学和细胞基因组学整合在一起以研究复杂的人类疾病 | 文章创新性地将人类多能干细胞与单细胞测序相结合，揭示了人类遗传变异的功能后果 | 整合这些领域和方法存在重大挑战，特别是在经济性和实用性上的问题 | 研究人类遗传变异的功能后果及其对复杂疾病的影响 | 主要研究对象为人类多能干细胞及其与遗传变异的关系 | 干细胞生物学 | 复杂疾病 | 单细胞测序 | 人类多能干细胞 | 细胞基因组数据 | NA |
| 10665 | 2024-08-05 |
Type 1 immunity enables neonatal thymic ILC1 production
2024-01-19, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adh5520
PMID:38232171
|
研究论文 | 本研究探讨了1型免疫如何促进新生儿胸腺来源的ILC1细胞扩展和外周定居 | 揭示了新生儿胸腺驻留的ILC1细胞是在与其他初级淋巴器官相比具有独特和幼稚的亚群 | 尚未探索1型免疫对其他类型淋巴细胞的具体影响 | 研究1型免疫对胸腺驻留先天淋巴细胞(ILCs)的影响 | 重点研究了新生儿胸腺内的ILC1细胞及其与1型细胞因子的相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 采用小鼠新生儿胸腺组织进行实验 |
| 10666 | 2024-08-04 |
Integration of single-cell sequencing with machine learning and Mendelian randomization analysis identifies the NAP1L1 gene as a predictive biomarker for Alzheimer's disease
2024, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2024.1406160
PMID:38988327
|
研究论文 | 本研究通过结合单细胞测序、机器学习和孟德尔随机化分析识别NAP1L1基因作为阿尔茨海默病的预测生物标志物 | 该文章首次将单细胞测序与机器学习及孟德尔随机化结合，以识别与阿尔茨海默病相关的特定基因 | 研究可能在外部验证样本的范围和多样性方面有局限性 | 识别可靠的阿尔茨海默病生物标志物，以便提前预测疾病并及时干预 | 阿尔茨海默病患者的外周血单核细胞及对照组样本 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组测序 | 机器学习 | 转录组数据 | NA |
| 10667 | 2024-08-05 |
A structured evaluation of cryopreservation in generating single-cell transcriptomes from cerebrospinal fluid
2023-07-24, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100533
PMID:37533636
|
研究论文 | 该文章报告了一种适用于单细胞RNA测序的脑脊液细胞冷冻保存协议 | 创新点在于提供了一种稳健的冷冻保存方案，使得脆弱的脑脊液细胞在中到大规模研究中得以有效表征 | 限制在于未提及其他潜在的影响因素，如冷冻时间对细胞质量的长远影响 | 研究脑脊液细胞特征化的冷冻保存方法 | 脑脊液细胞来自21名参与者的样本 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 细胞类型数据 | 21个脑脊液样本 |
| 10668 | 2024-08-05 |
Macrophage-mediated extracellular matrix remodeling controls host Staphylococcus aureus susceptibility in the skin
2023-07-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2023.06.006
PMID:37402364
|
研究论文 | 本研究探讨了巨噬细胞在皮肤中如何影响金黄色葡萄球菌的感染易感性 | 发现了巨噬细胞在调节透明质酸方面的新功能，从而影响感染结果 | 未提及具体的临床试验阶段或人类数据 | 研究巨噬细胞如何影响宿主对金黄色葡萄球菌感染的易感性 | 研究皮下巨噬细胞及其在感染中的作用 | 数字病理学 | 皮肤感染 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 10669 | 2024-08-05 |
Impaired immune signaling and changes in the lung microbiome precede secondary bacterial pneumonia in COVID-19
2021-Nov-30, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2021.03.23.21253487
PMID:33791731
|
研究论文 | 本文评估了COVID-19患者肺部免疫反应和微生物组动态，特别是与继发性细菌肺炎的关系 | 研究发现COVID-19患者在继发性细菌感染前的免疫信号受损，以及微生物组组成的变化 | 样本量相对较小，仅包括23名COVID-19患者 | 探讨COVID-19患者免疫信号失调如何导致继发性细菌肺炎 | 23名COVID-19患者及8名重症未感染对照 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 23名COVID-19患者和8名重症未感染对照 |
| 10670 | 2024-08-05 |
A Spatial Quantitative Systems Pharmacology Platform spQSP-IO for Simulations of Tumor-Immune Interactions and Effects of Checkpoint Inhibitor Immunotherapy
2021-Jul-26, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13153751
PMID:34359653
|
研究论文 | 本文开发了一个混合计算模型平台 spQSP-IO，用于研究肿瘤-免疫相互作用及检查点抑制免疫疗法的效果 | 本研究创新性地结合了空间解析的基于代理的模型与QSP模型，增强了其预测能力 | 目前尚未明确提及具体的限制 | 研究肿瘤微环境与癌症-免疫细胞相互作用对肿瘤发展的影响 | 非小细胞肺癌模型的虚拟患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 成像技术，空间转录组学 | 基于代理的模型（ABM） | 空间数据 | 虚拟患者的模拟模型 |
| 10671 | 2024-08-05 |
Deep evolutionary origin of limb and fin regeneration
2019-07-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1900475116
PMID:31270239
|
研究论文 | 这篇文章研究了两栖动物和鱼类在肢体再生能力上的进化起源 | 提供了对骨鱼类配对附肢再生的共同起源的支持，并且揭示了再生的共同遗传通路 | 未明确指出本研究的局限性 | 探讨骨鱼类配对附肢再生的进化起源 | 通过比较RNA测序和再生实验分析不同鱼类和萨拉曼德尔的再生能力 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 基因组数据 | 研究了4种鲑鱼科和其他几种鱼类的再生能力 |
| 10672 | 2024-08-04 |
Emerging roles for stromal cells in bone metastasis
2024-Aug, Journal of bone oncology
IF:3.1Q2
DOI:10.1016/j.jbo.2024.100610
PMID:38984147
|
研究论文 | 本文章探讨了基质细胞在骨转移中的新兴角色 | 文章强调了间质干细胞在癌症与骨微环境相互作用中的广泛功能及其在癌细胞休眠和免疫肿瘤学中的作用 | 文章未详细描述特定的实验方法和样本大小 | 研究基质细胞在癌症骨转移中的作用和机制 | 主要研究基质干细胞（MSCs）在恶性肿瘤骨转移中的角色 | 数字病理学 | 癌症转移 | 空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 10673 | 2024-08-04 |
Identification of signaling pathways that specify a subset of migrating enteric neural crest cells at the wavefront in mouse embryos
2024-Jul-08, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.03.034
PMID:38636517
|
研究论文 | 该文章探讨了小鼠胚胎中波前肠神经嵴细胞的信号通路 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学，揭示了波前ENCCs的分子动态和关键信号通路 | 尚未完全理解分子机制及其与周围细胞的相互作用 | 理解肠神经系统发展中的细胞迁移和信号通路 | 小鼠胚胎的波前肠神经嵴细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA | 小鼠胚胎样本 |
| 10674 | 2024-08-04 |
Detection of allele-specific expression in spatial transcriptomics with spASE
2024-Jul-08, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03317-4
PMID:38978101
|
研究论文 | 介绍了一种用于检测空间等位基因特异性表达的新计算框架spASE | 提出了spASE框架，用于估计空间等位基因特异性表达，以解决细胞类型混合和低信噪比带来的挑战 | 未提及具体的局限性 | 研究空间转录组学中等位基因特异性表达的可行性 | 小鼠小脑和海马的等位基因解析的Visium和Slide-seq数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 分层模型与加性混合空间平滑样条 | RNA数据 | NA |
| 10675 | 2024-08-04 |
Advancing cell-based therapy in sepsis: An anesthesia outlook
2024-Jul-05, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003097
PMID:38708689
|
综述 | 本文提供了免疫细胞治疗在脓毒症研究中的现状和进展的简要概述 | 讨论了基于干细胞的免疫调节干预和Chimeric抗原受体(CAR)免疫细胞治疗在脓毒症中的应用 | 缺乏具体的临床试验数据支持本文提出的治疗方法 | 探讨脓毒症患者围手术期管理中的创新治疗方法 | 免疫细胞治疗及其在脓毒症中的应用 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞测序和基因编辑技术 | NA | NA | NA |
| 10676 | 2024-08-05 |
Identification of potential immune-related mechanisms related to the development of multiple myeloma
2024-Jul-05, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003116
PMID:38844445
|
研究论文 | 本研究探讨了在未接受治疗的多发性骨髓瘤患者中的免疫微环境，尤其是单核细胞/巨噬细胞。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序揭示了未治疗的多发性骨髓瘤患者中单核细胞/巨噬细胞的免疫机制及其重要性。 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，可能未能涵盖所有免疫细胞类型的复杂交互作用。 | 本研究旨在揭示未治疗多发性骨髓瘤患者的免疫微环境特征。 | 研究对象为未治疗的多发性骨髓瘤患者及健康供体。 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及的样本包括未治疗的多发性骨髓瘤患者和健康供体的单细胞RNA测序数据 |
| 10677 | 2024-08-04 |
Profibrotic Subsets of SPP1+ Macrophages and POSTN+ Fibroblasts Contribute to Fibrotic Scarring in Acne Keloidalis
2024-Jul, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.12.014
PMID:38218364
|
研究论文 | 这篇文章探讨了在痤疮瘢痕病中，SPP1+巨噬细胞和POSTN+成纤维细胞的致纤维化亚群的作用 | 提出了POSTN成纤维细胞和SPP1巨噬细胞之间通过SPP1信号网络的交流可能在痤疮瘢痕病的发病机制中起作用 | 该研究可能局限于样本数和临床病理特征的多样性 | 进一步探索痤疮瘢痕病的发病机制 | 临床确诊的痤疮瘢痕患者的后枕部头皮活检标本 | 数字病理学 | 痤疮瘢痕病 | 大量RNA测序，单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 组织样本 | 涉及多个患者的病变和无病变皮肤活检样本 |
| 10678 | 2024-08-05 |
Genomic characteristics of adipose-derived stromal cells induced into neurons based on single-cell RNA sequencing
2024-Jun-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e33079
PMID:38984299
|
研究论文 | 本研究探讨了脂肪来源的基质细胞（ADSCs）诱导分化为神经元的基因组特征 | 阐明了ADSCs分化为神经元的分子机制及基因组特性 | 对ADSCs诱导分化的分子机制了解不足 | 研究脂肪来源的基质细胞向神经元分化的表观遗传学机制 | 成年ADSCs群体及不同诱导时间组的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 七个时间点的样本 |
| 10679 | 2024-08-04 |
AraLeTA: An Arabidopsis leaf expression atlas across diurnal and developmental scales
2024-Jun-28, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiae117
PMID:38428997
|
研究论文 | 本文构建了拟南芥叶片在日间和发育时间尺度上细胞类型特异性基因表达的地图 | 结合了单细胞RNA测序数据与整叶时间序列数据，揭示了不同细胞类型在时间上的转录本浓度变化 | 虽然进一步的细胞类型特征分析得到了加强，但依然无法完全消除整叶RNA测序的平均基因表达值的局限性 | 研究拟南芥叶片不同细胞类型基因表达随时间变化的模式 | 拟南芥（Arabidopsis thaliana）叶片的不同细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 10680 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics in cancer research and potential clinical impact: a narrative review
2024-Jun-08, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-05816-0
PMID:38850363
|
综述 | 本综述总结了空间转录组学在癌症研究中的应用及其潜在临床影响 | 空间转录组学提供了肿瘤微环境的新见解，并能够捕捉肿瘤异质性和多灶性 | 缺乏针对临床应用中的空间信息整合的深度分析 | 探索空间转录组学在精准肿瘤学及肿瘤研究中的应用 | 主要关注固体肿瘤的现有空间转录组学研究 | 数字病理学 | 肿瘤 | 空间转录组学（ST） | NA | 基因表达数据 | NA |