单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 10641 - 10660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10641 | 2024-08-05 |
Single-cell analyses of transcriptional heterogeneity in squamous cell carcinoma of urinary bladder
2016-10-04, Oncotarget
DOI:10.18632/oncotarget.11803
PMID:27602771
|
研究论文 | 本研究对膀胱鳞状细胞癌中的转录异质性进行了单细胞分析 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了膀胱鳞状细胞癌中细胞表达的异质性及其潜在机制 | 本研究主要集中在膀胱鳞状细胞癌中，可能不适用于其他癌症类型 | 探索膀胱鳞状细胞癌的细胞功能异质性及其机制 | 人类膀胱鳞状细胞癌及相应的生理正常上皮 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 单细胞样本，具体样本数量未提及 |
| 10642 | 2024-08-05 |
Partitioning and aggregating cross-tissue and tissue-specific genetic effects to identify gene-trait associations
2024-Jul-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49924-4
PMID:38982044
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研究论文 | 本文提出了MTWAS框架，用于识别基因-性状关联并增强TWAS和GWAS的信息利用 | 引入了一种非参数插补策略来增强不可获取组织的信息，并基于扩展贝叶斯信息准则将eQTL分类为跨组织和特定组织的eQTL | 未提及具体的局限性 | 开发一种新的统计框架MTWAS，以识别基因-性状关联 | 对GTEx数据集的47个组织和其他数据集中的免疫细胞类型进行基因预测和分析 | 生物统计学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 84项UK Biobank GWAS研究和其他数据集的样本 |
| 10643 | 2024-08-04 |
Deep 3D histology powered by tissue clearing, omics and AI
2024-Jul, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02327-1
PMID:38997593
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研究论文 | 本文讨论了通过3D组织组织学技术综合理解组织和生物体生理及病理生理的重要性 | 提出了一种结合组织清理化学、标记和体积成像的新技术，以增强3D重建，并与分子技术协同作用 | 缺乏针对具体应用案例的实证数据支持 | 创建完整的三维细胞图谱，以全面理解组织和生物体的生理和病理 | 涉及组织样本和细胞的3D空间结构及其分子组成 | 数字病理学 | NA | 组织清理化学、体积成像 | 深度学习 | 细胞结构和分子数据 | NA |
| 10644 | 2024-08-05 |
Diversification of the VH3-53 immunoglobulin gene segment by somatic hypermutation results in neutralization of SARS-CoV-2 virus variants
2024-Jul, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202451056
PMID:38593351
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研究论文 | 该研究揭示了通过体细胞超突变，VH3-53免疫球蛋白基因片段的多样化如何导致对SARS-CoV-2病毒变异体的中和作用 | 文章创新性地展示了特定B细胞克隆的体细胞超突变如何增加单克隆抗体的中和范围 | 研究中对B细胞克隆扩增的机制缺乏深入分析 | 本研究旨在探讨COVID-19恢复患者的B细胞如何通过超突变生成能够中和病毒变异体的抗体 | 研究对象为从SARS-CoV-2恢复患者中获得的针对刺突蛋白特异性B细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 来自一名SARS-CoV-2恢复患者的B细胞样本 |
| 10645 | 2024-08-05 |
Clustering single-cell RNA sequencing data via iterative smoothing and self-supervised discriminative embedding
2024-Jul, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-024-03074-5
PMID:38834657
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研究论文 | 本文提出了一种用于单细胞RNA测序数据的深层聚类方法scRISE，旨在解决聚类过程中的相似性度量挑战 | 提出了基于图自编码器的迭代平滑模块和自我监督的鉴别嵌入模块的新方法来改进数据表示和聚类质量 | 在文章中没有明确提到具体的局限性 | 研究单细胞转录组测序数据的聚类分析 | 用于单细胞RNA测序的17个数据集及HNSCC数据集 | 数字病理学 | NA | NA | 深度聚类模型 | 单细胞RNA测序数据 | 17个单细胞RNA测序数据集 |
| 10646 | 2024-08-04 |
Emerging Roles of Spatial Transcriptomics in Liver Research
2024-May, Seminars in liver disease
IF:4.3Q1
DOI:10.1055/a-2299-7880
PMID:38574750
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研究论文 | 空间转录组学在肝脏研究中的新兴角色，揭示了基因表达的复杂地图。 | 该文章通过空间转录组学技术识别肝细胞的分区功能，揭示了脂肪肝中脂质相关巨噬细胞的作用和肝再生过程中的内皮细胞信号。 | NA | 探讨空间转录组学在肝脏疾病理解和治疗中的应用 | 主要关注健康和病态肝脏中的细胞动力学和分子机制 | 数字病理学 | 肝癌 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 10647 | 2024-08-05 |
Identification of ferroptosis-related gene signature for tuberculosis diagnosis and therapy efficacy
2024-Jul-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110182
PMID:38989455
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研究论文 | 本文识别了与铁死亡相关的基因特征，旨在用于结核病的诊断和疗效评估 | 提出了一种包含ACSL4、CTSB和TLR4基因的铁死亡相关基因特征，作为结核病的生物标志物 | 研究主要依赖于血液样本，可能无法全面代表结核病患者的情况 | 探讨铁死亡相关基因特征在结核病诊断和治疗中的应用 | 结核病患者、潜伏结核感染者和健康对照者的血液样本 | 数字病理学 | 结核病 | scRNA-seq、微阵列和大规模RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四组基因表达数据，涉及结核病患者、潜伏感染者和健康对照者 |
| 10648 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals that NRF2 regulates vascular smooth muscle cell phenotypic switching in abdominal aortic aneurysm
2024-Jul-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202400001RR
PMID:38995239
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研究论文 | 研究表明NRF2在腹主动脉瘤中调节血管平滑肌细胞表型转变 | 识别NRF2作为维持血管平滑肌细胞收缩表型的重要调节因子，并且通过miR-145依赖性机制影响腹主动脉瘤形成 | 研究仅在小鼠模型中进行，可能存在物种间差异 | 深入理解NRF2在血管平滑肌细胞表型转变中的作用 | 血管平滑肌细胞及其在腹主动脉瘤形成中的反应 | 数字病理学 | 腹主动脉瘤 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因组转录组数据 | NA |
| 10649 | 2024-08-07 |
Erratum for the Research Article "Single-cell RNA-seq reveals cell type-specific molecular and genetic associations to lupus" by R. K. Perez et al
2024-Jul-12, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adr4064
PMID:38991087
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10650 | 2024-08-04 |
Unbiasedly decoding the tumor microenvironment with single-cell multiomics analysis in pancreatic cancer
2024-Jul-09, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02050-7
PMID:38982491
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研究论文 | 本文总结了胰腺癌肿瘤微环境的单细胞多组学分析研究 | 提供了一种无偏见的方式对胰腺癌肿瘤微环境进行解码，强调了每种细胞成分的功能和分类基础 | 研究可能未能全面评估所有细胞簇的功能及其在抗肿瘤中的潜力 | 旨在精确识别胰腺癌肿瘤微环境中的所有细胞簇并提供新的见解 | 关注胰腺导管腺癌的肿瘤微环境及其单细胞组成 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序和质谱技术 | NA | 多组学数据 | NA |
| 10651 | 2024-08-05 |
A novel CAF-cancer cell crosstalk-related gene prognostic index based on machine learning: prognostic significance and prediction of therapeutic response in head and neck squamous cell carcinoma
2024-Jul-09, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05447-6
PMID:38982511
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研究论文 | 本研究开发了一种与肿瘤相关成纤维细胞-癌细胞相互作用相关的预后指数，以评估头颈部鳞状细胞癌患者的预后和免疫治疗反应 | 提出了一种新颖的肿瘤相关成纤维细胞-癌细胞相互作用相关基因预后指数（CCRGPI），可用于评估头颈部鳞状细胞癌的预后和免疫检验点抑制剂的疗效 | 研究未涉及其他类型癌症的适用性，局限于头颈部鳞状细胞癌 | 旨在评估头颈部鳞状细胞癌患者的预后和免疫治疗反应 | 研究对象为头颈部鳞状细胞癌患者及其相关的细胞模型 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），LASSO回归 | FCICC模型和FC-organoid模型 | 基因组数据 | NA |
| 10652 | 2024-08-07 |
Correction to: Single-cell RNA Sequencing Reveals Sexually Dimorphic Transcriptome and Type 2 Diabetes Genes in Mouse Islet β Cells
2024-Jul-03, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae022
PMID:38981583
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10653 | 2024-08-05 |
GHCU, a Molecular Chaperone, Regulates Leaf Curling by Modulating the Distribution of KNGH1 in Cotton
2024-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202402816
PMID:38666376
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研究论文 | 该研究揭示了GHCU作为关键调节因子在棉花叶片展平中的作用 | 首次识别GHCU作为叶片形态发生的致因基因，并阐明其通过调节KNGH1分布影响生长素反应的机制 | 缺乏对GHCU在其他植物中功能的广泛验证 | 研究GHCU基因在棉花叶片形态发生中的作用 | 天然棉花突变体cu及相关的转基因棉花和烟草 | 遗传学 | NA | CRISPR | NA | 单细胞RNA测序数据及时空转录组数据 | NA |
| 10654 | 2024-08-05 |
BirthSeq, a new method to isolate and analyze dated cells in different vertebrates
2024-Jul-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202429
PMID:38856078
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研究论文 | 本文介绍了一种新的方法BirthSeq，用于根据细胞出生日期隔离和分析细胞。 | BirthSeq是一个创新的方法，能够进行体内标记、利用荧光激活细胞分选隔离细胞，并通过高通量技术分析。 | 尚未提及BirthSeq在其他物种或条件下的适用性和局限性。 | 研究开发一种新的实验工具，以理解时间如何转化为驱动细胞命运的遗传指令。 | 研究对象为不同脊椎动物的发育器官中的细胞。 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 三种脊椎动物（小鼠、雏鸡和壁虎）的发育器官样本 |
| 10655 | 2024-08-05 |
Unraveling dynamic immunological landscapes in intracerebral hemorrhage: insights from single-cell and spatial transcriptomic profiling
2024-Jul, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.635
PMID:38988493
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组剖析，揭示了脑内出血后的免疫学动态格局 | 首次从单细胞分辨率层面探讨了脑内出血后免疫细胞动态及其空间分布 | 临床试验的失败可能归因于细胞异质性和复杂的细胞间网络 | 揭示脑内出血后免疫学的动态变化和空间分布 | 针对脑内出血后的免疫细胞群体进行分析 | 数字病理学 | 脑卒中 | 单细胞RNA测序，空间转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 在超急性、急性和亚急性三个不同时间点的样本 |
| 10656 | 2024-08-05 |
Interleukin-7-based identification of liver lymphatic endothelial cells reveals their unique structural features
2024-Jul, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2024.101069
PMID:38966234
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研究论文 | 本文识别了肝脏淋巴内皮细胞的独特结构特征，并发现了IL7作为其特有标记物 | 创新点在于首次确定IL7为肝脏淋巴内皮细胞的特有标记，并建立了淋巴内皮细胞的分离方法 | 研究仅基于小鼠肝脏细胞，尚需在人体样本中验证IL7标记的有效性 | 探索肝脏淋巴内皮细胞的特征以及其在肝脏损伤过程中的转录组变化 | 小鼠肝脏中的淋巴内皮细胞（LyEC） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA数据 | 小鼠样本，具体数量未提及 |
| 10657 | 2024-08-04 |
Identification and validation of Cystatin A as a novel promising therapeutic target for gastric cancer
2024-Jun-30, Journal of gastrointestinal oncology
IF:2.0Q3
DOI:10.21037/jgo-23-941
PMID:38989439
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研究论文 | 本研究确定并验证了Cystatin A作为胃癌的新型有前景的治疗靶点 | 本研究通过生物信息学技术识别与胃癌复发无生存期相关的11个基因，并探讨了Cystatin A对信号通路和治疗的影响 | 研究尚未深入探索其他潜在的预后相关基因，可能忽略了一些重要因素 | 揭示胃癌发展的分子机制并确认新的预后靶点 | 胃癌患者的基因和单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 胃癌 | 生物信息学技术、单细胞测序、免疫组织化学 | LASSO-Cox模型 | 基因数据 | 涉及胃癌患者的TCGA-STAD和GSE54129数据集 |
| 10658 | 2024-08-05 |
Role of TAP1 in the identification of immune-hot tumor microenvironment and its prognostic significance for immunotherapeutic efficacy in gastric carcinoma
2024-Jun-30, Journal of gastrointestinal oncology
IF:2.0Q3
DOI:10.21037/jgo-24-28
PMID:38989426
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研究论文 | 本研究探讨了TAP1在胃癌免疫炎症微环境中的作用及其对免疫治疗效果的预后意义 | 本研究揭示了TAP1与免疫特征之间的积极相关性，并将其作为反映炎性肿瘤微环境和免疫反应的新生物标志物 | 未能发现TAP1表达与不同临床病理特征显著相关性，表明其对分子亚型并不特异 | 本研究旨在阐明TAP1表达与免疫特征的关联，并利用其作为反映免疫治疗反应的生物标志物 | 研究对象为胃癌患者及其肿瘤微环境特征 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自TCGA-STAD队列和GEO门户的数据 |
| 10659 | 2024-08-05 |
Optimizing single-cell RNA sequencing methods for human colon biopsies: droplet-based vs. picowell-based platforms
2024-Jun-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.24.600526
PMID:38979379
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研究论文 | 本研究比较了两种单细胞RNA测序平台在处理人类结肠活检样本时的效果 | 本研究首次系统比较了滴液基础与微井基础单细胞RNA测序平台在结肠活检样本中的应用差异 | 研究样本数量有限，仅涉及两名成人的活检样本 | 评估和优化人类结肠活检的单细胞RNA测序方法 | 来源于两名成人结肠的内镜直肠-乙状结肠黏膜活检细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 2名成人的结肠活检样本 |
| 10660 | 2024-08-04 |
Comprehensive single-cell and bulk RNA-seq analyses reveal a novel CD8+ T cell-associated prognostic signature in ovarian cancer
2024-06-25, Aging
DOI:10.18632/aging.205966
PMID:38925650
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研究论文 | 本文通过单细胞测序分析开发了一个新的CD8+ T细胞相关预后模型，应用于卵巢癌 | 开发了基于CD8 T细胞标记的新颖预后模型，并首次深入探索了CD8 T细胞在卵巢癌中的预后作用 | 未提供具体的样本大小及样本来源的细节 | 探讨CD8 T细胞在卵巢癌中的预后作用，并开发相应的预后模型 | 卵巢癌患者的CD8 T细胞及其相关预后 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归与LASSO回归 | NA | NA |