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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
81 2026-01-09
Physical activity decreases cancer burden by alleviating immunosenescence-related inflammation and improving overall immunity
2025-Dec-16, Cell reports. Medicine
研究论文 本研究通过队列研究和实验分析,揭示了体育锻炼通过减轻炎症、减少免疫衰老和增强整体免疫力来降低癌症风险的机制 首次通过大规模队列和单细胞测序等实验,系统性地证明了体育锻炼剂量依赖性地降低系统性炎症,从而减少炎症相关癌症风险和全癌死亡率,并阐明了其分子机制 研究主要基于观察性队列和动物模型,人类因果关系的直接证据有限,且具体运动类型和强度的优化方案需进一步探索 探究体育锻炼与癌症发病率及死亡率之间的关联及其潜在机制 英国和美国的443,768名成年人,以及小鼠和仓鼠动物模型 生物医学研究 癌症 单细胞测序, RNA测序, 细胞计数术, 炎症阵列 NA 队列数据, 基因表达数据, 细胞表型数据 443,768名成年人,以及小鼠和仓鼠动物模型 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
82 2026-01-09
A conserved differentiation programme facilitates inhibitory neuron production in the developing mouse and human cerebellum
2025-Dec-15, Development (Cambridge, England)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠和人类小脑发育中表达巢蛋白的祖细胞向抑制性神经元分化的保守分子机制 首次在小鼠和人类小脑发育中鉴定FOXO1作为ASCL1下游关键调控因子,并揭示WNT信号通路促进ASCL1+向FOXO1+细胞状态转变的保守机制 研究主要基于体外培养系统,体内验证不足;人类样本可能有限,未全面评估其他细胞类型或信号通路的影响 探究哺乳动物小脑发育中抑制性神经元产生的分子机制和转录因子协同作用 新生小鼠小脑和人类原代培养的表达巢蛋白的祖细胞 发育生物学 脊髓小脑性共济失调 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确指定样本数量,涉及小鼠和人类原代培养细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
83 2026-01-09
Identification and validation of efferocytosis-related biomarkers for the diagnosis of atherosclerosis based on bioinformatics and machine learning
2025-Dec-15, European journal of medical research IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过生物信息学和机器学习方法,识别并验证了与动脉粥样硬化诊断相关的胞葬作用生物标志物 结合机器学习筛选出5个潜在诊断生物标志物,并利用单细胞RNA测序和细胞实验验证其在动脉粥样硬化巨噬细胞中的特异性上调 研究主要基于公共数据库数据,外部验证样本有限,且未深入探讨生物标志物的具体作用机制 识别和验证与动脉粥样硬化诊断相关的胞葬作用生物标志物,并构建临床预测模型 动脉粥样硬化样本和对照样本的基因表达数据 生物信息学 心血管疾病 基因表达分析、蛋白质-蛋白质相互作用分析、功能富集分析、机器学习、免疫浸润分析、单细胞RNA测序、细胞实验 机器学习模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
84 2026-01-09
Rapamycin preserves cardiac function in autoimmune myocarditis by reprogramming Cxcl9+ macrophages via the mTORC1-C/EBPβ-OSM axis
2025-Dec-13, Redox biology IF:10.7Q1
研究论文 本文研究了雷帕霉素通过mTORC1-C/EBPβ-OSM轴重编程Cxcl9+巨噬细胞,从而在自身免疫性心肌炎中保护心脏功能 揭示了雷帕霉素通过抑制mTOR信号、恢复线粒体代谢并阻断C/EBPβ依赖性OSM介导的巨噬细胞-心肌细胞串扰来重编程致病性Cxcl9+巨噬细胞的新机制 研究基于小鼠模型,临床转化需进一步验证;未详细探讨长期治疗效应或潜在副作用 探究雷帕霉素在自身免疫性心肌炎中保护心脏功能的分子机制 BALB/c小鼠诱导的实验性自身免疫性心肌炎模型,重点关注心脏CD45+免疫细胞和心肌细胞 单细胞组学 心血管疾病 单细胞RNA测序,伪时间轨迹分析,SCENIC调控网络分析,NicheNet细胞通讯分析,Seahorse代谢测定,qPCR,ELISA 动物模型(小鼠),细胞共培养模型 单细胞转录组数据,基因表达数据,蛋白质水平数据,影像数据 未明确具体样本数量,但涉及小鼠模型和体外细胞实验 NA 单细胞RNA测序 NA NA
85 2026-01-09
Exploring the role of PANoptosis in idiopathic pulmonary fibrosis based on scRNA-seq and bulk-seq
2025-Dec-10, Clinical and experimental medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究结合单细胞RNA测序和转录组数据,探讨了PANoptosis在特发性肺纤维化发病机制中的作用 首次将PANoptosis(一种整合了焦亡、凋亡和坏死性凋亡的新型程序性细胞死亡形式)与特发性肺纤维化联系起来,并基于相关基因构建了诊断预测模型 研究主要基于公共数据集和动物模型,需要在更大规模的人类临床样本中进行验证 阐明PANoptosis在特发性肺纤维化发病机制中的作用 特发性肺纤维化患者和动物模型 生物信息学 特发性肺纤维化 单细胞RNA测序,转录组测序,qRT-PCR WGCNA,机器学习方法 基因表达数据 基于GEO数据集GSE227136(具体样本数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
86 2026-01-09
Single‑cell RNA sequencing reveals fibroblast heterogeneity and identifies CLOCK as a key regulator in fibrotic skin diseases
2025-Dec-06, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了纤维化皮肤疾病中成纤维细胞的异质性,并识别出CLOCK作为瘢痕疙瘩的关键调控因子 首次通过单细胞RNA测序系统解析了正常皮肤、疤痕、瘢痕疙瘩和硬皮病中成纤维细胞的异质性,并发现了疾病特异性调控因子如CLOCK在瘢痕疙瘩中的关键作用 研究主要基于公共数据库的scRNA-seq数据,缺乏实验验证的深度;样本来源和数量可能有限,未详细说明具体样本量 探究纤维化皮肤疾病的发病机制,识别关键调控因子以开发靶向治疗策略 纤维化皮肤疾病中的成纤维细胞,包括正常皮肤、疤痕、瘢痕疙瘩和硬皮病组织 数字病理学 皮肤纤维化疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
87 2026-01-09
Integrating single-cell RNA-Seq and machine learning to dissect a novel Palmitoylation-related prognostic signature of glioblastoma
2025-Dec-04, BMC neurology IF:2.2Q3
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序和机器学习方法,首次在胶质母细胞瘤单细胞水平揭示了棕榈酰化的异质性,并构建了一个基于棕榈酰化相关基因的新型预后特征 首次在GBM单细胞水平揭示棕榈酰化的异质性;通过10种机器学习算法的101种组合筛选变量和构建模型;鉴定出ZDHHC2、ZDHHC4和ZDHHC20作为GBM棕榈酰化的关键调控因子 NA 探索基于棕榈酰化相关基因的胶质母细胞瘤预后生物标志物 胶质母细胞瘤 机器学习 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序 多种机器学习算法组合 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
88 2026-01-09
NEO1 modulates the A1 astrocyte polarization in subarachnoid hemorrhage through the cPLA2-MAVS signaling pathway
2025-Dec-04, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
研究论文 本研究揭示了NEO1通过cPLA2-MAVS信号通路调控蛛网膜下腔出血后A1型星形胶质细胞极化的机制 首次发现NEO1在SAH后A1星形胶质细胞极化中的关键作用,并阐明其通过cPLA2-MAVS-NF-κB信号通路发挥功能的分子机制 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证;体外实验使用原代星形胶质细胞,可能存在细胞培养环境与体内条件的差异 探究蛛网膜下腔出血后神经炎症中星形胶质细胞极化的调控机制 小鼠蛛网膜下腔出血模型、原代星形胶质细胞 神经科学 脑血管疾病 单细胞RNA测序、转录组测序、慢病毒载体过表达 条件性基因敲除小鼠模型 RNA测序数据、基因表达数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
89 2026-01-09
Single-cell sequencing in bladder cancer: new insights from tumor cell diversity to individualized treatment strategies
2025-Dec-03, Cancer cell international IF:5.3Q1
综述 本文综述了单细胞测序技术在膀胱癌研究中的应用进展,包括其在评估肿瘤异质性、肿瘤微环境、转移和治疗耐药性方面的作用 系统总结了单细胞测序技术如何通过提高灵敏度、准确性和效率来增强对膀胱癌肿瘤异质性的检测,为理解其发病机制提供了新的视角 作为一篇综述文章,未提出新的实验数据或模型,主要基于现有文献进行总结和展望 回顾单细胞测序技术的发展及其在膀胱癌研究中的应用,为未来的研究方向提供新视角 膀胱癌 数字病理学 膀胱癌 单细胞测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
90 2026-01-09
Spatial transcriptomics analysis uncovers ER stress in MANF-deficient Purkinje cells underlying alcohol-induced cerebellar neurodegeneration in mice
2025-Dec-03, Acta neuropathologica communications IF:6.2Q1
研究论文 本研究通过空间转录组学分析,揭示了MANF缺陷的浦肯野细胞在酒精诱导的小鼠小脑神经退行性变中,内质网应激的潜在机制 首次利用PC特异性MANF敲除小鼠模型,结合空间转录组学和高通量原位分析,揭示了MANF在酒精诱导的内质网应激和神经退行性变中的性别特异性保护作用 研究主要基于小鼠模型,结果在人类中的适用性尚需进一步验证,且性别差异的分子机制尚未完全阐明 探究MANF在保护浦肯野细胞免受酒精诱导的内质网应激和神经退行性变中的作用 PC特异性MANF敲除小鼠的浦肯野细胞 空间转录组学 酒精使用障碍 空间转录组学, 高通量原位分析 PC特异性MANF敲除小鼠模型 基因表达数据, 行为数据 成年PC特异性MANF敲除小鼠 10x Genomics 空间转录组学 10x Xenium 10x Xenium原位分析平台
91 2026-01-09
Integrated multi-omics of mitophagy-related molecular subtype characterization and biomarker identification in sepsis
2025-Dec-01, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据,识别并验证了与线粒体自噬相关的关键基因作为脓毒症的诊断生物标志物,并基于这些基因对脓毒症患者进行了分子亚型分型 首次系统性地整合了批量转录组和单细胞RNA-seq数据,结合机器学习方法,识别出四个具有高诊断效能的线粒体自噬相关基因(RPL18、PRPF8、NUP93、CUL1),并基于这些基因对脓毒症患者进行分子亚型分型,揭示了不同的免疫微环境特征,同时通过体外实验功能验证了NUP93在脓毒症中促进线粒体自噬的作用 研究主要基于公共数据集和体外细胞实验,缺乏大规模的前瞻性临床队列验证,且功能验证仅针对NUP93一个基因在RAW264.7细胞系中进行,未涵盖所有生物标志物 识别和验证用于脓毒症诊断、分层和免疫调节的关键线粒体自噬相关基因 脓毒症患者(通过公共转录组数据集)和LPS刺激的RAW264.7巨噬细胞系 生物信息学 脓毒症 批量转录组测序、单细胞RNA-seq、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、机器学习、免疫浸润分析(ESTIMATE、ssGSEA)、腺病毒过表达 机器学习(具体模型未指定) 转录组数据(批量与单细胞) 未在摘要中明确指定样本数量,涉及公共转录组数据集和RAW264.7细胞系 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
92 2026-01-09
A mannitol-based buffer improves single-cell RNA sequencing of high-salt marine cells
2025-Dec-01, BMC genomics IF:3.5Q2
研究论文 本文提出了一种基于甘露醇的缓冲液(PBS-M),用于改善高盐度海洋生物细胞的单细胞RNA测序质量 开发了一种低盐度磷酸盐缓冲液(PBS-M),通过添加D-甘露醇来维持高盐度海洋细胞的活力,从而提高scRNA-seq的数据质量和细胞代表性 研究仅在海鞘类物种中进行了验证,尚未广泛测试于其他海洋生物,且未详细探讨缓冲液对细胞转录组的长期影响 改进高盐度海洋生物细胞的单细胞RNA测序方法,以提升数据质量和细胞状态检测能力 海鞘Ciona robusta的血细胞以及第二种海鞘物种的细胞 单细胞测序 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA测序数据 未明确指定样本数量,但涉及海鞘血细胞及第二种海鞘物种的细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
93 2026-01-09
IL-15 signaling via cis- and trans-presentation to progenitor-exhausted CD8+ T cells enhances radio-immunotherapy efficacy in ESCC
2025-Dec-01, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1
研究论文 本研究探讨了IL-15信号通过顺式和反式呈递给祖细胞耗竭CD8+ T细胞,以增强食管鳞状细胞癌(ESCC)放疗-免疫联合疗法疗效的机制 揭示了IL-15在ESCC肿瘤微环境中的关键作用,明确了其通过顺式/反式呈递激活祖细胞耗竭CD8+ T细胞的空间依赖性机制,并首次提出IL-15可作为预测放疗联合免疫治疗疗效的生物标志物 研究主要基于临床队列和临床前小鼠模型,需要更大规模的前瞻性临床试验验证IL-15作为生物标志物的可靠性 探究IL-15在食管鳞状细胞癌(ESCC)放疗联合免疫治疗中的作用机制,并评估其作为疗效预测生物标志物的潜力 接受放疗和免疫治疗的ESCC患者队列、患者血液和组织样本、临床前小鼠模型 肿瘤免疫学 食管鳞状细胞癌 ELISA、流式细胞术、单细胞RNA测序、空间分析 临床队列分析、临床前小鼠模型 蛋白质表达数据、细胞表型数据、单细胞转录组数据、空间分布数据 ESCC患者临床队列(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
94 2026-01-09
ASPEN: Robust detection of allelic dynamics in single cell RNA-seq
2025-Dec, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 本文介绍了一种名为ASPEN的统计方法,用于在单细胞转录组数据中建模等位基因均值和方差,以提高等位基因动态检测的敏感性 ASPEN结合了敏感映射流程、调节的β-二项模型和自适应收缩方法,能区分单细胞中的等位基因失衡和等位基因方差变化,相比现有方法敏感性提高约30% NA 开发一种统计方法以更准确地检测单细胞RNA-seq数据中的等位基因动态 F1杂交小鼠的脑类器官和T细胞 自然语言处理 NA 单细胞RNA-seq 调节的β-二项模型 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
95 2026-01-09
Expression of Opioid Growth Factor,Opioid Growth Factor Receptor,P16,and P21 and Their Correlations With Clinicopathological Characteristics in Elderly Patients With Colorectal Cancer
2025-Dec, Zhongguo yi xue ke xue yuan xue bao. Acta Academiae Medicinae Sinicae
研究论文 本研究探讨了阿片样生长因子(OGF)、其受体(OGFR)以及P16和P21在老年结直肠癌患者中的表达情况,并分析了它们与临床病理特征及预后的相关性 首次在老年结直肠癌患者中综合分析了OGF/OGFR信号通路与细胞周期调控蛋白P16、P21的关联,并结合生物信息学分析(包括单细胞RNA测序和空间转录组学)与多种实验方法(ELISA、Western blot、免疫组化)进行验证 研究样本量相对有限(共167例),且为单中心回顾性研究,可能存在选择偏倚;未深入探讨OGF/OGFR通路抑制P16/P21的具体分子机制 探究OGF、OGFR、P16和P21在老年结直肠癌中的表达模式及其与临床病理特征和患者预后的关系 老年结直肠癌患者的癌组织及癌旁正常组织 数字病理学 结直肠癌 ELISA, Western blot, 免疫组织化学, 生物信息学分析(差异表达分析、生存分析) NA 组织样本(新鲜组织、石蜡包埋组织)、基因表达数据 167例老年结直肠癌患者(30例新鲜组织样本,137例石蜡包埋组织样本) NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
96 2026-01-09
uPAR expression in M-MDSCs under high LDHA activity in pancreatic ductal adenocarcinoma
2025-Nov-30, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究探讨了胰腺导管腺癌中高LDHA活性通过调节乳酸代谢影响M-MDSCs上uPAR表达,从而促进免疫抑制肿瘤微环境的机制 首次揭示了LDHA驱动的乳酸代谢通过胆固醇代谢途径调控M-MDSCs中uPAR表达的具体机制,并建立了LDHA活性与uPAR阳性M-MDSCs在人类PDAC样本中的临床相关性 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,需要更大规模的临床验证;机制研究尚未完全阐明uPAR信号传导的具体下游通路 阐明高LDHA肿瘤微环境中乳酸代谢如何调节免疫细胞(特别是MDSCs)并促进胰腺癌免疫抑制 胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤微环境中的髓源性抑制细胞(MDSCs),特别是单核细胞性MDSCs(M-MDSCs) 肿瘤免疫学 胰腺癌 单细胞RNA测序,多重免疫荧光染色,基因集富集分析 小鼠Ldha敲低(shLdha)PDAC模型 单细胞转录组数据,免疫荧光图像数据 小鼠PDAC模型和人类PDAC样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
97 2026-01-09
Genomic heterogeneity drives distinct infiltration patterns in glioblastoma
2025-Nov-29, Acta neuropathologica communications IF:6.2Q1
研究论文 本研究利用高维空间转录组学技术,分析了胶质母细胞瘤中浸润性肿瘤细胞的基因表达谱和细胞状态,揭示了基因组异质性如何驱动不同的浸润模式 首次使用CosMx空间分子成像仪在单细胞分辨率下对胶质母细胞瘤的肿瘤核心和浸润边缘进行空间转录组分析,识别出一种新的胶质祖细胞样状态,并发现其在经典亚型中富集且与EGFR扩增或突变相关 样本量较小(仅8名患者),且研究基于福尔马林固定石蜡包埋样本,可能影响RNA质量,空间分析仅限于靶向1000个基因的panel 表征胶质母细胞瘤中浸润性肿瘤细胞的基因表达谱和细胞状态,以理解肿瘤异质性对疾病进展的影响 胶质母细胞瘤患者的肿瘤组织,包括肿瘤核心和浸润边缘 数字病理学 胶质母细胞瘤 空间转录组学 NA 空间基因表达数据 8名胶质母细胞瘤患者的肿瘤组织样本 NanoString 空间转录组学 CosMx Spatial Molecular Imager CosMx空间分子成像仪,使用靶向1000个基因的panel进行单细胞分辨率空间转录组分析
98 2026-01-09
Identification and validation of SUN modification-related anti-PD-1 immunotherapy-resistance signatures to predict prognosis and immune microenvironment status in glioblastoma
2025-Nov-29, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过生物信息学方法识别并验证了与泛素化、SUMO化和neddylation(统称SUN修饰)及抗PD-1免疫治疗耐药相关的关键基因,构建了一个用于预测胶质母细胞瘤预后和免疫微环境状态的六基因风险模型 首次整合SUN修饰与抗PD-1耐药性,识别出六个关键预后基因(PLK2、CDC73、PSMC2、SOCS3、ETV4、LMO7),并构建了具有优异预测性能(AUC>0.9)的预后风险模型,同时结合单细胞RNA测序和空间转录组分析揭示了SOCS3在单核细胞/巨噬细胞中的特异性表达及其潜在功能 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞系验证,缺乏大规模临床队列的独立验证和体内实验证据 探究SUN修饰相关基因在胶质母细胞瘤中的预后意义及其与抗PD-1免疫治疗耐药性的关联 胶质母细胞瘤(GBM)细胞系及相关的公共基因组学数据 生物信息学 胶质母细胞瘤 差异表达分析、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、机器学习算法、RT-qPCR、Western blotting、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组分析 机器学习算法(文中未指定具体模型类型) 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
99 2026-01-09
Single-cell transcriptome analysis defines novel molecular subtypes and reveals therapeutic implications of T/myeloid mixed-phenotype acute leukemia
2025-Nov-29, Genome medicine IF:10.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析定义了T/髓系混合表型急性白血病(T/My MPAL)的新型分子亚型,并揭示了其治疗意义 首次构建了T/My MPAL的单细胞转录组图谱,定义了三种恶性细胞亚群(AML样、T-ALL样和独特亚群),并发现了传统流式细胞术分类的局限性 研究样本量相对有限,且部分发现需进一步临床验证 识别T/My MPAL的分子亚型并开发亚型特异性治疗策略,以改善预后和实现个性化治疗 T/髓系混合表型急性白血病(T/My MPAL)、急性髓系白血病(AML)、T细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL)患者及正常供体的细胞 数字病理学 白血病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 近275,000个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
100 2026-01-09
Multi-region spatial transcriptomics reveals region specific differences in response to amyloid beta (Aβ) plaque induced changes in Alzheimer's disease (AD)
2025-Nov-29, Human genomics IF:3.8Q2
研究论文 本研究通过多区域空间转录组学分析,揭示了阿尔茨海默病中不同脑区对Aβ斑块诱导变化的区域特异性差异 首次在AD中结合多区域空间转录组学和Aβ免疫荧光染色,系统比较了不同皮质区域的细胞类型比例、基因表达和细胞间通讯差异 样本量较小(仅2名Braak III和Thal 4期AD患者),且未包括早期或晚期AD阶段 探究AD中不同脑区对Aβ斑块诱导变化的细胞类型和分子机制差异 两名Braak III和Thal 4期AD患者的四个脑区(内嗅皮质、枕颞皮质、背外侧前额叶皮质和纹状皮质) 空间转录组学 阿尔茨海默病 空间转录组学,免疫荧光染色 NA 空间转录组数据,免疫荧光图像 2名AD患者的4个脑区组织 NA 空间转录组学 NA NA
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