单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 34375 篇文献,本页显示第 81 - 100 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
81 2025-12-23
Cmpk2 Protects Against Acute Lung Injury in Mice
2025-Jul-05, Lung IF:4.6Q1
研究论文 本研究探讨了线粒体代谢酶Cmpk2在铜绿假单胞菌诱导的急性肺损伤中的作用及其保护机制 首次揭示了Cmpk2通过STING依赖的机制增强中性粒细胞吞噬功能并减轻肺部炎症,从而在急性肺损伤中发挥保护作用 研究主要基于小鼠和斑马鱼模型,在人体中的直接验证尚不充分,且STING通路的具体调控机制有待进一步阐明 探究Cmpk2在急性肺损伤/急性呼吸窘迫综合征中的功能与分子机制 Cmpk2基因敲除小鼠、斑马鱼胚胎、ARDS患者样本 数字病理学 急性肺损伤/急性呼吸窘迫综合征 单细胞RNA测序、流式细胞术、ELISA、GO/KEGG分析、苏木精-伊红染色 基因敲除动物模型 基因表达数据、病理图像、细胞计数数据 未明确样本数量,但使用了小鼠模型、斑马鱼胚胎及公共数据库(GEO)中ARDS患者数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
82 2025-12-23
Single-Cell RNA Sequencing and Spatial Transcriptomics Reveal a Novel Mechanism of Oligodendrocyte-Neuron Interaction in Cognitive Decline After High-Altitude Cerebral Edema
2025-Jun, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了高原脑水肿后认知衰退中少突胶质细胞与神经元相互作用的新机制 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,在高原脑水肿模型中系统解析了少突胶质细胞与神经元间的相互作用机制,并发现了PI3K/mTOR动态变化、Rps29-bax轴及Tnfrsf21-App作为新型调控因子 研究基于小鼠模型,结果在人类中的适用性需进一步验证;仅观察了3天和7天两个时间点,长期效应尚不明确 探究高原脑水肿导致认知衰退的细胞与分子机制 高原脑水肿小鼠模型中的海马组织细胞 数字病理学 高原脑水肿 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
83 2025-12-23
SPP1+ macrophages in tumor immunosuppression: mechanisms and therapeutic implications
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了SPP1+巨噬细胞在肿瘤免疫抑制中的作用机制及其治疗意义 系统总结了SPP1+巨噬细胞作为跨多种癌症类型的关键免疫抑制细胞亚群的最新研究进展,并强调了其作为治疗靶点的潜力 本文为综述文章,主要基于现有文献进行总结,未提供新的原始实验数据 探讨SPP1+巨噬细胞在肿瘤微环境中的分化机制、免疫抑制功能及其作为癌症治疗靶点的潜力 SPP1+巨噬细胞及其在多种人类恶性肿瘤中的作用 数字病理学 多种癌症 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
84 2025-12-23
Neutrophil-mediated immune dysregulation in recurrent miscarriage: implications of APP-CD74 signaling and CXCL1 as diagnostic biomarkers
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合转录组和单细胞测序数据,揭示了中性粒细胞驱动的免疫失调在复发性流产中的作用,并鉴定出APP-CD74信号轴和CXCL1作为潜在的诊断生物标志物 首次系统性地揭示了复发性流产中TNF-α极化中性粒细胞的激活状态及其通过APP-CD74信号轴介导的细胞间通讯,并鉴定出CXCL1作为具有诊断潜力的新生物标志物 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏在体动物模型或大规模临床队列的验证 探究复发性流产中中性粒细胞介导的免疫失调机制,并寻找诊断生物标志物 复发性流产患者样本、自身免疫疾病数据集、滋养层细胞 数字病理学 复发性流产 RNA-seq, 单细胞RNA测序 CellChat, 列线图模型, 分子对接 转录组数据, 单细胞测序数据 未明确指定样本数量,但整合了多个数据集 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
85 2025-12-23
Histone-related gene WDR77 promotes tumor progression through cell cycle regulation in skin cutaneous melanoma
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据和机器学习方法,发现组蛋白相关基因WDR77在皮肤黑色素瘤中通过调控细胞周期促进肿瘤进展,并验证了其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力 首次整合十种机器学习算法构建了101个预后模型,并识别出WDR77作为关键组蛋白相关基因;结合单细胞和空间转录组学技术验证了WDR77与CDC20在肿瘤区域的共定位和共上调关系 研究主要基于公共数据库的转录组数据,实验验证部分仅限于体外实验,缺乏体内动物模型验证 探索组蛋白相关基因在皮肤黑色素瘤中的预后价值和功能机制 皮肤黑色素瘤(SKCM)患者样本和细胞系 机器学习 皮肤黑色素瘤 转录组测序,单细胞RNA-seq,空间转录组学 随机森林,多种机器学习算法集成 转录组数据,单细胞数据,空间转录组数据 TCGA-SKCM数据集和五个GEO数据集,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq NA NA
86 2025-12-23
Integration of single-cell and bulk RNA-seq via machine learning to reveal ferroptosis- and lipid metabolism-driven immune landscape heterogeneity and predict immunotherapy response in colon cancer
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞和批量RNA-seq数据,利用机器学习揭示了结肠癌中铁死亡和脂质代谢驱动的免疫景观异质性,并预测了免疫治疗反应 整合单细胞和批量RNA-seq数据,结合多种机器学习算法构建预后模型,首次系统探讨铁死亡与脂质代谢在结肠癌免疫微环境中的相互作用及对免疫治疗反应的预测价值 研究主要基于公共数据库的转录组数据,缺乏前瞻性临床队列验证,且免疫治疗反应预测需进一步实验证实 探索结肠癌中铁死亡与脂质代谢的相互作用,建立预后模型以阐明免疫微环境异质性并评估免疫治疗前景 结肠癌患者 机器学习 结肠癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 免疫组化 支持向量机, 随机森林, 极端梯度提升, LASSO回归 转录组数据, 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 来自TCGA和GEO数据库的转录组及单细胞转录组数据 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
87 2025-12-23
Identification of a ubiquitin-binding domain protein, CD2AP, in predicting the prognosis and treatment of lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过多组学分析识别了CD2AP作为肺腺癌的关键预后生物标志物和治疗靶点 首次将CD2AP与肺腺癌的预后、免疫浸润及单细胞水平上的细胞间通讯联系起来,并通过分子对接识别了潜在靶向药物 研究主要基于公共数据库和细胞系实验,缺乏大规模临床队列验证和体内动物模型实验 识别肺腺癌中关键的泛素化相关调控因子并探讨其临床意义 肺腺癌组织样本和A549细胞系 生物信息学 肺癌 转录组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序、分子对接、qPCR、Western Blot、免疫荧光 NA 转录组数据、蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据 来自TCGA、GEO和CPTAC数据库的肺腺癌样本数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
88 2025-12-23
Advancing breast cancer biomarkers: a centromere-related gene signature integrated with single-cell analysis for prognostic prediction
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究整合多组学数据,首次建立了基于着丝粒蛋白的乳腺癌预后模型,并验证了关键分子MMP1的生物学功能 首次构建了基于着丝粒蛋白家族的乳腺癌预后模型,并结合单细胞分析揭示了CENPA高表达亚群与增殖性肿瘤细胞及免疫抑制微环境的关联 NA 开发乳腺癌预后预测模型并识别新的生物标志物和治疗靶点 乳腺癌患者,特别是三阴性乳腺癌亚型 数字病理学 乳腺癌 RNA转录组分析,单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析 Cox回归,LASSO算法 RNA转录组数据,单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
89 2025-12-23
SULF1's Role in Endothelial Senescence and Atherosclerosis: Insights from Single-Cell and Bulk Transcriptomics
2025, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本研究通过单细胞和批量转录组学分析,揭示了SULF1在动脉粥样硬化内皮细胞衰老中的关键作用 结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,首次在动脉粥样硬化背景下识别出SULF1作为内皮细胞衰老的关键基因,并通过体内外实验验证其功能 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,人类样本验证有限,且未深入探讨SULF1调控衰老的具体分子机制 探究动脉粥样硬化中内皮细胞衰老的分子机制,并寻找潜在治疗靶点 动脉粥样硬化斑块组织、ApoE-/-小鼠、人主动脉内皮细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, siRNA敲低, Western印迹, RT-qPCR, β-半乳糖苷酶染色 NA 转录组数据, 图像数据 动脉粥样硬化斑块及邻近正常组织的单细胞RNA测序数据、早期和晚期斑块的批量RNA测序数据、ApoE-/-小鼠模型、人主动脉内皮细胞体外实验 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
90 2025-12-23
Single-cell analysis reveals XCL1+ CD8+ T cells as a therapeutic target in hepatocellular carcinoma
2025, Molecular & cellular oncology IF:2.6Q3
研究论文 本研究通过单细胞分析揭示了XCL1+ CD8+ T细胞在肝细胞癌肿瘤微环境中的存在及其作为免疫治疗潜在靶点的重要性 首次在肝细胞癌中系统鉴定XCL1+ CD8+ T细胞亚群,并发现其与良好预后相关,提出了基于该细胞群的预后预测模型 研究主要基于已有数据集分析,缺乏实验验证;样本来源和数量可能限制结论的普适性 探究XCL1+ CD8+ T细胞在肝细胞癌免疫治疗中的作用和机制 肝细胞癌肿瘤微环境中的免疫细胞,特别是XCL1+ CD8+ T细胞 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,多重免疫组化,bulk RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,临床数据,bulk RNA测序数据 多个scRNA-seq数据集和两个独立bulk RNA-seq数据集,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
91 2025-12-23
BRAP Promotes the Tumorigenesis of Hepatocellular Carcinoma by Corrupting Cancer Cell Cycle Regulation and Enhancing Immune Evasion
2025, Journal of hepatocellular carcinoma IF:4.2Q2
研究论文 本研究揭示了BRAP通过RAF/MEK/ERK信号通路促进肝癌细胞增殖并塑造免疫抑制微环境,从而驱动肝癌进展 首次阐明BRAP在肝癌发生中的双重作用机制:通过抑制RAF/MEK/ERK通路诱导细胞周期阻滞,同时调控免疫抑制细胞浸润和M2巨噬细胞极化 研究主要基于体外实验和动物模型,缺乏大规模临床队列验证;免疫调控机制的具体分子通路尚未完全解析 探究BRAP在肝癌发生发展中的分子机制及其对肿瘤免疫微环境的调控作用 肝细胞癌(HCC)细胞系、临床组织样本、细胞源性异种移植(CDX)模型 肿瘤生物学 肝癌 RNA-seq, scRNA-seq, 流式细胞术, Western blotting, mfIHC, qRT-PCR CDX模型 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 蛋白质印迹数据, 免疫组化数据 临床HCC组织样本及TCGA、ICGC、GEO公共数据集 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
92 2025-12-23
Taurine-Modified Gossypol Exerts Dual Anti-Hepatocellular Carcinoma Effects by Inactivating PI3K/AKT Pathway and Targeting FASN-Mediated Lipid Metabolism in Regulatory T Cells
2025, Journal of hepatocellular carcinoma IF:4.2Q2
研究论文 本研究探讨了牛磺酸修饰的棉酚(GT)通过双重机制发挥抗肝细胞癌作用 首次揭示GT通过直接抑制肿瘤细胞增殖和靶向调节性T细胞的脂质代谢来重塑肿瘤免疫微环境 研究主要基于体外细胞系和患者来源的类器官模型,缺乏体内动物模型的验证 探究GT的抗肿瘤功效及其作用机制 肝细胞癌(HCC)细胞系、患者来源的HCC类器官、调节性T细胞 癌症研究 肝细胞癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、多参数流式细胞术、分子对接、表面等离子体共振(SPR)、Western blotting NA 基因表达数据、蛋白质数据、细胞表型数据 HepG2细胞系、患者来源的HCC类器官、TCGA数据库中的HCC患者数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
93 2025-12-23
Spatial, transcriptomic and epigenomic analyses link dorsal horn neurons to chronic pain genetic predisposition
2024-Mar-11, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过多物种方法,结合空间转录组学和表观基因组学分析,揭示了慢性疼痛遗传易感性与脊髓背角神经元亚型之间的关联 构建了更全面的单细胞图谱,整合了恒河猴、人类和小鼠数据,并利用空间转录组学揭示了物种保守神经元亚型的层状分布新组织模式 未在摘要中明确提及 确定慢性疼痛遗传变异是否影响背角神经元的调控元件 脊髓背角神经元 数字病理学 慢性疼痛 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单核开放染色质测序 NA 转录组数据, 表观基因组数据, 空间数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单核ATAC-seq NA NA
94 2025-12-23
Single-cell RNA-sequencing profiles reveal the developmental landscape of the Manihot esculenta Crantz leaves
2023-12-30, Plant physiology IF:6.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,构建了木薯叶片的单细胞转录组图谱,揭示了其细胞发育景观和光合特性 首次在木薯叶片中应用单细胞RNA测序技术,识别了15个细胞簇和120个候选标记基因,并构建了细胞发育轨迹图,发现了6个与细胞分化命运相关的基因 NA 在细胞水平上研究木薯叶片的结构和光合特性,为提升木薯产量和营养提供理论基础 木薯(Manihot esculenta Crantz)叶片 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 11,177个高质量叶片细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
95 2024-08-07
Spatial transcriptomics drives a new era in plant research
2023-12, The Plant journal : for cell and molecular biology
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
96 2025-12-23
Identification and validation of prognostic and tumor microenvironment characteristics of necroptosis index and BIRC3 in clear cell renal cell carcinoma
2023, PeerJ IF:2.3Q2
研究论文 本研究通过分析TCGA和GEO数据库,识别了与坏死性凋亡相关的基因簇和预后模型,并验证了枢纽基因BIRC3在透明细胞肾细胞癌中的表达及其对细胞增殖、迁移和侵袭的调控作用 首次构建了基于坏死性凋亡相关基因的预后模型,并深入探讨了BIRC3基因在ccRCC免疫微环境中的关键作用 研究主要依赖公共数据库数据,缺乏大规模临床样本验证,且实验部分仅限于细胞系水平 探索坏死性凋亡在透明细胞肾细胞癌中的调控机制及其临床意义 透明细胞肾细胞癌患者数据、细胞系及单细胞测序数据 生物信息学 肾癌 单细胞测序、定量实时PCR、CCK8实验、transwell实验、伤口愈合实验 LASSO回归模型 基因表达数据、单细胞测序数据 TCGA和GEO数据库中的ccRCC患者数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
97 2025-12-23
Proximal tubule cells in blood and urine as potential biomarkers for kidney disease biopsy
2023, PeerJ IF:2.3Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了肾炎患者的肾脏组织、外周血单核细胞和尿液中的细胞异质性,发现近端小管细胞在血液和尿液中的存在可作为肾脏疾病潜在的微创诊断标志物 首次通过单细胞RNA测序在肾炎患者的外周血和尿液中鉴定出近端小管细胞,并发现其与肾脏组织中的炎症性近端小管细胞具有高度相似的基因表达谱,提出了替代侵入性肾活检的潜在微创诊断方法 研究样本量较小(仅4名患者),且仅针对肾炎患者,结果在其他肾脏疾病中的普适性有待验证 探索肾脏疾病的病理机制并开发微创诊断方法 肾炎患者的肾脏组织、外周血单核细胞和尿液样本 单细胞组学 肾脏疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 4名肾炎患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
98 2025-12-23
Isolation of Endothelial Cells from the Lumen of Mouse Carotid Arteries for Single-cell Multi-omics Experiments
2021-10-04, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 本文介绍了一种从小鼠颈动脉内腔分离内皮细胞的方法,用于单细胞多组学实验,以研究动脉粥样硬化中血流扰动对内皮细胞的影响 开发了一种内腔消化方法,从动脉壁中富集内皮细胞,解决了内皮细胞在总细胞群中占比较低的问题,从而在单细胞分辨率下更有效地研究血流对转录组和染色质可及性的影响 方法可能无法完全排除其他细胞类型的污染,如平滑肌细胞、成纤维细胞和免疫细胞,且在小鼠模型中的结果需进一步验证才能应用于人类动脉样本 研究动脉粥样硬化中血流扰动对内皮细胞转录组和表观基因组的影响,开发内皮细胞富集方法以促进单细胞多组学研究 小鼠颈动脉内皮细胞,通过部分颈动脉结扎手术诱导血流扰动,使用右颈动脉作为对照 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 NA 单细胞RNA和染色质可及性数据 小鼠颈动脉样本,具体数量未在摘要中明确说明 10x Genomics 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq 10x Chromium 10x Genomics微流控设置,用于单细胞和单核条形码标记,后续进行RNA制备、文库生成和高通量DNA测序
99 2025-12-22
Chemical Perturbations Impacting Histone Acetylation Govern Colorectal Cancer Differentiation
2026-Jan, Gastroenterology IF:25.7Q1
研究论文 本研究通过筛选靶向表观遗传调控因子的小分子化合物,发现抑制HDAC1/2催化结构域可促进结直肠癌分化并抑制肿瘤生长,揭示了H3K27ac和H3K9ac作为关键调控标记的机制 首次将HDAC1/2抑制与结直肠癌分化直接关联,并通过单细胞RNA测序和组蛋白修饰谱分析揭示了H3K27ac在介导这一过程中的核心作用 研究主要基于体外模型和患者来源的类器官,体内验证和临床转化仍需进一步探索 识别和表征结直肠癌分化的表观遗传调控因子,揭示重编程癌细胞状态的机制 结直肠癌细胞系、小鼠模型和患者来源的结直肠癌类器官 表观遗传学 结直肠癌 单细胞RNA测序、质谱组蛋白修饰谱分析、遗传筛选 NA 基因表达数据、组蛋白修饰数据、单细胞转录组数据 未明确指定具体样本数量,涉及小鼠和人类结直肠癌模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
100 2025-12-22
MRPL17 is a critical regulator of mitochondrial function and a novel therapeutic target in non-small cell lung cancer
2025-Dec-21, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究探讨了线粒体蛋白MRPL17在非小细胞肺癌中的表达、临床意义及治疗潜力,揭示了其通过调控线粒体功能和细胞氧化还原平衡驱动肿瘤进展的机制 首次将MRPL17鉴定为非小细胞肺癌的关键促癌靶点,并发现其通过直接调控下游靶点COX8A介导线粒体功能障碍和肿瘤恶性表型 研究主要基于细胞系和异种移植模型,缺乏患者来源的类器官或原代细胞验证;临床相关性分析主要依赖公共数据库,需前瞻性队列进一步确认 阐明MRPL17在非小细胞肺癌发生发展中的作用机制,并评估其作为治疗靶点的潜力 非小细胞肺癌细胞系、TCGA和单细胞RNA测序数据、裸鼠异种移植模型 肿瘤生物学 肺癌 单细胞RNA测序、转录组分析、基因沉默/敲除、线粒体功能测定 NA 基因表达数据、单细胞测序数据 TCGA数据库的LUAD和LUSC样本、单细胞RNA测序数据集、体外细胞系实验及裸鼠异种移植模型 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
回到顶部