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当前共找到 43167 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-09-10 |
Microoxic conditions promote Escherichia-associated cellulase expression in the giant panda gut
2026-Jan-14, The ISME journal
DOI:10.1093/ismejo/wrag068
PMID:41925227
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研究论文 | 本研究通过构建物种分辨率的参考目录，结合多组学方法和微生物单细胞RNA测序，揭示了微氧条件下大肠杆菌对大熊猫肠道纤维素分解的贡献 | 首次结合培养组学、PacBio HiFi宏基因组学及微生物单细胞RNA测序，在物种水平上解析大熊猫肠道微生物群落功能，并发现大肠杆菌在微氧条件下参与纤维素降解的新机制 | 未在体内直接测量氧水平，仅基于体外实验和关联分析推断微氧条件的作用 | 阐明大熊猫肠道中纤维素处理如何进行，并确定关键微生物类群及其功能 | 大熊猫肠道微生物组及其纤维素降解功能 | 微生物组学 | 不适用 | PacBio HiFi宏基因组测序、微生物单细胞RNA测序、培养组学 | 无 | 基因组序列、单细胞转录组、培养表型数据 | 142份粪便样本和4份单细胞RNA测序样本（共16,659个细胞） | PacBio, 10x Genomics | HiFi宏基因组测序, 微生物单细胞RNA测序 | PacBio HiFi, 10x Chromium | PacBio HiFi测序和10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 82 | 2026-09-10 |
Senescent fibroblasts drive CD8+ T cell dysfunction in colorectal cancer via CD36-mediated lipid transfer and peroxidation
2026-01-14, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07636-3
PMID:41535933
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习等方法，发现衰老成纤维细胞通过CD36介导的脂质转移和过氧化作用驱动结直肠癌中CD8+ T细胞功能失常，并验证了衰老细胞清除剂作为免疫治疗策略的潜力。 | 首次揭示衰老成纤维细胞通过CD36依赖的脂质转移和过氧化作用直接损害CD8+ T细胞功能，为结直肠癌免疫抑制机制提供新见解，并提出靶向衰老基质细胞的免疫治疗策略。 | 尚需更多临床样本验证衰老成纤维细胞与CD8+ T细胞相互作用的临床相关性，以及衰老细胞清除剂的长期效果和副作用。 | 探索衰老成纤维细胞是否及如何驱动结直肠癌中CD8+ T细胞功能障碍，并评估靶向衰老细胞的治疗潜力。 | 人结直肠癌标本、邻近正常黏膜、患者来源的类器官（CRC-PDOs）、CD8+ T细胞、衰老成纤维细胞、AOM/DSS诱导的结直肠癌小鼠模型。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、机器学习、细胞-细胞通讯分析、共培养实验、高内涵成像、流式细胞术、ELISA、脂质脉冲追踪（BODIPY FL C16）、AOM/DSS小鼠模型、药物敏感性预测 | 随机森林 | 单细胞转录组数据、图像、基因表达数据 | 人结直肠癌标本和相邻正常黏膜（具体样本数未提供）、患者来源类器官、共培养细胞、小鼠模型（样本数未明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 83 | 2026-09-10 |
Decoding the tumor microenvironment remodeling orchestrated by CLEC3B+ inflammatory cancer-associated fibroblasts in lung adenocarcinoma immunotherapy: elucidation from pan-cancer spatially single-cell transcriptomics landscape
2026-01-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07677-2
PMID:41526921
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研究论文 | 通过泛癌单细胞RNA测序和空间转录组测序分析，揭示CLEC3B+炎症性癌症相关成纤维细胞在肺腺癌免疫治疗中的肿瘤微环境重塑作用，并开发预测免疫检查点抑制剂反应的特征模型 | 首次利用泛癌单细胞与空间转录组分析整合，揭示CLEC3B+ iCAFs的空间分布及其通过JAK2-STAT3通路增强免疫刺激功能的机制，并构建基于iCAF标志基因的ICS模型用于预测免疫治疗反应 | 尚不明确，需基于更多实验和临床数据验证 | 探究CLEC3B+炎症性癌症相关成纤维细胞在肺腺癌免疫治疗中的功能异质性及其调节肿瘤微环境的机制，提供预测免疫治疗反应的新型模型和潜在治疗策略 | 泛癌及肺腺癌中的癌症相关成纤维细胞与CD8+ T细胞，包括肺腺癌患者样本和小鼠肿瘤模型 | 癌症基因组学、单细胞转录组学、空间转录组学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组测序、RNA-seq、体内外功能实验 | 机器学习模型（用于预测免疫治疗反应） | 基因表达数据、空间转录组数据、实验数据 | 泛癌及肺腺癌患者的多中心数据，包含小鼠模型，具体样本数未明确 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq | 基于10x单细胞测序和空间转录组平台，并利用Illumina测序仪进行文库测序，具体方案未详细说明 |
| 84 | 2026-09-10 |
IL-6 regulates the polarization of Dectin-1 macrophages to weaken immune escape in thyroid cancer
2026-01-10, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07679-0
PMID:41519771
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研究论文 | 本研究探讨IL-6通过调控Dectin-1介导的巨噬细胞极化，抑制甲状腺癌免疫逃逸的机制 | 首次揭示IL-6/Dectin-1轴通过ERK通路维持M1型巨噬细胞极化，从而抑制甲状腺癌免疫逃逸的新机制 | 未提及明确的局限性 | 阐明IL-6调控Dectin-1介导的巨噬细胞极化对甲状腺癌进展、代谢重编程和免疫重塑的影响 | 甲状腺癌肿瘤微环境中的巨噬细胞、CAL-62细胞及甲状腺癌小鼠模型 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 85 | 2026-09-10 |
Single-cell multi-omics reveals DUSP9 as a key regulator of cancer stemness and a potential therapeutic target in hepatocellular carcinoma
2026-01-08, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07630-9
PMID:41508037
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研究论文 | 通过整合批量RNA测序、单细胞RNA测序和空间转录组学，揭示DUSP9作为肝细胞癌中癌症干细胞干性关键调控因子及其潜在治疗靶点 | 采用多组学整合分析（批量RNA-seq、scRNA-seq、空间转录组）识别DUSP9为干细胞干性相关调控因子，并通过功能实验验证其通过ERK-FOXO3轴增强干性，以及空间转录组揭示其在免疫抑制微环境中的定位，并筛选出候选化合物AKOS000434153 | 需要进一步的体内实验来验证这些调控关系 | 识别连接癌症干细胞干性与肝细胞癌肿瘤进展的分子调控因子，并探索潜在的治疗靶点 | 肝细胞癌组织样本，涉及癌细胞、癌症相关成纤维细胞等细胞类型 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多平台药物筛选 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、图像、药物筛选数据 | NA | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 86 | 2026-09-10 |
scSNViz: visualization and analysis of cell-specific expressed SNVs
2026-01-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag023
PMID:41533688
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研究论文 | 介绍了scSNViz，一个用于可视化与分析细胞特异性表达的单核苷酸变异的R包 | 首个提供单细胞RNA测序中表达变异的综合可视化和定量分析功能的R包，支持2D和3D可视化，并能与多种单细胞分析框架无缝集成 | 未提及具体限制，但可能依赖用户对不同单细胞工具链的熟悉程度或计算资源有要求 | 开发一种工具，用于探索、量化和可视化来自单细胞RNA测序数据的表达单核苷酸变异，以增强对转录异质性和等位基因动态的理解 | 来自细胞条形码单细胞RNA测序数据的表达单核苷酸变异 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未指定 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 87 | 2026-09-10 |
Tissue-resident macrophage and dendritic cells drive type I IFN immunity to enteroviruses in the liver
2026-Jan, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013891
PMID:41592119
|
研究论文 | 本研究利用小鼠模型和单细胞RNA测序，揭示了肝脏中组织驻留巨噬细胞和树突状细胞在肠道病毒感染中驱动I型干扰素免疫应答的细胞类型特异性机制。 | 首次通过单细胞RNA测序和条件性基因敲除小鼠，精确识别了肝脏中响应肠道病毒感染的细胞类型，并证明I型干扰素主要由库普弗细胞和树突状细胞亚群产生，而非肝细胞直接响应。 | 研究主要基于小鼠模型，可能不完全反映人类新生儿感染情况；未涉及其他类型的免疫细胞或分子机制。 | 明确肝脏中肠道病毒感染时，哪些固有免疫细胞负责启动I型干扰素抗病毒信号，并评估其对肝细胞保护的作用。 | 不同基因型小鼠（表达hFcRn且缺乏Ifnar1、Ifnlr1或两者）及肝脏中的多种细胞类型，包括肝细胞、库普弗细胞和树突状细胞。 | 免疫学 | 肠道病毒感染相关肝衰竭 | 单细胞RNA测序和条件性基因敲除 | 小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 多种基因型小鼠模型，具体样本数量未在摘要中提供 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序试剂盒（具体版本未详述） |
| 88 | 2026-09-10 |
Decidual cell invasion and decidualization at the trophoblast-decidual interaction in the progression of cesarean scar pregnancy
2025-12, Journal of reproductive immunology
IF:2.9Q2
DOI:10.1016/j.jri.2025.104747
PMID:41151220
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术，探究剖宫产瘢痕妊娠进展中蜕膜细胞侵袭和蜕膜化过程，并揭示KISS1基因的作用机制 | 首次在单细胞水平上研究剖宫产瘢痕妊娠中蜕膜细胞KISS1基因表达及其对PI3K/AKT信号通路的影响，并通过RNA干扰和过表达实验验证功能 | 摘要未提及研究局限性 | 阐明KISS1基因在剖宫产瘢痕妊娠进展中蜕膜细胞侵袭过程中的作用 | 剖宫产瘢痕妊娠植入部位基底蜕膜和正常早期宫内妊娠蜕膜组织样本 | 数字病理学 | 剖宫产瘢痕妊娠 | 单细胞RNA测序、RNA-seq、免疫组化、qRT-PCR、Western blotting、荧光素酶实验 | NA | 基因表达数据、图像 | 剖宫产瘢痕妊娠组和正常早期宫内妊娠组的蜕膜组织样本（具体数量未在摘要中提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 89 | 2026-09-10 |
Gain-of-function PPM1D mutations attenuate ischemic stroke
2025-11, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-025-01523-6
PMID:40399534
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研究论文 | 本研究通过全基因组测序和实验模型，发现PPM1D基因功能获得性突变可减轻缺血性脑损伤，并验证小分子T2755作为潜在治疗策略 | 首次在大型缺血性卒中患者队列中发现PPM1D功能获得性突变，并通过空间转录组学和蛋白质组学揭示其通过PPARα通路调节内皮脂肪酸代谢的机制，同时开发出PPM1D稳定剂T2755 | 未提及 | 识别缺血性卒中的遗传变异，探索PPM1D在缺血性脑损伤中的保护作用及潜在治疗策略 | 缺血性卒中患者及Ppm1d缺陷小鼠模型 | 基因组学 | 缺血性卒中 | 全基因组测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 | 小鼠模型 | 基因组序列, 转录组, 蛋白质组数据, 影像和临床数据 | 10,241名缺血性卒中患者及8名PPM1D突变携带者，Ppm1d缺陷小鼠 | NA | 全基因组测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 90 | 2026-09-10 |
Improving immunotherapy responses by dual inhibition of macrophage migration inhibitory factor and PD-1
2025-10-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.191539
PMID:41122966
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研究论文 | 本研究探讨了抗MIF疗法与抗PD-1联合使用在两种小鼠肿瘤模型中的抗肿瘤效果，并分析了其免疫机制及与黑色素瘤患者的相关性 | 首次证明抗MIF与抗PD-1联合治疗能显著增强抗肿瘤免疫反应，并通过单细胞RNA测序揭示联合疗法促进特定抗肿瘤巨噬细胞亚群扩增 | 研究仅基于小鼠模型和患者基因型关联分析，缺乏前瞻性临床验证 | 评估抗MIF疗法联合抗PD-1免疫检查点抑制剂在肿瘤治疗中的增效作用及其免疫机制 | YUMMER1.7黑色素瘤和MC38结直肠癌小鼠模型，以及黑色素瘤患者 | 免疫学 | 黑色素瘤、结直肠癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组化、细胞因子谱分析 | 小鼠肿瘤模型 | 基因表达数据、免疫细胞数据、临床数据 | 两种小鼠模型（YUMMER1.7和MC38），未报告动物数量；患者样本包括黑色素瘤患者和健康对照，具体数量未报告 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 91 | 2026-09-10 |
Infiltrating macrophages replace Kupffer cells and play diverse roles in severe alcohol-associated hepatitis
2025-10, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-025-01343-1
PMID:40962953
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和实验模型，揭示了严重酒精相关肝炎中巨噬细胞取代库普弗细胞并发挥多种功能 | 首次详细描述了sAH中独特的C1Q巨噬细胞群体及其在清除凋亡中性粒细胞和调节炎症中的双重作用，并比较了C1Q、S100A8和APOE在酒精性肝损伤模型中的功能差异 | 研究主要基于人类肝脏外植体样本和动物模型，可能不完全反映体内复杂微环境；未进行功能验证的巨噬细胞亚群在人类中的具体机制尚未完全阐明 | 探讨严重酒精相关肝炎和酒精性肝硬化中肝脏巨噬细胞的组成变化及其在疾病进展中的作用 | 严重酒精相关肝炎和酒精性肝硬化患者及小鼠模型中的肝脏巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 酒精性肝病（严重酒精相关肝炎和酒精性肝硬化） | 单细胞RNA测序、基因敲除小鼠模型、慢性加暴饮乙醇挑战模型 | 基因敲除小鼠模型（C1q KO、S100a8 KO、Apoe KO） | 转录组数据和实验数据 | 人类肝脏外植体（sAH和AC患者）和小鼠样本，具体数量未在摘要中提及 | 未明确提及具体公司 | 单细胞RNA测序 | 未明确提及 | 未明确提及 |
| 92 | 2026-09-10 |
CD8+GZMK+CD27+CCR7+ T cells mobilized by splenic sympathetic nerves aggravate brain ischemia‒reperfusion injury via CCL19-positive endothelial cells
2025-09, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-025-01311-9
PMID:40659887
|
研究论文 | 该研究通过脾交感神经去神经支配和单细胞RNA测序，发现CD8+GZMK+CD27+CCR7+ T细胞亚群（Tsa细胞）在脾交感神经信号驱动下动员，并通过CCL19/CCR7轴趋化进入脑实质，加重脑缺血再灌注损伤，提出靶向干预策略。 | 首次鉴定与急性缺血性卒中相关的Tsa细胞亚群，并揭示脾交感神经通过去甲肾上腺素-ADRB2信号促进其动员，以及CCL19-CCR7轴介导其脑内浸润的机制；开发CCR7靶向肽以阻断该通路。 | 研究基于小鼠模型和患者样本，但未在人类中验证CCR7靶向肽疗效；机制细节如Tsa细胞与其他免疫细胞的相互作用及长期安全性需进一步探索。 | 阐明脾-脑-免疫轴在脑缺血再灌注损伤中的作用机制，评估脾交感神经去神经支配及CCR7靶向策略的治疗潜力。 | 急性缺血性卒中患者和小鼠短暂大脑中动脉阻塞模型 | 免疫学, 神经科学 | 脑缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序, 手术去神经支配, 肽段干预 | NA | 单细胞转录组数据 | AIS患者样本及tMCAO小鼠模型（具体数量未提供） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 93 | 2026-09-10 |
Rapid generation of functional vascular organoids via simultaneous transcription factor activation of endothelial and mural lineages
2025-08-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.05.014
PMID:40516530
|
研究论文 | 本文介绍了一种通过同时激活内皮细胞和周细胞谱系的转录因子（ETV2和NKX3.1），快速从诱导多能干细胞生成功能性血管类器官的方法 | 通过正交激活ETV2和NKX3.1转录因子，实现内皮细胞和周细胞的高效共分化，在5天内无需ECM包埋即可生成功能性3D血管类器官，并能通过时间调控TF表达调节动脉和血管生成表型 | 摘要中未提及明确的局限性 | 开发一种快速、通用的血管类器官生成平台，用于血管发育研究、疾病建模和再生医学 | 诱导多能干细胞（iPSCs）来源的内皮细胞和周细胞，以及生成的血管类器官 | 数字病理学 | 外周缺血性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 摘要中未提及具体样本量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 94 | 2026-09-10 |
ChemPerturb-seq screen identifies a small molecule cocktail enhancing human beta cell survival after subcutaneous transplantation
2025-08-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.06.002
PMID:40562034
|
研究论文 | 结合化学筛选与单细胞RNA测序的ChemPerturb-seq平台，通过体内筛选发现一种小分子混合物，可增强人类β细胞在皮下移植后的功能与存活 | 首次将化学筛选与单细胞RNA测序结合，形成ChemPerturb-seq平台，实现单个小分子治疗下人类β细胞分子变化的系统分析，并开发了AI驱动的开放访问网站ChemPerturbDB | 小分子混合物对雄性小鼠的移植效果未得到增强，表明存在性别特异的反应机制，且研究仅限于皮下移植模型 | 开发并应用ChemPerturb-seq平台，筛选能增强人类β细胞在皮下移植后功能与存活的小分子混合物 | 人类β细胞和原代人胰岛，移植于雌性和雄性小鼠皮下 | 药物筛选与单细胞转录组学 | 糖尿病（胰岛移植） | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及人类β细胞和原代人胰岛的体内移植实验，具体样本量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 95 | 2026-09-10 |
TET2-mutant myeloid cells mitigate Alzheimer's disease progression via CNS infiltration and enhanced phagocytosis in mice
2025-08-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.06.006
PMID:40609533
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研究论文 | 本研究揭示TET2突变克隆性造血通过外周髓系细胞浸润和增强吞噬作用缓解阿尔茨海默病进展 | 首次发现TET2突变而非其他克隆性造血驱动因子能降低迟发性阿尔茨海默病风险，并阐明其机制涉及骨髓来源的微胶质细胞样细胞和单核细胞浸润及吞噬功能增强 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚需进一步临床验证，且对TET2突变保护效应的具体分子通路探讨有限 | 探究克隆性造血与阿尔茨海默病的关联，并明确TET2突变对AD发病的影响及机制 | 人类生物样本库数据、小鼠AD模型及骨髓移植、人类诱导多能干细胞衍生的微胶质细胞 | 神经科学, 免疫学 | 阿尔茨海默病, 迟发性阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 骨髓移植, 诱导多能干细胞技术, 行为学测试 | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据, 图像 | UK生物库人群数据及小鼠模型样本，具体数量未提供 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 96 | 2026-09-10 |
Bacterial ADP-heptose triggers stem cell regeneration in the intestinal epithelium following injury
2025-08-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.06.009
PMID:40651470
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研究论文 | 本研究揭示了细菌代谢物ADP-庚糖通过ALPK1-TIFA信号通路调控肠道干细胞在损伤后的再生过程 | 首次发现ALPK1-TIFA信号在肠道干细胞中表达并控制损伤后干细胞的替换，以及鉴定Paneth细胞作为ADP-庚糖诱导的revSC的起源细胞 | 尚未充分探索ALPK1-TIFA信号在其他生理或病理环境中的功能 | 探究ADP-庚糖通过ALPK1-TIFA信号在肠道上皮损伤后干细胞再生中的作用机制 | 肠道干细胞、潘氏细胞、ADP-庚糖、ALPK1-TIFA信号通路 | 细胞生物学、分子生物学 | 肠道损伤 | 单细胞转录组学、谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞3'转录组 |
| 97 | 2026-09-10 |
Comparative single-cell lineage tracing identifies distinct adipocyte precursor dynamics in skin and inguinal fat
2025-08-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.07.004
PMID:40744015
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序谱系追踪，比较分析皮肤和腹股沟脂肪组织中脂肪前体细胞的动态变化，识别新的细胞亚群及调控因子。 | 首次揭示未成熟前脂肪细胞的新亚群，挑战传统逐步分化模型，并识别Sox9作为祖细胞增殖和脂肪生成的关键调节因子 | 未明确提及实验限制，可能包括仅基于小鼠模型、无法完全模拟人类脂肪组织或谱系追踪的潜在偏差 | 阐明皮肤与腹股沟脂肪组织中脂肪前体细胞的异质性和分化潜能，理解快速脂肪生成的细胞和分子机制 | 小鼠皮肤脂肪组织和腹股沟脂肪组织中的脂肪前体细胞 | 单细胞转录组学、谱系追踪 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | 未指定具体样本量，涉及小鼠皮肤和腹股沟脂肪组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 98 | 2026-09-10 |
Decoding Cellular Stress States for Toxicology Using Single-Cell Transcriptomics
2025-Aug-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.10.657506
PMID:40766395
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研究论文 | 该研究利用TempO-LINC平台对约40,000个HepaRG细胞进行单细胞转录组分析，以解码化学物质诱导的细胞应激状态。 | 通过文献来源的应激反应通路基因签名评分细胞，并采用广义Jaccard度量聚类，识别出五种表型组，动态展示化学物质处理下细胞亚群的转变。 | 研究仅在一个细胞系和时间点进行，可能限制了对体内复杂毒性反应的推断。 | 利用单细胞转录组学解码细胞应激状态，以洞察毒性机制中细胞适应性反应与终末转变的过渡。 | 人肝癌细胞系HepaRG细胞。 | 毒理学，单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学，TempO-LINC平台 | 广义Jaccard度量聚类 | 基因表达数据 | 约40,000个HepaRG细胞，暴露于7种化学物质，各三种浓度，24小时。 | BioSpyder | 单细胞转录组学 | TempO-LINC | TempO-LINC平台用于生成单细胞转录组图谱 |
| 99 | 2026-09-10 |
CCR2+ monocytes promote memory CD8+ T-cell differentiation via membrane-bound TGF-β
2025-08, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-025-01299-2
PMID:40461701
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研究论文 | 该研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学，揭示了CCR2+单核细胞通过膜结合TGF-β促进CD8 T细胞记忆分化 | 利用空间转录组学结合单细胞测序，首次揭示了单核细胞通过细胞接触和TGF-β信号在CD8 T细胞命运决定中的新机制 | 摘要中未提及具体局限性 | 探究急性感染期间CD8 T细胞效应和记忆分化命运的空间决定因素 | 小鼠脾脏中的CD8 T细胞及单核细胞亚群 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间表达数据 | 未提及具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 100 | 2026-09-10 |
A pluripotent stem cell atlas of multilineage differentiation
2025-07-15, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-025-05549-w
PMID:40664685
|
研究论文 | 研究者利用单细胞RNA测序技术，生成了超过60000个人类多能干细胞体外多谱系分化过程中的基因表达时间序列图谱，覆盖从原肠胚形成状态到各胚层前体细胞和定型细胞类型。 | 首次提供了人类多能干细胞体外分化过程中跨越所有胚层的大规模单细胞转录组时间序列数据集，作为与体内发育比较的基准参考点。 | 研究可能受限于体外分化模型与真实体内发育环境的差异，且转录组数据未结合其他组学层面（如表观基因组）信息。 | 通过单细胞转录组测序，研究发育信号通路在调控人类多能干细胞体外多向分化中的作用。 | 人类多能干细胞在体外分化过程中的多谱系细胞状态。 | 单细胞转录组学，发育生物学 | 不适用（未涉及特定疾病，而是基础发育研究） | 单细胞RNA测序 | 不适用（不是深度学习模型，属于统计分析） | 单细胞转录组测序数据（超过60000个细胞的基因表达数据） | 超过60000个细胞，来自体外分化不同时间点的样本 | 不适用（未提及具体公司） | 单细胞RNA测序 | 不适用（未提及具体平台或产品） | 不适用（未提供平台配置细节） |