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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-03-19 |
Correction to 'Integrating Bulk RNA and Single-Cell RNA Sequencing Identifies and Validates Lactylation-Related Signatures for Intervertebral Disc Degeneration'
2026-Mar, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71061
PMID:41845558
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 82 | 2026-03-19 |
Single-cell sequencing reveals unexpected genetic diversity among Bodo spp. flagellates and their bacterial endosymbionts
2026-Mar, Microbial genomics
IF:4.0Q2
DOI:10.1099/mgen.0.001642
PMID:41848149
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了Bodo属鞭毛虫及其细菌内共生体的意外遗传多样性 | 首次利用单细胞测序技术从单个淡水样本中分离并组装了七个未培养Bodo spp.细胞的基因组,发现了三个潜在新物种,并揭示了宿主与内共生体之间的协同进化关系 | 研究仅基于一个淡水样本的七个细胞,样本量较小,可能无法完全代表Bodo属的全球多样性 | 探索Bodo属鞭毛虫及其细菌内共生体的遗传多样性和物种界定 | Bodo属自由生活鞭毛虫及其Holosporales目细菌内共生体 | 微生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 七个未培养Bodo spp.细胞 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 83 | 2026-03-19 |
Mapping kinase-dependent tumor immune adaptation with multiplexed single-cell CRISPR screens
2026-Feb-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.08.698516
PMID:41542636
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研究论文 | 本文介绍了一种集成的高通量单细胞CRISPR筛选框架,用于绘制胶质母细胞瘤中T细胞驱动免疫压力的肿瘤内在调控机制 | 结合了CRISPR干扰与激活技术、免疫匹配的肿瘤-T细胞共培养以及大规模单细胞转录组学,系统量化遗传扰动对肿瘤状态和适应性反应的影响 | 研究主要针对胶质母细胞瘤,可能不适用于其他癌症类型;且依赖于体外共培养模型,可能无法完全模拟体内肿瘤微环境 | 绘制肿瘤免疫适应的激酶依赖性调控网络,并识别潜在的免疫逃逸靶点 | 胶质母细胞瘤细胞与T细胞的相互作用 | 单细胞组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞CRISPR筛选、单细胞转录组学、CRISPR干扰与激活 | 深度生成模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 84 | 2026-03-19 |
scDock: streamlining drug discovery targeting cell-cell communication via scRNA-seq analysis and molecular docking
2026-Feb-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag103
PMID:41769845
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研究论文 | 本文介绍了一个名为scDock的集成化、用户友好型流程,旨在通过scRNA-seq分析和分子对接简化针对细胞间通讯网络的药物发现过程 | scDock提供了一个无缝连接scRNA-seq数据处理、细胞间通讯推断和基于分子对接的药物发现的一体化解决方案,填补了从单细胞数据到通讯靶向药物发现的可访问端到端工具的空白 | NA | 简化针对细胞间通讯网络的药物发现过程,将scRNA-seq分析与结构基础的药物筛选联系起来 | 细胞间通讯网络、疾病相关的配体-受体相互作用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、分子对接 | NA | scRNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 85 | 2026-03-19 |
Inhibition of CDC25C attenuates IL-17A-driven keratinocyte hyperproliferation and psoriasis progression
2026-02-26, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153342
PMID:41587503
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研究论文 | 本研究探讨了CDC25C在IL-17A驱动的角质形成细胞过度增殖和银屑病进展中的作用,并验证了其作为治疗靶点的潜力 | 首次将CDC25C鉴定为非经典IL-17信号通路中的关键效应因子,并证明其选择性抑制可减轻角质形成细胞过度增殖而不影响经典炎症因子表达 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人体临床试验中验证CDC25C抑制剂的疗效和安全性 | 探索银屑病治疗的新靶点,以克服现有抗IL-17生物制剂疗效不完全和疾病复发的问题 | 银屑病患者皮肤样本、角质形成细胞、IMQ诱导的银屑病样小鼠模型 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、组织病理学图像 | 银屑病患者单细胞RNA-seq数据集、体外培养的角质形成细胞、IMQ诱导的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 86 | 2026-03-19 |
Splicing variants in MYRF cause partial loss-of-function in the retinal pigment epithelium leading to nanophthalmos
2026-Feb-26, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.194681
PMID:41746734
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研究论文 | 本研究探讨了MYRF基因剪接变异如何通过导致视网膜色素上皮功能部分丧失而引起孤立性小眼症 | 首次将MYRF C末端变异与孤立性小眼症联系起来,并证明dG-MYRF是一种功能减弱等位基因,揭示了组织特异性阈值效应 | 研究主要基于体外和动物模型,人类样本数量有限,且胚胎致死表型限制了成年表型分析 | 阐明MYRF基因变异导致孤立性小眼症而非综合征性疾病的分子机制 | MYRF基因变异、视网膜色素上皮细胞、小鼠模型 | 遗传学与分子生物学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序、体外功能实验、动物模型构建 | 小鼠基因编辑模型 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 人类RPE细胞、原发性RPE细胞、多个人源化小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 87 | 2026-03-19 |
A non-canonical role of Myc in programming basal cells as sentinels of upper airway immunity during influenza infection
2026-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.22.696065
PMID:41509430
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研究论文 | 本研究探讨了流感感染期间,Myc在编程基底细胞作为上呼吸道免疫哨兵中的非经典作用 | 揭示了基底细胞作为上皮哨兵,通过MYC依赖的CXCL10-CXCR3轴协调急性修复并招募细胞毒性效应细胞的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类上呼吸道感染后的区域特异性机制仍需进一步验证 | 阐明流感病毒感染后上呼吸道的损伤与修复机制,特别是基底细胞在免疫协调中的作用 | 小鼠上呼吸道(声门下和气管)的假复层上皮细胞,包括纤毛细胞、分泌细胞、神经内分泌细胞和基底细胞 | 数字病理学 | 流感感染 | 单细胞转录组学、成像技术 | NA | 转录组数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 88 | 2026-03-19 |
MANTIS: Analytics toolkit for spatial metabolomics with matching spatial transcriptomics data
2026-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.20.700581
PMID:41648596
|
研究论文 | 介绍MANTIS,一个用于分析空间代谢组学与空间转录组学数据的统计框架工具包 | 首个统一空间代谢组学、空间转录组学、细胞类型信息和空间域的工具包,强调空间统计、假设检验和混杂因素校正 | NA | 开发一个统计框架,用于分析共注册的空间代谢组学和空间转录组学数据,以发现代谢物空间模式和基因-代谢物关系 | 空间代谢组学和空间转录组学数据,涵盖不同空间技术、组织和物种 | 空间组学 | NA | 空间代谢组学,空间转录组学 | 统计框架 | 空间代谢组学和空间转录组学数据 | NA | NA | 空间代谢组学,空间转录组学 | NA | NA |
| 89 | 2026-03-19 |
Loss of miR-29a/b1 cluster reprograms the tumor microenvironment and contributes to immunosuppression in lung cancer
2026-Feb-25, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-1060
PMID:41739590
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了miR-29a/b1簇在肺癌免疫抑制微环境中的关键调控作用及其对PD-1抑制剂耐药性的影响 | 首次在Kras/p53驱动的肺癌模型中,通过单细胞RNA测序发现miR-29下调与PD-1抑制剂耐药相关,并阐明其通过调控Enpp2/ATX表达重塑肿瘤免疫微环境的机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类患者数据的验证仍需进一步扩大样本量;miR-29调控的具体下游靶基因网络尚未完全解析 | 探究肺癌对免疫检查点抑制剂产生耐药性的分子机制,并寻找克服耐药的新策略 | Kras/p53驱动的肺癌小鼠模型、肺癌患者的公开RNA测序数据 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、RNA测序 | 小鼠基因工程模型 | 单细胞转录组数据、批量RNA测序数据 | 未明确样本数量的小鼠模型及公开人类肺癌数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 90 | 2026-03-19 |
Tumor cell villages define the co-dependency of tumor and microenvironment in liver cancer
2026-02-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69797-z
PMID:41723121
|
研究论文 | 本研究通过空间单细胞成像和单细胞RNA测序技术,揭示了肝癌中肿瘤细胞“村庄”与微环境之间的分子共依赖性及其对患者预后的影响 | 开发了基于深度学习的策略来空间映射肿瘤细胞状态及其周围环境结构,首次提出肿瘤细胞“村庄”概念,并揭示了村庄特异性分子共依赖性 | 研究主要聚焦于肝癌,结论在其他癌症类型中的普适性有待验证 | 探究肿瘤空间景观的形成机制及其对肿瘤适应性的影响 | 肝癌肿瘤样本 | 数字病理学 | 肝癌 | 空间单细胞成像, 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 图像, 转录组数据 | 50个肿瘤生物样本(超过200万个细胞),740名肝癌患者的验证数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 91 | 2026-02-21 |
Integrated single-cell and spatial transcriptomics uncover SPP1⁺ and HLA-DRB5⁺ macrophages as key modulators of the immune microenvironment in colorectal cancer liver metastasis
2026-Feb-19, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07853-4
PMID:41715121
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 92 | 2026-03-19 |
High-resolution spatial multi-omics enables prognostic scoring in intrahepatic cholangiocarcinoma
2026-Feb-18, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2026.02.029
PMID:41709577
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研究论文 | 本研究通过整合空间多组学技术,开发了一种用于肝内胆管癌预后评分的新型空间多模态评分系统 | 首次结合图像质谱流式细胞术、扩展凝胶空间蛋白质组学、单细胞RNA测序等技术,实现了肿瘤微环境的高分辨率空间多组学映射,并开发了基于毫米级分辨率的预后评分系统 | 研究样本量相对有限(训练队列155例,验证队列214例),且未在更广泛的多中心队列中进行外部验证 | 开发肝内胆管癌的预后工具,以进行精确风险分层和治疗优化 | 肝内胆管癌患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 图像质谱流式细胞术、扩展凝胶空间蛋白质组学、单细胞RNA测序、批量蛋白质组学、多重免疫荧光 | 空间多模态评分系统 | 图像、蛋白质组数据、转录组数据 | 训练队列155例患者,独立验证队列214例患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间蛋白质组学, 批量蛋白质组学 | NA | NA |
| 93 | 2026-03-19 |
Vitamin D deficiency alters prostate epithelial differentiation and increases prostate cancer aggressiveness in ex vivo and in vivo models
2026-Feb-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.16.700850
PMID:41756925
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研究论文 | 本研究通过体外和体内模型探讨了维生素D缺乏对前列腺上皮分化和前列腺癌侵袭性的影响 | 首次结合单细胞RNA测序技术,揭示了维生素D缺乏在前列腺发育和癌症进展中的关键作用,并验证了其作为激素的生物学功能 | 研究主要基于小鼠模型和特定人类癌细胞系,可能无法完全反映人类前列腺癌的复杂性 | 探究维生素D缺乏作为前列腺癌侵袭性风险因素的作用机制 | 小鼠前列腺类器官、MDA-PCa-2b人类前列腺癌细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 94 | 2026-03-19 |
Deciphering epileptogenic and activity-dependent gene programs in the human brain
2026-Feb-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.18.706645
PMID:41757101
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研究论文 | 本研究通过单核和空间转录组学技术,解析了人类大脑中癫痫发生和活动依赖性基因程序,揭示了神经元脆弱性和炎症特征 | 首次在人类药物抵抗性癫痫患者中,结合单核与空间转录组学,系统分析了癫痫发生与急性刺激下的基因表达程序,并识别了细胞类型特异性反应和代谢适应缺陷 | 研究样本来源于特定癫痫患者群体,可能无法完全代表其他类型癫痫或神经系统疾病;且空间转录组学分辨率有限,可能影响细胞间相互作用的精确解析 | 探究人类大脑中神经元活动依赖性基因程序,特别是在癫痫发生和急性刺激下的转录变化,以理解癫痫的病理机制 | 药物抵抗性癫痫患者的癫痫发生、非癫痫发生及术中刺激的非癫痫发生皮质组织 | 数字病理学 | 癫痫 | 单核转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 来自药物抵抗性癫痫患者的皮质组织样本,涉及26种细胞类型 | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 95 | 2026-03-19 |
Chronic inflammation promotes gastric cancer progression via ADAM10-mediated cleavage of CX3CL1
2026-Feb-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-39743-6
PMID:41691064
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研究论文 | 本研究探讨了慢性炎症通过ADAM10介导的CX3CL1切割促进胃癌进展的分子机制 | 揭示了慢性炎症通过上调ADAM10表达,将膜结合型CX3CL1转化为可溶性形式,从而激活ADAM10/CX3CL1轴促进胃癌进展的新机制 | 研究主要基于小鼠皮下异种移植模型和体外细胞实验,缺乏更复杂的体内模型验证;临床样本分析深度有限 | 探究慢性炎症对胃癌进展的影响及其分子机制 | 615品系小鼠、胃癌细胞系、胃癌患者组织样本 | 肿瘤生物学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学细胞因子阵列、ELISA、qRT-PCR、Western blot、免疫荧光染色、CCK-8、克隆形成、伤口愈合、Transwell实验 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、细胞功能数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及小鼠模型、细胞系和患者组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 96 | 2026-03-19 |
Single-cell RNA Sequencing-Based analysis of diverse ion-channel transcripts across human CD4+ T-cell subsets
2026-02-12, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153265
PMID:41547301
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了人类CD4+ T细胞亚群中离子通道转录本的多样性 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘了人类CD4+ T细胞亚群中离子通道和转运蛋白的转录组图谱,并识别了亚群特异性表达模式 | 研究基于体外极化模型,可能无法完全反映体内T细胞亚群的复杂性;样本来源仅限于外周血,未涵盖组织驻留T细胞 | 揭示人类CD4+ T细胞亚群中离子通道和转运蛋白的转录组表达模式,为免疫调节机制研究提供基础 | 人类外周血单核细胞来源的初始CD4+ T细胞及其体外极化产生的Th1、Th2、Th17和调节性T细胞亚群 | 单细胞转录组学 | 自身免疫性疾病和过敏性疾病 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量,但涉及人类外周血来源的CD4+ T细胞及其体外极化亚群 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 97 | 2026-03-19 |
Development and validation of an oxidative phosphorylation based prognostic model revealing tumor progression and immune microenvironment in lung adenocarcinoma
2026-Feb-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04478-3
PMID:41670771
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研究论文 | 本研究开发并验证了一个基于氧化磷酸化的预后模型,用于揭示肺腺癌的肿瘤进展和免疫微环境 | 首次构建了基于氧化磷酸化相关基因的肺腺癌预后模型,并揭示了UQCC3⁺和RAB5IF⁺上皮细胞通过特定信号通路促进肿瘤恶性增殖和免疫抑制的新机制 | 研究主要依赖于公共数据库的回顾性数据,缺乏前瞻性临床验证,且未进行实验验证以确认机制 | 开发肺腺癌的预后模型并探索氧化磷酸化在肿瘤进展和免疫微环境中的作用机制 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | LASSO-Cox回归模型 | RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据 | TCGA数据集作为发现队列,多个GEO数据集作为独立验证队列 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 98 | 2026-02-13 |
Spatial transcriptomics and single-cell analyses reveal the role of the cisplatin-resistant gene panel in NSCLC progression and the tumor microenvironment, identifying LOXL2 as a potential therapeutic target
2026-Feb-11, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-026-04170-0
PMID:41673658
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 99 | 2026-03-19 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals immunological mechanisms by which recombinant Echinococcus granulosus P29 protein alleviates airway inflammation in mice with allergic asthma
2026-Feb-11, Parasites & vectors
IF:3.0Q1
DOI:10.1186/s13071-026-07256-w
PMID:41673792
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了重组细粒棘球绦虫P29蛋白缓解过敏性哮喘小鼠气道炎症的免疫机制 | 首次使用单细胞转录组测序技术结合实验方法,系统研究了rEg.P29蛋白在过敏性哮喘中的免疫调节作用,并识别了关键的T细胞亚群及其相互作用 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证,且具体分子通路机制有待进一步深入探索 | 探究rEg.P29蛋白如何缓解过敏性哮喘小鼠的气道炎症并阐明其免疫机制 | 过敏性哮喘小鼠模型及其肺组织细胞 | 数字病理学 | 过敏性哮喘 | 单细胞转录组测序,流式细胞术,酶联免疫吸附试验,细胞因子微球阵列,生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据,血清学数据 | 小鼠肺组织细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 100 | 2026-03-19 |
TCF21-WNT5A axis drives metastasis of colorectal cancer via stromal-tumor cell communication
2026-Feb-11, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07835-6
PMID:41673874
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,揭示了TCF21-WNT5A轴在结直肠癌肝转移中的关键作用 | 首次通过单细胞和批量RNA测序整合分析,识别出12个与结直肠癌肝转移相关的核心基因,并阐明了TCF21通过调控WNT5A促进转移的分子机制 | 研究主要基于公共数据库数据,临床样本验证有限,机制研究主要在细胞系中进行,缺乏体内实验验证 | 探究结直肠癌肝转移的分子机制,寻找新的治疗靶点 | 结直肠癌组织(正常、原发肿瘤、转移灶)和HCT116细胞系 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,机器学习 | 机器学习 | RNA测序数据 | 来自GEO数据库的scRNA-seq和Bulk RNA-seq数据,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |