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当前共找到 43573 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 81 | 2026-09-23 |
Spatial Transcriptomic Profiling Reveals Microenvironment-Dependent Immune Signatures in a Lyme Arthritis model
2026-Jun-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.25.734510
PMID:42395505
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研究论文 | 该研究应用空间转录组学技术，对伯氏疏螺旋体感染的C3H小鼠踝关节组织在炎症高峰期和抗生素治疗后炎症消退期进行基因表达空间分析，揭示了关节微环境依赖的免疫特征 | 首次将空间转录组学应用于莱姆关节炎模型，揭示了关节组织内不同空间区域的免疫反应异质性，发现内侧关节区域的成纤维细胞和滑膜细胞在炎症高峰期获得免疫样表型，而外侧肱桡关节区域相同细胞类型表现出更强的感染耐受性 | 研究仅使用了C3H小鼠模型，未验证其他易感品系；仅分析了两个时间点（感染后两周和四周），缺乏更细粒度的时间动态信息；空间转录组的分辨率可能限制了对单细胞水平异质性的解析 | 探索莱姆关节炎关节组织中的空间基因表达环境，揭示关节微环境在疾病发病机制中的作用 | 感染伯氏疏螺旋体的C3H小鼠踝关节组织 | 空间转录组学 | 莱姆关节炎 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 82 | 2026-09-23 |
NanoCellAnnotator: Formalizing Expert Cell Type Annotation with Large Language Models
2026-Jun-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.21.728965
PMID:42395456
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研究论文 | 该论文提出了NanoCellAnnotator，一个基于大型语言模型且受生物学约束的自动化空间转录组细胞类型注释框架，在胆管癌和乳腺癌数据上进行评估 | 解耦空间结构发现、确定性生物学证据构建和语言模型语义推理；使用hSNMF识别空间聚类，通过GO富集和GO-slim投影抽象标记基因为功能程序；轻量级本地可执行语言模型在受约束的标签空间内进行标签选择；独立估计注释置信度并标记模糊或异质性聚类 | 仅在胆管癌和乳腺癌两个数据集上评估，未在其他组织类型或平台上广泛验证；依赖PanglaoDB和CellMarker数据库，可能遗漏新细胞类型；置信度估计方法需进一步验证 | 解决空间转录组学中细胞类型注释因基因面板稀疏、空间异质性和缺乏组织匹配参考图谱而困难的问题，并避免无约束LLM推理产生的幻觉细胞类型 | 肝内胆管癌和乳腺癌的空间转录组数据 | 空间转录组学 | 肝内胆管癌, 乳腺癌 | 空间转录组学 | 大型语言模型 | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Xenium | NA |
| 83 | 2026-09-23 |
Myeloid cell reprogramming drives enhanced defense against Streptococcus pneumoniae lung infection following exposure to commensal Prevotella
2026-Jun-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.25.734552
PMID:42395429
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序揭示了肺部暴露于共生普雷沃菌后，髓系细胞转录重编程如何增强对肺炎链球菌肺部感染的防御 | 首次通过单细胞RNA测序揭示肺部暴露于共生普雷沃菌后髓系细胞从干扰素主导型向抗菌型转录程序的转变，并发现TNFR2介导的TNF信号在增强中性粒细胞抗菌功能中的关键作用，以及CCR2依赖性单核细胞来源巨噬细胞中Cxcl3+成熟亚群的保护性富集 | 摘要中未明确说明研究局限性 | 探究共生普雷沃菌暴露介导的肺部免疫稳态调节机制及其增强肺炎链球菌清除的髓系细胞转录特征 | 小鼠肺部感染模型中的髓系细胞（包括巨噬细胞和中性粒细胞） | 免疫学 | 肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 84 | 2026-09-23 |
Spatial Transcriptomics Recontextualizes the Cellular Environment of Conjunctival Melanoma
2026-Jun-25, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.06.23.26356337
PMID:42396297
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研究论文 | 对结膜黑色素瘤活检组织进行Xenium空间转录组分析，研究其疾病进展过程中的细胞组成和基因表达变化 | 首次将空间转录组学应用于结膜黑色素瘤研究，能够在空间背景下比较不同疾病进展阶段的细胞组成和差异表达特征 | 样本量小，仅来自3名患者的12个FFPE组织切片，需要更大规模的验证研究 | 揭示结膜黑色素瘤进展机制、与邻近组织的关系及分子特征，寻找疾病进展生物标志物和诊断预后工具 | 结膜黑色素瘤患者的活检组织样本 | 空间转录组学 | 结膜黑色素瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、图像 | 3名患者的12个FFPE组织切片 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium空间转录组分析平台 |
| 85 | 2026-09-23 |
Age but not sex modifies lymphoid immune responses in murine sepsis
2026-Jun-25, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9751570/v1
PMID:42396534
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序绘制了年轻和老年、雄性和雌性小鼠在脓毒症后脾脏淋巴细胞的转录景观，发现年龄而非性别显著影响脓毒症诱导的淋巴细胞转录重编程 | 首次系统比较了年龄和性别两个因素对小鼠脓毒症后脾脏淋巴细胞转录组的影响，揭示了年龄而非性别主导脓毒症诱导的淋巴免疫重塑，并发现了年龄依赖的代谢通路抑制向过度激活转变的模式以及可药物靶点景观的改变 | 研究仅基于小鼠模型，结论是否适用于人类脓毒症患者尚需验证；研究聚焦于脾脏淋巴细胞，未涉及其他免疫器官或髓系免疫细胞；单细胞RNA测序可能遗漏低表达基因和转录后调控信息 | 解析年龄和性别在脓毒症诱导的淋巴免疫重塑中的相对贡献及其细胞和分子机制 | 年轻和老年、雄性和雌性的小鼠脓毒症模型中的脾脏淋巴细胞 | 机器学习 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 86 | 2026-09-23 |
The human limbus functions as an instructive epithelial transition zone
2026-Jun-24, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9948733/v1
PMID:42396502
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研究论文 | 该研究结合单细胞转录组学、空间映射和克隆功能分析，揭示成人角膜缘并非刚性边界，而是一个指导性的上皮过渡区，角膜缘基底祖细胞具有双潜能，可分化为结膜或角膜上皮 | 首次证明成人角膜缘并非不可逆的谱系屏障，而是具有指导性的上皮过渡区；重新定义了结膜-角膜功能边界位于角膜缘内缘；发现角膜缘基底祖细胞在转录组上与结膜基底细胞一致且具有内在双潜能；鉴定出角膜缘成纤维细胞来源的KGF通过增强PAX6蛋白丰度和FGFR2依赖的MYC激活来指导角膜命运，而EGF维持结膜身份，确立了生长因子平衡作为上皮命运分子开关的机制 | 摘要中未提及研究局限性 | 探究成人角膜缘在角膜和结膜上皮谱系分化中的功能角色及其分子调控机制 | 成人角膜缘组织、角膜缘基底祖细胞、角膜缘成纤维细胞、角膜和结膜上皮 | 单细胞生物学、空间转录组学 | 眼科疾病 | 单细胞转录组学、空间映射、克隆功能分析 | NA | 转录组数据、空间数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 87 | 2026-09-23 |
Type I Interferon-Driven Monocyte Dysregulation and MAS-associated CD8+ T cells During Macrophage Activation Syndrome
2026-Jun-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.23.727321
PMID:42244634
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研究论文 | 该研究通过批量与单细胞RNA测序分析MAS患儿单核细胞，揭示I型干扰素驱动的单核细胞失调及MAS相关CD8+ T细胞群体 | 发现MAS中经典单核细胞的I型干扰素（而非IFNγ）驱动的转录特征，鉴定出循环IFNβ升高及独特的MAS相关CD8+ T细胞群体 | 样本量有限，未在摘要中明确具体样本数，机制性结论需进一步功能验证 | 探究MAS中单核细胞和巨噬细胞的转录变化及其在MAS发病机制中的作用 | MAS患儿及健康对照的 sorted 单核细胞 | 机器学习 | 自身免疫性疾病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 文本 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 88 | 2026-09-23 |
Reference-informed spatial domain detection using weak supervision for spatial transcriptomics
2026-Jun-22, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.281260.125
PMID:42236081
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研究论文 | 提出GraphScrDom，一种基于参考信息的弱监督对比学习模型，结合专家标注的涂鸦和参考单细胞RNA-seq数据，用于空间转录组学的组织分割 | 首次将专家提供的涂鸦标注与参考单细胞RNA-seq数据整合到弱监督对比学习框架中，实现空间域检测，并在多种空间转录组平台和分辨率上优于现有方法 | 依赖于专家提供的涂鸦标注和参考单细胞RNA-seq数据，可能受标注质量和参考数据匹配度的影响 | 开发一种参考信息驱动的弱监督对比学习方法，用于空间转录组学中的空间域检测和组织分割 | 空间转录组数据、组织切片、专家标注、参考单细胞RNA-seq数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | 对比学习模型 | 图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 89 | 2026-09-23 |
An Integrated muti-omics cell atlas of the human trabecular meshwork and ciliary body
2026-Jun-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.17.732980
PMID:42395492
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研究论文 | 该研究构建了人类小梁网和睫状体的空间多组学细胞图谱，整合了超过一百万细胞和细胞核的单细胞转录组、单核转录组、单核ATAC及空间转录组数据，揭示了眼压调控和青光眼易感性的细胞与遗传机制 | 首次构建了跨112个供体、超过一百万细胞和细胞核的人类小梁网和睫状体空间多组学图谱，整合了snRNA-seq、scRNA-seq、snATAC-seq和Xenium空间转录组，发现了未被充分表征的成纤维细胞和上皮细胞亚群，并将青光眼遗传位点与细胞类型特异性调控元件相关联 | 未在摘要中明确提及研究局限性 | 构建人类小梁网和睫状体的高分辨率多组学细胞图谱，阐明细胞异质性、调控程序及其与青光眼遗传易感性的关系 | 人类小梁网和睫状体组织，来自112个供体 | 数字病理学, 机器学习 | 青光眼 | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序, 单核ATAC测序, 空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | 112个供体，超过一百万细胞和细胞核 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq, spatial transcriptomics | 10x Chromium, 10x Xenium | 10x Chromium单细胞/单核转录组和ATAC建库平台，10x Xenium空间转录组平台 |
| 90 | 2026-09-23 |
pyVIPER: a fast and scalable Python package for protein activity estimation and master regulator analysis of single-cell RNA sequencing data
2026-Jun-22, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-026-06524-x
PMID:42332576
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研究论文 | 介绍了一个基于Python的快速可扩展工具pyVIPER，用于单细胞RNA测序数据中的蛋白质活性推断和主调控因子分析 | 开发了基于Python的pyVIPER工具，支持灵活的数据转换/后处理模块、富集分析算法，具有新的基因调控网络数据结构，利用PyTorch GPU加速和优化核心操作，相比R版本VIPER运行效率提升数个数量级 | 摘要中未明确提及该工具的局限性 | 解决单细胞RNA测序数据规模增长带来的可扩展性分析需求，实现大规模单细胞数据集的蛋白质活性推断 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | VIPER算法 | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 91 | 2026-09-23 |
Spatial Orchestration of Skin Fibrosis by a CD8+ T cell- Myofibroblast Axis
2026-Jun-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.17.732787
PMID:42395449
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研究论文 | 本文通过多模态单核和空间转录组学技术，揭示了CD8+ T细胞与肌成纤维细胞轴在皮肤纤维化中的空间调控机制，并在小鼠模型中验证了CD8+ T细胞在纤维化过程中的关键驱动作用 | 首次通过多模态单核和空间转录组学揭示了CD8+ T细胞驱动的纤维化在皮肤纤维化疾病中的核心作用，发现了炎症组织域中CD8+ T细胞与ADAM12表达的炎症性成纤维细胞和肌成纤维细胞的紧密共定位关系，并证明了靶向CD8+ T细胞可改善纤维化 | 研究主要聚焦于硬斑病和嗜酸性筋膜炎，对其他类型纤维化皮肤疾病的适用性尚需进一步验证；小鼠模型采用博来霉素诱导，与人类自身免疫性纤维化的病理机制可能存在差异 | 探究纤维化皮肤疾病中免疫驱动因素以及促纤维化成纤维细胞亚群的身份和空间定位，特别是CD8+ T细胞在皮肤纤维化中的作用机制 | 硬斑病（morphea）和嗜酸性筋膜炎（EF）患者的纤维化皮肤组织样本，以及博来霉素诱导的小鼠纤维化模型 | 数字病理学 | 皮肤纤维化 | 单核RNA测序，空间转录组学 | NA | 图像，文本 | NA | 10x Genomics | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium Spatial Gene Expression |
| 92 | 2026-09-23 |
Benchmarking cell type annotation in spatial transcriptomics: resolving cellular hierarchies, biological fidelity, and dynamic cell states
2026-Jun-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.16.732716
PMID:42395478
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研究论文 | 该文章对20种最先进的细胞类型注释方法在四个空间转录组学数据集上进行了系统性基准测试，评估其在细胞层级解析、生物学保真度和动态细胞状态方面的表现 | 首次在多个空间转录组学数据集上系统性地基准测试20种细胞类型注释方法，涵盖基于参考和无参考两类方法，不仅评估传统分类指标，还引入结构感知指标来评估高阶生物学组织的保留程度 | 许多方法在细粒度亚型注释和稀有细胞群恢复方面仍面临挑战，特别是在捕捉损伤、修复、发育和再生等连续细胞状态转换过程的数据集中，高分类准确率不一定对应全局细胞关系的保留或生物学连贯的下游通路分析 | 系统评估和比较当前空间转录组学中细胞类型注释方法的性能，为研究人员根据具体生物学问题、数据集特征和分析优先级选择合适方法提供实用指导 | 四个空间转录组学数据集，涵盖不同技术平台、实验条件、细胞数量和基因面板大小，所有数据集均包含专家 curated 的细胞类型标签 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | scANVI, Seurat, TACCO等多种注释模型 | 空间转录组学数据（含基因表达和空间信息） | 四个空间转录组学数据集，包含多种细胞数量和基因面板大小 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 93 | 2026-09-23 |
Macrophage EHD1 Promotes Inflammation and Stabilizes Sortilin to Accelerate Atherosclerosis
2026-Jun-19, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.327751
PMID:42165151
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研究论文 | 本文研究了巨噬细胞中EHD1在动脉粥样硬化中的作用，发现EHD1通过促进TNFR2的胞吞循环再循环和稳定sortilin来促进炎症和加速动脉粥样硬化 | 首次揭示EHD1在巨噬细胞中通过调控TNFR2的胞吞再循环和稳定sortilin来促进炎症和动脉粥样硬化进展的新机制 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探索内吞调节因子EHD1在巨噬细胞免疫应答中的作用及其对动脉粥样硬化进展的贡献 | 小鼠和人类的动脉粥样硬化斑块中的巨噬细胞、骨髓来源的巨噬细胞、Ehd1-/-小鼠和Ldlr-/-小鼠 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、骨髓移植、内吞实验 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 94 | 2026-09-23 |
Sequential and coordinated control of human plasma cell differentiation by IRF4 and BLIMP1 utilizing a discriminating ISRE/EICE motif lexicon
2026-Jun-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.15.732353
PMID:42367882
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研究论文 | 该研究利用CRISPR/Cas9扰动和单细胞RNA测序等技术，揭示了IRF4和BLIMP1在人浆细胞分化过程中通过识别不同的ISRE/EICE基序词汇实现顺序和协调调控的机制 | 发现了ISRE/EICE基序中非保守核苷酸可区分IRF4与BLIMP1的结合，揭示了IRF4先独立作用、后与BLIMP1协同的基序词汇依赖性调控逻辑 | 研究主要基于体外分步分化系统，可能无法完全反映体内浆细胞分化的复杂微环境调控 | 解析IRF4和BLIMP1在人浆细胞分化过程中如何分配和协调其基因组活动 | 人初始B细胞及浆细胞前体细胞 | 机器学习 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑, 单细胞RNA测序, 多组学分析, CUT&RUN, DNA结合实验 | NA | 文本, 图像 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞多组学平台 |
| 95 | 2026-09-23 |
Cross-Modality Alignment of Spatial Transcriptomics, Multiplexed Imaging, and Histology with PHARAOH
2026-Jun-19, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9954002/v1
PMID:42370255
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研究论文 | 提出PHARAOH分层框架，实现空间转录组学、多重成像和组织学的跨模态对齐，通过全局结构对齐和自动核标志点锚定，在最小用户输入下精确转移坐标 | 结合全局结构对齐与自动核标志点锚定，无需人工标志点，实现细胞分辨率精度的跨模态对齐，并适用于相邻组织切片和多重免疫荧光成像 | 未明确说明 | 实现空间转录组学、多重成像和组织学之间的精确跨模态对齐，以支持空间背景下的分子分析 | 多种组织类型、成像平台和染色条件下的空间转录组学数据、多重成像和组织学图像 | 数字病理学, 空间转录组学 | NA | 空间转录组学, 多重成像, 组织学染色 | NA | 图像 | 多种组织类型和成像平台，具体数量未说明 | NA | 空间转录组学, 多重免疫荧光成像 | NA | NA |
| 96 | 2026-09-23 |
Dual-functional Nanocarrier for Improved Immunochemotherapy of Acute Myeloid Leukemia
2026-Jun-18, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9901177/v1
PMID:42370261
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研究论文 | 该文章设计了一种超小尺寸（约15纳米）的基于阿糖胞苷的聚合物胶束纳米载体（PAraC），用于共递送阿糖胞苷、柔红霉素和TLR7/8激动剂R848，以改善急性髓系白血病的免疫化疗效果。 | 开发了超小尺寸（约15 nm）的PAraC聚合物胶束纳米载体，实现AraC、Daun和R848的三药智能共递送，并通过scRNA-seq和真实世界数据集分析发现恶性AML细胞中TLR7/8上调，为联合TLR7/8激动剂提供依据。 | 摘要中未明确提及研究的局限性。 | 克服急性髓系白血病治疗中的耐药性和免疫逃逸问题，提高免疫化疗效果。 | 急性髓系白血病（AML）细胞、小鼠模型、患者来源异种移植（PDX）AML模型以及AraC耐药的急性淋巴细胞白血病（ALL）模型。 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和真实世界数据集分析 | NA | 文本、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 97 | 2026-09-23 |
A Counterfactual Framework for Directional Cell-Cell Interaction Analysis in Spatial Transcriptomics
2026-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.05.716510
PMID:42005861
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研究论文 | 提出一种基于反事实干预的框架，用于在空间转录组学中推断有向细胞-细胞影响，无需配体-受体先验知识 | 首次引入反事实干预框架推断有向细胞-细胞影响，不依赖配体-受体对，可检验发送者特异性，并定义反事实方向性评分（CDS）量化方向性影响 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 开发一种统计严谨且可扩展的有向细胞-细胞通讯分析方法，明确检验方向性 | 胆管癌组织微阵列中的肿瘤、免疫和基质细胞 | 空间转录组学 | 胆管癌 | 空间转录组学 | 邻域条件图模型 | 空间转录组数据 | 38个组织芯片核心 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium空间转录组平台 |
| 98 | 2026-09-23 |
Correcting spatial transcriptomics data affected by a prevalent transcript leakage problem across platforms, species, and tissues
2026-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.13.732076
PMID:42367830
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研究论文 | 该文章揭示了空间转录组数据中普遍存在的转录本泄漏问题，并提出了一种基于贝叶斯模型的无参考方法DeLeakage来校正该问题 | 首次系统性地揭示并证明了空间转录组数据中普遍存在转录本泄漏问题，该问题跨越不同平台、物种和组织；提出了首个基于贝叶斯模型的无参考方法DeLeakage来有效校正转录本泄漏 | 摘要中未明确提及该研究的局限性 | 揭示空间转录组数据中的转录本泄漏问题，并开发计算方法来校正该问题以改善下游分析 | 空间转录组数据，涵盖不同组织、不同物种、不同平台产生的数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 贝叶斯模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 涵盖基于成像和基于测序的空间转录组平台 |
| 99 | 2026-09-23 |
Dissecting and directing pathology foundation models
2026-Jun-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.12.731496
PMID:42367854
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研究论文 | 该文章提出了PICASSO框架，通过稀疏自编码器将病理基础模型的嵌入分解为人类可解释的视觉概念，构建了首个泛癌组织形态学概念图谱，并实现了模型的可解释性与可控性 | 首次提出PICASSO框架，利用稀疏自编码器将病理基础模型的密集嵌入分解为可解释的视觉概念，构建了覆盖32种癌症类型、超过1.2亿组织切片的泛癌组织形态学概念图谱；实现了概念级别的干预与操控，包括抑制技术伪影相关概念和生成反事实嵌入用于探索性治疗分析；发现了肺腺癌中EGFR突变的新型生物标志物——鞋钉样上皮形态 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 使病理基础模型变得可解释和可控，将其从黑箱系统转变为机制洞察和科学发现的平台 | 病理基础模型的嵌入表示、组织切片图像、32种癌症类型的组织形态学特征 | 数字病理学 | 肺癌、泛癌 | 稀疏自编码器、空间转录组学 | 基础模型、稀疏自编码器 | 图像 | 超过1.2亿组织切片，覆盖32种癌症类型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 100 | 2026-09-23 |
Deep Cellular and Spatial Profiling of the Mouse Spinal Cord Reveals Sex-Specific Neuron Types and the Ascending Projection Neuron Repertoire
2026-Jun-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.11.731752
PMID:42367914
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研究论文 | 该研究通过逆行病毒追踪、空间转录组学和多组学分析超过75万个小鼠脊髓神经元，揭示了性别特异性神经元类型和上行投射神经元库 | 识别了78个上行脊髓投射神经元类别和超过500个解剖和转录组上不同的神经元类型，发现了性别特异性脊髓神经元，并构建了细胞类型到表型的映射 | 研究仅限于小鼠模型，可能无法完全反映人类脊髓的复杂性；样本主要为小鼠，未涉及其他物种 | 定义脊髓的输出逻辑和功能细胞库，理解其细胞多样性如何实现功能 | 小鼠脊髓神经元 | 神经科学 | NA | 空间转录组学, 多组学分析, 逆行病毒追踪 | NA | 图像, 文本 | 超过750,000个小鼠脊髓神经元 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞多组学 | 10x Visium, 10x Chromium | 10x Visium 空间转录组学, 10x Chromium 单细胞多组学 |