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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
81 2026-09-29
Diurnal Insulin Clearance and Circadian Metabolic Gene Signatures in MASLD: Integrative Multi-Dataset Physiological and Transcriptomic Analysis
2026-Aug-29, Metabolites IF:3.4Q2
研究论文 该研究整合多个公共数据集,探索MASLD中胰岛素清除的昼夜节律变化及其与昼夜代谢基因特征的关系 首次整合单受试者试点评估、高胰岛素-正葡萄糖钳夹数据集、昼夜转录组数据集、空间转录组数据及HFD小鼠时间序列数据,系统探讨MASLD中胰岛素清除的昼夜变化与昼夜节律代谢基因特征的关联 单受试者试点评估样本量极小,缺乏大规模受控人体研究验证,结论需进一步验证 探索人体胰岛素清除的昼夜变化,并检查MASLD中相关的代谢基因特征 健康个体和MASLD患者、公共昼夜转录组数据集、空间转录组数据、HFD诱导小鼠模型 机器学习 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 高胰岛素-正葡萄糖钳夹、转录组分析、空间转录组学 NA 转录组数据、生理指标数据 单受试者试点评估1例,以及多个公共数据集中的健康个体和MASLD患者样本 NA bulk RNA-seq、空间转录组学 NA NA
82 2026-09-29
Peripheral Nerve Injury Induces an Interferon-Responsive State Centered on Satellite Glial Cells in the DRG That Sustains Neuropathic Pain Through STAT1 and CXCL10 Signaling
2026-Aug-29, Brain sciences IF:2.7Q3
研究论文 该研究结合单细胞转录组学与组织学、行为学和电生理学方法,发现周围神经损伤后背根神经节中卫星胶质细胞出现干扰素响应状态,并通过STAT1和CXCL10信号维持神经病理性疼痛 首次在背根神经节中鉴定出干扰素响应的卫星胶质细胞状态,并揭示其通过STAT1依赖的CXCL10/CXCR3趋化因子信号维持神经病理性疼痛,同时证明靶向该通路可缓解疼痛及运动功能缺陷 摘要中未明确说明研究的局限性 阐明周围神经损伤后维持神经病理性疼痛的细胞状态及细胞间信号机制 背根神经节中的卫星胶质细胞、感觉神经元和免疫细胞,以及 spared nerve injury 小鼠模型 单细胞转录组学 神经病理性疼痛 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组数据、组织学数据、行为学数据、电生理学数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
83 2026-09-29
Integrating Multi-Omics and Machine Learning to Reveal a Prognostic Model for Prostate Cancer Metastatic Recurrence Associated with Epithelial-Mesenchymal Transition Features
2026-Aug-27, Genes IF:2.8Q2
研究论文 该研究整合批量转录组、单细胞RNA测序和空间转录组数据,结合91种机器学习算法组合构建了一个与上皮-间质转化特征相关的三基因预后模型,用于前列腺癌转移复发风险分层 首次整合多组学数据与91种机器学习算法组合,构建了基于EMT相关基因(INHBA、FAP、ITGBL1)的前列腺癌转移复发预后模型,并结合SHAP分析增强模型可解释性,同时通过单细胞和空间转录组推断出COMP+成纤维细胞向NELL2+成纤维细胞的转录转变 空间分析仅基于一个组织切片,样本量有限;研究结果属于假设生成性证据,仍需实验验证;外部验证队列的AUC值(0.62-0.77)低于训练队列(0.93),模型泛化能力有待进一步验证 开发基于机器学习和多组学整合的前列腺癌预后模型,识别与EMT相关的转移复发风险标志物,实现精准风险分层 前列腺癌患者及其肿瘤组织样本 机器学习 前列腺癌 bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 Random Forest, Lasso, CoxBoost, 共识聚类, WGCNA, SHAP 转录组数据, 图像 训练队列248例(GSE116918),三个外部验证队列(TCGA-PRAD、GSE70769、GSE46602),单细胞RNA测序10,672个细胞(GSE268307),空间转录组1个组织切片 10x Genomics 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 10x Genomics Visium 10x Genomics Visium FFPE
84 2026-09-29
Single-Cell RNA Sequencing Combined with MEBOCOST Reveals Alveolar Macrophage-Mediated Immunometabolic Communication Mechanisms in Sepsis-Induced Acute Lung Injury
2026-Aug-27, Genes IF:2.8Q2
研究论文 该研究通过整合单细胞和批量转录组数据,结合CellChat和MEBOCOST重建蛋白质-代谢物双重通讯网络,揭示了脓毒症诱导急性肺损伤中肺泡巨噬细胞介导的免疫代谢通讯机制 首次建立SI-ALI的双层细胞通讯图谱,提出以巨噬细胞为中心的代谢炎症调控模型,并识别出铁-Slc40a1和LTB4-Ltb4r1信号主导的肺泡巨噬细胞-中性粒细胞免疫代谢轴 研究主要基于CLP诱导的脓毒症小鼠模型,尚未在人类临床样本中验证;MEBOCOST预测的代谢物通讯需要更多实验验证 阐明脓毒症诱导急性肺损伤中代谢物介导的免疫信号传递机制,特别是肺泡巨噬细胞作为中心代谢协调者的作用 CLP诱导的脓毒症小鼠肺组织 机器学习, 数字病理学 脓毒症诱导急性肺损伤 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 LASSO回归, 随机森林 基因表达数据, 图像 NA NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
85 2026-09-29
Prognostic Significance of CDKL2 in Non-Small Cell Lung Cancer: A Favorable Association in Lung Adenocarcinoma
2026-Aug-27, Medicina (Kaunas, Lithuania)
研究论文 该研究评估了CDKL2表达与非小细胞肺癌不同组织学亚型(肺腺癌和肺鳞癌)预后之间的关联差异 揭示了CDKL2在肺腺癌和肺鳞癌中具有相反的预后关联,且通过组织学交互项验证了这种差异的统计学显著性 LUSC的不良预后关联仅为初步结果,外部验证队列中未支持该关联,CDKL2应被视为候选预后标志物而非已确立的临床生物标志物 评估CDKL2表达在不同非小细胞肺癌组织学亚型中的预后意义是否存在差异 非小细胞肺癌患者,包括肺腺癌和肺鳞癌患者 数字病理学, 机器学习 肺癌 bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 多变量Cox比例风险模型 基因表达数据, 临床数据, 图像 TCGA队列943例患者(471例LUAD,472例LUSC,375例死亡),外部验证队列GSE30219 Illumina bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA TCGA表达数据及GSE30219数据集
86 2026-09-29
Integration of GWAS and single-cell analysis for psoriasis identifies disease-associated cell subtypes and therapeutic targets
2026-Aug-27, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 该研究通过整合GWAS和单细胞转录组数据,揭示了银屑病的遗传和分子结构,识别了疾病相关的细胞亚型和治疗靶点 进行了大规模GWAS荟萃分析,发现了17个新易感位点,并结合单细胞转录组数据识别了疾病相关细胞亚型和50个潜在治疗靶点 研究主要基于欧洲血统个体,可能不适用于其他人群;未进行实验验证治疗靶点 阐明银屑病的遗传和分子机制,识别疾病相关细胞亚型和治疗靶点 欧洲血统个体的基因组和单细胞转录组数据 机器学习, 数字病理学 银屑病 GWAS, 单细胞RNA测序 NA 基因组数据, 转录组数据 1,131,685个欧洲血统个体(GWAS),单细胞转录组数据样本量未指定 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
87 2026-09-29
Spatial analysis reveals cellular microenvironments and mechanisms of inflammation and injury in acute interstitial nephritis
2026-Aug-27, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 结合高分辨率成像质谱流式细胞术与单细胞空间转录组学,分析急性间质性肾炎肾脏活检中的细胞微环境及炎症和损伤机制 首次在急性间质性肾炎中应用高分辨率成像质谱流式细胞术和单细胞空间转录组学,揭示干扰素-γ诱导的CXCL9-CXCR3信号增强、T细胞-T细胞同型扩增网络、VCAM1损伤近端小管上调补体成分以及NAMPT作为VCAM1小管微环境最强空间相关因子 摘要未提及研究局限性 揭示急性间质性肾炎的细胞微环境和炎症损伤机制,并寻找潜在治疗靶点 人类肾脏活检组织,包括急性间质性肾炎、急性肾小管损伤和参考组织 数字病理学 急性间质性肾炎 成像质谱流式细胞术,单细胞空间转录组学 NA 图像,文本 NA NA 单细胞空间转录组学,成像质谱流式细胞术 NA NA
88 2026-09-29
The cellular and molecular basis of gyrus-sulcus specialization in the primate brain
2026-Aug-26, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 该研究利用成年雄性猕猴脑的单细胞空间转录组数据,开发了深度学习框架gsModel,用于区分脑回和脑沟,并揭示了其细胞和分子基础 开发了gsModel深度学习框架,仅基于局部细胞类型组成即可区分脑沟和脑回,准确率超过90%,并整合扩散MRI纤维束追踪,将局部分子结构与宏观连接联系起来 研究仅基于成年雄性猕猴,样本有限,未涉及其他物种或发育阶段,且未进行功能验证实验 探究灵长类大脑脑回和脑沟特化的细胞和分子基础 成年雄性猕猴的大脑皮层 空间转录组学、深度学习、神经科学 NA 单细胞空间转录组学、扩散MRI纤维束追踪 深度学习框架(gsModel) 空间转录组数据、图像数据(MRI) 成年雄性猕猴大脑样本(具体数量未提及) NA 单细胞空间转录组学 NA NA
89 2026-09-29
Single-Cell RNA-Seq Reveals Chromosomal Instability-Associated Transcriptomic Profiles in Breast Cancer
2026-Aug-26, Biomedicines IF:3.9Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序数据量化乳腺癌中的染色体不稳定性水平和克隆异质性,并揭示其转录组学特征 在单细胞分辨率下量化染色体不稳定性,揭示其与克隆异质性的关联,并发现新的候选生物标志物 染色体不稳定性与克隆异质性之间的正相关趋势在统计学上不显著 量化HER2阳性和三阴性乳腺癌中的染色体不稳定性水平和克隆异质性,探索其转录组学特征 HER2阳性和三阴性乳腺癌肿瘤及非恶性对照样本 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
90 2026-09-29
An L1CAM-Positive Fibroblast-Associated Stromal State Is Associated with Reduced T/NK Cytotoxicity Features in Colorectal Cancer
2026-Aug-26, Biomedicines IF:3.9Q1
研究论文 本研究利用公共批量与单细胞数据集,刻画了结直肠癌中L1CAM的表达模式、细胞定位及免疫相关特征 发现L1CAM主要表达于罕见的成纤维细胞和上皮细胞亚群而非T/NK细胞,并揭示L1CAM阳性成纤维细胞相关基质状态与T/NK细胞毒性特征降低相关 研究为假设生成性,结论具有数据集特异性,补充外部数据集未能重复相同方向的关联,需要空间和功能验证 表征结直肠癌中L1CAM的表达模式、细胞定位及免疫微环境相关特征 结直肠癌患者样本及公共数据库中的泛癌数据 数字病理学 结直肠癌 bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA 文本(基因表达数据) TCGA、GTEx、CPTAC/UALCAN泛癌数据集及GSE178341单细胞数据集 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
91 2026-09-29
CSNK2B Expression Aligns with a GDF15-Associated Immune Molecular State in Hepatocellular Carcinoma
2026-Aug-26, Biomedicines IF:3.9Q1
研究论文 该研究整合多组学数据,分析肝细胞癌中CSNK2B表达与GDF15相关免疫分子状态之间的关联 首次将CSNK2B表达与GDF15相关Treg/检查点转录模块在肝细胞癌中建立可重复的关联,并结合单细胞RNA测序、去卷积和CellChat推断进行多维度验证 证据仅为关联性,无法提供因果或治疗预测声明;去卷积结果较弱且异质性大;候选的肝细胞到T/NK细胞的GDF15-TGFBR2配受体对未能在合并数据或患者分层分析中重现 探讨CSNK2B在肝细胞癌中的表达与免疫状态之间的关系 肝细胞癌(HCC)患者样本及公共数据库数据 数字病理学 肝癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 蛋白质组学 NA 图像, 文本 TCGA-LIHC队列、6个GEO队列-平台组合、GSE149614单细胞RNA测序数据以及10例患者分层的CellChat分析 Illumina 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 Illumina NovaSeq TCGA-LIHC和GEO队列的批量RNA测序数据、GSE149614单细胞RNA测序数据
92 2026-09-29
An Exploratory Single-Cell Analysis Identifies Candidate Shared Molecular Features in Proliferative Diabetic Retinopathy and Parkinson's Disease
2026-Aug-26, Genes IF:2.8Q2
研究论文 该研究整合了增殖性糖尿病视网膜病变(PDR)视网膜纤维血管膜和帕金森病(PD)脑组织的单细胞RNA测序数据集,以探索两种疾病之间共享的分子和细胞特征 首次通过整合PDR和PD的单细胞RNA测序数据,识别出A2M、NRP1和ETS2等候选共享转录特征,并预测了ITGB2-ICAM1配体-受体相互作用作为两种疾病间潜在的免疫-血管通讯机制 本研究为探索性分析,样本量有限,ITGB2-ICAM1相互作用仅为计算预测结果,需要进一步的实验验证来确认其生物学意义 旨在描绘糖尿病视网膜病变与帕金森病之间的分子和细胞联系,特别关注两者趋同的神经免疫和血管通路 增殖性糖尿病视网膜病变(PDR)的视网膜纤维血管膜组织和帕金森病(PD)的脑组织 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 CellChat 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
93 2026-09-29
Aerobic Exercise Alleviates Oligodendrocyte Injury and Ferroptosis-Related Features in MPTP-Induced Parkinsonian Mice with Improved Neuropathological Phenotypes
2026-Aug-24, Brain sciences IF:2.7Q3
研究论文 本研究结合单核RNA测序和空间转录组学,探究有氧运动对MPTP诱导的帕金森病小鼠黑质致密部少突胶质细胞损伤及铁死亡相关特征的缓解作用 首次结合单核RNA测序和空间转录组学揭示MPTP诱导帕金森病小鼠黑质致密部少突胶质细胞丰度降低及铁死亡通路富集,并发现有氧运动可部分恢复少突胶质细胞标志基因Plp1及抗氧化分子Nrf2和Gpx4的表达 研究主要基于MPTP诱导的小鼠模型,尚未在人类帕金森病患者中验证;代谢组学分析为探索性非靶向研究,需要进一步验证 探究帕金森病中少突胶质细胞相关的调控机制,以及有氧运动对少突胶质细胞损伤和铁死亡相关特征的干预效果 MPTP诱导的帕金森病小鼠模型黑质致密部 数字病理学, 机器学习 帕金森病 单核RNA测序, 空间转录组学, 非靶向代谢组学 NA 图像, 文本 NA NA 单核RNA测序, 空间转录组学, 非靶向代谢组学 NA NA
94 2026-09-29
Single-cell spatial mapping of human kidney development implicates the microenvironment in guiding cell fate decisions
2026-Aug, Nature genetics IF:31.7Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术,分析了超过70万个细胞,绘制了人类肾脏发育的时空图谱,揭示了微环境在指导细胞命运决定中的作用。 揭示了肾脏发育过程中细胞命运的可塑性,即早期模式化建立的细胞命运可以在后期被修正;通过全基因组、空间感知的细胞间相互作用分析,将局部配体信号与细胞命运决定联系起来。 未明确提及 研究人类肾脏发育过程中细胞间相互作用如何协调器官形成,并绘制其空间组织图谱。 人类肾脏发育过程中的细胞 空间转录组学 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 基因表达数据,空间转录组数据 超过700,000个细胞 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
95 2026-09-29
[Research Progress on the Application of Single-Cell Sequencing Technology in Diffuse Large B-Cell Lymphoma --Review]
2026-Aug, Zhongguo shi yan xue ye xue za zhi
综述 本文系统综述了单细胞测序技术在弥漫性大B细胞淋巴瘤研究中的前沿进展 从单细胞层面系统解析DLBCL的细胞异质性、肿瘤微环境细胞互作及动态变化,并展望多组学和空间转录组技术的临床应用前景 未涉及具体实验数据或原始研究结果,属于文献综述,缺乏对现有研究局限性的深入批判性分析 阐述单细胞测序技术在DLBCL发病机制、肿瘤微环境、预后评估及新型治疗靶点研究中的应用进展 弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL) 数字病理学 淋巴瘤 单细胞测序 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
96 2026-09-29
CODAvision: best practices and a user-friendly interface for rapid, customizable segmentation of medical images
2026-Jul-07, Nature protocols IF:13.1Q1
研究方法 该论文介绍了CODAvision工具,这是一个用户友好的图形界面,用于快速、可定制的医学图像语义分割,并提供了最佳实践指南 CODAvision通过提供图形用户界面简化了参数配置、模型训练和性能评估,自动生成定量结果和综合报告,使没有编码经验的研究人员也能使用深度学习进行医学图像分割 需要用户对编程和解剖学有基本了解 简化医学图像的语义分割过程,使没有广泛编码专业知识的研究人员能够训练高度可定制的深度学习模型 医学图像,包括组织学、磁共振成像和计算机断层扫描等 数字病理学 NA 深度学习语义分割 卷积神经网络 图像 NA NA NA NA NA
97 2026-09-29
Single-cell transcriptomics-guided dynamic hydrogel delivery of artemisia argyi-derived EVs relieves ER stress and promotes diabetic wound regeneration
2026-Jul-06, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1
研究论文 该研究结合单细胞转录组学和多组学分析,开发了一种负载艾叶来源细胞外囊泡的注射用动态水凝胶(GPOK-2@EVs),用于调节糖尿病伤口的炎症微环境并促进伤口再生 首次整合单细胞转录组学和多组学分析揭示糖尿病伤口中促炎巨噬细胞内质网应激信号富集,并开发了基于苯硼酸修饰明胶与氧化魔芋葡甘聚糖双重动态交联的注射用水凝胶递送艾叶来源EVs,实现pH/ROS响应性持续释放 摘要中未明确提及该研究的局限性 开发一种基于单细胞转录组学指导的细胞外囊泡递送系统,通过靶向内质网应激和炎症微环境促进糖尿病伤口再生 糖尿病小鼠伤口模型、巨噬细胞、内皮细胞、艾叶来源细胞外囊泡 单细胞转录组学、生物材料、再生医学 糖尿病伤口、糖尿病 单细胞转录组学、多组学分析 NA 转录组数据、图像 NA NA 单细胞RNA测序、多组学 NA NA
98 2026-09-29
Single-cell RNA sequencing in thyroid cancer: a methodological review and thyroid specific dissociation protocol
2026-Jun-26, Thyroid research IF:1.9Q3
综述 该综述系统评估了甲状腺癌中已发表的单细胞RNA测序研究的方法学,并提出了一种优化的甲状腺组织解离方案,用于生成高质量的单细胞悬液 提出了用免疫磁珠去除步骤替代传统红细胞裂解缓冲液的优化甲状腺组织解离方案,提高了细胞回收率和活力,并系统评价了现有甲状腺癌scRNA-seq研究的方法学缺陷 优化方案仍需正式的验证研究,且需要在更广泛的样本类型中进行基准测试 评估甲状腺癌中已发表的scRNA-seq研究的方法学,并开发适用于珍贵患者来源甲状腺样本的优化组织解离方案 甲状腺癌原发肿瘤样本,包括乳头状甲状腺癌、低分化甲状腺癌和未分化甲状腺癌 数字病理学 甲状腺癌 单细胞RNA测序 NA 文本 22项研究,涉及作者收集的原发肿瘤标本 NA 单细胞RNA测序 NA 基于液滴的单细胞RNA测序平台
99 2026-09-29
Hybrid untargeted short-read and targeted long-read RNA sequencing facilitates genotype-phenotype associations at single-cell resolution
2026-Jun-01, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 本文系统评估短读长全转录组扩增、长读长全转录组扩增和长读长靶向测序,并开发了一种结合短读长全转录组扩增和长读长靶向测序的混合策略,通过Snakemake流程实现单细胞分辨率下的基因型-表型关联分析 开发了一种混合策略,结合短读长全转录组扩增的广泛转录组覆盖和长读长靶向测序对50基因面板的深度变异检测,通过Snakemake流程整合两种方法,提高了在单细胞分辨率下将突变谱与转录程序关联的能力 长读长单细胞RNA测序受限于低读取覆盖度,限制了单细胞分辨率下的基因型-表型分析 系统评估不同测序策略并开发混合方法,以促进单细胞分辨率下的基因型-表型关联分析 单细胞转录组 机器学习 NA 短读长全转录组扩增, 长读长全转录组扩增, 长读长靶向测序 NA 文本 NA NA single-cell RNA-seq NA NA
100 2026-09-29
Spatial atlas of diabetic kidney disease reveals a B cell-rich subgroup
2026-May, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本文利用Xenium和CosMx单细胞空间转录组学结合单核RNA测序构建了跨平台肾脏图谱,揭示了糖尿病肾病中一个B细胞富集的亚组,并开发了组织生物标志物和血浆蛋白面板用于患者分层和风险预测 构建了跨平台可计算的肾脏空间图谱,定义了可重复的组织生态位和损伤相关微环境,发现了一个以B细胞为主的三级淋巴结构样免疫微环境,该微环境定义了糖尿病肾病的一个独特亚组,并开发了组织生物标志物和匹配的血浆蛋白面板 摘要中未明确提及研究限制 构建糖尿病肾病的空间图谱,揭示其临床和分子异质性,开发用于预后、无创检测和患者选择的生物标志物 糖尿病肾病患者的肾脏组织样本和血浆样本 数字病理学 糖尿病肾病 单细胞空间转录组学,单核RNA测序 NA 空间转录组数据,单核RNA测序数据,图像 NA 10x Genomics, NanoString 单细胞空间转录组学,单核RNA测序 Xenium, CosMx NA
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