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当前共找到 37744 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-03-25 |
NUP85 as a Pan-Cancer Immune Biomarker: Integrated Multi Omics and Functional Analyses Reveal Its Role in Tumor Prognosis
2026, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S541852
PMID:41869435
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和功能验证，探讨NUP85作为泛癌免疫生物标志物在肿瘤预后中的作用 | 首次全面整合多组学数据和功能实验，揭示NUP85在肿瘤免疫和预后中的关键作用，特别是在增殖性T细胞中的表达特征 | 研究主要基于公共数据库和细胞系实验，缺乏体内动物模型验证和临床样本的直接验证 | 阐明NUP85在癌症发病机制中的潜在作用，探索其作为肿瘤标志物的价值 | 多种肿瘤类型，重点关注肺腺癌和口腔鳞状细胞癌的细胞系 | 生物信息学 | 泛癌研究 | 多组学分析，包括转录组、蛋白质组、表观遗传组和单细胞测序 | NA | 多组学数据，包括基因表达、蛋白质表达、甲基化、拷贝数变异等 | 基于TCGA、GTEx、CPTAC等多个公共数据库的大规模样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq，多组学分析 | NA | NA |
| 82 | 2026-03-25 |
Integrative Multi-Omics and Single-Cell Profiling Identify Chitinase Domain Containing Protein 1 (CHID1) as a Prognostic Biomarker in Glioblastoma
2026, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.130519
PMID:41869455
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研究论文 | 本研究通过整合多组学和单细胞分析，鉴定CHID1作为胶质母细胞瘤的预后生物标志物 | 首次全面探索CHID1在胶质母细胞瘤中的表达模式及其与代谢和氧化还原相关通路的关联 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏深入的实验验证 | 探究CHID1在胶质母细胞瘤中的表达、功能及其作为预后标志物的潜力 | 胶质母细胞瘤患者样本及正常脑组织 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、转录组学分析、分子对接 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | TCGA-GBM和CGGA数据集中的胶质母细胞瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 83 | 2026-03-25 |
Spatial Omics in Gastrointestinal Oncology: Recent Advances, Therapeutic Insights, and Clinical Translation
2026, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.127381
PMID:41869445
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综述 | 本文综述了空间组学技术在胃肠道肿瘤学中的最新进展、治疗见解及临床转化应用 | 整合了空间转录组学、蛋白质组学、代谢组学和表观基因组学等多组学技术，以高分辨率解析肿瘤微环境，揭示空间定义的生态位，为个性化治疗提供新视角 | 面临标准化、数据整合和临床验证等挑战，尚未完全融入常规肿瘤学实践 | 探讨空间组学技术在胃肠道肿瘤诊断、治疗分层和疗效监测中的应用潜力 | 胃肠道癌症，包括结直肠癌、胃癌和食管癌 | 数字病理学 | 胃肠道癌症 | 空间转录组学、空间蛋白质组学、空间代谢组学、空间表观基因组学 | NA | 空间多组学数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 空间代谢组学, 空间表观基因组学 | NA | NA |
| 84 | 2026-03-25 |
Mapping Myeloid Cell Diversity in Diffuse Large B-Cell Lymphoma: Impact on T Cell Exhaustion and Clinical Prognosis
2026, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.121954
PMID:41869451
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析了超过3000名弥漫性大B细胞淋巴瘤患者的免疫微环境，揭示了恶性B细胞和髓系细胞的多样性及其与临床预后的关联 | 利用单细胞测序技术大规模描绘DLBCL肿瘤微环境中的髓系细胞多样性，并发现巨噬细胞与CD8 T细胞间的相互作用可能导致T细胞耗竭，为免疫抑制微环境提供了新见解 | 研究主要基于单细胞和RNA表达微阵列数据的回顾性分析，缺乏实验验证和前瞻性临床研究 | 研究弥漫性大B细胞淋巴瘤肿瘤微环境中的免疫细胞多样性及其对临床预后的影响 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者肿瘤组织中的恶性B细胞和髓系细胞 | 数字病理学 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 单细胞测序，RNA表达微阵列 | NA | 单细胞数据，RNA表达数据 | 超过3000名DLBCL患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 85 | 2026-03-25 |
Resveratrol Alleviates Intervertebral Disc Degeneration by Targeting NCOA4-Mediated Ferritinophagy Through Dual Antioxidant and Anti-Inflammatory Effects
2026, Drug design, development and therapy
DOI:10.2147/DDDT.S575321
PMID:41873334
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和实验模型，揭示了NCOA4介导的铁蛋白自噬在椎间盘退变中的作用，并发现白藜芦醇通过靶向NCOA4发挥抗氧化和抗炎效应，从而缓解退变 | 首次将铁蛋白自噬确立为椎间盘退变的新病理机制，并发现白藜芦醇通过靶向NCOA4协调铁死亡与自噬的交互作用，提供了一种多靶点治疗策略 | 研究主要基于大鼠模型和细胞实验，临床转化仍需进一步验证；铁蛋白自噬的具体信号通路细节有待更深入阐明 | 探究铁蛋白自噬在椎间盘退变中的作用机制，并评估白藜芦醇的治疗潜力 | 椎间盘退变患者样本、大鼠模型以及髓核细胞 | 生物信息学与分子生物学 | 椎间盘退变 | 生物信息学分析、单细胞测序、转录组学、实验模型（大鼠和细胞） | NA | 临床转录组数据、单细胞测序数据、实验数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 86 | 2026-03-25 |
CellPhoneDB v5: inferring cell-cell communication from single-cell multiomics data
2025-12, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01137-1
PMID:40133495
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研究论文 | 本文介绍了CellPhoneDB v5，一个用于从单细胞多组学数据推断细胞间通信的生物信息学工具包 | 扩展了配体-受体相互作用库，新增约1000个非肽类配体介导的相互作用；引入了新的数据库查询方式，允许用户根据实验设计定制查询；整合了新的策略，利用空间转录组学或单细胞ATAC-seq数据优先考虑特定细胞间相互作用；新增了CellPhoneDBViz模块用于交互式可视化和结果共享 | 需要基本的Python知识，且协议执行时间约为15分钟，可能对非专业用户有一定门槛 | 开发并优化一个生物信息学工具包，以从单细胞多组学数据中推断细胞间通信 | 单细胞多组学数据，包括配体-受体相互作用、空间转录组学和单细胞ATAC-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞多组学分析、空间转录组学、单细胞ATAC-seq | NA | 单细胞多组学数据、空间转录组学数据、单细胞ATAC-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 87 | 2026-03-25 |
Epidermal Loss of PRMT5 Leads to the Emergence of an Atypical Basal Keratinocyte-Like Cell Population and Defective Epidermal Stratification
2025-Dec, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.04.008
PMID:40339790
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研究论文 | 本研究通过条件性敲除小鼠模型，探讨了PRMT5在表皮发育中的作用，揭示了其通过抑制Cdkn1a防止基底角质形成细胞衰老的机制 | 首次在体内模型中证明PRMT5通过表观遗传调控防止基底角质形成细胞衰老，并鉴定出一类非典型的基底角质形成细胞样细胞群 | 研究主要基于小鼠模型，人类皮肤疾病中的直接应用仍需进一步验证 | 探究PRMT5在表皮发育和分层过程中的功能及其在先天性皮肤疾病中的作用 | 条件性敲除Prmt5的小鼠表皮细胞 | 表观遗传学 | 先天性皮肤疾病 | 单细胞RNA测序，ATAC-seq | 条件性敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据，染色质可及性数据 | 条件性敲除小鼠表皮组织 | NA | 单细胞RNA-seq，ATAC-seq | NA | NA |
| 88 | 2026-03-25 |
Microplastic exposure elicits sex-specific atherosclerosis development in lean low-density lipoprotein receptor-deficient mice
2025-Dec, Environment international
IF:10.3Q1
DOI:10.1016/j.envint.2025.109938
PMID:41275764
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研究论文 | 本研究探讨了环境相关剂量微塑料暴露对低密度脂蛋白受体缺陷小鼠动脉粥样硬化发展的性别特异性影响 | 揭示了微塑料暴露在瘦小鼠中诱导性别特异性动脉粥样硬化发展的新现象，并通过单细胞RNA测序提供了机制性见解 | 研究仅使用小鼠模型，且暴露剂量和持续时间可能无法完全模拟人类长期低剂量暴露情况 | 评估微塑料暴露对心血管系统的影响，特别是动脉粥样硬化的发展 | 低密度脂蛋白受体缺陷小鼠（雄性和雌性）以及原代内皮细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 动物模型（小鼠） | 基因表达数据 | 低密度脂蛋白受体缺陷小鼠群体（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 89 | 2026-03-25 |
Identification of intestinal enteroendocrine cell subtypes and their associated hormones in zebrafish
2025-Dec, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3003522
PMID:41411332
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和质谱分析，鉴定了斑马鱼肠道内分泌细胞的亚型及其相关激素，并揭示了其分化谱系 | 首次在斑马鱼中系统鉴定出六种肠道内分泌细胞亚型及其激素谱，发现神经发生素3（neurog3）在斑马鱼中的作用与哺乳动物不同，并揭示了ghrelin+细胞作为特定亚型前体的新功能 | 研究主要基于斑马鱼模型，结果向哺乳动物外推需谨慎；部分激素编码基因（23个中的4个）未检测到相应成熟肽 | 阐明斑马鱼肠道内分泌细胞亚型的分化机制及其激素产生 | 斑马鱼肠道内分泌细胞及其前体细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序，质谱分析 | NA | 单细胞转录组数据，质谱数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 90 | 2026-03-25 |
Gene regulatory network determinants of rapid recall in human memory CD4+ T cells
2025-Nov-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.06.646912
PMID:41394561
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研究论文 | 本研究利用单核多组学测序技术，探索了人类记忆CD4+ T细胞中快速回忆反应的基因调控网络机制 | 首次结合单核多组学测序（snRNA-seq和snATAC-seq）与ChIP-seq验证，识别了记忆相关转录因子（如MAF、PRDM1、RUNX2、SMAD3、KLF6）在调控快速回忆反应中的核心作用，并将这些机制与免疫介导疾病的遗传风险关联 | 研究主要聚焦于CD4+ T细胞亚群，可能未涵盖其他免疫细胞类型；单核测序技术可能无法完全反映细胞在体状态 | 揭示记忆CD4+ T细胞快速回忆反应的基因调控网络机制，并探索其与免疫疾病遗传风险的关联 | 人类记忆CD4+ T细胞及其亚群 | 单细胞组学 | 免疫介导疾病 | 单核多组学测序（snRNA-seq和snATAC-seq）、ChIP-seq、GWAS | 基因调控网络重建 | 单细胞RNA-seq数据、单细胞ATAC-seq数据、ChIP-seq数据、GWAS数据 | 未明确指定样本数量，但涉及人类CD4+ T细胞亚群 | NA | 单核RNA-seq, 单核ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 91 | 2026-03-25 |
Single-Cell RNA Sequencing Uncovers Neutrophil Clusters Associated with Autoimmune Neuroinflammation
2025-Nov-19, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8012709/v1
PMID:41333423
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了与自身免疫性神经炎症相关的嗜中性粒细胞簇，并识别了Saa3/SAA1作为潜在的生物标志物和治疗靶点 | 利用单细胞RNA测序技术首次在EAE模型中系统性地揭示了嗜中性粒细胞在自身免疫性神经炎症中的异质性，并发现了与疾病严重程度相关的特定嗜中性粒细胞簇（Neu2和Neu4），同时将小鼠Saa3与人类SAA1关联起来，提出了新的生物标志物和治疗靶点 | 研究主要基于小鼠EAE模型，人类样本仅涉及血浆SAA1水平分析，未在人类MS患者中直接验证嗜中性粒细胞簇的异质性；单细胞测序数据可能受样本处理和测序深度影响 | 探究嗜中性粒细胞在自身免疫性神经炎症（特别是多发性硬化症）中的具体作用和异质性，并识别潜在的生物标志物和治疗靶点 | 小鼠实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）模型中的嗜中性粒细胞，以及多发性硬化症（MS）患者的血浆样本 | 单细胞组学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定具体样本数量，但涉及小鼠EAE模型和MS患者血浆 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 92 | 2026-03-25 |
Transcriptomic profiling of individual bacteria by MATQ-seq
2025-11, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01157-5
PMID:40204970
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研究论文 | 本文介绍了一种基于MATQ-seq的细菌单细胞转录组学协议，用于高效分析单个细菌的基因表达谱 | 该方法整合了索引分选、随机引物和rRNA去除，实现了高达95%的细胞保留率，显著优于现有协议 | NA | 开发一种适用于细菌单细胞转录组学的高效、可靠方法，以研究细菌群体内的细胞间变异 | 单个细菌，如鼠伤寒沙门氏菌等模型生物 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基于MATQ-seq的细菌scRNA-seq协议，包括荧光激活细胞分选和机器人液体处理 |
| 93 | 2026-03-25 |
Long-read RNA sequencing of transposable elements from single cells using CELLO-seq
2025-11, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01203-2
PMID:40670609
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CELLO-seq的单细胞长读长RNA测序协议，用于将转座元件（TE）表达数据精确映射到独特的基因组位点 | 通过整合长50核苷酸独特分子标识符和高PCR重复数，实现了对长读长的错误校正，从而能够高保真地映射到序列高度相似的年轻TE以及基因和TE亚型 | 协议需要用户具备分子生物学和转录组分析经验，且从细胞分离到定量完成需一周时间 | 开发一种单细胞长读长RNA测序方法，以解决短读长测序在转座元件表达分析中的模糊映射问题 | 哺乳动物细胞中的转座元件（TE） | 单细胞测序技术 | NA | 长读长RNA测序，单细胞测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 94 | 2026-03-25 |
Single-Cell Multi-Omics Identifies Specialized Cytotoxic and Migratory CD8+ Effector T Cells in Acute Myocarditis
2025-Oct-07, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学技术，在急性心肌炎患者中鉴定出一种具有高细胞毒性和迁移潜能的特化CD57+CD8+效应T细胞，并揭示了其上游炎症信号通路，为治疗提供了潜在靶点 | 首次在急性心肌炎中，通过整合单细胞RNA测序、单细胞T细胞受体测序、飞行时间质谱流式细胞术和Olink蛋白质组学等多组学方法，系统描绘了免疫图谱，并鉴定出CD57+CD8+效应T细胞这一关键的致病性免疫亚群及其功能特征 | 样本量相对有限（40名患者），且研究结果主要基于观察性数据和动物模型，其临床转化疗效仍需进一步验证 | 阐明急性心肌炎，尤其是暴发性心肌炎的免疫致病机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 急性心肌炎患者（40名，包括24名轻症和16名暴发性病例）的外周血单个核细胞和血浆，以及柯萨奇病毒B3诱导的暴发性心肌炎小鼠模型 | 单细胞多组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序, 飞行时间质谱流式细胞术, Olink蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据, 蛋白质组数据, 流式细胞术数据 | 40名急性心肌炎患者（24名轻症，16名暴发性） | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR-seq, 质谱流式细胞术, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 95 | 2026-03-25 |
IFN-I-Mediated Transcriptional Reprogramming Drives Myeloid-skewed Hematopoiesis in Sickle Cell Anemia
2025-Oct-07, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7766748/v1
PMID:41282081
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验，揭示了镰状细胞贫血中I型干扰素信号驱动的造血干细胞向髓系分化的转录重编程机制 | 首次发现镰状细胞贫血中造血干细胞存在I型干扰素介导的转录重编程，导致髓系偏向性造血，并揭示了G-CSF受体上调的新机制 | 研究主要基于体外实验和测序数据，体内功能验证和临床转化应用仍需进一步探索 | 阐明镰状细胞贫血中病理性髓系造血和慢性炎症的内在机制 | 镰状细胞贫血患者的造血干细胞和多能祖细胞 | 单细胞组学 | 镰状细胞贫血 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 96 | 2026-03-25 |
Biomarkers of immune dysregulation and posttreatment inflammation in spinal muscular atrophy
2025-Sep-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2506976122
PMID:40986347
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研究论文 | 本研究整合bulk RNA测序和单细胞RNA测序，揭示了脊髓性肌萎缩症（SMA）中的免疫失调特征及其与基因治疗反应的关系 | 首次整合bulk和单细胞RNA测序全面描绘SMA的免疫失调特征，识别出疾病进展的转录组生物标志物，并发现基因治疗后NF-κB相关炎症基因表达显著升高 | 样本量较小（SMA婴儿n=7用于bulk RNA-seq，n=4用于scRNA-seq），且研究对象年龄范围有限（<25个月） | 阐明脊髓性肌萎缩症（SMA）中的免疫失调特征及其对疾病进展和治疗反应的影响 | SMA婴儿（n=7用于bulk RNA-seq；n=4用于scRNA-seq）和年龄匹配的健康对照（n=4用于bulk RNA-seq；n=6用于scRNA-seq）的外周血样本 | 生物信息学 | 脊髓性肌萎缩症 | bulk RNA测序，单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | SMA婴儿：bulk RNA-seq n=7，scRNA-seq n=4；健康对照：bulk RNA-seq n=4，scRNA-seq n=6 | NA | bulk RNA-seq，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 97 | 2026-03-25 |
Human single-cell atlas analysis reveals heterogeneous endothelial signaling
2025-Sep-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.15.670370
PMID:40894541
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研究论文 | 本研究通过整合15个人体组织的超过300万个单细胞RNA测序数据，系统分析了内皮细胞在组织与血管类型中的异质性，并开发了计算流程探究微环境调控机制 | 首次在血管类型与组织微环境双重背景下系统研究内皮细胞异质性，开发了基于主题建模的细胞间通讯模式分析方法，揭示了代谢物与蛋白质介导的异质性调控机制 | 研究基于已发表的单细胞数据集，可能受原始实验设计差异影响；未通过功能实验验证所有计算预测的调控机制 | 系统探究人体内皮细胞在不同组织与血管类型中的异质性及其微环境调控机制 | 人体15种组织中的内皮细胞及其他组织驻留细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 主题建模 | 单细胞转录组数据 | 超过300万个单细胞（来自15个人体组织） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 98 | 2026-03-25 |
RNA Sequencing at Single Vesicle Resolution via 3D Printed Embedded Droplet Arrays
2025-Sep-24, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.5c09959
PMID:40938793
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研究论文 | 本研究开发了一种基于3D打印嵌入式液滴阵列的平台，用于实现单囊泡分辨率的RNA测序 | 利用3D打印技术创建可控、均匀的皮升级液滴阵列，首次实现了单个细胞外囊泡（EV）的RNA测序，解决了EV RNA异质性研究的难题 | 目前主要针对poly(A) RNA进行测序，可能无法全面捕获EV中的所有RNA类型；平台仍需后续体外生化反应步骤来生成测序文库 | 开发单囊泡RNA测序技术以解析细胞外囊泡RNA载物的异质性 | 单个细胞外囊泡（EVs），特别是CD9、CD63、CD81阳性的EVs以及THP-1细胞来源的100 nm免疫纯化EVs | 单细胞测序技术 | NA | RNA测序，PCR，cDNA合成 | NA | RNA测序数据 | 从THP-1 EVs中识别出3689个具有至少两个poly(A) RNA读长的独特条形码 | NA | 单囊泡RNA测序 | 3D打印嵌入式液滴阵列平台 | 利用碳氢化合物支撑材料与打印水溶液之间的界面不稳定性，生成可控、均匀的皮升级液滴，并在有机凝胶支撑介质中进行PCR和poly(A) RNA兼容cDNA合成等反应 |
| 99 | 2026-03-25 |
Size-Modulated Mesoderm-Endoderm Divergence and Myocardial Cavitation in Micropatterned Cardioids
2025-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.17.676874
PMID:41000917
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研究论文 | 本研究利用微图案化心脏类器官、CRISPR工程报告hiPSCs、深层组织成像和单细胞RNA测序，探索中胚层-内胚层协同发育，揭示了模式大小对细胞组成、类器官腔化、收缩功能和信号串扰的影响 | 整合微图案化心脏类器官与单细胞RNA测序技术，首次系统研究中胚层-内胚层协同发育，并发现模式尺寸调控心脏腔化形成 | 研究基于体外类器官模型，可能无法完全模拟体内胚胎发育的复杂性 | 探索中胚层-内胚层在心脏发育中的协同作用及信号机制 | 人类诱导多能干细胞衍生的心脏类器官 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, CRISPR基因编辑, 深层组织成像 | NA | 单细胞转录组数据, 成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 100 | 2026-03-25 |
DAESC+: High-performance, integrated software for single-cell allele-specific expression data
2025-Sep-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.03.674100
PMID:40964337
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研究论文 | 本文介绍了DAESC+，一个用于单细胞等位基因特异性表达数据处理和分析的高性能集成软件包 | DAESC+结合了用户友好的预处理模块DAESC-P和基于GPU加速的可扩展分析模块DAESC-GPU，在准确性和速度上均优于现有方法 | 未明确提及具体局限性，但可能依赖于特定硬件（GPU）和数据类型 | 开发用于单细胞等位基因特异性表达分析的计算工具，以增强基因调控机制的研究 | 单细胞等位基因特异性表达数据，特别是来自OneK1K队列的CD4+ T细胞和B细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 超过一百万细胞（可扩展），具体应用涉及OneK1K队列的子集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |