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当前共找到 36976 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-03-02 |
Single-Cell Sequencing of Human Neural Organoids in a Model of Intracerebral Hemorrhage Reveals Temporally Dynamic Responses to Blood
2025-Nov, Stroke
IF:7.8Q1
DOI:10.1161/STROKEAHA.125.051788
PMID:40905149
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研究论文 | 本研究利用人类神经类器官模型，通过单细胞RNA测序分析了脑出血后血液暴露对不同脑细胞类型的时序动态影响 | 首次在可扩展的人类神经类器官模型中，通过单细胞测序揭示了血液暴露引起的细胞特异性转录组变化及其时间动态性，并识别了潜在的治疗靶点 | 研究基于体外类器官模型，可能无法完全模拟体内脑出血的复杂微环境；样本量相对有限（18个类器官） | 探究脑出血后血液诱导的继发性神经损伤对不同脑细胞类型的影响，以优化手术清除时机 | 人类神经类器官，包含兴奋性神经元、抑制性神经元、神经祖细胞、星形胶质细胞、内皮细胞和小胶质细胞 | 单细胞测序 | 脑出血 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 18个类器官，共96,725个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 82 | 2026-03-02 |
Disrupted developmental signaling induces novel transcriptional states
2025-Oct-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2418351122
PMID:41118206
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研究论文 | 本研究提出了一种名为DAISEE的新算法，用于在复杂实验设计下分析单细胞数据中的信号扰动响应，并应用于斑马鱼胚胎的psMEK激活ERK信号通路研究 | 开发了DAISEE算法，能更有效地从单细胞数据中分离扰动响应与混杂变异，并首次在斑马鱼胚胎中应用psMEK技术揭示ERK信号过激活诱导新型转录状态 | 研究主要基于斑马鱼胚胎模型，结果可能不直接适用于其他生物系统；算法性能依赖于实验设计，可能受数据质量影响 | 开发新算法以分析单细胞数据中的信号扰动响应，并探索发育信号通路异常对胚胎细胞状态的影响 | 斑马鱼胚胎的单细胞转录组数据，特别是表达优化光开关MEK（psMEK）的5小时龄胚胎 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解框架 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 83 | 2026-03-02 |
Single-Cell Analysis of Fibroblast Subpopulations in Skin and Oral Mucosa
2025-Oct-22, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251380210
PMID:41123093
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综述 | 本文综述了皮肤和口腔黏膜中成纤维细胞亚群的最新研究，重点关注其转录组特征在稳态和疾病条件下的差异及其功能意义 | 通过单细胞RNA测序技术，首次在皮肤和口腔黏膜这两种屏障组织中系统比较了成纤维细胞的亚群多样性，并关联了功能机制研究 | 作为综述文章，未提供原始实验数据，且主要基于现有文献，可能受限于已发表研究的覆盖范围和深度 | 探讨成纤维细胞在组织再生和免疫调节中的组织特异性作用，以支持精准治疗的发展 | 皮肤和口腔黏膜中的成纤维细胞亚群 | 数字病理学 | 慢性炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 84 | 2026-03-02 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Depletion and Dysregulation of Mycobacterium tuberculosis-Specific Th1 and Th17 Cells Early After Acquisition of Human Immunodeficiency Virus
2025-Oct-15, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiaf354
PMID:40605619
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学揭示了HIV感染早期对结核分枝杆菌特异性Th1和Th17细胞的耗竭与功能失调 | 首次在HIV感染前后对结核分枝杆菌特异性CD4 T细胞进行纵向单细胞RNA测序分析，揭示了早期耗竭模式及转录调控通路的改变 | 样本量有限，且为观察性研究，无法确定因果关系 | 探究HIV感染如何影响结核分枝杆菌特异性CD4 T细胞的频率与功能 | HIV感染者和未感染者的结核分枝杆菌特异性CD4 T细胞 | 单细胞组学 | 结核病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | HIV感染前后个体的结核分枝杆菌特异性CD4 T细胞亚群 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 85 | 2026-03-02 |
Molecular and spatial analysis of ganglion cells on retinal flatmounts identifies perivascular neurons resilient to glaucoma
2025-Oct-15, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2025.07.025
PMID:40840447
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研究论文 | 本研究通过结合成像空间转录组学和免疫染色技术，分析了小鼠视网膜神经节细胞在二维视网膜表面的空间分布及其与微环境的关系，并探讨了青光眼模型中细胞存活与血管周围微环境的关联 | 首次在视网膜平铺片上结合MERFISH和免疫染色技术，全面绘制了视网膜神经节细胞的空间分布图谱，并揭示了血管周围微环境在神经退行性疾病中的保护作用 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证；实验青光眼模型可能无法完全模拟人类疾病的复杂性 | 探究视网膜神经节细胞的空间分布特征及其在青光眼等神经退行性疾病中的差异脆弱性 | 小鼠视网膜神经节细胞 | 数字病理学 | 青光眼 | 成像空间转录组学（MERFISH）、免疫染色 | NA | 图像、转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 86 | 2026-03-02 |
Profibrotic monocyte-derived alveolar macrophages as a biomarker and therapeutic target in systemic sclerosis-associated interstitial lung disease
2025-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.07.669006
PMID:40832362
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研究论文 | 本文探讨了系统性硬化症相关间质性肺病中促纤维化单核来源肺泡巨噬细胞作为生物标志物和治疗靶点的作用 | 首次在SSc-ILD患者中通过流式细胞术和单细胞RNA测序分析BAL液中的MoAM和间质巨噬细胞，并发现其丰度与肺纤维化严重程度相关 | 样本量较小（仅9名SSc-ILD患者和13名健康对照），且为前瞻性研究，需更大规模验证 | 评估MoAM在SSc-ILD中的生物标志物潜力和治疗靶点价值 | SSc-ILD患者和健康对照的BAL液样本及肺移植组织 | 数字病理学 | 间质性肺病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 细胞计数数据, 转录组数据, 空间转录组数据 | 9名SSc-ILD患者和13名健康对照的BAL液样本，以及SSc-ILD肺移植组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 87 | 2026-03-02 |
Data-driven fine-grained region discovery in the mouse brain with transformers
2025-Oct-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64259-4
PMID:41057352
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研究论文 | 本文介绍了一种基于Transformer的自监督工作流程CellTransformer，用于在小鼠脑部空间转录组数据中发现细粒度区域 | 提出了一种可扩展至数百万细胞数据集的自我监督空间域检测工作流程，使用编码器-解码器架构CellTransformer分层学习组织特征，并耦合GPU加速聚类算法 | NA | 解决器官尺度空间转录组数据分析中的关键瓶颈，实现细粒度组织域检测 | 小鼠脑部 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | Transformer, 编码器-解码器架构 | 空间转录组数据 | 四只小鼠，超过200个组织切片，九百万个细胞 | NA | 空间转录组学 | MERFISH, Slide-seqV2 | 多百万细胞MERFISH数据集，全脑Slide-seqV2数据集 |
| 88 | 2026-03-02 |
Deconvoluting single-cell transcriptomics reveals cellular programs regulated by cell-cell communication in colorectal cancer
2025-Sep-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.09.648030
PMID:40321215
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荟萃分析 | 本研究通过整合八个单细胞队列数据，开发了一种新颖的分析框架，以揭示结直肠癌中细胞间通讯网络及其调控的细胞程序 | 采用分层主题建模识别反映单细胞信号状态的基因表达模块，并结合因果发现方法系统揭示可能受配体-受体信号和跨细胞类型通讯调控的模块，通过空间转录组学验证了这些模块在空间域中的共定位 | NA | 深入理解结直肠癌中细胞间通讯网络的复杂性及其在肿瘤微环境中的作用 | 结直肠癌患者样本中的单细胞转录组数据 | 单细胞转录组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 分层主题建模，因果发现方法 | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 153名患者，279个样本 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 89 | 2026-03-02 |
Epac1 deletion attenuates Müller glial pathological activation and mitigates retinal neurodegeneration in ischemia-induced retinopathy
2025-Sep-19, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.09.031
PMID:40976555
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研究论文 | 本研究探讨了Epac1在缺血性视网膜病变中的作用，发现其缺失可减轻Müller胶质细胞的病理激活并缓解视网膜神经变性 | 揭示了Epac1通过调节Müller细胞中的VEGF信号通路促进视网膜神经变性的新作用机制 | 研究基于小鼠OIR模型，其发现向人类疾病的转化仍需进一步验证 | 探究Epac1在缺血性视网膜病变中的作用及其分子机制 | 小鼠氧诱导视网膜病变(OIR)模型中的视网膜组织及Müller胶质细胞 | 数字病理学 | 视网膜病变 | 单细胞RNA测序, qPCR, Western blot, 免疫染色, TUNEL检测 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 图像数据, 分子生物学数据 | 未明确说明具体样本数量，使用小鼠OIR模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 90 | 2026-03-02 |
Single-cell transcriptome and surfaceome profiling of the adult human retinal pigment epithelium
2025-Sep-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102611
PMID:40882639
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和表面蛋白组分析，探索了成人视网膜色素上皮细胞的亚群多样性及其在视网膜生物学中的意义 | 首次利用CITE-seq技术结合单细胞转录组和表面蛋白标记，识别了成人视网膜色素上皮细胞的独特亚群，并揭示了其空间分布和功能差异 | 研究主要基于成人样本，可能未涵盖发育或疾病状态下的变化；培养细胞的比较虽显示亚群保存，但长期培养效应未完全评估 | 探索成人视网膜色素上皮细胞的亚群多样性及其生物学功能，为基于RPE的细胞疗法优化提供依据 | 成人视网膜色素上皮细胞 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | CITE-seq（转录组和表位测序） | NA | 单细胞转录组和表面蛋白数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 91 | 2026-03-02 |
Interferon Epsilon Loss Is Elusive 9p21 Link to Immune-Cold Tumors, Resistant to Immune Checkpoint Therapy, and Endogenous CXCL9/10 Induction
2025-Sep, Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer
IF:21.0Q1
DOI:10.1016/j.jtho.2024.12.020
PMID:39725169
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研究论文 | 本研究揭示了9号染色体短臂（9p）缺失通过干扰素ε（IFNϵ）信号通路导致免疫冷肿瘤及免疫检查点疗法（ICT）耐药性的机制 | 首次将9p缺失与IFNϵ信号联系起来，并证明IFNϵ是调控CXCL9/10表达和免疫细胞浸润的关键因子 | IFNϵ在肿瘤免疫微环境中的作用具有显著的组织特异性，且部分肿瘤类型中相关性较弱 | 探究9p缺失导致免疫冷肿瘤和ICT耐药的分子机制 | 人类肿瘤样本、细胞系及小鼠模型，涵盖头颈鳞癌、非鳞非小细胞肺癌、黑色素瘤等多种癌症类型 | 肿瘤免疫学 | 多种癌症（头颈鳞癌、非鳞非小细胞肺癌、黑色素瘤等） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、拷贝数变异分析、介导分析 | 小鼠基因工程模型（ΔS与ΔL缺失模型） | 基因组数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 13项研究报告、36个ICT队列数据，涵盖多种肿瘤类型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 92 | 2026-03-02 |
Roadmap for spatial transcriptomics of HIV in tissues
2025-Sep-01, Current opinion in HIV and AIDS
IF:4.5Q1
DOI:10.1097/COH.0000000000000961
PMID:40626838
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综述 | 本文概述了空间转录组学平台及其在HIV组织持久性研究中的应用，包括工作流程和质量控制 | 提出了空间转录组学在HIV组织研究中的路线图，强调高分辨率（<1 μm）和全基因组覆盖（约20,000基因）的创新应用 | 目标捕获中目标数量增加常降低灵敏度，且分析需确保严谨性以避免报告无生物学意义的特征 | 探索HIV在组织中的持久性机制，并为治疗策略提供信息 | HIV感染细胞、周围微环境及组织样本 | 空间转录组学 | HIV感染 | 空间转录组学、ATAC-seq、蛋白质捕获、T细胞受体测序 | NA | RNA分子、空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、单细胞多组学 | NA | NA |
| 93 | 2026-03-02 |
Nerve-associated macrophages control adipose homeostasis across lifespan and restrain age-related inflammation
2025-Sep, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-025-00952-9
PMID:40897908
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和流式细胞术，揭示了神经相关巨噬细胞在脂肪组织稳态和年龄相关炎症中的关键作用 | 首次定义了神经相关巨噬细胞作为脂肪组织巨噬细胞的一个特殊亚群，并发现其随年龄减少会加剧炎症和脂解功能障碍 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性尚需进一步验证 | 探究脂肪组织巨噬细胞在年龄相关炎症中的作用机制 | 小鼠脂肪组织中的巨噬细胞亚群 | 单细胞生物学 | 年龄相关炎症 | 单细胞测序，多参数流式细胞术，血管内标记 | NA | 单细胞RNA测序数据，流式细胞术数据 | 小鼠脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 94 | 2026-03-02 |
Cholinergic neuronal activity promotes diffuse midline glioma growth through muscarinic signaling
2025-Aug-21, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.05.031
PMID:40541184
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研究论文 | 本研究揭示了中脑胆碱能神经元活动通过毒蕈碱信号通路促进弥漫性中线胶质瘤生长的机制 | 首次发现中脑胆碱能长程投射通过M1/M3受体依赖的方式促进弥漫性中线胶质瘤的活性依赖性生长，并揭示了其与健康少突胶质前体细胞增殖的平行效应 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床样本验证相对有限；胆碱能神经元亚型特异性作用机制有待进一步阐明 | 探究胆碱能神经元活动对弥漫性中线胶质瘤生长的影响及其分子机制 | 弥漫性中线胶质瘤细胞、少突胶质前体细胞、中脑胆碱能神经元 | 神经肿瘤学 | 弥漫性中线胶质瘤 | 光遗传学刺激、单细胞RNA测序、药理学阻断、遗传学阻断、共培养实验 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据、细胞增殖数据、神经活动数据 | 未明确样本数量，使用DMG荷瘤小鼠模型和原代DMG样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 95 | 2026-03-02 |
Dynamic GLUT trafficking at high glucose levels enhances insulin secretion: Dysregulation leads to decreased insulin secretion during type 2 diabetes
2025-Aug-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2425955122
PMID:40811462
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研究论文 | 本研究揭示了葡萄糖转运蛋白（GLUT）在高葡萄糖浓度下的动态转运机制及其在胰岛素分泌中的作用，并发现2型糖尿病中该过程的失调 | 首次阐明了GLUT在β细胞质膜上的招募与网格蛋白介导的内存作用之间的动态耦合关系，并揭示了其在2型糖尿病胰岛素分泌缺陷中的作用 | 研究主要基于体外细胞模型和人类胰岛组织，体内生理环境下的验证尚需进一步研究 | 探究葡萄糖刺激下GLUT转运的动态调控机制及其在2型糖尿病胰岛素分泌障碍中的作用 | 胰腺β细胞、人类胰岛组织（来自非糖尿病和2型糖尿病供体） | 细胞生物学与糖尿病研究 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序、分子生物学技术 | NA | 基因表达数据、细胞成像数据 | 人类胰岛组织（非糖尿病与2型糖尿病供体） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 96 | 2026-03-02 |
Decoding Cellular Stress States for Toxicology Using Single-Cell Transcriptomics
2025-Aug-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.10.657506
PMID:40766395
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术解码细胞应激状态，应用于毒理学领域 | 应用TempO-LINC平台生成单细胞转录组图谱，通过文献衍生的应激反应通路基因特征对单个细胞进行评分，并采用广义Jaccard度量进行聚类，揭示了细胞应激状态的动态变化和异质性响应 | 研究仅针对HepaRG细胞系和七种化合物在24小时暴露下的响应，可能无法完全代表其他细胞类型或更长时间尺度的应激反应 | 解码细胞应激状态以应用于毒理学研究 | 约40,000个暴露于七种不同化合物（依托泊苷、布雷菲德菌素A、环己酰亚胺、鱼藤酮、tBHQ、曲格列酮和衣霉素）的HepaRG细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约40,000个HepaRG细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | TempO-LINC | TempO-LINC平台用于生成单细胞转录组图谱 |
| 97 | 2026-03-02 |
Persistent type I interferon signaling within the brain of people with HIV on ART with cognitive impairment
2025-Aug, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013411
PMID:40833988
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研究论文 | 本研究通过分析HIV感染者大脑蛋白质谱和单细胞RNA测序，揭示了I型干扰素信号在神经胶质和内皮细胞中的持续激活，这可能与神经炎症和认知障碍相关 | 首次结合蛋白质组学和单细胞RNA测序技术，在HIV感染者大脑中系统性地识别了I型干扰素信号的持续激活，并发现其可由内源性逆转录病毒触发，即使在有效抗逆转录病毒治疗下仍持续存在 | 样本量相对较小（27个HIV感染者大脑和9个对照），且主要基于快速尸检组织，可能限制了结果的普遍性 | 探究HIV感染者神经炎症的分子机制，特别是I型干扰素信号在认知障碍中的作用 | HIV感染者的大脑组织、迷你脑类器官模型以及对照样本 | 数字病理学 | HIV相关神经认知障碍 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、蛋白质谱分析 | NA | 蛋白质数据、单细胞RNA测序数据 | 27个HIV感染者大脑和9个对照大脑 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 98 | 2026-03-02 |
From preneoplastic lesion to heterogenous tumor: recent insights into hepatoblastoma biology and therapeutic opportunities
2025-Jul-19, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02405-8
PMID:40684183
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综述 | 本文综述了肝母细胞瘤生物学的最新发现，包括肿瘤异质性、肿瘤微环境及治疗机会 | 整合单细胞RNA-seq、多组学、空间转录组学和功能基因组学筛查，揭示了肝母细胞瘤的细胞亚群、WNT信号通路、发育途径及肿瘤免疫微环境的复杂性 | NA | 综述肝母细胞瘤生物学进展，以推动治疗策略 | 肝母细胞瘤细胞、肿瘤相关细胞类型及遗传依赖性 | 数字病理学 | 肝母细胞瘤 | 单细胞RNA-seq, 多组学, 空间转录组学, 功能基因组学筛查 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 99 | 2026-03-02 |
Cell type-specific master metabolic regulators of Alzheimer's disease
2025-Jul-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.11.664443
PMID:40791427
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研究论文 | 本研究开发了一种名为scFUMES的算法，用于识别阿尔茨海默病中细胞类型特异性的主要代谢调控因子，并揭示了神经元和小胶质细胞在疾病中的代谢异质性 | 开发了scFUMES算法，首次整合单细胞RNA测序、相互作用组学、基因组学、转录组学和代谢组学数据，系统性地绘制了AD中细胞类型特异性的主要代谢调控因子网络 | 研究主要基于人类脑库的组学数据，实验验证部分有限，且算法在更广泛疾病类型中的应用效果尚待检验 | 揭示阿尔茨海默病中细胞类型特异性的代谢异质性及其调控机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 人类大脑组织（来自脑库），重点关注神经元和小胶质细胞 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序，相互作用组学，基因组学，转录组学，代谢组学 | scFUMES算法（整合多组学数据的计算模型） | 多组学数据（包括RNA-seq、基因组、转录组、代谢组数据） | 来自两个AD易感区域（颞中回和背外侧前额叶皮层）的人类脑组织样本，具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 100 | 2026-03-02 |
Role of Dual Specificity Phosphatase 1 (DUSP1) in influencing inflammatory pathways in macrophages modulated by Borrelia burgdorferi lipoproteins
2025-Jul-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.20.624562
PMID:39605372
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研究论文 | 本研究探讨了双特异性磷酸酶1（DUSP1）在伯氏疏螺旋体脂蛋白调控的巨噬细胞炎症通路中的作用 | 应用单细胞RNA测序和多组学方法，首次揭示了DUSP1在调节NLRP3炎症信号和线粒体变化中的双重作用，并提出了其作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠骨髓来源巨噬细胞模型，在人体或体内环境中的适用性尚需验证 | 阐明DUSP1在莱姆病病原体脂蛋白诱导的宿主免疫反应中的调控机制 | 小鼠骨髓来源巨噬细胞（BMDMs） | NA | 莱姆病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq），无偏蛋白质组学分析 | NA | RNA测序数据，蛋白质组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |