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当前共找到 41240 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 81 | 2026-07-05 |
Integrative single-cell and spatial multi-Omics analyses identify NETs-driven colon cancer subtypes with distinct metabolic features and prognostic implications
2026-May-09, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08227-6
PMID:42106773
|
研究论文 | 通过整合单细胞和空间多组学分析，识别NETs驱动的结肠癌亚型及其代谢特征和预后意义 | 首次通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析，揭示了NETs驱动的结肠癌亚型在免疫组成、代谢重编程和基因表达上的差异，并构建四基因预后模型 | 四基因预后模型的预测精度在当前阶段有限，需要进一步验证 | 探究NETs在结肠癌中的作用及其对肿瘤进展、免疫逃逸和代谢重编程的影响，并构建预后模型 | 结肠癌患者肿瘤样本中的NETs相关基因和细胞 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 多变量Cox回归, LASSO回归 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 来自TCGA和GEO的多个队列数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'端测序, 10x Visium空间转录组 |
| 82 | 2026-07-05 |
High-dimensional Spatial Immune Profiling Highlights Microglia-Like Cells in Human Dorsal Root Ganglia
2026-05, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.70211
PMID:42153599
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研究论文 | 利用高维空间免疫图谱技术，在人体背根神经节中鉴定出小胶质细胞样细胞 | 首次在人体背根神经节中通过高维成像质谱流式技术，在亚细胞分辨率下描绘了髓系细胞的蛋白表达图谱，并识别出具有小胶质细胞标志物（如P2RY12、TMEM119、SLC2A5）的细胞亚群，揭示了其与神经元胞体的空间邻近关系 | 研究仅基于人体组织样本，可能无法完全反映疾病状态下的动态变化；此外，未对鉴定的小胶质细胞样细胞进行功能验证 | 深入解析人体背根神经节中髓系细胞的空间分布和蛋白表达特征，探索神经免疫微环境在慢性疼痛和外周神经病变中的作用 | 人体背根神经节中的髓系细胞（特别是Iba1阳性细胞）和神经元细胞 | 数字病理学 | 慢性疼痛 | 成像质谱流式技术（IMC） | FlowSOM（无监督聚类模型） | 图像 | 未在摘要中明确提及样本量 | NA | NA | NA | NA |
| 83 | 2026-07-05 |
Accurate profiling of single-cell alternative transcript start sites by correcting RNA degradation
2026-Apr-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72298-8
PMID:42045202
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研究论文 | 开发scATS工具，通过校正RNA降解，实现单细胞层面精确的替代转录起始位点分析，并揭示其在造血和肺癌中的作用 | 提出scATS方法，首次在亚型和样本水平估计RNA降解并校正其对TSS定量的影响，同时结合机器学习管道LRS识别与肺癌相关的TSS，实验验证了特定TSS亚型对癌细胞增殖和迁移的促进作用 | 未说明 | 解决RNA降解导致的读段覆盖不均匀问题，提高单细胞RNA-seq数据中转录起始位点定量的准确性，并揭示TSS在基因调控中的功能 | 造血过程中的细胞和肺癌细胞系（包括CCR6、CCR2和RTKN2等基因的TSS亚型） | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、机器学习 | 机器学习管道（LRS） | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量，涉及造血过程和肺癌细胞系 | NA | 单细胞RNA测序（5' scRNA-seq） | NA | NA |
| 84 | 2026-07-05 |
Targeting ANXA1/TRKA axis enhances immunotherapy sensitivity in neural invasion-positive gastric cancer
2026-Apr-09, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-026-00444-1
PMID:41954859
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示神经浸润阳性胃癌中ANXA1/TRKA轴导致CD8⁺T细胞耗竭并降低免疫治疗敏感性 | 首次阐明神经浸润阳性胃癌中ANXA1/TRKA轴通过阻断NEDD4L介导的TRKA泛素化降解，促进糖酵解代谢和CD8⁺T细胞耗竭，并提出A11肽联合TRKA抑制剂逆转T细胞耗竭的新策略 | 未明确提及，可能需进一步在更大样本或临床环境中验证其普遍性和治疗有效性 | 阐明神经浸润阳性胃癌的免疫微环境特征及分子机制，以增强免疫治疗敏感性 | 神经浸润阳性胃癌和阴性胃癌患者的肿瘤标本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、多重免疫组化 | NA | 基因表达数据 | 未明确提及，基于临床肿瘤标本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 85 | 2026-07-05 |
TMEM184A promotes progression and drug resistance in colorectal cancer: a bioinformatics and clinical study
2026-Apr-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-46674-9
PMID:41932993
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research paper | 整合单细胞转录组学、空间转录组学、分子对接和多队列公共数据库，系统阐明结直肠癌中上皮细胞驱动的耐药机制，并通过临床病理石蜡样本评估关键蛋白TMEM184A的临床意义和预后价值 | 首次结合单细胞测序与空间转录组学揭示TMEM184A在结直肠癌上皮细胞耐药亚群中的驱动作用，并通过分子对接验证其与拉帕替尼等EGFR酪氨酸激酶抑制剂的强结合能力 | 样本仅限于病理石蜡切片，未在独立大样本队列中验证；功能性实验数据不足，缺乏体内外模型直接证明TMEM184A调控脂质代谢引发耐药的具体机制 | 阐明结直肠癌中耐药相关的分子机制并鉴定关键蛋白TMEM184A作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 结直肠癌肿瘤及癌旁组织样本 | digital pathology | colorectal cancer | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics, molecular docking, tissue microarray, immunohistochemistry | machine learning (unspecified) | single-cell RNA-seq data, spatial transcriptomics data, bulk gene expression data, drug sensitivity data, tissue microarray images | 多队列公共数据库样本及临床石蜡病理切片（具体数量未在摘要中说明） | 10x Genomics | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | 10x Chromium, 10x Visium | NA |
| 86 | 2026-07-05 |
Exploring Parkinson's through the Lens of Genomics and Bioinformatics
2026-04-02, Cold Spring Harbor perspectives in medicine
IF:7.8Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a041621
PMID:39929729
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综述 | 探讨基因组学与生物信息学技术在帕金森病研究中的应用及其对分子机制理解的影响 | 综述了从1997年发现首个帕金森病相关风险基因至今，新技术如何革命性改变对遗传和分子机制的研究，特别是单细胞转录组学在揭示细胞类型特异性失调中的作用 | 未提及具体局限性 | 讨论神经基因组学和生物信息学如何应用于解析帕金森病这一复杂疾病的本质，以识别治疗干预的新靶点 | 帕金森病的遗传和分子机制 | 机器学习 | 帕金森病 | 基因分型、基因组测序、转录组学、单细胞转录组学 | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 87 | 2026-07-05 |
Spatial Transcriptomics Reveals Injured Cells, Signature Genes, and Communication Patterns in the Cyst Microenvironment of Polycystic Kidney Disease
2026-Apr-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000894
PMID:41071604
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研究论文 | 利用空间转录组学揭示多囊肾病囊肿微环境中的损伤细胞、特征基因和通信模式 | 首次通过空间转录组学分析多囊肾病囊肿微环境的局部基因表达和细胞通信，鉴定出囊肿相关基因特征和关键配体-受体相互作用 | 未提及 | 研究多囊肾病囊肿微环境中的空间基因表达模式和细胞通信 | 野生型和Pkd1缺陷小鼠肾脏 | 数字病理学 | 多囊肾病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 使用野生型和Pkd1缺陷小鼠肾脏 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Genomics Visium Spatial Gene Expression |
| 88 | 2026-07-05 |
Hmx2 and Dmrt2 Coordinate the Differentiation of Intercalated Cell Subtypes in Kidney
2026-Apr-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000885
PMID:41051882
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研究论文 | 本研究揭示了Hmx2和Dmrt2转录因子在肾集合管闰细胞亚型分化中的协同调控作用 | 首次发现Hmx2和Dmrt2以互斥方式分别调控B型和A型闰细胞分化，并揭示Hmx3在双缺失条件下的补偿机制 | 基于小鼠模型和单细胞RNA测序分析，但人类肾脏中的验证仍需进一步研究 | 阐明转录因子Dmrt2和Hmx2在肾闰细胞亚型分化中的作用机制 | 小鼠肾脏闰细胞及人肾脏单细胞RNA测序数据集 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 条件性基因敲除与敲入、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 基因敲除与敲入小鼠模型，以及公开的人和小鼠肾脏单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 89 | 2026-07-05 |
Generation of spatially patterned human neural tube-like structures using microfluidic gradient devices
2026-04, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01266-1
PMID:41062703
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研究论文 | 本文利用微流控梯度装置生成了具有空间模式的人类神经管样结构 | 首次利用微流控梯度装置实现人类多能干细胞在精确控制化学梯度下的管状或球状菌落形成，产生具有空间组织模式的神经管样结构和前脑样结构 | 协议耗时较长（约8-41天），且需要聚二甲基硅氧烷软光刻和细胞培养经验 | 模拟人类神经管形成和区域模式化 | 人类多能干细胞 | 数字病理学 | NA | 微流控技术 | NA | 图像 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 90 | 2026-07-05 |
Prussian blue analogue-mineralized ginseng-derived vesicles promote PPARγ nuclear translocation to suppress tumor vasculogenic mimicry and reverse the immunosuppressive microenvironment
2026-Mar-18, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04263-y
PMID:41851872
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研究论文 | 开发了一种仿生纳米平台GDVs@CuPBA-iRGD，通过铜基普鲁士蓝类似物在人参源囊泡上原位矿化，并偶联肿瘤穿透肽iRGD，用于抑制肿瘤血管生成拟态并逆转免疫抑制微环境 | 首次将人参源囊泡与铜基普鲁士蓝类似物结合，通过PPARγ核转位机制抑制血管生成拟态，并利用单细胞RNA测序揭示其激活抗肿瘤免疫的后续效应 | 研究主要基于肝细胞癌模型，对其他肿瘤类型的适用性有待验证；纳米平台的长期毒性和临床转化潜力需进一步评估 | 开发一种抑制肿瘤血管生成拟态并逆转免疫抑制微环境的创新治疗策略 | 肝细胞癌（HCC）细胞和小鼠模型 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠肝细胞癌模型样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞3'试剂盒 |
| 91 | 2026-07-05 |
M[Formula: see text]DGAT: Multi-view multi-scale dynamic graph attention network(GAT) based prediction of Parkinson's disease(PD) progression using whole-blood RNA sequencing data
2026-Mar-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-40636-x
PMID:41771960
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研究论文 | 提出了多视图多尺度动态图注意力网络（M³DGAT），利用全血RNA测序数据预测帕金森病进展 | 首次融合多视图（时间、空间）与多尺度信息，并采用计数草图双线性融合策略整合时空视图，在动态图表示中编码疾病进展动态信息 | 论文未提及具体局限性 | 预测神经退行性疾病（如帕金森病）的进展轨迹，包括疾病阶段和认知评分 | 帕金森病患者全血RNA测序数据 | 机器学习 | 帕金森病 | RNA测序 | 动态图注意力网络（DGAT） | 基因表达数据 | 来自PPMI和PDBP队列的人体血液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 92 | 2026-07-05 |
Inhibition of 5αR2 promotes postoperative wound repair in BPH patients after TURP by alleviating fibrosis and inflammation
2026-03-01, Asian journal of andrology
IF:3.0Q1
DOI:10.4103/aja202561
PMID:41147439
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研究论文 | 探究5αR2抑制剂对良性前列腺增生患者经尿道前列腺切除术后伤口愈合的影响，发现其通过减轻纤维化和炎症促进恢复 | 首次通过随机临床试验结合动物模型和类器官实验，系统揭示5αR2抑制剂通过抑制纤维化和炎症加速BPH术后伤口修复的分子机制 | 未提及长期随访数据及潜在副作用评估，样本量较小（87例患者和12只比格犬） | 评估5αR2抑制剂对BPH患者TURP术后伤口愈合、炎症控制和纤维化减少的效果 | 良性前列腺增生患者、比格犬、膀胱类器官 | 数字病理学 | 前列腺疾病 | 单细胞RNA测序,酶联免疫吸附试验,组织学分析 | NA | 基因表达数据,组织图像,蛋白质数据 | 87例BPH患者（治疗组47例，对照组42例），12只比格犬 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 93 | 2026-07-05 |
TCRγ constant usage tunes human γδ T cell antigen sensitivity, thymic programming, and peripheral function
2026-02-13, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adr7167
PMID:41686911
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研究论文 | 揭示人类γδ T细胞中TCRγ恒定区使用调节抗原敏感性、胸腺编程和外周功能 | 首次发现人类γδ T细胞受体中γ恒定区可独立于可变区抗原识别调节激活强度，且Cγ1和Cγ2的使用对应不同表型和功能 | 基于单细胞RNA测序数据，未涉及功能验证实验，样本量可能有限 | 探究γδ T细胞受体中γ恒定区使用对T细胞功能的影响 | 人类γδ T细胞 | 免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类胸腺和外周组织样本，具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 94 | 2026-07-05 |
RCC1 Domain-Containing Protein 1 Promotes Colon Cancer Malignant Progression by Activating Autophagy-Dependent WNT5A Secretion in Cancer-Associated Fibroblasts
2026-Feb, Journal of the Royal Society of New Zealand
IF:2.1Q2
DOI:10.1002/snz2.70013
PMID:41798776
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研究论文 | RCC1结构域包含蛋白1通过激活癌症相关成纤维细胞中自噬依赖的WNT5A分泌促进结肠癌恶性进展 | 揭示了RCCD1通过AMPK/mTOR/ULK1信号通路激活癌症相关成纤维细胞自噬，进而驱动WNT5A分泌，促进肿瘤细胞恶性转化的新机制 | 未提及具体局限性 | 探索自噬在结肠癌肿瘤-基质相互作用中的作用机制 | 结肠癌细胞及癌症相关成纤维细胞 | 机器学习 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | TCGA-COAD和GSE161277数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 95 | 2026-07-05 |
Integrated multi-omics and machine learning identify an interaction between SLC39A11 and phosphoinositide metabolism in deep vein thrombosis
2026-01-22, BMC medical informatics and decision making
IF:3.3Q2
DOI:10.1186/s12911-026-03342-2
PMID:41566314
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研究论文 | 通过整合多组学和机器学习方法，识别深静脉血栓中SLC39A11与磷脂酰肌醇代谢之间的相互作用 | 首次通过多组学（代谢组学和转录组学）与机器学习结合，鉴定SLC39A11和磷脂酰肌醇在深静脉血栓中的关键作用，并利用单细胞RNA测序将SLC39A11定位到M1样巨噬细胞 | 样本量较小（代谢组学62例，转录组学17例，验证集18例，单细胞RNA测序6例），可能影响结果的泛化性；未提及因果关系验证 | 探索深静脉血栓的多组学特征及其调控机制 | 深静脉血栓患者和健康对照者的外周血样本 | 机器学习 | 深静脉血栓 | 非靶向代谢组学, 转录组学, 单细胞RNA测序, 电感耦合等离子体质谱 | 双向正交偏最小二乘法, 机器学习算法 | 代谢组学数据, 转录组学数据, 单细胞RNA测序数据 | 代谢组学62例, 转录组学17例, 验证集18例, 单细胞RNA测序6例 | 未提供 | 非靶向代谢组学, 转录组学, 单细胞RNA测序 | 未提供 | 未提供 |
| 96 | 2026-07-05 |
YAP-Induced Glycolysis Drives Fibroinflammation and Disrupts Fibroblast Fidelity
2025-Dec-05, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326480
PMID:41165345
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研究论文 | 本研究揭示了YAP诱导的糖酵解驱动纤维炎症并破坏成纤维细胞谱系保真度的机制 | 首次发现右心房成纤维细胞比其他心脏腔室具有更高的糖酵解活性和YAP活性，并揭示YAP通过诱导糖酵解驱动纤维化，同时破坏成纤维细胞谱系保真度使其转化为表达SOX9的骨软骨祖细胞状态 | NA | 探究Hippo/YAP通路如何调控心脏成纤维细胞的代谢微环境及其在纤维炎症中的作用 | 心脏成纤维细胞及其在不同心脏腔室的代谢和转录组差异 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞核RNA测序, 单细胞核ATAC测序, 空间转录组学, 同位素标记葡萄糖摄取实验 | NA | 转录组数据, 表观组数据, 空间转录组数据 | 人类和小鼠心脏样本 | 10x Genomics | 单细胞核RNA测序, 单细胞核ATAC测序, 空间转录组学 | 10x Chromium | 10x Chromium平台进行单细胞核RNA测序和单细胞核ATAC测序 |
| 97 | 2026-07-05 |
PFKFB3 Promotes Myofibroblast Differentiation and Cardiac Fibrosis Through its Intra- and Extra- Cellular Roles
2025-10, Journal of cardiovascular translational research
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12265-025-10688-x
PMID:41166052
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研究论文 | 本研究揭示了PFKFB3通过细胞内糖酵解调控和细胞外信号双重作用促进心脏纤维化的机制 | 首次发现PFKFB3通过细胞内糖酵解调控和细胞外信号双重驱动心脏纤维化，并揭示其作为治疗靶点的转化潜力 | NA | 阐明PFKFB3在心脏纤维化发病机制中的角色及其潜在治疗价值 | 小鼠模型（异丙肾上腺素和冠状动脉结扎诱导）和心肌病患者 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、Western blot、ELISA | NA | 转录组数据、蛋白质表达数据 | 小鼠模型（异丙肾上腺素和冠状动脉结扎诱导）以及心肌病患者血浆样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统用于分析心肌病中激活的心脏肌成纤维细胞 |
| 98 | 2026-07-05 |
Single-cell dissection of the genotype-immunophenotype relationship in glioblastoma
2025-Sep-03, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awaf129
PMID:40215269
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究胶质母细胞瘤的基因型与免疫表型关系 | 利用基因工程小鼠模型在单细胞水平系统性地描绘了三种胶质母细胞瘤亚型（EGFRvIII、PDGFB和NF1驱动）的基因型-免疫表型关系 | 未明确提及局限性，但可能包括小鼠模型与人类肿瘤的差异以及样本量限制 | 揭示胶质母细胞瘤中驱动突变对肿瘤微环境免疫表型的影响，为人鼠整合分析平台提供基础 | 基因工程小鼠胶质母细胞瘤模型（EGFRvIII、PDGFB和NF1驱动突变） | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多种基因工程小鼠模型，具体样本数未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 99 | 2026-07-05 |
LncRNA MIR181A1HG Deficiency Attenuates Vascular Inflammation and Atherosclerosis
2025-Apr-11, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325196
PMID:40047069
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研究论文 | 本研究探讨长链非编码RNA MIR181A1HG在血管炎症和动脉粥样硬化中的调控作用 | 首次发现MIR181A1HG通过隔离Foxp1远离目标基因启动子，激活NLRP3炎症小体，驱动血管内皮炎症和动脉粥样硬化，独立于miR-181a1/b1簇功能 | 未进一步研究其他潜在分子机制或临床人群样本验证 | 研究MIR181A1HG在调控血管炎症和动脉粥样硬化中的作用和分子机制 | 人类和小鼠动脉粥样硬化病变中的内皮细胞及免疫细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、荧光素酶报告基因检测、染色质免疫沉淀 | NA | 基因表达数据 | 人类和小鼠主动脉样本，MIR181A1HG敲除和过表达小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 100 | 2026-07-05 |
Protocol for directly selecting cell type marker genes for single-cell clustering analyses by Festem
2025-Mar-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103514
PMID:39700012
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研究论文 | 提出Festem协议，直接从单细胞RNA测序数据中选择细胞类型标记基因，以优化下游聚类分析 | 利用期望最大化检验（Festem）直接选择细胞类型标记基因，无需预先聚类即可识别关键基因，提高单细胞数据分析的效率和可解释性 | 未提及具体局限，但依赖单细胞RNA测序数据质量和参数设置可能影响结果 | 开发一种直接选择细胞类型标记基因的方法，以简化单细胞聚类分析流程 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型标记基因 | 机器学习 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 基因表达数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |