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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
81 2026-02-24
Blinatumomab-driven T-cell activation in αβ and γδ T-cell subsets: insights from in vitro assays
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文通过体外实验研究了Blinatumomab在αβ和γδ T细胞亚群中驱动的T细胞活化机制 首次系统比较了Blinatumomab在传统αβ T细胞和非常规γδ T细胞中的效应功能差异,并探索了γδ T细胞作为联合治疗策略的潜力 研究基于健康供者体外培养的T细胞,未在患者来源模型或临床研究中验证,且单细胞转录组学仅分析了一个供者样本 阐明Blinatumomab治疗B细胞前体急性淋巴细胞白血病时,不同T细胞亚群的免疫应答机制 健康成人供者的αβ和γδ T细胞,以及CD19+ BCP-ALL细胞系(NALM-6, HAL-01) 免疫学 B细胞前体急性淋巴细胞白血病 多参数流式细胞术,靶向单细胞转录组学 NA 细胞功能数据,流式细胞术数据,单细胞转录组数据 健康成人供者T细胞,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
82 2026-02-24
Diversity and function of tumor-associated macrophages in brain metastases: mechanisms and therapeutic prospects
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了脑转移瘤中肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的多样性、功能、调控机制及其作为治疗靶点的前景 超越了传统的M1/M2二分法,基于单细胞研究揭示了TAMs的功能亚群谱系(如脂质相关、干扰素响应、促血管生成型),并系统阐述了其在脑转移从预转移生态位形成到肿瘤定植全过程中的作用机制 TAMs的高度异质性、靶向治疗缺乏特异性以及血脑屏障递送障碍仍是当前面临的挑战 探讨脑转移瘤中肿瘤相关巨噬细胞的多样性、功能及其作为治疗靶点的机制与前景 脑转移瘤中的肿瘤相关巨噬细胞(TAMs) 肿瘤免疫学 脑转移瘤(以乳腺癌和肺癌脑转移为例) 单细胞测序、空间转录组学 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
83 2026-02-24
ECM remodeling-associated immune signatures and hub proteins: predictive markers and therapeutic targets for metastatic gastric cancer
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过蛋白质组学和单细胞RNA测序技术,揭示了胃癌转移中细胞外基质重塑相关的免疫特征和核心蛋白,并验证了RPS29在胃癌细胞转移机制中的功能作用 结合蛋白质组学和单细胞RNA测序技术,系统识别了胃癌转移相关的核心蛋白和肿瘤细胞亚型,并首次验证了RPS29在胃癌转移中的调控机制 研究主要基于体外实验和生物信息学分析,缺乏体内动物模型的验证,且样本量可能有限 探索胃癌转移过程中细胞外基质重塑的分子机制,识别预测标志物和治疗靶点 胃癌细胞和细胞外基质蛋白 数字病理学 胃癌 蛋白质组学, 单细胞RNA测序 NA 蛋白质组数据, 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
84 2026-02-24
Multi-omics comprehensive analysis identified KIF22 and KRAS as highly synthetic lethal pairs for triple-negative breast cancer
2026, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过多组学分析识别出KIF22和KRAS作为三阴性乳腺癌的合成致死基因对 首次通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序等多组学数据,结合机器学习方法,系统性地鉴定出三阴性乳腺癌中具有高合成致死活性的新型细胞亚型,并实验验证了KIF22和KRAS作为合成致死基因对的功能 研究主要基于生物信息学分析和体外体内实验验证,临床转化潜力尚需进一步临床试验评估 探索三阴性乳腺癌的异质性,识别与疾病进展相关的合成致死基因对,为靶向治疗提供新策略 三阴性乳腺癌细胞及其微环境细胞亚群 生物信息学 三阴性乳腺癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 随机森林, 机器学习 RNA测序数据 未明确指定具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
85 2026-02-24
ESRP1 drives epithelial-mesenchymal transition by activating EPAC-RAP1A signaling axis
2026, Frontiers in medicine IF:3.1Q1
研究论文 本研究揭示了ESRP1通过激活EPAC-RAP1A信号轴驱动上皮-间质转化,从而促进特发性肺纤维化进展 首次在单细胞水平上识别ESRP1作为EMT的关键上游调控因子,并阐明其通过EPAC-RAP1A轴的新机制 研究主要基于小鼠模型和细胞系,人类样本验证不足,且未探讨其他潜在信号通路 探究特发性肺纤维化中上皮-间质转化的分子机制 小鼠肺组织、原代肺泡上皮细胞、MLE-12肺泡上皮细胞系 单细胞转录组学 特发性肺纤维化 单细胞RNA测序、qPCR、Western blot、免疫荧光、Co-IP NA 单细胞转录组数据、基因表达数据、蛋白质互作数据 未明确样本数量,包括BLM处理的小鼠模型和细胞培养实验 NA 单细胞RNA-seq NA NA
86 2026-02-24
Decoding Cellular Stress States for Toxicology Using Single-Cell Transcriptomics
2025-Aug-02, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用单细胞转录组学技术解码HepaRG细胞在多种化学物质暴露下的应激状态,揭示了细胞应激响应通路的异质性和动态变化 应用TempO-LINC平台生成大规模单细胞转录组数据,结合文献衍生的应激响应通路基因特征对单个细胞进行评分,并通过广义Jaccard度量进行聚类,系统可视化化学物质诱导的细胞亚群动态转变 研究仅针对HepaRG细胞系在24小时暴露下的反应,可能无法完全反映体内长期毒性或其它细胞类型的响应 解码细胞应激状态以应用于毒理学研究,揭示化学物质诱导的细胞适应性应激与终末转变之间的潜在过渡 HepaRG细胞系暴露于七种化学物质(依托泊苷、布雷菲德菌素A、环己酰亚胺、鱼藤酮、tBHQ、曲格列酮和衣霉素) 数字病理学 NA 单细胞转录组测序 NA 单细胞转录组数据 约40,000个HepaRG细胞 NA 单细胞RNA-seq TempO-LINC TempO-LINC平台用于生成单细胞转录组图谱
87 2026-02-24
Decoding muscle-resident Schwann cell dynamics during neuromuscular junction remodeling
2025-May-20, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了肌肉驻留雪旺细胞在神经肌肉接头重塑中的作用,并发现了调控该过程的关键分子通路 发现了神经肌肉接头重塑过程中一种新型的终末雪旺细胞亚型,并确定了SPP1信号通路作为调控雪旺细胞增殖和肌肉再神经支配的关键调节因子 研究主要基于小鼠模型,其在人类疾病中的直接适用性尚需进一步验证 阐明肌肉驻留雪旺细胞在神经肌肉接头重塑中的细胞动力学和分子机制 肌肉驻留雪旺细胞及其在稳定神经支配、部分去神经支配和完全去神经支配再神经支配模型中的亚型 单细胞组学 神经肌肉疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
88 2026-02-24
Interleukin-1β Drives Disease Progression in Arrhythmogenic Cardiomyopathy
2024-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单核RNA测序和空间转录组学分析,揭示了白细胞介素-1β在致心律失常性心肌病进展中的关键驱动作用 首次结合单核RNA测序与空间转录组学技术,在ACM患者心肌样本中识别出炎症-纤维化空间生态位,并证实靶向IL-1β治疗可改善疾病表型 研究样本量有限,且动物模型(Desmoglein-2突变小鼠)可能无法完全模拟人类ACM的复杂性 探究致心律失常性心肌病的疾病进展机制并评估靶向IL-1β的治疗潜力 ACM患者心肌样本、对照供体样本、纯合Desmoglein-2突变小鼠 数字病理学 心血管疾病 单核RNA测序, 空间转录组学 NA RNA测序数据, 空间转录组数据 ACM患者与对照供体的心肌样本(具体数量未明确),纯合Desmoglein-2突变小鼠 NA 单核RNA测序, 空间转录组学 NA NA
89 2026-02-24
Human vascularized macrophage-islet organoids to model immune-mediated pancreatic β cell pyroptosis upon viral infection
2024-Nov-07, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 本研究开发了一种人源血管化巨噬细胞-胰岛类器官模型,用于模拟病毒感染下免疫介导的胰腺β细胞焦亡 首次利用人源多能干细胞构建血管化巨噬细胞-胰岛类器官,结合GeoMx空间多组学平台和单细胞RNA测序技术,揭示了TNFSF12-TNFRSF12A信号通路在促炎巨噬细胞介导的β细胞焦亡中的作用 研究主要基于体外类器官模型,可能无法完全模拟体内复杂免疫微环境;样本来源和数量可能有限 研究病毒感染下免疫介导的胰腺β细胞损伤机制 人源多能干细胞衍生的血管化巨噬细胞-胰岛类器官、COVID-19胰腺尸检样本、暴露于SARS-CoV-2或CVB4病毒的人胰岛 数字病理学 糖尿病 单细胞RNA测序、空间多组学分析 类器官模型 空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 未明确具体样本数量,包括COVID-19胰腺尸检样本和病毒感染的人胰岛样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 GeoMx GeoMx空间多组学平台
90 2026-02-24
Single cell RNA-seq reveals cellular and transcriptional heterogeneity in the splenic CD11b+Ly6Chigh monocyte population expanded in sepsis-surviving mice
2024-Nov-06, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了脓毒症存活小鼠脾脏CD11b+Ly6Chigh单核细胞群体的细胞和转录异质性 首次在脓毒症存活小鼠模型中,利用单细胞RNA测序技术深入解析了脾脏CD11b+Ly6Chigh髓系细胞的转录异质性,并识别出具有免疫抑制能力的增殖性M-MDSCs亚群 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证;且仅关注了脾脏中的特定髓系细胞群体,可能未全面反映全身免疫状态 旨在理解脓毒症幸存者免疫失调的细胞和分子基础 C57BL/6J和BALB/c小鼠脾脏中的CD11b+Ly6Chigh髓系细胞 单细胞组学 脓毒症 单细胞RNA测序,流式细胞术,吞噬和糖酵解功能测定 NA 单细胞转录组数据,流式细胞数据 C57BL/6J和BALB/c小鼠的假手术和CLP手术组 NA 单细胞RNA-seq NA NA
91 2026-02-24
Review of multi-omics data resources and integrative analysis for human brain disorders
2021-07-17, Briefings in functional genomics IF:2.5Q3
综述 本文综述了人类脑部疾病的多组学数据资源及整合分析方法 及时更新了快速发展的多组学数据资源,并涵盖了单细胞组学和空间转录组学等新兴技术 NA 总结人类脑部健康与疾病的多组学数据资源及整合分析方法 人类大脑,包括健康对照和神经精神疾病患者 生物信息学 神经精神疾病 多组学数据整合分析 NA 多组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 NA NA
92 2026-02-23
Accurate classification of ependymomas and medulloblastomas using Raman spectroscopy and pilot transcriptomic profiling
2026-May-05, Spectrochimica acta. Part A, Molecular and biomolecular spectroscopy
研究论文 本研究利用拉曼光谱准确区分后颅窝室管膜瘤和髓母细胞瘤,并通过初步空间转录组分析提供生物学背景 首次将拉曼光谱与空间转录组分析结合,用于区分室管膜瘤和髓母细胞瘤,揭示了与脂质代谢和血管生成相关的生化差异 患者层面的性能需在更大队列中进一步验证,研究为回顾性设计且样本量有限 评估拉曼光谱在区分室管膜瘤和髓母细胞瘤中的准确性,并探索其作为无标记辅助诊断技术的潜力 后颅窝室管膜瘤和髓母细胞瘤的冷冻及FFPE组织样本 数字病理学 脑肿瘤 拉曼光谱,空间转录组学 PCA-SVM分类器 光谱数据,转录组数据 34个样本(21个冷冻,13个FFPE) 10x Genomics 空间转录组学 10x Genomics Xenium In Situ 10x Genomics Xenium In Situ v2 FFPE工作流程
93 2026-02-23
Monocyte-derived macrophages promote retinal damage after ischemic stroke via IL-1β-dependent mechanism
2026-May, Experimental neurology IF:4.6Q1
研究论文 本研究揭示了缺血性中风后单核细胞来源的巨噬细胞通过IL-1β依赖机制促进视网膜损伤 首次结合单细胞RNA测序、Cx3cr1Ccr2报告小鼠和CCL2中和抗体干预,明确了中风后浸润的单核细胞来源巨噬细胞在视网膜中的扩增和促炎表型,并通过IL-1β中和抗体及Nlrp3缺陷小鼠证实了其IL-1β依赖的损伤机制 研究基于小鼠MCAO模型,结果在人类中的直接适用性需进一步验证;未详细探讨其他炎症因子或细胞类型的潜在作用 探究缺血性中风后视网膜损伤的炎症机制,特别是单核细胞来源巨噬细胞的作用 小鼠(包括Cx3cr1Ccr2报告小鼠和Nlrp3缺陷小鼠)的视网膜组织及其中风后变化 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序, 视网膜bulk RNA测序, 免疫荧光染色, Luminex检测, 视网膜电图, TUNEL染色, 苏木精-伊红染色 NA RNA测序数据, 图像数据, 电生理数据 未明确样本数量,但涉及多种小鼠模型和实验方法 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
94 2026-02-23
Single-cell RNA-seq reveals cellular dynamics and emergency hematopoiesis in banana shrimp Penaeus merguiensis hemocytes upon Yellow Head Virus infection
2026-Apr, Fish & shellfish immunology IF:4.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了香蕉虾在黄头病毒感染下的血细胞动态变化和紧急造血反应 首次整合香蕉虾13种主要组织数据建立参考转录组,并利用单细胞RNA测序解析YHV感染下的血细胞景观变化,强调了单细胞分析在准确解读宿主-病原体相互作用中的必要性 研究主要关注血细胞,未涉及其他免疫组织或长期感染动态,且样本量相对有限 探究香蕉虾对黄头病毒感染的细胞免疫反应机制 香蕉虾(Penaeus merguiensis)的血细胞 单细胞组学 病毒感染 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA测序数据 未明确具体样本数量,但涉及正常和YHV感染条件下的血细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
95 2026-02-23
Clusterin Drives Fiber Endocytosis by Mesothelial Cells to Resolve Liver Fibrosis
2026-Mar, Gastroenterology IF:25.7Q1
研究论文 本研究揭示了簇集蛋白(CLU)通过其受体LRP2驱动间皮细胞增殖、迁移并内吞纤维,从而缓解肝纤维化的机制,并设计了一种模拟CLU的肽段CLUtide,展示了其治疗潜力 首次发现CLU通过LRP2受体激活间皮细胞的内吞作用来清除纤维,并设计出具有治疗潜力的模拟肽CLUtide 研究主要基于小鼠模型,人类临床应用的可行性和安全性仍需进一步验证 探究CLU在肝纤维化中的作用机制及其治疗潜力 肝纤维化患者和小鼠模型中的CLU、LRP2及间皮细胞 数字病理学 肝纤维化 单细胞RNA测序、免疫荧光、基因敲除小鼠模型 NA 基因表达数据、图像数据 患者和小鼠样本,具体数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
96 2026-02-23
Therapeutic reprogramming of circulating myeloid cells via signal regulatory protein α extracellular vesicles in acute kidney injury
2026-Mar, Kidney international IF:14.8Q1
研究论文 本文探讨了通过表达高亲和力信号调节蛋白α变体的细胞外囊泡靶向CD47,以治疗急性肾损伤 开发了表达高亲和力SIRPα变体的细胞外囊泡,用于系统性靶向循环髓系细胞中的CD47,提供了一种新型免疫调节策略 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限,且长期疗效和安全性未充分评估 研究靶向CD47的细胞外囊泡在急性肾损伤中的治疗潜力 人类急性肾损伤样本和小鼠模型(顺铂和双侧缺血/再灌注) 数字病理学 急性肾损伤 单细胞RNA测序,CD47蛋白染色 NA RNA测序数据,蛋白质染色图像 人类急性肾损伤标本和两种小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
97 2026-02-23
Mechanistic insights from transcript analysis of long-term pig to non-human primate kidney xenografts
2026-Mar, Kidney international IF:14.8Q1
研究论文 本文通过转录分析探讨了猪到非人灵长类动物肾脏异种移植物的长期机制,揭示了稳定移植物中转录升高、VEGFA损失与血栓性微血管病相关,以及异种移植物中供体内皮转录损失和受体内皮转录获得的新颖过程 研究发现异种移植物中供体内皮转录损失和受体内皮转录及蛋白的意外获得,这是一种在异种移植物中检测到的新过程,与同种异体移植中的抗体介导排斥反应形成对比 研究基于非人灵长类动物模型,可能不完全适用于人类临床环境,样本数量有限(58个样本),且依赖于转录分析,需要进一步功能验证 研究猪肾脏异种移植物在非人灵长类动物中的长期转录机制,以了解异种移植与同种异体移植的不同机制 eGenesis猪肾脏异种移植物在猕猴中的样本,包括供体、灌注后、协议和终末样本 数字病理学 肾脏疾病 转录分析、空间转录组学、抗体检测 NA 转录数据、空间转录组数据、蛋白质表达数据 58个样本来自猕猴中的猪肾脏异种移植物 NA 空间转录组学 NA NA
98 2026-02-23
Lactate metabolism-driven tumor heterogeneity and molecular signatures in intrahepatic cholangiocarcinoma
2026-Feb-21, World journal of gastroenterology IF:4.3Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量转录组数据,系统表征了肝内胆管癌中乳酸代谢驱动的异质性及其分子和功能意义 首次在单细胞水平系统表征了肝内胆管癌中乳酸代谢的异质性,并利用多种机器学习算法识别出12个与乳酸代谢相关的特征基因,其中CYC1被鉴定为主要驱动基因 研究主要基于转录组数据,功能验证仅限于细胞系实验,缺乏体内模型和临床样本的进一步验证 系统表征肝内胆管癌中乳酸代谢驱动的异质性及其分子和功能意义 肝内胆管癌恶性细胞 机器学习 肝内胆管癌 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, 定量PCR, 细胞功能实验 LASSO, 随机森林, 梯度提升机, 自适应最佳子集选择, 决策树 RNA测序数据, 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
99 2026-02-23
Pancancer Fine-Mapping of Mutational Intolerance Identifies CHEK1 as an Immunosuppressive Driver in Lung Adenocarcinoma
2026-Feb-21, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究开发了miDriver计算框架,通过泛癌-正常组织突变对比识别了1,020个突变不耐受基因,并揭示了CHEK1作为肺腺癌中免疫抑制驱动因子的作用机制 提出了基于泛癌-正常组织突变对比的计算框架miDriver,首次系统识别了1,020个突变不耐受基因,并发现CHEK1通过调控MIF表达驱动M2样巨噬细胞极化的新机制 研究基于13种癌症类型的8,096个肿瘤样本,可能未覆盖所有癌症类型;体内实验的临床转化潜力需进一步验证 识别癌症中突变不耐受基因的功能作用及其作为治疗靶点的潜力 13种癌症类型的8,096个肿瘤样本,重点关注肺腺癌中的CHEK1基因 计算生物学 肺腺癌 CRISPR筛选、单细胞转录组学、多重免疫荧光 计算框架miDriver 基因组突变数据、单细胞转录组数据、免疫荧光图像数据 8,096个肿瘤样本(涵盖13种癌症类型) NA 单细胞RNA-seq NA NA
100 2026-02-23
Intratumoral Parvimonas micra promotes esophageal squamous cell carcinoma via p-cresol-induced Treg differentiation
2026-Feb-20, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究通过宏基因组测序和单细胞RNA测序,揭示了食管鳞状细胞癌(ESCC)肿瘤内微生物群中Parvimonas micra的富集及其通过代谢产物p-甲酚促进调节性T细胞分化,从而驱动肿瘤生长的机制 首次在ESCC中系统揭示了肿瘤内微生物Parvimonas micra通过代谢产物p-甲酚调控肿瘤免疫微环境(诱导Treg分化)的具体分子机制,建立了微生物-代谢物-免疫抑制-肿瘤生长的完整因果链条 样本量相对有限(119对肿瘤-正常组织),且机制研究主要基于细胞和动物实验,在人体内的直接验证尚需进一步研究 探究食管鳞状细胞癌(ESCC)肿瘤内微生物群的组成、功能及其与肿瘤免疫微环境的相互作用机制 食管鳞状细胞癌(ESCC)患者的肿瘤组织及配对正常组织 肿瘤微生物组学 食管鳞状细胞癌 宏基因组测序, 单细胞RNA测序 NA 基因组序列数据, 单细胞转录组数据 119对肿瘤-正常组织用于宏基因组测序;45个样本用于单细胞RNA测序 NA 宏基因组测序, 单细胞RNA-seq NA NA
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