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当前共找到 44127 篇文献,本页显示第 81 - 100 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
81 2026-10-07
Weighted sliced inverse regression for scalable supervised dimensionality reduction of spatial transcriptomics data
2026-Sep-03, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文提出了一种加权切片逆回归(wSIR)方法,用于空间转录组数据的可扩展监督降维,保留空间坐标的预测能力 wSIR是一种充分降维技术,旨在保留空间坐标的预测能力,具有高度可扩展性(在标准笔记本电脑上两分钟内处理超过100,000个细胞),特征载荷可解释,且新的非空间数据可投影到wSIR的低维空间进行下游分析 摘要中未明确提及研究的局限性 开发一种可扩展的监督降维方法,用于空间转录组数据的空间感知分析,保留具有生物学意义的空间变异 空间转录组数据集,包括人类乳腺癌和小鼠早期胚胎发育数据 空间转录组学 乳腺癌 空间转录组学 加权切片逆回归(wSIR) 空间转录组数据 超过100,000个细胞 NA 空间转录组学 NA NA
82 2026-10-07
Microenvironment-aware transcriptome reconstruction in spatial transcriptomics
2026-Sep-03, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文提出了一种名为Emerge的微环境感知框架,通过整合转录身份与局部微环境信息,从靶向空间转录组数据中重建转录组规模的表达谱 首次揭示了局部微环境组织与超越细胞身份的转录变异相关,并提供了转录组重建的互补约束条件;提出了微环境感知框架Emerge,将转录组重建从基因补全扩展到细胞状态的上下文感知恢复 摘要中未明确提及研究的局限性 从靶向基因面板的空间转录组数据中重建转录组规模的表达,以捕获细胞类型内依赖上下文的变化 MERFISH和Xenium空间转录组数据集,涵盖神经和肿瘤生态系统 空间转录组学 肿瘤 基于成像的空间转录组学(MERFISH、Xenium) NA 图像、文本 多个MERFISH和Xenium数据集,涵盖神经和肿瘤生态系统 Vizgen, 10x Genomics 空间转录组学 MERFISH, Xenium NA
83 2026-10-07
Tumor-intrinsic IFNγ signaling and niche adaptation drive early colonization in ovarian cancer metastasis
2026-Sep-03, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 该研究开发了MetTag单细胞条形码和转录组分析方法,解析卵巢癌腹膜转移中早期定植克隆的时间动态和干扰素-γ信号的作用 开发了MetTag时间戳条形码技术,揭示了先到先得的转移原则,发现肿瘤内在IFNγ信号和腹膜巨噬细胞协同保护播散肿瘤细胞免于失巢凋亡 摘要未明确提及研究局限性 阐明卵巢癌转移过程中播散肿瘤细胞在腹膜生态位存活和定植的机制 卵巢癌腹膜转移中的播散肿瘤细胞和 pioneer 克隆 单细胞组学 卵巢癌 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9筛选 NA 单细胞转录组数据, 条形码序列数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
84 2026-10-07
Spatial transcriptomics reveals laminar and cell-type-specific A-to-I RNA editing signatures in the macaque cortex
2026-Sep-03, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 该研究开发了SRDRE分析框架,用于在空间转录组数据中鉴定RNA编辑位点,并揭示了猕猴大脑皮层中A-to-I RNA编辑的层状和细胞类型特异性空间特征 开发了SRDRE空间转录组RNA编辑位点分析框架;首次在猕猴大脑皮层142个空间注释区域中系统绘制A-to-I RNA编辑图谱;发现神经元RNA编辑水平与视觉和体感系统的皮层层级相关;发现灵长类富集的离子通道基因编辑位点;初步发现抑郁样行为猕猴前额叶皮层深层RNA编辑改变 抑郁样行为相关的RNA编辑改变仅为初步探索性分析,需要进一步研究验证;研究局限于猕猴模型,向人类推广需谨慎 探索大脑皮层中A-to-I RNA编辑的空间特征,揭示RNA编辑在皮层特化、大脑演化和神经精神疾病中的潜在作用 成年猕猴大脑皮层,涵盖142个空间注释皮层区域,超过4000万个细胞 空间转录组学 神经精神疾病 空间转录组学 NA 空间转录组数据 超过4000万个细胞,来自142个空间注释的皮层区域 NA 空间转录组学 NA NA
85 2026-10-07
Spatial analysis of head and neck cancer identifies two ecosystems with distinct modes of epithelial-to-mesenchymal transition
2026-Sep, Nature genetics IF:31.7Q1
研究论文 通过空间转录组学分析26例头颈部鳞状细胞癌样本,揭示了HPV阳性和阴性肿瘤中两种不同的上皮-间质转化空间模式及其微环境相互作用机制 首次通过空间转录组学在HNSCC中鉴定出两种截然不同的p-EMT空间架构:p-EMT边缘型(通过TGFβ与成纤维细胞偶联)和p-EMT核心型(通过抑瘤素M由免疫抑制性巨噬细胞和中性粒细胞诱导),且同一肿瘤内多种p-EMT模式一致存在 样本量相对较小(n=26),未明确说明是否包含多时间点或治疗前后样本,缺乏功能验证实验 绘制HPV阳性和HPV阴性头颈部鳞状细胞癌的肿瘤空间架构,阐明p-EMT的不同空间模式及其微环境驱动机制 HPV阳性和HPV阴性头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)肿瘤组织 空间转录组学 头颈部鳞状细胞癌 空间转录组学 NA 空间转录组数据、图像 26例头颈部鳞状细胞癌样本 NA 空间转录组学 NA NA
86 2026-10-07
Evolution of complex organelles in ocelloid-bearing dinoflagellates
2026-Sep, PNAS nexus IF:2.2Q1
研究论文 该研究通过对12个新物种进行单细胞转录组测序,探究了具有眼点和刺丝囊的复杂细胞器在warnowiid甲藻中的演化 首次对来自两个未采样属的12个新物种进行单细胞转录组测序,扩展了warnowiid甲藻的基因组数据,并基于刺丝囊的有无将其分为两个主要亚支,揭示了眼点功能的谱系差异 样本量仍然有限,仅涵盖部分已知谱系,可能无法完全代表warnowiid甲藻的多样性 探究warnowiid甲藻中眼点复合体和刺丝囊等复杂细胞器的功能、演化及其在不同谱系间的差异 warnowiid甲藻(包括12个新物种,来自两个未采样属,采集自亚北极和热带环境) 机器学习 NA 单细胞转录组测序 NA 文本 12个新物种(此前研究涉及18个细胞、5个属) NA 单细胞RNA-seq NA NA
87 2026-10-07
ACSL1 orchestrates ferroptosis and degranulation in low-density neutrophils: a novel pathogenic mechanism and therapeutic target in systemic lupus erythematosus
2026-Sep, Molecular and cellular biochemistry IF:3.5Q3
研究论文 通过整合生物信息学分析和临床样本验证,发现ACSL1是系统性红斑狼疮中低密度中性粒细胞铁死亡和脱颗粒的关键调控因子,并鉴定出非诺贝特等潜在靶向药物 首次揭示ACSL1作为低密度中性粒细胞中铁死亡和脱颗粒的双重调控因子,将线粒体功能障碍与SLE免疫异常激活联系起来,并通过分子对接发现FDA已批准药物非诺贝特等小分子化合物可靶向ACSL1 ACSL1在塑造致病性低密度中性粒细胞炎症表型中的作用仅基于单细胞RNA测序轨迹分析推测,仍需进一步实验验证;分子对接结果为预测性结合,缺乏实验验证 阐明中性粒细胞铁死亡、脱颗粒与干扰素放大之间的分子机制,寻找系统性红斑狼疮的精准治疗靶点 系统性红斑狼疮患者来源的中性粒细胞,特别是低密度中性粒细胞亚群 机器学习, 数字病理学 系统性红斑狼疮 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 分子对接 NA 文本, 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
88 2026-10-07
UCHL1-mediated deubiquitination of PARK7 suppresses ferroptosis and enhances tumor progression in triple-negative breast cancer
2026-Sep, Molecular and cellular biochemistry IF:3.5Q3
研究论文 该研究揭示了UCHL1通过去泛素化稳定PARK7蛋白,抑制铁死亡,从而促进三阴性乳腺癌进展的分子机制 首次发现UCHL1通过去泛素化调控PARK7蛋白稳定性,进而抑制铁死亡并促进三阴性乳腺癌进展,提出UCHL1-PARK7轴作为潜在治疗靶点 摘要中未明确说明研究的局限性 探究UCHL1是否通过调控铁死亡影响三阴性乳腺癌的进展,并阐明其分子机制 三阴性乳腺癌组织、细胞系及裸鼠移植瘤模型 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序,免疫共沉淀,蛋白质印迹,免疫荧光共定位 NA 图像,文本 使用了公共数据库GSE176078乳腺癌单细胞RNA测序数据集及TCGA数据,具体样本数量未在摘要中说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
89 2026-10-07
YBX1-mediated m5C modification of exosomal LGALS3 derived from M2 tumor-associated macrophages drives colorectal cancer cell malignant behaviors
2026-Sep, Molecular and cellular biochemistry IF:3.5Q3
研究论文 本文揭示了M2型肿瘤相关巨噬细胞来源的外泌体LGALS3通过YBX1介导的m5C修饰促进结直肠癌细胞恶性行为及脂质代谢的机制 首次发现YBX1通过识别LGALS3 mRNA的m5C修饰维持其稳定性,进而调控M2型肿瘤相关巨噬细胞外泌体LGALS3对结直肠癌细胞的促进作用 未提及 探究外泌体LGALS3对结直肠癌进展的影响及其分子机制 结直肠癌细胞、M2型肿瘤相关巨噬细胞、外泌体 机器学习 结直肠癌 scRNA-Seq、RT-qPCR、western blot、m5C RIP、RIP、双荧光素酶报告基因检测 NA 图像、文本 NA NA 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq NA NA
90 2026-10-07
Endothelial ATF4 attenuates hypertensive vascular damage via preserving mitochondrial redox homeostasis
2026-Sep, Molecular and cellular biochemistry IF:3.5Q3
研究论文 该研究发现内皮细胞中ATF4通过转录激活IDH2维持线粒体氧化还原稳态,从而减轻高血压性血管损伤 首次揭示内皮ATF4-IDH2轴是高血压血管损伤中的新型保护通路,通过转录重编程线粒体抗氧化防御发挥保护作用 研究主要基于小鼠模型和HUVECs体外实验,尚需进一步验证在人类高血压患者中的临床转化价值 探究ATF4在高血压状态下维持内皮线粒体氧化还原稳态中的作用及其分子机制 小鼠主动脉内皮细胞、人脐静脉内皮细胞(HUVECs)、Ang II输注高血压小鼠模型 机器学习, 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序, ChIP-qPCR, 荧光素酶报告基因检测, siRNA敲低, 腺病毒过表达, AAV递送 NA 图像, 文本 公共小鼠主动脉scRNA-seq数据集及高血压小鼠主动脉和HUVECs样本(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
91 2026-10-07
α2,6-Sialoglycan-regulated antitumor immunity of tumor-infiltrating CD8+ T cells
2026-Sep-01, Nature chemical biology IF:12.9Q1
研究论文 该研究开发了一种单细胞关联分析策略,同时检测α2,3-和α2,6-连接的唾液酸聚糖与转录组,揭示肿瘤浸润免疫细胞中唾液酸化的功能作用 首次实现单细胞水平上α2,3-和α2,6-连接唾液酸聚糖与转录组的关联分析,发现α2,6-唾液酸聚糖下调是肿瘤内高亲和力肿瘤特异性抗原反应性CD8 T细胞的细胞表面标志物 研究主要基于小鼠肿瘤模型,尚未在人类肿瘤中验证;单细胞唾液酸聚糖检测技术的通量和灵敏度可能有限 探究肿瘤浸润免疫细胞中唾液酸化的功能作用及其与基因表达的关系 小鼠肿瘤浸润免疫细胞,特别是肿瘤浸润CD8+ T细胞 机器学习 肺癌 单细胞RNA测序 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
92 2026-10-07
Tumor-derived KLK5 activates TMEM158+ cancer-associated fibroblasts to induce CD8+ T cell exhaustion and confer immunotherapy resistance in lung cancer
2026-Aug-25, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1
研究论文 该研究通过整合单细胞和空间转录组学,揭示了肿瘤来源的KLK5通过激活TMEM158⁺癌症相关成纤维细胞诱导CD8⁺ T细胞耗竭并导致肺鳞癌免疫治疗耐药的机制 首次鉴定出TMEM158⁺ CAF亚群在肺鳞癌免疫检查点阻断治疗无应答者中富集,并阐明肿瘤来源KLK5通过TMEM158-SDCBP-MEK/ERK-ELK1信号轴诱导TNC和SPP1表达从而建立免疫抑制微环境的新机制 摘要中未明确提及研究局限性 定义肺鳞癌免疫检查点阻断治疗耐药的微环境机制 接受新辅助抗PD-1治疗联合化疗的肺鳞癌患者手术标本 数字病理学 肺癌 单细胞转录组测序, 空间转录组学, bulk RNA-seq, 多重免疫荧光 NA 图像, 文本 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
93 2026-10-07
Artificial intelligence in oncology: linking biological discovery to clinical utility
2026-Aug-22, Molecular cancer IF:27.7Q1
综述 通过对202篇文献(含182项原始研究)进行批判性叙事综述,构建证据图谱,提出按临床或生物学主张匹配相应证据等级的评价框架,以区分肿瘤学中有前景的计算模型与临床或机制上可信的应用 提出“主张匹配”评价框架,针对不同临床或生物学主张(可迁移性、实用性、操作价值、患者结局、生物学机制)匹配相应证据等级(外部验证、校准/决策分析、前瞻性工作流研究、随机对照试验、扰动实验),系统揭示肿瘤学AI应用中证据梯度而非统一转化的问题 本文为批判性叙事综述,非系统综述或荟萃分析,检索截止至2026年7月21日,可能存在发表偏倚和文献选择偏倚,且未提供定量合并分析 批判性评估人工智能在肿瘤学全流程(早期检测、组织病理学、分子分型、治疗选择、药物发现、毒性监测和生存照护)中的应用证据等级,并提出将生物学发现与临床实用性相衔接的评价框架 202篇关于人工智能在肿瘤学中应用的文献,包括182项原始研究,覆盖检测与影像、病理学、分子与系统生物学、治疗决策支持等领域 数字病理学 肺癌 多组学、单细胞、空间转录组学、图模型、扰动模型、大语言模型 自监督模型、视觉-语言基础模型、大语言模型、图模型、扰动模型 图像、文本、多组学数据、单细胞数据、空间转录组学数据 202篇文献,包括182项原始研究 NA NA NA NA
94 2026-10-07
Dissociation of Murine Mammary Gland and Tumor Tissues to Create Highly Viable Single-Cell Suspensions
2026-08-21, Journal of visualized experiments : JoVE
研究方法 本文提出了一种从小鼠乳腺和肿瘤组织中分离高活性单细胞悬液的可重复且经济有效的方法 针对乳腺脂肪垫组织富含脂肪细胞难以获得干净细胞悬液的挑战,建立了能够保留细胞表面表位的高活性单细胞悬液制备方案 该方案针对小鼠乳腺和肿瘤组织优化,可能不适用于其他组织类型,且需要根据具体组织类型进行优化 建立从小鼠乳腺和肿瘤组织生成高活性单细胞悬液的方法,以用于单细胞RNA测序和免疫表型分析 小鼠乳腺脂肪垫组织和上皮样肿瘤组织 单细胞生物学 乳腺癌 机械解离、酶消化、过滤、单细胞RNA测序、流式细胞术 NA 单细胞悬液、图像、文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
95 2026-08-15
Intact Cell Dissociation of Formalin-Fixed Paraffin-Embedded Colon Tissue Enhances Cell Recovery and Gene Detection in Single-Cell RNA Sequencing
2026-Aug-13, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
96 2026-10-07
Adipose tissue microvasculature is linked to insulin resistance and lipidome alterations in treated HIV
2026-Aug-01, AIDS (London, England)
研究论文 本研究对接受长期现代抗逆转录病毒治疗且病毒学抑制的HIV感染者进行横断面观察,结合血浆脂质组学和腹部皮下脂肪组织单细胞RNA测序,发现脂肪组织微血管重塑与胰岛素抵抗及特定循环脂质改变相关 首次在接受现代抗逆转录病毒治疗的HIV感染者中,将腹部皮下脂肪组织的单细胞转录组细胞组成与循环脂质组特征联系起来,揭示脂肪组织微血管内皮减少及脂质转运受体LPL、GPIHBP1表达下降与胰岛素抵抗相关脂质组特征之间的关联 横断面观察性设计无法确定因果关系,样本量相对有限(脂质组学127例、单细胞RNA测序59例),且未纳入HIV阴性对照人群进行比较 探讨在接受现代抗逆转录病毒治疗且病毒学抑制的HIV感染者中,皮下脂肪组织细胞组成如何影响循环脂质水平及其与胰岛素抵抗的关系 接受长期现代抗逆转录病毒治疗且病毒学抑制的HIV感染者,涵盖非糖尿病、糖尿病前期和糖尿病等不同代谢状态 数字病理学 HIV感染相关代谢性疾病 非靶向血浆脂质组学、单细胞RNA测序 NA 脂质组数据、单细胞转录组数据 127例HIV感染者用于血浆脂质组学分析,其中59例用于腹部皮下脂肪组织单细胞RNA测序分析 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于腹部皮下脂肪组织细胞组成分析
97 2026-10-07
Identification of potential biological biomarkers for acute ischemic stroke based on integrated bioinformatics analyses
2026-Jul-11, BMC neurology IF:2.2Q3
研究论文 该研究通过多种生物信息学方法结合单细胞RNA测序和外周血样本验证,鉴定出TGM2作为急性缺血性脑卒中的潜在生物标志物 首次通过整合生物信息学分析和单细胞RNA测序数据,系统鉴定TGM2作为急性缺血性脑卒中的候选生物标志物,并在外周血样本中进行了实验验证,揭示了TGM2在不同细胞类型中的表达模式及其细胞间通讯的潜在背景 摘要中未明确提及研究的具体局限性,样本量较小,仅在外周血样本中验证了TGM2的表达,需要更大规模的临床队列进一步验证其诊断价值 识别急性缺血性脑卒中的可靠诊断生物标志物并探索其潜在分子机制,以实现疾病的早期识别和临床干预 急性缺血性脑卒中患者的外周血样本及相关基因表达数据 生物信息学 急性缺血性脑卒中 单细胞RNA测序,生物信息学分析 NA 基因表达数据,单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
98 2026-10-07
Single-cell RNA sequencing and cross-species analysis revealed the role of T cell-driven inflammatory responses in the pathogenesis of aortic dissection
2026-Jul-11, BMC cardiovascular disorders IF:2.0Q3
研究论文 本研究通过对人类和小鼠主动脉夹层样本进行单细胞RNA测序和跨物种转录组分析,揭示了T细胞驱动的炎症反应在主动脉夹层发病机制中的关键作用 首次结合单细胞RNA测序和跨物种整合分析,系统揭示了主动脉夹层中T细胞介导的适应性免疫反应与先天性免疫的协同作用,并鉴定了51个保守的差异表达基因,主要富集于IL-17和细胞因子-细胞因子受体相互作用通路 循环细胞因子变化有限,未能完全反映组织水平的炎症状态;样本量相对有限;小鼠模型虽能模拟部分人类疾病特征,但种属差异可能影响结论的完全转化 描绘主动脉夹层的免疫图谱,特别是T细胞介导的免疫反应,并鉴别人和小鼠模型中保守的炎症机制 主动脉夹层患者的升主动脉组织和血浆样本,以及BAPN诱导的主动脉夹层小鼠模型的主动脉组织 数字病理学, 机器学习 心血管疾病 单细胞RNA测序, 真核转录组测序, 定量PCR, ELISA Seurat, Cell Ranger 图像, 文本 主动脉夹层患者和正常对照的升主动脉组织及血浆样本(具体数量未在摘要中说明),以及BAPN诱导的主动脉夹层小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA测序, 真核转录组测序 10x Chromium 10x Genomics Chromium平台进行单细胞RNA测序,结合磁激活细胞分选分离CD45⁺免疫细胞
99 2026-10-07
ATP7A-mediated copper ion efflux reprogrammes tumour immunity and promotes cisplatin resistance in cervical cancer
2026-Jul-10, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究揭示了ATP7A介导的铜离子外排通过SOX21/ATP7A/铜离子轴导致免疫抑制和顺铂耐药,靶向该轴可恢复CD8⁺T细胞活性并增强顺铂疗效 首次揭示SOX21直接结合ATP7A启动子两个保守基序增强其转录活性,阐明ATP7A介导的铜离子外排通过铜离子直接结合LCK激活环Tyr394损害TCR信号通路从而抑制CD8⁺T细胞功能的新机制 摘要中未明确提及研究局限性 探究铜离子、顺铂耐药与免疫调控之间的关联机制,寻找逆转宫颈癌顺铂耐药的潜在靶点 宫颈癌组织样本及顺铂耐药与敏感患者 数字病理学 宫颈癌 转录组测序,单细胞RNA测序,多组学分析 NA 图像,文本 NA NA 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq NA NA
100 2026-10-07
PRMT5 promotes psoriatic inflammation through mediating dimethylation of p65 in keratinocytes
2026-Jul-10, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
研究论文 本文揭示了PRMT5通过介导角质形成细胞中p65的对称二甲基化(R158和R166位点)抑制自噬-溶酶体降解途径从而稳定p65蛋白,进而放大NF-κB驱动的炎症反应,促进银屑病炎症发生 首次发现PRMT5通过催化p65在R158和R166位点的对称二甲基化(SDMA)修饰,抑制自噬介导的溶酶体降解从而稳定p65蛋白,阐明了一条全新的PRMT5-p65调控轴在银屑病角质形成细胞炎症中的关键作用 研究主要依赖公共转录组数据集和小鼠模型,缺乏大规模银屑病患者队列的临床验证,且PRMT5抑制剂EPZ015666的临床转化安全性和有效性仍需进一步评估 探究PRMT5在银屑病角质形成细胞中的功能及其调控银屑病炎症的分子机制,并评估PRMT5作为银屑病治疗靶点的潜力 银屑病患者皮肤样本的公共转录组数据、银屑病角质形成细胞、咪喹莫特诱导和IL-23诱导的小鼠银屑病模型 机器学习 银屑病 bulk RNA-sequencing, single-cell RNA-sequencing (scRNA-seq), 免疫荧光染色, 免疫共沉淀, 分子对接, GST pull-down, 质谱分析, 定点突变 NA 转录组数据, 图像, 文本 多个银屑病患者公共bulk RNA-seq和scRNA-seq数据集以及银屑病皮损活检样本,具体样本量未在摘要中明确说明 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
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