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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-10-24 |
Desmoglein-1 coordinates cell proliferation and actin dynamics to promote epidermal morphogenesis
2026-Sep-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.09.29.755418
PMID:42856473
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研究论文 | 该研究利用野生型和Dsg1敲除小鼠皮肤的单细胞RNA测序图谱,揭示Dsg1通过Nck1-N-WASP轴协调细胞增殖和肌动蛋白动力学以促进表皮形态发生 | 首次构建了小鼠皮肤野生型scRNA-seq图谱并与Dsg1敲除胚胎多个发育时间点的scRNA-seq数据整合,鉴定出位于基底和分化状态之间的过渡性角质形成细胞亚群,并揭示了Dsg1-Nck1-N-WASP轴将桥粒黏附与细胞骨架重塑联系起来的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,Dsg1在人类表皮形态发生中的直接作用仍需进一步验证;Dsg1 KO表皮厚度在E16.5-E18.5恢复的具体代偿机制尚未完全阐明 | 探究桥粒钙黏蛋白Dsg1在表皮形态发生中的贡献及其分子机制 | 小鼠皮肤表皮角质形成细胞,包括野生型和Dsg1敲除胚胎(E14.5、E15.5、E16.5、E18.5) | 单细胞组学、发育生物学 | NA | scRNA-seq、EdU掺入实验、PCNA染色、免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据、图像 | 覆盖E14.5、E15.5、E16.5和E18.5四个发育时间点的野生型和Dsg1敲除小鼠胚胎皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 82 | 2026-10-24 |
IL-23-engineered oncolytic vaccinia virus enhances pancreatic cancer control through inflammasome-driven Th17-skewed CD4+ T-cell responses
2026-Sep-28, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2026-016326
PMID:42805762
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研究论文 | 该研究构建了表达IL-23的溶瘤痘苗病毒,并通过单细胞RNA测序揭示其通过炎性小体驱动Th17偏向性CD4+ T细胞反应增强胰腺癌控制 | 首次将IL-23的p40和p19亚基分别表达以模拟天然异二聚体组装,并发现病毒通过肿瘤细胞介导的巨噬细胞炎性小体激活释放IL-1β,与病毒编码的IL-23协同促进Th17偏向性Cxcr6+Rora+ CD4+ T细胞分化 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究IL-23工程化溶瘤痘苗病毒增强胰腺癌控制的免疫机制 | 免疫抑制性胰腺导管腺癌模型 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | CRISPR-Cas9同源重组、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 83 | 2026-10-24 |
Epidermal HLA-DQB1 exerts negative regulation of mast cell activation through the TSLP-driven SPP1-expressing macrophage axis
2026-Sep-26, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.09.013
PMID:42800483
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研究论文 | 本文研究了表皮HLA-DQB1通过TSLP驱动的SPP1表达巨噬细胞轴负调控肥大细胞活化的机制 | 首次揭示角质形成细胞内在MHC II类分子(HLA-DQB1/H2-Ab1)通过表观遗传抑制TSLP表达,进而限制TSLP-SPP1+巨噬细胞-肥大细胞活化级联反应,发挥免疫调节功能 | 摘要中未明确说明研究局限性 | 探究表皮MHC II类分子在IgE介导的皮肤炎症中的因果关系和功能机制 | 荨麻疹患者、KC特异性H2-Ab1敲除小鼠模型(K14Cre/+H2-Ab1fl/f)、巨噬细胞、肥大细胞 | 免疫学、皮肤病学、分子生物学 | 荨麻疹 | 孟德尔随机化、免疫组化、流式细胞术、单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀实验、RNA干扰、荧光素酶报告基因实验、Western blotting | NA | 基因表达数据、临床数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 84 | 2026-10-24 |
IFNγ-dependent tumor-cell MHC-II is restrained by MAPK signaling and associated with immunotherapy responsiveness in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Sep-24, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-1612
PMID:42784801
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研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序、空间转录组学、bulk转录组学、多重免疫组化及小鼠模型功能研究,揭示胰腺导管腺癌肿瘤细胞MHC-II受MAPK信号抑制、依赖IFNγ,并与免疫治疗敏感性相关 | 首次系统阐明肿瘤细胞MHC-II在PDAC中是IFNγ依赖、受MAPK信号限制的程序,并可作为免疫检查点阻断联合MEK抑制疗效的预测标志 | 机制与疗效验证主要基于小鼠KPC模型和体外实验,人体队列样本量有限,且MAPK抑制与ICB联合的最佳策略仍需进一步临床验证 | 探究PDAC肿瘤细胞MHC-II的表达调控机制及其与免疫治疗反应的关系 | 胰腺导管腺癌患者数据集、配对活检样本及小鼠KPC PDAC模型 | 肿瘤免疫学、单细胞与空间组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、bulk转录组学、多重免疫组化、功能实验 | NA | 基因表达数据、图像、文本 | NA(人类PDAC数据集及配对活检,例数未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 85 | 2026-10-24 |
RIPK3 acts as a molecular switch between neuroprotection and neuropathology during herpes simplex encephalitis
2026-09-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-77881-7
PMID:42907439
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研究论文 | 该研究揭示RIPK3在单纯疱疹病毒性脑炎中作为细胞类型特异性的分子开关,平衡神经保护与神经病理 | 首次揭示RIPK3在HSV-1脑炎中具有细胞类型特异性的双重功能:其支架功能促进干扰素反应和病毒控制,而激酶活性在星形胶质细胞中触发坏死性凋亡导致神经元丢失和致死性神经炎症 | 研究主要基于动物模型和遗传敲除模型,尚未在人类患者中验证RIPK3选择性调控策略的临床可行性和安全性 | 阐明RIPK3在单纯疱疹病毒性脑炎中保护性与病理性作用的机制,探索选择性调控RIPK3信号作为治疗策略的可能性 | HSV-1感染的神经元、星形胶质细胞、小胶质细胞和髓系细胞 | 感染性疾病与神经免疫学 | 单纯疱疹病毒性脑炎 | 单细胞转录组测序、基因敲除模型、病毒复制分析、干扰素产生分析、细胞死亡分析 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据、基因表达数据、病毒学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 86 | 2026-10-24 |
BEAR-GRN: Systematic assessment of single-cell multi-omics-based gene regulatory network inference methods
2026-09-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-77838-w
PMID:42901905
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研究论文 | 该文提出了BEAR-GRN,一个用于系统性评估基于单细胞多组学数据的基因调控网络推断方法的标准化基准框架 | 提供了标准化数据集、整理好的真实网络和统一计算流程,支持对GRN推断方法进行无偏性能评估,并引入模态扰动实验分析RNA和染色质可及性的贡献 | 当前方法主要受RNA驱动,染色质可及性贡献的独立信号有限;真实网络的选择对性能评估有深刻影响 | 系统评估基于单细胞多组学数据的基因调控网络推断方法 | 人类和小鼠细胞类型的配对单细胞RNA-seq和ATAC-seq数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 87 | 2026-10-24 |
The Impact of Low-Protein Diet on the Molecular and Cellular Development of the Fetal Kidney
2026-Sep-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000001053
PMID:41885952
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研究论文 | 该研究综合运用断层成像、共聚焦成像和单细胞RNA测序,揭示母体低蛋白饮食通过损害肾单位祖细胞增殖与分化、改变分支形态发生,导致子代肾单位数量减少 | 结合光学投影断层成像、共聚焦显微镜与单细胞RNA测序,系统解析低蛋白饮食对胎儿肾脏分支形态发生和肾单位形成细胞分子过程的时空影响,发现肾单位祖细胞分化和Wnt信号通路受损是关键机制 | 未明确说明具体样本量;机制验证主要依赖转录组关联分析,缺乏功能实验验证;仅关注低蛋白饮食模型,未与其他宫内生长受限模型比较 | 探究母体低蛋白饮食对胎儿肾脏发育过程中分支形态发生和肾单位形成的细胞与分子机制的影响 | 母体低蛋白饮食模型下的胎儿及子代肾脏(包括肾单位祖细胞、输尿管尖端、肾单位前体聚集体等) | 数字病理学, 发育生物学 | 肾脏疾病, 高血压, 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序, 光学投影断层成像, 共聚焦显微镜成像 | NA | 图像, 文本(基因表达数据) | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 88 | 2026-10-24 |
KIAA0319 Plays a Critical Role in Cortical Neuronal Maturation and Synaptic Development Through a Dyslexia-Associated Gene Network
2026-08-15, Biological psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1016/j.biopsych.2025.10.014
PMID:41115623
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研究论文 | 该研究利用CRISPR-Cas9构建KIAA0319敲除的人胚胎干细胞并分化为大脑皮层类器官,揭示该阅读障碍相关基因在皮层神经元成熟和突触发育中的关键作用 | 首次利用KIAA0319敲除的人皮层类器官结合单细胞转录组揭示该基因通过阅读障碍相关基因网络调控初级纤毛形成、皮层组织和神经网络连接 | 研究基于体外类器官模型,缺乏体内验证,且未在患者样本中直接验证相关机制 | 探究KIAA0319在神经发育中的作用及其分子机制 | KIAA0319敲除的人胚胎干细胞及其分化的人大脑皮层类器官 | 神经发育生物学 | 阅读障碍 | CRISPR-Cas9基因编辑, 免疫染色, EdU检测, 钙成像, 单细胞RNA测序 | 人皮层类器官模型 | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 89 | 2026-10-24 |
DBP: Adaptive and Interpretable Factor Analysis for Single-cell RNA-seq Data with Deep Beta Processes
2026-Aug-14, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf117
PMID:41298306
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研究论文 | 提出Deep Beta Process (DBP)深度概率框架,用于单细胞转录组数据的自适应且可解释的因子分析 | 通过stick-breaking Beta过程实现因子数量的自适应选择,并采用对抗学习策略进行批次校正,同时从细胞和基因两个角度解释生物学变异 | 摘要中未明确说明 | 解决现有因子分析方法在最优因子数量选择上缺乏自适应性以及在捕获生物学变异方面可解释性不足的问题 | 单细胞转录组数据,包括模拟数据集和胃腺癌数据集 | 机器学习 | 胃癌 | 单细胞RNA-seq | 深度概率框架(Deep Beta Process) | 基因表达矩阵 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 90 | 2026-10-24 |
DRG meningeal tertiary lymphoid structures are regulated by B cells as a pronociceptive locus after peripheral nerve injury
2026-Aug-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.08.09.743585
PMID:42845338
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研究论文 | 该文揭示外周神经损伤后背根神经节脑膜中形成由B细胞调控的第三级淋巴结构,并作为促痛位点驱动神经病理性疼痛 | 首次发现DRG脑膜中存在生发中心样第三级淋巴结构,并证明生发中心B细胞对该结构的组织形成不可或缺,且该结构紊乱可阻止神经病理性疼痛的发生 | 研究主要基于动物模型,人体样本数量有限,TLS形成与疼痛之间的因果机制及临床转化仍需进一步验证 | 探究外周神经损伤后背根神经节中B细胞组织形成位点及其在神经病理性疼痛中的作用机制 | 外周神经损伤小鼠模型、B细胞缺陷muMT小鼠、猪及慢性疼痛人类供体的背根神经节组织 | 神经免疫学 | 神经病理性疼痛 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学、B细胞受体克隆型分析、脑内注射抗体及细胞过继转移 | NA | 单细胞转录组数据、组织图像、文本 | 小鼠、猪及人类供体DRG组织,具体样本量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 91 | 2026-10-24 |
Cadmium exposure triggers a functional switch of APP to drive joint degeneration
2026-Aug-14, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-026-01603-4
PMID:42907963
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研究论文 | 本研究通过NHANES横断面分析、网络毒理学、机器学习、单细胞RNA测序、孟德尔随机化及分子动力学模拟,揭示镉暴露通过APP介导的免疫炎症轴驱动骨关节炎进展的分子机制 | 首次系统阐明镉暴露通过功能性切换APP驱动关节退变的分子景观,整合多组学与临床验证揭示APP介导的免疫炎症轴在骨关节炎中的作用 | NAC与APP的结合模式仅基于分子动力学模拟的初步结构见解,尚需进一步实验验证 | 探究镉暴露在骨关节炎发病中的具体作用及潜在分子机制 | 骨关节炎患者、颈椎病对照人群及公共数据库样本 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序、网络毒理学、机器学习、孟德尔随机化、分子对接、分子动力学模拟 | 机器学习算法 | 文本、图像 | NHANES数据库2001-2018年数据,180例骨关节炎患者和400例颈椎病对照,以及GEO和CTD数据库样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 92 | 2026-10-24 |
An integrated single-cell transcriptomic and microbiome dataset of orbital adipose tissue in thyroid eye disease
2026-Aug-13, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-026-08064-8
PMID:42897260
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研究论文 | 该研究构建了甲状腺眼病(TED)患者与健康对照者眶脂肪组织的单细胞转录组和微生物组多组学数据集 | 首次将眶脂肪组织的单细胞转录组与低生物量微生物组(16S rRNA基因测序)数据整合,并包含环境样本用于污染评估,提供了研究宿主细胞免疫与局部微生物组相互作用的资源 | 摘要中未明确说明样本量细节及微生物组低生物量带来的技术挑战对结果的影响 | 解析甲状腺眼病眶脂肪组织的细胞异质性及局部微生物失调在眶微环境中的潜在作用 | 甲状腺眼病患者及健康对照者的眶脂肪组织和皮下脂肪,以及用于污染评估的环境样本 | 单细胞组学、微生物组学、数字病理学(免疫微环境) | 甲状腺眼病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、16S rRNA基因测序 | NA | 单细胞转录组数据、微生物组测序数据 | 61,302个高质量单细胞;眶脂肪组织样本及环境样本(具体样本数未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA-seq、16S rRNA基因测序 | NA | NA |
| 93 | 2026-10-24 |
Binary-SPA: a reference-free method for cell annotation in high-resolution spatial transcriptomics
2026-Aug-10, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag812
PMID:42605801
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研究论文 | 提出了一种无需参考数据的空间转录组细胞注释计算框架Binary-SPA,通过两阶段策略实现高分辨率空间转录组的准确细胞类型注释 | 开发了Binary-SPA方法,采用两阶段注释策略:首先利用预定义标记集进行二分类识别高置信度细胞,然后将这些高置信度注释细胞作为内部参考进行基于锚点的标签转移,完全消除了对外部参考数据的依赖 | 摘要中未明确提及该方法的局限性 | 解决高分辨率空间转录组学中细胞注释的挑战,克服现有方法对单细胞RNA测序参考数据的依赖以及基于标记方法的准确性和覆盖度限制 | 高分辨率空间转录组数据,包括多种空间平台、组织类型和保存方案下的样本,以及骨髓活检等 Challenging 标本 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 94 | 2026-10-24 |
Immune and stromal features of durable complete response to radiation and dual immune checkpoint blockade in pancreatic cancer
2026-Aug-10, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.08.06.26359422
PMID:42845633
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研究论文 | 本研究开展了一项单臂II期临床试验,联合纳武利尤单抗、伊匹木单抗和放疗治疗经治的转移性MSS胰腺导管腺癌患者,并通过单细胞/单核转录组、空间转录组和外周血TCR测序等多组学手段,解析了一例持久完全缓解患者的免疫和基质特征 | 首次在一例持久完全缓解的MSS PDAC患者中,整合纵向单核/单细胞转录组、配对TCR克隆型、Visium空间转录组和外周血TCR测序,揭示了治疗相关的CD8 T细胞克隆型从GZMK+向耗竭及预测肿瘤反应性状态的转变,以及ACKR1+静脉内皮和干扰素极化巨噬细胞/成纤维细胞程序在支持T细胞招募、再循环和持久性中的关键作用 | 整体临床活性有限,仅一例患者实现持久完全缓解,样本量较小(30例患者,22例有活检,13例空间转录组,25例外周血TCR测序),结论主要基于单例响应者的观察,需在更大队列中验证 | 探究MSS胰腺导管腺癌对放疗联合双免疫检查点阻断产生持久完全缓解的免疫和基质机制,为未来免疫治疗和疫苗策略设计提供依据 | 经治的转移性微卫星稳定(MSS)胰腺导管腺癌(PDAC)患者 | 数字病理, 肿瘤免疫学, 单细胞组学 | 胰腺癌 | 单核RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR测序, 空间转录组, 外周血TCR测序 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, TCR序列数据 | 30例患者;22例患者的32份治疗前和治疗中肿瘤活检;245,529个单核转录组和128,295个单细胞转录组(含27,215个T细胞及配对TCR克隆型);13份活检的空间转录组;25例患者的外周血TCR测序 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR测序, 空间转录组 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞/单核转录组及配对TCR克隆型测序, 10x Visium空间转录组 |
| 95 | 2026-10-24 |
Genetic tool for specific tracking of mature neutrophils
2026-Aug, hLife
DOI:10.1016/j.hlife.2026.05.007
PMID:42903866
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研究论文 | 该研究开发了CD101-tdTomato报告小鼠模型,用于特异性追踪成熟中性粒细胞,并验证CD101作为成熟中性粒细胞标志物的稳定性 | 首次构建CD101-tdTomato报告小鼠模型,并与Lysozyme-GFP小鼠杂交建立双报告系统,可精确区分成熟中性粒细胞与总髓系细胞;证明CD101在炎症条件下表达下降并非由于蛋白脱落或降解,支持其作为成熟中性粒细胞标志物的稳健性 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;CD101在病理条件下的稳定性仅在LPS、流感病毒和G-CSF刺激模型中评估,未涵盖所有炎症或疾病状态;摘要中未提及空间转录组学和谱系追踪的实际应用数据 | 开发特异性追踪成熟中性粒细胞的遗传工具,并评估CD101作为成熟中性粒细胞标志物在病理条件下的稳定性 | CD101-tdTomato报告小鼠、野生型小鼠、Lysozyme-GFP小鼠及其杂交后代 | 免疫学 | NA | 流式细胞术、Transwell迁移实验、Wright-Giemsa染色 | CD101-tdTomato报告小鼠模型、Lysozyme-GFP小鼠模型、双报告小鼠系统 | 流式细胞术数据、图像 | LPS处理组n=8,流感病毒处理组n=6,G-CSF处理组n=5,均为小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 96 | 2026-10-24 |
Histology images in spatial transcriptomics: a critical evaluation of their effectiveness in spatial domain detection
2026-Jul-27, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-026-12830-8
PMID:42907765
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研究论文 | 该文章系统评估了在空间转录组数据分析中整合组织学图像对空间域检测效果的提升作用,并通过统计检验发现组织学图像并未显著改善空间域检测性能 | 设计统计检验方法系统性地量化组织学图像对空间域检测质量提升的显著性,并深入探讨组织学图像未能提升性能的可能原因 | 研究发现组织学图像作为额外信息源并未显著提升空间域检测性能,表明现有整合方法存在不足,且研究仅针对所调查的方法 | 评估在空间转录组数据中整合组织学图像对空间域检测任务的实际效果,并探讨其有效整合的未来方向 | 空间转录组数据集及其配套的组织学图像 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像, 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 97 | 2026-10-24 |
Unraveling the dual role of fibroblast growth factor 5 (FGF5) in cardiorenal diseases through multi-omics causal inference
2026-Jul-26, Cardiovascular diabetology
IF:8.5Q1
DOI:10.1186/s12933-026-03309-7
PMID:42907830
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和孟德尔随机化等方法,揭示了FGF5在心血管疾病和慢性肾脏病中的双向多效性作用 | 首次系统性地通过跨祖先pQTL共定位筛选和多种因果推断方法,发现FGF5在心血管疾病与慢性肾脏病中的拮抗性多效性效应,并鉴定出其肾脏组织特异性调控机制及候选因果变异 | 研究主要基于遗传学因果推断和观察性分析,缺乏实验功能验证;FGF5作为治疗靶点的具体分子机制尚未完全阐明;研究人群主要限于欧洲和东亚人群 | 阐明多效性分子在心血管疾病与慢性肾脏病共病机制中的作用,筛选共享遗传信号并评估其临床转化价值 | 2719种血浆蛋白、34种年龄相关疾病、欧洲和东亚人群的大型pQTL队列数据 | 多组学因果推断、遗传流行病学 | 心血管疾病、慢性肾脏病 | pQTL分析、孟德尔随机化、贝叶斯共定位分析、遗传精细定位、顺式调控元件分析、单细胞转录组学、PheWAS | NA | 遗传数据、蛋白质定量性状数据、单细胞转录组数据、临床观察数据 | 四个大规模pQTL队列涉及2719种血浆蛋白和34种年龄相关疾病 | NA | pQTL、单细胞转录组学 | NA | NA |
| 98 | 2026-10-24 |
Epigenetic regulation of INPP5D and its downstream molecular network in autoimmune pancreatitis
2026-Jul-25, BMC gastroenterology
IF:2.5Q2
DOI:10.1186/s12876-026-05170-0
PMID:42902176
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研究论文 | 该研究通过全基因组DNA甲基化芯片分析和单细胞RNA测序,揭示自身免疫性胰腺炎中INPP5D的表观遗传调控及其下游分子网络 | 首次在自身免疫性胰腺炎中结合全基因组DNA甲基化芯片和单细胞RNA测序,发现INPP5D启动子低甲基化与其在基质巨噬细胞谱系中蛋白表达降低的关联,揭示表观遗传重塑与AIP纤维炎症微环境的关系 | 样本量有限,仅使用甲基化芯片和单细胞转录组数据,缺乏功能验证实验;INPP5D低甲基化与蛋白表达降低之间的因果机制尚未明确 | 探究表观遗传调控在自身免疫性胰腺炎发病机制中的作用,特别是INPP5D及其下游分子网络的调控 | 自身免疫性胰腺炎(AIP)组织和梗阻性胰腺炎(OP)组织 | 表观遗传学 | 自身免疫性胰腺炎 | DNA甲基化芯片,单细胞RNA测序,免疫组织化学 | NA | 甲基化数据,单细胞转录组数据,图像 | NA | Illumina | DNA甲基化芯片,单细胞RNA测序 | Infinium MethylationEPIC | Infinium MethylationEPIC芯片用于全基因组DNA甲基化分析 |
| 99 | 2026-10-24 |
High xCT expression indicates poor prognosis and chemoradiotherapy resistance in rectal cancer patients
2026-Jul-25, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-026-04428-7
PMID:42902388
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研究论文 | 该研究探讨了xCT/SLC7A11在直肠癌中的表达及其对预后和放化疗反应的预测价值 | 首次系统性地揭示了xCT在直肠癌中的预后预测价值和放化疗耐药机制,并构建了基于xCT的预后列线图模型,同时发现xCT通过调控铁死亡影响放化疗敏感性 | 摘要中未明确提及研究局限性,样本量及具体实验设计细节未充分披露 | 探索xCT在直肠癌患者中的预后预测价值及其对放化疗反应的预测作用 | 直肠癌患者组织样本及直肠癌细胞系 | 数字病理 | 直肠癌 | 免疫组化、RT-qPCR、单细胞RNA测序 | 列线图模型 | 图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 100 | 2026-10-24 |
Aging-enhanced accumulation of fibroblasts excludes oligodendrocytes in demyelinated lesions
2026-Jul-25, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-026-03976-z
PMID:42902401
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研究论文 | 该文揭示了在溶血卵磷脂诱导的脊髓脱髓鞘病变中,成纤维细胞积累并排斥少突胶质前体细胞,且该过程随衰老加剧 | 首次报道成纤维细胞在脱髓鞘病变实质中积累,并通过单核和空间转录组学将其与周细胞区分;发现成纤维细胞是微胶质/巨噬细胞和少突胶质前体细胞信号的主要来源;揭示成纤维细胞积累随年龄增加并排斥少突胶质前体细胞;在MS病变中验证了成纤维细胞的存在及细胞间通讯网络 | 研究主要基于小鼠模型和公共单核RNA数据库,人体MS病变的直接实验验证有限;未完全阐明成纤维细胞排斥少突胶质前体细胞的具体分子机制 | 探究成纤维细胞在脱髓鞘病变中的积累及其对少突胶质细胞修复反应的影响,特别是衰老的作用 | 6-10周龄年轻小鼠和48-52周龄老年小鼠的溶血卵磷脂诱导脊髓白质脱髓鞘病变,以及公共多发性硬化单核RNA数据库 | 神经科学、数字病理学 | 多发性硬化、脱髓鞘疾病 | 免疫荧光显微镜、单核RNA测序、空间转录组学、细胞培养、CellChat配体-受体分析 | NA | 图像、文本(转录组数据) | NA | 10x Genomics | 单核RNA-seq、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | NA |