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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-02-02 |
The expression of mercaptopyruvate sulfurtransferase serves as a potential biomarker for prognostic stratification and immunotherapy in certain cancers
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1686443
PMID:41613530
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和临床样本验证,探讨了MPST基因在多种癌症中的表达、预后分层和免疫治疗潜力 | 首次对MPST基因进行全面的泛癌分析,结合单细胞测序数据揭示其在肿瘤免疫微环境中的功能状态 | 研究主要基于公共数据库和初步临床验证,需要更多实验和前瞻性研究来确认MPST作为生物标志物的临床适用性 | 评估MPST基因在癌症诊断、预后和免疫反应中的潜在影响 | 多种癌症类型,包括肺腺癌等 | 生物信息学 | 多种癌症 | 生物信息学分析,免疫组化染色,单细胞测序 | NA | 基因表达数据,DNA甲基化数据,蛋白质相互作用网络,临床样本图像 | 基于TCGA和HPA数据库的多种癌症样本,以及收集的临床组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 82 | 2026-02-02 |
Spatial transcriptome and single-cell sequencing reveal the role of nucleotide metabolism in breast cancer progression and tumor microenvironment
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1703778
PMID:41613532
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和空间转录组学技术,揭示了核苷酸代谢在乳腺癌进展和肿瘤微环境中的作用 | 整合五种单细胞富集评分方法对乳腺癌细胞群进行综合分析,并利用空间转录组学数据映射单细胞簇,以区分肿瘤细胞亚型 | NA | 探索核苷酸代谢在乳腺癌细胞中的复杂性及其与肿瘤微环境的相互作用 | 乳腺癌细胞及其与肿瘤微环境的相互作用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序, 空间转录组学 | 机器学习算法 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 83 | 2026-02-02 |
DPCDI: an artificial intelligent-derived indicator interpreting the diagnostic, stratification, and therapeutic implications of druggability programmed cell death in heart failure
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1753636
PMID:41613752
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研究论文 | 本文开发了一种名为DPCDI的人工智能衍生指标,用于解释心力衰竭中可药物化程序性细胞死亡的诊断、分层和治疗意义 | 通过整合机器学习框架(Lasso和随机森林算法)识别了15个关键基因构建DPCDI,并结合非负矩阵因子分析、单细胞RNA测序、孟德尔随机化分析和实验验证,为心力衰竭提供了全面的诊断、风险分层和靶向治疗开发框架 | NA | 开发一个指标以解释心力衰竭中可药物化程序性细胞死亡的诊断、分层和治疗意义 | 心力衰竭患者和HF小鼠模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, 分子对接 | Lasso, 随机森林, 非负矩阵因子分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 84 | 2026-02-02 |
High glucose-induced PLCG1 histone acetylation to promote ferroptosis by LAMP2A/HSPA8 in a diabetic nephropathy model
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1640721
PMID:41614070
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研究论文 | 本研究探讨了高血糖诱导的PLCG1组蛋白乙酰化通过LAMP2A/HSPA8信号通路促进铁死亡,从而在糖尿病肾病模型中加速疾病进展 | 首次揭示了PLCG1通过组蛋白乙酰化调控LAMP2A/HSPA8信号通路,促进线粒体氧化应激和铁死亡,在糖尿病肾病中的新作用机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验,缺乏大规模临床样本验证;单细胞RNA测序数据的分析深度可能有限 | 探究PLCG1在糖尿病肾病中的分子机制及其与铁死亡的关系 | 糖尿病肾病小鼠模型(C57BL/6小鼠)和高糖诱导的NRK-52E细胞 | 分子生物学与病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序、生物信息学分析、组蛋白乙酰化检测、蛋白质印迹 | NA | RNA测序数据、蛋白质表达数据、临床生化指标 | 糖尿病肾病患者与正常对照组、小鼠模型、NRK-52E细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 85 | 2026-02-02 |
Network pharmacology, bioinformatics and in vitro/in vivo validation elucidate the anti-lung cancer activities and potential targets of Rhoifolin
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1727729
PMID:41614077
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研究论文 | 本研究通过整合网络药理学、生物信息学及体外/体内实验验证,系统探究了Rhoifolin的抗肺癌活性及其潜在靶点EPHB2 | 首次采用网络药理学、转录组学结合机器学习方法,识别出Rhoifolin在肺癌中的关键靶点EPHB2,并通过分子对接、动力学模拟及体内外实验验证其作用机制 | 研究主要基于细胞系和异种移植小鼠模型,缺乏临床样本的直接验证,且未深入探讨EPHB2下游信号通路的具体调控网络 | 系统研究Rhoifolin的抗肿瘤效应并鉴定其关键分子靶点,为肺癌治疗提供新策略 | 肺癌细胞系(如H358)及H358异种移植小鼠模型 | 生物信息学 | 肺癌 | 网络药理学、转录组分析、机器学习、RT-qPCR、Western blot、免疫荧光、分子对接、动力学模拟 | 机器学习 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、临床生存数据 | 体外实验使用肺癌细胞系,体内实验使用H358异种移植小鼠模型,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 86 | 2026-02-02 |
Insights Into Systemic Sclerosis from Gene Expression Profiling
2021-Sep, Current treatment options in rheumatology
IF:1.7Q3
DOI:10.1007/s40674-021-00183-0
PMID:41614080
|
综述 | 本文综述了基因表达谱分析在系统性硬化症研究中的应用,特别是通过转录组学揭示疾病异质性、病因及治疗靶点 | 利用转录组学(包括bulk和单细胞技术)量化系统性硬化症的分子异质性,为个性化治疗提供数据驱动见解 | 疾病轨迹预测仍具挑战性,需进一步研究靶组织中的细胞和分子动态 | 通过基因表达谱分析提升对系统性硬化症分子异质性和治疗策略的理解 | 系统性硬化症患者 | 自然语言处理 | 系统性硬化症 | 转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 87 | 2026-01-30 |
Spatial transcriptomics: challenges and future directions in musculoskeletal diseases
2026-Mar-01, Current opinion in rheumatology
IF:5.2Q1
DOI:10.1097/BOR.0000000000001140
PMID:41263435
|
综述 | 本文回顾了空间转录组学在肌肉骨骼疾病研究中的最新进展、挑战及未来方向 | 总结了空间转录组学在揭示肌肉骨骼疾病分子机制中的作用,并探讨了其在应用中面临的挑战及克服策略 | NA | 探讨空间转录组学在肌肉骨骼疾病研究中的当前应用、挑战及未来潜力 | 肌肉骨骼系统及疾病 | 空间转录组学 | 肌肉骨骼疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 88 | 2026-01-30 |
Germ line LCP1 mutations cause immunodeficiency with neutropenia, monocytopenia, lymphopenia, and defective cytokinesis
2026-Feb-10, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2025016507
PMID:41056520
|
研究论文 | 本研究报道了LCP1基因的杂合变异导致一种新型的造血系统疾病,表现为中性粒细胞减少症、淋巴细胞减少症、单核细胞减少症、低丙种球蛋白血症和细胞分裂缺陷 | 首次发现LCP1基因的激活突变可引起一种新型的常染色体显性遗传性造血系统疾病,并揭示了其导致细胞分裂缺陷和G-CSF治疗无效的机制 | 研究仅涉及4个独立家系,样本量有限;不同变异类型导致的临床表现异质性需要进一步研究 | 探究严重先天性中性粒细胞减少症(SCN)的新型遗传病因及其致病机制 | 携带LCP1基因杂合变异的患者及其家系成员 | 遗传学 | 造血系统疾病 | 单细胞转录组分析、诱导多能干细胞技术、F-肌动蛋白束形成实验 | NA | 基因组数据、转录组数据、细胞表型数据 | 4个独立家系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 89 | 2026-01-30 |
Lycium barbarum polysaccharides enhance testicular spermatogenesis in d-galactose-induced aging rats via calcium signaling
2026-Feb, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.70119
PMID:40939042
|
研究论文 | 本研究探讨了枸杞多糖如何通过调节钙信号通路改善d-半乳糖诱导的衰老大鼠睾丸精子发生功能 | 首次结合单细胞测序和多组学方法,系统揭示了枸杞多糖通过钙信号通路改善睾丸衰老的具体细胞机制 | 研究主要基于动物和细胞模型,尚未在人体中进行验证 | 探究枸杞多糖对d-半乳糖诱导的睾丸功能障碍的保护作用及其分子机制 | d-半乳糖诱导的衰老雄性大鼠和TM3细胞模型 | 生殖医学 | 老年性疾病 | 单细胞测序、多组学分析、组织学分析、SA-β-gal染色 | 动物模型、细胞模型 | 测序数据、组织图像、生化指标 | 未明确说明具体样本数量,但包括大鼠和细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 90 | 2026-01-30 |
Systemic activation and tissue infiltration of CD8 + CX3CR1 + T cells in non-small cell lung cancer treated with neoadjuvant immune checkpoint blockade
2026-Feb, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03160-9
PMID:41275012
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术,揭示了CD8+CX3CR1+T细胞在非小细胞肺癌新辅助免疫检查点阻断治疗中的系统性激活和组织浸润特征 | 首次系统性地鉴定并表征了与NA-ICB治疗反应相关的CD8+CX3CR1+T细胞亚群,揭示了其在血液中的增殖动态、组织迁移路径以及向耗竭和细胞毒性NK样CD8+T细胞分化的轨迹 | 样本量相对有限(共40例患者),且为观察性研究,需要更大规模的前瞻性队列验证其作为生物标志物的预测价值 | 探究新辅助免疫检查点阻断治疗非小细胞肺癌时,哪些T细胞亚群发生扩增和功能重激活,及其组织起源、迁移模式和表型转换 | 26例接受NA-ICB治疗和14例未经治疗的NSCLC患者的肿瘤组织、配对正常肺组织及外周血样本 | 单细胞组学与免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, TCR repertoire分析, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, TCR序列数据, 流式细胞数据 | 40例NSCLC患者(26例治疗组,14例未治疗组)的肿瘤、正常肺组织和外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 91 | 2026-01-30 |
Single-cell transcriptional mapping of Mustn1 exhibits consistent mural cell localization across musculoskeletal tissues
2026-Feb, JBMR plus
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/jbmrpl/ziaf193
PMID:41522665
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学方法,系统性地绘制了Mustn1基因在肌肉骨骼组织中的表达图谱,并揭示了其在平滑肌肌动蛋白表达细胞中的一致定位 | 首次利用开源单细胞RNA测序数据集,采用自上而下的转录组学方法,在多种肌肉骨骼组织中系统性地绘制了Mustn1基因的表达图谱,并发现其与Acta2在血管周细胞中的共定位 | 研究依赖于已有的开源数据集,可能受限于数据质量和覆盖范围;未进行实验验证Mustn1蛋白的功能 | 探究Mustn1基因在肌肉骨骼组织中的表达模式和细胞定位 | 肌肉骨骼组织(骨、滑膜、肌肉、肌腱)中的细胞,特别是血管周细胞和Sox9谱系细胞 | 单细胞转录组学 | 肌肉骨骼疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 92 | 2026-01-30 |
Ranitidine protects Müller cells against ferroptosis in diabetic retinopathy by regulating the AKT1/GSK3β pathway
2026-Feb-01, Indian journal of ophthalmology
IF:2.1Q2
DOI:10.4103/IJO.IJO_1522_25
PMID:41581041
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研究论文 | 本研究探讨了雷尼替丁通过调控AKT1/GSK3β通路抑制高糖诱导的视网膜Müller细胞铁死亡,从而保护糖尿病视网膜病变的潜在机制 | 首次结合单细胞测序技术和网络药理学预测并验证了雷尼替丁在糖尿病视网膜病变中通过AKT1/GSK3β通路抑制Müller细胞铁死亡的保护作用 | 研究主要基于小鼠细胞系(rMC-1)和高糖体外模型,缺乏体内动物模型和临床样本的验证 | 探究雷尼替丁对抗糖尿病视网膜病变的主要靶点和可能机制 | 糖尿病小鼠的视网膜Müller细胞以及高糖培养的小鼠视网膜Müller细胞系(rMC-1) | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞测序技术、网络药理学、Western blotting、CCK-8检测、Edu检测 | NA | 单细胞测序数据、蛋白质印迹数据、细胞活性数据 | 未明确样本数量,使用糖尿病小鼠视网膜组织和高糖培养的rMC-1细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | SPIED3平台 | NA |
| 93 | 2026-01-30 |
Integrative Single-Cell Analysis Reveals Targetable Vacuole Membrane Protein 1-Mediated Mechanism of Tumor Angiogenesis in Glioblastoma
2026-Feb, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70619
PMID:41589276
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞分析揭示了VMP1在胶质母细胞瘤中促进肿瘤血管生成的非自噬功能机制 | 首次发现VMP1在胶质母细胞瘤中具有独立于自噬功能的促肿瘤生长作用,并揭示了其通过VEGFA-VEGFR2信号通路促进血管生成的新机制 | 研究主要基于胶质母细胞瘤模型,VMP1在其他癌症类型中的功能仍需进一步验证 | 探究VMP1在胶质母细胞瘤肿瘤微环境中的非经典功能及其在血管生成中的作用机制 | 胶质母细胞瘤细胞、内皮细胞、小鼠模型 | 单细胞分析 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组测序、空间转录组学、bulk RNA-seq | NA | 转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 94 | 2026-01-30 |
omnideconv: a unifying framework for using and benchmarking single-cell-informed deconvolution of bulk RNA-seq data
2026-Jan-26, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-03955-w
PMID:41582216
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研究论文 | 本文提出了omnideconv框架,用于统一和基准测试基于单细胞RNA测序数据的批量RNA-seq数据去卷积方法 | 开发了一个统一的框架omnideconv,用于简化去卷积方法的应用、基准测试和优化,并全面评估了第二代工具的准确性、可扩展性和鲁棒性 | NA | 评估和优化基于单细胞RNA测序数据的批量RNA-seq数据去卷积方法的性能 | 批量RNA-seq数据的细胞类型去卷积 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 95 | 2026-01-30 |
Busulfan plus cyclophosphamide induced spermatogenic dysfunction and recovery: A dynamic change perspective
2026-Jan-24, Toxicology letters
IF:2.9Q2
DOI:10.1016/j.toxlet.2026.111833
PMID:41587595
|
研究论文 | 本研究通过小鼠模型,系统描述了白消安联合环磷酰胺(BuCy)诱导的睾丸损伤与恢复的长期动态变化 | 首次在小鼠中应用BuCy联合治疗方案,并利用单细胞转录组测序(scRNA-seq)进行纵向多时间点分析,揭示了生殖细胞群体的逐步减少及差异表达基因的动态变化 | 研究基于小鼠模型,可能无法完全模拟人类临床情况,且样本量未明确说明 | 探究BuCy预处理方案对睾丸功能的损伤机制及恢复过程 | 小鼠睾丸组织及生殖细胞 | 数字病理学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 96 | 2026-01-30 |
A supramolecular peptide reprograms PD-L1+ tumor-associated macrophages to enhance antitumor immunity in lung adenocarcinoma
2026-Jan-22, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114657
PMID:41580126
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研究论文 | 本研究开发了一种超分子肽纳米平台MH-PDBP,通过靶向并重编程肺腺癌中PD-L1阳性的肿瘤相关巨噬细胞,以增强抗肿瘤免疫 | 首次通过金亲和自组装构建了靶向M2样巨噬细胞的超分子肽纳米平台,该平台能特异性内化并促进PD-L1的溶酶体降解,从而将巨噬细胞重编程为M1表型 | 研究主要基于小鼠模型,其临床转化效果和长期安全性仍需进一步验证 | 开发一种针对肺腺癌免疫抑制微环境的新型治疗策略,通过重编程肿瘤相关巨噬细胞来增强抗肿瘤免疫 | 肺腺癌中的PD-L1阳性肿瘤相关巨噬细胞 | NA | 肺腺癌 | 多重免疫组织化学,单细胞RNA测序 | NA | 图像,测序数据 | 来自接受免疫检查点抑制剂治疗的肺腺癌患者样本及公共单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 97 | 2026-01-30 |
CIPHER: An end-to-end framework for designing optimized aggregated spatial transcriptomics experiments
2026-Jan-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.08.698503
PMID:41542523
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为CIPHER的端到端框架,用于设计优化的聚合空间转录组学实验,通过联合优化实验编码矩阵和下游细胞嵌入,提高细胞类型可分离性和解码准确性 | CIPHER首次将实验编码矩阵和下游细胞嵌入联合优化,并将成像检测的物理限制直接整合到损失函数中,从而在提高区分能力的同时保持对测量噪声和信号约束的鲁棒性 | NA | 开发一个计算框架,用于设计基于聚合测量的空间转录组学实验,以实现与单细胞RNA-seq数据的高效准确整合 | 小鼠大脑单细胞RNA-seq参考数据 | 空间转录组学 | NA | 聚合转录特征测量,单细胞RNA-seq | 神经网络 | 转录组数据,模拟数据,实验数据 | 大规模小鼠大脑scRNA-seq参考数据 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 98 | 2026-01-30 |
The vulnerabilities of chemotherapy resistant pancreatic cancer revealed by organoids of pre- and post-neoadjuvant therapy
2026-Jan-19, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218252
PMID:41565051
|
研究论文 | 本研究利用新辅助治疗前后匹配的患者来源类器官,揭示了化疗耐药胰腺癌的脆弱性,特别是AG化疗激活KRAS和MAPK信号通路,为治疗干预提供了潜在靶点 | 建立了新辅助治疗前后匹配的胰腺癌患者来源类器官平台,首次在类器官模型中追踪并证实了AG化疗诱导KRAS/MAPK信号激活及耐药细胞亚群的出现 | 研究样本量有限,特别是匹配的治疗前后类器官对数量未明确说明;类器官模型可能无法完全模拟体内肿瘤微环境 | 揭示胰腺导管腺癌化疗耐药机制并寻找治疗靶点 | 胰腺导管腺癌患者组织、患者来源类器官、类器官来源异种移植模型 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、转录组分析 | NA | RNA测序数据、转录组数据 | 90例PDAC患者样本(30例AG治疗,60例未治疗)、29个类器官验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 99 | 2026-01-30 |
Single-cell transcriptomics combined with spatial proteomics defines phagocytes type-specific immune regulation in diabetic cataract
2026-Jan-19, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2026.110865
PMID:41565148
|
研究论文 | 本研究结合单细胞转录组学和空间蛋白质组学,定义了糖尿病性白内障中吞噬细胞类型特异性的免疫调控机制 | 首次在糖尿病性白内障中结合单细胞RNA测序和定量蛋白质组学,系统揭示了单核吞噬细胞(特别是促炎M1巨噬细胞)在疾病发展中的关键作用,并确定了MIF作为重要的巨噬细胞趋化因子 | 研究样本主要来自大鼠模型,人类样本验证有限;需要进一步研究这些免疫细胞的具体功能以设计靶向疗法 | 利用多组学数据研究糖尿病性白内障中免疫细胞的特征及其潜在机制 | 糖尿病大鼠的晶状体样本、糖尿病性白内障患者和年龄相关性白内障患者的前囊膜样本 | 数字病理学 | 糖尿病性白内障 | 单细胞RNA测序, 串联质量标签定量蛋白质组学, 免疫荧光染色, 前段光学相干断层扫描 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据, 成像数据 | 糖尿病大鼠和正常大鼠的晶状体样本、DC和ARC患者的前囊膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 定量蛋白质组学 | NA | NA |
| 100 | 2026-01-30 |
A dual-action core-shell microneedle system restores mitochondrial function and accelerates healing in diabetic wounds
2026-Jan-17, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04048-3
PMID:41547872
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研究论文 | 本文开发了一种用于治疗糖尿病伤口的新型核壳微针系统,通过顺序递送策略恢复线粒体功能并加速愈合 | 利用单细胞RNA测序识别了糖尿病伤口中上调的关键内皮靶点VDAC1,并设计了一种具有ROS响应外壳和光交联核心的双功能核壳微针系统,实现了抗氧化、抗菌与持续抑制VDAC1寡聚化的顺序治疗 | 研究主要基于动物模型(小鼠和猪),尚未进行人体临床试验;长期安全性和大规模生产可行性有待进一步评估 | 开发一种新型治疗平台,以解决糖尿病伤口愈合中由线粒体功能障碍和持续炎症导致的临床挑战 | 糖尿病伤口(小鼠和猪模型) | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 糖尿病小鼠和猪模型(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |