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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-04-24 |
[Advances in tumor-associated macrophage research driven by single-cell sequencing and spatial omics technologies]
2026-Apr, Xi bao yu fen zi mian yi xue za zhi = Chinese journal of cellular and molecular immunology
PMID:42020332
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综述 | 本文综述了单细胞测序和空间组学技术在肿瘤相关巨噬细胞研究中的进展 | 利用单细胞RNA测序和空间组学技术识别多种转录上不同、功能特化的TAM亚群,超越了传统的M1/M2极化框架 | NA | 探讨单细胞和空间组学技术如何推动肿瘤相关巨噬细胞研究及精准免疫治疗策略开发 | 肿瘤相关巨噬细胞(TAM)在各种实体肿瘤(包括胶质瘤、肝癌和乳腺癌)中的亚群 | 机器学习 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 空间组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间组学 | NA | NA |
| 82 | 2026-04-24 |
Quercetin improves retinal glycolysis to slow myopia progression through orchestrating the AKT/FOXO/HK2 axis
2026-Mar-31, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2026.104139
PMID:41980459
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研究论文 | 本文研究了槲皮素通过调控AKT/FOXO/HK2轴改善视网膜糖酵解以延缓近视进展的机制 | 首次通过多组学分析(单细胞RNA测序、蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学)揭示AKT/FOXO/HK2通路在近视进展中抑制糖酵解,并发现槲皮素可通过调控该通路恢复糖酵解、减轻氧化应激和神经元损伤 | 研究主要基于豚鼠模型,结论是否适用于人类近视尚需进一步验证 | 探讨视网膜糖酵解变化引起的氧化损伤如何促进近视,并评估槲皮素缓解该过程的效果 | 豚鼠视网膜组织及细胞 | 数字病理学 | 近视 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、免疫共沉淀、双荧光素酶实验、代谢组学 | NA | 测序数据、蛋白质数据、代谢组数据 | 近视豚鼠视网膜样本(具体数量未说明) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 83 | 2026-04-24 |
TAZ alleviates ischemic stroke injury by activating Foxo1: Usp1-mediated deubiquitination is the pivotal mechanism
2026-Mar-30, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 本文揭示了转录共激活因子TAZ通过Usp1介导的去泛素化稳定自身并激活Foxo1,从而减轻缺血性脑卒中氧化损伤和神经元凋亡的机制 | 首次发现Usp1-TAZ-Foxo1轴是缺血性脑卒中抗氧化防御和神经元存活的關鍵调控通路,并阐明了TAZ通过去泛素化稳定的分子机制 | 仅使用了小鼠模型和体外神经元损伤模型,研究结果尚需在临床样本中验证;机制细节如Usp1对TAZ的特异性调控仍需进一步探索 | 阐明转录共激活因子TAZ在缺血性脑卒中中调控氧化损伤的作用及其分子机制 | 缺血性脑卒中小鼠模型及氧糖剥夺/复氧神经元损伤模型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠脑组织样本,具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 84 | 2026-04-24 |
Integrated single-cell and spatial mapping coupled with machine learning unveils core stemness landscapes and regulatory drivers in triple-negative breast cancer
2026-Mar-23, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04824-5
PMID:41870799
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研究论文 | 整合单细胞和空间转录组数据,结合机器学习构建三阴性乳腺癌干细胞性景观及调控驱动因子模型 | 首次将单细胞RNA测序、空间转录组学和机器学习技术相结合,构建基于五个核心干性相关基因(CALD1, ANP32B, FIS1, CD82, APLP2)的预测模型,并揭示了高干性评分与不良预后及免疫逃逸的关联 | 研究主要基于公开数据集,缺乏独立的临床队列验证;虚拟敲除实验尚未在体内或体外模型中进行功能验证 | 解析三阴性乳腺癌中癌症干细胞相关干性特征的分子调控机制,并构建预测模型以指导个性化治疗 | 三阴性乳腺癌患者的单细胞、空间转录组和批量转录组数据 | 机器学习, 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量转录组学 | XGBoost, 机器学习 | 基因表达数据, 空间转录组数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 85 | 2026-04-24 |
Maternal opioid use and hepatitis C infection disrupt the placental immune landscape and structure
2026-Mar-17, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.199606
PMID:41842943
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研究论文 | 利用流式细胞术、组织学、空间和单细胞转录组学揭示母体阿片类药物使用障碍对胎盘免疫景观和结构的破坏性影响 | 首次综合运用空间和单细胞转录组学技术,系统揭示阿片类药物使用障碍对胎盘血管发育、免疫细胞通讯和稳态维持的干扰,并进一步按丙型肝炎感染状态分层分析 | 未提及样本量、因果关系验证及临床转化潜力 | 探究母体阿片类药物使用障碍对胎盘结构和功能的影响 | 胎盘组织,包含伴有或不伴有丙型肝炎共感染的母体样本 | 数字病理学 | 阿片类药物使用障碍 | 流式细胞术、组织学、空间转录组学、单细胞转录组学 | NA | 组织图像、基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | 10x Visium, 10x Chromium | 10x Visium 空间转录组学, 10x Chromium 单细胞转录组学 |
| 86 | 2026-03-19 |
Dissecting the immunosuppressive microenvironment of LAMA3 + malignant cells and SPP1 + macrophages in esophageal squamous cell carcinoma using single-cell and spatial transcriptomics
2026-Mar-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08004-5
PMID:41845425
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 87 | 2026-03-18 |
Integrative bibliometrics and spatial transcriptomics identify CAF-associated genes and immune niches in hepatocellular carcinoma
2026-Mar-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04694-x
PMID:41838222
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 88 | 2026-04-24 |
SPP1high fibrogenic macrophages mediate protective fibrotic remodeling and promote vascular stability in hypertension-associated aortic dissection
2026-Mar-16, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-04798-9
PMID:41840626
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研究论文 | 本研究鉴定出SPP1高表达的促纤维化巨噬细胞在高血压相关主动脉夹层中促进保护性纤维化重塑和血管稳定性 | 首次发现TGF-β1-SPP1轴驱动SPP1高表达促纤维化巨噬细胞的出现,该细胞群通过促进胶原组织化和降低炎症因子表达来稳定剥离的主动脉壁 | 样本量较小(每组3例进行单细胞测序),且主要基于小鼠模型验证,临床转化需进一步研究 | 揭示高血压相关主动脉夹层中促进血管壁稳定的巨噬细胞状态及其治疗潜力 | 高血压相关主动脉夹层患者、马凡综合征相关主动脉夹层患者及健康捐献者的胸主动脉和外周血样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 单细胞测序每组3例(共9例),临床样本每组30例(共90例),手术中采集样本10例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 89 | 2026-04-24 |
IDH2 Clonal Hematopoiesis and IKAROS Loss Cooperate in a B-ALL Subtype after Lenalidomide Therapy for Multiple Myeloma
2026-03-13, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025031047
PMID:41824395
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研究论文 | 该研究对57例来那度胺相关B细胞急性淋巴细胞白血病(LenB-ALL)进行了全面的分子特征分析,揭示了三种突变亚群,并发现IDH2 R140Q突变在LenB-ALL中高度富集 | 首次将来那度胺相关B-ALL定义为IDH2突变克隆造血与IKAROS缺失协同作用的分子亚型,并阐明了来那度胺通过促进IDH2突变克隆扩增及IKAROS下调导致B前体细胞成熟阻滞的致癌机制 | 研究样本量有限且为回顾性分析,未探索IDH2突变在不同种族人群中的差异,未明确继发白血病中其他遗传或表观遗传改变的具体类型 | 阐明来那度胺相关B-ALL的分子特征及致病机制 | 57例来那度胺治疗多发性骨髓瘤后继发B-ALL的患者标本 | 数字病理学 | B细胞急性淋巴细胞白血病, 多发性骨髓瘤 | NGS, RNA-seq, 甲基化测序, 单细胞RNA测序 | NA | DNA序列, RNA序列, 甲基化数据, 单细胞转录组数据 | 57例来那度胺相关B-ALL患者标本及对照样本 | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | NA |
| 90 | 2026-04-24 |
Insights from pooled CRISPRi single-cell screens in K562 cells reveal gene functions, regulatory networks, and highlight opportunities and limitations
2026-Mar-13, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-026-12667-1
PMID:41826830
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研究论文 | 本研究利用改良的CRISPRi单细胞筛选技术在K562细胞中敲低六个转录因子,重建基因调控网络并评估技术潜力与局限性 | 优化CROP-seq方案实现sgRNA高效捕获,无需单独富集步骤,并揭示如LMO2-GATA2等新调控相互作用 | 仅约40-50%靶基因实现有效敲低,扰动效率存在实验间差异,需进一步优化标准化 | 评估联合CRISPRi和单细胞RNA测序的筛选技术在基因功能解析和调控网络重建中的潜力与局限性 | K562细胞系中的六个转录因子(LMO2、TCF3、LDB1、MYB、GATA2、RUNX1) | 功能性基因组学 | NA | CRISPRi、单细胞RNA测序、CROP-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | K562细胞系,具体样本数未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | CROP-seq | 改良CRISPR droplet sequencing (CROP-seq) 方案,从cDNA文库直接捕获sgRNA |
| 91 | 2026-04-24 |
The MDM2-p53 Axis in Osteosarcoma: Current Understanding of Regulatory Mechanisms and Targeted Therapeutic Strategies
2026-Mar-13, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph19030476
PMID:41901322
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综述 | 系统阐述骨肉瘤中MDM2-p53通路的分子机制及靶向治疗策略 | 综述了新兴MDM2抑制剂(如APG-115)进入II期临床试验的突破进展,并引入单细胞测序和AI辅助药物设计加速开发 | 多数药物尚未在骨肉瘤专用队列中验证,早期抑制剂存在疗效有限与剂量限制性毒性 | 阐明MDM2-p53通路调控机制并总结靶向治疗策略 | 骨肉瘤患者及MDM2-p53通路相关分子机制 | 机器学习 | 骨肉瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 92 | 2026-04-24 |
Transcriptome combined with single-cell data to construct a prognostic model for glycosylation-related genes in osteosarcoma
2026-Mar-12, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04761-3
PMID:41820703
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研究论文 | 结合转录组和单细胞数据构建骨肉瘤糖基化相关基因的预后模型 | 首次系统性地将单细胞RNA测序数据与转录组数据结合,鉴定骨肉瘤中糖基化相关基因的预后价值,并构建了基于LASSO回归的预后模型 | 未明确指出具体局限,但可能包括数据集样本量有限和模型验证不足 | 鉴定骨肉瘤中糖基化相关预后基因并构建预后模型,探索其分子机制 | 骨肉瘤患者样本(来自GSE36001、TARGET-OS、GSE21257和GSE152048数据集) | 机器学习 | 骨肉瘤 | 转录组测序、单细胞RNA测序 | LASSO回归、Cox比例风险模型 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 未明确说明样本量,但涉及多个公开数据集(GSE36001、TARGET-OS、GSE21257和GSE152048) | NA | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | NA | NA |
| 93 | 2026-04-24 |
Pericytes and mesenchymal stromal cells converge toward pro-tumor phenotypes in the tumor microenvironment
2026-Mar-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04790-y
PMID:41811593
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综述 | 综述间充质基质细胞和周细胞在肿瘤微环境中向促肿瘤表型的趋同现象 | 提出了MSC-周细胞状态分类框架,强调了空间分辨多标志物分析的重要性 | 该领域仍需更多实验验证机制,且目前对表型趋同的理解还比较有限 | 探讨MSCs和周细胞在肿瘤微环境中功能趋同的角色及其对治疗的影响 | 肿瘤微环境中的间充质基质细胞和周细胞 | 分子生物学 | 结直肠癌, 血液系统恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 94 | 2026-04-24 |
Comprehensive In Silico Investigation of L-Glutamine Transporters and Metabolism in Glioblastoma
2026-Mar-11, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph19030455
PMID:41901300
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研究论文 | 通过计算生物学方法系统研究了胶质母细胞瘤中L-谷氨酰胺转运蛋白和代谢的调控机制 | 首次系统整合多组学数据(转录组、表观遗传、单细胞RNA测序等)鉴定了三个与谷氨酰胺代谢相关且具有预后意义的基因(CP、SLC25A13、SLC38A2),并揭示其通过不同机制驱动GBM恶性进展 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据,缺乏独立实验验证,药物基因组学分析和分子对接仅作为辅助验证层 | 系统鉴定胶质母细胞瘤中与谷氨酰胺代谢相关且具有预后意义和生物学合理性的调控因子 | 胶质母细胞瘤(GBM)中谷氨酰胺代谢相关基因 | 机器学习 | 脑肿瘤 | RNA测序、单细胞RNA测序、分子对接 | NA | 转录组数据、蛋白质表达数据、表观遗传数据、单细胞RNA测序数据 | TCGA和GTEx数据库的转录组数据,CGGA数据库的生存验证数据 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 95 | 2026-04-24 |
HIF3A-mediated aberrant activation of TXNIP promotes Alzheimer's disease progression
2026-Mar-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-43404-z
PMID:41807716
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示HIF3A通过转录上调TXNIP介导阿尔茨海默病中星形胶质细胞的异常氧化应激反应 | 首次在单细胞水平上鉴定了星形胶质细胞中HIF3A作为关键氧化应激相关基因,并阐明其通过直接结合TXNIP启动子促进阿尔茨海默病进展的分子机制 | NA | 探究阿尔茨海默病中细胞类型特异性的氧化应激机制 | 星形胶质细胞中HIF3A和TXNIP的调控关系 | 自然语言处理 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 96 | 2026-04-24 |
Spatial cartography of human thymus enables the geopositioning of lineage transcription factors in rare mimetic thymic epithelial cells
2026-Mar-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68596-w
PMID:41807357
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研究论文 | 利用Stereo-seq空间转录组学技术构建人类胎儿和儿童胸腺的高分辨率空间图谱,揭示稀有模拟胸腺上皮细胞中的谱系转录因子定位 | 首次应用Stereo-seq空间转录组学技术建立人类胎儿和儿童胸腺的高分辨率空间图谱,并定位调控稀有模拟胸腺上皮细胞的谱系转录因子 | 未提及具体限制,但可能涉及样本量有限(仅胎儿和儿童样本)以及空间分辨率的局限性 | 构建人类胸腺的高分辨率空间图谱,揭示稀有模拟胸腺上皮细胞中谱系转录因子的空间定位和调控机制 | 人类胎儿(受孕后13、14、17或18周)和儿童(7周、2、5或6岁)胸腺组织 | 空间转录组学 | NA | Stereo-seq空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | 空间转录组数据, 空间蛋白质组数据 | 多个胎儿(13、14、17或18周)和儿童(7周、2、5或6岁)胸腺样本 | BGI | 空间转录组学 | Stereo-seq | Stereo-seq空间转录组学平台 |
| 97 | 2026-04-24 |
Human neuronal differentiation under Aβ exposure: a single-cell transcriptomic and epigenomic dataset
2026-Mar-10, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-026-06971-4
PMID:41807428
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研究论文 | 本研究呈现了一个多模态单细胞数据集,记录人类诱导多能干细胞衍生的神经前体细胞在淀粉样蛋白-β暴露下进行神经分化的转录组和表观基因组动态 | 首次提供配对单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序的多模态数据集,用于在淀粉样蛋白-β暴露条件下分析神经分化过程中的转录和染色质可及性动力学 | 未明确指出局限 | 构建一个参考多模态数据集,支持人类NPC衍生神经分化的研究及单细胞、多模态整合和调控网络分析 | 人类诱导多能干细胞衍生的神经前体细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | NA | 基因表达数据,染色质可及性数据 | RNA测序42575个高质量细胞,ATAC测序30192个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 98 | 2026-04-24 |
Mechanism of action of Astragalus membranaceus for treating diabetic foot ulcers based on single-cell RNA sequencing data and network pharmacology
2026-Mar-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-41921-5
PMID:41807627
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研究论文 | 基于单细胞RNA测序数据和网络药理学探究黄芪治疗糖尿病足溃疡的作用机制 | 首次将单细胞RNA测序与网络药理学相结合,在单细胞分辨率下系统揭示黄芪通过调控巨噬细胞相关分子途径治疗糖尿病足溃疡的机制 | 结果基于公开数据集和分析手段,仍需进一步的功能和转化研究验证 | 探究黄芪治疗糖尿病足溃疡的潜在分子机制 | 糖尿病足溃疡患者和对照组的伤口组织样本中的巨噬细胞及其他细胞类型 | 生物信息学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序、网络药理学、分子对接、qPCR验证 | NA | 基因表达数据 | scRNA-seq队列:4例非糖尿病足溃疡和5例糖尿病足溃疡样本;临床验证队列:6例非糖尿病足溃疡和9例糖尿病足溃疡患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 99 | 2026-04-24 |
Gene expression dynamics of human and mouse craniofacial development at the single-cell level
2026-Mar-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70232-6
PMID:41803119
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研究论文 | 通过单细胞核RNA测序分析人类和老鼠颅面发育的基因表达动态 | 首次在单细胞水平上系统描绘人类颅面发育4至8周的细胞类型图谱,并比较人类与老鼠的发育保守性及差异,揭示细胞亚型对正常面部形态和唇腭裂风险的贡献 | 研究样本仅限于4至8周胚胎阶段,可能未覆盖更早或更晚发育时期的细胞动态;单细胞核测序可能遗漏某些细胞质的转录信息 | 阐明人类颅面发育过程中细胞类型的多样性和基因表达动态 | 人类和老鼠的颅面发育组织样本 | 单细胞组学 | 唇腭裂 | 单细胞核RNA测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 人类颅面发育样本(孕4至8周);老鼠发育阶段样本 | 10x Genomics | 单细胞核RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium | NA |
| 100 | 2026-04-24 |
Iron and Copper Homeostasis in Cardiometabolic Disease: Therapeutic Potential of Chelators
2026-Mar-09, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph19030441
PMID:41901288
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综述 | 本文综述了铁和铜稳态失衡在心代谢疾病中的作用,重点阐述了铁死亡和铜死亡两种细胞死亡形式,并探讨了金属螯合剂在治疗中的潜力 | 整合了单细胞转录组学、脂质组学和金属组学与机器学习衍生的基因特征,揭示了铁-铜轴的统一分子机制及其作为治疗靶点的可行性 | 翻译受限于生物标志物变异性、系统性安全性问题以及缺乏大型前瞻性临床试验 | 探讨铁和铜稳态在心代谢疾病中的机制,并评估金属螯合剂的治疗潜力 | 冠状动脉疾病、心肌梗死、心力衰竭、动脉粥样硬化和糖尿病并发症等心代谢疾病 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、脂质组学、金属组学 | 机器学习衍生的基因签名 | 文本 | 不适用 | NA | NA | NA | NA |