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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
81 2026-03-15
scPlantAnnotate: an accurate and robust transformer-based model for plant cell type annotation
2026-Jan-17, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本文介绍了scPlantAnnotate,一种基于Transformer的植物单细胞RNA测序细胞类型注释模型,旨在提高注释准确性和鲁棒性 开发了首个专门针对植物单细胞RNA测序数据的Transformer-based参考注释框架,在多个植物物种中表现出优于现有深度学习和传统方法的性能,特别是在处理未见数据集和组织类型时具有更强的鲁棒性 模型主要基于四个植物物种(拟南芥、玉米、水稻和大豆)的精选数据集训练,可能在其他植物物种上的泛化能力有待进一步验证 开发一个植物特异性的单细胞RNA测序细胞类型注释工具,以解决现有工具在植物数据上性能不佳的问题,支持植物细胞图谱构建和下游生物学发现 植物单细胞RNA测序数据,具体包括拟南芥、玉米、水稻和大豆的细胞类型注释 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序 Transformer 单细胞RNA测序数据 基于拟南芥、玉米、水稻和大豆的精选数据集,具体样本数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
82 2026-03-15
Deciphering the therapeutic mechanism of kaempferol in diabetic retinopathy via the P21/Thioredoxin axis
2026-Jan, Molecular and cellular biochemistry IF:3.5Q3
研究论文 本研究通过整合WGCNA和scRNA-seq分析,揭示了山柰酚通过调控P21/硫氧还蛋白轴在糖尿病视网膜病变中的治疗机制,并发现成纤维细胞活性与疾病纤维化进展的新关联 首次结合加权基因共表达网络分析和单细胞RNA测序技术,系统阐明山柰酚通过P21/硫氧还蛋白轴调控血管损伤和细胞衰老的新机制,并建立了成纤维细胞活性与糖尿病视网膜病变纤维化进程的分子联系 研究主要基于体外实验和动物模型,尚未进行临床试验验证;分子机制研究虽全面但部分通路相互作用仍需进一步验证 阐明山柰酚治疗糖尿病视网膜病变的分子机制,探索疾病从早期到晚期的进展规律 糖尿病视网膜病变的分子通路、细胞亚群及山柰酚的靶点 生物信息学与分子生物学 糖尿病视网膜病变 加权基因共表达网络分析、单细胞RNA测序、分子对接、Evans Blue渗漏实验、H&E染色、PAS染色、TUNEL染色、ELISA、免疫荧光、Western blotting、实时PCR NA 基因表达数据、单细胞转录组数据、分子对接数据、组织染色图像、蛋白质印迹数据、PCR数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
83 2026-03-15
Elucidating the mechanistic association of xylene inducing non-small cell lung cancer through network toxicology and molecular docking analysis
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究结合网络毒理学和分子对接分析,探讨二甲苯暴露与非小细胞肺癌(NSCLC)发生之间的潜在分子机制 首次整合网络毒理学、分子对接及单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据分析,系统揭示二甲苯异构体通过影响核心靶点基因(IL1A、H3C13、ITGAM、CCR5、COMT)及相关信号通路(如PI3K-Akt)促进NSCLC发展的分子机制 研究主要基于公共数据库和计算模拟分析,缺乏实验验证;核心靶点与通路的因果关系仍需体内外实验进一步证实 阐明环境二甲苯暴露诱导非小细胞肺癌的分子机制 二甲苯异构体(邻二甲苯、间二甲苯、对二甲苯)及其潜在作用靶点与信号通路 计算毒理学 肺癌 网络毒理学、分子对接、单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据分析、GO与KEGG富集分析 分子对接模型、蛋白-配体相互作用模型 基因表达数据、蛋白结构数据、化合物-靶点相互作用数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
84 2026-03-15
From genes to diagnosis: The impact of UNC5B and DOK5 in intracranial aneurysm detection and pathogenesis
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过整合机器学习、免疫浸润分析和单基因测序,探讨了UNC5B和DOK5基因在颅内动脉瘤检测和发病机制中的作用 首次将机器学习算法(LASSO、随机森林、SVM-RFE)与免疫细胞浸润分析及单细胞测序相结合,识别出UNC5B和DOK5作为颅内动脉瘤的潜在诊断生物标志物,并揭示了UNC5B在成纤维细胞中的表达与M1巨噬细胞浸润的关联 研究基于公共数据库的微阵列数据,样本可能有限,且未进行大规模前瞻性临床验证,外部验证数据集可能不足 探索颅内动脉瘤的诊断生物标志物和发病机制 颅内动脉瘤患者和健康对照的基因表达数据 机器学习 颅内动脉瘤 单基因测序、微阵列分析 LASSO、随机森林、SVM-RFE 基因表达数据 基于GEO数据库的微阵列数据,具体样本数量未明确说明 NA 单基因测序 NA NA
85 2026-03-15
PFKFB2-Induced Glycolysis and Ferroptosis in Diabetic Nephropathy by HIF-1α
2026, Critical reviews in eukaryotic gene expression IF:1.5Q4
研究论文 本研究探讨了PFKFB2在糖尿病肾病中的作用及其通过HIF-1α信号通路调节糖酵解和铁死亡的分子机制 揭示了PFKFB2通过抑制HIF-1α泛素化来调节线粒体ROS诱导的铁死亡,从而影响糖尿病肾病进程的新机制 研究主要基于动物模型和细胞实验,缺乏大规模临床样本验证 探究PFKFB2在糖尿病肾病发病机制中的作用及潜在治疗靶点 糖尿病肾病小鼠模型和高糖刺激的人肾近端小管HK-2细胞 数字病理学 糖尿病肾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 DN小鼠模型和HK-2细胞系 NA 单细胞RNA-seq NA NA
86 2026-03-15
Stress-Induced Disruption of Circadian and Neuroimmune Networks in Lacrimal Glands Drives Dry Eye Pathogenesis
2025-Dec-01, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 本研究探讨了慢性心理压力如何通过破坏泪腺的昼夜节律和神经免疫网络,驱动干眼病的发病机制 首次揭示了慢性压力导致泪腺昼夜节律输出解耦,并明确了神经内分泌信号在干眼病发病中的关键作用 研究仅使用雄性小鼠模型,未考虑性别差异;干预措施仅部分恢复功能,未完全逆转病理变化 研究慢性压力如何改变泪腺的昼夜节律调控及神经内分泌信号在压力诱导干眼病中的作用 雄性C57BL/6J小鼠的泪腺组织 生物医学研究 干眼病 RNA测序、单细胞RNA测序、免疫组织化学、血浆激素检测 JTK_CYCLE算法 转录组数据、单细胞数据、组织学图像 未明确具体样本数量,但涉及多个时间点采集的小鼠泪腺组织 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
87 2026-03-15
Distinct stromal cell populations define the B-cell acute lymphoblastic leukemia microenvironment
2025-Nov, Leukemia IF:12.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了B细胞急性淋巴细胞白血病微环境中不同的间质基质细胞亚群及其功能 首次在B-ALL患者中识别出两种不同的间质基质细胞亚群(早期间质祖细胞和成脂祖细胞),并通过空间转录组学发现第三种骨活检特有的成骨谱系细胞,阐明了这些细胞亚群通过分泌特定因子支持白血病细胞生存和化疗耐药的新机制 研究主要基于儿科B-ALL患者样本,结果在成人患者中的普适性未验证,且功能实验主要在体外进行,体内验证有限 解析B细胞急性淋巴细胞白血病骨髓微环境的细胞异质性及其在疾病进展中的作用 儿科B-ALL患者的骨髓穿刺样本和骨活检样本中的间质基质细胞 单细胞组学 B细胞急性淋巴细胞白血病 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 儿科B-ALL患者的骨髓穿刺样本和骨活检样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
88 2026-03-15
Altered Epithelial-Mesenchymal Progenitor States Lead to Matrix Deposition, Tissue Inflammation, and Transitional Epithelial State in Congenital Diaphragmatic Hernia
2025 Nov-Dec, Fetal and pediatric pathology IF:0.7Q4
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了先天性膈疝(CDH)肺中上皮-间质祖细胞状态的改变,导致基质沉积、组织炎症和上皮细胞过渡状态,从而影响肺发育 首次在CDH模型中利用单细胞RNA测序技术系统分析了间质祖细胞的异常状态及其对上皮-间质转化动态和炎症信号通路的干扰 研究基于大鼠模型,结果向人类临床转化的直接适用性有待验证;样本量相对有限 探究先天性膈疝肺发育异常的细胞和分子机制 正常和CDH胎鼠肺组织(E17、E19、E21时间点) 数字病理学 先天性膈疝 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫染色 Seurat 单细胞转录组数据、图像数据 正常和CDH胎鼠肺组织(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
89 2026-03-15
CD81+ senescent-like fibroblasts exaggerate inflammation and activate neutrophils via C3/C3aR1 axis in periodontitis
2025-Aug-13, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究探讨了细胞衰老在牙周炎发病机制中的作用,发现CD81+衰老样成纤维细胞通过C3/C3aR1轴加剧炎症并激活中性粒细胞 首次在牙周炎中鉴定出CD81高表达的衰老牙龈成纤维细胞亚群,并阐明其通过C3/C3aR1轴招募中性粒细胞、维持炎症反应的新机制 研究主要基于小鼠模型和有限的人体样本,临床转化潜力需进一步验证;衰老细胞的具体清除机制尚未完全阐明 探究细胞衰老在牙周炎发病机制中的作用及分子基础 牙周炎患者样本、小鼠牙周炎模型、牙龈成纤维细胞 单细胞组学 牙周炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 人类牙周炎样本及小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
90 2026-03-15
Cerulenin partially corrects the disrupted developmental transcriptomic signature in Huntington's disease striatal medium spiny neurons
2025-Jul-21, Stem cells (Dayton, Ohio)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了亨廷顿病(HD)诱导多能干细胞分化的纹状体中型多棘神经元(MSNs)的发育轨迹,并发现HD MSNs中多个关键基因下调,导致发育异常 利用单细胞RNA测序技术模拟人类胎儿纹状体神经元发育轨迹,首次在HD MSNs发育模型中识别出DLX家族转录因子等关键基因的下调,并通过L1000数据集筛选出新型小分子Cerulenin,部分恢复HD MSNs的DARPP-32水平和电活动 研究基于体外诱导多能干细胞模型,可能无法完全模拟体内神经发育的复杂性;Cerulenin的恢复效果仅为部分,且其长期影响和机制需进一步验证 探究突变HTT蛋白对MSNs发育的影响,并寻找能纠正HD相关转录组异常的小分子化合物 亨廷顿病诱导多能干细胞(iPSCs)及其等基因对照分化的纹状体中型多棘神经元(MSNs) 神经科学 亨廷顿病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 HD iPSCs和等基因对照分化的神经元群体,包括早期、中间祖细胞和新生MSNs NA 单细胞RNA测序 NA NA
91 2026-03-15
Integrative analysis of single-cell transcriptomics and genetic associations identify cell states associated with vascular disease
2025-04, Atherosclerosis IF:4.9Q1
研究论文 本研究通过整合单核RNA测序数据和遗传关联分析,识别了与血管疾病相关的细胞状态 开发了新的计算方法整合GWAS数据与单核表达谱,揭示了VSMC和成纤维细胞在疾病中的表型连续体 样本量相对较小(正常n=7,动脉瘤n=9,动脉粥样硬化n=2),且仅针对人类升主动脉组织 识别血管疾病早期功能障碍相关的特定血管亚群和中间细胞状态 人类升主动脉组织(正常、动脉瘤性和动脉粥样硬化) 数字病理学 心血管疾病 单核RNA测序(snRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 18个样本(7个正常,9个动脉瘤,2个动脉粥样硬化) NA 单核RNA-seq NA NA
92 2026-03-15
An accelerated human in-vitro aging model mimicsin-vivo aging and facilitates dynamic testing of anti-aging compounds
2025-Mar-28, Research square
研究论文 本研究开发了一种加速的人类体外衰老模型,模拟体内衰老过程,并用于动态测试抗衰老化合物 通过长期有丝分裂后培养人类成纤维细胞,真实再现并加速了体内衰老特征,结合单细胞转录组学揭示了衰老异质性,并利用该平台评估了抗衰老化合物的疗效 模型基于成纤维细胞,可能无法完全代表所有细胞类型的衰老过程,且体外环境与体内存在差异 研究人类特异性衰老动力学,开发实验平台以预测抗衰老治疗效果 人类成纤维细胞及其衍生的神经元 生物医学研究 衰老相关疾病 转录组学、表观遗传学分析、单细胞转录组学 体外衰老模型 转录组数据、表观遗传数据 未明确指定样本数量,但涉及成纤维细胞的长期培养和单细胞分析 NA 单细胞RNA-seq NA NA
93 2026-03-15
DNTT-mediated DNA damage response drives inotuzumab ozogamicin resistance in B-cell acute lymphoblastic leukemia
2025-Mar-13, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本文通过全基因组CRISPR筛选发现DNTT缺失是B细胞急性淋巴细胞白血病对伊珠单抗奥佐米星耐药的主要驱动因素 首次揭示DNTT在调节伊珠单抗奥佐米星诱导的DNA损伤反应和白血病耐药中的关键作用,并利用单细胞RNA测序展示了白血病内异质性 研究主要基于体外和动物模型,临床验证样本有限,耐药机制可能涉及其他因素 探究B细胞急性淋巴细胞白血病对伊珠单抗奥佐米星耐药的遗传基础 B细胞急性淋巴细胞白血病细胞 NA B细胞急性淋巴细胞白血病 全基因组CRISPR筛选,单细胞RNA测序 NA 基因组数据,RNA测序数据 儿童肿瘤学组试验AALL1621中的B-ALL患者样本及患者来源异种移植模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
94 2026-03-15
Single-cell atlas of endothelial cells in atherosclerosis: identifying C1 CXCL12+ ECs as key proliferative drivers for immunological precision therapeutics in atherosclerosis
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术绘制了动脉粥样硬化中内皮细胞的图谱,识别出C1 CXCL12+ ECs作为关键增殖驱动亚群,并探讨其在疾病进展中的作用 首次通过单细胞RNA测序全面绘制动脉粥样硬化内皮细胞图谱,识别出C1 CXCL12+ ECs这一关键增殖驱动亚群,并揭示FOXM1在其中的调控作用 NA 揭示动脉粥样硬化中内皮细胞的异质性及其在疾病进展中的关键作用,为精准免疫治疗提供新靶点 动脉粥样硬化中的内皮细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
95 2026-03-15
Analysis of head and neck cancer scRNA-seq data identified PRDM6 promotes tumor progression by modulating immune gene expression
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序数据和IRIS3平台分析头颈鳞状细胞癌,发现PRDM6通过调控免疫基因表达促进肿瘤进展 首次发现组蛋白甲基转移酶PRDM6在头颈癌中通过诱导免疫应答基因表达促进肿瘤细胞增殖的新功能,并揭示HPV病毒癌蛋白通过上调PRDM6表达与HPV阳性头颈癌相关 未明确说明样本量大小,机制研究可能仍需进一步实验验证 探究头颈鳞状细胞癌中免疫应答基因调控网络及其在肿瘤进展中的作用机制 头颈鳞状细胞癌患者样本 数字病理学 头颈癌 单细胞RNA测序 IRIS3(细胞类型特异性调控网络推断工具) 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
96 2026-03-15
Interleukin-1β Drives Disease Progression in Arrhythmogenic Cardiomyopathy
2024-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单核RNA测序和空间转录组学分析,揭示了白细胞介素-1β在致心律失常性心肌病进展中的关键作用,并探索了靶向IL-1β的治疗潜力 首次结合单核RNA测序和空间转录组学技术,在ACM患者心肌样本中识别出炎症-纤维化空间微环境,并验证了靶向IL-1β抗体在动物模型中的治疗效果 研究样本量有限,且动物模型结果需进一步在人类临床试验中验证 探究致心律失常性心肌病的疾病进展机制并评估潜在治疗靶点 ACM患者心肌样本、对照捐赠者样本及Desmoglein-2突变小鼠模型 数字病理学 心血管疾病 单核RNA测序, 空间转录组学 NA RNA序列数据, 空间转录组数据 ACM患者和对照捐赠者的心肌样本(具体数量未明确),以及Desmoglein-2突变小鼠 NA 单核RNA测序, 空间转录组学 NA NA
97 2026-03-15
Gene Regulatory Network Analysis of Decidual Stromal Cells and Natural Killer Cells
2024-10, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
研究论文 本文通过单细胞转录组数据分析,首次对早孕期蜕膜基质细胞和自然杀伤细胞进行了基因调控网络分析,揭示了与妊娠成功相关的关键转录因子 首次对早孕期蜕膜基质细胞和自然杀伤细胞亚群进行基因调控网络分析,发现了新的蜕膜化驱动转录因子(如DDIT3和BRF2)以及免疫耐受相关的转录因子(如IRX3和RELB) 研究基于第一孕期妊娠终止样本的单细胞转录组数据,样本来源和时间点可能存在局限性 研究蜕膜基质细胞和自然杀伤细胞的转录调控网络,以理解其在妊娠成功中的作用机制 早孕期蜕膜基质细胞和自然杀伤细胞 单细胞转录组学 妊娠相关疾病 单细胞RNA测序 基因调控网络分析 单细胞转录组数据 第一孕期妊娠终止样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
98 2026-03-15
Age-related epithelial defects limit thymic function and regeneration
2024-Sep, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞和空间转录组学等技术,揭示了胸腺衰老过程中出现的两种非典型胸腺上皮细胞状态,它们限制了胸腺功能和再生能力 首次发现并定义了两种与年龄相关的非典型胸腺上皮细胞状态,揭示了它们通过消耗TEC生长因子和干扰再生通路来限制胸腺功能的机制 未明确aaTECs的具体起源和调控其形成的上游信号通路,也未在人体中验证这些发现 探究胸腺随年龄增长功能衰退和再生能力下降的细胞和分子机制 小鼠胸腺中的非造血基质细胞,特别是胸腺上皮细胞 空间转录组学 衰老相关免疫缺陷 单细胞转录组学, 空间转录组学, 谱系追踪, 先进成像技术 NA 转录组数据, 图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
99 2026-03-15
Gut-Derived Exosomes Mediate the Microbiota Dysbiosis-Induced Spermatogenesis Impairment by Targeting Meioc in Mice
2024-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究揭示了肠道菌群失调通过肠道来源的外泌体miR-211-5p靶向睾丸中的Meioc基因,从而干扰减数分裂过程并损害精子发生 首次阐明了非生殖组织来源的外泌体在精子发生调控中的作用,定义了“肠道-睾丸”轴的新机制 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证;具体信号通路细节需进一步探索 探究肠道菌群失调导致雄性生育能力下降的调控机制 小鼠(包括肠道菌群失调模型和野生型小鼠) 生殖生物学 生育障碍 单细胞测序 NA 测序数据 未明确指定样本数量的小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
100 2026-03-15
Pan-Cancer Single-Cell and Spatial-Resolved Profiling Reveals the Immunosuppressive Role of APOE+ Macrophages in Immune Checkpoint Inhibitor Therapy
2024-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过整合单细胞和空间转录组数据,揭示了APOE+巨噬细胞在免疫检查点抑制剂治疗中的免疫抑制角色,并构建了一个预测模型 首次结合单细胞RNA测序、机器学习及空间转录组技术,系统性地探究了APOE+巨噬细胞在泛癌种ICI治疗中的免疫抑制机制,并开发了基于巨噬细胞特征的预测模型 模型验证主要基于回顾性数据,前瞻性临床验证有待加强;机制研究虽结合了体内外实验,但具体信号通路细节仍需进一步阐明 探究巨噬细胞异质性对免疫检查点抑制剂治疗响应的影响,并开发预测模型 泛癌种患者样本、三阴性乳腺癌患者样本、4T1荷瘤小鼠模型 数字病理学 泛癌种(重点关注三阴性乳腺癌) 单细胞RNA测序,空间转录组技术,多重免疫组化,机器学习 机器学习算法(具体未指明,如SVM、随机森林等) 单细胞RNA测序数据,bulk RNA测序数据,空间转录组数据,图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
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