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当前共找到 45642 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-11-11 |
An integrated bioinformatics analysis reveals that targeted activation of IL7R may reduce influenza A virus infection risk in patients with depression
2026-Aug-08, Virology journal
IF:4.0Q2
DOI:10.1186/s12985-026-03272-5
PMID:43004330
|
研究论文 | 通过整合生物信息学分析、孟德尔随机化、单细胞测序、分子对接与分子动力学模拟及体外实验，揭示IL7R是抑郁症合并甲型流感病毒感染的潜在治疗靶点，并筛选出sanguinarine作为候选化合物 | 首次将孟德尔随机化与多组学生物信息学分析相结合，系统揭示抑郁症对流感易感性的因果关系；发现IL7R为连接抑郁症与IAV感染的关键基因；通过虚拟敲除模拟和分子动力学模拟筛选并验证sanguinarine可靶向激活IL7R并抑制病毒复制 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据与体外细胞实验，缺乏体内动物模型和临床队列验证；样本来源和人群背景可能影响结果的普适性 | 探究抑郁症增加甲型流感病毒易感性的分子机制，并寻找潜在治疗靶点及候选化合物 | 抑郁症患者相关基因表达数据、甲型流感病毒感染相关数据集、IAV感染的Jurkat T细胞 | 生物信息学、机器学习 | 抑郁症、流感 | 孟德尔随机化分析、差异表达基因分析、PPI分析、GO/KEGG富集分析、ROC曲线分析、免疫浸润分析、单细胞RNA测序、虚拟敲除模拟、分子对接、分子动力学模拟、体外细胞实验 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 82 | 2026-11-11 |
Radiotherapy and tertiary lymphoid structures: balancing immune activation and immune damage in cancer immunotherapy
2026-07-22, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-026-02735-1
PMID:42482188
|
综述 | 该综述系统总结了放疗与三级淋巴结构（TLS）之间的双向关系，探讨放疗如何通过免疫原性细胞死亡等机制促进TLS形成，以及高剂量或大范围照射如何破坏已形成的TLS，并评估了多种优化策略 | 提出放疗与TLS生物学存在双向调控关系，系统区分了已验证机制与间接证据及假设性转化概念，并综合评估了淋巴结感知规划、质子/重离子治疗、FLASH放疗、血管正常化、STING或LTβR激动剂及免疫检查点阻断联合等研究性策略 | 为综述性文章，缺乏原始实验数据；所讨论的优化策略多处于研究阶段而非已确立的TLS导向临床干预；部分机制基于间接证据或假设性概念 | 总结放疗与三级淋巴结构生物学双向关系的现有证据，探讨剂量、分割方式、时机、照射体积、淋巴结管理和放疗模式如何影响抗原呈递、淋巴细胞可用性及局部免疫结构，并评估潜在的优化策略 | 肿瘤微环境中的三级淋巴结构（TLS）及放疗对其的影响 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 83 | 2026-11-11 |
Evidence of endothelial anergy and T-cell exclusion in microsatellite stable colorectal liver metastases revealed through human hemi-liver perfusion and spatial transcriptomics
2026-07-20, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-026-02732-4
PMID:42477793
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研究论文 | 该研究通过常温肝脏机器灌注和空间转录组学技术，揭示微卫星稳定型结直肠癌肝转移中内皮细胞无反应性和T细胞排斥的免疫逃逸机制 | 首次将常温肝脏机器灌注重新用作MSS CRLM的临床前模型，使标记T细胞能够通过生理血管途径递送至活体载瘤人肝脏；同时在单细胞分辨率下对约190万个细胞进行空间转录组映射，并结合19标志物多重免疫荧光验证 | 研究为观察性研究，需要进一步机制性工作来验证这些发现，以指导新型免疫治疗药物的开发 | 解析微卫星稳定型结直肠癌肝转移及周围肝脏微环境的空间和分子特征，阐明其免疫逃逸机制 | 微卫星稳定型结直肠癌肝转移患者及周围肝脏组织 | 空间转录组学、肿瘤免疫学 | 结直肠癌肝转移 | 空间转录组学、多重免疫荧光、常温肝脏机器灌注 | NA | 空间转录组数据、图像 | 约190万个细胞的单细胞分辨率空间转录组数据，以及一个验证队列的19标志物多重免疫荧光 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 84 | 2026-11-11 |
Remodeling of the tumor microenvironment in muscle-invasive bladder cancer: insights from single-cell and spatial transcriptomics after neoadjuvant immunochemotherapy
2026-07-17, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-026-02738-y
PMID:42464338
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研究论文 | 该研究结合单细胞RNA测序和空间转录组学，揭示肌层浸润性膀胱癌新辅助免疫化疗后肿瘤微环境的重塑特征 | 首次整合单细胞和空间转录组学解析MIBC新辅助免疫化疗应答者与非应答者的免疫细胞亚群、细胞通讯网络及空间分布差异，发现巨噬细胞来源CXCL8与CAFs的空间共定位及SPP1信号在耐药中的作用 | 样本量较小，仅纳入4例未治疗对照、3例应答者和3例非应答者，需更大规模队列验证 | 探究肌层浸润性膀胱癌新辅助免疫化疗后肿瘤免疫微环境的关键免疫细胞亚群、细胞间通讯网络和空间分布，识别与治疗应答相关的细胞和空间特征 | 肌层浸润性膀胱癌患者的肿瘤组织样本，包括未治疗对照、nICT应答者和非应答者 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学测序 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据, 医学影像 | 10例患者组织样本（4例未治疗对照、3例nICT应答者、3例nICT非应答者） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 85 | 2026-11-11 |
Mutation-specific dynamics of dedifferentiation trajectories and tumor-stromal interactions in thyroid cancer
2026-07-16, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-026-02699-2
PMID:42458477
|
研究论文 | 该文整合单核RNA测序、空间转录组和bulk RNA测序，揭示BRAF与RAS驱动甲状腺癌去分化轨迹及肿瘤-基质相互作用的突变特异性动态 | 首次系统比较BRAF与RAS驱动甲状腺癌的去分化轨迹差异，发现BRAF肿瘤呈渐进去分化伴免疫通路激活，RAS肿瘤呈突变式转变伴非整倍体、EMT、缺氧和ECM重塑，并鉴定突变特异性CAF-上皮配体-受体互作回路（如整合素信号、PLAU-PLAUR、TNFSF10-TNFRSF10B、AREG-EGFR） | 摘要未提及具体样本量、随访数据及功能验证实验，结论主要基于转录组和空间关联分析，因果关系和临床转化价值尚需进一步验证 | 阐明BRAF和RAS驱动突变如何塑造甲状腺癌去分化轨迹和肿瘤微环境重塑，为晚期甲状腺癌的分子分型治疗提供依据 | BRAF驱动和RAS驱动的甲状腺肿瘤（包括分化型甲状腺癌至未分化甲状腺癌进展样本） | 数字病理学、肿瘤生物学 | 甲状腺癌 | 单核RNA测序、空间转录组学、bulk RNA测序 | NA | 转录组数据、空间转录组数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 86 | 2026-11-11 |
Reprogramming the pancreatic ductal adenocarcinoma microenvironment: a novel integrin-targeted cytotoxin, ProAgio, potentiates chemotherapy
2026-07-03, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-026-02725-3
PMID:42399938
|
研究论文 | 该研究探讨了新型整合素靶向细胞毒素ProAgio与标准化疗联合使用，通过重塑胰腺导管腺癌肿瘤微环境来增强化疗疗效。 | 首次将新型整合素靶向细胞毒素ProAgio与标准化疗（FOI或GPTx）联合应用于PDAC的基因工程小鼠和原位小鼠模型，揭示其通过抑制活化CAFs和内皮细胞、减少缺氧、重编程免疫微环境及抑制肿瘤干性来增强化疗疗效的新机制。 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证；ProAgio联合化疗的安全性和有效性仍需进一步评估。 | 探究ProAgio联合标准化疗对胰腺导管腺癌肿瘤微环境的重塑作用及增强化疗疗效的潜力。 | 胰腺导管腺癌（PDAC）的基因工程小鼠模型（KPC GEM）和原位小鼠模型，以及mKPC-GB-Luc和KPC-ML1-Luc细胞系。 | 肿瘤生物学、肿瘤微环境、转化医学 | 胰腺癌 | bulk RNA测序、单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组织化学、多重免疫荧光（COMET）、哌莫硝唑缺氧检测 | KPC基因工程小鼠模型、原位小鼠模型 | 基因表达数据、图像、流式细胞数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 87 | 2026-11-11 |
IL-17-driven tumor cell-intrinsic inflammatory programming creates an immunotherapy-permissive microenvironment
2026-06-30, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-026-02726-2
PMID:42380903
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研究论文 | 该文通过免疫组化分析和转录组数据，揭示了IL-17驱动的肿瘤细胞内在炎症编程可将卵巢透明细胞癌的免疫微环境重塑为免疫治疗允许状态 | 首次阐明IL-17通过激活NF-κB依赖的炎症程序直接重塑OCCC肿瘤免疫微环境，并发现IL17A高表达亚群可独立于MSI和TMB预测免疫检查点治疗敏感性 | IL17A高表达亚群仅占5%，样本量有限且未与生存关联；机制验证主要依赖小鼠同种移植模型，人体临床验证不足 | 探究IL-17在卵巢透明细胞癌中对肿瘤细胞炎症信号、免疫微环境重塑及免疫检查点阻断响应性的作用 | 卵巢透明细胞癌（OCCC）患者肿瘤样本及免疫健全同种移植OCCC小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 卵巢癌 | 免疫组化、转录组分析、单细胞RNA测序 | 同种移植小鼠模型 | 图像、文本 | 180例OCCC转录组样本及同种移植小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 88 | 2026-11-11 |
Deconvoluting the cellular black box of cell therapies for osteoarthritis: A mandate for protocol standardization
2026-Jun-16, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2026.102916
PMID:42100557
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评论 | 本文评论了Chatterjee等人对MILES试验样本的单细胞转录组研究，指出BMAC成分的位点间技术变异掩盖了与治疗反应相关的生物学信号，呼吁在个性化基因组分析前标准化采集方案 | 强调细胞治疗中位点间技术变异对生物学信号的掩盖效应，提出治疗后动态相互作用可能比基线细胞状态更能决定疗效的新视角，并建立细胞骨科循证质量控制的基础框架 | 应答者与非应答者之间的差异较为细微，基线细胞状态对疗效的解释力有限，且研究受制于未标准化的采集方案带来的技术变异 | 探讨自体细胞疗法治疗膝骨关节炎的机制，评估BMAC和SVF的细胞组成及其与治疗反应的关系 | 膝骨关节炎患者及MILES临床试验样本中的骨髓抽吸浓缩物（BMAC）和基质血管组分（SVF） | 单细胞组学 | 骨关节炎 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 89 | 2026-11-11 |
CMS4 epithelial-intrinsic glycosyltransferase GALNT5 promotes tumor aggressiveness and correlates with poor survival in colorectal cancer
2026-06-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-57104-1
PMID:42259894
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析鉴定CMS4结直肠癌肿瘤上皮内在的糖基转移酶特征，并验证GALNT5在肿瘤侵袭性和预后中的作用 | 利用单细胞RNA测序克服基质信号干扰，首次定义CMS4肿瘤上皮内在的九基因糖基转移酶特征，并发现GALNT5作为独立预后标志物和治疗靶点 | GALNT5调控肿瘤侵袭性的具体分子机制未完全阐明，且未观察到经典EMT标志物或AKT/ERK信号通路的显著变化 | 区分CMS4肿瘤上皮细胞与其它细胞群体的糖基转移酶表达特征，并探究GALNT5在结直肠癌中的临床意义和功能 | 结直肠癌CMS4亚型肿瘤上皮细胞、结直肠癌细胞系及431例切除的结直肠癌标本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学 | NA | 文本、图像 | 431例结直肠癌切除标本及单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 90 | 2026-11-11 |
Platycodin D3 protects against sepsis-associated acute lung injury through direct inhibition of the PKM2-NLRP3 axis
2026-Jun, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2026.112443
PMID:41748044
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研究论文 | 该研究通过生物信息学分析和虚拟筛选发现天然产物桔梗皂苷D3（PD3）可直接结合PKM2，抑制PKM2-NLRP3轴，从而缓解脓毒症相关急性肺损伤 | 首次将天然产物桔梗皂苷D3鉴定为直接靶向PKM2的化合物，并揭示其通过破坏PKM2-NLRP3轴及改善巨噬细胞代谢功能障碍来缓解脓毒症诱导急性肺损伤的新机制 | 研究主要基于LPS诱导的小鼠模型和RAW264.7细胞系，缺乏临床患者样本的直接验证及PD3的药代动力学和安全性评估 | 探究桔梗皂苷D3对脓毒症诱导急性肺损伤的保护作用及其靶向PKM2-NLRP3轴的分子机制 | 脓毒症诱导急性肺损伤患者数据、LPS诱导的SI-ALI小鼠模型及RAW264.7巨噬细胞 | 机器学习, 数字病理学 | 脓毒症相关急性肺损伤, 肺癌相关炎症（非肿瘤） | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 分子对接, 微量热泳动, 表面等离子共振, 细胞热位移实验, Seahorse代谢分析 | NA | 基因表达数据, 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 91 | 2026-11-11 |
Intestinal epithelial formyl peptide receptor 2 contributes to intestinal epithelium homeostasis and injury repair by regulating intestinal stem cell and transit-amplifying cell proliferation and differentiation
2026-Jun, Life metabolism
DOI:10.1093/lifemeta/loaf045
PMID:42099526
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研究论文 | 该研究探讨了肠道上皮甲酰肽受体2（FPR2）在肠道上皮稳态和损伤修复中的作用，通过调节肠道干细胞和过渡扩增细胞的增殖与分化 | 首次揭示了肠道上皮FPR2通过PKC-ERK通路激活Wnt、Notch和Hippo信号通路调控肠道干细胞和过渡扩增细胞的增殖与分化，并证明FPR2激动剂可提高辐射后小鼠生存率并加速肠道上皮再生 | 研究主要基于小鼠模型和肠道类器官，尚未在人体中验证FPR2的作用；FPR2激动剂的具体分子机制和长期安全性仍需进一步研究 | 探究FPR2在肠道上皮稳态维持和损伤后再生中的作用及其分子机制，评估其作为化疗和放疗所致肠道损伤治疗靶点的潜力 | 小鼠肠道上皮细胞、肠道干细胞、过渡扩增细胞及肠道类器官 | 分子生物学、细胞生物学、再生医学 | 肠道损伤、化疗和放疗诱导的肠道损伤 | 基因敲除、肠道类器官培养、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据（RNA测序数据）、图像（组织学图像） | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 92 | 2026-11-11 |
NSCLC brain metastases exhibit reduced HLA-I antigen presentation machinery and immune evasion independent of IFNγ signaling defects
2026-05-28, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-026-02687-6
PMID:42210261
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研究论文 | 该研究通过多重定量免疫荧光、全转录组分析和空间转录组学，揭示NSCLC脑转移中HLA-I类抗原呈递机制下调且独立于IFNγ信号缺陷，并与免疫逃逸和不良预后相关 | 发现NSCLC脑转移中HLA-I类APM下调是独立于局部IFNγ信号缺陷的显著特征，挑战了传统认为IFNγ信号缺陷与APM下调相互依赖的观点，并鉴定了脑转移中APM通路的候选调节因子 | 样本量有限（两个患者队列），机制研究主要基于H2030细胞系模型，候选调节因子需进一步功能验证，空间转录组学数据规模较小 | 探究NSCLC脑转移中IFNγ信号和HLA-I类抗原呈递机制的改变及其在免疫逃逸和ICI耐药中的作用 | NSCLC患者的原发肿瘤、颅内转移和颅外转移组织，以及人NSCLC细胞系H2030及其脑转移对应株H2030-BrM3 | 数字病理学, 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 多重定量免疫荧光, 全转录组测序, 空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | 两个患者队列的原发肿瘤、颅内和颅外NSCLC转移组织，以及H2030和H2030-BrM3细胞系 | NA | 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 93 | 2026-11-11 |
HSPCs and Treg cells cooperate to preserve extramedullary hematopoiesis under chronic inflammation
2026-May-08, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adv9351
PMID:42090507
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研究论文 | 该研究利用慢性自身炎症性疾病小鼠模型，揭示了在慢性炎症条件下骨髓外造血干/祖细胞（HSPCs）与调节性T细胞（Treg）之间的相互支持关系 | 发现了血液、脾脏及炎症尾部与爪部存在髓外HSPCs；单细胞转录组揭示了髓外HSCs独特的表达谱，显著上调MHCII相关及免疫抑制基因；证明髓外CD53+ HSPCs可作为抗原提呈细胞促进Treg发育以控制慢性炎症，而Treg反过来保护髓外HSPCs | 研究基于小鼠慢性自身炎症性疾病模型，尚未在人类样本中验证，且髓外HSPCs与Treg相互作用的具体分子机制尚待进一步阐明 | 探究慢性炎症对骨髓外HSPCs的影响，以及髓外HSPCs在髓外造血和炎症调控中的作用 | 慢性自身炎症性疾病小鼠模型中的血液、脾脏及炎症尾部与爪部组织中的造血干/祖细胞和调节性T细胞 | 单细胞组学、免疫学 | 慢性自身炎症性疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据、文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 94 | 2026-11-11 |
Identification of high-risk cells in single-cell spatially resolved transcriptomics data using Diagnostic Evidence GAuge of Single-cells with spatial smoothing
2026-05-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag098
PMID:41934088
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研究论文 | 提出并评估DEGAS方法，利用基因表达的潜在表示和域适应技术将患者层面的疾病属性迁移到单个细胞，从而在单细胞空间分辨转录组数据中识别高风险细胞和区域 | 通过潜在表示与域适应将疾病属性从患者迁移到单个细胞，解决了现有方法只能将细胞类型或聚类与疾病属性关联而无法做到单细胞层面关联的问题，并新增空间平滑功能以适配多种scSRT平台 | 摘要中未明确说明方法的具体局限性 | 在单细胞空间分辨转录组数据中识别高风险细胞与区域，以深入理解特定疾病过程 | 肝细胞癌、皮肤黑色素瘤以及新生成的II型糖尿病Xenium数据集中的细胞与组织区域 | 空间转录组学、数字病理学 | 肝癌、皮肤黑色素瘤、II型糖尿病 | 单细胞空间分辨转录组学（scSRT）、单细胞RNA测序 | 域适应、潜在表示学习 | 基因表达数据、空间转录组图像/坐标数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞空间转录组学、单细胞RNA测序 | 10x Xenium | Xenium空间转录组平台（用于II型糖尿病数据集），并涉及多种scSRT平台数据 |
| 95 | 2026-11-11 |
From early-onset asthma to chronic obstructive pulmonary disease: potential mediating proteins and therapeutic targets
2026-May-03, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag209
PMID:42089751
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研究论文 | 该研究整合大规模遗传与蛋白质组数据，利用孟德尔随机化方法探究早发型哮喘向慢性阻塞性肺疾病进展的因果机制、潜在介导蛋白及治疗靶点 | 首次系统性地从遗传学角度揭示早发型哮喘到慢阻肺的因果关联，并鉴定出六个具有显著中介效应的蛋白（KREMEN1、BLMH、CNTN5、IL1RN、MIA、PILRA），结合单细胞转录组学、共定位分析、多组织eQTL和可成药性评估优先筛选出疾病特异性治疗靶点 | 摘要中未明确说明研究的具体局限性 | 探究早发型哮喘增加慢性阻塞性肺疾病风险的因果机制，识别潜在介导蛋白并优先筛选疾病特异性治疗靶点 | 早发型哮喘患者与慢性阻塞性肺疾病患者的大规模遗传和蛋白质组数据 | 机器学习, 数字病理学 | 肺癌, 心血管疾病 | 孟德尔随机化, 蛋白质组范围孟德尔随机化, 中介分析, 单细胞转录组学, 共定位分析, 表达数量性状位点分析, 可成药性评估 | NA | 遗传数据, 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据, 文本 | 7847个蛋白质数量性状位点（pQTLs） | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 96 | 2026-11-11 |
Ectopic expression of MUC5B in the respiratory bronchiole initiates endoplasmic reticulum stress in the IPF lung
2026-05-01, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2025-0261OC
PMID:41091081
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研究论文 | 利用空间转录组学揭示MUC5B在呼吸性细支气管异位表达引发内质网应激，进而驱动IPF肺纤维化的机制 | 首次在空间转录组水平揭示MUC5B在呼吸性细支气管与AT2细胞中的异位表达及其与内质网应激标志物XBP1的共定位，并实验验证MUC5B表达与支气管上皮内质网应激的直接关系 | 样本量有限（15例IPF和13例对照），仅捕获43个视野，体外实验验证范围有限，未涉及MUC5B驱动纤维化的完整下游通路 | 理解MUC5B驱动肺纤维化的发病机制，特别是MUC5B启动子变异如何通过内质网应激导致IPF | IPF患者和对照者的肺组织样本，以及体外支气管上皮细胞 | 空间转录组学 | 肺纤维化 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、图像 | 15例IPF和13例对照肺组织，共43个视野 | NanoString | 空间转录组学 | CosMx | CosMx空间分子成像平台，半监督聚类鉴定19种细胞类型 |
| 97 | 2026-11-11 |
Protocol for Single-Cell Dissociation, RNA Sequencing, and Isolation of Myoepithelial Cells and Fibroblasts from the Aged Lacrimal and Salivary Glands
2026-04-24, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/70441
PMID:42113735
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研究方法学论文 | 本文提出了一套针对衰老小鼠泪腺和唾液腺的优化单细胞解离、RNA测序及肌上皮细胞与成纤维细胞分选方案 | 针对衰老腺体纤维化增加、细胞脆弱和脂质蓄积等难题，采用分步酶解策略（Collagenase IV、Dispase II、DNase I，随后Accutase和DNase I），并结合BSA预包被耗材、控温控速操作、红细胞裂解和多级过滤，提高细胞活率和纯度；同时利用报告小鼠品系联合FACS实现肌上皮细胞和成纤维细胞的靶向分离 | 摘要未明确说明该方案的具体样本量、成功率统计、与现有方案的定量比较，以及是否经过scRNA-seq全流程验证 | 建立从衰老小鼠泪腺（并适用于年轻泪腺、结膜及其他外分泌组织）获取高质量可存活单细胞悬液，并分离特定细胞类型以用于下游单细胞RNA测序分析的可重复方案 | 衰老小鼠泪腺和唾液腺组织，以及年轻泪腺、结膜和其他外分泌组织 | 单细胞组学 | 干眼病、衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、酶解组织解离、FACS流式分选 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 98 | 2026-11-11 |
PEBP1 inhibition as a therapeutic target for neurological recovery in ischemic stroke
2026-04, Neurotherapeutics : the journal of the American Society for Experimental NeuroTherapeutics
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.neurot.2026.e00912
PMID:42066623
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研究论文 | 该研究结合单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析，鉴定缺血性脑卒中风险基因，并验证PEBP1抑制对神经功能恢复的治疗作用 | 首次通过整合单细胞转录组与大规模遗传学数据（孟德尔随机化与共定位分析）鉴定PEBP1等核心基因，并结合药物抑制与AAV介导的shRNA敲低实验验证PEBP1作为缺血性脑卒中治疗靶点的转化价值 | 机制研究主要局限于Akt/p38 MAPK信号通路的体外与动物模型验证，缺乏临床患者干预数据，且干预措施存在潜在脱靶效应 | 寻找缺血性脑卒中新的干预基因靶点并验证其促进神经功能恢复的治疗潜力 | 缺血性脑卒中患者遗传数据、大脑中动脉闭塞（MCAO）动物模型、氧糖剥夺条件下的细胞 | 机器学习, 数字病理学, 基因组学 | 缺血性脑卒中, 心血管疾病, 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 共定位分析, 定量PCR, 免疫荧光, shRNA敲低 | 孟德尔随机化模型, 共定位分析模型 | 单细胞转录组数据, 基因组数据, 图像, 文本 | 欧洲生物信息学研究所数据集34,593例病例和624,214例对照，独立验证集86,668例病例和1,503,898例对照，UK Biobank 26,052例病例和487,214例对照，以及MCAO动物模型和体外细胞实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 99 | 2026-11-11 |
Probing the Feasibility of Single-Cell Fixed RNA Sequencing from FFPE Tissue
2026-Feb-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27031605
PMID:41684032
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研究论文 | 该研究评估了从FFPE组织中进行单细胞固定RNA测序的可行性，并与新鲜组织样本进行了比较 | 开发并验证了scFFPE-seq技术，能够从FFPE组织块中分离细胞核进行单核RNA测序，克服了传统scRNA-seq对新鲜或冷冻样本的限制 | 研究仅使用了结肠、回肠和皮肤的新鲜组织样本作为对照，样本类型有限，未在更多类型的FFPE临床样本中验证 | 探究从FFPE组织中进行单细胞固定RNA测序的可行性，并评估其与新鲜组织样本的细胞类型注释和通路特征比较 | 结肠、回肠和皮肤组织样本（新鲜和FFPE） | 单细胞转录组学 | NA | 单核RNA测序 | NA | 基因表达数据、图像 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | Chromium Fixed RNA Profiling（scFFPE-seq） |
| 100 | 2026-11-11 |
Can LLMs Bridge Domain and Visualization? A Case Study on High-Dimension Data Visualization in Single-Cell Transcriptomics
2026-01, IEEE transactions on visualization and computer graphics
IF:4.7Q1
DOI:10.1109/TVCG.2025.3633869
PMID:41269823
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研究论文 | 本文旨在利用大语言模型分析单细胞转录组学领域文献中高维数据可视化的使用情况，通过分析1203篇论文中的2056个高维可视化，揭示领域内可视化的实际应用模式 | 提出了一种人机协同的大语言模型工作流程，结合图像处理和传统自然语言处理方法为三个目标大语言模型子任务准备结构化输入，并在整个过程中设置人工参与和验证的检查点，从而有效分析大量文献并将领域专业术语转化为标准化的数据和任务抽象 | 研究仅以单细胞转录组学高维数据可视化作为测试案例，可能无法完全推广到其他领域；依赖大语言模型和人工验证，可能存在主观性和效率限制 | 填补领域内可视化“在野外”使用情况的理解空白，探索使用大语言模型分析领域文献中可视化使用的潜力 | 单细胞转录组学领域的高维数据可视化相关文献 | 数据可视化 | NA | 大语言模型、图像处理、自然语言处理 | 大语言模型 | 文本、图像 | 1203篇论文，包含2056个高维可视化 | NA | NA | NA | NA |