单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 42641 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-08-20 |
Single-cell RNA sequencing reveals immune-peritubular myoid cell crosstalk driving testicular interstitial fibrosis in idiopathic non-obstructive azoospermia
2026-Jun-12, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-026-01600-4
PMID:42286720
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了特发性非梗阻性无精子症中免疫-睾丸肌样细胞相互作用驱动睾丸间质纤维化的机制 | 首次通过单细胞RNA测序解析iNOA中肌样细胞与免疫细胞的相互作用，并利用网络药理学和分子对接预测瑞戈非尼作为潜在治疗药物 | 研究样本量有限，需要更多临床样本和功能实验验证；瑞戈非尼的治疗效果尚未在体内模型中验证 | 揭示特发性非梗阻性无精子症的发病机制，探索潜在诊断和治疗靶点 | 特发性非梗阻性无精子症患者和健康对照者的睾丸组织 | 单细胞转录组学 | 特发性非梗阻性无精子症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 患有iNOA的患者和健康对照者的睾丸组织样本（具体数量未在摘要中提供） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 82 | 2026-08-20 |
MZB1 Modulates Inflammatory Severity in Severe Acute Pancreatitis through an IgA-Associated Intestinal Barrier Axis
2026-Jun-12, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-026-02534-2
PMID:42283950
|
研究论文 | 本研究通过纵向单细胞RNA测序分析轻度和重度急性胰腺炎患者外周血单核细胞，发现MZB1通过IgA相关的肠道屏障轴调节炎症严重程度 | 首次在急性胰腺炎中揭示适应性体液免疫，特别是MZB1在浆细胞分化和IgA产生中的作用，及其对肠道屏障完整性和巨噬细胞驱动炎症的调节 | 摘要未提供明确的局限性信息 | 探究适应性体液免疫在急性胰腺炎炎症调控中的作用，特别是MZB1的功能 | 轻度和重度急性胰腺炎患者的外周血单核细胞，以及实验性胰腺炎小鼠模型 | 单细胞转录组学、免疫学 | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、小鼠模型数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 83 | 2026-08-20 |
CAF-derived PTGDS drives pancreatic cancer neuroendocrine differentiation and chemoresistance via PAQR9-MAPK
2026-Jun-11, Oncogenesis
IF:5.9Q1
DOI:10.1038/s41389-026-00634-0
PMID:42276991
|
研究论文 | 本研究揭示了癌症相关成纤维细胞分泌的PTGDS通过PAQR9-MAPK信号轴驱动胰腺导管腺癌的神经内分泌分化及化疗耐药 | 首次发现CAF源性PTGDS通过其膜受体PAQR9激活MAPK信号通路，促进胰腺癌神经内分泌分化和化疗耐药，提出新的CAFs/PTGDS-PAQR9-MAPK信号轴 | 摘要中未提及研究的局限性 | 探究胰腺导管腺癌微环境中癌症相关成纤维细胞如何调控神经内分泌分化及其对化疗耐药的影响 | 胰腺导管腺癌临床样本、转录组数据集、癌细胞系及癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、转录组测序（RNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据、转录组数据、临床标本 | 摘要中未明确样本量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞3'文库制备 |
| 84 | 2026-08-20 |
ScEnsemble: weighted hypergraph ensemble clustering for single-cell RNA sequencing
2026-Jun-11, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-026-06525-w
PMID:42277645
|
研究论文 | 提出ScEnsemble，一种基于质量的加权超图集成聚类框架，用于单细胞RNA测序数据的细胞聚类 | 通过质量权重整合多个基础聚类算法，利用超图表示聚类共分配关系，并结合多种共识算法，优于单一算法和未加权的集成方法 | 未明确提及，但可能包括对计算资源的较高需求以及在不同数据类型上的泛化性需进一步验证 | 解决单细胞RNA测序数据中聚类算法选择的不确定性问题，提供稳定且高质量的细胞聚类方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群体 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 超图集成聚类 | 基因表达数据 | 五个单细胞RNA测序数据集及一个乳腺癌肿瘤微环境数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 85 | 2026-08-20 |
Integrated single cell and spatial transcriptomics reveals the cellular and molecular mechanisms underlying UCMSCs treatment of ovarian aging in tree shrews
2026-Jun-11, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-026-05089-z
PMID:42277867
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术，揭示了脐带间充质干细胞治疗树鼩卵巢衰老的细胞和分子调控机制 | 首次整合单细胞和空间转录组学，系统解析了UCMSCs治疗卵巢衰老的细胞空间图谱和分子机制，并发现UBB作为潜在治疗靶点 | UCMSCs治疗未能完全恢复年轻组水平，且研究仅在树鼩模型中进行 | 阐明UCMSCs治疗卵巢衰老的细胞和分子调控机制，探索潜在治疗靶点 | 老年雌性树鼩的卵巢和外周血 | 数字病理学 | 卵巢衰老 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、HE染色、ELISA、免疫组化、免疫荧光 | NA | 基因表达数据、图像、文本 | 老年雌性树鼩（具体数量不详），分为治疗组和年轻对照组 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3'、10x Visium |
| 86 | 2026-08-20 |
Single-cell RNA sequencing reveals chemotherapy-induced apoptosis in acute myeloid leukemia via B cell depletion and M2 to M1 macrophage repolarization
2026-Jun-11, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-026-01001-1
PMID:42277943
|
研究论文 | 该研究利用单细胞RNA测序技术探讨了急性髓系白血病化疗过程中免疫微环境的动态变化，揭示了化疗通过B细胞耗竭和M2到M1巨噬细胞重极化诱导细胞凋亡的机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了化疗期间AML免疫微环境中B细胞和肿瘤相关巨噬细胞的动态变化，并识别出MCM7和SPINK2作为化疗期间的潜在靶向基因 | 样本量较小，且研究基于转录组数据，未进行功能验证实验 | 探究急性髓系白血病化疗期间免疫微环境的动态变化，以揭示化疗耐药机制 | 急性髓系白血病患者骨髓样本 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 未指定 | 基因表达数据 | 6个骨髓样本 | 未指定 | 单细胞RNA测序 | 未指定 | 未指定 |
| 87 | 2026-08-20 |
Constitutive interferon epsilon expression shapes antiviral epithelial states in the female reproductive tract and intestine
2026-06-10, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00340-26
PMID:42084361
|
研究论文 | 本研究利用小鼠模型和单细胞RNA测序技术，揭示了干扰素ε在女性生殖道和肠道黏膜表面的组成型表达及其在抗病毒防御中的作用。 | 首次系统阐明IFNε在肠道中的表达模式和功能，发现其在小肠绒毛顶端肠上皮细胞中高表达，维持炎症性肠上皮亚群和III型干扰素表达，并证明其缺失增加肠道病毒感染易感性。 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关验证有限，且未深入探讨IFNε在人类肠道中的具体作用。 | 明确IFNε在不同黏膜表面（女性生殖道和肠道）的表达特征及其在抗病毒免疫中的功能。 | 小鼠和人类女性生殖道及肠道来源的细胞。 | 免疫学 | 感染性疾病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 小鼠和人类细胞样本（具体数量未提供） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 88 | 2026-08-20 |
Multi-omics Integration of Single-cell and Spatial Transcriptomics with Tissue and Urine Proteomics Identifies TRIM28 as a Translationally Relevant Candidate Regulator in Acute Kidney Injury
2026-Jun-10, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-026-02521-7
PMID:42270879
|
研究论文 | 构建跨尺度多组学图谱，整合单细胞、空间转录组及组织和尿液蛋白质组，识别出TRIM28作为急性肾损伤的候选调节因子，并提名HY-N10592作为潜在化合物工具 | 首次整合人类单细胞、空间转录组与小鼠肾组织蛋白质组及临床尿液蛋白质组的跨尺度多组学方法，通过随机森林排序候选因子并结合结构虚拟筛选和CETSA验证药物靶点结合 | 未进行体内药效学评估，HY-N10592的治疗潜力需进一步动物模型验证；尿液蛋白检测的临床样本量及特异性未详述 | 整合多组学数据以识别连接肾损伤机制和尿液可检测信号的候选调节因子，并探索治疗靶向性 | 急性肾损伤患者样本、小鼠肾缺血再灌注损伤模型、HK-2细胞缺氧/复氧模型 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞转录组学、空间转录组学、蛋白质组学、随机森林模型、结构虚拟筛选、分子对接、分子动力学模拟、CETSA | 随机森林模型 | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、蛋白质组数据、尿液蛋白质组数据 | 人类样本数未明确，涉及小鼠RIRI模型及HK-2细胞模型 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学、蛋白质组学 | NA | NA |
| 89 | 2026-08-20 |
Integration of bulk and single-cell RNA-seq data identifies a cellular senescence-related prognostic signature in liver hepatocellular carcinoma
2026-Jun-10, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05440-z
PMID:42270911
|
研究论文 | 整合bulk和单细胞RNA-seq数据，识别肝细胞癌中与细胞衰老相关的预后特征 | 首次整合bulk和单细胞RNA-seq数据构建基于细胞衰老相关基因的预后模型，并识别EEF1E1作为关键基因具有致癌潜能 | 未提及具体局限性 | 构建细胞衰老相关基因的预后特征，并探究其在肝细胞癌中的功能作用 | 肝细胞癌患者样本及细胞系 | 基因组学 | 肝细胞癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | TCGA、ICGC、TISCH数据集中的肝细胞癌样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 90 | 2026-08-20 |
RANBP1 promotes oral cancer progression through activating YAP1 and NDUFB3 derived from the database of single-cell sequencing
2026-Jun-10, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-026-04361-9
PMID:42271351
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序数据库和功能实验揭示RANBP1通过激活YAP1和NDUFB3促进口腔癌进展的机制 | 首次利用单细胞转录组数据库识别RANBP1作为口腔癌恶性上皮细胞中的差异表达基因，并阐明其通过YAP1-NDUFB3轴调控氧化磷酸化和肿瘤侵袭性的新机制 | 研究中未涉及RANBP1在其他头颈癌类型中的验证，且未探讨肿瘤微环境中其他细胞类型（如免疫细胞、成纤维细胞）对RANBP1作用的影响 | 探索口腔鳞状细胞癌进展的分子机制，特别是通过单细胞测序识别关键基因并验证其功能 | 口腔鳞状细胞癌组织样本、细胞系、斑马鱼异种移植模型和NOD/SCID小鼠异种移植模型 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 10例口腔鳞状细胞癌患者的活检样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 91 | 2026-08-20 |
CSF2 drives radiation-induced lung injury by eliciting PADI4-high pathogenic neutrophils
2026-Jun-10, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08413-6
PMID:42271382
|
研究论文 | 该研究通过多组学分析揭示了CSF2通过诱导PADI4高表达致病性中性粒细胞驱动放射性肺损伤的机制，并验证了PADI4抑制剂的治疗潜力 | 首次识别PADI4为放射性肺损伤中与中性粒细胞相关的核心分子，并阐明受损上皮细胞分泌CSF2通过诱导中性粒细胞PADI4高表达形成致病性表型的分子回路，为治疗提供了新靶点 | 研究基于小鼠模型，需进一步在人类样本中验证；HL-60细胞系与原发性中性粒细胞的差异可能影响结果的普遍性 | 解码放射性肺损伤微环境中受损上皮细胞与中性粒细胞之间的相互作用机制，并探索治疗干预靶点 | 小鼠放射性肺损伤模型中的中性粒细胞、受损肺上皮细胞，以及HL-60中性粒细胞样细胞 | 转录组学、免疫学 | 放射性肺损伤 | 单细胞RNA测序、批量转录组分析、免疫荧光、ELISA | 伪时间算法 | 基因表达数据、图像（免疫荧光） | 小鼠模型（17 Gy照射）及体外共培养系统 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 92 | 2026-08-20 |
Multi-omic analysis reveals Wharton's jelly mesenchymal stem cells shift the pro-inflammatory phenotype of fibroblast subpopulation to induce skin rejuvenation
2026-Jun-10, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-026-01594-z
PMID:42271436
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示华通胶间充质干细胞通过改变成纤维细胞亚群的促炎表型来诱导皮肤年轻化 | 首次通过整合bulk RNA-seq、微阵列和单细胞转录组学等多组学方法，全面阐明WJMSCs改善皮肤衰老的机制，并发现其下调促炎成纤维细胞中富集的昼夜节律相关基因Dbp | 摘要中未提及明确的局限性 | 探究WJMSCs对皮肤衰老的作用机制及其对成纤维细胞亚群的影响 | 人类皮肤成纤维细胞（HDFs）和裸鼠皮肤组织 | 数字病理学、机器学习 | 皮肤衰老 | bulk RNA-seq、微阵列、单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据、组织学图像、细胞学数据 | 体外HDFs和裸鼠模型，具体样本数未在摘要中提供 | NA | bulk RNA-seq、单细胞转录组学 | NA | NA |
| 93 | 2026-08-20 |
SGMHA: semantic graph reconstruction with multi-head attention for gene regulatory network inference
2026-Jun-09, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-026-13022-0
PMID:42265576
|
研究论文 | 提出SGMHA，一种基于语义图重建和多头注意力机制的两阶段框架，用于从单细胞RNA测序数据中推断基因调控网络，并在乳腺癌转移研究中验证了其有效性 | 创新性地将表示学习与链接预测解耦，采用自监督图掩码自编码器（GraphMAE）重建随机掩码的表达值以缓解数据稀疏性，再结合多头注意力微调模块整合预训练表示和原始数据以推断有向调控链接 | 摘要中未提及明确局限性 | 提高从稀疏单细胞RNA测序数据中推断基因调控网络的准确性和鲁棒性，并支持复杂疾病中的生物标志物发现 | 基因调控网络，从单细胞RNA测序数据推断 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 图掩码自编码器（GraphMAE）和多头注意力（MHA） | 基因表达数据 | 七个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 94 | 2026-08-20 |
CMS4 epithelial-intrinsic glycosyltransferase GALNT5 promotes tumor aggressiveness and correlates with poor survival in colorectal cancer
2026-Jun-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-57104-1
PMID:42259894
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，发现结直肠癌CMS4亚型肿瘤上皮细胞特有糖基转移酶GALNT5，其高表达与肿瘤侵袭性和不良生存相关 | 利用单细胞转录组学区分CMS4肿瘤上皮细胞与基质细胞，首次定义CMS4上皮内在糖基化程序，并鉴定GALNT5作为预后标志物和治疗候选靶点 | 未提及具体局限性 | 明确CMS4肿瘤上皮细胞内在的糖基转移酶表达谱，并评估GALNT5作为预后标志物的潜力 | 结直肠癌CMS4亚型肿瘤上皮细胞、CMS1-3上皮细胞、正常上皮、基质/免疫细胞、CRC细胞系及431例手术切除的结直肠癌标本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据、组织微阵列图像 | 431例结直肠癌手术切除标本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 单细胞3'转录组测序 |
| 95 | 2026-08-20 |
C3+ cancer-associated fibroblast-derived GAS6 promotes cervical cancer metastasis via activation of AXL signaling pathway in a syngeneic orthotopic mouse model
2026-Jun-08, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08392-8
PMID:42260511
|
研究论文 | 本研究建立了同基因原位小鼠宫颈癌模型，并通过单细胞RNA测序揭示了C3+癌症相关成纤维细胞通过GAS6/AXL信号通路促进宫颈癌转移的机制 | 建立了能忠实再现宫颈癌转移级联反应且保留免疫能力的同基因原位小鼠模型，并首次发现C3+成纤维细胞亚型通过GAS6/AXL通路增强肿瘤侵袭性 | 未提及明显局限性 | 建立同基因原位宫颈癌小鼠模型，以真实模拟转移过程并定义肿瘤微环境中与转移相关的细胞相互作用 | 小鼠宫颈癌U14细胞及其衍生的U14-Luc细胞，以及模型中的原发肿瘤和淋巴结转移肿瘤组织 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序、生物发光成像、组织学分析 | 小鼠肿瘤模型 | 基因表达数据、图像数据 | 未明确提及样本数量，涉及小鼠模型及肿瘤组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 96 | 2026-08-20 |
The exploration to identify key molecules in the interaction between endothelial cells and mono-macrophages in atherosclerosis based on the single cell transcriptome
2026-Jun-05, BMC cardiovascular disorders
IF:2.0Q3
DOI:10.1186/s12872-026-06031-0
PMID:42243679
|
研究论文 | 本研究基于单细胞转录组数据，探索动脉粥样硬化中内皮细胞与单核-巨噬细胞相互作用的关键分子 | 通过单细胞RNA测序分析，识别出与动脉粥样硬化相关的细胞亚群和信号通路，特别是MK（Midkine）通路及MDK-NCL配体-受体对，并通过体外共培养实验初步验证其表达变化 | 未提及明确的局限性 | 识别动脉粥样硬化中内皮细胞与单核-巨噬细胞相互作用的关键分子和信号通路，为冠状动脉疾病的防治提供候选靶点 | 钙化动脉粥样硬化核心斑块和患者匹配的近端邻近颈动脉组织中的内皮细胞和单核-巨噬细胞群体 | 单细胞转录组学 | 冠状动脉疾病、动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 公开数据集，具体样本数量未在标题和摘要中提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 97 | 2026-08-20 |
Linking childhood interstitial lung disease to IARS-related disorder: clinical and preliminary functional studies in four new cases
2026-Jun-03, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-026-00998-9
PMID:42237414
|
研究论文 | 本研究通过四个新病例的临床和初步功能研究，将儿童间质性肺病与IARS相关疾病联系起来，并确定IARS为chILD/PAP的新型致病基因 | 首次将IARS双等位基因突变与儿童间质性肺病及肺泡蛋白沉积症建立明确关联，并利用单细胞RNA测序揭示单核细胞/巨噬细胞谱系的潜在功能缺陷 | 研究样本量小（仅四例），且功能研究为初步探索，缺乏更深入的机制验证 | 阐明IARS双等位基因突变在儿童间质性肺病和肺泡蛋白沉积症中的致病作用及潜在免疫相关机制 | 四名表现为进行性chILD/PAP并伴有肺外表现的儿科患者 | 基因组学、单细胞测序 | 儿童间质性肺病、肺泡蛋白沉积症、IARS相关疾病 | 全外显子组测序、AlphaFold蛋白结构预测、PAS和ORO染色、western blotting、透射电子显微镜、单细胞RNA测序 | AlphaFold | 基因组测序数据、蛋白结构数据、染色图像、蛋白质表达数据、电子显微镜图像、单细胞转录组数据 | 4例儿科患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序用于外周血单核细胞分析 |
| 98 | 2026-08-20 |
Impaired early type I interferon responses to influenza virus infection in aged mice are associated with subsequent increased pulmonary inflammation
2026-Jun, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-025-01892-3
PMID:40987991
|
研究论文 | 本研究通过年轻和老年小鼠感染流感病毒模型，发现老年小鼠早期I型干扰素反应受损，导致病毒载量增加和后期肺部炎症加剧 | 首次利用单细胞RNA测序揭示老年小鼠在流感感染后期多种免疫细胞中持续存在炎症相关基因高表达，并关联早期I型干扰素反应受损 | 研究仅基于小鼠模型，未涉及人类样本；未探讨老年小鼠早期I型干扰素反应受损的分子机制 | 探究衰老对流感病毒感染早期固有免疫反应的影响及其与后期肺部炎症的关系 | 年轻（12周龄）和老年（70周龄）C57BL/6J小鼠，感染流感病毒PR8后的肺组织 | 免疫学 | 流感 | qRT-PCR, 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据, 组织病理图像 | 两组小鼠（年轻和老年），每组若干只（具体未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 99 | 2026-08-20 |
Spatial blueprint of colorectal cancer identifies Hypoxic CAF program that orchestrates Go-or-Grow decisions and predicts outcomes
2026-Jun, Investigational new drugs
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s10637-026-01611-5
PMID:42018268
|
研究论文 | 本研究整合单细胞转录组和空间转录组数据，绘制结直肠癌的空间蓝图，识别出缺氧CAF程序，该程序调控肿瘤细胞的“生长或迁移”决策并预测患者预后 | 首次揭示结直肠癌中由缺氧CAF调控的“生长或迁移”空间开关机制，并鉴定HMGA2作为关键转录调控因子，为空间指导的结直肠癌干预提供新靶点 | 未在摘要中明确说明，但可能包含样本量有限、验证依赖特定队列及体外模型等局限 | 解析结直肠癌肿瘤微环境的空间组织及其功能影响，揭示驱动肿瘤进展的关键机制 | 结直肠癌患者肿瘤组织中的细胞（412,208个单细胞和76,627个空间点）及原代CAF培养物 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序，空间转录组测序，SCENIC网络推断，细胞间通讯分析，Seahorse代谢分析 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据，临床生存数据，代谢数据 | 32例患者的38个组织切片，包含412,208个单细胞和76,627个空间点 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq | 未在摘要中明确但常用配置为10x Chromium Single Cell 3'和10x Visium FFPE |
| 100 | 2026-08-20 |
Integrated transcriptomic analysis identifies liver aging-driven fibrosis signatures and reveals therapeutic strategies based on medicine-food homology
2026-May-26, NPJ science of food
IF:6.3Q1
DOI:10.1038/s41538-026-00904-6
PMID:42191706
|
研究论文 | 通过整合纵向转录组学、单细胞RNA测序和机器学习方法，识别肝脏衰老驱动的纤维化特征，并基于药食同源筛选治疗策略 | 首次整合多组学数据与机器学习构建衰老基因评分（AGS），并鉴定预测晚期纤维化的五基因面板，同时利用网络药理学筛选药食同源中药 | 研究主要基于转录组数据和体外功能实验，未进行体内验证；样本量未明确；分子对接结果缺乏实验验证 | 系统表征肝脏衰老与纤维化的关联机制，并探索基于药食同源的抗衰老和抗纤维化治疗策略 | 肝脏衰老与纤维化的细胞群体，特别是巨噬细胞，以及药食同源草本植物（金荞麦、黄芪） | 机器学习 | 纤维化相关肝脏疾病 | 转录组测序（RNA-seq）、单细胞RNA测序、机器学习（Boruta、LASSO）、网络药理学、分子对接 | 机器学习模型 | 转录组数据、单细胞表达数据、分子结构数据 | 未提供具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、bulk转录组测序（bulk RNA-seq） | NA | NA |