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当前共找到 34043 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-12-14 |
Unveiling the dental cellular landscape: A comprehensive review of single-cell RNA sequencing in human dental tissues
2025-Dec, The Japanese dental science review
DOI:10.1016/j.jdsr.2025.11.004
PMID:41377691
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综述 | 本文系统回顾了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在揭示人类牙组织细胞异质性和分子动态方面的应用 | 首次对scRNA-seq在人类牙组织研究中的应用进行系统性综述，比较了健康与疾病状态下以及体内与培养环境中的细胞组成差异 | 仅纳入15项符合标准的研究，样本量有限；部分细胞亚群的具体功能仍需进一步验证 | 评估scRNA-seq在解析人类牙组织细胞图谱、理解组织稳态、再生和疾病机制方面的贡献 | 人类牙组织（包括牙髓、牙周组织等） | 单细胞组学 | 牙科疾病（龋齿、牙周炎） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 15项研究（具体样本数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 82 | 2025-12-14 |
Systematic analysis of the expression profiles and prognostic values of the FAM72 family in liver cancer
2025-Dec, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102358
PMID:41378103
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析评估了FAM72家族成员在肝癌中的表达水平及其预后相关性 | 首次系统分析了FAM72A-D在肝癌中的表达谱和预后价值，并开发了基于FAM72的基因特征用于预测肝癌患者预后 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证；单细胞RNA测序数据仅提示FAM72A-D主要存在于增殖性T细胞中，具体机制未深入探讨 | 探究FAM72家族在肝癌中的表达特征和预后意义 | 肝癌组织与正常组织中的FAM72A-D基因 | 生物信息学 | 肝癌 | 生物信息学分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 83 | 2025-12-14 |
ETV1 is a key regulator of enteroendocrine PYY production
2025-Dec-01, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.052610
PMID:41048045
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和类器官实验，揭示了ETV1作为调节肠道内分泌细胞中PYY表达的关键转录因子 | 首次发现ETV1特异性调控PYY表达而不影响GLP-1，揭示了L细胞谱系中激素转录调控的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和类器官，尚未在人体中进行验证 | 探究肠道内分泌激素PYY的转录调控机制 | 小鼠小肠和类器官培养中的L细胞 | 单细胞组学 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序, 定量PCR | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 84 | 2025-12-14 |
Neutrophil-chemoattractant CXCL5 increases lung barrier permeability in acute lung injury
2025-Dec, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2025.10.003
PMID:41076014
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研究论文 | 本研究探讨了中性粒细胞趋化因子CXCL5在急性肺损伤中对肺屏障通透性的影响 | 揭示了CXCL5除了已知的中性粒细胞招募作用外，还能独立增加肺泡上皮屏障的通透性 | NA | 研究CXCL5在肺屏障功能和炎症中的作用 | 严重肺炎患者、体外和体内急性肺损伤模型、Cxcl5缺陷小鼠、人类原代肺泡上皮细胞 | NA | 急性肺损伤 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 85 | 2025-12-14 |
Aqueous Humor Exosomal Membrane Proteins: Decoding Pathogenic Molecular Signatures in Retinitis Pigmentosa
2025-Dec-01, Translational vision science & technology
IF:2.6Q2
DOI:10.1167/tvst.14.12.15
PMID:41384798
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研究论文 | 本研究通过建立房水外泌体膜蛋白的细胞来源追踪框架，揭示了其在视网膜色素变性中的病理意义 | 首次建立房水外泌体膜蛋白的细胞来源追踪框架，并利用EVArray技术结合单细胞RNA测序数据，解码了视网膜色素变性中的免疫和胶质细胞相关分子特征 | 样本量较小（14例RP患者和7例对照），且研究对象为并发白内障的RP患者，可能限制了结果的普遍性 | 解码视网膜色素变性中房水外泌体膜蛋白的致病分子特征 | 房水外泌体膜蛋白 | 数字病理学 | 视网膜色素变性 | EVArray技术、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组学数据、单细胞RNA测序数据 | 14例视网膜色素变性并发白内障患者和7例年龄匹配的老年性白内障对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 86 | 2025-12-14 |
Hub genes and common pathogenic mechanisms between COPD and H. pylori infection
2025-Dec, Journal, genetic engineering & biotechnology
DOI:10.1016/j.jgeb.2025.100622
PMID:41386886
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学分析，识别了慢性阻塞性肺疾病与幽门螺杆菌感染之间的共享枢纽基因及共同致病机制 | 首次通过整合多组学数据（包括WGCNA、SVM-RFE、单细胞RNA测序和细胞间通讯分析）系统性地揭示了COPD与H. pylori感染之间的共享分子机制和枢纽基因 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，缺乏实验验证；样本来源和批次效应可能影响结果的普适性 | 探究慢性阻塞性肺疾病与幽门螺杆菌感染之间共同的致病分子机制和关键基因 | 慢性阻塞性肺疾病患者和幽门螺杆菌感染患者的基因表达数据 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序，加权基因共表达网络分析，支持向量机递归特征消除，基因集富集分析 | SVM-RFE | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 87 | 2025-12-14 |
Single-cell and spatial transcriptome landscapes reveal the spatial immune defense pattern shared by primary and brain metastatic lung adenocarcinoma
2025-Nov-30, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-2025-1224
PMID:41376899
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学，揭示了原发性与脑转移性肺腺癌共有的空间免疫防御模式 | 首次通过整合单细胞和空间转录组数据，识别出原发性与脑转移性肺腺癌共有的、具有空间富集特征的肿瘤免疫防御模式（TIDP），并发现其与髓系相关的免疫抑制特征及不良预后显著相关 | 研究主要基于转录组数据，功能验证和临床转化潜力仍需进一步实验和临床试验证实 | 阐明原发性与脑转移性肺腺癌共有的免疫防御机制，识别导致免疫逃逸和治疗抵抗的空间组织化程序及分子相互作用 | 肺腺癌（LUAD）的原发性肿瘤和脑转移性肿瘤 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 非负矩阵分解（NMF） | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 88 | 2025-12-14 |
Identification of the key gene for hepatocellular carcinoma based on bioinformatics and machine learning and experimental verification
2025-Nov-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1067
PMID:41378005
|
研究论文 | 本研究结合生物信息学与机器学习方法，筛选并验证了肝细胞癌的关键基因FAM83D | 整合多个GEO数据集，应用SVM-RFE和LASSO机器学习算法筛选诊断基因，并通过单细胞和空间转录组学分析验证FAM83D在恶性细胞中的上调及其与免疫治疗反应的关联 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，实验验证部分可能受样本量限制，且未深入探讨FAM83D的具体分子机制 | 识别肝细胞癌的关键驱动基因，以辅助早期诊断和预后评估 | 肝细胞癌患者与非癌肝组织 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 生物信息学分析、机器学习算法（SVM-RFE、LASSO）、免疫组化、单细胞转录组学、空间转录组学 | SVM-RFE、LASSO | 基因表达数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 三个GEO数据集（GSE78737、GSE98383、GSE121248），具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 89 | 2025-12-14 |
MCRS1 is associated with immunosuppressive microenvironments in pan-cancer and promotes hepatocellular carcinoma malignant phenotypes
2025-Nov-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1463
PMID:41378029
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研究论文 | 本研究通过泛癌分析揭示了微球蛋白1（MCRS1）在肿瘤免疫抑制微环境中的关键作用，并重点阐明了其在肝细胞癌（HCC）恶性表型中的表观遗传驱动机制 | 首次报道了MCRS1在泛癌水平上的免疫学意义和治疗潜力，并发现其启动子低甲基化驱动的过表达与M2巨噬细胞极化的免疫抵抗微环境相关 | 研究主要基于公共数据库和体外功能验证，缺乏体内动物模型的深入机制验证 | 阐明MCRS1在泛癌中的免疫学意义和治疗潜力，并揭示其在肝细胞癌进展中的表观遗传驱动机制 | 多种癌症类型（泛癌分析），重点关注肝细胞癌（HCC） | 生物信息学，癌症免疫学 | 肝细胞癌，泛癌 | 批量转录组学，单细胞RNA测序（scRNA-seq），表观遗传分析，功能验证 | NA | 转录组数据，单细胞RNA测序数据，表观遗传数据，蛋白质表达数据 | 来自TCGA、GTEx、HPA等公共数据库的大量样本（具体数量未明确说明），包括24种恶性肿瘤 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 90 | 2025-12-14 |
Integrating Functional Genomic Screens and Multi-Omics Data to Construct a Prognostic Model for Lung Adenocarcinoma and Validating SPC25
2025-Nov-29, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17233844
PMID:41375045
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研究论文 | 本研究整合功能基因组筛选与多组学数据，构建了一个肺腺癌预后风险评分模型，并验证了核心基因SPC25的致癌作用 | 结合CRISPR-Cas9功能基因组筛选与患者多组学数据构建预后模型，并通过体内外实验及单细胞RNA-seq验证核心基因SPC25 | 模型验证主要依赖公共数据集，需要更多前瞻性临床队列验证；SPC25的具体作用机制有待进一步阐明 | 开发肺腺癌的可靠预后生物标志物并识别新的治疗靶点 | 肺腺癌细胞系及患者样本 | 生物信息学 | 肺腺癌 | CRISPR-Cas9筛选，RNA-seq，单细胞RNA-seq | LASSO回归，多变量Cox回归 | 基因组筛选数据，转录组数据，单细胞测序数据 | TCGA-LUAD队列及独立GEO数据集，具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 91 | 2025-12-14 |
NK cells undergo transcriptional and functional reprogramming following Streptococcus pneumoniae infection
2025-Nov-28, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2025.11.012
PMID:41320160
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了自然杀伤细胞在肺炎链球菌感染后经历转录和功能重编程，并形成具有增强活性的记忆亚群 | 首次在细菌感染背景下系统揭示NK细胞的转录重编程和记忆形成机制，为先天免疫记忆在细菌感染中的作用提供了新见解 | 研究主要基于小鼠模型，人类NK细胞的类似机制仍需验证；单细胞测序数据的功能验证有待进一步深入 | 探究NK细胞在肺炎链球菌感染中的应答机制和记忆形成过程 | 自然杀伤细胞 | 单细胞组学 | 细菌感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 92 | 2025-12-14 |
Single-Cell Omics in Legumes: Research Trends and Applications
2025-Nov-27, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14233615
PMID:41375325
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综述 | 本文综述了单细胞组学在豆科植物中的应用进展，重点关注不同细胞类型中基因功能对植物发育、病原响应、应激可塑性及根瘤共生的贡献 | 强调了从批量分析向单细胞多组学研究的转变，并展望了构建集成豆科植物细胞图谱的未来方向 | 当前技术存在局限性，需进一步整合数据以支持转化研究和作物改良 | 探讨单细胞组学在豆科植物研究中的趋势与应用，以推动作物改良 | 豆科植物（如大豆、豌豆等）及其细胞类型 | 植物生物学 | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学、单细胞表观基因组学 | NA | 基因表达数据、表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 93 | 2025-12-14 |
Alterations in Resident Immune Cells in Prenatal Trisomy 21 Lungs
2025-Nov-26, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14231866
PMID:41369355
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间表型分析，揭示了唐氏综合征胎儿肺部免疫细胞的变化，特别是B细胞减少，这可能解释其呼吸道感染易感性增加 | 首次在产前唐氏综合征肺部中系统表征免疫细胞变化，结合单细胞测序与空间技术揭示B细胞减少的分子机制 | 样本量较小（T21组5例，非T21组4例），且仅关注产前阶段，未追踪出生后免疫发育变化 | 探究唐氏综合征胎儿肺部免疫细胞异常，以解释其呼吸道感染易感性增加的潜在原因 | 产前唐氏综合征（T21）和非唐氏综合征（非T21）胎儿肺部组织 | 单细胞组学 | 唐氏综合征 | 单细胞RNA测序，荧光原位杂交，免疫荧光染色，qRT-PCR | NA | 单细胞RNA测序数据，空间组织切片图像，基因表达数据 | T21组5例，非T21组4例产前肺部样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 94 | 2025-12-14 |
A spatially informed matrix normal model for gene co-expression analysis in spatial transcriptomics studies
2025-Nov-26, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1264
PMID:41370198
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研究论文 | 本文提出了一种名为spMOCA的统计框架，用于在空间转录组学研究中分析基因共表达网络，并明确建模空间依赖性 | 引入矩阵正态模型，联合考虑基因-基因和空间协方差，从而区分内在共表达关系与空间诱导效应 | NA | 开发一种统计方法，以更准确地推断空间转录组学数据中的基因共表达网络 | 空间转录组学数据中的基因共表达关系 | 空间转录组学 | 肿瘤、神经退行性疾病 | 空间转录组学 | 矩阵正态模型 | 空间转录组学数据 | 九个空间转录组学数据集，涵盖不同技术、组织和物种 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 95 | 2025-12-14 |
Single-Cell Sequencing Reveals Novel Tumor Populations and Their Interplay with the Immune Microenvironment in a Pleomorphic Rhabdomyosarcoma
2025-Nov-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262311420
PMID:41373578
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学探究了多形性横纹肌肉瘤的肿瘤异质性及其与免疫微环境的相互作用 | 首次通过单细胞测序揭示了pRMS中肌源性和非肌源性肿瘤亚群的明确划分，并识别了它们与免疫细胞间不同的信号通路交互 | 研究为单病例分析，缺乏多患者队列验证、蛋白质水平确认及体内外功能实验支持 | 解析多形性横纹肌肉瘤的肿瘤细胞异质性及其免疫微环境调控机制 | 多形性横纹肌肉瘤肿瘤组织及其免疫微环境中的细胞 | 数字病理学 | 横纹肌肉瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 单个病例样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 96 | 2025-12-14 |
De Novo Detection of Clonal Structure and Evolution in Single-Cell and Spatial Transcriptomes
2025-Nov-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262311428
PMID:41373592
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研究论文 | 本文介绍了scClone，一种用于从单细胞RNA测序和空间转录组数据中检测克隆结构和进化的计算工具包 | 开发了scClone工具包，整合变异检测和基因型推断，解决了scRNA-seq数据中的表达丢失和等位基因不平衡问题，并支持空间转录组数据的克隆结构分析 | 未明确提及具体局限性，但可能受限于单细胞测序的成本和数据量 | 揭示肿瘤的精细克隆结构和动态进化过程 | 肿瘤细胞，包括骨髓瘤、肝细胞癌、胰腺癌、卵巢癌和皮肤鳞状细胞癌 | 数字病理学 | 多种癌症 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | RNA测序数据，空间转录组数据 | 多个数据集，具体样本数量未明确 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 97 | 2025-12-14 |
Functional Division of Insect Blood Cells by Single-Cell RNA-Sequencing and Cell-Type-Specific FISH Markers
2025-Nov-22, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14231842
PMID:41369332
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和细胞类型特异性FISH标记，揭示了昆虫血细胞的功能分化与动态变化 | 首次在鳞翅目昆虫中应用单细胞RNA测序技术解析血细胞功能分化，发现了24个功能簇和7个功能组，并开发了特异性FISH标记识别新细胞群 | 研究仅针对一种鳞翅目昆虫幼虫，结果可能不适用于其他昆虫种类或发育阶段 | 探究昆虫血细胞的功能分化类型及其在免疫应答中的动态变化 | 鳞翅目昆虫（烟草天蛾）幼虫的血细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq），荧光原位杂交（FISH） | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 未明确样本数量，使用烟草天蛾幼虫血细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 98 | 2025-12-14 |
A Comprehensive Analysis of Novel Variations Associated with Bile Duct Cancer: Insights into Expression, Methylation, and 3D Protein Structure
2025-Nov-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262311244
PMID:41373405
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研究论文 | 本研究通过整合基因组、转录组、单细胞、甲基化和分子动力学数据，对胆管癌（胆管细胞癌）进行了全面的多组学分析，旨在识别致病性变异并揭示其分子机制 | 首次将基因组、转录组、单细胞RNA-seq、甲基化组和分子动力学模拟数据整合到一个公共数据驱动的分析框架中，以系统识别胆管癌的致病性变异并阐明其结构功能影响 | 研究主要基于公开数据集，样本量相对有限（如23个肿瘤样本用于体细胞变异分析），且缺乏独立的实验验证 | 识别与胆管癌相关的致病性变异，并理解其在基因表达、甲基化和蛋白质结构层面的影响，以期为诊断和治疗提供新策略 | 胆管癌（胆管细胞癌）肿瘤样本、正常肝组织以及相关的基因组、转录组、单细胞和甲基化数据 | 生物信息学 | 胆管癌 | 基因组学、转录组学、单细胞RNA-seq、甲基化分析、分子动力学模拟 | DESeq2, limma, DMRcate, AlphaFold3, GROMACS, FoldX5 | 基因组变异数据、RNA-seq数据、单细胞RNA-seq数据、甲基化阵列数据、蛋白质结构数据 | 23个肿瘤样本（TCGA）、23,782个单细胞（来自一个肝内胆管癌样本）、52个肿瘤和12个正常肝脏样本（甲基化分析） | Illumina | 单细胞RNA-seq, 甲基化分析 | Illumina 450 K甲基化阵列 | Illumina 450 K甲基化阵列用于甲基化分析，单细胞RNA-seq数据集来自公开资源 |
| 99 | 2025-12-14 |
PHD-MS: Multiscale Domain Identification for Spatial Transcriptomics via Persistent Homology
2025-Nov-11, ArXiv
PMID:41293536
|
研究论文 | 本文提出了一种基于持久同调的多尺度空间域识别方法PHD-MS，用于空间转录组学数据分析 | 首次将拓扑数据分析（TDA）中的持久同调方法应用于空间转录组学的多尺度空间域识别，能够捕捉不同形态尺度下的组织结构 | 未明确说明方法在计算效率或大规模数据集上的表现，也未讨论对特定组织类型或技术平台的适用性限制 | 开发能够识别多尺度空间域的算法，以更好地理解组织结构的层次性 | 空间转录组学数据中的基因表达空间模式 | 空间转录组学 | NA | 持久同调，拓扑数据分析 | 持久同调模型 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 100 | 2025-12-14 |
Inferring the regulation dynamics of oscillatory networks from scRNA-seq data
2025-Nov-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.08.687360
PMID:41292720
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研究论文 | 本文提出了一种通过整合细胞周期位置信息来改进单细胞RNA测序数据中基因调控网络推断的方法 | 将振荡过程（如细胞周期）的周期性约束纳入基因调控网络推断，相比传统基于基因相关性或时间进程的方法，能更准确地解析细胞周期调控动力学 | 仅在小鼠视网膜祖细胞单细胞基因表达数据集上进行了验证，尚未在其他细胞类型或生物系统中广泛测试 | 提高从单细胞RNA测序数据中推断振荡网络（如细胞周期）调控动力学的准确性 | 小鼠视网膜祖细胞的单细胞基因表达数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 基因调控网络推断方法（包括Tricycle等八种代表性方法） | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |