单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 37368 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-03-14 |
Integrative transcriptomic and machine learning framework reveals candidate genes and potential mechanisms of aflatoxin B1 exposure in breast cancer
2026-Feb-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-39844-2
PMID:41688730
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组学与机器学习框架，揭示了黄曲霉毒素B1暴露在乳腺癌中的候选基因与潜在机制 | 首次结合多组学评估（包括转录组、共表达网络、免疫景观、转录因子调控、空间及单细胞转录组学）与机器学习流程，系统解析AFB1影响乳腺癌的生物学通路，并识别出高判别性生物标志物组合 | 研究主要基于计算分析与组学数据，缺乏实验验证；样本异质性可能影响结果普适性；AFB1暴露剂量与时间效应未详细探讨 | 探究黄曲霉毒素B1（AFB1）影响乳腺癌肿瘤生物学的分子机制与潜在生物标志物 | 乳腺癌相关的转录组数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据及AFB1暴露的分子靶点 | 机器学习 | 乳腺癌 | 转录组分析、共表达网络建模（WGCNA）、免疫景观分析、转录因子调控图谱、空间转录组学、单细胞转录组学 | glmBoost、StepGLM、SHAP可解释性分析 | 转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 82 | 2026-02-10 |
Integrating single-cell and spatial transcriptomics with pan-cancer bulk sequencing identifies OSR2 as a multifaceted biomarker for prognosis and tumor immunity
2026-Feb-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04595-z
PMID:41661456
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 83 | 2026-03-14 |
JAG1 expression in papillary thyroid cancer stem-like cells predicts poor prognosis and implicates angiogenesis
2026-Feb-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04601-4
PMID:41663780
|
研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序数据，探讨了甲状腺癌干细胞样细胞的特性及其与肿瘤组织内其他细胞的相互作用，特别是JAG1基因在预测预后中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序数据和临床数据，系统分析了甲状腺癌干细胞样细胞的基因表达谱及其与内皮细胞的相互作用，揭示了JAG1作为预后不良标志物的新角色 | 研究基于公共数据库的回顾性分析，缺乏实验验证；样本来源和数量可能有限，且未考虑其他潜在影响因素 | 探索甲状腺癌干细胞样细胞的特性、细胞间相互作用以及与预后相关的基因 | 甲状腺癌干细胞样细胞和肿瘤组织内的其他细胞类型 | 单细胞测序分析 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | Seurat, CytoTRACE, STRING, cytoHubba, clusterProfiler, CellChat | 单细胞RNA测序数据和临床数据 | 两个独立数据集（GSE191288和GSE250521），具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 84 | 2026-03-14 |
Mitochondria-targeted nanozyme system for psoriasis treatment
2026-Feb-07, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04068-z
PMID:41652629
|
研究论文 | 本研究开发了一种用于靶向治疗银屑病样皮肤炎症的多功能脂质体水凝胶纳米平台 | 开发了一种集成了白藜芦醇和线粒体靶向氧化铈纳米酶的新型多功能脂质体水凝胶纳米平台，用于通过抗氧化和抗炎联合机制靶向治疗银屑病 | 研究主要在IMQ诱导的小鼠模型中进行，其临床转化效果和长期安全性有待进一步验证 | 开发一种用于治疗银屑病及其他慢性炎症性皮肤病的纳米治疗策略 | 银屑病样皮肤炎症 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序，转录组分析，网络药理学 | NA | RNA测序数据 | IMQ诱导的银屑病样小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 85 | 2026-03-14 |
PTPN2 deficiency amplifies inflammatory signalling and impairs functional maturation of human stem cell-derived islets
2026-Feb-07, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04892-4
PMID:41654987
|
研究论文 | 本研究探讨了PTPN2基因缺陷对人类干细胞来源胰岛分化、炎症信号及功能成熟的影响 | 首次利用CRISPR-Cas12a编辑的PTPN2缺陷人胚胎干细胞构建胰岛模型，揭示PTPN2在胰岛发育和抗炎保护中的动态作用机制 | 研究主要基于体外干细胞分化模型和免疫缺陷小鼠移植实验，未在完全免疫环境中验证PTPN2缺陷的影响 | 阐明PTPN2在人类干细胞来源胰岛分化成熟过程中的作用及其与1型糖尿病发病机制的关联 | PTPN2缺陷的H1人胚胎干细胞及其分化产生的干细胞来源胰岛 | 干细胞生物学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas12a基因组编辑 | 干细胞分化模型, 小鼠移植模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，使用T1D器官捐献者β细胞数据集和干细胞分化体系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 86 | 2026-03-14 |
Comprehensive analysis of PANoptosis-related molecular subtypes and prognostic model development of clear cell renal cell carcinoma
2026-Feb-06, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04561-9
PMID:41649622
|
研究论文 | 本研究通过多组学数据分析，定义了与PANoptosis相关的分子亚型，并开发了一个用于透明细胞肾细胞癌的预后评分模型 | 首次在ccRCC中系统描绘了PANoptosis景观，定义了相关的分子亚型，并构建了一个基于三个基因的独立预后评分模型，同时通过实验验证了RBCK1的致癌功能 | 研究主要基于TCGA数据库的回顾性数据，需要前瞻性临床队列进一步验证 | 阐明PANoptosis在透明细胞肾细胞癌中的作用，并开发预后评估工具 | 透明细胞肾细胞癌患者的多组学数据及肿瘤细胞系 | 生物信息学与计算生物学 | 肾细胞癌 | 多组学数据分析，单细胞RNA测序，体外实验 | Cox回归，LASSO回归 | 基因组，转录组，单细胞RNA测序数据 | TCGA数据库中的ccRCC样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 87 | 2026-03-14 |
scLong: a billion-parameter foundation model for capturing long-range gene context in single-cell transcriptomics
2026-Feb-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69102-y
PMID:41639087
|
研究论文 | 本文介绍了scLong，一个基于48百万细胞预训练的十亿参数基础模型，用于在单细胞转录组学中捕获长距离基因上下文 | scLong通过自注意力机制处理人类基因组中全部28,000个基因，包括低表达基因，并整合了基因本体论知识，以增强对基因功能和关系的理解 | NA | 开发一个能够捕获单细胞转录组数据中长距离基因依赖关系的基础模型 | 单细胞RNA测序数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 自注意力机制，图卷积网络 | 基因表达数据 | 48百万细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 88 | 2026-03-14 |
FLASH-MM: fast and scalable single-cell differential expression analysis using linear mixed-effects models
2026-Feb-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69063-2
PMID:41644528
|
研究论文 | 本文开发了一种名为FLASH-MM的快速可扩展线性混合效应模型估计算法，用于解决单细胞差异表达分析中的样本相关性、个体变异和可扩展性等挑战 | 通过重新构建线性混合模型估计过程，降低计算复杂度和内存使用，实现了快速且可扩展的单细胞差异表达分析 | NA | 开发快速可扩展的单细胞差异表达分析方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 结核病、肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | 线性混合效应模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 89 | 2026-03-14 |
Tumour-intrinsic features shape T cell differentiation through precursor to symptomatic multiple myeloma
2026-Feb-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68718-4
PMID:41644568
|
研究论文 | 本研究通过大规模单细胞RNA测序数据集，揭示了多发性骨髓瘤中T细胞分化的独特模式及其与肿瘤内在特征的关系 | 首次证明多发性骨髓瘤中T细胞分化并非由耗竭驱动，而是由抗原驱动的终末记忆分化，并发现肿瘤负荷和抗原呈递基因表达等肿瘤内在特征影响此过程 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，可能未完全捕捉到蛋白质水平或功能性的T细胞变化 | 探究多发性骨髓瘤中T细胞分化的机制及其在疾病进展中的作用 | 多发性骨髓瘤患者、前驱条件患者和非癌症对照者的骨髓和血液样本 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 来自多发性骨髓瘤、前驱条件和非癌症对照患者的大规模骨髓和血液样本数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 90 | 2026-03-14 |
Opioid-induced transcriptional reprogramming of cerebrospinal fluid immune cells drives neuroinflammation in SIV-infected rhesus macaques
2026-Feb-05, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8632387/v1
PMID:41674808
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术，探究了慢性吗啡暴露如何重编程SIV感染猕猴脑脊液免疫细胞，驱动神经炎症和神经认知功能障碍 | 首次在SIV感染猕猴模型中，利用纵向单细胞转录组测序揭示了慢性阿片类药物暴露如何重编程脑脊液免疫细胞（特别是单核细胞）向疾病相关小胶质细胞（DAM）状态转变，并持续驱动神经炎症 | 研究基于猕猴模型，其结果向人类HIV感染者的直接外推需谨慎；样本量未明确说明；研究主要关注转录组变化，缺乏蛋白质或功能验证数据 | 探究阿片类药物使用如何影响HIV感染者（PWH）的神经认知功能障碍和神经炎症机制 | SIV感染、接受抗逆转录病毒治疗（ART）的恒河猴（RMs），分为吗啡给药组和盐水对照组 | 单细胞转录组学 | HIV感染相关神经认知障碍 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 91 | 2026-03-14 |
Identification of DIO2 as a Molecular Therapeutic Target for Depression in Chronic Rhinosinusitis: A Comprehensive Bioinformatics and Experimental Study
2026-Feb, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-025-11085-4
PMID:40089956
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，识别了慢性鼻窦炎与抑郁症共病的分子机制，并确定了DIO2作为潜在诊断和治疗靶点 | 首次结合生物信息学、机器学习、单细胞RNA测序和动物实验，系统性地揭示了慢性鼻窦炎与抑郁症共病的分子关联，并验证了DIO2的核心作用 | 研究主要基于公共数据库和动物模型，临床样本验证有限，且分子机制的具体通路细节仍需进一步探索 | 识别慢性鼻窦炎与抑郁症之间的潜在分子联系，并探索其诊断和治疗靶点 | 慢性鼻窦炎和抑郁症患者的基因表达数据，以及CRS小鼠模型 | 生物信息学 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），差异表达基因分析，加权基因共表达网络分析（WGCNA），富集分析（GO、KEGG、GSEA），机器学习算法（随机森林、LASSO回归） | 随机森林，LASSO回归 | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | 未明确指定样本数量，但使用了GEO数据库中的多个数据集和动物实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 92 | 2026-03-14 |
The Role of Coagulation-Related Genes in Glioblastoma: A Comprehensive Analysis of the Tumor Microenvironment, Prognosis, and Treatment
2026-Feb, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-025-11086-3
PMID:40113719
|
研究论文 | 本研究全面分析了凝血相关基因在胶质母细胞瘤肿瘤微环境、预后和治疗中的作用 | 首次从单细胞层面揭示了凝血通路在GBM内皮细胞中的激活及其通过SPP1-整合素途径介导的细胞间通讯，并构建了一个基于五个CRG的风险特征模型来预测预后和免疫治疗反应 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，需要更多前瞻性临床研究验证；体外实验模型可能无法完全模拟体内复杂的肿瘤微环境 | 阐明凝血相关基因在胶质母细胞瘤发生发展中的作用，并探索其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 胶质母细胞瘤患者（来自TCGA和CGGA693队列）及胶质瘤细胞系 | 生物信息学与计算生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，体细胞突变分析，免疫组化，CCK8实验，伤口愈合实验，集落形成实验 | LASSO回归，随机生存森林分析，无监督聚类 | 基因组数据（SNP，CNV），转录组数据（单细胞RNA-seq，批量RNA-seq），临床数据 | TCGA队列461例GBM患者，CGGA693队列GBM患者，以及公共单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 93 | 2026-03-14 |
Integration of imaging-based and sequencing-based spatial omics mapping on the same tissue section via DBiTplus
2026-Jan-15, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02948-0
PMID:41540123
|
研究论文 | 本文提出了一种名为DBiTplus的新型空间组学方法，可在同一组织切片上整合基于测序的空间转录组学和多重蛋白质成像 | 开发了DBiTplus方法，首次实现基于测序的空间转录组学与多重蛋白质成像在同一组织切片上的整合，并建立了配套的计算流程进行多模态数据整合与单细胞分辨率分析 | NA | 开发一种整合性多模态空间组学方法，以在单细胞分辨率下同时研究组织中的转录组和蛋白质组空间信息 | 小鼠胚胎冷冻切片、人类淋巴结和淋巴瘤组织的福尔马林固定石蜡包埋切片 | 空间组学 | 淋巴瘤 | 空间条形码技术、RNase H介导的cDNA回收、多重蛋白质成像 | NA | 空间转录组数据、蛋白质成像数据 | 多种样本类型，包括小鼠胚胎和人类淋巴组织 | NA | 空间转录组学、多重蛋白质成像 | DBiTplus | DBiTplus整合工作流程，包括空间条形码、cDNA回收和蛋白质成像技术 |
| 94 | 2026-03-14 |
Microneedle Delivery of Small Extracellular Vesicles From Young Blood to Treat Endothelial Senescence
2026-Jan, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202418352
PMID:40765122
|
研究论文 | 本文研究了从年轻脐带血浆分离的小细胞外囊泡通过微针贴片递送，对老年小鼠内皮细胞衰老的调节作用 | 首次比较年轻与老年血浆来源的小细胞外囊泡，并利用微针贴片实现其持续递送，以治疗内皮衰老 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类临床试验中验证 | 评估小细胞外囊泡在调节衰老中的作用，并探索其作为治疗血管疾病的潜在策略 | 老年小鼠（22-24个月大）的内皮细胞、心脏成纤维细胞和大脑小胶质细胞 | NA | 血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 老年小鼠，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 95 | 2026-03-14 |
Butyrate modifies epigenetic and immune pathways in peripheral mononuclear cells from children with neurodevelopmental disorders associated with chromatin dysregulation
2026-Jan, Neurotherapeutics : the journal of the American Society for Experimental NeuroTherapeutics
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.neurot.2025.e00792
PMID:41260988
|
研究论文 | 本研究探讨了丁酸盐对染色质相关神经发育障碍儿童外周单核细胞中表观遗传和免疫通路的调节作用 | 首次在染色质相关神经发育障碍中识别出共同的核糖体-免疫RNA特征，并证明丁酸盐能逆转这些通路异常，为跨多种神经发育障碍的潜在治疗策略提供新见解 | 样本量较小（总n=21），单细胞RNA测序仅涉及4名患者和2名对照，且丁酸盐治疗效果评估基于有限样本 | 研究丁酸盐作为组蛋白去乙酰化酶抑制剂，是否可通过调节染色质失调来改善神经发育障碍的病理机制 | 患有染色质相关神经发育障碍（如Kabuki综合征、CHARGE综合征、Rett综合征）和非单基因诊断神经发育障碍的儿童，以及健康对照儿童 | 表观遗传学与免疫学 | 神经发育障碍 | bulk RNA-seq, scRNA-seq | NA | RNA测序数据 | 总样本数21名儿童（包括患者和对照），单细胞RNA测序涉及101,539个外周免疫细胞 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 96 | 2026-03-14 |
Medicinal cannabis plant extract (NTI164) modifies epigenetic, ribosomal, and immune pathways in paediatric acute-onset neuropsychiatric syndrome
2026-Jan, Neurotherapeutics : the journal of the American Society for Experimental NeuroTherapeutics
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.neurot.2025.e00828
PMID:41513541
|
研究论文 | 本研究是一项开放标签试验，评估了富含大麻素、低THC的药用大麻提取物NTI164在14名慢性复发性儿童急性发作性神经精神综合征患者中的安全性、疗效及生物学效应 | 首次在PANS患者中应用多组学方法（包括单细胞转录组学、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学和DNA甲基化分析）全面揭示疾病相关的表观遗传、核糖体、免疫和信号通路失调，并证实NTI164能显著调节这些通路 | 研究为开放标签试验，样本量较小（n=14），缺乏安慰剂对照组，且随访时间较短（12周） | 评估药用大麻提取物NTI164在儿童急性发作性神经精神综合征中的治疗潜力，并探索其生物学作用机制 | 14名慢性复发性儿童急性发作性神经精神综合征患者（平均年龄12.1岁，范围4-17岁，71%为男性） | NA | 儿童急性发作性神经精神综合征 | 单细胞转录组学、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、DNA甲基化分析 | NA | 血液样本、临床评估量表数据 | 14名患者 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 97 | 2026-03-14 |
GenX-associated molecular signatures overlap with testicular aging and male infertility: a multi-omics integration analysis
2026, Journal of environmental science and health. Part A, Toxic/hazardous substances & environmental engineering
DOI:10.1080/10934529.2026.2640332
PMID:41797399
|
研究论文 | 本研究通过多组学整合分析，揭示了GenX暴露与睾丸衰老及男性不育相关的分子特征 | 首次构建了GenX-衰老基因集，并结合单细胞转录组学、机器学习及分子对接技术，系统阐明了GenX诱导生殖毒性的关键分子机制 | 研究主要基于生物信息学分析和动物模型验证，缺乏大规模人群队列的直接证据 | 探究GenX暴露与男性生殖系统衰老及不育的分子关联机制 | 人类睾丸衰老的单细胞RNA测序数据、男性不育转录组数据集、GenX暴露的大鼠睾丸组织 | 生物信息学 | 男性不育 | 单细胞RNA测序、转录组分析、RT-qPCR、分子对接 | LASSO回归、支持向量机递归特征消除 | 基因表达数据 | 人类睾丸衰老数据集GSE254315、男性不育数据集GSE45885/GSE45887、GenX暴露的大鼠睾丸组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 98 | 2026-03-14 |
A thermosensitive hydrogel encapsulating 2-DG alleviates periodontitis by inhibiting glycolysis and effector response of Th17 cells
2026, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2026.1767931
PMID:41821617
|
研究论文 | 本研究探讨了Th17细胞在牙周炎免疫调节中的作用，并开发了一种基于糖酵解抑制的局部药物递送系统，以提供更安全有效的治疗干预 | 通过单细胞RNA测序揭示牙周炎条件下CD4+ T细胞的代谢特征，并首次开发了封装2-DG的热敏水凝胶用于局部治疗 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类临床试验中验证 | 研究牙周炎中Th17细胞的免疫调节机制，并开发基于糖酵解抑制的局部治疗策略 | IL17A-KO小鼠模型、CD4+ T细胞、Th17细胞 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 99 | 2026-03-14 |
A Cross-Tissue Transcriptome Association Study Revealed Novel Susceptibility Genes for Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2026, International journal of chronic obstructive pulmonary disease
IF:2.7Q2
DOI:10.2147/COPD.S578900
PMID:41821648
|
研究论文 | 本研究通过跨组织转录组关联分析结合单细胞转录组分析，鉴定了慢性阻塞性肺疾病的两个新易感基因DNAJA4和IREB2 | 首次通过跨组织转录组关联研究结合单细胞验证，发现DNAJA4和IREB2这两个新的COPD易感基因，并揭示了它们通过调节蛋白质折叠修饰和代谢过程影响疾病风险的潜在机制 | 研究主要基于欧洲人群数据（FinnGen数据库和GTEx数据），可能在其他人群中的普适性有待验证；动物和细胞模型虽能模拟炎症，但无法完全复制人类COPD的复杂病理过程 | 鉴定慢性阻塞性肺疾病的遗传易感基因并探索其潜在作用机制 | 人类遗传数据（FinnGen R10数据库、GTEx v8）、C57BL/6小鼠、Beas-2b细胞、COPD患者肺组织 | 生物信息学与遗传学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 转录组关联研究、单细胞转录组分析、SMR分析、共定位分析、基因功能验证（质粒过表达和siRNA）、GeneMANIA网络分析 | TWAS模型、sCCA模型、FUSION方法、MAGMA验证 | 转录组数据、单细胞RNA-seq数据、遗传关联数据 | 未明确说明具体样本数量，但使用了FinnGen R10数据库、GTEx v8数据库以及实验动物和细胞模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 100 | 2026-03-14 |
Machine learning-derived AS and AIS scores leverage BCAA metabolism and IL4I1 activity for prognosis and tailored therapy in ccRCC
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1720910
PMID:41822356
|
研究论文 | 本研究通过单细胞数据分析，结合机器学习算法构建了AS评分和AIS评分，用于评估ccRCC患者的预后和指导个体化治疗，并探讨了IL4I1与支链氨基酸代谢在ccRCC进展中的作用 | 利用十种机器学习算法整合多组学数据构建AS评分和AIS评分，首次将支链氨基酸代谢与IL4I1活性结合用于ccRCC的预后预测和个体化治疗策略制定 | 研究主要基于TCGA和GEO队列的回顾性数据，缺乏前瞻性临床验证；样本异质性可能影响评分系统的普适性 | 开发基于支链氨基酸代谢和IL4I1活性的评分系统，以改善ccRCC患者的预后评估和个体化治疗 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）患者 | 机器学习 | 肾癌 | 单细胞数据分析，空间转录组学，单细胞多组学 | 十种机器学习算法（具体未指定），主成分分析 | 单细胞数据，空间转录组数据，多组学数据 | TCGA和GEO队列数据（具体样本数未提供） | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学，单细胞多组学 | NA | NA |