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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-01-01 |
Construction of a prognostic model for colorectal cancer liver metastasis based on single-cell transcriptomics and regulation of the MIF pathway
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1588514
PMID:41127012
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研究论文 | 本研究基于单细胞转录组学数据,构建了结直肠癌肝转移的预后模型,并探讨了MIF通路在转移过程中的调控作用 | 结合单细胞转录组学与批量RNA-seq数据,识别了结直肠癌肝转移过程中上皮细胞的关键基因表达变化,并构建了一个新的预后风险模型 | 研究数据主要来源于公共数据库(GEO和TCGA),需要进一步的独立队列和实验验证来确认模型的普适性 | 构建结直肠癌肝转移的预后模型并阐明MIF通路在转移中的作用机制 | 结直肠癌患者样本(含肝转移) | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | 预后风险模型 | 转录组数据 | 来自GEO和TCGA数据库的结直肠癌样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 82 | 2026-01-01 |
Inhibition of A2AR alleviates adenosine-mediated suppression of plasma cell differentiation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1702402
PMID:41472728
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研究论文 | 本研究探讨了A2AR在腺苷介导的B细胞向抗体分泌细胞分化抑制中的作用,并通过A2AR拮抗剂inupadenant逆转这一效应 | 首次揭示了A2AR通过B细胞内在机制抑制B细胞成熟为抗体分泌细胞,并利用空间转录组学验证了inupadenant在患者肿瘤活检中的治疗效果 | 样本量较小(10个肿瘤样本用于质谱成像,5名患者用于空间转录组学分析),且主要基于体外实验和有限的患者数据 | 研究A2AR在人类B细胞中的作用,特别是其对B细胞成熟和抗体分泌的影响 | 人类B细胞、浆细胞、肿瘤浸润B细胞、扁桃体B细胞以及肿瘤样本 | 免疫学 | 肿瘤 | 定量质谱成像、GeoMx分析、免疫组织化学、多重免疫荧光、scRNA-seq、流式细胞术、LegendPLEX、空间转录组学 | NA | 图像、单细胞RNA-seq数据、空间转录组数据 | 10个肿瘤样本用于质谱成像,5名癌症患者肿瘤活检用于空间转录组学分析,以及体外分化的B细胞和扁桃体B细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Visium | Visium空间转录组平台用于肿瘤活检分析 |
| 83 | 2026-01-01 |
EGR3 as a dual tumor-immune regulator: a machine learning-driven prognostic target for cold breast cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1627133
PMID:41472745
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学方法和机器学习,识别并验证了EGR3作为乳腺癌预后生物标志物和免疫治疗靶点 | 利用机器学习优化的3基因预后模型,并首次验证EGR3在肿瘤抑制和免疫调节中的双重功能 | 研究主要基于回顾性队列数据,需要进一步前瞻性临床验证 | 识别乳腺癌的关键分子驱动因子并验证其临床相关性 | 乳腺癌患者的多组学数据及临床样本 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,多组学分析,机器学习 | StepCox-Random Survival Forest (RSF) | 基因表达数据,临床数据 | TCGA、GEO (GSE42568, GSE9893, GSE7390) 和 METABRIC 数据集中的多个队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 84 | 2026-01-01 |
Correction: Construction of a prognostic model for colorectal cancer liver metastasis based on single-cell transcriptomics and regulation of the MIF pathway
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1731870
PMID:41473439
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correction | 本文是对一篇关于基于单细胞转录组学构建结直肠癌肝转移预后模型及调控MIF通路研究的文章的更正 | NA | NA | NA | NA | NA | 结直肠癌肝转移 | 单细胞转录组学 | 预后模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 85 | 2026-01-01 |
The Neuroimmune Axis in Atopic Dermatitis: From Pathogenic Mechanisms to Targeted Neuroimmunotherapy
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S578036
PMID:41473600
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综述 | 本文综述了神经免疫轴在特应性皮炎发病机制中的核心作用,并探讨了基于生物标志物的精准神经免疫治疗策略 | 将神经免疫轴置于AD发病机制的核心位置,系统整合了多组学、系统生物学和神经影像学的最新发现,提出了基于生物标志物的分层、持久和以患者为中心的神经免疫治疗新框架 | 生物标志物的临床验证、长期安全性、可及性以及在不同患者群体中的实施仍面临挑战 | 阐明特应性皮炎的神经免疫发病机制,并探索基于精准医学的神经免疫靶向治疗策略 | 特应性皮炎 | NA | 特应性皮炎 | 单细胞转录组学、空间转录组学、神经影像学、微生物组分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 86 | 2026-01-01 |
DIAPH3 is upregulated in high-grade gliomas and linked to chromosomal instability
2025 Jan-Dec, Neuro-oncology advances
IF:3.7Q2
DOI:10.1093/noajnl/vdaf233
PMID:41473744
|
研究论文 | 本研究探讨了DIAPH3在胶质瘤中的表达及其与染色体不稳定性的关联 | 首次在临床胶质瘤样本中确认DIAPH3在高级别胶质瘤中特异性上调,并验证其与染色体不稳定性(非整倍体)的直接关联 | DIAPH3的预后价值未超越WHO CNS5胶质瘤分类,且研究主要基于公共数据集和细胞系实验,缺乏体内验证 | 研究DIAPH3在胶质瘤中的表达模式及其对染色体稳定性的影响 | 胶质瘤样本(包括低级别和高级别)及胶质母细胞瘤细胞系 | 癌症生物学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA-seq、公共数据库分析 | NA | 基因表达数据 | 基于公共数据集(如TCGA)和单细胞RNA-seq研究的胶质瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 87 | 2026-01-01 |
Spatial, transcriptomic and epigenomic analyses link dorsal horn neurons to chronic pain genetic predisposition
2024-Mar-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2022.04.01.486135
PMID:41427296
|
研究论文 | 本研究通过多物种方法,结合空间转录组学和表观基因组学分析,揭示了慢性疼痛遗传易感性变异与脊髓背角神经元调控元件的关联 | 首次构建了包含猕猴、人类和小鼠的综合单细胞图谱,并利用细胞分辨率空间转录组学绘制了物种保守神经元亚型的层状分布,发现了意外的组织模式 | 研究主要基于动物模型和体外数据,需要进一步验证这些发现是否直接适用于人类慢性疼痛的临床治疗 | 确定慢性疼痛遗传变异是否影响背角神经元的调控元件 | 猕猴、人类和小鼠的脊髓背角神经元 | 数字病理学 | 慢性疼痛 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、单细胞开放染色质分析 | NA | 转录组数据、表观基因组数据、空间分布数据 | 多物种综合数据集(具体数量未在摘要中明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 88 | 2026-01-01 |
Longitudinal multi-functional analysis identified responses of T cells, B cells, and monocytes as hallmarks of immunotherapy tolerance in patients with merkel cell carcinoma
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0293922
PMID:37983224
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了默克尔细胞癌患者外周血中免疫细胞的动态变化,揭示了免疫治疗耐受的机制 | 采用纵向多组学方法,结合单细胞RNA测序和批量RNA数据验证,识别了T细胞耗竭、B细胞失调和单细胞亚群变化作为免疫逃逸的关键标志 | 样本量较小(仅基于四名患者的时间点数据),且主要依赖外周血分析,可能未完全反映肿瘤微环境的变化 | 探究默克尔细胞癌患者免疫治疗耐受的细胞机制和免疫逃逸条件 | 默克尔细胞癌患者的外周血免疫细胞 | 数字病理学 | 皮肤癌(默克尔细胞癌) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 四名患者的外周血样本,采集自四个时间点 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 89 | 2026-01-01 |
High-Throughput Monitoring of Bacterial Cell Density in Nanoliter Droplets: Label-Free Detection of Unmodified Gram-Positive and Gram-Negative Bacteria
2021-01-19, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.0c03408
PMID:33301291
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于纳米液滴散射光的高通量、无标记细菌检测方法,适用于革兰氏阳性和阴性细菌 | 开发了无需基因修饰或化学标记的高通量无标记细菌检测技术,利用纳米液滴散射光测量实现细菌增殖的可靠检测 | 未在摘要中明确说明具体局限性 | 开发适用于临床、研究和工业领域多种细菌菌株的高通量微液滴分析技术 | 未修饰的革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌 | 微生物分析技术 | NA | 液滴微流控技术、散射光测量 | NA | 光学信号数据(散射光、荧光) | NA | NA | 液滴微流控 | NA | 纳米液滴封装系统 |
| 90 | 2025-12-31 |
Single-cell landscape of peripheral and tumor-infiltrating immune cells in HPV-negative HNSCC
2026-Dec-31, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2025.2605741
PMID:41467967
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据和空间蛋白质组学数据,揭示了HPV阴性头颈鳞状细胞癌中肿瘤浸润免疫细胞的独特景观和空间分布特征 | 首次在HPV阴性HNSCC中整合单细胞转录组和空间蛋白质组数据,揭示了肿瘤局部免疫细胞的空间特异性耗竭状态 | 样本量相对有限(29个单细胞样本,9个空间蛋白质组样本),且所有空间样本均来自舌侧黏膜,可能限制结果的普适性 | 揭示HPV阴性头颈鳞状细胞癌的肿瘤局部免疫景观,以发现可行的免疫治疗靶点 | HPV阴性头颈鳞状细胞癌患者的外周血单个核细胞和肿瘤浸润免疫细胞 | 单细胞组学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光分析 | 伪时间轨迹分析, 配体-受体分析 | 单细胞转录组数据, 空间蛋白质组数据 | 29个单细胞RNA测序样本(总计约30万个免疫细胞),9个空间蛋白质组样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组/蛋白质组 | NA | NA |
| 91 | 2025-12-31 |
Breaking barriers: epithelial-mesenchymal transition role in melanoma invasion and resistance
2026-Feb-01, Melanoma research
IF:1.5Q4
DOI:10.1097/CMR.0000000000001068
PMID:41222312
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综述 | 本综述探讨了上皮-间质转化(EMT)在黑色素瘤侵袭和耐药中的核心作用 | 详细阐述了EMT在黑色素瘤中的分子机制,包括转录因子、信号通路、表观遗传和非编码RNA调控,并强调了EMT与肿瘤微环境的相互作用及作为预后生物标志物的潜力 | 存在EMT异质性和临床前模型不足的局限性 | 阐明EMT在黑色素瘤进展、转移和耐药中的角色,以推动治疗策略发展 | 黑色素瘤细胞及其EMT过程 | NA | 黑色素瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞分析, 空间转录组学 | NA | NA |
| 92 | 2025-12-31 |
Bulk and Single-Cell Transcriptomics Reveal the Role of Inflammatory Response-Related Genes in Cerebral Ischemia-Reperfusion Injury
2026-Jan-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202503423R
PMID:41460635
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组学数据,识别了在脑缺血再灌注损伤中起关键作用的炎症反应相关基因,并构建了诊断模型 | 首次整合单细胞和批量转录组学数据,系统识别了脑缺血再灌注损伤中的关键炎症反应相关基因,并揭示了小胶质细胞的功能异质性亚群在炎症调控中的协同作用 | 需要进一步的前瞻性临床研究和功能实验验证 | 识别脑缺血再灌注损伤中的诊断和治疗性炎症反应相关基因 | 大鼠/小鼠的脑缺血再灌注损伤样本 | 生物信息学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | LASSO回归, 共识聚类 | 基因表达谱数据 | 来自GEO数据库的多个数据集(GSE97537, GSE61616, GSE137482, GSE227651),具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 93 | 2025-12-31 |
Multi-Omic Profiling of T Cell-Mediated Rejection After Kidney Transplantation Reveals B Cell Receptor Repertoire Expansion and Its Prognostic Relevance
2026-Jan-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202502448RR
PMID:41467897
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了肾移植后T细胞介导排斥反应中B细胞受体库的显著扩增及其预后相关性 | 首次描绘了T细胞介导排斥反应中BCR库的免疫图谱,发现了MEI1作为BCR相关关键基因,并确定浸润性浆细胞是BCR的主要携带者 | 研究基于多个独立队列但仍需更大样本验证,机制研究有待深入 | 探索肾移植后T细胞介导排斥反应的免疫机制并寻找新的治疗靶点 | 肾移植患者的肾同种异体移植物 | 数字病理学 | 肾移植排斥反应 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫荧光, 多组学整合分析 | TRUST4算法 | 转录组数据, 单细胞数据, 细胞系数据, 图像数据 | 三个独立的肾移植队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 94 | 2025-12-31 |
Tumor microenvironment differences between diagnostic and relapsed classic Hodgkin lymphoma revealed by scRNA-seq
2026-Jan-13, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2025017107
PMID:40924921
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了经典霍奇金淋巴瘤诊断与复发阶段肿瘤微环境的差异,特别关注了早期复发中幼稚B细胞的作用 | 首次在早期复发经典霍奇金淋巴瘤中发现并验证了具有免疫抑制潜能的galectin-9阳性幼稚B细胞群体,揭示了其通过LGALS9-HAVCR2轴与调节性T细胞相互作用的空间结构 | 研究样本量有限,且主要关注B细胞亚群,其他免疫细胞在复发中的作用仍需进一步探索 | 探究经典霍奇金淋巴瘤诊断与复发阶段肿瘤微环境的差异,特别是非恶性B细胞在复发中的作用 | 配对的诊断和复发经典霍奇金淋巴瘤样本 | 单细胞组学 | 经典霍奇金淋巴瘤 | 单细胞RNA测序,成像质谱流式细胞术,免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据,空间蛋白质表达数据 | 配对诊断和复发CHL样本及独立验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 95 | 2025-12-31 |
Revealing Inhibition of Gastric Cancer Occurrence and Metastasis by GPX3 Through Single-Cell Transcriptomics and Organoid Multimodal Technologies
2026-Jan, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.70057
PMID:41118587
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学结合类器官多模态技术,揭示了GPX3在抑制胃癌发生和转移中的作用 | 首次结合单细胞转录组分析和类器官模型,系统性地揭示了GPX3作为胃癌转移的潜在抑制因子及其在体内外实验中的功能验证 | 样本量相对较小(3个原发肿瘤、1个癌旁组织、6个转移样本),且主要基于公共数据集GSE163558进行分析 | 阐明驱动胃癌转移的关键因子,并探索其作为治疗靶点的潜力 | 胃癌细胞、患者来源的胃癌类器官、裸鼠肝转移模型 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 10个样本(3个原发GC、1个癌旁、6个GC转移样本) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 96 | 2025-12-31 |
Genetic Association Between Polymyositis/Dermatomyositis and Epilepsy: Insights From Mendelian Randomization and Bioinformatic Analyses
2026-Jan, Brain and behavior
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/brb3.71148
PMID:41466027
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研究论文 | 本研究利用孟德尔随机化和生物信息学分析探讨了多发性肌炎/皮肌炎与癫痫之间的遗传关联及免疫介导机制 | 首次结合孟德尔随机化与单细胞转录组学揭示多发性肌炎与癫痫之间的因果关联及免疫细胞浸润模式 | 研究未发现皮肌炎与癫痫的显著关联,且样本主要基于公开数据库,缺乏大规模临床验证 | 探索多发性肌炎/皮肌炎与癫痫之间的潜在因果联系及免疫介导机制 | 多发性肌炎、皮肌炎和癫痫患者,以及癫痫小鼠模型的海马组织 | 生物信息学 | 多发性肌炎/皮肌炎与癫痫 | GWAS, 孟德尔随机化, 转录组分析, 单细胞转录组学, PCR | 孟德尔随机化模型, 生物信息学分析模型 | 基因组关联数据, 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 基于公开GWAS数据库(如finn-b-M13_POLYMYO, finn-b-DERMATOPOLY_FG, ebi-a-GCST90018840)和癫痫小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 97 | 2025-12-31 |
Spatial Transcriptomics Unveils Landscape of Resistance to Concurrent Chemo-Radiotherapy in Hypopharyngeal Squamous Cell Carcinoma: The Role of SPP1+ Macrophages
2026-Jan, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71493
PMID:41466485
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术,揭示了SPP1+巨噬细胞通过CD44和ITGB1介导的配体-受体相互作用,在晚期下咽鳞状细胞癌中对同步放化疗产生抵抗的肿瘤微环境中的作用机制 | 首次在CCRT抵抗的下咽鳞状细胞癌中,通过空间转录组学技术,明确了SPP1+巨噬细胞在肿瘤微环境中的空间分布特征及其与恶性细胞的特异性相互作用 | 研究样本量有限,且为观察性研究,需要更大规模的前瞻性队列和功能实验验证SPP1+巨噬细胞在CCRT抵抗中的因果作用 | 探究下咽鳞状细胞癌对同步放化疗产生抵抗的肿瘤微环境机制,以寻找预测性生物标志物和开发靶向治疗策略 | 晚期下咽鳞状细胞癌患者的组织样本,包括CCRT抵抗组和未接受CCRT组 | 空间转录组学 | 下咽鳞状细胞癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 未明确具体数量,但包括CCRT抵抗和未接受CCRT的晚期下咽鳞状细胞癌患者组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 98 | 2025-12-31 |
Prognostic Significance of LGALS3BP in Triple-Negative Breast Cancer: Implications for Immune Infiltration and Therapeutic Response
2026-Jan, Journal of biochemical and molecular toxicology
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jbt.70536
PMID:41467329
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转录组分析,鉴定出LGALS3BP作为三阴性乳腺癌中关键的脂质相关巨噬细胞标志物,并探讨其与免疫浸润、治疗反应及预后的关联 | 首次将LGALS3BP识别为三阴性乳腺癌中脂质相关巨噬细胞的关键预后标志物,并揭示了其与免疫浸润和免疫治疗反应的直接联系 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;样本来源和数量可能有限,需进一步临床队列验证 | 识别三阴性乳腺癌肿瘤微环境中的新型预后标志物,并探索其免疫调节功能 | 三阴性乳腺癌患者样本,特别是肿瘤微环境中的脂质相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 99 | 2025-12-31 |
Nanoplastics in Duckweed: Single-Cell Responses and Recovery
2025-Dec-30, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c15989
PMID:41400345
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学、酶活性测定和铕掺杂纳米塑料示踪技术,全面探究了浮萍对聚苯乙烯纳米塑料在环境相关剂量和高剂量下的响应与恢复过程 | 首次在单细胞分辨率下揭示了浮萍对纳米塑料的细胞类型特异性响应机制,并整合纳米示踪技术量化了吸收与排泄过程 | 研究仅针对聚苯乙烯纳米塑料和浮萍模型,其他类型纳米塑料或水生植物的响应机制仍需进一步探究 | 阐明水生植物对纳米塑料污染的响应与恢复分子机制 | 浮萍(水生植物模型) | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组学,酶活性测定,纳米示踪技术 | NA | 单细胞转录组数据,酶活性数据,示踪定量数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单核RNA测序(snRNA-seq) |
| 100 | 2025-12-31 |
A complete spatial map of mouse retinal ganglion cells reveals density and gene expression specializations
2025-Dec-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2515449122
PMID:41452983
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学和机器学习技术,绘制了小鼠视网膜神经节细胞(RGCs)的完整空间分布图谱,揭示了其密度和基因表达的特异性 | 首次绘制了所有已知RGC类型的完整空间分布图,并发现了基因表达在背腹轴和ART区域内的空间变异,以及小鼠ART与灵长类黄斑基因谱的有限相关性 | 研究主要基于小鼠模型,与灵长类中央视觉的特化可能存在差异,且空间转录组学技术分辨率可能限制细胞亚型的精细分析 | 揭示小鼠视网膜神经节细胞的空间分布特化和基因表达模式 | 小鼠视网膜神经节细胞(RGCs) | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,机器学习,en-face冷冻切片 | 机器学习 | 空间转录组数据,图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |