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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-07-08 |
TranscriptFormer: A generative cell atlas across 1.5 billion years of evolution
2026-Jul-02, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aec8514
PMID:42096520
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研究论文 | 提出TranscriptFormer,一个跨1.53亿年进化史的生成式细胞图谱基础模型,在细胞类型分类和疾病状态识别上达先进水平 | 首次训练包含12个物种、1.12亿细胞的生成式基础模型,实现跨超过6.85亿年进化距离物种的零样本疾病状态识别,无需训练即可自然涌现发育轨迹和系统发育关系 | 未说明 | 开发通用单细胞分析框架,揭示跨物种细胞组织的普适原则 | 12个物种的细胞,涵盖1.53亿年进化史 | 机器学习 | 未指定 | 单细胞转录组测序 | 生成式基础模型(Transformer变体) | 单细胞基因表达数据 | 1.12亿个细胞 | 未指定 | 单细胞RNA测序 | 未指定 | 未指定 |
| 82 | 2026-07-08 |
Patterning human kidney organoids with synthetic Wnt-secreting organizers
2026-Jul-02, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adu9122
PMID:42391378
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研究论文 | 通过合成Wnt分泌组织者实现人类肾脏类器官的模式化 | 首次通过引入工程化的Wnt分泌细胞组织者,在体外重建了肾脏发育中的信号几何结构,从而实现对肾脏类器官空间模式的控制 | 未提及具体限制 | 研究肾脏发育中组织信号几何结构的作用,并探索在体外重建该结构以控制组织模式化的可能性 | 人类肾脏类器官及工程化Wnt分泌细胞组织者 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 83 | 2026-07-08 |
The dual role of the microbiome in sepsis: A complex interplay between pathogenicity and protection
2026-Jul-02, Physics of life reviews
IF:13.7Q1
DOI:10.1016/j.plrev.2026.07.001
PMID:42407193
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综述 | 探讨微生物组在脓毒症中的双重作用,强调其既参与致病机制又具有保护潜力 | 提出超越传统抗感染治疗,以微生物组为中心的免疫-微生物稳态修复新范式 | 未明确讨论现有微生物组调控策略的具体临床转化障碍 | 总结微生物组在脓毒症发病和免疫调节中的双重作用,并展望基于微生物组调控的治疗策略 | 脓毒症患者中微生物组与宿主免疫系统的相互作用 | 机器学习 | 脓毒症 | 单细胞组学,空间转录组学,代谢组学 | NA | 综述文章,不涉及具体数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 84 | 2026-07-08 |
Single-cell transcriptomics reveals a new marine parasite: Characterization and distribution of Rozellomyces from the Gulf of Alaska
2026 Jul-Aug, Mycologia
IF:2.6Q2
DOI:10.1080/00275514.2026.2631200
PMID:41871174
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研究论文 | 基于单细胞转录组学在阿拉斯加湾发现了一种新的海洋寄生微生物——Rozellomyces,并对其特征和分布进行了描述 | 首次通过单细胞转录组学方法从阿拉斯加湾分离并描述了一种新的罗兹菌门(Rozellomycota)物种,系统发育分析证实其与已知分类群的差异,并基于metaPR数据库恢复其地理分布 | 未明确提及限制,但可能受限于单一样本来源(阿拉斯加湾)和数据库依赖的分布推断 | 揭示海洋寄生微生物的多样性和生态功能,特别是罗兹菌门中未被充分研究的类群 | 来自阿拉斯加湾的新罗兹菌分离株,以及其寄主——海洋硅藻 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序、系统发育分析、扩增子序列变异分析 | NA | 转录组数据、扩增子序列数据 | 阿拉斯加湾的1个罗兹菌分离株样本及metaPR数据库中的相关序列变异 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 85 | 2026-07-08 |
Exploring the immune environment of glioblastoma in humanized mouse models
2026-Jul-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag073
PMID:41913047
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研究论文 | 通过人源化小鼠模型探索胶质母细胞瘤的免疫环境,建立患者来源异种移植模型以模拟复发性人类GBM | 首次利用表达关键人细胞因子的免疫缺陷小鼠构建人源化GBM模型,成功重现人类复发性GBM的免疫细胞特征,并增强肿瘤异质性 | 仅评估了两个免疫缺陷小鼠品系,可能未涵盖所有相关细胞因子表达模型;人源化程度及长期稳定性未详细讨论 | 建立能真实反映人类GBM免疫环境的小鼠模型,以促进新型疗法(特别是免疫疗法)的研究 | 胶质母细胞瘤(GBM)患者来源的放疗抵抗性异种移植物,以及人源化小鼠中重建的人类免疫细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、光谱流式细胞术、免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据、图像数据 | 两种免疫缺陷小鼠模型,接受CD34+造血干祖细胞移植后植入放疗抵抗性PDX肿瘤 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 86 | 2026-07-08 |
Glyoxalase 1 promotes glioma progression by modulating Sox2 transcriptional networks in glioma stem-like cells
2026-Jul-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag090
PMID:42011505
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研究论文 | 通过单细胞转录组学等手段发现乙二醛酶1通过调节Sox2转录网络促进胶质瘤干细胞样细胞驱动的肿瘤进展 | 首次发现Glo1是胶质瘤干细胞样细胞的关键调控因子,并揭示其作为治疗靶点的潜力 | 未明确指出局限性 | 研究乙二醛酶1在胶质瘤干细胞样细胞和胶质母细胞瘤中的作用及治疗潜力 | 胶质瘤干细胞样细胞和胶质母细胞瘤 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组学,功能性基因组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 患者来源异种移植模型和宫内电穿孔模型的胶质母细胞瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 87 | 2026-07-08 |
Optics-free spatial genomics for mapping mammalian brain aging by IRISeq
2026-Jul, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-026-02293-1
PMID:42120609
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研究论文 | 介绍一种无光学器件的空间基因组学平台IRISeq,用于绘制哺乳动物大脑衰老图谱 | 提出无光学器件、基于索引测序的空间交互映射平台IRISeq,实现可调尺寸和分辨率的组织分析,兼具高通量和低成本优势 | 未明确提及,可能包括分辨率受限或样本处理复杂性 | 开发无光学器件的空间转录组学平台,揭示大脑衰老中淋巴细胞依赖的区域特异性机制 | 成年和老年小鼠脑部冠状切片,包括野生型和两种淋巴细胞缺陷模型(Rag1和Prkdc突变体) | 机器学习和空间转录组学 | 老年性疾病 | 索引测序(Indexed Sequencing)、单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据、单细胞转录组数据 | 超过70个小鼠脑部冠状切片,生成超过46万个空间转录组图谱,整合783,264个单细胞转录组 | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | IRISeq | 无光学器件的空间交互映射平台,分辨率为5-50微米 |
| 88 | 2026-07-08 |
Single-cell multi-omic atlas and morphogen screening informs midbrain and hindbrain organoid engineering
2026-Jul, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-026-02316-x
PMID:42237030
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研究论文 | 通过单细胞多组学图谱和形态发生素筛选,指导中脑和后脑类器官的工程化构建 | 首次结合单细胞转录组与可及染色质测序,系统解析中脑和后脑类器官的细胞组成及调控机制,并通过高通量形态发生素筛选扩展类器官模型 | 研究主要依赖体外类器官模型,可能无法完全模拟体内复杂微环境及长期发育过程 | 阐明中脑和后脑类器官的细胞类型及基因调控网络,优化类器官工程化策略 | 中脑和后脑类器官的细胞亚群及神经分化过程 | 数字病理学, 机器学习 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 转录因子扰动, 形态发生素筛选 | 基因调控网络, 转录因子扰动模型 | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 89 | 2026-07-08 |
Laser interstitial thermal therapy enhances bidirectional blood-brain barrier permeability in glioblastoma
2026-Jul-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag080
PMID:41981754
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研究论文 | 激光间质热疗增强胶质母细胞瘤血脑屏障双向通透性的机制研究 | 首次揭示LITT通过下调细胞连接通路和上调胞吞作用实现血脑屏障双向通透性变化,并证明其能促进循环肿瘤DNA释放 | 未提及具体局限性 | 探究激光间质热疗对胶质母细胞瘤血脑屏障通透性的机制及时空特征 | 小鼠模型及人胶质母细胞瘤组织 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、透射电镜、数字液滴PCR | NA | 基因表达数据、图像数据 | 小鼠模型(具体数量未提及)及人胶质母细胞瘤组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 90 | 2026-07-08 |
Single-Cell Transcriptomics and Development of Gametocyte-Specific Molecular Markers for Avian Malaria Parasites
2026-Jul, Molecular ecology resources
IF:5.5Q1
DOI:10.1111/1755-0998.70157
PMID:42409029
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研究论文 | 基于单细胞转录组学开发禽疟原虫配子体特异性分子标记,用于区分和定量雄性和雌性配子体 | 首次开发出能区分禽疟原虫无性期、雄性和雌性配子体的分子标记,并利用单细胞RNA测序和直系同源引导的阶段映射方法,实现灵敏的配子体定量和性别鉴定 | 研究受限于禽类宿主有核红细胞和缺乏体外培养系统,可能影响标记的进一步验证和应用 | 开发分子标记以定量和区分禽疟原虫的雄性和雌性配子体,改善对传播动态的理解 | 广泛分布的禽疟原虫(Plasmodium relictum)的两种细胞色素b谱系(pSGS1和pDELURB4) | 单细胞转录组学 | 禽疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及两种寄生虫细胞色素b谱系的多个样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 采用单细胞RNA测序和直系同源引导的阶段映射方法 |
| 91 | 2026-07-08 |
Revolutionary Tools for Decoding the Complexity of Forest Trees: The Application of Single-Cell and Spatial Transcriptomics in Woody Plants
2026 Jul-Aug, Physiologia plantarum
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/ppl.71007
PMID:42409600
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综述 | 系统阐述了单细胞RNA测序和空间转录组学在木本植物研究中的发展历程、技术流程、整合方式及前沿应用 | 首次系统总结了scRNA-seq和ST在木本植物维管形成层分化、非生物胁迫响应及稀有细胞类型鉴定等方面的突破性应用 | 讨论了将这些技术应用于森林树木研究时面临的挑战,如组织解离困难、细胞标记物缺乏和数据分析复杂性 | 揭示单细胞和空间转录组学在解读木本植物复杂生物学中的潜力,为相关领域研究和应用提供新视角 | 木本植物(森林树木) | 其他 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 转录组数据、空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 92 | 2026-07-08 |
Transcriptomic-based molecular classification of ampullary adenocarcinoma
2026-Jun-30, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218701
PMID:42379261
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研究论文 | 通过整合批量RNA测序、单细胞RNA测序和临床病理数据,对壶腹部腺癌进行基于转录组的分子分型,并提出了新型分子分类系统AMS | 首次提出基于转录组的壶腹部腺癌分子分类系统AMS,将患者分为预后不同的两个亚型,并鉴定MUC16作为潜在生物标志物和治疗靶点 | 信息不足,无法提取具体局限性 | 建立壶腹部腺癌的分子分类框架,揭示肿瘤微环境异质性,并推动精准肿瘤学发展 | 壶腹部腺癌患者肿瘤样本、细胞系及异种移植模型 | 机器学习和数字病理学 | 壶腹部腺癌 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、临床数据 | NA | NA | 批量RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 93 | 2026-07-08 |
Integrated transcriptomic analysis reveals key regulatory mechanisms of HIPK2 in osteoarthritis and identifies potential therapeutic target drugs
2026-Jun-26, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000049323
PMID:42363474
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研究论文 | 整合转录组分析揭示HIPK2在骨关节炎中的关键调控机制并识别潜在治疗靶点药物 | 首次结合多个批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据系统分析HIPK2在骨关节炎中的表达模式及其与细胞外基质相关通路的关联,并通过分子对接筛选潜在的HIPK2结合化合物 | 研究结果仅为假设生成性质,需要在体外和体内进行进一步的实验验证 | 旨在通过整合转录组分析表征HIPK2在骨关节炎中的表达模式并探索其转录组关联,识别潜在治疗靶点药物 | 骨关节炎患者软骨组织样本中的HIPK2表达及其相关的基因和通路变化 | 自然语言处理 | 骨关节炎 | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 加权基因共表达网络分析, LASSO回归, 分子对接 | NA | 基因表达数据, 转录组数据 | 多个批量RNA-seq数据集和单细胞RNA-seq数据集 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 94 | 2026-07-08 |
Research on RARs in neurodegenerative diseases: A bibliometric analysis
2026-Jun-26, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000049472
PMID:42363496
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研究论文 | 通过文献计量学和可视化分析,系统概述视黄酸受体在神经退行性疾病中的研究现状与未来趋势 | 首次利用文献计量方法定量分析RARs在神经退行性疾病领域的研究脉络,揭示国际合作格局和新兴热点如微胶质细胞、血脑屏障及转化模型 | 研究局限于已发表文献,可能遗漏未收录的灰色文献;分析方法依赖关键词共现,无法深入解析分子机制 | 系统梳理RARs在神经退行性疾病中的研究现状和发展轨迹 | 关于RARs在神经退行性疾病中的原创研究和综述文章 | 自然语言处理 | 神经退行性疾病 | NA | NA | 文本 | 1094篇文章 | NA | NA | NA | NA |
| 95 | 2026-07-08 |
An Integrated Approach Reveals the Pre-Osteoblast-Driven Metrnl Synergizes With Circadian Genes to Inhibit Osteogenesis
2026-Jun-24, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/FBL53692
PMID:42411481
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研究论文 | 通过整合临床样本、蛋白质组学、单细胞RNA测序和基因敲除小鼠模型,揭示Metrnl通过Rack1-PKCα-Bmal1-Cry2信号轴抑制骨形成的机制 | 首次发现Metrnl作为骨形成负调控因子,阐明其通过细胞内Rack1相互作用影响昼夜节律基因表达调控成骨分化的全新机制 | 未提供具体局限性描述,但推论在于研究的样本量有限(每组6只小鼠),临床关联仅基于绝经后女性骨髓样本,可能需更广泛的验证 | 系统研究Metrnl在骨骼生物学中的表达谱、生理功能和分子机制,为骨质疏松促合成疗法提供新靶点 | 绝经后骨质疏松女性骨髓标本、小鼠(全身敲除和条件性敲除模型)及成骨前体细胞 | 机器学习 | 骨质疏松症 | 蛋白质组学, 单细胞RNA测序, Micro-CT, 骨组织形态计量学, 免疫共沉淀, 转录活性测定 | NA | 基因表达数据, 蛋白质互作数据, 影像数据 | 临床骨髓标本(未明确数量)、小鼠每组6只 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 96 | 2026-07-08 |
Identification of the Mitochondrial Gene NME6 as an Immune Modulator in Heart Failure
2026-Jun-24, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/FBL48958
PMID:42411484
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研究论文 | 本研究通过功能富集分析、单细胞RNA测序及小鼠模型,发现线粒体基因NME6作为免疫调节因子在心力衰竭中起关键作用 | 首次鉴定NME6作为心力衰竭中连接线粒体功能与免疫调节的关键基因,并证实其敲低可改善心功能及免疫细胞亚群比例 | 研究主要基于小鼠模型和公开数据集,缺乏大规模临床验证及NME6具体分子机制的深入解析 | 探索心力衰竭中与线粒体功能障碍和免疫失调相关的关键基因及分子机制 | 心力衰竭相关差异表达基因,特别是线粒体基因NME6 | 机器学习 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | GSE145154单细胞RNA测序数据集及横向主动脉缩窄诱导的心力衰竭小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 97 | 2026-07-08 |
The macrophage PELI1-JAK2/STAT3-secretome axis: a potential target for ameliorating septic inflammation and coagulation dysfunction
2026-06-23, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2026053
PMID:42411143
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研究论文 | 研究巨噬细胞PELI1通过JAK2/STAT3信号通路调控分泌组在脓毒症炎症和凝血功能障碍中的作用 | 首次揭示PELI1通过JAK2/STAT3通路调控巨噬细胞分泌组,从而影响脓毒症炎症和凝血功能障碍,并验证了PELI1-分泌组轴作为潜在治疗靶点的可能性 | 主要基于小鼠模型和体外实验,结论向临床转化需进一步验证 | 探究巨噬细胞PELI1在脓毒症诱导的炎症和凝血功能障碍中的调控机制 | 脓毒症患者单核细胞、小鼠脓毒症模型、RAW264.7巨噬细胞 | 机器学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序、RT-qPCR、Western blotting、ELISA、H&E染色、免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据 | 公开脓毒症患者单细胞RNA-seq数据集及小鼠模型(具体样本量未提供) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 98 | 2026-07-08 |
Targeting fibrillin-1 disrupts the fibrogenic niche formation and ameliorates kidney fibrosis
2026-Jun-22, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.06.023
PMID:42331317
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研究论文 | 本研究揭示了纤维蛋白-1(FBN1)在肾纤维化微环境中的核心作用,并通过破坏FBN1-EGFR相互作用找到潜在治疗策略 | 首次阐明FBN1作为纤维化微环境核心结构成分,通过结合成纤维细胞EGFR激活MAPK信号促进肾纤维化,并发现fucosterol能有效阻断该相互作用 | 未说明 | 阐明FBN1在肾纤维化微环境中调控成纤维细胞增殖和激活的机制,并评估靶向破坏FBN1-EGFR相互作用作为治疗策略 | 肾纤维化小鼠模型、去细胞化肾支架、NRK-49F细胞、原代肾成纤维细胞 | 计算机视觉 | 肾脏疾病 | 空间转录组学、免疫共沉淀、RNA测序、基因敲除模型、高通量筛选 | NA | 空间转录组数据、测序数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 99 | 2026-07-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Revealing Yiqi Huayu Jiedu Formula Mediated Alleviation of Acute Respiratory Distress Syndrome via Macrophage Chemotaxis
2026-Jun-22, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/70657
PMID:42406684
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示益气化瘀解毒方缓解急性呼吸窘迫综合征的机制,涉及巨噬细胞趋化性调节 | 首次结合网络药理学、单细胞RNA测序和体内外实验系统阐明益气化瘀解毒方通过抑制巨噬细胞趋化性及PI3K/AKT、MAPK、NF-κB信号通路缓解ARDS | 缺乏正式临床试验,仅基于初步观察和动物模型验证 | 探究益气化瘀解毒方对急性呼吸窘迫综合征的保护机制 | LPS诱导的ARDS大鼠模型及RAW264.7巨噬细胞系 | 单细胞测序 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序, qPCR, ELISA, 蛋白质印迹 | NA | 基因表达数据 | 大鼠肺组织样本及RAW264.7细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 100 | 2026-07-08 |
TIM3 Signaling in Effector T Cells Acts as an Immunometabolic Switch in the Purine Degradation Pathway to Suppress Intestinal Inflammation
2026-Jun-17, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2026.05.027
PMID:42309263
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研究论文 | 研究TIM3信号在效应T细胞中作为免疫代谢开关抑制肠道炎症的机制 | 首次揭示TIM3信号通过抑制腺苷脱氨酶(ADA)和嘌呤降解途径,作为免疫代谢开关调控效应T细胞功能,并在慢性炎症中发现配体Gal-9缺乏限制TIM3信号,为治疗提供新靶点 | 研究主要基于小鼠模型和人类样本,需进一步验证TIM3信号在其他炎症环境中的普适性,Gal-9治疗的安全性和有效性需更多临床评估 | 阐明免疫检查点受体TIM3在炎症性肠病(IBD)中对T细胞信号传导的免疫代谢调控作用 | IBD患者和对照的血液及黏膜T细胞,TIM3缺陷小鼠的效应T细胞 | 免疫学 | 炎症性肠病(IBD) | 多色流式细胞术,细胞因子分析,非靶向代谢组学,单细胞测序 | NA | 细胞,代谢物 | IBD患者和对照样本(未明确数量),TIM3缺陷小鼠模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |