单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 36626 篇文献,本页显示第 81 - 100 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
81 2026-02-21
Acute Phase Response-driven Hepatic Niche Remodeling Promotes Fibrosis Resolution After Alcohol Cessation
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学技术,探讨了酒精戒断后急性期反应驱动的肝微环境重塑如何促进酒精相关性肝病纤维化消退的机制 首次通过空间转录组学识别了酒精戒断后肝内独特的促纤维化和纤维溶解微环境,并揭示了血清淀粉样蛋白A(SAA)通过HDL介导的巨噬细胞信号通路在纤维化消退中的关键作用 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限,且未全面评估长期酒精戒断后的动态变化 探究酒精相关性肝病在戒断后纤维化消退的分子机制 酒精相关性肝病小鼠模型及人类肝组织样本 空间转录组学 酒精相关性肝病 空间转录组学、体外细胞分析、基因敲除模型 NA 空间转录组数据、基因表达数据 小鼠模型(具体数量未明确)及人类肝样本 Nanostrings 空间转录组学 CosMx 1000-plex CosMx空间转录组学检测
82 2026-02-21
Androgen Signaling in ILC2s Drives Sex Differences in Helicobacter-induced Gastric Inflammation and Atrophy
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究揭示了雄激素通过调节2型先天淋巴细胞(ILC2)的活化,在幽门螺杆菌诱导的胃部炎症中发挥保护作用,并阐明了ILC2在驱动胃部癌前病变性别差异中的关键角色 首次发现雄激素信号通过调控ILC2的活性来影响幽门螺杆菌感染的胃部炎症反应,并明确了ILC2是驱动胃部癌前病变性别差异的主要调节因子 研究主要基于小鼠模型,其在人类中的直接相关性仍需进一步验证;且未详细探讨其他性激素(如雌激素)的潜在影响 探究雄激素如何影响幽门螺杆菌感染后的胃部炎症反应,并阐明其在胃部癌前病变性别差异中的作用机制 感染幽门螺杆菌的雄性和雌性小鼠,以及经手术去势或二氢睾酮处理的模型小鼠 单细胞组学与免疫学 胃癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量,但涉及多种性别和处理条件的小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
83 2026-02-21
The Glutamine Metabolic Switch Influences the Response of Neonatal Intestinal Macrophages to Breast Milk
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究探讨了谷氨酰胺和谷氨酸在新生儿坏死性小肠结肠炎(NEC)中对肠道巨噬细胞代谢重编程的双重作用及其机制 揭示了谷氨酰胺代谢开关(从谷氨酰胺酶GLS转向谷氨酸脱氢酶GLUD1)如何决定巨噬细胞的促炎或抗炎表型,并阐明了其在疾病不同阶段(预防期与进展期)产生相反效果的机制 研究主要基于新生大鼠NEC模型和体外骨髓来源巨噬细胞实验,人类数据为对已发表scRNA-seq数据的再分析,缺乏直接的人类体内验证 探究谷氨酰胺和谷氨酸在新生儿肠道炎症中的作用机制,为新生儿肠道疾病的个性化营养干预提供依据 新生大鼠坏死性小肠结肠炎(NEC)模型、骨髓来源巨噬细胞(BMDMs)、已发表的人类新生儿NEC单细胞RNA测序数据 NA 坏死性小肠结肠炎 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、转录组学分析 NA 基因表达数据、流式细胞数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
84 2026-02-21
Loss of Intestinal Endosome-associated Protein Sorting Nexin 27 Disrupts Epithelial Barrier and Promotes Inflammation
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究探讨了分选连接蛋白SNX27在肠道稳态、上皮屏障完整性和炎症反应中的新作用 首次揭示了SNX27在肠道中的关键作用,发现其缺失会破坏上皮屏障功能并促进炎症,为理解炎症性肠病(IBD)的发病机制提供了新视角 研究主要基于小鼠模型,人类样本数据来自公共数据库,缺乏直接的人类功能验证 确定SNX27在调节肠道稳态、上皮屏障完整性和炎症反应中的未知作用 人类炎症性肠病(IBD)患者数据和小鼠肠道上皮细胞特异性SNX27敲除模型 分子生物学与病理学 炎症性肠病(包括溃疡性结肠炎和克罗恩病) 单细胞RNA测序、基因敲除小鼠模型、葡聚糖硫酸钠(DSS)诱导的结肠炎模型 条件性基因敲除小鼠模型 基因表达数据、组织病理学数据 未明确说明具体样本数量,但使用了公共数据库(NCBI GEO)中的IBD患者数据集和SNX27ΔIEC小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
85 2026-02-21
GPR68, A Proton-sensing GPCR, Mediates Acid-induced Visceral Nociception
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究探讨了质子感应G蛋白偶联受体GPR68在酸诱导的结肠痛觉中的作用 首次发现GPR68在结肠感觉神经元中表达,并证实其在酸诱导的结肠痛觉中起关键作用 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 探究GPR68在结肠炎症酸诱导痛觉中的机制 结肠感觉神经元、小鼠模型、人类炎症性肠病组织 NA 炎症性肠病 单细胞RNA测序、Ca2+成像、药理学研究 NA RNA-seq数据、电生理记录、Ca2+成像数据 野生型和GPR68-/-小鼠、人类炎症性肠病组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
86 2026-02-21
Mapping the evolution of kainate receptor research over five decades: trends, hotspots, and emerging frontiers
2026-Jan, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
综述 本文对过去五十年(1975-2024)关于红藻氨酸受体(KAR)的研究进行了全面的文献计量学分析,旨在绘制该领域的发展脉络、识别关键趋势和研究热点,并指出新兴前沿 这是首个关于KAR研究的文献计量学路线图,系统性地揭示了该领域的动态演变、全球合作模式以及未被满足的转化需求 研究挑战包括KAR调节剂的临床转化有限,以及其在精神疾病中的作用尚未完全阐明 提供一个关于KAR研究领域的系统性概述,包括其发展历程、全球贡献和转化潜力,以指导未来的研究和临床应用 红藻氨酸受体(KARs),一种离子型谷氨酸受体亚型 神经科学 癫痫等神经和精神疾病 文献计量学分析(使用CiteSpace, VOSviewer, Bibliometrix),以及cryo-electron microscopy, single-cell RNA sequencing等先进技术 NA 文献数据(出版物) 从PubMed, Web of Science, Scopus数据库中检索并去重后的11,671篇出版物 NA NA NA NA
87 2026-02-21
Canopy2: Tumor Phylogeny Inference by Bulk DNA and Single-Cell RNA Sequencing
2026, Statistics in biosciences IF:0.8Q4
研究论文 本文提出了一种名为Canopy2的贝叶斯框架,用于通过bulk DNA和单细胞RNA测序数据推断肿瘤系统发育树并进行突变分析 Canopy2通过联合概率分布模型,首次能够解析单细胞数据中零值的不同来源(非癌性、随机性和技术性),并在低测序深度、低细胞捕获率及高度异质性肿瘤中保持高精度 方法主要基于单核苷酸变异(SNVs),未明确讨论其对拷贝数变异(CNVs)或其他结构变异的适用性 开发一种能够准确推断肿瘤系统发育树和亚群突变谱的计算方法 肿瘤细胞群体(特别是乳腺癌和胶质母细胞瘤) 计算生物学 乳腺癌, 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序, bulk DNA测序 贝叶斯框架, 马尔可夫链蒙特卡洛方法 单核苷酸变异数据, 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk DNA-seq NA NA
88 2026-02-21
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals ISG15 as a Key Regulator of Macrophage-Mediated Inflammation Driving Primary Sjögren's Syndrome Progression
2026, Critical reviews in immunology IF:0.8Q4
研究论文 本研究通过整合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq分析,揭示了ISG15作为原发性干燥综合征中巨噬细胞介导炎症的关键调节因子 结合批量转录组学、单细胞转录组学和机器学习算法,系统识别了pSS中的免疫代谢生物标志物,并首次在体外验证了ISG15在巨噬细胞炎症反应中的关键作用 研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证;体外实验仅使用THP-1细胞系,可能无法完全反映体内复杂微环境 识别原发性干燥综合征的诊断生物标志物并表征单核-巨噬细胞分化轨迹 原发性干燥综合征患者的唾液腺细胞 数字病理学 自身免疫性疾病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq LASSO回归, SVM-RFE, 随机森林 转录组数据 42,157个唾液腺细胞 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
89 2026-02-21
Single-Cell Sequencing Combined with RNA Sequencing Reveals the Role of Natural Killer Cells in Prognosis and Immunotherapy Response in Cervical Squamous Cell Carcinoma
2026, Critical reviews in immunology IF:0.8Q4
研究论文 本研究结合单细胞测序和RNA测序,揭示了自然杀伤细胞在宫颈鳞状细胞癌预后和免疫治疗反应中的作用 整合单细胞测序和RNA测序数据,识别高活性NK细胞及其相关基因,并构建基于六种关键基因的预后风险模型 NA 阐明高活性NK细胞相关基因在CSCC预后和免疫治疗中的潜在价值 宫颈鳞状细胞癌患者 数字病理学 宫颈鳞状细胞癌 单细胞测序, RNA测序 Cox回归, LASSO回归 转录组数据, 单细胞数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
90 2026-02-21
DeepCE: a deep learning framework for correlation-enhanced gene regulatory network inference in single-cell RNA sequencing data
2026, Bioinformatics advances IF:2.4Q2
研究论文 本文提出了一种名为DeepCE的深度学习框架,用于增强单细胞RNA测序数据中的基因调控网络推断 DeepCE通过整合双向门控循环单元和卷积神经网络,强化了动态调控的提取,能捕获时间依赖性和局部空间模式,从而提高基因调控网络推断的准确性和鲁棒性 NA 开发一种新的深度学习算法,以增强单细胞RNA测序数据中基因调控网络推断的有效性和可靠性 小鼠和人类数据集中的单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 双向门控循环单元, 卷积神经网络 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
91 2026-02-21
Integrated single-cell and transcriptomic profiling identifies machine-learning-based pyroptosis biomarkers in IBD
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞和转录组分析,识别了IBD中基于机器学习的焦亡生物标志物 结合单细胞RNA-seq和批量转录组数据,利用多种机器学习方法识别了IBD中焦亡相关的关键诊断基因 研究主要基于现有数据,未进行实验验证,且样本来源可能有限 识别IBD中焦亡相关的关键细胞类型和调控基因,并开发非侵入性诊断生物标志物 IBD患者的肠道黏膜单细胞RNA-seq数据和批量外周血转录组数据 机器学习 炎症性肠病 单细胞RNA-seq, 转录组分析 LASSO, GBM, SVM, Boruta, Random Forest RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
92 2026-02-21
UNC93B1 promotes pancreatic cancer progression through modulation of cGAS-STING signaling
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据,揭示了UNC93B1通过抑制cGAS-STING信号通路促进胰腺癌进展的机制 首次将GWAS、空间转录组学与单细胞转录组学整合,系统性地将遗传易感性映射到单细胞数据,并利用机器学习框架识别出UNC93B1作为关键驱动基因,阐明了其通过抑制cGAS-STING通路促进肿瘤进展的新机制 研究主要基于体外细胞系和异种移植模型,缺乏体内免疫微环境的全面验证;临床样本量相对有限;cGAS-STING通路下游的具体效应分子网络有待进一步解析 阐明胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤微环境(TME)的遗传决定因素,识别核心分子驱动因子,并为开发精准治疗策略提供依据 胰腺导管腺癌(PDAC)患者样本、PDAC细胞系(PANC-1, BxPC-3, Capan-1, SW1990)及小鼠异种移植模型 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 全基因组关联研究(GWAS), 批量转录组测序, qPCR, 流式细胞术 LASSO回归, 随机森林, 支持向量机 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 基因组数据, 蛋白质组数据, 临床生存数据 22个PDAC样本的单细胞RNA-seq数据, 172例TCGA-PAAD生存数据, 196,187例GWAS数据, 4种PDAC细胞系 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
93 2026-02-21
Single-cell and spatial transcriptomics reveal transplant-associated T cells and myeloid cells in human liver transplantation
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学,揭示了人类肝移植中移植相关T细胞和髓系细胞的动态变化及空间分布 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,系统解析肝移植排斥反应中免疫细胞的亚群特征、功能状态和空间定位 样本量相对有限,且主要关注移植后早期阶段,长期动态变化和临床治疗应用仍需进一步验证 探究肝移植排斥反应中肝内免疫细胞的动态变化和空间分布机制 人类肝移植患者的移植肝组织样本 数字病理学 肝移植排斥反应 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 多阶段人类肝移植的移植组织样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
94 2026-02-21
ScRNA-seq Identifies High CXCL8 Linked to Liver Fibrosis in HBeAg-negative Chronic Hepatitis B Patients With Low HBsAg
2026, Gastro hep advances
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序发现,在HBeAg阴性慢性乙型肝炎患者中,低HBsAg水平与高CXCL8表达相关,且与肝纤维化程度增加有关 首次在低HBsAg水平的HBeAg阴性慢性乙型肝炎患者中,通过单细胞RNA测序揭示了CXCL8在血浆、外周和肝内单核-巨噬细胞群体中的高表达与肝纤维化的关联,并识别了独特的CD8 T细胞簇 样本量较小(仅35名患者,其中6名进行单细胞RNA测序),且为单中心研究,可能限制结果的普遍性 探讨CXCL8在HBeAg阴性慢性乙型肝炎患者肝纤维化中的作用,特别是在不同HBsAg水平下的表达差异 HBeAg阴性、未接受治疗的慢性乙型肝炎患者,根据HBsAg水平分为低(<2000 IU/mL)和高(>2000 IU/mL)两组 单细胞组学 慢性乙型肝炎 单细胞RNA测序,组织病理学分析,血浆细胞因子分析 NA 单细胞RNA测序数据,血浆细胞因子数据,组织病理学数据 35名患者(12名低HBsAg,23名高HBsAg),其中6名进行单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA-seq NA NA
95 2026-02-21
Changes in the brain [NAD+]/[NADH] and [NADPH]/[NADP+] with aging and anti-aging dietary restriction
2026, Frontiers in aging neuroscience IF:4.1Q2
研究论文 本研究探讨了小鼠和人类大脑中NAD+/NADH和NADPH/NADP+比值随衰老和抗衰老饮食限制的变化,并分析了相关代谢通路 揭示了不同小鼠品系(C57BL/6J vs C57BL/6N)和人类大脑在衰老过程中呈现相反的氧化还原变化,并比较了禁食与生酮饮食对脑氧化还原状态的不同影响 研究主要基于代谢物比值作为间接指标,未直接测量NAD+/NADH和NADPH/NADP+的绝对浓度,且人类数据可能有限 探究大脑氧化还原状态在衰老过程中的变化机制及饮食干预(如禁食和生酮饮食)的影响 C57BL/6J和C57BL/6N小鼠大脑、人类大脑 NA 衰老相关疾病 单细胞RNA测序、批量RNA测序、蛋白质组学分析 NA 代谢物数据、转录组数据、蛋白质组数据 未明确指定样本数量,涉及小鼠和人类大脑数据 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
96 2026-02-21
Association of Increased Nasal Fluids-Serum Concordance of Protein Profile with Prognosis in Nasal Polyps
2026, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本研究首次探讨了鼻液与血清蛋白质谱一致性作为鼻息肉术后复发的预测指标 首次提出并验证了鼻液与血清蛋白质谱一致性作为鼻息肉术后复发的整合预后标志物 样本量相对较小(54例患者),且随访时间至少为6个月,可能影响长期复发预测的准确性 预测鼻息肉术后复发,通过多室分析提供更整合的预后标志 54名鼻息肉患者(包括18名复发和36名未复发)的鼻液和血清样本 数字病理学 鼻息肉 邻近延伸分析(PEA)、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq(scRNAseq)、免疫荧光、公共数据库分析 NA 蛋白质组学数据、RNA-seq数据、免疫荧光图像 54名鼻息肉患者 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
97 2026-02-21
Multi-omics profiling of acute Pseudomonas aeruginosa pneumonia unmasks conventional NK cell depletion and stage-specific therapeutic targets
2025-12, Virulence IF:5.5Q1
研究论文 本研究通过多组学分析揭示了急性铜绿假单胞菌肺炎中宿主固有免疫反应的特征,特别是常规NK细胞的耗竭及其作为早期免疫检查点失效的作用 首次通过整合蛋白质组、细胞群和转录组分析,并结合公共单细胞RNA测序数据,明确了在铜绿假单胞菌肺炎早期常规NK细胞(而非组织驻留NK细胞)特异性耗竭是关键的早期免疫检查点失效事件 研究主要基于小鼠模型,其结论在人体中的普适性有待验证;公共scRNA-seq数据的分析可能受限于原始实验设计和样本来源的异质性 阐明吸入性铜绿假单胞菌感染后宿主固有免疫反应的特征,并识别潜在的阶段特异性治疗靶点 铜绿假单胞菌感染的小鼠模型,以及公共数据库中的单细胞RNA测序数据集 免疫学,感染性疾病研究 肺炎(医院获得性肺炎和呼吸机相关性肺炎) RNA测序,单细胞RNA测序,蛋白质分析,细胞群分析 NA 基因表达数据,蛋白质数据,细胞计数数据 NA NA RNA-seq,单细胞RNA-seq NA NA
98 2026-02-21
Molecular mechanism of PANoptosis and programmed cell death in neurological diseases
2025-06-01, Neurobiology of disease IF:5.1Q1
综述 本文系统解析了PANoptosis的分子机制及其在神经系统疾病中的作用,并提出了靶向治疗框架 首次系统综述了PANoptosis作为炎症性程序性细胞死亡在神经疾病中的分子机制与治疗潜力 NA 阐明PANoptosis在神经系统疾病中的分子机制并开发精准治疗策略 神经系统疾病中的程序性细胞死亡通路 NA 神经系统疾病 单细胞转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
99 2026-02-21
Interleukin-1β Drives Disease Progression in Arrhythmogenic Cardiomyopathy
2024-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单核RNA测序和空间转录组学分析,揭示了白细胞介素-1β在致心律失常性心肌病疾病进展中的关键驱动作用,并验证了靶向IL-1β治疗的潜在益处 首次在ACM中结合单核RNA测序和空间转录组学技术,识别了炎症-纤维化空间微环境,并证实IL-1β是疾病进展的关键驱动因子 研究样本量有限,且动物模型结果需在更大规模临床研究中进一步验证 探究致心律失常性心肌病的疾病进展机制并寻找潜在治疗靶点 ACM患者心肌样本、对照供体样本、纯合子Desmoglein-2突变小鼠 数字病理学 心血管疾病 单核RNA测序, 空间转录组学 NA RNA测序数据, 空间转录组数据 未明确具体数量,包括ACM患者和对照供体的心肌样本 NA 单核RNA测序, 空间转录组学 NA NA
100 2026-02-21
HiDDEN: a machine learning method for detection of disease-relevant populations in case-control single-cell transcriptomics data
2024-11-02, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文介绍了一种名为HiDDEN的机器学习方法,用于在病例对照单细胞转录组学数据中检测疾病相关细胞群体 HiDDEN通过优化病例对照标签,解决了标准单细胞分析在受影响细胞子集较小或扰动强度较弱时无法准确识别的问题,从而提高了生物信号恢复能力 方法主要基于模拟数据进行验证,实际应用中的复杂生物异质性可能未完全覆盖 开发一种计算方法来检测单细胞转录组数据中疾病相关的细胞群体 单细胞RNA-seq数据中的细胞群体,包括人类多发性骨髓瘤前体条件和脱髓鞘小鼠模型 机器学习 多发性骨髓瘤 单细胞RNA-seq 机器学习方法 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
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