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当前共找到 44994 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-10-30 |
Fibrotic Rewiring of CD8+ T Cells by Doxorubicin Drives Pathological Remodeling of Cardiac Extracellular Matrix
2026-Oct, JACC. CardioOncology
DOI:10.1016/j.jaccao.2026.09.001
PMID:42904623
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研究论文 | 该文通过多物种转录组分析揭示多柔比星诱导CD8+ T细胞获得促纤维化表型（mxT细胞），并通过LOX活性交联心脏细胞外基质导致心脏重塑 | 首次提出多柔比星在CD8+ T细胞中印迹新的内在促纤维化功能，发现mxT细胞通过HIF1α-P53-TGFβ1-LOX轴直接交联ECM并增加心脏硬度 | 摘要未提及，机制研究主要在鼠源原代T细胞体外实验中进行，人体数据仅为外周血CD8+ T细胞的bulk转录组 | 探究多柔比星处理后T细胞影响不良心脏重塑的分子机制，寻找心脏保护策略的干预靶点 | 蒽环类药物治疗患者的外周血CD8+ T细胞、多柔比星或PBS处理小鼠的心脏CD8+ T细胞以及体外培养的原代小鼠T细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 体外细胞实验, 离体心脏ECM力学表征 | NA | 文本 | 患者治疗前及治疗后3个月外周血CD8+ T细胞（人数未说明），多柔比星或PBS处理小鼠心脏CD8+ T细胞（数量未说明），原代小鼠T细胞 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 82 | 2026-10-30 |
Reimagining research papers as interactive and reliable AI agents
2026-Oct, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-026-11044-y
PMID:42749808
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研究论文 | 本文提出Paper2Agent框架，可自动将研究论文转换为可交互的AI智能体，通过构建MCP服务器实现论文代码、数据和方法的自然语言调用 | 首次提出将静态研究论文自动转化为可交互AI智能体的范式，利用多智能体分析论文与代码库自动构建MCP服务器并生成测试以提升鲁棒性，实现虚拟通讯作者功能 | 仅在AlphaGenome、Scanpy和TISSUE三个案例中验证有效性，缺乏大规模系统性评估，依赖论文代码库质量与完整性 | 解决传统研究论文难以被理解和复用的问题，将研究成果从被动人工制品转化为加速使用和发现的主动系统 | 研究论文及其手稿、补充材料、数据集、代码和工作流 | 自然语言处理 | 银屑病 | 大型语言模型智能体、模型上下文协议（MCP） | 基于LLM的多智能体系统 | 文本、代码 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 83 | 2026-10-30 |
Single-Cell Sequencing Reveals Androgen Deficiency Arrests Meibocyte Differentiation and Impairs EMC-Mediated Lipid Metabolism
2026-Oct-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.12.46
PMID:42910814
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序揭示雄激素缺乏导致睑板腺细胞分化停滞及EMC介导的脂质代谢受损 | 首次在单细胞水平揭示雄激素缺乏通过双重机制驱动睑板腺功能障碍：睑板腺细胞命运向非产脂谱系重编程以及抑制EMC介导的内质网驻留产脂酶稳定化；发现DHT治疗后产脂再激活与内质网容量恢复的时间错配诱导蛋白质稳态应激 | 摘要未明确说明样本量及具体实验验证的详细局限性，仅在小鼠模型中开展，尚未在人类样本中验证 | 研究雄激素缺乏性睑板腺功能障碍的细胞动力学，并阐明局部双氢睾酮治疗结构性再生疗效受限的分子机制 | 假手术对照组、去势小鼠及接受局部0.08% DHT治疗的去势小鼠的睑板腺 | 单细胞测序、眼科、内分泌学 | 睑板腺功能障碍、干眼症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 84 | 2026-10-30 |
Multi-omics analysis of high-grade serous ovarian cancers reveals heterogeneity and distinct immunological patterns based upon clinico-genomic status
2026-Oct, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1012355
PMID:42911976
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研究论文 | 该研究整合全外显子组测序、总RNA测序和空间转录组学，分析BRCA突变型与非突变型高级别浆液性卵巢癌的肿瘤免疫微环境异质性及空间转录状态 | 揭示了BRCA突变状态并非广泛重塑肿瘤整体空间结构，而是与保守空间区域内（尤其是免疫富集区IC7）的功能状态差异相关，并识别了CAF样区域与巨噬细胞富集区域之间保守的结构界面及CXCL12-CXCR4趋化招募轴 | 研究为探索性分析，CellChat的配体-受体信号预测及空间区域功能状态差异仍需未来机制性实验验证，样本队列规模有限 | 探究BRCA基因型如何塑造高级别浆液性卵巢癌的肿瘤免疫微环境及空间组织结构 | BRCA突变型（BRCA-MT）与非BRCA突变型（BRCA-WT）高级别浆液性卵巢癌肿瘤样本 | 空间转录组学, 肿瘤免疫学, 数字病理学 | 卵巢癌 | 全外显子组测序, 总RNA测序, 空间转录组学 | RCTD解卷积, CellChat细胞通讯分析, 整合聚类 | 图像, 文本（基因表达数据） | NA | NA | 空间转录组学, 全外显子组测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 85 | 2026-10-30 |
Prediction of therapeutic targets and drug candidates for pancreatic ductal adenocarcinoma by network-based computational framework
2026-Oct, Chinese herbal medicines
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.chmed.2026.03.006
PMID:42948742
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研究论文 | 构建基于网络的计算框架，整合多队列转录组数据识别胰腺导管腺癌治疗靶点并通过转录组引导策略预测候选药物 | 整合多队列转录组数据构建基因共表达网络，结合预后基因特征、多指标中心性分析、单细胞RNA测序和CRISPR依赖性数据优先排序关键调控基因，并利用LINCS数据库转录组引导策略系统匹配PDAC特异基因表达特征与化合物诱导转录谱，发现三个新的功能必需致癌驱动基因及候选化合物 | 摘要未明确说明，可能包括计算预测需更多体内实验验证、LINCS数据库化合物覆盖范围限制、跨队列异质性影响等 | 开发基于网络的计算框架，用于胰腺导管腺癌的基因组范围治疗靶点识别和药物发现 | 胰腺导管腺癌细胞、PDAC多队列转录组数据、LINCS化合物扰动转录谱 | 机器学习, 计算生物学, 药物基因组学 | 胰腺导管腺癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, CRISPR筛选, qRT-PCR, Western blotting, CCK-8 | 基因共表达网络, 超几何富集分析, 多指标中心性分析, 跨队列共识评分 | 转录组数据, 单细胞RNA-seq数据, CRISPR依赖性数据, 化合物扰动转录谱 | 多个独立PDAC队列（具体数量未说明） | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, CRISPR筛选 | NA | NA |
| 86 | 2026-10-30 |
Computational deconvolution of drug sensitivity via single-cell-to-bulk transcriptome mapping
2026-Oct, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014862
PMID:42886762
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研究论文 | 本文提出了CLIMB和CLIFF两步机器学习框架，将bulk RNA-seq数据解卷积为细胞类型组成和表达，并将bulk药物敏感性测量解析为细胞亚型和单细胞特异性图谱 | 提出了两步机器学习框架CLIMB和CLIFF，能够将bulk转录组和药物敏感性数据解卷积到细胞亚型和单细胞分辨率，并在多种癌症类型和真实数据集中验证了其优越性能 | 依赖于独立scRNA-seq参考数据集，可能存在参考与目标不匹配的问题，且在体外细胞系混合物和伪bulk模拟中验证，需要更多真实临床样本验证 | 开发计算解卷积框架，从bulk测量中解析细胞类型和单细胞水平的信号，应用于药物开发和精准医学 | 白血病细胞系混合物、bulk RNA-seq数据、药物敏感性数据、beatAML队列数据集 | 机器学习 | 白血病 | bulk RNA-seq, scRNA-seq | 机器学习框架 | 转录组数据, 药物敏感性数据 | 体外白血病细胞系混合物、三个测试数据集和三个患者队列、beatAML队列数据集（121种化合物） | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 87 | 2026-10-30 |
Transcriptomics of thyroid cancer
2026-Oct-01, European thyroid journal
IF:3.5Q2
DOI:10.1530/ETJ-26-0241
PMID:42886830
|
综述 | 本文综述了甲状腺癌转录组学的研究进展，重点探讨了从乳头状甲状腺癌到未分化癌进展过程中肿瘤细胞与微环境相互作用的机制 | 强调了单细胞RNA-seq技术在揭示甲状腺癌肿瘤微环境中细胞亚群（如癌症相关成纤维细胞和免疫细胞）分子表型差异方面的重要作用，将转录组学研究范围从恶性甲状腺细胞本身扩展到肿瘤细胞与周围微环境的动态相互作用 | 转录组研究的结论需要独立验证 | 展示甲状腺癌转录组学成就如何加深对恶性转化过程和甲状腺癌进展机制的理解 | 甲状腺癌，包括乳头状甲状腺癌和未分化甲状腺癌 | 转录组学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA-seq | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 88 | 2026-10-30 |
ProxiNet transfers spatially learned cellular proximity to dissociated single-cell transcriptomes
2026-Sep-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.09.25.754372
PMID:42856154
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研究论文 | 开发了ProxiNet框架，从空间转录组数据中学习细胞邻近性的转录组特征，并将其迁移到解离的单细胞转录组中 | 提出空间监督框架ProxiNet，实现细胞邻近性从空间数据到解离单细胞数据的零样本跨技术迁移，并可解释邻近性预测相关基因和转录程序 | 摘要中未明确说明研究局限性 | 将空间学习中获得的组织结构信息扩展到解离的单细胞转录组，推断细胞邻近关系和邻域结构 | 空间转录组数据集和解离的单细胞RNA测序数据，包括阿尔茨海默病数据集 | 空间转录组学，单细胞转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 空间监督学习框架，基于梯度归因的模型解释 | 基因表达谱，空间坐标数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 89 | 2026-10-30 |
Mapping the response of primary human chondrocytes to an osteoarthritis-relevant stimulus by single-cell RNA sequencing
2026-Sep-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.09.24.754148
PMID:42856248
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析纤连蛋白片段（Fn-f）刺激后原代人软骨细胞状态和转录程序的动态变化 | 首次在单细胞分辨率下解析Fn-f刺激对健康人软骨细胞状态丰度和转录程序的重塑，发现转录程序可跨软骨细胞状态动态部署，而非严格对应亚型身份 | 仅使用两名无OA供体的原代踝关节软骨细胞，样本量有限，且体外刺激时间较短（18小时），可能无法完全反映体内OA病理过程 | 确定Fn-f如何改变软骨细胞状态和转录程序，以补充观察性OA图谱的不足 | 两名无OA的尸体供体来源的原代人踝关节软骨细胞 | 单细胞转录组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 2名供体的原代软骨细胞，分别经PBS或Fn-f处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 90 | 2026-10-30 |
SpaReg: sparsity-based 3D reconstruction of tissue microenvironments at native resolution across morphological and spatial molecular modalities
2026-Sep-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.09.28.754175
PMID:42856322
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研究论文 | 提出了一种基于稀疏性的三维重建方法SpaReg，用于在原生分辨率下跨形态学和空间分子模态重建组织微环境 | 基于稀疏性的三维重建方法，能够跨组织学、空间蛋白质组学和空间转录组学模态，在切片伪影存在下保持亚细胞形态，并支持从H&E图像生成单细胞分辨的三维图谱 | 切片过程可能引入撕裂和折叠，计算对齐可能进一步扭曲组织完整性 | 实现跨形态学和空间分子模态的组织微环境原生分辨率三维重建 | 组织微环境，包括细胞和非细胞组分，涉及多种器官和胰腺组织 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 组织学成像，空间蛋白质组学，空间转录组学 | 基于稀疏性的重建方法，H&E基于的上皮、T和B细胞分类器 | 图像，空间分子数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 91 | 2026-10-30 |
Macrophage-derived IL-27 sustains autoreactive CD8+ cytotoxic T cells in autoimmune hepatitis
2026-Sep-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.09.25.754422
PMID:42856347
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研究论文 | 该文章揭示了在自身免疫性肝炎中，巨噬细胞来源的IL-27通过TLR9驱动的自我DNA识别机制，维持肝脏内自身反应性CD8+细胞毒性T细胞的功能性、自我更新的耗竭前体细胞程序 | 首次发现慢性炎症外周器官（肝脏）内存在局部运作的耗竭前体T细胞到效应T细胞的管道，并阐明了TLR9驱动的巨噬细胞-IL-27回路维持自身反应性CD8+ T细胞功能的新机制 | 研究基于小鼠模型（DNase2a和Ifnar1双敲除小鼠），尚未在人类自身免疫性肝炎中验证该机制 | 探究在慢性自身免疫性肝炎中，自身反应性CD8+ T细胞如何在持续自身抗原暴露下保持功能完整，以及肝脏内是否存在类似淋巴组织中的耗竭前体T细胞储备 | DNase2a和Ifnar1双敲除小鼠模型中的肝脏炎症、炎性巨噬细胞和CD8+ T细胞 | 免疫学、单细胞组学、空间转录组学 | 自身免疫性肝炎 | 单细胞TCR测序、单细胞转录组测序、空间转录组学、流式细胞术、基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞转录组数据、TCR序列数据、空间转录组数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、单细胞TCR-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 92 | 2026-10-30 |
Spatial multi-omics reveals disease-associated oligodendrocytes and metabolic dysregulation in male Parkinson's disease mouse models
2026-09-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-78051-5
PMID:42934224
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研究论文 | 结合单核RNA测序、空间转录组和空间代谢组，在雄性帕金森病小鼠模型中揭示疾病相关少突胶质细胞及代谢失调 | 首次在帕金森病小鼠模型中整合单核RNA测序、空间转录组与空间代谢组，发现以Il33和Kirrel3升高为特征的疾病相关少突胶质细胞谱系，并揭示少突胶质细胞IL-33-ST2信号在调控小胶质细胞激活、α-突触核蛋白病理和运动功能中的作用 | 研究主要基于雄性小鼠模型，未涵盖雌性；人类样本仅用于验证蛋白升高，机制验证仍以动物模型为主 | 解析帕金森病中α-突触核蛋白病理如何重塑脑内空间免疫代谢格局，以及少突胶质细胞在其中的参与机制 | 雄性A53T α-突触核蛋白转基因小鼠、AAV介导α-突触核蛋白过表达的雄性小鼠、人类中脑和脑脊液样本 | 空间多组学 | 帕金森病 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | 转录组数据, 代谢组数据, 空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 93 | 2026-10-30 |
DR-GEM enables self-supervised machine learning for single-cell embeddings and annotations
2026-09-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-77908-z
PMID:42928257
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研究论文 | 提出自监督元算法DR-GEM，通过重建误差重新定向模型注意力并应用平衡共识学习，解决单细胞和空间基因组数据分析中维度降维和聚类方法偏向过采样类别、忽略稀有细胞类型和状态的问题 | 首次指出该问题主要源于模型将丰度等同于重要性，而非数据稀缺本身，并提出结合分布鲁棒性和潜在组感知共识学习的自监督框架 | 未明确说明在极大规模数据集上的计算效率及对超参数选择的敏感性 | 改进单细胞和空间基因组数据的嵌入与注释方法，以可靠地恢复稀有细胞类型、过滤噪声、缓解细胞水平和患者水平的数据不足问题 | 合成和真实单细胞、空间转录组学以及Perturb-seq数据集 | 机器学习, 单细胞基因组学, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, Perturb-seq | 自监督元算法（DR-GEM） | 基因表达数据, 空间转录组数据, 扰动数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 94 | 2026-10-30 |
The Role of Angiopoietin-Like Proteins 3 and 4 and Their Target Lipases in CKD: A Drug-Target Mendelian Randomization Study
2026-Sep-22, American journal of kidney diseases : the official journal of the National Kidney Foundation
IF:9.4Q1
DOI:10.1053/j.ajkd.2026.06.015
PMID:42772348
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研究论文 | 该研究采用药物靶点孟德尔随机化方法和单细胞RNA测序分析，探讨ANGPTL3、ANGPTL4及其靶向脂肪酶与慢性肾病（CKD）之间的因果关系 | 首次在人类中利用药物靶点孟德尔随机化方法系统评估ANGPTL3、ANGPTL4及其靶向脂肪酶对CKD风险的因果效应，并结合单细胞RNA测序分析验证相关基因在肾脏细胞类型中的差异表达 | 严格的孟德尔随机化假设限制、非肾脏特异性工具变量选择以及CKD潜在的错误分类 | 研究ANGPTL3、ANGPTL4及其靶向脂肪酶与慢性肾病之间的因果关系 | 欧洲、东亚和非洲裔参与者（来自All of Us、Penn Medicine Biobank和全基因组关联研究），以及Susztaklab肾脏生物样本库的肾脏样本 | 机器学习 | 慢性肾病 | 药物靶点孟德尔随机化, 单细胞RNA测序 | NA | 遗传变异数据, 基因表达数据 | 2,369,738名个体，其中186,388例CKD病例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 95 | 2026-10-30 |
Targeting pro-senescent PTGS2+ macrophages alleviates chondrocyte senescence and osteoarthritis progression
2026-Sep-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117907
PMID:42664050
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序鉴定出与关节衰老相关的PTGS2高表达巨噬细胞亚群，并揭示其通过THBS1促进软骨细胞衰老和骨关节炎进展的机制 | 首次鉴定出与关节衰老相关的PTGS2高表达巨噬细胞亚群，揭示了巨噬细胞代谢重编程（糖酵解乳酸升高）通过THBS1 K262乳酸化修饰稳定THBS1蛋白，进而通过SDC4相关细胞周相互作用和TGF-β依赖信号促进软骨细胞衰老的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类骨关节炎患者中验证；对于THBS1促进软骨细胞衰老的具体下游信号通路仍需进一步阐明 | 探究特定巨噬细胞状态如何影响软骨细胞衰老及骨关节炎进展的机制 | 自然衰老小鼠关节和手术诱导骨关节炎模型小鼠的巨噬细胞和软骨细胞 | 单细胞组学、骨关节炎研究 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序、谱系追踪、条件性基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞转录组数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 96 | 2026-10-30 |
ABCC9/SUR2 has a Complex Expression Pattern in Human Brain Gliovascular Unit Cells, Including Astrocytes
2026-Sep-19, Journal of molecular neuroscience : MN
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12031-026-02603-z
PMID:42762395
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研究论文 | 该文章分析了人脑胶质血管单元细胞中ABCC9/SUR2的细胞类型特异性表达模式，并探讨了其与遗传风险变异的相关性 | 首次系统研究人脑胶质细胞中SUR2的表达，发现SUR2富集的星形胶质细胞亚群可能与甲状腺激素信号相关，并揭示ABCC9单核苷酸变异rs1914361与星形胶质细胞中SUR2表达增加相关 | 研究主要基于转录组数据和免疫组化，缺乏功能验证实验；小鼠脑组织中未检测到星形胶质细胞Sur2表达，提示种属差异 | 探究人脑胶质血管单元细胞中ABCC9/SUR2的细胞类型特异性表达模式及其与已知遗传风险变异的相关性 | 人脑组织样本（包括海马硬化老化相关样本）、小鼠脑组织样本 | 空间转录组学, 单细胞转录组学, 神经生物学 | 海马硬化老化, 阿尔茨海默病, 脑血管疾病 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 免疫组化 | NA | 转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 97 | 2026-10-30 |
Mouse models of acute and chronic hepatitis E virus infection
2026-Sep-11, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2026.08.034
PMID:42727860
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研究论文 | 该研究建立了急性和慢性戊型肝炎病毒感染的小鼠模型，利用AG129和C57BL/6J小鼠，通过单细胞RNA测序和转录组分析揭示了病毒嗜性和感染动态 | 首次建立了免疫健全的C57BL/6J小鼠戊型肝炎病毒感染模型；发现大鼠源HEV-C1株可跨物种感染AG129小鼠；提供了肝内HEV-C1感染的单细胞图谱；通过连续传代13次获得了可感染免疫健全小鼠的小鼠适应株；发现CD4+ T细胞耗竭是持续性感染的关键驱动因素 | 未明确说明研究的局限性 | 开发戊型肝炎病毒感染的近交系小鼠模型，研究病毒-宿主相互作用和跨物种传播机制 | AG129小鼠和C57BL/6J小鼠，以及大鼠源HEV-C1毒株 | 感染性疾病研究 | 戊型肝炎 | 逆转录PCR，RNAscope，单细胞RNA测序，转录组分析 | NA | RNA测序数据，图像数据，文本数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 98 | 2026-10-30 |
Human nasal organoids sustain reproducible airway epithelial differentiation and influenza virus-host innate immune interaction
2026-Sep-10, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08908-2
PMID:42947224
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研究论文 | 该研究建立了人鼻上皮细胞类器官，并利用其研究流感病毒感染与宿主先天免疫反应 | 成功构建可连续传代至P5的人鼻上皮类器官，并证明其可作为研究IAV感染及IFN相关先天免疫反应的体外模型 | 类器官中基底祖细胞比例较高而纤毛细胞较少，与体内上皮组成存在差异 | 构建人鼻上皮类器官，评估其作为气液界面培养及流感A病毒感染体外模型的细胞学特征 | 健康供体鼻黏膜组织来源的原代人鼻上皮细胞 | 类器官与感染免疫 | 流感病毒感染 | Matrigel三维培养、气液界面培养、组织学、免疫染色、电子显微镜、qRT-PCR、单细胞RNA测序 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 99 | 2026-10-30 |
SCG: Identifying spatially co-expressed genes using spatial covariance regression
2026-Sep-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.09.01.748618
PMID:42922782
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研究论文 | 提出空间协方差回归（SCR）框架，用于估计空间分辨的基因共表达网络并识别空间共表达基因（SCG） | 首个基于可扩展贝叶斯因子模型的空间协方差回归框架，能够在组织域水平估计空间分辨的基因共表达网络，并发现作为潜在预后生物标志物和治疗靶点的空间共表达基因 | 摘要未提及具体局限性 | 利用空间转录组数据估计空间分辨的基因共表达网络，识别空间共表达基因 | 空间转录组数据中的基因表达 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 贝叶斯因子模型 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 100 | 2026-10-30 |
Parasite and host factors associated with malaria parasite liver stage latency
2026-Sep-02, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-10657810/v1
PMID:42922745
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研究论文 | 本研究利用伯氏疟原虫Chesson株孢子体和泰国野外分离株在人肝细胞嵌合小鼠及原代人肝细胞中建立可重复的肝期感染模型，鉴定出RNA结合蛋白PUF1作为休眠子持久性的保守标志物，并揭示其与CCR4-NOT去腺苷酸化复合体的关联及休眠子所处的宿主微环境特征 | 首次鉴定PUF1为休眠子（hypnozoite）持久性的保守分子标志物，发现其在激活后下调；揭示PUF1相关的9-mer RNA基序及其与CCR4-NOT去腺苷酸化复合体的联系；通过空间转录组学发现休眠子占据与复制型裂殖体不同的转录静止宿主微环境 | 摘要未明确说明研究的具体局限性 | 探究调控间日疟原虫肝期休眠子（hypnozoite）持久存在的寄生虫内在机制和宿主因素，为靶向休眠子的治疗策略提供框架 | 间日疟原虫（Plasmodium vivax）Chesson株孢子体、泰国野外分离株、人肝细胞嵌合小鼠、原代人肝细胞 | 空间转录组学、感染性疾病研究 | 疟疾（复发性疟疾） | 转录组分析、RNA-FISH、空间转录组学 | NA | 转录组数据、空间转录组数据、图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |