本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-09-26 |
Molecular and Cellular Hallmarks of Age-Related Vestibular Hair Cell Degeneration
2026-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.76340
PMID:42360208
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析年轻和老年小鼠的前庭毛细胞,揭示了年龄相关前庭毛细胞退化的分子和细胞特征 | 首次在单细胞水平上系统描绘了老年前庭毛细胞的转录组衰老特征,发现毛束变性和机械转导功能下降先于毛细胞丢失,并比较了前庭和耳蜗毛细胞的衰老异同 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;未进行功能救援实验来证实因果关系 | 探究年龄相关前庭功能障碍的病因和分子机制,聚焦于机械敏感毛细胞的衰老过程 | 年轻和老年小鼠的前庭毛细胞 | 机器学习 | 老年性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、图像、电生理数据 | 年轻和老年小鼠的前庭组织样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 82 | 2026-09-26 |
Reduced expression of Brain Expressed X-linked genes in Alzheimer's disease
2026-Sep, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.1177/13872877261471446
PMID:42545253
|
研究论文 | 该研究整合 bulk 和单细胞转录组数据,分析 5xFAD 小鼠和阿尔茨海默病患者皮层中 BEX 基因表达变化,并通过 RT-qPCR 和 SH-SY5Y 细胞实验验证其与氧化应激的关系 | 整合 bulk 与单细胞转录组数据系统刻画 BEX 基因在 AD 中的表达模式,并在 SH-SY5Y 细胞中实验验证 BEX 敲低可增加氧化应激 | 摘要未明确说明样本来源、样本量、具体 BEX 基因亚型及实验验证的详细条件 | 刻画 BEX 表达模式,分析其表达与 AD 病理的关联,并研究 BEX 表达改变引起的细胞变化 | 5xFAD 小鼠、阿尔茨海默病患者及 SH-SY5Y 细胞 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | bulk 转录组测序, 单细胞转录组测序, RT-qPCR | NA | 文本, 图像 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞 RNA-seq | NA | NA |
| 83 | 2026-09-26 |
Evolution of complex organelles in ocelloid-bearing dinoflagellates
2026-Sep, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgag287
PMID:42725094
|
研究论文 | 通过对12种新的单细胞转录组进行测序,研究含眼点复合体的甲藻中复杂细胞器的演化,特别是光系统II的丢失以及眼点功能的谱系差异 | 新增12个物种(包括两个之前未采样的属)的单细胞转录组,来自亚北极和热带环境,扩展了之前仅18个细胞、5个属的研究;更新了系统发育基因组分析,将warnowiids分为武装和非武装两个主要亚支;发现眼点大小、形状、位置和基因表达在武装与非武装之间以及不同属之间存在差异 | 样本量仍然有限,仅增加了12个物种;研究基于转录组数据,缺乏功能验证实验;眼点功能与能量和营养策略的联系仅为推测 | 探究warnowiid甲藻中眼点复合体的演化,验证之前关于质体丢失光系统II的发现,并理解眼点功能在不同谱系间的差异 | warnowiid甲藻,包括12个新测序的物种(来自两个未采样属),以及之前已测序的物种 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 文本 | 12个新物种的单细胞转录组,以及之前已测序的18个细胞(共5个属),总体样本包括来自亚北极和热带环境的多个物种 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 84 | 2026-09-26 |
Tangential single-cell spatial transcriptomics resolves early ray lineage trajectory in poplar
2026-Sep-01, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koag275
PMID:42725656
|
研究论文 | 该研究通过切向单细胞空间转录组学、时间序列茎转录组学和为期两年的野外调查,解析了杨树早期射线谱系的发育轨迹。 | 利用切向切片增强射线形成层细胞回收,生成了单细胞分辨率空间转录组图谱,区分纺锤状原始细胞和射线原始细胞,并重建了从纺锤状原始细胞到射线原始细胞的连续早期射线轨迹。 | 摘要中未明确提及研究限制。 | 解析木本植物维管形成层中射线原始细胞的早期命运特化及其与季节性环境协变量的关系。 | 欧洲山杨×银白杨无性系717(Populus tremula × Populus alba clone 717)的茎和木质部射线。 | 空间转录组学,植物生物学 | NA | 单细胞空间转录组学,时间序列转录组学,RNA原位杂交 | NA | 空间转录组数据,图像,文本 | 两个生长季节,每两周一次野外调查;杨树茎样本(具体数量未详述) | NA | 单细胞空间转录组学,时间序列转录组学 | NA | NA |
| 85 | 2026-09-26 |
CCR2/CCR5 Signaling Defines a Pathogenic Interstitial Macrophage Subset That Drives Severe Asthma
2026-Sep, Clinical and translational allergy
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/clt2.70201
PMID:42731116
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术,在重度哮喘小鼠模型中鉴定出一群由CCR2/CCR5信号驱动的致病性间质巨噬细胞亚群,并验证了双CCR2/CCR5拮抗剂的治疗潜力 | 首次鉴定出Lyve1loMHCIIhi间质巨噬细胞亚群是重度哮喘中的主要炎症细胞群体,揭示了CCR2/CCR5信号在其募集中的关键作用,并通过U-BIOPRED人类队列数据进行转化验证,提出双CCR2/CCR5拮抗作为治疗策略 | 主要基于小鼠模型,人类数据仅为转录组层面的验证,缺乏人类功能性实验,且CVC治疗的长期安全性和有效性有待进一步评估 | 探究间质巨噬细胞亚群在重度哮喘发病机制中的作用,并评估靶向CCR2/CCR5信号通路的治疗潜力 | C57BL/6小鼠重度哮喘模型(CFA-HDM诱导)及U-BIOPRED哮喘队列患者转录组数据 | 单细胞组学 | 重度哮喘 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 轨迹分析 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据, 转录组数据 | 小鼠模型肺组织巨噬细胞及U-BIOPRED哮喘队列患者痰液转录组数据 | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 86 | 2026-09-26 |
Single-Cell RNA Editing Identifies T Cell ADAR1 as a Key Regulator of Immune Exhaustion and Anti-PD-1 Resistance in Colorectal Cancer
2026-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.76143
PMID:42295773
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA编辑图谱分析,揭示了ADAR1在结直肠癌肿瘤浸润T细胞中高表达,促进T细胞耗竭并介导抗PD-1免疫治疗耐药 | 首次从单细胞水平系统性解析结直肠癌免疫微环境中ADAR1介导的RNA编辑图谱,突破以往聚焦肿瘤细胞内在IFN信号的局限,明确T细胞中ADAR1是免疫耗竭和抗PD-1耐药的关键调控因子,并揭示其通过TGF-β-SMAD信号通路发挥作用的机制 | 摘要中未明确提及研究的具体局限性,如样本量有限、单中心验证、缺乏ADAR1特异性抑制剂的临床转化数据等 | 阐明ADAR1介导的RNA编辑在结直肠癌免疫微环境中的细胞类型特异性功能,特别是其在T细胞中的作用及其对抗PD-1免疫治疗疗效的影响 | 结直肠癌患者的肿瘤微环境,重点关注肿瘤浸润T细胞 | 数字病理学, 机器学习 | 结直肠癌 | bulk RNA测序, 全长单细胞RNA测序 | NA | 文本, 图像 | 多个免疫治疗队列的临床样本,具体数量未在摘要中说明 | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | 全长单细胞RNA测序技术,具体平台配置未在摘要中说明 |
| 87 | 2026-09-26 |
S100A8/A9-High Macrophages Activate Intestinal Fibroblasts via mCCL6/hCCL15-CCR1 Axis to Drive Intestinal Fibrosis in Crohn's Disease
2026-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.76353
PMID:42371772
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析克罗恩病全层肠道组织,发现高表达S100A8/A9的促纤维化巨噬细胞亚群通过mCCL6/hCCL15-CCR1轴激活肠道成纤维细胞,从而驱动肠道纤维化 | 首次鉴定出以S100A8和S100A9高表达为特征的促纤维化巨噬细胞亚群,并揭示其通过mCCL6/hCCL15-CCR1轴激活成纤维细胞驱动肠道纤维化的新机制,提出靶向S100A8/A9巨噬细胞作为克罗恩病肠道纤维化的治疗策略 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究克罗恩病肠道纤维化的潜在机制并寻找有效的治疗靶点 | 克罗恩病患者全层肠道组织、慢性DSS诱导结肠炎小鼠模型 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA-seq、蛋白质组学分析 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 88 | 2026-09-26 |
Comprehensive evaluation of angiogenesis-associated genes in papillary thyroid cancer using bulk RNA and single-cell sequencing data
2026-Sep, European archives of oto-rhino-laryngology : official journal of the European Federation of Oto-Rhino-Laryngological Societies (EUFOS) : affiliated with the German Society for Oto-Rhino-Laryngology - Head and Neck Surgery
IF:1.9Q2
DOI:10.1007/s00405-026-10456-w
PMID:42472943
|
研究论文 | 本研究通过整合甲状腺乳头状癌公共数据库的批量RNA测序和单细胞测序数据,系统评估了血管生成相关基因的表达模式,并通过机器学习、诊断模型构建、转录因子分析及qPCR验证,鉴定了CDH13、SPHK1和EMCN等关键基因 | 整合批量RNA与单细胞测序数据,结合机器学习筛选血管生成相关关键标志物,并通过qPCR在本地队列中验证,系统揭示了血管生成相关基因在甲状腺乳头状癌中的表达模式及潜在诊断价值 | 研究主要基于公共数据库数据,本地队列样本量有限,qPCR验证后仅三个基因表达一致,部分关键标志物未得到充分验证 | 探索血管生成相关基因在甲状腺乳头状癌中的表达模式,加深对血管生成分子机制的理解,为治疗策略开发提供依据 | 甲状腺乳头状癌肿瘤组织及癌旁组织 | 机器学习 | 甲状腺癌 | 批量RNA测序、单细胞测序、qPCR | 机器学习 | 基因表达数据 | 公共数据库中甲状腺乳头状癌肿瘤及癌旁组织样本,以及本地队列组织样本(具体数量未提及) | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 89 | 2026-09-26 |
Comprehensive Profiling of ac4C RNA Modification Identifies CERCAM in Cancer-Associated Fibroblasts as a Key Prognostic and Microenvironmental Regulator in Colorectal Cancer
2026-Sep, Cancer reports (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/cnr2.70677
PMID:42773727
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和体外实验,全面描绘了结直肠癌中ac4C RNA修饰的景观,并确定CERCAM是癌症相关成纤维细胞中的关键预后和微环境调节因子 | 首次全面描绘结直肠癌中ac4C RNA修饰的景观,发现ac4C模式决定侵袭性基质串扰,并鉴定CERCAM为CAF特异性的肿瘤进展驱动因子 | 主要基于生物信息学分析和体外实验验证,缺乏体内动物模型和临床前瞻性验证 | 全面描绘结直肠癌中ac4C RNA修饰的景观,揭示其在塑造肿瘤微环境和临床结局中的作用 | 结直肠癌患者转录组和临床数据以及结直肠癌细胞系(RKO、HCT116)和癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, DNA甲基化分析 | ssGSEA, 预后评分模型 | 转录组数据, 临床数据, 图像 | 来自TCGA和GEO数据库(GSE14333、GSE17536、GSE38832、GSE39582)的结直肠癌患者转录组和临床数据,以及单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, DNA甲基化测序 | NA | NA |
| 90 | 2026-09-26 |
microRNAs as Regulators of the Immune Response and Their Potential Therapeutic Applications in Cancer
2026-Sep-01, Non-coding RNA
IF:3.6Q2
DOI:10.3390/ncrna12050034
PMID:42776740
|
综述 | 本文综述了microRNA调控抗肿瘤免疫应答及免疫逃逸的机制,重点探讨其在PD-1/PD-L1、CTLA-4、LAG-3、TIM-3和CD28等免疫检查点通路中的调控作用,并评估miRNA模拟物和抑制剂在癌症免疫治疗中的临床应用前景 | 系统整合了miRNA调控固有免疫和适应性免疫的机制及其与免疫检查点阻断、化疗、PARP抑制剂和靶向治疗联合应用的潜力,并结合空间转录组学和计算方法在单细胞及组织水平上对miRNA介导的调控网络进行了新解读 | miRNA疗法的临床转化仍面临高效递送、脱靶效应、免疫原性和患者异质性等重大挑战 | 全面概述miRNA调控抗肿瘤免疫和免疫逃逸的机制,评估miRNA作为诊断生物标志物、治疗靶点和治疗工具在癌症免疫治疗中的应用潜力 | miRNA、肿瘤免疫微环境、免疫细胞、免疫检查点通路 | 机器学习 | 肺癌 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 91 | 2026-09-26 |
TMEM59 regulates microglial Aβ phagocytosis in a TREM2-dependent manner and acts as a potential therapeutic target for Aβ amyloidosis
2026-Sep, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.71873
PMID:42786742
|
研究论文 | 本文研究了TMEM59在微胶质细胞Aβ吞噬中的调控作用及其作为阿尔茨海默病潜在治疗靶点的价值 | 首次发现TMEM59通过稳定TREM2蛋白以TREM2依赖的方式调控微胶质细胞Aβ吞噬,并开发了靶向降解TMEM59的CMATAC肽用于治疗淀粉样变 | 摘要中未提及具体研究局限性 | 探究TMEM59在微胶质细胞Aβ吞噬中的分子调控机制及其作为阿尔茨海默病治疗靶点的可行性 | 5xFAD小鼠模型中的微胶质细胞及TMEM59蛋白 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 92 | 2026-09-26 |
COBRA: cell-type-specific orthogonal batch effect removal algorithm in single cell RNA-sequencing data
2026-Aug-31, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag660
PMID:42684056
|
研究论文 | 本文提出了一种名为COBRA的线性模型批效应校正方法,可在单细胞RNA测序数据中实现细胞类型特异性的正交批效应去除 | 首次显式调整细胞类型特异性批效应,通过将批相关参数与生物变量正交化来去除技术伪影,并在无细胞类型注释时采用迭代聚类算法估计伪细胞类型 | 摘要中未明确提及局限性 | 解决单细胞RNA测序数据整合中的批效应问题,同时保留细胞类型特异性的生物学信息 | 单细胞RNA测序数据,包括模拟数据集和真实世界数据集(2型糖尿病和COVID-19数据集) | 机器学习 | 2型糖尿病、COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 线性模型 | 基因表达矩阵 | 未提及具体样本量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 93 | 2026-09-26 |
Diurnal Insulin Clearance and Circadian Metabolic Gene Signatures in MASLD: Integrative Multi-Dataset Physiological and Transcriptomic Analysis
2026-Aug-29, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo16090629
PMID:42783754
|
研究论文 | 该研究通过单受试者试点评估、公共高胰岛素-正血糖钳夹数据集、昼夜节律转录组数据集、空间转录组数据及高脂饮食小鼠时间序列数据,整合分析MASLD中胰岛素清除的昼夜变化及其与昼夜节律代谢基因特征的关系 | 首次整合多数据集探索人类胰岛素清除率的昼夜差异,并关联MASLD中胰岛素清除相关基因与昼夜节律基因的表达特征,结合空间转录组揭示肝小叶分布改变 | 单受试者试点评估样本量极小,依赖公共数据集且缺乏大规模受控人体研究验证,因果关系尚不明确 | 探索人类胰岛素清除的昼夜变化,并检查MASLD中相关的代谢基因特征 | 健康个体、MASLD患者、高脂饮食诱导小鼠模型、公共昼夜节律转录组及空间转录组数据集 | 机器学习, 数字病理学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 高胰岛素-正血糖钳夹, 转录组学, 空间转录组学, 时间序列转录组学 | NA | 文本, 图像 | 单受试者试点评估1例,公共钳夹数据集(健康个体和MASLD患者),公共昼夜节律转录组数据集、空间转录组数据及高脂饮食小鼠时间序列数据集(具体样本量未明确) | NA | 单细胞空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 94 | 2026-09-26 |
The cellular and molecular basis of gyrus-sulcus specialization in the primate brain
2026-Aug-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-77086-y
PMID:42786222
|
研究论文 | 该研究利用成年雄性猕猴大脑的单细胞空间转录组数据,开发了gsModel深度学习框架,仅基于局部细胞类型组成即可高精度区分脑沟与脑回,并揭示了其与结构连接及基因调控网络的关系 | 首次结合单细胞空间转录组学与定制化深度学习框架gsModel,仅凭局部细胞类型组成实现脑沟与脑回的高精度分类,并整合扩散MRI纤维束示踪,建立了从微观分子架构到宏观皮层组织的联系 | 研究仅基于成年雄性猕猴大脑数据,样本性别和物种单一,未涵盖其他灵长类或人类,且未进行功能验证实验 | 探究灵长类大脑脑沟与脑回特化的细胞和分子基础,建立连接微观分子架构与宏观皮层组织的分子框架 | 成年雄性猕猴大脑的脑沟与脑回区域 | 空间转录组学,深度学习,神经科学 | NA | 单细胞空间转录组学,扩散MRI纤维束示踪 | 深度学习框架(gsModel),机器学习模型 | 空间转录组数据,图像,扩散MRI数据 | 成年雄性猕猴大脑样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 95 | 2026-08-15 |
Intact Cell Dissociation of Formalin-Fixed Paraffin-Embedded Colon Tissue Enhances Cell Recovery and Gene Detection in Single-Cell RNA Sequencing
2026-Aug-13, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2026.101863
PMID:42595207
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 96 | 2026-09-26 |
Spatial multi-omics landscape of colorectal cancer macro- and micrometastases
2026-Aug-10, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2026.06.009
PMID:42425074
|
研究论文 | 该研究通过空间多组学分析揭示了结直肠癌宏观和微转移的演化景观及微环境特征 | 首次结合斑点级和高分辨率空间转录组学、激光捕获显微切割的多区域全基因组测序及高plex蛋白成像,构建了结直肠癌转移的空间演化图谱,并发现了肝微转移特异性的六基因特征 | 样本量有限,仅纳入19例患者,且未进行功能性验证实验 | 揭示结直肠癌转移的空间演化景观,并寻找用于监测和治疗靶向的空间验证生物标志物 | 19例结直肠癌患者的49个肿瘤样本,包括配对的原发灶、肝转移和肺转移 | 空间多组学 | 结直肠癌 | 空间转录组学、全基因组测序、高plex蛋白成像 | NA | 空间转录组数据、基因组数据、蛋白质成像数据 | 49个肿瘤样本来自19例患者 | 10x Genomics | 空间转录组学、全基因组测序 | 10x Visium | 斑点级和高分辨率空间转录组学,激光捕获显微切割结合全基因组测序 |
| 97 | 2026-09-26 |
Mapping and engineering the human cell-cell interactome
2026-Aug, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03177-2
PMID:42337362
|
观点文章 | 提出绘制和工程化人类细胞-细胞相互作用组的倡议,包括十亿细胞×细胞项目 | 首次提出系统性绘制人类细胞-细胞相互作用组的功能图谱,并启动十亿细胞×细胞项目 | 未提及具体实施细节或潜在技术障碍 | 系统理解细胞间相互作用如何调控组织水平功能,并构建细胞间通讯的功能图谱 | 人类主要细胞类型及其相互作用 | 单细胞转录组学, 空间组学 | NA | 单细胞转录组学, 空间分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间数据 | 十亿细胞×细胞对(计划) | NA | NA | NA | NA |
| 98 | 2026-09-26 |
Single-cell RNA sequencing reveals intrinsic and microbiota-associated sex differences in murine lung
2026-Jul-23, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2026.100389
PMID:42492858
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术比较了SPF和无菌条件下雌雄小鼠肺部免疫细胞的差异,揭示了共生微生物对性别特异性肺部免疫的调控作用 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统比较了SPF和无菌条件下雌雄小鼠肺部免疫细胞的组成和转录程序差异,揭示了共生微生物在塑造性别特异性肺部免疫中的关键作用 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证;仅关注肺部免疫细胞,未涉及其他组织器官;未深入探讨具体微生物种类或代谢产物如何驱动这些差异 | 探究共生微生物是否影响性别特异性的肺部免疫差异,以及内在因素(性别)和外在因素(微生物)如何交互塑造黏膜免疫 | SPF和无菌条件下饲养的雌性和雄性小鼠的肺部免疫细胞 | 单细胞组学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | SPF和无菌条件下雌雄小鼠的肺部免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 99 | 2026-09-26 |
Decoding dry eye disease based on bioinformatics and in vitro experimental: the role of immune responses and natural product intervention
2026-Jul-18, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-026-00992-1
PMID:42471730
|
研究论文 | 该研究结合生物信息学分析与体外细胞实验,探索干眼症的免疫机制及天然产物Genistein的治疗潜力 | 整合多数据库差异基因分析、机器学习特征基因筛选、分子对接、免疫细胞浸润估计和单细胞RNA测序,并结合体外实验验证Genistein对干眼症的治疗作用 | 仅进行了体外细胞实验验证,缺乏体内动物模型和临床试验数据 | 解码干眼症的免疫机制并探索天然产物干预的治疗潜力 | 干眼症相关基因数据集及人角膜上皮细胞 | 生物信息学 | 干眼症 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 分子对接 | LASSO, SVM-RFE | 基因表达数据, 图像 | GSE44101基础数据集及多个GEO独立验证数据集 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 100 | 2026-09-26 |
Single-cell hdWGCNA identifies checkpoint inhibitor pneumonitis-linked CD4 + T-cell subsets driving immunotherapy response and prognosis in lung cancer
2026-Jul-10, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-026-06522-9
PMID:42429963
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和高维加权基因共表达网络分析,识别了与免疫检查点抑制剂相关性肺炎相关的CD4+ T细胞亚群,并构建了预测肺癌免疫治疗反应和预后的基因特征 | 首次将hdWGCNA应用于免疫检查点抑制剂相关性肺炎的单细胞数据分析,识别了CIP相关的CD4+ T细胞基因模块,并构建了预测LUAD患者生存和ICI反应的预后特征,同时通过免疫荧光验证了BIRC3+CD4+ T细胞在CIP肺组织中的空间定位 | 摘要中未明确说明研究局限性 | 阐明免疫检查点抑制剂相关性肺炎的发病机制及其对免疫治疗结局的影响,特别是特定免疫细胞亚群在介导这些过程中的作用 | 免疫检查点抑制剂相关性肺炎患者的单细胞RNA测序数据及独立的肺腺癌队列 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、高维加权基因共表达网络分析、免疫荧光染色 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |