单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 39643 篇文献,本页显示第 81 - 100 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
81 2026-05-23
Identification of anti-TIM-3 based checkpoint inhibitor combinations with activity in immunotherapy refractory melanoma models
2025-Aug-18, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 该研究通过黑色素瘤模型探索了基于抗TIM-3的免疫检查点抑制剂组合在免疫治疗耐药中的作用机制 首次发现抗PD-1+LAG-3+TIM-3三联疗法能有效克服TIM-3+终末耗竭CD8+T细胞富集的黑色素瘤耐药模型,并揭示其通过增加前体耗竭CD8+T细胞和减少调节性T细胞实现肿瘤完全消退 研究主要基于小鼠模型和少量患者scRNA-Seq数据,未在大型临床试验中验证该组合的临床疗效和安全性;且SW1耐药模型对PD-1+CTLA-4+LAG-3三联不敏感仅针对特定亚型 为免疫检查点抑制剂耐药的黑色素瘤患者识别新型有效的二线免疫检查点抑制剂组合 SM1、SW1和B16-10黑色素瘤小鼠模型,以及黑色素瘤患者的单细胞RNA测序数据 数字病理学 黑色素瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 3种小鼠黑色素瘤模型(SM1、SW1、B16-10)及黑色素瘤患者队列(scRNA-Seq数据) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
82 2026-05-23
Autoimmune origin for immune checkpoint inhibitor-diabetes revealed by deep immune phenotyping of the pancreas
2025-Aug-14, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 通过深度免疫表型分析揭示免疫检查点抑制剂诱导糖尿病的自身免疫起源 首次获取并深入分析接受CPI治疗并发糖尿病的患者胰腺组织,通过单细胞RNA测序和免疫表型确定CPI-D的自身免疫机制 仅基于一例患者数据,缺乏对照组,限制了发现的普遍性 阐明免疫检查点抑制剂诱导糖尿病的细胞和分子机制 一名接受CPI治疗并发糖尿病和胰腺癌的患者 数字病理学 自身免疫性糖尿病 单细胞RNA测序, 免疫表型分析 NA 单细胞转录组数据 一例患者胰腺组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
83 2026-05-23
Decoding Cellular Stress States for Toxicology Using Single-Cell Transcriptomics
2025-Aug-02, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 利用单细胞转录组学技术解析毒理学中细胞应激状态 首次应用TempO-LINC平台对暴露于多种化学物质的HepaRG细胞进行单细胞转录组分析,系统揭示不同应激反应通路(如未折叠蛋白反应、氧化应激反应、热休克反应和DNA损伤反应)的异质性和动态变化,并通过广义Jaccard聚类将细胞分为五种不同应激表型组 NA 使用单细胞转录组学解码化学物质暴露诱导的细胞应激状态,探索细胞适应性反应与终末结局之间的转换机制 经依托泊苷、布雷菲德菌素A、放线菌酮、鱼藤酮、tBHQ、曲格列酮和衣霉素处理24小时的约40,000个HepaRG细胞 数字病理学 NA 单细胞转录组测序 NA 基因表达数据 约40,000个HepaRG细胞样本 TempO-LINC 单细胞RNA测序 TempO-LINC平台 TempO-LINC单细胞转录组平台
84 2026-05-23
Enhanced Translational Activity Is Linked to Lymphatic Endothelial Cell Activation in Cutaneous Leishmaniasis
2025-Aug, Lymphatic research and biology IF:1.6Q4
研究论文 利用单细胞RNA测序等技术,表征了皮肤利什曼病小鼠模型淋巴内皮细胞的转录和翻译反应,发现其激活状态和抗原呈递潜能 首次揭示了淋巴内皮细胞在利什曼病病变中的翻译活性增强及其与免疫激活的关系,并证实其作为抗原呈递细胞的能力 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类皮肤利什曼病的病理机制 探究淋巴内皮细胞在皮肤利什曼病免疫微环境中的激活状态及其对局部免疫和炎症的潜在影响 小鼠真皮淋巴内皮细胞 机器学习 利什曼病 单细胞RNA测序,流式细胞术,嘌呤霉素掺入 NA 基因表达数据 未明确说明具体数量,但涉及小鼠组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
85 2026-05-23
Disruption of cell-intrinsic PCSK9 enhances the antitumor efficacy of CD8+ T cells
2025-Jul-15, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 研究发现破坏CD8+ T细胞内源性PCSK9可增强其抗肿瘤功效 首次揭示免疫细胞内源性PCSK9在肿瘤控制中的抑制作用,并证明PCSK9缺失可增强CD8+ T细胞的抗肿瘤能力 未提及具体局限性 探究免疫细胞内源性PCSK9在CD8+ T细胞抗肿瘤免疫中的作用 小鼠CD8+ T细胞和人类嵌合抗原受体(CAR)-T细胞 机器学习和免疫学交叉 胰腺癌和黑色素瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和流式细胞术 NA 单细胞转录组数据 Pcsk9缺陷小鼠和肿瘤模型小鼠 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
86 2026-05-23
Malevolent alliance of MYBL2hi cancer stem cell and SPP1+ macrophage confers resistance to neoadjuvant immunotherapy in bladder cancer
2025-Jul-10, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 通过单细胞和空间转录组学揭示MYBL2高表达癌症干细胞与SPP1阳性巨噬细胞的协同作用导致膀胱癌对免疫检查点阻断新辅助治疗耐药 首次从单细胞和空间转录组角度阐明MYBL2高表达癌症干细胞与SPP1阳性巨噬细胞通过CCL15-CCR1和SPP1-ITGα9β1轴的双向通讯驱动膀胱癌免疫治疗耐药,并发现老年CCL3阳性中性粒细胞参与其中 研究样本量较小(2例初治和10例治疗患者),需要更大队列验证;主要基于转录组分析,功能验证仅在小鼠模型中进行 探究膀胱癌对新辅助免疫检查点阻断治疗的耐药机制 膀胱癌患者的外周血单核细胞、肿瘤组织、癌旁正常组织和转移淋巴结 机器学习和数字病理学 膀胱癌 单细胞RNA测序、空间RNA测序、多重免疫组化、流式细胞术 NA 基因表达数据、空间基因表达数据 12例膀胱癌患者(2例初治、5例应答者、5例非应答者) 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium用于单细胞RNA测序,10x Visium用于空间RNA测序
87 2026-05-23
Overexpression of high affinity Type I adenosine receptors promotes the growth of uterine leiomyomas
2025-07-03, Molecular human reproduction IF:3.6Q1
研究论文 本研究探讨了高亲和力I型腺苷受体(ADORA1)过表达促进子宫平滑肌瘤生长的机制 首次揭示ADORA1在子宫平滑肌瘤中过表达通过调节AKT1信号通路促进肿瘤生长,并利用单细胞转录组数据分析多种细胞亚型的ADORA1表达 未明确阐述体外结果与体内机制的完全对应性,且样本量可能有限 阐明细胞外腺苷水平改变对子宫平滑肌瘤生长的作用机制 子宫平滑肌瘤组织和匹配的肌层组织标本及其原代培养细胞 数字病理学 子宫平滑肌瘤 RT-qPCR, Western blot, 免疫组化, 单细胞转录组学, siRNA干扰 NA 组织标本和原代培养细胞 匹配的子宫肌层和肌瘤标本及其原代培养物(具体数量未提及) NA 单细胞转录组学 NA NA
88 2026-05-23
scRNA-Seq and Bulk-Seq Identify Novel Markers Associated With Calcium Regulation and Immunomodulation in Acute Pancreatitis
2025-07-01, Pancreas IF:1.7Q3
research paper 通过单细胞RNA测序和批量RNA测序识别与急性胰腺炎中钙调控和免疫调节相关的新型标志物 结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据构建ceRNA网络,首次发现与钙信号和免疫调节相关的新候选基因 未说明具体局限性,试验注册不适用 阐明急性胰腺炎的发病机制并识别新的潜在生物标志物 急性胰腺炎小鼠模型 machine learning acute pancreatitis RNA-seq, scRNA-seq, qRT-PCR ceRNA network RNA-seq data, scRNA-seq data 小鼠样本(具体数量未明确) Illumina bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq Illumina NovaSeq NA
89 2026-05-23
Fibroblasts-The emerging therapeutic target of the cardiovascular system?
2025-07, Pharmacological reviews IF:19.3Q1
综述 综述了单细胞RNA测序揭示的成纤维细胞在心血管系统中的异质性和可塑性,及其在健康和疾病状态下的多样角色 强调缺乏成纤维细胞亚型共识命名法,提出跨心脏和血管组织的共享标志物及其治疗潜力与安全性问题 心脏成纤维细胞靶向治疗的临床前研究虽有前景,但血管干预手段有限,且亚型表型重叠和功能多样性构成挑战 探索成纤维细胞在心血管系统中的治疗靶点潜力,并倡导完善其分类和命名 心血管系统中健康和疾病状态下的成纤维细胞 自然语言处理 心血管疾病 NA NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
90 2026-05-23
Low-dose radiotherapy enhances the efficacy of PD-L1 blockade and induces the abscopal effect
2025-Jun-30, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 低剂量放疗能增强PD-L1免疫检查点抑制剂的疗效并诱导远端未照射肿瘤的远隔效应,通过单细胞RNA测序揭示肿瘤相关巨噬细胞向促炎表型极化是关键机制 首次证明低剂量放疗联合抗PD-L1可诱导与高剂量放疗相当的远隔效应,并阐明肿瘤相关巨噬细胞在该效应中的关键作用 研究仅局限于小鼠肿瘤模型(MC38和CT26),尚未在临床试验中验证 探究低剂量放疗在增强免疫检查点抑制剂疗效和诱导远隔效应中的潜力及其机制 小鼠肿瘤模型(MC38或CT26)中的肿瘤微环境、免疫细胞及治疗反应 机器学习 癌症(肿瘤) 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据(单细胞转录组) 免疫健全小鼠(分别携带MC38或CT26肿瘤,每只小鼠1或2个肿瘤) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
91 2026-05-23
Targeting Annexin A2 to reactivate tumor-associated antigens presentation and relieve immune tolerance in liver cancer
2025-Jun-26, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 靶向Annexin A2恢复肝癌中肿瘤相关抗原呈递并缓解免疫耐受 首次发现Annexin A2通过抑制与HSP90的结合来阻碍肿瘤相关抗原呈递,并证明靶向Annexin A2可增强CD8+ T细胞杀伤肿瘤效果,提高抗PD-1治疗的疗效 未明确提及,但可能局限在于仅使用小鼠模型,临床样本验证不足 阐明Annexin A2在肝癌中调控肿瘤相关抗原呈递和免疫逃逸的分子机制,并探索其作为免疫治疗靶点的潜力 Annexin A2蛋白,HSP90蛋白,肿瘤相关抗原,CD8+ T细胞 机器学习 肝癌 CRISPR-Cas9基因敲除,共免疫沉淀偶联液相色谱串联质谱,单细胞测序 NA NA 化学和基因诱导的原发性肝癌模型及原位肝癌移植模型 NA 单细胞测序 NA NA
92 2026-05-23
Hyperglycemia induces an immunosuppressive microenvironment in colorectal cancer liver metastases by recruiting peripheral blood monocytes through the CCL3-CCR1 axis
2025-Jun-22, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 研究高血糖通过CCL3-CCR1轴招募外周血单核细胞,从而在结直肠癌肝转移中诱导免疫抑制微环境 首次揭示了高血糖通过CCL3-CCR1信号轴调控结直肠癌肝转移中免疫抑制的新机制 主要基于小鼠模型和有限的人类样本分析,可能无法完全代表人类疾病的复杂性 探讨2型糖尿病背景下结直肠癌肝转移的免疫微环境并识别潜在治疗靶点 高血糖结直肠癌肝转移小鼠模型以及人类外周血单核细胞和肝转移样本 机器学习 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 20个结直肠癌肝转移样本及匹配的外周血单核细胞数据集,加上健康供体和2型糖尿病患者的PBMC数据集 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium NA
93 2026-05-23
STS2 deficiency revives CD8+T cells from exhaustion and augments checkpoint blockade efficacy in cancer immunotherapy
2025-Jun-22, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究揭示了STS2缺失通过调控PD-1表达和内吞作用,恢复CD8+ T细胞功能,增强抗PD-1免疫检查点疗法在肿瘤免疫治疗中的效果 首次发现STS2作为T细胞耗竭的多面调控因子,通过与PD-1蛋白直接相互作用调节其表达、内吞和降解,为增强抗肿瘤免疫和改善免疫治疗疗效提供新靶点 NA 研究STS2在调控肿瘤微环境中CD8+ T细胞耗竭中的作用及其对免疫检查点疗法的影响 小鼠模型中的CD8+肿瘤浸润淋巴细胞 machine learning 肿瘤 遗传敲除、流式细胞术、质谱流式、单细胞转录组学、免疫共沉淀、蛋白降解实验、内吞测量 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
94 2026-05-23
EZH2 inhibition and 5-azacytidine enhance antitumor immunity in PTEN-deficient glioblastoma by activation viral mimicry response
2025-Jun-13, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 通过抑制EZH2与5-氮杂胞苷联合治疗,在PTEN缺陷的胶质母细胞瘤中激活病毒拟态反应,增强抗肿瘤免疫 首次揭示EZH2抑制与5-氮杂胞苷联合通过表观遗传调控重新激活内源性逆转录病毒-病毒拟态通路,克服PTEN缺陷胶质母细胞瘤的免疫逃逸 未提及具体局限性 探索PTEN缺陷胶质母细胞瘤中通过病毒拟态通路增强抗肿瘤免疫的治疗策略 PTEN缺陷的胶质母细胞瘤及其免疫微环境 机器学习 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
95 2026-05-23
C5a/C5aR pathway blocking promoted CuS-mediated cancer therapy effect by inhibiting cuproptosis resistance
2025-Jun-08, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究揭示了C5a/C5aR通路通过上调ATP7B表达介导铜死亡抵抗,并证明联合CuS纳米颗粒和C5a受体拮抗剂可显著增强抗肿瘤疗效 首次阐明C5a/C5aR通路通过Wnt/β-catenin信号上调ATP7B表达介导铜死亡抵抗,并提出CuS纳米颗粒联合C5aRA的协同治疗策略(整合铜死亡靶向、免疫治疗和光热治疗) NA 探究C5a/C5aR通路在铜死亡抵抗中的作用机制,并评估联合CuS纳米颗粒和C5aRA的癌症治疗疗效 乳腺癌细胞系、异种移植小鼠模型 机器学习 乳腺癌 单细胞RNA测序、RNA测序、生物信息学分析、免疫组化、ELISA NA 文本 NA 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 10x Chromium, Illumina NovaSeq 单细胞RNA测序使用10x Chromium平台,批量RNA测序使用Illumina NovaSeq测序仪
96 2026-05-23
Characterization of the recombination activity in the pituitary and ovary of Prop1-iCre knockin mice
2025-06-01, American journal of physiology. Endocrinology and metabolism
研究论文 该论文描述了Prop1-iCre敲入小鼠在垂体和卵巢中的重组活性,为垂体内分泌细胞基因操作提供了有效工具,并提醒注意其在卵巢中的活性 通过CRISPR/Cas9系统生成Prop1-iCre敲入小鼠,实现Prop1与Cre重组酶的双顺反子表达,表现出在垂体内分泌细胞中稳健且特异的重组活性,无外位活性,同时意外发现卵巢颗粒细胞中的活性 未明确讨论该模型在其他组织中的潜在活性,且需进一步验证其在不同背景下的重复性和长期稳定性 评估Prop1-iCre敲入小鼠在垂体和卵巢中的Cre重组活性,为垂体生物学研究提供更可靠的基因操作工具 Prop1-iCre敲入小鼠及其与Rosa-tdTomato报告品系杂交产生的后代,包括垂体和卵巢组织 数字病理学 NA CRISPR/Cas9基因编辑 NA 图像 上述小鼠品系的多个个体样本,具体数量未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
97 2026-05-23
Characterization of ROMK cellular heterogeneity along the mouse kidney thick ascending limb
2025-06, Pflugers Archiv : European journal of physiology
研究论文 该研究结合RNAscope原位杂交、迭代间接免疫荧光成像和机器学习技术,揭示了小鼠肾脏髓质升支粗段(TAL)中ROMK通道的细胞异质性,发现顶膜ROMK蛋白分布与不同的TAL细胞类型相关 首次证明虽然ROMK mRNA在TAL所有细胞中普遍表达,但顶膜ROMK蛋白分布具有细胞异质性,且与特定的分子标记(Ptger3、Foxq1)和紧密连接蛋白(Claudin-10b、Claudin-16/19)表达模式对齐,揭示了TAL功能异质性的分子基础 未提供具体局限性信息 探究ROMK通道在小鼠肾脏TAL中不同细胞类型的分布规律和分子特征 小鼠肾脏TAL细胞 数字病理学 NA RNAscope原位杂交、迭代间接免疫荧光成像、机器学习 机器学习 图像 灌注固定的小鼠肾脏样本 NA NA NA NA
98 2026-05-23
D-SPIN constructs gene regulatory network models from multiplexed scRNA-seq data revealing organizing principles of cellular perturbation response
2025-May-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 介绍D-SPIN计算框架,利用多重单细胞RNA测序数据构建基因调控网络模型,揭示细胞扰动响应的组织原理 提出D-SPIN框架,能从数千种不同扰动条件下收集的单细胞mRNA测序数据中生成基因调控网络的定量模型,并揭示细胞命运决定的关键调控因子和药物响应机制 未明确提及 利用单细胞RNA测序数据构建基因调控网络定量模型,揭示细胞信息处理和生理控制原理 受扰动后的细胞群体 机器学习 NA 单细胞RNA测序 概率模型 基因表达数据 大规模Perturb-seq和药物响应数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
99 2026-05-23
Library-based single-cell analysis of CAR signaling reveals drivers of in vivo persistence
2025-May-21, Cell systems IF:9.0Q1
研究论文 利用单细胞测序技术分析嵌合抗原受体(CAR)信号域库,揭示不同信号架构对T细胞体内持久性和功能的影响 首次利用单细胞测序系统性地将不同的CAR细胞内信号域(ICD)架构与转录输出进行映射,并发现特定ICD架构能够驱动T细胞在液体肿瘤中产生独特的强直信号特征,从而增强体内持久性和疗效 该研究仅限于液体肿瘤模型,未证实相同ICD架构在实体肿瘤中的有效性,且基于文库的体外分析可能未能完全模拟体内复杂的微环境 解码CAR信号设计原理,通过系统分析ICD架构与T细胞功能的关系,为下一代ICD的理性设计提供依据 表达不同CAR信号域架构的工程化T细胞 数字病理学 肿瘤 单细胞测序,NGS NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
100 2026-05-23
Intratumoral microbiota predicts the response to neoadjuvant chemoimmunotherapy in triple-negative breast cancer
2025-Apr-24, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 探索瘤内微生物群在三阴性乳腺癌新辅助化学免疫治疗反应预测中的作用 首次将瘤内微生物群作为预测三阴性乳腺癌新辅助化学免疫治疗病理完全缓解的生物标志物,并利用单细胞转录组测序揭示微生物群与肿瘤微环境免疫细胞浸润的关联 样本量较小(仅89例患者),且未在其他独立队列中验证预测模型的泛化能力 评估瘤内微生物群对早期三阴性乳腺癌新辅助化学免疫治疗反应的预测价值 接受新辅助化学免疫治疗的早期三阴性乳腺癌女性患者 机器学习 乳腺癌 16S rDNA测序, 单细胞转录组测序 机器学习模型 基因组数据, 转录组数据 89例早期三阴性乳腺癌女性患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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