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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-11-13 |
Repetitive Trans-spinal Magnetic Stimulation Suppresses Microglia to Engulf Synapse and Promotes Nerve Repairment via cGAS-STING Signaling Pathway after Spinal Cord Injury
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.114428
PMID:41208875
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研究论文 | 本研究探讨重复经脊髓磁刺激通过cGAS-STING信号通路调控小胶质细胞突触吞噬促进脊髓损伤后神经修复的机制 | 首次揭示rTSMS通过抑制cGAS-STING通路调控小胶质细胞突触吞噬功能促进神经修复的新机制 | 研究主要基于大鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 探究重复经脊髓磁刺激在脊髓损伤修复中的作用机制 | 脊髓损伤模型大鼠 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序,蛋白质印迹,免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,组织图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 82 | 2025-11-13 |
DPP7 promotes fatty acid β-oxidation in tumor-associated macrophages and determines immunosuppressive microenvironment in colorectal cancer
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.117909
PMID:41208881
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研究论文 | 本研究揭示了DPP7通过增强脂肪酸β-氧化促进结直肠癌中肿瘤相关巨噬细胞的免疫抑制功能 | 首次发现DPP7通过结合CPT1A减少其泛素化降解,增强脂肪酸氧化,从而驱动肿瘤相关巨噬细胞的免疫抑制表型 | 研究主要基于临床队列和动物模型,需要进一步验证在人类患者中的治疗潜力 | 探索肿瘤相关巨噬细胞中影响免疫治疗效果的基因及其机制 | 结直肠癌患者样本、肿瘤相关巨噬细胞、骨髓来源巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 飞行时间流式细胞术, 多重免疫荧光, RNA测序, 液相色谱-串联质谱, 靶向脂质代谢组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据, 代谢组数据, 临床数据 | 华东医院和TCGA数据库的多个患者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 83 | 2025-11-13 |
TTC36-Mediated Tumor Suppression via YBX3/SPRED1 Axis Paradoxically Reduces Sorafenib Sensitivity in Hepatocellular Carcinoma
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.115727
PMID:41208883
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研究论文 | 本研究揭示TTC36通过稳定YBX3上调SPRED1抑制肝细胞癌增殖,但意外增强索拉非尼耐药性的分子机制 | 首次发现TTC36通过YBX3/SPRED1轴发挥肿瘤抑制作用,并揭示该通路通过PI3K/Akt代偿性激活导致索拉非尼耐药的矛盾现象 | 未明确说明样本量及动物模型具体数量 | 探究TTC36在肝细胞癌中的功能作用、分子机制及其对靶向治疗的影响 | 肝细胞癌组织、细胞系和动物模型 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | RNA-seq, scRNA-seq, 质谱分析, 分子对接, RNA pulldown, 双荧光素酶报告实验, IHC染色, TUNEL染色 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 84 | 2025-11-13 |
Comparative transcriptomic analysis of tumor- infiltrating canine natural killer cells and candidate biomarkers from first-in-dog NK immunotherapy trials
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1646849
PMID:41208961
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较犬类和人类肉瘤中肿瘤浸润自然杀伤细胞的转录组特征,并分析犬类NK免疫疗法试验中的候选生物标志物 | 首次在犬类肉瘤中系统分析肿瘤浸润NK细胞的转录特征,并利用犬类自发癌症模型作为人类临床试验的桥梁 | 样本量相对有限,需要更大规模验证生物标志物的预测价值 | 改善实体瘤中NK细胞免疫疗法的疗效并识别响应生物标志物 | 犬类和人类自然杀伤细胞 | 单细胞转录组学 | 肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 犬类和人类供体的血液、组织和肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 85 | 2025-11-13 |
Identification of CAF signature genes and construction of CAF-based risk signature in hepatocellular carcinoma by multi-omics analysis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1690174
PMID:41208981
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研究论文 | 通过多组学分析鉴定肝细胞癌中癌症相关成纤维细胞特征基因并构建基于CAF的风险预测模型 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组技术鉴定CAF特征基因,并构建了基于四个CAF基因的预后风险模型 | 研究样本量有限,需要更大规模验证 | 开发基于CAF的风险特征模型用于预测肝细胞癌预后和识别潜在治疗靶点 | 肝细胞癌组织、癌症相关成纤维细胞、HepG2细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组,免疫组织化学,多变量Cox回归 | 多变量Cox回归风险模型 | 基因表达数据,空间分布数据,蛋白质表达数据 | 数据集GSE242889的肝细胞癌组织样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组 | NA | NA |
| 86 | 2025-11-13 |
Identification of sex- and inflammation-associated heterogeneity in the mouse omentum
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1670112
PMID:41208978
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序系统描绘了小鼠大网膜在静息和激活状态下的细胞异质性,揭示了性别和炎症相关的细胞差异 | 首次提供了按性别和激活状态分层的大网膜细胞综合图谱,发现了先前未表征的免疫和基质细胞亚群,包括三种具有激活依赖性基因表达模式的巨噬细胞亚型 | 研究仅限于小鼠模型,缺乏人类样本验证 | 系统定义小鼠大网膜的细胞异质性,探索性别和炎症对细胞组成的影响 | 小鼠大网膜组织,包括静息状态和激活状态的样本 | 单细胞生物学 | 卵巢癌转移 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自两种性别小鼠的静息和激活大网膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 87 | 2025-11-13 |
Single-cell and machine learning-based pyroptosis-related gene signature predicts prognosis and immunotherapy response in glioblastoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1693940
PMID:41208987
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和机器学习方法构建了焦亡相关基因特征,用于预测胶质母细胞瘤的预后和免疫治疗反应 | 首次系统整合单细胞RNA测序数据和多种机器学习算法,构建胶质母细胞瘤焦亡相关基因特征,并实验验证关键基因MAP1B的功能 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要进一步的前瞻性临床验证 | 探索焦亡在胶质母细胞瘤中的作用并开发预后预测模型 | 胶质母细胞瘤患者和肿瘤细胞 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 机器学习 | StepCox[both]+Ridge, 十种机器学习算法组合 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | TCGA-GBM, CGGA, GEO, GSE141383, GSE223063等多个数据库样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序 | NA | NA |
| 88 | 2025-11-13 |
Dysregulated arginine metabolism is associated with pro-tumor neutrophil polarization in liver cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1673665
PMID:41208994
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据揭示了精氨酸代谢调控肝癌中中性粒细胞极化的机制 | 首次在肝癌中发现中性粒细胞存在三种不同的精氨酸代谢状态,并鉴定出PADI4作为关键调控基因 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限 | 探索精氨酸代谢在肝癌肿瘤微环境中对中性粒细胞极化的调控作用 | 肝癌肿瘤微环境中的中性粒细胞 | 生物信息学 | 肝癌 | RNA-seq, scRNA-seq, 机器学习 | CytoTRACE, monocle2, CellChat, 七种机器学习算法 | 基因表达数据 | TCGA和GEO数据库中的多个数据集(GSE39791, GSE149614, GSE290925) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 89 | 2025-11-13 |
Monocyte-driven IFN and TNF programs orchestrate inflammatory networks in antisynthetase syndrome-associated interstitial lung disease
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1652999
PMID:41209011
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了抗合成酶综合征相关间质性肺病中单核细胞驱动的干扰素和肿瘤坏死因子信号网络 | 首次在单细胞水平识别了ASS-ILD中单核细胞特异性干扰素特征和炎症轨迹,发现mono2亚群在免疫失调中的核心作用 | 样本量较小(仅3名患者和3名对照),需更大队列验证 | 阐明ASS-ILD的免疫致病机制和细胞特异性干扰素特征 | 抗合成酶综合征相关间质性肺病患者的外周血单个核细胞 | 单细胞基因组学 | 间质性肺病 | 单细胞RNA测序 | AUCell, Seurat, Monocle, CellChat, decoupleR | 单细胞转录组数据 | 3名ASS-ILD患者和3名健康对照的67,421个细胞,整合外部队列共126,026个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 90 | 2025-11-13 |
Integrated bioinformatic analysis and machine learning developed a prognostic model based on mitochondrial function for acute myeloid leukemia
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1597633
PMID:41209008
|
研究论文 | 本研究通过整合线粒体基因表达数据和机器学习算法,开发了基于线粒体功能的急性髓系白血病预后模型MitoScore | 首次整合14种机器学习算法构建线粒体功能评分系统,并结合单细胞测序分析线粒体基因在免疫细胞中的表达模式 | 未明确说明样本来源和验证队列的具体信息 | 开发基于线粒体功能的急性髓系白血病预后评估工具 | 急性髓系白血病患者样本 | 机器学习 | 急性髓系白血病 | bulk RNA测序, 单细胞测序 | 集成机器学习算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 91 | 2025-11-13 |
Single-cell RNA sequencing analysis reveals the critical role of fibroblasts in aortic progeria-associated vascular remodeling in Hutchinson-Gilford progeria syndrome mice
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1638083
PMID:41209003
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示了成纤维细胞在Hutchinson-Gilford早衰综合征小鼠主动脉早衰相关血管重塑中的关键作用 | 首次在HGPS小鼠模型中系统揭示主动脉成纤维细胞的异质性、发育轨迹和细胞间通讯网络,并鉴定Lgals3bp作为关键调控因子 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究成纤维细胞在早衰综合征主动脉血管重塑中的作用机制 | HGPS小鼠主动脉组织 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 基因表达谱分析, GO分析, 细胞通讯网络分析, 基因敲低 | NA | 单细胞转录组数据 | HGPS小鼠主动脉组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 92 | 2025-11-13 |
HOXA5-mediated spatial remodeling of tumor-immune interfaces across cancers promotes AML pathogenesis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1677713
PMID:41209012
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据揭示了HOXA5在多种癌症中的空间免疫调节功能及其在AML发病机制中的关键作用 | 首次系统揭示HOXA5在泛癌水平调控肿瘤-免疫界面空间重塑的功能,并发现巯嘌呤作为潜在治疗药物 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于AML细胞系,缺乏体内实验验证 | 阐明HOXA5在癌症中的空间免疫调节功能和治疗潜力 | 33种癌症类型的多组学数据和AML细胞系(U937, KG-1) | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 多组学整合分析, 空间转录组学, 分子对接 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 空间转录组数据 | TCGA数据库11,096例样本, GTEx数据库7,469例样本, AML细胞系3个生物学重复 | NA | 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 93 | 2025-11-13 |
Elevated KNSTRN as a potential indicator for triple-negative breast cancer progression and immune infiltration
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1572359
PMID:41209020
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研究论文 | 本研究探讨KNSTRN基因在三阴性乳腺癌中的表达及其与预后和免疫浸润的关系 | 首次确认KNSTRN在三阴性乳腺癌中的过表达与不良预后和免疫抑制微环境相关 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,需要更多临床样本验证 | 确定KNSTRN在三阴性乳腺癌预后、免疫浸润和进展中的潜在作用 | 三阴性乳腺癌细胞系(MDA-MB-231和BT549)及患者组织样本 | 生物信息学 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞转录组, siRNA敲低, 免疫组织化学 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 临床数据 | 来自TCGA、GEO和METABRIC数据库的多个数据集 | NA | RNA-seq, 单细胞转录组 | NA | NA |
| 94 | 2025-11-13 |
Profiling Shared Cytotoxic Immune Signatures in SLE-Associated Coronary Injury Through Transcriptomics and Machine Learning
2025, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S539756
PMID:41209049
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研究论文 | 本研究通过转录组学和机器学习方法揭示了系统性红斑狼疮相关冠状动脉损伤中共享的细胞毒性免疫特征 | 首次发现SLE和CAD共享细胞毒性淋巴细胞驱动的分子轴,识别出GZMK/KLRK1介导的免疫失调是SLE冠状动脉损伤的关键机制 | 在冠状动脉微血管功能障碍的SLE患者亚组中样本量较小(n=4),需要在扩大队列中进一步验证 | 揭示系统性红斑狼疮和冠状动脉疾病之间的共享分子通路,探索SLE相关冠状动脉损伤机制 | 系统性红斑狼疮患者、冠状动脉疾病患者、外周血单个核细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, qPCR | 机器学习诊断模型 | 基因表达数据, 单细胞数据 | 多个公共数据集(GSE45291, GSE61145, GSE49454, GSE179789, GSE264125, GSE135779)和患者PBMCs样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 95 | 2025-11-13 |
Mathematical strategies for predicting resistant subpopulations from scRNAseq data of a PANC-1 3D tissue model: Insight into gemcitabine resistance and TGFB1-induced invasion and EMT
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.10.032
PMID:41209344
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析3D培养的PANC-1细胞模型,开发数学方法预测吉西他滨耐药亚群并研究TGFB1诱导的侵袭和上皮间质转化 | 开发了基于互信息的机器学习框架(gSELECT)和新型数学方法,能够从看似相似的细胞群体中预测耐药亚群 | 研究仅基于PANC-1细胞系,需要在更多细胞系和临床样本中验证 | 研究胰腺导管腺癌的化疗耐药机制和侵袭表型 | 3D培养的PANC-1胰腺癌细胞系 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | 基于互信息的机器学习框架(gSELECT) | 单细胞RNA测序数据 | PANC-1细胞3D培养模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 96 | 2025-11-13 |
Single-cell analysis decodes cellular dynamics in clear cell renal cell carcinoma with tumor thrombus
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.10.019
PMID:41209347
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序解析肾透明细胞癌中肿瘤血栓形成的细胞动态和分子特征 | 首次对肾透明细胞癌原发肿瘤及其匹配静脉肿瘤血栓进行系统单细胞分析,揭示血栓特异性免疫抑制微环境和促肿瘤巨噬细胞亚群 | NA | 系统表征肿瘤血栓形成的微环境特征 | 肾透明细胞癌原发肿瘤及其匹配静脉肿瘤血栓 | 单细胞组学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 97 | 2025-11-13 |
The Alterations in the Osteoimmune Microenvironment of STZ-Induced Type 2 Diabetic Mice:A Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S544316
PMID:41209384
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示STZ诱导的2型糖尿病小鼠骨髓免疫微环境的细胞组成变化和细胞间通讯改变 | 首次在单细胞水平系统描绘2型糖尿病小鼠骨髓免疫微环境的转录组特征和细胞间相互作用网络 | 研究仅基于小鼠模型,样本量相对有限,需要进一步在人类样本中验证 | 阐明2型糖尿病条件下骨髓免疫微环境的特征性改变 | 野生型和STZ诱导的2型糖尿病小鼠的骨髓细胞 | 单细胞组学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序,qRT-PCR | UMAP,伪时间分析,CellphoneDB | 单细胞转录组数据 | 20,245个细胞(9,360个WT细胞 + 10,885个T2DM细胞) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 98 | 2025-11-13 |
Kushe Tincture Ameliorates DNCB-Induced Atopic Dermatitis by Affecting NF-Kb/JAK-STAT3 Pathway: Bioinformatics Analysis and Animal Experiment Verification
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S562462
PMID:41209388
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和动物实验验证苦参酊通过影响NF-κB/JAK-STAT3通路改善DNCB诱导的特应性皮炎 | 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学和动物实验系统揭示苦参酊治疗特应性皮炎的分子机制 | 研究主要聚焦于NF-κB和STAT3通路,可能忽略其他潜在作用机制 | 探索苦参酊治疗DNCB诱导的特应性皮炎的作用机制 | DNCB诱导的特应性皮炎小鼠模型 | 生物信息学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 流式细胞术, Western blotting | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 细胞图像 | DNCB诱导的AD样小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 99 | 2025-11-13 |
Retinoic Acid-Loaded Cartilage Organoids Attenuate Chondrocyte Senescence in Osteoarthritis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S545622
PMID:41209382
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研究论文 | 本研究开发了一种负载视黄酸的仿生软骨类器官系统,用于减轻骨关节炎中的软骨细胞衰老 | 结合多组学分析和机器学习识别衰老相关基因,开发新型三相GelMA/HAMA软骨类器官系统实现视黄酸时空控释 | 研究主要基于大鼠DMM模型,需要进一步临床验证 | 开发针对软骨细胞衰老的骨关节炎治疗策略 | 骨关节炎中的软骨细胞和软骨组织 | 组织工程与再生医学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析,机器学习,分子对接,分子动力学模拟 | 机器学习算法,临床预测模型 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 大鼠骨关节炎模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 100 | 2025-11-13 |
Microbial function in food fermentations: Current research and future directions
2025, Current research in microbial sciences
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.crmicr.2025.100491
PMID:41209716
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综述 | 概述食品发酵中微生物功能研究方法,涵盖传统到新兴技术,并总结该领域最新研究进展 | 强调从微生物组成研究转向功能研究的迫切性,提出稳定同位素探测和单细胞测序等新兴技术的应用前景 | 现有功能预测方法产生群体平均数据,掩盖功能异质性、稀有类群和低丰度种群中的关键贡献者 | 指导复杂发酵系统中微生物功能的针对性研究 | 食品发酵过程中的微生物群落 | 微生物组学 | NA | 扩增子测序、组学技术、稳定同位素探测、单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |