单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 39812 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-05-30 |
Biomimetic KeMA hydrogel encapsulating CAP-EVs-MEF2C for inhibiting inflammation and senescence in intervertebral disc degeneration
2026-Apr-17, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04416-z
PMID:41998644
|
研究论文 | 开发了一种仿生KeMA水凝胶，包裹MEF2C过表达巨噬细胞来源的软骨亲和肽修饰细胞外囊泡，通过调节MEF2C/P21/CDK2轴抑制椎间盘退变中的炎症和衰老 | 首次利用单细胞RNA测序鉴定MEF2C为关键调控因子，并通过仿生KeMA水凝胶包裹CAP修饰的EVs实现靶向递送和缓释，同时调节软骨终板软骨细胞炎症和髓核细胞衰老 | 未说明 | 开发一种针对椎间盘退变的新型治疗策略，通过调节MEF2C/P21/CDK2轴抑制炎症和细胞衰老 | 软骨终板软骨细胞、髓核细胞和椎间盘退变模型 | 数字病理学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 82 | 2026-04-18 |
Single-Cell Transcriptomics Identifies a Pivotal Role of SPHK1+ Macrophage-Driven Inflammation in Mechanism of Aortic Dissection and Highlights SPHK1 as a Therapeutic Target
2026-Apr-16, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-026-02505-7
PMID:41991732
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 83 | 2026-04-18 |
Exploring and experimental validation of SLC7A11 and ferroptosis related prognostic genes in non-small cell lung cancer using bulk RNA sequencing and single-cell RNA sequencing
2026-Apr-16, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-026-00786-4
PMID:41992345
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 84 | 2026-04-17 |
Single-cell transcriptomics uncovers heterogenous cell clusters and the biomarker FUT11 in ovarian cancer progression
2026-Apr-15, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-026-04299-y
PMID:41987229
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 85 | 2026-05-30 |
Hexokinase 3 promoted cytokine production of monocytes by targeting metabolic reprogramming and histone lactylation in sepsis
2026-Apr-10, Clinical epigenetics
IF:4.8Q1
DOI:10.1186/s13148-026-02129-6
PMID:41964014
|
研究论文 | 该文章研究了己糖激酶3（HK3）通过代谢重编程和组蛋白乳酸化促进脓毒症中单核细胞的细胞因子产生 | 首次发现HK3作为代谢检查点在脓毒症中通过H3K18乳酸化依赖性激活IL-6和TNF-α基因，驱动单核细胞过度炎症反应，并确定HK3为潜在的诊断标志物和治疗靶点 | 未提供具体局限性信息 | 阐明脓毒症中糖酵解相关调控基因在单核细胞免疫反应中的作用机制 | 脓毒症患者的外周血单核细胞及LPS诱导的单核细胞脓毒症模型 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序、ROC曲线分析、免疫细胞浸润分析 | NA | 基因表达数据 | 使用GEO数据库数据集，具体样本数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 86 | 2026-04-11 |
Integrating single-cell and spatial transcriptomics to reveal the spatiotemporal dynamics of retinal cells during ischemia-reperfusion injury progression in rats
2026-Apr-09, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-026-01571-6
PMID:41957682
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 87 | 2026-05-30 |
Single-cell transcriptomics reveals FXR1 as an actionable target for siRNA therapy in ovarian cancer
2026-Apr-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71468-y
PMID:41932914
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示FXR1是卵巢癌siRNA治疗的可行靶点 | 首次证明锁定核酸修饰的siRNA靶向FXR1在体内抑制肿瘤生长和转移，并利用单细胞RNA测序阐明其免疫微环境调节机制 | 未提供 | 评估FXR1作为卵巢癌RNA干扰治疗靶点的潜力及其作用机制 | 卵巢癌肿瘤组织及腹水中的肿瘤细胞、基质细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | RNA干扰、单细胞RNA测序 | 未提供 | 单细胞转录组数据 | 体内实验涉及肿瘤组织及腹水样本 | 未提供 | 单细胞RNA测序 | 未提供 | 未提供 |
| 88 | 2026-05-30 |
Current understanding and future directions in severe asthma through artificial intelligence-integrated multi-omic approaches
2026-Apr, European respiratory review : an official journal of the European Respiratory Society
IF:9.0Q1
DOI:10.1183/16000617.0040-2025
PMID:42203233
|
综述 | 探讨人工智能整合多组学方法在重症哮喘研究中的现状与未来方向 | 首次系统综述AI与多组学（基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学）结合在重症哮喘中的应用，揭示传统方法无法识别的数据模式 | 研究多停留在概念验证阶段，临床转化面临数据整合标准化、算法解释性等挑战 | 阐明AI整合多组学如何提升重症哮喘诊断精度、预测治疗效果并指导个性化治疗策略 | 重症哮喘患者的多组学数据（基因组、转录组、蛋白质组、代谢组）及单细胞RNA测序数据 | machine learning | 重症哮喘 | 多组学技术（基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学）、单细胞RNA测序 | NA | 多组学数据（基因组、转录组、蛋白质组、代谢组）、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 89 | 2026-05-30 |
Splicing variants in MYRF cause partial loss of function in the retinal pigment epithelium leading to nanophthalmos
2026-Mar-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.194681
PMID:41746734
|
研究论文 | 研究揭示了MYRF基因的剪接变异体导致视网膜色素上皮细胞部分功能丧失，从而引发纳米眼 | 首次证明MYRF基因的C末端剪接变异体（如dG-MYRF）是功能减退等位基因，并解释了为何此类变异导致孤立性纳米眼而非综合征性疾病 | 未提及 | 探究MYRF基因C末端变异导致孤立性纳米眼与完全功能丧失变异导致综合征疾病的差异机制 | MYRF基因C末端剪接变异体（dG-MYRF, p.Gly1126fs30*, c.3376-1G>A）及两个产生非功能性亚型的MYRF剪接变异体 | 分子生物学 | 纳米眼 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 人源化MYRF C末端小鼠模型（MyrfhumdG/humdG胚胎致死，MyrfhumWT/humWT存活）及KO RxCre;Myrffl/fl小鼠（E15.5和P0） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 90 | 2026-05-30 |
A single-nucleus and spatial transcriptomic atlas of poplar leaves reveals the regulation of leaf polarity and cuticle deposition
2026-Mar-20, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2026.03.015
PMID:41866110
|
研究论文 | 通过单核和空间转录组学构建杨树叶片的细胞图谱，揭示叶面极性及角质层沉积的调控机制 | 首次整合单核和空间转录组学解析杨树叶片近轴-远轴极性，发现MYC2作为角质层生物合成的关键调控因子，结合脂质合成和转运基因启动子并促进角质层增厚 | 研究主要基于杨树叶片，需验证MYC2在其他植物中的保守性及其在非生物胁迫中的具体功能 | 探究叶片近轴-远轴极性建立过程中转录组和代谢组的空间调控网络 | 杨树叶片细胞类群（叶肉细胞、表皮细胞、维管相关细胞）及其近轴-远轴亚型 | 数字病理学 | 不适用 | 单核RNA测序（snRNA-seq）、空间转录组学 | 不适用 | 基因表达数据、空间位置数据 | 杨树叶片样本 | 10x Genomics | 单核RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单核RNA测序平台, 10x Visium空间转录组平台 |
| 91 | 2026-05-30 |
Optimal transport fate mapping resolves T cell differentiation dynamics across tissues
2026-Feb-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.24.707057
PMID:42124734
|
研究论文 | 利用最优输运命运映射方法重建跨组织CD8 T细胞分化动态 | 首次将最优输运框架应用于时间序列单细胞RNA-seq数据，重建连续细胞轨迹并解析效应与记忆T细胞分化路径，实验验证了小肠中时间上不同的迁移波导致不同的组织驻留记忆T细胞命运 | 未明确说明研究局限性 | 重建免疫细胞在不同命运间转化的连续轨迹，特别是在抗病毒CD8 T细胞分化过程中的动态变化 | 急性病毒感染小鼠的CD8 T细胞 | 机器学习 | 病毒感染（急性） | 单细胞RNA-seq | 最优输运 | 基因表达数据 | 小鼠样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 纵向单细胞RNA-seq数据 |
| 92 | 2026-05-30 |
RORγt+ dendritic cells are a distinct lymphoid-derived lineage
2026-Feb-20, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aed7439
PMID:41591258
|
研究论文 | 该研究发现了小鼠中RORγt树突状细胞作为一个独立的淋巴来源谱系，其发育由特定增强子和转录因子调控，对于维持肠道免疫耐受至关重要 | 首次鉴定RORγt DC为淋巴源性的独立谱系，并揭示了其骨髓中的前体细胞（包括RILP和pre-RORγt DC前体）以及REV-ERBα/β、PRDM16和PU.1等关键调控因子 | 研究主要基于小鼠模型，结论向人类转化的可行性尚待验证 | 阐明耐受性树突状细胞谱系如何建立以防止对共生菌和食物抗原的不适当免疫反应 | 小鼠RORγt树突状细胞及其前体细胞 | 机器学习 | NA | 谱系追踪、单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠骨髓细胞和肠道样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒 |
| 93 | 2026-05-30 |
Single-cell analysis reveals that MXRA8 affected the progression of breast cancer via regulating ferroptosis
2026-Feb-02, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-026-04175-9
PMID:41629963
|
研究论文 | 通过单细胞RNA-seq数据重分析，发现MXRA8通过调控铁死亡影响乳腺癌进展 | 首次在单细胞水平揭示铁死亡相关肿瘤亚群在乳腺癌进展和肿瘤免疫中的关键作用，并鉴定MXRA8为调控铁死亡的关键基因 | 基于公开数据集的再分析，缺乏大规模临床样本验证，MXRA8调控铁死亡的具体分子机制有待进一步阐明 | 探究乳腺癌细胞对铁死亡的异质性反应及其调控机制，寻找新的生物标志物和治疗靶点 | 26例乳腺癌患者的单细胞RNA-seq数据和体外实验中的乳腺癌细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NMF算法 | 基因表达数据 | 26名乳腺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 94 | 2026-05-30 |
Modeling cell-cell interactions to advance drug discovery in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2026-Feb-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.29.702646
PMID:41676623
|
研究论文 | 利用支架共培养类器官模型研究特发性肺纤维化中细胞间相互作用，并评估抗纤维化药物疗效 | 开发了一种基于支架的人源共培养肺泡类器官模型，结合IPF患者原代成纤维细胞和携带SFTPC 173T突变的多能干细胞衍生肺泡2型细胞，模拟疾病进展中的上皮-间质细胞通讯 | 模型可能无法完全复制体内复杂微环境，体外结果向临床转化存在局限 | 建立更贴近患者病情的模型以研究IPF发病机制和抗纤维化药物 | 人类原代肺成纤维细胞（健康与IPF）、多能干细胞来源的肺泡2型细胞（iAT2）；包含SFTPC 173T突变及其同基因校正对照 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | 类器官模型、共培养系统 | 单细胞转录组数据 | 未明确样本量，涉及多能干细胞系和原代成纤维细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | NA |
| 95 | 2026-05-30 |
Müller cell glutamine metabolism links photoreceptor and endothelial injury in diabetic retinopathy
2026-02, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202503434
PMID:41266111
|
研究论文 | 本研究通过分析糖尿病小鼠视网膜在6个月内的分子变化，发现穆勒细胞谷氨酰胺代谢异常连接了光感受器和内皮细胞损伤，是糖尿病视网膜病变早期发病的关键 | 首次揭示穆勒细胞谷氨酰胺驱动的厌氧代谢功能障碍在糖尿病视网膜病变早期阶段连接光感受器和内皮细胞损伤的机制 | 未提及明显的局限性 | 阐明糖尿病视网膜病变和糖尿病视网膜疾病中分子功能障碍的时间线 | 链脲佐菌素诱导的糖尿病小鼠视网膜、小鼠和人类视网膜组织 | 机器学习 | 糖尿病视网膜病变 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠视网膜样本，分别在糖尿病诱导后1、3、6个月采集，及3个月时进行单细胞RNA测序 | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 96 | 2026-05-30 |
The unfolded protein response in progeria arteries originates from non-endothelial cell types
2026-02, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202503485
PMID:41326174
|
研究论文 | 在早衰症动脉中，未折叠蛋白反应起源于非内皮细胞类型 | 首次通过内皮特异性HGPS小鼠模型，证明早衰症动脉中未折叠蛋白反应主要源于非内皮细胞，挑战了之前关于内皮细胞功能障碍的观点 | 未提及具体局限性 | 研究Hutchinson-Gilford早衰综合征中蛋白质稳态失衡对内皮细胞功能障碍的影响 | Hutchinson-Gilford早衰综合征小鼠模型的内皮细胞和主动脉组织 | 生物医学研究 | 早衰症 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 早衰症小鼠主动脉组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序分析主动脉组织 |
| 97 | 2026-05-30 |
Characterising the Periodontal Granulation Tissue Using scRNAseq
2026-02, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.70048
PMID:41055332
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序表征牙周肉芽组织的细胞组成和分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序发现牙周肉芽组织中特有的NOTCH3阳性内皮细胞亚群，并揭示了其与骨化通路的关系；肉芽组织成纤维细胞呈现类似肿瘤相关成纤维细胞的前体状态 | 样本量较小（n=3），缺乏功能验证实验 | 揭示牙周肉芽组织形成的细胞组成和分子机制，寻找再生治疗的潜在靶点 | 牙周手术患者的肉芽组织样本 | 单细胞组学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3例患者的牙周肉芽组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 98 | 2026-05-30 |
Periodontitis Induces Arterial Microbiota Shifts and Immune Dysregulation Contributing to Peripheral Vascular Inflammation
2026-02, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.70055
PMID:41117288
|
研究论文 | 探究牙周炎诱导的股动脉微生物群变化及其对免疫系统的影响，阐明牙周炎与外周动脉疾病之间关联的机制 | 首次揭示牙周炎通过改变动脉微生物群和免疫失调，特别是FABP4+内皮细胞在牙周炎与外周动脉疾病联系中的关键介导作用 | 仅使用小鼠模型，未在人体中验证结果；未详细探讨微生物群变化与免疫失调之间的直接因果关系 | 阐明牙周炎诱导外周血管炎症的机制，特别是动脉微生物群和免疫系统的变化 | 牙周炎模型小鼠的股动脉组织 | 机器学习 | 牙周炎，外周动脉疾病 | 2bRAD-M测序, 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | 未明确提及样本数量 | Illumina | 2bRAD-M微生物组测序, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | 2bRAD-M用于微生物组分析，单细胞RNA-seq用于免疫微环境表征 |
| 99 | 2026-05-30 |
Neoadjuvant modified FOLFIRINOX plus nivolumab in borderline-resectable pancreatic ductal adenocarcinoma: a pilot phase 1 trial
2026-01-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68976-2
PMID:41620440
|
研究论文 | 一项评估新辅助modified FOLFIRINOX联合nivolumab治疗交界可切除胰腺导管腺癌的1期临床试验 | 首次在交界可切除胰腺导管腺癌中评估新辅助化疗联合免疫检查点抑制剂的安全性和病理反应率，并利用空间转录组学揭示免疫微环境变化 | 单臂设计、样本量小（28例）、缺乏随机对照，且后续分析为探索性 | 评估新辅助modified FOLFIRINOX联合nivolumab在交界可切除胰腺导管腺癌患者中的安全性和疗效 | 28例交界可切除胰腺导管腺癌患者 | 数字病理学 | 胰腺导管腺癌 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据、免疫组化图像、空间转录组数据 | 28例患者（22例行手术） | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学用于分析肿瘤免疫微环境 |
| 100 | 2026-05-30 |
Thymic myeloid cells are heterogenous and include a novel population of transitional dendritic cells
2026-Jan-05, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20250733
PMID:41123595
|
研究论文 | 利用单细胞转录组学和谱系定义小鼠模型，发现胸腺髓系细胞具有异质性，并鉴定出一种新的过渡性树突状细胞群体 | 首次揭示传统认为的DC2细胞实际上由四个不同细胞谱系组成，并发现一种新型CX3CR1+过渡性树突状细胞 | 未明确指出，但可能涉及小鼠模型与人类的差异性及功能验证的局限性 | 探究胸腺髓系细胞的异质性、起源、发育和稳态维持机制 | 胸腺髓系细胞，包括树突状细胞和巨噬细胞 | 机器学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |