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当前共找到 39154 篇文献,本页显示第 81 - 100 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
81 2026-05-06
SCSEQ: A web tool for analyzing single-cell RNA-seq data
2026-Jan-21, GigaScience IF:11.8Q1
研究论文 开发了一个名为SCSEQ的交互式网络生物信息学分析平台,用于处理和分析单细胞RNA测序数据,即使没有编程经验的用户也能方便使用 SCSEQ提供了一个全面的工作流,涵盖数据预处理、标准化、聚类、降维、差异表达分析、细胞类型鉴定及下游分析(如基因富集分析、转录因子分析、细胞间通讯分析、拷贝数变异检测、轨迹推断和泛癌分析),并支持不同工作流之间的信息传递、多种输入格式以及图形和表格输出,通过详细参数设置和动态交互增强用户体验 未提及具体的局限性 为单细胞RNA测序数据分析提供一个用户友好的网络平台,使无编程背景的研究者也能有效处理复杂数据 单细胞RNA测序数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
82 2026-05-06
DeepSpaceDB: a spatial transcriptomics atlas for interactive in-depth analysis of tissues and tissue microenvironments
2026-Jan-06, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 介绍DeepSpaceDB——一个用于交互式深度分析组织及组织微环境的空间转录组图谱数据库 该数据库专注于10X Genomics Visium样本,提供高级交互式分析工具与跨样本比较功能,区别于仅注重平台覆盖而忽视功能的数据库 当前版本仅支持10X Genomics Visium样本,且分析需依赖用户上传或已有的数据集 构建一个用户友好的空间转录组数据库,支持灵活探索、交互式比较及高级分析 健康及疾病状态下的组织样本,如阿尔茨海默病模型小鼠的海马区域 数字病理学 阿尔茨海默病 空间转录组学 NA 基因表达数据 未明确说明具体数量,但包含多个组织和疾病模型的样本 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium FFPE或新鲜冰冻组织分析
83 2026-05-06
Antibody Generation Using Cancer-Derived Small Extracellular Vesicles (sEVs): A Platform for Targeted Cancer Therapy and Potential Personalized Applications
2026-Jan, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
研究论文 利用癌症来源的小细胞外囊泡生成靶向单克隆抗体,并将其功能化于T细胞来源的小细胞外囊泡上,用于靶向癌症治疗 首次利用癌症来源的小细胞外囊泡作为免疫原,生成高特异性或细胞毒性单克隆抗体,并通过抗体功能化T细胞来源的小细胞外囊泡实现肿瘤靶向药物递送 未提及研究的局限性,如样本类型单一(仅卵巢癌细胞系)或临床转化潜力的评估不足 开发一种基于癌症来源小细胞外囊泡的抗体生成平台,用于靶向癌症治疗和个性化医学 人卵巢癌细胞系OVCAR-8来源的小细胞外囊泡及CD8⁺ T细胞来源的小细胞外囊泡 数字病理学 卵巢癌 RNA测序, 空间转录组学 NA 转录数据, 空间转录数据 小鼠模型(具体数量未提及),OVCAR-8肿瘤样本 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium 空间转录组学平台用于分析抗体功能化小细胞外囊泡诱导的转录变化
84 2026-05-06
DrugSurvPlot: A Novel Web-Based Platform Harnessing Drug Sensitivity Scores as Molecular Biomarkers for Pan-Cancer Survival Prognosis
2026, Current gene therapy IF:3.8Q2
研究论文 介绍DrugSurvPlot,一种利用药物敏感性评分作为泛癌症生存预后分子生物标志物的新型网络平台 建立药物敏感性评分作为肿瘤生存分析的新型预后生物标志物,整合大规模多癌种数据集并提供无需登录的交互式分析工具 药物覆盖范围有限,数据集多样性不足,未来需扩展药理学数据库并整合新兴数据模态(如单细胞转录组学) 利用预测药物敏感性评分作为生存生物标志物,提高精准医学水平并克服基因组指导方法在临床试验中的局限性 189个GEO数据集(含10个免疫检查点抑制剂治疗数据集)和33个TCGA数据集,共85,531条记录,覆盖52种癌症类型和13种生存状态数据类型,以及GDSC2中的198种抗癌药物 计算肿瘤学 泛癌症 NA NA 药物敏感性评分数据 85,531条记录,涵盖189个GEO数据集和33个TCGA数据集 NA NA NA NA
85 2026-05-06
Screening macrophage polarization genes in spinal cord injury as therapeutic targets
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 筛选脊髓损伤中巨噬细胞极化相关基因作为治疗靶点 首次鉴定Soat1、Comt和Myo1f为脊髓损伤相关的巨噬细胞极化关键基因,并通过多组学分析揭示其作为诊断和治疗靶点的潜力 未提及具体局限性 探索巨噬细胞极化相关基因在脊髓损伤诊断、预后和治疗中的潜在作用 脊髓损伤样本和对照样本中的巨噬细胞极化相关基因 机器学习 脊髓损伤 RNA-seq, 单细胞RNA测序, RT-qPCR LASSO, 随机森林, XGBoost 基因表达数据, 单细胞转录组数据 未明确提及样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
86 2026-05-06
Tumor-Promoting Crosstalk of MMP11⁺ Fibroblasts and SPP1⁺ Macrophages Drive Poor Prognosis in Breast Cancer: Integrated Multi-Omics Analysis
2026, ImmunoTargets and therapy IF:6.2Q1
研究论文 通过多组学分析揭示了MMP11阳性的癌症相关成纤维细胞与SPP1阳性巨噬细胞之间的相互作用对乳腺癌预后不良的驱动作用 首次发现MMP11+ CAFs和SPP1+巨噬细胞的相互作用与乳腺癌患者不良预后及免疫治疗反应受损相关 仅基于公共数据库和有限样本分析,需更多临床样本验证,且机制研究缺乏直接功能实验 探索乳腺癌肿瘤微环境中基质-免疫相互作用及其对预后的影响 乳腺癌肿瘤微环境中的MMP11+成纤维细胞和SPP1+巨噬细胞 数字病理学 乳腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA RNA测序数据 NA NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
87 2026-05-06
Integrative single-cell and spatial transcriptome analysis reveals the functions of TREM2high macrophages and infarct border dynamics post-myocardial infarction
2025-Dec, Molecular and cellular biochemistry IF:3.5Q3
研究论文 结合单细胞RNA测序和空间转录组学,研究心肌梗死后TREM2高表达巨噬细胞的功能和梗死边界动态 首次整合单细胞和空间转录组分析,揭示了TREM2高表达巨噬细胞在心肌梗死后组织修复中的关键作用及其在梗死边界的动态变化 未提供 探究心肌梗死后细胞和分子水平的复杂动态变化,特别是免疫细胞的作用和调控网络 心肌梗死小鼠模型和缺血再灌注模型中的心肌细胞和免疫细胞 NA 心血管疾病 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序、RT-qPCR、Western blot、免疫组织化学、免疫荧光 NA 转录组数据 未提供样本数量 Illumina 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序 10x Genomics 10x Genomics 单细胞RNA测序和空间转录组学平台
88 2026-05-06
Pan-cancer multi-omics profiling of MS4A2 unveils its functional landscape in lung adenocarcinoma
2025-Nov-01, International journal of surgery (London, England)
研究论文 通过多组学泛癌分析揭示MS4A2在肺腺癌中的功能景观,并将其重新定义为肥大细胞驱动的肿瘤进展守护者 首次整合四个生存指标(OS/DSS/PFI/DFI)的预后评估,并发现MS4A2通过双向趋化因子调控建立免疫抑制微环境,同时高表达肿瘤对化疗药物敏感 未在独立外部队列中验证其预后模型的泛化性,且MS4A2调控免疫微环境的具体分子机制仍需进一步实验验证 阐明MS4A2在肺腺癌中的预后价值及其作为治疗靶点的潜力 33种癌症类型的转录组数据(TCGA/GTEx)和非小细胞肺癌单细胞转录组数据 机器学习 肺腺癌 转录组测序,单细胞转录组测序 Cox回归,Kaplan-Meier模型 基因表达数据,单细胞转录组数据,药物敏感性数据 33种癌症的bulk RNA-seq样本和NSCLC单细胞测序队列 NA bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq NA TCGA/GTEx数据库和GDSC药物基因组学数据
89 2026-05-06
Nonhuman Primate Model of Super-selective Intra-arterial Ophthalmic Arterial Interventional Thrombolysis for Treatment of Ophthalmic Arterial Embolism Resulting From Hyaluronic Acid Filler Cosmetic Injection
2025-10-16, Aesthetic surgery journal IF:3.0Q1
研究论文 建立非人灵长类动物模型,评估超选择性眼动脉介入溶栓治疗透明质酸填充剂注射所致眼动脉栓塞的疗效 首次在非人灵长类动物模型中模拟临床眼动脉缺血再灌注,并验证超选择性眼动脉介入溶栓治疗在一定时间窗内能有效改善视觉功能 模型中仍观察到部分视觉功能损伤,且单细胞测序显示栓塞时间长会导致视紫红质细胞因子表达下降 证明超选择性眼动脉介入溶栓治疗在特定时间窗内能有效改善透明质酸栓塞导致的视觉功能损伤,并提出一个临床相关的视网膜缺血再灌注模型 猕猴(恒河猴) 数字病理学 心血管疾病 介入溶栓,单细胞RNA测序,数字减影血管造影,眼底荧光血管造影,视网膜电图,苏木精-伊红染色,透射电子显微镜 NA 图像,文本,基因表达数据 猕猴样本(具体数量未在摘要中说明) 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序用于检测视网膜细胞变化
90 2026-05-06
IFN-I-Mediated Transcriptional Reprogramming Drives Myeloid-skewed Hematopoiesis in Sickle Cell Anemia
2025-Oct-07, Research square
研究论文 通过单细胞RNA测序和功能实验,揭示了镰状细胞贫血中I型干扰素介导的转录重编程驱动骨髓偏斜造血的内在机制 首次阐明I型干扰素信号异常激活是镰状细胞贫血中造血干细胞向髓系分化的关键驱动因素,并发现SCA祖细胞通过上调CSF3R对G-CSF产生意外反应,导致单核细胞系偏向性造血 NA 探索镰状细胞贫血中粒细胞和单核细胞持续升高的内在机制 镰状细胞贫血患者的造血干细胞和多能祖细胞(HSPCs) 自然语言处理 镰状细胞贫血 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
91 2026-05-06
Decoding the association between mucosal-associated invariant T cells and prostate cancer via multi-omics analysis
2025-Oct-03, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 通过多组学分析揭示黏膜相关恒定T细胞与前列腺癌的关联 结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析,首次揭示MAIT细胞在前列腺癌中的潜在因果作用并发现关键调控基因ZFP36L2 NA 探究MAIT细胞与前列腺癌易感性的关联并识别潜在调控基因 前列腺癌样本和癌旁正常样本 NA 前列腺癌 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, 实时定量PCR, 蛋白质印迹, 免疫组织化学 NA 基因表达数据 4个前列腺癌样本和4个癌旁正常样本,共计13139个细胞 NA 单细胞RNA测序 NA 基于液滴的单细胞RNA测序
92 2026-05-06
TMEM258 modulates immune infiltration networks underlying co-susceptibility to Crohn disease and acute pancreatitis
2025-Oct-03, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 通过孟德尔随机化和多组学分析,发现TMEM258是克罗恩病和急性胰腺炎的共同易感基因,并调节免疫浸润网络 首次利用孟德尔随机化结合多组学数据(eQTL、bulk和单细胞RNA测序)揭示TMEM258作为CD和AP共病的共享遗传因子,并阐明其通过调控T细胞浸润影响疾病风险的机制 样本量较小(23例共病患者),且基于小鼠模型验证,需进一步在更大队列和功能实验中验证 探究克罗恩病与急性胰腺炎共病的遗传机制和免疫调节网络 克罗恩病和急性胰腺炎患者,以及DSS诱导的急性结肠炎小鼠模型 machine learning 克罗恩病, 急性胰腺炎 孟德尔随机化, 表达数量性状位点分析, 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, RT-PCR NA 基因表达数据, 临床数据, 免疫细胞数据 23名CD患者,31864名个体的血液样本(来自37个队列的5421个顺式eQTL基因) NA 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 NA NA
93 2026-05-06
Lymphatic dysfunction is linked to disease pathogenesis in Duchenne muscular dystrophy animal models
2025-Sep-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究揭示了Duchenne肌营养不良动物模型中淋巴功能障碍与疾病发病机制的相关性 首次在DMD动物模型中证明淋巴系统功能失调与疾病进展相关,并发现抗肌萎缩蛋白在淋巴肌细胞中表达,且微抗肌萎缩蛋白基因治疗可改善炎症性淋巴管新生 未提及具体局限性 探究DMD动物骨骼肌中淋巴系统是否失调及其在疾病中的作用 Duchenne肌营养不良小鼠模型、金毛犬模型以及小鼠和大鼠淋巴肌细胞(LMCs) 数字病理学 肌营养不良症 单细胞RNA测序、微量淋巴造影术、磁共振淋巴管成像、基因表达谱分析、免疫荧光分析 NA 基因表达数据、影像数据 小鼠模型(D2.mdx)、金毛犬模型(GRMD)及体外细胞样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序用于控制组LMCs的scRNA-seq
94 2026-05-06
From preneoplastic lesion to heterogenous tumor: recent insights into hepatoblastoma biology and therapeutic opportunities
2025-Jul-19, Molecular cancer IF:27.7Q1
综述 综述了肝母细胞瘤从癌前病变到异质性肿瘤的最新生物学见解和治疗机会 通过单细胞RNA测序、多组学、空间转录组学和功能基因组学筛选,揭示了肝母细胞瘤的复杂异质性,包括不同细胞亚群、WNT信号传导、发育通路以及肿瘤与免疫微环境的相互作用 未明确提及局限性 总结肝母细胞瘤的生物学新发现,推动治疗进展 肝母细胞瘤肿瘤细胞、肿瘤相关细胞类型及遗传依赖性 数字病理学 儿科肝癌 单细胞RNA-seq, 多组学, 空间转录组学, 功能基因组学筛选 NA 转录组数据, 空间数据, 多组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
95 2026-05-06
Hair Bundle Degeneration is a Key Contributor to Age-Related Vestibular Dysfunction
2025-Jul-03, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 利用单细胞RNA测序研究衰老小鼠前庭毛细胞,揭示纤毛束退化和机械传导障碍是年龄相关性前庭功能障碍的关键因素 首次通过单细胞转录组分析揭示前庭毛细胞在衰老过程中的细胞类型特异性变化,特别是纤毛束退化和机械传导障碍先于毛细胞丢失,并比较了前庭与耳蜗毛细胞衰老特征的差异 仅基于小鼠模型,人类前庭衰老机制有待验证;未深入探讨导致纤毛束退化的上游分子调控网络 阐明年龄相关性前庭功能障碍的分子机制,特别是毛细胞退化的关键驱动因素 年轻和衰老小鼠的前庭毛细胞 数字病理学 老年病 单细胞RNA测序,电生理记录,成像 NA 基因表达数据,图像,电生理数据 年轻和老年小鼠的前庭毛细胞样本 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
96 2026-05-06
The foraging gene coordinates brain and heart networks to modulate socially cued interval timing in Drosophila
2025-Jul, PLoS genetics IF:4.0Q1
研究论文 本文探讨了 foraging 基因 (for) 如何通过协调大脑和心脏网络来调节果蝇的社会性间隔定时行为 首次揭示 foraging 基因通过神经和非神经机制(心脏肽能信号和钙动力学)整合社会线索调节间隔定时行为,并发现 forR 和 forS 两种等位变体的复杂相互作用 未提供 探究 foraging 基因在果蝇间隔定时行为,特别是交配持续时间中的调控作用及其神经和非神经机制 果蝇 (Drosophila melanogaster) 的两种等位变体(forR 和 forS)及其转杂合子 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序, 敲低实验, CaLexA信号成像 NA 基因表达数据, 行为数据, 钙成像数据 未详细说明样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA 未提供具体平台配置
97 2026-05-06
Transcriptomic profiling after B cell depletion reveals central and peripheral immune cell changes in multiple sclerosis
2025-Jun-02, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示B细胞耗竭治疗多发性硬化症后中枢和外周免疫细胞的变化 首次使用单细胞RNA-Seq全面描绘B细胞耗竭治疗对多发性硬化症患者免疫景观的影响,发现细胞类型特异性的转录组变化 未提及 探索B细胞耗竭疗法如何调节多发性硬化症患者的免疫景观 多发性硬化症患者的脑脊液巨噬细胞和外周血单核细胞 数字病理学 多发性硬化症 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未提及具体样本量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
98 2026-05-06
Selective GSK3α Inhibition Promotes Self-Renewal Across Different Stem Cell States
2025-May-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 选择性抑制GSK3α可促进不同干细胞状态的自我更新,并建立一种基于BRD0705/IWR1的通用培养系统 发现选择性抑制GSK3α(而非泛抑制GSK3α/β)能独立于β-catenin信号促进多种干细胞(ESC、EpiSC、NSC)的长期自我更新;联合IWR1构建的BRD0705/IWR1培养体系可维持多种多能干细胞状态并支持共培养 未提及具体限制 研究选择性GSK3α抑制对干细胞自我更新的调控作用,并开发一种能维持不同干细胞状态的培养系统 小鼠胚胎干细胞(ESC)、上胚层干细胞(EpiSC)、神经干细胞(NSC)及形成性多能干细胞 机器学习 NA 单细胞转录组测序、表观基因组分析、功能分析 NA 转录组数据、表观基因组数据 多种小鼠干细胞系(具体数量未提及) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
99 2026-05-06
High-dimensional profiling of immune responses to kidney transplant reveals heterogeneous T helper 1 and B cell effectors associated with rejection
2025-Apr, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons IF:8.9Q1
研究论文 通过对肾移植后免疫应答进行高维分析,揭示了与排斥反应相关的异质性T辅助1细胞和B细胞效应器 首次在单细胞分辨率下系统描绘了肾移植排斥反应中不同内型涉及的免疫亚群多样性,并整合了表型、转录和克隆状态分析 信息未提供 探究肾移植后免疫排斥反应的机制,区分不同排斥反应内型中的免疫亚群特征 76名肾移植患者的血液CD4 T细胞和B细胞 数字病理学 肾脏疾病 单细胞RNA测序,T/B细胞受体测序,血浆细胞因子谱分析,批量RNA测序 NA 测序数据,细胞因子表达数据 76名肾移植受者 NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
100 2026-05-06
Graft-derived extracellular vesicles transport miRNAs to modulate macrophage polarization after heart transplantation
2025-Apr, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons IF:8.9Q1
研究论文 本研究利用小鼠心脏移植模型和单细胞RNA测序,揭示移植物来源的细胞外囊泡通过携带miRNA调节巨噬细胞极化,影响心脏移植后免疫排斥反应 首次发现移植物CD63阳性巨噬细胞来源的细胞外囊泡携带microRNA-363和microRNA-709,通过Fcho2/Notch1信号通路诱导受体脾脏M1型巨噬细胞极化,揭示了器官间免疫通讯的新机制 基于小鼠模型,结论在人体的适用性需进一步验证;未详细说明EV分离和表征的具体方法;未探讨其他可能参与的免疫细胞类型 探究心脏移植后移植物与受体脾脏之间免疫细胞相互作用的动态机制 小鼠心脏移植模型中的CD45免疫细胞,包括移植心脏和脾脏中的单核细胞/巨噬细胞亚群 机器学习 心血管疾病 单细胞RNA测序 非监督聚类 单细胞转录组数据 小鼠异位移植模型,具体样本量未在摘要中说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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