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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
81 2026-04-21
Single-Cell Profiling Reveals RAB13+ Endothelial Cells and Profibrotic Mesenchymal Cells in Aged Human Bone Marrow
2026-Apr, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了人类骨髓中内皮细胞和间充质基质细胞在衰老过程中的转录变化,识别了RAB13+内皮细胞和促纤维化间充质细胞等新型细胞亚群 首次在衰老个体中识别出表达RAB13的新型动脉内皮细胞亚群,并揭示了THY1促纤维化间充质细胞在衰老相关基质重塑中的作用 研究主要基于转录组数据,功能验证和机制探索有待进一步深入 探究人类骨髓微环境在衰老过程中的分子和细胞变化 人类骨髓中的内皮细胞和间充质基质细胞 单细胞组学 衰老相关疾病 单细胞RNA测序, 免疫荧光成像, 空间转录组学 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 来自年轻和年老个体的骨髓样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
82 2026-04-21
High ALG1 Expression Is Correlated With Poor Prognosis and the Immune Microenvironment in Glioma
2026-Apr, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 本研究探讨了ALG1在胶质瘤中的表达及其临床意义,发现ALG1高表达与不良预后和免疫微环境相关 首次通过单细胞RNA测序分析ALG1在细胞状态转换中的作用,并构建了基于ALG1水平的预后列线图 研究主要基于生物信息学分析和体外/体内实验,临床样本验证有限 研究ALG1在胶质瘤中的表达、预后价值及其与免疫微环境的关联 胶质瘤患者数据(TCGA、CGGA数据库)和临床样本,以及小鼠模型 生物信息学 胶质瘤 RT-qPCR, Western blotting, 免疫组织化学/荧光, 单细胞RNA测序, siRNA敲低, 伤口愈合实验 NA 基因表达数据, 临床数据, 图像数据 TCGA和CGGA数据库中的胶质瘤患者数据,以及未指定数量的临床样本和小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
83 2026-04-21
Comparative transcriptomics reveals differences in cortical cell type organization between metatherian and eutherian mammals
2026-Apr, PNAS nexus IF:2.2Q1
研究论文 本研究通过比较转录组学分析,揭示了有袋类与真兽类哺乳动物在皮层细胞类型组织上的差异 首次在哺乳动物早期分化物种间比较皮层柱的细胞类型特异性组织,结合单核RNA测序和空间转录组学技术 研究仅关注初级视觉皮层(V1),可能无法完全代表整个新皮层的组织差异 比较有袋类和真兽类哺乳动物在皮层细胞类型组织和层状结构上的差异 有袋类和真兽类哺乳动物的初级视觉皮层(V1) 转录组学 NA 单核RNA测序, 空间转录组学 NA RNA测序数据, 空间转录组数据 NA NA 单核RNA测序, 空间转录组学 NA NA
84 2026-04-21
Spatial and single-cell RNA sequencing reveals the immune microenvironment of human ascending thoracic aortic aneurysms
2026-Apr, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本研究结合单细胞RNA测序和空间转录组学,首次构建了人升主动脉瘤的高分辨率免疫细胞图谱,揭示了其免疫微环境特征 首次将单细胞RNA测序与Visium HD空间转录组学结合,在近单细胞分辨率下解析了人升主动脉瘤的免疫细胞组成、空间定位和功能多样性,并识别了干扰素、AP1和NF-κB通路作为潜在治疗靶点 样本量相对有限(8例患者和9例对照),且部分对照数据来自公共数据库,可能影响结果的普适性 构建人升主动脉瘤的高分辨率免疫细胞图谱,并探索其免疫介导的血管重塑机制 人升主动脉瘤患者的主动脉组织(ATAA组)和对照组的主动脉组织 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间转录组学 细胞分割算法,CellChat分析 单细胞转录组数据,空间转录组数据 8例ATAA患者和9例对照(其中6例来自GEO数据库) 10x Genomics 单细胞RNA-seq,空间转录组学 10x Chromium,10x Visium Visium高清晰度空间转录组分析(Visium HD)
85 2026-04-21
Re-analysis of single-cell transcriptomics reveals a critical role of TNS1 gene in driving contractile VSMC transdifferentiation into macrophage-like SMC and atherosclerotic plaque instability
2026-Apr, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本研究通过重新分析单细胞转录组数据,揭示了TNS1基因在驱动收缩型血管平滑肌细胞向巨噬细胞样平滑肌细胞转分化及促进动脉粥样硬化斑块不稳定性中的关键作用 首次通过单细胞转录组数据再分析,结合高维加权基因共表达网络分析,识别出巨噬细胞样平滑肌细胞是斑块不稳定性的关键亚型,并发现TNS1基因在这一过程中的核心调控作用 研究主要基于已发表的单细胞转录组数据集,可能受限于原始数据的质量和样本量;体内实验仅在ApoE-/-小鼠模型中进行,需进一步验证其在人类中的普适性 探究血管平滑肌细胞表型转换在动脉粥样硬化斑块不稳定性中的作用机制 血管平滑肌细胞、动脉粥样硬化斑块、TNS1基因 单细胞转录组学 心血管疾病 单细胞RNA测序、单样本基因集富集分析、高维加权基因共表达网络分析、细胞通讯分析 NA 转录组数据、单细胞RNA测序数据 两个单细胞转录组数据集(GSE155513和GSE253903)及三个不稳定斑块转录组数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
86 2026-04-21
A uniquely leptin sensitive hypothalamic neuron population limits hyperphagia and weight gain in diet-induced obesity
2026-Mar-29, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过结合空间转录组学和单核RNA测序技术,在小鼠饮食诱导肥胖模型中鉴定出一个独特的、对瘦素保持敏感的下丘脑神经元亚群,该亚群通过限制摄食行为来调控体重增加 首次在肥胖状态下,识别出一个通过共表达GLP-1受体而保持瘦素敏感性的特定下丘脑神经元亚群,并揭示了其在抑制过度摄食和体重增加中的关键作用 研究基于小鼠模型,其在人类中的直接相关性尚需验证;研究聚焦于特定神经元亚群,其他可能参与瘦素信号通路的细胞类型未被全面探讨 探究在肥胖状态下,哪些神经基质仍保持对瘦素的敏感性并介导其对摄食行为的抑制作用 饮食诱导肥胖(DIO)小鼠模型中的下丘脑神经元 神经科学,代谢研究 肥胖症 空间转录组学,单核RNA测序 NA 空间转录组数据,单核RNA测序数据 NA NA 空间转录组学,单核RNA测序 NA NA
87 2026-04-21
Same-Slide Spatial Multi-Omics Integration with IN-DEPTH Reveals Tumor Virus-Linked Spatial Reorganization of the Tumor Microenvironment
2026-Mar-24, Cancer discovery IF:29.7Q1
研究论文 本文介绍了一种名为IN-DEPTH的新型空间多组学整合工作流程,结合SGCC分析方法,用于揭示弥漫性大B细胞淋巴瘤中EBV相关的肿瘤微环境空间重组 开发了IN-DEPTH工作流程,实现同一切片上的空间蛋白质组学和转录组学整合,避免了RNA信号损失,并创建了SGCC框架来解析细胞群体间的空间协调功能状态变化 NA 开发并应用空间多组学技术来研究肿瘤微环境的空间组织和功能机制 弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)组织样本,包括EBV阳性和EBV阴性肿瘤 数字病理学 淋巴瘤 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 单细胞空间蛋白质组学成像 NA 图像, 转录组数据, 蛋白质组数据 NA NA 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 单细胞多组学 NA NA
88 2026-04-21
Single cell RNA analysis of murine osteosarcoma uncovers Skp2 function in metastasis, genomic instability and immune activation and reveals additional target pathway
2026-Mar-24, Cancer research communications IF:2.0Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析小鼠骨肉瘤,揭示了Skp2在转移、基因组不稳定性和免疫激活中的功能,并发现了额外的靶向通路 首次在免疫活性小鼠骨肉瘤模型中应用单细胞RNA测序,系统揭示了Skp2缺失如何影响肿瘤异质性、微环境复杂性、T细胞耗竭、干扰素信号传导以及转移相关基因表达,同时识别了肿瘤逃逸Skp2靶向的潜在机制 研究基于小鼠模型,可能不完全反映人类骨肉瘤的复杂性;单细胞测序数据虽全面,但功能验证仍需进一步实验支持 探究骨肉瘤中Skp2的功能及其在肿瘤进展、转移和免疫调节中的作用,以识别新的治疗靶点 小鼠骨肉瘤模型(Osx-Cre条件性Rb1/Trp53敲除小鼠)及其Skp2敲除或Skp2-p27相互作用破坏的变体 数字病理学 骨肉瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq),蛋白质组学分析 NA 单细胞RNA测序数据,蛋白质组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
89 2026-04-21
Integrated single-cell and spatial mapping coupled with machine learning unveils core stemness landscapes and regulatory drivers in triple-negative breast cancer
2026-Mar-23, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量转录组数据,结合机器学习方法,揭示了三阴性乳腺癌中的核心干性景观和调控驱动因子 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学和机器学习算法(如XGBoost)来识别三阴性乳腺癌中的高干性细胞群体,并构建了基于五个核心基因的预测模型,同时通过虚拟敲除实验验证了核心基因在维持干性中的作用 研究主要基于计算分析和体外实验验证,缺乏体内实验或临床样本的直接功能验证,且样本量可能有限 阐明三阴性乳腺癌中癌症干细胞相关的干性特征与肿瘤进展之间的分子调控机制 三阴性乳腺癌细胞,特别是高干性细胞亚群 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量转录组测序 XGBoost, hdWGCNA, Monocle3, scTour, CellChat, SHAP 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,批量转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
90 2026-04-21
Spatial Distribution of K13-Positive Airway Epithelial Cells in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2026-Mar-23, Biomedicines IF:3.9Q1
研究论文 本研究探讨了K13阳性气道上皮细胞在特发性肺纤维化(IPF)中的空间分布及其在疾病进展中的作用 首次揭示了K13阳性hillock细胞在IPF远端气道中异常激活并驱动近端化表型转变,通过单细胞分析鉴定了相关的促纤维化亚群和信号通路 研究主要基于组织样本的空间分析和单细胞数据重分析,缺乏直接的体内功能验证实验 阐明特发性肺纤维化(IPF)中远端气道重塑的细胞机制,特别是上皮干细胞的作用 IPF患者和对照组的肺组织样本,重点关注K13阳性气道上皮细胞 数字病理学 特发性肺纤维化 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间免疫荧光,多重染色,体外培养实验 CellChat(用于细胞间通讯推断) 空间成像数据,单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量,涉及IPF和对照肺组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
91 2026-04-21
RBX1+ CAFs Drives Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Progression Through Tenascin C Overexpression
2026-Mar-22, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 本研究揭示了RBX1+癌症相关成纤维细胞通过上调Tenascin C表达驱动胰腺导管腺癌进展的机制 首次在单细胞水平上鉴定出RBX1在CAF亚群中的特异性表达,并阐明其通过调控Tenascin C促进PDAC进展的新机制 研究样本主要来自单一医疗中心,缺乏多中心验证;体内实验仅使用异种移植模型,未涉及基因工程小鼠模型 探究E3泛素连接酶在胰腺癌基质成纤维细胞中的作用及其对肿瘤进展的影响 胰腺导管腺癌组织样本、癌症相关成纤维细胞、PAAD细胞系 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序、RT-PCR、Western blotting、假时间分析、细胞通讯分析 NA 单细胞转录组数据、基因表达数据、蛋白质数据 来自哈尔滨医科大学第一附属医院的胰腺组织样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
92 2026-04-21
Modern Pathology-Driven Strategies in Neoadjuvant Immunotherapy for Head and Neck Squamous Cell Carcinoma: From Residual Tumor Quantification to Spatial and AI-Based Biomarkers
2026-Mar-21, Cancers IF:4.5Q1
综述 本文综述了头颈部鳞状细胞癌新辅助免疫治疗中基于病理学的策略,包括残留肿瘤量化、空间分析和人工智能生物标志物 整合了数字病理学和人工智能辅助图像分析,以增强病理反应评估的可重复性,并实现高分辨率映射,同时强调从解剖学分期向生物学驱动反应分层的转变 作为叙述性综述,可能未涵盖所有相关研究,且依赖于现有文献,缺乏原始数据分析 探讨头颈部鳞状细胞癌新辅助免疫治疗中病理学驱动的反应评估策略及其在指导治疗和临床试验设计中的应用 头颈部鳞状细胞癌患者的新辅助治疗标本 数字病理学 头颈部鳞状细胞癌 单细胞测序、空间转录组学、多重免疫分析 人工智能辅助图像分析 图像、文本 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
93 2026-04-21
Mixed Lymphocyte Reaction: Functional Immune Profiling in Transplantation and Beyond
2026-Mar-20, Diagnostics (Basel, Switzerland)
综述 本文是一篇关于混合淋巴细胞反应(MLR)的叙述性综述,旨在提供该领域的实用、非系统性综合,涵盖MLR的设计、读出方法及转化应用,并强调新技术如何将其从批量增殖扩展为多维免疫分析 强调MLR作为一种功能性兼容性探针在HLA分型之外的持续价值,并整合了如scRNA-seq和TCR测序等下一代技术,以提升其分辨率和应用范围 本文为叙述性、非系统性综述,可能未全面涵盖所有相关研究,且依赖于现有文献,缺乏原始数据分析 提供MLR的现代实践导向综合,以改进其在移植、免疫治疗和免疫调节研究中的可重复性和转化准备度 混合淋巴细胞反应(MLR)作为一种体外功能测定,用于模拟应答T细胞与同种异体抗原呈递细胞(APCs)之间的相互作用 免疫学 移植相关疾病 混合淋巴细胞反应(MLR)、流式细胞术、scRNA-seq、TCR测序 NA 功能测定数据、增殖数据、细胞因子/趋化因子谱、细胞毒性数据 NA NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA NA
94 2026-04-21
Causal Effects of a Hepatic Senescence Gene Set on MASLD Fibrosis: A Mendelian Randomization Study and Quercetin Molecular Docking Analysis
2026-Mar-17, Biomedicines IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过孟德尔随机化分析探讨了肝脏衰老相关基因集与MASLD肝纤维化之间的因果关系,并结合分子对接分析了槲皮素的潜在干预作用 首次将孟德尔随机化、免疫浸润分析、单细胞RNA测序和分子对接技术结合,系统揭示了GBP2基因在肝纤维化和胆管癌中的双重作用,并提出了槲皮素通过IRF1间接调控GBP2的新机制 研究主要基于遗传关联和计算模拟,缺乏体内外实验验证;样本来源和数量在部分分析中可能有限;分子对接结果需要进一步实验确认 探究肝脏衰老相关基因集与代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)肝纤维化之间的因果关系及潜在治疗靶点 肝脏衰老相关基因集(SHGS)、GBP2基因、肝纤维化、胆管癌、槲皮素 生物信息学 肝病 孟德尔随机化(MR)、CIBERSORT算法、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、分子对接 NA 基因组数据、转录组数据、单细胞数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
95 2026-04-21
Patient-Derived Organoids from Multiple Sites of a Single Tumor Recapitulates Intratumoral Heterogeneity in Patients with Gastric Cancer
2026-03-15, Gut and liver IF:3.4Q2
研究论文 本研究利用单细胞转录组学分析来自单个胃癌肿瘤不同部位的病人来源类器官,以评估其反映肿瘤内异质性的能力 首次通过单细胞转录组学分析来自同一肿瘤多个部位的PDOs,揭示了其在基因表达上的相似性和差异性,并验证了神经内分泌肿瘤标志物的上调 PDOs在反映肿瘤内异质性方面存在挑战,需要更全面的评估 评估病人来源类器官在捕捉胃癌肿瘤内异质性方面的临床效用 胃癌患者肿瘤不同部位的病人来源类器官 数字病理学 胃癌 单细胞转录组学,免疫组织化学染色 NA 单细胞转录组数据,图像数据 来自单个胃癌肿瘤不同部位的多个PDOs样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
96 2026-04-21
Bridging the Precision Gap in Rheumatoid Arthritis: Spatial Transcriptomics, Spatial Proteomics, and Artificial Intelligence in Precision Health
2026-Mar-14, Biomedicines IF:3.9Q1
综述 本文综述了空间转录组学、空间蛋白质组学与人工智能如何共同推动类风湿关节炎的精准医疗发展 整合空间组学技术与人工智能,以解决类风湿关节炎治疗中的精准性差距,实现个体化分子和空间疾病图谱的匹配 NA 探讨空间组学与人工智能在类风湿关节炎精准医疗中的应用,以缩小治疗策略与个体疾病特征之间的差距 类风湿关节炎的免疫微环境和组织异质性 数字病理学 类风湿关节炎 空间转录组学, 空间蛋白质组学 NA 空间分子数据 NA NA 空间转录组学, 空间蛋白质组学 NA NA
97 2026-04-21
Proliferative Tumor States and Immunogenic Ecosystems Predict Neoadjuvant Chemotherapy Response in Triple-Negative Breast Cancer
2026-Mar-12, Biomedicines IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过整合公共大块转录组数据和探索性单细胞多组学数据,旨在识别与三阴性乳腺癌新辅助化疗反应相关的肿瘤和免疫特征 首次将大块队列数据与仅来自5名患者的探索性单细胞多组学数据集整合,以识别与化疗反应相关的肿瘤和免疫特征,并提出了TIGIT-NECTIN2作为潜在的免疫检查点轴 单细胞队列样本量小(n=5),候选生物标志物和通路需要在更大的独立队列中进行验证,临床转化尚不成熟 识别与三阴性乳腺癌新辅助化疗反应相关的肿瘤和免疫相关特征 三阴性乳腺癌患者 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序,T细胞和B细胞受体测序,单细胞ATAC测序,糖基化标签分析 NA 转录组数据,表观基因组数据,免疫受体数据 两个公共乳腺癌队列(GSE76275和GSE25065)以及一个5名三阴性乳腺癌患者的单细胞队列(4名应答者,1名无应答者) NA 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq,单细胞多组学 NA NA
98 2026-04-21
Systematic clustering alignment and feature characterization for single-cell omics using ACE-OF-Clust
2026-Mar-12, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种名为ACE-OF-Clust的工具,用于解决单细胞组学数据聚类分析中的对齐与特征表征问题 提出了一个四步工作流程(多重聚类、聚类对齐、模型比较、特征识别),首次系统解决单细胞聚类中的对齐问题,并支持跨组学聚类变异性量化 未明确说明算法在超大规模数据集上的计算效率,也未提及对特定噪声数据的鲁棒性评估 提高单细胞聚类分析的可解释性、灵活性和鲁棒性,以研究细胞异质性和基因表达动态 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、多组学单细胞数据 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学分析 混合隶属度聚类模型 转录组数据、空间表达数据、多组学数据 PBMC单细胞RNA-seq数据、乳腺癌空间转录组数据 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 NA NA
99 2026-04-21
Pericytes and mesenchymal stromal cells converge toward pro-tumor phenotypes in the tumor microenvironment
2026-Mar-11, Discover oncology IF:2.8Q2
综述 本文综述了间充质基质细胞(MSCs)和周细胞在肿瘤微环境中如何趋同于促肿瘤表型,并探讨了它们在癌症进展、转移和治疗反应中的作用 通过单细胞RNA测序分析揭示了MSCs和周细胞在肿瘤微环境中功能趋同,模糊了传统分类界限,并提出了一个分类“MSC-周细胞状态”的实用框架 NA 探讨MSCs和周细胞在肿瘤微环境中的趋同表型及其对癌症进展和治疗的影响 间充质基质细胞(MSCs)和周细胞在肿瘤微环境中的行为 肿瘤生物学 结直肠癌、血液恶性肿瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
100 2026-04-21
Neutrophil extracellular traps-associated candidate genes in IgA vasculitis: an exploratory multi-omics analysis integrating transcriptomics and Mendelian randomization
2026-Mar-05, Pediatric rheumatology online journal
研究论文 本研究通过整合转录组学和孟德尔随机化分析,探索了IgA血管炎中与中性粒细胞胞外陷阱相关的候选基因 采用多组学整合方法,结合转录组差异表达、基因集富集分析、孟德尔随机化和单细胞RNA测序,首次系统识别了IgA血管炎中NET相关的候选基因及其在免疫细胞中的特异性表达 这是一项探索性研究,样本量有限,结果需在更大队列和功能研究中进一步验证 识别与IgA血管炎相关的NET相关候选基因,并探索其在免疫细胞中的特异性表达 IgA血管炎患者和健康对照的外周血转录组数据 生物信息学 IgA血管炎 转录组测序, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析 基因集富集分析, 基因集变异分析, 孟德尔随机化 转录组数据 NA NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
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