单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 43483 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-09-20 |
Siglec-15 binds mucin-domain glycoproteins with extended glycans and marks an osteoclast-like, matrix remodeling myeloid state in human tumors
2026-05-22, Glycobiology
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/glycob/cwag035
PMID:42286920
|
研究论文 | 本文研究了Siglec-15识别肿瘤细胞的分子基础及其在肿瘤相关髓系细胞中与破骨细胞样和基质重塑相关的转录和功能程序 | 揭示了Siglec-15结合的糖基决定因素和蛋白质支架，发现复合N-糖和延伸的粘蛋白型O-糖对Siglec-15结合至关重要，并将SIGLEC15表达与人类肿瘤中破骨细胞样和基质重塑髓系程序相关联 | 摘要中未明确说明研究的具体局限性 | 研究Siglec-15识别癌细胞的分子基础，并检查肿瘤相关髓系细胞群中与Siglec-15表达相关的转录和功能程序 | 胰腺癌细胞系AsPC-1、人类肿瘤相关髓系细胞、THP-1共培养模型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 免疫沉淀-质谱联用、单细胞RNA测序 | NA | 文本、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 82 | 2026-09-20 |
Neuroprotection following FLASH-RT may be mediated by sustained glutamate receptor AMPAR activation in CA3 neurons
2026-May-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.15.725423
PMID:42239092
|
研究论文 | 本文通过空间转录组学技术，研究了FLASH放射治疗后小鼠正常脑组织的早期转录组变化，揭示了CA3和DG神经元中谷氨酸受体相关基因的上调及AMPAR蛋白的持续激活 | 首次利用空间转录组学揭示FLASH-RT在全脑照射后CA3和DG神经元中诱导的独特转录组特征，并提出早期钙内流和AMPAR持续表达介导FLASH神经保护的新机制 | 研究仅基于小鼠模型，样本量有限，机制假设仍需进一步功能验证实验证实 | 阐明FLASH-RT对正常脑组织长期神经保护作用的早期分子机制 | C57BL/6J小鼠全脑照射后的CA3和DG神经元 | 空间转录组学 | 神经系统疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | C57BL/6J小鼠，接受1或3次10 Gy全脑照射（FLASH或常规剂量率） | Nanostring | 空间转录组学 | Nanostring | Nanostring空间转录组学平台 |
| 83 | 2026-09-20 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal that the CXCL12-CXCR4 axis drives the immune-desert phenotype in small cell lung cancer by recruiting immunosuppressive CXCR4+ neutrophils and S100A8+ monocytes
2026-Apr-16, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013867
PMID:41991241
|
研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序和Xenium空间转录组学，揭示CXCL12-CXCR4轴通过招募免疫抑制性CXCR4+中性粒细胞和S100A8+单核细胞驱动小细胞肺癌免疫荒漠表型 | 首次整合单细胞RNA测序和Xenium空间转录组学揭示CXCL12-CXCR4轴通过招募CXCR4+中性粒细胞和S100A8+单核细胞驱动小细胞肺癌免疫荒漠表型，并发现ISL1和DLX5转录因子调控CXCR4表达 | 样本量较小（仅5例SCLC和4例NSCLC样本），需要更大规模的队列研究验证 | 探究小细胞肺癌免疫抑制性肿瘤微环境的分子机制，特别是免疫荒漠表型的驱动因素 | 小细胞肺癌和非小细胞肺癌患者的肿瘤组织样本及动物模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫荧光 | NA | 图像, 文本 | 5例小细胞肺癌和4例非小细胞肺癌样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Xenium | 10x Chromium单细胞RNA测序和10x Xenium原位空间转录组学分析 |
| 84 | 2026-09-20 |
Clonal amplification of peripheral CD4+ and CD8+ T cells is associated with clinical response to checkpoint blockade in chronic hepatitis B
2026-Apr-11, ImmunoHorizons
DOI:10.1093/immhor/vlag020
PMID:42033764
|
研究论文 | 通过对接受nivolumab治疗的慢性乙型肝炎患者进行单细胞测序分析，发现外周血CD4+和CD8+ T细胞的克隆扩增与临床应答相关 | 首次在慢性乙型肝炎中揭示了检查点阻断治疗有效的患者具有特定的T细胞表型（如干细胞样记忆CD8+ T细胞基线水平高）以及治疗过程中出现的特定T、B细胞克隆扩增，特别是未发生类别转换的记忆B细胞克隆提示新发B细胞应答 | 样本量小（仅4例患者），需要更大规模的验证研究来确认这些免疫标志物的预测价值 | 探究检查点阻断疗法在慢性乙型肝炎中的作用机制，寻找与临床应答相关的免疫标志物 | 接受单剂量nivolumab治疗的慢性乙型肝炎患者的外周血样本 | 单细胞测序、免疫学 | 慢性乙型肝炎 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 4例患者的血液样本，在基线及治疗期间两个时间点采集 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 85 | 2026-09-20 |
Multi-scale spatial testing recovers gene programs missed by existing detection methods
2026-Apr-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.12.711372
PMID:41890107
|
研究论文 | 本文提出FlashS方法，通过在频域中重新构建基于核的空间检验，实现多尺度空间表达模式检测，并在多个数据集上验证其性能 | 将基于核的空间检验重新构建在频域中，能够检测任意多尺度表达模式，并可扩展至数百万细胞 | 摘要中未明确提及 | 识别空间可变基因，检测现有多尺度空间表达模式 | 空间转录组学数据，包括人类心脏组织和50个基准数据集 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | 基于核的空间检验，频域方法 | 基因表达空间数据 | 人类心脏组织样本（具体数量未提及），50个基准数据集，艾伦脑MERFISH图谱（394万细胞） | 10x Genomics, NanoString, 等（9个平台，具体未列出） | 空间转录组学, MERFISH | NA | NA |
| 86 | 2026-09-20 |
Depletion of Fibrinogen Suppresses Growth of Primary Tumors and Metastasis of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2026-Apr, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2025.09.024
PMID:41432649
|
研究论文 | 该研究通过耗竭纤维蛋白原，探究其对胰腺导管腺癌原发肿瘤生长和转移的影响及相关机制 | 首次在多个PDAC患者来源异种移植模型中，使用正在临床测试的反义寡核苷酸或含siRNA的脂质纳米颗粒技术平台耗竭纤维蛋白原，并结合蛋白质组学和空间转录组学揭示其通过重塑肿瘤微环境促进肿瘤生长和早期转移的新机制 | 研究仅使用了3个PDAC患者来源异种移植模型，样本量较小；未在人体临床试验中验证纤维蛋白原耗竭疗法的安全性和有效性 | 探究纤维蛋白原耗竭对胰腺导管腺癌原发肿瘤生长和转移的影响及其分子机制 | 胰腺导管腺癌患者来源异种移植小鼠模型 | 数字病理学, 机器学习 | 胰腺癌 | 反义寡核苷酸, 小干扰RNA脂质纳米颗粒, 蛋白质组学, 空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | 3个PDAC患者来源异种移植模型 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台用于分析肿瘤微环境中的基质成分变化 |
| 87 | 2026-09-20 |
Species-specific roles of SP1 in bovine and human embryonic genome activation and early embryonic development
2026-Mar-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2526998123
PMID:41849396
|
研究论文 | 该研究通过牛胚胎单细胞RNA测序揭示主要EGA在8细胞期卵裂球间异步启动，并比较牛与人类胚胎中SP1在EGA和早期发育中的物种特异性作用 | 首次揭示牛胚胎主要EGA在8细胞期卵裂球间异步启动；发现EGA过程中蛋白质积累与转录及翻译激活存在差异；阐明SP1在牛和人类胚胎EGA中的保守及物种特异性功能 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 揭示胚胎基因组激活（EGA）的分子特征及调控该过程的转录因子，并探究SP1在牛和人类早期胚胎发育中的作用 | 牛胚胎和人类胚胎 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq、多组学分析 | NA | 文本、图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 88 | 2026-09-20 |
Type 2 lymphocytes restrict type 3 lymphocytes during liver fibrosis and colocalize in fibroblast niches
2026-Mar-13, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aea6805
PMID:41811951
|
研究论文 | 该研究通过小鼠肝损伤和纤维化模型、三维显微镜和空间转录组学，发现2型淋巴细胞（主要是ILC2）与3型淋巴细胞及成纤维细胞生态位空间共定位，并相互制约调节肝纤维化 | 揭示了2型淋巴细胞和3型淋巴细胞在肝纤维化中的空间关联和相互制约作用，以及它们与成纤维细胞生态位的共定位 | 研究主要基于小鼠模型，人类肝脏疾病的适用性需要进一步验证 | 探究2型淋巴细胞和3型淋巴细胞的空间定位如何影响肝脏修复或病理性纤维化 | 小鼠肝脏中的2型淋巴细胞（包括ILC2）、3型淋巴细胞（包括γδ T细胞）、成纤维细胞和肌成纤维细胞 | 空间转录组学 | 肝纤维化 | 空间转录组学, 三维显微镜 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 89 | 2026-09-20 |
scDEcrypter: Uncertainty-aware differential expression analysis for viral infection in scRNA-seq
2026-Mar-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.09.710583
PMID:41959296
|
研究论文 | 本文提出了 scDEcrypter，一种带惩罚的双向混合模型，利用部分标签进行病毒感染单细胞RNA测序数据的差异表达分析 | 提出了带惩罚的双向混合模型，利用感染状态和细胞类型等变量的部分标签，并采用数据拆分策略避免double-dipping，实现快速、基于似然的差异表达推断 | 摘要中未明确说明研究局限性 | 解决病毒感染单细胞RNA测序研究中病毒reads稀疏、感染细胞标签不足以及旁观者反应干扰差异表达分析的问题 | 病毒感染单细胞RNA测序数据中的感染细胞状态及感染相关基因 | 机器学习 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | 带惩罚的双向混合模型 | 文本 | 两个不同的病毒感染数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 90 | 2026-09-20 |
Single-cell and spatial profiling highlights TB-induced myofibroblasts as drivers of lung pathology
2026-03-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20251067
PMID:41489684
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析结核感染与阴性个体的肺组织，揭示了TB诱导的肌成纤维细胞在肺病理中的驱动作用 | 首次识别出MMP1+CXCL5+成纤维细胞亚群，表达肌成纤维细胞样基因签名，并与严重疾病和更高细菌载量相关；通过网络分析揭示了该成纤维细胞与SPP1+巨噬细胞在肉芽肿袖套中的相互作用 | 摘要中未提及研究限制 | 定义人类结核免疫病理的细胞驱动因素，并寻找新型结核治疗的潜在靶点 | 结核感染和结核阴性个体的肺组织 | 数字病理学 | 肺结核 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组织化学, 流式细胞术 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 91 | 2026-09-20 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals cellular and molecular changes in EGFR-positive lung adenocarcinoma before and after Furmonertinib treatment
2026-03, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-025-01706-y
PMID:41307822
|
研究论文 | 通过对EGFR阳性肺腺癌患者Furmonertinib治疗前后肿瘤及配对癌旁组织进行单细胞RNA测序，揭示肿瘤微环境重塑、转录组适应及细胞间通讯网络重编程 | 首次系统整合公开和自有数据集，对EGFR阳性肺腺癌患者在Furmonertinib治疗前后的肿瘤及配对癌旁组织进行单细胞转录组分析，揭示了肿瘤微环境重塑、转录组重编程及细胞间通讯网络变化 | 摘要中未明确说明样本量及具体研究局限性 | 阐明EGFR阳性肺腺癌患者对Furmonertinib响应和适应的细胞及分子机制，特别是肿瘤微环境的变化 | EGFR阳性肺腺癌患者治疗前后的肿瘤组织及配对癌旁组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 92 | 2026-09-20 |
Spatial transcriptomics in the human left atrial appendage and pulmonary vein sleeve
2026 Mar-Apr, Cardiovascular pathology : the official journal of the Society for Cardiovascular Pathology
IF:2.3Q2
DOI:10.1016/j.carpath.2025.107802
PMID:41314481
|
研究论文 | 该研究利用空间转录组学技术分析了人类左心耳和肺静脉袖套组织，以探究心房颤动（AF）相关基因的空间表达模式 | 首次对人类肺静脉和左心耳组织进行空间转录组学研究，克服了获取PV组织的挑战，并揭示了AF相关基因如SHOX2在PV中的潜在重要性 | 样本来源于未使用的移植供体，可能无法完全代表AF患者的病理状态；每个55微米直径空间区域可能包含多种细胞，分辨率有限 | 通过空间转录组学揭示人类肺静脉和左心耳组织的细胞类型分布和空间区域特征，以及AF相关基因的空间表达 | 人类肺静脉（PV）和左心耳（LAA）组织 | 空间转录组学 | 心房颤动 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 来自未使用移植供体的人类PV和LAA组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 93 | 2025-12-02 |
Single-cell RNA sequencing reveals tumor microenvironment characteristics in ovarian malignant Brenner tumor
2026-Mar, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101635
PMID:41322338
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 94 | 2026-09-20 |
The Role of CCR1 as a decisive factor for immune response activation versus suppression phenotypes in gastric cancer
2026-03, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2026.101277
PMID:41621162
|
研究论文 | 本研究通过转录组分析、单细胞与空间转录组学、体内实验等手段，探究CCR1在胃癌免疫微环境中激活或抑制免疫应答的作用机制 | 首次系统阐明CCR1在胃癌中作为免疫应答激活因子的决定性作用，揭示CCR1通过NF-κB和MAPK通路上调CXCL9/CXCL10促进T细胞浸润的机制 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究CCR1在胃癌中是促进还是抑制肿瘤进展，并阐明其调控免疫微环境的分子机制 | 胃癌患者组织样本、CCR1敲除小鼠模型 | digital pathology | 胃癌 | 转录组分析、单细胞转录组测序、空间转录组学、Western blotting、qRT-PCR、免疫荧光 | NA | 转录组数据、图像 | NA | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 95 | 2026-09-20 |
Experimental study of tumor-associated macrophage-derived SPP1 inhibit CD8+ T cells to promote Colorectal cancer progression
2026-03, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2026.101276
PMID:41633116
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和空间转录组分析，揭示了肿瘤相关巨噬细胞来源的SPP1通过CD44信号抑制CD8⁺ T细胞向Tc1分化，从而促进结直肠癌进展 | 首次整合单细胞RNA测序和空间转录组学鉴定出高表达SPP1的肿瘤相关巨噬细胞亚群，并阐明TAM来源的SPP1通过CD44介导的LCK-ZAP70-LAT信号通路抑制CD8⁺ T细胞向Tc1分化 | 研究主要基于小鼠模型和体外共培养实验，缺乏临床患者样本验证，且SPP1-CD44轴的具体下游分子机制仍需进一步探讨 | 探究肿瘤相关巨噬细胞在结直肠癌免疫微环境中的免疫调节作用及其分子机制 | 结直肠癌肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞和CD8⁺ T细胞，以及MC38细胞系和CL2MDP脂质体处理的巨噬细胞清除小鼠模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 96 | 2026-09-20 |
Integrating single-cell and spatial transcriptomics to dissect mast-cell heterogeneity and arginine-metabolism-associated markers in BRCA
2026-03, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2026.101281
PMID:41655499
|
研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序数据，揭示了乳腺癌中肥大细胞基于精氨酸代谢的异质性，并识别出与精氨酸代谢相关的标志物 | 首次基于精氨酸代谢活性将乳腺癌中的肥大细胞分为高活性和低活性两个亚群，揭示了HAS细胞在TNBC中的富集及其促肿瘤机制，并构建了五基因预后模型 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，功能验证仅限于OAT基因，其他模型基因的功能尚未验证，且缺乏前瞻性临床试验数据 | 探究精氨酸代谢是否定义了乳腺癌中转录和功能上不同的肥大细胞亚群，并揭示其在肿瘤微环境中的作用 | 乳腺癌（BRCA）特别是三阴性乳腺癌（TNBC）中的肥大细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | LASSO-Cox, Seurat-Louvain聚类, Monocle2, CellChat, hdWGCNA | 图像, 文本 | 272,592个细胞（GSE161529）；空间转录组数据（GSE243022）；批量RNA-seq数据（TCGA, GSE42568） | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | 10x Chromium, Illumina测序平台 | 10x Chromium单细胞3'端文库构建，Illumina平台测序，空间转录组使用10x Visium |
| 97 | 2026-09-20 |
Tamoxifen promotes metastasis of breast cancer via reshaping lipid-driven fibrotic microenvironments in the lung
2026-03, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2026.101286
PMID:41666535
|
研究论文 | 该研究探究了长期他莫昔芬治疗对乳腺癌肺转移微环境形成的影响，发现其通过重塑脂质驱动的肺纤维化微环境促进肿瘤转移 | 首次揭示长期他莫昔芬治疗可通过诱导肺纤维化和脂质代谢重编程重塑转移微环境，进而促进ER阳性乳腺癌肺转移，并提出靶向脂质代谢可能作为限制转移的治疗策略 | 研究主要基于PyMT和4T1小鼠同种移植模型，尚需进一步在人类临床样本中验证；他莫昔芬促进转移的具体分子机制仍需深入探究 | 探究长期他莫昔芬治疗对乳腺癌转移微环境形成的影响及其潜在机制 | ER阳性乳腺癌小鼠模型（PyMT和4T1同种移植模型）及他莫昔芬处理后的肺组织 | 肿瘤生物学、单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫荧光、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、图像 | PyMT和4T1同种移植小鼠模型的肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 98 | 2026-09-20 |
SMARCA4 deficiency in glioblastoma: Mitochondrial transfer from MSCs and the clinical dilemma in targeting the tumor microenvironment
2026-03, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2026.101288
PMID:41692001
|
研究论文 | 该研究探讨了SMARCA4在胶质母细胞瘤进展中的作用，重点关注肿瘤微环境中间充质基质细胞的线粒体转移 | 首次揭示了SMARCA4缺陷的间充质基质细胞通过微管依赖性线粒体转移促进胶质母细胞瘤生长的机制 | 研究主要基于体外实验和免疫缺陷异种移植模型，需要进一步验证在人体中的适用性 | 探究SMARCA4表达与胶质母细胞瘤进展的相关性及其在肿瘤微环境中的作用 | 胶质母细胞瘤细胞、间充质基质细胞、免疫缺陷小鼠异种移植模型 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 99 | 2026-09-20 |
From noise to models to numbers: Evaluating negative binomial models and parameter estimations in single-cell RNA-seq
2026-Mar, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014014
PMID:41838800
|
研究论文 | 本文通过计算效率高的模型选择技术，探讨了单细胞RNA测序数据中负二项分布模型与基因表达动力学参数之间的关系，并评估了参数估计的准确性。 | 揭示了负二项分布广泛适用的参数范围，并指出其拟合良好并不唯一指示转录爆发；同时发现即使校正技术噪声后，爆发参数估计仍存在较大误差，但爆发频率的基因排序相对可靠。 | 研究主要基于模拟数据，实际scRNA-seq数据的验证有限；参数估计误差较大，尤其在小样本情况下；未全面考虑所有可能的噪声来源和模型复杂性。 | 探究负二项分布模型在scRNA-seq数据中广泛适用的原因，评估其与基因表达动力学参数的关系及参数估计的准确性。 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达计数分布，以及模拟生成的基因表达数据，包括哺乳动物基因。 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 负二项分布模型、Beta-Poisson模型、泊松模型 | 计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 100 | 2026-09-20 |
"Recurrent Extinction of Resistance Mutations Leads to Convergent Multidrug Resistance in Sequential Antibiotic Treatment"
2026-Feb-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.08.647880
PMID:42124691
|
研究论文 | 该研究通过模拟临床抗生素药代动力学，探索在单一或序贯抗生素治疗下细菌耐药性的进化轨迹，发现序贯治疗可通过消除耐药突变导致基因型和表型趋同的多重耐药性。 | 揭示了序贯抗生素治疗可通过反复消除耐药突变，使原本分歧的进化路径趋同，形成多重耐药性，挑战了传统认为耐药进化不可预测的观点。 | 摘要中未明确说明研究的局限性。 | 为设计不易产生耐药性的抗生素治疗方案提供进化生物学依据。 | 在单一或序贯抗生素治疗下进化的大肠杆菌或其他细菌群体（具体菌种未明确）。 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |