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当前共找到 45274 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-11-05 |
Multimodal imaging reveals a lysosomal drug reservoir that drives heterogeneous distribution of PARP inhibitors
2026-Mar-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70558-1
PMID:41844641
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研究论文 | 该研究利用患者来源的外植体多模态成像流程，揭示了PARP抑制剂在肿瘤内和患者间的异质性积累，并发现溶酶体作为药物储库驱动这种异质性分布 | 首次通过患者来源外植体多模态成像结合空间转录组学，在单细胞水平揭示PARP抑制剂积累的异质性；发现溶酶体隔离形成芦卡帕利药物储库决定核内药物水平；发现弱碱性PARP抑制剂芦卡帕利和尼拉帕利受溶酶体调控而奥拉帕利不受影响 | 摘要中未明确说明样本量及具体局限性，可能受限于外植体模型的体外代表性及单细胞空间转录组学技术的分辨率限制 | 探究肿瘤异质性是否影响药物分布和疗效，特别是PARP抑制剂在高分级浆液性卵巢癌中的异质性积累机制 | 高级别浆液性卵巢癌患者来源的肿瘤外植体 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 多模态成像, 空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 82 | 2026-11-05 |
Reactive oligodendrocytes promote glioblastoma progression through CCL5/CCR5-mediated glioma stem cell maintenance
2026-01-21, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2025.12.012
PMID:41570802
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研究论文 | 该研究利用单细胞和空间转录组学等技术，揭示了反应性少突胶质细胞通过CCL5/CCR5信号通路维持胶质瘤干细胞并促进胶质母细胞瘤进展的机制 | 发现了由干扰素诱导的反应性少突胶质细胞状态在CNS恶性肿瘤中富集，并揭示了CCL5/CCR5轴作为胶质瘤干细胞维持和复发的关键驱动因素，提出maraviroc作为潜在治疗药物 | 摘要中未明确说明研究的局限性 | 探究少突胶质细胞谱系细胞在胶质母细胞瘤微环境中的功能及其与肿瘤细胞的相互作用机制 | 原发性和复发性胶质母细胞瘤肿瘤组织、人少突胶质细胞元图谱、同系小鼠模型 | 数字病理学, 单细胞生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 免疫组织化学, 细胞因子谱分析, 迁移实验 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 83 | 2026-11-05 |
Single-cell transcriptomic profiling of C. elegans Q neuroblast lineage during migration and differentiation
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0343734
PMID:41774717
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研究论文 | 该研究利用FACS分离线虫Q神经母细胞谱系不同发育阶段的细胞，并通过单细胞RNA测序绘制其迁移与分化过程中的转录组图谱 | 首次在单细胞分辨率下构建Q神经母细胞谱系的转录组分化图谱，发现新基因、揭示母Q细胞具有上皮样身份并经历上皮-间质转化，以及发现Wnt相关基因（cwn-1和cwn-2）的左右不对称表达和Wnt/β-catenin不对称通路的参与 | 研究仅基于线虫模型，结论在哺乳动物中的保守性有待验证；FACS分离可能引入应激相关基因表达变化；单细胞测序可能受限于细胞数目和测序深度 | 研究线虫Q神经母细胞迁移和分化的分子机制 | 秀丽隐杆线虫（Caenorhabditis elegans）Q神经母细胞谱系细胞 | 单细胞转录组学、发育神经生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、FACS | NA | 单细胞转录组数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 84 | 2026-11-05 |
Increased secreted PLA2 in epithelial cells promotes the progression of chronic non-atrophic gastritis to chronic atrophic gastritis through the TGF-β signaling
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0343531
PMID:41779702
|
研究论文 | 本研究探讨上皮细胞中的分泌型磷脂酶A2（PLA2G10）是否通过TGF-β信号通路促进慢性非萎缩性胃炎向慢性萎缩性胃炎进展 | 首次揭示PLA2G10在慢性非萎缩性胃炎向慢性萎缩性胃炎进展中的关键作用，并阐明其通过TGF-β信号通路发挥作用的机制 | 研究主要基于动物模型和细胞系实验，缺乏大规模临床样本验证；PLA2G10调控TGF-β信号的具体分子机制尚未完全阐明 | 研究上皮细胞中PLA2G10是否通过TGF-β信号通路促进慢性非萎缩性胃炎向慢性萎缩性胃炎的进展 | SD大鼠慢性非萎缩性胃炎模型及人胃黏膜上皮细胞（GES-1） | 转录组学 | 慢性萎缩性胃炎 | RNA芯片, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 图像 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 85 | 2026-11-05 |
Integrating multi-omics and machine learning to decipher the molecular pathways of bisphenol a-associated lactylation-related genes driving bladder cancer
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0347134
PMID:42085381
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研究论文 | 本研究整合多组学数据与机器学习方法，筛选与双酚A相关的乳酰化相关基因，并解析其在膀胱癌中的分子通路 | 提出了一种基于毒理基因组学的假设生成框架，首次将BPA暴露、乳酰化相关通路与膀胱癌联系起来，并结合多种机器学习算法和多层次验证手段 | 研究属于假设生成性框架，缺乏实验验证和功能研究，候选基因的生物学机制仍需进一步证实 | 系统地研究膀胱癌相关基因特征，重点关注与乳酰化相关通路相关的基因，并探索BPA暴露与膀胱癌之间的分子联系 | 膀胱癌相关的基因表达数据及BPA暴露相关的毒理基因组学数据 | 多组学分析、机器学习 | 膀胱癌 | 多组学数据整合、毒理基因组学、WGCNA、机器学习、单细胞转录组、蛋白质组学、分子对接与动力学模拟 | LASSO、SVM、随机森林 | 基因表达数据、单细胞转录组数据、蛋白质组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 86 | 2026-11-05 |
Mature adipocytes lack functional Aryl Hydrocarbon Receptor - a study investigating its role in diet-induced obesity in mice
2026, Wellcome open research
DOI:10.12688/wellcomeopenres.25201.2
PMID:42376192
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研究论文 | 本研究利用基因敲除小鼠模型和多种测序技术，探究芳香烃受体（AHR）在饮食诱导肥胖中的作用，发现成熟脂肪细胞不表达功能性AHR，而AHR在脂肪前体细胞中活跃并可能调控脂肪细胞分化 | 首次通过脂肪细胞特异性Ahr敲除、多种成熟脂肪细胞分离技术及单细胞RNA测序结合Cyp1a1命运报告小鼠，证明成熟白色脂肪细胞不表达Ahr，而AHR通路在脂肪干细胞和前体细胞中活跃 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类中验证；AHR调控脂肪细胞分化的具体分子机制未完全阐明 | 探究配体激活转录因子AHR在肥胖和代谢综合征发展中的作用，寻找治疗肥胖的新药理学靶点 | 全局和脂肪细胞特异性Ahr敲除小鼠模型、Cyp1a1命运报告小鼠品系、体外培养的脂肪前体细胞 | 代谢疾病研究 | 肥胖 | 基因敲除小鼠模型、单细胞RNA测序、bulk RNA测序、翻译核糖体亲和纯化、体外分化 | NA | 基因表达数据、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 87 | 2026-11-05 |
Spatial compartmentalization of melanoma cell states reveals CAF-associated tumor cells with enhanced proliferative capacity
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0358235
PMID:42743160
|
研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学，揭示了黑色素瘤中CAF相关的肿瘤细胞状态及其空间分区，并分析了CAF与免疫排斥和药物敏感性的关系 | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学（892个感兴趣区域）构建黑色素瘤CAF-免疫相互作用的空间图谱，识别出六种黑色素瘤细胞状态，发现CAF相关肿瘤状态（State 4）比免疫相关状态（State 5）具有更强的增殖能力 | 药物敏感性分析仅在细胞系模型中进行，需要在包含CAF的系统中进一步验证 | 探究黑色素瘤肿瘤微环境中CAF、细胞外基质重塑和免疫排斥之间的空间关系 | 原发性黑色素瘤样本 | 空间转录组学, 单细胞分析, 肿瘤微环境 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据, 图像 | 892个感兴趣区域（来自原发性黑色素瘤样本），以及TCGA批量RNA-seq数据和GDSC数据库 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 88 | 2026-11-05 |
eNAMPT is a plasma biomarker of COVID-19 severity and ARDS progression linked to increased immune effector cell expression
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0360244
PMID:42976129
|
研究论文 | 该研究评估了血浆eNAMPT作为COVID-19严重程度和ARDS进展生物标志物的效用，并探究了其细胞来源 | 首次在多个独立COVID-19队列中系统评估eNAMPT作为COVID-19严重程度和ARDS进展的血浆生物标志物，并结合单细胞RNA测序揭示了NAMPT在免疫效应细胞中的表达与疾病严重程度的关联 | 研究未明确说明各队列的样本采集时间点和临床特征差异，单细胞RNA测序数据来自公共数据库且样本量较小（n=18），未进行纵向随访分析 | 探索血浆eNAMPT作为COVID-19生物标志物与ARDS进展和疾病严重程度的关联，并研究COVID-19患者中eNAMPT释放/分泌的潜在细胞来源 | COVID-19阳性患者（迈阿密、亚利桑那、坦帕三个队列，n=277）和健康对照者（n=214），以及坦帕COVID-19幸存者亚组（n=18）的PBMCs和COVID肺组织尸检数据库 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序，血浆生物标志物检测 | NA | 血浆生物标志物数据，单细胞RNA测序数据，文本 | COVID-19患者277例，健康对照214例，单细胞RNA测序PBMCs样本18例，以及COVID肺组织尸检数据库 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 89 | 2026-11-05 |
Integrated time-series multi-omics reveals temporal reprogramming and inter-organ divergence in diabetic cardiorenal syndrome
2026, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2026.1950040
PMID:42978585
|
研究论文 | 该研究通过时间序列bulk RNA-seq和公共单细胞RNA-seq数据，揭示了糖尿病心脏和肾脏在转录组重编程中的时间动态差异及细胞类型特异性变化 | 采用密集采样的纵向设计进行时间序列多组学分析，整合bulk与单细胞数据交叉验证，发现肾脏比心脏更早出现转录 divergence，并识别时间依赖核心基因及细胞类型定位 | 研究为探索性发现阶段，样本量有限，SGLT2i相关发现来自独立公共数据集且为假设生成性，需直接比较研究验证 | 探究糖尿病诱导的心脏和肾脏组织特异性时间转录重编程动态及细胞机制 | 小鼠心脏和肾脏组织（Control、高脂饮食、糖尿病、胰岛素治疗组），以及公共单细胞数据集中的小鼠肾脏（Control、DKD、SGLT2i治疗组） | 机器学习, 数字病理学 | 心血管疾病, 糖尿病肾病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qPCR, 免疫组织化学 | NA | 文本, 图像 | bulk RNA-seq共38个小鼠心脏和肾脏样本；公共单细胞RNA-seq数据集包含16个小鼠肾脏 | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | NA |
| 90 | 2026-11-05 |
Single-cell profiling of dysfunctional NK cells in COVID-19: from immunization to acute infection and beyond
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1972608
PMID:42978614
|
研究论文 | 该研究通过纵向单细胞RNA测序分析接种BNT162b2疫苗个体及未接种新冠患者（急性感染和康复期）的NK细胞转录组，揭示疫苗与感染诱导的不同NK细胞状态 | 首次将纵向疫苗接种者的NK细胞scRNA-seq数据与未接种急性感染及康复期患者的横截面数据整合，系统比较疫苗与感染对NK细胞转录程序的差异化影响 | 样本量有限，且疫苗组与感染组为不同队列的整合分析，缺乏直接对比；未进行功能验证实验 | 阐明疫苗接种和SARS-CoV-2感染如何塑造NK细胞生物学特征，特别是与COVID-19疾病严重程度的关系 | 接种两剂BNT162b2 mRNA疫苗的SARS-CoV-2未感染个体、未接种的急性COVID-19患者及独立康复期个体 | 单细胞转录组学、免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 91 | 2026-11-05 |
Single-cell atlas of urethral stricture reveals fibroblast, mast cell, and macrophage heterogeneity with candidate regulators
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1932042
PMID:42978627
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研究论文 | 该研究对尿道瘢痕组织和正常尿道组织进行单细胞RNA测序，揭示了成纤维细胞、肥大细胞和巨噬细胞的异质性及其在尿道狭窄纤维化中的潜在调控因子 | 首次构建尿道狭窄的单细胞图谱，鉴定出成纤维细胞、肥大细胞和巨噬细胞的多个异质性亚群，并发现ETS1和SMAD3等候选转录因子及细胞间通讯网络在尿道瘢痕形成中的作用 | 样本量较小（仅3例瘢痕组织和3例正常组织），缺乏功能验证实验来确认候选调控因子和细胞亚群在纤维化中的因果作用 | 解析尿道狭窄瘢痕组织的细胞微环境异质性，揭示参与纤维化的关键细胞亚群、转录调控因子和细胞间通讯网络，为探索治疗靶点提供依据 | 尿道瘢痕组织和正常尿道组织 | 单细胞组学 | 尿道狭窄 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6例组织样本，包括3例尿道瘢痕组织和3例正常尿道组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 92 | 2026-11-05 |
Overcoming primary non-response to infliximab in ulcerative colitis: monocyte-derived PTGS2 as a therapeutic target
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1957588
PMID:42978631
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研究论文 | 该文揭示单核细胞来源的PTGS2通过促进中性粒细胞募集导致溃疡性结肠炎对英夫利西单抗的原发性无应答，并发现葛根芩连汤及其活性成分槲皮素可靶向PTGS2改善疗效 | 首次将PTGS2鉴定为介导UC患者对IFX原发性无应答的关键分子，明确其来源于CD14+S100A9+炎性单核细胞，并揭示葛根芩连汤及槲皮素通过抑制PTGS2/NF-κB/CXCL8轴减轻中性粒细胞趋化从而增敏IFX的新机制 | 研究主要基于公共RNA测序数据的生物信息学分析、体外细胞实验和DSS诱导小鼠结肠炎模型，人体临床验证样本量有限，缺乏前瞻性临床试验证据 | 阐明溃疡性结肠炎对英夫利西单抗原发性无应答的分子机制，并寻找可提高IFX疗效的靶向治疗策略 | 溃疡性结肠炎患者结肠组织、CD14+S100A9+炎性单核细胞、DSS诱导的小鼠结肠炎模型 | 数字病理学、转录组学 | 溃疡性结肠炎 | RNA-seq、单细胞RNA测序、网络药理学、分子对接、虚拟基因敲除 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq、single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 93 | 2026-11-05 |
Hupehenine suppresses tumor cell phenotypes and modulates macrophage marker profiles in a diabeticmimetic colorectal cancer model
2026, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2026.1962620
PMID:42978697
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研究论文 | 该研究通过生物信息学分析识别糖尿病与结直肠癌共享的分子特征，发现IL1β-CXCL8-CXCR2轴作为候选炎症模块，并鉴定湖贝碱（Hupehenine）作为多靶点配体，在糖尿病模拟模型中抑制肿瘤细胞表型并调节巨噬细胞标志物 | 首次将IL1β-CXCL8-CXCR2轴确定为糖尿病-结直肠癌界面的候选免疫调节模块，并发现湖贝碱作为该轴的多靶点配体，且在糖尿病模拟条件下肿瘤细胞对湖贝碱的敏感性增加 | 研究仅在体外模型中进行，需要进一步的机制和临床前评估，包括直接评估巨噬细胞功能 | 表征糖尿病和结直肠癌的共享分子特征，并识别能够调节该界面上候选轴的化合物 | 糖尿病与结直肠癌共享的疾病相关基因、HCT116细胞、THP-1衍生的巨噬细胞 | 生物信息学、药物发现、肿瘤免疫学 | 结直肠癌、糖尿病 | 生物信息学分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析、TCGA数据分析、单细胞RNA测序数据分析、深度学习虚拟筛选（DeepPurpose）、基于结构的虚拟筛选（AutoDock Vina）、表面等离子体共振（SPR）、分子动力学模拟 | 深度学习模型（DeepPurpose）、分子对接模型（AutoDock Vina） | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、文本（化合物数据库） | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 94 | 2026-11-05 |
Single-cell and spatial transcriptomics in intrahepatic cholangiocarcinoma: spatial immune ecosystems, metabolic remodeling, and immunotherapeutic implications
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1918458
PMID:42978882
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综述 | 本文综述了单细胞和空间转录组学在肝内胆管癌中的应用，聚焦空间免疫生态系统、代谢重塑及免疫治疗意义 | 系统整合了肝内胆管癌中适应性免疫区域（含三级淋巴结构）、侵袭前沿基质与髓系细胞屏障、缺氧驱动的髓系微环境及转移生态系统四类空间生态位，并区分了计算推断的相互作用与功能支持的机制 | 作为综述，未提供原始实验数据验证；现有证据多基于计算推断，功能支持的机制有限，跨队列可重复性尚待确立 | 总结单细胞与空间转录组学揭示的肝内胆管癌空间免疫生态系统和代谢重塑特征，探讨其对生物标志物开发和免疫治疗策略的指导意义 | 肝内胆管癌（iCCA）及其肿瘤微环境中的恶性细胞、免疫细胞、基质细胞和代谢状态 | 数字病理, 单细胞组学, 空间转录组学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 文本, 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 95 | 2026-11-05 |
Bone morphogenetic protein 4 meets artificial intelligence: a comprehensive review of AI-driven advances in drug discovery, structural modeling, and clinical translation
2026, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2026.1930582
PMID:42978922
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综述 | 本文系统综述了人工智能在BMP4相关药物发现、结构建模和临床转化方面的研究进展 | 首次系统梳理BMP4生物学与人工智能交叉领域的三大核心方向，并提出未来5年的优先研究方向 | 缺乏BMP4特异性从头蛋白质设计研究，BMP4靶向药物发现的大规模训练数据稀缺，多模态AI方法在BMP4临床研究中的整合有限，部分预测模型尚待实验和前瞻性验证 | 系统考察BMP4生物学与人工智能在药物发现、蛋白质结构预测与计算建模、临床AI应用三个核心领域的交叉进展 | BMP4及其受体复合物、BMP信号通路、BMP4相关疾病（癌症、纤维化、进行性骨化性纤维发育不良等） | 机器学习 | 癌症, 纤维化, 进行性骨化性纤维发育不良 | 机器学习, 深度学习, 虚拟筛选, 单细胞转录组学, LASSO-Cox回归 | AlphaFold3, LASSO-Cox回归 | 文本, 图像, 组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 96 | 2026-11-05 |
Integrative Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Analysis Identifies Ion Channel-Related Biomarkers in Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2026, International journal of chronic obstructive pulmonary disease
IF:2.7Q2
DOI:10.2147/COPD.S638940
PMID:42979147
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研究论文 | 该研究整合单细胞与批量RNA测序数据，利用107种机器学习模型识别慢性阻塞性肺疾病（COPD）中与离子通道基因相关的生物标志物，并探索其诊断、分型及治疗潜力 | 系统性地将107种机器学习模型与SHAP分析结合用于筛选COPD的枢纽离子通道基因，并结合共识聚类、WGCNA、单细胞RNA-seq、虚拟敲除、虚拟药物筛选和分子对接进行多维度验证 | 摘要中未明确说明研究的具体局限性 | 探究离子通道基因在慢性阻塞性肺疾病中的潜在价值 | 慢性阻塞性肺疾病（COPD）相关数据集及患者样本 | 机器学习 | 慢性阻塞性肺疾病 | 批量RNA-seq，单细胞RNA-seq | 107种机器学习模型，SHAP分析 | 基因表达数据（批量RNA-seq与单细胞RNA-seq） | NA | NA | 批量RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 97 | 2026-11-05 |
Tumor Immune Microenvironment Heterogeneity and Key Immunoregulatory Gene Expression in Lung Cancer
2026, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/8365959
PMID:42979143
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析肺癌肿瘤免疫微环境的细胞异质性和关键免疫调控基因表达 | 在单个GEO样本中鉴定出七种免疫细胞类型，发现巨噬细胞具有最强的细胞间相互作用强度和SPP1信号来源，并识别ISG15、TNFRSF18和TNFRSF4为潜在免疫调控候选基因 | 仅基于单个GEO样本（223个细胞），PC1仅解释5.3%的方差，T细胞、NK细胞和Treg标志物低于检测阈值，缺乏外部多样本验证 | 表征肺癌肿瘤免疫微环境的细胞异质性和关键免疫调控基因表达模式 | 肺癌肿瘤免疫微环境中的免疫细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 223个单细胞（来自1个GEO样本GSM4453577） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 98 | 2026-11-05 |
Integrated Transcriptomic Analysis and Experimental Validation Identify ATF3 as a Mesangial Cell-Associated Candidate Regulator in IgA Nephropathy
2026, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S638648
PMID:42979491
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研究论文 | 该研究整合公共转录组数据，结合单细胞分析和实验验证，识别出ATF3作为IgA肾病中系膜细胞相关的候选调控因子 | 首次通过整合转录组分析结合单细胞RNA测序和实验验证，将ATF3识别为IgA肾病系膜细胞相关的候选调控因子 | 研究主要基于公共数据集的再分析，ATF3的调控机制和临床价值仍需进一步的机制研究和临床验证 | 识别IgA肾病相关基因，评估激活转录因子3（ATF3）与系膜细胞活化的相关性 | IgA肾病相关的公共转录组数据集、单细胞RNA测序数据以及IgA1刺激的人系膜细胞模型 | 转录组学、单细胞分析 | IgA肾病 | bulk转录组测序、单细胞RNA-seq、机器学习、共表达网络分析、单细胞调控网络推断 | 机器学习模型、高维加权基因共表达网络分析（hdWGCNA）、单细胞调控网络推断 | 转录组数据、单细胞RNA-seq数据、文本注释数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 99 | 2026-11-05 |
Bridging large language model-based agents and workflow languages for automated multi-perspective analysis of single-cell RNA sequencing data
2026, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbag301
PMID:42979577
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研究论文 | 提出一个将大语言模型智能体与工作流语言结合的框架，用于自动化多视角分析单细胞RNA测序数据 | 将大语言模型智能体与工作流语言结合，自动生成、验证并并行执行多种分析策略，实现可重复可扩展的多视角单细胞数据分析 | 仅在三个数据集和三种大语言模型上评估，未涉及更广泛的生物学验证或更多平台数据 | 系统化、可重复且可扩展地探索单细胞RNA测序数据的多种互补分析策略 | 单细胞RNA测序数据集 | 机器学习, 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 大语言模型智能体 | 文本, 基因表达数据 | 三个数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 100 | 2026-11-05 |
Epidermal Loss of PRMT5 Leads to the Emergence of an Atypical Basal Keratinocyte-Like Cell Population and Defective Epidermal Stratification
2025-Dec, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.04.008
PMID:40339790
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研究论文 | 该研究通过在早期外胚层条件性敲除Prmt5，发现PRMT5缺失导致表皮分层缺陷，并通过单细胞RNA测序和ATAC-seq鉴定出一群具有衰老样程序的不典型基底角质细胞样细胞 | 首次在体内证明PRMT5通过抑制Cdkn1a维持基底角质细胞的干细胞状态并防止其衰老，揭示了PRMT5在先天性皮肤疾病中表皮分层和基底角质细胞维持的表观遗传调控作用 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证；对PRMT5下游分子机制的具体调控网络解析仍有限 | 探究PRMT5在体内是否维持角质细胞的干细胞表型，以及其在表皮分层和基底角质细胞维持中的作用 | 条件性敲除Prmt5的小鼠胚胎（胚胎第7.5天早期外胚层）及其表皮组织 | 单细胞组学 | 先天性皮肤病 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据, 组织学图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |