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当前共找到 39678 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 81 | 2026-05-27 |
Long-chain sulfatide enrichment is an actionable metabolic vulnerability in intraductal papillary mucinous neoplasm (IPMN)-associated pancreatic cancers
2025-09-08, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-335220
PMID:40268349
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研究论文 | 通过跨物种空间分析揭示长链硫苷脂富集是导管内乳头状黏液性肿瘤相关胰腺癌的可干预代谢脆弱性 | 首次通过整合空间转录组和代谢组学技术，发现长链羟基硫苷脂在IPMN/PDAC肿瘤上皮中选择性富集，并验证UGT8抑制通过神经酰胺介导的补偿性线粒体自噬和内在凋亡通路发挥抗癌作用 | 未明确提及限制性 | 揭示IPMN恶性进展为PDAC的生化和分子驱动因素 | 人类IPMN/PDAC组织样本及突变Kras;Gnas小鼠模型的胰腺组织 | 数字病理学 | 胰腺导管腺癌 | MALDI质谱成像、空间转录组学、CRISPR/cas9技术、小干扰RNA、药理学抑制 | NA | 图像、转录组数据、代谢组数据 | 23例人类IPMN/PDAC组织 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学技术 |
| 82 | 2026-05-27 |
Transcription factors that define the epigenome structures and transcriptomes in microglia
2025-Sep, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2025.104814
PMID:40425139
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研究论文 | 本文通过ATAC-seq、ChIP-seq/CUT&RUN和单细胞RNA-seq等全基因组分析，揭示了决定小胶质细胞表观基因组结构和转录组的转录因子 | 首次确认PU.1、Irf8、Sall1和Smad4四个转录因子作为谱系决定因子形成增强子复合物，共同塑造小胶质细胞身份，并阐明TGF-β在维持小胶质细胞稳态中的关键作用 | NA | 研究定义小胶质细胞表观基因组结构和转录组的转录因子 | 小胶质细胞 | 机器学习 | 神经退行性疾病 | ATAC-seq,ChIP-seq,CUT&RUN,单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据 | NA | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA-seq, 批量ATAC-seq, 批量ChIP-seq | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞测序平台，Illumina NovaSeq高通量测序系统 |
| 83 | 2026-05-27 |
Ontogeny-specific induction of the KMT2A::AFF1-fusion drives development of a distinct CD24 positive pre-leukemic state
2025-09, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-025-02665-9
PMID:40646135
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研究论文 | 本研究通过新型小鼠KMT2A::AFF1融合基因模型，揭示了胚胎期特异性诱导该融合基因驱动CD24阳性前白血病状态形成的机制 | 首次建立精确诱导KMT2A::AFF1致癌融合的胚胎小鼠模型，发现CD24PreProB细胞亚群在胚胎期特异性扩增，并证明其前白血病干细胞特征，且该特征在人类患者中具有可转移性 | 未明确说明 | 探究KMT2A::AFF1融合基因在胚胎期启动白血病发生的早期机制 | KMT2A::AFF1融合基因驱动的婴儿急性淋巴细胞白血病（ALL）的胚胎前白血病状态 | 机器学习 | 淋巴细胞白血病 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型及人类患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 84 | 2026-05-27 |
Expanding canonical cortical cell type markers in the era of single-cell transcriptomics
2025-Aug-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.26.672469
PMID:40909566
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研究论文 | 利用来自19项研究的近50万个高质量单细胞核转录组图谱，量化了皮层细胞类型标记物的表达保真度和背景表达，并开发统计框架识别出具有更高保真度和跨区域一致表达的标记物集 | 首次系统量化了经典皮层细胞类型标记物在不同皮层区域的表达保真度和背景表达，开发了将注释条形码汇总为伪批量图谱的统计框架，并扩展了六大主要脑细胞类型的经典标记物集 | 未明确说明局限性，但可能包括现有数据来源的批次效应、组织样本的偏好性以及亚型特异性标记物在特定区域的验证不足 | 评估和优化人类皮层细胞类型标记物的表达特性，为单细胞转录组数据中的细胞类型注释和验证研究提供更可靠的标记物资源 | 人类皮层细胞类型标记物，涵盖神经元、星形胶质细胞、少突胶质细胞等六种主要脑细胞类型及其亚型 | 单细胞转录组学 | 神经系统疾病 | 单细胞核RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约500,000个单细胞核转录组图谱来自19项研究 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基于单细胞核转录组测序平台 |
| 85 | 2026-05-27 |
Endothelial-like cancer-associated fibroblasts facilitate pancreatic cancer metastasis via vasculogenic mimicry and paracrine signalling
2025-08-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-333638
PMID:40122596
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和多重免疫组化鉴定出一种新型内皮样癌相关成纤维细胞（endoCAFs），并揭示其通过血管生成拟态和旁分泌信号促进胰腺癌转移的机制 | 首次发现并鉴定FAPα+CD144+内皮样癌相关成纤维细胞亚型，阐明其通过CD144-β-catenin-STAT3信号轴同时发挥血管生成拟态和旁分泌双重功能，并开发靶向该亚型的siRNA递送纳米系统 | 基于动物模型和体外实验，尚需在更大规模临床样本中验证endoCAFs的预后价值，且纳米系统的长期安全性与有效性需进一步评估 | 探索胰腺导管腺癌中肿瘤微环境内癌相关成纤维细胞的异质性及其在血管生成拟态中的作用 | 胰腺导管腺癌患者肿瘤组织、细胞系、类器官、原位肿瘤模型及KPC基因工程小鼠模型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、多重免疫组化、细胞因子阵列、RNA测序、免疫沉淀-质谱、染色质免疫沉淀、荧光素酶分析 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 包含前瞻性和回顾性临床队列分析，具体样本量未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 86 | 2026-05-27 |
Concurrent genetic and non-genetic resistance mechanisms to KRAS inhibition in CRC
2025-Aug-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.05.668666
PMID:40799551
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研究论文 | 本研究通过靶向外显子测序和单细胞空间转录组学分析结直肠癌患者对KRAS抑制剂的急性反应及耐药机制 | 首次揭示结直肠癌中KRAS抑制剂耐药的遗传与非遗传机制共存，并发现TBK1可作为克服早期炎症适应阶段的潜在靶点 | 样本量有限，且主要基于患者活检和类器官模型，可能无法完全反映体内肿瘤微环境的复杂性 | 探索结直肠癌对KRAS抑制剂耐药的急性反应及分子机制 | 结直肠癌患者配对活检样本（治疗前、治疗中、进展期）及人类和小鼠类器官模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 靶向外显子测序、单细胞空间转录组学 | NA | 基因测序数据、空间基因表达数据 | 多名结直肠癌患者的配对活检样本 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 87 | 2026-05-27 |
Decoding Cellular Stress States for Toxicology Using Single-Cell Transcriptomics
2025-Aug-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.10.657506
PMID:40766395
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研究论文 | 利用单细胞转录组学分析有毒物质暴露后的细胞应激状态及应激反应通路 | 首次使用TempO-LINC平台在单细胞水平系统解码化学物质诱导的适应性应激反应与终端应激状态之间的转换 | 未提及具体局限性 | 探索单细胞转录组学在毒理学中揭示细胞应激状态动态变化的潜力 | 经依托泊苷、布雷菲德菌素A、放线菌酮、鱼藤酮、叔丁基氢醌、曲格列酮和衣霉素处理的HepaRG细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序 | 广义Jaccard度量聚类 | 单细胞转录组数据 | 约40000个HepaRG细胞 | BioSpyder | 单细胞转录组学 | TempO-LINC | TempO-LINC单细胞转录组分析平台 |
| 88 | 2026-05-27 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal mechanisms of radioresistance and immune escape in recurrent nasopharyngeal carcinoma
2025-Aug, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02253-8
PMID:40691404
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research paper | 通过单细胞和空间转录组学分析，揭示复发性鼻咽癌中放疗抵抗和免疫逃逸的机制 | 首次在复发性鼻咽癌中鉴定出MCAM癌症相关成纤维细胞通过胶原IV-ITGA2-FAK-AKT轴促进肿瘤放疗抵抗，并发现CD8 ZNF683细胞在复发性鼻咽癌中功能降低且细胞毒性较弱，以及B细胞和三级淋巴结构显著减少 | 未提及具体局限性 | 探究复发性鼻咽癌放疗抵抗和免疫逃逸的机制 | 来自24名患者的39个鼻咽癌肿瘤样本 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | NA | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 24名患者的39个肿瘤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium用于单细胞RNA测序，10x Visium用于空间转录组分析 |
| 89 | 2026-05-27 |
ETS1 Orchestrates a Hybrid EMT Program Driving in vivo Metastasis and Immune Evasion
2025-Jul-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.17.665404
PMID:40777467
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析，揭示了ETS1转录因子在头颈鳞癌中驱动混合上皮-间充质转化程序，促进体内转移和免疫逃逸 | 首次发现ETS1作为双重驱动因子，同时调控肿瘤远端转移和免疫逃逸，并确定HSP90抑制剂可作为针对性治疗策略 | 未明确说明局限性 | 研究转录组瘤内异质性如何驱动上气道消化道鳞状细胞癌的转移和免疫逃逸 | 上气道消化道鳞状细胞癌细胞系和患者肿瘤样本 | 机器学习和单细胞转录组学 | 头颈鳞癌 | 单细胞RNA测序 | 转录因子调控网络模型 | 单细胞基因表达数据 | 多个患者队列的肿瘤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 90 | 2026-05-27 |
DGAT: A Dual-Graph Attention Network for Inferring Spatial Protein Landscapes from Transcriptomics
2025-Jul-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.05.662121
PMID:40672156
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研究论文 | 提出双图注意力网络DGAT，从转录组数据推断空间蛋白景观，弥合空间组学中转录组与蛋白质组之间的鸿沟 | 首次利用双图注意力网络从纯转录组空间数据中学习RNA-蛋白质关系，实现空间蛋白质表达推断，无需直接测量蛋白质 | 未提及明确的局限性 | 通过空间转录组数据推断空间蛋白质表达，增强对组织功能环境和细胞状态的理解 | 扁桃体、乳腺癌、胶质母细胞瘤和恶性间皮瘤的空间转录组数据集 | 机器学习 | 乳腺癌, 胶质母细胞瘤, 恶性间皮瘤 | 空间转录组学, 空间CITE-seq | 双图注意力网络（DGAT） | 空间转录组数据 | 包含扁桃体、乳腺癌、胶质母细胞瘤和恶性间皮瘤的多个数据集 | NA | 空间转录组学, 空间CITE-seq | NA | NA |
| 91 | 2026-05-27 |
Single-cell omics in inflammatory bowel disease: recent insights and future clinical applications
2025-07-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-334165
PMID:39904604
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综述 | 本综述总结了单细胞组学技术在炎症性肠病研究中的应用，涵盖溃疡性结肠炎和克罗恩病，并探讨了其在治疗靶点识别、药物反应机制及临床诊断中的潜在价值 | 全面梳理了单细胞组学（尤其是单细胞RNA测序）在揭示IBD相关新细胞类型、细胞功能及并发症机制中的最新进展，并前瞻性地讨论了其向临床实践转化的可能性 | 单细胞组学在临床实施中仍处于早期阶段，存在技术成本高、数据分析复杂及样本量限制等挑战 | 系统综述单细胞组学在IBD研究中的应用成果，并展望其在临床诊断、监测和预后预测中的未来发展 | 炎症性肠病（IBD患者） | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 92 | 2026-05-27 |
Multiplexed single-cell transcriptomics reveals diverse phenotypic outcomes for pathogenic SHP2 variants
2025-Jul-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.30.662374
PMID:40631144
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研究论文 | 结合单细胞转录组分析、蛋白质生物化学、结构分析和细胞生物学，研究致病性SHP2突变如何失调信号通路，揭示不同突变表型结果的多样性 | 首次通过单细胞转录组分析揭示催化活性丧失与基因敲除在表达水平上表型不同，发现机制不同的突变可能产生趋同的表型效应，且同一热点残基的不同突变可产生不同的细胞状态 | 信息不足，无法提取具体局限性 | 解释致病性SHP2突变如何失调Ras/MAPK信号通路，并阐明突变类型与细胞表型之间的关联 | 表达临床不同SHP2变异的细胞 | 机器学习和转录组学 | 努南综合征及相关发育障碍、癌症 | 单细胞转录组分析、蛋白质生物化学、结构分析、细胞生物学 | NA | 单细胞转录组数据 | 表达不同SHP2变异体的细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 93 | 2026-05-27 |
Diminished SUV3 expression and its functional implications in the IFN-enriched monocyte subset of childhood Sjögren's disease
2025-07-01, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keaf193
PMID:40268748
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研究论文 | 研究了儿童干燥综合征中IFN富集单核细胞亚群中SUV3表达降低的功能意义 | 首次揭示SUV3通过线粒体dsRNA介导的PKR激活驱动先天免疫功能障碍的新机制 | 样本量有限（儿童患者），且机制验证主要依赖体外细胞模型 | 探究儿童干燥综合征发病机制中SUV3表达降低的分子和功能影响 | 儿童干燥综合征患者的IFN富集CD14+单核细胞 | 分子生物学 | 儿童干燥综合征 | 单细胞RNA测序、甲醛交联免疫沉淀-qPCR、透射电子显微镜 | NA | 单细胞转录组数据、免疫沉淀定量数据、电子显微镜图像 | cSjD患者和对照组（具体数量未明确提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 94 | 2026-05-27 |
Decoding Cellular Communication Networks and Signaling Pathways in Bone, Skeletal Muscle, and Bone-Muscle Crosstalk Through Spatial Transcriptomics
2025-Jun-12, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6701121/v1
PMID:40585205
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研究论文 | 通过空间转录组学解码骨、骨骼肌及骨-肌交互中的细胞通讯网络和信号通路 | 首次提供了骨和骨骼肌跨组织细胞间通讯的空间分辨图谱，揭示了骨-肌交互中的新配体-受体对和信号通路 | 研究仅基于小鼠模型，且空间转录组学技术在骨-肌交互中的应用仍有限 | 探究骨和骨骼肌中细胞间通讯网络及信号通路在组织稳态和疾病中的作用 | 小鼠股骨及相邻骨骼肌组织 | 数字病理学 | 骨质疏松症、肌肉减少症、代谢综合征 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 小鼠股骨和骨骼肌样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Genomics Visium空间转录组学分析 |
| 95 | 2026-05-27 |
Glucocorticoid receptor suppresses GATA6-mediated RNA polymerase II pause release to modulate classical subtype identity in pancreatic cancer
2025-06-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-334374
PMID:39884837
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序、ATAC-seq、ChIP-seq、HiChIP和PRO-seq等多种组学技术，揭示了糖皮质激素受体（GR）通过抑制GATA6介导的RNA聚合酶II暂停释放来调控胰腺癌经典亚型身份的分子机制 | 首次发现GR激动剂通过直接与GATA6互作抑制经典转录程序，并阐明GATA6通过启动子近端暂停释放控制经典特异性转录的机制 | NA | 揭示控制胰腺导管腺癌（PDAC）亚型身份的转录调控机制 | 胰腺导管腺癌细胞及其经典亚型和基底亚型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序， ATAC-seq， ChIP-seq， HiChIP， PRO-seq， 多光谱成像 | NA | 测序数据， 图像数据 | 原发肿瘤单细胞RNA测序样本， 患者来源异种移植RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA测序， 单细胞ATAC测序， 空间转录组学 | NA | NA |
| 96 | 2026-05-27 |
scE2EGAE: enhancing single-cell RNA-Seq data analysis through an end-to-end cell-graph-learnable graph autoencoder with differentiable edge sampling
2025-05-27, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-025-00616-z
PMID:40426257
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研究论文 | 提出了一种名为scE2EGAE的端到端细胞图可学习图自编码器，通过可微分的边采样增强单细胞RNA-Seq数据分析 | 首次在训练过程中学习细胞图而非使用固定k近邻图，通过直通估计器和Gumbel-Softmax实现可微分边采样 | 未明确说明局限性 | 通过可学习的细胞图构建提升单细胞RNA-Seq数据下游分析性能 | 单细胞RNA测序数据中的细胞关系和基因表达 | 机器学习 | NA | scRNA-Seq | 图自编码器（GAE） | 基因表达数据 | 八个公开的scRNA-Seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 97 | 2026-05-27 |
Reparative immunological consequences of stem cell transplantation as a cellular therapy for refractory Crohn's disease
2025-05-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-333558
PMID:39961646
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研究论文 | 探讨自体造血干细胞移植作为难治性克罗恩病细胞疗法的免疫修复后果 | 首次揭示造血干细胞移植通过作用于髓系细胞尤其是巨噬细胞来修复难治性克罗恩病患者的免疫系统，并发现克罗恩病中造血干细胞亚群存在未被认知的功能异质性 | 样本量较小（n=19），且为单中心研究，可能影响结果的普遍性 | 理解造血干细胞移植后免疫系统重建机制及其作为细胞疗法修复免疫细胞群体的潜力 | 难治性克罗恩病成人患者 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序，质谱流式细胞术 | 小鼠异种移植模型 | 单细胞转录组数据，细胞表型数据 | 19名活动性临床和内镜疾病且对现有治疗无效的克罗恩病成人患者 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞质谱流式 | NA | NA |
| 98 | 2026-05-27 |
Fasting-mimicking diet-enriched Bifidobacterium pseudolongum suppresses colorectal cancer by inducing memory CD8+ T cells
2025-04-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-333020
PMID:39870395
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研究论文 | 研究揭示禁食模拟饮食富集的假长双歧杆菌通过诱导记忆CD8+ T细胞抑制结直肠癌 | 首次揭示禁食模拟饮食通过富集假长双歧杆菌并产生L-精氨酸，促进CD8+ T细胞分化为组织驻留记忆细胞，从而抑制结直肠癌的机制 | 尚未明确假长双歧杆菌在其他癌症模型中的作用，以及L-精氨酸诱导TRM表型的详细分子通路 | 探究禁食模拟饮食通过调节肠道微生物群保护结直肠癌的机制 | 结直肠癌小鼠模型和结直肠癌患者 | 机器学习和生物信息学 | 结直肠癌 | 粪便宏基因组测序, 单细胞RNA测序, 多色流式细胞术, 代谢组学分析 | NA | 基因测序数据, 代谢物数据 | 结直肠癌小鼠模型以及结直肠癌患者样本 | Illumina | 宏基因组测序, 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | 粪便宏基因组测序和单细胞RNA测序平台 |
| 99 | 2026-05-27 |
Large-scale bulk and single-cell RNA sequencing combined with machine learning reveals glioblastoma-associated neutrophil heterogeneity and establishes a VEGFA+ neutrophil prognostic model
2025-04-05, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-025-00640-z
PMID:40188324
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研究论文 | 通过大规模bulk和单细胞RNA测序结合机器学习，揭示GBM相关中性粒细胞异质性并构建VEGFA+中性粒细胞预后模型 | 首次对GBM相关中性粒细胞进行详细亚群分类，并利用117种机器学习组合开发了新的风险模型VNRS，该模型比现有胶质瘤模型具有更高准确性 | 未提及明确局限性 | 探索GBM相关中性粒细胞异质性在肿瘤微环境中的作用，并开发预后模型以指导免疫治疗策略 | GBM相关中性粒细胞及其亚群 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 机器学习模型组合 | 基因表达数据 | 127例IDH野生型GBM样本，共498,747个细胞，其中5,032个中性粒细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 100 | 2026-05-27 |
Recurrent Composite Markers of Cell Types and States
2025-Apr-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.17.549344
PMID:37503180
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research paper | 提出RECOMBINE算法，用于识别重复的复合标记集，以定义和区分层次细胞身份 | RECOMBINE是一种新的算法，能够从单细胞数据中识别重复的复合标记集，相比传统差异基因表达分析等方法，在识别区分性标记方面具有更高准确性，并能在空间转录组学数据中验证 | 标题和摘要未提及局限性 | 开发一种算法，识别可解释的复合标记集，以定义和区分层次细胞类型和状态 | 小鼠视觉皮层、CD8+ T细胞状态、小鼠肠道罕见亚群、来自Tabula Sapiens项目的人类组织 | machine learning | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | RECOMBINE算法 | 基因表达数据 | 小鼠视觉皮层样本、小鼠肠道样本、多种人体组织样本 | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |