单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 41858 篇文献,本页显示第 81 - 100 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
81 2026-07-28
Antipsychotics-Induced Hyposalivation Mediated by Impaired Salivary Ca2+ Signaling
2026-Jul-27, Oral diseases IF:2.9Q1
研究论文 研究抗精神病药物通过损害唾液钙信号导致唾液分泌减少的分子机制 首次发现抗精神病药物通过直接抑制唾液腺中毒蕈碱受体而非多巴胺或血清素受体导致唾液分泌减少 未提及研究局限性 阐明奥氮平、氟哌啶醇和利培酮诱导唾液分泌减少的分子机制 人唾液腺NS-SV-AC细胞和小鼠模型 数字病理学 老年性疾病 单细胞RNA测序 不适用 基因表达数据 不适用 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
82 2026-07-28
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Tumor Heterogeneity and the Microenvironment in Pseudomyxoma Peritonei
2026-Jul-27, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 整合单细胞RNA测序、全外显子测序、批量RNA测序和组织病理学验证,构建了原发性与配对转移性假性腹膜黏液瘤的高分辨率图谱,揭示了肿瘤异质性和微环境特征 首次构建了假性腹膜黏液瘤原发性与配对转移性肿瘤的高分辨率单细胞转录组图谱,鉴定了上皮细胞的不同功能状态(如TFF3黏液分泌相关状态和MACC1恶性相关状态),并发现了转移病变中微环境的重编程,包括POSTN纤维化相关成纤维细胞、CXCL5巨噬细胞及胶原免疫排斥屏障 回顾性观察仅来自三例复发性假性腹膜黏液瘤病例,样本量有限,且抗血管生成治疗的潜力需进一步前瞻性验证 利用单细胞转录组学阐明假性腹膜黏液瘤的肿瘤异质性和微环境生态系统,为开发新型治疗策略提供资源 假性腹膜黏液瘤的原发性及配对转移性肿瘤样本 计算病理学 假性腹膜黏液瘤 单细胞RNA测序、全外显子测序、批量RNA测序、组织病理学验证 NA 基因表达数据(单细胞和批量)、外显子测序数据、组织图像 多例假性腹膜黏液瘤肿瘤样本(含3例复发性病例的回顾性观察) 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞RNA测序平台
83 2026-07-28
Targeting the KCNC3-Dependent Anterior Insular-Lateral Orbitofrontal Cortex Glutamatergic Circuit Attenuates Post-Traumatic Anxiety
2026-Jul-27, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究揭示了创伤性脑损伤后焦虑的关键神经环路与分子机制,发现前岛叶-外侧眶额叶皮层谷氨酸能环路的过度活跃及KCNC3下调是核心病理基础 首次阐明KCNC3依赖的前岛叶-外侧眶额叶皮层谷氨酸能环路在创伤后焦虑中的双向调控作用,并整合fMRI、单细胞测序及光遗传学技术验证机制 主要基于小鼠模型,人类验证仅通过影像学关联,缺乏直接因果验证;KCNC3下游分子通路尚未完全解析 探索创伤性脑损伤后焦虑的神经环路及分子机制 人类创伤性脑损伤患者(额叶损伤伴焦虑)及小鼠额叶创伤模型 神经科学 创伤后焦虑症 BOLD-fMRI、单细胞RNA测序、光遗传学、化学遗传学、c-Fos表达分析 NA 影像数据、基因表达数据、行为学数据 人类患者数据(具体数量未提及);小鼠模型(分焦虑与不焦虑组) NA 单细胞RNA测序 NA NA
84 2026-07-28
Pasta, a Versatile Transcriptomic Clock, Maps the Chemical and Genetic Determinants of Aging and Rejuvenation
2026-Jul-27, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 开发了一种名为Pasta的通用转录组时钟,用于绘制衰老与年轻化的化学和遗传决定因素 采用创新的‘年龄偏移’学习框架构建Pasta,使其在不同组织和数据类型(包括bulk和单细胞RNA-Seq以及微阵列数据)中准确预测相对年龄,并识别了新的年龄调节化合物和遗传扰动 NA 开发一种稳健且广泛适用的人类转录组衰老时钟,以追踪生物年龄并识别衰老和年轻化的调节因子 人类转录组数据,包括多种组织和细胞类型 机器学习 衰老相关疾病 RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq, 微阵列 年龄偏移学习框架 转录组数据 超过三百万个转录组(来自Connectivity Map L1000数据集) NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 微阵列 NA NA
85 2026-07-28
High-Fat Diet Reprograms the Periapical Immune Landscape in a Mouse Model of Apical Periodontitis: A Spatial Transcriptomics Study
2026-Jul-27, International endodontic journal IF:5.4Q1
研究论文 利用空间转录组学揭示高脂饮食如何重塑小鼠根尖周炎模型中的免疫微环境 首次结合空间转录组学与高脂饮食诱导的代谢紊乱模型,系统解析根尖周病中先天免疫细胞(中性粒细胞和巨噬细胞)的空间重编程及其对骨破坏的影响 仅使用雄性C57BL/6小鼠,未纳入雌性个体,且高脂饮食暴露时间为18周,可能无法完全代表长期慢性代谢疾病状态 探究慢性高脂饮食如何通过空间转录组学改变根尖周髓系细胞状态及病变特征 雄性C57BL/6小鼠(n=20,6-8周龄) 数字病理学, 空间转录组学 根尖周炎 空间转录组学(10x Genomics Xenium原位分析), 微型CT NA 空间基因表达数据, 组织切片, 微型CT图像 20只C57BL/6小鼠,分为正常饮食组(n=10)和高脂饮食组(n=10),每只小鼠第一磨牙诱导根尖周炎 10x Genomics 空间转录组学 10x Xenium 10x Genomics Xenium原位空间转录组学分析,重点检测中性粒细胞和巨噬细胞相关基因
86 2026-07-28
DSSMST: A Deterministic State Space Model for Self-Supervised Spatial Domain Identification in Spatial Transcriptomics
2026-Jul-27, Biochemical genetics IF:2.1Q3
研究论文 提出了DSSMST,一个结合确定性状态空间模型、图神经网络和对比学习的自监督学习框架,用于空间转录组学中的空间域识别 引入确定性状态空间模型(DSSM)捕捉空间梯度变化和连续依赖关系,克服了静态图方法的局限性;结合自监督对比学习机制增强潜在嵌入空间,提升识别精度 未提及 准确识别空间转录组学数据中的功能区域 空间转录组学数据集中的空间域 机器学习 NA 空间转录组学 确定性状态空间模型(DSSM)、图神经网络(GNN)、对比学习 基因表达数据 多个代表性空间转录组数据集 NA 空间转录组学 NA NA
87 2026-07-28
Tumor-derived ITGB3 shapes a primed but functionally constrained NK cell state in breast cancer through HLA-E-NKG2A signaling
2026-Jul-27, Molecular biology reports IF:2.6Q3
研究论文 本研究揭示乳腺癌中肿瘤来源的ITGB3通过HLA-E-NKG2A信号塑造一种启动但功能受限的NK细胞状态 首次发现恶性细胞中ITGB3表达通过HLA-E-NKG2A信号轴影响NK细胞状态,并揭示NKG2A抑制性分支的功能贡献 未明确排除NKG2C激活信号的协同作用,且结论基于体外共培养实验,需体内验证 探究乳腺癌中恶性细胞ITGB3表达对NK细胞状态的调控机制及其在免疫逃逸中的作用 乳腺癌肿瘤微环境中的NK细胞和ITGB3阳性/阴性恶性细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据、临床数据 TCGA-BRCA队列(具体样本数未提及),MDA-MB-231和BT-474细胞系 NA 单细胞RNA测序 NA NA
88 2026-07-28
Integrative epidemiological analysis, plasma metabolomics, and single-cell RNA sequencing reveal the protective effects and mechanisms of dietary flavonoids against abdominal aortic aneurysm
2026-Jul-27, Food & function IF:5.1Q1
研究论文 综合流行病学分析、血浆代谢组学和单细胞RNA测序揭示膳食黄酮类化合物对腹主动脉瘤的保护作用及机制 首次综合运用大规模队列研究、血浆代谢组学与单细胞RNA测序技术,揭示原花青素通过调控巨噬细胞中C型凝集素受体信号通路(尤其是CLEC4E)预防腹主动脉瘤的机制 未明确提及局限性,但可能包括观察性研究的残余混杂、代谢物鉴定的覆盖范围有限及机制验证仅基于生信分析 探究膳食黄酮类化合物与腹主动脉瘤风险的关联及相关机制 UK Biobank中188,101名基线无腹主动脉瘤的参与者 机器学习, 自然语言处理 心血管疾病 血浆代谢组学, 单细胞RNA测序, 网络药理学 Cox比例风险模型, 弹性网络回归 代谢组学数据, 单细胞转录组数据 188,101名参与者 NA 单细胞RNA测序, 代谢组学 NA NA
89 2026-07-28
PLOD2 promotes colorectal cancer progression and immune escape via attenuating CD8+ T cells function
2026-Jul-26, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序等技术,揭示PLOD2通过与c-Myc相互作用,促进结直肠癌进展并抑制CD8+ T细胞功能,从而驱动免疫逃逸 首次揭示PLOD2通过与c-Myc直接互作稳定其蛋白,上调PD-L1表达,从而抑制T细胞功能并促进免疫逃逸,并证明靶向PLOD2可增强抗CTLA-4免疫治疗效果 尚未在大量临床样本中验证PLOD2作为生物标志物的可靠性,且PLOD2与c-Myc相互作用的详细分子机制仍需进一步阐明 研究PLOD2在结直肠癌免疫调控中的作用及其对免疫治疗效果的潜在影响 结直肠癌细胞系、小鼠模型以及临床肿瘤组织样本中的CD8+ T细胞 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
90 2026-07-28
Mucosal BCG vaccination reprograms lung interstitial macrophages and enhances antimicrobial defense in mice
2026-Jul-26, Mucosal immunology IF:7.9Q1
研究论文 本文研究黏膜BCG疫苗接种如何重新编程肺间质巨噬细胞并增强小鼠的抗微生物防御能力 首次揭示接种途径决定肺巨噬细胞亚群的重编程方式,其中气管内BCG优先重编程间质巨噬细胞,形成与CD4 T细胞的空间组织免疫枢纽 研究仅在动物模型中进行,尚未在人体中验证 阐明BCG疫苗接种后肺巨噬细胞重塑的机制及其对免疫保护的影响 小鼠肺巨噬细胞,包括肺泡巨噬细胞和间质巨噬细胞 免疫学 结核病、铜绿假单胞菌感染 流式细胞术、单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 基因表达数据、空间转录数据 小鼠样本,具体数量未在摘要中说明 10x Genomics 单细胞RNA测序、空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞RNA测序、10x Visium空间转录组学
91 2026-07-28
Lgals3high Macrophages Orchestrate Neuroinflammation and Extracellular Matrix Remodelling via NF-κB Pathway in Acute Spinal Cord Injury
2026-Jul-26, Brain research bulletin IF:3.5Q2
研究论文 整合单细胞RNA测序与体内外实验,揭示Lgals3high巨噬细胞通过NF-κB通路调控急性脊髓损伤中神经炎症与细胞外基质重塑 首次阐明Lgals3high巨噬细胞(Mac-1)通过Lgals3/NF-κB/p65/Ccl2信号轴驱动急性脊髓损伤后的细胞外基质重塑,并验证GB1107抑制剂通过重塑该轴实现免疫-基质双靶向治疗 未提及 探究Lgals3在急性脊髓损伤相关细胞外基质重塑和神经炎症中的作用机制 SD大鼠急性脊髓损伤模型、LPS+IFN-γ诱导的RAW264.7巨噬细胞 机器学习, 数字病理学 脊髓损伤 单细胞RNA测序, 多重免疫组化, siRNA敲低, 药理学抑制 NA 单细胞转录组数据, 图像 NA(未明确样本数量) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
92 2026-07-28
The immunological landscape of the area postrema in neuromyelitis optica spectrum disorders
2026-Jul-26, Brain pathology (Zurich, Switzerland)
研究论文 通过空间转录组学和免疫组化分析,揭示了视神经脊髓炎谱系疾病中后区与延髓的免疫景观差异,并探讨了视黄酸的保护作用 首次结合空间转录组学与功能注释聚类,系统比较了后区与延髓在水通道蛋白4抗体作用下的免疫反应差异,并发现醛脱氢酶1家族成员A2(Aldh1a2)在后区的高表达及其通过视黄酸发挥保护作用的潜在机制 文中未明确提及研究局限性 探究视神经脊髓炎谱系疾病中后区对水通道蛋白4抗体具有抵抗性的免疫学原因 视神经脊髓炎谱系疾病患者的后区和延髓组织 数字病理学 视神经脊髓炎谱系疾病 免疫组化分析,空间转录组学 NA 图像,基因表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
93 2026-07-28
Intracerebral Hemorrhage Induces Monocyte TNF Signaling in Patients That Is Suppressed by BAF312
2026-Jul-25, Annals of clinical and translational neurology IF:4.4Q1
研究论文 对脑出血患者外周血免疫细胞进行单细胞RNA测序,发现BAF312抑制单核细胞TNF信号且与临床结局相关 首次在脑出血患者中纵向追踪BAF312(Siponimod)对单核细胞TNF信号通路的抑制作用,并揭示单核细胞TNF信号与良好临床结局的正相关关系 样本量较小(仅7例患者),需更大规模研究验证结果的普适性 研究脑出血后一周内免疫应答的动态变化及免疫调节药物BAF312的影响 脑出血患者外周血单核细胞及淋巴细胞 数字病理学 脑血管疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 7例患者(5例BAF312治疗,2例安慰剂) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
94 2026-07-28
GenAR: Next-scale autoregressive generation for spatial gene expression prediction
2026-Jul-25, Medical image analysis IF:10.7Q1
研究论文 提出GenAR,一种多尺度自回归框架,用于从H&E染色图像预测空间基因表达 创新性地将基因表达建模为离散整数计数令牌的生成,并通过从粗到细的分层分解捕捉基因间共表达结构 未明确提及局限性 从H&E染色图像预测空间基因表达,替代成本高昂的空间转录组学技术 H&E染色图像与空间基因表达数据 计算机视觉 不适用 RNA-seq 自回归模型 图像 五个跨不同组织类型的空间转录组数据集 NA 空间转录组学 NA NA
95 2026-07-28
FOSL2-driven SASP in endometrial stroma promotes the inflammation of endometriosis
2026-Jul-24, npj aging IF:4.1Q2
研究论文 本研究探讨FOSL2驱动的子宫内膜基质细胞衰老相关分泌表型(SASP)在子宫内膜异位症炎症中的作用 首次发现转录因子FOSL2异常过表达诱导子宫内膜基质细胞衰老和SASP,并通过NF-κB信号通路促进M2巨噬细胞极化和招募,揭示了FOSL2作为子宫内膜异位症慢性盆腔炎症的新机制 未明确说明 探究子宫内膜异位症中促炎性SASP的机制及其潜在影响 子宫内膜基质细胞(ESCs)及子宫内膜异位症患者的在位内膜和异位病灶 数字病理学 子宫内膜异位症 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA 未明确说明 单细胞RNA测序 NA NA
96 2026-07-28
Immunological Reprogramming in Cardiomyopathies: From Cardiomyocyte Injury to Disease of the Cardiac Immune Ecosystem
2026-Jul-22, Cells IF:5.1Q2
综述 提出心肌病中免疫重编程的统一框架,从心肌细胞损伤转向心脏免疫生态系统疾病的概念 整合心血管免疫学、单细胞和空间转录组学、免疫代谢及系统生物学,提出心肌病免疫重编程的统一框架,并引入免疫型概念以超越传统表型和遗传分类 未明确说明局限性 探讨心肌病中免疫重塑的动态作用并提出免疫生态系统分类新维度 心肌病中的免疫细胞、成纤维细胞、骨髓细胞等免疫生态系统组分 机器学习 心肌病 单细胞转录组学、空间转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
97 2026-07-28
Human primary antibody response to vaccination follows a partially sequential class-switching program with a checkpoint at IGHG2
2026-Jul-21, Cell reports. Medicine
研究论文 本研究通过分析新冠疫苗接种后志愿者的B细胞反应,揭示了抗体类别转换重组遵循部分顺序的程序并在IGHG2处存在检查点 首次通过高频采血和多种测序技术结合,揭示人类初级免疫应答中类别转换重组的有序性和IGHG2检查点的存在,挑战了传统单基因无菌转录的观点 样本量有限,仅针对新冠疫苗初免反应,且研究时间窗口限于接种后10周 阐明人类初级抗体应答中类别转换重组的动态机制 新冠疫苗初免的健康志愿者在接种后前三周内每隔一天采集的样本,包括B细胞受体库、单细胞转录组、免疫表型和IGHC无菌转录本 免疫学 传染病 B细胞受体库测序, 单细胞转录组测序, 免疫表型分析, 无菌转录本分析 NA 测序数据, 转录组数据 新冠疫苗初免的健康志愿者,接种后前三周内高频采样 NA NA NA NA
98 2026-07-28
Multi-omics profiling unveils biological and clinical insights into pulmonary sarcomatoid carcinoma
2026-Jul-21, Cell reports. Medicine
研究论文 通过整合多组学数据(全外显子组测序、转录组、蛋白质组、磷酸化蛋白质组和单细胞RNA测序),对肺肉瘤样癌进行生物学和临床研究 首次对肺肉瘤样癌进行多组学综合分析,发现铁死亡抑制增强特征及靶向FTL和SLC3A2可诱导铁死亡,并鉴定出三种具有不同微环境失调和遗传改变的患者亚型 未说明 揭示肺肉瘤样癌的生物学和临床特征,寻找潜在治疗靶点 86例肺肉瘤样癌患者的肿瘤组织样本及3例接受新辅助化学免疫治疗患者的单细胞样本 数字病理学 肺癌 全外显子组测序、转录组测序、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、单细胞RNA测序 NA 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据、磷酸化蛋白质组数据、单细胞测序数据 86例肺肉瘤样癌患者和3例接受新辅助化学免疫治疗患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
99 2026-07-28
Differential T cell clonal dynamics underlie outcomes to frontline chemoimmunotherapy in advanced gastric cancer
2026-Jul-21, Cell reports. Medicine
research paper 研究晚期胃癌化疗免疫治疗中T细胞克隆动态变化与疗效的关系 首次通过单细胞RNA和TCR测序揭示化疗免疫治疗联合应用的T细胞克隆动态机制 样本量有限(33名患者),且为单中心试验 阐明化疗-免疫疗法协同作用的T细胞动态机制,解释晚期胃癌患者对chemoimmunotherapy的差异反应 来自33名晚期胃癌患者的66,813个T细胞(治疗前、化疗后和免疫治疗后) machine learning 胃腺癌 单细胞RNA测序、T细胞受体测序 NA 单细胞转录组数据、TCR序列数据 33名患者的66,813个T细胞 10x Genomics single-cell RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序和TCR测序
100 2026-07-28
Microglia in Alzheimer's Disease: From Homeostatic Guardians to Multifaceted Drivers of Neuropathology
2026-Jul-18, Cells IF:5.1Q2
综述 综述了小胶质细胞在阿尔茨海默病中从稳态守护者到多面神经病理驱动者的转变 整合单细胞测序和代谢组学的最新进展,提出小胶质细胞可塑性、代谢重编程和细胞间通讯的综合框架 缺乏原始实验数据支持,依赖现有研究的总结 阐明小胶质细胞在阿尔茨海默病进展中的功能转变机制及治疗策略 小胶质细胞及其在阿尔茨海默病中的作用 人工智能 阿尔茨海默病 NA NA 文本 NA NA 单细胞测序 NA NA
回到顶部