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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
81 2026-09-04
Truncated Gpr114-based ultrasound-hypersensitive gene circuit for controlled expression of therapeutics
2026-Aug-05, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究结合AlphaFold3预测和分子动力学模拟,开发出基于截短的Gpr114超声超敏基因回路,用于控制治疗性蛋白表达,并在小鼠模型中验证其对肿瘤的抑制作用。 首次利用AlphaFold3预测和分子动力学模拟筛选出对短脉冲超声高度敏感的Gpr114变体,并将其与合成基因回路融合,实现超声远程控制治疗基因的表达。 文中未明确提及局限性。 开发一种基于超声敏感的基因回路,实现对治疗性基因表达进行远程控制,以增强抗肿瘤免疫治疗的效果。 雌性荷瘤小鼠及其肿瘤组织。 合成生物学 肿瘤 单细胞RNA测序 分子动力学模拟和AlphaFold3预测模型 基因表达数据和单细胞转录组数据 研究使用雌性荷瘤小鼠,样本量未具体说明。 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
82 2026-09-04
Gata3 dosage governs primitive endoderm versus trophectoderm specification in embryonic stem cells
2026-08, EMBO reports IF:6.5Q1
研究论文 本研究揭示Gata3转录因子剂量在小鼠胚胎干细胞中指导原始内胚层与滋养外胚层谱系特化的作用 重新定义Gata3不仅作为滋养外胚层决定因子,还是一个剂量敏感的中心开关,通过剂量依赖的增强子重分布和染色质结合来指导谱系分化 未提供明确的局限性信息 探讨Gata3剂量如何调控胚胎干细胞中原始内胚层与滋养外胚层的互斥谱系特化 小鼠胚胎干细胞 机器学习和生物信息学 NA 单细胞转录组学、全基因组结合分析 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
83 2026-09-04
Acbd7 is essential for preserving hair cell-mediated auditory and vestibular function
2026-Aug, Experimental & molecular medicine
研究论文 该研究发现Acbd7是毛细胞特异表达基因,对维持听觉和前庭功能至关重要,其缺失导致毛细胞退化和功能障碍 首次揭示Acbd7作为脂肪酸代谢因子通过调控钙稳态维持毛细胞功能的关键机制,为内耳疾病提供潜在治疗靶点 研究主要基于小鼠模型,Acbd7在人类毛细胞中的作用尚需验证 阐明毛细胞功能的分子基础,为听觉-前庭障碍的诊疗提供理论依据 小鼠耳蜗类器官和Acbd7缺陷小鼠的听觉及前庭毛细胞 单细胞转录组学、蛋白质组学 听觉-前庭障碍 单细胞RNA测序、转录组分析、蛋白质组分析 NA 基因表达数据、蛋白质数据 小鼠模型,具体样本数未在摘要中说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
84 2026-09-04
The absence of Trim28 in nephron progenitors results in impaired kidney development and function
2026-08-01, Development (Cambridge, England)
研究论文 本研究通过条件性敲除小鼠模型,发现Trim28在肾单位祖细胞中的缺失导致肾脏发育受损和功能异常,影响祖细胞维持和分化。 首次揭示Trim28在肾单位祖细胞中对肾脏发育和功能的关键作用,并发现其影响逆转录元件表达及炎症基因表达模式。 研究未发现肿瘤形成,且具体机制尚需进一步探索。 探究Trim28在肾发生过程中的作用及其对肾脏发育和功能的影响。 Trim28条件性敲除(Trim28Δ/Δ)小鼠的肾单位祖细胞和肾脏组织。 发育生物学 肾母细胞瘤 转录组分析、单细胞RNA测序 条件性基因敲除小鼠模型 转录组数据、单细胞RNA测序数据 Trim28Δ/Δ小鼠及对照小鼠的肾脏样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
85 2026-09-04
NF-κB-active tumors with matrix CAFs and suppressive immunity as key resistance mechanisms to chemoradiation in rectal cancer
2026-Aug, Experimental & molecular medicine
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析了局部晚期直肠癌患者新辅助放化疗前后的配对活检样本,揭示了NF-κB激活的肿瘤细胞、基质癌症相关成纤维细胞和免疫抑制微环境共同驱动治疗耐药的机制。 首次整合多组学单细胞和空间转录组数据,系统性地描绘了直肠癌新辅助放化疗耐药的多细胞生态图景,并发现NF-κB与氧化磷酸化联合评分可作为预测反应状态的强力生物标志物。 样本量较小(26例患者),且缺乏功能验证实验来直接证实基质-上皮相互作用对耐药的驱动作用。 探索局部晚期直肠癌新辅助放化疗耐药的生物标志物和分子机制。 26例中高危局部晚期直肠癌患者的配对肿瘤活检样本。 数字病理学 直肠癌 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 基因表达数据,空间转录组图像 26例中高危局部晚期直肠癌患者,包括配对治疗前和治疗后活检样本 10x Genomics 单细胞RNA测序,空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium NA
86 2026-09-04
Smarcc1 drives optic stalk patterning and optic nerve head astrocyte differentiation
2026-08-01, Development (Cambridge, England)
研究论文 该论文研究了Smarcc1在视柄模式形成和视神经头星形胶质细胞分化中的作用。 首次定义了视柄形成星形胶质细胞的进程,并识别了Smarcc1和Smarcc2在阶段特异性功能上的差异,特别是Smarcc1通过抑制色素基因程序来促进星形胶质细胞祖细胞的产生。 文章可能未涉及Smarcc1在其他神经发育过程中的潜在作用,或仅在小鼠模型中进行研究。 研究Smarcc1在视柄形态发生和星形胶质细胞分化过程中的作用机制。 小鼠模型中的视神经发育相关细胞,包括RPE、视柄祖细胞以及星形胶质细胞。 神经发育生物学 NA 条件性基因敲除、空间转录组学、功能实验 NA 基因表达数据、影像数据、功能数据 未提供具体样本数量,但来自小鼠模型。 未提供 空间转录组学 未提供 未提供
87 2026-09-04
Hematopoietic stem cell aging: a review of transcriptional and multi-omics insights and potential paths for AI integration
2026-Aug, Experimental & molecular medicine
综述 本文综述了造血干细胞衰老的转录组和表观基因组研究进展,讨论了多组学整合和人工智能应用的潜力,并提出建立中央交互式数据库以促进该领域的发展。 本文系统总结了HSC衰老的转录和表观遗传特征,并首次提出将人工智能和机器学习应用于表观遗传时钟、变异检测和轨迹推断等,同时倡导建立综合数据库以整合多组学数据。 现有研究数据分散,跨物种整合有限,多组学及单细胞数据稀缺,阻碍了进展。 梳理HSC衰老的分子特征,探讨人工智能在预测模型、表观时钟等中的应用,并提出一个整合资源的愿景以加速转化研究。 人类和小鼠的造血干细胞,以及相关公共转录组、表观基因组、单细胞和干预数据集。 机器学习 血液疾病 RNA-seq、单细胞RNA-seq、表观基因组测序、多组学 NA 转录组、表观基因组、单细胞、蛋白质组数据 综述中提及多个公开数据集,具体样本量未详细说明 NA 单细胞RNA-seq、转录组、表观基因组 NA NA
88 2026-09-04
Immune hallmarks of recurrent immune checkpoint inhibitor-mediated inflammatory arthritis
2026-Jul-31, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 通过纵向分析免疫检查点抑制剂介导的炎症性关节炎患者的滑液样本,揭示其复发的免疫机制 首次对复发性免疫检查点抑制剂相关关节炎进行纵向单细胞分析,发现效应CD8+ T细胞和PD-1hiCXCL13hiCD4+ T细胞在第一和第二次复发事件中共享克隆扩增的特征 样本量较小(6例患者),且机制研究主要在转录水平,可能需进一步功能验证 阐明复发性免疫检查点抑制剂相关炎症性关节炎的细胞和分子机制,特别是免疫记忆反应的作用 免疫检查点抑制剂相关炎症性关节炎患者(首次和第二次发作)的滑液细胞 免疫学 自身免疫性关节炎 单细胞RNA测序、单细胞TCR测序、单细胞BCR测序、流式细胞术 NA 单细胞转录组和单细胞免疫组库数据及流式细胞术数据 6例ICI-IA患者的12份滑液样本,以及6例非癌症骨关节炎患者的滑液样本作为阴性对照 NA 单细胞RNA测序、单细胞TCR测序、单细胞BCR测序 NA NA
89 2026-09-04
Longitudinal analysis reveals myeloid cell contributions to murine neuroPASC pathogenesis
2026-07-30, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 对SARS-CoV-2感染小鼠进行纵向单细胞RNA测序分析,揭示髓系细胞在神经PASC发病机制中的贡献 首次通过纵向单细胞RNA测序分析,绘制了神经PASC期间大脑髓系免疫动态的高分辨率图谱,并揭示了微胶质细胞在维持慢性神经炎症中的核心作用 由于是基于小鼠模型的研究,结果可能不完全适用于人类神经PASC 探究神经PASC中髓系细胞(特别是微胶质细胞)对神经炎症起始和持续的作用机制 SARS-CoV-2感染小鼠的大脑免疫细胞 单细胞转录组学 神经PASC(COVID-19后神经精神后遗症) 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 来自0、6、30和100天感染后时间点的脑免疫细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
90 2026-09-04
Role and prognostic value of N6-methyladenosine RNA modification regulators in glycolytic reprogramming during sepsis
2026-Jul-30, Journal of intensive care IF:3.8Q1
研究论文 本研究整合多个脓毒症转录组队列数据,分析m6A RNA修饰调节因子在脓毒症中的表达及其与糖酵解重编程和预后的关联。 首次系统阐明ALKBH5相关m6A修饰与脓毒症糖酵解重编程的关联,并构建了基于m6A相关基因的预后模型。 研究结果基于生物信息学分析,缺乏前瞻性实验验证,且预后模型的外部可重复性不完全,需在更大临床队列中验证。 探讨脓毒症中m6A调节因子表达特征及其与糖酵解重编程的关联,并评估其预后价值。 脓毒症患者转录组数据、ALKBH5敲除模型、MeRIP-seq数据及单细胞RNA测序数据。 机器学习和生物信息学 脓毒症 转录组测序、MeRIP-seq、单细胞RNA测序、基因敲除模型 LASSO-Cox回归模型、CIBERSORT免疫浸润分析 转录组测序数据、MeRIP-seq数据、单细胞RNA-seq数据 多个GEO队列(GSE65682, GSE95233, GSE54514, GSE198316, GSE224650, GSE225143, GSE147363),具体样本数未在摘要中提供。 NA bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、MeRIP-seq NA NA
91 2026-09-04
Single-cell profiling of natural killer/T-cell lymphoma reveals stratified immune features and potential therapeutic implications
2026-07-29, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过对63个样本进行单细胞RNA测序并整合空间转录组、批量转录组、蛋白质组和代谢组数据,绘制了自然杀伤/T细胞淋巴瘤的分子图谱,揭示了四种分子亚型及其独特的免疫和代谢特征,为患者分层和治疗策略提供见解 首次在自然杀伤/T细胞淋巴瘤中整合单细胞转录组、空间转录组、蛋白质组及代谢组等多组学数据,系统解析肿瘤间和肿瘤内异质性,并定义了与不同分子和免疫特征关联的四种功能元程序 基于标题和摘要,未明确提及研究的具体局限性 解析自然杀伤/T细胞淋巴瘤的肿瘤细胞异质性及其与免疫微环境的相互作用,并探索不同分子亚型在治疗应答上的潜在意义 自然杀伤/T细胞淋巴瘤患者的肿瘤样本及肿瘤微环境中的免疫细胞等 单细胞组学 自然杀伤/T细胞淋巴瘤 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量转录组学、蛋白质组学、代谢组学 NA 单细胞转录组、空间转录组、转录组、蛋白质组、代谢组数据 63个样本 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量转录组学 NA NA
92 2026-09-04
Multi-omic analysis of androgen-deprived human testes reveals Sertoli cell regulation and niche reprogramming
2026-07-29, Nature communications IF:14.7Q1
research paper 该研究利用去雄激素的人睾丸组织,构建了整合单核RNA测序、单细胞ATAC测序和空间转录组的多组学图谱,揭示了支持细胞的功能调控和微环境重编程机制 首次在人类去雄激素模型中构建多组学图谱,发现NRG2作为雄激素依赖的微环境因子促进精原细胞增殖,并发现去雄激素导致间质细胞异位表达WT1并重编程为支持细胞样状态 研究基于去雄激素组织,可能无法完全反映自然衰老或疾病状态下的变化,且涉及伦理和技术限制,样本数量有限 探究雄激素调控成人睾丸功能的分子机制,为雄激素相关性不育和生殖疾病的治疗提供资源 去雄激素处理的人成人睾丸组织,研究其中的支持细胞、间质细胞和精原细胞 digital pathology 不育 单核RNA测序、单细胞ATAC测序、空间转录组 NA 基因表达数据、开放染色质数据、空间表达数据 未提供具体样本量 NA single-cell RNA-seq NA NA
93 2026-09-04
LACC1 attenuates LPS-induced acute lung injury by inhibiting inflammatory response in alveolar macrophage through LPAR3/PI3K/AKT/mTOR signaling pathway
2026-Jul-23, Biomarker research IF:9.5Q1
研究论文 本研究探讨LACC1在脂多糖诱导的急性肺损伤中的作用及其通过LPAR3/PI3K/AKT/mTOR信号通路调节肺泡巨噬细胞炎症反应的机制 首次揭示LACC1在肺泡巨噬细胞中通过LPAR3/PI3K/AKT/mTOR信号通路减轻急性肺损伤炎症反应,并利用单细胞RNA测序和条件性敲除小鼠模型进行验证 研究主要基于体外细胞和动物模型,缺乏临床样本验证,且未深入探讨LACC1调控LPAR3表达的具体分子机制 阐明LACC1在LPS诱导的急性肺损伤中的保护作用及其潜在的调控机制 急性肺损伤患者的支气管肺泡灌洗液巨噬细胞、LACC1条件性敲除小鼠、THP-1细胞 免疫学与炎症研究 急性肺损伤 单细胞RNA测序、RNA测序、Western blot、qRT-PCR NA 基因表达谱、图像 涉及多组小鼠模型和体外细胞,具体数目未提供 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
94 2026-09-04
Mechanistic study on comorbidities of kidney stones and sepsis using transcriptome sequencing combined with single-cell spatial transcriptome sequencing
2026-Jul-17, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 本研究利用转录组测序和单细胞空间转录组测序技术探究肾结石与脓毒症共病的分子机制,并筛选关键基因 首次结合转录组、单细胞RNA测序和空间转录组数据,系统分析肾结石与脓毒症共病的分子调控网络,并鉴定出5个关键基因及其细胞类型特异性表达模式 研究基于公共数据库数据,缺乏实验验证;样本量可能有限;分子对接和药物预测结果需要进一步体内外实验证实 探索肾结石与脓毒症共病的分子调控网络,筛选关键基因并阐明其在疾病进展中的作用 肾结石和脓毒症患者的转录组、单细胞RNA测序及空间转录组数据 转录组学 肾结石、脓毒症 转录组测序、单细胞RNA测序、空间转录组测序 随机森林、LASSO回归 转录组数据、单细胞测序数据、空间转录组数据 未在标题和摘要中提供具体样本数量 NA 转录组测序、单细胞RNA测序、空间转录组测序 NA 数据来源于基因表达综合数据库,具体平台未说明
95 2026-09-04
Intervening in p53-Induced Death Domain Protein 1 to Decrease Regulatory T Cell Recruitment Boosts the Effectiveness of Radiofrequency Ablation Combined With Anti-Programmed Cell Death Protein-1 Therapy in Hepatocellular Carcinoma
2026-Jul-03, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究探讨了在肝细胞癌中干扰p53诱导死亡结构域蛋白1以减少调节性T细胞招募,从而增强射频消融联合抗程序性细胞死亡蛋白-1疗法的疗效 首次揭示p53诱导死亡结构域蛋白1通过caspase-2/鼠双微体2轴增强p53表达、促进转化生长因子-β1分泌并驱动T细胞分化,从而连接不完全消融与免疫抑制微环境,为联合治疗提供新靶点 研究主要基于小鼠模型和回顾性临床数据,缺乏前瞻性临床试验验证,且机制研究侧重单一靶点,可能需要更大样本和多方验证 识别不完全射频消融后残余肿瘤细胞与免疫抑制微环境之间的肿瘤内在分子联系,以改善治疗结果 肝细胞癌患者和小鼠模型中的肿瘤细胞及调节性T细胞 机器学习、数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序、转录组分析、蛋白质印迹、流式细胞术、酶联免疫吸附试验、免疫组织化学/免疫荧光 加权基因共表达网络分析(WGCNA) 转录组数据、蛋白质表达、细胞影像 回顾性临床队列及小鼠模型,具体样本数量未在摘要中说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
96 2026-09-04
Quantitative molecular cartography of emergency myelopoiesis reveals conserved modules of hematopoietic activation
2026-Jul-02, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 该研究通过单细胞RNA测序定量描绘紧急髓系造血的分子图谱,揭示造血干细胞和祖细胞激活的保守模块 提出了可推广的细胞注释方法HemaScribe和精细化的造血分化定量模型HemaScape,并首次系统比较多种紧急髓系造血诱导剂,发现跨炎症挑战保守的髓系祖细胞激活模块,且该模块在人类中保守并可预测急性髓系白血病预后 摘要未提及局限性 探究不同紧急髓系造血诱导剂如何通过共享或独特的分子机制调控造血干细胞和祖细胞 小鼠造血干细胞和祖细胞(HSPCs),以及人类成人和儿童急性髓系白血病相关数据 单细胞转录组学、造血生物学 急性髓系白血病(成人和儿童) 单细胞RNA测序(scRNA-seq) HemaScribe(细胞注释方法),HemaScape(造血分化定量模型) 单细胞转录组数据 多种小鼠HSPCs样本,以及人类急性髓系白血病样本的跨验证数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
97 2026-09-04
KRAS inhibition is an effective therapy for appendiceal adenocarcinoma
2026-Jul-02, Journal of hematology & oncology IF:29.5Q1
研究论文 研究评估KRAS抑制剂(MRTX1133和RMC-6236)在阑尾腺癌器官样和PDX模型中的疗效,并在15例患者队列中验证临床效果 首次在阑尾腺癌中验证KRASG12D和泛KRAS抑制剂的疗效,结合多组学分析揭示肿瘤微环境重塑和先天免疫激活机制 未明确提及局限性,可能包括样本量小、仅短期观察等 评估KRAS抑制剂在阑尾腺癌中的临床前和转化相关性 阑尾腺癌的KRAS突变器官样、PDX模型及15例患者 精准肿瘤学 阑尾腺癌 多组学分析、基因集富集分析、单细胞RNA测序、器官样培养、PDX模型 器官样模型、PDX模型、细胞活力测定 基因组、转录组、病理图像、临床疗效数据 15例患者,多器官样和PDX模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
98 2026-09-04
Characteristics of Splenic CD8αβ+ γδT Cells in Plasmodium yoelii Infection
2026-Jul, Parasite immunology IF:1.4Q3
研究论文 本研究探讨了约氏疟原虫感染小鼠脾脏中CD8αβ+ γδT细胞的特征,发现其活化与功能增强,可能参与抗疟疾免疫应答。 首次详细表征了疟疾感染中CD8αβ γδT这一特定亚群的表型和功能特性,揭示了其向IFN-γ产生型极化并上调DNA复制修复相关基因。 研究基于小鼠模型,未探讨CD8αβ γδT细胞在人疟疾感染中的确切功能;样本量有限,且未进行功能验证实验。 明确CD8αβ γδT细胞在约氏疟原虫感染中的频率变化、表型特征和功能作用及潜在机制。 约氏疟原虫感染的C57BL/6小鼠脾脏中的CD45+淋巴细胞,特别是CD8αβ γδT细胞。 免疫学 疟疾 流式细胞术、单细胞RNA测序 (scRNA-seq) NA 细胞(免疫细胞) 共使用若干只雌性C57BL/6小鼠(具体数量未在摘要中指定) NA 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) NA NA
99 2026-09-04
Therapeutic effects of Icariside II on radiation cystitis: revealing the mechanistic role of the FN1/Itgαvβ6-PI3K/AKT signaling pathway using single-cell RNA sequencing
2026-Jul, International journal of surgery (London, England)
研究论文 利用单细胞RNA测序揭示放射性膀胱炎的细胞异质性,并阐明淫羊藿次苷II通过调节FN1/Itgαvβ6-PI3K/AKT信号通路发挥治疗作用的机制 首次通过单细胞RNA测序描绘放射性膀胱炎的膀胱细胞图谱,识别出16种细胞类型,并发现FN1-Itgαvβ6相互作用是纤维化进展的关键驱动因素,同时验证了淫羊藿次苷II作为潜在治疗药物的作用 该研究基于大鼠模型,其发现需要进一步在人类样本中验证;未提供充分的体内疗效数据,且对ICA II的长期安全性评估不足 阐明放射对膀胱不同细胞类型的影响,并探究淫羊藿次苷II在放射性膀胱炎治疗中的保护作用及潜在分子机制 放射性膀胱炎大鼠模型中的膀胱细胞,以及淫羊藿次苷II对细胞间相互作用的影响 单细胞测序 放射性膀胱炎 单细胞RNA测序、免疫共沉淀、分子动力学模拟 NA 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 实验使用大鼠模型,具体样本数量未在摘要中提及 NA 单细胞RNA-seq NA NA
100 2026-09-04
RUNX3+ basal-like malignant cells: architects of an immunosuppressive microenvironment in bladder cancer: a comprehensive bioinformatics analysis of single-cell and spatial transcriptomics
2026-Jul, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究通过对膀胱癌单细胞和空间转录组数据进行综合分析,揭示了RUNX3+基底样恶性细胞在免疫抑制微环境中的重要作用及其作为预后标志物的潜力 整合多个公开的单细胞RNA-seq数据集,并结合单核和空间转录组数据验证,首次识别出RUNX3调控的基底样恶性细胞亚群及其通过MIF-CD74信号通路与免疫细胞互作的机制 研究主要基于公开数据集和生信分析,缺乏实验验证的深度,且样本来源的异质性可能影响结果的普适性 利用单细胞和空间转录组学技术,深入解析膀胱癌的细胞异质性,识别可靠的预后生物标志物,并为个体化治疗策略提供依据 膀胱癌和正常样本中的恶性上皮细胞、免疫细胞(如CD8 T细胞、IL7R+初始T细胞、FCN1+单核细胞)及其微环境 生物信息学分析、单细胞转录组学、空间转录组学 膀胱癌 单细胞RNA测序、单核RNA测序、空间转录组测序、RNA荧光原位杂交 NA 基因表达数据(单细胞、单核、空间) 62个膀胱癌和正常样本,超过530,000个细胞 10x Genomics, Illumina, NA 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 空间转录组学 10x Chromium, Illumina NovaSeq, 10x Visium 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium Spatial Transcriptomics
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