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当前共找到 43267 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-09-13 |
CXCL8 Enhances Malignancy of GBM via TNFα-NFκB Mediated Suppression of Ferroptosis
2026-Sep, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-026-05759-x
PMID:42262679
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研究论文 | 该研究揭示了CXCL8通过TNFα-NFκB信号通路抑制铁死亡，从而增强胶质母细胞瘤恶性程度 | 首次阐明CXCL8-TNFα-NFκB轴通过抑制铁死亡调控胶质母细胞瘤肿瘤微环境，并结合单细胞和空间转录组学揭示MES样细胞与CXCL8+肿瘤相关巨噬细胞在铁死亡区域的空间共定位 | 研究主要基于生物信息学分析和体外验证，缺乏体内动物实验和临床大样本验证 | 探究铁死亡相关基因在胶质母细胞瘤中的异质性及其与趋化因子的关系，阐明CXCL8调控铁死亡的分子机制 | 胶质母细胞瘤（GBM）肿瘤微环境中的肿瘤细胞和肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学, 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 转录组测序, 单细胞分析, 空间转录组学, 基因集富集分析, 透射电子显微镜 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 62 | 2026-09-13 |
The development of novel chimeric antigen receptor gamma-delta T cells against multiple myeloma and single-cell RNA sequencing analysis
2026-Sep, British journal of haematology
IF:5.1Q1
DOI:10.1111/bjh.70660
PMID:42438316
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研究论文 | 该研究开发了靶向BCMA的新型CAR γδ T细胞用于治疗多发性骨髓瘤，并通过功能实验和单细胞RNA测序分析其与CAR αβ T细胞的差异。 | 首次系统性地开发了一系列靶向BCMA的新型CAR γδ T细胞，并通过单细胞转录组分析揭示了CAR γδ T细胞增殖能力低下是限制其体内持久性的关键瓶颈。 | CAR γδ T细胞体外增殖能力较低，体内细胞毒性持久性不如CAR αβ T细胞，需要更高剂量才能达到相当的肿瘤控制效果。 | 开发靶向BCMA的新型CAR γδ T细胞并评估其治疗多发性骨髓瘤的潜力，通过与CAR αβ T细胞的对比以及单细胞转录组分析揭示其功能特点。 | 多发性骨髓瘤细胞及靶向BCMA的CAR γδ T细胞和CAR αβ T细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 63 | 2026-09-13 |
Mechanisms of Hericium erinaceus polysaccharides on chronic atrophic gastritis: An integrated study of network pharmacology, molecular docking, in vivo experiments, and scRNA-seq
2026-Sep, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.153556
PMID:42457054
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研究论文 | 本研究通过网络药理学、分子对接、体内实验和单细胞RNA测序，系统探讨了猴头菇多糖对慢性萎缩性胃炎的治疗作用及其分子机制 | 首次将网络药理学预测、分子对接模拟、体内实验验证与单细胞RNA测序分析相结合，系统阐明猴头菇多糖通过调控IKKβ/NF-κB信号通路发挥抗炎抗氧化作用的结构依赖性机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证；单细胞RNA测序数据来源于公共数据库的再分析，而非本研究直接产生的数据 | 评估猴头菇多糖对慢性萎缩性胃炎的治疗效果并阐明其作用机制 | 慢性萎缩性胃炎小鼠模型及猴头菇多糖 | 机器学习 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 网络药理学, 分子对接, 转录组学 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 64 | 2026-09-13 |
Multiancestry genome-wide association and multiomics analyses elucidate spatiocellular features of multiple sclerosis genetics
2026-Sep, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-026-02741-5
PMID:42706308
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研究论文 | 该研究通过跨祖先全基因组关联分析及多组学整合，揭示了多发性硬化症遗传风险的空间细胞特征 | 首次在东亚人群中开展MS大规模GWAS并发现11q24区域人群特异性风险变异，通过跨4个祖先群体的荟萃分析鉴定了22个新易感位点，并创新性地整合单细胞/单核RNA测序与空间转录组学揭示MS遗传风险在CD4辅助性T细胞谱系、调节性T细胞及内皮细胞中的富集及病变区域的空间时间异质性 | 摘要中未明确说明研究局限性 | 解析多发性硬化症的遗传基础及其在不同人群和空间细胞层面的特征 | 多发性硬化症患者及健康对照的外周血单核细胞和皮层下病灶组织 | 机器学习 | 多发性硬化症 | GWAS、单细胞RNA测序、单核RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因组数据、转录组数据、图像 | 日本人群688例MS患者和205199例对照；跨人群荟萃分析共29374例患者和1843563例对照，来自4个祖先群体 | NA | 单细胞RNA-seq、单核RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 65 | 2026-09-13 |
Spatially guided in vivo single-cell functional genomics of postnatal heart
2026-Sep, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-026-00861-z
PMID:42706440
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研究论文 | 本文通过整合单核RNA测序和基于图像的空间转录组学，构建了出生后小鼠心脏的高分辨率时空图谱，并开发了PIP-seq平台进行体内单细胞功能基因组学研究 | 开发了PIP-seq（基于探针的可检测indel的Perturb-seq）高通量平台，能够在固定细胞核中检测sgRNA身份、推断基因编辑并分析转录组；结合空间转录组学和单细胞功能基因组学，在体内规模上功能验证了心脏成熟调控因子 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类心脏中验证；PIP-seq技术的广泛应用可能需要进一步优化；空间转录组学的分辨率可能限制了对某些细胞间相互作用的解析 | 理解空间组织和细胞间相互作用如何塑造基因调控程序，解码出生后心脏成熟的时空协调机制 | 出生后小鼠心脏 | 空间转录组学, 单细胞功能基因组学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序, 空间转录组学, Perturb-seq, CRISPR基因编辑 | NA | 图像, 文本 | NA | 10x Genomics | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3'（用于单核RNA测序）, 10x Visium（用于空间转录组学） |
| 66 | 2026-09-13 |
Spatially guided translation from histology images to transcriptomic profiles using foundation model-driven contrastive learning
2026-Sep, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014762
PMID:42709893
|
研究论文 | 该文章提出了FOCST框架，利用组织病理学基础模型和空间引导对比学习从组织学图像预测空间转录组表达谱 | 首次将大规模组织病理学基础模型UNI与空间引导对比学习相结合，通过图神经网络融入位置信息，实现从组织学图像到空间转录组数据的跨模态预测与插补 | 基准测试仅使用了6张图像，样本量较小，需要在更大规模数据集上进一步验证 | 降低高质量空间转录组数据生成的高昂成本和冗长流程，通过深度学习方法从组织学图像高效预测空间转录组表达谱 | 乳腺癌组织样本的组织学图像及对应的空间转录组数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 基础模型（UNI），对比学习，图神经网络（GNN） | 图像 | 6张图像 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 67 | 2026-09-13 |
An immune exhaustion signature predicts prognosis and identifies patients with diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) who derive preferential benefit from chimeric antigen receptor (CAR)-T cell therapy
2026-Sep, Cancer pathogenesis and therapy
DOI:10.1016/j.cpt.2026.02.002
PMID:42724625
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研究论文 | 该研究通过整合多个弥漫大B细胞淋巴瘤（DLBCL）队列的转录组和临床数据，构建了一个五基因免疫耗竭相关预后评分（IERPS），并发现该评分可预测预后及CAR-T细胞治疗的获益人群 | 首次基于免疫耗竭特征构建了DLBCL的五基因预后评分（IERPS），并揭示了该评分与CAR-T细胞治疗疗效之间的显著交互作用，表明CAR-T治疗可能克服高IERPS带来的不良预后 | 单细胞RNA测序分析仅纳入4个样本，纵向验证队列为描述性案例研究且样本量小，需要更大规模的前瞻性研究验证IERPS的临床实用性 | 表征DLBCL中耗竭性肿瘤微环境的分子特征，构建预后模型，并评估其对CAR-T细胞治疗反应的预测价值 | 弥漫大B细胞淋巴瘤（DLBCL）患者，包括多个公共队列及256例复发/难治性患者队列 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 转录组测序、单细胞RNA测序 | LASSO-Cox回归 | 转录组数据、临床数据、单细胞数据 | 多个DLBCL队列（TCGA、GSE181063、GSE10846、GSE248835、GSE182434），256例复发/难治性患者，4个单细胞RNA测序样本，以及一个纵向队列 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 68 | 2026-09-13 |
Evolution of complex organelles in ocelloid-bearing dinoflagellates
2026-Sep, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgag287
PMID:42725094
|
研究论文 | 通过对12个新增物种的单细胞转录组测序，研究眼点藻类双鞭毛虫中复杂细胞器（眼点体和刺丝囊）的演化与功能差异 | 新增了12个物种（包括两个此前未采样的属）的单细胞转录组数据，覆盖亚北极和热带环境，首次将warnowiids分为具刺丝囊（armed）和不具刺丝囊（unarmed）两大亚支，并发现眼点体大小、形状、位置和基因表达在两者间存在差异 | 此前相关发现仅基于5个属的18个细胞，本研究虽扩展至更多物种但仍受限于warnowiids的稀有性和难以培养的特性，样本量依然有限，功能验证不足 | 探究warnowiids双鞭毛虫中眼点体和刺丝囊等复杂细胞器的功能、演化关系及其与能量和营养策略的关联 | warnowiid双鞭毛虫（包括12个新增物种，来自两个此前未采样的属，采集自亚北极和热带环境） | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 12个新增物种的单细胞转录组（加上此前18个细胞共5个属的数据） | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 69 | 2026-09-13 |
Ferroptosis in Low-Density Neutrophils of Tuberculosis Patients Suppresses Bactericidal Function
2026-Sep, Clinical and experimental pharmacology & physiology
DOI:10.1111/1440-1681.70155
PMID:42725380
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验分析了结核病患者低密度中性粒细胞的免疫特征，发现其铁死亡和NETosis通路激活导致杀菌功能受损 | 首次系统揭示结核病患者低密度中性粒细胞中铁死亡通路的激活及其对杀菌功能的抑制作用，并证明铁死亡抑制剂Ferrostatin-1可恢复其杀菌能力 | 未提及具体样本量，单细胞测序分析的细胞数量未明确，功能实验仅使用BCG而非结核分枝杆菌，临床转化应用尚需进一步验证 | 分析结核病患者低密度中性粒细胞的免疫学特征及其在抗结核免疫中的作用机制 | 活动性结核病患者和健康对照者的外周血低密度中性粒细胞 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序，实时定量PCR | NA | 文本，图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 70 | 2026-09-13 |
scASprofiler: profiling single-cell RNA splicing with a deep convolutional generative network
2026-Sep-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag497
PMID:42725920
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研究论文 | 开发了scASprofiler，一种深度卷积生成网络，用于从scRNA-seq数据中分析单细胞RNA可变剪接 | 利用掩码感知的VAE-GAN生成细胞进行连接读数缺失值插补，减少过平滑并保留生物学异质性 | 仅针对剪接连接覆盖稀疏问题，可能在其他数据类型或平台上的适用性有限 | 克服scRNA-seq数据中稀疏剪接连接覆盖的限制，实现单细胞分辨率下的可变剪接分析 | 单细胞RNA测序数据中的可变剪接事件 | 机器学习, 生物信息学 | NA | scRNA-seq | 深度卷积生成网络, VAE-GAN | 文本/计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 71 | 2026-09-13 |
Multi-omics characterization of a GPRC5A+ epithelial subpopulation associated with malignant features in colorectal cancer
2026-08-31, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08886-5
PMID:42723078
|
研究论文 | 该研究通过整合大规模多组学数据（bulk RNA-seq、scRNA-seq、空间转录组学和蛋白质组学），鉴定并表征了结直肠癌中一个与恶性特征相关的GPRC5A+上皮细胞亚群 | 构建了分期分层的单细胞图谱，解析出11个恶性上皮亚群，首次将GPRC5A+Epi定义为晚期富集且具有EMT、缺氧和炎症程序的恶性上皮状态，并揭示了其与POSTN+成纤维细胞的潜在互作及与trametinib敏感性的关联 | GPRC5A+Epi与POSTN+成纤维细胞的功能性互作、GPRC5A与trametinib的直接结合以及治疗学意义尚未经实验验证，属于假设生成性发现 | 解析结直肠癌中与恶性特征相关的上皮细胞程序及其细胞背景，鉴定关键标志物和潜在治疗靶点 | 结直肠癌样本（包括患者组织和细胞系） | 数字病理学 | 结直肠癌 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组学, 蛋白质组学, CRISPR功能实验, EMT免疫印迹, 异种移植, TF分析（SCENIC/JASPAR/ChIP-qPCR）, 药物反应预测（OncoPredict）, 细胞敏感性实验, 分子对接/分子动力学模拟 | NA | 图像, 文本 | 2,993例结直肠癌样本，包括bulk RNA-seq（n=2,568；两个OS/RFS队列）、scRNA-seq（281,961个细胞/152个标本）、空间转录组学（n=6）和蛋白质组学（n=267） | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics, proteomics | NA | NA |
| 72 | 2026-09-13 |
DPEP1 promotes pulmonary fibrosis by regulating arachidonic acid metabolism
2026-Aug-31, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-2026-1666
PMID:42724184
|
研究论文 | 该研究通过公共转录组数据和小鼠模型揭示DPEP1通过调控花生四烯酸代谢和内皮炎症反应促进肺纤维化，并评估DPEP1抑制剂西司他丁钠的治疗潜力 | 首次确立DPEP1在特发性肺纤维化中的致病作用，揭示其通过花生四烯酸代谢和内皮炎症反应促进肺纤维化的新机制，并提出靶向DPEP1的治疗策略 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究DPEP1在特发性肺纤维化发病机制中的作用及其涉及花生四烯酸代谢和内皮炎症反应的潜在机制 | 特发性肺纤维化患者血清和肺组织样本、博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | bulk RNA测序、单细胞RNA测序、ELISA、RT-qPCR、免疫组化、免疫荧光、Western blotting | 博来霉素诱导的小鼠肺纤维化模型 | 转录组数据、图像、文本 | NA | NA | bulk RNA-seq、single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 73 | 2026-09-13 |
Midkine restrains T-cell mediated anti-tumor immunity by suppressing macrophage M1 polarization in lung adenocarcinoma
2026-Aug-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2026-1204
PMID:42724375
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析和体外共培养模型，揭示了MDK通过抑制巨噬细胞M1极化从而抑制T细胞介导的抗肿瘤免疫，在肺腺癌免疫抑制微环境中发挥关键调控作用 | 首次系统阐明MDK在肺腺癌中通过同时抑制细胞毒性CD8+ T细胞扩增、TH1极化和巨噬细胞M1极化来发挥免疫抑制功能，并证明MDK中和抗体可有效逆转这些免疫抑制效应 | 研究主要基于体外共培养模型和单细胞测序数据分析，缺乏体内动物实验验证；样本量有限，未进行大规模临床队列验证MDK作为治疗靶点的临床转化潜力 | 探究MDK在肺腺癌中的免疫调节作用，并评估MDK中和抗体的治疗潜力 | 肺腺癌细胞系、非小细胞肺癌细胞系、人外周血单个核细胞（PBMCs） | digital pathology | lung cancer | single-cell sequencing, flow cytometry, LDH release assay, multiplex cytokine measurement | NA | 单细胞测序数据、流式细胞术数据 | 多种非小细胞肺癌细胞系及人外周血单个核细胞（PBMCs），具体数量未提及 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 74 | 2026-09-13 |
Single-cell transcriptomic analysis identifies decreased CEBPB and PAX8 expression associated with immune landscape differences between medullary and papillary thyroid carcinoma
2026-Aug-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2026-1098
PMID:42724389
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研究论文 | 通过对一例甲状腺髓样癌和一例甲状腺乳头状癌组织进行单细胞RNA测序，并结合RT-qPCR和免疫组化验证，揭示了MTC与PTC之间转录和免疫景观的差异 | 首次在单细胞分辨率上探索性地表征甲状腺髓样癌与甲状腺乳头状癌之间的转录和免疫差异，发现CEBPB和PAX8下调可能与MTC免疫监视受损相关 | 样本量极小，仅包含一例PTC和一例MTC组织，属于探索性初步研究，结果需要更大样本量验证 | 在单细胞分辨率上探索性地表征甲状腺乳头状癌和甲状腺髓样癌之间潜在的转录和免疫差异 | 一例甲状腺乳头状癌组织和一例甲状腺髓样癌组织，以及TPC-1和TT细胞系 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 免疫组化 | NA | 图像, 文本 | 2例组织样本（1例PTC和1例MTC），共19334个基因和0.11亿个UMI，来自MTC样本的10039个细胞和PTC样本的9295个细胞，分为22个聚类，注释为10种细胞谱系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 75 | 2026-09-13 |
The role of KIAA1467 in breast cancer: insights from pan-cancer and single-cell sequencing analysis
2026-Aug-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2026-1233
PMID:42724418
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研究论文 | 该研究通过泛癌和单细胞测序分析，系统探索了KIAA1467在乳腺癌中的表达模式、预后价值、免疫调控功能、生物学效应及耐药相关性 | 首次系统揭示KIAA1467在乳腺癌中驱动免疫排斥型非炎症肿瘤微环境的作用，并结合泛癌分析、单细胞测序、多组学分析和体外实验全面阐明其作为免疫检查点联合治疗靶点的潜力 | 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞实验，缺乏体内动物模型验证和临床试验数据，KIAA1467的具体分子机制尚未完全阐明 | 系统探索KIAA1467在乳腺癌中的表达模式、预后价值、免疫调控功能、生物学效应及耐药相关性，为优化基于免疫检查点阻断的联合治疗提供新靶点 | 乳腺癌（BRCA）及多种其他肿瘤类型，乳腺癌临床标本，乳腺癌细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组化, 蛋白质印迹, 多组学生物信息学分析 | NA | 图像, 文本, 基因表达数据 | TCGA泛癌数据集及GSE176078单细胞RNA测序数据，乳腺癌临床标本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 76 | 2026-09-13 |
RECQL correlates with immune infiltration and serves as a prognostic biomarker and therapeutic predictor in gastric cancer
2026-Aug-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2026-0411
PMID:42724473
|
研究论文 | 该研究通过生物信息学分析和体外实验，探讨了RECQL在胃癌中的临床意义、生物学功能及其在肿瘤免疫微环境中的潜在作用 | 首次综合运用WGCNA、LASSO回归和空间转录组学分析，揭示了RECQL在胃癌中与免疫浸润（特别是M2巨噬细胞）的关联，并通过体外实验验证了RECQL敲低对胃癌细胞功能的影响 | 主要基于公共数据集和体外细胞实验，缺乏体内动物实验和临床大样本验证；机制研究尚不深入 | 探索RECQL在胃癌中的临床意义、生物学功能及其在肿瘤免疫微环境中的潜在作用 | 胃癌组织及胃癌细胞系（HGC-27） | 数字病理学 | 胃癌 | WGCNA、差异表达分析、LASSO回归、功能富集分析、免疫浸润分析、空间转录组学分析、CCK-8、集落形成、划痕实验、TUNEL实验 | NA | 文本、图像 | 来自TCGA-STAD和GSE150290公共数据集的胃癌样本，以及HGC-27细胞系 | NA | 空间转录组学、批量RNA-seq | NA | NA |
| 77 | 2026-09-13 |
Identification of a novel signature for prognostic stratification and integrative analyses in lung adenocarcinoma
2026-Aug-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2026-0943
PMID:42724475
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研究论文 | 本研究利用高尔基体相关基因构建了一个包含5个基因的肺腺癌预后风险模型，并验证了其在预后分层和免疫治疗反应预测中的效用 | 首次基于高尔基体相关基因构建了包含5个基因（GNPNAT1、RGS20、CAV3、NTSR1和FURIN）的肺腺癌预后风险模型，并结合单细胞RNA测序揭示了这些基因在细胞中的分布模式 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 利用高尔基体相关基因构建一个更简洁实用的肺腺癌风险模型，用于预后分层和免疫治疗反应预测 | 肺腺癌（LUAD）患者 | 机器学习 | 肺癌 | Bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | LASSO, 单变量Cox回归, 多变量Cox回归 | 基因表达数据, 文本 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 78 | 2026-09-13 |
scRNA-seq and bulk RNA-seq reveal the characteristics of macrophage copper metabolism and establish a risk signature in hepatocellular carcinoma
2026-Aug-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2026-0604
PMID:42724516
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研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据，揭示肝细胞癌中巨噬细胞铜代谢特征，并构建了一个七基因风险预后模型 | 首次从巨噬细胞铜代谢角度出发，整合scRNA-seq和bulk RNA-seq数据构建肝细胞癌预后风险模型，并结合免疫微环境和药物敏感性分析进行多维度验证 | 模型在TCGA-LIHC中具有中等预后区分能力，但外部验证表现异质性较大，在不同数据集间性能不一致 | 探索巨噬细胞铜代谢相关的预后模型，并研究该风险模型与肿瘤免疫微环境的关系 | 肝细胞癌患者及其肿瘤微环境中的巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | LASSO回归, 多因素Cox回归 | 基因表达数据 | TCGA-LIHC队列及肝细胞癌单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 79 | 2026-09-13 |
Epigallocatechin gallate is associated with PDGFRB downregulation and altered PI3K-AKT signaling in gastric cancer
2026-Aug-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2026-0722
PMID:42724533
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析与体外实验，鉴定表没食子儿茶素没食子酸酯（EGCG）在胃癌中的候选靶基因，发现EGCG与PDGFRB下调及PI3K-AKT信号通路改变相关 | 将公共数据库筛选的EGCG相关差异基因与LASSO-Cox预后模型结合，首次提出PDGFRB作为EGCG在胃癌中的候选关联基因，并结合单细胞测序揭示其细胞定位 | 研究仅提供相关性证据与假设，缺乏深入的机制验证，未明确EGCG与PDGFRB之间的直接调控关系 | 识别胃癌中EGCG相关候选基因，并为进一步机制研究提供假设 | 胃癌差异表达基因、EGCG相关靶点、胃癌细胞系 | 机器学习 | 胃癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, Western blotting, MTT, Transwell迁移实验 | LASSO回归, Cox比例风险模型, ROC曲线 | 文本, 图像 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 80 | 2026-09-13 |
Uncovering sodium overload-associated gene signatures in chronic obstructive pulmonary disease through integrated bioinformatics and machine learning
2026-Aug-31, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-2026-0843
PMID:42724664
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研究论文 | 该研究整合了两个肺转录组队列，利用生物信息学和机器学习方法识别慢性阻塞性肺疾病（COPD）中钠超载相关的基因特征，并验证了一个三基因面板 | 首次系统性地将钠超载相关基因集与COPD的转录组架构相结合，并通过十二种机器学习算法基准测试筛选出紧凑的三基因面板（ALDH3A1、MUC5AC、PHEX） | 三基因面板的区分能力中等（AUC 0.686），PHEX在不同平台间存在方向异质性，样本量有限，需要在更大规模的前瞻性匹配队列中验证 | 识别COPD中钠超载相关的基因，并评估一个紧凑的上皮基因面板在多个验证平台中的表现 | COPD患者和对照组的肺组织转录组数据、单细胞RNA测序数据以及qPCR样本 | 机器学习 | 慢性阻塞性肺疾病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, qPCR | 十二种机器学习算法 | 转录组数据、图像（单细胞测序数据）、文本（基因表达数据） | 两个bulk肺转录组队列、一个独立外部队列、13例COPD和12例非COPD对照的qPCR样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qPCR | NA | NA |