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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-08-27 |
CACNA2D1 promotes ovulation by regulating ovarian immune cell infiltration
2026-Jun-13, BMC veterinary research
IF:2.3Q1
DOI:10.1186/s12917-026-05617-2
PMID:42288857
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研究论文 | 本研究旨在探讨CACNA2D1在排卵过程中通过调节卵巢免疫细胞浸润所发挥的功能 | 首次在体内和体外模型中系统研究了CACNA2D1在排卵期间对卵巢免疫细胞浸润,特别是巨噬细胞募集的调控作用,并揭示了其通过钙信号依赖的趋化因子产生机制 | 研究主要基于小鼠模型,未能直接在人类或其他家畜物种中验证;且对CACNA2D1在非颗粒细胞类型中的潜在作用未作深入探讨 | 明确CACNA2D1在排卵过程中对卵巢免疫细胞浸润的调节功能及其分子机制 | 小鼠排卵模型及卵巢颗粒细胞 | 基因组学, 细胞生物学 | NA | 单细胞转录组分析, 药理学抑制, 转录组测序, 免疫细胞浸润评估, 钙信号检测, 蛋白印迹, 细胞迁移实验 | NA | 转录组数据, 图像(免疫组化/免疫荧光), 细胞迁移数据, 生物化学数据 | 小鼠模型;体外颗粒细胞实验(具体数量未在摘要中说明) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 用于山羊排卵过程中的单细胞转录组分析,以识别CACNA2D1的表达模式 |
| 62 | 2026-08-27 |
CD49a+ NK cells promote M2 polarization and are associated with poor pathological response in NSCLC
2026-Jun-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-57649-1
PMID:42286110
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析非小细胞肺癌肿瘤微环境中的NK细胞,发现CD49a+组织驻留NK细胞亚群与不良病理反应相关,并促进M2巨噬细胞极化。 | 首次在非小细胞肺癌中鉴定出CD49a+组织驻留NK细胞亚群,并揭示其通过CSF-1促进M2巨噬细胞极化及抑制三级淋巴结构形成的新机制。 | 研究基于手术标本,样本量有限,且未深入探讨CD49a+ NK细胞在体内的动态变化及与其他免疫细胞间更复杂的相互作用。 | 全面分析非小细胞肺癌肿瘤微环境中的NK细胞,鉴定组织驻留亚群,评估其临床意义并探究其免疫抑制功能及机制。 | 非小细胞肺癌手术标本中的NK细胞亚群,特别是CD49a+组织驻留NK细胞。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 非小细胞肺癌手术标本,具体数量未在标题和摘要中提供。 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 63 | 2026-08-27 |
Subgroup-Specific Associations of GRIA Genes Encoding AMPA Glutamate Receptor Subunits with Patient Survival in Medulloblastoma
2026-06-11, Neuromolecular medicine
IF:3.3Q2
DOI:10.1007/s12017-026-08935-8
PMID:42277445
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研究论文 | 本研究分析髓母细胞瘤中编码AMPA谷氨酸受体亚基的GRIA1-4基因表达,发现其在不同分子亚型中与患者生存期存在亚型特异性关联 | 首次系统揭示GRIA基因在髓母细胞瘤不同分子亚型中的差异表达及其与预后的亚型特异性关联,特别是GRIA3和GRIA4在SHH亚型中与生存期的相反关联 | 研究主要基于公开数据集和细胞系,缺乏功能实验验证;需进一步在更大临床队列中确认预后关联 | 探究AMPA受体亚基编码基因GRIA1-4在髓母细胞瘤中的表达模式及其与患者生存期的关联 | 髓母细胞瘤肿瘤样本和细胞系 | 基因组学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、定量逆转录聚合酶链反应 | NA | 基因表达数据(RNA-seq和qRT-PCR) | 包含公开数据集中的髓母细胞瘤肿瘤样本和细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 64 | 2026-08-27 |
Integrative single-cell and spatial transcriptomics with machine learning identify a Luminal-inflam malignant program and reveal an RPN1-PERK UPR vulnerability in triple-negative breast cancer
2026-Jun-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-56434-4
PMID:42270806
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研究论文 | 结合单细胞和空间转录组学与机器学习,识别三阴性乳腺癌中的Luminal_inflam恶性程序,并揭示RPN1-PERK未折叠蛋白反应脆弱性。 | 通过整合单细胞和空间转录组学、网络分析和机器学习,识别出特定的恶性上皮亚群Luminal_inflam,并构建12基因风险签名,揭示RPN1相关的蛋白质稳态脆弱性作为潜在治疗靶点。 | 研究结果需结合先前工作解释,RPN1耗竭诱导内质网应激依赖性凋亡并非全新机制,而是对现有观察的扩展。 | 表征三阴性乳腺癌中的恶性上皮程序并确定预后生物标志物,探索RPN1相关脆弱性的治疗潜力。 | 三阴性乳腺癌的恶性上皮细胞亚群,特别是Luminal_inflam亚群,以及MDA-MB-231细胞模型。 | 机器学习 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 机器学习模型(具体类型未指定) | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 未明确样本数量,涉及生存队列和细胞系模型 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 65 | 2026-08-27 |
Bulk and single-cell transcriptomics reveal prognostic signatures of phosphoinositide metabolism in lung adenocarcinoma
2026-Jun-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-56684-2
PMID:42270842
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研究论文 | 综合运用批量转录组和单细胞转录组数据,识别肺腺癌中磷脂酰肌醇代谢相关的预后基因,并构建风险评估模型。 | 首次结合批量与单细胞转录组数据系统分析磷脂酰肌醇代谢基因在肺腺癌中的预后价值,并揭示其与肿瘤微环境、突变及药物敏感性的关联。 | 研究基于公开数据库,缺乏大规模临床验证,预后基因的功能机制需进一步实验验证。 | 探讨磷脂酰肌醇代谢与肺腺癌的关联,并识别预后生物标志物以提供治疗新见解。 | 肺腺癌患者及其肿瘤组织样本,包括临床样本中的基因表达数据。 | 转录组学 | 肺腺癌 | 批量RNA测序,单细胞RNA测序 | 机器学习模型,风险评分模型 | 基因表达数据,单细胞表达数据,临床数据 | 来自公共数据库的肺腺癌患者样本(具体数量未在摘要中说明) | NA | 批量RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 66 | 2026-08-27 |
A prognostic model for breast cancer based on mitochondria-associated endoplasmic reticulum membrane (MAM) signature genes
2026-Jun-10, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05287-4
PMID:42268522
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研究论文 | 基于线粒体相关内质网膜(MAM)特征基因构建乳腺癌预后模型,并通过多组学数据及实验验证其预后价值与治疗相关性 | 首次基于MAM相关基因构建乳腺癌预后模型,并结合单细胞转录组和药物敏感性分析揭示其免疫治疗与化疗反应的预测潜力 | 模型基于公共数据库构建,缺乏前瞻性临床验证;实验验证仅限于细胞系,未在动物模型或患者样本中进一步证实 | 阐明MAM相关基因在乳腺癌中的预后价值及其对个性化治疗(尤其是免疫治疗和化疗)的指导意义 | 乳腺癌患者及乳腺癌细胞系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qRT-PCR, 免疫印迹, LASSO回归 | Cox回归模型, LASSO, 列线图 | 基因表达数据, 单细胞转录组, 临床数据, 蛋白表达数据 | TCGA乳腺癌队列(具体数量未提供),GSE255068单细胞数据集,多个乳腺癌细胞系 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 67 | 2026-08-27 |
Tumor microenvironment-specific nanomedicine: from biology-driven to multi-omics-guided precision engineering
2026-Jun-10, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-026-01811-9
PMID:42271438
|
综述 | 本文综述了肿瘤微环境特异性纳米医学,提出从生物学驱动到多组学指导的精准工程框架 | 提出闭环的组学到设计框架,将空间分辨的生物学特征转化为可操作的纳米粒子工程参数 | 未提及具体实验验证,缺乏临床转化数据支持 | 探讨如何利用肿瘤微环境的多组学数据指导纳米医学的精准设计和翻译应用 | 肿瘤微环境中的细胞外基质、血管、免疫细胞及纳米粒子 | 机器学习 | 肿瘤 | 单细胞测序、空间转录组学、多组学分析 | NA | 空间转录组数据、单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 68 | 2026-08-27 |
scKSFD: federated distillation model with knowledge sharing for cell type classification of clinical transcriptome data
2026-Jun-04, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-026-06508-x
PMID:42243648
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研究论文 | 提出了一种具有知识共享的联邦蒸馏框架scKSFD,用于临床转录组数据的细胞类型分类,在保护隐私的同时实现跨机构协作。 | 通过参考数据集上的概率级软标签输出在预测空间进行知识聚合,避免了传统联邦学习中交换模型参数的隐私风险,并集成了分层代理采样以保留稀有细胞群体和概率级聚合以减轻批次效应。 | 未明确提及局限性。 | 开发一种隐私保护的联邦蒸馏框架,用于跨机构单细胞RNA测序数据的细胞类型分类,以平衡预测性能、鲁棒性和数据共享约束。 | 42个临床单细胞转录组数据集,以及一个多医院COVID-19案例研究。 | 机器学习 | COVID-19 | scRNA-seq | 联邦蒸馏模型 | 转录组数据 | 42个临床单细胞转录组数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 69 | 2026-08-27 |
Matrix Stiffness Directs Early Injury and Ketogenesis Programs to Prime Kidney Repair
2026-Jun-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000967
PMID:41563281
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研究论文 | 本研究绘制了急性肾损伤(AKI)中细胞外基质(ECM)重塑的动态图谱,并确定微纤维相关蛋白2(Mfap2)作为关键的修复介质。 | 首次结合组织工程、蛋白质组学和空间转录组学,系统解析了ECM力学信号通过非经典Hippo通路调控肾小管酮生成的机制,并提出了Mfap2-Esr2-Hmgcs2回路作为潜在治疗靶点。 | 研究主要基于动物模型,缺乏人类样本验证;部分机制(如Esr2转录抑制的细节)需进一步阐明。 | 阐明细胞外基质如何通过力学信号调控急性肾损伤后的修复过程,并探索潜在的治疗策略。 | 急性肾损伤小鼠模型以及其中的成纤维细胞、周细胞和肾小管细胞。 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 空间转录组学、蛋白质组学(DIA)、磷酸化蛋白质组学 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、空间转录组数据 | 未明确说明,但涉及多个AKI动物模型和不同实验条件。 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 70 | 2026-08-27 |
GraphTME: graph-based framework for predicting immunotherapy response by interpreting tumour microenvironment interactions using spatial transcriptomics
2026-May-29, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00735-x
PMID:42215484
|
研究论文 | 提出GraphTME框架,利用空间转录组数据建模肿瘤微环境中的配体-受体信号,预测免疫检查点抑制剂治疗反应 | 首次将空间转录组数据中的单细胞水平细胞间相互作用定量建模为多关系有向图,并用于预测免疫治疗反应,提供空间分辨且生物学可解释的生物标志物 | 未提及 | 开发一种基于空间转录组数据的框架,以预测免疫检查点抑制剂治疗反应并解释肿瘤微环境中的细胞相互作用 | 非小细胞肺癌(NSCLC)患者,特别是其CD8 T细胞和肿瘤细胞 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | 空间转录组学 | 图神经网络(Graph Neural Network) | 空间转录组数据(MERFISH),单细胞RNA测序数据 | 未提及具体样本数量 | NA | 空间转录组学 | MERFISH | NA |
| 71 | 2026-08-27 |
Supporting-like cells constitute an alternative steroidogenic lineage conserved in amniotes
2026-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.25.726204
PMID:42244723
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研究论文 | 本研究通过比较单细胞转录组学、类固醇组学和器官成像,揭示了支持样细胞(SLCs)在哺乳动物胚胎发育中作为主要类固醇生成谱系的新作用,并证明该谱系在羊膜动物中保守 | 首次发现支持样细胞(SLCs)可作为哺乳动物胚胎发育期间的主要类固醇生成细胞谱系,挑战了传统上认为性激素产生仅依赖于间质谱系(如睾丸间质细胞或卵泡膜细胞)的观点,并揭示了性别分化中的意外可塑性和进化上的功能趋同 | 摘要中未提及明显的局限性信息 | 探究哺乳动物胚胎发育中是否存在替代性类固醇生成细胞类型,并验证支持样细胞(SLCs)在该过程中的作用及其进化保守性 | 兔、哺乳动物及非哺乳动物物种的性腺组织,特别是支持样细胞(SLCs)及其分化产物 | 单细胞转录组学、类固醇组学、器官成像 | NA | 单细胞转录组学、类固醇组学、器官成像 | NA | 单细胞转录组数据、类固醇组数据、成像数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 72 | 2026-08-27 |
Sigma-1R-CD36 axis in myeloid cells contributes to the alleviation of depression-like behaviors
2026-05-26, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08297-6
PMID:42192440
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研究论文 | 本研究探讨了髓系细胞中Sigma-1受体(Sigma-1R)与CD36的相互作用,及其通过TRIM28介导的泛素化降解减轻抑郁症样行为的机制 | 首次揭示髓系细胞中Sigma-1R-CD36轴在抑郁症中的作用,并阐明Sigma-1R通过TRIM28依赖的K48连接泛素化促进CD36蛋白酶体降解的新机制 | 未提及具体局限性,但可推测样本量和人群异质性可能影响结果,且机制研究主要基于小鼠模型 | 探讨髓系细胞中Sigma-1R和CD36在抑郁症中的作用,评估其作为调节外周炎症和改善抑郁表型的潜在治疗靶点 | 抑郁症患者外周血单核细胞(PBMC)转录组数据、慢性束缚应激(CRS)小鼠模型及体外细胞实验 | 机器学习 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、共免疫沉淀、泛素化/蛋白酶体降解实验、流式细胞术 | 未提及 | 转录组数据、图像(流式细胞术)、分子生物学数据 | 五个PBMC转录组队列(n=1388)、单细胞RNA测序(MDD: n=8, HC: n=8)、CRS小鼠实验 | 未提及 | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | 未提及 | 未提及 |
| 73 | 2026-08-27 |
Identifying potential ligand-receptor interactions by integrating LSTM network and the attention mechanism for cell-cell communication prediction
2026-05-25, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08033-0
PMID:42185831
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研究论文 | 开发了CellAL,一种基于深度学习的框架,通过整合LSTM网络和注意力机制,直接从蛋白质序列预测配体-受体相互作用,并推断细胞间通讯。 | 引入注意力机制的LSTM网络以捕捉蛋白质序列的长程依赖性,克服对静态数据库的依赖,并实现直接从序列预测新型配体-受体相互作用。 | 可能受到训练数据集规模和质量的影响,且未在更广泛的生物场景中进行验证。 | 开发能直接从蛋白质序列数据预测潜在配体-受体相互作用及推断细胞通讯的稳健计算框架。 | 配体-受体相互作用和细胞间通讯,基于scRNA-seq数据。 | 机器学习 | 黑色素瘤 | 深度学习,scRNA-seq | LSTM,注意力机制 | 蛋白质序列数据,单细胞RNA测序数据 | 四个标准数据集和人类黑色素瘤scRNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 74 | 2026-08-27 |
CR1(+) tumor-associated macrophages orchestrate an immunosuppressive niche in hepatocellular carcinoma: a genetic and multi-omics dissection
2026-05-25, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08301-z
PMID:42185899
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研究论文 | 通过遗传与多组学分析,揭示CR1阳性肿瘤相关巨噬细胞在肝细胞癌中构建免疫抑制微环境的作用。 | 首次整合遗传、空间和功能证据,证明CR1+ TAM是肝细胞癌中临床相关的免疫调节轴,扩展了对补体相关免疫抑制的理解。 | 未提供具体局限性信息。 | 评估CR1在肝细胞癌免疫抑制微环境中的调节作用及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力。 | 肝细胞癌肿瘤相关巨噬细胞及其与CD8+ T细胞的相互作用。 | 多组学、遗传学 | 肝细胞癌 | 孟德尔随机化、代谢物中介分析、批量转录组、单细胞RNA测序、空间转录组、功能实验 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、临床样本数据 | 包括TCGA-HCC队列、21个样本的53474个单细胞、2个空间HCC切片、30对配对临床样本 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组、批量RNA测序 | NA | NA |
| 75 | 2026-08-27 |
Spatial and single-cell transcriptomic profiling reveals interplay between SRGN-associated epithelial programs and C1QC+ macrophages in early LUAD progression
2026-05-23, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08241-8
PMID:42177544
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组分析,揭示了早期肺腺癌进展中SRGN相关上皮程序与C1QC+巨噬细胞之间的相互作用。 | 首次整合单细胞和空间转录组学方法,系统描绘了从癌前病变到浸润性腺癌的演变轨迹,并发现了SRGN+恶性细胞与C1QC+巨噬细胞在空间上的共定位及特异性受体-配体介导的相互作用。 | 研究主要基于组织样本和动物模型,可能无法完全反映人类体内复杂的肿瘤微环境;且需要进一步的功能实验验证所发现的分子相互作用的因果性。 | 阐明早期肺腺癌从癌前病变到浸润性癌的分子和细胞机制,为早期诊断和治疗提供潜在靶点。 | 早期肺腺癌的四个组织学阶段(非典型腺瘤样增生、原位腺癌、微浸润性腺癌、浸润性腺癌)的细胞群体。 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组分析 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 人类肺腺癌四个阶段的组织样本及A/J小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组 | NA | NA |
| 76 | 2026-08-27 |
Targeted suppression of SPP1 inhibits tumor invasion and metastasis in NRF2 hyperactivated cisplatin resistant HNSCC
2026-05-22, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08292-x
PMID:42174609
|
研究论文 | 本研究探讨靶向抑制SPP1对NRF2过度激活的顺铂耐药头颈鳞状细胞癌的肿瘤侵袭和转移的抑制作用 | 首次揭示SPP1在NRF2过度激活的顺铂耐药HNSCC中的促肿瘤作用,并通过空间转录组学发现SPP1与整合素和CD44受体的潜在机制交互 | 基于细胞系和小鼠模型,临床验证尚需进一步研究 | 评估靶向SPP1是否能抑制肿瘤侵袭和转移,并提高顺铂敏感性,以改善HNSCC患者预后 | 人HNSCC细胞系、小鼠模型及HNSCC患者样本 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 蛋白质印迹、细胞侵袭实验、功能蛋白质组学、高分辨率空间转录组学 | NA | 蛋白质表达数据、基因表达数据、空间转录组数据 | 多种HNSCC细胞系、小鼠模型及患者样本(具体数量未提供) | NA | 空间转录组学 | NA | 高分辨率空间转录组学平台(具体型号未提供) |
| 77 | 2026-08-27 |
Targeting C5AR1 disrupts complement-driven G0-phase maintenance and overcomes metabolic drug resistance in glioma
2026-05-22, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07782-2
PMID:42174621
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研究论文 | 本研究揭示了C5AR1通过补体信号维持胶质瘤细胞G0期静息状态,并促进代谢药物抵抗的机制,靶向该轴可克服化疗耐药。 | 首次阐明C5AR1将细胞外补体激活与细胞内G0期维持及代谢适应性相连接,并提出靶向C3-C5-C5AR1轴作为克服胶质母细胞瘤化疗耐药的新策略。 | 研究主要基于体外细胞系和异种移植模型,可能未完全模拟人类肿瘤微环境;临床转化需进一步验证。 | 探究补体信号调控胶质瘤细胞静息和代谢药物抵抗的分子机制,并评估靶向C5AR1的治疗潜力。 | 胶质瘤细胞系、异种移植模型及TCGA、CGGA、GEO多组学数据集。 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 多组学分析、单细胞转录组学、流式细胞术、免疫荧光、线粒体染色、ELISA | 细胞系和异种移植模型 | 基因表达数据、单细胞转录组数据、实验图像和定量数据 | TCGA、CGGA和GEO数据集(具体样本数未在摘要中提供) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 78 | 2026-08-27 |
Mitochondrial DNA release contributes to neuropathic pain via a cGAS-STING-IRF3-CMPK2-associated immunometabolic feedback mechanism
2026-05-22, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08314-8
PMID:42174715
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研究论文 | 本研究揭示线粒体DNA释放通过cGAS-STING-IRF3-CMPK2相关的免疫代谢反馈机制促进神经病理性疼痛 | 首次阐明mtDNA-cGAS-STING-IRF3-CMPK2免疫代谢反馈环路在脊髓微环境中驱动神经病理性疼痛的机制,并证实小胶质细胞是该环路的主要细胞类型 | 研究主要基于小鼠模型,未在人类样本中验证;CMPK2基因沉默和药物抑制的长期安全性及临床转化潜力尚需进一步评估 | 探究线粒体功能障碍与神经病理性疼痛中持续神经炎症之间的机制联系,并评估靶向线粒体免疫代谢的治疗潜力 | 小鼠脊髓组织、BV2细胞、原代小胶质细胞 | 神经科学、免疫学、分子生物学 | 神经病理性疼痛 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、分子分析、药理学抑制、基因沉默 | 小鼠神经损伤模型、细胞培养模型 | 基因表达数据、图像、行为学数据 | 未明确样本量,涉及小鼠模型及细胞实验 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 79 | 2026-08-27 |
Expanding canonical cortical cell type markers in the era of single-cell transcriptomics
2026-May-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-51501-2
PMID:42168596
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研究论文 | 利用近50万个单核和单细胞转录组数据,系统评估了大脑皮层经典细胞类型标志物的表达保真度和背景表达,并开发了统计框架拓展了主要细胞类型的标志物列表 | 首次在大规模跨研究数据中定量评估经典标志物的表达保真度和背景表达,并开发了基于伪批量分析的统计框架来识别高保真、低背景且跨区域一致的标志物,同时提供了交互式分析界面 | 未明确提及,但对标志物表达的区域变异性分析可能受限于研究间的批次效应和不同数据源的质量差异 | 量化并拓展大脑皮层细胞类型的经典标志物,以改进单细胞表达数据中的细胞类型注释和靶点验证 | 人类大脑皮层细胞,涵盖六种主要脑细胞类型(如神经元、星形胶质细胞等) | 单细胞转录组学 | 不适用 | 单核RNA测序和单细胞RNA测序 | 统计框架(伪批量分析) | 单细胞表达数据(基因表达矩阵) | 近500,000个高质量单核和单细胞转录组,来自19项研究 | 不适用 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 80 | 2026-08-27 |
Pan-cancer analysis of single-cell profiles with polygenic signals reveals genetic influences on tumor immunity across cancers
2026-05-21, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10158-3
PMID:42168330
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研究论文 | 本研究提出一种多基因分析框架,整合单细胞RNA测序和全基因组关联研究统计数据,分析14种癌症类型,揭示种系遗传变异对肿瘤免疫微环境的影响 | 开发了整合单细胞转录组和GWAS数据的新型多基因分析框架,并构建了基于深度学习的免疫治疗反应预测模型 | 未明确提及局限性 | 揭示种系遗传变异如何影响不同癌症类型的肿瘤免疫微环境,并评估其作为免疫治疗预测生物标志物的潜力 | 14种癌症类型的肿瘤微环境中的免疫细胞(T细胞、B细胞、髓系细胞)及相关基因 | 机器学习 | 泛癌种(包括黑色素瘤和乳腺癌) | 单细胞RNA测序、全基因组关联研究分析 | 深度学习模型 | 单细胞转录组数据、GWAS统计数据、组织及血液样本数据 | 涉及14种癌症类型,具体样本数量未提及 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |