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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-04-14 |
COUP-TFII promotes macrophage-myofibroblast transition by attenuating HIF-1α-mediated glycolysis
2026-May-28, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153640
PMID:41916009
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研究论文 | 本文研究了COUP-TFII在糖尿病肾病纤维化中通过抑制HIF-1α介导的糖酵解促进巨噬细胞-肌成纤维细胞转化的机制 | 揭示了COUP-TFII在糖尿病肾病纤维化中的新作用机制,即通过调控HIF-1α依赖性糖酵解来促进巨噬细胞向肌成纤维细胞转化 | 研究主要基于体外细胞实验和动物模型,尚未在人体临床试验中得到验证 | 探究COUP-TFII在糖尿病肾病纤维化进程中的调控机制 | 巨噬细胞、DB/DB糖尿病肾病小鼠模型 | NA | 糖尿病肾病 | Western blotting、单细胞测序、免疫荧光 | NA | 蛋白质表达数据、单细胞测序数据、GEO数据库数据 | 22周龄DB/DB糖尿病肾病小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 62 | 2026-04-14 |
From antigen to atlas: A multi-omics, single-cell pipeline for discovering safe and effective CAR targets in ovarian cancer
2026-May, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2026.105249
PMID:41794160
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综述 | 本文提出了一种用于发现卵巢癌安全有效CAR靶点的多组学单细胞整合分析流程 | 提出了一个结合多组学、单细胞和空间转录组学的综合分级验证流程,并建立了三级同质性分类系统来指导CAR靶点的工程策略 | 作为一篇综述,主要提出概念框架,缺乏大规模实验数据的验证 | 开发一个用于发现和验证卵巢癌CAR-T细胞疗法安全有效靶点的综合流程 | 卵巢癌(OC)的肿瘤抗原和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组学,空间转录组学,糖蛋白组学,免疫表型分析 | NA | 多组学数据,单细胞数据,空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 63 | 2026-04-14 |
Integrated Plasma Proteomics and Functional Analyses Reveal Hepatic CDHR2 as a Potential Therapeutic Target in MASLD
2026-May, Diabetes, obesity & metabolism
DOI:10.1111/dom.70623
PMID:41804813
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研究论文 | 本研究通过整合血浆蛋白质组学与功能分析,发现肝细胞中的CDHR2是MASLD发展的新型调控因子和潜在治疗靶点 | 首次通过整合多源数据(包括孟德尔随机化分析)识别并功能验证了CDHR2在MASLD中的因果作用 | 研究主要基于体外细胞模型,需要进一步的体内实验和临床验证 | 识别和验证与代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)相关的蛋白质治疗靶点 | MASLD患者、肝细胞(原代肝细胞、HepG2和AML12细胞系) | 生物信息学与功能基因组学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD) | 血浆蛋白质组学、孟德尔随机化分析、RNA-seq、免疫染色、基因沉默与过表达 | NA | 蛋白质组数据、基因表达数据、影像数据、临床数据 | UK Biobank中具有影像学cT1和血浆蛋白质组数据的MASLD参与者 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 64 | 2026-04-14 |
Chronic psychological stress disrupts liver homeostasis by dysregulating oxidative phosphorylation via the PI3K/AKT/FoxO3a axis
2026-Apr-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115389
PMID:41971987
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研究论文 | 本研究通过慢性束缚应激小鼠模型,揭示了慢性心理应激通过PI3K/AKT/FoxO3a轴抑制氧化磷酸化,从而破坏肝脏稳态的机制 | 首次在单细胞水平上识别FoxO3a作为关键转录因子,介导心理应激诱导的氧化磷酸化抑制,并发现FoxO3a驱动的表观遗传沉默作用 | 研究基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证;机制细节如FoxO3a具体靶基因有待深入探索 | 探究慢性心理应激导致慢性肝病的分子机制 | 慢性束缚应激小鼠模型中的肝细胞,特别是门静脉周围肝细胞(区域1) | 单细胞组学 | 慢性肝病 | 单细胞RNA测序,组织学分析,生化分析,电子显微镜 | NA | 单细胞RNA测序数据,组织图像,生化指标 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 65 | 2026-04-14 |
SpaHE-Infil: A spatial heterogeneity framework for decoding TME infiltration from H&E-stained slides
2026-Apr-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115155
PMID:41971992
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研究论文 | 开发了一个名为SpaHE-Infil的多模态计算框架,通过整合空间转录组学和全切片图像,从H&E染色切片中解码肿瘤微环境中的免疫细胞浸润 | 结合空间转录组学和全切片图像,利用随机森林模型提取形态、纹理和密度特征,动态校准临床样本中的免疫细胞比例偏差,实现高精度的空间细胞分布预测 | 未明确提及具体局限性,但可能依赖于图像质量和样本可用性 | 解码肿瘤微环境中免疫细胞的空间分布,以预测免疫治疗反应和患者生存 | 肿瘤微环境中的12种核心细胞类型,包括免疫细胞 | 数字病理学 | 多种癌症 | 空间转录组学,全切片图像分析 | 随机森林 | 图像,空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 66 | 2026-04-14 |
PEPITEM Regulates the Synovial Microenvironment During Immune-Mediated Inflammatory Arthritis to Limit Disease
2026-Apr-13, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70108
PMID:41968960
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研究论文 | 本文研究了PEPITEM在早期、未治疗类风湿关节炎和银屑病关节炎中的状态及其在临床前模型中的治疗效果 | 揭示了PEPITEM通过抑制COX-2和NF-κB信号通路,改变关节内白细胞亚群组成,从而减轻关节炎严重性 | 研究主要基于临床前动物模型,尚未在人类患者中进行大规模临床试验验证 | 探究PEPITEM在免疫介导的炎症性关节炎中的调控作用及治疗潜力 | 类风湿关节炎和银屑病关节炎患者的外周血单核细胞,以及三种不同的炎症性关节炎动物模型 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 流式细胞术、Western blot、单细胞RNA测序、多重分析 | NA | 流式细胞数据、蛋白质印迹数据、单细胞RNA测序数据、组织学数据 | 临床疑似关节痛和疑似炎症性关节炎患者的外周血样本,以及三种动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 67 | 2026-04-14 |
CKAP4 Regulates ERS-Induced Apoptosis in Osteoclasts Through FOXO3 in Periodontitis
2026-Apr-13, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70208
PMID:41969105
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研究论文 | 本研究揭示了CKAP4通过FOXO3调控内质网应激诱导的破骨细胞凋亡在牙周炎中的作用机制 | 首次发现CKAP4在牙周炎破骨细胞凋亡中的调控作用,并阐明其通过FOXO3介导的内质网应激通路 | 研究主要基于动物模型和测序数据分析,临床样本验证相对有限 | 探究牙周炎中破骨细胞凋亡失调的分子机制 | 破骨细胞(Osteoclasts) | 单细胞组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | GEO数据库中的牙周炎患者组织样本数据及Ckap4基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 68 | 2026-04-14 |
Vorinostat Potentiates Chemoimmunotherapy in Immune-Enriched Pancreatic Cancer
2026-Apr-13, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202521844
PMID:41969226
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研究论文 | 本研究探讨了组蛋白去乙酰化酶抑制剂伏立诺他(SAHA)在免疫富集型胰腺癌中增强化疗免疫疗法效果的机制 | 通过整合体外药物筛选和计算机敏感性预测,首次识别出SAHA作为IE-PDAC中化疗免疫疗法的有效增敏剂,并揭示了其通过抑制FASN和PARP9破坏肿瘤微环境中代谢陷阱的新机制 | 研究主要基于临床前模型(如患者来源的异种移植模型和类器官共培养),尚未进行大规模临床试验验证 | 探究免疫富集型胰腺癌(IE-PDAC)的潜在机制并寻找有效疗法 | 胰腺导管腺癌(PDAC),特别是免疫富集型亚型 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),体外药物筛选,计算机敏感性预测,患者来源的异种移植模型 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 69 | 2026-04-14 |
Integrating Radiomics and Computational Pathology to Predict Early Recurrence of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma and Uncover Its Biological Basis in Tumor Microenvironment
2026-Apr-13, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202523985
PMID:41969272
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研究论文 | 本研究开发并验证了一个整合放射组学和计算病理学的模型,用于预测胰腺导管腺癌的早期复发,并揭示了其与肿瘤微环境中细胞外基质重塑相关的生物学机制 | 首次整合放射组学和计算病理学特征构建预测模型,并结合单细胞RNA测序和空间转录组学验证了预测结果与肿瘤微环境中成纤维细胞和胰腺星状细胞富集以及细胞外基质通路失调的关联 | 研究为回顾性设计,样本量有限(225例患者),且模型在外部验证中的性能略有下降 | 预测胰腺导管腺癌根治性切除后的早期复发,并阐明其生物学基础 | 胰腺导管腺癌患者 | 计算病理学 | 胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 机器学习模型(11种) | CT图像, 全切片图像 | 225例胰腺导管腺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 70 | 2026-04-14 |
MELK is Required for G2/M Phase Progression in Cortical Progenitors: Insights from Rare ASD-Associated Variants
2026-Apr-13, Cellular and molecular neurobiology
IF:3.6Q2
DOI:10.1007/s10571-026-01728-4
PMID:41973119
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研究论文 | 本研究探讨了母体胚胎亮氨酸拉链激酶(MELK)在胚胎皮层发育中的作用,特别是其与自闭症谱系障碍(ASD)相关罕见变异的功能关联 | 首次将ASD相关的罕见MELK功能丧失变异与皮层发育中G2/M期进程和神经元形态发生的调控机制联系起来 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类直接证据有限,且未全面评估其他神经发育条件 | 阐明MELK在胚胎皮层发育中的功能角色及其与神经发育障碍的机制联系 | 小鼠皮层祖细胞和ASD个体中发现的MELK罕见变异 | 神经发育生物学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞转录组学、子宫内电穿孔、流式细胞分选、转录组分析 | NA | 转录组数据、细胞表型数据 | 未明确指定样本数量,涉及小鼠皮层细胞和ASD个体变异 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 71 | 2026-04-14 |
Amelioration of acute liver failure by a cinnamic acid derivative through inhibition of the ROS-NETosis axis
2026-Apr-13, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-026-00448-x
PMID:41973300
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研究论文 | 本研究探讨了肉桂酸衍生物CA7通过抑制ROS-NETosis轴在小鼠急性肝衰竭模型中的保护作用 | 首次发现CA7通过选择性抑制活性氧产生来抑制中性粒细胞胞外诱捕网形成,从而减轻肝脏氧化损伤和炎症反应 | 研究仅使用小鼠模型,尚未进行临床试验验证 | 开发急性肝衰竭的新型治疗策略 | 急性肝衰竭小鼠模型 | NA | 急性肝衰竭 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 72 | 2026-04-14 |
Single-cell RNA sequencing analysis reveals cellular heterogeneity and immune microenvironment dynamics in colorectal cancer
2026-Apr-12, The International journal of biological markers
DOI:10.1177/03936155261441324
PMID:41968056
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了结直肠癌中的细胞异质性和免疫微环境动态,重点关注CD8+ CD101hiTim3+ T细胞及其前体细胞与免疫治疗反应的关联 | 识别并注释了结直肠癌中的多种T细胞亚型,构建了CCT T细胞及其前体细胞的伪时间轨迹,揭示了PD-1免疫治疗组中CCT T细胞前体与其他细胞间增强的相互作用,并开发了一个包含15个基因特征的预后模型 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;样本来源和数量可能限制结果的普适性;对免疫治疗反应的预测仍需临床数据进一步确认 | 通过研究结直肠癌微环境中的CCT T细胞及其前体细胞,识别新的治疗靶点和潜在生物标志物,并探索它们与免疫治疗反应的关联 | 结直肠癌患者样本中的T细胞,特别是CD8+ CD101hiTim3+ T细胞及其前体细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 预后模型(基于基因特征) | 单细胞测序数据,转录组数据 | 未明确指定具体样本数量,但使用了单细胞测序数据和TCGA数据库 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 73 | 2026-04-14 |
Senescence Programs Shape the Chronic Wound Microenvironment
2026-Apr-12, Advances in wound care
IF:5.8Q1
DOI:10.1177/21621918261441046
PMID:41968061
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综述 | 本文综述了细胞衰老在慢性伤口微环境中的作用及其对愈合过程的影响 | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,揭示慢性伤口中衰老细胞的异质性及其空间分布,为靶向治疗提供新见解 | 依赖非特异性衰老标志物(如p21或SA-β-gal)导致结果解释复杂化,且衰老细胞在慢性伤口中的身份、丰度和定位仍不明确 | 探讨细胞衰老如何影响慢性伤口的愈合过程,并评估靶向衰老细胞的治疗策略 | 慢性伤口(如糖尿病足溃疡、静脉性腿部溃疡和压力性溃疡)中的衰老细胞,特别是成纤维细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 慢性伤口 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 74 | 2026-04-14 |
Mapping the immune landscape of PCa: From tumor microenvironment to therapeutics
2026-Apr-11, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2026.189586
PMID:41956336
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综述 | 本文综述了前列腺癌免疫景观的时空异质性,并探讨了从肿瘤微环境到治疗策略的生态编辑路线图 | 整合单细胞和空间转录组学数据,提出并强调了“神经-免疫-微生物组”轴这一被低估的三角调控网络,并引入了“生态编辑”作为精准肿瘤学的未来方向 | NA | 解码前列腺癌生态系统的时空异质性,并评估治疗策略如何重塑免疫景观,以提出精准肿瘤学路线图 | 前列腺癌及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 75 | 2026-04-14 |
Licochalcone A from Ma-Xing-Shi-Gan decoction to prevent Asthma through the inhibition of ferroptosis CD4+ T Cell by GART/HSP90α signaling pathway
2026-Apr-11, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116549
PMID:41967212
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研究论文 | 本研究探讨了麻杏石甘汤中的甘草查尔酮A通过抑制铁死亡CD4+ T细胞,经由GART/HSP90α信号通路预防哮喘的机制 | 首次揭示了甘草查尔酮A通过调控T细胞铁死亡,特别是通过抑制GART/HSP90α信号通路来预防哮喘,并利用单细胞RNA测序技术识别出GART作为关键候选基因 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证,且具体信号通路的上下游机制有待进一步阐明 | 探究麻杏石甘汤中的甘草查尔酮A预防哮喘的作用及其分子机制 | 雌性裸鼠和BALB/c小鼠,以及体外T细胞 | 生物医学研究 | 哮喘 | 单细胞RNA测序,网络药理学,分子对接 | NA | 基因表达数据,分子对接数据 | 未明确指定样本数量,但涉及雌性裸鼠和BALB/c小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 76 | 2026-04-14 |
Oscillatory gene expression in cell differentiation and tissue patterning
2026-Apr-11, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2026.102470
PMID:41967294
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综述 | 本文综述了振荡基因表达在细胞分化和组织模式形成中的功能作用,特别关注细胞命运决策的时机 | 整合了成像技术和单细胞转录组学的最新进展,揭示了超昼夜节律基因表达在发育和组织稳态中的普遍性及其调控机制 | 作为综述文章,未提供原始实验数据,且对振荡基因表达的具体分子机制讨论可能不够深入 | 探讨振荡基因表达在细胞命运调控和组织模式形成中的功能角色 | 基因表达动态、细胞命运决策、组织模式 | 自然语言处理 | NA | 成像技术、单细胞转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 77 | 2026-04-14 |
SCTGE infers transformer-based graph embeddings to improve cell-cell interaction identification and cell identity annotations
2026-Apr-11, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本文提出了一种名为SCTGE的新型架构,该架构结合了基于Transformer的自注意力和图神经网络,用于解决空间感知的单细胞嵌入问题,以改进细胞间相互作用识别和细胞身份注释 | SCTGE整合了自适应多尺度注意力以平衡全局-局部依赖关系、图特定编码以保持空间关系,并引入了上下文感知自适应多头注意力和APPNP增强的特征传播等创新,共同应对空间转录组学中的可扩展性和噪声挑战 | 在某些特定情况下,SCTGE在细胞身份注释方面可能表现不如其他工具,存在例外情况 | 旨在通过计算生物学方法改进单细胞转录组数据分析,特别是在空间嵌入提取、细胞间通信分析和细胞身份注释方面 | 单细胞转录组数据 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | Transformer-based Graph Neural Networks | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 78 | 2026-04-14 |
COPD reshapes the tumor microenvironment of NSCLC and enhances anti-PD-1 therapy response
2026-Apr-10, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2025.100996
PMID:41690302
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研究论文 | 本研究揭示了慢性阻塞性肺疾病(COPD)通过重塑非小细胞肺癌(NSCLC)的肿瘤微环境,特别是通过诱导上皮细胞重塑和建立CXCL14-CXCR4信号轴来招募巨噬细胞,从而增强抗PD-1免疫疗法的疗效 | 首次通过整合多组学分析和功能验证,阐明了COPD作为共病通过诱导特定的基底样肿瘤细胞群和建立肿瘤-巨噬细胞招募回路来增强NSCLC对PD-1阻断剂反应的分子机制 | 研究主要基于手术切除的新鲜肿瘤样本,样本量可能有限,且机制验证主要在体外进行,需要进一步的体内模型验证 | 探究COPD如何影响NSCLC的肿瘤微环境并增强抗PD-1免疫疗法的疗效 | 非小细胞肺癌(NSCLC)患者,特别是伴有COPD共病的患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,免疫荧光图像 | 三个临床队列的新鲜手术肿瘤标本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 79 | 2026-04-14 |
Single-cell transcriptomics brings stroke thrombi into cellular and molecular focus: A commentary on "characterizing stroke clots using single-cell sequencing"
2026-Apr-10, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism
IF:4.9Q1
DOI:10.1177/0271678X261437925
PMID:41958358
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评论 | 本文评论了单细胞转录组学在人类缺血性卒中血栓研究中的应用,强调了血栓作为免疫活性微环境的重要性 | 通过单细胞RNA测序技术,揭示了卒中血栓并非惰性栓塞物质,而是具有结构化、免疫活性且受卒中病因塑造的微环境 | NA | 探讨单细胞转录组学如何提升对卒中血栓细胞和分子特征的理解 | 人类缺血性卒中血栓 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 80 | 2026-04-11 |
Integrating machine learning and spatial transcriptomics uncovers shared immunomodulatory deubiquitinases in MAFLD and HCC
2026-Apr-10, Human genetics
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s00439-026-02833-6
PMID:41961303
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |