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当前共找到 36477 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-02-17 |
Bulk and Single-Cell Transcriptomics Reveal That SCO2 Drives Psoriasis via Activating CCR7+ Dendritic Cell
2026-Jan-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27031397
PMID:41683819
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研究论文 | 本研究通过整合批量与单细胞转录组学，揭示了线粒体蛋白SCO2在银屑病中作为关键致病枢纽基因，通过激活CCR7+树突状细胞驱动疾病进程 | 首次将SCO2鉴定为连接角质形成细胞代谢与适应性免疫的关键免疫代谢开关，并阐明其通过MIF-(CD74+CD44)相互作用促进CCR7+树突状细胞活化的新机制 | 研究主要基于转录组学和体外实验，缺乏体内功能验证和临床干预试验 | 探究乳酸代谢在角质形成细胞介导的免疫失调中的作用，并识别银屑病的关键致病基因 | 银屑病皮损组织中的角质形成细胞和CCR7+树突状细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 代谢测定 | NA | 转录组数据, 图像数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 62 | 2026-02-17 |
Single-Cell Comparison of Small Intestinal Neuroendocrine Tumors and Enterochromaffin Cells from Two Patients
2026-Jan-29, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18030435
PMID:41681906
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序比较了两名患者的小肠神经内分泌肿瘤细胞与正常黏膜中的肠嗜铬细胞，揭示了肿瘤细胞的转录组特征和功能重编程 | 首次在单细胞水平直接比较SI-NET肿瘤细胞与其起源细胞肠嗜铬细胞，并采用两步验证策略减少假阳性发现 | 样本量较小（仅两名患者），统计功效和普适性有限，特别是关于血清素表型的关联性需要更大规模研究验证 | 识别小肠神经内分泌肿瘤发展的驱动因素及其转移的分子机制 | 小肠神经内分泌肿瘤细胞和正常黏膜中的肠嗜铬细胞 | 单细胞测序 | 小肠神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两名患者的原发SI-NET和配对正常黏膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 63 | 2026-02-17 |
The Novel Soluble Guanylate Cyclase Stimulator Attenuates Acute Lung Injury via Inhibiting Pericyte Phenotypic Transition
2026-Jan-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27031346
PMID:41683771
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研究论文 | 本研究通过结构修饰开发了一种新型可溶性鸟苷酸环化酶刺激剂sGC003，并在小鼠急性肺损伤模型中验证了其通过抑制周细胞表型转换来减轻肺损伤的疗效 | 首次通过单细胞RNA测序和免疫荧光共定位分析证实sGC主要在周细胞中表达，并揭示了sGC刺激剂通过NO-sGC-cGMP通路调节LPS诱导的周细胞转录组重编程的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证；sGC003的长期安全性和药代动力学特性需要进一步评估 | 探究可溶性鸟苷酸环化酶在急性肺损伤中的作用机制，并开发新型sGC刺激剂用于治疗 | 小鼠急性肺损伤模型、肺组织周细胞 | 单细胞组学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序、免疫荧光共定位分析、假时间分析 | NA | 单细胞转录组数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 64 | 2026-02-17 |
Hypoxia-Driven Pulmonary Adaptation in the Yak: A Homeostatic Mechanism Mediated by Cell Adhesion Molecules
2026-Jan-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27031368
PMID:41683789
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研究论文 | 本研究通过转录组测序、分子生物学实验和单细胞RNA测序，揭示了细胞粘附分子在牦牛肺组织适应高海拔低氧环境中的关键作用 | 首次系统阐明了细胞粘附分子在牦牛高海拔肺适应中的调控网络，并利用单细胞分辨率揭示了不同肺细胞亚群中粘附状态的异质性变化 | 研究主要基于相关性分析，缺乏直接的体内功能验证实验来证实CAMs调控的具体因果机制 | 探究牦牛肺组织适应高海拔低氧环境的分子机制，特别是细胞粘附分子的作用 | 高海拔与低海拔地区的牦牛肺组织 | 单细胞组学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qRT-PCR, 免疫组化, 电感耦合等离子体质谱 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 图像数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及高海拔和低海拔两组牦牛肺组织 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3‘基因表达解决方案（基于文中“10× scRNA-seq”描述推断） |
| 65 | 2026-02-17 |
Single-Cell RNA-Seq Profiling of Transposable Element Expression in Human Peripheral Blood Cells During Viral Infections
2026-Jan-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27031286
PMID:41683713
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，分析了人类外周血单个核细胞在流感病毒、HIV和SARS-CoV-2感染期间非长末端重复转座元件的表达特征 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示了不同病毒感染中非长末端重复转座元件的细胞特异性表达模式，并发现其可用于区分疾病严重程度、预测进展和评估疗效 | 研究样本量相对有限（98名患者），且需要进一步研究转座元件参与抗病毒防御的具体机制以确认其作为生物标志物或治疗靶点的潜力 | 探究病毒感染期间人类外周血细胞中转座元件的表达特征及其在抗病毒免疫中的作用 | 人类外周血单个核细胞（PBMCs），特别是前体细胞毒性T淋巴细胞（T CD8+ Naive细胞） | 单细胞转录组学 | 病毒感染（流感、HIV、COVID-19） | 单细胞RNA测序 | 生物信息学分析（共表达网络分析） | 单细胞RNA测序数据 | 98名患者（涵盖流感病毒、HIV和SARS-CoV-2感染队列） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 66 | 2026-02-17 |
IL-17 Cytokines Induce IκBζ in Dermal Fibroblasts to Promote Pro-Inflammatory Gene Expression in Psoriasis
2026-Jan-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27031297
PMID:41683722
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研究论文 | 本研究揭示了IL-17细胞因子通过诱导真皮成纤维细胞中的IκBζ表达，促进银屑病中促炎基因的表达 | 首次系统性地在真皮成纤维细胞中表征了IκBζ的调控机制，并利用空间转录组学技术验证其在银屑病皮损中的表达模式 | 研究主要基于体外细胞模型，体内功能验证尚需进一步深入 | 探究IκBζ在真皮成纤维细胞中的调控作用及其在银屑病发病机制中的贡献 | 人类真皮成纤维细胞及银屑病患者的皮肤活检组织 | 数字病理学 | 银屑病 | 空间转录组学, qPCR, Western blotting, siRNA敲低 | NA | 转录组数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 空间转录组学 | CosMx™ | NA |
| 67 | 2026-02-17 |
Multimodal single-cell network analysis uncovers BSG/CD147 as an early biomarker and signaling hub in hepatocellular carcinoma
2026-Jan-27, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8593693/v1
PMID:41646335
|
研究论文 | 本研究通过多模态单细胞网络分析，揭示了BSG/CD147作为肝细胞癌早期生物标志物和信号枢纽的作用 | 首次通过整合单细胞RNA测序、高维加权基因共表达网络分析和细胞间通讯分析，系统性地识别出BSG/CD147作为肝细胞癌早期恶性转化过程中的关键枢纽基因，并验证了其在小于2厘米小病灶中的高诊断准确性 | 研究依赖于两个公开的单细胞RNA测序数据集，样本来源和数量可能有限；体外验证虽证实了蛋白表达差异，但需要更多前瞻性临床研究来确认其临床应用价值 | 识别肝细胞癌早期恶性转化阶段的分子标志物，以改善早期诊断 | 肝细胞癌组织与非肿瘤肝组织中的肝细胞亚群 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，定量免疫荧光 | 高维加权基因共表达网络分析，CellChat，蛋白质-蛋白质相互作用分析 | 单细胞转录组数据，免疫荧光图像数据 | 两个独立单细胞RNA测序数据集（GSE149614和GSE189903），包含非肿瘤和肝细胞癌组织；配对人类肝脏标本用于验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 68 | 2026-02-17 |
Intracerebral hemorrhage induces monocyte TNF signaling that is suppressed by Siponimod (BAF312): a single-cell transcriptomics study in patients
2026-Jan-27, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.01.22.26344292
PMID:41646803
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和血浆细胞因子分析，探讨了免疫调节药物BAF312（Siponimod）对脑出血患者外周血免疫反应的影响 | 首次在脑出血患者中应用单细胞转录组学分析，揭示BAF312如何抑制单细胞TNF信号通路，并发现单细胞TNF信号增强与更好功能结局相关 | 研究未涉及脑组织样本，且BAF312未影响血浆细胞因子或趋化因子浓度，样本量可能有限 | 研究脑出血后免疫反应及BAF312的免疫调节作用 | 脑出血患者的外周血样本 | 单细胞转录组学 | 脑出血 | 单细胞RNA测序，血浆细胞因子分析 | NA | RNA序列数据，血浆细胞因子数据 | 脑出血患者的外周血样本，在出血后第1、3、7天采集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 69 | 2026-02-17 |
Identification and characterization of fibroblast-related biomarkers and pro-inflammatory subpopulations in periodontitis by integrated transcriptomic and single-cell analysis
2026-Jan-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-37385-2
PMID:41588193
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研究论文 | 本研究通过整合转录组学和单细胞RNA测序数据，识别了牙周炎中成纤维细胞相关的生物标志物和促炎亚群，并构建了诊断模型 | 首次整合批量转录组和单细胞RNA测序数据，使用LASSO回归识别出六个成纤维细胞相关基因（FRGs），并发现CXCL13⁺成纤维细胞这一促炎亚群，为牙周炎提供了新的诊断和治疗靶点 | 研究主要基于公共数据集（GSE10334、GSE16134、GSE173078），样本来源和数量可能有限，且实验验证仅通过qRT-PCR、IHC和FISH进行，需要进一步的功能性研究来确认这些基因和亚群的具体作用机制 | 探索牙周炎中成纤维细胞相关的生物标志物和促炎亚群，以开发潜在的治疗策略 | 牙周炎组织中的成纤维细胞 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量转录组学、qRT-PCR、免疫组化（IHC）、荧光原位杂交（FISH） | LASSO回归、诊断模型、列线图 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 基于多个公共数据集（GSE10334、GSE16134、GSE173078），具体样本数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 70 | 2026-02-17 |
ICI-induced Granulomatous Sialadenitis is Responsive to Prednisone
2026-Jan-26, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.01.21.26344113
PMID:41646709
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研究论文 | 本文报告了首例免疫检查点抑制剂诱导的肉芽肿性涎腺炎病例，并通过整合组织学、单细胞RNA测序和空间转录组学分析揭示了其发病机制 | 首次报道免疫检查点抑制剂诱导的肉芽肿性涎腺炎，并利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术深入解析其细胞和分子机制 | 研究仅基于单个病例，样本量有限，且尽管治疗改善了唾液流率和组织结构，但广泛的纤维化持续存在 | 研究免疫检查点抑制剂引起的免疫相关不良事件（irAEs）的病理机制及治疗反应 | 一名患有BRAF-V600E突变乳头状甲状腺癌的中年男性患者 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 组织学图像, 单细胞RNA测序数据, 空间转录组学数据 | 1例患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 71 | 2026-02-17 |
Distinct Endothelial Phenotype Associates with Macrophage-Enriched Microenvironments in Triple-Negative Breast Cancer
2026-Jan-23, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8595402/v1
PMID:41646309
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研究论文 | 本研究探讨了三阴性乳腺癌中巨噬细胞富集微环境与血管状态之间的关联 | 揭示了巨噬细胞富集肿瘤中血管正常化的特征，并通过单细胞RNA测序发现了内皮细胞炎症基因的上调及静脉样状态 | 研究主要基于小鼠模型和人类单细胞数据集，可能无法完全反映临床异质性 | 探究三阴性乳腺癌中巨噬细胞微环境对肿瘤血管的影响 | 小鼠三阴性乳腺癌模型及人类三阴性乳腺癌单细胞数据集 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 72 | 2026-02-17 |
The Landscape of Ferroptosis-Related Gene Signatures as Molecular Stratification in Triple-Negative Breast Cancer
2026-Jan-23, Diagnostics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/diagnostics16030379
PMID:41681697
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研究论文 | 本研究通过转录组和蛋白质组数据分析，揭示了三阴性乳腺癌中铁死亡相关基因的分子分层特征 | 首次在三阴性乳腺癌中系统描绘了铁死亡相关基因的分子分层景观，并构建了铁死亡指数作为预后标志 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证其生物学机制和临床转化价值 | 探索铁死亡相关基因在三阴性乳腺癌中的分子分层和预后价值 | 三阴性乳腺癌患者的转录组和蛋白质组数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 转录组测序，蛋白质组分析，单细胞RNA测序 | LASSO回归模型，Cox回归模型 | 基因表达数据，蛋白质表达数据 | 来自METABRIC、TCGA、GEO和CPTAC数据库的多中心样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 73 | 2026-02-17 |
scIRT: Imputation and Dimensionality Reduction for Single-Cell RNA-Seq Data by Combining NMF with SMOTE
2026-Jan-23, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27031173
PMID:41683604
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研究论文 | 本文提出了一种名为scIRT的迭代插补流程，结合SMOTE和NMF技术，用于单细胞RNA测序数据的插补和降维 | 通过结合合成少数类过采样技术（SMOTE）和非负矩阵分解（NMF），同时实现数据插补和降维，提高了单细胞RNA测序数据的处理性能 | NA | 开发一种预处理工具，以改善单细胞RNA测序数据的质量，便于下游分析如细胞类型聚类和可视化 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NMF, SMOTE | 基因表达矩阵 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 74 | 2026-02-17 |
Dynamic single-cell transcriptomics reveals lsamp-guided neural network formation in male S. japonicum driving female reproduction
2026-Jan-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68305-7
PMID:41571647
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了日本血吸虫雄性个体中lsamp基因引导的神经网络形成如何驱动雌性生殖成熟 | 首次构建了日本血吸虫高分辨率单细胞转录组图谱，发现雄性特异性N4.3神经元亚型及其关键基因lsamp在神经网络形成和雌雄互作中的作用 | 研究主要基于转录组数据，功能验证可能有限，且样本仅涵盖四个发育阶段 | 探究血吸虫雌雄配对过程中细胞动态和神经调控机制 | 日本血吸虫（Schistosoma japonicum）雄性和雌性个体 | 单细胞转录组学 | 血吸虫病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 104,671个细胞，来自雄性和雌性日本血吸虫的四个发育阶段 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 75 | 2026-02-17 |
Evaluating deconvolution methods using real bulk RNA-expression data for robust prognostic insights across cancer types
2026-Jan-21, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-03942-1
PMID:41566530
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研究论文 | 本研究提出了一种基于真实批量RNA表达数据的新框架，用于评估五种去卷积方法，并识别出ReCIDE和BayesPrism作为稳健方法，同时发现基质癌症相关成纤维细胞（mCAF）作为跨多种癌症的预后标志物 | 引入了一个新颖的真实数据框架，利用18个真实批量RNA表达队列来评估去卷积方法，并基于三种创新基准场景（与scRNA-seq的一致性、跨队列可重复性、预后相关性可重复性）进行验证 | 传统伪批量基准在真实世界设置中可能不可靠，因为绝对细胞比例未知 | 评估去卷积方法在真实批量RNA表达数据中的性能，以提供精准肿瘤学的可操作工具并指导转化研究中的方法选择 | 18个真实批量RNA表达队列（5,891个样本）涵盖九种癌症类型，以及TCGA和GEO队列 | 自然语言处理 | 肺癌 | 批量RNA测序，单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA表达数据 | 5,891个样本 | NA | 批量RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 76 | 2026-02-17 |
CCL14, identified by multi-omics approach, serves as a novel indicator of disease severity and progression in lymphangioleiomyomatosis
2026-Jan-20, Orphanet journal of rare diseases
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s13023-025-04193-2
PMID:41559739
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研究论文 | 本研究通过多组学方法鉴定出CCL14是淋巴管平滑肌瘤病（LAM）疾病严重程度和进展的新型生物标志物 | 首次通过整合血浆蛋白质组学和单细胞RNA测序，系统揭示了CCL14在LAM中的表达模式、细胞来源及其在疾病微环境中的调控网络，并验证了其作为预测疾病进展的临床潜力 | 样本量相对有限（尤其是单细胞测序部分），且为观察性研究，需要更大规模的前瞻性队列验证CCL14的临床预测价值 | 探索CCL14在淋巴管平滑肌瘤病（LAM）中的生物学功能及其作为疾病生物标志物的临床价值 | 淋巴管平滑肌瘤病（LAM）患者和健康对照者的血浆样本及肺组织样本 | 生物信息学与多组学整合分析 | 淋巴管平滑肌瘤病 | 蛋白质组学分析, 单细胞RNA测序（scRNA-seq）, ELISA | 生物信息学通路富集分析, CellPhoneDB细胞互作分析 | 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据, 临床表型数据 | 单细胞测序：6名LAM患者和5名健康供体的肺组织；ELISA验证：53名LAM患者和25名对照的血浆样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 血浆蛋白质组学 | NA | NA |
| 77 | 2026-02-17 |
Dysregulated TGFβ-ERK Signaling Drives Aberrant Extracellular Matrix Production in Noonan Syndrome-Associated Pulmonary Valve Stenosis
2026-Jan-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.16.700032
PMID:41648231
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研究论文 | 本研究利用人iPSC瓣膜分化平台，揭示了Noonan综合征相关肺动脉瓣狭窄中TGFβ-ERK信号失调驱动细胞外基质异常产生的分子机制 | 首次建立人iPSC瓣膜分化平台模拟NS相关PVS，结合单细胞转录组学和磷酸化蛋白质组学揭示TGFβ信号通路异常激活是导致ECM病理改变的核心机制 | 研究样本量有限（仅两个NS婴儿瓣膜组织验证），iPSC模型可能无法完全模拟体内复杂微环境 | 阐明Noonan综合征相关肺动脉瓣狭窄的分子发病机制 | CRISPR编辑的iPSC衍生的瓣膜间质细胞亚型（纤维层和海绵层VICs），NS婴儿的狭窄肺动脉瓣组织 | 发育生物学与疾病建模 | 先天性心脏病（肺动脉瓣狭窄） | iPSC分化、CRISPR基因编辑、单细胞RNA测序、磷酸化蛋白质组学（质谱）、组织病理学分析 | 人iPSC疾病模型 | 单细胞转录组数据、磷酸化蛋白质组数据、组织病理图像 | CRISPR编辑的多种基因型iPSC系，两个NS婴儿的肺动脉瓣组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 78 | 2026-02-17 |
Multimodal single-cell and spatial profiling reveals altered T cell-mediated immunity and B-cell follicular architecture in non-metastatic lymph nodes of patients with aggressive non-small cell lung cancer
2026-Jan-18, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.01.12.25343268
PMID:41646724
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研究论文 | 本研究通过多模态单细胞和空间分析，揭示了侵袭性非小细胞肺癌患者非转移性区域淋巴结中T细胞介导的免疫和B细胞滤泡结构的改变 | 首次结合CITE-seq、scRNA-seq和成像质谱流式细胞术，在侵袭性NSCLC患者的非转移性区域淋巴结中识别出免疫抑制微环境和B细胞滤泡结构异常 | 样本量较小（36个淋巴结来自11名患者），且仅针对非转移性淋巴结进行研究，可能未涵盖转移性淋巴结的免疫特征 | 探究侵袭性非小细胞肺癌患者非转移性区域淋巴结中的免疫失调机制 | 非小细胞肺癌患者的区域淋巴结 | 数字病理学 | 肺癌 | CITE-seq, scRNA-seq, 成像质谱流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据、蛋白质表达数据、空间成像数据 | 36个淋巴结来自11名患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 79 | 2026-02-17 |
Uniform pre-processing of bacterial single-cell RNA-seq
2026-Jan-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.04.692398
PMID:41648409
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研究论文 | 本文介绍了一种针对细菌单细胞RNA测序数据的统一预处理方法，通过改进kallisto-bustools工具套件以适应细菌基因组的特性 | 将原本用于真核生物scRNA-seq的kallisto-bustools工具套件进行优化，使其能够处理细菌的操纵子结构和更短的基因长度分布，实现了细菌scRNA-seq数据的高效准确量化 | 未明确说明该方法在具体细菌种类或实验条件下的性能限制，也未与其他预处理方法进行广泛比较 | 开发一种统一、高效的细菌单细胞RNA测序数据预处理方法，以促进微生物单细胞转录组学的标准化分析 | 细菌单细胞RNA测序数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 80 | 2026-02-17 |
3D reconstruction of spatial transcriptomics with spatial pattern enhanced graph convolutional neural network
2026-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.13.699328
PMID:41648149
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Spa3D的新方法，利用反泄漏傅里叶变换和图卷积神经网络模型，从多个2D空间转录组学切片中重建3D空间结构 | Spa3D通过3D重建改进了空间域识别，阐明了3D细胞组织中的细胞间通讯景观，以3D方式建模器官级时空发育模式，并注释了2D空间坐标无法捕获的3D空间轨迹 | NA | 解决现有空间转录组学数据分析方法仅依赖2D空间坐标的局限性，以更准确地识别3D空间域、空间可变基因、细胞间通讯和发育轨迹 | 空间转录组学数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 图卷积神经网络 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |