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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
61 2026-01-07
MMSpa is a deep learning-based tool that enhances the identification of spatial domains in spatial transcriptomics studies
2026-Jan, PLoS biology IF:7.8Q1
研究论文 本文提出了一种名为MMSpa的深度学习工具,用于增强空间转录组学研究中空间区域的识别能力 MMSpa采用掩码图注意力自编码器框架,结合边移除策略构建增强的空间图,以解决跨区域干扰并刻画更清晰的区域边界,通过掩码基因表达重建学习稳定的潜在表征 NA 提高空间转录组学中空间区域的识别准确性 空间转录组学数据 数字病理学 NA 空间转录组学 掩码图注意力自编码器 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
62 2026-01-07
HBx hijacks the miR-19a-3p/BAMBI/TGF-β1 axis to impair the anti-tumour activity of CD4+ T cells in diffuse large B-cell lymphoma
2026-Jan, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本研究揭示了HBV感染通过HBx蛋白下调miR-19a-3p,激活BAMBI/Wnt信号通路,进而促进TGF-β1分泌,从而损害弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)中CD4+ T细胞的抗肿瘤活性 首次阐明了HBV感染通过HBx-miR-19a-3p-BAMBI/TGF-β1轴调控肿瘤微环境中CD4+ T细胞功能耗竭的具体分子机制,并利用单细胞测序解析了TGFB1-TGFBR2配体-受体对在介导DLBCL细胞与CD4+ T细胞通讯中的关键作用 研究主要基于细胞和小鼠模型,其结论在人类患者中的普适性仍需进一步临床验证;针对miR-19a-3p或TGF-β的靶向治疗策略尚未进行临床试验 探究HBV感染导致DLBCL预后不良的免疫学机制,特别是HBx如何介导肿瘤细胞与免疫细胞间的相互作用 HBV阳性的弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者样本、DLBCL细胞系、CD4+ T细胞以及小鼠模型 肿瘤免疫学 弥漫性大B细胞淋巴瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、双荧光素酶报告实验、qRT-PCR、蛋白质印迹、染色质免疫沉淀、免疫共沉淀、流式细胞术、酶联免疫吸附试验、免疫组织化学 NA 单细胞转录组数据、基因表达数据、蛋白质数据 未在摘要中明确说明具体样本数量,但涉及了HBV+ DLBCL患者队列分析、细胞实验和小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
63 2026-01-07
Whole-heart 3D reconstruction of mouse CVB3 myocarditis reveals spatial and transcriptomic heterogeneity of immune foci
2025-Dec-31, Cardiovascular research IF:10.2Q1
研究论文 本研究利用新型大组织学重建工作流程CODA,对小鼠CVB3心肌炎进行全心脏3D重建,结合免疫组化染色和空间RNA测序,揭示了心肌炎炎症灶在空间、形态、免疫和转录组层面的异质性 开发了CODA工作流程,首次实现急性小鼠CVB3心肌炎在单细胞分辨率下的全心脏3D重建,并整合多模态数据揭示免疫灶的空间和转录组异质性 研究主要基于小鼠模型,虽在人类扩张型心肌病心脏中验证了部分发现,但仍需进一步临床研究确认其普遍性 探究心肌炎炎症灶的空间、形态、免疫和转录组异质性 小鼠CVB3心肌炎模型及人类扩张型心肌病移植心脏 数字病理学 心血管疾病 空间RNA测序、免疫组化染色、流式细胞术、qRT-PCR NA 图像、转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
64 2026-01-07
4R-tau seeding activity reveals molecular subtypes in progressive supranuclear palsy
2025-Dec-31, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过分析进行性核上性麻痹(PSP)患者大脑中tau蛋白的分子形式,揭示了tau种子活性与疾病分子异质性的关联 首次发现高分子量tau组装体在PSP患者大脑中的丰度和生物活性存在差异,并证明tau种子活性可反映疾病的分子异质性 样本量相对有限,需要更大规模研究验证;分子机制尚未完全阐明 探究PSP临床异质性的分子基础,开发患者分层方法 进行性核上性麻痹(PSP)患者大脑组织 神经退行性疾病研究 进行性核上性麻痹 生化检测、种子扩增试验、蛋白质组学分析、空间转录组学 NA 蛋白质数据、转录组数据 PSP患者大脑组织样本(具体数量未明确说明) NA 空间转录组学 NA NA
65 2026-01-07
Single-cell RNA-sequencing-guided reactive oxygen species-scavenging hydrogel design for regeneration of osteoporotic bone
2025-Dec-31, Journal of Zhejiang University. Science. B
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,设计了一种微环境适应性水凝胶系统,用于促进骨质疏松性骨缺损的再生修复 利用单细胞RNA测序识别骨质疏松微环境中的ROS过载成骨细胞亚群,并以此为指导设计具有双重功能(清除ROS并抑制破骨细胞分化)的水凝胶系统 研究主要在骨质疏松小鼠模型中进行,尚未在人类临床试验中验证其安全性和有效性 开发针对骨质疏松病理微环境的生物材料,以促进骨缺损的再生修复 骨质疏松性骨缺损,特别是骨髓间充质干细胞和破骨细胞 数字病理学 骨质疏松症 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 骨质疏松小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
66 2026-01-07
Constructing a PANoptosis-based prognostic signature to evaluate the immune landscape and therapeutic response in clear cell renal cell carcinoma
2025-Dec-31, Journal of Zhejiang University. Science. B
研究论文 本研究构建了一个基于PANoptosis的预后特征,用于评估透明细胞肾细胞癌的免疫景观和治疗反应 首次在ccRCC中整合焦亡、凋亡和坏死性凋亡相关基因构建预后模型PANI,并验证其在免疫治疗反应预测中的价值 研究主要基于回顾性数据,需要前瞻性临床验证;模型在外部数据集中的验证有限 识别ccRCC中PANoptosis相关基因,用于患者分层和预后预测 透明细胞肾细胞癌患者 生物信息学 肾细胞癌 差异表达分析、WGCNA、LASSO回归、Cox回归、scRNA-seq、免疫组化、RT-qPCR、CCK-8检测、Transwell实验 预后模型(PANI) 基因表达数据、临床数据、单细胞RNA测序数据 未明确指定样本数量,但使用了外部数据集E-MTAB-1980进行验证 NA 单细胞RNA测序 NA NA
67 2026-01-07
Dissection of Gαs and Hedgehog Signaling Crosstalk Reveals Therapeutic Opportunities to Target Hedgehog-Dependent Tumors
2025-Dec-29, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究通过组织学、bulk RNA测序和单细胞RNA测序,揭示了Gαs和Hedgehog信号通路在基底细胞癌中的交互作用,并提出了针对Hedgehog依赖性肿瘤的治疗策略 首次发现Gαs通路失活可驱动与经典Hedgehog信号相似的基底细胞癌样肿瘤,并识别出Gαs和PKA活性降低的突变存在于人类BCC中,为SMO非依赖性肿瘤提供了新的治疗靶点 研究主要基于小鼠模型和有限的人类BCC样本,临床转化需进一步验证 探究Gαs和Hedgehog信号通路的交互作用及其在基底细胞癌发生和治疗中的潜在应用 小鼠基底细胞癌样肿瘤和人类基底细胞癌样本 数字病理学 基底细胞癌 组织学分析、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 NA 图像、RNA测序数据 未明确指定样本数量,但涉及小鼠肿瘤模型和人类BCC样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
68 2026-01-07
Single-Cell Transcriptome Analysis of the Retina During the Development of Normal Tension Glaucoma in Mice
2025-Dec-28, Inflammation IF:4.5Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析OPTN E50K突变小鼠视网膜,揭示了正常眼压性青光眼发展过程中视网膜神经节细胞和胶质细胞的转录特征及相互作用 首次在正常眼压性青光眼小鼠模型中应用单细胞转录组学,系统揭示了小胶质细胞和Müller细胞在疾病进展中的动态变化及CD74-MIF通路的关键作用 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;样本量未明确说明;未涉及其他青光眼亚型 探究正常眼压性青光眼发展过程中视网膜细胞类型的分子变化及胶质细胞与神经节细胞的相互作用机制 OPTN E50K突变小鼠的视网膜细胞 数字病理学 青光眼 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 不同年龄的OPTN E50K突变小鼠(具体数量未说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
69 2026-01-07
Single cell transcriptomic profiling uncovers shared inflammatory pathways and immune dysregulation underlying the asthma to lung cancer transition
2025-Dec-24, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了肺癌免疫细胞景观,并探讨了CXCL12-CXCR4信号轴在免疫细胞相互作用中的关键作用 结合单细胞转录组学和空间分析,揭示了肺癌免疫微环境中细胞亚群的复杂空间分布和动态变化,并通过qRT-PCR验证了关键基因的表达 研究主要基于单细胞测序数据,样本量可能有限,且体外细胞系验证可能无法完全反映体内肿瘤微环境的复杂性 探究肺癌免疫微环境中免疫细胞的时空行为及关键基因表达,以理解疾病进展并发现治疗靶点 肺癌免疫细胞,包括肿瘤相关巨噬细胞和细胞毒性T细胞等 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序,qRT-PCR UMAP,t-SNE 单细胞转录组数据,基因表达数据 未明确指定样本数量,但涉及肺癌细胞系 NA 单细胞RNA-seq NA NA
70 2026-01-07
Integration analysis of single-cell and spatial transcriptomics identifies prognostic genes associated with neddylation in colorectal cancer
2025-Dec-24, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞和空间转录组学数据,识别了与结直肠癌中neddylation相关的预后基因,并构建了一个三基因预后模型 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,系统性地筛选与neddylation修饰相关的结直肠癌预后基因,并构建了新的三基因预后模型 研究依赖于公共数据集,缺乏独立的前瞻性队列验证;空间转录组样本量有限;未进行实验验证 识别与neddylation相关的结直肠癌预后基因,以改进结直肠癌的治疗策略 结直肠癌患者 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序, 空间转录组测序, 生物信息学分析 预后风险模型, 列线图模型 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 批量RNA测序数据 TCGA-CRC数据集(训练/内部验证,7:3分割),GSE28722(外部验证),GSE132257(scRNA-seq),GSE226997(ST) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
71 2026-01-07
MIF Regulates the Th17/Treg Ratio to Exacerbate Kidney Injury in Chronic Kidney Disease
2025-Dec-23, Inflammation IF:4.5Q2
研究论文 本研究探讨了巨噬细胞迁移抑制因子(MIF)通过调节Th17/Treg比例加剧慢性肾病肾损伤的机制 揭示了MIF通过MIF-(CD74+CXCR4)通路调控Th17/Treg比例,并证实肾组织特异性抑制MIF可逆转肾损伤 样本量相对较小(15例CKD患者和20例健康个体用于单细胞测序),且主要依赖小鼠模型验证,临床转化需进一步研究 探究MIF介导的Th17/Treg比例变化对慢性肾病肾损伤的影响 慢性肾病患者、健康个体、5/6肾切除小鼠模型 单细胞测序 慢性肾病 单细胞测序、流式细胞术 NA 单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据 15例CKD患者和20例健康个体(单细胞测序),20例CKD患者和10例健康供者(流式细胞术),5/6肾切除小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
72 2026-01-07
The Sixth Annual Symposium of the Midwest Aging Consortium
2025-Dec-22, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
会议记录 本文记录了2025年4月在美国明尼苏达州罗切斯特市梅奥诊所举行的中西部衰老联盟第六届年度研讨会的概况与成果 强调了区域合作平台在促进跨学科衰老研究、整合前沿方法(如单细胞与空间转录组学)以及加速基础发现向临床转化方面的持续影响力 本文为会议记录,非原创性研究论文,未报告具体实验数据或新发现 促进衰老研究领域的跨学科合作、知识交流与区域协同创新,加速衰老机制发现向临床干预的转化 衰老研究人员(包括受训人员和早期职业研究者)、衰老生物学机制、新型治疗概念与临床试验方法 老年医学 老年疾病 单细胞转录组学, 空间转录组学, 代谢组学, 类器官培养 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
73 2026-01-07
Hepatic adaptation to chronic metabolic stress primes tumorigenesis
2025-Dec-22, Cell IF:45.5Q1
研究论文 本研究通过跨物种纵向单细胞多组学分析,揭示了慢性代谢压力下肝细胞的功能变化如何为未来肿瘤发生奠定基础 开发了整合计算方法,识别并实验验证了扰动肝细胞功能平衡、在压力下增加增殖并直接促进未来肿瘤发生的关键调控因子 未明确说明样本的具体数量或实验设计的局限性 探究慢性代谢压力对肝细胞功能的影响及其与肿瘤发生的关系 肝细胞(非转化肝细胞) 数字病理学 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH) 单细胞多组学、空间转录组学 整合计算方法、地理回归分析 单细胞多组学数据、空间转录组学数据 NA NA 单细胞多组学, 空间转录组学 NA NA
74 2026-01-07
Atherosclerosis licenses for an exceeding immune response in COVID-19 disease by interferon priming in circulating myeloid cells
2025-Dec-13, Cardiovascular research IF:10.2Q1
研究论文 本研究探讨了动脉粥样硬化性心血管疾病(ASCVD)患者如何通过表观遗传印记在循环髓系细胞中引发过度的免疫反应,从而在COVID-19中导致更严重的疾病 揭示了ASCVD患者通过单核细胞的表观遗传启动,增强炎症介质和I型干扰素信号表达,导致COVID-19中髓系免疫反应失调的分子机制 研究主要基于德国队列,可能无法完全推广到其他人群;且机制验证部分依赖于体外实验 探究心血管疾病患者COVID-19病情加重的分子机制 ASCVD患者与无ASCVD患者的免疫细胞(特别是髓系细胞) 单细胞组学与免疫学 心血管疾病与COVID-19 单细胞RNA测序、ATAC测序、体外感染实验、多重细胞因子检测、ELISA、bulk RNA测序 NA 单细胞转录组数据、表观基因组数据、细胞因子数据、RNA测序数据 德国全国性队列(NAPKON)中的患者样本 NA 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, bulk RNA-seq NA NA
75 2026-01-07
Exploring the role of PANoptosis in idiopathic pulmonary fibrosis based on scRNA-seq and bulk-seq
2025-Dec-10, Clinical and experimental medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究结合单细胞RNA测序和转录组数据,探讨了PANoptosis在特发性肺纤维化发病机制中的作用 首次将PANoptosis(一种整合了细胞焦亡、凋亡和坏死性凋亡的新型程序性细胞死亡形式)的概念引入IPF研究,并基于此构建了诊断预测模型 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要进一步的前瞻性临床研究验证 阐明PANoptosis在特发性肺纤维化发病机制中的作用,并开发诊断预测模型 特发性肺纤维化患者及动物模型的肺组织 生物信息学 特发性肺纤维化 单细胞RNA测序,转录组测序,qRT-PCR WGCNA,机器学习方法 基因表达数据 基于GEO数据集GSE227136及其他转录组数据,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
76 2026-01-07
Ketogenic diet impairs NK cell cytotoxic function in colorectal cancer liver metastasis by inducing ferroptosis via suppression of the p62-Keap1-Nrf2 pathway
2025-Dec-10, Redox biology IF:10.7Q1
研究论文 本研究揭示了生酮饮食通过诱导NK细胞铁死亡促进结直肠癌肝转移的机制 首次阐明生酮饮食通过p62-Keap1-Nrf2通路诱导NK细胞铁死亡,从而损害抗肿瘤免疫的新机制 研究主要基于小鼠模型,人体临床验证尚不充分 探究生酮饮食对结直肠癌肝转移的影响及其免疫调控机制 结直肠癌肝转移小鼠模型、患者肿瘤微环境NK细胞 肿瘤免疫学 结直肠癌 单细胞RNA测序、流式细胞术、非靶向代谢组学、免疫荧光染色 小鼠转移模型 单细胞转录组数据、代谢组数据、流式细胞数据 未明确样本数量,包含小鼠模型和患者样本对比 NA 单细胞RNA-seq NA NA
77 2026-01-07
A comparative review of single-cell atlases: mapping cellular diversity across species and tissues
2025-Dec-02, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1
综述 本文对现有单细胞图谱进行了深入的比较分析,评估了其范围、优势和局限性 基于Hrovatin等人更新的框架,系统性地比较了不同单细胞图谱,并提出了未来扩展、整合和标准化的关键建议 现有图谱在物种和组织类型代表性方面存在不足,存在关键空白 系统比较和评估现有单细胞图谱,以指导未来图谱计划的扩展、整合和标准化 单细胞图谱,如人类细胞图谱和小鼠细胞图谱 生物医学研究 NA 单细胞测序技术 NA 单细胞转录组学、表观基因组学和空间分析数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 NA NA
78 2026-01-07
Transcriptomic plasticity of cholinergic adipose macrophages in the acute thermogenic response
2025-Dec, The Journal of biological chemistry IF:4.0Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了胆碱能脂肪巨噬细胞在急性冷暴露下的转录组可塑性及其混合起源 首次在单细胞水平上系统描述了胆碱能脂肪巨噬细胞在急性冷暴露下的转录组动态变化,并揭示了其混合的胚胎和成体骨髓起源 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;功能机制研究有待深入 探究胆碱能脂肪巨噬细胞在急性产热反应中的转录组可塑性和细胞起源 小鼠皮下白色脂肪组织中的ChAT-eGFP+细胞(表达胆碱乙酰转移酶) 单细胞转录组学 代谢性疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠皮下白色脂肪组织细胞(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
79 2026-01-07
A mannitol-based buffer improves single-cell RNA sequencing of high-salt marine cells
2025-Dec-01, BMC genomics IF:3.5Q2
研究论文 本文介绍了一种基于甘露醇的缓冲液(PBS-M),用于改善高盐度海洋生物细胞的单细胞RNA测序质量 提出了一种低盐度磷酸盐缓冲液补充D-甘露醇(PBS-M),能减少细胞死亡和环境mRNA,提高单细胞RNA测序数据质量 NA 改进单细胞RNA测序技术,使其适用于高盐度环境下的海洋生物细胞研究 海鞘(Ciona robusta)的血细胞 单细胞测序 NA 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
80 2026-01-07
uPAR expression in M-MDSCs under high LDHA activity in pancreatic ductal adenocarcinoma
2025-Nov-30, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究探讨了高LDHA活性的肿瘤微环境如何通过调节胆固醇代谢通路,特别是uPAR在M-MDSCs中的表达,来促进胰腺导管腺癌的免疫抑制 首次将LDHA活性、胆固醇代谢通路与M-MDSCs上uPAR表达联系起来,阐明了乳酸代谢调控免疫抑制的新机制 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,需要在更大规模的人类队列中验证,且机制细节如uPAR如何精确调控MDSC功能仍需进一步探索 阐明高LDHA活性的肿瘤微环境如何促进胰腺导管腺癌免疫抑制的机制 胰腺导管腺癌(PDAC)的肿瘤微环境、髓源性抑制细胞(MDSCs,特别是M-MDSCs) 肿瘤免疫学、单细胞组学 胰腺癌 单细胞RNA测序、多重免疫荧光染色、基因集富集分析 NA 单细胞转录组数据、图像数据 小鼠PDAC模型(Ldha敲低组与对照组)、人类PDAC样本(高/低LDHA表达组) NA 单细胞RNA-seq NA NA
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