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当前共找到 36626 篇文献,本页显示第 61 - 80 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
61 2026-02-21
Innate antiviral and immune functions associated with the HIV reservoir decay after anti-PD-1 therapy
2026-Feb, Nature medicine IF:58.7Q1
研究论文 本研究通过多组学分析,揭示了抗PD-1疗法在HIV感染者中诱导先天抗病毒和免疫功能,并与HIV病毒库衰减相关的机制 首次在HIV感染者中,通过纵向多组学分析,明确了抗PD-1疗法诱导的持续干扰素刺激基因激活与HIV病毒库衰减之间的关联,并识别出可能从该疗法中获益的个体特征 样本量较小(30名参与者),且研究人群为同时患有HIV和癌症的特殊群体,结果可能无法推广到所有HIV感染者 探究抗PD-1疗法减少HIV病毒库的机制,并识别哪些HIV感染者可能从该疗法中获益 30名同时患有HIV和癌症的参与者(29名男性,1名女性) 免疫学 HIV感染 多组学分析,单细胞RNA测序 NA 转录组数据,临床数据 30名参与者,其中14名被追踪至治疗结束 NA 单细胞RNA测序 NA NA
62 2026-02-21
Enteric nervous system and inflammatory bowel disease
2026-Feb, Gastroenterology report IF:3.8Q2
综述 本文综述了肠道神经系统(ENS)与炎症性肠病(IBD)之间复杂的相互作用,探讨了ENS功能障碍如何促进IBD的发病机制,并评估了靶向ENS的治疗潜力 强调了ENS作为“第二大脑”在IBD中的核心作用,系统阐述了ENS功能障碍(如神经兴奋性增高、突触脆弱性)与肠道炎症的双向关联,并指出了靶向ENS的神经调控疗法作为新兴治疗前沿 研究ENS面临神经元细胞丰度低、技术限制等挑战,需要空间转录组学等先进方法来克服 探讨ENS在IBD发病机制中的作用及其作为治疗靶点的潜力 肠道神经系统、炎症性肠病、肠道胶质细胞、神经免疫相互作用 数字病理学 炎症性肠病 空间转录组学 NA NA NA NA 空间转录组学 NA NA
63 2026-02-21
Identifying cell-type-specific marker genes of dental epithelial cells using single-cell RNA sequence: A review
2026-Feb, Journal of oral biosciences IF:2.6Q1
综述 本文通过整合单细胞RNA测序数据、组织学验证、表型数据库和CAGE-seq,建立了牙上皮细胞类型的更新分子图谱 系统性地整合了已发表的scRNA-seq牙齿发育研究中的经典和新提出的标记基因,并结合实验验证和表型数据库,为牙上皮细胞类型提供了全面的分子身份描述 主要基于小鼠模型数据,可能不完全适用于人类牙上皮细胞研究,且非成釉细胞群体的分子标记和功能角色仍有待进一步探索 识别牙上皮细胞的细胞类型特异性标记基因,以理解牙齿发育中的分子异质性 牙上皮细胞,包括成釉细胞(如内釉上皮、分泌期和成熟期)以及非成釉细胞群体(如外釉上皮、星网状层和中间层) 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫染色、原位杂交、CAGE-seq NA 文本 基于已发表的小鼠牙齿组织研究,具体样本数量未在摘要中指定 NA 单细胞RNA-seq NA NA
64 2026-02-21
Microbiota-dependent transcriptional priming of lung innate immune cells in a mouse model of LPS-induced sepsis-associated lung injury
2026-Feb, Journal of oral biosciences IF:2.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序,揭示了共生微生物群在正常生理和LPS诱导的脓毒症条件下,对小鼠肺先天免疫细胞转录活性和成熟轨迹的调控作用 首次在单细胞分辨率下,系统比较了无菌小鼠与常规小鼠肺先天免疫细胞在稳态和脓毒症状态下的转录组差异,并明确了微生物信号通过调控Cebpb表达等机制影响免疫细胞的炎症准备状态 研究基于小鼠模型,结论在人体中的普适性有待验证;实验仅聚焦于LPS诱导的脓毒症模型,未涵盖其他类型的肺部损伤 阐明微生物信号如何塑造肺先天免疫系统的功能成熟及其在脓毒症相关肺损伤中的作用机制 无菌小鼠和常规小鼠的肺免疫细胞 单细胞组学 脓毒症相关肺损伤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 无菌小鼠和常规小鼠在正常及脓毒症条件下的肺免疫细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
65 2026-02-21
Applications of Spatial Transcriptomics in Ischemic Stroke Research
2026-Jan-31, The American journal of pathology
综述 本文综述了空间转录组学在缺血性卒中研究中的应用,重点探讨了胶质细胞在卒中病理生物学中的复杂作用 通过结合空间转录组学与单细胞及多组学方法,识别了新的治疗靶点,如不同激活状态的胶质细胞及其关键信号通路 当前研究仍面临挑战,包括需要多时间点分析、三维重建和标准化数据集以推动临床应用 探讨空间转录组学如何促进对卒中后细胞变化的理解,并推动卒中研究与治疗 缺血性卒中后的脑组织,特别是小胶质细胞、星形胶质细胞和少突胶质细胞 数字病理学 缺血性卒中 空间转录组学,单细胞多组学 NA 空间基因表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
66 2026-02-21
Diffusion-based Representation Integration for Foundation Models Improves Spatial Transcriptomics Analysis
2026-Jan-30, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出DRIFT框架,通过热核扩散在空间图上整合空间上下文到基础模型的输入表示中,以改进空间转录组学分析 利用热核扩散在空间图上传播嵌入,将ST数据的局部邻域上下文整合到现有单细胞基础模型中,弥补了空间信息利用的不足 未明确提及具体局限性,但可能依赖于基础模型的性能和数据质量 开发一个通用框架,将空间上下文整合到基础模型中,以提升空间转录组学数据的分析性能 空间转录组学数据及其在细胞类型注释、聚类和跨样本对齐等任务中的应用 数字病理学 NA 空间转录组学,单细胞RNA测序 基础模型(包括scRNA-seq和ST-based模型) 基因表达谱数据(空间转录组学和单细胞RNA测序数据) NA NA 空间转录组学,单细胞RNA-seq NA NA
67 2026-02-21
A Single-Cell and Spatial 3D Multi-omic Atlas of Developing Human Basal Ganglia and Inhibitory Neurons
2026-Jan-29, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞和空间多组学技术,绘制了发育中人类基底神经节和抑制性神经元的3D多组学图谱 结合单核甲基-3C测序、高多重空间转录组学和染色质+RNA单分子成像,首次揭示了基底神经节发育中的3D表观基因组动态和异质性时间进程 研究主要关注围产期人脑,可能未涵盖成年阶段的发育变化,且样本量有限 阐明基底神经节发育过程中表观基因组和3D基因组动态,以理解神经元分化和疾病风险 发育中的人类基底神经节、神经节隆起及其衍生的神经元 数字病理学 神经精神疾病 单核甲基-3C测序, 空间转录组学, 染色质+RNA单分子成像 NA 单细胞多组学数据, 空间转录组数据, 3D基因组数据 NA NA 单细胞多组学, 空间转录组学 NA NA
68 2026-02-21
A tri-omics and machine learning framework identifies prognostic biomarkers and metabolic signatures in sepsis
2026-Jan-29, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过整合转录组学、蛋白质组学、代谢组学和单细胞转录组学数据,结合机器学习方法,识别了脓毒症相关的预后生物标志物和代谢特征 建立了一个结合多组学数据、机器学习算法和单细胞分析的综合分析框架,首次将TPR和ERN1基因与脓毒症的免疫代谢重塑联系起来,并构建了基因-代谢物联合分类模型 研究缺乏独立、多组学匹配队列的外部验证,且计算筛选的中药活性单体需后续实验验证 阐明脓毒症的分子机制并识别候选生物标志物,为下游机制和转化研究提供可测试的假设 脓毒症患者的多组学数据(转录组、蛋白质组、代谢组)及单细胞转录组数据 机器学习 脓毒症 转录组学、蛋白质组学、代谢组学、单细胞转录组学、非靶向代谢组学筛选 LASSO回归、SVM-RFE算法、逻辑回归、支持向量机、随机森林 组学数据(转录组、蛋白质组、代谢组)、单细胞数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
69 2026-02-21
scAURA: Alignment- and Uniformity-based Graph Debiased Contrastive Representation Architecture for Self-Supervised Clustering of Single-Cell Transcriptomics
2026-Jan-27, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种名为scAURA的统一框架,结合图去偏对比学习和自监督聚类,用于单细胞转录组数据的细胞类型识别 scAURA通过整合图去偏对比学习与自监督聚类,解决了单细胞RNA测序数据中的高维性、稀疏性和噪声问题,在多个数据集上超越了现有最先进方法 NA 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型识别的准确性和鲁棒性 人类和小鼠的单细胞转录组数据 机器学习 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序 图去偏对比学习架构 单细胞转录组数据 18个真实单细胞数据集,涵盖多种组织和细胞类型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
70 2026-02-21
HMGB1 affects the progression of neurofibromatosis type 1-associated malignant peripheral nerve sheath tumors through E2F2
2026-Jan-24, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 本研究揭示了HMGB1通过直接转录激活E2F2,驱动神经纤维瘤病1型相关恶性外周神经鞘瘤的细胞周期进程和肿瘤恶性进展 首次在单细胞水平上整合分析NF1-MPNST和PNF组织,阐明了HMGB1通过直接结合并激活E2F2转录来驱动肿瘤进展的新机制 研究主要基于患者来源的组织和细胞系,体内模型为异种移植小鼠模型,未来需要在更接近人类肿瘤微环境的基因工程小鼠模型中进一步验证 探究HMGB1在神经纤维瘤病1型相关恶性外周神经鞘瘤进展中的功能作用和分子机制 患者来源的NF1-MPNST和丛状神经纤维瘤组织、NF1细胞系、异种移植小鼠模型 肿瘤生物学 恶性外周神经鞘瘤 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq、CUT&Tag、ChIP-qPCR、qPCR、Western blot NA RNA测序数据、蛋白质印迹数据、染色质免疫沉淀数据 患者来源的NF1-MPNST和PNF组织(具体数量未在摘要中明确说明) NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
71 2026-02-21
Spatially resolved transcriptome-metabolome integration reveals region-specific glial lipid dysregulation associated with Alzheimer's pathology
2026-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究开发了一个名为iMIST的集成平台,结合代谢物成像、组织学和空间转录组学,揭示了阿尔茨海默病小鼠模型中胶质细胞脂质代谢失调的区域特异性模式及其与病理的联系 首次开发了iMIST集成平台,能够在同一组织切片上整合MALDI代谢物成像、组织学和空间转录组学数据,直接展示了胶质细胞稳态失调如何在不同脑区和微环境中表现,并将局部病理与整体代谢失衡联系起来 研究基于小鼠模型,结果在人类中的适用性需要进一步验证;技术整合的复杂性可能限制其广泛推广 探究阿尔茨海默病中胶质细胞脂质代谢失调的空间分布特征及其与病理的关联 晚发性阿尔茨海默病小鼠模型的脑组织 空间转录组学 阿尔茨海默病 MALDI代谢物成像,空间转录组学,组织学分析 NA 空间多组学数据(代谢组、转录组、图像) NA NA 空间转录组学 NA NA
72 2026-02-21
An integrated single-cell lung cancer atlas reveals distinct fibroblast phenotypes between adenocarcinoma and squamous cell carcinomas
2026-Jan-23, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 本研究通过整合公开可用的单细胞RNA测序数据,构建了一个非小细胞肺癌的单细胞图谱,揭示了肺腺癌和肺鳞状细胞癌之间肿瘤微环境异质性和细胞组成的差异,特别是癌症相关成纤维细胞亚型的显著不同 首次大规模整合单细胞RNA测序数据构建非小细胞肺癌综合图谱,系统比较了肺腺癌和肺鳞状细胞癌中癌症相关成纤维细胞亚型的分布差异及其与预后的关联 研究依赖于公开数据,可能受原始数据质量和批次效应影响;共培养分析可能无法完全模拟体内复杂微环境 探究非小细胞肺癌中肿瘤微环境的异质性,特别是癌症相关成纤维细胞亚型在肺腺癌和肺鳞状细胞癌中的差异及其临床意义 非小细胞肺癌组织样本,重点关注癌症相关成纤维细胞 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 整合多个公开数据集的大规模样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
73 2026-02-21
Super-resolved, three-dimensional spatial transcriptomics reveals cell-type and brain-region-specific modulation of key epitranscriptomic switches following adolescent alcohol exposure
2026-Jan-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究开发了一种超分辨三维空间转录组学方法,用于量化大鼠脑内关键表观转录组开关在青少年酒精暴露后的细胞类型和脑区特异性变化 开发了首个超分辨三维空间转录组学方法,实现了在完整脑组织中以细胞类型和脑区特异性方式量化关键表观转录组调节因子 研究仅针对特定表观转录组调节因子(m6A甲基转移酶),且仅在啮齿动物模型中进行,尚未在人类样本或更广泛的表观转录组标记中验证 阐明表观转录组机制在神经精神疾病中的作用,特别是青少年酒精暴露对大脑表观转录组调控的影响 大鼠脑组织(包括杏仁核中央核、海马CA1区、齿状回、杏仁基底外侧核、海马CA3区)中的神经元、星形胶质细胞和小胶质细胞 空间转录组学 神经精神疾病 空间转录组学,表观转录组分析 NA 空间转录组数据,RNA表达数据 青少年间歇性乙醇暴露(AIE)大鼠模型 NA 空间转录组学 NA 超分辨三维空间转录组学方法(作者自主研发)
74 2026-02-21
Integrative multi-omics reveal a CD4⁺ T cell-derived six-gene signature linking the immune-stromal ecosystem to prognosis and immunotherapy selection in pancreatic cancer
2026-Jan-22, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过整合多组学数据,揭示了一个源自CD4⁺ T细胞的六基因特征,该特征将胰腺癌的免疫-基质生态系统与预后及免疫治疗选择联系起来 首次从CD4⁺ T细胞角度构建了一个六基因特征,用于连接胰腺癌的免疫-基质生态系统、预后分层和免疫治疗选择,并通过单细胞RNA测序和细胞通讯分析揭示了其细胞定位和相互作用网络 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要前瞻性临床队列进一步验证;体外细胞系实验未能完全模拟体内复杂的肿瘤微环境 开发用于胰腺癌风险分层和指导免疫治疗选择的稳健生物标志物 胰腺癌患者(来自TCGA、GTEx、GEO数据库)、胰腺癌细胞系(H6C7、CAPAN-1、PANC-1) 生物信息学 胰腺癌 单细胞RNA测序、定量实时聚合酶链反应、Western印迹、生物信息学分析 六基因特征模型 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 TCGA和GTEx数据集(训练集)、GEO数据集GSE57495(验证集)、单细胞RNA测序数据集GSE212966 NA 单细胞RNA-seq NA NA
75 2026-02-21
The Camellia sinensis var. sinensis cv. Fuding Dabaicha genome unveils structural variation-driven metabolic innovation
2026-Jan-14, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序结合PacBio HiFi和ONT超长测序技术,构建了福鼎大白茶的高质量单倍型基因组,揭示了结构变异如何驱动茶叶代谢多样性 首次利用单细胞测序技术对茶叶精子细胞进行测序,结合长读长测序实现高精度单倍型基因组组装,并建立了基于半同胞的QTL定位平台 研究主要聚焦于福鼎大白茶品种,其他茶叶品种的基因组变异和代谢多样性可能未被全面覆盖 探究茶叶基因组结构变异与代谢多样性之间的关联 福鼎大白茶(Camellia sinensis var. sinensis cv. Fuding Dabaicha)的基因组和代谢产物 基因组学 NA 单细胞测序, PacBio HiFi测序, ONT超长测序 NA 基因组序列数据, 代谢组数据 107个精子细胞 PacBio, Oxford Nanopore Technologies 单细胞测序, 长读长测序 PacBio HiFi, ONT PacBio HiFi测序和ONT超长测序技术
76 2026-02-21
An unsupervised method for spatial transcriptomics analysis based on adversarial autoencoder
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文提出了一种基于对抗自编码器的无监督方法DACN,用于分析空间转录组学数据,通过集成改进的对抗自编码器和图卷积网络来提高分析的准确性和鲁棒性 DACN框架结合了改进的对抗自编码器与图卷积网络,采用混合编码器集成多头注意力和残差连接,以捕获细粒度局部表达模式并保留全局信息,从而在多种分辨率下优于现有方法 NA 开发一个统一的框架来稳健分析不同分辨率和通量的空间转录组学数据 空间转录组学数据 空间转录组学 NA 空间转录组学 对抗自编码器, 图卷积网络 基因表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
77 2026-02-21
Scar-associated macrophages and biliary epithelial cells interaction exacerbates hepatic fibrosis in biliary atresia
2026-Jan, Pediatric research IF:3.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间定位数据,揭示了胆道闭锁中疤痕相关巨噬细胞与胆道上皮细胞相互作用加剧肝纤维化的机制 首次结合单细胞和空间转录组技术,系统解析了胆道闭锁肝脏微环境异质性,并识别出促进纤维化的关键细胞互作及诊断标志物 样本量较小(仅8例组织),且缺乏长期随访数据验证治疗靶点的临床转化潜力 探究胆道闭锁肝纤维化的微环境机制并开发诊断模型 人类肝脏组织(包括正常组织、胆总管囊肿组织和胆道闭锁组织) 数字病理学 胆道闭锁 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间转录组学 诊断模型(基于基因特征) 单细胞转录组数据,空间定位数据 8例组织(2例正常邻近组织,2例胆总管囊肿组织,4例胆道闭锁组织) NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
78 2026-02-21
Identifying potential therapeutic targets in periodontitis: a multi-omics approach integrating bulk and single-cell RNA sequencing with Mendelian randomization
2026-Jan, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 本研究通过整合孟德尔随机化、单细胞RNA测序和转录组学分析,识别了与牙周炎相关的关键基因特征 采用多组学方法结合孟德尔随机化、单细胞RNA测序和转录组学分析,识别了牙周炎相关的关键基因,并发现了四个枢纽基因 研究依赖于GEO数据库的公开数据集,样本来源和数量可能有限,且未进行实验验证 识别牙周炎的潜在治疗靶点 牙周炎相关的基因表达数据 自然语言处理 牙周炎 单细胞RNA测序, 转录组学分析, 孟德尔随机化 LASSO, 随机森林 RNA测序数据 三个独立数据集(具体数量未明确) NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
79 2026-02-21
Multi-omics genetic study revealing ferroptosis regulator CTSB driving prostate cancer progression by modulating the immune microenvironment
2026-Jan, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 本研究利用多组学孟德尔随机化方法,揭示了铁死亡调控因子CTSB通过调节免疫微环境驱动前列腺癌进展的因果作用机制 首次提供了铁死亡-免疫相互作用在前列腺癌中因果作用的证据,并识别CTSB为关键风险因子 研究主要基于遗传学关联分析,需要进一步的实验验证来阐明具体的分子机制 探究铁死亡基因/蛋白表达与前列腺癌之间的遗传因果关系及免疫微环境的中介作用 前列腺癌 生物信息学 前列腺癌 多组学孟德尔随机化,单细胞RNA测序,基因集富集分析,免疫浸润分析 孟德尔随机化模型 基因组,转录组,蛋白组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
80 2026-02-21
A New Model of Gastric Pre-neoplasia Induced by Aberrant ADAR1-mediated Double-stranded RNA Signaling
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本文通过构建ADAR1缺失的小鼠模型,揭示了内源性双链RNA信号在胃上皮损伤和胃癌前病变中的关键作用 首次建立了由ADAR1介导的双链RNA信号异常驱动的胃前瘤形成遗传模型,并发现线粒体dsRNA的富集是这一过程的关键因素 研究基于小鼠模型,其结论在人类中的直接适用性尚需进一步验证 探究双链RNA信号在胃上皮损伤和胃癌前病变中的作用机制 ADAR1缺失的小鼠胃壁细胞及相关的干扰素信号通路 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫电子显微镜、dsRNA免疫沉淀 遗传小鼠模型(Adar1ΔPC) 转录组数据、免疫学数据、组织学图像 Adar1ΔPC小鼠及年龄匹配的对照组,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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