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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-02-22 |
Tuft Cells in the Gut Limit Cognitive Disorders by Regulating Gut Homeostasis
2026-Jan-30, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2026.101747
PMID:41621641
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研究论文 | 本文探讨了肠道簇细胞在认知障碍中的作用,通过小鼠模型揭示了其通过调节肠道稳态来限制认知功能障碍的机制 | 首次明确了肠道簇细胞在认知障碍中的关键作用,并发现β-淀粉样蛋白抑制簇细胞分化,而琥珀酸作为簇细胞激活剂可恢复认知功能和肠道稳态 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性尚需进一步验证,且样本量有限 | 研究肠道簇细胞在认知障碍中的作用机制 | 雄性簇细胞缺失小鼠(Pou2f3-/-)及其野生型同窝仔鼠,以及阿尔茨海默病模型小鼠 | NA | 阿尔茨海默病 | 16S rRNA测序、流式细胞术、单细胞RNA测序、荧光成像、结肠类器官培养 | NA | 微生物组数据、细胞计数数据、基因表达数据、图像数据 | 10月龄小鼠,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 62 | 2026-02-22 |
Flexibility of cell fates and functions across sex determination systems revealed by comparative single-cell analyses
2026-Jan-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.29.701242
PMID:41659566
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研究论文 | 本研究通过比较单细胞转录组学分析,揭示了脊椎动物性别决定系统中细胞命运和功能的灵活性 | 首次在温度依赖性性别决定的龟类中进行单细胞转录组学分析,并与遗传性别决定系统(如小鼠和鸡)进行比较,揭示了细胞类型库和功能的显著差异 | 研究主要基于龟类、小鼠和鸡的样本,可能未涵盖所有脊椎动物性别决定系统,且样本量有限 | 探究脊椎动物性别决定系统中细胞类型和遗传程序的保守性与可塑性 | 龟类(温度依赖性性别决定)、小鼠(XY遗传性别决定)和鸡(ZW遗传性别决定)的性腺细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 龟类、小鼠和鸡的性腺样本,具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 63 | 2026-02-22 |
CytoVerse: Single-Cell AI Foundation Models in the Browser
2026-Jan-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.29.702554
PMID:41659670
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研究论文 | 本文介绍了CytoVerse,一个在浏览器中运行单细胞RNA测序基础模型的框架,旨在解决单细胞数据集映射到大型图谱时面临的服务器限制和隐私问题 | 通过ONNX部署模型实现无服务器端计算,使用压缩索引(IVFPQ)在客户端搜索超过2000万个细胞的参考数据,并采用轻量级协议在联盟间共享嵌入而不暴露原始数据 | NA | 开发一个可扩展且保护隐私的分布式单细胞分析框架 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 基础模型(scFM) | 单细胞RNA测序数据 | 超过2000万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 64 | 2026-02-22 |
A Single-Cell and Spatial 3D Multi-omic Atlas of Developing Human Basal Ganglia and Inhibitory Neurons
2026-Jan-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.28.702385
PMID:41659519
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研究论文 | 本研究构建了发育中人类基底神经节和抑制性神经元的单细胞与空间3D多组学图谱 | 首次结合单核甲基-3C测序、高多重空间转录组学和染色质+RNA单分子成像技术,揭示了基底神经节发育中3D表观基因组的动态变化 | 研究主要关注围产期大脑,未涵盖更广泛的发育阶段或疾病状态 | 阐明基底神经节发育过程中表观基因组和3D基因组的动态变化 | 人类基底神经节、神经节隆起及其衍生的神经元 | 数字病理学 | 神经精神疾病 | 单核甲基-3C测序, 空间转录组学, 染色质+RNA单分子成像 | NA | 单细胞多组学数据, 空间转录组数据, 3D基因组数据 | 未明确说明样本数量,但涉及发育中的人类大脑组织 | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 65 | 2026-02-22 |
The clinical significance of the Mediterranean fever gene MEFV variants in Castleman disease
2026-Jan-29, Communications medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1038/s43856-026-01392-1
PMID:41611845
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研究论文 | 本研究探讨了地中海热基因MEFV变异在Castleman病(CD)中的临床意义,特别是在iMCD-TAFRO亚型中的作用 | 首次在较大队列中揭示MEFV变异在CD中的高流行率,并通过体外实验和单细胞RNA测序阐明了MEFV表达与IL-6通路激活的关联 | 样本量较小(37例患者),且为回顾性研究,可能限制结果的普遍性 | 阐明MEFV基因变异在Castleman病发病机制中的作用,特别是对iMCD-TAFRO亚型的影响 | Castleman病患者(包括iMCD-TAFRO亚型)及其血液/淋巴结活检样本 | 单细胞组学 | Castleman病 | 全外显子测序, 单细胞RNA测序, 定量PCR, Luminex细胞因子检测 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 临床数据 | 37例CD患者,包括一名青少年TAFRO患者及其无症状父母和健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 66 | 2026-02-22 |
MicroRNAs as potential prognostic biomarkers in acute lymphoblastic leukemia: a systematic review, meta-analysis, and bioinformatics study
2026-Jan-29, Systematic reviews
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s13643-026-03083-3
PMID:41612480
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系统综述与荟萃分析 | 本文通过系统综述、荟萃分析和生物信息学方法,评估了microRNAs作为急性淋巴细胞白血病预后生物标志物的潜力 | 结合了系统综述、荟萃分析、ceRNA网络构建和单细胞RNA测序分析,全面评估miRNA在ALL中的预后价值及其调控机制 | 需要大型多中心试验进一步确认miRNA的预后作用,现有研究样本量和异质性可能存在限制 | 评估microRNAs作为急性淋巴细胞白血病预后生物标志物的有效性,并探索其调控机制 | 急性淋巴细胞白血病患者,涉及1974名患者的数据 | 生物信息学 | 急性淋巴细胞白血病 | 系统综述、荟萃分析、ceRNA网络分析、单细胞RNA测序 | NA | 文献数据、基因表达数据 | 22项研究,共1974名患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 67 | 2026-02-22 |
Sod1 trisomy causes ENS developmental defects and susceptibility to Hirschsprung disease via neuronal Ret suppression and glial remodeling
2026-Jan-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.26.701837
PMID:41659476
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研究论文 | 本文通过构建人源化三体小鼠模型,揭示了SOD1基因剂量增加如何通过抑制神经元Ret表达和促进胶质细胞重塑,导致肠神经系统发育缺陷并增加Hirschsprung病易感性 | 首次证明SOD1基因单独剂量增加足以扰乱肠神经系统发育,并阐明了其在Hirschsprung病易感性中的双重作用机制 | 研究基于小鼠模型,可能无法完全模拟人类Down综合征的复杂性;单细胞RNA-seq数据仅来自出生后第0天的远端结肠,缺乏更长时间点的动态观察 | 探究Down综合征中特定染色体21基因(特别是SOD1)如何导致Hirschsprung病风险增加 | 人源化三体小鼠模型的肠神经系统细胞 | 单细胞组学 | Hirschsprung病 | 单细胞RNA测序,免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 出生后第0天小鼠远端结肠组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 68 | 2026-02-22 |
Spatial transcriptomics reveals brain-wide circadian disruption in an Alzheimer's disease model
2026-Jan-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.26.701799
PMID:41659563
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研究论文 | 本研究利用大规模空间转录组学技术,揭示了小鼠大脑中24小时节律性转录的空间组织架构,并发现阿尔茨海默病模型中病理易感脑区在淀粉样斑块沉积前出现早期、区域特异性的昼夜节律转录紊乱 | 首次通过大规模空间转录组学全面绘制了小鼠大脑皮层和皮层下区域的24小时节律性转录图谱,揭示了健康与疾病状态下大脑昼夜节律的空间组织差异,并识别出阿尔茨海默病早期病理过程中的节律失调特征 | 研究基于APP23小鼠模型,可能无法完全反映人类阿尔茨海默病的所有病理特征;空间转录组学技术分辨率有限,可能无法捕捉到单细胞水平的节律变化 | 探究健康与阿尔茨海默病状态下大脑昼夜节律转录的空间组织架构及其在疾病早期病理过程中的变化 | 小鼠大脑(包括皮层和皮层下区域),特别关注APP23阿尔茨海默病模型小鼠 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 未明确说明样本数量,但涉及小鼠大脑多个区域的大规模空间转录组分析 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 69 | 2026-02-22 |
Substantial unannotated noncoding transcripts in tumors may transcriptionally regulate cancer-related genes
2026-Jan-28, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-026-02524-8
PMID:41606598
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研究论文 | 本研究通过泛癌分析识别未注释的非编码转录本(UNTs),并利用CRISPR/Cas9技术验证其在肿瘤中转录调控基因的潜在功能 | 首次系统性地在多种肿瘤中识别未注释的非编码转录本,并通过实验验证其通过DNA结合域直接调控基因转录的机制 | 研究仅针对三种特定UNTs进行功能验证,未涵盖所有已识别的UNTs,且机制探索可能受限于现有预测方法 | 探究肿瘤中未注释非编码转录本的转录调控功能及其在癌症中的特异性作用 | 四种肿瘤的细胞系和组织样本,包括两种癌细胞系(用于CRISPR/Cas9实验) | 生物信息学 | 癌症 | RNA-seq, scRNA-seq, CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | 转录组数据 | 未明确指定具体样本数量,但包括四种肿瘤的细胞系和组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 70 | 2026-02-22 |
stGCL: a versatile cross-modality fusion method based on multi-modal graph contrastive learning for spatial transcriptomics
2026-Jan-28, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03896-w
PMID:41606649
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 71 | 2026-02-22 |
Machine learning identifies disulfidptosis-related gene signature for pancreatic cancer prognosis and immune infiltration
2026-Jan-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04463-w
PMID:41591656
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研究论文 | 本研究通过生物信息学和单细胞分析,探索了与胰腺癌预后和免疫浸润相关的二硫死亡相关基因特征 | 首次将新型细胞死亡方式——二硫死亡相关基因特征应用于胰腺癌预后模型的构建,并结合单细胞RNA测序揭示了关键基因在肿瘤微环境中的表达模式 | 外部验证集的模型性能中等(C-index=0.6),表明模型有待进一步优化 | 识别胰腺癌的预后生物标志物和免疫浸润模式 | 胰腺癌患者 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | 随机生存森林,StepCox | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 72 | 2026-02-22 |
Exploring the key molecular mechanisms and immune microenvironment of oxidative stress-related pathways in pancreatic neuroendocrine tumor combining scRNA-seq and bulk RNA
2026-Jan-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04515-1
PMID:41591671
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,系统探索了氧化应激相关通路在胰腺神经内分泌肿瘤中的关键分子机制和免疫微环境 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据,系统阐明氧化应激通路通过BCL2L1和PHGDH等关键基因调控pNET进展的分子机制和免疫微环境相互作用 | 研究主要基于公共数据集的分析,缺乏实验验证;单细胞数据样本量相对有限(20个样本) | 阐明氧化应激相关通路如何驱动胰腺神经内分泌肿瘤进展的分子机制及其与肿瘤微环境的相互作用 | 胰腺神经内分泌肿瘤(pNET)样本 | 生物信息学 | 胰腺神经内分泌肿瘤 | scRNA-seq, bulk RNA-seq, 差异表达分析, WGCNA, GO/KEGG富集分析, PPI网络, CIBERSORTx免疫浸润分析, ceRNA网络构建, 转录因子预测, 药物预测, 分子对接 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA), 蛋白质-蛋白质相互作用网络, 预后列线图模型, ROC分析 | 基因表达数据(RNA-seq) | 批量RNA-seq数据集GSE73338包含63个pNET样本和5个对照样本;单细胞RNA-seq数据集GSE256136包含20个样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 73 | 2026-02-22 |
Unveiling the early defense response dynamics in grapevines against Plasmopara viticola by single-cell transcriptomics
2026-Jan-27, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03904-z
PMID:41593733
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间RNA测序技术,首次构建了葡萄叶片在霜霉病菌感染期间的单细胞转录组图谱,揭示了植物细胞在感染早期的动态防御响应 | 首次在单细胞水平上解析葡萄对霜霉病菌感染的防御响应,结合scRNA-seq和spRNA-seq技术,发现了保卫细胞转录组被病原体重编程以促进入侵的新机制 | 研究主要关注早期感染阶段,可能未覆盖整个感染过程的动态变化;样本数量虽大,但仅针对特定葡萄品种和感染条件 | 揭示葡萄在单细胞水平上对霜霉病菌感染的早期防御响应动态 | 葡萄叶片细胞在Plasmopara viticola感染下的转录组变化 | 数字病理学 | 植物病害 | 单细胞RNA测序, 空间RNA测序 | NA | 转录组数据 | 约100,000个单个细胞(约89,000个来自scRNA-seq,约11,000个来自spRNA-seq) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 74 | 2026-02-22 |
SCITO-seq2: ultra-high-throughput single-cell transcriptome and epitope sequencing
2026-Jan-27, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-03954-x
PMID:41593779
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研究论文 | 本文介绍了SCITO-seq2,一种增强型单细胞转录组和表位测序平台,能够同时量化超过10万个细胞的转录本和表面蛋白 | SCITO-seq2整合了基于探针的RNA检测与超高通量蛋白质分析,采用共享池条形码策略确保分子谱的精确匹配,并兼容细胞哈希技术以实现高效样本多重分析 | NA | 开发一个可扩展、简化且成本效益高的下一代单细胞多组学工作流程 | 自身免疫性疾病,包括儿童系统性红斑狼疮和CTLA4单倍体不足伴自身免疫浸润 | 单细胞测序 | 自身免疫性疾病 | 单细胞转录组测序,表位测序 | NA | RNA序列数据,蛋白质表达数据 | 超过100,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞多组学 | SCITO-seq2 | 整合探针RNA检测与超高通量蛋白质分析,采用共享池条形码策略和细胞哈希技术 |
| 75 | 2026-02-22 |
Deciphering stromal cell interactions in osteosarcoma highlights CDKN2A and MMP14 as novel diagnostic and therapeutic biomarkers
2026-Jan-27, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-026-03902-2
PMID:41593799
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和转录组分析,揭示了骨肉瘤中基质细胞网络,并识别了CDKN2A和MMP14作为新型诊断标志物和治疗靶点 | 首次结合单细胞RNA测序和转录组数据集,利用hdWGCNA分析基质细胞基因模块,并识别出CDKN2A和MMP14作为骨肉瘤的潜在生物标志物,同时通过分子对接验证了白藜芦醇作为MMP14的候选治疗分子 | 研究主要基于公共数据库(GEO)数据,缺乏大规模临床样本验证,且功能实验仅限于骨肉瘤细胞系,未涉及体内模型 | 解析骨肉瘤中基质细胞相互作用网络,识别新的诊断标志物和治疗靶点 | 骨肉瘤(OS)及其基质微环境中的细胞亚群,包括巨噬细胞、基质细胞、T细胞等 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq)、转录组分析、WGCNA、DESeq2差异表达分析、分子对接 | Seurat、CellChat、hdWGCNA | 单细胞转录组数据、转录组数据集 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 76 | 2026-02-22 |
KIF5B-driven unfolded protein response reprograms breast cancer immunosuppressive microenvironment for single-cell guided therapeutic targeting
2026-Jan-26, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04526-y
PMID:41587002
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA-seq数据,揭示了KIF5B在乳腺癌中作为预后生物标志物和治疗靶点的作用,并探讨了其对肿瘤免疫微环境的影响 | 首次通过多模态数据分析,将KIF5B与未折叠蛋白反应、免疫浸润和药物敏感性联系起来,为乳腺癌的精准治疗提供了新见解 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;数据来源于多个数据集,可能存在批次效应 | 探究KIF5B在乳腺癌预后、肿瘤微环境和治疗反应中的综合作用 | 乳腺癌患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | hdWGCNA, 共识聚类 | RNA-seq数据 | 多个数据集的样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 77 | 2026-02-22 |
Exosome RAB10 inhibits JAK1/STAT1 to hinder macrophage M1 polarization and promote tumor immune escape
2026-Jan-26, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-026-02681-x
PMID:41588435
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研究论文 | 本研究揭示了乳腺癌细胞通过外泌体递送RAB10蛋白,抑制巨噬细胞M1极化并促进其M2极化,从而促进肿瘤免疫逃逸的机制 | 首次发现外泌体RAB10通过与干扰素受体IFNAR1结合,抑制JAK1/STAT1通路磷酸化,从而调控巨噬细胞极化,并证明联合靶向RAB10和PD-L1具有协同抗肿瘤效应 | 研究主要基于乳腺癌模型,其他肿瘤类型中的普适性有待验证;临床样本验证相对有限 | 探究外泌体RAB10在调控巨噬细胞极化及肿瘤免疫逃逸中的作用机制 | 乳腺癌细胞、巨噬细胞、肿瘤微环境、CD8⁺ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、体外实验、动物模型 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 78 | 2026-02-22 |
SAMSN1 restrains NK cell mediated anti-tumor immunity in hepatocellular carcinoma
2026-Jan-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68661-4
PMID:41565668
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研究论文 | 本文发现SAMSN1作为肝癌中NK细胞功能的新型免疫检查点,抑制其活性并影响抗肿瘤免疫 | 首次识别SAMSN1为肝癌中NK细胞功能的关键调节因子,并证明其特异性缺失可增强抗肿瘤免疫 | 研究主要基于小鼠模型和单细胞测序数据,人类样本验证和临床转化仍需进一步探索 | 探究SAMSN1在肝癌微环境中对NK细胞功能的调控机制及其作为免疫治疗靶点的潜力 | 肝癌患者样本、小鼠肝癌模型(Hepa1-6)及NK细胞 | 免疫学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 肝癌患者样本及小鼠模型,具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 79 | 2026-02-22 |
Intermittent fasting inhibits Tp53-driven glioma through gut microbiota-mediated methionine-m6A regulation
2026-Jan-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68512-2
PMID:41559043
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研究论文 | 本研究揭示了间歇性禁食(IF)通过肠道菌群介导的甲硫氨酸-m6A调控途径抑制Tp53驱动型胶质瘤的分子机制 | 首次发现IF的抗肿瘤效果与胶质母细胞瘤(GBM)亚型(Tp53型 vs CDKN2A型)相关,并通过多组学技术系统阐明了肠道菌群-甲硫氨酸-m6A修饰-TGF-β信号轴在其中的作用机制 | 研究主要基于小鼠模型,人体临床验证尚需开展;对CDKN2A亚型GBM中IF效果不显著的机制未深入探讨 | 探究间歇性禁食抑制胶质母细胞瘤的亚型特异性机制 | Tp53驱动型和Cdkn2a驱动型胶质母细胞瘤小鼠模型 | 肿瘤生物学 | 胶质母细胞瘤 | 多组学测序(空间转录组、空间代谢组、单细胞转录组、单细胞RNA甲基化、代谢组、微生物组) | 小鼠肿瘤模型 | 多组学数据 | 未明确说明 | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学, 单细胞转录组学, 单细胞RNA甲基化, 代谢组学, 微生物组学 | NA | NA |
| 80 | 2026-02-22 |
Single-cell transcriptomics reveals diversity and conservation of chicken lymphocytes
2026-Jan-18, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2026.106475
PMID:41719991
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研究论文 | 本研究构建了鸡三个主要免疫器官的高分辨率单细胞转录组图谱,揭示了鸡淋巴细胞的多样性和保守性 | 首次构建了鸡免疫器官的单细胞转录组图谱,识别了24种免疫和基质细胞类型,并揭示了性二态性免疫成熟和跨物种保守的免疫调控回路 | 研究仅基于三个主要免疫器官,可能未覆盖所有免疫细胞类型;样本量有限,需进一步验证 | 旨在全面解析鸡免疫系统的细胞组成和功能,为禽类免疫防御、抗病育种和脊椎动物免疫进化提供基础框架 | 家鸡(Gallus gallus)的三个主要免疫器官:胸腺、法氏囊和脾脏 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三个主要免疫器官的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |