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当前共找到 42726 篇文献,本页显示第 61 - 80 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
61 2026-08-23
Host immune network-guided reverse vaccinology approach for prioritizing candidate antigens in Schistosoma japonicum-associated liver fibrosis
2026-Aug, PLoS neglected tropical diseases IF:3.4Q1
研究论文 本研究结合宿主单细胞分析与反向疫苗学,开发了一种计算策略,用于筛选与日本血吸虫相关肝纤维化相关的候选抗原。 首次将宿主单细胞转录组分析与反向疫苗学相结合,以宿主病理相关的免疫网络为指导,筛选寄生虫抗原,而非仅关注寄生虫负担。 研究基于计算预测,需要进一步的实验验证来确认候选抗原的免疫原性和保护效果。 开发一种计算策略,优先筛选与日本血吸虫相关肝纤维化相关的寄生虫抗原,为疫苗开发提供候选。 日本血吸虫抗原和宿主肝纤维化相关的免疫分子网络。 计算生物学、免疫学 日本血吸虫相关肝纤维化 单细胞RNA测序、反向疫苗学、分子对接 NA 单细胞转录组数据、蛋白质序列 未提供具体样本数量,使用公开数据集。 NA 单细胞RNA测序 NA NA
62 2026-08-23
Inhibiting CXCL12/CXCR4 axis enhances T cell activity in gastric cancer
2026-Aug, Cancer gene therapy IF:4.8Q1
research paper 本研究旨在通过单细胞转录组测序探究CXCL12/CXCR4轴如何通过增强癌症相关成纤维细胞与肿瘤相关巨噬细胞之间的细胞通讯来促进胃癌的免疫逃逸 首次利用单细胞转录组测序揭示了CXCL12/CXCR4轴通过介导CAFs与TAMs之间的通讯触发M2巨噬细胞极化,并由此通过PD-L1/PD-1轴抑制T细胞活性,进而促进胃癌免疫逃逸的新机制 研究主要基于小鼠胃癌模型,尚需要人体样本和临床数据的验证 探讨CXCL12/CXCR4轴在胃癌免疫逃逸中的作用及其作为免疫治疗靶点的潜力 小鼠胃癌模型中的肿瘤和正常胃组织细胞 digital pathology gastric cancer single-cell RNA-seq NA gene expression data 小鼠胃癌模型中的肿瘤和正常胃组织样本 NA single-cell RNA-seq NA NA
63 2026-08-23
Multifunctional Catechol-Functionalized Cellulose Hydrogels for the Minimally Invasive Treatment of Acute Optic Nerve Injuries
2026-Aug, Advanced healthcare materials IF:10.0Q1
研究论文 开发了一种可注射的儿茶酚功能化羧甲基纤维素水凝胶CMCDA,用于微创治疗急性视神经损伤,通过抗氧化、生物粘附和重塑视网膜微环境实现神经保护和功能恢复。 首次将儿茶酚功能化羧甲基纤维素水凝胶作为生物粘附性和抗氧化性的玻璃体内平台,兼具剪切变稀注射性、自愈合性、湿组织粘附性和可控生物降解性,并在视神经挤压模型中通过单细胞RNA测序揭示其对损伤视网膜微环境的重塑机制。 摘要未提及明确局限性,可能包括长期安全性、临床转化可行性及更广泛的神经损伤模型验证等。 开发一种微创、长效的抗氧化水凝胶平台,用于减轻氧化应激诱导的视网膜神经节细胞变性,促进轴突再生和功能恢复,治疗急性视神经损伤。 急性视神经损伤大鼠模型(视神经挤压模型)及其中视网膜组织。 生物材料、药物递送、神经科学 急性视神经损伤 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、水凝胶合成表征、视觉功能评估(视觉悬崖测试和视网膜电图) 水凝胶材料平台,未涉及特定深度学习模型 单细胞转录组表达数据、组织图像、视觉功能数据 摘要未提供具体样本数量;涉及视神经挤压模型的视网膜样本,具体规模不详。 NA 单细胞RNA测序 NA NA
64 2026-08-23
Multi-Omics-Guided Design and Safety Engineering of Nucleic Acid Therapeutics: From Molecular Perturbation to Predictive Toxicology and Precision Translation
2026-Aug, Chemical biology & drug design IF:3.2Q3
综述 本文综述了多组学策略在核酸治疗药物(如ASOs、siRNAs和mRNAs)开发中的应用,旨在揭示其作用机制、预测毒性和推动精准转化。 创新性地提出结合蛋白质组学、代谢组学和单细胞转录组学等多组学技术,从分子扰动层面全面评估核酸药物的脱靶效应和器官毒性,以弥补传统预测方法的不足。 未明确指出具体实验验证,可能缺乏实证支持;综述基于现有文献,可能未涵盖所有最新进展。 探讨多组学策略在核酸治疗药物开发中的应用,以改善其安全性评估和疗效预测。 核酸治疗药物,包括反义寡核苷酸、小干扰RNA和信使RNA及其化学修饰和缀合物。 生物信息学、药物开发 不适用(关注药物开发,而非特定疾病) 蛋白质组学、代谢组学、单细胞转录组学 不适用 组学数据(蛋白质、代谢物、单细胞转录组) 不适用(综述文章) 不适用 多组学技术(蛋白质组学、代谢组学、单细胞转录组学) 不适用 不适用
65 2026-08-23
Heme acts as a metabolic brake on erebosis in the Drosophila gut
2026-Aug, PLoS biology IF:7.8Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序和遗传学方法,发现血红素作为代谢刹车调控果蝇肠道中的erebosis细胞死亡过程,并影响肠道干细胞增殖以维持组织稳态 首次揭示了erebosis的分子调控机制,发现血红素是启动这一非凋亡性细胞死亡过程的关键代谢物,并阐明了其通过Dpp信号通路调控肠道干细胞增殖的串扰机制 研究主要在果蝇模型中进行,其机制在哺乳动物中的保守性尚未验证,且未深入探讨血红素调控erebosis的上下游分子细节 阐明果蝇肠道中erebosis细胞死亡的分子机制及其在组织稳态维持中的作用 果蝇肠道enterocyte细胞及肠道干细胞 细胞生物学与遗传学 NA 单细胞RNA测序、遗传学操作 NA 单细胞转录组数据、基因表达数据 未明确样本数量,涉及果蝇肠道组织及单细胞测序数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
66 2026-08-23
Chronic stress-induced brain-derived small extracellular vesicles promote colorectal cancer through Treg differentiation
2026-Aug, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本研究揭示了慢性应激通过脑源性小细胞外囊泡重塑肿瘤微环境中的调节性T细胞分化,从而促进结直肠癌进展的免疫抑制机制 首次阐明'慢性应激-脑源性小细胞外囊泡-NOXA-HSP60-Treg'轴,揭示心理应激信号从中枢神经系统传递至外周肿瘤免疫微环境的新机制 主要基于小鼠模型和临床队列的关联性分析,尚需更大规模的前瞻性研究验证临床相关性 探究慢性应激通过脑源性细胞外囊泡调控结直肠癌肿瘤微环境中Treg分化并促进癌症进展的机制 慢性束缚应激小鼠模型(MC38皮下和CT26原位结直肠癌模型)及结直肠癌患者队列 数字病理学 结直肠癌 miRNA测序、单细胞RNA测序、免疫共沉淀、质谱分析、流式细胞术 小鼠肿瘤模型 基因表达、蛋白质互作、临床数据 67例回顾性队列和37例前瞻性队列的结直肠癌患者 NA 单细胞RNA测序, miRNA测序 NA NA
67 2026-08-23
Integrative drug repositioning identifies FDA-approved inhibitors of HSP90AA1 with therapeutic potential in colorectal cancer
2026-Jul-24, Bioorganic chemistry IF:4.5Q1
研究论文 本文提出一种整合多组学数据的药物重定位框架,并首次应用于结直肠癌,识别出四种FDA批准的HSP90AA1抑制剂具有潜在治疗价值 首次将整合批量与单细胞数据、网络药理学、结构建模和验证的多组学药物重定位框架应用于结直肠癌,发现四种未与结直肠癌关联的FDA批准药物 未提及明显的局限性,但可能包括体外实验结果的临床转化不确定性 开发并验证一种多组学药物重定位框架,以发现结直肠癌的FDA批准药物候选 结直肠癌相关基因表达数据、FDA批准药物、HSP90AA1蛋白 机器学习和结构建模 结直肠癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 分子对接, 分子动力学模拟, 表面等离子体共振 NA 基因表达数据、药物结构数据、蛋白质结构数据 TCGA-COADREAD(约600例)、GSE103512、GSE231559、GSE144735(具体样本数未明确) NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
68 2026-08-23
Distinct cell type-specific mechanisms underlie cognitive dysfunction during persistent integrated stress response activation
2026-Jul-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 通过整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序,构建了持续整合应激反应激活的小鼠大脑图谱,并揭示了不同细胞类型在认知功能障碍中的特异性机制 首次构建了持续性整合应激反应激活的大脑单细胞图谱,并发现GABA能神经元中ATF4的缺失会加剧认知衰退,揭示了不同神经元亚型依赖不同的ISR效应因子 研究主要基于小鼠模型,其结论在人类中的普遍性尚需进一步验证;同时,单细胞测序技术可能无法完全捕捉所有细胞类型的动态变化 阐明持续整合应激反应激活下不同脑细胞类型特异性的分子机制及其对认知功能障碍的贡献 小鼠大脑中的各类细胞,特别是GABA能神经元和谷氨酸能神经元 单细胞生物学 智力障碍 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 小鼠模型 基因表达数据、染色质可及性数据 小鼠大脑样本(具体数量未提供) 10x Genomics 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 10x Chromium 单细胞RNA测序文库和单细胞ATAC测序文库
69 2026-08-23
Urinary Proteomics Identifies ADAMDEC1 as a Non-invasive Biomarker of Unstable Carotid Atherosclerotic Plaques
2026-Jul-17, Molecular & cellular proteomics : MCP IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过尿液蛋白质组学鉴定并验证了ADAMDEC1作为不稳定颈动脉粥样硬化斑块的非侵入性生物标志物,并探讨了其生物学相关性。 首次通过多阶段研究设计,结合尿液无创蛋白质组学与斑块组织、单细胞及体外实验,确定了ADAMDEC1作为不稳定颈动脉斑块的尿液标志物,为缺血性卒中的风险评估提供了新手段。 研究未详细说明潜在混杂因素的控制,且尿液标志物的临床广泛应用需进一步前瞻性验证。 识别并验证不稳定颈动脉粥样硬化斑块的非侵入性尿液生物标志物,并探索其生物学意义。 颈动脉粥样硬化斑块患者(稳定和不稳定斑块)及健康对照,涉及尿液、斑块组织和细胞样本。 蛋白质组学、生物标志物研究 颈动脉粥样硬化、缺血性卒中 非靶向尿液蛋白质组学(DIA质谱)、ELISA、单细胞RNA测序、免疫组化、Western blot、免疫荧光、体外巨噬细胞表型分析 NA 尿液蛋白质组数据、斑块组织蛋白质组和转录组数据、单细胞测序数据、免疫组化和免疫荧光图像 发现队列179例患者,验证队列225名个体(包括稳定或不稳定颈动脉斑块患者和健康对照) NA NA NA NA
70 2026-08-23
Single-nucleus analysis of the adult human olfactory epithelium uncovers shared neurogenesis programs with the brain
2026-Jul-17, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 对成人嗅觉上皮进行单核RNA测序,发现嗅觉神经元发育与大脑神经发生有共享的基因程序,为研究神经精神疾病提供了可及模型 首次对成人嗅觉上皮进行大规模单核RNA测序,揭示了嗅觉感觉神经元发育轨迹及其与大脑皮层兴奋性神经元在转录和调控水平上的收敛,并提出嗅觉神经元可作为研究大脑神经发生和精神疾病的替代模型 样本量有限(6名供体),且单核RNA-seq无法捕获细胞质转录本,可能遗漏某些信息;与大脑神经发生的比较基于数据整合,需进一步功能验证 解析成人嗅觉上皮中嗅觉感觉神经元的发育机制,并探索其与大脑神经发生程序的相似性,为研究神经精神疾病提供可及模型 6名成人供体的嗅觉上皮标本,145,720个细胞的转录组数据 单细胞转录组学 神经精神疾病(如自闭症谱系障碍、精神疾病) 单核RNA测序 轨迹推断和调控网络分析模型 单核转录组数据 6名成人供体的嗅觉上皮,145,720个细胞 未提及 单核RNA-seq 未提及 未提及
71 2026-08-23
Reduced melanocortin tone modulates feeding during pregnancy in mice
2026-Jul-17, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究揭示了怀孕小鼠中弓状核AgRP神经元激活和POMC神经元抑制对食欲增加的调节机制,并利用空间转录组学分析了神经元转录状态的变化。 首次通过单细胞分辨率的空间转录组学,结合化学遗传学,明确了AgRP和POMC神经元在怀孕期间动态变化对食欲的关键调控作用。 研究仅限于小鼠模型,未涉及人类怀孕时的相应机制;且未深入探讨其他能量稳态神经元的潜在作用。 探究怀孕期间哺乳动物食欲增加的神经环路和分子机制。 怀孕与非怀孕小鼠的弓状核神经元,特别是AgRP和POMC神经元。 神经科学 不适用 空间转录组学 化学遗传学(DREADD) 基因表达数据 怀孕和非怀孕小鼠的弓状核样本(具体数量未提供) 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组学平台
72 2026-08-23
Cellular hallmarks and aging clock of the human lung parenchyma
2026-Jul-15, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 利用单细胞和空间转录组数据剖析人类肺实质衰老的细胞和分子特征,并构建肺生物学年龄预测模型 结合大规模单细胞和空间转录组数据,系统揭示了肺衰老中细胞类型特异性的衰老标志物、肺泡细胞增殖和WNT信号下降、髓系细胞炎症和线粒体功能障碍、T细胞扩增与免疫功能障碍等,并利用机器学习预测肺生物学年龄 研究仅基于横断面数据,未能动态追踪衰老过程;样本量为184个肺实质样本和70个空间转录组样本,可能限制统计效能和外部验证 解析人类肺实质衰老的细胞和分子机制,识别肺衰老的生物标志物和疾病风险预测因子 人类肺实质组织样本(含184个单细胞样本和70个空间转录组样本) 单细胞转录组学、空间转录组学、机器学习 呼吸系统疾病(与衰老相关) 单细胞RNA测序、空间转录组测序 机器学习模型(具体类型未提及,如随机森林或神经网络) 单细胞转录组数据、空间转录组数据 184个肺实质样本(单细胞)和70个肺实质样本(空间转录组) NA 单细胞RNA-seq、空间转录组测序 NA NA
73 2026-08-23
The SIRT5-SUCLG2 desuccinylation axis delays ovarian aging via a mitochondrial-epigenetic regulatory mechanism
2026-Jul-15, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析揭示卵巢衰老中的线粒体-表观遗传调控机制,发现SIRT5-SUCLG2去琥珀酰化轴通过影响线粒体功能和组蛋白修饰延迟卵巢衰老。 首次揭示SIRT5介导的SUCLG2去琥珀酰化在卵巢衰老中的关键作用,并阐明其通过乙酰辅酶A积累影响H4K8ac修饰的线粒体-核串扰机制。 摘要中未提及具体的局限性信息,如样本数量、动物模型具体类型或临床相关性验证等。 阐明线粒体-核串扰在卵巢衰老中的分子机制,并评估SIRT5-SUCLG2轴作为治疗靶点的潜力。 衰老卵巢组织及其单细胞转录组数据,重点关注SIRT5和SUCLG2蛋白功能和修饰。 计算生物学、表观遗传学、细胞衰老 卵巢衰老 单细胞转录组测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
74 2026-08-23
Microbial single-cell transcriptomics links gut microbiota functional states to metabolic changes in male mice
2026-Jul-15, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究利用微生物单细胞RNA-seq平台smRandom-seq,对雄性糖尿病(db/db)和对照小鼠的肠道内容物进行单细胞转录组分析,结合代谢组学数据,揭示了肠道微生物功能状态与代谢变化的关联 首次将smRandom-seq平台应用于肠道内容物样本,结合smClassify物种识别和代谢组学整合分析策略,实现了功能注释的微生物单细胞转录组分析,并揭示了跨物种功能模式与糖尿病相关代谢变化的联系 研究仅限于小鼠模型,未涉及人类样本;样本量未明确说明;功能验证实验可能不足 开发并验证微生物单细胞转录组分析框架,以解析小鼠肠道微生物功能异质性及其与宿主代谢变化的关联 雄性糖尿病(db/db)和对照小鼠的肠道内容物微生物 微生物组学 糖尿病 单细胞RNA-seq(smRandom-seq) NA 转录组数据、代谢组数据 未明确说明,但涉及db/db和对照小鼠的盲肠、结肠和直肠内容物 NA 单细胞RNA-seq smRandom-seq smRandom-seq平台,结合smClassify物种识别工作流程
75 2026-08-23
Scalable hypothalamic neuron differentiation from human pluripotent stem cells suitable for modeling metabolic disorders
2026-Jul-14, Stem cell reports IF:5.9Q2
研究论文 本研究提出一种可扩展的化学限定方法,将人类多能干细胞分化为富含POMC细胞的下丘脑神经元,并验证其用于代谢疾病建模的适用性 开发了兼容机器人细胞培养平台的规模化分化方法,并通过MERFISH单细胞转录组学等多组学验证,发现与BMI相关的基因富集和代谢性状相关的候选调控区域 摘要未明确提及局限性 建立可扩展的人类下丘脑神经元分化平台,用于代谢疾病的机制和治疗研究 人类多能干细胞衍生的下丘脑神经元,特别是POMC神经元 干细胞生物学与代谢疾病建模 代谢性疾病 单细胞转录组学(MERFISH)、RNA-seq、ATAC-seq NA 基因表达和染色质开放性数据 多个hPSC细胞系,具体数量未在摘要中说明 NA 单细胞转录组学、RNA-seq、ATAC-seq NA NA
76 2026-08-23
Proteoform Detection Across 17,000 Single Nuclei From Differentiating Skin Keratinocytes
2026-Jul-14, Molecular & cellular proteomics : MCP IF:6.1Q1
研究论文 应用单细胞蛋白质形式成像质谱(scPiMS)技术对人表皮角质形成细胞超过17,000个单核进行无标记、蛋白质形式分辨的分析,绘制了表皮分化过程中的单核蛋白质形式图谱 首次将单细胞蛋白质形式成像质谱(scPiMS)应用于单核,实现了无标记的完整蛋白质形式分析,并揭示了表皮分化过程中组合组蛋白蛋白质形式的连续染色质轨迹 未提供明确的局限性信息 利用单核蛋白质形式成像质谱技术研究表皮角质形成细胞分化过程中的蛋白质形式变化,揭示染色质状态轨迹 人表皮角质形成细胞的单核,跨越未分化增殖状态到分化状态 蛋白质组学 NA 单细胞蛋白质形式成像质谱(scPiMS),自上而下液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS) 无监督聚类 质谱成像数据 超过17,000个单核,来自人表皮角质形成细胞 NA 单细胞蛋白质形式成像质谱 NA NA
77 2026-08-23
WNT signaling in human pluripotent stem cells promotes HDAC2-dependent epigenetic programs and development of retinoic acid-responsive mesoderm
2026-Jul-14, Stem cell reports IF:5.9Q2
研究论文 本研究揭示了WNT信号通过HDAC2依赖性表观遗传程序促进人类多能干细胞向维甲酸反应性中胚层分化,并增强T细胞生成。 首次整合单细胞RNA测序和ATAC测序,定义WNT依赖的发育轨迹,并预测和验证HDAC2作为关键表观遗传调控因子。 研究主要基于体外细胞模型,缺乏体内验证;E-box转录因子的作用未观察到显著效果,机制尚不完全明确。 阐明WNT信号在人类多能干细胞向造血中胚层分化中的作用机制,以提高淋巴细胞生成的效率。 人类多能干细胞及其分化的中胚层细胞。 干细胞生物学、表观遗传学 不适用(涉及细胞治疗,但非特定疾病) 单细胞RNA测序、ATAC测序、基因编辑、化学筛选 基因调控网络模型 基因表达数据、染色质开放性数据、图像(细胞形态) 未明确说明样本数量 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞3'测序,Illumina NovaSeq测序平台
78 2026-08-23
Resident mesenchymal progenitor cells require autocrine IGF-I in homeostatic and regenerating skeletal muscle
2026-Jul-14, Stem cell reports IF:5.9Q2
研究论文 本文研究了肌肉驻留间充质祖细胞(FAPs)通过自分泌胰岛素样生长因子-I(IGF-I)在骨骼肌稳态和再生中的关键作用。 首次通过诱导性FAP特异性Igf1缺陷小鼠模型,直接证明了FAP来源的IGF-I对FAP功能及肌肉再生的重要作用。 未明确说明研究的局限性。 评估FAP来源的IGF-I在骨骼肌稳态和再生中的作用。 肌肉驻留间充质祖细胞(FAPs)及骨骼肌组织。 分子生物学 肌肉损伤 scRNA-seq NA 基因表达数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 单细胞RNA测序
79 2026-08-23
Cellular heterogeneity of hepatic granuloma formation and evolution in murine schistosomiasis japonica
2026-Jul-08, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 结合单细胞RNA测序和多重免疫荧光技术,揭示日本血吸虫感染小鼠肝脏肉芽肿形成和演化过程中的细胞异质性,并验证两个中性粒细胞亚群的功能 首次系统描绘了日本血吸虫卵诱导的肝脏肉芽肿中免疫细胞的动态组成,并鉴定了CD177和Ltf两种中性粒细胞亚群在肉芽肿形成中的相反作用 研究基于小鼠模型,可能不完全反映人类血吸虫病的复杂性且样本量有限 阐明血吸虫卵诱导的肝脏肉芽肿形成和演化的细胞机制,为肝纤维化治疗提供新靶点 日本血吸虫感染小鼠的肝脏肉芽肿及其中性粒细胞亚群 单细胞测序、免疫学 血吸虫病、肝纤维化 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光, 基因敲低 NA 单细胞转录组数据, 免疫荧光图像 日本血吸虫感染小鼠肝脏样本 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'端测序
80 2026-08-23
Unraveling cell-cell communication through spatial transcriptomics: a review of computational methods
2026-Jul-03, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
综述 本文全面综述了空间转录组学中用于推断细胞间通讯的计算方法,将其分为基于空间模式和基于表达调控的两大类轨迹 首次系统性地将空间细胞间通讯推断方法划分为基于空间模式和基于表达调控两大轨迹,并深入剖析其生物学假设、统计与深度学习框架及优缺点 原文未明确提及具体局限性,但综述指出了验证、基准测试、多模态整合和组织特异性建模等方面的挑战 综述空间转录组学中细胞间通讯推断计算方法的进展、分类及未来方向 空间转录组学数据及其细胞间通讯推断方法 空间转录组学 NA 空间转录组学 深度学习模型 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
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