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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
61 2026-08-25
SARS-CoV-2 infection produces an IL-33-dependent chronic eosinophilic pneumonia and muco-inflammatory airways disease in Scnn1b-Tg mice
2026-Aug-24, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究在慢性支气管炎小鼠模型(Scnn1b-Tg)中探讨SARS-CoV-2感染后的长期后遗症,发现感染导致IL-33依赖性嗜酸性肺炎和黏液炎症性气道疾病,并测试了抗ST2单克隆抗体和泼尼松的治疗效果 首次在Scnn1b-Tg慢性支气管炎小鼠模型中模拟SARS-CoV-2感染后的人类嗜酸性肺炎,并揭示IL-33信号通路在其中的关键作用,提出靶向IL-33的治疗策略 研究基于小鼠模型,可能无法完全反映人类PASC的复杂性,且未进行长期临床验证 阐明SARS-CoV-2感染在有慢性肺病背景下的长期后遗症(PASC)的病理机制,并评估潜在治疗干预措施 Scnn1b-Tg慢性支气管炎小鼠和野生型小鼠,接种小鼠适应型SARS-CoV-2 MA10病毒 数字病理学 慢性肺病 RNA-seq, 空间转录组学 NA 转录组数据, 图像 未明确提供具体样本数量,但涉及Scnn1b-Tg和WT小鼠的多个组别 10x Genomics 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序和10x Visium空间转录组学用于病理特征分析
62 2026-08-25
A whole-blood cryopreservation method streamlines clinical sample collection for multimodal single-cell immune profiling in sepsis
2026-Aug-24, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 开发了一种全血冷冻保存方法(Cryo-PRO),简化了脓毒症多模态单细胞免疫分析中的临床样本采集流程 提出Cryo-PRO方法,实现现场快速全血冷冻和后续集中分离PBMC,将现场处理时间从2小时以上缩短至15分钟以内,并保持多模态单细胞免疫分析结果的一致性 研究仅在23名脓毒症患者中验证,需进一步扩大样本量和多中心验证;未探讨该方法在其他疾病或长期冷冻保存条件下的适用性 简化临床样本采集流程,以提高多模态单细胞分析在脓毒症等多中心研究中的可行性 23名脓毒症患者的外周血样本 数字病理学 脓毒症 单细胞RNA测序 NA 转录组和表面蛋白表达数据 23名脓毒症患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
63 2026-08-25
Renin cells orchestrate a neuro-endocrine microenvironment of the kidney arterial tree in health and disease
2026-Aug-24, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究利用高分辨率3D成像、单细胞RNA测序等技术,揭示了肾素细胞在健康和疾病状态下协调肾脏动脉树神经内分泌微环境的机制。 首次通过高分辨率3D成像和单细胞RNA测序,详细描绘了肾素细胞与神经纤维及周围细胞的相互作用,并发现肾素细胞通过产生Ngf因子调控肾脏小动脉的生长和定向,以及神经支配过程。 肾素细胞极为罕见,占肾脏细胞的0.01%,可能限制了某些分析的分辨率或全面性;具体局限性未在摘要中提及。 阐明肾素细胞如何构建和维持其局部神经微环境,并参与肾脏小动脉的发育和疾病过程中的组织结构。 肾素细胞及其前体细胞,以及肾脏小动脉和神经纤维。 数字病理学 高血压相关疾病(推测,摘要未明确) 高分辨率3D成像、单细胞RNA-seq 条件性基因敲除小鼠模型 图像、基因表达数据 未明确说明具体样本量,但涉及小鼠模型 未明确 单细胞RNA-seq 未明确 未明确
64 2026-08-25
Cellular and molecular dysregulation of the esophageal epithelium in systemic sclerosis
2026-Aug-24, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间分子成像技术,比较了系统性硬化症(SSc)患者、胃食管反流病(GERD)患者及健康对照的食管上皮细胞,揭示了SSc中食管上皮的细胞和分子失调,特别是近端食管的过度酸暴露和免疫调节通路异常 首次在单细胞分辨率下全面描绘SSc患者食管上皮细胞的转录失调,并结合空间分子成像验证细胞类型定位,发现SSc特异性基因失调涉及免疫调节通路,且通过配体-受体分析揭示成纤维细胞与上皮细胞间的促纤维化信号增强 未明确提及样本量大小及具体临床细节,可能限制结果的普适性;研究中未进行纵向随访以评估疾病进展与分子变化的因果关系 探究系统性硬化症中食管上皮细胞的独特变化及其对食管受累的贡献,并比较与GERD和健康状态的差异 系统性硬化症患者、胃食管反流病患者及健康对照的食管分层鳞状上皮活检样本(近端和远端) 单细胞转录组学、空间转录组学 系统性硬化症、胃食管反流病 单细胞RNA测序、空间分子成像 NA 单细胞基因表达数据、空间成像数据 未知(具体样本数量未在摘要中提及) NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
65 2026-08-25
Microbiome-derived metabolites shape CD4+ T cell differentiation and immune aging in HIV-1 infection
2026-Aug-24, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 该研究通过代谢组学和单细胞测序等方法,揭示了肠道微生物衍生的芳香族代谢物,特别是对甲酚硫酸盐(PCS),如何影响HIV-1感染者CD4+ T细胞的分化、免疫衰老及病毒库持久性。 首次将细胞相关芳香族肠道细菌代谢物与CD4+ T细胞的代谢和功能状态直接联系起来,并确定PCS作为机制原型,展示了其通过诱导细胞周期停滞、线粒体功能障碍和衰老相关程序来影响免疫衰老和HIV-1病毒库。 摘要中未明确提及研究局限性。 探讨肠道微生物衍生的芳香族代谢物在HIV-1感染者中对CD4+ T细胞代谢、分化和免疫衰老的作用,及其与HIV-1病毒库持久性的关联。 HIV-1感染者(PLWH)的CD4+ T细胞和血浆样本,以及体外处理的CD4+ T细胞。 免疫学、微生物组学、代谢组学 HIV-1感染 代谢组学、流式细胞术、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组学、蛋白质组学 NA 代谢物谱、转录组、蛋白质组、单细胞基因表达数据 摘要中未明确说明样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
66 2026-08-25
Machine Learning Analysis of Single-Cell Transcriptomics Identifies a B-Cell-Associated Fibroblast Signature Predictive of Renal Fibrosis Severity
2026-Aug-24, Iranian journal of immunology : IJI IF:1.1Q4
研究论文 利用机器学习分析单细胞转录组数据,识别出与肾纤维化严重程度相关的B细胞相关成纤维细胞特征,并验证其诊断价值 首次通过机器学习结合单细胞RNA测序数据,确定了一个包含CXCL13、CCL19、TNFSF13B、IL6和TGFB1的五基因签名,该签名能预测肾纤维化严重程度,并揭示B细胞-成纤维细胞相互作用在纤维化进展中的关键作用 未提及具体局限性,但可能包括样本量有限、外部验证数据集单一等 开发基于机器学习的转录组特征,以预测肾纤维化严重程度并阐明免疫-基质细胞相互作用 肾纤维化组织中的成纤维细胞和B细胞 机器学习 慢性肾脏病 单细胞RNA测序 随机森林和LASSO回归 单细胞转录组数据 未提供具体样本数,但使用了独立数据集GSE183276进行外部验证 NA 单细胞RNA测序 NA NA
67 2026-08-25
BNT162b2 mRNA Vaccination Activates Spike-Reactive Regulatory T Cells in Humans
2026-Aug-24, International immunology IF:4.8Q2
研究论文 本研究探讨BNT162b2 mRNA COVID-19疫苗在健康成年人中是否激活刺突蛋白反应性调节性T细胞 首次在人类中证明mRNA疫苗能够激活病毒抗原特异性调节性T细胞,并揭示其转录特征和功能 研究仅限于健康成年人,未评估疫苗对疾病结局的影响,且样本量较小 探究BNT162b2 mRNA疫苗接种对刺突蛋白反应性调节性T细胞活化的影响 健康成年人的外周血单个核细胞(PBMC)中的刺突蛋白反应性CD4+ T细胞 免疫学 COVID-19 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、T细胞受体(TCR)谱分析、流式细胞术 NA 单细胞转录组数据、流式细胞术数据 样本量未明确说明,但来自健康成年人 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
68 2026-08-25
Reduced dosage of Kmt2d modifies Tbx1 haploinsufficiency toward phenotypes of 22q11.2DS
2026-Aug-24, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究探讨了Kmt2d基因剂量减少如何改变Tbx1单倍剂量不足,从而引发类似22q11.2DS的表型。 首次证明Kmt2d的剂量减少能修饰Tbx1单倍剂量不足,导致22q11.2DS和歌舞伎综合征共享的表型。 研究仅限于小鼠模型,未涉及人类样本,且未深入探讨分子机制细节。 探究KMT2D基因剂量减少对Tbx1单倍剂量不足表型的影响及其在22q11.2DS和歌舞伎综合征中的作用。 Tbx1杂合小鼠和Kmt2d条件性敲除小鼠。 发育生物学 22q11.2缺失综合征、歌舞伎综合征 条件性基因敲除、单细胞RNA测序 小鼠模型 基因表达数据、单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
69 2026-08-25
Mutation-resolved single-cell transcriptomics reveals enhanced β-amyloid clearance in TET2-mutant human monocytes
2026-Aug-24, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 利用突变分辨的单细胞转录组学揭示TET2突变单核细胞增强β-淀粉样蛋白清除的机制 首次在人类衰老个体中通过突变分辨的单细胞转录组学区分TET2突变和野生型单核细胞,揭示突变细胞富集吞噬和补体程序,且TET2沉默能增强β-淀粉样蛋白摄取 未提及明确局限性 阐明TET2驱动的克隆性造血降低阿尔茨海默病风险的人类机制 老年个体中的TET2突变和野生型单核细胞及巨噬细胞 单细胞转录组学 阿尔茨海默病 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组数据 未提及具体样本量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
70 2026-08-25
Ultrasound-responsive microencapsulated curcumin nanobubbles for treatment of mice rheumatoid arthritis and mechanistic insights based on single-cell Transcriptomics
2026-Aug-24, Nanomedicine (London, England)
研究论文 本研究开发了超声响应性姜黄素纳米泡,并利用单细胞转录组学揭示其在类风湿关节炎小鼠模型中的治疗机制。 首次将超声响应性姜黄素纳米泡与单细胞转录组学结合,深入探讨其在类风湿关节炎治疗中的分子机制。 未提及具体局限性。 探究超声辅助姜黄素纳米泡对类风湿关节炎的治疗效果及其分子机制。 类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞和胶原诱导的关节炎小鼠模型。 数字病理学 类风湿关节炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠模型(具体数量未在摘要中提及) NA 单细胞RNA-seq NA NA
71 2026-08-25
A single-cell transcriptome atlas reveals paradoxical monoallelic expression of RNA editing and heterozygous SNPs
2026-Aug-24, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本研究利用果蝇单细胞转录组图谱,揭示了RNA编辑和杂合SNP的悖论性单等位基因表达现象 首次在单细胞水平发现94.0%的RNA编辑位点和92.8%的杂合SNP呈二元表达,挑战了传统认知,并对Smart-Seq技术在分子多样性分析中的适用性提出质疑 未深入探讨二元表达背后的生物或技术机制,仅保守地指出Smart-Seq可能不适用于分子多样性分析 探究单细胞水平RNA编辑和杂合SNP的表达模式及其对分子多样性的影响 果蝇(Drosophila melanogaster)的单细胞 转录组学 不适用 Smart-Seq单细胞转录组测序 不适用 转录组测序数据 13,025个单细胞 不适用 单细胞RNA-seq Smart-Seq Smart-Seq单细胞转录组测序
72 2026-08-25
Single-cell profiling reveals senescent bone marrow mesenchymal stem cell subpopulations driving pathological ossification in ankylosing spondylitis
2026-Aug-24, Rheumatology (Oxford, England)
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示强直性脊柱炎中衰老性骨髓间充质干细胞亚群驱动病理性骨化的机制 首次在单细胞水平上识别出与强直性脊柱炎结构损伤相关的衰老相关簇(SRC),该簇表现出细胞衰老和代谢亢进的双重表型,并定义了特定基因签名与氧化应激和异常分化轨迹相关 未在功能实验中验证JAK抑制剂对SRC表型的影响,且样本量有限(12例患者) 表征强直性脊柱炎患者骨髓间充质干细胞的细胞异质性和分化状态,识别与结构损伤相关的亚群,并探索其分子特征和潜在治疗靶点 强直性脊柱炎患者(按结构损伤严重程度分为SSD和NSD组)的骨髓间充质干细胞 单细胞测序 强直性脊柱炎 单细胞RNA测序 无监督聚类、轨迹推断、代谢分析、通路富集、药物预测 单细胞转录组数据 12例强直性脊柱炎患者(9例重度结构损伤,3例无结构损伤)的骨髓间充质干细胞,共47,628个细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
73 2026-08-25
Uncoupling Type I Interferon Benefits From Inflammatory Toxicity: Transformer-Prioritized Precision Agonists for Potent and Safer Cancer Immunotherapy
2026-Aug-24, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 开发了一种基于Transformer的深度学习框架DLINP,从1.23亿个化合物中筛选出有机金属PNP钳形配合物Co68,其能解耦I型干扰素激活与炎症毒性,在胰腺导管腺癌模型中展现出优于标准STING激动剂的抗肿瘤效果,并通过单细胞和空间转录组学揭示了其重塑髓系细胞区室的机制 首次提出通过深度学习框架DLINP筛选能够解耦I型干扰素诱导与有害炎症信号的精准免疫调节剂,发现的Co68以非经典方式结合TLR4-MD2复合物,通过TLR4-TRIF-IFN-I轴触发干扰素信号同时通过TLR4-SYK-STAT1通路抑制NF-κB驱动的炎症,实现了免疫调节功能的解耦 摘要中未提及研究的局限性 开发能够解耦I型干扰素激活与炎症毒性的精准免疫调节剂,以克服紫杉醇化疗的免疫调节悖论,增强癌症免疫治疗效果 胰腺导管腺癌模型中的肿瘤微环境及免疫细胞(包括肿瘤相关巨噬细胞、NK细胞、CD8 T细胞) 机器学习 胰腺癌 单细胞转录组、空间转录组 Transformer 转录组数据、空间转录组数据 未明确说明样本量 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
74 2026-08-25
Single-Cell Transcriptomics Reveals the FA9-VAP Module Regulating Fatty Acid Accumulation in Soybean Seeds
2026-Aug-23, Plant biotechnology journal IF:10.1Q1
研究论文 通过单细胞转录组学和空间转录组学,揭示FA9-VAP模块调控大豆种子脂肪酸积累的分子机制 首次利用单细胞RNA测序和空间转录组学解析大豆种子中FA9基因调控脂质代谢的细胞类型特异性机制,并鉴定出FA9与VAP蛋白的相互作用 未提及 阐明FA9基因调控大豆种子脂肪酸积累的分子机制 野生型和FA9敲除的大豆种子 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学、免疫沉淀-质谱、CRISPR-Cas9基因编辑 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据、蛋白质互作数据 野生型和FA9敲除大豆种子(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
75 2026-08-25
The gut microbiome in chemotherapy-induced fatigue: Exploring clinical associations and modulation via fecal microbiota transplantation in female mice
2026-Aug-23, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究探讨了化疗引起的疲劳与肠道微生物组之间的关联,并通过粪便微生物群移植在小鼠模型中评估了其对疲劳及炎症反应的影响 首次结合乳腺癌患者临床数据和化疗小鼠模型,综合评估粪便微生物群移植对化疗引起的疲劳、肠道和脑部基因表达及炎症标志物的影响 粪便微生物群移植仅对5-FU治疗的小鼠产生温和至中度益处,且对紫杉醇治疗无明显效果,表明其效果因化疗药物而异 研究化疗引起的疲劳与肠道微生物组的关联,并评估粪便微生物群移植在缓解化疗相关疲劳和炎症中的作用 乳腺癌患者(n=67)和接受化疗(5-氟尿嘧啶或紫杉醇)的小鼠模型 微生物组学,神经科学 乳腺癌,化疗引起的疲劳 16S rRNA测序,RT-qPCR,单细胞RNA测序,多重电化学发光分析 NA 微生物组数据,基因表达数据,临床数据,行为数据 67名乳腺癌患者,小鼠模型(具体数量未提供) Illumina 16S rRNA测序,单细胞RNA测序 Illumina测序仪 16S rRNA测序和单细胞RNA测序使用Illumina平台
76 2026-08-25
Epithelial-mesenchymal transition in carcinoma: navigating phenotypic states to target resistance and metastasis
2026-Aug-22, Cancer metastasis reviews
综述 探讨癌细胞内上皮-间质转化(EMT)的异质性表型状态及其对抗转移和耐药治疗策略的影响 强调EMT并非二元切换,而是细胞分布于连续的部分EMT状态中,并整合单细胞测序、空间组学和谱系追踪数据重塑对EMT的传统理解 EMT定向干预的临床转化面临方法学挑战,包括因果动态未验证和治疗安全性未解决 分析EMT在肿瘤转移和耐药中的作用,并探讨针对癌细胞可塑性的治疗策略 癌细胞(特别是癌组织中的肿瘤细胞) 癌症生物学 癌症 单细胞测序、空间组学、谱系追踪 NA 单细胞数据、空间组学数据、谱系追踪数据 NA NA NA NA NA
77 2026-08-25
Combining in vitro and in silico approaches to model neural tube patterning and isthmic organizer formation
2026-Aug-21, NPJ systems biology and applications IF:3.5Q1
研究论文 结合体外实验和计算建模方法,模拟神经管模式和峡部组织者的形成 将单细胞RNA测序数据与三维计算模型相结合,揭示瞬时形态发生素信号如何诱导不可逆的神经管模式,并准确捕捉峡部组织者的形成和维持 未提供具体限制信息 理解人类神经管在早期胚胎发育中的模式形成机制,特别是峡部组织者的形成 人类神经管模式形成过程中的细胞和分子机制,包括单细胞RNA测序数据 计算生物学, 发育生物学 NA 单细胞RNA测序 计算模型(具体类型未提及,可能涉及微分方程或布尔网络) 单细胞转录组数据 未提供具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
78 2026-08-25
Integrative multi-omics analysis identifies an enhancer-driven ELF3-CLDN4 regulatory axis that shapes an immunosuppressive microenvironment and predicts prognosis in high-grade serous ovarian cancer
2026-Aug-20, Gene IF:2.6Q2
研究论文 整合多组学分析确定了一个增强子驱动的ELF3-CLDN4调控轴,该轴塑造了高级别浆液性卵巢癌的免疫抑制微环境并预测预后 首次整合H3K27ac ChIP-seq、Hi-C、单细胞RNA-seq和空间转录组学等多组学数据,重建了细胞类型特异性的增强子-基因调控网络,并确定了ELF3-CLDN4调控轴连接肿瘤可塑性与CD4+ T细胞免疫抑制 未提及具体局限性 识别高级别浆液性卵巢癌中连接肿瘤可塑性、CD4+ T细胞极化和预后的增强子相关调控回路 高级别浆液性卵巢癌肿瘤组织及非恶性卵巢组织 多组学分析 卵巢癌 ChIP-seq, Hi-C, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 多重免疫荧光 SCENIC, Louvain聚类, CellChat, 拟时间分析, GSVA, 生存模型 基因组、转录组、空间转录组、蛋白表达数据 90例原发性高级别浆液性卵巢癌和10例非恶性卵巢组织 NA NA NA NA
79 2026-08-25
TIGIT-associated immune cell exhaustion in pediatric B-cell acute lymphoblastic leukemia: An integrated clinical and transcriptomic analysis
2026-Aug-19, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
研究论文 本研究通过整合临床样本、TARGET-ALL批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,分析了儿童B细胞急性淋巴细胞白血病中TIGIT的表达及其与免疫耗竭相关的转录特征 首次在儿童B-ALL中系统描绘TIGIT的转录景观,结合临床样本、批量转录组和单细胞转录组多维度数据,揭示TIGIT与免疫耗竭的关联 样本量有限,且结论基于转录组证据,尚需蛋白水平和功能验证 探讨TIGIT在儿童B-ALL中的表达模式及其与免疫耗竭的关系 儿童B细胞急性淋巴细胞白血病患者的临床样本、TARGET-ALL批量RNA测序数据(1587例)及单细胞RNA测序数据(GSE154109) 转录组学 儿童B细胞急性淋巴细胞白血病 批量RNA测序、单细胞RNA测序 NA 转录组数据 临床样本未明确数量,TARGET-ALL批量样本1587例,单细胞数据来自GSE154109 NA 批量RNA测序、单细胞RNA测序 NA NA
80 2026-08-25
The Hsd17b13P260S patient variant knock-in male mouse model provides translational insights into HSD17B13 biology
2026-Aug-14, EBioMedicine IF:9.7Q1
研究论文 本研究通过构建携带人HSD17B13 P260S患者变异的敲入小鼠模型,结合空间转录组学、组织学、MALDI成像及体外细胞表征,探究该变异对MASLD向MASH进展的保护机制 首次建立Hsd17b13P260S患者变异的敲入小鼠模型,并利用空间转录组学和MALDI成像揭示其保护表型,发现蛋白丰度降低、酶活性减少及门静脉周围区域化保留是潜在机制 仅使用雄性小鼠,未涉及雌性;研究局限于饮食诱导模型,未完全模拟人类疾病复杂性;机制未完全阐明 探究HSD17B13 P260S变异对MASLD向MASH进展的保护机制,验证小鼠模型的转化价值 携带Hsd17b13P260S变异的敲入小鼠及其野生型对照 分子生物学 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 空间转录组学、MALDI成像、组织学分析 小鼠模型 基因表达数据、图像数据 雄性Hsd17b13P260S小鼠和野生型小鼠(具体数量未提供) NA 空间转录组学 NA NA
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