本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-10-23 |
Immune and stromal features of durable complete response to radiation and dual immune checkpoint blockade in pancreatic cancer
2026-Aug-10, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.08.06.26359422
PMID:42845633
|
研究论文 | 结合纳武利尤单抗、伊匹木单抗和放疗治疗经治的转移性MSS胰腺导管腺癌的单臂II期临床试验,通过单细胞、单核和空间转录组等多组学分析揭示一例持久完全缓解患者的免疫和基质特征 | 发现PDAC中持久的免疫治疗完全缓解不仅需要肿瘤反应性T细胞,还需要能够支持其招募、再循环和存活的基质-血管生态位,特别是ACKR1+静脉内皮细胞高表达与更好生存、更高TCR丰富度和克隆性以及肿瘤-血液TCR共享增加相关 | 总体临床活性有限,仅一例患者达到持久完全缓解,样本量较小(30例患者,22例活检),结论主要基于个案观察和相关性分析 | 探究MSS胰腺导管腺癌中对放疗联合双免疫检查点阻断产生持久完全缓解的免疫和基质特征 | 经治的转移性微卫星稳定胰腺导管腺癌患者 | 肿瘤免疫学、单细胞组学、空间转录组学 | 胰腺癌 | 单核RNA测序、单细胞RNA测序、TCR测序、空间转录组学、外周血TCR测序 | NA | 单细胞转录组数据、单核转录组数据、TCR序列数据、空间转录组数据、外周血TCR测序数据 | 30例患者,22例患者的32份治疗前和治疗中肿瘤活检样本,245529个单核转录组和128295个单细胞转录组(包括27215个具有配对TCR克隆型的T细胞),13份活检的空间转录组,25例患者的外周血TCR测序 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq, single-nucleus RNA-seq, spatial transcriptomics, TCR sequencing | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞/单核转录组和TCR测序,10x Visium空间转录组 |
| 62 | 2026-10-23 |
Epigenetic regulation of INPP5D and its downstream molecular network in autoimmune pancreatitis
2026-Jul-25, BMC gastroenterology
IF:2.5Q2
DOI:10.1186/s12876-026-05170-0
PMID:42902176
|
研究论文 | 该文通过全基因组DNA甲基化芯片和单细胞RNA测序,研究INPP5D的表观遗传调控及其下游分子网络在自身免疫性胰腺炎中的作用 | 首次在自身免疫性胰腺炎中揭示INPP5D基因启动子低甲基化与基质巨噬细胞系细胞中INPP5D蛋白表达降低之间的关联,并结合单细胞转录组定位INPP5D表达细胞类型 | 样本量有限,仅基于组织水平的甲基化与蛋白表达关联分析,未进行功能验证实验,INPP5D作为生物标志物和治疗靶点仍需进一步验证 | 探究表观遗传失调在自身免疫性胰腺炎发病机制中的作用,特别是INPP5D相关的免疫调控网络 | 自身免疫性胰腺炎(AIP)组织与梗阻性胰腺炎(OP)组织 | 表观遗传学, 单细胞组学 | 自身免疫性胰腺炎, IgG4相关疾病 | DNA甲基化芯片, 单细胞RNA测序, 免疫组化 | NA | 甲基化数据, 单细胞转录组数据, 图像 | AIP和OP组织样本(具体数量未在摘要中说明) | Illumina, 10x Genomics | DNA甲基化芯片, 单细胞RNA测序 | Infinium MethylationEPIC array, 10x Chromium | Infinium MethylationEPIC BeadChip用于全基因组DNA甲基化检测,10x Chromium单细胞RNA测序用于细胞类型鉴定 |
| 63 | 2026-10-23 |
High xCT expression indicates poor prognosis and chemoradiotherapy resistance in rectal cancer patients
2026-Jul-25, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-026-04428-7
PMID:42902388
|
研究论文 | 本研究探讨了xCT/SLC7A11在直肠癌中的预后预测价值和放化疗反应中的作用 | 首次系统性地研究了xCT在直肠癌中的预后价值和放化疗耐药机制,并构建了基于xCT的预后列线图模型 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 探索xCT在直肠癌患者预后和放化疗反应中的预测价值 | 直肠癌患者及其肿瘤组织样本 | 数字病理 | 直肠癌 | 免疫组化,RT-qPCR,单细胞RNA测序 | 列线图模型 | 图像,文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 64 | 2026-10-23 |
Aging-enhanced accumulation of fibroblasts excludes oligodendrocytes in demyelinated lesions
2026-Jul-25, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-026-03976-z
PMID:42902401
|
研究论文 | 该文揭示成纤维细胞在溶血卵磷脂诱导的脊髓白质脱髓鞘病变中积累,并随衰老加剧,排斥少突胶质前体细胞,影响髓鞘再生 | 首次通过单核和空间转录组学明确成纤维细胞在脱髓鞘病变中的存在及其与周细胞的区分,揭示成纤维细胞随衰老积累并排斥少突胶质前体细胞,且在多发性硬化病变中验证成纤维细胞的存在及细胞通讯网络 | 研究主要基于小鼠模型和公共单核RNA数据库,缺乏直接的人体组织功能验证;成纤维细胞标记物的特异性可能存在争议;未完全阐明成纤维细胞排斥少突胶质前体细胞的具体分子机制 | 探究成纤维细胞在中枢神经系统脱髓鞘病变中的积累机制及其对少突胶质细胞修复反应的影响,特别是衰老的作用 | 6-10周龄年轻小鼠和48-52周龄老年小鼠的脊髓白质脱髓鞘病变,以及多发性硬化患者的单核RNA数据库 | 神经科学、空间转录组学 | 多发性硬化、脱髓鞘疾病 | 免疫荧光显微镜、单核RNA测序、空间转录组学、细胞培养、配体-受体分析 | NA | 图像、文本(转录组数据) | 小鼠脊髓脱髓鞘病变样本(年龄6-10周和48-52周),公共多发性硬化单核RNA数据库 | NA | 单核RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 65 | 2026-10-23 |
Lactylation in cancer: a new frontier in metabolic-epigenetic regulation and clinical practice
2026-Jul-24, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-026-03085-7
PMID:42897554
|
综述 | 本文综述了赖氨酸乳酰化(Kla)作为一种连接细胞代谢与表观遗传调控的新型翻译后修饰,在肿瘤恶性表型、免疫微环境重塑及临床转化中的新兴作用 | 系统性地将Kla定位为肿瘤代谢-表观遗传串扰的核心枢纽,并提出整合单细胞多组学和空间转录组学等先进技术来克服Kla生物标志物临床转化中的检测限制和时空异质性瓶颈 | Kla的检测技术存在局限,且其时空异质性制约了基于机器学习的预后模型,目前尚缺乏成熟的临床转化方案 | 阐述Kla在肿瘤代谢与表观遗传调控中的新兴角色,为将其作为精准肿瘤学中诊断和治疗基石提供框架 | 肿瘤及其肿瘤微环境中的组蛋白和非组蛋白蛋白 | 肿瘤生物学、表观遗传学、代谢组学 | 多种癌症 | 多组学分析、单细胞多组学、空间转录组学 | 机器学习 | 文本(文献综述) | NA | NA | NA | NA | NA |
| 66 | 2026-10-23 |
Single‑cell and spatial transcriptomics in chronic lung disease: cellular heterogeneity and molecular mechanisms in IPF and COPD
2026-Jul-24, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-026-03836-7
PMID:42897617
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序和空间转录组学在特发性肺纤维化(IPF)和慢性阻塞性肺疾病(COPD)中的应用,揭示了细胞异质性和分子机制 | 整合了近期scRNA-seq和ST研究,提出了IPF和COPD共享和疾病特异性的细胞程序,强调了上皮功能障碍和祖细胞修复受损作为共享机制,并分别突出了IPF的肺泡再生失败、成纤维细胞活化和促纤维化生态位形成以及COPD的气道重塑、炎症上皮状态和肺气肿相关实质损伤 | 涉及终末期组织采样、平台限制以及小鼠与人类对应关系的局限性 | 综合近期scRNA-seq和ST研究,理解IPF和COPD的发病机制和转化意义 | 特发性肺纤维化(IPF)和慢性阻塞性肺疾病(COPD) | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 67 | 2026-10-23 |
Integrated transcriptomics reveals a TNFRSF-metabolism axis and a context-dependent BCMA signaling state in myeloma progression
2026-Jul-24, Annals of hematology
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s00277-026-07192-w
PMID:42902067
|
研究论文 | 该研究整合单细胞与批量转录组数据,揭示多发性骨髓瘤进展中TNFRSF信号与代谢状态的协同轴及BCMA信号状态的情境依赖性 | 首次在单细胞分辨率上系统描绘TNFRSF信号与代谢活性在MM疾病连续谱中的协同关系,并提出BCMA信号状态的情境依赖性预后分层模型 | 生存关联对调整方式敏感,需进一步外部验证;单细胞样本量有限;未进行功能性实验验证机制 | 探究TNFRSF协同激活是否与代谢状态及预后在MM疾病连续谱中相一致 | 健康供者、MGUS、SMM和MM患者的骨髓浆细胞 | 数字病理学, 机器学习 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 文本, 基因表达数据 | 骨髓单细胞RNA测序样本(健康供者、MGUS、SMM、MM患者)及MMRF CoMMpass队列批量RNA测序样本(具体数量未在摘要中明确) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 68 | 2026-10-23 |
Single cell RNA sequencing and emerging transcriptomic technologies in Alzheimer's disease cerebral organoids: a mini review
2026-Jul-24, Molecular brain
IF:3.3Q2
DOI:10.1186/s13041-026-01335-w
PMID:42902292
|
综述 | 本文是一篇小型综述,总结了单细胞RNA测序及其他转录组学技术在阿尔茨海默病脑类器官模型中的应用,并对现有模型进行了分类和讨论 | 系统性地将AD脑类器官模型分为五类,并强调了单细胞技术揭示的关键分子改变,同时提出了改进下一代AD类器官模型生理保真度的方法路线 | 作为小型综述,可能未全面覆盖所有相关研究,且未提供原始实验数据验证 | 概述AD脑类器官模型中单细胞转录组学技术的应用现状,并探讨未来发展方向 | 阿尔茨海默病人脑类器官模型 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 计算去卷积, 空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 69 | 2026-10-23 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal that THBS1 induces radiation resistance in TNBC through the interaction between myCAF and TOPBP1⁺ tumor cells
2026-Jul-24, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08614-z
PMID:42902364
|
研究论文 | 结合单细胞与空间转录组学揭示THBS1通过myCAF与TOPBP1⁺肿瘤细胞互作诱导三阴性乳腺癌放疗抵抗 | 鉴定出与不良预后相关的TOPBP1⁺ E.T.细胞亚群,并揭示myCAF通过THBS1-NOTCH信号轴介导放疗抵抗 | 摘要未明确说明样本量及实验验证的完整细节,机制仍需更大规模临床验证 | 探究三阴性乳腺癌放疗抵抗的细胞与分子机制 | 三阴性乳腺癌患者肿瘤组织及细胞 | 数字病理 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, qPCR, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 70 | 2026-10-23 |
P4HA1⁺ collagen-modifying fibroblasts are associated with pro-tumor niches and therapeutic vulnerabilities in colorectal cancer
2026-Jul-24, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08678-x
PMID:42902379
|
研究论文 | 该研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和bulk转录组数据,系统分析了结直肠癌中癌症相关成纤维细胞(CAF)的异质性,并鉴定出一个P4HA1⁺胶原修饰型CAF亚群及其在空间组织化生态位中的作用和治疗潜力 | 首次鉴定出P4HA1⁺胶原修饰型CAF亚群,揭示其在肿瘤-基质交界处与促血管生成内皮细胞、免疫抑制巨噬细胞和恶性上皮细胞共定位形成同时协调ECM重塑、血管生成和免疫抑制的空间组织化生态位,并预测了WNT5A-MCAM、MDK-LRP1、MDK-NCL等配体-受体轴 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 系统解析结直肠癌中CAF亚群的异质性,揭示各CAF亚群如何在空间组织化生态位中同时协调细胞外基质重塑、血管生成和免疫抑制,并评估CAF相关转录程序的临床意义和潜在治疗价值 | 结直肠癌(CRC)肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞(CAFs) | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk转录组测序 | 机器学习 | 文本, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 71 | 2026-10-23 |
CYBB regulates synovial fibroblast inflammatory activation and sEV-mediated synovial-cartilage communication in osteoarthritis
2026-Jul-23, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-026-03866-y
PMID:42894224
|
研究论文 | 该研究通过整合重分析骨关节炎滑膜组织的bulk和单细胞RNA测序数据,识别出CYBB是连接炎症性成纤维样滑膜细胞与软骨细胞功能障碍的关键调控因子 | 首次揭示CYBB通过调控sEV介导的成纤维样滑膜细胞与软骨细胞间通讯,连接滑膜炎症与软骨损伤 | 研究主要基于大鼠模型验证,尚未在人体临床试验中验证CYBB靶向治疗的安全性和有效性 | 识别连接炎症性成纤维样滑膜细胞与软骨细胞功能障碍的关键调控因子,探索骨关节炎治疗新靶点 | 骨关节炎滑膜组织、炎症性成纤维样滑膜细胞、软骨细胞、骨关节炎大鼠模型 | 骨关节炎研究 | 骨关节炎 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, sEV分离与追踪 | NA | 基因表达数据、图像 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 72 | 2026-10-23 |
Cell-resolved genetic risk reveals hyperandrogenism-associated immune and metabolic rewiring in the PMOS follicular microenvironment
2026-Jul-23, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-026-01734-7
PMID:42894247
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序构建了PMOS卵泡微环境的细胞图谱,将遗传风险映射到卵泡细胞群体,揭示高雄激素型PMOS中与类固醇生成重构和能量代谢受损相关的GC2_CYP19A1⁺颗粒细胞状态及免疫重塑 | 首次在单细胞分辨率上将GWAS遗传风险评分与卵巢染色质可及性注释整合,定位PMOS遗传风险至特定卵泡细胞群体,并鉴定出与高雄激素型PMOS优先相关的GC2_CYP19A1⁺颗粒细胞状态,揭示类固醇生成失衡与颗粒细胞生物能量学受损的耦联机制 | 研究以转录组关联和相关性分析为主,GC2_CYP19A1⁺状态与PMOS的因果关系需功能验证;样本来源于卵泡液细胞,缺乏卵泡空间结构信息;小鼠DHEA模型仅提供支持性证据 | 解析PMOS卵泡发育停滞的细胞类型特异性机制,连接遗传易感性、内分泌失衡与卵泡微环境功能障碍,并区分不同临床亚型 | 健康对照女性及无并发症PMOS、高雄激素型PMOS和二甲双胍治疗的胰岛素抵抗型PMOS女性的排卵前卵泡液细胞,以及DHEA诱导的小鼠PMOS样卵巢数据集 | 数字病理学 | 多内分泌代谢性卵巢综合征 | 单细胞RNA测序, GWAS, snATAC-seq, 配体-受体分析 | NA | 文本, 图像 | 220,983个高质量单细胞(来自健康对照及三种PMOS亚型女性的排卵前卵泡液),另包括DHEA诱导小鼠卵巢数据集 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序及卵巢snATAC-seq |
| 73 | 2026-10-23 |
IGFBP5 derived from endothelial cells drive vascular invasion and liver metastasis of colorectal cancer by activating the ITGB3/PI3K/AKT Axis
2026-Jul-23, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-09081-6
PMID:42897140
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析结直肠癌肝转移样本,发现内皮细胞来源的IGFBP5通过激活ITGB3/PI3K/AKT轴驱动血管侵犯和肝转移 | 首次鉴定出IGFBP5_tipECs亚群在血管侵犯性结直肠癌肝转移中显著富集,并揭示了内皮细胞来源IGFBP5与肿瘤细胞ITGB3的直接配体-受体相互作用机制 | 样本量有限(8例肝转移样本),主要基于体外和动物实验验证,缺乏大规模临床队列验证 | 探究肿瘤微环境中内皮细胞如何调控结直肠癌血管侵犯和肝转移的分子机制 | 结直肠癌肝转移患者样本、人脐静脉内皮细胞、结直肠癌细胞系、患者来源的类器官 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, RNA测序, 多重免疫荧光, 免疫共沉淀, 邻近连接 assay | NA | 单细胞转录组数据, 图像 | 8例结直肠癌肝转移样本(4例血管侵犯阳性,4例血管侵犯阴性) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 74 | 2026-10-23 |
A single-cell atlas of intracranial aneurysm progression identifies a dysfunctional VSMC subpopulation associated with rupture risk
2026-Jul-23, BMC neuroscience
IF:2.4Q3
DOI:10.1186/s12868-026-01029-y
PMID:42897467
|
研究论文 | 该研究对小鼠颅内动脉瘤模型进行单细胞RNA测序,揭示与破裂风险相关的功能障碍性血管平滑肌细胞亚群 | 首次在单细胞分辨率下构建覆盖假手术、形成和破裂阶段的颅内动脉瘤图谱,并发现代谢特化的VSMC_0亚群与动脉瘤破裂风险相关 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据仅用于验证,样本量有限 | 在单细胞分辨率下阐明颅内动脉瘤从稳定病变到破裂的细胞机制 | 小鼠颅内动脉瘤模型(假手术、形成和破裂阶段)及人类颅内动脉瘤组织 | 单细胞转录组学 | 颅内动脉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、bulk RNA-seq数据、蛋白质水平数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 75 | 2026-10-23 |
Advancing assisted reproductive technology in Africa: a narrative review on the promising role of molecular biology and molecular techniques
2026-Jul-23, Reproductive health
IF:3.6Q1
DOI:10.1186/s12978-026-02410-0
PMID:42897661
|
综述 | 本文综述分子生物学和先进分子技术在非洲辅助生殖技术中的应用前景与挑战 | 系统探讨PGT、NIPT、CRISPR/Cas9、MRT和单细胞RNA测序等分子技术在非洲ART中的整合潜力,并提出分阶段实施策略 | 为叙述性综述,未进行系统文献检索或定量分析,缺乏原始数据支持 | 探讨分子生物学和分子技术如何克服非洲ART面临的障碍并推动其发展 | 非洲地区接受辅助生殖技术的个体和夫妇 | 生殖医学 | 不孕不育 | 植入前遗传学检测, 无创产前检测, CRISPR/Cas9基因编辑, 线粒体替代疗法, 单细胞RNA测序, 液体活检, 基因组筛查 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 76 | 2026-10-23 |
Spatial multi-omics analyses of the tumor immune microenvironment: advances and novel therapeutic avenues
2026-Jul-23, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-026-02740-4
PMID:42902370
|
综述 | 综述空间多组学技术(空间转录组学、蛋白质组学和代谢组学)在肿瘤免疫微环境研究中的进展及其在新型治疗策略中的应用 | 系统整合空间转录组学、蛋白质组学和代谢组学等多维空间组学技术,从空间维度解析肿瘤免疫微环境的细胞分布、细胞间通讯网络及三级淋巴结构等模式结构,并探讨其在重塑肿瘤免疫微环境、预后预测和免疫治疗响应方面的新治疗策略 | 空间多组学技术在标准化和临床转化方面仍面临挑战 | 综述空间多组学技术的实验方法及其在肿瘤免疫微环境研究中的应用,探讨空间图谱信息如何指导新型治疗策略开发、预后预测和治疗响应评估 | 肿瘤免疫微环境(TIME) | 空间多组学、肿瘤免疫学 | 肿瘤 | 空间转录组学、空间蛋白质组学、空间代谢组学 | NA | 空间多组学数据 | NA | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学、空间代谢组学 | NA | NA |
| 77 | 2026-10-23 |
Benchmarking single-cell format conversion tools reveals interoperability gaps and introduces CrossCell for reliable cross-ecosystem data exchange
2026-Jul-22, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-026-13198-5
PMID:42894136
|
研究论文 | 本文系统性地基准测试了五种单细胞数据格式转换工具,并提出了基于Rust的CrossCell工具以实现R与Python生态系统之间的可靠数据交换 | 首次对五种格式转换工具从七个维度进行系统全面基准测试,覆盖68个数据集,并引入基于Rust的运行时无关工具CrossCell,实现100%转换成功率及2.5-4.9倍加速 | 基准测试主要聚焦于RDS与H5AD两种格式之间的转换,未涵盖其他单细胞数据格式;现有工具在小于74,000细胞的数据集上已广泛失败,大规模转换问题仍未完全解决 | 评估现有单细胞RNA测序数据格式转换工具的可靠性、性能和数据保真度,并开发更优的跨生态系统数据交换工具 | 单细胞RNA测序数据集,共68个数据集,细胞数范围从1,438到1,665,937 | 单细胞组学数据分析 | NA | 单细胞RNA测序数据分析 | NA | 单细胞表达矩阵及元数据 | 68个数据集,细胞数范围1,438至1,665,937 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 78 | 2026-10-23 |
Radiotherapy and tertiary lymphoid structures: balancing immune activation and immune damage in cancer immunotherapy
2026-Jul-22, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-026-02735-1
PMID:42482188
|
综述 | 综述放疗与三级淋巴结构之间的双向关系及其在肿瘤免疫治疗中的作用 | 系统区分了放疗调控TLS的已验证机制与间接证据,并从剂量、分割、时机、照射体积、淋巴结管理和放疗模式等维度提出优化策略 | 为综述性文章,未提供原始实验数据;许多机制仍属假设性转化概念,缺乏TLS定向临床干预的确定性证据 | 总结放疗与三级淋巴结构生物学双向关系的现有证据,探讨如何平衡免疫激活与免疫损伤 | 肿瘤微环境中的三级淋巴结构及接受放疗的肿瘤患者 | 肿瘤免疫学 | 多种恶性肿瘤 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 79 | 2026-10-23 |
Deciphering the heterogeneity of chicken gonadal primordial germ cells via single-cell RNA sequencing
2026-Jul-22, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-026-06331-w
PMID:42897262
|
研究论文 | 利用单细胞转录组分析揭示鸡胚胎性腺原始生殖细胞存在三种转录上不同的亚型,并证明体外培养的PGCs可通过血管注射整合到受体性腺中 | 首次发现鸡性腺原始生殖细胞存在三种转录上不同的亚型,打破了以往认为PGCs是均一细胞群体的观点;证明体外长期培养的基因修饰PGCs可通过二次血管注射重新建立并整合到受体性腺 | 摘要未提及具体样本量、测序平台和技术细节,也未说明亚型的功能验证和分子机制 | 解析鸡性腺原始生殖细胞的异质性,并探索体外培养PGCs的移植整合能力 | 鸡胚胎性腺原始生殖细胞(PGCs) | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 80 | 2026-10-23 |
Single-cell RNA sequencing reveals that TAF7 promotes colorectal cancer stemness by targeting SOX2
2026-Jul-22, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-026-00910-4
PMID:42897654
|
研究论文 | 该研究通过单细胞转录组测序发现TAF7通过靶向SOX2促进结直肠癌干性 | 首次揭示TAF7通过转录激活SOX2促进结直肠癌干性和EMT,并鉴定出TAF7+上皮细胞亚群 | 摘要未明确说明研究局限性 | 探究TAF7在结直肠癌干性中的作用及其分子机制 | 结直肠癌组织和癌旁正常组织、结直肠癌细胞系、结直肠癌异种移植小鼠模型 | 单细胞转录组学、肿瘤生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀、双荧光素酶报告基因实验 | NA | 单细胞转录组数据、实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |