单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 37112 篇文献,本页显示第 61 - 80 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
61 2026-03-06
Unraveling pancreatic ductal adenocarcinoma at single-cell resolution with spatial insights: From mechanisms to clinical translation
2026-Feb-28, Cancer letters IF:9.1Q1
综述 本文系统总结了基于单细胞RNA测序(scRNA-seq)的研究,以揭示胰腺导管腺癌(PDAC)的异质性、发生机制、免疫重塑、治疗抵抗和生物标志物发现,并讨论了整合单细胞与空间多组学方法在解析PDAC肿瘤微环境中的应用 从单细胞和空间分辨率层面系统整合了PDAC的最新研究进展,强调了整合单细胞与空间多组学方法在解析肿瘤微环境动态交互网络中的创新性 作为一篇综述文章,未报告原始实验数据,其结论依赖于对现有文献的总结和归纳 系统总结基于单细胞测序的PDAC研究进展,并探讨整合空间多组学方法以更深入理解PDAC生物学 胰腺导管腺癌(PDAC)及其肿瘤微环境 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间多组学 NA 单细胞转录组数据,空间多组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
62 2026-03-06
TLR5 versus TLR7/8 agonist-dependent modulation of the early gene expression response to inactivated influenza virus vaccine in newborn nonhuman primates
2026-Feb-27, Vaccine IF:4.5Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,探讨了TLR5与TLR7/8激动剂对新生非人灵长类动物接种灭活流感病毒疫苗后早期基因表达反应的影响 首次在新生非人灵长类动物模型中,利用单细胞RNA测序技术比较了TLR5激动剂(鞭毛蛋白)和TLR7/8激动剂(R848)作为疫苗佐剂对早期免疫反应的调控机制,揭示了它们在B细胞和T细胞激活中的不同作用 研究仅分析了疫苗接种后24小时的引流淋巴结样本,未能评估长期免疫保护效果;且样本来源于非人灵长类动物,结果向人类转化的适用性需进一步验证 旨在识别灭活流感病毒疫苗单独或联合TLR激动剂(R848或鞭毛蛋白)在新生非人灵长类动物中触发的早期免疫事件,以改进疫苗免疫原性策略 新生非人灵长类动物的引流淋巴结细胞 免疫学 流感 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
63 2026-03-06
Metabolic RNA Labeling-Enabled Time-Resolved Single-Cell RNA Sequencing
2026-Feb-27, Accounts of chemical research IF:16.4Q1
综述 本文综述了代谢RNA标记技术结合单细胞RNA测序在时间分辨基因表达动态研究中的最新进展 开发了Well-TEMP-seq和scDUAL-seq等方法,提高了时间分辨scRNA-seq的性能,并实现了从体外到体内、从时间到时空的扩展 当前化学工具在单细胞RNA动态分析中仍存在局限性,需要进一步改进 研究细胞基因表达的异质性和动态性,以揭示健康与疾病中的分子机制 细胞在胚胎发育、疾病进展和刺激响应等生物过程中的基因表达 单细胞组学 NA 代谢RNA标记,单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
64 2026-03-06
PANX1-mediated NLRP3 inflammasome activation promotes an adaptive doxorubicin resistance through IL-1β signaling in breast cancer
2026-Feb-27, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究揭示了PANX1通过激活NLRP3炎症小体和IL-1β信号通路,促进乳腺癌对阿霉素产生适应性耐药的关键机制 首次阐明PANX1在化疗耐药中的功能,并发现PANX1-NLRP3-IL-1β信号轴作为乳腺癌适应性耐药的新机制 研究主要聚焦于阿霉素耐药,其他化疗药物的耐药机制可能不同;临床验证队列为外部队列,需要进一步前瞻性研究验证 探究PANX1在乳腺癌化疗耐药中的作用机制 乳腺癌患者队列、乳腺癌细胞系、动物模型 肿瘤生物学 乳腺癌 单细胞转录组学、空间转录组学、药理学抑制、基因敲低 动物模型、细胞系模型 转录组数据、临床数据 患者队列(具体数量未明确)、细胞系和动物模型 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
65 2026-03-06
Deciphering the Impact of RAC1-SPTAN1 in ARPKD Cystogenesis Using Multifaceted Models
2026-Feb-26, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过多模型方法揭示了SPTAN1在常染色体隐性多囊肾病囊肿发生中的核心作用,并探索了表观基因组编辑作为潜在治疗策略 首次将SPTAN1确定为ARPKD中RAC1激活和囊肿病理的关键调节因子,并利用CRISPR激活技术恢复SPTAN1表达以缓解囊肿表型 研究主要基于模型系统(类器官和小鼠),在人类患者中的直接验证仍需进一步开展 阐明ARPKD囊肿发生的分子机制并寻找潜在治疗靶点 ARPKD患者肾脏样本、转基因小鼠、肾脏类器官芯片模型 数字病理学 多囊肾病 单细胞RNA-seq、CRISPR激活、转录组学、活体成像 NA 基因表达数据、图像数据 包括患者肾脏样本、转基因小鼠和肾脏类器官模型,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
66 2026-03-06
scMAG: Integrating single-cell multi-omics data via multi-stage deep fusion with manifold-aware gating
2026-Feb-26, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2
研究论文 本文提出了一种名为scMAG的多阶段深度融合框架,用于整合单细胞多组学数据,通过多核流形保持和门控优化策略提高聚类精度和数据可视化效果 创新性地引入了多阶段特征深度融合形式化方法,结合组学多核流形保持和引导门控优化策略,自适应平衡多组学共享信号和模态特异性信号 NA 提高单细胞多组学数据的聚类准确性和数据可视化效果,同时实现多组学潜在空间的自适应对齐 单细胞多组学数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞ATAC测序(scATAC-seq)、抗体衍生标签(ADT) 多阶段深度融合框架 单细胞多组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 NA NA
67 2026-03-06
Human hippocampal neurogenesis in adulthood, ageing and Alzheimer's disease
2026-Feb-25, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究通过多组学单细胞测序技术,分析了人类海马体神经发生的分子特征,探讨了其在成年、衰老及阿尔茨海默病中的变化 首次在人类海马体中识别神经干细胞、神经母细胞和未成熟颗粒神经元,并揭示了神经发生失调与染色质可及性变化的关联,特别是在阿尔茨海默病早期阶段 研究基于死后海马体样本,可能无法完全反映活体神经发生的动态过程;样本量虽大但来自不同队列,可能存在异质性 探究人类海马体神经发生在成年、衰老及阿尔茨海默病中的分子机制和认知功能关联 人类死后海马体样本,包括年轻成人、无认知障碍老年成人、超常记忆能力老年成人(SuperAgers)、临床前阿尔茨海默病成人和阿尔茨海默病成人 神经科学 阿尔茨海默病 多组学单细胞测序,包括单核RNA测序和单核转座酶可及染色质测序 NA 单细胞多组学数据 355,997个从海马体样本中分离的细胞核 NA 单核RNA测序, 单核ATAC-seq NA NA
68 2026-03-06
Protocol for the generation of a human-derived nasal epithelial model and induction of tissue-resident memory-like T cells in a co-culture system
2026-Feb-25, STAR protocols IF:1.3Q4
研究论文 本文提出了一种用于研究人类组织驻留记忆T细胞(TRMs)的体外模型系统协议 开发了一种通过共培养系统诱导TRM样T细胞的人类鼻上皮模型 NA 研究人类组织驻留记忆T细胞的诱导与分析 人类鼻上皮模型与自体免疫细胞 NA NA 流式细胞术、单细胞RNA测序、细胞因子释放分析 NA NA NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
69 2026-03-06
Specific depletion of TIGIThigh CD226- clonally expanded intratumoral Tregs defines safe and effective TIGIT targeting
2026-Feb-24, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究通过多组学分析鉴定出TIGIThigh CD226-克隆扩增的肿瘤内调节性T细胞是限制TIGIT阻断疗法疗效的主要障碍,并开发了具有增强ADCC活性的αTIGIT-IgG1抗体以特异性清除该Treg亚群,从而显著提升抗肿瘤效果 首次将TIGIThigh CD226-克隆扩增的肿瘤内Tregs确定为TIGIT阻断疗法的主要限制因素,并设计了具有增强ADCC活性的αTIGIT抗体以特异性清除该亚群,从而释放效应T细胞功能 研究主要基于小鼠模型和有限的患者样本,其临床转化效果和长期安全性仍需在更大规模的临床试验中验证 克服当前基于TIGIT阻断的癌症免疫疗法的局限性,提升其抗肿瘤疗效 肿瘤微环境中的调节性T细胞(Tregs)、效应T细胞(特别是干细胞样CD4+ T细胞和CD8+ T细胞)以及TIGIT和CD226的相互作用 免疫肿瘤学 非小细胞肺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞TCR测序(scTCR-seq)、癌症基因组图谱(TCGA)批量RNA-seq、流式细胞术、生物层干涉测量法、体外ADCC测定 NA 单细胞转录组数据、TCR序列数据、批量RNA-seq数据、流式细胞术数据 小鼠模型(MC38肿瘤接种的人源化TIGIT敲入小鼠)和患者来源的肿瘤浸润淋巴细胞 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR-seq, 批量RNA-seq NA NA
70 2026-03-06
Somatic structural variants drive upper tract urothelial carcinoma muscle invasiveness via activation of TPX2 transcription
2026-Feb-24, EBioMedicine IF:9.7Q1
研究论文 本研究揭示了体细胞结构变异通过激活TPX2转录驱动上尿路尿路上皮癌肌肉浸润的分子机制 首次系统性地将体细胞结构变异与UTUC的肌肉浸润表型相关联,并通过多组学整合及功能实验验证了TPX2上游SSV区域通过调控启动子活性促进肿瘤侵袭性的新机制 功能验证主要在5637细胞系中进行,需要在更多UTUC细胞模型或体内模型中进一步验证;样本量(162例)相对有限 揭示上尿路尿路上皮癌肌肉浸润的分子基础,寻找预后标志物和治疗靶点 上尿路尿路上皮癌患者肿瘤组织及5637细胞系 癌症基因组学 尿路上皮癌 体细胞结构变异分析,bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq,空间转录组学,单分子测序,双荧光素酶报告基因实验,伤口愈合实验,侵袭/迁移实验 NA 基因组测序数据,转录组数据,单细胞数据,空间转录组数据 162例UTUC患者 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq NA NA
71 2026-03-06
Decoding muscle-resident Schwann cell dynamics during neuromuscular junction remodeling
2026-Feb-23, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,通过比较稳定神经支配模型与部分或完全去神经支配后的再神经支配模型,揭示了肌肉驻留施万细胞在神经肌肉接头重塑中的作用 发现了多个不同的施万细胞亚型,包括一个在去神经-再神经循环中起关键作用的终末施万细胞亚型,并确定了SPP1信号通路作为神经肌肉接头动态的关键调节因子 研究主要基于小鼠模型,结果向人类临床转化的适用性尚需进一步验证 阐明肌肉驻留施万细胞在神经肌肉接头重塑中的贡献 肌肉驻留施万细胞 单细胞组学 神经肌肉疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
72 2026-03-06
IL-21 enhances the cytotoxicity of intratumoral CD8+ T cells, improving radiation efficacy
2026-Feb-23, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究探讨了IL-21与放疗联合应用如何通过增强肿瘤微环境中CD8+ T细胞的细胞毒性来改善癌症治疗效果 首次揭示了IL-21与放疗在增强肿瘤微环境激活和CD8+ T细胞功能方面的协同作用,并通过单细胞转录组测序提供了机制性见解 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,临床转化需进一步验证 评估IL-21作为放疗佐剂在增强抗肿瘤免疫反应中的潜力 人类癌症数据库、组织微阵列、小鼠肿瘤模型、人源化小鼠以及食管癌患者的样本 肿瘤免疫学 癌症(包括食管癌) 单细胞转录组测序、组织微阵列分析 NA 转录组数据、组织图像数据 涉及人类数据库、小鼠模型、人源化小鼠及患者样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
73 2026-03-06
Single-cell capture of on-ART SIV transcription reveals TGF-β-mediated metabolic control of viral latency
2026-Feb-23, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序、代谢分析和流式细胞术,探讨了galunisertib阻断TGF-β如何通过代谢重编程激活SIV潜伏感染细胞的机制 开发了新型敏感的SIV转录捕获检测方法,首次在单细胞水平揭示了TGF-β通过代谢抑制调控SIV潜伏的机制 研究样本仅来自ART治疗的SIV感染猕猴,未涉及人类HIV感染模型,且样本量相对有限 探究TGF-β阻断剂galunisertib激活SIV潜伏感染的分子和代谢机制 ART治疗的SIV感染猕猴的淋巴结单细胞样本 单细胞组学 病毒感染 单细胞RNA测序, 代谢分析, 高维流式细胞术 NA 单细胞转录组数据, 代谢数据, 流式细胞数据 来自SIV感染猕猴的淋巴结单细胞样本,其中检测到127个SIV表达细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
74 2026-03-06
Single-cell immunophenotyping identifies CD8+GZMK+IFNG+ T cells as a key immune population in cutaneous Lyme disease
2026-Feb-23, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学结合适应性免疫受体测序,揭示了皮肤莱姆病中CD8+GZMK+IFNG+ T细胞作为关键免疫群体的作用 识别了在皮肤莱姆病病变中克隆扩增的CD8+GZMK+IFNG+ T细胞亚群,并揭示了其炎症潜能和早期防御功能 NA 探究皮肤莱姆病中T细胞对伯氏疏螺旋体感染的免疫反应 皮肤莱姆病患者的红斑移行病变和自体未受累皮肤样本 数字病理学 莱姆病 单细胞RNA测序,适应性免疫受体测序 NA 单细胞转录组数据 扩展的样本量(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
75 2026-03-06
High-resolution spatial multi-omics enables prognostic scoring in intrahepatic cholangiocarcinoma
2026-Feb-18, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy IF:12.1Q1
研究论文 本研究通过整合空间多组学技术,开发了一种用于肝内胆管癌预后评分的新系统 首次结合图像质谱流式细胞术、扩展凝胶空间蛋白质组学、单细胞RNA测序、批量蛋白质组学及多重免疫荧光,实现高分辨率空间多组学分析,并构建了基于微尺度(1毫米)的空间多模态评分系统 研究依赖于特定技术平台,且样本量虽较大但可能仍需在更广泛人群中验证 开发肝内胆管癌的预后工具,以进行精确风险分层和治疗优化 肝内胆管癌(iCCA)患者 数字病理学 肝内胆管癌 图像质谱流式细胞术、扩展凝胶空间蛋白质组学、单细胞RNA测序、批量蛋白质组学、多重免疫荧光 NA 图像、蛋白质组数据、转录组数据 训练队列155名患者,验证队列214名患者 NA 单细胞RNA-seq、空间蛋白质组学、批量蛋白质组学 NA NA
76 2026-03-06
Spatiotemporal histogenesis of the developing human cerebellum reveals dynamic layering of Bergmann glia
2026-Feb-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究结合组织病理学、空间转录组学和单核RNA测序,揭示了人类小脑中Bergmann胶质细胞(BG)的时空发育图谱 首次系统描绘了人类小脑BG的发育时间线和分子特征,挑战了BG在妊娠晚期才出现的传统观点,并发现包括lamina dissecans在内的三层组织结构可能是人类特有的 研究主要基于发育中的人类小脑样本,未直接验证BG在神经发育障碍中的具体作用机制 阐明人类小脑Bergmann胶质细胞的发育过程、分子特征及其在神经发育中的潜在作用 人类发育中小脑组织,以及小鼠、雪貂和狨猴的小脑组织作为比较 数字病理学 神经发育障碍 组织病理学分析、空间转录组学、单核RNA测序 NA 图像、空间转录组数据、单核RNA测序数据 未明确说明具体样本数量,但涵盖了多个发育时间点(如11-12PCW、17PCW等)的人类小脑样本,以及小鼠、雪貂和狨猴的样本 NA 空间转录组学, 单核RNA测序 NA NA
77 2026-03-06
Cell-dependent contributions of thrombospondin-1 to the rupture of abdominal aortic aneurysm in mice
2026-Feb-14, Cardiovascular research IF:10.2Q1
研究论文 本研究探讨了血小板反应蛋白-1在不同细胞类型中对小鼠腹主动脉瘤破裂的影响 首次通过细胞特异性敲除模型揭示髓系细胞来源的TSP1在抑制动脉瘤破裂中的关键作用 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;仅关注了特定细胞类型 研究TSP1在不同细胞类型中对腹主动脉瘤破裂的调控机制 高胆固醇血症小鼠模型中的腹主动脉瘤 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 条件性基因敲除小鼠模型 基因表达数据、组织学图像 多种基因工程小鼠模型,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
78 2026-03-06
Tumor-immune-neural circuit disrupts energy homeostasis in cancer cachexia
2026-Feb-12, Cancer cell IF:48.8Q1
研究论文 本研究揭示了一种由肿瘤-免疫-神经回路驱动的癌症恶病质新机制,该机制以生长分化因子15(GDF15)为核心 首次发现并阐明了一个以GDF15为中心的肿瘤-免疫-神经回路,揭示了肿瘤信号、巨噬细胞来源的GDF15与神经通路之间的非细胞自主性机制 研究主要基于基因工程小鼠模型,其发现向人类临床转化的有效性尚需进一步验证 探究癌症恶病质和厌食症的潜在分子与神经环路机制,以寻找新的治疗靶点 胰腺癌、肺癌和皮肤癌的基因工程小鼠模型 癌症生物学与神经免疫学 癌症恶病质 单细胞RNA测序 基因工程小鼠模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
79 2026-03-06
Spatiotemporal cell type deconvolution leveraging tissue structure
2026-Feb-12, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种名为SpaDecoder的新方法,用于基于空间转录组学数据进行细胞类型反卷积,该方法能有效利用3D组织结构信息 提出了一种并行化的矩阵分解方法,通过自适应推断的3D邻域高斯核有效利用组织结构,并考虑了单细胞参考谱的变异性和批次效应 未在摘要中明确说明 改进空间转录组学中的细胞类型反卷积,以揭示空间细胞类型分布并支持下游分析 空间转录组学数据(spot-based)和单细胞RNA-seq参考图谱 空间转录组学 NA 空间转录组学,单细胞RNA-seq 矩阵分解 空间转录组学数据,单细胞RNA-seq数据 NA NA 空间转录组学,单细胞RNA-seq NA NA
80 2026-03-06
Seq-Scope-eXpanded: spatial omics beyond optical resolution
2026-Feb-10, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究提出了一种名为Seq-Scope-X的空间组学技术,通过结合组织膨胀与测序方法,实现了亚微米级分辨率的全转录组和蛋白质组空间分析 将组织膨胀技术与Seq-Scope结合,突破了传统测序空间转录组学的光学分辨率限制,首次在测序方法中实现亚微米级分辨率,并能同时分析核与细胞质转录组差异 NA 开发超高分辨率空间组学技术,用于研究细胞结构、功能和疾病机制 肝脏组织、脑组织、结肠组织、小鼠脾脏、人类扁桃体 空间转录组学 NA 空间转录组学、空间蛋白质组学、组织膨胀技术 NA 空间转录组数据、空间蛋白质组数据 NA NA 空间转录组学、空间蛋白质组学 Seq-Scope-X 结合组织膨胀的Seq-Scope改进平台,支持亚微米级分辨率的全转录组和蛋白质组分析
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