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当前共找到 39123 篇文献,本页显示第 61 - 80 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
61 2026-05-05
TNF-α blockade mitigates immune checkpoint-related nephritis in a humanized mouse model
2026-Apr-22, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 使用人源化小鼠模型研究TNF-α阻断对免疫检查点抑制剂相关肾炎的缓解作用 首次在人源化嵌合PD-1/PD-L1小鼠模型中评估TNF-α阻断对免疫检查点抑制剂所致急性间质性肾炎的预防效果,并利用单细胞RNA-seq揭示免疫细胞群和关键基因变化 未提及具体局限性 探讨TNF-α阻断能否预防免疫检查点抑制剂相关急性间质性肾炎 人源化PD-1/PD-L1嵌合小鼠 机器学习和数字病理学 肾炎 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未明确样本数量,但分为4组:对照组、ICI-only组、ICI-细胞因子组、ICI-阻断组 未指定 单细胞RNA-seq NA NA
62 2026-05-05
Single-cell profiling reveals epithelial and immune responses in BK polyomavirus-infected human kidney biopsies
2026-Apr-22, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析BK多瘤病毒感染人肾活检组织中的上皮和免疫反应 首次在单细胞分辨率下揭示BK病毒感染不同阶段(病毒滴度上升期和消退期)中肾小管上皮细胞和免疫细胞的动态分子变化 横断面研究设计无法观察纵向动态变化,且体外细胞培养模型未能完全模拟体内代谢适应和免疫反应 阐明BK多瘤病毒感染导致肾损伤的分子机制,为临床管理提供新见解 肾移植活检组织中的上皮细胞和免疫细胞 机器学, 数字病理学 BK病毒性肾病,肾移植并发症 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未感染者对照和BK病毒感染两个阶段(病毒滴度上升期和消退期)的肾移植活检样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
63 2026-05-05
Spatial proteomic mapping of the human and mouse retina using IBEX
2026-Apr-22, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 使用IBEX技术生成人和小鼠视网膜的空间蛋白质组图谱 将抗体解离选项与化学漂白相结合,实现同一宿主物种抗体的灵活使用,并将其与超分辨率成像耦合,揭示了视网膜细胞群体和外界膜的超微结构特征 NA 绘制人和小鼠视网膜的空间蛋白质组图谱,并探究外界膜的结构组成 人和小鼠视网膜组织 数字病理学 NA 多重免疫组织化学 IBEX NA 图像 健康人和野生型小鼠视网膜,以及Crb1rd8小鼠模型 NA 空间蛋白质组学 NA IBEX 超分辨率成像
64 2026-05-05
FOSL2 regulates endothelial cell state and chromatin accessibility in systemic sclerosis pulmonary vascular remodeling
2026-Apr-22, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 探究FOSL2在系统性硬化症肺部血管重塑中调控内皮细胞状态和染色质可及性的作用 首次通过多组学数据、转基因小鼠模型和深度学习模型ChromBPNet,揭示FOSL2在系统性硬化症相关肺动脉高压中调控内皮细胞表型的关键机制 未明确说明研究限制 阐明FOSL2在系统性硬化症肺部血管病变中对内皮细胞表型和染色质可及性的调控机制 系统性硬化症合并间质性肺病和肺动脉高压患者肺部组织、Fosl2转基因小鼠、Sugen/缺氧及缺氧处理小鼠、原代血管内皮细胞 数字病理学 血管疾病, 肺病, 自身免疫病 多组学分析、单细胞RNA测序、深度学习模型 ChromBPNet 基因表达数据、染色质可及性数据 系统性硬化症患者肺部样本及多种小鼠模型样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
65 2026-05-05
scVIP: personalized modeling of single-cell transcriptomes for developmental and disease phenotypes
2026-Apr-22, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出scVIP生成框架,整合单细胞转录组与表型标记预测个体化特征 首次通过细胞类型感知的多实例学习将单细胞转录组与个体表型(发育年龄、疾病进展、神经病理)直接关联,并实现跨数据集表型定义统一 基于抽象信息无法评估具体方法学缺陷或验证范围限制 建立单细胞转录组与个体水平表型(发育和疾病)的关联预测模型 单细胞转录组数据及对应的个体发育年龄、疾病进展、神经病理表型 机器学习 神经退行性疾病 单细胞RNA测序 生成模型(含细胞类型感知多实例学习) 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
66 2026-05-05
Ancestry-specific rewiring of BCR-MAPK signaling in sarcoidosis B cells
2026-Apr-22, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示结节病B细胞中BCR-MAPK信号通路的祖先特异性重构 首次在单细胞水平上揭示结节病B细胞中MAPK信号重编程及BCR的祖先特异性扩增,并发现与非裔和欧裔人群疾病差异相关的基因表达模式 未提及 探究B细胞在结节病发病机制中的作用及其在不同祖先人群中的差异 外周血单核细胞(PBMCs)来自非洲裔和欧洲裔个体,包括健康对照、结节病患者和系统性红斑狼疮(SLE)患者 单细胞转录组学 结节病 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 48名健康对照、59名结节病患者、28名SLE患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
67 2026-05-05
MCT1 governs a metabolic checkpoint at pachytene during spermatogenesis
2026-Apr-22, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文发现单羧酸转运蛋白1(MCT1)依赖的代谢检查点控制哺乳动物精子发生中的减数分裂进程,通过整合单细胞转录组学、代谢分析和计算扰动模型揭示其机制 首次发现MCT1介导的代谢检查点作为指导信号,通过乳酸诱导的组蛋白乳酸化修饰(H4K12la)整合代谢状态与表观遗传调控,控制减数分裂细胞命运进程 未提及具体限制 阐明代谢通量如何直接调控减数分裂进入的机制 哺乳动物精子发生过程中的生殖细胞 机器学习 NA 单细胞转录组学、代谢分析、计算扰动建模 NA 单细胞转录组、代谢组、表观遗传组 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
68 2026-05-05
Resilience to Diabetic Retinopathy (RDR) Is Associated with a Pre-Retinopathy Transcriptional Program Induced by Diabetes
2026-Apr-21, Biomolecules IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了糖尿病诱导的视网膜细胞基因表达变化,揭示了糖尿病视网膜病变抵抗力的分子基础 首次在单细胞水平上揭示了糖尿病视网膜病变抵抗力与Müller细胞中防御程序激活的时间关联 未明确说明研究局限性 定义与糖尿病视网膜病变抵抗力获得和丧失相关的单个视网膜细胞类型中的基因表达变化 雄性小鼠视网膜,包括经历5天或15天糖尿病的小鼠及年龄匹配的非糖尿病小鼠 数字病理学 糖尿病视网膜病变 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
69 2026-05-05
Neutrophil Heterogeneity: Molecules to Cellular Behavior
2026-Apr-21, Life (Basel, Switzerland)
综述 总结中性粒细胞异质性的分子机制及其在疾病中的功能行为,并探讨活体成像技术在连接静态分子谱与动态细胞行为中的应用 提出利用活体成像技术弥合分子定义的中性粒细胞状态与体内时空行为之间的差距,强调从分子到细胞行为的综合视角 未详细提及目前活体成像技术的具体局限或实验验证上的挑战 综述中性粒细胞异质性的分子特征及其在癌症、脓毒症和缺血性卒中等疾病中的体内功能行为 中性粒细胞的异质性及其在健康与病理条件下的功能行为 机器学习 癌症、脓毒症、缺血性卒中 单细胞RNA测序、高维流式细胞术、活体成像 NA 单细胞转录组数据、流式细胞术数据、活体成像数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
70 2026-05-05
The Hodgkin Lymphoma Microenvironment: Insights from Spatial Transcriptomics
2026-Apr-21, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
综述 本综述总结了空间转录组学在经典霍奇金淋巴瘤微环境研究中的应用,探讨了其对疾病生物学、免疫逃逸及治疗反应的启示 利用空间转录组学技术对经典霍奇金淋巴瘤微环境进行空间解析,揭示了HRS细胞为中心的细胞生态位和免疫逃逸机制,为风险分层、生物标志物发现和微环境导向治疗提供了新视角 空间转录组学技术仍存在分辨率有限、成本较高等局限性,且基于综述性质,未涉及原始实验数据或真实样本分析 总结经典霍奇金淋巴瘤微环境的空间转录组学研究进展,探讨其对疾病机制和治疗策略的启示 经典霍奇金淋巴瘤的肿瘤微环境,特别是HRS细胞及其周围的免疫和基质细胞 数字病理学 淋巴瘤 空间转录组学、单细胞RNA测序 NA 图像(组织切片)、基因表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
71 2026-05-05
Integrated Transcriptomic and Single-Cell Analyses Identify HILPDA as a Hypoxia-Mediated Regulator of Ferroptotic Signaling in Glioblastoma
2026-Apr-21, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 通过整合转录组和单细胞分析,鉴定HILPDA为胶质母细胞瘤中缺氧介导的铁死亡信号调控因子 首次系统揭示HILPDA作为缺氧与铁死亡信号之间的桥梁基因,并利用结构方程模型阐明其通过缺氧通路介导铁死亡相关基因表达的关系 未进行功能验证实验,仅基于转录组关联分析,缺乏直接因果证据 探究胶质母细胞瘤中缺氧信号与铁死亡相关基因表达谱之间的关系 胶质母细胞瘤患者的转录组和单细胞RNA测序数据 机器学习 胶质母细胞瘤 RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA 转录组数据, 单细胞转录组数据 NA(研究未明确说明样本数量) NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
72 2026-05-05
Dissecting the coordinated progression of cell states in spatial transcriptomics with CoPro
2026-Apr-21, bioRxiv : the preprint server for biology
research paper 提出CoPro计算框架用于检测空间转录组中细胞状态的协调进展 CoPro能够在有监督和无监督模式下识别细胞类型内部或之间的共变基因程序,并解析多重重叠的空间模式,适用于多种单细胞级空间转录组数据集 NA 识别基因表达程序在空间上连续变化以及在细胞类型间协调的挑战 结肠、脑、肝脏和肾脏组织 machine learning NA MERFISH, SeqFISH+, Xenium, histology-imputed transcriptomic data CoPro (计算框架) 空间转录组数据 多组织样本(结肠、脑、肝脏和肾脏) 10x Genomics spatial transcriptomics 10x Xenium NA
73 2026-05-05
Microporous annealed particle scaffolds avoid foreign body response by down regulating complement-fibroblast-macrophage signaling loop
2026-Apr-21, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过比较微孔退火颗粒支架与纳米多孔水凝胶的皮下植入免疫反应,揭示了支架孔隙度如何调节免疫反应和补体信号通路,从而避免异物反应 首次揭示微孔退火颗粒支架通过下调补体-成纤维细胞-巨噬细胞信号环路(特别是C5a信号串扰通路)来减少异物反应,并利用C5缺陷小鼠验证了该机制的特异性 未说明 探究植入物孔隙度对异物反应的影响及其分子机制 皮下植入的微孔退火颗粒支架和纳米多孔水凝胶 机器学习 NA 质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序, 多重细胞因子分析 NA 质谱数据, 单细胞转录组数据, 细胞因子数据 小鼠皮下植入模型,具体数量未说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
74 2026-05-05
Prognostic Role of Uric Acid-Related Gene Signatures in Glioblastoma Multiforme: Insights from Bulk RNA and Single-Cell RNA Sequencing
2026-Apr-20, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 利用批量RNA和单细胞RNA测序分析尿酸相关基因在胶质母细胞瘤中的预后作用,构建并验证了一个六基因风险模型 首次系统阐明尿酸相关基因在胶质母细胞瘤中的预后价值,并利用单细胞RNA测序揭示树突状细胞、巨噬细胞和T细胞在肿瘤微环境中的关键作用及细胞间通讯网络 未提及具体局限性 阐明尿酸驱动机制在胶质母细胞瘤中的作用,重点关注风险分层和治疗易感性 胶质母细胞瘤患者的转录组数据和单细胞RNA测序数据 机器学习 胶质母细胞瘤 批量RNA测序,单细胞RNA测序 Cox回归,LASSO回归 转录组数据,单细胞RNA测序数据 NA NA 批量RNA测序,单细胞RNA测序 NA NA
75 2026-05-05
Multimodal Single-Cell Transcriptomic and Chromatin Accessibility Profiling Reveals Monocyte-Derived Macrophage Dynamics Following Ischemic Stroke
2026-Apr-20, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 通过多模态单细胞转录组和染色质可及性分析,揭示了单核细胞来源的巨噬细胞在缺血性卒中后的动态变化 首次通过联合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序,描绘了卒中亚急性期小鼠脑中单核细胞来源巨噬细胞亚群的异质性和表型转换轨迹,并鉴定了富集溶酶体和脂质代谢基因表达程序的独特MDM亚群 尚未明确描述 研究缺血性卒中后单核细胞来源巨噬细胞的异质性和表型转换及其功能状态 小鼠脑中单核细胞来源的巨噬细胞 单细胞组学 缺血性卒中 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 基因表达数据、染色质可及性数据 小鼠大脑样本,具体数量未说明 NA 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 NA NA
76 2026-05-05
Generative AI-assisted Bayesian-frequentist Hybrid Inference in Single-cell RNA Sequencing Analysis for Genes Associated with Alzheimer's Disease
2026-Apr-20, medRxiv : the preprint server for health sciences
research paper 提出了一种生成式AI辅助的贝叶斯-频率学派混合推断框架,用于单细胞RNA测序分析中与阿尔茨海默病相关的基因 首次将基于大语言模型的先验知识获取与混合推断理论相结合,在基因组范围贝叶斯分析中实现了计算高效和统计效能提升 依赖于ChatGPT-4o的标准化提示输出,可能受限于先验校准的准确性;仅在线性模型下推导了闭式混合估计量,尚未扩展到非线性模型 开发一种计算可扩展的贝叶斯-频率学派混合推断方法,用于高维组学数据的全基因组关联分析 ROSMAP队列中阿尔茨海默病患者的单细胞RNA测序数据 machine learning 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序 大语言模型(ChatGPT-4o)、线性模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
77 2026-05-05
Plectin promotes an aggressive phenotype and represses cytotoxic T cell activity in pancreatic cancer
2026-Apr-20, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 揭示网蛋白(plectin)在胰腺癌中促进侵袭性表型并抑制细胞毒性T细胞活性的作用机制 首次发现网蛋白作为调节PDAC中T细胞抑制性肿瘤微环境的新因子,并验证抗CSP单克隆抗体可恢复抗肿瘤免疫 未提及具体局限性,但可能包括样本量限制、小鼠模型与人类疾病的差异等 探究网蛋白在胰腺癌中调节T细胞抑制性肿瘤微环境的分子机制 胰腺腺癌(PDAC)患者的肿瘤样本及两种小鼠PDAC模型 计算机视觉 胰腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq(scRNA-seq) NA 基因表达数据, 单细胞转录组数据 229例PDAC患者(scRNA-seq分析)及TCGA-PAAD数据集(未明确具体样本数) NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
78 2026-05-05
PALINCODE: Recording cell lineage with ternary palindromic CRISPR bits
2026-Apr-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 介绍PALINCODE系统,利用三元CRISPR位点随机写入细胞谱系信息,实现高密度谱系记录 首次提出使用三元CRISPR位点(cBits)实现更高信息密度的细胞谱系记录,通过截断的Cas9引导序列提高三元编辑效率,理论编码能力达10^25比特 未明确提及局限性,但可能受限于CRISPR编辑的随机性及体内应用时的脱靶效应 开发高密度、高精度的细胞谱系记录平台,克服传统CRISPR谱系追踪方法的局限性 细胞谱系记录系统及体内黑色素瘤模型中的克隆进化 机器学习 黑色素瘤 CRISPR NA 单细胞测序数据 293T细胞及黑色素瘤体内模型 NA 单细胞测序 NA NA
79 2026-05-05
An Integrative Network Analysis Framework for Identifying Altered Glycosylation Pathways Associated with Autism Spectrum Disorder
2026-Apr-19, Genes IF:2.8Q2
研究论文 开发了一个整合性网络分析框架,用于识别与自闭症谱系障碍相关的糖基化通路改变 首次从系统层面整合转录组和网络分析,揭示糖基化通路在ASD病理中的潜在作用,并识别出糖基化-免疫轴 依赖公共数据集,可能受限于样本异质性和批次效应;没有进行实验验证 探讨糖基化相关基因表达变化及其功能关联如何参与ASD病理生理学 自闭症谱系障碍患者的大脑和血液组织样本 计算生物学与生物信息学 自闭症谱系障碍 RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA 转录组数据 公开数据集(具体数量未明确) NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
80 2026-05-05
Dynamic regulation of long non-coding RNAs across asexual and gametocyte development in Plasmodium falciparum
2026-Apr-18, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 利用长读长Oxford Nanopore直接RNA测序、核糖体图谱分析和单细胞转录组学,对恶性疟原虫无性期和配子体发育过程中的长链非编码RNA进行动态调控研究 首次整合长读长纳米孔直接RNA测序、核糖体分析和单细胞转录组学,对恶性疟原虫lncRNA进行稳健的阶段特异性表征,揭示了其在配子体发生和传播中的潜在作用 研究中可能受到短读长Illumina测序、逆转录酶伪迹以及链特异性cDNA文库中第二链不完全降解的影响,这些因素阻碍了全基因组lncRNA的鉴定 全面鉴定恶性疟原虫无性期和配子体阶段的lncRNA,并探讨其基因表达调控中的作用 恶性疟原虫的无性期和配子体阶段样本 机器学习 疟疾 纳米孔直接RNA测序、核糖体图谱分析、单细胞RNA测序 NA RNA测序数据、单细胞转录组数据 多个无性期和配子体阶段样本,具体数量未说明 Oxford Nanopore Technologies 直接RNA测序、单细胞RNA测序 Oxford Nanopore直接RNA测序平台 NA
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