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当前共找到 44322 篇文献,本页显示第 61 - 80 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
61 2026-10-19
Mechanism of luteolin in treating chronic heart failure by regulating HIF-1 signaling pathway-mediated mitochondrial damage to inhibit cardiomyocyte apoptosis
2026, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 该文结合生物信息学分析、分子对接以及体内外实验,探究木犀草素通过调控HIF-1信号通路介导的线粒体损伤、抑制心肌细胞凋亡来改善慢性心力衰竭的机制 整合网络药理学、机器学习、单细胞转录组与体内外实验,首次系统揭示木犀草素经HIF-1信号通路下调L-M-C基因集(HIF1A、NOS2、BNIP3、BNIP3L、PDK1、BBC3)以减轻线粒体损伤和心肌细胞凋亡的作用机制 摘要中未明确说明研究局限性 阐明木犀草素改善慢性心力衰竭的分子机制,特别是其对HIF-1信号通路及线粒体损伤的调控作用 慢性心力衰竭相关的靶点基因、心肌细胞亚群以及慢性心力衰竭大鼠模型 生物信息学、心血管疾病研究 慢性心力衰竭、心血管疾病 网络药理学、分子对接、单细胞转录组测序(scRNA-seq)、GO与KEGG富集分析、机器学习 机器学习组合模型、临床预测模型、蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络 基因表达数据、单细胞转录组数据、图像、文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
62 2026-10-19
Single-Cell Multiomics Integration Reveals Cell Trajectories and Regulatory Networks in Breast Cancer Progression
2026, International journal of genomics IF:2.6Q2
研究论文 该文整合单细胞多组学与肠道微生物组分析,揭示乳腺癌进展中的细胞轨迹、染色质调控网络及细胞间通讯 首次将scRNA-seq、scATAC-seq、细胞通讯推断与肠道微生物16S rRNA分析整合,构建乳腺癌进展的多层次图谱,并发现SNAI1-ZEB1-FOXM1核心调控网络及肠道菌群失调作为系统性维度 摘要中未明确说明研究局限性 解析乳腺癌从luminal向间质状态进展的单细胞转录轨迹、染色质调控景观及细胞间通讯网络,并同步刻画肠道微生物组的系统性变化 乳腺癌患者肿瘤及癌旁正常组织样本,以及599对乳腺癌-健康对照匹配的肠道微生物组样本 数字病理学 乳腺癌 scRNA-seq, scATAC-seq, 16S rRNA扩增子测序, 定量RT-PCR Seurat, Scanpy, Monocle3, scVelo, Slingshot, SCENIC, CellChat, 随机森林 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据, 微生物组测序数据, 文本 42037个高质量单细胞,599对乳腺癌-健康对照肠道微生物组样本(266个属,4个BioProject) NA single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq, 16S rRNA扩增子测序 NA NA
63 2026-10-19
Mouse cortical cellular diversification through lineage progression of radial glia
2025-11-03, Genes & development IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过时间序列scRNA-seq和snATAC-seq分析小鼠皮层放射状胶质细胞(RGs)在胚胎和出生后阶段的谱系进展,揭示其细胞内在程序如何驱动皮层细胞多样化 揭示了RGs从早期到晚期的转变,依次产生中间神经元祖细胞(INPs)和中间胶质祖细胞(IGPs),并发现染色质可及性通过限制广泛表达的转录因子到特定阶段和细胞类型来驱动皮层细胞多样化 研究仅基于小鼠模型,未验证人类皮层发育的保守性;未进行功能实验验证染色质可及性变化的因果作用 探究皮层细胞多样化的细胞内在程序,特别是RGs谱系进展的分子机制 小鼠皮层放射状胶质细胞(RGs)及其分化的中间祖细胞和成熟细胞 单细胞组学 NA scRNA-seq, snATAC-seq NA 单细胞转录组和染色质可及性数据 NA NA single-cell RNA-seq, single-nucleus ATAC-seq NA NA
64 2026-10-19
Highly accurate reference and method selection for universal cross-data set cell type annotation with CAMUS
2025-11-03, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 该论文提出了一种名为CAMUS的通用参考数据和方法选择策略,用于跨数据集细胞类型注释,以实现高精度和高效的注释 提出了一种通用的参考数据和方法选择策略CAMUS,能够为基于参考的细胞类型注释方法选择最优的参考数据集和方法组合 未明确提及 解决单细胞数据分析中参考数据集和方法选择被忽视的问题,提高跨数据集细胞类型注释的准确性和效率 单细胞RNA测序数据、单细胞空间转录组数据、单细胞ATAC测序数据 单细胞数据分析 NA 单细胞RNA测序、单细胞空间转录组学、单细胞ATAC测序 NA 基因表达数据、表观遗传数据、空间转录组数据 672对跨物种scRNA-seq数据集、80个scST数据集、5个scATAC-seq数据集,共3360对参考-方法组合 NA 单细胞RNA测序、单细胞空间转录组学、单细胞ATAC测序 NA NA
65 2026-10-19
RNA binding proteins PCBP1 and PCBP2 regulate pancreatic β cell translation
2025-08, Molecular metabolism IF:7.0Q1
研究论文 研究RNA结合蛋白PCBP1和PCBP2在胰腺β细胞翻译调控及血糖稳态中的作用 首次揭示PCBP1与PCBP2协同调控β细胞翻译起始因子和核糖体mRNA的稳定与翻译,共同维持β细胞功能和血糖稳态 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类β细胞中验证;对PCBP1/2直接靶标mRNA的全景图及分子机制细节仍需进一步阐明 探究PCBP2及其同源异构体PCBP1在β细胞稳态和翻译调控中的关系与作用 小鼠胰腺β细胞 分子生物学、糖尿病研究 糖尿病 单细胞RNA测序、qRT-PCR、western blot、RNA免疫沉淀、CRISPR-Cas9、shRNA、嘌呤霉素标记翻译监测 NA 基因表达数据、RNA-蛋白质互作数据、图像(western blot) NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
66 2026-10-19
Pathogenesis of Graves' Disease Determined Using Single-Cell Sequencing with Thyroid Autoantigen Peptide Stimulation in B Cells
2025-07-17, Cells IF:5.1Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序分析Graves病(GD)患者外周血和甲状腺内B细胞在甲状腺自身抗原肽刺激下的反应 首次结合单细胞RNA测序与甲状腺自身抗原(TSHR、Tg、TPO)重叠肽刺激,对比分析GD患者外周血与甲状腺内B细胞的转录组和BCR特征 摘要中部分基因名称缺失,样本量未明确说明,仅涉及接受甲状腺切除术的GD患者,可能存在选择偏倚 探究Graves病中B细胞对甲状腺自身抗原(TSHR、Tg、TPO)的免疫反应差异及其在发病机制中的作用 接受甲状腺切除术的Graves病患者的外周血单个核细胞(PBMCs)和甲状腺内血液单核细胞中的B细胞 单细胞组学/免疫学 Graves病(自身免疫性甲状腺疾病) 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据、BCR序列数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
67 2026-10-19
Abundance of a metabolically active subpopulation in dedifferentiated adipocytes inversely correlates with body mass index
2025-07, Molecular metabolism IF:7.0Q1
研究论文 该研究通过单细胞RNA测序分析人脂肪细胞去分化后的细胞亚群,发现一个代谢活跃的亚群,其丰度与体重指数呈负相关 首次在去分化脂肪细胞中鉴定出具有肌肉细胞基因特征的独特亚群C7,该亚群能量消耗增加,且其比例与BMI呈负相关,并在大规模人皮下脂肪组织队列中验证了相关基因与临床代谢参数的相关性 样本量有限(11名供体),且主要基于体外去分化细胞模型,需要进一步体内验证和更大规模研究 探究人脂肪细胞中是否存在具有独特基因表达和功能特征的亚群,并分析其与代谢疾病的关系 人脂肪细胞去分化细胞(DFAT)及人皮下脂肪组织 单细胞转录组学 肥胖、代谢疾病 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、流式细胞术 NA 单细胞转录组数据、bulk转录组数据 11名供体用于单细胞分析,1759名供体用于皮下脂肪组织bulk分析 10x Genomics 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq 10x Chromium, Illumina测序平台 10x Genomics单细胞RNA测序(具体型号未提及),bulk RNA测序(平台未明确)
68 2026-10-19
A STT3A-dependent PD-L1 glycosylation modification mediated by GMPS drives tumor immune evasion in hepatocellular carcinoma
2025-05, Cell death and differentiation IF:13.7Q1
研究论文 该文章通过蛋白质组学和单细胞RNA测序分析晚期肝细胞癌组织,揭示了GMPS通过STT3A依赖的PD-L1糖基化修饰驱动肿瘤免疫逃逸的机制 首次发现GMPS作为连接Sec61通道复合物和STT3A的额外模块,促进新生肽的转位和修饰,从而增加PD-L1表达并诱导免疫逃逸;提出靶向GMPS的抑制剂angustmycin A可抑制PD-L1表达和肿瘤生长并增强抗CTLA-4免疫治疗敏感性 摘要中未明确提及研究局限性 探索肝细胞癌快速生长和转移的调控机制,特别是免疫逃逸的分子机制 晚期肝细胞癌组织及CD8 T细胞 肿瘤免疫学 肝癌 蛋白质组学, 单细胞RNA测序 NA 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
69 2026-10-19
Impact of mechanotransduction on gene expression changes in periodontal ligament during orthodontic tooth movement
2025-May, Journal of bone and mineral metabolism IF:2.4Q3
研究论文 该研究通过单细胞RNA测序分析大鼠正畸牙齿移动过程中牙周膜细胞群和基因表达变化,探讨Mkx在机械转导中的作用 首次在单细胞水平上揭示正畸牙齿移动过程中Mkx表达细胞群的动态变化及其与肌腱基因表达的关系 研究主要基于大鼠模型,人类牙周膜细胞实验仅验证了MKX过表达对COL1A1和DECORIN的影响,样本量有限 阐明Mkx在正畸牙齿移动过程中对牙周膜机械转导的调控作用及细胞群变化 野生型大鼠牙周膜组织及人类牙周膜细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序, RT-qPCR NA 基因表达数据, 文本 大鼠牙周膜组织在0天、1周、2周三个时间点进行单细胞RNA测序,人类牙周膜细胞用于RT-qPCR验证 NA 单细胞RNA-seq NA NA
70 2026-10-19
Spatial transcriptomics of Glomerulo-centric antibody mediated rejection in renal transplants
2025-May, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
案例研究 本文利用数字空间表达谱分析技术,对一名肾移植患者治疗前后的四次活检样本进行转录本定位分析,以研究以肾小球为中心的抗体介导排斥反应 采用数字空间表达谱技术揭示了急性抗体介导排斥反应中肾小球内先天免疫细胞(如NK细胞和巨噬细胞)的分子特征及HLA II类抗原转录本上调,同时发现足细胞特征基因转录本在排斥反应期间下降,且IVIg治疗虽缓解组织学肾小球炎但未恢复足细胞转录本表达 本研究为单病例的案例研究,样本量小(仅一名患者的4次活检),结果需在更多患者中验证 研究以肾小球为中心的急性抗体介导排斥反应的空间分子特征及治疗后的转录本变化 一名接受肾移植并发生急性抗体介导排斥反应(以肾小球强C4d染色为特征)的患者 空间转录组学, 肾脏病理学 肾移植抗体介导排斥反应 数字空间表达谱分析(Digital Spatial Profiling) NA 空间转录组数据 4例活检样本(来自同一患者治疗前、治疗期间及治疗后) NanoString 空间转录组学 GeoMx Digital Spatial Profiler Digital Spatial Profiling
71 2026-10-19
Inactivation of GSK3β by Ser389 phosphorylation prevents thymocyte necroptosis and impacts Tcr repertoire diversity
2025-05, Cell death and differentiation IF:13.7Q1
研究论文 该研究通过单细胞RNA测序分析小鼠双阴性(DN)3和DN4胸腺细胞,揭示了GSK3β Ser389磷酸化失活对胸腺细胞坏死性凋亡和TCR库多样性的影响 发现了除已知G1检查点外的G2M细胞周期检查点,在Tcrb和Tcra重组过程中;揭示了GSK3β通过坏死性凋亡而非凋亡促进DN3/DN4胸腺细胞死亡;GSK3β失活对胸腺细胞存活和TCR库多样性至关重要 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类胸腺细胞中验证;未详细探讨其他可能参与胸腺细胞存活的信号通路 探究V(D)J重组过程中胸腺细胞存活的机制,特别是GSK3β在其中的作用 小鼠双阴性(DN)3和DN4胸腺细胞 免疫学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 分选的小鼠DN3和DN4胸腺细胞(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
72 2026-10-19
scDILT: A Model-Based and Constrained Deep Learning Framework for Single-Cell Data Integration, Label Transferring, and Clustering
2025 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
研究论文 提出并验证了一个基于条件自编码器和深度嵌入聚类的深度学习框架scDILT,用于单细胞RNA测序数据的整合、标签转移和聚类 结合条件自编码器与深度嵌入聚类,利用同质约束保持参考数据集的细胞类型/聚类模式,并采用异质约束将新数据集中的细胞映射到参考数据集的注释细胞簇,同时实现批次效应去除、标签转移和聚类 未明确提及 开发一个能够同时实现单细胞数据整合、标签转移和聚类,并确保整合过程不改变参考数据集细胞簇结构的工具 单细胞RNA测序数据,包括模拟数据集和真实数据集,以及多组学单细胞数据集 机器学习 NA 单细胞RNA测序 条件自编码器, 深度嵌入聚类 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
73 2026-10-19
CellPie: a scalable spatial transcriptomics factor discovery method via joint non-negative matrix factorization
2025-03-20, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本文提出了一种基于联合非负矩阵分解的空间转录组因子发现方法CellPie,可同时分析空间RNA转录本和组织学图像特征 结合空间RNA转录本与组织学图像特征进行联合非负矩阵分解,并采用加速层次最小二乘法显著降低计算时间,适用于高维空间转录组数据集 仅在三种人类癌症类型上进行了评估,未涉及其他疾病或组织类型,且未与其他多模态因子发现方法进行全面比较 开发一种快速、无监督的因子发现方法,用于整合空间转录组数据与组织学图像特征,以揭示组织中的潜在因子 三种不同人类癌症类型的空间转录组数据集,包括高分辨率的Visium HD数据集 空间转录组学 癌症 空间转录组学,组织学图像分析 联合非负矩阵分解,加速层次最小二乘法 空间RNA转录本数据,组织学图像 三种人类癌症类型的数据集 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium HD Visium HD高分辨率空间转录组平台
74 2026-10-19
ScRNA-seq revealed disruption in CD8+ NKG2A+ natural killer T cells in patients after liver transplantation and immunosuppressive therapy
2023-09, Immunity, inflammation and disease
研究论文 该研究通过单细胞转录组测序揭示了肝移植患者接受免疫抑制治疗后CD8+ NKG2A+自然杀伤T细胞的动态变化 首次在单细胞水平上分析了肝移植后不同时间点接受免疫抑制治疗患者的外周血免疫细胞组成和基因表达,发现特异性表达NKG2A的CD8+ NKT细胞可能在肝移植免疫耐受中起重要作用 样本量较小(仅5例外周血样本),未进行功能验证实验,需要更大规模的队列研究来验证发现 探究肝移植后免疫抑制治疗期间免疫耐受过程中细胞免疫系统组成的动态变化 外周血单个核细胞(来自1名正常个体和4名接受肝移植及免疫抑制治疗2个月、1年、3年和7年的患者) 单细胞转录组学 肝移植 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 5例外周血样本,共获得17,462个外周血单个核细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
75 2026-10-18
Estradiol Augments Tumor-Induced Neutrophil Production to Promote Tumor Cell Actions in Lymphangioleiomyomatosis Models
2023-04-17, Endocrinology IF:3.8Q2
研究论文 该文章探讨了雌二醇通过促进中性粒细胞生成来促进淋巴管肌瘤病(LAM)肿瘤生长的机制 揭示了雌二醇和肿瘤因子通过正反馈环路诱导中性粒细胞扩增,进而促进TSC2缺失肿瘤生长的机制,并建立了新型TSC2缺失小鼠子宫肌层细胞系 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类LAM患者的单细胞RNA测序数据仅用于验证,未进行临床干预实验 探究雌二醇在LAM肿瘤进展中的作用机制,特别是其与中性粒细胞生成的关联 LAM小鼠模型、TSC2缺失细胞系、LAM患者单细胞RNA测序数据 肿瘤生物学、免疫学 淋巴管肌瘤病 单细胞RNA测序 NA 文本(单细胞RNA测序数据)、实验数据 未明确说明(包括小鼠模型和患者样本) NA 单细胞RNA测序 NA NA
76 2026-10-17
Leveraging Single-Cell RNA Sequencing to Characterize Murine Ewing Sarcoma Xenografts
2027, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究方法论文 本文描述了一种从尤文肉瘤肿瘤中分离、冷冻保存和处理单细胞悬液的稳健且可重复的实验方案,并配套了生物信息学分析流程 采用冷活性地衣芽孢杆菌蛋白酶消化策略结合温和机械解离,在严格冷链条件下处理组织,减少细胞应激和转录扰动;计算流程整合了ambient RNA校正、doublet检测、SCTransform标准化以及AUCell模块评分与多参考Azimuth标签转移 该方案主要针对小鼠尤文肉瘤异种移植模型进行优化,尚未在人类原发肿瘤或其他肉瘤亚型中广泛验证 建立标准化的尤文肉瘤单细胞RNA测序组织处理和计算分析工作流程 小鼠尤文肉瘤异种移植肿瘤组织 单细胞组学 尤文肉瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
77 2026-10-17
Spatial Transcriptomics Analysis of Ewing Sarcoma
2027, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
综述 本文介绍了尤文肉瘤空间转录组学分析中组织选择、样本制备、panel设计及分析流程的系列教程 为尤文肉瘤空间转录组学研究提供系统性的操作指南,涵盖从组织选择到数据分析的全流程 作为教程章节,可能缺乏原始实验数据验证,且未涉及具体实验结果的深入讨论 指导尤文肉瘤空间转录组学实验的设计与数据分析 尤文肉瘤肿瘤组织及其肿瘤微环境 空间转录组学 尤文肉瘤 空间转录组学 NA 图像,文本 NA NA 空间转录组学 NA NA
78 2026-10-17
FOXG1 spatiotemporally orchestrates subtype fate specification and patch/matrix identity of striatal spiny projection neurons
2026-Oct-20, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和功能缺失实验,揭示了转录因子FOXG1在纹状体棘突投射神经元亚型命运特化及 patch/matrix 区域身份决定中的时空调控作用 首次发现eSPNs与iSPNs在发育上更为相似,并证明FOXG1在侧神经节隆起腹侧区域促进dSPN和iSPN命运而抑制eSPN命运;同时揭示FOXG1通过直接调控细胞迁移和黏附相关分子控制SPN迁移,从而影响patch/matrix身份 摘要中未明确说明研究的局限性 阐明纹状体棘突投射神经元亚型特化(尤其是eSPNs)以及patch/matrix互补模式形成的细胞和分子机制 纹状体棘突投射神经元(SPNs),包括dSPNs、iSPNs和eSPNs 机器学习 NA 单细胞RNA测序 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
79 2026-10-17
Distinguishing the endotypes of Chronic rhinosinusitis: the emerging roles of macrophages
2026-Oct-16, Expert review of clinical immunology IF:3.9Q2
综述 本文综述了巨噬细胞在慢性鼻窦炎不同内型中的异质性及其作用 系统总结了单细胞转录组分析鉴定的与慢性鼻窦炎内型相关的巨噬细胞亚群,并提出了基于巨噬细胞的生物标志物用于内型分型和靶向治疗的新视角 未明确说明,但作为综述可能缺乏原始实验数据验证 剖析巨噬细胞在慢性鼻窦炎不同内型中的异质性,并探讨其作为生物标志物和靶向治疗靶点的潜力 慢性鼻窦炎患者及相关的巨噬细胞 单细胞转录组学、免疫学 慢性鼻窦炎 单细胞转录组分析 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
80 2026-10-17
Biased signaling of endothelial GPCRs as a therapeutic frontier in atherosclerosis
2026-Oct-15, Journal of receptor and signal transduction research
综述 本文综述了内皮GPCR偏向性信号作为动脉粥样硬化治疗前沿的研究进展,探讨了主要内皮GPCR家族的功能选择性机制及新兴转化工具 提出将内皮靶向的偏向性GPCR信号工程化作为精准、通路特异性的策略来阻止斑块进展和稳定易损病变,并强调高分辨率结构生物学、单细胞转录组学、空间组学和动态生物工程模型作为新兴转化工具指导未来药物发现 未涉及具体临床试验数据或药物开发验证,主要基于机制综述和理论探讨 探讨内皮GPCR偏向性信号在动脉粥样硬化治疗中的应用潜力,分析功能选择性机制并展望未来精准心血管药物发现方向 内皮GPCR家族(包括血管紧张素II受体、1-磷酸鞘氨醇受体、非典型趋化因子受体和β-肾上腺素能受体)及动脉粥样硬化 机器学习 心血管疾病 NA NA 文本 NA NA 单细胞转录组学, 空间组学 NA NA
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