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当前共找到 44270 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-10-16 |
Resveratrol alleviates intervertebral disc degeneration by regulating ferroptosis of nucleus pulposus cells
2026-Jun-22, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00761-9
PMID:42331862
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研究论文 | 本研究通过批量转录组和单细胞转录组分析，揭示铁死亡在椎间盘退变中的作用，并验证白藜芦醇通过调控髓核细胞铁死亡缓解椎间盘退变 | 首次系统探索铁死亡在椎间盘退变中的作用，结合批量转录组、单细胞转录组和高维加权基因共表达网络分析，发现白藜芦醇通过调控髓核细胞铁死亡相关枢纽基因缓解椎间盘退变 | 摘要中未提及具体研究局限性 | 探索铁死亡在椎间盘退变中的分子机制，并评估白藜芦醇靶向髓核细胞铁死亡的治疗潜力 | 椎间盘退变患者临床样本、髓核细胞模型及动物实验 | 机器学习 | 椎间盘退变 | 批量转录组测序，单细胞转录组测序 | 高维加权基因共表达网络分析 | 文本，图像 | NA | NA | 批量RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 62 | 2026-10-16 |
The Logic of Thalamic Inputs onto the Molecular Taxonomy of Cortical Neurons Reveals a Visual Hierarchy
2026-Jun-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.12.731929
PMID:42327034
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研究论文 | 该研究结合顺行跨突触示踪与空间转录组学，揭示了小鼠视觉皮层中丘脑输入如何映射到皮层神经元的分子分类上，并建立了视觉层级结构 | 首次将顺行跨突触示踪与空间转录组学结合，揭示了丘脑不同输入靶向特定分子定义的皮层神经元集合，形成由细胞类型组成及GABA能/谷氨酸能神经元比例定义的“自下而上”或“自上而下”特征，并发现这些特征揭示了跨越丘脑核团和视觉皮层的层级结构 | 研究仅在小鼠视觉皮层中进行，未验证其他感觉皮层或非哺乳动物物种的普适性；未阐明丘脑输入与皮层分子分类之间的具体分子机制 | 理解丘脑自下而上和自上而下的投射如何映射到皮层细胞分类上，并建立皮层层级结构的细胞框架 | 小鼠视觉皮层神经元及丘脑核团 | 空间转录组学 | NA | 顺行跨突触示踪、空间转录组学 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 63 | 2026-10-16 |
A multi-omics map of diabetic nephropathy reveals c-Jun as a driver of tubular injury and metabolic stress
2026-Jun-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.09.731164
PMID:42327115
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研究论文 | 该研究通过整合单细胞多重蛋白成像、空间转录组学、单核和单细胞RNA测序以及染色质可及性分析，全面表征了人类糖尿病肾病的病理特征，并发现c-Jun是肾小管损伤和代谢应激的关键驱动因子 | 首次整合单细胞多重蛋白成像、空间转录组学、单核和单细胞RNA测序及染色质可及性分析等多种技术全面解析糖尿病肾病的分子机制；鉴定出八个定义免疫纤维化微环境的细胞邻域；发现c-Jun是肾小管损伤和纤维化重塑中转录重编程的核心调控因子；通过可诱导的c-Jun小鼠模型证明肾小管特异性c-Jun激活足以诱导肾小管损伤、慢性炎症、进行性纤维化和全身代谢改变 | 未明确提及研究的局限性 | 全面表征人类糖尿病肾病的病理特征，揭示驱动肾小管损伤和纤维化的分子机制 | 人类糖尿病肾病肾脏组织样本及糖尿病小鼠模型 | 空间转录组学, 单细胞组学, 多组学 | 糖尿病肾病 | 单细胞多重蛋白成像, 空间转录组学, 单核RNA测序, 单细胞RNA测序, 染色质可及性分析 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多重蛋白成像, 染色质可及性分析 | NA | NA |
| 64 | 2026-10-16 |
Conserved Cell Type Signatures Across the Brainstem and Spinal Cord in the Mouse Central Nervous System
2026-Jun-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.09.728039
PMID:42327133
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研究论文 | 该研究整合单核多组学测序、空间转录组学和计算分析，绘制了成年小鼠脑干和脊髓中保守的细胞类型特征图。 | 揭示了脑干-脊髓边界处保守的细胞生态位，发现细胞类型身份与位置身份在很大程度上正交，且不同神经元类别受区域位置影响程度不同。 | 研究仅基于成年小鼠，未涵盖发育阶段或其他物种，可能限制结论的普适性。 | 理解中枢神经系统中细胞类型如何跨区域组织，并揭示脑干和脊髓共享的分子结构。 | 成年小鼠的脑干和脊髓 | 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | 单核Multiome测序（RNA+ATAC）, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据, 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞多组学, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | NA |
| 65 | 2026-10-16 |
A method utilizing chemical carcinogens and a Western diet to reliably induce advanced hepatocellular carcinoma in male and female mice
2026-Jun-09, Cancer & metabolism
IF:6.0Q1
DOI:10.1186/s40170-026-00441-6
PMID:42265746
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研究论文 | 本研究开发了一种利用化学致癌物和西方饮食在雄性和雌性小鼠中可靠诱导晚期肝细胞癌的方法 | 提出了一种简单、可耐受且可靠的方法，能够在雄性和雌性小鼠中均以高发生率诱导晚期肝细胞癌，克服了以往模型雌性小鼠HCC发生率低和HCC分期差异大的问题 | 研究未明确提及具体局限性，但方法依赖于30周的时间周期，且仅在小鼠模型中进行验证 | 创建一种简单、可耐受且可靠的方法，利用化学致癌物和西方饮食在雄性和雌性小鼠中诱导晚期肝细胞癌 | 雄性和雌性小鼠 | 肿瘤生物学 | 肝癌 | 空间转录组学、蛋白质组学、Western blotting | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | 雄性和雌性小鼠，30周龄时100%雄性小鼠和96%雌性小鼠发展为2-3期HCC（4%为1期HCC） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 66 | 2026-10-16 |
Transcription factor 21 deletion from podocyte precursors as a model for congenital nephrotic syndrome
2026-06-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00490.2025
PMID:42090190
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研究论文 | 本文通过从小鼠足细胞前体细胞中敲除转录因子21（TCF21），构建了先天性肾病综合征小鼠模型，并利用单细胞RNA测序分析了肾脏的转录组变化 | 首次报道了从足细胞前体细胞中敲除TCF21导致出生后进展性肾病综合征的小鼠模型，并生成了该模型的全面肾脏单细胞转录组数据集，揭示了TCF21在足细胞健康和发育中的作用以及肾小管间质对大量蛋白尿的响应机制 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 构建先天性肾病综合征小鼠模型，并研究TCF21缺失对肾脏发育和损伤的影响机制 | 小鼠肾脏（足细胞、壁上皮细胞、成纤维细胞、亨利氏环细胞） | 单细胞转录组学 | 肾病综合征 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 67 | 2026-10-16 |
Decoding Multicellular Communication Motifs from Spatial Transcriptomics with ALARMIST
2026-Jun-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.21.726986
PMID:42244777
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研究论文 | 开发了一个概率框架ALARMIST，从空间转录组学数据中推断可解释的多细胞通讯模式，即基序，并应用于肺腺癌和胶质母细胞瘤数据集 | 首次提出从空间转录组学数据中解码多细胞通讯基序的概率框架，能够识别涉及多种细胞类型和配体-受体相互作用的重复通讯子网络，并估计每个基序对活跃细胞的下游表型效应，超越了现有仅考虑单个配体-受体相互作用的方法 | 论文摘要中未明确提及研究的局限性 | 识别肿瘤进展的微环境驱动因素，通过空间转录组学数据推断多细胞通讯模式 | 肺腺癌（LUAD）、原位腺癌（AIS）和胶质母细胞瘤（GBM）的空间转录组学数据集 | 空间转录组学, 计算生物学 | 肺癌, 脑癌 | 空间转录组学 | 概率框架 | 空间转录组学数据 | 配对LUAD和AIS样本，以及匹配的低级别和高级别胶质瘤样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 68 | 2026-10-16 |
The role of the RS1-NEDD4-YAP1 axis orchestrates epithelial-macrophage interplay in COPD
2026-May-22, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-026-03735-x
PMID:42169001
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研究论文 | 该研究整合单细胞转录组学、条件性基因敲除小鼠模型、类器官培养、多重免疫荧光和流式细胞术，揭示了RS1-NEDD4-YAP1轴在COPD中调控上皮细胞-巨噬细胞相互作用的机制 | 首次发现RS1是AT2细胞的标志基因，揭示了RS1通过丝氨酸105介导NEDD4与YAP1的相互作用，促进YAP1去磷酸化和核转位，从而调控AT2细胞增殖能力和巨噬细胞浸润，并发现选择性NEDD4抑制剂I3C可抑制TGFB1表达和巨噬细胞浸润 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 探究RS1基因在慢性阻塞性肺疾病（COPD）中的作用及其调控AT2细胞和巨噬细胞相互作用的分子机制 | COPD小鼠模型中的肺泡II型上皮细胞（AT2细胞）、巨噬细胞及类器官 | 单细胞组学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞转录组学、条件性基因敲除、类器官培养、多重免疫荧光、流式细胞术 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 69 | 2026-10-16 |
PSGRN: Gene regulatory network inference from single-cell perturbational data through self-training with synthetic gold standards
2026-May, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aeb3376
PMID:42054465
|
研究论文 | 提出PSGRN方法，通过自训练框架结合合成金标准，从单细胞扰动数据中推断基因调控网络 | 整合干预性和观察性单细胞RNA测序数据，采用自训练框架和合成金标准，在CausalBench挑战中表现最佳 | 未明确提及 | 从单细胞扰动数据中推断基因调控网络 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 八个数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 70 | 2026-10-16 |
Immune modulation promotes heart regeneration through macrophage and Granulin functions in medaka
2026-Apr-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2524705123
PMID:41980096
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研究论文 | 该研究通过bulk和单细胞转录组学结合功能实验，揭示了poly I:C免疫刺激通过促进巨噬细胞功能和Granulin表达来加速青鳉心脏再生的机制 | 首次在非再生性青鳉模型中证明TLR3激动剂poly I:C可通过重塑巨噬细胞功能状态和上调Granulin表达来促进心脏再生，并鉴定出与再生相关的巨噬细胞亚群及其空间分布特征 | 研究主要基于青鳉模型，其在进化上与哺乳动物存在差异，结论向哺乳动物特别是人类的转化仍需进一步验证；对Granulin下游信号通路的具体分子机制尚未完全阐明 | 探究免疫调节如何影响心脏修复过程，明确与心脏再生相关的免疫程序及巨噬细胞功能状态 | 青鳉（medaka）心脏损伤模型中的巨噬细胞和心肌细胞 | 单细胞转录组学, 免疫学, 再生医学 | 心血管疾病, 心肌梗死 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 杂交链式反应（HCR）空间分析, 功能实验 | NA | 转录组数据, 图像 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 71 | 2026-10-16 |
Single-cell profiling reveals that dynamic lung immune responses distinguish protection from susceptibility to tuberculosis
2026-04, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013635
PMID:42044120
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研究论文 | 该研究通过对气溶胶结核分枝杆菌感染后的小鼠肺部免疫细胞进行单细胞RNA测序，揭示了保护性免疫与易感性之间的动态免疫应答差异 | 在不同时间点、小鼠品系和结核分枝杆菌菌株背景下进行单细胞RNA测序，发现保护性免疫与免疫激活的时间动态和协调性相关，而非单一应答的强度；并发现与静脉BCG疫苗接种的非人灵长类动物转录特征重叠 | 研究基于小鼠模型，其结果向人类结核病免疫的转化仍需进一步验证 | 识别与结核分枝杆菌保护性免疫相关的免疫相关性因素 | naïve小鼠和已控制Mtb感染的小鼠（CoMtb，自然获得性抵抗模型）的肺部免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 72 | 2026-10-16 |
Limited protection against early-life lung murine cytomegalovirus infection results from deficiency of cytotoxic CD8 T cells
2026-Apr, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1014150
PMID:42008567
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研究论文 | 该研究通过呼吸道小鼠巨细胞病毒感染模型和过继性T细胞转移，揭示了生命早期细胞毒性CD8 T细胞缺陷导致对肺部MCMV感染保护有限 | 首次结合单细胞RNA测序和过继性T细胞转移模型，系统阐明生命早期CD8 T细胞启动缺陷是导致肺部MCMV疾病高风险的关键因素，并发现补充关键细胞因子可增强过继转移成年T细胞的感染控制能力 | 研究基于小鼠模型，结论是否适用于人类CMV感染仍需进一步验证；未明确具体哪些细胞因子补充最为关键及其最佳给药方案 | 阐明生命早期抗病毒T细胞免疫差异影响CMV感染临床结局的潜在机制 | 新生小鼠和成年小鼠的MCMV特异性T细胞及过继转移T细胞 | 免疫学 | 巨细胞病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 73 | 2026-10-16 |
Single-cell profiling of HDAC inhibitor-induced EBV lytic heterogeneity defines abortive and refractory states in B lymphoblasts
2026-03, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013610
PMID:41871169
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了HDAC抑制剂诱导EBV阳性B淋巴母细胞中裂解重激活的异质性，发现流产裂解细胞上调NF-κB和CD137信号通路 | 首次在单细胞水平上定义了HDAC抑制剂诱导的EBV裂解重激活的流产和难治状态，并发现CD137/CD137L信号轴在阻止成功裂解重激活中的作用 | 研究仅对四种EBV阳性细胞系中的一个（P3HR1-ZHT BL）进行了单细胞RNA测序，可能无法完全代表其他细胞系的异质性 | 表征HDAC抑制剂对EBV阳性细胞系生长、生存和裂解重激活的影响，并阐明宿主因素在阻止成功裂解重激活中的潜在作用 | 四种EBV阳性细胞系：P3HR1-ZHT BL、Jijoye BL、IBL-1免疫母细胞淋巴瘤和从头感染衍生的淋巴母细胞样细胞系（LCL） | 单细胞转录组学 | 伯基特淋巴瘤、霍奇金淋巴瘤、鼻咽癌、胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 四种EBV阳性细胞系（P3HR1-ZHT BL、Jijoye BL、IBL-1、LCL），其中P3HR1-ZHT BL细胞系进行了单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 74 | 2026-10-16 |
Spatial transcriptomics reveals the mechanistic role of lactate metabolism in the pancreatic ductal adenocarcinoma microenvironment
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1743187
PMID:41766855
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研究论文 | 本研究利用高通量转录组测序和单细胞转录组分析，结合空间转录组学，揭示了乳酸代谢在胰腺导管腺癌肿瘤微环境中的机制作用，并构建了基于机器学习的预后模型。 | 结合高通量转录组测序、单细胞转录组分析和空间转录组学，系统解析了乳酸代谢在胰腺导管腺癌肿瘤微环境中的作用，并利用集成机器学习（StepCox + Enet）构建了乳酸代谢相关基因的预后模型，鉴定了LYZ和PIGR等关键预后基因。 | 摘要中未明确提及研究局限性。 | 探究乳酸代谢在胰腺导管腺癌及其肿瘤微环境中的作用，并建立预后模型以识别用于早期诊断和个性化治疗的乳酸代谢生物标志物。 | 胰腺导管腺癌（PDAC）患者样本中的肿瘤细胞及其微环境。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 高通量转录组测序, 单细胞转录组分析, 空间转录组学 | 集成机器学习（StepCox + Enet） | 图像, 文本 | 92例PDAC患者（ICGC队列）；8例PDAC样本中50,795个细胞；GSE28735队列45例；GSE62452队列69例；GSE183795队列139例 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 75 | 2026-10-16 |
Single-cell transcriptomics of bronchoalveolar lavage reveals divergent macrophage subpopulations and trajectories in interstitial lung disease
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0347852
PMID:42054404
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研究论文 | 该文章通过单细胞RNA测序技术对24名不同类型间质性肺病患者的支气管肺泡灌洗液样本进行分析，揭示了不同疾病亚型中巨噬细胞亚群的差异及其与端粒长度和疾病遗传数据的关联 | 首次在单细胞分辨率下系统表征了不同间质性肺病亚型支气管肺泡灌洗液中的免疫细胞群体，发现了六种单核细胞样巨噬细胞亚簇及其分化轨迹，并揭示了短端粒患者中促纤维化SPP1hi巨噬细胞亚群的扩增趋势 | 样本量相对较小且仅包含男性患者，研究结果可能无法推广到女性人群，且未进行功能验证实验 | 表征不同间质性肺病患者支气管肺泡灌洗液中的免疫细胞群体，并研究外周血白细胞端粒缩短对BAL免疫谱的影响 | 24名患有不同类型间质性肺病的男性患者的支气管肺泡灌洗液样本 | 数字病理学 | 间质性肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 24名男性患者的支气管肺泡灌洗液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 76 | 2026-10-16 |
Effects of esketamine on electrophysiology and metabolic reprogramming in brain organoids: insights into antidepressant mechanisms
2025-12, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-025-03198-4
PMID:40885845
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研究论文 | 本研究利用健康对照者和抑郁症患者iPSC来源的脑类器官，探究艾司氯胺酮对电生理和代谢重编程的影响及其抗抑郁机制 | 首次在抑郁症患者来源的脑类器官中系统研究艾司氯胺酮对电生理和代谢重编程的浓度和时间依赖性效应，揭示了艾司氯胺酮可能通过能量代谢途径调控NMDAR活性和电生理的新机制 | 摘要中未明确提及研究的具体局限性 | 探究艾司氯胺酮对脑类器官电生理和代谢的影响，揭示其抗抑郁的潜在药理机制 | 健康对照者和抑郁症患者iPSC来源的脑类器官 | 机器学习 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序 | NA | 电生理信号, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 77 | 2026-10-16 |
Probiotics derived sodium benzoate improves social behavior of offspring exposed in the maternal immune activation through regulation of histone lysine benzoylation in astrocytes
2025-12, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-025-03164-0
PMID:40855005
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研究论文 | 该研究发现自闭症儿童中乳杆菌属耗竭与社交缺陷相关，并在母体免疫激活（MIA）诱导的自闭症小鼠模型中证明植物乳杆菌及其衍生苯甲酸钠（NaB）可通过调节星形胶质细胞组蛋白赖氨酸苯甲酰化改善社交行为 | 首次揭示益生菌来源的苯甲酸钠通过促进星形胶质细胞中Cxcl16基因增强子区域H3K27苯甲酰化来恢复自闭症小鼠的社交记忆，阐明了微生物-肠-脑轴中的新型表观遗传机制 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究微生物-肠-脑轴在自闭症谱系障碍中的因果微生物介质及分子机制，并寻找潜在治疗靶点 | 自闭症儿童队列及MIA诱导的自闭症小鼠模型 | 机器学习 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序，RNA-seq，Cut & Tag | NA | 文本，图像 | 未明确说明具体样本量 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 78 | 2026-10-16 |
Dual-modality Molecular Cartography: Integrating Multiplex mRNA Detection with Protein Imaging Mass Cytometry
2025-11-14, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/68616
PMID:41325369
|
研究方法 | 该文提出了一种将多重mRNA原位杂交与蛋白质成像质谱流式（IMC）整合在同一组织切片上的双模态分子制图方案，以实现空间分辨的mRNA与蛋白质联合检测 | 在同一组织切片上将金属探针介导的mRNA原位杂交与蛋白质成像质谱流式相结合，实现双模态检测；避免荧光光谱溢出和组织自发荧光问题，减少补偿与后处理需求；可检测分泌蛋白或难以用抗体量化的标志物 | 该方案聚焦于蛋白质与少数mRNA的整合，mRNA多重检测能力相对有限；未明确说明通量、样本规模及具体验证结果 | 建立整合蛋白质成像质谱流式与mRNA原位杂交的双模态空间分子检测方法，用于解析细胞在微环境中的通讯与状态 | 同一组织切片中的空间分辨mRNA与蛋白质 | 空间多组学 | NA | 成像质谱流式（IMC）、mRNA原位杂交（ISH）、金属探针检测 | NA | 图像 | NA | Fluidigm | 空间转录组学、空间蛋白质组学 | 成像质谱流式（IMC） | 基于金属探针的蛋白质成像质谱流式与金属探针mRNA原位杂交在同一组织切片上整合 |
| 79 | 2026-10-16 |
Single-cell transcriptomics reveals Sox6 positive interneurons enriched in the prefrontal cortex of female mice vulnerable to chronic social stress
2025-11, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-025-03088-9
PMID:40581656
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研究论文 | 本研究利用慢性社会挫败应激模型结合单核RNA测序技术，揭示了雌性小鼠前额叶皮层中Sox6阳性中间神经元的富集及其与抑郁样行为的关系 | 首次在雌性小鼠慢性社会挫败应激模型中揭示Sox6阳性中间神经元在易感组中富集，并发现其与炎症、免疫反应、突触功能和线粒体通路改变相关，同时通过特定敲低Sox6验证了其在抑郁样行为中的因果作用 | 研究仅基于雌性小鼠模型，未涉及雄性比较；样本量未明确说明；仅聚焦前额叶皮层，未考察其他脑区 | 探究雌性小鼠前额叶皮层中与抑郁样行为相关的细胞和分子变化，揭示重性抑郁障碍的神经生物学基础 | 雌性小鼠前额叶皮层 | 机器学习 | 重性抑郁障碍 | 单核RNA测序 | WGCNA | 文本 | NA | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 80 | 2026-10-16 |
Comprehensive Spatial Profiling of Species-agnostic Transcriptomes via Stereo-seq
2025-10-31, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/68619
PMID:41248068
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研究方法论文 | 本文介绍了使用Stereo-seq对FFPE组织进行物种无关转录组空间 profiling 的逐步操作流程，包括组织切片、文库制备及随机引物探针方法 | 采用随机引物探针方法实现物种无关的RNA检测，可同时捕获宿主和非宿主RNA（包括微生物、病毒和真菌RNA），而传统空间转录组方法仅能捕获mRNA或物种特异性转录本 | 需要特殊考虑以区分组织内RNA与收集、保存、切片和检测过程中沉积的环境及操作污染物 | 建立一种基于Stereo-seq的物种无关空间转录组检测流程，实现FFPE组织中多物种RNA的亚细胞分辨率空间检测 | FFPE组织样本中的宿主及非宿主RNA（包括长链非编码RNA、线粒体RNA、microRNA、微生物RNA、病毒RNA和真菌RNA） | 空间转录组学 | NA | Stereo-seq、空间转录组测序、随机引物探针方法 | NA | 空间转录组数据、图像 | NA | BGI | 空间转录组学 | Stereo-seq | Stereo-seq随机捕获珠尺寸为0.22 µm，以0.5 µm间隔在阵列中重复排列，实现基于测序技术的亚细胞分辨率 |