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当前共找到 41190 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-07-03 |
Glutathione metabolism-linked ferroptosis in human seminoma: a spatial multi-omics mapping study
2026-Jun-29, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2026.104284
PMID:42385389
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研究论文 | 对精原细胞瘤进行空间多组学分析，揭示谷胱甘肽代谢与铁死亡之间的关联 | 首次通过整合空间转录组学和空间代谢组学技术，在组织原位揭示精原细胞瘤中谷胱甘肽代谢重编程及其与铁死亡的关键调控关系 | 样本量有限（仅4例患者），且功能验证仅限于TCam-2细胞系和异种移植小鼠模型 | 阐明精原细胞瘤的分子机制，探索靶向谷胱甘肽代谢或铁死亡的新型治疗策略 | 精原细胞瘤患者的肿瘤组织以及TCam-2细胞系和异种移植小鼠模型 | 数字病理学 | 睾丸癌（精原细胞瘤） | 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | 基因表达数据, 代谢物数据 | 4例患者的精原细胞瘤新鲜冷冻组织 | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 62 | 2026-07-03 |
Unveiling tumor heterogeneity by single cell RNA-sequencing: From basic considerations to clinical applications
2026-Jun-28, Seminars in cancer biology
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.semcancer.2026.06.005
PMID:42365863
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在解析肿瘤异质性方面的技术基础、平台演变及临床应用，并强调了其在肺癌研究中的具体进展 | 系统梳理了scRNA-seq从基础考量到临床应用的完整路径，并结合机器学习方法加速生物标志物发现和个体化治疗预测 | 成本高、可扩展性有限，且在常规临床应用前需严格验证 | 探讨scRNA-seq在解析肿瘤异质性并推动精准医学中的潜力 | 肺癌中的肿瘤细胞、免疫微环境及治疗耐药机制 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 深度学习分类器、图模型 | 单细胞转录组数据 | 约380项已完成或正在进行的研究（来自ClinicalTrials.gov） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 从手动显微操作到高通量系统 |
| 63 | 2026-07-03 |
Single-cell transcriptomic profiling identifies TIMP1 as a diagnostic marker linked to macrophage ferroptosis in ulcerative colitis
2026-Jun-28, Tissue & cell
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.tice.2026.103743
PMID:42385606
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析，鉴定TIMP1为溃疡性结肠炎中与巨噬细胞铁死亡相关的诊断标志物 | 首次在溃疡性结肠炎小鼠模型中揭示巨噬细胞铁死亡的发生，并发现TIMP1作为关键诊断标志物与免疫浸润和NOD样受体信号通路相关 | 研究仅基于小鼠模型和体外实验，临床验证和人类样本的确认仍需进一步研究 | 探讨溃疡性结肠炎中巨噬细胞铁死亡的特征，并评估TIMP1在诊断和治疗中的潜在价值 | 溃疡性结肠炎小鼠模型中的结肠巨噬细胞及原代巨噬细胞 | 机器学习和生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | DSS诱导的溃疡性结肠炎小鼠模型，具体样本数量未说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 64 | 2026-07-03 |
Integrative transcriptomic and CRISPR dependency analysis identifies hepatoblastoma-specific essential genes and actionable vulnerabilities
2026-Jun-24, Cancer genetics
IF:1.4Q4
DOI:10.1016/j.cancergen.2026.06.008
PMID:42385356
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研究论文 | 整合转录组学和CRISPR依赖性分析，识别肝母细胞瘤特异性必需基因和可利用的药物靶点 | 首次结合转录组分析、CRISPR依赖性图谱、机器学习及药物基因组学注释，系统识别肝母细胞瘤特异性必需基因和预测性分子标志物 | 未提及潜在限制 | 识别肝母细胞瘤特异性必需基因和可利用的药物脆弱性 | 肝母细胞瘤肿瘤样本与正常肝组织 | 机器学习 | 肝母细胞瘤 | CRISPR-Cas9, RNA-seq | 弹性网络回归, 深度学习分类器 | 转录组数据, 单细胞RNA-seq数据, CRISPR依赖性数据 | 训练队列和外部队列，具体样本数量未提及 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 65 | 2026-07-03 |
Heterogeneous expression patterns of the T2D-associated kinesin-4 KIF21A in pancreatic islet endocrine cells
2026-Jun-23, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2026.102408
PMID:42336059
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研究论文 | 研究T2D相关驱动蛋白KIF21A在胰岛内分泌细胞中的异质性表达模式 | 首次揭示KIF21A在胰岛内分泌细胞中的细胞类型特异性异质性表达，并发现其在血管取向分泌热点（玫瑰花结和层粘连蛋白富集界面）的空间富集 | NA | 探索KIF21A在胰岛内分泌细胞中的表达模式及其与2型糖尿病的潜在关联 | 人类和小鼠胰岛内分泌细胞（包括β细胞、α细胞、δ细胞） | 机器学习和数字病理学 | 2型糖尿病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 免疫荧光, 超分辨率显微镜, 定量蛋白质组学 | NA | 转录组和蛋白质组数据以及图像 | 人类胰岛（T2D组和对照组）和小鼠胰岛 | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | NA |
| 66 | 2026-07-03 |
Targeting a Myeloid-Regulatory B Cell Network Reverses Immune Paralysis in Periprosthetic Joint Infections
2026-Jun-22, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.76149
PMID:42325123
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示假体周围关节感染中骨髓调节性B细胞网络，并发现阿仑膦酸钠可逆转免疫麻痹 | 首次鉴定出高表达CXCR4的多形核骨髓源性抑制细胞（PMN-MDSC）与AHR和TIM1调节性B细胞（Breg）相互作用形成免疫抑制轴，并筛选出阿仑膦酸钠作为特异性抑制剂通过STAT3途径发挥作用 | 主要基于小鼠模型，需要进一步在人体中验证该免疫抑制网络和治疗策略的临床转化潜力 | 探索可逆转假体周围关节感染中免疫麻痹的免疫调节策略 | 假体周围关节感染小鼠模型中的骨髓源性抑制细胞和调节性B细胞 | 机器学习 | 骨关节感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型样本，具体数量未明确 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 67 | 2026-07-03 |
Establishment and validation of the NEX-RiboTag system for profiling the excitatory neuronal translatome in the postnatal mouse forebrain
2026-Jun-21, Neuroscience
IF:2.9Q2
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研究论文 | 建立并验证了一种名为NEX-RiboTag的小鼠系统，用于特异性分析出生后小鼠前脑中兴奋性神经元的翻译组 | 首次通过Neurod6-Cre与RiboTag报告小鼠的杂交，实现了对皮层和海马兴奋性神经元核糖体相关mRNA的靶向分析，填补了转录组与细胞类型特异性翻译输出之间的空白 | 该研究仅针对出生后1周的小鼠，未涵盖其他发育阶段；技术依赖于小鼠模型，可能不完全适用于其他物种；翻译组的分析局限于核糖体相关mRNA，未能直接检测蛋白质水平 | 建立一种能够特异性捕获兴奋性神经元翻译组的方法，以研究出生后神经元成熟和突触形成的分子调控机制 | 出生后1周小鼠皮层和海马的兴奋性神经元 | 分子生物学 | NA | RNA-seq, 核糖体相关mRNA捕获(RiboTag) | NA | 序列数据(RNA-seq) | 小鼠模型（具体数量未在摘要中提及） | Illumina | bulk RNA-seq | Illumina NovaSeq | 通过RiboTag免疫沉淀核糖体相关mRNA后进行RNA-seq |
| 68 | 2026-07-03 |
PD-1 H (VISTA) drives immunosuppressive reprogramming of glioma-associated myeloid cells to promote glioma progression
2026-Jun-21, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08497-0
PMID:42324467
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研究论文 | 该研究揭示了PD-1 H（VISTA）作为髓系限制性免疫检查点，驱动胶质瘤相关髓系细胞的免疫抑制重编程，促进胶质瘤进展 | 首次系统研究了PD-1 H在胶质瘤相关髓系细胞中的功能角色，发现其通过AKT/NF-κB通路驱动髓系细胞免疫抑制重编程，并验证了靶向PD-1 H的免疫治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型和临床样本分析，PD-1 H阻断在人体中的治疗效果和潜在副作用仍需进一步验证 | 探究PD-1 H在胶质瘤相关髓系细胞中的功能及其对胶质瘤进展的影响 | 人胶质瘤组织、胶质瘤相关髓系细胞（包括小胶质细胞和浸润巨噬细胞）、CD8+ T细胞 | 机器学习 | 胶质瘤 | NA | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 人类胶质瘤临床队列样本、原位胶质瘤小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 69 | 2026-07-03 |
Inferring cell-specific gene regulatory networks based on causal graph embedding
2026-Jun-15, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101423
PMID:42061403
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研究论文 | 提出一种基于因果图嵌入的监督计算框架CSGRN，从单细胞RNA测序数据中推断细胞特异性基因调控网络 | 将图嵌入与条件细胞特异性网络相结合，整合因果调控结构及局部与全局表征，提升调控网络推断的准确性和鲁棒性 | 未提及局限性 | 开发能从单细胞RNA测序数据中推断细胞特异性基因调控网络的监督计算方法 | 单个细胞的基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图嵌入模型 | 基因表达数据 | 三个数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 70 | 2026-07-03 |
scParadise: tunable, highly accurate multi-level cell type annotation, unknown cell type identification, and modality imputation
2026-Jun-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag612
PMID:42312491
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研究论文 | 提出scParadise工具套件，用于单细胞RNA测序数据的多水平细胞类型注释、未知细胞类型识别和跨组织模态数据填补 | scParadise整合三个独立工具（scAdam、scEve、scNoah），实现高精度的多水平细胞注释、未知细胞类型检测及跨组织蛋白质表达填补，并在人类内脏脂肪组织中鉴定出三种新的自然杀伤T细胞亚群 | 基于标题和摘要未提及明显的局限性 | 解决单细胞RNA测序数据稀疏性和异质性带来的细胞类型注释、多组学状态解释及可重复结论的挑战 | Tabula Muris Senis图谱以及人类内脏脂肪组织样本 | 机器学习 | 肥胖相关慢性炎症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包含Tabula Muris Senis图谱数据及人类内脏脂肪组织样本（具体样本量未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 71 | 2026-07-03 |
An artificial intelligence optimized hepatic differentiation unveils NR5A2 and AP-1 transcriptional regulation in hepatic maturation
2026-Jun, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2026.111435
PMID:41962865
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研究论文 | 利用机器学习人工智能工具优化肝细胞分化方案，发现NR5A2和AP-1在肝细胞成熟中的转录调控机制 | 开发基于机器学习的人工智能工具，利用肝祖细胞明场图像优化肝分化方案，无需免疫染色或谱系追踪，结合转录组和表观基因组分析揭示NR5A2和AP-1的关键调控作用 | 未明确说明 | 提高肝分化成功率并解析肝细胞成熟的基因调控机制 | 人多能干细胞衍生的肝祖细胞和肝细胞样细胞 | 机器学习 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序、转录组分析、表观基因组分析 | 机器学习模型 | 明场图像 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 72 | 2026-07-03 |
Spermidine Mitigates Immune Cell Senescence and Boosts Vaccine Responses in Healthy Older Adults-A Pilot Study
2026-06, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70545
PMID:42169618
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研究论文 | 一项随机双盲安慰剂对照试验，评估亚精胺对健康老年人免疫细胞衰老和疫苗应答的影响 | 首次在老年人临床试验中证明亚精胺可通过增强自噬改善疫苗无应答者的免疫反应，并鉴定出免疫衰老标志物可作为疫苗失败的预测指标 | 样本量较小（40人），仅针对SARS-CoV-2疫苗，需在更大样本和不同疫苗中验证 | 评估亚精胺补充剂对老年人疫苗诱导免疫的改善效果及其安全性 | 65岁以上健康老年人在接种第三剂SARS-CoV-2疫苗后的免疫应答 | 机器学习 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | scRNA-seq数据 | 40名65岁以上健康老年人 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 73 | 2026-07-03 |
A Unique Intraexonic Splicing Mechanism in the Immunoglobulin Domain of NKp30 Produces a Surface-Expressed Receptor With Altered Ligand Specificity
2026-Jun, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.70215
PMID:42231749
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研究论文 | 发现NKp30免疫球蛋白结构域中一种独特的剪接机制，产生表面表达的受体并改变配体特异性 | 首次发现NKp30 Ig结构域外显子中一对剪接信号在灵长类和胎盘哺乳动物中高度保守，产生非人为的25个氨基酸缺失剪接变体NKp30-S，且该剪接机制在其他Ig超家族蛋白中未见 | NKp30-S剪接机制仅在NKL细胞中检测到而在293T细胞中未观察到，表明具有细胞特异性；未完全阐明该剪接变体在体内对NK细胞杀伤肿瘤的具体调控作用 | 研究NKp30受体在NK细胞杀伤癌细胞中的新型剪接机制及其功能意义 | 人类NKp30基因及其剪接变体NKp30-S | 分子生物学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人血NK细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 74 | 2026-07-03 |
Praxis-BGM: clustering of omics data using semi-supervised transfer learning for Gaussian mixture models via natural-gradient variational inference
2026-Jun-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag395
PMID:42308558
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研究论文 | 提出了一个名为Praxis-BGM的半监督迁移学习框架，通过自然梯度变分推断对高斯混合模型进行聚类，以改善小样本组学数据的稳定性与泛化能力 | 将半监督迁移学习引入高斯混合模型，利用大规模参考数据的稳健聚类结构作为先验，结合自然梯度变分推断实现小样本条件下的高效聚类 | 仅针对组学数据的有限样本量场景进行评估，未涵盖其他数据类型或更大规模异质性样本的验证 | 开发一种针对高维小样本组学数据的高斯混合模型聚类方法，提升聚类性能与生物可解释性 | 乳腺癌批量转录组数据（亚型恢复）和单细胞转录组数据（跨平台细胞类型标签迁移） | 机器学习和数字病理学 | 乳腺癌 | 转录组测序（批量RNA-seq和单细胞RNA-seq） | 高斯混合模型 (GMM) | 基因表达数据（转录组） | 模拟数据及两个真实数据集（乳腺癌批量转录组和单细胞转录组样本） | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 75 | 2026-07-03 |
Exploring mechanisms of scar-free skin wound healing in adult zebrafish in comparison to mouse
2026-Jun, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1012200
PMID:42341061
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学比较成年斑马鱼与小鼠皮肤伤口愈合机制，揭示斑马鱼无疤痕愈合的分子基础 | 首次利用HCR-based空间转录组学分析斑马鱼皮肤伤口愈合过程中细胞动态，发现斑马鱼成纤维细胞缺乏胶原表达但表达促纤维化基因，且TGFβ信号诱导plod2表达但不影响肉芽组织消退 | 斑马鱼基因组缺乏retln基因，但仍存在plod2表达和胶原交联，提示存在其他未明确的促进暂时性纤维化消退的途径 | 探究成年斑马鱼无疤痕皮肤伤口愈合的细胞和分子机制，并与小鼠进行比较 | 成年斑马鱼和小鼠的皮肤伤口愈合过程 | 数字病理学 | 皮肤损伤 | 单细胞RNA测序、HCR-based空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 斑马鱼和小鼠的皮肤伤口样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序和HCR-based空间转录组学 |
| 76 | 2026-07-03 |
Hypoxic niche drives lineage imbalance and early tumorigenesis in EGFR-mutant lung cancer
2026-06-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1093/ajrccm/aamag150
PMID:42085227
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研究论文 | 该研究揭示了缺氧微环境通过核糖体碰撞信号驱动EGFR突变肺癌早期肿瘤发生和谱系失衡的机制 | 首次发现中心型EGFR突变肺腺癌的早期恶性进展与缺氧微环境相关，并阐明ZAKα-MAPK-c-Fos轴介导的核糖体碰撞信号在肺泡谱系失衡中的作用 | 研究主要基于小鼠模型和类器官，人类患者数据有限，且未深入探讨不同缺氧程度对肿瘤进展的剂量效应 | 明确EGFR突变肺腺癌早期侵袭性进展的空间临床决定因素，并建立基于谱系的机制框架 | EGFR突变肺腺癌细胞、小鼠模型、3D类器官、临床样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组学、空间转录组学、多组学分析 | NA | 基因表达数据、组织图像 | 277例临床样本 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 77 | 2026-07-03 |
ZNF469 drives TGF-β1/SMAD3-mediated extracellular matrix regulation in pulmonary fibrosis
2026-May-28, Biomolecules & biomedicine
DOI:10.17305/bb.2026.14165
PMID:42206677
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研究论文 | 通过整合功能与转录组方法，研究ZNF469在肺纤维化中通过TGF-β1/SMAD3轴驱动细胞外基质调控的机制 | 首次揭示ZNF469作为TGF-β1/SMAD3轴的下游转录因子在肺成纤维细胞激活及细胞外基质沉积中的关键作用，并利用CUT&RUN技术证明其直接调控胶原基因启动子 | 未在体内模型中验证ZNF469的促纤维化功能，且未阐明ZNF469与SMAD3相互作用的分子细节 | 揭示ZNF469在肺纤维化中调控成纤维细胞激活和细胞外基质沉积的转录机制 | 人类肺成纤维细胞及来自特发性肺纤维化和系统性硬化症患者的肺组织样本 | NA | 肺纤维化 | RNA-seq, CUT&RUN, 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | 转录组数据, 基因表达数据 | 来自特发性肺纤维化和系统性硬化症患者的肺组织样本（具体数量未提及） | NA | NA | NA | NA |
| 78 | 2026-07-03 |
Identification of Poor Prognosis-Associated Fibroblast Subpopulation Signature Genes Utilizing the Scissor Algorithm to Classify Colorectal Cancer Subtypes and Evaluate the Immune Landscape
2026-05-15, Gut and liver
IF:3.4Q2
DOI:10.5009/gnl250363
PMID:41787974
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研究论文 | 利用Scissor算法鉴定与预后相关的成纤维细胞亚群特征基因，对结直肠癌亚型进行分类并评估免疫微环境 | 首次利用Scissor算法整合单细胞与批量转录组数据，鉴定出与结直肠癌不良预后显著相关的成纤维细胞亚群，并揭示其促转移通路激活及免疫激活但功能耗竭的特征 | 未提及具体局限性，可能包括算法依赖的数据整合质量及验证样本的有限性 | 识别与结直肠癌预后相关的成纤维细胞亚群特征基因，用于亚型分类和免疫微环境评估 | 结直肠癌成纤维细胞亚群及肿瘤微环境中的免疫细胞 | 机器学习 | 结直肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Scissor算法 | 基因表达数据 | 从TCGA和GEO数据库整合的批量RNA-seq及单细胞RNA-seq数据 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 79 | 2026-07-03 |
Single-cell profiling identifies a pro-tumoral VCAN positive macrophage subset and defines a prognostic signature in glioblastoma
2026-May-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05166-y
PMID:42105040
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序鉴定胶质母细胞瘤中促肿瘤的VCAN阳性巨噬细胞亚群并构建预后特征 | 首次鉴定出GBM微环境中VCAN⁺巨噬细胞亚群，揭示其终末分化状态、TNF-α驱动的独特极化表型及SPP1信号介导的促肿瘤免疫抑制机制，并基于其相关基因构建有效预后模型 | 样本量较小，需更大队列和功能性验证以明确该亚群的治疗潜力和空间分布模式 | 解析胶质母细胞瘤微环境中巨噬细胞的异质性，鉴定关键亚群并建立预后模型 | 胶质母细胞瘤组织中的肿瘤相关巨噬细胞 | 机器学学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 80 | 2026-07-03 |
Combining single cell and bulk transcriptomics with Mendelian randomization identifies gut microbiota related prognostic genes and mechanisms in thyroid cancer
2026-May-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05132-8
PMID:42105187
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研究论文 | 结合单细胞与批量转录组学及孟德尔随机化方法，鉴定甲状腺癌中与肠道菌群相关的预后基因及机制 | 首次通过整合单细胞RNA测序、批量转录组数据和孟德尔随机化分析，系统鉴定与肠道菌群相关的甲状腺癌预后基因，并揭示成纤维细胞在甲状腺癌进展中的关键作用 | 未明确提及局限性 | 鉴定与甲状腺癌及肠道菌群相关的预后基因，并探索其分子机制 | 甲状腺癌患者 | 机器学学习 | 甲状腺癌 | RNA-seq | 机器学习模型（如用于构建预后模型） | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |