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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-07-27 |
Antigen-specific type 1 regulatory T cell responses shape immunity and disease tolerance in human malaria
2026-Jul-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI208046
PMID:42454490
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评论 | 本文探讨了抗原特异性1型调节性T细胞应答如何影响人类疟疾的免疫和疾病耐受性 | 提出通过CD127下调和CXCR6表达结合来更好鉴定Tr1细胞,并利用单细胞转录组学建立更严格的标记验证框架 | 未明确提及,但作为评论文章,可能缺乏原始实验数据的直接支持 | 阐明Tr1细胞在儿童疟疾感染中的角色及其在免疫与免疫病理平衡中的作用 | 儿童恶性疟原虫感染期间的Tr1细胞 | 数字病理学 | 疟疾 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 62 | 2026-07-27 |
Gut microbe-derived short-chain fatty acids regulate alphavirus arthritis and macrophage activation in mice
2026-Jul-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI202262
PMID:42454492
|
研究论文 | 本研究利用甲病毒诱导的关节炎小鼠模型,探讨肠道微生物衍生的短链脂肪酸在调节关节炎和巨噬细胞活化中的作用 | 首次揭示抗生素引起的肠道菌群失调通过短链脂肪酸丢失加重甲病毒关节炎的机制,并证明补充短链脂肪酸可缓解关节炎症 | 未明确短链脂肪酸在人类中的相似作用 | 探究肠道微生物、代谢物和宿主免疫机制在促进肌肉骨骼炎症中的作用 | 甲病毒关节炎小鼠模型 | 机器学习 | 关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 63 | 2026-07-27 |
Mitigating Fixation Artifacts in Spatial Transcriptomics: Methodological Insights from Human Brain Tissue
2026-Jul-15, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-026-06033-1
PMID:42455257
|
研究论文 | 本研究开发了一种在长期福尔马林固定的人类下丘脑组织中进行空间转录组学分析的方案,并使用GeoMx数字空间分析仪和Illumina NovaSeq平台实现了两个不同细胞群体的RNA表达分析 | 首次针对长期福尔马林固定的人类脑组织样本优化了空间转录组学工作流程,并通过RNAscope靶标检索优化和QuPath定量评估确定了最佳RNA结合条件 | 未明确提及,但可能包括样本来源仅限于下丘脑区域、长期固定组织的RNA质量仍存在批次效应,以及CRH和Iba1细胞群的特异性标记物可能存在交叉染色 | 开发一种从长期福尔马林固定的人类下丘脑组织中获得空间转录组信息的可靠方案 | 来自丹麦SURVIVE研究的长期福尔马林固定人类下丘脑样本中的小胶质细胞(Iba1阳性)和CRH阳性神经元 | 数字病理学 | 神经退行性疾病、精神疾病 | 空间转录组学(GeoMx DSP)、RNAscope、NGS | StandR生物信息工具 | 基因表达数据 | 未明确样本数量,但包括人类下丘脑组织切片 | NanoString, Illumina | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler, Illumina NovaSeq | GeoMx数字空间分析仪与Illumina NovaSeq测序平台配合使用,RNAscope用于靶标检索优化,QuPath用于定量评估 |
| 64 | 2026-07-27 |
Identification and functional validation of a four-gene signature associated with radiotherapy resistance in oral squamous cell carcinoma
2026-Jul-15, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102918
PMID:42456537
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA-seq等多种分析,识别出口腔鳞状细胞癌放疗抵抗相关四基因特征并进行功能验证 | 首次通过整合单细胞RNA-seq、TCGA体细胞转录组、Scissor分析、hdWGCNA和随机生存森林模型,系统鉴定了KPNA2、P4HA1、ARL6IP1和TUBA1B四个基因的放疗抵抗风险特征 | 主要基于公共数据库和体外细胞实验,缺乏体内模型验证和大规模临床队列验证 | 识别与口腔鳞状细胞癌放疗抵抗相关的预后生物标志物并探索其功能机制 | 口腔鳞状细胞癌组织和细胞系(HSC-3、SCC9) | 机器学习 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA-seq、体细胞转录组分析、免疫组化、siRNA敲低 | 随机生存森林 | 基因表达数据、单细胞转录组数据、临床病理数据 | TCGA-OSCC训练集和GSE41613验证集(具体样本数未明确)、体外细胞系HSC-3和SCC9 | NA | 单细胞RNA-seq、体细胞RNA-seq | NA | NA |
| 65 | 2026-07-27 |
CMTM3 links inflammation-related transcriptional dysregulation to immune and therapeutic stratification in gastric cancer
2026-Jul-15, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102906
PMID:42456536
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序、批量转录组数据和机器学习,发现CMTM3作为胃癌中炎症-代谢轴相关生物标志物,用于预后和治疗分层 | 首次将CMTM3与胃癌的炎症相关转录失调联系起来,并建立了结合炎症和代谢信号的综合性生物标志物筛选框架 | 体外验证为主,缺乏体内实验和大规模临床试验的进一步验证;机制研究尚未完全揭示CMTM3的具体作用路径 | 识别胃癌中与炎症-代谢轴相关的生物标志物,用于免疫和治疗分层 | 胃癌患者的肿瘤样本和细胞系 | 机器学习 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,机器学习 | CoxBoost,随机生存森林 | 基因表达数据 | 多个独立胃癌队列 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 66 | 2026-07-27 |
CroCoNet: a framework for the quantitative comparison of gene regulatory networks across species
2026-Jul-15, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04152-5
PMID:42458527
|
研究论文 | 提出一个用于跨物种基因调控网络定量比较的框架CroCoNet | 构建以假定的调控因子为中心的可比较网络模块,区分真正的进化分歧与技术和生物学混杂因素 | 未提及局限性 | 定量比较跨物种的基因调控网络以理解表型进化 | 灵长类动物早期神经分化中的基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序, CRISPRi | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 67 | 2026-07-27 |
Interleukin-6 is critical in the development of pulmonary vascular disease in Gcn2-deficient mice
2026-Jul-14, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2531623123
PMID:42406961
|
研究论文 | 揭示GCN2缺陷小鼠肺血管疾病发展中白介素-6的关键作用 | 首次证明白介素-6是GCN2缺陷相关及丝裂霉素C诱导的小鼠肺血管疾病的关键介质,并揭示完整的GCN2-整合应激反应对IL-6信号的调节作用 | 研究仅在小鼠模型中进行,人类患者验证尚欠缺 | 探索GCN2缺陷与肺血管病理之间的机制联系 | GCN2基因敲除小鼠和丝裂霉素C处理的小鼠模型 | 机器学习 | 肺血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 野生型和GCN2缺陷小鼠的肺样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 68 | 2026-07-27 |
Single-Cell and Spatial Analysis Reveal the Differences Between Left-Sided and Right-Sided Colorectal Cancer
2026-Jul-14, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70260
PMID:42444407
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示左、右侧结直肠癌的分子异质性 | 首次综合运用单细胞和空间分析技术系统比较左右侧结直肠癌的免疫微环境差异,发现右侧肿瘤中增强的生发中心B细胞浸润和CXCL13+T细胞富集与适应性免疫启动相关 | 未说明具体样本量及临床验证,可能缺乏多中心独立队列验证 | 解析左右侧结直肠癌的分子和免疫微环境差异,为精准治疗提供依据 | 结直肠癌患者肿瘤组织样本(区分左右侧) | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 69 | 2026-07-27 |
Single-cell analysis of Powassan virus-infected brains reveals age-dependent neuroinflammatory crosstalk and progressive Alzheimer's-like APP/Aβ accumulation
2026-Jul-14, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01294-26
PMID:42446869
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析波瓦桑病毒感染小鼠大脑,揭示年龄依赖性神经炎症串扰和进行性阿尔茨海默样APP/Aβ积累 | 首次在单细胞水平揭示波瓦桑病毒通过年龄依赖性机制诱发神经退行性疾病相关小胶质细胞转变和阿尔茨海默病样APP/Aβ积累 | 仅使用小鼠模型,未在人类样本中验证发现 | 阐明波瓦桑病毒年龄依赖性致死性和持续神经退行性疾病的潜在机制 | 年轻(10周龄)和老年(50周龄)C57BL/6小鼠的大脑中枢神经系统细胞 | 数字病理学 | 脑炎、阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻小鼠和老年小鼠各若干只,具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3 |
| 70 | 2026-07-27 |
Morphological and functional diversity of spatially resolved vestibular ganglion neuron cell types
2026-Jul-14, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2530677123
PMID:42412930
|
研究论文 | 利用单细胞和空间转录组学定义了五种具有不同空间分布的 vestibular 神经节细胞类型,并揭示了其特异性功能和神经支配模式 | 首次通过单细胞与空间转录组学联合分析,在空间分辨率下鉴定出五种具有离散分布的 VGN 细胞类型,并开发了遗传工具选择性标记每种细胞类型,从而建立细胞类型与特定前庭功能(如重力感知)的直接联系 | 未讨论在体功能验证中的潜在混杂因素,且遗传工具的长期表达效应未在摘要中提及 | 阐明前庭神经节神经元的分子异质性及其对前庭系统多样化功能的贡献 | 前庭神经节神经元(VGN) | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 未明确说明样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium 单细胞3'测序, 10x Visium 空间转录组学 |
| 71 | 2026-07-27 |
IL-13 signaling in cDC2 is required for systemic anaphylactic responses
2026-Jul-14, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2608478123
PMID:42424420
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研究论文 | 本研究揭示了cDC2中IL-13信号在系统性过敏反应中的关键作用 | 首次明确cDC2而非T或B细胞是IL-13产生高亲和力IgE的关键靶点,并阐明IL-13-cDC2轴调控特应性进程的机制 | 研究基于小鼠模型,人类中是否具有相同机制有待验证 | 阐明IL-13信号在皮肤过敏原致敏引发系统性过敏反应中的细胞靶点和机制 | 小鼠皮肤过敏原致敏模型中的树突状细胞亚群 | 免疫学 | 特应性皮炎、食物过敏、过敏反应 | 单细胞转录组学、基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型(具体样本量不详) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 72 | 2026-07-27 |
Single-cell atlas of neuroglial dynamics in SNCA-A53T Parkinson's disease mouse model
2026-Jul-14, Animal models and experimental medicine
IF:3.8Q2
DOI:10.1002/ame2.70252
PMID:42447147
|
研究论文 | 通过对SNCA-A53T帕金森病小鼠模型中脑和纹状体进行单细胞RNA测序,揭示了神经胶质细胞动态变化的细胞图谱 | 首次通过单细胞RNA测序技术在SNCA-A53T转基因小鼠模型中全面解析中脑和纹状体的细胞异质性,鉴定出PD特异性的胶质细胞亚群及其炎症、凋亡和线粒体通路变化,并发现新的转录调控因子如Rorb、Foxc1等 | 仅基于小鼠模型,可能无法完全代表人类帕金森病的病理机制 | 研究帕金森病的病理机制,特别是SNCA-A53T突变诱导的神经胶质细胞动态变化 | SNCA-A53T转基因小鼠的中脑和纹状体细胞 | 单细胞组学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 22,865个中脑细胞和32,117个纹状体细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 73 | 2026-07-27 |
Immunohistochemical analysis and scRNA-Seq identifies vascular endothelial CXCR4 expression as a predictor of poor prognosis in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Jul-14, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102916
PMID:42447567
|
研究论文 | 通过免疫组化和单细胞RNA测序分析,发现胰腺导管腺癌浸润前沿血管内皮CXCR4表达与不良预后相关 | 首次在切除的胰腺导管腺癌标本中,系统评估浸润前沿血管内皮CXCR4表达与预后关系,并结合单细胞RNA测序验证表达定位 | 样本量较小(80例),回顾性研究设计,且仅使用公共数据库进行单细胞RNA测序验证,缺乏独立队列验证 | 探究胰腺导管腺癌浸润前沿血管内皮CXCR4表达的临床意义及其与预后的关联 | 80例胰腺导管腺癌切除标本及公共单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 免疫组化, 单细胞RNA测序 | NA | 组织图像, 基因表达数据 | 80例胰腺导管腺癌患者组织标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 74 | 2026-07-27 |
Dissecting immunosuppressive microenvironment in chemotherapy-resistant colorectal cancer through single-cell transcriptomic analysis
2026-Jul-14, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102889
PMID:42447566
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示化疗耐药结直肠癌中的免疫抑制微环境 | 首次构建化疗敏感与耐药结直肠癌标本的单细胞转录组图谱,系统解析了耐药肿瘤中多维免疫抑制微环境的重塑过程 | 样本量较小,且体外验证仅使用两种耐药细胞系,缺乏体内动物模型验证 | 揭示化疗耐药结直肠癌中免疫抑制微环境的细胞和分子机制,为预测治疗耐药和开发免疫治疗联合策略提供候选生物标志物 | 化疗敏感和耐药的结直肠癌标本及HCT116-OxR与SW480-5FUR耐药细胞系 | 单细胞转录组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,定量RT-PCR,ELISA | NA | 单细胞转录组数据 | 13,380个细胞,来自化疗敏感和耐药结直肠癌标本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 75 | 2026-07-27 |
IL7R depletion mitigates neuroinflammation and ischemic stroke via AKT dephosphorylation dependent LCP1 suppression in mice
2026-Jul-14, Neurotherapeutics : the journal of the American Society for Experimental NeuroTherapeutics
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.neurot.2026.e00966
PMID:42447806
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定IL7R巨噬细胞亚群,揭示IL7R-pAKT-LCP1信号通路在缺血性卒中后神经炎症中的作用 | 首次发现IL7R巨噬细胞亚群在卒中后具有高脂肪酸代谢特征,并阐明IL7R通过AKT去磷酸化依赖的LCP1抑制调控神经炎症的新机制 | 仅在小鼠模型中验证,缺乏人类样本数据;未深入探讨其他免疫细胞类型的相互作用 | 探究IL7R在缺血性卒中后神经炎症中的免疫代谢调控机制 | 小鼠脑内浸润的单核细胞来源巨噬细胞 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、代谢组学 | NA | 基因表达数据、代谢物数据 | 小鼠大脑组织(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 76 | 2026-07-27 |
Anti-PD1-IL18 immunoconjugate promotes effector T cell-mediated antitumor immunity
2026-Jul-14, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2026-015090
PMID:42448430
|
研究论文 | 描述了一种新型免疫偶联物aPD1-IL18mut,通过将PD-1阻断与局部IL-18免疫激活相结合,增强效应T细胞介导的抗肿瘤免疫 | 通过化学偶联抗PD-1抗体与工程化IL-18变体,实现PD-1阻断和IL-18靶向免疫激活的双重功能,并在多种肿瘤模型中验证其机制 | 未提及具体局限性,但可能涉及抗PD-1耐药性机制及临床转化的挑战 | 开发并表征aPD1-IL18mut免疫偶联物,评估其在不同肿瘤免疫环境中的抗肿瘤效应和机制 | 人类PD-1转基因小鼠、MC38肿瘤模型、抗PD-1耐药的YUMM1.7肿瘤模型、人类肿瘤样本及公开单细胞RNA测序数据 | 免疫学 | 肿瘤 | 化学偶联、免疫组化、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据、肿瘤样本培养数据 | 涉及多种小鼠肿瘤模型和人类肿瘤样本,具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 使用公开的单细胞RNA测序数据集进行分析 |
| 77 | 2026-07-27 |
LysoPS-GPR34 axis enhances tumor-associated macrophages efferocytosis to promote immune escape in gastric cancer peritoneal metastasis
2026-Jul-14, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2026-015464
PMID:42448431
|
研究论文 | 揭示LysoPS-GPR34轴通过增强肿瘤相关巨噬细胞胞葬作用促进胃癌腹膜转移免疫逃逸的机制 | 首次阐明LysoPS通过GPR34受体激活ERK/c-Jun信号通路上调AXL和CD36表达增强胞葬作用,驱动TAMs免疫抑制表型,并发现GPR34抑制剂联合抗PD-1治疗具有协同抗肿瘤效应 | 未提及具体局限性 | 探究LysoPS在胃癌腹膜转移中介导免疫逃逸的机制及潜在治疗策略 | 胃癌腹膜转移患者的原发肿瘤、正常腹膜和转移灶组织 | 机器学习, 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 未明确提及样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 78 | 2026-07-27 |
Context-aware sequence-to-function model of human gene regulation
2026-07-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-75527-2
PMID:42448699
|
研究论文 | 提出一种上下文感知的序列到功能模型Corgi,通过整合DNA序列和反式调控因子表达,预测染色质可及性、组蛋白修饰和基因表达覆盖度 | Corgi模型能够外推到训练数据中未包含的细胞类型和条件,实现了跨序列和跨细胞类型的表观遗传轨道联合预测,并提出了仅利用RNA-seq数据插补表观遗传轨道的Corgi+版本 | 未明确说明,但可能受限于训练数据集的多样性和模型对未知细胞类型的泛化能力 | 开发一种能外推到未见细胞类型的上下文感知序列到功能模型,用于预测人类基因调控 | 人类基因调控中的染色质可及性、组蛋白修饰和基因表达覆盖度 | 机器学习 | NA | NA | Corgi, Corgi+ | DNA序列, 基因表达数据, 表观遗传数据 | 多种批量测序和单细胞测序数据集(未明确具体数量) | Illumina | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 批量ATAC-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 79 | 2026-07-27 |
Spatial and single-cell profiling identify NDRG1⁺ macrophages as key hallmark of angiogenic remodeling and platinum resistance in HGSOC
2026-Jul-13, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102905
PMID:42442223
|
研究论文 | 通过空间转录组学和单细胞测序鉴定出NDRG1阳性巨噬细胞是高级别浆液性卵巢癌中血管生成重塑和铂类耐药的关键标志 | 首次整合空间转录组学与单细胞测序鉴定出NDRG1⁺Macro4巨噬细胞亚型,揭示其在缺氧驱动的血管生成龛形成及铂类耐药中的核心调控作用 | 摘要未提及明显局限性,但可能缺少体内功能验证或跨瘤种泛化性评估 | 阐明高级别浆液性卵巢癌中驱动疾病进展和治疗耐药的巨噬细胞程序 | 高级别浆液性卵巢癌肿瘤组织中的巨噬细胞亚型及其微环境 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 空间转录组学, 单细胞测序, 多重免疫荧光, 伪时间重建 | RSF(随机生存森林) | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据, 多重免疫荧光图像 | 多队列(具体样本量未在摘要中明确) | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 80 | 2026-07-27 |
Multi-omics analysis of arginine metabolism in ovarian cancer: A prognostic signature and GTF2F2-driven stromal remodeling
2026-Jul-13, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102911
PMID:42442222
|
研究论文 | 通过多组学分析构建基于精氨酸代谢的预后标志物,并揭示GTF2F2在卵巢癌基质重塑中的驱动作用 | 首次利用十种机器学习算法构建精氨酸代谢相关的预后标志物,并识别GTF2F2为关键调控因子,揭示其在精氨酸代谢、基质激活和精氨酸剥夺敏感性中的转录调控机制 | 需要前瞻性验证来确认该标志物的临床应用价值 | 构建精氨酸代谢相关预后标志物以指导卵巢癌的预后和治疗策略,并鉴定可干预的调控因子 | 卵巢癌的肿瘤样本、单细胞转录组数据及批量RNA测序数据 | 机器学习 | 卵巢癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, siRNA敲降, qPCR, 免疫印迹, 流式细胞术, 双荧光素酶报告实验 | 随机生存森林, 随机森林 | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 单细胞RNA-seq和多个批量RNA测序数据集,具体样本量未详细说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |