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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-05-02 |
Single-cell RNA sequencing reveals depot-specific characteristics of adipose progenitor cells in ducks
2026-Apr-23, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2026.107004
PMID:42061263
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序鸭脂肪前体细胞,揭示不同脂肪组织库的异质性和特异性调控机制 | 首次构建鸭不同脂肪组织库脂肪前体细胞的单细胞图谱,揭示分子异质性、谱系动力学和微环境特异性调控 | 未提及具体局限性,但可能包括样本量有限或仅针对特定发育阶段 | 探讨鸭不同脂肪沉积部位(胸肌、皮下和内脏)脂肪前体细胞的调控机制 | 鸭的胸肌、皮下脂肪和内脏脂肪组织中的脂肪前体细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量,但涉及胸肌、皮下脂肪和内脏脂肪组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 62 | 2026-05-02 |
Comprehensive single-cell analysis reveals cellular heterogeneity and immune interactions in colorectal cancer
2026-Apr-22, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102761
PMID:42024995
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序对结直肠癌组织进行综合分析,揭示了细胞异质性和免疫相互作用 | 通过单细胞RNA测序识别了六个主要细胞群,并在T_NK细胞中定义了四个不同亚群,使用CytoTRACE和Monocle伪时间分析揭示了分化潜力差异,结合年龄相关基因构建预后模型,并通过免疫算法和肿瘤突变负荷分析揭示了免疫复杂性 | 未说明 | 研究结直肠癌的细胞异质性和免疫相互作用,以支持靶向和个性化治疗 | 结直肠癌组织中的18,741个单个细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 18,741个单个细胞来自结直肠癌组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 63 | 2026-05-02 |
Endothelial MerTK impairment promotes cardiac dysfunction in the condition of high fat diet
2026-Apr-21, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2026.104184
PMID:42030645
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研究论文 | 该研究探讨了在高脂饮食条件下,内皮细胞MerTK功能受损对心脏功能障碍的促进作用 | 发现内皮细胞MerTK在调节高脂饮食诱导的心脏功能障碍中的新角色,并利用多组学方法结合人类标本揭示其机制 | 未提及具体局限性 | 研究内皮细胞MerTK在高脂饮食条件下调节心脏功能障碍的新作用 | 内皮细胞MerTK缺陷小鼠及人类扩张型心肌病和肥厚型心肌病患者标本 | 机器学习和数字病理学 | 心血管疾病 | 多组学分析(蛋白质组学、单细胞RNA测序、单核RNA测序)、免疫染色 | NA | 蛋白质组学数据、单细胞转录组数据、免疫染色图像 | 小鼠模型及人类心脏标本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序、单核RNA测序 | NA | NA |
| 64 | 2026-05-02 |
Single-cell landscape of goose thymus uncovers developmental and regulatory dynamics of T cell differentiation
2026-Apr-17, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2026.106951
PMID:42061246
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研究论文 | 通过单细胞转录组图谱揭示了浙东白鹅胸腺在胚胎、幼鹅、幼年和成年阶段的T细胞分化与调控动态 | 首次构建禽类胸腺单细胞转录组图谱,揭示γδ T细胞丰度显著高于哺乳动物,并阐明T细胞分化的关键转录因子及物种特异性差异 | 未涉及功能性验证实验,且物种间比较仅基于小鼠和人,未扩展到其他禽类或动物群 | 阐明禽类胸腺中T细胞发育和分化的动态过程及调控机制,为禽类免疫学和育种提供基础见解 | 浙东白鹅的胸腺组织(涵盖胚胎、幼鹅、幼年和成年四个阶段) | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 涵盖四个发育阶段的浙东白鹅胸腺样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 65 | 2026-05-02 |
Distinct gene signatures of human intermuscular adipose tissue expansion visualized by spatial transcriptomics in mice
2026-Apr-17, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.04.16.26351017
PMID:42064925
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研究论文 | 通过空间转录组学在小鼠中展示人类肌间脂肪组织扩张的独特基因特征 | 首次将人类肌间脂肪组织(IMAT)的基因特征映射到疾病模型小鼠的空间转录组,揭示了IMAT扩张的细胞组织结构和调控机制,包括发现EBF2作为关键调控因子以及IMAT是一种活性、空间有序的重构微环境 | 部分保守的人类IMAT基因程序在小鼠模型中体现,提示存在物种特异性特征;FAP丰度不能预测脂肪细胞形成,表明限于局部和依赖环境的谱系转变 | 阐明肌间脂肪组织(IMAT)扩张的细胞组织和调控机制 | 人类肌间脂肪组织和小鼠(患有心肌代谢疾病)的肌间脂肪组织 | 计算机视觉 | 心肌代谢疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 人类IMAT样本和小鼠IMAT样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台用于小鼠IMAT |
| 66 | 2026-05-02 |
Characterization of a pancreatic cancer GWAS signal suggests PDX1 buffers stress in the exocrine pancreas
2026-Apr-15, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.04.13.26350790
PMID:42064940
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研究论文 | 该研究表征了胰腺癌GWAS信号,发现PDX1在胰腺外分泌部分中缓冲压力的作用 | 首次将chr13q12.2 GWAS风险位点中的rs9581943变异与PDX1表达调控联系起来,阐明PDX1在减轻外分泌胰腺细胞压力及维持上皮细胞稳态中的作用 | 基于细胞系和单细胞转录组分析,缺乏体内或动物模型的功能验证 | 功能表征胰腺导管腺癌GWAS风险位点chr13q12.2的因果变异及其生物学机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)相关的遗传风险位点 | 机器学习 | 胰腺癌 | GWAS, CRISPR/Cas9编辑, 荧光素酶报告基因检测, 电泳迁移率变动分析, 单核RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 新生儿、成年及慢性胰腺炎供体的胰腺外分泌细胞;胰腺肿瘤样本 | 10x Genomics | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单核RNA测序及单细胞RNA测序 |
| 67 | 2026-05-02 |
TopClust: Topological-based analysis of scRNA-seq data for data-driven identification of clusters and core cluster cells
2026-Apr-14, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2026.04.010
PMID:41981916
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研究论文 | 提出基于拓扑数据分析的scRNA-seq聚类方法TopClust,实现无偏且可重复的细胞聚类 | 利用拓扑数据分析自动识别峰细胞和峰顶细胞,无需主观参数选择,通过方向向量投影鉴定簇特异性基因 | 未明确提及局限性,可能需在高维大数据集上验证计算效率 | 开发数据驱动的scRNA-seq聚类方法,减少人工偏差并提高细胞类型注释准确性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞聚类与细胞类型鉴定 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 拓扑数据分析,共享最近邻模型 | 单细胞基因表达数据 | 基准数据集(肺癌细胞系和流式分选免疫细胞) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 68 | 2026-05-02 |
Aged automobile cabin air filters as secondary pollution sources: mechanistic insights into NLRP3 inflammasome activation and discovery of a natural inhibitor
2026-Apr-13, Particle and fibre toxicology
IF:7.2Q1
DOI:10.1186/s12989-026-00674-9
PMID:41975463
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研究论文 | 本研究系统调查了汽车空调滤清器沉积颗粒物的差异毒性,揭示内侧颗粒因富集超细颗粒而毒性更强,并发现天然环二肽Cyclo-(Tyr-Phe)可作为NLRP3炎症小体抑制剂 | 首次揭示汽车空调滤清器内外侧颗粒物的差异化毒性机制,发现超细颗粒物通过非活性氧途径激活NLRP3炎症小体并诱发细胞焦亡,并通过虚拟筛选发现天然环二肽Cyclo-(Tyr-Phe)作为新型NLRP3抑制剂 | 未提及具体局限性 | 探究汽车空调滤清器沉积颗粒物内外侧的差异毒性及其分子机制,并寻找天然抑制剂 | 汽车空调滤清器内外膜沉积颗粒物 | NA | 肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 69 | 2026-05-02 |
Disrupted glial-mediated synaptic refinement in Fragile X syndrome
2026-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.10.717772
PMID:41993264
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研究论文 | 该研究揭示了在脆性X综合征中,胶质细胞介导的突触修剪过程被破坏的机制 | 首次通过多组学框架系统阐明FMRP缺失如何通过胶质细胞(小胶质细胞和星形胶质细胞)异常信号导致突触修剪失调,并发现EphA和semaphorin通路及脂质代谢变化在其中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;且仅聚焦于出生后第7天的关键窗口期,未探讨长期发育效应 | 探究FMRP缺失如何影响胶质细胞介导的突触修剪及其在脆性X综合征神经发育中的作用 | Fmr1基因敲除小鼠(FXS模型)的视网膜-膝状体通路 | 机器学习 | 脆性X综合征 | NGS, RNA-seq, 脂质组学 | 神经网络 | 图像, 文本 | 未明确说明样本量,涉及Fmr1敲除小鼠和野生型对照小鼠 | NA | 单细胞RNA测序, 脂质组学 | NA | NA |
| 70 | 2026-05-02 |
Multimodal profiling reveals Mycobacterium tuberculosis restricts lung mitochondrial immunometabolism to promote pathogenesis
2026-Apr-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.07.717012
PMID:41993288
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研究论文 | 通过多组学分析揭示结核分枝杆菌通过限制肺部线粒体免疫代谢促进致病机制 | 首次发现结核分枝杆菌通过丝氨酸蛋白酶Hip1抑制肺部线粒体氧化磷酸化,诱导持续糖酵解,破坏线粒体功能,从而促进致病性免疫;同时鉴定出与保护性结局相关的新型线粒体免疫代谢肺部特征 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据的验证范围有限;早期事件的详细分子机制仍有待进一步探索 | 阐明结核分枝杆菌感染后早期肺部免疫环境如何决定保护性还是致病性结局 | 小鼠和人类受试者 | 机器学习 | 结核病 | 高维流式细胞术、单细胞转录组学、非靶向代谢组学 | NA | 多模态数据(流式细胞术数据、单细胞转录组数据、代谢组数据) | 未明确说明具体样本数量,涉及小鼠和人类样本 | NA | 单细胞转录组学、代谢组学 | NA | NA |
| 71 | 2026-05-02 |
Local IFNγ signaling contributes to the regenerative decline of aged alveolar progenitor cells
2026-Apr-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.07.716929
PMID:41993319
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研究论文 | 研究发现老年肺泡干细胞再生能力下降与局部IFNγ信号传导有关,通过中和IFNγ或敲除免疫蛋白酶体可部分恢复其再生功能 | 首次揭示老年肺中局部IFNγ信号主动抑制肺泡再生,证明慢性炎性信号是年龄相关肺功能衰退的原因 | 研究主要基于小鼠模型,人类验证不足,且未完全阐明IFNγ下游具体分子机制 | 探究老年肺泡II型细胞再生能力下降的机制 | 老年小鼠肺泡II型细胞及CD8+ T细胞 | 机器学习 | 老年疾病 | 单细胞测序、类器官培养、基因敲除小鼠 | NA | 单细胞转录组数据、类器官图像数据 | 不同年龄小鼠模型(老年组与年轻组)的肺泡组织和细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 72 | 2026-05-02 |
Serial Thermal Ablation Induces Abscopal Antitumor Immunity and Reveals Targetable CSF1R-Dependent Resistance in Pancreatic Cancer
2026-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.05.713683
PMID:41993287
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研究论文 | 本研究探讨了连续热消融在胰腺导管腺癌中诱导的远隔抗肿瘤免疫效应及CSF1R依赖性耐药机制 | 首次揭示了连续射频消融能诱导全身性远隔抗肿瘤免疫应答,并识别出CSF1驱动的髓系免疫抵抗程序,提出联合免疫治疗策略可增强消融的系统性疗效 | 研究仅基于双侧肿瘤小鼠模型,尚未在人体中验证;CD8 T细胞耗竭实验虽证实关键作用,但其他免疫机制可能未被完全涵盖 | 探究热消融诱导全身抗肿瘤免疫的能力及限制该反应的机制,并开发有效的联合免疫治疗策略 | 双侧flank肿瘤小鼠模型中的胰腺导管腺癌细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 射频消融, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 双侧flank肿瘤小鼠模型,具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 73 | 2026-05-02 |
Spatially Anchored Regulatory State Inference in Melanoma
2026-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.05.716552
PMID:41993479
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研究论文 | 提出一种空间锚定的调控状态推断框架,整合空间转录组与单细胞多组学数据,推断黑色素瘤组织中的空间分辨调控程序 | 首次将空间转录组与单细胞多组学数据结合,实现空间锚定的调控状态推断,并通过空间正则化细胞-点映射传播染色质可及性和转录因子基序活性 | 未提及具体局限性 | 开发一种模块化方法,整合空间转录组和单细胞多组学数据,以推断组织空间中的调控程序并评估其稳定性 | 黑色素瘤组织切片 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学、单细胞多组学 | GraphST | 空间转录组数据、单细胞多组学数据(染色质可及性、转录因子基序活性) | 黑色素瘤组织切片样本 | 10x Genomics | 空间转录组学、单细胞多组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 74 | 2026-05-02 |
MitoChontrol: Adaptive mitochondrial filtering for robust single-cell RNA sequencing quality control
2026-Apr-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.04.716517
PMID:41993278
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研究论文 | 提出一种细胞类型自适应的线粒体质量控制方法MitoChontrol,用于单细胞RNA测序数据的可靠质量过滤 | 构建基于高斯混合分布的细胞类型感知概率框架,自适应确定每个转录组聚类中的线粒体过滤阈值,替代传统固定百分比阈值方法 | NA | 改进单细胞RNA测序中线粒体质量控制的适应性和准确性 | 受控扰动实验和胰腺导管腺癌单细胞数据集中的细胞群体 | 计算机视觉,自然语言处理,机器学习,数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | 高斯混合模型 | 单细胞转录组数据 | NA(受控扰动实验及一个胰腺导管腺癌单细胞数据集) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 75 | 2026-05-02 |
Emergent latent neurotoxic effects of manganese following nominal chronic exposures in human stem cell and Caenorhabditis elegans models
2026-Apr-07, Toxicological sciences : an official journal of the Society of Toxicology
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/toxsci/kfag040
PMID:42033779
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研究论文 | 本文通过人诱导多能干细胞和秀丽隐杆线虫模型,揭示了慢性锰暴露后出现的潜在神经毒性效应 | 首次在两种遗传和机制可操作的系统中证实,慢性锰暴露停止后会出现此前未检测到的潜在神经毒性效应,且其程度远超慢性锰暴露本身的影响 | 尚未明确潜在效应的具体分子机制,且需要进一步验证其在人体中的相关性 | 研究慢性锰暴露后潜在神经毒性效应的存在及机制 | 人诱导多能干细胞衍生的皮层培养物和秀丽隐杆线虫 | 机器学习 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据和行为数据 | 人诱导多能干细胞衍生的皮层培养物(具体数量未明确)和秀丽隐杆线虫(具体数量未明确) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 76 | 2026-05-02 |
Human Lymph Node Cellular Senescence Atlas Reveals Age-Dependent Alteration in Germinal Center B Cell Function and Niches
2026-Apr-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.02.716161
PMID:41993351
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research paper | 通过整合单细胞和空间多组学技术,系统描绘了人类淋巴结中与年龄相关的细胞衰老图谱,揭示了衰老过程中生发中心B细胞功能及生态位的年龄依赖性变化 | 首次构建人类淋巴结衰老相关免疫状态的空间多组学图谱,结合单细胞转录组、空间蛋白质组、转录组、表观基因组和代谢成像,揭示了衰老细胞类型的空间异质性和从滤泡外到生发中心的逐步定位转变 | 未提供具体局限性信息 | 系统描述人类淋巴结中与年龄相关的细胞衰老状态及其对免疫微环境的影响 | 人类淋巴结组织,来自18至100岁供体 | digital pathology | geriatric disease | 单细胞转录组学、高多重免疫荧光、空间转录组学、空间表观基因组学、代谢成像 | NA | 单细胞转录组数据、空间蛋白质组数据、空间转录组数据、空间表观基因组数据、代谢成像数据 | 单细胞转录组:来自18-100岁供体;空间蛋白质组:51名供体(18-86岁)的99个淋巴结切片,约2000万个细胞 | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 77 | 2026-05-02 |
Thymic stromal lymphopoietin promotes ozone-induced inflammation in the airway
2026-Apr-01, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2025-0281OC
PMID:41025995
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research paper | 本研究探讨了胸腺基质淋巴细胞生成素(TSLP)在臭氧诱导的气道炎症中的作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序发现TSLP通过调节cDC1细胞中Fscn1的表达促进臭氧诱导的中性粒细胞性气道炎症 | 未涉及人体样本验证,且具体分子通路细节尚需进一步探索 | 阐明TSLP在臭氧诱导的2型低炎症表型气道高反应性和中性粒细胞炎症中的作用 | BALB/c小鼠、TSLP受体缺陷小鼠、Batf3缺陷小鼠以及骨髓来源的cDC1细胞 | machine learning | 哮喘、气道炎症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多组小鼠(如BALB/c、TSLP受体缺陷、Batf3缺陷)每组至少6只,具体数量未详细说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台用于单细胞转录组分析 |
| 78 | 2026-05-02 |
The Spatially Resolved Kidney Transcriptome Signatures in Rat Models of Trauma-Induced Acute Kidney Injury
2026-Apr-01, Kidney360
IF:3.2Q1
DOI:10.34067/KID.0000001045
PMID:41396698
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research paper | 利用大鼠模型,通过整体和空间转录组学揭示了创伤性急性肾损伤中肾转录组的空间特征 | 首次将商用小鼠空间转录组探针成功应用于大鼠肾组织,实现了成本效益高且区域特异性的基因表达谱分析,并揭示了出血性休克与横纹肌溶解症协同作用下的独特区域和分子特征 | NA | 研究创伤后急性肾损伤中出血性休克和横纹肌溶解症单独及联合作用对肾脏转录组的影响 | 大鼠肾组织 | machine learning | 创伤性急性肾损伤 | 整体转录组学、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | bulk transcriptomics, spatial transcriptomics | NA | 商用小鼠空间转录组探针用于大鼠肾组织 |
| 79 | 2026-05-02 |
Temporal modulation of microglial repopulation attenuates retinal degeneration in retinitis pigmentosa
2026-04, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2026.107295
PMID:41690604
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研究论文 | 探究时间性调控小胶质细胞再增殖在视网膜色素变性中对视网膜变性的缓解作用 | 首次发现小胶质细胞再增殖的时间依赖性表型可塑性,并提出两轮连续清除-再增殖策略以维持小胶质细胞稳态并保护视功能 | 研究主要基于rd10小鼠模型,需进一步验证在人类RP中的适用性;长期再增殖小胶质细胞恢复促炎表型的机制未完全阐明 | 评估时间性调控小胶质细胞清除与再增殖对视网膜色素变性小鼠模型视网膜变性的影响及其治疗潜力 | rd10小鼠视网膜小胶质细胞 | 机器学习 | 视网膜色素变性 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | rd10小鼠视网膜样本(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 80 | 2026-05-02 |
Multi-omics analysis of the lactylation-driven microenvironment and non-invasive clinical translation in hepatocellular carcinoma
2026-Apr, Hepatology international
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12072-025-11016-w
PMID:41699363
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研究论文 | 通过整合多组学策略,研究赖氨酸乳酸化驱动的微环境及非侵入性临床转化在肝细胞癌中的价值 | 首次构建基于赖氨酸乳酸化的风险模型,并整合超声影像组学实现非侵入性预测,揭示乳酸化驱动的免疫抑制微环境与增殖性肿瘤表型 | 未在独立大规模外部队列中验证模型普适性,超声影像组学参数可能受设备差异影响 | 探究乳酸化相关风险模型在肝细胞癌中的临床预后评估及非侵入性预测潜力 | 肝细胞癌患者 | 机器学习 | 肝癌 | 多组学分析, 免疫组化, Western blot, 单细胞测序, 超声影像组学 | 风险模型, 影像组学模型 | 转录组, 蛋白质组, 乳酸化修饰组, 单细胞测序数据, 超声图像 | 本地队列及公开肝癌队列(具体数量未提及) | NA | 单细胞测序 | NA | NA |