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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
61 2026-06-14
The immune-cardiovascular metabolic circuitry in myocardial ischemia-reperfusion injury: from metabolic signal release to spatiotemporal reprogramming
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 总结心肌缺血再灌注损伤中免疫-心血管代谢环路的时空重编程机制 将MIRI重新定义为免疫-心脏代谢通讯的时空组织失衡,而非氧化应激与无菌炎症的简单叠加 未提供具体实验数据验证机制,主要基于现有文献总结 阐明MIRI中免疫细胞与心脏细胞代谢信号释放及时空重编程的机制 心肌细胞、冠状动脉微血管内皮细胞、成纤维细胞、驻留心脏巨噬细胞及浸润中性粒细胞、单核细胞/巨噬细胞、淋巴细胞亚群 机器学习 心血管疾病 NA NA 文本 NA NA 单细胞组学, 空间转录组学, 空间代谢组学 NA 单细胞组学、空间转录组学、空间代谢组学及代谢通量分析
62 2026-06-14
Diagnostic value and immune microenvironment regulatory network of metabolic reprogramming in chronic rhinosinusitis with nasal polyps identified by multidimensional transcriptome integration and machine learning
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过多维转录组整合和机器学习,识别慢性鼻窦炎伴鼻息肉中代谢重编程的诊断价值及免疫微环境调控网络 首次系统整合机器学习、单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析,揭示代谢重编程相关基因在CRSwNP诊断中的价值及其与免疫微环境的关联 研究依赖于公共数据库GEO的数据,可能受到数据集偏差和样本量限制的影响;qRT-PCR验证的样本数量有限 探索慢性鼻窦炎伴鼻息肉中代谢重编程的分子机制及其在诊断和免疫微环境调控中的作用 慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者组织样本及基因表达数据 机器学习 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 孟德尔随机化, qRT-PCR 加权基因共表达网络分析, 机器学习算法 基因表达数据, 单细胞转录组数据 GEO数据库中的CRSwNP数据集及独立qRT-PCR验证样本 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
63 2026-06-14
Non-invasive radiogenomic mapping of the SMARCAL1-driven ferroptotic niche is associated with longitudinal MRD-negative surveillance in early-stage NSCLC
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过术前CT影像组学特征构建Rad-Score,非侵入性地映射SMARCAL1驱动的铁死亡免疫微环境,并与早期非小细胞肺癌患者术后持续MRD阴性监测相关 首次将术前影像组学特征与铁死亡驱动的肿瘤微环境空间组织联系起来,并验证其与术后持续MRD阴性的关联,同时通过CRISPR-Cas9敲除和功能实验揭示了SMARCAL1在铁死亡和免疫趋化中的关键作用 单中心回顾性队列研究,样本量有限(n=71),需前瞻性多中心验证 探究术前影像组学特征能否非侵入性地捕捉与术后持续MRD阴性相关的铁死亡富集、免疫活跃的肿瘤微环境空间组织 早期非小细胞肺癌(IB-IIIA期)术后患者 计算机视觉 非小细胞肺癌 CT影像组学, 全外显子测序, 批量RNA-seq, 空间转录组学, 多重免疫荧光, 免疫组化, CRISPR-Cas9敲除 NA 图像, 文本 71例患者(训练队列),14例肿瘤组织(空间转录组学,36,318个高质量空间点),40例多重免疫荧光,60例免疫组化 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组学平台
64 2026-06-14
Tracing the stemness and malignant transition in a heritable colorectal cancer Lynch Syndrome by single-cell RNA-seq analysis
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析遗传性结直肠癌林奇综合征的干性和恶性转变 首次利用单细胞RNA测序和单核RNA测序技术,结合整合计算分析,系统描绘林奇综合征从良性状态到结直肠癌恶性转变过程中癌细胞干性标记物、突变负荷和肿瘤免疫的动态变化图谱 研究样本量较小(仅3例林奇综合征患者的新鲜活检样本和1例冰冻活检样本),可能限制结果的普遍性 探究林奇综合征良性结肠组织向恶性结直肠癌转变过程中的分子和细胞变化 林奇综合征患者的配对新鮮活检组织(癌组织与癌旁组织)以及冰冻活检组织 数字病理学 结直肠癌, 林奇综合征 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 免疫组织荧光染色 NA 单细胞转录组数据, 图像数据 3例林奇综合征患者的配对新鮮癌与癌旁组织,1例林奇综合征患者的冰冻活检组织 NA 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 NA NA
65 2026-06-14
Multisite Assessment of Methods for Cell Preservation Upstream of Single-Cell RNA Sequencing
2026, Journal of biomolecular techniques : JBT
研究论文 多中心评估三种商业细胞保存方法在上游单细胞RNA测序中的性能和可重复性 首次跨平台多中心比较10x Genomics FLEX、Parse Biosciences Evercode WT v2和Honeycomb Bio HIVE三种细胞保存方法在scRNA-seq中的表现 仅使用单一健康个体的样本,可能无法反映不同疾病样本或复杂组织的保存效果 评估固定或冷冻保存方法在单细胞RNA测序前的性能和可重复性 健康个体的总白细胞和外周血单个核细胞(PBMC) 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 单一个体样本,分为白细胞和PBMC两种类型 10x Genomics, Parse Biosciences, Honeycomb Biotech, Illumina 单细胞RNA测序 10x Chromium FLEX, Parse Biosciences Evercode WT v2, Honeycomb Bio HIVE, 10x Genomics 3' v3.1 10x Chromium Single Cell 3' v3.1 (3pGEX) 化学试剂及三种保存方法平台
66 2026-06-14
Integrative Multiomics and Network Pharmacology Exploration of Active Components and Mechanisms of Action of Qufu Shengxin Ointment in Treating Chronic Nonhealing Wounds
2026, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 采用整合多组学和网络药理学方法,探索祛腐生新膏治疗慢性难愈合创面的活性成分与作用机制 首次将多组学分析、网络药理学和孟德尔随机化相结合,系统解析了祛腐生新膏通过PI3K/Akt/mTOR通路调控自噬和免疫炎症促进慢性创面愈合的分子机制,并鉴定出AKR1B1和VCAM1为潜在治疗靶点 主要基于公开数据库和动物实验,缺乏临床样本验证;活性成分与靶点的相互作用需进一步体外实验确认 阐明祛腐生新膏治疗慢性难愈合创面的药理学机制 慢性难愈合创面组织样本及动物模型 机器学习 慢性创面疾病 RNA-seq NA 转录组数据 1274个差异表达基因(来自GEO数据库)及小鼠动物模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
67 2026-06-13
Jinhuang San alleviates plasma cell mastitis by restoring Th17/Treg balance through the HTR7/IL-6/JAK2/STAT3 axis
2026-Oct-28, Journal of ethnopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 探究金黄散通过HTR7/IL-6/JAK2/STAT3轴恢复Th17/Treg平衡缓解浆细胞性乳腺炎的机制 首次揭示金黄散通过调控巨噬细胞中HTR7/IL-6/JAK2/STAT3轴恢复Th17/Treg平衡来治疗浆细胞性乳腺炎的分子机制 缺乏临床样本验证,虚拟HTR7敲除的模拟分析可能无法完全反映体内真实情况 阐明金黄散治疗浆细胞性乳腺炎的作用机制 浆细胞性乳腺炎小鼠模型和巨噬细胞-CD4+ T细胞共培养体系 NA 浆细胞性乳腺炎 转录组测序, 单细胞RNA测序, UPLC-Q-Orbitrap-MS/MS NA 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
68 2026-06-13
LC3B promotes bladder cancer cell proliferation via the Sp1-cyclin D1/p27 axis with pan-cancer clinical associations
2026-Sep, Cellular signalling IF:4.4Q2
研究论文 该研究揭示了LC3B通过Sp1-cyclin D1/p27轴促进膀胱癌细胞增殖的机制,并评估了其在多种癌症中的临床相关性 首次发现LC3B通过非经典自噬途径调控细胞周期,即通过增强Sp1介导的Cyclin D1转录并抑制p27表达,促进G1/S期转换,从而驱动膀胱癌细胞增殖 LC3B的非脂化依赖性功能机制尚未完全阐明,且泛癌分析主要基于转录组数据,缺乏蛋白水平的验证 阐明LC3B在膀胱癌中的表达模式、生物学功能和分子机制,并评估其在多种人类癌症中的临床相关性 膀胱癌上皮细胞以及T24T和J82膀胱癌细胞系 机器学习 膀胱癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 涉及膀胱癌T24T和J82细胞系,以及多种肿瘤类型的泛癌分析数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
69 2026-06-13
The BTN3A3-TOMM22 axis preserves mitochondrial homeostasis to facilitate HCC stemness and drug resistance
2026-Sep-01, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 该研究利用整合组学和实验验证,发现BTN3A3通过与TOMM22相互作用维持线粒体稳态,促进肝癌干性和耐药性,并揭示了pan-BTN3单克隆抗体5E08的潜在治疗价值 首次揭示BTN3A3在肝癌中通过非免疫途径驱动线粒体重编程促进干性和耐药的新机制,并发现TOMM22是BTN3A3的新型相互作用蛋白 未明确说明研究局限性 探究线粒体功能与肝癌干性之间的分子机制,寻找新的治疗靶点 BTN3A3、TOMM22、肝细胞癌(HCC)细胞系、CD90/EpCAM癌症干细胞、原位异种移植模型、患者来源类器官(PDOs) 数字病理学 肝癌 批量转录组学、单细胞转录组学、质谱分析、免疫共沉淀、原位异种移植模型、患者来源类器官 NA 转录组数据、蛋白质相互作用数据 涉及HCC细胞系、原位异种移植模型和患者来源类器官 NA 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq NA NA
70 2026-06-13
Targeting dysregulated glycolysis in type 2 diabetic osteoporosis: Identification of a diagnostic gene signature and therapeutic validation of calcifediol
2026-Sep-01, Life sciences IF:5.2Q1
研究论文 结合生物信息学与实验验证,鉴定2型糖尿病骨质疏松(T2DOP)中与糖酵解失调相关的诊断基因特征,并验证骨化二醇的治疗效果 首次综合运用差异表达分析、WGCNA、113种机器学习算法和scRNA-seq,系统鉴定T2DOP糖酵解相关核心生物标志物,并通过分子对接和体内实验验证骨化二醇的治疗潜力 骨化二醇的临床价值需在后续研究中进一步验证 探究2型糖尿病骨质疏松中糖酵解相关基因的机制,并筛选潜在治疗药物 2型糖尿病骨质疏松患者及T2D小鼠模型 机器学习 2型糖尿病骨质疏松 生物信息学分析、scRNA-seq、分子对接 机器学习模型(113种算法) 基因表达数据、单细胞转录组数据 骨质疏松与2型糖尿病数据集的合并数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
71 2026-06-13
A GPCR atlas across human microglial states in Alzheimer's disease: Insights from snRNA-seq and hiPSC models
2026-Sep, Experimental neurology IF:4.6Q1
综述 系统回顾了2020至2025年间基于人脑组织的snRNA-seq研究,分析了阿尔茨海默病中五种关键小胶质细胞状态的GPCR表达特征,并结合hiPSC模型数据优先筛选出保守的候选GPCR 首次系统整合snRNA-seq与hiPSC衍生小胶质细胞数据,全面解析阿尔茨海默病不同小胶质细胞状态下的GPCR差异表达谱,并筛选出高兴趣的保守GPCR候选靶点 主要基于已发表研究的再分析,可能受原始数据质量和分析流程差异影响;hiPSC模型与真实人脑微环境存在差异,限制了部分发现的直接转化 阐明阿尔茨海默病中小胶质细胞不同状态的GPCR表达特征及潜在功能,为药物研发提供候选靶点 阿尔茨海默病相关的小胶质细胞状态(疾病相关、tau相关、炎症相关、增殖相关和干扰素相关小胶质细胞) 数字病理学 阿尔茨海默病 snRNA-seq, 单细胞测序 NA 基因表达数据, 转录组数据 NA NA 单核RNA测序, 单细胞RNA测序 NA NA
72 2026-06-13
Rheumatoid arthritis synovial fibroblasts promote the glycolysis of myeloid-derived suppressor cells via TREM1/mTOR axis
2026-Sep-01, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示类风湿关节炎中成纤维样滑膜细胞通过TREM1/mTOR轴促进髓系抑制细胞糖酵解的机制 首次阐明TREM1信号在介导成纤维样滑膜细胞与髓系抑制细胞交互作用中的关键角色,并揭示其通过PI3K-AKT-mTOR-HIF-1α级联驱动糖酵解重编程的机制 未提供明显局限性信息 探究类风湿关节炎中髓系抑制细胞代谢重编程的驱动因素及调控机制 类风湿关节炎患者的髓系抑制细胞和成纤维样滑膜细胞(MH7a细胞) 机器学习和数字病理学 类风湿关节炎 单细胞RNA测序、流式细胞术、空间转录组学、细胞外酸化率检测、葡萄糖摄取和乳酸生成检测 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据、代谢检测数据 未明确说明样本数量 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium用于单细胞RNA测序,10x Visium用于空间转录组学分析
73 2026-06-13
Tepraloxydim metabolite exposure disrupts placental function revealed by single-cell sequencing and metabolomics
2026-Aug-20, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究结合单细胞RNA测序和代谢组学,系统探究除草剂tepraloxydim代谢物DMP对小鼠胎盘细胞组成、转录程序和代谢稳态的影响 首次系统揭示DMP通过代谢重编程和细胞命运改变破坏胎盘结构与功能的机制 未提及,摘要中无相关信息 探究DMP对胎盘发育的影响及其潜在机制 小鼠胎盘组织 数字病理学 妊娠相关疾病 单细胞RNA测序, 代谢组学 无特定模型 表达谱数据, 代谢物数据 小鼠模型,具体样本数量未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
74 2026-06-13
Inferring gene regulatory networks via adversarially regularized directed graph autoencoder
2026-Aug, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society IF:6.0Q1
研究论文 提出通过对抗正则化有向图自编码器推断基因调控网络的方法 结合一阶和二阶邻近度捕获复杂拓扑结构,并通过对抗训练策略将目标向量正则化为基因表达数据的先验分布,以保持生物统计特性 未明确指出具体限制,但可能依赖于高质量的训练数据和网络拓扑假设 开发一种能够处理基因调控网络复杂拓扑和非同分布基因表达数据的新型推断方法 基因调控网络、基因表达数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 有向图自编码器、生成对抗网络 基因表达数据 DREAM5数据集和七个单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
75 2026-06-13
scDCL: A multi-view single-cell RNA sequencing clustering method based on dual contrastive learning
2026-Aug, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2
研究论文 提出一种名为scDCL的多视图单细胞RNA测序聚类方法,通过双对比学习整合ZINB掩码自编码器、图神经网络和双对比学习,以同时捕捉细胞内在特征和全局结构特征 首次将ZINB掩码自编码器、图神经网络和双对比学习集成在一个统一框架中,通过多视图特征生成和双重对比损失来增强聚类紧凑性和分离性,同时保持结构一致性 未提及具体的局限性 解决单细胞RNA-seq数据中高稀疏性、强非线性和极端维度带来的聚类挑战,提高聚类性能 单细胞RNA测序数据中的细胞群体 机器学习 NA scRNA-seq ZINB掩码自编码器、图神经网络、双对比学习 基因表达数据 多个公开数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
76 2026-06-13
GLUL drives metabolic reprogramming and confers docetaxel resistance in prostate cancer
2026-Aug, Biochemical pharmacology IF:5.3Q1
研究论文 该论文发现谷氨酸-氨连接酶(GLUL)驱动前列腺癌代谢重编程并导致多西他赛耐药 首次将GLUL确定为多西他赛耐药的关键代谢驱动因子,并揭示谷氨酰胺合成作为去势抵抗性前列腺癌(CRPC)中可药用的脆弱点 未提及具体局限性 探索前列腺癌中多西他赛耐药的代谢决定因素及GLUL的作用机制 前列腺癌临床样本、细胞系及异种移植模型 机器学习和数字病理的交叉领域 前列腺癌 转录组学、代谢组学、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、代谢物数据 临床样本及独立队列验证 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 用于单细胞RNA测序的10x Chromium平台
77 2026-06-13
Single-cell RNA sequencing unveils CD8+ T cell heterogeneity in the diffuse large B-cell lymphoma microenvironment: A systematic review
2026-Aug, Critical reviews in oncology/hematology
系统综述 通过单细胞RNA测序揭示弥漫大B细胞淋巴瘤微环境中CD8+ T细胞的异质性 首次系统性整合单细胞RNA测序研究,构建了弥漫大B细胞淋巴瘤中CD8+ T细胞的动态耗竭轨迹图谱,发现了Tpex亚群与预后的关联以及CXCR5+TCF7+ S1亚群对化疗敏感性的预测作用 未进行荟萃分析,仅基于定性系统综述; 需要未来多中心研究验证CD58和CD8-fit等新靶点 系统综述单细胞RNA测序研究以刻画弥漫大B细胞淋巴瘤中CD8+ T细胞的异质性及其临床意义 弥漫大B细胞淋巴瘤肿瘤微环境中的CD8+ T细胞 自然语言处理 弥漫大B细胞淋巴瘤 单细胞RNA测序 不适用 基因表达数据 18项合格研究,具体样本量未说明 不适用 不适用 不适用 不适用
78 2026-06-13
Loss of foxp3a drives sex-specific immune-metabolic remodeling across the gut-liver-gonad axis in zebrafish
2026-Aug, Fish & shellfish immunology IF:4.1Q1
研究论文 研究发现foxp3a缺失导致斑马鱼肠道-肝脏-性腺轴出现性别特异性免疫代谢重塑 首次证明foxp3a是哺乳动物FOXP3的功能性斑马鱼同源物,并揭示其在性别差异性黏膜免疫调控中的关键作用 未明确说明研究局限性 探究foxp3a在性别和器官间免疫代谢调控中的差异作用 foxp3a缺失的斑马鱼模型 机器学习 NA 单细胞RNA测序、转录组分析、微生物组分析、多组学整合分析 NA 基因表达数据、微生物组数据 未明确说明样本数量 10x Genomics 单细胞RNA测序、批量RNA测序 10x Chromium 用于肠道黏膜细胞的单细胞RNA测序
79 2026-06-13
STING Drives Psoriatic Inflammation by Promoting Neutrophil Recruitment and Facilitating NETosis
2026-Jul, Immunology IF:4.9Q2
研究论文 研究了STING通路在银屑病中通过促进中性粒细胞募集和NETosis驱动炎症的机制 首次揭示STING在银屑病中性粒细胞中直接调控NET形成及细胞募集的双重作用,并发现小鼠品系间STING通路激活的差异 小鼠模型与人类银屑病的差异性,以及品系特异性差异提示通路调控的复杂性,可能影响个体化治疗响应 阐明STING在中性粒细胞介导的银屑病炎症中的具体作用机制 银屑病患者皮损和血液中性粒细胞、IMQ处理的小鼠模型(野生型、STING-/-、PADi4-/-)、HL-60细胞 数字病理学 银屑病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 人类银屑病皮损和血液中性粒细胞样本、小鼠模型样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
80 2026-06-13
Silencing Adamts2 attenuates fibroblast-mediated fibrosis and promotes axonal regeneration in an in vitro model
2026-Jul, Cellular signalling IF:4.4Q2
研究论文 通过单细胞测序数据分析小鼠脊髓损伤后成纤维细胞的变化,筛选出特异性高表达基因Adamts2,并验证其沉默可减轻纤维化并促进轴突再生 首次利用单细胞测序数据鉴定出Adamts2在脊髓损伤后成纤维细胞中特异性高表达,并证明沉默Adamts2可通过上调神经营养因子激活AKT和ERK信号通路,减轻纤维化并促进轴突再生 该研究仅基于体外模型,缺乏体内验证,且机制研究未完全阐明Adamts2在体内微环境中的具体作用路径 探索抑制Adamts2能否减轻成纤维细胞介导的纤维化,并促进中枢神经损伤后的轴突再生 小鼠脊髓成纤维细胞和运动神经元 数字病理学 脊髓损伤 单细胞测序,RNA干扰 NA 基因表达数据 未提及具体样本量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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