单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 33397 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-11-30 |
Pan-cancer NK cell-related immunotherapy signatures for predicting PD-1 treatment response
2025-Nov-21, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000045753
PMID:41305714
|
研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA-seq数据构建了泛癌自然杀伤细胞免疫治疗预测模型NKCIPM | 首次建立基于NK细胞的泛癌免疫治疗预测模型，识别了7个关键枢纽基因和188个NK细胞差异表达基因 | 研究样本量相对有限(164个样本)，仅涵盖6种癌症类型 | 预测PD-1免疫治疗反应并指导临床决策 | 多种癌症类型的肿瘤样本和NK细胞 | 机器学习 | 泛癌研究 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | 机器学习算法 | RNA测序数据 | 164个样本，涵盖6种癌症类型 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 62 | 2025-11-30 |
S100A12 as a key biomarker in a neutrophil-associated gene prediction model for sepsis diagnosis
2025-Nov-21, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000046140
PMID:41305822
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据和机器学习方法开发了脓毒症诊断模型，并确定S100A12为关键生物标志物 | 首次结合113种机器学习框架和SHAP分析识别脓毒症关键驱动基因，发现基于4个中性粒细胞相关基因的随机森林模型具有优越诊断性能 | 研究依赖于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 开发脓毒症诊断模型并识别关键生物标志物 | 脓毒症患者和健康对照的外周血样本 | 机器学习 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | 随机森林 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 63 | 2025-11-30 |
Applications of Genome-wide Screening of CRISPR/Cas9 Knockout Library in Identifying Novel Molecular Targets for Xenobiotics
2025-Nov-21, Environment & health (Washington, D.C.)
DOI:10.1021/envhealth.5c00072
PMID:41306301
|
综述 | 本文综述了全基因组CRISPR/Cas9敲除库筛选在识别外源性物质新型分子靶点中的应用 | 系统总结了CRISPR/Cas9文库筛选技术在外源性致病因子机制研究中的创新应用，包括与单细胞测序和类器官技术的结合 | 未提及具体实验数据或案例研究的局限性 | 探讨全基因组CRISPR/Cas9敲除库筛选在识别外源性物质分子靶点中的应用价值 | 外源性致病因子（环境致癌物、病原体、化学污染物） | 基因组编辑技术 | 肿瘤、感染性疾病、中毒性疾病 | CRISPR/Cas9基因组编辑、单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 全基因组筛选、单细胞测序 | NA | NA |
| 64 | 2025-11-30 |
All-Trans Retinoic Acid Impacts Early Palatal Shelves Development via the Wnt and TGF-β Signaling Pathways
2025-Nov-20, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13112836
PMID:41301924
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术探究全反式维甲酸通过Wnt和TGF-β信号通路影响早期腭板发育的机制 | 首次在E12.5胚胎期使用10x单细胞测序技术分析atRA对腭板发育的影响，并发现Ppp1r14b基因是atRA作用的关键介质 | 研究仅聚焦于E12.5特定发育阶段，未涵盖腭板发育全过程 | 阐明全反式维甲酸诱导腭裂的分子机制 | C57BL/6小鼠胚胎腭板组织 | 发育生物学 | 腭裂 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, Western blot | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据, 蛋白质数据 | C57BL/6小鼠对照组和atRA暴露组 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x单细胞测序分析 |
| 65 | 2025-11-30 |
Harnessing Single-Cell RNA-Seq for Computational Drug Repurposing in Cancer Immunotherapy
2025-Nov-20, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph18111769
PMID:41305010
|
综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序数据进行计算药物重定位在癌症免疫治疗中的应用 | 强调利用单细胞RNA测序技术精确靶向肿瘤微环境中癌症驱动细胞成分，并展示scDrug和scDrugPrio两种工具在食管鳞癌数据集中的应用 | 当前方法主要基于单细胞转录组数据，尚未整合多组学和空间转录组数据 | 通过计算药物重定位方法识别能与免疫检查点抑制剂联合使用以增强治疗反应的候选药物 | 食管鳞状细胞癌数据集和肿瘤微环境中的不同细胞类型 | 生物信息学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | scDrug, scDrugPrio | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 66 | 2025-11-30 |
Integrated Pan-Cancer Analysis and Experimental Verification of the Roles of Retinoid-Binding Proteins in Breast Cancer
2025-Nov-19, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17223706
PMID:41301068
|
研究论文 | 通过整合性泛癌分析和实验验证，探讨视黄醇结合蛋白在乳腺癌中的作用 | 首次进行视黄醇结合蛋白的泛癌综合分析，并结合单细胞RNA测序技术研究其在肿瘤微环境中的表达特征 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分相对有限，需要进一步的功能机制研究 | 系统分析视黄醇结合蛋白在不同癌症类型中的表达特征和预后价值 | 多种癌症类型中的视黄醇结合蛋白，特别关注RBP4和RBP7在乳腺癌中的作用 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析,Kaplan-Meier生存分析,Cox回归分析 | NA | 基因表达数据,临床数据 | 基于癌症基因组图谱(TCGA)的多癌种数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 67 | 2025-11-30 |
Neural Cues and Genomic Clues: NGS Insights into Neurogenic Sarcopenia and Muscle Atrophy
2025-Nov-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262211185
PMID:41303670
|
综述 | 本文通过整合下一代测序和多组学数据，系统回顾神经源性肌少症的分子机制和转化应用前景 | 首次系统整合NGS和多组学证据揭示神经源性肌少症的分子网络，并提出精准防治新策略 | 基于叙述性综述方法，可能存在文献选择偏倚，缺乏定量荟萃分析 | 阐明神经源性肌少症的分子机制并探索诊断和治疗转化机会 | 人类和动物研究中与神经肌肉功能相关的组学和生理学数据 | 生物信息学 | 老年疾病 | 下一代测序(NGS), 基因组学, 转录组学, 表观基因组学, 单细胞测序, 空间转录组学 | 人工智能 | 基因组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多组学 | NA | NA |
| 68 | 2025-11-30 |
Integrated Transcriptomic Analysis of S100A8/A9 as a Key Biomarker and Therapeutic Target in Sepsis Pathogenesis and AI Drug Repurposing
2025-Nov-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262211186
PMID:41303672
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和RNA测序方法，揭示S100A8/A9在脓毒症发病机制中的关键作用，并利用AI模型进行药物重定位研究 | 整合单细胞和批量RNA测序技术解析S100A8/A9在脓毒症中的作用机制，并首次应用预训练AI模型PLAPT进行药物重定位预测 | NA | 阐明S100A8/A9在脓毒症发病机制中的作用并探索其作为治疗靶点的潜力 | 脓毒症相关的免疫细胞和分子通路 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序,RNA测序,分子对接,分子动力学分析 | PLAPT AI模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
| 69 | 2025-11-30 |
Multimodal Integration of Genomic Data Reveals Regulatory Mechanisms at the Polycystic Ovary Syndrome (PCOS)-Associated 12q13.2 Locus
2025-Nov-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262211184
PMID:41303667
|
研究论文 | 通过整合多种基因组数据揭示多囊卵巢综合征相关12q13.2位点的调控机制 | 首次整合WES、STARR-seq和scRNA-seq三种互补数据集，系统解析PCOS相关12q13.2位点的功能机制 | 研究主要聚焦于12q13.2特定基因座，可能未涵盖PCOS的其他遗传因素 | 阐明多囊卵巢综合征相关12q13.2基因座的调控机制和功能验证 | 多囊卵巢综合征患者和正常对照者的卵泡膜细胞 | 基因组学 | 多囊卵巢综合征 | 全外显子测序,STARR-seq,单细胞RNA测序,全基因组测序,eQTL共定位分析 | NA | 基因组数据,增强子活性数据,单细胞表达数据 | PCOS和正常卵泡膜细胞样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq,全外显子测序,全基因组测序 | NA | NA |
| 70 | 2025-11-30 |
Research Progress Regarding the Use of Single-Cell Sequencing Technology in Analyzing Tumor Endothelial Cell Pathophysiology
2025-Nov-18, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262211128
PMID:41303611
|
综述 | 本文综述单细胞测序技术在肿瘤血管内皮细胞异质性研究中的应用进展 | 整合单细胞组学领域发现，从基因和细胞层面系统分析肿瘤内皮细胞异质性的共性与特性 | NA | 阐明肿瘤血管内皮细胞的异质性特征，为精准肿瘤治疗提供见解 | 肿瘤血管内皮细胞 | 单细胞组学 | 肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞组学数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 71 | 2025-11-30 |
Enhancing RNA Capture Efficiency in Spatial Transcriptomics: A Review of Innovative Technologies and Strategies
2025-Nov-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262211076
PMID:41303559
|
综述 | 系统回顾了提高空间转录组学RNA捕获效率的创新技术与策略 | 重点分析了纳米材料增强捕获、微流控芯片优化、分子生物学技术进展及计算辅助预测等创新方法 | NA | 提高空间转录组学中RNA捕获效率 | 空间转录组学技术 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学, 计算预测, 人工智能 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | Decoder-seq, Stereo-seq V2, MAGIC-seq, MSN-seq | 福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)临床样本优化方法 |
| 72 | 2025-11-30 |
From CMS to iCMS/IMF: Developing Roadmap to Precision Therapy in Colorectal Cancer
2025-Nov-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262211086
PMID:41303568
|
综述 | 本文回顾了结直肠癌分类从CMS到iCMS/IMF系统的演变，探讨了其在精准治疗中的应用前景 | 提出了结合iCMS/IMF框架的精准医疗路线图，整合病理学、分子诊断和治疗映射 | NA | 为结直肠癌精准治疗制定发展路线图 | 结直肠癌分子分型系统及其治疗应用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学、空间转录组学、分子分型 | NA | RNA测序数据、FFPE样本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 73 | 2025-11-30 |
An Integrated Multi-Omics Analysis Identifies Oxeiptosis-Related Biomarkers in Diabetic Retinopathy
2025-Nov-15, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13112789
PMID:41301882
|
研究论文 | 通过整合多组学分析鉴定糖尿病视网膜病变中与氧化凋亡相关的生物标志物 | 首次将氧化凋亡通路与糖尿病视网膜病变联系起来，并采用多组学整合分析框架识别因果基因 | 研究样本量相对有限，需要进一步实验验证候选基因的功能机制 | 探索糖尿病视网膜病变的早期生物标志物和潜在治疗靶点 | 糖尿病视网膜病变患者和对照人群的血液样本、人视网膜微血管内皮细胞 | 生物信息学 | 糖尿病视网膜病变 | 转录组分析、孟德尔随机化、机器学习特征选择、单细胞RNA测序 | SVM-RFE, Boruta算法 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 转录组数据：69例DR患者 vs 50例对照；单细胞数据：GSE165784数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组分析 | NA | NA |
| 74 | 2025-11-30 |
Biomarker Identification via Spatial Transcriptomics Profiling of Colorectal Cancer and Colorectal Cancer with Liver Metastasis Stem Cells
2025-Nov-14, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262211045
PMID:41303528
|
研究论文 | 通过空间转录组学分析结直肠癌及其肝转移干细胞，鉴定出CCN2作为关键生物标志物并验证其功能 | 首次结合空间转录组学技术系统分析结直肠癌原发灶和肝转移灶中癌症干细胞的分子特征，发现CCN2在原发性结直肠癌干细胞中特异性富集 | APOC2在肝转移干细胞中的作用尚未完全验证，需要进一步机制研究阐明CCN2的分子通路 | 鉴定结直肠癌干细胞相关生物标志物并评估其在癌症进展中的功能相关性 | 正常结肠黏膜、原发性结直肠癌组织和肝转移组织 | 空间转录组学 | 结直肠癌 | 空间转录组学分析，CRISPR-Cas9基因编辑，免疫组织化学分析 | NA | 空间转录组数据，组织微阵列图像 | 正常结肠黏膜、原发性结直肠癌和肝转移组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 75 | 2025-11-30 |
GPU-accelerated, self-optimizing processing for 3D multiplexed iterative RNA-FISH experiments
2025-Nov-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.10.681751
PMID:41279966
|
研究论文 | 开发GPU加速的计算框架merfish3d-analysis，用于加速基于成像的空间转录组学数据处理 | 提出GPU加速计算框架量化轴向采样变化导致的信息损失，并设计针对死后人类样本的自发荧光淬灭方案 | 未明确说明样本数量的统计意义和框架在其他组织类型的适用性 | 加速基于成像的空间转录组学实验的计算处理并提高数据质量 | 模拟成像实验、公开MERFISH数据集、死后人类嗅球样本 | 空间转录组学 | NA | 多重错误鲁棒荧光原位杂交(MERFISH) | GPU加速计算框架 | 3D成像数据 | 未明确指定具体样本数量 | NA | 空间转录组学,荧光原位杂交 | NA | merfish3d-analysis计算框架 |
| 76 | 2025-11-30 |
Redefining the Diagnostic and Therapeutic Landscape of Non-Small Cell Lung Cancer in the Era of Precision Medicine
2025-Nov-12, Journal of clinical medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jcm14228021
PMID:41303058
|
综述 | 本文综述了精准医学时代下非小细胞肺癌诊断与治疗领域的最新进展 | 整合液体活检、放射组学分析、AI多模态平台等新型诊断策略，结合多组学技术和机器学习优化预测模型 | 临床获益仍限于特定分子亚型，治疗耐药性问题尚未完全解决 | 改善非小细胞肺癌的早期检测、动态监测和个性化治疗策略 | 非小细胞肺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序、空间转录组学、蛋白质组学、液体活检、放射组学分析 | 机器学习模型 | 多模态数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 77 | 2025-11-30 |
Dietary Modulation of the Enteric Nervous System: From Molecular Mechanisms to Therapeutic Applications
2025-Nov-11, Nutrients
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/nu17223519
PMID:41305570
|
综述 | 本文系统探讨了膳食成分对肠神经系统（ENS）的调控作用，从分子机制到治疗应用 | 首次系统整合膳食成分对ENS的调控机制，并提出精准医学和先进工具的未来研究方向 | 主要依赖啮齿动物模型、人类ENS机制不明确、干预措施不够精确 | 探讨膳食成分调控肠神经系统的分子机制及治疗应用前景 | 肠神经系统（包括肌间神经丛和粘膜下神经丛）及其细胞成分（肠神经元和肠胶质细胞） | 神经胃肠病学 | 胃肠道疾病 | 单细胞测序、靶向递送系统 | NA | 文献综述数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 78 | 2025-11-30 |
Magrolimab (Hu5F9-G4) promotes macrophage M1 polarization and is associated with enhanced autophagy in colorectal cancer
2025-Nov-10, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102598
PMID:41218551
|
研究论文 | 本研究探讨巨噬细胞免疫检查点抑制剂Hu5F9-G4通过促进巨噬细胞M2d向M1极化并增强自噬抑制结直肠癌进展的机制 | 首次揭示Hu5F9-G4通过调控自噬通路促进巨噬细胞极化转变，并鉴定CDKN1A和MAP1LC3B作为潜在治疗靶点 | 样本量相对有限（73例CRC样本），需要更大规模临床研究验证 | 研究巨噬细胞免疫检查点抑制剂对结直肠癌免疫微环境和肿瘤进展的影响 | 结直肠癌样本、巨噬细胞、结直肠癌细胞系、荷瘤小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组分析、生物信息学分析、体外细胞实验、体内动物实验 | 动物疾病模型、细胞模型 | 转录组数据、临床数据、实验数据 | 73例CRC样本，体外和体内实验样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 79 | 2025-11-30 |
Rewriting the Fate of Cancer: Epigenetic and Epitranscriptomic Regulators in the Metastatic Cascade
2025-Nov-10, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15111573
PMID:41301491
|
综述 | 本文综述了表观遗传和表观转录调控在癌症转移过程中的作用机制 | 系统整合DNA甲基化、RNA修饰和非编码RNA在转移级联中的相互作用机制 | NA | 探讨表观遗传和表观转录调控在癌症转移中的作用 | 癌症转移过程中的表观遗传和表观转录调控机制 | 表观遗传学 | 癌症 | 多组学方法、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 80 | 2025-11-30 |
MiRNAs in Poultry Health and Production: Progress and Challenges
2025-Nov-07, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani15223230
PMID:41301939
|
综述 | 本文全面概述了miRNAs在家禽健康与生产中的功能机制研究进展及面临的挑战 | 系统整合了不同家禽物种中miRNAs的鉴定验证进展及其在经济性状调控中的具体作用，并探讨了人工智能、基因编辑和单细胞测序等前沿技术带来的机遇 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据，主要基于现有文献进行归纳总结 | 阐明miRNAs在家禽生物学过程中的调控作用及其在农业生产中的应用潜力 | 鸡、鹅、火鸡、鹌鹑和鸭等家禽物种 | 自然语言处理 | NA | 单细胞测序、基因组编辑 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |