单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 32827 篇文献,本页显示第 61 - 80 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
61 2025-11-20
A parabrachial hub for need-state control of enduring pain
2025-Nov, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究揭示了表达神经肽Y受体Y1的臂旁核神经元在持续性疼痛调控中的枢纽作用 首次发现臂旁核Y1R神经元作为内源性镇痛枢纽,能够被饥饿、口渴等生理需求状态抑制 研究主要聚焦于臂旁核特定神经元群体,对其他疼痛调控通路的探索相对有限 探索持续性疼痛的中枢调控机制 小鼠臂旁核表达Y1受体的神经元 神经科学 慢性疼痛 空间转录组学, 神经操作, 活动记录, 计算建模 计算模型 基因表达数据, 神经活动记录 NA NA 空间转录组学 NA NA
62 2025-11-20
NK Cell-Derived Small Extracellular Vesicles Armed With CLDN4-Targeting Peptides Potentiate Radiotherapy in Gastric Cancer
2025-Nov, Journal of extracellular vesicles IF:15.5Q1
研究论文 本研究开发了一种靶向CLDN4的NK细胞来源小细胞外囊泡纳米材料NESC,可增强胃癌放疗效果 首次将NK细胞来源的小细胞外囊泡与CLDN4靶向肽结合,创建具有放射增敏作用的新型纳米治疗平台 研究主要基于患者来源类器官模型,尚未进行大规模临床试验验证 开发针对胃癌的靶向治疗系统以增强放疗效果 胃癌细胞、患者来源类器官模型和类器官来源异种移植模型 癌症治疗 胃癌 单细胞RNA测序、蛋白质组学分析、多模态成像 NA 单细胞RNA测序数据、蛋白质组数据、影像数据 多个单细胞RNA测序数据集和患者来源类器官模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
63 2025-11-02
Duplicated genes find their space: Spatial transcriptomics illuminates evolutionary fates
2025-Oct-31, The Plant cell
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
64 2025-11-20
Tertiary lymphoid structures support the development of allergen-specific progenitor CD4+ T cells
2025-Oct-05, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了肺脏三级淋巴结构在过敏原特异性CD4+ T细胞发育中的关键作用 首次发现三级淋巴结构作为组织前体细胞巢支持TCF1+前体CD4+ T细胞的发育,并阐明其空间分布特征 研究主要聚焦于屋尘螨诱导的肺部过敏模型,在其他疾病模型中的普适性需进一步验证 探究过敏原特异性CD4+ T细胞在组织中的异质性发育机制 屋尘螨暴露后肺脏中的过敏原特异性CD4+ T细胞 免疫学 过敏性疾病 转录组分析,流式细胞术,共聚焦显微镜,空间转录组学 NA 基因表达数据,细胞表型数据,空间定位数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
65 2025-11-20
Comparative transcriptomics reveals shifts in cortical architecture at the metatherian/eutherian transition
2025-Oct-05, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过比较转录组学揭示后兽类与真兽类过渡时期大脑皮层结构的变化 首次结合单核RNA测序和空间转录组学比较后兽类与真兽类大脑皮层细胞类型和分层结构的差异 仅研究了初级视觉皮层,样本物种数量有限 探究后兽类与真兽类分支时期大脑皮层柱状结构是否发生改变 后兽类和真兽类哺乳动物的初级视觉皮层 转录组学 NA 单核RNA测序,空间转录组学 NA 基因表达数据,空间转录组数据 两个物种的初级视觉皮层样本 NA 单核RNA测序,空间转录组学 NA NA
66 2025-11-20
Single-cell nanodroplet processing proteomics pipeline for analysis of human-derived microglia
2025-Oct-04, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 开发了一种用于人源小胶质细胞单细胞蛋白质组学分析的纳米液滴处理流程 首次建立了基于FACS分离、冷冻保存和纳米液滴处理的单细胞质谱蛋白质组学工作流程,能够从单个小胶质细胞中平均鉴定1039种蛋白质 初步研究数据仅部分重现了先前已知的小胶质细胞亚型,样本规模有限 探索脑小胶质细胞在细胞水平的异质性 人脑皮层来源的小胶质细胞 蛋白质组学 阿尔茨海默病和其他神经系统疾病 单细胞质谱蛋白质组学,FACS,纳米液滴处理 NA 蛋白质组数据 未明确具体样本数量 NA 单细胞蛋白质组学 NA 基于纳米液滴处理的单细胞质谱分析平台
67 2025-11-20
Medium-Chain Fatty Acid exposure in non-transformed mammary glands leads to pro-tumorigenic alterations associated with aging
2025-Oct-03, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序发现中链脂肪酸暴露会导致非转化乳腺组织出现类似衰老的前肿瘤性改变 首次揭示中链脂肪酸辛酸通过改变细胞间连接和细胞外基质相互作用,诱导乳腺组织产生与衰老相关的前肿瘤性变化 研究主要关注非转化乳腺组织,未在肿瘤模型中验证这些变化对癌症发展的直接影响 探索乳腺局部环境中影响乳腺癌发生的病因学和生物学因素 非转化乳腺组织 单细胞测序分析 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
68 2025-11-20
Persistent interferon signaling and clonal expansion mark early events in DNA methylation damage-induced liver cancer
2025-Oct-03, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过多组学分析揭示了NDMA诱导肝癌的早期分子事件,包括持续性干扰素信号和克隆扩增 首次发现DNA甲基化损伤诱导的持续性干扰素信号与克隆扩增是肝癌发生的早期标志事件 研究基于小鼠模型,需要在人类样本中进一步验证 阐明NDMA诱导肝癌进展的分子机制 野生型和MGMT缺陷型小鼠 多组学分析 肝癌 磷酸化蛋白质组学,转录组学,空间转录组学 NA 分子表型数据,转录组数据,磷酸化蛋白质组数据 NA NA 空间转录组学,转录组分析,磷酸化蛋白质组分析 NA NA
69 2025-11-20
Latent plasticity of the human pancreas across development, health, and disease
2025-Oct-03, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 构建了人类胰腺的单细胞多组学图谱,涵盖发育、健康和疾病状态 识别了成人中具有胎儿样特征的可塑性中央腺泡样细胞,揭示了HNF1A定义的β细胞表观遗传状态 样本量相对有限(57名供体),未涵盖所有胰腺疾病类型 解析人类胰腺的细胞多样性和可塑性机制 人类胰腺细胞 单细胞多组学 2型糖尿病 单细胞/单核RNA测序,单核ATAC测序,VASA测序,空间转录组学,多重蛋白质组学 NA 单细胞多组学数据,空间转录组数据,蛋白质组数据 57名供体的超过400万个细胞和细胞核 10x Genomics 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序,单细胞多组学,空间转录组学 10x Chromium,10x Xenium 10x Xenium空间转录组平台,CODEX多重蛋白质组分析
70 2025-11-20
A conserved logic for the development of cortical layering in tetrapods
2025-Oct-02, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过识别蝾螈端脑中的分层神经元,揭示了四足动物皮层发育的保守机制 首次在传统认为无层的两栖动物端脑中发现分层神经元,并揭示哺乳动物皮层从外向内发育模式的进化起源 研究主要基于蝾螈模型,在其他四足动物中的普适性需要进一步验证 探究大脑皮层分层结构的进化起源和发育机制 蝾螈端脑神经元 神经发育生物学 NA 谱系追踪,scRNA-seq NA 单细胞基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
71 2025-11-20
Integrative analysis of spatiotemporal transcriptomics delineates dynamic cell states in squamous tumorigenesis
2025-Oct-02, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过整合分析时空转录组数据揭示鳞状肿瘤发生过程中的动态细胞状态 首次在鳞状肿瘤发生连续谱系中整合单细胞和空间转录组学数据,揭示上皮细胞转录组的早期持续变化 研究样本数量有限,主要基于小鼠和人类口腔鳞状上皮数据 探索鳞状细胞癌治疗抵抗机制及其在癌前病变阶段的起源 小鼠和人类口腔鳞状上皮组织,涵盖从最早癌前阶段到浸润性癌的连续过程 空间转录组学 头颈部鳞状细胞癌 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
72 2025-11-20
Photolabile oligonucleotides combined with topologically imposed light gradients enable spatially resolved single-cell transcriptomics and epigenomics
2025-Oct-02, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 开发了一种名为scSTAMP-seq的空间分辨单细胞转录组和表观基因组分析技术 使用胆固醇标记的光不稳定寡核苷酸结合拓扑光梯度,在组织解离前通过空间光图案标记细胞位置 未明确说明样本量限制或技术适用范围 开发能够同时保留空间信息的单细胞转录组和表观基因组分析方法 活细胞和组织中的单个细胞 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序, 单细胞表观基因组测序 NA 转录组数据, 表观基因组数据, 空间位置信息 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 板式方法, 液滴方法 可整合多种下游单细胞测序技术
73 2025-11-20
scGPD: single-cell informed gene panel design for targeted spatial transcriptomics
2025-Oct-02, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出一种基于深度学习的基因面板设计框架scGPD,利用单细胞RNA-seq数据为靶向空间转录组学选择紧凑且非冗余的基因集合 采用基因-基因相关性感知的门控机制,从数据中提取信息特征,鼓励所选基因的多样性并消除冗余 NA 为靶向空间转录组学技术设计信息丰富的基因面板 单细胞RNA-seq数据和空间转录组学数据 生物信息学 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 深度学习 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
74 2025-11-20
Mechanisms of Sepsis From a Metabolic Immunology Perspective: A Bidirectional Mendelian Randomization and Single-Cell Sequencing Study of CD39 + Cells
2025-Oct-01, Shock (Augusta, Ga.)
研究论文 本研究通过双向孟德尔随机化和单细胞测序分析,探讨了CD39+细胞在脓毒症发病机制中的代谢免疫作用 首次整合双向孟德尔随机化和单细胞转录组学方法,揭示CD39+CD8+T细胞通过代谢中间产物如雄酮硫酸盐驱动脓毒症进展的机制 研究样本量相对有限,需要进一步验证代谢物与免疫表型之间的因果关系 研究脓毒症发病机制中免疫表型与代谢物之间的相互作用 脓毒症患者与对照组的免疫细胞,特别是CD39+CD8+T细胞 生物信息学 脓毒症 双向孟德尔随机化,单细胞RNA测序 MR分析,单细胞聚类分析 基因组关联研究数据,代谢组数据,单细胞转录组数据 11,643例脓毒症病例,GSE167363数据集(脓毒症vs对照组) NA 单细胞RNA测序 NA NA
75 2025-11-20
Single-Cell Sequencing Identifies the Crucial Role of Mitochondrial Fission-Fusion Imbalance in Heart Failure Progression
2025-Oct, Journal of cardiovascular translational research IF:2.4Q3
研究论文 通过单细胞测序比较病理性和生理性心脏肥大的分子机制差异,揭示线粒体融合/分裂失衡在心力衰竭进展中的关键作用 首次在单细胞水平系统比较病理性和生理性心脏肥大的线粒体动态变化,发现融合/分裂比率的时间动态变化是决定心脏命运的关键因素 研究主要基于动物模型,需要进一步验证在人类心脏疾病中的适用性 阐明病理性和生理性心脏肥大的分子机制差异,揭示心力衰竭的发病机制 TAC诱导的病理性心脏肥大和运动诱导的生理性心脏肥大小鼠模型 单细胞生物学 心血管疾病 单细胞转录组测序, bulk转录组测序 NA 转录组数据 多个时间点(2周、5-8周、11周)的小鼠心脏组织样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
76 2025-11-20
PFKFB3 Promotes Myofibroblast Differentiation and Cardiac Fibrosis Through its Intra- and Extra- Cellular Roles
2025-Oct, Journal of cardiovascular translational research IF:2.4Q3
研究论文 本研究揭示了PFKFB3通过细胞内糖酵解调控和细胞外信号传导双重机制驱动心肌纤维化的新机制 首次发现PFKFB3通过细胞内糖酵解调控和细胞外信号传导双重作用促进心肌纤维化 NA 探究PFKFB3在心肌纤维化发病机制中的作用 心肌成纤维细胞、心肌病患者、小鼠模型 单细胞测序 心肌病 单细胞RNA测序, Western blot, ELISA NA 基因表达数据, 蛋白质数据 心肌病患者和小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
77 2025-11-20
Single-Cell RNA-Seq Dissects Specific Marker in Glioblastoma Based on Gene Regulatory Networks
2025-Oct, Iranian journal of biotechnology IF:1.6Q4
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序数据构建基因调控网络,揭示胶质母细胞瘤的分子异质性并识别预后生物标志物 首次结合单细胞RNA测序与基因调控网络分析胶质母细胞瘤亚型特异性调控机制,发现GATA3作为新型预后标志物 研究样本量有限,需进一步验证GATA3的临床适用性 解析胶质母细胞瘤异质性调控机制并发现预后生物标志物 胶质母细胞瘤恶性细胞 生物信息学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序,基因调控网络分析,拷贝数变异推断,差异表达分析 共识聚类,转录因子-基因共表达网络 单细胞RNA测序数据,批量RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
78 2025-11-20
Multiscale Hyperbolic Embedding for Cell Hierarchies in Large-Scale Bioinformatics Data
2025-Oct-01, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出一种新型多尺度双曲嵌入算法MuH-MDS,用于大规模生物信息学数据中细胞层次结构的可视化与分析 采用物理学中的'绝热'近似方法优化局部位置同时保持聚类中心固定,计算速度比现有方法提升10倍,能处理超过80,000个样本的大规模数据集 论文未明确说明算法在特定数据类型或生物场景下的适用性限制 开发可扩展的双曲嵌入方法以捕获复杂层次结构 大规模生物信息学数据集,包括胚胎发生单细胞RNA测序数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 双曲多维标度 单细胞基因表达数据 超过80,000个样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
79 2025-11-20
Nephrobase Cell+: Multimodal Single-Cell Foundation Model for Decoding Kidney Biology
2025-Oct-01, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 开发了首个肾脏特异性多模态单细胞基础模型Nephrobase Cell+,用于解码肾脏生物学 首个专注于肾脏的大型基础模型,采用器官规模的多模态预训练和专门的transformer架构 NA 开发肾脏特异性单细胞基础模型以改进肾脏生物学解码 人类、小鼠、大鼠和猪的肾脏单细胞数据 单细胞分析 肾脏疾病 单细胞RNA测序,单核RNA测序,单核ATAC测序,空间转录组学 transformer编码器-解码器架构,混合专家模块 单细胞和单核转录组数据,表观基因组数据,空间转录组数据 约39.5百万个单细胞和单核图谱,来自4,319个样本 NA 单细胞RNA-seq,单核RNA-seq,单核ATAC-seq,空间转录组学 NA NA
80 2025-11-20
scTWAS: A powerful statistical framework for single-cell transcriptome-wide association studies
2025-Sep-30, Research square
研究论文 提出一种用于单细胞转录组范围关联研究的统计方法scTWAS,能够在细胞类型特异性背景下识别基因与复杂性状的关联 开发了首个专门针对单细胞数据的TWAS统计框架,利用潜变量模型和基于矩的估计方法解决单细胞数据的高噪声、技术变异和高稀疏性问题 NA 开发能够在单细胞水平进行细胞类型特异性转录组范围关联研究的统计方法 血液和脑组织中的免疫细胞类型,包括小胶质细胞和星形胶质细胞亚型 生物信息学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序 潜变量模型 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
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