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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-05-19 |
Single-cell transcriptomics identifies NF-κB/STAT3-associated neutrophil inflammatory reprogramming in rheumatoid arthritis synovium
2026-05, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2026.111231
PMID:41831621
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析类风湿性关节炎滑膜中的中性粒细胞异质性及其炎症重编程机制 | 首次在单细胞水平揭示RA滑膜中性粒细胞的NF-κB/STAT3轴驱动的炎症重编程,并鉴定C1和C3炎症表型以及M3/M4功能模块 | 验证仅基于bulk RNA-seq队列(n=19),缺乏功能实验的直接验证 | 阐明类风湿性关节炎滑膜中中性粒细胞的异质性和炎症重编程机制 | 8名RA患者滑膜组织的66,539个细胞,包括中性粒细胞和其他基质细胞 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 8名RA患者(66,539个细胞)和19名独立队列的bulk RNA-seq样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 62 | 2026-05-19 |
Endothelial cells recruit pro-inflammatory macrophage clusters via App-Cd74 exacerbating ICI-associated myocarditis
2026-05, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2026.111238
PMID:41905617
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序发现内皮细胞通过App-Cd74信号轴招募促炎性巨噬细胞簇,加剧ICI相关心肌炎 | 首次在单细胞水平揭示内皮细胞通过App-Cd74轴与Cxcl9+Cxcl10+巨噬细胞簇相互作用,加重ICI相关心肌炎的免疫病理机制,并利用深度学习框架scTenifoldXct验证该配体-受体相互作用 | 未提及具体局限性,但基于小鼠模型的研究结果可能需在人类样本中验证 | 阐明免疫检查点抑制剂相关心肌炎的免疫病理机制并探索潜在治疗靶点 | 小鼠ICI心肌炎模型的心脏组织 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 深度学习框架(scTenifoldXct) | 单细胞转录组数据 | 小鼠ICI心肌炎模型的心脏组织样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 63 | 2026-05-19 |
Unraveling the spatial landscape of dystrophinopathies: a transcriptomic approach to Becker and Duchenne muscular dystrophies
2026-May-01, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.70067
PMID:42067897
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研究论文 | 利用空间转录组学解析Becker和Duchenne肌营养不良症中肌营养不良蛋白病的空间景观 | 首次使用Visium空间转录组学技术研究肌营养不良蛋白病患者骨骼肌样本,并结合单核RNA-seq数据去卷积分析细胞类型比例和空间定位,识别脂肪斑块富集基因及活跃病理区域中纤维脂肪祖细胞等细胞类型 | 样本量较小(8例患者和4例健康对照),且缺乏对基因表达梯度动态过程的纵向验证 | 阐明Becker和Duchenne肌营养不良症的病理组织学变化,特别是肌肉纤维化和脂肪替代的分子机制 | 肌营养不良蛋白病患者(n=8)和健康对照(n=4)的骨骼肌活检样本 | 数字病理学 | 肌营养不良症 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据(空间转录组和单核RNA-seq) | 12例骨骼肌活检样本(8例患者和4例健康对照) | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台 |
| 64 | 2026-05-08 |
Abi3S212F Alzheimer's disease variant alters plaque structure and disrupts microglia
2026-05, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.71452
PMID:42092345
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研究论文 | 本研究通过构建Abi3S212F小鼠模型,发现该阿尔茨海默病风险变体会改变淀粉样斑块结构并导致小胶质细胞功能障碍 | 首次在体内揭示ABI3S209F/Abi3S212F变体通过破坏细胞骨架动力学导致小胶质细胞功能障碍和死亡,并证明这种损伤发生在斑块形成之前 | 未提及具体局限性 | 阐明ABI3S209F(Abi3S212F)阿尔茨海默病风险变体对小胶质细胞功能和淀粉样病理的影响机制 | Abi3S212F基因敲入小鼠与两种人源化β-淀粉样蛋白(Aβ)模型杂交的后代 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学, 单细胞分析, 共聚焦成像 | NA | 图像, 转录组数据 | 不同年龄段的小鼠样本(具体数量未说明) | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 10x Visium, 10x Chromium | 空间转录组学使用10x Visium平台,单细胞分析使用10x Chromium平台 |
| 65 | 2026-05-19 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals APOE genotype-dependent sex differences in Alzheimer's disease
2026-05, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.71463
PMID:42108391
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研究论文 | 单细胞转录组分析揭示APOE基因型依赖性性别差异在阿尔茨海默病中的作用 | 首次在单细胞水平全面研究性别与APOE基因型之间的相互作用 | 未提供具体局限性信息 | 探索阿尔茨海默病中性别和APOE相关差异的单细胞转录组学变化 | 阿尔茨海默病患者的脑细胞类型(54种高分辨率细胞类型) | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 66 | 2026-05-19 |
Inflammation-Driven Lymphoid Structures: Organization, Function, and Clinical Impact Across Autoimmunity, Cancer, and Checkpoint Toxicity
2026-May, Immunological reviews
IF:7.5Q1
DOI:10.1111/imr.70127
PMID:42144723
|
综述 | 本文提出一个框架来区分炎性淋巴样结构(ILS)和成熟三级淋巴样结构(mTLS),并讨论它们在自身免疫、癌症、移植、免疫相关不良事件和衰老中的发育、功能及临床影响 | 提出了将炎性淋巴样结构和成熟三级淋巴样结构区分开来的框架,而非简单归为同一类别,并强调其功能高度依赖于微环境 | 未深入讨论不同淋巴样结构之间的转化机制及在复杂疾病中的动态变化 | 综述淋巴样结构在非淋巴组织中的组织、功能及临床意义,并探讨空间转录组学与人工智能在检测、分类和功能解释中的应用 | 自身免疫、癌症、移植、免疫相关不良事件和衰老背景下的炎性淋巴样结构和成熟三级淋巴样结构 | 自然语言处理 | 自身免疫性疾病、癌症、心血管疾病、老年疾病 | 空间转录组学 | NA | 图片、文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 67 | 2026-05-19 |
Tumour-derived SAA1 reprogrammes macrophages to promote CXCL1-mediated metastasis in Ovarian Cancer
2026-May, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70698
PMID:42145073
|
研究论文 | 揭示肿瘤来源的SAA1通过重编程巨噬细胞促进CXCL1介导的卵巢癌转移机制 | 首次发现SAA1-TAM-CXCL1免疫炎症信号轴在卵巢癌转移中的关键作用,并阐明其通过FPR2-JAK2/STAT3通路重编程肿瘤相关巨噬细胞的机制 | 尚需进一步验证该信号轴在其他癌症类型中的普适性,以及开发针对该通路的临床治疗策略 | 阐明SAA1在高级别浆液性卵巢癌腹膜转移中的驱动机制 | 高级别浆液性卵巢癌患者肿瘤标本及小鼠模型 | NA | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 临床标本及动物模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 68 | 2026-05-19 |
Transcriptional Profiling at Single-Cell Resolution Reveals Diversity and Regulatory Networks of Primary and Secondary Senescent Cells
2026-May, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70540
PMID:42148795
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示了原代和继代衰老细胞的转录多样性与调控网络 | 首次在单细胞分辨率下系统比较了原代衰老(X射线诱导)和继代衰老(条件培养基诱导)人肾上皮细胞的转录异质性,识别出不同的终末簇和亚型相关基因 | 仅使用了体外细胞模型,未在体内或组织层面验证;未探讨衰老细胞的长期动态变化或体内微环境的影响 | 阐明原代和继代衰老细胞在单细胞水平的转录异质性及其调控机制 | 人肾上皮细胞(通过X射线辐照诱导原代衰老,通过条件培养基诱导继代衰老) | 机器学习 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 人肾上皮细胞样本(具体数量未在标题和摘要中说明) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 69 | 2026-05-19 |
Integrin β3 Promotes Retinal Neovascularization via Endoplasmic Reticulum Stress-Mediated Endothelial Cell Senescence
2026-May-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.5.40
PMID:42149032
|
研究论文 | 本研究探索整合素β3通过内质网应激介导的内皮细胞衰老促进视网膜新生血管形成的机制 | 首次揭示整合素β3通过PERK/eIF2α/ATF4通路激活内质网应激,驱动内皮细胞衰老,进而促进视网膜新生血管形成 | 主要基于体外细胞实验和动物模型,缺乏临床样本验证 | 阐明整合素β3驱动视网膜新生血管形成的分子机制 | 视网膜血管内皮细胞,特别是氧诱导视网膜病变模型中的内皮细胞亚群 | 机器学习 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 氧诱导视网膜病变小鼠模型及人视网膜微血管内皮细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 70 | 2026-05-19 |
Myeloid Cell States in Influenza-Associated Pulmonary Aspergillosis Are Shaped by Iron Overload and Metabolic Reprogramming
2026-Apr-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.22.720189
PMID:42079193
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研究论文 | 通过整合小鼠模型和单细胞RNA测序,揭示流感相关肺曲霉病中由铁过载和代谢重编程驱动的髓系细胞状态变化 | 首次利用单细胞转录组学结合小鼠模型阐明IAV感染后肺内铁积累如何通过免疫代谢重编程损害髓系细胞抗真菌功能,并验证与人类患者转录缺陷的相似性 | 未提及 | 探究流感A病毒感染后肺部微环境如何导致继发性曲霉感染的机制 | 小鼠肺单核细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺曲霉病,流感 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据(转录组) | 小鼠模型,具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 71 | 2026-05-19 |
Synovial transcriptional clusters link cartilage degeneration to cell-type-specific gene expression in knee osteoarthritis
2026-Apr-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.21.719697
PMID:42079156
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研究论文 | 探究膝骨关节炎滑膜转录簇与软骨退变及细胞类型特异性基因表达的关系 | 首次通过共识聚类分析将人类膝骨关节炎滑膜组织划分为四个转录簇,并揭示其与软骨退变严重程度及细胞类型特异性基因表达的关联 | 未提及 | 识别膝骨关节炎滑膜转录簇,并阐明其与滑膜组织学特征、细胞类型相关基因表达及软骨退变严重程度的关系 | 膝骨关节炎患者的滑膜组织 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学 | 共识聚类 | 转录组数据 | 135例膝骨关节炎患者滑膜组织用于批量RNA-seq,18例用于单细胞RNA-seq | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 72 | 2026-05-19 |
Turep: Detecting cross-cancer tumor-reactive T cells in single-cell and spatial transcriptomics data
2026-Apr-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.21.719961
PMID:42079298
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研究论文 | 介绍了一种名为Turep的深度学习方法,用于通过单细胞和空间转录组数据稳健地跨癌种预测肿瘤反应性T细胞 | 通过整合七种人类恶性肿瘤的配对单细胞RNA和T细胞受体测序数据,识别出泛癌肿瘤反应性基因特征,并利用生成式数据增强解决数据不平衡问题 | 未明确提及局限性 | 开发一种能够在跨癌种场景下稳健预测肿瘤反应性T细胞的工具 | 肿瘤浸润淋巴细胞中的肿瘤反应性T细胞与非反应性旁观者T细胞 | 机器学习 | 泛癌(七种人类恶性肿瘤) | 单细胞RNA测序,T细胞受体测序,空间转录组学 | 深度学习模型 | 单细胞基因表达数据,T细胞受体序列数据,空间转录组数据 | 七种人类恶性肿瘤的配对单细胞RNA和T细胞受体测序数据,具体样本量未明确 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 73 | 2026-05-19 |
Dissecting the coordinated progression of cell states in spatial transcriptomics with CoPro
2026-Apr-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.17.719309
PMID:42079111
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研究论文 | 提出CoPro计算框架,用于检测空间转录组学中细胞状态的协调进展 | 能够以监督和非监督模式检测细胞类型内部或之间的共变基因程序,并解析多个重叠的空间模式 | 未提及局限性 | 识别在空间中连续变化且在不同细胞类型之间协调的基因表达程序 | 结肠、脑、肝脏和肾脏组织样本 | 空间转录组学 | 与衰老相关的肝脏疾病 | MERFISH, SeqFISH+, Xenium, 组织学推断转录组数据 | NA | 空间转录组数据 | 来自结肠、脑、肝脏和肾脏组织的数据集 | NA | 单细胞水平空间转录组学 | MERFISH, SeqFISH+, Xenium | 用于单细胞水平空间转录组学分析的平台 |
| 74 | 2026-05-19 |
Microporous annealed particle scaffolds avoid foreign body response by down regulating complement-fibroblast-macrophage signaling loop
2026-Apr-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.17.719225
PMID:42079188
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研究论文 | 该研究通过比较多孔退火颗粒支架与纳米多孔水凝胶的皮下植入反应,揭示了支架孔隙度如何调节补体-成纤维-巨噬细胞信号环,从而避免异物反应 | 首次阐明MAP支架通过下调C5a信号串扰通路抑制补体-成纤维-巨噬细胞信号环,从而避免异物反应 | NA | 研究植入物孔隙度如何影响异物反应,并揭示MAP支架减少纤维包囊及改善组织整合的机制 | MAP支架和纳米多孔水凝胶植入后的免疫反应及组织整合情况 | 机器学习和数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术、多重细胞因子检测 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白组数据 | 小鼠皮下植入模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 75 | 2026-05-19 |
Transcriptomic profile reveals cellular composition contribute to hyaline-vascular variant in unicentric Castleman disease-associated paraneoplastic pemphigus
2026-Apr-20, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljag153
PMID:42008118
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研究论文 | 整合转录组学分析揭示单中心Castleman病相关副肿瘤性天疱疮中透明血管变异型的细胞组成特征 | 首次通过单细胞RNA测序揭示内皮细胞在血管透明化和基质失调中的核心作用,并阐明内皮-免疫细胞互作机制 | 未提及 | 通过整合转录组和细胞分析,阐明单中心Castleman病相关副肿瘤性天疱疮的细胞和分子发病机制 | 33例UCD-PNP患者的淋巴结样本(包含5例进行单细胞测序) | 计算机视觉 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 33例UCD-PNP患者淋巴结样本(5例进行单细胞测序,共58,811个细胞) | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | Illumina NovaSeq 6000测序平台 |
| 76 | 2026-05-19 |
Mechanotransduction unifies healthy nondiabetic wound healing over time by promoting a Cd14+/C1qa+ fibroblast subpopulation
2026-Apr-15, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2026.02.027
PMID:41997300
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析遗传诱导和病理生理性糖尿病小鼠伤口愈合过程中的成纤维细胞异质性,发现机械传导通路在健康伤口愈合中促进Cd14+/C1qa+成纤维细胞亚群,而在糖尿病模型中该通路被选择性消耗 | 首次在伤口愈合所有阶段系统表征糖尿病模型中成纤维细胞异质性,揭示机械传导通路(FAK和MAPK)在生理性愈合中的关键作用,并发现遗传性糖尿病中WNT通路过度激活导致愈合障碍 | 仅在小鼠模型中研究,未在人类样本中验证;未深入探讨机械传导通路与WNT通路之间的交互机制 | 探究糖尿病对伤口愈合过程中成纤维细胞异质性和机械传导通路的影响 | C57BL/6野生型小鼠(非糖尿病)、高脂饮食诱导的病理生理性糖尿病小鼠和瘦素受体缺陷的遗传性糖尿病小鼠的伤口组织 | 单细胞测序 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三种小鼠模型(非糖尿病、病理生理性糖尿病、遗传性糖尿病)在术后第0、2、7、30天收集伤口组织 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 77 | 2026-05-19 |
High-throughput strategy for targeting MDM2 in uveal melanoma to reverse radiation therapy resistance
2026-Apr-11, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-026-02970-x
PMID:41965789
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研究论文 | 结合机器学习与高通量筛选平台,发现靶向MDM2的小分子抑制剂SAR405838可逆转葡萄膜黑色素瘤放疗抵抗 | 首次将机器学习模型与高通量筛选平台整合,系统识别MDM2为葡萄膜黑色素瘤放疗抵抗关键基因,并验证新型抑制剂SAR405838的增敏作用 | 未提及体内实验验证及长期疗效评估 | 开发靶向MDM2的新策略以克服葡萄膜黑色素瘤的放疗抵抗 | 葡萄膜黑色素瘤细胞系及放疗抵抗细胞模型 | 机器学习 | 葡萄膜黑色素瘤 | 转录组测序,单细胞RNA测序,高通量筛选 | 机器学习模型 | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
| 78 | 2026-05-19 |
Altered MDC1 Interactions and Dysfunctional DNA Repair in Lobular Breast Cancer Confers Sensitivity to PARP Inhibition
2026-Apr-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-1217
PMID:41512199
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研究论文 | 该研究揭示了浸润性小叶乳腺癌中MDC1相互作用改变和DNA修复功能障碍导致PARP抑制剂的敏感性 | 首次发现浸润性小叶乳腺癌细胞的ER与MDC1协同作用导致类似BRCA状态的同源重组修复障碍,以及这种障碍与经典BRCA缺失不同,并且可被PARP抑制剂靶向 | 未在文章和摘要中明确提及 | 探究MDC1如何调控浸润性小叶乳腺癌中ER活性和DNA修复功能,以及其治疗靶向潜力 | 浸润性小叶乳腺癌细胞、肿瘤组织及异种移植模型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组分析、DNA修复活性分析、免疫共沉淀、PARP抑制剂治疗 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质互作数据、DNA修复信号数据 | 包括体外和体内多个ILC异种移植模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 79 | 2026-05-19 |
Chemoradiation Reprograms Tumor Cells and the Immune Microenvironment in Cervical Cancer
2026-Apr-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-3776
PMID:41860764
|
研究论文 | 通过多队列纵向研究,整合RNA测序和单细胞转录组学,分析放化疗对宫颈癌细胞和免疫微环境的重编程作用 | 首次在人类宫颈癌放化疗过程中整合RNA测序和单细胞转录组学,揭示MDM2作为放化疗耐药关键靶点,并验证MDM2抑制增强放疗效果 | 未提及具体限制 | 探究放化疗如何重编程宫颈癌细胞和免疫微环境,以寻找克服耐药的新靶点 | 人类宫颈肿瘤及其微环境 | 数字病理学 | 宫颈癌 | RNA-seq, 单细胞转录组测序 | NA | 测序数据(RNA-seq和单细胞转录组数据) | 多队列纵向研究样本,具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 80 | 2026-05-19 |
Transcriptomic Plasticity Is a Hallmark of Metastatic Pancreatic Cancer
2026-Apr-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-1117
PMID:41379552
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研究论文 | 对一名胰腺导管腺癌患者的原发肿瘤和多种转移灶进行单细胞转录组分析,揭示转移性胰腺癌的转录组可塑性 | 通过无监督原型分析和新开发的PICASSO系统发育推断方法,揭示胰腺癌细胞在转移过程中适应局部环境主要依赖环境效应而非克隆基因型 | 研究仅基于一名患者的样本,结论的普适性需要更多样本人群验证 | 研究肿瘤细胞在转移过程中适应不同器官微环境的分子机制 | 一名胰腺导管腺癌患者的原发肿瘤和肝、网膜、腹膜、胃壁、淋巴结、膈肌等转移灶样本 | 单细胞转录组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、全外显子测序 | PICASSO(基于拷贝数变异的克隆系统发育推断方法) | 单细胞转录组数据、全外显子测序数据 | 1名患者的多个原发和转移组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |