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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
61 2026-02-14
Single-cell RNA sequencing unveils CCDC86-driven immune modulation and antigen-presenting cell dynamics in head and neck squamous cell carcinoma
2026-Feb-09, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序数据,揭示了CCDC86基因在头颈鳞状细胞癌免疫微环境中的表达模式及其在抗原呈递细胞动态和免疫调节中的关键作用 首次在头颈鳞状细胞癌中表征了免疫相关基因CCDC86的表达模式及其在抗原呈递细胞中的特异性功能,揭示了其通过调控APC-T细胞相互作用在免疫调节和免疫逃逸中的双重作用 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于FaDu细胞系的qPCR,缺乏体内功能验证和临床样本的广泛验证 阐明CCDC86基因在头颈鳞状细胞癌免疫微环境中的表达模式、免疫学功能及其在肿瘤免疫调节中的作用 头颈鳞状细胞癌患者样本(来自TCGA和GEO数据库)及FaDu细胞系 数字病理学 头颈鳞状细胞癌 单细胞RNA测序,qPCR NA RNA测序数据,单细胞转录组数据 来自TCGA和GEO数据库的批量RNA测序数据及单细胞RNA测序数据(GSE139324),具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
62 2026-02-14
Tumoroid model recreates clinically relevant phenotypes of high grade serous ovarian cancer cells, carcinoma associated fibroblasts, and macrophages
2026-Feb-06, Acta biomaterialia IF:9.4Q1
研究论文 本研究开发了一种包含高级别浆液性卵巢癌细胞、癌相关成纤维细胞和巨噬细胞的三组分肿瘤球模型,以模拟卵巢癌肿瘤微环境的关键表型 首次构建了高度可调的3D异质三组分肿瘤球模型,整合了基质细胞与癌细胞,能更准确地复现肿瘤微环境中复杂的细胞间相互作用,并适用于高通量药物筛选 模型基于特定细胞系和条件建立,可能无法完全代表体内肿瘤微环境的全部复杂性,且临床转化潜力需进一步验证 研究高级别浆液性卵巢癌肿瘤微环境中细胞间相互作用及其对化疗耐药、癌症干细胞富集等表型的影响 高级别浆液性卵巢癌细胞(OVCAR3、OVCAR4、OVCAR8)、原发性间充质干细胞、U937衍生的M2样巨噬细胞 数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术 3D肿瘤球模型 单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据 使用特定细胞系构建的肿瘤球模型,未明确样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
63 2026-02-14
The I148M PNPLA3 Variant Forces Progressive Portal MASLD by Spatially Perturbing Metabolic Pathways Across Liver Zones
2026-Feb-06, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究利用空间转录组学技术,探究了I148M PNPLA3变异如何通过影响肝脏区域代谢途径,驱动代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)的进展 首次应用空间转录组学(Visium CytAssist技术)分析I148M变异携带者肝脏中门静脉区(PZ)和中央区(CZ)的代谢过程差异,揭示了该变异如何破坏生理性肝区带化并促进脂肪变性 发现队列样本量较小(n=4),可能限制统计效力;研究主要基于相关性分析,需要进一步实验验证因果机制 探究I148M PNPLA3遗传变异如何通过影响肝脏代谢区带化,促进MASLD的进展 MASLD患者的肝脏活检样本,包括野生型和I148M变异纯合子个体 数字病理学 代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD) 空间转录组学 NA 空间转录组数据、组织学图像 发现队列4例(空间转录组学),验证队列100例(组织学评估) 10x Genomics 空间转录组学 Visium CytAssist Visium CytAssist空间转录组技术
64 2026-02-14
Probing the Feasibility of Single-Cell Fixed RNA Sequencing from FFPE Tissue
2026-Feb-06, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究评估了基于FFPE组织的单细胞固定RNA测序技术(scFFPE-seq)的可行性,并与新鲜组织样本进行了比较 开发并验证了从FFPE组织中获取高质量单细胞转录组数据的新方法,突破了传统scRNA-seq对新鲜或冷冻样本的限制 研究仅使用了结肠、回肠和皮肤组织样本,尚未在其他组织类型或更广泛的临床样本中得到验证 评估单细胞固定RNA测序技术从FFPE组织中获取可靠转录组数据的可行性 结肠、回肠和皮肤的新鲜组织及对应的FFPE组织样本 单细胞测序技术 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据、H&E图像 结肠、回肠和皮肤组织样本(具体数量未明确说明) 10x Genomics 单细胞RNA测序 Chromium Fixed RNA Profiling Chromium Fixed RNA Profiling on FFPE tissue blocks (scFFPE-seq)
65 2026-02-14
Unraveling the Cross-Tissue Neuroimmune-Vascular Genetic Architecture of Migraine Using Integrated Multi-Omics, Single-Cell, and Spatial Transcriptomics: Prioritizing T-Cell Regulatory Networks and Peripheral Targets
2026-Feb-06, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究通过整合多组学、单细胞和空间转录组学数据,揭示了偏头痛的跨组织神经免疫-血管遗传结构,并优先考虑了T细胞调控网络和外围靶点 首次系统性整合GWAS、GTEx eQTLs/sQTLs、单细胞RNA测序、单细胞多组学图谱、hdWGCNA和空间转录组学,以揭示偏头痛的跨组织遗传结构,并识别出T细胞激活通路作为遗传易感性的组成部分 研究依赖于现有公共数据集和有限样本的单细胞数据,可能未涵盖所有偏头痛亚型或人群多样性,且机制验证需要后续实验研究 阐明偏头痛的遗传风险在组织和细胞类型层面的具体背景,识别关键遗传通路和治疗靶点 偏头痛患者和对照者的外周血单核细胞(PBMCs)、健康单细胞多组学图谱、胚胎水平空间转录组学数据 生物信息学 偏头痛 GWAS, eQTLs, sQTLs, 单细胞RNA测序, 单细胞多组学(ATAC+RNA), hdWGCNA, 空间转录组学 贝叶斯共定位, 加权基因共表达网络分析 遗传数据, 表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序, 单细胞多组学, 空间转录组学 NA NA
66 2026-02-14
Safety, immunogenicity, and baseline immune correlates of vaccine JNJ-0535 in participants with or without CHB
2026-Feb-05, NPJ vaccines IF:6.9Q1
研究论文 本研究评估了通过电穿孔肌肉注射给药的HBV特异性治疗性DNA疫苗JNJ-0535在健康志愿者和慢性乙型肝炎患者中的安全性、耐受性和免疫原性,并探索了与疫苗反应相关的免疫相关生物标志物 首次在CHB患者中评估了通过电穿孔给药的HBV特异性治疗性DNA疫苗JNJ-0535,并采用单细胞RNA测序和血清蛋白质组学探索了与疫苗反应相关的基线免疫特征 研究样本量较小,发现的免疫相关生物标志物需要在未来更大规模的研究中进一步确认 评估JNJ-0535疫苗的安全性、免疫原性,并探索与疫苗反应相关的基线免疫特征 健康志愿者和慢性乙型肝炎患者 NA 慢性乙型肝炎 酶联免疫斑点试验, 细胞内细胞因子染色, 单细胞RNA测序, 血清蛋白质组学 NA 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组学数据 涉及两项I期临床试验的参与者(健康志愿者和慢性乙型肝炎患者),具体人数未在摘要中明确说明 Olink 单细胞RNA测序, 血清蛋白质组学 Olink Explore 3072 Olink Explore 3072用于血清蛋白质组学分析
67 2026-02-14
Azoospermia phenotype and scRNA-seq reveal hnRNPK as a factor essential for male germ cell development in mice
2026-Feb-05, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本研究通过构建生殖细胞特异性Hnrnpk敲除小鼠模型并结合多组学分析,揭示了hnRNPK作为维持分化精原细胞正常发育的关键因子,其缺失导致细胞周期失调和凋亡,进而引发小鼠不育 首次在生殖细胞特异性敲除模型中系统阐明了hnRNPK在分化精原细胞发育中的关键作用,并揭示了其在转录后水平通过调控翻译效率和剪接参与减数分裂、细胞周期等过程的分子机制 研究主要基于小鼠模型,其在人类中的保守性和具体功能仍需进一步验证;机制研究虽涉及多组学,但具体信号通路和下游靶基因的调控网络尚未完全解析 探究哺乳动物雄性生殖细胞发育的遗传调控机制,特别是hnRNPK在分化精原细胞发育中的功能与作用机制 生殖细胞特异性Hnrnpk敲除小鼠模型及其睾丸组织中的分化精原细胞 生殖生物学 男性不育症 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、多组学分析 基因敲除小鼠模型 单细胞转录组数据、多组学数据 生殖细胞特异性hnRNPK敲除成年小鼠及其对照 NA 单细胞RNA-seq NA NA
68 2026-02-14
Sporoplasm: The initial cell in microsporidia life cycle
2026-Feb-05, Journal of advanced research IF:11.4Q1
综述 本文综述了微孢子虫生活周期起始细胞——孢子质的最新研究进展,包括其结构特征、基因表达模式、感染过程中的相互作用以及体外培养方法 系统总结了孢子质研究的最新进展,特别是利用冷冻电镜解析孢子质形成过程,以及通过单细胞RNA测序技术表征微孢子虫不同发育阶段的基因表达特征 NA 阐明微孢子虫孢子质的生物学特性及其在感染和增殖过程中的作用机制 微孢子虫(特别是家蚕微孢子虫Nosema bombycis)的孢子质 NA 寄生虫感染 冷冻电镜(Cryo-EM),单细胞RNA测序 NA 图像数据,基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
69 2026-02-06
Subject: letter to the editor: platelet single-cell RNA sequencing
2026-Feb-04, Journal of thrombosis and thrombolysis IF:2.3Q2
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
70 2026-02-14
STransfer: a transfer learning-enhanced graph convolutional network for clustering spatial transcriptomics data
2026-Feb-03, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文提出了一种名为STransfer的迁移学习框架,结合图卷积网络和正点互信息,用于聚类空间转录组学数据,以建模局部和全局空间依赖性 STransfer通过引入基于注意力的模块融合多图特征,并利用迁移学习从标记切片向未标记切片传递知识,显著提升了聚类精度并降低了人工标注成本 NA 提高空间转录组学数据的聚类准确性,并减少多切片数据集中的手动标注需求 空间转录组学数据 机器学习 NA 空间转录组学 图卷积网络 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
71 2026-02-14
BCL2A1high CD8+ T Cells Are a Survival-Associated Predictor of Immune Checkpoint Blockade Response in Lung Adenocarcinoma
2026-Feb-03, Diagnostics (Basel, Switzerland)
研究论文 本研究通过整合bulk和单细胞RNA-seq数据,发现BCL2A1high CD8+ T细胞是肺腺癌中免疫检查点阻断(ICB)反应的一个生存相关预测因子 首次识别BCL2A1在CD8+ T细胞中的高表达作为ICB反应的预测生物标志物,并开发了一个整合BCL2A1、PD-L1和HOT评分的三标志物模型,其预测性能优于现有签名 研究结果仍需临床验证,且样本量相对有限 探索肺腺癌中免疫检查点阻断(ICB)反应的预测生物标志物 肺腺癌(LUAD)患者 生物信息学 肺腺癌 bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq 三标志物预测模型 RNA-seq数据 发现队列60例,验证队列126例 NA 单细胞RNA-seq NA NA
72 2026-02-14
Dual Immunological Prognostic Models for Risk Stratification and Treatment Insights in Triple-Negative Breast Cancer
2026-Feb-03, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究基于单细胞RNA测序数据,构建了两种免疫预后模型(SPSM和IPSM),用于三阴性乳腺癌的风险分层和治疗指导 通过整合单细胞RNA测序数据,识别了关键肿瘤表达元程序及其与免疫抑制性树突状细胞亚群的相互作用,并基于NECTIN1-NECTIN4轴开发了双模型预后框架 研究样本量相对有限(30个TNBC样本),且模型验证依赖于多队列转录组数据,需进一步临床验证 构建基于肿瘤-免疫相互作用的预后框架,以改善三阴性乳腺癌的精准诊断和治疗 三阴性乳腺癌患者及其肿瘤微环境中的细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 预后模型(SPSM和IPSM) 转录组数据 30个TNBC样本(106,132个细胞) NA 单细胞RNA-seq NA NA
73 2026-02-14
Atrial Fibrillation and Primary Cilia-Associated Genes: The Role of CEP68
2026-Feb-03, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究通过整合多组学数据和孟德尔随机化分析,探讨了中心粒相关基因CEP68与心房颤动(AF)之间的因果关系及其潜在机制 首次将心房颤动的GWAS数据与左心耳组织和血液的多组学数据(包括eQTL、mQTL和pQTL)相结合,并利用单细胞测序数据分析了候选基因在不同细胞类型中的表达,揭示了CEP68基因通过成纤维细胞活化和心脏重构途径影响心房颤动易感性的新机制 样本量相对有限(PREDICT-AF队列22例无AF患者,MARK-AF队列40例AF患者),且研究主要基于遗传预测和相关性分析,需要进一步的实验验证来明确CEP68的具体作用机制 探究原发性纤毛相关基因与心房颤动发生之间的因果关系及其分子机制 人类左心耳组织、血液样本、以及来自PREDICT-AF和MARK-AF队列的患者(包括无AF、阵发性AF和持续性AF患者) 生物信息学 心血管疾病 GWAS, 多组学整合分析(包括基因表达、DNA甲基化、蛋白质表达QTL),单细胞测序,RNA测序,免疫组织化学 基于汇总数据的孟德尔随机化,贝叶斯共定位分析 基因组数据,转录组数据,表观基因组数据,蛋白质组数据,单细胞测序数据,临床指标数据 来自PREDICT-AF队列的22名无AF患者,以及来自MARK-AF队列的21名阵发性AF患者和19名持续性AF患者,此外还使用了公开的GWAS和多组学数据集 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
74 2026-02-14
Single-Cell Mapping Reveals MIF-Centered Immunoregulatory Networks in Colorectal Cancer
2026-Feb-03, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了结直肠癌肿瘤微环境中以MIF为中心的免疫调节网络 首次在单细胞分辨率下识别出MIF-CD74信号轴作为连接肿瘤上皮细胞与免疫细胞的主要通讯枢纽 研究基于现有数据集进行分析,缺乏实验验证和临床样本的深入追踪 解析结直肠癌肿瘤微环境中的细胞间通讯网络 结直肠癌肿瘤微环境中的上皮细胞、免疫细胞和基质细胞 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 Seurat, CellChat 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
75 2026-02-14
Experimental study of tumor-associated macrophage-derived SPP1 inhibit CD8+ T cells to promote Colorectal cancer progression
2026-Feb-02, Neoplasia (New York, N.Y.)
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了肿瘤相关巨噬细胞(TAM)来源的分泌磷蛋白1(SPP1)通过抑制CD8⁺ T细胞分化为Tc1细胞,从而促进结直肠癌进展的机制 首次在结直肠癌中通过整合单细胞和空间转录组技术鉴定出一个高表达SPP1的独特TAM亚群,并阐明了TAM-SPP1轴通过CD44信号通路抑制CD8⁺ T细胞功能的免疫抑制新机制 研究主要基于小鼠模型和体外共培养实验,人类患者样本中的验证尚不充分;SPP1中和或CD44抑制在临床治疗中的具体应用策略和潜在副作用有待进一步探索 阐明肿瘤相关巨噬细胞在结直肠癌免疫微环境中的调控作用及其分子机制 结直肠癌小鼠模型(MC38细胞)、肿瘤相关巨噬细胞、CD8⁺ T细胞 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序,空间转录组学 小鼠结直肠癌模型(MC38细胞) 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 未在摘要中明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
76 2026-02-14
Spatial multi-omics unveils the monoclonal origin, neuroendocrine plasticity, and microenvironment niches in combined small cell lung cancer
2026-Feb-02, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过空间多组学技术揭示了联合小细胞肺癌的单克隆起源、神经内分泌可塑性及微环境生态位 首次在联合小细胞肺癌中整合空间全外显子组测序、空间转录组学和单核RNA测序,揭示了其单克隆起源、组织学分化机制、肿瘤微环境异质性以及活跃的谱系可塑性,并开发了基于突变的诊断工具cSCLC Detector 研究样本量相对较小(19例未经治疗的肿瘤),且为回顾性研究,需要更大规模的前瞻性队列验证 阐明联合小细胞肺癌的分子生物学特征、谱系可塑性及肿瘤微环境相互作用,以改进其诊断和治疗策略 19例未经治疗、涵盖所有主要组织学亚型的联合小细胞肺癌肿瘤样本 数字病理学 肺癌 空间全外显子组测序, 空间转录组学, 单核RNA测序 NA 基因组测序数据, 转录组测序数据, 空间转录组数据 19例治疗初治的联合小细胞肺癌肿瘤 NA 空间转录组学, 单核RNA测序, 全外显子组测序 NA NA
77 2026-02-14
Multiomics Analyses Reveal an Essential Role of Tryptophan in Treatment of csDMARDs in Rheumatoid Arthritis
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过多组学分析揭示了色氨酸在类风湿关节炎患者对传统合成改善病情抗风湿药治疗反应中的关键调控作用 首次通过整合代谢组学、微生物组学、转录组学、单细胞转录组学、蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学等多组学方法,结合体外/体内实验和临床试验,系统阐明了色氨酸在类风湿关节炎治疗中的分子机制 NA 阐明类风湿关节炎患者对传统合成改善病情抗风湿药治疗反应差异的分子机制,重点关注色氨酸的作用 类风湿关节炎患者(采集血浆、粪便和外周血单个核细胞)以及小鼠模型 多组学分析 类风湿关节炎 代谢组学、微生物组学、转录组学、单细胞转录组学、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学 NA 多组学数据(代谢物、微生物、基因表达、蛋白质、磷酸化蛋白质) NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
78 2026-02-14
LPS-Binding Hydrogel for TLR4-Mediated Microbiota-Immune Modulation
2026-Feb, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
研究论文 本研究开发了一种协同LPS结合水凝胶(OCMC-PMBP),用于治疗口鼻穿孔伤口,通过靶向脂质A的细菌裂解和静电捕获LPS,调节微生物群-免疫相互作用以促进愈合 结合多粘菌素B和聚乙烯亚胺的协同水凝胶设计,同时实现抗菌和免疫调节功能,针对LPS-TLR4信号通路在复杂黏膜伤口中的应用 NA 开发一种生物材料以解决微生物失调引起的炎症并增强复杂黏膜伤口的再生愈合 口鼻穿孔伤口(如腭裂修复相关)中的微生物群和免疫细胞 生物材料学 伤口愈合障碍 16S rRNA测序、宏基因组学、单细胞转录组学 NA 微生物组数据、转录组数据 临床微生物组分析和鼠类模型 NA 单细胞转录组学 NA NA
79 2026-02-14
Characterizing Stage-Specific Cellular Dynamics and Microenvironmental Remodeling in Lung Adenocarcinoma by Single-Cell RNA Sequencing
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,系统分析了肺腺癌不同阶段的细胞组成和转录状态,揭示了肿瘤微环境在疾病进展中的动态重塑过程 识别了阶段依赖性的肿瘤微环境转变,发现了一个具有转移和缺氧特征的缺氧适应上皮肿瘤细胞亚群(C5),并揭示了LGMN⁺巨噬细胞、STAT1驱动的耗竭CD8⁺ T细胞、FKBP11⁺浆B细胞以及POSTN⁺癌症相关成纤维细胞在晚期肺腺癌中的关键作用 研究整合了公开数据集,可能存在批次效应或样本异质性,且未进行功能验证实验 阐明肺腺癌进展过程中阶段特异性的细胞动力学和肿瘤微环境重塑机制 肺腺癌患者标本(早期阶段)及公开可用的晚期疾病数据集 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 早期患者标本及公开数据集,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
80 2026-02-14
Inferring Gene Regulatory Networks From Single-Cell RNA Sequencing Data by Dual-Role Graph Contrastive Learning
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文提出了一种名为RegGAIN的新型深度学习模型,用于从单细胞转录组数据中推断基因调控网络 提出了一种基于双角色图对比学习的自监督模型,通过分离编码器同时学习基因的调控者和靶标驱动模式,以表征调控方向性 未在摘要中明确提及 从单细胞RNA测序数据中准确推断细胞类型特异性基因调控网络,以阐明细胞身份、发育和疾病的调控机制 基因调控网络 机器学习 NA 单细胞RNA测序 深度学习, 对比学习 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
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