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当前共找到 45138 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-11-02 |
Functional heterogeneity of mouse fetal liver hematopoietic stem cells revealed by clonal lineage tracing and single-cell transcriptomics
2026-Sep-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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研究论文 | 该研究通过慢病毒条形码标记移植结合单细胞RNA测序和克隆分析，系统表征了E14.5小鼠胎肝造血干细胞的功能异质性 | 首次在胎肝中揭示三种基于谱系偏向的HSC亚型，发现同一亚型的HSC及其后代共享转录程序（称为“转录持久性”），且该现象在成体骨髓中未观察到；同时基于输出活性分类发现低输出和高输出亚型，其转录特征和信号激活状态不同且随发育阶段变化 | 研究仅基于小鼠胎肝HSC，未在人类样本中验证；转录持久性与输出活性无显著相关性的机制尚未阐明 | 系统表征E14.5小鼠胎肝造血干细胞的功能异质性，并比较其与成体骨髓HSC的差异 | E14.5小鼠胎肝造血干细胞及其在受体骨髓中的供体来源后代 | 单细胞组学 | NA | 慢病毒条形码标记、移植实验、单细胞RNA测序、克隆分析 | NA | 文本（scRNA-seq表达数据） | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 62 | 2026-11-02 |
Metabolic depot for nucleated erythrocyte degradation: molecular and structural elucidation of the teleost melanomacrophage center
2026-Sep-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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研究论文 | 该研究结合透射电子显微镜和高分辨率空间转录组学，系统解析了硬骨鱼脾脏黑色素巨噬细胞中心的代谢功能，否定了其作为原始生发中心的假说 | 首次将TEM与高分辨率空间转录组学结合用于MMC研究，从分子和结构两个层面系统阐明MMC是高度特化的代谢加工和隔离生态位而非原始生发中心，并对传统组织学染色方法的非特异性信号提出警示 | 仅基于一种高等硬骨鱼进行验证，未在多种鱼类中比较；空间转录组学在低转录活性区域的检测灵敏度可能受限；未进行功能验证实验（如敲除或过表达） | 阐明硬骨鱼脾脏黑色素巨噬细胞中心的真实功能，解决其究竟是代谢废物处理场所还是原始生发中心的长期争议 | 高等硬骨鱼的脾脏黑色素巨噬细胞中心 | 空间转录组学 | NA | 透射电子显微镜, 高分辨率空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 63 | 2026-11-02 |
Overcoming Intrinsic Barriers in Myofibroblasts Permits Efficient Cardiac Reprogramming After Infarction
2026-Sep-08, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 该研究揭示了心肌梗死后的肌成纤维细胞中MEOX1上调是心脏重编程的内在障碍，敲低MEOX1可显著提高体内外重编程效率并改善心脏功能 | 首次鉴定MEOX1为肌成纤维细胞重编程抵抗的主要分子屏障，并证明敲低MEOX1可实现无GATA4的高效重编程及谱系追踪证实的体内肌成纤维细胞向诱导心肌细胞转化 | 研究主要基于小鼠模型和体外人类细胞，尚未在大型动物或临床试验中验证；MEOX1敲低的安全性和长期效果有待评估 | 探究心肌梗死后肌成纤维细胞重编程抵抗的分子机制，并寻找克服该障碍以提高心脏重编程效率的策略 | 小鼠和人的心脏成纤维细胞、肌成纤维细胞，包括PDGFRα+细胞、Postn谱系追踪细胞、人iPSC来源肌成纤维细胞及原代人肌成纤维细胞 | 心脏再生医学、细胞重编程 | 心肌梗死、心血管疾病 | 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq、CUT&Tag、shRNA筛选、谱系追踪 | NA | 基因表达数据、表观遗传数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 64 | 2026-11-02 |
platpy: A spatial-first framework for multi-layer spatial transcriptomic analysis
2026-Sep-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.26.727917
PMID:42922800
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研究论文 | 本文提出了一个名为platpy的基于Python的“空间优先”框架，用于多层空间转录组学分析，以绝对物理微米坐标为组织原则管理所有数据类型 | 将绝对物理微米坐标作为所有数据类型的组织原则，所有数据（形态学图像、转录本点云、表达矩阵、分割细胞和用户定义区域）存储为携带自身空间元数据的类型化对象（Channels），实现跨平台、分辨率和分析操作的自动配准；提供ViewPort（多通道可视化合成引擎）和DataPort（原生格式数据提取）两个互补接口；包含基于ROI的表达分箱、皮层展开和亚微米级转录本与图像数据精细对齐等空间分析工具 | 设计为补充而非替代现有广泛使用的工具（scanpy、squidpy、CellPose、StarDist），依赖于这些工具进行下游分析 | 开发一个能够处理空间数据集复杂性和规模的空间优先分析框架，简化多模态数据对齐、感兴趣区域选择和跨分辨率可视化等常见任务 | 空间转录组学数据，包括形态学图像、转录本点云、表达矩阵、分割细胞和用户定义区域 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像, 文本（转录本点云、表达矩阵） | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium HD, 10x Xenium | NA |
| 65 | 2026-11-02 |
PIEZO1 impairs antioxidant capacity and drives ferroptosis via dual regulation of GPX4 in degenerative disc cells
2026-Sep-03, NPJ Regenerative medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41536-026-00504-8
PMID:42963377
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序解析人髓核细胞亚群，揭示PIEZO1通过双重调控GPX4（转录下调和TRIM21介导的泛素化降解）诱导铁死亡并驱动椎间盘退变 | 首次阐明机械敏感离子通道PIEZO1通过同时抑制GPX4转录和促进TRIM21介导的GPX4泛素化降解的双重机制诱导髓核细胞铁死亡，并揭示祖细胞耗竭是椎间盘退变修复稳态失衡的核心触发因素 | 摘要未明确说明样本量、单细胞测序的具体平台和详细参数，临床样本验证规模有限，体内实验仅使用小鼠模型 | 探究椎间盘退变中髓核细胞的异质性、内源性修复稳态以及机械信号与铁死亡之间的调控网络 | 人髓核细胞、临床椎间盘标本、髓核特异性PIEZO1敲除小鼠 | 单细胞组学、骨科研究 | 椎间盘退变、慢性下腰痛 | 单细胞RNA测序、多组学分析、体外细胞实验、体内机械加载实验 | NA | 单细胞转录组数据、临床标本数据、动物实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 66 | 2026-11-02 |
Parasite and host factors associated with malaria parasite liver stage latency
2026-Sep-02, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-10657810/v1
PMID:42922745
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研究论文 | 该研究利用人肝细胞嵌合小鼠和原代人肝细胞建立可重复的肝期感染模型，鉴定PUF1为与休眠子持续相关的保守标志物，并揭示宿主微环境特征 | 首次通过转录组分析和RNA-FISH鉴定PUF1作为间日疟原虫休眠子相关保守标志物，发现PUF1相关的9-mer RNA基序与CCR4-NOT去腺苷酸化复合体关联，并利用空间转录组学揭示休眠子占据转录静止的宿主微环境 | 摘要未明确说明研究的具体局限性 | 探究间日疟原虫肝期休眠子持续存在的寄生虫内在机制和宿主因素 | 间日疟原虫Chesson株孢子体和泰国野外分离株，人肝细胞嵌合小鼠和原代人肝细胞 | 转录组学、空间转录组学 | 疟疾 | 转录组分析、RNA-FISH、空间转录组学 | NA | RNA表达数据、图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 67 | 2026-11-02 |
Spatial Mapping of the Lung Cancer Ecosystem Reveals Distinct Patterns of Intratumoral and Internodular Heterogeneity
2026-Sep-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.08.31.748358
PMID:42922549
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研究论文 | 利用Xenium空间转录组技术绘制小鼠原位肺癌模型的空间生态系统图谱，揭示肿瘤内和瘤间异质性模式 | 首次系统解析肺癌微环境的精细空间域结构，将空间域聚为三大群落，并发现瘤内异质性可细分为多个生物学上不同的肿瘤亚型，且该方法可应用于人类肺癌组织 | 研究主要基于小鼠原位肺癌模型，人类肺癌组织验证有限，未在摘要中提及更大的临床队列验证 | 全面绘制肺癌肿瘤微环境的空间生态系统，理解微生态位结构及瘤内瘤间异质性 | 小鼠原位肺癌模型及人类肺癌组织 | 空间转录组学 | 肺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Xenium | 基于Xenium的空间转录组分析 |
| 68 | 2026-11-02 |
Spatial mapping of the lung cancer ecosystem reveals distinct patterns of intratumoral and internodular heterogeneity
2026-Sep-01, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-10682967/v1
PMID:42922878
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研究论文 | 该研究利用Xenium空间转录组学技术全面绘制了原位小鼠肺癌模型的空间生态系统图谱，揭示了肿瘤内和结节间异质性的不同模式 | 首次利用Xenium空间转录组学在原位小鼠肺癌模型中系统解析肿瘤微环境的微生态位结构，识别出三个主要空间社区（非肿瘤区域、瘤周区域和瘤内区域），并发现空间域分析可将肿瘤结节解析为生物学上不同的亚型 | 研究主要基于小鼠肺癌模型，虽然验证了分析方法在人类肺癌组织中的适用性，但人类样本验证可能有限；未提及具体样本量；空间转录组学在单细胞分辨率下的基因检测灵敏度可能存在局限 | 全面绘制肺癌生态系统的空间图谱，解析肿瘤微环境中恶性细胞和非恶性细胞的空间组织架构及微生态位结构 | 原位小鼠肺癌模型及人类肺癌组织 | 空间转录组学、肿瘤生物学 | 肺癌 | 空间转录组学（Xenium） | NA | 空间转录组数据、图像 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Xenium | Xenium空间转录组学平台 |
| 69 | 2026-11-02 |
DiST: disentangling structure via self-supervised tensors for heterophilous spatial transcriptomics
2026-Sep-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag600
PMID:42960993
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研究论文 | 提出DiST自监督张量学习框架，用于解决空间转录组学中空间域识别因数据稀疏和图方法过平滑而受限的问题 | 引入语义对齐自我网络张量构建策略，将扁平图数据转换为高阶张量结构以保留局部异质性，并采用低秩稀疏分解机制分离用于表示学习的连贯成分与测序丢失和技术伪影相关的稀疏偏差，从而获得抗稀疏的表示 | 摘要中未明确说明研究局限性 | 实现空间转录组学中准确的空间域识别，克服数据稀疏性和组织边界处表示过平滑的问题 | 空间转录组学数据，包括五个基准数据集及人类乳腺癌数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | NA | 自监督张量学习框架 | 空间转录组数据 | 五个基准数据集及人类乳腺癌数据 | NA | NA | NA | NA |
| 70 | 2026-11-02 |
Shared genetic basis of sarcopenia and osteoporosis: insights from GWAS and multi-omics analyses
2026-Sep, Journal of bone and mineral metabolism
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s00774-026-01757-5
PMID:42763834
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研究论文 | 该研究通过GWAS和多组学分析揭示了肌肉减少症与骨质疏松症之间的共享遗传基础 | 构建了肌肉减少症的潜在因子模型，并综合运用GWAS、功能注释、孟德尔随机化、共定位以及单细胞和空间转录组学揭示了共享遗传变异和关键共病基因 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究肌肉减少症与骨质疏松症之间的共享遗传结构和潜在共病机制 | 肌肉减少症和骨质疏松症及其相关性状 | 机器学习, 数字病理学 | 肌肉减少症, 骨质疏松症 | GWAS, 连锁不平衡得分回归, MiXeR, conjFDR, 功能注释, 预测表达, 孟德尔随机化, 共定位分析, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | 潜在因子模型, MetaXcan | GWAS汇总统计数据, 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 71 | 2026-11-02 |
Single-cell Transcriptomic Profiling Reveals Novel Stem Cell Markers for Corneal Limbal Epithelium Homeostasis
2026-Aug-31, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-10594726/v1
PMID:42922712
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研究论文 | 该研究利用Sox9-EGFP转基因小鼠作为参考标记，通过单细胞RNA测序绘制了角膜缘上皮细胞在稳态下的转录组图谱，并鉴定了新的角膜缘干细胞标记物 | 首次以Sox9-EGFP为参考标记，通过单细胞转录组测序系统描绘角膜缘上皮细胞的异质性组成，并鉴定出Gabrp、Fmo1、Fmo2和Alcam等新的角膜缘干细胞候选标记物 | 研究基于Sox9-EGFP转基因小鼠模型，尚未在人类角膜缘组织中验证这些新标记物的保守性和功能 | 表征稳态下角膜缘上皮细胞的转录组图谱，并鉴定新的角膜缘干细胞标记物 | Sox9-EGFP转基因小鼠的角膜缘上皮细胞 | 单细胞转录组学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序、qPCR、Western blotting、免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据、图像 | 21,066个活细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 72 | 2026-11-02 |
Integrating single-cell and bulk transcriptomic perturbation resources reveals complementary therapeutic spaces for drug repurposing
2026-Aug-31, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-10606217/v1
PMID:42922874
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研究论文 | 开发了CDRPipe统一框架，整合微阵列和单细胞来源的扰动图谱资源，用于基于转录组的药物重定位 | 首次将CMap微阵列扰动数据与Tahoe-100M单细胞来源的伪批量扰动数据进行统一整合，揭示两种资源仅3.5%重叠、高度互补，证明整合独立扰动资源可扩展治疗覆盖范围并识别高置信度共识候选药物 | 两种资源召回率差异部分源于药物库组成和临床注释覆盖度的不同，并非完全反映技术本身优劣；单细胞伪批量数据虽然召回率更高但可能受注释偏差影响 | 构建统一的转录组药物重定位框架，整合异质性扰动资源以提高药物重定位的稳健性和可解释性 | 233个来自GEO和CREEDS的疾病特征签名，以及CMap（1,968个质控实验）和Tahoe-100M（56,827个实验）的扰动签名 | 药物基因组学 | 自身免疫疾病，子宫内膜异位症 | 微阵列，单细胞RNA测序 | 基于排名的连接性评分模型，经验零模型 | 转录组数据 | 233个疾病特征签名，1,968个CMap扰动实验，56,827个Tahoe-100M单细胞扰动实验 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | Connectivity Map (CMap), Tahoe-100M | CMap微阵列扰动图谱与Tahoe-100M单细胞RNA测序伪批量扰动图谱的整合分析框架 |
| 73 | 2026-11-02 |
CMV-specific clonal expansion in human Th1 and GZMK⁺ CD8⁺ T cells
2026-Aug-04, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04198-5
PMID:42958310
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序、TCR测序和流式细胞术分析六个队列，刻画了潜伏性巨细胞病毒（CMV）感染相关的人体免疫重塑及克隆扩增特征 | 首次结合新建立的CMV特异性TCRβ数据库与预测模型CMVerify，在多个独立队列中重复鉴定出新的CMV特异性克隆扩增，并发现GZMK⁺ CD8⁺ T细胞和Th1细胞是此前被低估的CMV应答组分 | 摘要未明确说明样本量、队列人口学特征及各平台具体配置等细节，纵向追踪仅涉及一名血清转换个体 | 在单细胞分辨率上系统刻画潜伏性CMV感染相关的人体免疫重塑和克隆扩增特征 | 六个包含CMV血清阳性/阴性个体的人体队列，包括两名新建立的队列及一名发生血清转换的纵向追踪个体 | 免疫学、单细胞组学 | 巨细胞病毒感染 | 单细胞RNA测序、TCR测序、流式细胞术 | CMVerify预测模型 | 单细胞转录组数据、TCR序列数据、流式细胞术数据 | 六个队列（含两个新建立队列）及一名纵向追踪的血清转换个体，具体人数未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA-seq、TCR测序 | NA | NA |
| 74 | 2026-11-02 |
LLM-based cell type annotation harmonization across single-cell studies using GCTHarmony
2026-Aug-04, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04231-7
PMID:42958419
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研究论文 | 开发了基于LLM的细胞类型注释协调方法GCTHarmony，用于跨单细胞研究统一细胞类型注释 | 利用OpenAI的文本嵌入模型，将任意细胞类型注释映射到标准化的细胞本体术语，并协调不同研究间注释层次的差异 | 摘要中未提及 | 解决整合先前分析的单细胞RNA-seq研究时细胞类型注释不一致的问题 | 单细胞RNA-seq研究中的细胞类型注释 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA-seq | LLM | 文本 | NA | OpenAI | NA | 文本嵌入模型 | OpenAI的文本嵌入模型 |
| 75 | 2026-11-02 |
Single-cell dissection of shoulder-derived mesenchymal stem cells reveals source-specific progenitor heterogeneity and a SIX2-driven chondrogenic program
2026-Aug-03, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-026-10251-7
PMID:42957914
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研究论文 | 该研究比较了人类肩峰下滑囊来源的间充质干细胞（sMSCs）和肩袖止点来源的间充质干细胞（rMSCs），通过功能实验和纵向bulk及单细胞RNA测序，揭示了来源特异性的分化轨迹，并鉴定出SIX2是驱动软骨生成的关键调控因子 | 首次系统比较了肩关节不同解剖部位来源的MSCs的软骨生成潜能，构建了单细胞图谱揭示组织来源决定谱系命运，发现SIX2作为能力因子协调早期增殖扩展与晚期基质组装并主动抑制炎症信号，且SIX2过表达可挽救sMSCs的软骨生成缺陷并将其轨迹重编程为再生表型 | 摘要中未明确提及研究局限性，可能包括样本量有限、体外实验未能完全模拟体内微环境、慢病毒过表达的临床转化安全性等问题尚待进一步验证 | 阐明肩袖不同部位来源MSCs的软骨生成潜力差异及其潜在分子机制，为精准细胞来源选择和谱系特异性治疗设计提供分子框架 | 人类肩峰下滑囊来源的间充质干细胞（sMSCs）和肩袖止点来源的间充质干细胞（rMSCs） | 单细胞组学、干细胞生物学、再生医学 | 肩袖损伤 | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、功能软骨生成实验、慢病毒过表达 | NA | 基因表达数据（转录组）、单细胞转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 76 | 2026-11-02 |
Integration of bulk RNA-seq data with single-cell RNA-seq data to identify urinary biomarkers derived from prostate tumor tissues
2026-Aug-03, BMC urology
IF:1.7Q3
DOI:10.1186/s12894-026-02295-y
PMID:42958227
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研究论文 | 该研究整合批量RNA-seq与单细胞RNA-seq数据，筛选并验证尿液来源的MARCKSL1作为前列腺癌及临床显著前列腺癌的无创诊断生物标志物 | 通过整合链特异性捕获批量RNA-seq与单细胞RNA-seq数据，系统筛选前列腺肿瘤细胞来源的尿液mRNA生物标志物，并首次验证尿液MARCKSL1对前列腺癌和临床显著前列腺癌的诊断价值 | qPCR验证样本量较小（63例尿液样本），且体外敲低实验仅初步探索生物学功能，仍需更大规模临床队列验证 | 筛选前列腺肿瘤细胞来源的尿液mRNA生物标志物，用于前列腺癌及临床显著前列腺癌的无创诊断和风险分层 | 前列腺癌患者的前列腺肿瘤及癌旁正常组织、前列腺癌患者尿液样本、年龄匹配的无癌健康男性尿液样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 链特异性捕获RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qPCR, 基因敲低实验 | NA | RNA-seq数据, 单细胞转录组数据, qPCR数据 | 5对肿瘤及癌旁正常前列腺组织、10例前列腺癌患者尿液和年龄匹配健康男性尿液、3例正常前列腺组织和13例前列腺癌组织的scRNA-seq数据、63例尿液样本（33例前列腺癌患者和30例健康男性） | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 77 | 2026-11-02 |
The VASN-YAP-MYL9 axis drives M2-like macrophage polarization and immune evasion in colorectal cancer
2026-Aug-03, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08741-7
PMID:42958563
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研究论文 | 该研究揭示了VASN-YAP-MYL9轴通过驱动M2样巨噬细胞极化介导结直肠癌免疫逃逸的机制 | 首次发现VASN通过激活Hippo-YAP通路促进YAP/TEAD4复合物直接激活MYL9转录，进而通过IL-4和IL-13旁分泌驱动巨噬细胞M2样极化，形成新的VASN-YAP-MYL9免疫逃逸轴 | 摘要中未明确说明研究的具体局限性 | 探究VASN在结直肠癌肿瘤免疫微环境调控中的具体作用及其分子机制 | 结直肠癌患者肿瘤组织样本及同系小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | TCGA转录组分析, 单细胞转录组测序, 免疫组织化学, 免疫荧光, Transwell共培养, ELISA, 染色质免疫沉淀(ChIP), 双荧光素酶报告基因实验 | NA | 转录组数据, 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞转录组测序, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 78 | 2026-11-02 |
Targeting monocyte dysregulation in ovarian cancer: insights from single-cell genomics and Mendelian randomization
2026-Aug-01, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-026-02217-4
PMID:42958425
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研究论文 | 该研究整合单细胞转录组学和孟德尔随机化，识别与卵巢癌风险存在因果关联的单核细胞相关基因，并验证SGK1在免疫抑制性巨噬细胞极化中的作用 | 将单细胞基因组学与孟德尔随机化相结合，从因果层面揭示单核细胞在卵巢癌肿瘤免疫微环境中的作用，并首次提出SGK1作为重塑免疫抑制微环境的精准治疗靶点 | 因果关系主要依赖孟德尔随机化和生物信息学分析，体外实验验证有限，缺乏体内动物模型和临床队列验证 | 探究单核细胞在卵巢癌发病中的因果作用及其相关基因，并寻找可重塑肿瘤免疫微环境的治疗靶点 | 卵巢癌患者单细胞RNA测序数据、eQTLGen统计数据和卵巢癌GWAS数据（1,588例病例） | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, eQTL分析, qRT-PCR, Western blot, 免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据, 基因组关联数据, 文本 | GEO和TISCH数据库的单细胞RNA测序数据集、eQTLGen统计量（n=31,684）和卵巢癌GWAS数据（1,588例病例） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 79 | 2026-11-02 |
Single-cell RNA-seq reveals SPP1+ tumor-associated macrophage population associated with collagen remodeling in anaplastic thyroid cancer
2026-Aug-01, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-16648-1
PMID:42963735
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研究论文 | 该研究结合单细胞RNA测序和bulk转录组数据，揭示了未分化甲状腺癌中SPP1⁺肿瘤相关巨噬细胞群体与胶原重塑的关联 | 首次鉴定出未分化甲状腺癌中富集的SPP1⁺肿瘤相关巨噬细胞亚群，并揭示其通过SPP1-CD44信号与间充质样ATC细胞相互作用，促进胶原重塑 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据和小鼠模型，需要进一步在临床样本中验证；SPP1抑制仅部分抑制肿瘤生长和胶原积累 | 探究肿瘤相关巨噬细胞在未分化甲状腺癌细胞胶原重塑中的作用及机制 | 未分化甲状腺癌肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞和肿瘤细胞 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 免疫荧光分析 | CIBERSORTx, 拟时序分析 | 转录组数据, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 80 | 2026-11-02 |
Endothelial regulators in the infrapatellar fat pad of osteoarthritis revealed by integrative multi-omics and genetic causal inference
2026-Jul-31, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-026-06365-0
PMID:42957875
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研究论文 | 该研究通过整合单核RNA测序、空间转录组学和孟德尔随机化分析，揭示了骨关节炎髌下脂肪垫中内皮细胞的关键调控基因FAM241A和TK2 | 首次将单核RNA测序、空间转录组学与孟德尔随机化分析相结合，鉴定出FAM241A和TK2作为骨关节炎髌下脂肪垫内皮细胞特异性的因果调控基因，并揭示了其时空调控的转录程序 | 摘要中未明确说明研究的局限性 | 阐明骨关节炎髌下脂肪垫的细胞和分子图谱，鉴定内皮细胞特异性的骨关节炎因果调控基因 | 骨关节炎患者的髌下脂肪垫组织 | 数字病理学, 机器学习 | 骨关节炎 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 孟德尔随机化分析, eQTL分析, pQTL分析, GWAS整合分析 | NA | 基因表达数据, 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |