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当前共找到 36496 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-02-18 |
Spatial transcriptomics reveals organizational properties of mouse spinal cord and alterations in neuropathic pain
2026-Jan-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.10.698734
PMID:41648549
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，揭示了小鼠脊髓的组织特性及其在神经性疼痛模型中的变化 | 首次应用空间分辨的单细胞转录组分析，系统描绘了成年小鼠脊髓的神经元亚型空间分布、性别差异及在神经性疼痛中的转录组变化 | 研究主要基于小鼠模型，结果向人类转化需进一步验证；空间转录组技术分辨率可能受限于当前平台 | 解码脊髓在健康和疾病状态下的感觉与运动功能电路机制 | 成年小鼠脊髓组织 | 空间转录组学 | 神经性疼痛 | 空间分辨单细胞转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 未明确指定样本数量，但基于成年小鼠脊髓 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 62 | 2026-02-18 |
Transcriptomic signature-guided depletion of intermediate alveolar epithelial cells ameliorates pulmonary fibrosis in mice
2026-Jan-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68354-y
PMID:41519994
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术识别了肺纤维化中的中间上皮细胞状态，并开发了一种RNA感应依赖的蛋白质翻译技术，选择性靶向并耗竭这些细胞，从而在小鼠模型中减轻了肺纤维化 | 引入了RNA感应依赖的蛋白质翻译技术，能够选择性靶向并耗竭Krt8+肺泡分化中间细胞，首次证明了这些过渡性上皮细胞在肺纤维化中的致病驱动作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类细胞的应用和临床转化仍需进一步验证 | 探究肺纤维化中中间上皮细胞的功能贡献，并开发靶向治疗策略 | 小鼠模型中的Krt8+肺泡分化中间细胞及人类KRT5-/KRT17+异常基底样细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序，RNA感应依赖的蛋白质翻译技术 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 63 | 2026-02-18 |
3D reconstruction of spatial transcriptomics with spatial pattern enhanced graph convolutional neural network
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag060
PMID:41686651
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研究论文 | 本文提出了一种名为Spa3D的方法，利用反泄漏傅里叶变换和图卷积神经网络模型，从多个二维空间转录组切片重建三维空间结构 | Spa3D通过三维重建克服了现有方法仅依赖二维空间坐标的限制，提升了空间域识别、细胞间通讯分析、器官级时空发育模式建模和三维空间轨迹注释的能力 | NA | 解决空间转录组数据分析中因依赖二维坐标而无法准确进行三维空间分析的问题 | 空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 图卷积神经网络 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 64 | 2026-02-18 |
Imputing missing values in single-cell RNA-sequencing data: a statistical and machine learning-based approach
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag072
PMID:41697922
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研究论文 | 本文提出了一种名为scDDI的新方法，用于检测和填补单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 结合泊松-负二项混合模型进行缺失事件检测，并使用决策树回归模型进行填补，优于现有单细胞填补技术 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中因RNA含量有限导致的缺失值问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 决策树回归模型 | 基因表达矩阵 | 模拟和真实单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 65 | 2026-02-18 |
Screening Co-Diagnostic Genes for Lung Adenocarcinoma and Myocardial Infarction and Analysis of the Molecular Functions and Drug Value of the Genes
2026, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析，筛选出肺腺癌和心肌梗死的共同诊断基因MMP9，并分析了其分子功能和潜在药物价值 | 首次通过生物信息学方法系统筛选并验证了肺腺癌与心肌梗死之间的共同诊断基因MMP9，并揭示了其在炎症和免疫调节中的作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据分析，缺乏实验验证；样本来源和平台存在异质性 | 发现肺腺癌和心肌梗死的共同诊断基因，并分析其分子功能和潜在药物价值，为两种疾病的诊疗提供新策略 | 肺腺癌和心肌梗死患者的基因表达数据 | 生物信息学 | 肺腺癌, 心血管疾病 | 生物信息学分析，包括差异表达分析、WGCNA、PPI网络分析、LASSO、SVM-RFE、免疫浸润分析、药物预测、分子对接、单细胞测序分析 | LASSO, SVM-RFE | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 66 | 2026-02-18 |
Single-cell RNA sequencing of platelets: challenges and potential
2026-Jan, Journal of thrombosis and thrombolysis
IF:2.3Q2
DOI:10.1007/s11239-025-03153-8
PMID:40745405
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研究论文 | 本研究首次使用10X Genomics平台对全血来源的血小板进行单细胞RNA测序，探索其转录组特征 | 首次在全血来源的血小板富集血浆上应用10X Genomics平台进行scRNA-seq，克服了血小板RNA含量低、细胞小易激活等技术挑战 | 样本量较小（仅一名健康供体），且存在血小板易耗竭、操作敏感、RNA含量有限等技术限制 | 探索血小板单细胞转录组测序的可行性并分析其生物学特征 | 健康供体的全血来源的血小板 | 单细胞组学 | 血管疾病 | 单细胞RNA测序 | UMAP聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 1名健康供体的全血样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10X Genomics平台（具体型号未指定），用于血小板富集血浆的scRNA-seq |
| 67 | 2026-02-18 |
Deciphering the therapeutic mechanism of kaempferol in diabetic retinopathy via the P21/Thioredoxin axis
2026-Jan, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-025-05412-x
PMID:41129046
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研究论文 | 本研究探讨了山奈酚通过P21/硫氧还蛋白轴在糖尿病视网膜病变中的治疗机制 | 首次结合加权基因共表达网络分析和单细胞RNA测序分析，揭示了山奈酚调控P21/硫氧还蛋白通路的新机制，并建立了成纤维细胞活性与DR纤维化进展之间的新联系 | 研究未明确山奈酚的具体给药剂量和长期治疗效果，且分子机制仍需进一步体内验证 | 阐明糖尿病视网膜病变从早期到晚期的进展相似性，并探索山奈酚治疗DR的关键靶点 | 糖尿病视网膜病变的分子机制和山奈酚的治疗作用 | 生物信息学与分子生物学 | 糖尿病视网膜病变 | 加权基因共表达网络分析, 单细胞RNA测序, 分子对接, Evans Blue渗漏实验, H&E染色, PAS染色, TUNEL染色, ELISA, 免疫荧光, Western blotting, 实时PCR | NA | 基因表达数据, 图像数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 68 | 2026-02-18 |
Multiomics analysis of polyamine metabolism in colorectal cancer, highlighting the key role of extracellular putrescine in impairing CXCR6+CD8+ T cell anti-tumor activity
2026, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.20663
PMID:41700134
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了结直肠癌中多胺代谢，特别是细胞外腐胺，如何通过损害CXCR6+CD8+ T细胞的抗肿瘤活性来促进肿瘤进展 | 定义了新的“Pi值”来量化CXCR6+CD8+ T细胞周围的局部腐胺积累，并揭示了细胞外腐胺直接抑制这些T细胞毒性功能的新机制 | 研究主要基于体外实验和动物模型，其在人类患者中的直接临床转化仍需进一步验证 | 阐明腐胺代谢在结直肠癌肿瘤免疫监视受损中的作用机制 | 结直肠癌患者样本、结直肠癌细胞系（HCT-116和RKO）、CXCR6+CD8+ T细胞、DSS诱导的结肠炎小鼠模型 | 多组学分析 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，多组学分析 | NA | 单细胞转录组数据，基因表达数据 | 来自131名受试者的221个样本，共计517,191个细胞；两个独立队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 69 | 2026-02-18 |
Plasma Proteomics Identifies Thousand-and-One-Amino Acid Kinase 3 as a Potential Biomarker of Rheumatoid Arthritis Activity and a Novel Therapeutic Target
2025-Dec-22, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70020
PMID:41429590
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研究论文 | 本研究通过血浆蛋白质组学分析，发现TAOK3作为类风湿关节炎活动期骨破坏的潜在生物标志物和治疗靶点 | 首次将TAOK3与类风湿关节炎活动期的骨破坏关联，并验证其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 研究样本量有限，且主要在体外和动物模型中进行功能验证，需进一步临床验证 | 识别类风湿关节炎活动期骨破坏的新型生物标志物，为精准监测和靶向治疗提供策略 | 类风湿关节炎患者血浆样本、成纤维样滑膜细胞和胶原诱导关节炎小鼠模型 | 蛋白质组学 | 类风湿关节炎 | 数据非依赖性采集质谱、单细胞RNA测序、酶联免疫吸附测定、多重免疫组织化学 | NA | 蛋白质组数据、RNA测序数据 | 160名RA患者和40名健康对照的血浆样本，以及两个独立验证队列（N1=50，N2=10） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 70 | 2026-02-18 |
CXCR6 defines a distinct resident state in γδ T cells for protecting from liver cirrhosis
2025-Dec-11, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001643
PMID:41380134
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术，揭示了肝脏中CD69+CXCR6+ γδ T细胞在抑制肝纤维化中的关键保护作用 | 首次鉴定出CXCR6作为肝脏驻留γδ T细胞的标志物，并阐明其通过FasL-Fas信号通路诱导肝星状细胞凋亡从而抑制纤维化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人体内的验证和临床转化仍需进一步探索 | 探究组织驻留记忆T细胞（特别是γδ T细胞）在肝纤维化发生发展中的作用机制 | 肝脏中的γδ T细胞亚群（特别是CD69+CXCR6+细胞） | 免疫学 | 肝硬化 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 71 | 2026-02-18 |
Sig27 stratifies prostate cancer recurrence by assessing the immunosuppressive properties of tumors
2025-Nov-01, Endocrine-related cancer
IF:4.1Q2
DOI:10.1530/ERC-25-0326
PMID:41186269
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研究论文 | 本研究评估了新型27基因面板Sig27及其衍生面板Sig27IMG在前列腺癌复发预测中的作用，并揭示了其与免疫抑制特征（特别是肿瘤相关单核/巨噬细胞和内皮细胞）的关联 | 开发了新型27基因面板Sig27及其衍生5基因面板Sig27IMG，用于前列腺癌复发风险分层，并首次系统性地揭示了这些基因在多种癌症类型中与肿瘤相关单核/巨噬细胞、树突状细胞和内皮细胞的免疫抑制功能的关联 | 研究主要基于回顾性RNA-seq数据集，需要前瞻性临床验证来确认其预测价值；样本量虽大但可能存在批次效应；未详细探讨这些基因在肿瘤微环境中的具体作用机制 | 开发并验证基因表达面板用于前列腺癌复发风险分层，并探究其与肿瘤免疫抑制特征的关联 | 前列腺癌患者肿瘤组织样本（包括原发性和转移性）以及多种癌症类型的肿瘤样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 基因表达面板（多基因特征） | 基因表达数据（RNA-seq和scRNA-seq） | 批量RNA-seq：3,133个肿瘤样本（13个数据集）；单细胞RNA-seq：53名患者（6个数据集）；多癌症类型验证：单细胞RNA-seq 386名患者（26种癌症类型），批量RNA-seq 5,672名患者（17种癌症类型） | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 72 | 2026-02-18 |
Decoding Cellular Stress States for Toxicology Using Single-Cell Transcriptomics
2025-Aug-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.10.657506
PMID:40766395
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学平台分析HepaRG细胞在多种化学物质暴露下的应激反应状态 | 应用TempO-LINC平台生成大规模单细胞转录组数据，系统解码细胞应激状态并可视化动态亚群变化 | 仅使用HepaRG细胞系，暴露时间固定为24小时，可能无法完全反映体内复杂环境 | 解码细胞应激状态以应用于毒理学研究 | HepaRG细胞 | 单细胞转录组学 | 毒理学 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约40,000个HepaRG细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | TempO-LINC | TempO-LINC平台用于生成单细胞转录组图谱 |
| 73 | 2026-02-18 |
Spatiotemporal transcriptomic profiling reveals metabolic dysfunction prior to overt tauopathy in the PS19 mouse model
2025-Jul-10, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6941464/v1
PMID:40671812
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研究论文 | 本研究利用PS19小鼠模型，通过空间转录组学分析揭示了tau蛋白病早期代谢功能障碍与区域脆弱性的关联 | 首次在PS19小鼠模型中结合空间转录组学技术，揭示了代谢功能障碍在可检测tau缠结病理出现之前的早期发生，并关联了区域脆弱性与转录组变化 | 研究基于转基因小鼠模型，可能无法完全模拟人类神经退行性疾病的复杂性，且样本时间点有限 | 探究tau蛋白病中区域脆弱性与tau驱动转录组变化之间的关系，特别是代谢功能障碍的作用 | PS19转基因小鼠模型（tau P301S）的海马体和皮质区域 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学分析 | NA | 空间转录组数据 | PS19小鼠模型在选定疾病阶段的海马体和皮质区域样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 74 | 2026-02-18 |
A multi-step immune-competent genetic mouse model reveals phenotypic plasticity in uveal melanoma
2025-Jun-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.04.657841
PMID:40502063
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研究论文 | 本文开发了一种多步骤基因工程小鼠模型，用于模拟葡萄膜黑色素瘤的进展，并揭示其表型可塑性 | 该模型首次结合了时空控制的GNAQ突变、BAP1缺失和MYC激活，成功模拟了人类葡萄膜黑色素瘤的进展和免疫微环境 | 模型可能无法完全捕捉人类疾病的所有复杂性，且单细胞测序样本量有限 | 研究葡萄膜黑色素瘤的生物学机制、驱动基因功能及免疫治疗策略 | 基因工程小鼠模型中的葡萄膜黑色素瘤肿瘤细胞及其微环境 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确指定，但涉及小鼠模型中的肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 75 | 2026-02-18 |
Single-cell transcriptomics reveals targeted modulation of inflammatory repertoire by SOCE blockers
2025-May-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.28.651042
PMID:40654653
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学揭示了SOCE阻断剂如何靶向调节免疫细胞的炎症反应谱 | 首次利用多路单细胞RNA测序技术，系统比较了两种典型SOCE阻断剂BTP2和CM4620对多克隆刺激下人类外周血单个核细胞中不同免疫细胞亚群的影响，揭示了其在降低细胞毒性同时保留耐受性相关通路的特异性免疫调节机制 | 研究仅基于体外多克隆刺激的PBMCs模型，未在体内疾病模型或临床样本中验证；样本来源为健康供者，未涵盖病理状态下的免疫细胞；机制研究局限于转录组水平，缺乏蛋白质或功能层面的深入验证 | 探究SOCE阻断剂对免疫细胞功能的特异性调节作用及其分子机制 | 多克隆刺激的正常人类外周血单个核细胞（PBMCs），重点关注CD8效应T细胞、自然杀伤细胞和CD4调节性T细胞 | 单细胞转录组学 | 免疫介导性疾病（如器官移植） | 多路单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，但使用正常人类PBMCs | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 76 | 2026-02-18 |
Identifiability for Gaussian Processes with Holomorphic Kernels
2025-Apr, ... International Conference on Learning Representations
PMID:41695776
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研究论文 | 本文为高斯过程（GPs）中在零点附近全纯的核函数参数可识别性建立了新的理论框架 | 开发了一种新颖的理论框架，用于确定在零点附近全纯的核函数参数的可识别性，填补了现有研究主要关注Matérn型核的空白 | NA | 研究高斯过程核函数参数的可识别性问题，以支持参数在应用中的有意义的解释 | 高斯过程（GPs）及其核函数参数 | 机器学习 | NA | NA | 高斯过程（GPs） | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 77 | 2026-02-18 |
A comparative study of statistical methods for identifying differentially expressed genes in spatial transcriptomics
2025-Feb-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.17.638726
PMID:40027680
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研究论文 | 本文提出了一种基于广义估计方程框架的广义得分检验方法，用于空间转录组学数据中的差异表达基因识别，并通过模拟和实际癌症数据集验证了其优越性 | 提出了一种新的广义得分检验方法，有效整合空间相关性，相比常用的Wilcoxon秩和检验，能更好地控制假阳性率并提高生物学相关性 | 研究主要基于模拟和特定癌症数据集验证，可能未覆盖所有空间转录组学数据场景，且方法依赖于R包实现，需进一步优化计算效率 | 比较和开发更稳健的统计方法，以识别空间转录组学数据中的差异表达基因 | 空间转录组学数据，特别是来自乳腺癌和前列腺癌的样本 | 空间转录组学 | 乳腺癌, 前列腺癌 | 空间转录组学分析 | 广义估计方程, 广义得分检验, Wilcoxon秩和检验 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 78 | 2026-02-18 |
Seq-Scope-eXpanded: Spatial Omics Beyond Optical Resolution
2025-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.04.636355
PMID:39975076
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Seq-Scope-X的空间组学技术，通过组织扩张实现亚微米级分辨率，超越传统测序方法的限制 | 结合组织扩张技术，将Seq-Scope的分辨率提升至亚微米级，首次在测序方法中接近光学分辨率，并揭示核质转录组差异 | 未明确提及技术在大规模应用中的成本、通量或数据处理复杂性 | 开发超高分辨率空间转录组和蛋白质组分析工具，以突破现有测序方法的分辨率限制 | 肝脏、大脑、结肠等组织样本，以及小鼠脾脏和人类扁桃体 | 空间组学 | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学、组织扩张技术 | NA | 空间转录组数据、蛋白质组数据 | 未指定具体样本数量，但涉及多种组织类型 | NA | 单细胞空间转录组学、空间蛋白质组学 | Seq-Scope-X | Seq-Scope-eXpanded，结合组织扩张的亚微米分辨率空间组学平台 |
| 79 | 2026-02-18 |
Deconvolution and Phylogeny Inference of Diverse Variant Types Integrating Bulk DNA-seq with Single-cell RNA-seq
2025-Jan-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.24.634791
PMID:39975330
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研究论文 | 本文开发了一种名为TUSV-int的方法，通过整合bulk DNA-seq和scRNA-seq数据，进行去卷积和系统发育推断，以解决癌症克隆结构重建中的技术限制 | TUSV-int首次整合bulk DNA-seq和scRNA-seq数据，利用整数线性规划同时处理SNV、CNA和SV等多种变异类型，提高了克隆谱系树的分辨率 | 方法依赖于scRNA-seq数据的可用性，且scDNA-seq的高成本和挑战性可能限制大规模队列应用，对结构变异和拷贝数变异的观测在RNA-seq中仍存在困难 | 开发一种整合多组学数据的方法，以改进癌症克隆谱系树的重建和突变历史解析 | 癌症基因组数据，包括bulk DNA-seq和scRNA-seq数据，专注于乳腺癌数据集 | 生物信息学 | 乳腺癌 | bulk DNA-seq, scRNA-seq | 整数线性规划 | 基因组序列数据，RNA序列数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk DNA-seq | NA | NA |
| 80 | 2026-02-18 |
Cystic fibrosis-related diabetes is associated with reduced islet protein expression of GLP-1 receptor and perturbation of cell-specific transcriptional programs
2024-10-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-76722-1
PMID:39463434
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研究论文 | 本研究探讨了囊性纤维化相关糖尿病（CFRD）中胰岛GLP-1受体表达降低及细胞特异性转录程序紊乱的机制 | 首次结合空间转录组学和免疫组化揭示CFRD中胰岛α/β细胞基因表达失调及GLP-1R蛋白表达特异性降低 | 样本量有限，未验证GLP-1R恢复是否能直接改善β细胞功能 | 阐明CFRD中胰岛素分泌受损的分子机制 | 人类胰腺组织（CFRD患者与非CF/非糖尿病对照） | 空间转录组学 | 囊性纤维化相关糖尿病 | 免疫组化、空间转录组学、基因集富集分析 | NA | 组织切片图像、空间基因表达数据 | 人类CFRD与非CF/非糖尿病对照胰腺样本（未明确数量） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |