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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-09-07 |
HIF3A-mediated aberrant activation of TXNIP promotes Alzheimer's disease progression
2026-Mar-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-43404-z
PMID:41807716
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析,揭示HIF3A通过转录上调TXNIP促进阿尔茨海默病中星形胶质细胞的氧化应激,为治疗提供新靶点 | 首次在单细胞水平揭示HIF3A在星形胶质细胞中通过直接结合TXNIP启动子调控氧化应激的机制,并采用多种机器学习和功能实验进行验证 | 未提供明确的局限性说明 | 阐明阿尔茨海默病中细胞类型特异性的氧化应激机制,并识别关键基因作为潜在治疗靶点 | 阿尔茨海默病相关的单细胞RNA测序数据,涉及多种细胞类型,重点是星形胶质细胞 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | scRNA-seq | 机器学习 | 单细胞基因表达数据 | NA(未提供具体样本数量) | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 62 | 2026-09-07 |
Mechanism of action of Astragalus membranaceus for treating diabetic foot ulcers based on single-cell RNA sequencing data and network pharmacology
2026-Mar-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-41921-5
PMID:41807627
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研究论文 | 结合单细胞RNA测序和网络药理学,探究黄芪治疗糖尿病足溃疡的分子机制 | 首次在单细胞水平上解析黄芪治疗糖尿病足溃疡的机制,将黄芪活性成分与巨噬细胞异质性联系起来 | 研究基于公开数据集和临床样本,需进一步的功能和转化研究验证 | 探索黄芪治疗糖尿病足溃疡的潜在分子机制 | 糖尿病足溃疡和足部非溃疡组织样本 | 生物信息学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序、网络药理学、分子对接、qPCR验证 | NA | 单细胞基因表达数据、药物化合物结构数据 | 单细胞队列含4个非糖尿病足溃疡和5个糖尿病足溃疡样本;临床验证队列含6个NFU和9个DFU患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 63 | 2026-09-07 |
Perivascular mesenchymal cells instruct ST2+ reparative macrophages to promote endovascular injury-induced neointimal hyperplasia in mice
2026-Mar-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68587-x
PMID:41794821
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研究论文 | 本研究使用内皮损伤小鼠模型,揭示血管周围MSC通过IL33-ST2-OPN轴促进ST2+修复性巨噬细胞功能,驱动新生内膜增生,并提出局部siRNA递送的潜在治疗策略。 | 首次阐明IL33-ST2-OPN轴在血管周围MSC与修复性巨噬细胞间串扰中的作用,并利用单细胞测序揭示巨噬细胞表型转换,提出局部递送siRNA的治疗新方法。 | 研究仅在雄性小鼠中进行,可能未涵盖性别差异;实验模型为小鼠,人体验证尚缺。 | 探究血管损伤后免疫-基质细胞相互作用机制,识别驱动修复性巨噬细胞功能的信号通路并验证潜在治疗靶点。 | 血管周围间充质基质细胞、ST2+修复性巨噬细胞、血管平滑肌细胞和小鼠内皮损伤模型。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、基因沉默(siRNA)、免疫组化。 | NA | 单细胞表达数据、图像、实验数据。 | 小鼠内皮损伤模型(样本数未明确)。 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于时间分辨单细胞测序 |
| 64 | 2026-09-07 |
Selective weakening of population-coupled synaptic activity in vivo in a mouse model of amyloid-beta pathology
2026-Mar-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69866-3
PMID:41794826
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型探究阿尔茨海默病早期淀粉样病理中突触功能障碍的选择性特征,发现群体耦合的突触活动在早期阶段选择性地减弱,并涉及特定神经元类型 | 首次揭示阿尔茨海默病早期淀粉样病理中的突触功能障碍并非全局性,而是选择性发生在与群体活动紧密耦合的突触上,并采用体内成像与空间转录组学相结合的方法 | 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类阿尔茨海默病,且早期阶段的具体分子机制仍需深入探索 | 阐明早期阿尔茨海默病相关突触病理的分布特征及其分子机制 | 表达淀粉样蛋白前体蛋白的App小鼠及对照小鼠,关注突触、神经元和神经胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 体内双光子成像、空间转录组学、电生理记录 | 小鼠模型、神经网络模型 | 图像(钙成像、突触结构成像)、转录组数据 | 使用App小鼠(具体数量未明确)及对照小鼠 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 65 | 2026-09-07 |
AI-enabled single-cell dissection of the palmitoylation landscape identifies a multicellular prognostic program in gastric cancer
2026-Mar-07, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01359-4
PMID:41794921
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量队列,解析胃癌中棕榈酰化景观,并识别出一个多细胞预后程序。 | 首次通过AI赋能的单细胞分析描绘胃癌棕榈酰化景观,识别出与转移和免疫抑制相关的恶性细胞亚群及一个87基因多细胞预后特征。 | 未明确提及,但可能涉及样本量有限或需要进一步功能验证。 | 揭示棕榈酰化在胃癌肿瘤生态系统中的作用及其对临床结局的影响,并开发预后分层工具。 | 胃癌肿瘤中的恶性细胞、免疫细胞和基质细胞。 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序、药物响应建模、功能实验和异种移植 | 卷积神经网络 | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、批量转录组数据、药物响应数据 | 25个胃癌肿瘤样本,共119,931个细胞,以及外部批量队列和功能实验样本。 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium Slides |
| 66 | 2026-09-07 |
Combining AI to reveal CCDC3-mediated pathways of colorectal cancer liver metastasis
2026-Mar-07, NPJ digital medicine
IF:12.4Q1
DOI:10.1038/s41746-026-02457-0
PMID:41792471
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序、加权基因共表达网络分析和非负矩阵分解,构建染色体不稳定性(CIN)指数,并发现CAF来源的CCDC3通过CCDC3/CXCR3/STAT3/CDT1信号轴促进结直肠癌肝转移 | 首次揭示癌症相关成纤维细胞(CAF)来源的CCDC3通过物理相互作用于CXCR3,激活STAT3磷酸化及下游CDT1转录,形成新的信号轴,从而驱动染色体不稳定性和结直肠癌肝转移 | 研究主要基于体外和体内模型,缺乏大规模临床样本的验证;具体信号轴的细节机制需进一步探索 | 阐明结直肠癌肝转移中染色体不稳定性相关的分子机制,并评估其作为治疗靶点的潜力 | 结直肠癌细胞系、小鼠模型以及人类结直肠癌组织样本 | 机器学习和数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、加权基因共表达网络分析、非负矩阵分解、人工智能生物知识图分析、体外和体内实验 | 非负矩阵分解、生物知识图分析 | 基因表达数据(单细胞RNA-seq) | 未明确,研究涉及结直肠癌组织和细胞系 | 未明确 | 单细胞RNA测序 | 未明确 | 未明确 |
| 67 | 2026-09-07 |
Cuproptosis-associated PDHA1 promotes sarcoma progression and immunotherapy responsiveness via the E2F1-PD-L1 axis: a multi-omics and clinical validation study
2026-Mar-06, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01298-0
PMID:41792370
|
研究论文 | 通过多组学及临床验证,发现铜死亡相关基因PDHA1通过E2F1-PD-L1轴促进肉瘤进展和免疫逃逸,并预测免疫检查点抑制剂的反应性 | 首次揭示PDHA1通过E2F1转录激活PD-L1启动子,连接铜死亡代谢与免疫逃逸,并整合多组学、功能实验和临床数据验证其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 研究主要基于公共数据集和体外/体内模型,临床试验验证不足;铜死亡在肉瘤中的确切机制和PDHA1的特异性尚需进一步探索 | 探索PDHA1在肉瘤进展和免疫逃逸中的作用及其机制,评估其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 肉瘤患者样本、细胞系、异种移植小鼠模型 | 多组学 | 肉瘤 | 多组学分析、单细胞RNA测序、免疫组化、多重免疫荧光 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组、临床病理数据 | 多个肉瘤队列(TCGA/GEO/ICGC)及临床样本 | NA | 单细胞RNA测序、免疫组化、多重免疫荧光 | NA | NA |
| 68 | 2026-09-07 |
Early cAMP signaling orchestrates single-cell synchronicity throughout Dictyostelium development
2026-Mar-06, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09806-5
PMID:41792273
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析,揭示早期cAMP信号在盘基网柄菌发育过程中协调单细胞同步性的作用 | 首次使用单细胞RNA测序定量分析发育过程中的单细胞同步性,并揭示cAMP信号在建立和维持同步性中的关键作用 | 尚无相关信息 | 探讨cAMP信号在盘基网柄菌发育中如何调控单细胞同步性及其机制 | 盘基网柄菌发育过程中的单个细胞 | 单细胞生物学 | 无 | 单细胞RNA测序 | 无 | 单细胞转录组数据 | 无具体样本数量信息 | 无 | 单细胞RNA测序 | 无 | 无 |
| 69 | 2026-09-07 |
Single-Cell Profiling of Splenic Immune Ageing and Chronic Stress Adaptations in Mice With Natural Microbiota
2026-03, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.70170
PMID:41817300
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了年轻、老年及慢性应激老年小鼠脾脏免疫细胞,并结合公共数据集构建了超过27.2万个脾细胞的综合图谱,揭示了脾脏免疫衰老的保守特征及慢性应激的影响 | 利用自然微生物群小鼠进行跨队列单细胞分析,揭示了Gzmk CD8 T细胞中Gzmk-high和Gzmk-low亚群的异质性与功能转变,并整合6个公共数据集构建大规模脾细胞图谱,确定保守的衰老特征 | 未提供具体限制信息 | 探索脾脏免疫衰老及其与慢性应激的相互作用,并构建脾细胞参考图谱 | 小鼠脾脏细胞(包括T细胞、NK细胞、巨噬细胞、B细胞等) | 单细胞测序 | 免疫衰老 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 年轻、老年及慢性应激老年小鼠(具体数量不明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 70 | 2026-09-07 |
Increased CD44 Expression in Endothelial Cells Induced by Advanced Glycation End Products Leads to Insufficient Maturation of Angiogenesis
2026-Mar, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71088
PMID:41840419
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研究论文 | 该研究探讨了晚期糖基化终末产物诱导内皮细胞CD44表达增加,导致血管基底膜结构异常和病理性血管生成成熟不足的分子机制。 | 首次揭示了AGEs通过β-catenin/TCF4信号通路上调CD44,进而促进MMP9介导的基底膜过度降解,从而影响病理性血管生成的成熟过程。 | 摘要中未提及研究的局限性。 | 阐明AGEs是否改变血管基底膜结构及其潜在的分子机制。 | 氧诱导视网膜病变小鼠模型的内皮细胞、视网膜组织,以及内皮细胞-周细胞共培养体系。 | 数字病理学 | 糖尿病血管并发症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 来自GSE204880数据集的氧诱导视网膜病变小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 71 | 2026-09-07 |
Old Blood, Young Bones: Identification of Middle-Aged Myeloid Cells That Limit Cortical Bone Loss
2026-Mar, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71094
PMID:41873045
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研究论文 | 本研究通过骨髓移植和单细胞RNA测序等方法,发现中年小鼠骨髓中CD11B+CD36+髓系细胞通过表达Wnt6等因子促进皮质骨形成,从而限制中年期骨丢失。 | 首次揭示了中年期骨髓中CD11B+CD36+髓系细胞作为促成骨巨噬细胞亚群,通过分泌Wnt6等骨合成代谢因子增强成骨作用,为中年期骨骼保护提供了新机制。 | 研究主要基于小鼠模型,人体验证仅限于骨髓样本中标记物的存在,功能验证尚不充分;中年期具体时间窗口及长期效应待进一步研究。 | 探究中年期骨髓造血变化对皮质骨丢失的影响及潜在细胞机制。 | 8周和40周龄小鼠的骨髓细胞、骨髓移植后受体小鼠的骨组织、人骨髓中相应细胞亚群。 | 分子生物学 | 骨质疏松症 | 骨髓移植、Micro-CT、流式细胞术、单细胞RNA测序、谱系追踪 | NA | 基因表达数据、影像学数据、流式细胞数据 | 小鼠实验(未给出具体数量)及人骨髓样本(未给出具体数量) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 72 | 2026-09-07 |
Targeting mesenchymal monocyte-derived macrophages to enhance the sensitivity of glioblastoma to temozolomide by inhibiting TNF/CELSR2/p65/Kla-HDAC1/EPAS1 axis
2026-02, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.05.032
PMID:40373963
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组数据,揭示了间充质单核细胞来源巨噬细胞通过TNF/CELSR2/p65/Kla-HDAC1/EPAS1轴促进胶质母细胞瘤对替莫唑胺耐药性的机制,并提出了靶向MES-MDM的治疗策略以提高TMZ敏感性。 | 首次鉴定出MES-MDM亚型并建立GBM细胞亚型模型,揭示乳酸介导的组蛋白赖氨酸乳酰化在MDM诱导TMZ耐药中的新机制,并采用TREM1抑制肽联合TMZ或PD-1抗体治疗以克服耐药。 | 摘要未提及具体局限性,需查阅原文获取。 | 确定具有治疗潜力的MDM亚型,并阐明该亚型促进肿瘤恶性进展和TMZ耐药性的机制。 | 胶质母细胞瘤肿瘤微环境中的单核细胞来源巨噬细胞(MDM),特别是MES-MDM亚型。 | machine learning, digital pathology | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 73 | 2026-09-07 |
Biomimetic bone niche reconstructs proliferation-inhibited and therapy-resistant bone-metastatic prostate cancer
2026-Feb, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.09.041
PMID:41141585
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研究论文 | 构建仿生骨微环境模型,该模型可诱导前列腺癌细胞进入增殖抑制状态并产生治疗抗性,重现患者单细胞转录组特征,为研究骨转移性前列腺癌提供临床相关工具。 | 整合钙磷支架、脱细胞细胞外基质、间充质干细胞和成骨细胞构建三维仿生骨微环境,首次诱导出增殖抑制和治疗抗性的肿瘤状态,并利用患者单细胞数据验证其相关性。 | 摘要中未提及具体局限性。 | 开发模拟骨转移性前列腺癌生理相关模型,以研究增殖抑制和耐药机制并促进靶向治疗开发。 | 前列腺癌细胞及骨微环境成分(钙磷支架、dECM、MSCs、成骨细胞)。 | 组织工程与再生医学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | 3D共培养模型 | 转录组数据 | 患者来源的单细胞RNA测序数据集(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 74 | 2026-09-07 |
Plectin promotes an aggressive phenotype and represses cytotoxic T cell activity in pancreatic cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1894080
PMID:42676425
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研究论文 | 本研究探讨了网蛋白(Plectin)在胰腺癌中促进侵袭性表型并抑制细胞毒性T细胞活性的机制,以及靶向细胞表面网蛋白的抗肿瘤免疫治疗潜力。 | 首次揭示网蛋白作为胰腺癌侵袭性生物标志物,并证明其高表达与T细胞浸润减少相关,且抗CSP单克隆抗体治疗能够恢复抗肿瘤免疫并减小肿瘤体积 | 未明确提及限制,但可能包括样本量和模型适用性的局限 | 阐明网蛋白在胰腺癌中促进侵袭性表型和抑制细胞毒性T细胞活性的分子机制,并评估其作为治疗靶点的潜力 | 人类胰腺癌肿瘤样本、TCGA-PAAD数据集、229例PDAC患者的单细胞RNA-seq数据、两种鼠胰腺癌模型 | 数字病理学、机器学习 | 胰腺癌 | RNA-seq、单细胞RNA-seq、免疫组化、CIBERSORTx | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据、免疫组化图像 | TCGA-PAAD数据集、229例PDAC患者、两种鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 75 | 2026-09-07 |
Unraveling cellular dynamic changes in tumor evolution induced by long-term low dose-rate radiation
2025-Nov, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03128-9
PMID:40913060
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研究论文 | 本研究通过建立长期低剂量率辐射暴露的细胞模型,结合单细胞RNA测序等方法,揭示了长期低剂量率辐射导致细胞恶性程度增加及其机制,为肺癌早期肿瘤演化提供理论见解。 | 首次提供证据表明长期低剂量率辐射导致细胞恶性程度增加,并阐明其机制,即通过诱导拷贝数变异和上皮-间质转化事件及延迟DNA修复通路激活,以及特异性配体-受体对ANGPTL4-SDC4促进血管生成。 | 未提及 | 探究长期低剂量率辐射对肿瘤演化的生物学影响及其机制。 | BEAS-2B细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 流式细胞术(FACS), 分子对接, 多重免疫组化, qRT-PCR, 免疫共沉淀 | NA | 基因表达数据, 图像 | BEAS-2B细胞系,经辐射暴露连续传代,具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 76 | 2026-09-07 |
Histology-Based Virtual RNA Inference Identifies Pathways Associated With Metastasis Risk in Colorectal Cancer
2025-11, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2025.100866
PMID:40803647
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研究论文 | 本研究开发并优化了虚拟RNA推断(VRI)技术,直接从H&E染色组织图像中推断空间转录组信息,并识别与结直肠癌转移风险相关的通路 | 利用最大规模的匹配结直肠癌空间转录组数据集(45例患者、超过30万Visium点)训练VRI模型,并采用多种先进深度学习模型(UNI、ResNet-50、Vision Transformer和Vision Mamba)实现从组织图像预测空间基因表达 | 某些肿瘤相关通路无法仅通过组织学完全捕获 | 开发一种能够从标准H&E组织图像中推断空间级分子信息的方法,以替代成本高昂的空间转录组技术,并用于识别与结直肠癌转移风险相关的生物学通路 | 结直肠癌患者的原发肿瘤组织图像及匹配的空间转录组数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组测序 | UNI, ResNet-50, Vision Transformer, Vision Mamba | 图像和基因表达数据 | 45例患者的原发肿瘤,超过30万Visium点 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium用于空间转录组分析 |
| 77 | 2026-09-07 |
Large-scale CRISPR screening in primary human 3D gastric organoids enables comprehensive dissection of gene-drug interactions
2025-Aug-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62818-3
PMID:40813572
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研究论文 | 本文展示了在原发性人类3D胃类器官中应用大规模CRISPR筛选(包括敲除、CRISPRi、CRISPRa和单细胞方法)来系统鉴定影响顺铂敏感性的基因,从而深入解析基因-药物相互作用。 | 首次在原发性人类3D胃类器官中实施大规模CRISPR筛选,并结合单细胞转录组学揭示基因变异与药物在单细胞水平的相互作用,发现岩藻糖基化与顺铂敏感性之间的意外关联。 | 研究仅限于顺铂一种药物,且胃类器官模型可能无法完全反映体内肿瘤微环境的复杂性。 | 利用人类胃类器官模型系统解析基因-药物相互作用,识别影响顺铂敏感性的关键基因。 | 原发性人类3D胃类器官。 | 基因组学、药物基因组学 | 胃癌 | CRISPR筛选(包括敲除、CRISPRi、CRISPRa)、单细胞转录组学 | 细胞模型(类器官) | 单细胞RNA测序数据、CRISPR筛选数据 | 多个原发性人类胃类器官样本(具体数量未在标题和摘要中提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 78 | 2026-09-07 |
Immune dysfunction during S. aureus biofilm-associated implant infections: opportunities for novel therapeutic strategies
2025-Jul-25, NPJ biofilms and microbiomes
IF:7.8Q1
DOI:10.1038/s41522-025-00782-y
PMID:40715142
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综述 | 本文综述了金黄色葡萄球菌生物膜相关植入物感染中免疫功能障碍的机制,并探讨了新的治疗策略机会 | 强调通过细菌单细胞测序研究揭示生物膜如何改变细菌代谢和毒素产生以诱导免疫功能障碍,并关注粒细胞髓源性抑制细胞和组织微环境的作用 | 未提供具体实验数据,仅基于文献综述,可能缺乏对新兴策略的实证验证 | 探讨金黄色葡萄球菌生物膜感染中免疫功能障碍的机制及新的治疗靶点 | 金黄色葡萄球菌生物膜感染及相关免疫细胞(如粒细胞髓源性抑制细胞) | 微生物学 | 植入物相关感染 | 细菌单细胞测序 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 79 | 2026-09-07 |
Prenatally derived macrophages support choroidal health and decline in age-related macular degeneration
2025-Jul-07, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20242007
PMID:40261298
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研究论文 | 本研究通过多种技术手段揭示人类脉络膜的免疫细胞组成和空间组织,发现产前来源的FOLR2+巨噬细胞在年龄相关性黄斑变性中减少并功能失调 | 首次使用单细胞RNA测序、3D多重免疫荧光和流式细胞术全面解析人类脉络膜的免疫景观,识别出两种表达FOLR2的巨噬细胞亚群,并揭示其在AMD中的变化及产前来源特性 | 未提及具体局限性 | 阐明人类脉络膜的免疫细胞组成和空间组织,并探究其在年龄相关性黄斑变性中的作用 | 人类脉络膜组织及其中的免疫细胞,特别是巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序、3D多重免疫荧光、流式细胞术 | NA | 图像和基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 80 | 2026-09-07 |
DNFE: Directed network flow entropy for detecting tipping points during biological processes
2025-07, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013336
PMID:40729372
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研究论文 | 开发了有向网络流熵(DNFE)方法,用于检测生物过程中的临界点或 tipping point,并适用于单细胞和批量数据 | 提出了一种利用有向网络流熵的新方法,以提高对临界点检测的鲁棒性和有效性,特别是在高维小样本数据如单细胞数据中;能够识别动态网络生物标志物和探索基因调控关系,并预测活跃转录因子及发现传统方法忽略的“暗基因” | 未明确说明局限性 | 开发一种鲁棒且有效的方法来识别生物过程中的临界点及其驱动网络,以预防或延迟灾难性结果 | 生物过程中的临界状态和驱动网络,涉及基因表达数据 | 生物信息学 | 未明确指定,但涉及肿瘤(批量肿瘤数据集) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量测序数据分析方法 | 无 | 基因表达数据(单细胞和批量) | 六个真实数据集:三个单细胞数据集、两个批量肿瘤数据集和一个血液数据集;数值模拟包括100节点和1000节点基因调控网络 | 未指定 | 单细胞RNA测序和批量RNA测序(推断) | 未指定 | 未指定 |