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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-07-10 |
Molecular profiling of the single-cell proteome via gel electrophoresis and 3D single-molecule imaging
2026-Jul-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74840-0
PMID:42420286
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研究论文 | 提出了一种结合凝胶电泳与三维单分子荧光成像的超灵敏单细胞蛋白质组分析策略 | 首次实现单细胞水平上超过1000种蛋白质拷贝的定量检测,灵敏度低至每种蛋白质10个拷贝,并能基于蛋白质组图谱区分细胞类型 | NA | 开发一种高灵敏度的单细胞蛋白质组定量方法 | 哺乳动物单细胞(如心肌细胞分化过程中的细胞) | 机器学习 | NA | 凝胶电泳、三维单分子荧光成像 | NA | 图像 | 单个哺乳动物细胞(具体数量未提及) | NA | NA | NA | NA |
| 62 | 2026-07-10 |
Cellular heterogeneity of hepatic granuloma formation and evolution in murine schistosomiasis japonica
2026-Jul-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-75112-7
PMID:42420289
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研究论文 | 结合单细胞RNA测序与多重免疫荧光技术,表征日本血吸虫感染小鼠肝脏免疫景观,并验证两个中性粒细胞亚群的功能作用 | 首次揭示肝脏肉芽肿形成和演变的不同发育阶段,发现CD177和Ltf中性粒细胞亚群对肉芽肿形成具有相反作用 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;具体分子机制有待进一步阐明 | 探究日本血吸虫感染后肝脏肉芽肿的细胞组成动态及关键免疫细胞的功能 | 日本血吸虫感染小鼠的肝脏组织 | NA | NA | 单细胞RNA测序,多重免疫荧光 | NA | 基因表达数据,图像数据 | 日本血吸虫感染小鼠样本(具体数量文中未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 63 | 2026-07-10 |
SBRT embedded in low-dose RT plus αPD-1 (immuno-EclipseRT, iERT) elicits CD8+ T cell immunity against bulky tumors via an IFN-I/NK/DC axis
2026-Jul-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73683-z
PMID:42420294
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研究论文 | 该论文提出一种名为EclipseRT(ERT)的新型放疗技术,将低剂量放疗与立体定向体部放疗相结合,并联合免疫检查点抑制剂,通过IFN-I/NK/DC轴激活CD8+ T细胞免疫,有效控制巨大肿瘤 | 首次提出EclipseRT(ERT)放疗技术,将低剂量放疗和立体定向体部放疗相结合,并联合免疫检查点抑制剂,通过单细胞RNA测序揭示了SBRT成分通过IFN-I/NK/DC轴激活CD8+ T细胞免疫的机制,特别是SBRT诱导IFN-I激活NK细胞分泌XCL1,招募交叉呈递的XCR1+树突状细胞 | 未提及具体局限性 | 探索一种新型放疗技术EclipseRT联合免疫检查点抑制剂(iERT)对巨大肿瘤的治疗效果及其免疫机制 | 巨大肿瘤患者或动物模型 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 64 | 2026-07-10 |
Pulmonary mRNA-LNP vaccines for rapid and durable protection against bacterial infection
2026-Jul-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-75413-x
PMID:42420327
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研究论文 | 报道一种肺部mRNA-脂质纳米颗粒疫苗,通过快速激活先天免疫和诱导持久适应性免疫,提供对细菌感染的即时和长期保护 | 首次实现mRNA-LNP疫苗通过气道递送同时触发快速抗原非依赖性先天免疫和长效抗原特异性适应性免疫的双相保护机制 | 主要在雌性小鼠模型中进行验证,缺乏大型动物及人类临床试验数据;仅针对铜绿假单胞菌进行测试,对其他病原体的普适性需进一步验证 | 开发针对细菌性肺部感染的快速且持久的mRNA-LNP疫苗策略 | 雌性小鼠的肺部免疫反应及铜绿假单胞菌感染模型 | 机器学习和单细胞转录组学 | 肺部细菌感染 | mRNA疫苗、脂质纳米颗粒递送、单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 雌性小鼠(具体数量未在摘要中明确) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞转录组测序用于分析肺部免疫细胞转录状态 |
| 65 | 2026-07-10 |
Microglial TDP-43 mediates myelin refinement and represses Tyrobp cryptic exon inclusion in mice
2026-Jul-08, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-026-02348-3
PMID:42420559
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研究论文 | 揭示了小胶质细胞TDP-43在小鼠髓鞘精炼和抑制Tyrobp隐性外显子包含中的作用 | 首次阐明了TDP-43在小胶质细胞中的功能,特别是通过调节TREM2-DAP12轴控制髓鞘吞噬和降解,并发现了隐性外显子包含新机制 | 未对人类样本进行验证,且仅在小鼠模型中研究,机制可能不直接适用于人类 | 研究小胶质细胞中TDP-43的功能及其在神经退行性疾病中的潜在机制 | 缺乏小胶质细胞TDP-43的小鼠模型 | 机器学, 数字病理学 | 神经退行性疾病(如肌萎缩侧索硬化症和额颞叶痴呆) | RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 图像(磁共振成像和电子显微镜)、文本(转录组数据) | 小鼠样本(早期出生后和成年期) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 66 | 2026-07-10 |
Immune dysregulation in the prostates of C57BL/6Aire-/- mice mirrors that seen in human benign prostatic hyperplasia
2026-Jul-08, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.70093
PMID:42420752
|
研究论文 | 本研究利用C57BL/6Aire-/-小鼠模型模拟良性前列腺增生中观察到的免疫失调现象 | 首次在C57BL/6J背景小鼠中利用Aire转录因子缺陷建立非消退性慢性炎症模型,并验证其与人类良性前列腺增生免疫特征的相似性 | 模型可能仅代表疾病的早期阶段,且炎症局限于前列腺,与人类疾病的全面异质性存在差距 | 研究良性前列腺增生相关的慢性前列腺炎症的免疫机制 | C57BL/6Aire-/-小鼠的前列腺组织及人类良性前列腺增生数据 | 数字病理学 | 前列腺增生 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | C57BL/6小鼠(数量未明确说明),时间点包括21天和35天 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒 |
| 67 | 2026-07-10 |
Exercise suppresses IP6K3 to modulate BCAA metabolism and ferroptosis in MASLD
2026-Jul-08, Cellular & molecular biology letters
IF:9.2Q1
DOI:10.1186/s11658-026-00981-1
PMID:42420830
|
研究论文 | 运动通过抑制IP6K3基因调节MASLD中的BCAA代谢和铁死亡 | 首次发现运动下调的IP6K3蛋白通过结合HNRNPK稳定BCAT2 mRNA,促进BCAA分解代谢从而抑制铁死亡,揭示MASLD保护新机制 | 未明确说明样本量和临床转化验证的局限性 | 阐明运动改善代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)的分子机制 | MASLD患者肝脏样本、小鼠肝脏组织及原代肝细胞 | 机器学习 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 单细胞RNA测序、IP6K3过表达与敲低、液相色谱-串联质谱、免疫共沉淀 | NA | 基因表达数据、蛋白质互作数据、代谢物数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统 |
| 68 | 2026-07-10 |
Single-cell and bulk transcriptomics identify senescence-related EMT transcriptional programs and a prognostic framework in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Jul-08, BMC gastroenterology
IF:2.5Q2
DOI:10.1186/s12876-026-05043-6
PMID:42420840
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研究论文 | 通过单细胞和批量转录组学分析,鉴定胰腺导管腺癌中与衰老相关的EMT转录程序并构建预后框架 | 首次在单细胞层面系统性描绘PDAC中EMT样肿瘤亚群的衰老相关转录活性异质性,并开发出基于5基因的预后风险评分模型 | 未建立衰老与EMT之间的因果关系,预后模型性能中等,需前瞻性验证和功能性实验确认 | 阐明PDAC中EMT相关衰老样程序的单细胞分布、功能异质性及临床意义 | 胰腺导管腺癌患者的肿瘤组织单细胞转录组数据和批量转录组数据 | 生物信息学 | 胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、ssGSEA、伪时间分析、药物敏感性预测 | NA | 基因表达数据 | 10例治疗初治PDAC肿瘤样本(单细胞数据),TCGA-PAAD队列及独立验证队列(批量数据) | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 69 | 2026-07-10 |
An efficient method for tissue-specific protoplast isolation suitable for single-cell RNA sequencing and transient gene expression analysis in saffron (Crocus sativus L.)
2026-Jul-08, BMC biotechnology
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12896-026-01187-1
PMID:42421006
|
research paper | 建立了一种适用于藏红花组织特异性原生质体分离的高效方法,可用于单细胞RNA测序和瞬时基因表达分析 | 首次详细报道了藏红花原生质体分离、评估和应用的方法,针对不同器官(顶端芽、花瓣、叶片和根部)优化了酶解条件,并成功构建了单细胞文库 | 研究中未提及方法的通用性验证,且根部原生质体活力较低(约61%),可能影响后续应用 | 建立高效的藏红花原生质体分离方法,以促进分子生物学研究进展 | 藏红花(Crocus sativus L.)的顶端芽、花瓣、叶片和根部组织 | NA | NA | 单细胞RNA测序、瞬时基因表达分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 来自藏红花的顶端芽、花瓣、叶片和根部组织样本,具体数量未提及 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 70 | 2026-07-10 |
CXCL13⁺ CD4⁺ T cells are associated with B-cell recruitment and lesion progression in cerebral cavernous malformations
2026-Jul-08, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-026-03950-9
PMID:42421023
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研究论文 | 本研究发现CXCL13⁺ CD4⁺ T细胞与脑海绵状血管畸形(CCM)中B细胞募集和病变进展相关 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定出CCM中产生CXCL13的CD4⁺ T细胞亚群,揭示其与CXCR5⁺记忆B细胞的相互作用,并验证CXCL13信号在病变进展中的致病作用 | 未提及具体局限性 | 探究CCM病变微环境中免疫细胞募集机制,特别是CXCL13⁺ CD4⁺ T细胞在B细胞招募和病变进展中的作用 | 脑海绵状血管畸形(CCM)患者病变组织及小鼠模型 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫组化染色、体内重组蛋白注射与阻断实验 | NA | 单细胞转录组数据、免疫组化图像、体内实验数据 | 人CCM病变组织样本(具体数量未给出)及小鼠模型(具体数量未给出) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 71 | 2026-07-10 |
Ferroptosis-related TFRC: a potential therapeutic target in sepsis and regulatory effect of γ-Tocotrienol
2026-Jul-08, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-026-01003-z
PMID:42421098
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研究论文 | 本研究通过转录组和单细胞测序发现铁死亡相关TFRC是脓毒症的潜在治疗靶点,并验证γ-生育三烯酚的调控作用 | 首次结合孟德尔随机化、蛋白质队列和单细胞测序多维度验证TFRC在脓毒症中的核心作用,并发现γ-生育三烯酚通过抑制TFRC表达改善脓毒症生存率 | 研究样本量较小(19例患者和10例对照),且仅基于回顾性生物样本分析,缺乏前瞻性临床验证 | 识别脓毒症中与铁死亡相关的核心治疗靶点及潜在治疗药物 | 脓毒症患者和健康对照的外周血样本,以及斑马鱼和小鼠脓毒症模型 | 生物信息学 | 脓毒症 | RNA-seq, 单细胞测序, 孟德尔随机化 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 19例脓毒症患者和10例健康对照的外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 72 | 2026-07-10 |
Gene expression profiling enables refined parcellation of cortical layers in the heterogeneous human cerebral cortex
2026-Jul-08, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-026-01704-z
PMID:42421091
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研究论文 | 利用空间转录组数据和贝叶斯空间算法对人脑皮层进行基因表达定义的精细分层,并验证其跨区域、跨平台、跨物种的适用性及病理识别能力 | 首次基于空间转录组学数据,通过贝叶斯空间算法提出基因表达定义的皮层分层框架,能够解析传统解剖方法无法识别的精细层内异质性和病理改变 | 可能需要更多独立数据集和跨物种验证以进一步确认其普适性,且算法依赖高质量空间转录组数据 | 开发一种基于基因表达的自适应皮层分层方法,以克服传统解剖方法的分子分辨率不足和主观性问题 | 人脑皮层组织(包含不同脑叶)、以及猕猴和小鼠大脑皮层 | 数字病理学、机器学习 | 神经系统疾病 | 空间转录组学 | 贝叶斯空间模型 | 空间转录组数据 | 多样本(包含人脑皮层不同脑叶、健康死后数据集、以及猕猴和小鼠样本) | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 基于空间转录组平台进行皮层基因表达分析 |
| 73 | 2026-07-10 |
Integrated PANoptosis Profiling Identifies Immunosuppressive Subtypes and a Prognostic Signature With Functional Validation of MLKL in Glioblastoma
2026-Jul-08, Annals of clinical and translational neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/acn3.70481
PMID:42421178
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研究论文 | 通过整合PANoptosis分析识别胶质母细胞瘤的免疫抑制亚型,并构建包含MLKL功能验证的预后模型 | 首次系统阐明PANoptosis在胶质母细胞瘤肿瘤异质性和免疫抑制微环境中的功能作用,并建立预后风险评分模型 | 未提及具体局限性 | 探索PANoptosis在胶质母细胞瘤中的功能角色,构建预后模型并进行MLKL的功能验证 | 胶质母细胞瘤患者肿瘤组织及单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, MLKL敲低实验 | Cox回归, K-means聚类, CIBERSORT, ESTIMATE | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 多独立队列的胶质母细胞瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 74 | 2026-07-10 |
DFCE-KanT: Predicting Spatial Gene Expression from Histology Images via Contrastive Learning
2026-Jul-08, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag502
PMID:42421216
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研究论文 | 提出DFCE-KanT对比学习框架,从H&E组织学图像预测空间基因表达,整合图像特征、基因特征和空间位置信息 | 结合DenseNet与特征通道增强注意力、KAN和Transformer多头注意力的KanT结构,自动学习空间信息融合策略,提升非线性投影能力与特征兼容性 | 未在更大队列或临床样本中验证泛化能力,且计算资源需求较高 | 开发低成本替代空间转录组学技术,从常规H&E染色切片预测空间基因表达 | 五个公开数据集:HER2+、cSCC、Alex、HBC和Liver的H&E组织学图像与空间基因表达数据 | 数字病理学 | 乳腺癌、皮肤鳞状细胞癌、肝癌 | 空间转录组学 | DenseNet, Kolmogorov-Arnold Network, Transformer多头注意力 | 组织学图像 | 五个公开数据集,具体样本数量未说明 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 75 | 2026-07-10 |
SpatialPEFT: A Parameter-Efficient Fine-Tuning Framework for Spatial Transcriptomics Foundation Models
2026-Jul-08, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag503
PMID:42421217
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研究论文 | SpatialPEFT是一个统一的参数高效微调框架,可在单张16 GB消费级GPU上实现大规模空间转录组基础模型(高达14亿参数)的鲁棒适应 | 集成低秩适应(LoRA)、梯度检查点和空间感知适配器,峰值VRAM减少超过87%,同时显著提升下游空间注释准确性 | NA | 开发参数高效微调框架以适应性调整大规模空间转录组基础模型 | 空间转录组基础模型 | 数字病理 | NA | 空间转录组学 | 低秩适应(LoRA) | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 76 | 2026-07-10 |
The clinical promise of mass spectrometry based single-cell proteomics: from bedside to bench
2026-Jul-08, Expert review of proteomics
IF:3.8Q1
DOI:10.1080/14789450.2026.2701811
PMID:42421240
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综述 | 本文综述了基于质谱的单细胞蛋白质组学在临床转化中的进展、挑战与前景 | 强调单细胞蛋白质组学从技术验证走向临床应用的转型,并系统分析了预分析变量对结果的影响 | 细胞通量低、数据稀疏导致群体检测困难和数据集整合困难,且需严格质控措施 | 探讨单细胞蛋白质组学在解决临床相关问题和精准医学中的潜力 | 临床样本中的单细胞蛋白质组学数据 | machine learning | NA | 质谱 | NA | 蛋白质组学数据 | NA | NA | 单细胞蛋白质组学 | NA | NA |
| 77 | 2026-07-10 |
Multiomics Insights Into the Role of Spondin-1 in the Pathogenesis and Prognosis of Atrial Fibrillation
2026-Jul-07, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.126.050152
PMID:42333675
|
研究论文 | 通过整合多组学方法,研究Spondin-1在房颤发病机制与预后中的作用 | 首次结合血浆蛋白质组与心房转录组的共定位分析,系统鉴定SPON1作为房颤的潜在因果蛋白靶点,并利用单核RNA测序和空间转录组学揭示其在成纤维细胞中的特异性表达 | 未说明具体局限性信息 | 识别房颤的新型蛋白靶点并评估其临床意义 | 房颤患者及UK Biobank队列(N=39,372) | 计算生物学 | 心血管疾病 | 孟德尔随机化、共定位分析、单核RNA测序、空间转录组学 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据、临床队列数据 | UK Biobank队列(39,372名参与者) | NA | 全基因组关联分析、表达数量性状位点分析 | NA | NA |
| 78 | 2026-07-10 |
Atrazine induces Alzheimer's disease-like neurotoxicity by targeting SDHB and disrupting synaptic function: An integrated bioinformatic and in vivo study
2026-Jul-07, Chemico-biological interactions
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.cbi.2026.112249
PMID:42413810
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研究论文 | 整合生物信息学、机器学习和体内实验,揭示莠去津通过靶向SDHB诱导阿尔茨海默病样神经毒性的分子机制 | 首次建立从ATR诱导SDHB抑制到认知障碍的标准不良结局通路框架,并通过14种机器学习算法构建诊断模型,识别SDHB为关键风险因子 | NA | 阐明莠去津诱导阿尔茨海默病样神经病理的分子机制 | 莠去津暴露的小鼠模型及人类AD脑转录组数据 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | RNA-seq, 单细胞测序, 分子对接 | 集成机器学习模型 | 转录组数据, 单细胞数据, 体内行为学数据 | 训练集和外部验证集(AUC值分别为0.891,0.833,0.869,0.900),体内实验中小鼠暴露于ATR | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 79 | 2026-07-10 |
TNF-α induces type I IFN signalling to suppress neurogenesis and recruit T cells
2026-Jul-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74104-x
PMID:42414275
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研究论文 | 本文发现TNF-α通过诱导I型IFN信号在人类海马祖细胞中抑制神经发生并招募T细胞 | 揭示了TNF-α通过此前未被识别的I型IFN自分泌/旁分泌环路驱动神经源性失调的新机制 | NA | 探究慢性炎症导致成人海马神经发生障碍的分子机制 | 人类海马祖细胞 | 机器学习 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 女性来源的人类体外神经发生模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 80 | 2026-07-10 |
Anti-PD-1 plus anti-CTLA-4 blockade overcomes immune exclusion in NSCLC brain metastases by enhancing CD8+ T cell responses and promoting tertiary lymphoid structure formation
2026-Jul-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74782-7
PMID:42414284
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研究论文 | 结合临床分析、人体组织配对分析和同源小鼠模型,研究抗PD-1联合抗CTLA-4治疗对非小细胞肺癌脑转移的免疫微环境的影响 | 首次揭示双免疫检查点抑制(抗PD-1和抗CTLA-4)通过增强CD8+ T细胞应答和促进三级淋巴结构形成,克服非小细胞肺癌脑转移中的免疫排除表型 | 主要基于临床样本和同源小鼠模型,未提及在更大规模临床试验中的验证结果 | 阐明非小细胞肺癌脑转移对抗PD-1单药治疗耐药机制,并探索双免疫检查点阻断的疗效和免疫调控机制 | 非小细胞肺癌脑转移患者临床样本和同源小鼠模型 | 免疫学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据 | 配对人体组织样本和小鼠模型,未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |