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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
61 2026-05-12
Serial Spatial Transcriptomics Reveal Divergent Routes to Therapy Resistance in Metastatic Breast Cancer
2026-Apr-15, Research square
研究论文 通过连续空间转录组学揭示四名转移性乳腺癌患者在长达3.5年的个性化治疗过程中产生的治疗耐药性差异路径 将概率主题建模与空间深度学习相结合,首次在患者层面系统解析了转移性乳腺癌中治疗耐药性的三种普遍原则(通路独立性、微环境重塑和代偿性信号)及其背后的具体分子机制 样本量较小(仅四名患者),可能限制了结果的普遍适用性;研究主要基于空间转录组学数据,未结合其他组学数据(如蛋白质组学)进行验证 探索转移性乳腺癌在治疗过程中如何通过复杂的空间异质性机制产生耐药性 四名转移性乳腺癌患者在不同治疗时间点获取的十份活检样本中的345,207个细胞 数字病理学 乳腺癌 空间转录组学 概率主题模型、空间深度学习 空间转录组数据 四名患者的十份活检样本,共计345,207个细胞 NA 空间转录组学 NA NA
62 2026-05-12
sigNATURE maps cohort-specific T-cell states to reproducible programs of ICI response
2026-Apr-15, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出sigNATURE框架,通过参考图谱映射方法增强免疫检查点抑制剂单细胞RNA-seq研究中T细胞生物标志物的可重复性 提出参考引导框架sigNATURE,将查询细胞映射到大型CD4和CD8 T细胞图谱,并在图谱对齐坐标系中评估已发布的免疫检查点抑制剂响应标志物,通过细胞级可识别性评分量化图谱支持度 基于两个独立队列(36例非小细胞肺癌和15例皮肤癌患者)验证,样本量和癌症类型有限 提高单细胞RNA-seq研究中免疫检查点抑制剂响应T细胞标志物的可重复性和跨队列可比性 免疫检查点抑制剂治疗患者的T细胞状态 自然语言处理 非小细胞肺癌, 皮肤癌 单细胞RNA测序 参考图谱映射 单细胞RNA-seq数据 36例非小细胞肺癌患者和15例皮肤癌患者(11例基底细胞癌和4例鳞状细胞癌) NA 单细胞RNA-seq NA NA
63 2026-05-12
Regional and Systemic Metabolic Remodeling Promotes Longevity by Bioengineered Yeast-Derived Lipids
2026-Apr-13, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 研究发现从基因工程改造的长寿酵母菌株中提取的脂质能延长果蝇寿命,揭示其通过改善肠道完整性、代谢重编程和肠道-脑通讯等机制促进健康衰老 首次发现来自基因改造长寿酵母的饮食脂质能跨物种延长果蝇寿命,结合重水探针受激拉曼散射显微镜、单核RNA测序和FLY-MAP代谢分析流程,系统揭示了脂质通过改善肠道上皮结构、重编程代谢及增强肠-脑通讯的多层次长寿机制 研究主要基于果蝇模型,酵母脂质在哺乳动物中的功效和安全性有待验证;脂质组成复杂,具体活性成分和作用靶点需进一步阐明 探究基因工程改造长寿酵母来源的饮食脂质对果蝇寿命的影响及其分子机制 果蝇(Drosophila)以及基因工程改造的长寿酵母菌株 机器学习 老年病 重水探针受激拉曼散射显微镜、单核RNA测序、拉曼光谱、脂质组学 NA 图像、文本、序列 未明确说明样本量,涉及果蝇肠道和脑组织的单核RNA测序及代谢成像 10x Genomics 单核RNA测序 10x Chromium 10x Chromium 单核RNA测序
64 2026-05-12
MitoChontrol: Adaptive mitochondrial filtering for robust single-cell RNA sequencing quality control
2026-Apr-07, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出MitoChontrol,一种基于细胞类型感知的概率框架,用于单细胞RNA测序质量控制中的线粒体过滤 采用高斯混合分布建模转录相干簇内的线粒体转录本比例,动态确定过滤阈值,避免固定百分比阈值的局限性 未提及具体限制 开发更稳健的自适应线粒体过滤方法,以改进单细胞RNA测序质量控制 受控扰动实验和胰腺导管腺癌单细胞数据集中的细胞群体 机器学习 胰腺癌 单细胞RNA测序 高斯混合模型 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
65 2026-05-12
Mass cytometry uncovers distinct blood myeloid phenotypes linked to clinical responses during gastric cancer chemoimmunotherapy
2026-Mar-31, Cancer immunology, immunotherapy : CII
研究论文 利用质谱流式技术揭示胃癌化疗联合免疫治疗中与临床反应相关的外周血髓系细胞表型 首次通过高维度质谱流式技术动态监测胃癌患者化疗联合免疫治疗过程中外周血免疫细胞的变化,发现早期单核细胞升高与良好生存率相关 样本量较小(24例患者),且为回顾性分析,需要更大规模前瞻性研究验证 探索胃癌患者在帕博利珠单抗联合XELOX化疗方案治疗下外周血免疫细胞的动态变化及其与临床反应的关系 转移性胃癌患者的外周血免疫细胞和配对组织样本 免疫学 胃癌 质谱流式细胞术、单细胞RNA测序 NA 细胞数据、基因表达数据 24例胃癌患者在基线、一个周期XELOX化疗后、帕博利珠单抗添加18周后采集的外周血样本 NA 质谱流式细胞术、单细胞RNA测序 NA NA
66 2026-05-12
Identification of suicide brain transcriptomic signatures using meta-analysis of multiple cohorts
2026-Mar-31, Translational psychiatry IF:5.8Q1
研究论文 通过多个队列的荟萃分析鉴定自杀大脑转录组特征 整合了16个队列的公开死后大脑转录组数据集及一个国内队列,采用多种荟萃分析方法并结合细胞类型特异性表达反卷积,识别出与自杀相关的差异表达基因,突出了小胶质细胞、星形胶质细胞、免疫反应及长链非编码RNA的表观遗传调控机制 未提及具体限制 识别自杀行为的转录组生物标志物,为预防和治疗提供分子靶点 死后大脑样本的转录组数据 机器学习 精神疾病 RNA-seq, 微阵列, 单细胞RNA测序 荟萃分析 转录组数据 16个队列 NA 单细胞RNA测序 NA 多个技术平台,具体未指明
67 2026-05-12
Identification of biomarkers associated with endoplasmic reticulum stress-related cell death in osteoporosis based on bulk and single-cell transcriptomic analyses and experimental validation
2026-Mar-30, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 基于批量与单细胞转录组分析及实验验证,鉴定与骨质疏松中内质网应激相关细胞死亡有关的生物标志物 首次整合内质网应激和程序性细胞死亡相关基因,通过批量与单细胞转录组分析及实验验证,确定CAMKK2和DAPK3为骨质疏松的诊断生物标志物,并揭示其在骨髓间充质干细胞分化中的动态表达及细胞间相互作用 未提及具体局限性,可能包括样本量有限、缺乏大规模临床验证、以及生物标志物在更广泛人群中的适用性需进一步探索 鉴定与骨质疏松中内质网应激相关细胞死亡有关的诊断生物标志物,并探索其潜在机制 骨质疏松患者与对照组的批量转录组数据(GSE56815和GSE56814)及单细胞RNA测序数据(GSE147287) 机器学习 骨质疏松 批量RNA测序、单细胞RNA测序、逆转录定量聚合酶链反应 机器学习模型 基因表达数据、单细胞转录组数据 训练数据集GSE56815、验证数据集GSE56814、单细胞RNA测序数据集GSE147287,具体样本数未提供 NA 批量RNA测序、单细胞RNA测序 NA NA
68 2026-05-12
Targeting LAPTM5 enhances AML sensitivity to cytarabine through autophagy inhibition
2026-Mar-30, Cell death & disease IF:8.1Q1
原创研究论文 本研究通过分析AML患者单细胞RNA测序数据发现LAPTM5高表达与阿糖胞苷耐药相关,并证实靶向LAPTM5可通过抑制自噬增强AML细胞对阿糖胞苷的敏感性 首次揭示LAPTM5通过调控LAMP1/LAMP2转录促进溶酶体生成和自噬流,进而介导AML对阿糖胞苷耐药的新机制 具体样本量和体内实验模型细节未在摘要中说明 探究LAPTM5在AML对阿糖胞苷耐药中的作用机制及靶向治疗潜力 急性髓系白血病(AML)细胞及耐药细胞 数字病理学 急性髓系白血病 单细胞RNA测序 未明确 单细胞RNA测序数据 未明确 未明确 单细胞RNA-seq 未明确 公开的AML患者scRNA-seq数据
69 2026-05-12
The RASSF1C-HIF-1α axis drives macrophage lipid metabolism to promote pancreatic cancer
2026-Mar-30, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示RASSF1C-HIF-1α轴通过乳酸调控巨噬细胞脂质代谢促进胰腺癌进展的机制 首次阐明RASSF1C-HIF-1α轴通过乳酸介导的免疫代谢调控重塑肿瘤相关巨噬细胞功能,并揭示UFL1-IRF7 UFMylation修饰在其中的关键抑制作用 未提及 探究胰腺癌微环境中肿瘤相关巨噬细胞的作用机制及潜在治疗靶点 胰腺癌患者组织样本及肿瘤相关巨噬细胞 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,免疫组化 NA 图像,文本 20例人胰腺导管腺癌组织微阵列样本 10x Genomics 单细胞RNA测序,空间转录组学 10x Chromium,10x Visium 10x Chromium Single Cell 3',10x Visium FFPE
70 2026-05-12
Bisphenol a exposure and major depressive disorder: an integrative analysis combining network toxicology, molecular docking, genetic epidemiology, and transcriptomic validation
2026-Mar-30, Translational psychiatry IF:5.8Q1
研究论文 整合网络毒理学、分子对接、遗传流行病学和转录组学验证分析双酚A暴露与重度抑郁症的关系 首次综合运用网络毒理学、基于汇总数据的孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、分子对接和实验验证等多维方法,系统揭示双酚A暴露导致重度抑郁症的分子机制 未提及具体局限性 探究双酚A暴露对重度抑郁症的潜在毒理学机制 双酚A暴露与重度抑郁症相关的分子靶点及因果机制 机器学习 重度抑郁症 网络毒理学, 分子对接, 孟德尔随机化分析, 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究, 表达数量性状位点分析, 批量RNA测序, 酶联免疫吸附测定, 定量实时聚合酶链反应 NA 基因表达数据, 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
71 2026-05-12
Antagonistic SMAD2/3 control of TIMP-1, VEGF-A, and hypoxia signaling in myofibroblasts shapes histotype-specific angiogenesis in lung cancer
2026-Mar-30, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 研究发现肺癌相关肌成纤维细胞中SMAD2/3对TIMP-1、VEGF-A和缺氧信号通路的拮抗调控决定了肺癌组织学亚型特异的血管生成模式 首次揭示了肿瘤相关肌成纤维细胞通过SMAD3依赖的TIMP-1和VEGF-A过量产生驱动肺腺癌血管生成,而鳞状细胞癌中SMAD2补偿性上调导致血管生成能力减弱 未明确提及研究的局限性 探究肿瘤相关肌成纤维细胞在非小细胞肺癌两种主要组织学亚型中调控血管生成的机制 肿瘤相关肌成纤维细胞、非小细胞肺癌患者样本、内皮细胞 machine learning lung cancer RNA-seq, scRNA-seq, 血管生成检测阵列, 遗传扰动 NA 转录组数据、血管生成功能数据 多个患者队列 NA bulk RNA-seq, scRNA-seq NA NA
72 2026-05-12
Spatial transcriptomics in the human adult ovary: insights into key signalling pathways during follicular atresia
2026-Mar-26, Human reproduction (Oxford, England)
研究论文 利用空间转录组学探究人类成年卵巢中卵泡闭锁期间WNT、TGFβ/BMP、NOTCH和HH等关键信号通路 首次应用空间转录组学技术研究人类卵巢卵泡闭锁,揭示了不同卵泡类型中关键信号通路的动态变化 研究基于跨性别男性捐赠者的卵巢组织,无法排除睾酮治疗对卵泡动力学的影响 阐明WNT、TGFβ/BMP、NOTCH和HH信号通路在人类成年卵巢卵泡闭锁进程中的作用 人类卵巢组织中的健康与不同闭锁阶段的小窦状卵泡 生物信息学 妇科疾病 空间转录组学、单分子荧光原位杂交 NA 空间转录组数据 6名捐赠者的16个卵巢组织区域,包含21个直径0.5-4毫米的小窦状卵泡 Resolve BioSciences 空间转录组学 Molecular Cartography平台 Resolve BioSciences Molecular Cartography平台,冷冻切片上多重单分子荧光原位杂交
73 2026-05-12
CXCR6+ T cells promote apoptosis and necroptosis in proximal tubules during AKI-to-CKD transition
2026-Mar-24, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究利用小鼠模型,整合批量及单细胞RNA测序与免疫组化和蛋白质分析,揭示了CXCR6+ T细胞在急性肾损伤向慢性肾脏病转化过程中通过促进近端肾小管凋亡和坏死性凋亡的作用机制 首次鉴定CXCR6+ T细胞作为免疫驱动肾小管细胞死亡的关键介质,并揭示CXCL16-CXCR6轴在适应不良修复中的作用 研究主要基于小鼠模型,人类中的验证有限 探索免疫浸润如何促进肾小管损伤和细胞死亡,特别是急性肾损伤向慢性肾脏病转化过程中的机制 近端肾小管细胞和T细胞(特别是CXCR6+ T细胞) 机器学习 肾脏疾病 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠模型样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
74 2026-05-12
Dynamic changes of the immune microenvironment in ovarian cancer following neoadjuvant chemotherapy
2026-Mar-23, Cell death discovery IF:6.1Q1
研究论文 本研究探讨高级别浆液性卵巢癌在新辅助化疗后免疫微环境的动态变化,揭示前列腺素介导的免疫抑制微环境在化疗耐药中的关键作用 首次揭示前列腺素在卵巢癌化疗后免疫抑制微环境形成中的关键作用,并发现顺铂联合前列腺素特异性抑制剂可显著提高治疗效果 主要基于公开的scRNA-seq数据和体外体内实验验证,临床样本来源有限 探索卵巢癌新辅助化疗后免疫微环境变化及化疗耐药机制 高级别浆液性卵巢癌患者肿瘤样本及小鼠模型 数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 来自公开数据集的卵巢癌患者样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
75 2026-05-12
TRIM21-Mediated ubiquitination of FBL suppresses PI3K/AKT signaling and tumor progression in clear cell renal cell carcinoma
2026-Mar-21, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1
research paper 本研究揭示了TRIM21介导的FBL泛素化通过调控PI3K/AKT信号通路抑制透明细胞肾细胞癌的肿瘤进展 首次发现TRIM21作为FBL的新型E3泛素连接酶,通过K48连接的多聚泛素化修饰FBL的K292位点,促进其蛋白酶体降解,从而抑制PI3K/AKT信号通路 未提及具体局限性 探究FBL在透明细胞肾细胞癌中的致癌机制及其与TRIM21的相互作用 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)细胞及其肿瘤组织样本 machine learning 肾细胞癌 单细胞RNA测序、批量转录组学、蛋白质组学、免疫沉淀-质谱联用、分子对接 NA 单细胞转录组数据、批量转录组数据、蛋白质组数据 NA NA single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
76 2026-05-12
Histone lactylation-driven feedback loop modulates pyrimidine metabolism to promote oral carcinogenesis
2026-Mar-19, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 组蛋白乳酸化驱动的正反馈环路调节嘧啶代谢促进口腔癌变 首次发现组蛋白乳酸化(特别是H3K18la)通过激活TK1转录促进嘧啶生物合成,形成糖酵解/H3K18la/TK1/β-catenin正反馈环路,揭示了表观遗传调控与乳酸驱动的代谢重编程之间的新联系 具体局限性未在摘要中提及 探究组蛋白乳酸化在口腔癌变中的作用及其分子机制 口腔白斑和口腔鳞状细胞癌组织及细胞 计算机视觉 口腔鳞状细胞癌 RNA-seq NA 图像, 文本 涉及口腔白斑和口腔鳞状细胞癌组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA 使用CUT&Tag、单细胞RNA测序、ChIP-qPCR等技术
77 2026-05-12
A microfluidic-engineered vascularized endometrium micro-organoid platform for functional repair of intrauterine adhesion
2026-03-18, Biofabrication IF:8.2Q1
研究论文 提出一种微流控生物制造策略,构建血管化子宫内膜微类器官,用于修复宫腔粘连 利用微流控技术共包封子宫内膜基质细胞、上皮类器官和内皮细胞,构建具有血管结构的类器官,并通过转录组和单细胞测序揭示内皮细胞缓解缺氧炎症和促进上皮稳态的机制 研究中未提及具体局限性,可能包括临床转化中的规模化和长期效果评估不足 开发可再生的血管化子宫内膜微类器官平台,用于子宫内膜修复和疾病建模 人子宫内膜基质细胞、上皮类器官、内皮细胞(HUVECs) 数字病理学 妇科疾病(宫腔粘连) 微流控生物制造、转录组测序、单细胞测序 NA 转录组数据、单细胞数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
78 2026-05-12
Epigenetic context defines the transcriptional activity of canonical and noncanonical NF-κB signaling in pancreatic cancer
2026-Mar-17, Cell death discovery IF:6.1Q1
研究论文 本研究探讨了胰腺癌中经典和非经典NF-κB信号通路转录活性的表观遗传背景依赖性 发现RELA和RELB在不同染色质可及性区域结合,RELB与AP1基序共定位,揭示TNFα和TWEAK分别通过RELA和RELB调控不同转录程序 未完全阐明上游信号激活机制及体内功能验证 阐明胰腺导管腺癌中RELA和RELB的差异激活和功能 胰腺导管腺癌细胞系和原发肿瘤组织 机器学习 胰腺癌 RNA-seq, ChIP-seq, 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光染色 NA 基因表达数据, 表观基因组数据, 图像 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
79 2026-05-12
Lysine attenuates acute lung injury by restoring α-tubulin acetylation and ciliary activity
2026-Mar-16, Cell death discovery IF:6.1Q1
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序分析与靶向血浆代谢组学,发现赖氨酸在急性肺损伤中显著减少,补充赖氨酸可通过恢复α-微管蛋白乙酰化与纤毛活性减轻肺损伤 首次揭示赖氨酸通过乙酰辅酶A恢复α-微管蛋白乙酰化,调节纤毛TRPC1定位进而阻断钙内流与上皮修复受损,将氨基酸代谢与纤毛信号相连接 具体机制有待阐明,特别是赖氨酸代谢在肺泡上皮不同细胞亚型间的精细调控及其临床转化需进一步验证 探究氨基酸代谢中的赖氨酸在急性肺损伤后肺泡上皮修复中的作用及其分子机制 急性肺损伤患者样本、小鼠及非人灵长类ALI模型 机器学习 急性肺损伤 单细胞RNA测序、靶向血浆代谢组学 NA 单细胞转录组数据及代谢物数据 人类ALI样本及对应小鼠与灵长类实验动物 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
80 2026-05-12
MAPK14/SLC7A11/GPX4 axis dysregulation drives podocyte ferroptosis via mediating glycerophospholipid metabolism
2026-Mar-11, Cell death discovery IF:6.1Q1
研究论文 通过综合多组学方法解析糖尿病肾病的细胞特异性发病机制,发现足细胞铁死亡及MAPK14/SLC7A11/GPX4轴失调的关键作用,并验证了黄芪甲苷IV的治疗潜力 首次通过单细胞RNA测序与空间代谢组学等多组学整合,揭示足细胞铁死亡在糖尿病肾病中的核心驱动作用,并锁定MAPK14/SLC7A11/GPX4轴失调机制 未提及具体研究局限性 探索糖尿病肾病的细胞特异性病理机制及潜在治疗靶点 人类糖尿病肾脏组织及足细胞 机器学习 糖尿病肾病 单细胞RNA测序, 空间代谢组学, 代谢组学 NA 单细胞转录组数据, 空间代谢组数据, 临床代谢组数据 人类糖尿病肾脏样本(具体数量未提及) 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序, 空间代谢组学 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞3'测序,Illumina NovaSeq高通量测序
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