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当前共找到 35128 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-01-12 |
The Role of Metabolites in Cell-Cell Communication: A Review of Databases and Computational Tools
2025-Dec-26, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15010049
PMID:41511333
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综述 | 本文综述了用于识别代谢物介导的细胞间通讯的现有数据库和计算工具，并讨论了其局限性与未来改进方向 | 强调了代谢物在细胞间通讯中的关键作用，并系统总结了基于单细胞RNA测序数据的相关数据库和计算工具，同时指出了当前方法的不足及结合空间组学和人工智能的未来方向 | 现有数据库因缺乏统一收集标准而存在较大变异性，且多数计算工具源自通用细胞间通讯推断方法，未能充分捕捉代谢物与其传感器间复杂的互作机制 | 总结并评估用于推断代谢物介导细胞间通讯的数据库和计算工具，以促进该领域的方法学发展 | 代谢物介导的细胞间通讯及其相关数据库与计算工具 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 62 | 2026-01-12 |
Single-cell RNA sequencing reveals a quiescence-senescence continuum and distinct senotypes following chemotherapy
2025-Dec-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66836-z
PMID:41436452
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研究论文 | 本文通过结合延时成像和单细胞RNA测序技术，揭示了化疗后细胞静止与衰老状态的连续体及不同的衰老类型 | 首次将细胞周期动态的延时成像与单细胞RNA测序配对，以区分静止和衰老状态，并识别出多种衰老类型及其与两种细胞周期停滞途径的关联 | NA | 研究化疗后细胞静止与衰老状态的区分及其转录组特征 | 化疗处理后的细胞 | 单细胞组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 63 | 2026-01-12 |
DUSP5 Downregulation in Nucleus Accumbens Core Correlates with Cocaine-Induced Maladaptive Synaptic Plasticity
2025-Dec-23, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15010032
PMID:41511316
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研究论文 | 本研究探讨了双特异性磷酸酶5（DUSP5）在可卡因诱导的伏隔核核心区突触可塑性中的作用 | 首次探索DUSP5在可卡因成瘾中的具体作用，而先前研究仅涉及其他DUSP家族成员 | 分子机制尚未完全阐明，研究主要基于动物模型和公开数据 | 揭示可卡因诱导的神经可塑性的分子机制 | 伏隔核核心区（NAcore）的神经元 | 神经科学 | 物质使用障碍 | 单细胞RNA测序，分子分析 | NA | RNA测序数据，行为数据 | 大鼠可卡因自我给药模型及公开单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 64 | 2026-01-12 |
Hypoxia Affects Stem Cell Fate in Patient-Derived Ileum Enteroids in a HIF-1α-Dependent Manner
2025-Dec-23, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15010031
PMID:41511315
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研究论文 | 本研究探讨了缺氧如何通过HIF-1α依赖的方式影响患者来源回肠类器官中干细胞命运 | 首次在患者来源回肠类器官中证明生理性缺氧通过HIF-1α稳定化直接调控干细胞命运，揭示了氧可用性沿隐窝-绒毛结构控制肠道稳态的机制 | NA | 研究氧可用性如何影响肠道干细胞增殖和分化 | 患者来源的人类回肠类器官（enteroids） | NA | NA | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 65 | 2026-01-12 |
Spatial Transcriptomics As Rasterized Image Tensors (STARIT) characterizes cell states with subcellular molecular heterogeneity
2025-Dec-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.18.695193
PMID:41497642
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研究论文 | 本文提出了一种名为STARIT的方法，将成像空间转录组学数据转换为图像张量表示，以利用亚细胞异质性识别细胞类型和状态 | STARIT创新地将转录本转换为图像张量，结合深度学习计算机视觉模型，能够捕捉传统基因计数方法忽略的亚细胞转录定位异质性 | 方法主要基于模拟和真实imSRT数据验证，可能在其他类型空间转录组学数据或更大规模应用中存在未探索的局限性 | 开发一种新方法以利用成像空间转录组学数据中的分子分辨率信息，基于亚细胞异质性识别和表征细胞状态 | 成像空间转录组学数据中的转录本和细胞 | 计算机视觉 | NA | 成像空间转录组学 | 深度学习计算机视觉模型 | 图像张量 | NA | NA | 成像空间转录组学 | NA | NA |
| 66 | 2026-01-12 |
Spatial Transcriptomics Analysis of Macrophage-to-Myofibroblast Transition in Bronchiolitis Obliterans Following Hematopoietic Stem Cell Transplantation
2025-Dec-20, Transplantation and cellular therapy
IF:3.6Q1
DOI:10.1016/j.jtct.2025.12.950
PMID:41429336
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，分析了造血干细胞移植后闭塞性细支气管炎（BO）中巨噬细胞向肌成纤维细胞转化（MMT）的过程及其在纤维化中的作用 | 首次在BO中应用空间转录组学技术，揭示了MMT在疾病进展中的存在，并明确了从炎症到纤维化的基因表达模式转变 | 样本量较小（3例BO患者，2例对照），且为回顾性研究，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 探究巨噬细胞向肌成纤维细胞转化（MMT）是否参与造血干细胞移植后闭塞性细支气管炎（BO）的纤维化发展 | 造血干细胞移植后发生BO患者的肺组织样本（n=3），以及肺癌患者的肺组织作为对照（n=2） | 空间转录组学 | 闭塞性细支气管炎 | 免疫荧光染色，空间转录组学 | 无监督聚类 | 空间基因表达数据，图像数据 | 5例患者（3例BO，2例肺癌对照）的肺组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 67 | 2026-01-12 |
Machine learning-driven comprehensive profiling of tumor heterogeneity and sialylation in hepatocellular carcinoma
2025-Dec-17, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01213-z
PMID:41408439
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术解析肝细胞癌的细胞异质性，识别了五个恶性肝细胞亚群，并开发了一个基于PGAM2和唾液酸化相关基因的预后模型 | 首次在单细胞水平系统描绘了肝细胞癌的肿瘤生态系统，识别了与疾病进展阶段特异相关的恶性亚群，并构建了一个整合转录调控因子与唾液酸化过程的临床预后工具 | 样本量相对有限，功能验证主要在体外进行，缺乏大规模前瞻性队列验证 | 解析肝细胞癌的细胞异质性及其与疾病进展、免疫微环境重塑的关系，并开发预后预测工具 | 人类肝细胞癌组织样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习驱动的预后模型 | 单细胞转录组数据 | 32,247个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 68 | 2026-01-12 |
New insights into the mechanism of microvascular rarefaction via endothelial-mesenchymal transition in steroid-induced osteonecrosis of femoral head
2025-Dec-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-30454-y
PMID:41398023
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研究论文 | 本研究探讨了内皮-间质转化在激素性股骨头坏死中的作用及其与微血管稀疏和组织损伤的关联 | 首次通过单细胞RNA测序结合体内外实验，揭示了EndMT在SONFH发病机制中的潜在作用及其与微血管稀疏的紧密联系 | 研究为初步探索，抗氧化干预的效果仅部分缓解了病理变化，具体分子机制和临床应用潜力需进一步验证 | 探究EndMT在SONFH中的作用机制，评估其与微血管稀疏和组织损伤的关联，并初步探索糖皮质激素诱导的氧化应激是否参与此过程 | 激素性股骨头坏死的囊性病变组织、人脐静脉内皮细胞以及糖皮质激素诱导的SONFH小鼠模型 | 数字病理学 | 股骨头坏死 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 未明确指定样本数量，涉及SONFH囊性病变组织、HUVECs细胞系及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 69 | 2026-01-12 |
Hematopoietic EphA4 deficiency alters microglial heterogeneity and improves chronic spatial memory after brain injury
2025-Dec-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-30648-4
PMID:41350381
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研究论文 | 本研究利用造血细胞特异性EphA4敲除的骨髓嵌合小鼠模型，探究了外周免疫来源的EphA4信号在脑损伤后如何调节小胶质细胞异质性并影响长期功能恢复 | 首次揭示了外周免疫细胞来源的EphA4信号在调节脑损伤后小胶质细胞异质性和长期神经免疫重塑中的关键作用，并发现其缺失可改善慢性空间记忆 | 研究主要基于小鼠模型，其结论在人类中的适用性有待验证；单细胞测序仅在损伤后90天进行，缺乏更长时间点的动态数据 | 探究外周免疫来源的信号如何影响创伤性脑损伤后小胶质细胞的动态变化和功能恢复 | 造血细胞特异性EphA4敲除的骨髓嵌合小鼠及其在控制性皮质撞击模型后的神经免疫反应 | 神经科学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序，骨髓嵌合小鼠模型，行为学测试 | 动物模型（小鼠） | 基因表达数据，行为数据，形态学数据 | 未明确说明具体数量，但涉及骨髓嵌合小鼠模型并进行多时间点分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 70 | 2026-01-12 |
AI-based Predictive Signaling Pathway Profiling in Cardiac Fibrosis Suggests a Novel Combinatorial Treatment Strategy
2025-Dec-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.04.692460
PMID:41497580
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研究论文 | 本文利用人工智能分析心脏纤维化相关文献，识别关键信号通路，并通过单细胞RNA测序验证，提出了一种基于JAK-STAT和TGF-β通路时序抑制的新型组合治疗策略 | 首次结合AI模型从大量文献中预测心脏纤维化的关键信号通路，并通过单细胞分析揭示JAK-STAT和TGF-β通路的时序动态，提出差异时序抑制的组合治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型和有限临床样本，需进一步在人类临床试验中验证策略的有效性和安全性 | 开发更有效的心脏纤维化治疗策略，以改善心血管疾病预后 | 心脏纤维化过程、信号通路（如JAK-STAT、TGF-β）、成纤维细胞亚群 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | AI模型 | 文本、基因表达数据 | 基于6,528篇文献训练AI模型，并使用小鼠模型和临床样本进行验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 71 | 2026-01-12 |
Spatial transcriptomics analysis uncovers ER stress in MANF-deficient Purkinje cells underlying alcohol-induced cerebellar neurodegeneration in mice
2025-Dec-03, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-025-02162-1
PMID:41339935
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学分析，揭示了MANF缺陷的浦肯野细胞中内质网应激在酒精诱导的小鼠小脑神经退行性变中的作用 | 首次结合PC特异性MANF敲除小鼠模型、空间转录组学和高通量原位分析，揭示了MANF缺陷通过性别特异性方式影响浦肯野细胞的转录组景观，并阐明了其在酒精诱导的内质网应激和神经退行性变中的保护作用 | 研究主要基于小鼠模型，其在人类酒精使用障碍中的直接相关性仍需进一步验证；性别差异的分子机制尚未完全阐明 | 探究MANF是否在保护浦肯野细胞免受酒精诱导的内质网应激和神经退行性变中发挥作用 | 浦肯野细胞特异性MANF敲除小鼠 | 空间转录组学 | 酒精使用障碍 | 空间转录组学，高通量Xenium原位分析 | PC特异性MANF敲除小鼠模型 | 空间转录组数据，原位基因表达数据，行为学数据 | 成年PC特异性MANF敲除小鼠（包括雄性和雌性） | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium, Xenium | 用于空间转录组学分析和原位基因表达分析 |
| 72 | 2026-01-12 |
Comprehensive bulk and single-cell RNA sequencing uncovers senescence-associated biomarkers in therapeutic mesenchymal stem cells
2025-Dec-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-30633-x
PMID:41326705
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研究论文 | 本研究通过结合形态学、分子和转录组学分析，深入表征了犬间充质干细胞在衰老过程中的变化，并利用bulk和单细胞RNA测序发现了衰老相关的生物标志物 | 首次在犬模型中系统结合bulk和单细胞RNA测序技术研究间充质干细胞的衰老过程，揭示了衰老亚群的异质性分布并发现了新的潜在衰老标志基因 | 研究仅基于体外传代模型，未在体内验证衰老标志物的临床相关性；样本量相对有限 | 探究间充质干细胞衰老的分子机制并识别衰老相关的生物标志物，以提高细胞治疗的质量控制 | 犬间充质干细胞（早期传代P2和晚期传代P6） | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, SA-β-半乳糖苷酶染色, 细胞周期分析 | NA | RNA测序数据, 形态学数据 | 早期传代（P2）和晚期传代（P6）犬间充质干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 73 | 2026-01-12 |
Single-Cell Sequencing of a Bile Sample From an Acute Cholecystitis Patient
2025-Dec, Cureus
DOI:10.7759/cureus.98748
PMID:41510448
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术分析急性胆囊炎患者的胆汁样本，探索细菌感染 | 首次应用单细胞扩增基因组测序技术于急性胆囊炎患者的胆汁样本，提供细菌感染的新颖基因组信息 | 单细胞测序的基因组覆盖度较低（9.45-42.88%），与传统全基因组测序相比存在序列缺口 | 评估单细胞测序技术在临床细菌感染样本中的应用潜力 | 急性胆囊炎患者的胆汁样本及其中的细菌 | 微生物基因组学 | 急性胆囊炎 | 单细胞扩增基因组测序，16S宏基因组分析 | NA | 基因组序列数据 | 1例患者的胆汁样本，从中分离出4个细菌菌落 | NA | 单细胞基因组测序 | NA | NA |
| 74 | 2026-01-12 |
High expression of Fgr in the left ventricle attenuates myocardial injury in the infarcted region via regulating the phosphorylation level of PI3K/Akt
2025-Oct-13, Bioscience reports
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BSR20253737
PMID:41004172
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研究论文 | 本研究探讨了Fgr基因在急性心肌梗死中的表达及其通过调节PI3K/Akt磷酸化水平发挥心脏保护作用的机制 | 首次揭示了Fgr在急性心肌梗死中的心脏保护作用，并通过多组学数据分析和体内外实验验证了其通过PI3K/Akt信号通路发挥作用的机制 | 研究主要基于动物模型和细胞实验，尚未在临床患者中进行验证；Fgr的具体调控机制和下游效应分子仍需进一步探索 | 探究Fgr在急性心肌梗死中的表达变化及其对心肌损伤的保护作用机制 | 大鼠左前降支冠状动脉结扎模型、H9C2心肌细胞、人类空间转录组学和单核RNA测序数据 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 转录组范围关联研究、bulk-RNA测序、空间转录组学、单核RNA测序、siRNA敲低、药理学抑制 | 动物疾病模型、细胞缺氧缺糖模型 | 基因表达数据、测序数据、功能实验数据 | 大鼠模型、H9C2细胞系、人类测序数据集 | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 75 | 2026-01-12 |
Biology as vulnerability in follicular lymphoma: genetics, epigenetics, and immunogenetics
2025-Oct-09, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024026020
PMID:40089999
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综述 | 本文综述了滤泡性淋巴瘤的遗传学、表观遗传学和免疫遗传学特征，探讨了其生物学脆弱性及潜在治疗策略 | 整合了高通量测序、空间转录组学和成像技术的最新发现，揭示了滤泡性淋巴瘤的遗传、表观遗传和免疫遗传基础，并提出了针对癌症前体细胞的靶向治疗新思路 | 未涉及具体实验数据或临床研究，主要基于现有文献综述，缺乏原创性实证研究 | 深入理解滤泡性淋巴瘤的生物学特性，识别治疗脆弱性，以改善患者预后 | 滤泡性淋巴瘤及其肿瘤微环境中的细胞 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 高通量测序、空间转录组学、成像技术 | NA | 遗传、表观遗传、免疫遗传数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 76 | 2026-01-12 |
Single-cell and clonal analysis of AL amyloidosis plasma cells and their bone marrow microenvironment
2025-Sep-18, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024024719
PMID:40493887
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和克隆分析，揭示了AL淀粉样变性患者浆细胞及其骨髓微环境的转录特征 | 首次在治疗初治的AL淀粉样变性患者中应用5'单细胞RNA测序，系统描述了克隆性浆细胞的转录特征及其骨髓微环境的改变，并识别出与蛋白质稳态相关的基因表达变化 | 研究样本量有限，且为横断面研究，未能评估治疗反应或疾病进展的动态变化 | 阐明AL淀粉样变性中克隆性浆细胞的功能特性及其骨髓微环境的特征 | 新诊断、未治疗的AL淀粉样变性患者及健康对照者的骨髓样本 | 单细胞组学 | AL淀粉样变性 | 5'单细胞RNA测序，定量蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据，蛋白质组数据 | 新诊断的AL淀粉样变性患者和健康受试者（具体数量未在摘要中明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 5'单细胞RNA测序 |
| 77 | 2026-01-12 |
Exploring Intratumoral Heterogeneity in Mixed Neuroendocrine-Nonneuroendocrine Neoplasms with Spatial Transcriptomics: Even More Diverse Than Anticipated
2025-Aug-20, Endocrine pathology
IF:11.3Q1
DOI:10.1007/s12022-025-09869-w
PMID:40833530
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学和成分特异性测序技术，探索混合神经内分泌-非神经内分泌肿瘤的瘤内异质性，揭示其遗传和转录组特征 | 首次结合空间转录组学和成分特异性测序，在混合神经内分泌-非神经内分泌肿瘤中揭示形态学相似区域内的转录组亚群，并关联化疗反应预测 | 研究仅基于三个病例，样本量有限，且未涉及长期临床随访数据 | 探究混合神经内分泌-非神经内分泌肿瘤的瘤内异质性及其生物学基础 | 三个来自不同解剖部位（回盲部、卵巢、胃）的混合腺癌-神经内分泌癌病例 | 数字病理学 | 神经内分泌肿瘤 | 空间转录组学，成分特异性下一代测序，基因集富集分析 | NA | 空间转录组数据，基因组数据 | 三个病例 | NA | 空间转录组学，下一代测序 | NA | NA |
| 78 | 2026-01-12 |
spRefine Denoises and Imputes Spatial Transcriptomics with a Reference-Free Framework Powered by Genomic Language Model
2025-Jul-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.22.649977
PMID:40631230
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研究论文 | 本文介绍了一种名为spRefine的深度学习框架，它利用基因组语言模型对空间转录组数据进行联合去噪和插补，以提高数据质量和下游分析性能 | 提出了首个基于基因组语言模型的无参考框架，能够同时处理空间转录组数据中的噪声和基因测量缺失问题，并展示了其在空间衰老时钟估计和新生物学信号发现方面的应用 | 未明确说明框架的计算资源需求、处理大规模数据时的效率，以及在不同组织类型或技术平台上的泛化能力 | 解决空间转录组数据分析中因高噪声和基因测量缺失带来的挑战，提升数据质量和下游分析准确性 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | 衰老相关疾病 | 空间转录组学 | 深度学习框架、基因组语言模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 79 | 2026-01-12 |
Spatial Transcriptomics in Lung Cancer and Pulmonary Diseases: A Comprehensive Review
2025-Jun-09, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17121912
PMID:40563563
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综述 | 本文全面综述了空间转录组学在肺癌及其他肺部疾病研究中的应用与进展 | 系统总结了空间转录组学如何揭示传统测序方法无法捕获的肺部组织空间基因表达模式、局部免疫微环境、疾病相关转录“热点”以及药物在组织内的作用位点信息 | 作为一篇综述文章，未提出新的实验数据或分析方法，主要基于现有文献进行归纳总结 | 阐述空间转录组学技术在呼吸系统疾病研究中的新兴作用及其临床应用潜力 | 肺癌、慢性阻塞性肺疾病、哮喘、特发性肺纤维化等肺部疾病 | 空间转录组学 | 肺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 80 | 2026-01-12 |
Defining pathogenic IL-17 and CSF-1 gene expression signatures in chronic graft-versus-host disease
2025-May-08, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024025337
PMID:39977705
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序方法，在慢性移植物抗宿主病（cGVHD）小鼠模型中定义了IL-17和CSF-1的基因表达特征，并验证了这些特征在患者中的可检测性 | 利用单细胞测序技术在小鼠血液单核细胞中定义了非直观的IL-17和CSF-1基因表达特征，并首次在cGVHD患者中验证了这些特征的临床相关性 | 研究基于小鼠模型推导特征，在患者中的验证样本量有限，且特征仅在70%诊断时和50%后续发病患者中检测到，可能存在假阴性 | 开发用于识别cGVHD患者中可药物靶向的免疫失调的生物标志物，以指导个体化治疗选择 | 慢性移植物抗宿主病（cGVHD）的小鼠模型和患者样本 | 单细胞测序 | 慢性移植物抗宿主病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确具体样本数量，但涉及小鼠模型和患者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |