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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-02-27 |
Lymph Node Metastasis-Associated Spatiotemporal Mapping of the TFF3-Linked Niche in Breast Cancer: Integrating Radiogenomic Signatures with Immune-Ecosystem Remodeling
2026, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.1016
PMID:41551914
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和放射基因组学,揭示了TFF3在乳腺癌淋巴结转移中的核心调控作用及其与免疫微环境重塑和MAPK-EMT轴的关系 | 首次通过多模态整合(单细胞测序、空间图谱、放射组学)系统解析了TFF3在淋巴结转移性乳腺癌中的双重功能(调控MAPK-EMT轴和免疫检查点),并发现6-巯基嘌呤可作为新型TFF3拮抗剂 | 研究主要基于回顾性队列(TCGA/佛山队列),需要前瞻性临床验证;动物模型未能完全模拟人类肿瘤微环境的复杂性 | 阐明乳腺癌淋巴结转移的分子机制并开发潜在治疗策略 | 原发性乳腺癌伴腋窝淋巴结转移患者样本、体外细胞模型、体内异种移植模型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 蛋白质组学, 孟德尔共定位分析, 放射组学 | 机器学习 | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据, 影像数据 | TCGA和佛山队列患者样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 62 | 2026-02-27 |
A Deep Learning-Generated Mixed Tumor-Stroma Ratio for Prognostic Stratification and Multi-omics Profiling in Bladder Cancer
2026, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.1053
PMID:41602481
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研究论文 | 本研究开发了一种基于卷积神经网络的混合肿瘤-基质比率(MTSR)计算方法,用于膀胱癌的预后分层和多组学分析 | 首次提出并验证了深度学习生成的MTSR作为膀胱癌的独立预后指标,并通过多组学分析揭示了其与ITGB8富集的基质-致癌通路的机制联系 | 研究依赖于回顾性多中心队列,需要前瞻性验证;mpMRI放射组学模型的预测准确性有待进一步提高 | 通过量化肿瘤-基质架构来改进膀胱癌的风险分层,并探索其分子基础 | 膀胱癌患者的组织切片和多参数MRI图像 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 全切片图像分析,多组学分析(包括bulk RNA测序和单细胞RNA测序),放射组学 | 卷积神经网络(ResNet50),随机森林 | 图像(组织切片和MRI图像),转录组数据 | 多中心队列,具体数量未在摘要中明确说明 | NA | bulk RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 63 | 2026-02-27 |
Single-Cell Multiome Impact of Prenatal Heavy Metal Exposure on Early Airway Development
2026-Jan-01, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0563OC
PMID:40737448
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学测序和高分辨率代谢组学,揭示了产前镉和砷暴露对小鼠早期胚胎肺发育的多层面分子和细胞破坏 | 首次整合单细胞多组学测序(ATAC-seq + RNA-seq)和高分辨率代谢组学,系统描绘了产前重金属暴露对早期肺发育的多层次破坏,并识别出Gata6和Gli2功能减弱是其中的核心调控缺陷 | 研究仅在小鼠模型中进行,且暴露剂量和时间为特定设定,人类暴露的复杂环境和长期效应仍需进一步验证 | 探究产前镉和砷共同暴露对早期肺气道发育的细胞类型特异性机制和分子影响 | 产前暴露于镉和砷的小鼠胚胎肺组织(胚胎第12天) | 单细胞多组学 | 肺发育障碍 | 单细胞多组学测序(scATAC-seq + scRNA-seq),高分辨率代谢组学 | NA | 单细胞多组学数据,代谢组学数据 | 小鼠胚胎肺组织(对照组和暴露组,具体数量未明确说明) | NA | 单细胞多组学测序,单细胞ATAC-seq,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 64 | 2026-02-27 |
WNT10A-SMOC2-LRP4 network affects permanent tooth development via potential tooth-bone interaction
2025-Dec-17, BMC oral health
IF:2.6Q1
DOI:10.1186/s12903-025-06451-y
PMID:41408627
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研究论文 | 本文通过一例非综合征性牙齿缺失病例,探讨了WNT10A、SMOC2和LRP4基因变异如何通过牙-骨相互作用影响恒牙发育 | 首次报道了LRP4基因的新变异与牙齿缺失的关联,并通过单细胞RNA-seq和免疫荧光揭示了LRP4阳性牙槽骨细胞通过FGF信号调控WNT10A和SMOC2阳性牙髓细胞的潜在机制 | 研究基于单一病例,样本量有限,需要更大规模的研究验证 | 探究下颌环境对非综合征性牙齿缺失的影响,特别是基因变异在牙-骨相互作用中的作用 | 一名19岁非综合征性牙齿缺失患者及其基因变异 | 数字病理学 | 牙齿缺失 | 全外显子组测序、Sanger测序、单细胞RNA-seq、免疫荧光染色 | NA | 基因序列数据、单细胞RNA-seq数据、影像数据 | 1名患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 65 | 2026-02-27 |
A defined bacterial consortium and spatial transcriptomics highlight the complex interaction between Campylobacter jejuni and the murine intestine
2025-Dec, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2600053
PMID:41411657
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研究论文 | 本研究通过建立定义的细菌群落并结合空间转录组学技术,揭示了空肠弯曲菌与小鼠肠道之间的复杂相互作用 | 首次使用定义的13种细菌群落结合空间转录组学,在单细胞水平上解析宿主、微生物群和病原体在肠道感染中的相互作用 | 研究仅使用小鼠模型,结果可能无法完全适用于人类;定义的细菌群落可能无法完全模拟自然微生物群的复杂性 | 阐明特定肠道细菌与空肠弯曲菌介导的宿主反应之间的相互作用机制 | 无菌小鼠、定义的13种细菌群落、空肠弯曲菌81-176菌株 | 空间转录组学 | 肠道感染 | 16S rRNA基因测序、荧光原位杂交、RNAscope、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 三组无菌小鼠:C13组、C13+空肠弯曲菌组、无菌对照组 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 66 | 2026-02-27 |
Engineering a spatiotemporal macrophage circuit via STING phase separation to override immune suppression in pancreatic cancer
2025-Nov-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2504718122
PMID:41264244
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于STING相分离的时空巨噬细胞重编程平台,用于克服胰腺癌的免疫抑制微环境 | 首次利用STING相分离原理构建时空可控的巨噬细胞回路,实现TAMs的序贯重编程并防止过度炎症反应 | 研究目前处于临床前模型阶段,尚未进行人体临床试验验证 | 开发新型巨噬细胞靶向免疫治疗策略以克服胰腺癌免疫抑制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)及其肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 67 | 2026-02-27 |
Genetically Engineered Mouse Models for Alzheimer Disease and Frontotemporal Dementia: New Insights from Single-Cell and Spatial Transcriptomics
2025-Nov, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.11.006
PMID:39743215
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综述 | 本文综述了阿尔茨海默病和额颞叶痴呆的基因工程小鼠模型,并基于单细胞和空间转录组学研究总结了主要发现 | 整合了最新的单细胞转录组学、多组学和空间转录组学数据,为神经退行性疾病模型提供了新的分子和细胞层面见解 | 没有模型是完美的,可能存在物种差异和病理不完全模拟的问题 | 研究神经退行性疾病的病因和潜在治疗方法 | 基因工程小鼠模型,特别是阿尔茨海默病和额颞叶痴呆模型 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学, 多组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞 RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 68 | 2026-02-27 |
GreenCells: A comprehensive resource for single-cell analysis of plant lncRNAs
2025-10, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110678
PMID:40912654
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研究论文 | 本文介绍了GreenCells数据库,一个专门用于在单细胞水平探索植物长非编码RNA的综合资源 | 开发了首个专注于植物lncRNA的单细胞分析数据库,整合了多物种数据并识别了lncRNA标记基因及共表达网络 | NA | 研究植物lncRNA在单细胞分辨率下的表达和功能 | 八种植物物种的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 69 | 2026-02-27 |
Computational Drug Repurposing for Alzheimer's Disease via Sheaf Theoretic Population-Scale Analysis of snRNA-seq Data
2025-Sep-29, ArXiv
PMID:41256885
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研究论文 | 本文提出了一种基于鞘理论的计算药物重定位模型,用于阿尔茨海默病的治疗,通过分析大规模单核RNA测序数据来识别药物靶点 | 首次将持久鞘拉普拉斯算子应用于阿尔茨海默病的药物重定位,结合群体水平的单核RNA测序数据进行蛋白质-蛋白质相互作用分析 | 研究依赖于公共数据集,可能未涵盖所有阿尔茨海默病亚型或细胞类型,且药物预测模型需进一步实验验证 | 开发一种计算药物重定位方法,以针对阿尔茨海默病的分子靶点筛选现有药物 | 阿尔茨海默病相关的微胶质细胞和脑血管组织中的多种细胞类型,涉及数十万个细胞核 | 计算生物学 | 阿尔茨海默病 | 单核RNA测序 | 机器学习模型 | 单核RNA测序数据 | 涉及多患者、多区域研究的数十万个细胞核 | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 70 | 2026-02-27 |
The urokinase receptor/uPAR is a major effector of p53 gain-of-function mutations in gemcitabine-treated pancreatic ductal adenocarcinoma
2025-09, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110561
PMID:40759369
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研究论文 | 本文研究了在胰腺导管腺癌中,TP53功能获得性突变通过上调uPAR表达,促进吉西他滨治疗后癌细胞侵袭和转移的机制 | 揭示了TP53功能获得性突变通过上调PLAUR/uPAR表达,驱动吉西他滨治疗后胰腺癌细胞的侵袭性增强和化疗耐药,并利用单细胞RNA测序技术验证了PLAUR在特定恶性上皮细胞簇中的表达增加 | 研究主要基于细胞系和TCGA数据,缺乏体内实验验证,且EGFR沉默对uPAR介导的ERK1/2激活无影响的机制未完全阐明 | 探究TP53功能获得性突变在胰腺导管腺癌化疗耐药和侵袭转移中的作用机制 | 胰腺导管腺癌细胞系(PANC1和MIA PaCa-2)及TCGA数据库中的患者数据 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq)、基因沉默、细胞迁移和侵袭实验 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | TCGA数据库中的胰腺导管腺癌样本及PANC1、MIA PaCa-2细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 71 | 2026-02-27 |
SMAD1/5-mediated recruitment of the histone demethylase KDM1A controls cell fate programs in embryonic stem cells
2025-09, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110591
PMID:40812426
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研究论文 | 本研究揭示了SMAD1/5通过招募组蛋白去甲基化酶KDM1A来调控小鼠胚胎干细胞中细胞命运程序的转录抑制机制 | 发现了SMAD1/5通过招募KDM1A去除增强子相关的H3K4me1/2标记,从而调控细胞类型特异性基因表达程序的新机制 | 研究主要基于小鼠胚胎干细胞模型,在人类细胞或其他生物系统中的普适性尚需验证 | 探究SMAD1/5在小鼠胚胎干细胞中调控细胞命运的具体分子机制 | 小鼠胚胎干细胞(mESCs) | 表观遗传学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq) | NA | 基因表达数据,染色质修饰数据 | Smad1/5双敲除(S1/5 dKO)和野生型(WT)小鼠胚胎干细胞 | NA | 单细胞RNA测序,染色质免疫沉淀测序 | NA | NA |
| 72 | 2026-02-27 |
Mutual Regulation of Cardiovascular and Hematopoietic Development
2025-Apr-22, Current cardiology reports
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s11886-025-02236-5
PMID:40261519
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综述 | 本文探讨了心血管与造血系统在发育中的相互调控关系,特别是心内膜造血这一进化保守过程及其在心脏发育和巨噬细胞形成中的作用 | 通过单细胞RNA测序技术揭示了心内膜细胞具有独立于已知造血器官的内在造血程序,并阐明了心源性巨噬细胞在心脏形态发生中的独特贡献 | NA | 探讨心血管与造血系统发育的相互调控机制及其进化保守性 | 心内膜造血过程、心脏发育、组织驻留巨噬细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、谱系追踪、转录组研究 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 73 | 2026-02-27 |
CREB Drives Acinar to Ductal Cells Reprogramming and Promotes Pancreatic Cancer Progression in Preclinical Models of Alcoholic Pancreatitis
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101606
PMID:40812683
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研究论文 | 本研究探讨了在酒精性慢性胰腺炎背景下,CREB与致癌KrasG12D/+在促进胰腺癌进展中的分子相互作用 | 揭示了CREB在酒精性胰腺炎模型中驱动腺泡细胞向导管细胞重编程并加速胰腺癌进展的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 阐明慢性炎症下CREB与Kras*协同促进胰腺癌进展的分子机制 | 胰腺腺泡细胞、导管病变、胰腺上皮内瘤变 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、Western blotting、磷酸激酶阵列、定量PCR、谱系追踪 | 遗传工程小鼠模型(KC, KCC-/-) | 基因表达数据、组织学图像 | 多种遗传背景的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 74 | 2026-02-27 |
Single cell and TCR analysis of immune cells from AAV gene therapy-dosed Duchenne muscular dystrophy patients
2024-Dec-12, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2024.101349
PMID:39524974
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和T细胞受体测序,分析了接受AAV基因治疗的杜氏肌营养不良症患者治疗前后的外周血单个核细胞,以探究免疫反应机制 | 首次在AAV基因治疗临床试验中结合单细胞转录组和TCR测序,揭示了治疗后T细胞干扰素反应基因的诱导以及特定TCR克隆的扩增,并发现部分扩增克隆与既往疱疹病毒感染相关 | 样本量较小(仅5名参与者),且仅有一例发生血栓性微血管病,限制了统计效力与普遍性结论的得出 | 探究高剂量AAV基因治疗在杜氏肌营养不良症患者中引发的免疫反应机制,特别是血栓性微血管病发生的潜在原因 | 接受AAV基因治疗的杜氏肌营养不良症患者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 杜氏肌营养不良症 | 单细胞RNA测序,T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据,TCR序列数据 | 5名患者治疗前后的外周血单个核细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 75 | 2026-02-27 |
The IL-1β inhibitor canakinumab in previously treated lower-risk myelodysplastic syndromes: a phase 2 clinical trial
2024-11-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54290-2
PMID:39537648
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研究论文 | 本研究是一项II期非随机单臂临床试验,评估IL-1β抑制剂卡那单抗在先前治疗过的低风险骨髓增生异常综合征患者中的安全性和疗效 | 首次在低风险MDS患者中评估IL-1β抑制剂卡那单抗的临床活性,并利用单细胞RNA测序分析揭示其作用机制与遗传复杂性的关联 | 样本量较小(25例患者),且为非随机单臂设计,可能限制结果的普遍性和因果推断 | 评估靶向IL-1β信号通路是否能挽救MDS患者的无效红细胞生成 | 先前治疗过的低风险骨髓增生异常综合征患者 | 数字病理学 | 骨髓增生异常综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 25例患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 76 | 2026-02-27 |
MerTK+ macrophages promote melanoma progression and immunotherapy resistance through AhR-ALKAL1 activation
2024-10-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ado8366
PMID:39365866
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序识别了表达高水平MerTK的巨噬细胞亚群,揭示了其在黑色素瘤进展和免疫治疗耐药中的作用机制 | 首次发现AhR-ALKAL1通路激活驱动MerTK+巨噬细胞的免疫抑制表型极化,并开发了靶向递送AhR拮抗剂的治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;靶向递送系统的临床转化潜力需进一步评估 | 探究巨噬细胞异质性在黑色素瘤微环境中的调控机制及免疫治疗耐药成因 | 黑色素瘤微环境中的MerTK+巨噬细胞亚群 | 单细胞组学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量(基于小鼠模型) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 77 | 2026-02-27 |
SpaTopic: A statistical learning framework for exploring tumor spatial architecture from spatially resolved transcriptomic data
2024-09-27, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adp4942
PMID:39331720
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SpaTopic的统计学习框架,用于从空间分辨转录组数据中探索肿瘤的空间结构 | SpaTopic通过整合单细胞转录组学和空间分辨转录组数据,协调spot聚类和细胞类型反卷积,利用主题建模将肿瘤微环境分层为具有一致细胞组织的空间域,提高了空间架构注释的性能 | NA | 开发一个统计学习框架,以探索和解释肿瘤空间分辨转录组数据中的空间架构 | 肿瘤组织及其微环境 | 空间转录组学 | 肿瘤 | 空间分辨转录组学,单细胞转录组学 | 主题建模 | 空间分辨转录组数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 空间分辨转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 78 | 2026-02-27 |
Chemically programmed metabolism drives a superior cell fitness for cartilage regeneration
2024-09-13, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adp4408
PMID:39259800
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研究论文 | 本研究通过药物筛选发现化合物FPH2能增强人软骨细胞的适应性,促进关节软骨再生,并揭示其通过抑制肉碱棕榈酰转移酶I和优化代谢稳态的机制 | 首次发现FPH2能诱导软骨细胞进入“超级适应”状态,并通过代谢编程提升细胞适应性,为软骨再生提供新策略 | 研究主要基于动物模型,人类临床应用效果需进一步验证;单细胞转录组学分析可能未覆盖所有细胞亚群 | 探索增强软骨细胞适应性和促进关节软骨再生的化学方法 | 人软骨细胞和关节软骨组织 | 细胞治疗与再生医学 | 骨关节炎 | 药物筛选、单细胞转录组学、动物模型实验 | NA | 转录组数据、组织图像 | 大鼠动物模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 79 | 2026-02-27 |
High-Lactate-Metabolizing Photosynthetic Bacteria Reprogram Tumor Immune Microenvironment
2024-09, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202405930
PMID:38924191
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研究论文 | 本研究筛选出一种高乳酸代谢光合细菌(LAB-1),用于重编程肿瘤免疫微环境,以增强免疫治疗效果 | 首次通过正交实验模拟肿瘤微环境并利用乳酸作为唯一有机碳源筛选高乳酸代谢光合细菌,并证明其能选择性定植于肿瘤组织、降低乳酸水平、提高pH值,从而有效重编程肿瘤免疫微环境 | 研究仅在鼠源4T1模型中进行验证,尚未在人类肿瘤或更广泛的肿瘤模型中测试其普适性与安全性 | 通过降低肿瘤组织中的乳酸水平来重编程肿瘤免疫微环境,以增强肿瘤免疫治疗的效果 | 高乳酸代谢光合细菌(LAB-1)及其在鼠源4T1肿瘤模型中的作用 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 鼠源4T1肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 80 | 2026-02-27 |
Tracing Immunological Interaction in Trimethylamine N-Oxide Hydrogel-Derived Zwitterionic Microenvironment During Promoted Diabetic Wound Regeneration
2024-08, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202402738
PMID:38885961
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研究论文 | 本研究开发了一种新型三甲胺N-氧化物(TMAO)衍生的两性离子水凝胶,以促进糖尿病伤口愈合,并通过单细胞RNA测序探索了其周围的多细胞生态系统 | 首次利用TMAO衍生的两性离子水凝胶调控免疫微环境,揭示了巨噬细胞和中性粒细胞在糖尿病伤口愈合中的关键作用,并验证了两性离子微环境对适应性免疫系统激活的影响 | 未明确提及研究的具体局限性,如样本量、实验模型或长期效果评估 | 解析糖尿病伤口愈合的免疫调节机制并开发治疗策略 | 糖尿病伤口愈合过程中的多细胞生态系统,特别是巨噬细胞和中性粒细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |