单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
61	2025-09-19	High-Dimensional Analysis of Type 2 Lymphocyte Dynamics During Mepolizumab or Dupilumab Treatment in Severe Asthma 2025-Sep, Allergy IF:12.6Q1 DOI:10.1111/all.16633 PMID:40566935	研究论文	本研究通过高维流式细胞术和单细胞RNA测序分析美泊利单抗和度普利尤单抗治疗重症哮喘期间对2型淋巴细胞动态的影响	首次揭示美泊利单抗通过改变2型淋巴细胞的归巢受体表达和细胞因子产生能力来减少气道炎症的新机制	样本量较小（特别是度普利尤单抗组仅7例），单细胞测序样本量有限（n=3）	研究两种2型生物制剂对重症哮喘患者循环淋巴细胞的影响	40例重症哮喘患者（美泊利单抗33例，度普利尤单抗7例）	免疫学	哮喘	高参数流式细胞术，单细胞RNA测序（scRNA-seq），细胞刺激实验	NA	流式细胞数据，单细胞转录组数据	40例患者（治疗前、4个月和12个月随访），其中3例进行scRNA-seq，3例进行细胞刺激实验
62	2025-09-19	Epithelial Lining Fluid Cystatin SN is a Noninvasive Biomarker for Predicting Type 2 Chronic Rhinosinusitis 2025-Sep, Allergy IF:12.6Q1 DOI:10.1111/all.16652 PMID:40689541	研究论文	本研究识别并验证了上皮衬液中的cystatin SN作为预测2型慢性鼻窦炎的非侵入性生物标志物	首次发现cystatin SN在2型慢性鼻窦炎患者上皮细胞中特异性表达，并证实其在鼻上皮衬液中的水平与疾病严重程度正相关	NA	寻找能够预测2型慢性鼻窦炎炎症内型的非侵入性生物标志物	慢性鼻窦炎患者和对照个体的鼻组织和上皮衬液样本	生物标志物研究	慢性鼻窦炎	单细胞RNA测序(scRNA-seq), Luminex多重检测, 酶联免疫吸附测定(ELISA), 免疫荧光染色	NA	基因表达数据, 蛋白质浓度数据, 临床评分数据	慢性鼻窦炎患者和对照个体（具体数量未在摘要中说明）
63	2025-09-19	After the bite: cellular responses to mosquito blood feeding 2025-Sep, Trends in parasitology IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.pt.2025.07.018 PMID:40803965	研究论文	通过单细胞转录组学和代谢组学分析埃及伊蚊中肠和脂肪体组织在吸血后的细胞反应	首次在吸血后蚊子组织中鉴定新细胞类型和标记物，并揭示转录组和代谢响应及病毒感染的动态过程	NA	探究蚊子吸血后的细胞水平响应机制	埃及伊蚊（Aedes aegypti）的中肠和脂肪体组织	单细胞组学	虫媒病毒感染	单细胞转录组学、代谢组学	NA	转录组数据、代谢组数据	NA
64	2025-09-19	Nerve-associated macrophages control adipose homeostasis across lifespan and restrain age-related inflammation 2025-Sep, Nature aging IF:17.0Q1 DOI:10.1038/s43587-025-00952-9 PMID:40897908	研究论文	本研究通过单细胞测序和流式细胞术揭示了神经相关巨噬细胞（NAMs）在脂肪组织稳态和衰老相关炎症中的关键作用	首次发现并定义了神经相关巨噬细胞（NAMs）这一特殊亚群，并证明其通过调控儿茶酚胺敏感性抑制年龄相关炎症	研究仅限于小鼠模型，人类中的类似机制尚未验证	探究脂肪组织巨噬细胞在衰老过程中调控炎症的分子机制	小鼠脂肪组织中的巨噬细胞亚群	免疫学	老年性疾病	单细胞测序、多参数流式细胞术、血管内标记	NA	单细胞RNA测序数据、流式细胞数据	不同年龄段的雌雄小鼠脂肪组织样本
65	2025-09-19	Response to Antiangiogenic Therapy Is Associated with AIMP Protein Family Expression in Glioblastoma and Lower-Grade Gliomas 2025-Sep-01, Cancer research communications IF:2.0Q3 DOI:10.1158/2767-9764.CRC-25-0170 PMID:40874786	研究论文	本研究探讨AIMP蛋白家族在胶质瘤血管生成中的作用及其作为抗血管生成治疗反应预测生物标志物的潜力	首次发现AIMP1/2/3表达与胶质瘤血管生成显著相关，并证实高AIMP2亚组对抗血管生成治疗反应更佳	回顾性研究设计，需前瞻性验证AIMP2作为分层标志物的临床适用性	研究AIMP蛋白在胶质瘤血管生成中的作用并开发治疗反应预测生物标志物	胶质母细胞瘤和低级别胶质瘤患者样本	数字病理	胶质瘤	转录组学、表观遗传学、蛋白质组学、单细胞转录组分析	Cox比例风险模型	基因组数据、转录组数据、表观遗传数据、蛋白质组数据	来自TCGA、CGGA、REMBRANDT、Gravendeel、BELOB和REGOMA试验的多队列样本及四个单细胞转录组数据集
66	2025-09-19	Heart failure-specific cardiac fibroblasts contribute to cardiac dysfunction via the MYC-CXCL1-CXCR2 axis 2025-Sep, Nature cardiovascular research IF:9.4Q1 DOI:10.1038/s44161-025-00698-y PMID:40931092	研究论文	本文揭示了心力衰竭特异性心脏成纤维细胞通过MYC-CXCL1-CXCR2轴导致心功能不全的机制	首次发现心力衰竭特异性心脏成纤维细胞亚群及其通过MYC-CXCL1-CXCR2信号通路影响心肌细胞功能的新机制	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限	探究心脏成纤维细胞在心力衰竭中的作用机制	小鼠心脏、新生大鼠心肌细胞、人iPSC来源心肌细胞及人心力衰竭组织样本	心血管疾病研究	心力衰竭	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	基因表达数据	小鼠压力超负荷模型、人类心力衰竭患者与对照组心脏组织
67	2025-09-19	IL7R+ T Cell-Macrophage Crosstalk Links Asthma to Alzheimer's Pathogenesis: Integrating Mendelian Randomization and CellChat Analysis 2025-Sep, Brain and behavior IF:2.6Q3 DOI:10.1002/brb3.70809 PMID:40951943	研究论文	本研究通过孟德尔随机化和单细胞分析探讨中重度哮喘与阿尔茨海默病之间的潜在因果联系和分子机制	首次整合孟德尔随机化与单细胞通讯分析揭示IL7R+ T细胞-巨噬细胞串扰在哮喘与阿尔茨海默病关联中的作用	研究主要基于欧洲裔人群数据，遗传相关性分析未发现显著重叠	探究中重度哮喘与阿尔茨海默病之间的因果关系和生物学机制	欧洲裔人群的基因组数据和单细胞测序数据	生物信息学	阿尔茨海默病	孟德尔随机化(MR), 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 连锁不平衡评分回归(LDSC)	NA	基因组关联数据, 单细胞测序数据	AD样本455,258例，中重度哮喘样本57,695例
68	2025-09-19	Region-specific gene expression and sex inform about disease susceptibility in the aorta 2025-Sep, Nature cardiovascular research IF:9.4Q1 DOI:10.1038/s44161-025-00692-4 PMID:40841834	研究论文	通过单细胞转录组学分析大血管不同区域的基因表达差异，揭示疾病易感性的区域和性别特异性机制	首次系统比较主动脉不同区域（颈动脉、主动脉弓、胸腹主动脉）的单细胞转录组，并关联GWAS和eQTL数据鉴定疾病候选基因	NA	探究大血管疾病易感性的区域和性别特异性分子机制	小鼠和人类的主动脉组织	生物信息学	心血管疾病	单细胞转录组学，GWAS，eQTL分析	NA	基因表达数据	NA
69	2025-09-19	A Spinal Circuit for Modular Gating of Organ Somatosensation 2025-Sep-01, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.08.27.672386 PMID:40949983	研究论文	本研究识别了一组遗传定义的腰骶脊髓中间神经元，它们调控膀胱感觉输入和排尿反射	发现了分子特性不同的神经元亚型，这些神经元对协调膀胱-括约肌活动和门控内脏疼痛至关重要	NA	探索协调器官功能（如膀胱控制）的特定脊髓回路	腰骶脊髓中间神经元	神经科学	泌尿系统疾病	单细胞转录组学、原位生理学、回路追踪	NA	分子数据、生理数据	NA
70	2025-09-19	shinyUMAP: an online tool for promoting understanding of single cell omics data visualization 2025-Sep-01, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.08.27.672621 PMID:40949989	研究论文	开发了一个名为shinyUMAP的在线工具，用于帮助用户交互式探索单细胞组学数据的UMAP可视化效果	提供了一个交互式在线平台，允许用户上传单细胞数据并实时调整UMAP超参数，直观观察细胞簇分布变化	NA	促进对单细胞组学数据可视化中UMAP方法的正确理解和使用	单细胞组学数据，特别是scRNA-seq表达数据	生物信息学	NA	UMAP（均匀流形近似与投影）	NA	单细胞组学数据	NA
71	2025-09-19	Tumour Single-Cell Bioinformatics: From Immune Profiling to Molecular Dynamics 2025-Sep, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2 DOI:10.1111/jcmm.70783 PMID:40954554	综述	系统总结单细胞RNA测序在解析肿瘤微环境中的应用进展及其对精准肿瘤学的意义	揭示了肿瘤微环境中细胞异质性、新型免疫细胞亚群及动态功能状态，阐明了驱动肿瘤进展的细胞间信号网络	NA	解析肿瘤微环境复杂性并推动精准癌症治疗策略开发	肿瘤微环境中的免疫细胞、癌症相关成纤维细胞及细胞外基质成分	生物信息学	肿瘤	scRNA-seq（单细胞RNA测序）	NA	单细胞RNA测序数据、临床信息	NA
72	2025-09-19	Dopaminergic short axon cells integrate sensory and top-down inputs to enhance discriminative learning in the mouse olfactory bulb 2025-Sep, PLoS biology IF:7.8Q1 DOI:10.1371/journal.pbio.3003375 PMID:40956809	研究论文	本研究揭示了小鼠嗅球中多巴胺能短轴突细胞通过整合感觉和自上而下输入来增强嗅觉辨别学习的神经回路机制	发现了SACs通过突触和结构可塑性实现基于气味效价的输入门控，并确定了斜角带水平支的胆碱能输入作为效价依赖信号	研究局限于小鼠模型，尚未在其它物种或更复杂行为情境中验证	探究嗅觉辨别学习中感觉表征增强的神经机制	小鼠嗅球中的多巴胺能短轴突细胞(SACs)及其神经回路	神经科学	NA	光学成像、空间转录组学、电子显微镜	NA	神经成像数据、基因表达数据、超微结构数据	小鼠模型（具体数量未明确说明）
73	2025-09-19	Genetic associations between serotonin receptor 1F (HTR1F) regulatory variation and sleep apnoea in non-obese individuals: insights from GWAS and eQTL analyses 2025-Sep, The European respiratory journal DOI:10.1183/13993003.01778-2024 PMID:40571323	研究论文	本研究通过GWAS和eQTL分析揭示了非肥胖人群中血清素受体1F（HTR1F）基因调控变异与睡眠呼吸暂停的遗传关联	首次在非肥胖人群中识别HTR1F基因座与睡眠呼吸暂停的显著关联，并通过多组织共定位和单细胞测序验证其神经元表达调控作用	研究主要基于芬兰和爱沙尼亚人群数据，结果在其他人群中的普适性需进一步验证	阐明非肥胖个体睡眠呼吸暂停的遗传风险因素	非肥胖（BMI<30 kg·m⁻²）人群，包括20,413名睡眠呼吸暂停患者和443,463名健康对照	遗传学	睡眠呼吸暂停	GWAS, eQTL分析, 单细胞测序, 表型全关联研究	NA	基因型数据, 表达数据, 临床诊断数据	芬兰队列463,876人（病例20,413，对照443,463），爱沙尼亚生物样本库验证队列
74	2025-09-19	Single-cell sequencing analysis reveals the promotion of ELR CXCL genes on angiogenesis and the influence on malignant progression in glioblastoma 2025-Sep-01, Journal of clinical biochemistry and nutrition IF:2.0Q3 DOI:10.3164/jcbn.25-26 PMID:40963732	研究论文	本研究通过单细胞测序分析揭示了ELR CXCL基因在胶质母细胞瘤中促进血管生成并影响恶性进展的作用	首次在胶质母细胞瘤中鉴定出癌症相关BMDM亚群及其特异性高表达的ELR CXCL基因，特别是CXCL3对血管生成和肿瘤恶性进展的促进作用	研究主要基于数据库分析和体外实验，缺乏体内实验验证和临床样本的深入验证	探究胶质母细胞瘤微环境中髓系细胞亚群的异质性及其在肿瘤发生发展中的作用机制	胶质母细胞瘤细胞、髓系细胞、骨髓来源巨噬细胞(BMDMs)和内皮细胞	肿瘤生物学	胶质母细胞瘤	单细胞测序、qRT-PCR、血管生成实验、CCK-8检测、集落形成实验、Transwell实验、流式细胞术	NA	单细胞测序数据、实验数据	从GEO数据库获取的单细胞测序数据，具体样本数量未明确说明
75	2025-09-19	Single-Cell RNA Analysis Reveals Reduced Frequency and Activity of CXCR5+ Atypical Memory B Cells in Islet Xenotransplantation Treated With Clinically Applicable Immunosuppressants Including Belimumab 2025 Sep-Oct, Xenotransplantation IF:3.3Q2 DOI:10.1111/xen.70076 PMID:40964768	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了Belimumab在猪到非人灵长类胰岛异种移植中抑制B细胞活性的机制	首次在异种移植模型中揭示Belimumab不仅减少CXCR5+非典型记忆B细胞比例，还引起所有B细胞亚群的功能损伤	研究基于非人灵长类动物模型，临床适用性需进一步验证	评估Belimumab作为免疫抑制剂在胰岛异种移植中的作用机制	恒河猴的血液样本及移植的猪胰岛细胞	免疫学	1型糖尿病	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	恒河猴治疗前后血液样本
76	2025-09-19	Single-cell RNA sequencing study reveals the potential role of the RPS26 gene in attention deficit hyperactivity disorder 2025-Aug-30, Progress in neuro-psychopharmacology & biological psychiatry IF:5.3Q1 DOI:10.1016/j.pnpbp.2025.111444 PMID:40653146	研究论文	通过单细胞RNA测序技术探索RPS26基因在注意力缺陷多动障碍（ADHD）中的潜在作用及其与心血管疾病的分子联系	首次应用单细胞RNA测序技术研究ADHD患者白细胞亚群的基因表达差异，并发现RPS26基因在单核细胞中的调控作用	样本量较小（仅一对异卵双胞胎），且主要基于体外实验验证，需要更大规模研究进一步确认	探索ADHD与心血管疾病之间的潜在生物学联系，重点关注单核/巨噬细胞生物学	ADHD患者（特别是异卵双胞胎中患病个体）的白细胞样本	生物信息学	注意力缺陷多动障碍	单细胞RNA测序（scRNA-seq），定量PCR（qPCR），体外功能实验	NA	RNA测序数据，基因表达数据	一对ADHD不一致的异卵双胞胎
77	2025-09-19	Comparing Xenium 5K and Visium HD data from identical tissue slide at a pathological perspective 2025-Jul-26, Journal of experimental & clinical cancer research : CR IF:11.4Q1 DOI:10.1186/s13046-025-03479-4 PMID:40713820	研究论文	比较相同组织切片上Xenium 5K和Visium HD空间转录组数据在病理学视角下的性能差异	首次使用同一组织切片生成的公开肺数据集进行两种高分辨率技术的直接病理标注对比	研究基于特定肺数据集，结论可能受组织类型和病理特征限制	评估Visium-HD和Xenium原位技术在空间转录组学中的技术性能差异	肺组织切片的空间转录组数据	数字病理	肺癌	空间转录组学，Visium-HD测序技术，Xenium原位成像技术	聚类算法	空间转录组数据，病理标注数据	公开肺数据集（具体样本数量未明确说明）
78	2025-09-19	The glycolytic reaction PGAM restrains Th17 pathogenicity and Th17-dependent autoimmunity 2025-Jun-24, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2025.115799 PMID:40482033	研究论文	本研究揭示糖酵解反应中PGAM酶对Th17细胞致病性的负向调控作用	发现PGAM酶（与其他糖酵解酶相反）抑制Th17细胞的致病性分化，通过单细胞代谢状态推断算法Compass预测并验证了这一新机制	研究主要基于实验性自身免疫性脑脊髓炎模型，人类Th17细胞中的直接应用尚需进一步验证	探究糖酵解反应如何决定Th17细胞的致病性	T辅助17细胞（Th17 cells）	免疫代谢学	自身免疫性疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq），Compass算法，酶活性扰动实验	Compass代谢状态推断算法	基因表达数据	NA
79	2025-09-19	An updated and spatially validated somatic single-cell atlas of Hydractinia symbiolongicarpus 2025-Jun-07, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.06.03.657738 PMID:40502179	研究论文	本研究通过整合新数据集与已有数据，构建并验证了Hydractinia symbiolongicarpus的更新版体细胞单细胞图谱	发现了新的神经亚型、两个空间分布不同的腺细胞群体、一个匍匐茎特异性细胞类型以及一个推定的免疫细胞簇，并揭示了完整的刺细胞发育轨迹	NA	深化对刺胞动物细胞多样性和动态变化的理解，为干细胞和再生研究提供资源	Hydractinia symbiolongicarpus（一种刺胞动物模型）的摄食水螅体和匍匐茎组织	单细胞转录组学	NA	scRNA-seq（单细胞RNA测序）	NA	单细胞转录组数据	超过47,000个细胞
80	2025-09-19	Simultaneous inference for generalized linear models with unmeasured confounders 2025-Jun-06, Journal of the American Statistical Association IF:3.0Q1 DOI:10.1080/01621459.2025.2485379 PMID:40964623	研究论文	提出一种针对存在未测量混杂因子的广义线性模型的大规模假设检验统一框架	利用正交结构和线性投影，在任意混杂机制下解耦边际与不相关混杂效应，并通过投影加权偏差校正步骤进行假设检验	NA	解决基因组研究中由未测量混杂因子导致的假设检验偏差问题	广义线性模型中的系数估计与假设检验	统计遗传学	NA	单细胞RNA测序	广义线性模型，lasso优化	基因表达数据	NA