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当前共找到 39439 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-05-17 |
Patient-derived liver organoids recapitulate liver epithelial heterogeneity and enable precision modeling of alcohol-related liver disease
2026-01, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.07.014
PMID:40754225
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研究论文 | 本研究开发了一种从酒精性肝病患者肝脏穿刺活检样本中衍生的类器官模型，该模型能够重现肝上皮异质性，并用于酒精性肝病的精准建模 | 首次从酒精性肝病患者的穿刺活检样本中生成类器官，并证明其能捕捉肝上皮细胞的异质性和疾病阶段特异性特征，从而为个性化疾病建模和药物测试提供新的平台 | 未提及具体局限性 | 开发一种能够捕捉肝上皮异质性和患者特异性特征的人类模型，以推进酒精性肝病的精准建模和个性化治疗 | 酒精性肝病患者的穿刺活检样本及其衍生的类器官 | 数字病理学 | 酒精性肝病 | 单细胞RNA测序、免疫荧光 | 类器官模型 | 图像、文本 | 早期阶段患者28例，晚期阶段患者34例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 62 | 2026-05-17 |
Integrative bioinformatic analysis prioritizes TIMP1 and FN1 as angiogenesis-related candidate genes in diabetic foot ulcers
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0348808
PMID:42127081
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研究论文 | 通过整合生物信息学分析，优先识别TIMP1和FN1作为糖尿病足溃疡中血管生成相关的候选基因 | 首次将批量转录组数据、机器学习基因优先级排序和单细胞RNA测序相结合，系统表征糖尿病足溃疡中血管生成损伤相关的分子特征 | FN1 mRNA表达下降趋势未达到统计学显著性，且结论基于生物信息学探索性分析，需进一步实验验证 | 探索糖尿病足溃疡中与血管生成损伤和修复受损相关的分子特征 | 糖尿病足溃疡的转录组数据及单细胞表达模式 | 机器学习, 数字病理学 | 糖尿病足溃疡 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 机器学习 | LASSO逻辑回归模型 | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 使用GSE199939和GSE134431数据集（含发现队列和复制队列） | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 63 | 2026-05-17 |
UBE2S emerges as a key driver in an NK cell-based prognostic model for clear cell renal cell carcinoma
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0344925
PMID:42133651
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序与多队列转录组验证，构建基于NK细胞和UBE2S的肾透明细胞癌预后模型 | 首次通过单细胞RNA测序揭示NK细胞亚群在ccRCC肿瘤微环境中的关键作用，并发现UBE2S作为驱动基因参与肿瘤进展；基于CoxBoost算法构建的12基因预后模型在多独立数据集中验证了高预测准确性 | 未提供明显的局限性信息 | 探索肾透明细胞癌的免疫微环境异质性，建立稳健的预后分子标志物和治疗靶点 | 肾透明细胞癌患者肿瘤及癌旁组织 | 机器学习, 数字病理学 | 肾细胞癌, 肾透明细胞癌 | 单细胞RNA测序, 转录组测序, CoxBoost, 体外敲低实验 | CoxBoost, 加权基因共表达网络分析 | 单细胞转录组数据, 转录组数据 | 多队列转录组验证，具体样本数未说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 64 | 2026-05-17 |
Influence of Age on Fracture Healing in Young and Middle-Aged Mice in a Proximal Femur Fracture Model
2025-12, Journal of orthopaedic research : official publication of the Orthopaedic Research Society
IF:2.1Q2
DOI:10.1002/jor.70063
PMID:40931376
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研究论文 | 研究年龄对年轻和中年小鼠股骨近端骨折愈合的影响 | 利用空间转录组学结合多重细胞因子分析，揭示了中年小鼠骨折愈合能力下降与衰老相关分泌表型（SASP）因子的关联 | 仅使用雄性C57BL/6J小鼠，未包括雌性小鼠及更年长小鼠，且未深入探讨SASP因子的具体分子机制 | 确定年龄对小鼠股骨近端骨折愈合的影响，并评估该模型是否适用于研究年龄相关性延迟骨折愈合的分子机制 | 12周龄（年轻）和52周龄（中年）雄性C57BL/6J小鼠 | 机器学习 | 骨质疏松, 骨折 | 空间转录组学, 多重细胞因子分析, μCT分析, 组织形态计量学, 免疫染色 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 12周龄和52周龄雄性C57BL/6J小鼠（具体数量未提及） | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台用于骨折后14天的组织分析 |
| 65 | 2026-05-17 |
Transcriptomic plasticity of cholinergic adipose macrophages in the acute thermogenic response
2025-12, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110925
PMID:41207622
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序研究冷暴露后皮下白色脂肪组织中胆碱能脂肪巨噬细胞的转录组可塑性及其起源 | 首次以高分辨率描绘了胆碱能脂肪巨噬细胞在急性热生成反应中的转录组动态，揭示了其混合起源（成体骨髓和胚胎）及冷诱导的广泛基因表达变化 | 未提及具体局限性 | 探究胆碱能脂肪巨噬细胞在急性冷暴露下的转录组可塑性、起源及其在代谢疾病中的治疗潜力 | 小鼠皮下白色脂肪组织中的ChAT-eGFP+细胞 | 单细胞转录组学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 在热中性或急性冷暴露后饲养的小鼠皮下白色脂肪组织样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 66 | 2026-05-17 |
ETV1 is a key regulator of enteroendocrine PYY production
2025-12-01, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.052610
PMID:41048045
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研究论文 | 本研究发现ETS变异转录因子1（ETV1）是肠内分泌L细胞中PYY产生的关键调节因子 | 首次揭示ETV1在L细胞中特异调节PYY表达的转录调控机制，而对GLP-1表达无影响 | 未明确说明 | 探究肠内分泌L细胞中ETV1对激素PYY和GLP-1的转录调控作用 | 小鼠小肠和类器官培养中的L细胞 | 医学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、定量PCR | NA | 基因表达数据 | 小鼠小肠组织样本和类器官培养样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 67 | 2026-05-17 |
MIG-6 Plays a Critical Role as a PGR Mediator in Maintaining Epithelial and Stromal Cells for Uterine Receptivity
2025-Sep-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501455R
PMID:40905903
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序探究MIG-6在子宫容受性维持中对上皮和基质细胞的调节作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示MIG-6缺失导致非容受性子宫内膜的细胞组成和功能改变，发现LRP2表达降低是MIG-6缺失和子宫内膜异位症不孕患者的共同特征 | NA | 评估MIG-6缺乏是否破坏子宫中特定细胞群体的复杂动态功能 | 子宫特异性Mig-6敲除小鼠及子宫内膜异位症不孕女性的子宫内膜细胞 | 数字病理学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | Mig-6敲除小鼠与对照小鼠，以及子宫内膜异位症不孕女性样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 68 | 2026-05-17 |
Progress and new challenges in image-based profiling
2025-Aug-07, ArXiv
PMID:40799808
|
综述 | 本文综述了基于成像的表型分析在计算领域的最新进展，包括深度学习、单细胞分析及批次效应校正等技术创新，并探讨了该领域面临的主要挑战与未来方向 | 创新点在于系统回顾了深度学习如何重塑基于成像的表型分析流程，提升了特征提取、可扩展性和多模态数据整合能力，并借鉴单细胞转录组学方法改进了单细胞分析和批次效应校正技术 | 主要限制在于未广泛涵盖生物学应用细节，仅聚焦于技术演进，可能忽略实际应用中的特定问题与需求 | 为研究人员提供基于成像的表型分析领域进展与新挑战的技术路线图 | 基于成像的表型分析技术及其计算流程 | 计算机视觉 | 不适用 | 不适用 | 深度学习 | 图像 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 |
| 69 | 2026-05-17 |
Decoding Cellular Stress States for Toxicology Using Single-Cell Transcriptomics
2025-Aug-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.10.657506
PMID:40766395
|
研究论文 | 应用TempO-LINC平台生成约40,000个HepaRG细胞的单细胞转录组图谱，解码七种化学物质诱导的应激反应通路及细胞状态转变 | 首次利用单细胞转录组学系统解码多种化合物诱导的细胞应激状态异质性，通过广义Jaccard度量聚类识别出五种表型群体，揭示从稳态到凋亡的动态转变过程 | 未明确说明 | 利用单细胞转录组解析化学物质暴露下细胞适应性和终末应激反应路径的异质性 | 暴露于依托泊苷、布雷菲德菌素A、环己酰亚胺、鱼藤酮、tBHQ、曲格列酮和衣霉素三种浓度24小时的HepaRG细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约40,000个HepaRG细胞 | BioSpyder Technologies | 单细胞RNA-seq | TempO-LINC平台 | TempO-LINC单细胞转录组分析平台 |
| 70 | 2026-05-17 |
TCF7 functions as a prognostic biomarker in bladder cancer by strengthening EMT and stemness associated with TGF-β/SMAD3 signaling
2025-Jul, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-025-05241-y
PMID:40025258
|
research paper | 本研究探究TCF7在膀胱癌中通过调控TGF-β/SMAD3信号通路促进上皮间质转化和干性，作为预后生物标志物的作用机制 | 首次揭示TCF7通过转录调控TGFBR1影响TGF-β/SMAD3通路，驱动膀胱癌上皮间质转化和干性的新机制 | NA | 阐明TCF7在膀胱癌进展中的生物学功能和转录调控机制 | 膀胱癌患者样本及TCF7相关分子机制 | machine learning | bladder cancer | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 71 | 2026-05-17 |
Circulating monocytes upregulate CD52 and sustain innate immune function in cirrhosis unless acute decompensation emerges
2025-07, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.12.031
PMID:39818234
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析不同阶段肝硬化患者循环单核细胞的异质性，发现CD52在先天免疫功能中的关键作用 | 首次在单细胞水平上描述CD52在肝硬化不同阶段循环单核细胞中的表达变化，并揭示CD52稳定化可增强单核细胞抗感染功能 | 未在急性失代偿患者中深入验证CD52的机制，且缺乏体内功能验证 | 阐明肝硬化不同阶段循环单核细胞状态的异质性，以及CD52在先天免疫麻痹中的功能和潜在治疗意义 | 健康个体和不同阶段肝硬化患者的循环单核细胞 | 数字病理学 | 肝硬化 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 体外功能实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康个体和各阶段肝硬化患者的血液样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 测序平台 |
| 72 | 2026-05-17 |
Engineering sonogenetic EchoBack-CAR T cells
2025-May-15, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.02.035
PMID:40179881
|
研究论文 | 利用超声遗传学技术构建EchoBack-CAR T细胞，通过聚焦超声刺激实现CAR的持续表达，用于实体肿瘤治疗 | 首次设计超声响应型EchoBack-CAR T细胞，利用超灵敏热休克启动子和CAR信号正反馈回路实现长效表达，并通过聚焦超声刺激精准调控 | 未提及 | 开发一种通用、高效且安全的实体肿瘤治疗策略 | EchoBack-CAR T细胞及其靶向GD2或PSMA的变体 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤，前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 73 | 2026-05-17 |
Rorγt-positive dendritic cells are required for the induction of peripheral regulatory T cells in response to oral antigens
2025-May-15, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.03.020
PMID:40185101
|
研究论文 | 本文通过开发一种特异性删除Rorc基因顺式调控元件的小鼠，发现RORγt阳性树突状细胞对于口服抗原诱导外周调节性T细胞是必需的，而ILC3则无此作用 | 首次通过基因编辑手段特异性缺失RORγt阳性树突状细胞，明确区分了其在pTreg诱导中的独特作用，并发现RORγt DC与ILC3共享淋巴样起源 | 未明确指出局限性 | 阐明RORγt抗原呈递细胞在外周调节性T细胞诱导及口服耐受维持中的作用 | RORγt阳性树突状细胞和3型固有淋巴样细胞 | 机器学习和数字病理不适用，应归类为免疫学或细胞生物学 | 食物过敏、炎症性肠病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、谱系追踪 | 不适用 | 单细胞转录组数据 | 基因修饰小鼠模型，具体数目未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序平台，具体配置未详述 |
| 74 | 2026-05-17 |
Enhanced Production of Lipid Mediators in Plasma and Activation of DNA Damage Pathways in PBMCs Are Correlated With the Severity of Ancestral SARS-CoV-2 Infection
2025-May-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202403195R
PMID:40322970
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研究论文 | 通过血浆脂质代谢物分析和PBMCs转录组测序，揭示脂质介质与DNA损伤通路在SARS-CoV-2感染严重程度中的相关性 | 首次系统揭示花生四烯酸（AA）和二十碳五烯酸（EPA）等促炎脂质介质与WHO疾病严重程度评分的正相关关系，并发现EPA水平与高评分患者细胞周期和DNA损伤通路的激活相关 | 样本量较小（10例感染和10例未感染患者），需要更大样本验证；鼻拭子scRNA-seq数据集为已有公开数据，可能未完全匹配本研究的患者群体 | 探究遗传因素和脂质代谢物与重型SARS-CoV-2感染之间的关联机制 | COVID-19患者和健康对照者的血浆、PBMCs和鼻拭子样本 | 自然语言处理 | 呼吸道病毒感染 | bulk RNA-seq、总脂肪酸面板分析、Mann-Whitney U检验、Ontology/KEGG/Reactome通路分析 | NA | 基因表达数据、脂质代谢物数据 | 10例感染和10例未感染患者用于RNA-seq和脂质分析；58例健康与COVID-19参与者用于鼻拭子基因表达研究 | NA | bulk RNA-seq、scRNA-seq | NA | NA |
| 75 | 2026-05-17 |
Regulation of RNA polymerase II transcription through re-initiation and bursting
2025-May-15, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2025.04.011
PMID:40378829
|
综述 | 综述了RNA聚合酶II通过再起始和爆发式转录调控的最新研究进展 | 整合活细胞成像和单细胞转录组学数据，提出RNAPII再起始和爆发式转录作为基因调控的普遍现象，并聚焦于分子机制和未解问题 | 未提供具体实验数据，主要基于现有文献总结，可能忽略某些研究细节 | 探讨RNAPII爆发式转录的调控策略及其在健康和疾病中的意义 | 真核细胞中RNA聚合酶II的转录调控过程 | 自然语言处理 | NA | 活细胞成像、单细胞转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 76 | 2026-05-17 |
Angiotensin-Converting Enzyme-Dependent Intrarenal Angiotensin II Contributes to CTP: Phosphoethanolamine Cytidylyltransferase Downregulation, Mitochondrial Membranous Disruption, and Reactive Oxygen Species Overgeneration in Diabetic Tubulopathy
2025-05, Antioxidants & redox signaling
IF:5.9Q1
DOI:10.1089/ars.2024.0637
PMID:39495586
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研究论文 | 该研究探讨了血管紧张素转换酶依赖性肾内血管紧张素II在糖尿病肾小管病变中导致线粒体膜破坏、活性氧过度生成和CTP:磷酸乙醇胺胞苷酰转移酶下调的作用 | 首次揭示了ACE依赖性肾内AngII通过破坏线粒体膜稳态和下调PCYT2导致糖尿病肾小管损伤的新机制，为ACEI联合治疗提供新靶点 | 研究主要基于小鼠模型，未在人类样本中验证；仅部分改善效果，未完全逆转损伤 | 探究ACE依赖性肾内AngII在糖尿病肾小管病变中对线粒体膜稳态和ROS生成的影响 | 高脂饮食/链脲佐菌素诱导的2型糖尿病小鼠模型 | 生物信息学 | 糖尿病肾病, 肾小管病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 基因表达数据 | 小鼠模型，具体数量未在标题和摘要中说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 用于肾小管单细胞RNA测序分析PCYT2富集 |
| 77 | 2026-05-17 |
scPharm: Identifying Pharmacological Subpopulations of Single Cells for Precision Medicine in Cancers
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202412419
PMID:39560158
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研究论文 | 介绍scPharm计算框架，整合药理图谱与单细胞RNA测序数据，识别肿瘤内药物敏感性亚群并优化个性化治疗 | 首次提出通过标准化富集分数将药物反应基因列表与细胞身份基因分布关联，实现单细胞分辨率的药物亚群识别，并预测联合用药策略与毒性评估 | 仅依赖基因集富集分析评估相关性，可能忽略非编码RNA或表观遗传调控对药物反应的影响 | 为癌症精准医学提供单细胞分辨率的治疗异质性解析方法 | 人乳腺癌组织（ER阳性/HER2阳性）、人PC9细胞（经埃罗替尼处理）、小鼠模型 | 机器学习 | 乳腺癌，肺癌 | 单细胞RNA测序 | scPharm计算框架（基于基因集富集分析） | 基因表达数据 | 人乳腺癌组织（具体样本量未提及）、人PC9细胞系、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 78 | 2026-05-17 |
H. Pylori-Facilitated TERT/Wnt/β-Catenin Triggers Spasmolytic Polypeptide-Expressing Metaplasia and Oxyntic Atrophy
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202401227
PMID:39587848
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研究论文 | 本研究揭示了幽门螺杆菌通过CagA蛋白破坏TERT与E3连接酶SYVN1的相互作用，上调TERT水平并激活Wnt/β-Catenin通路，从而诱导主细胞去分化和痉挛性多肽表达化生及胃底腺萎缩的机制 | 首次阐明CagA通过干扰TERT与新型E3连接酶SYVN1的结合来上调TERT蛋白丰度，并证实TERT/Wnt/β-Catenin通路在幽门螺杆菌诱导的SPEM中的关键作用 | 未提及具体局限 | 探究幽门螺杆菌诱导胃黏膜痉挛性多肽表达化生和胃底腺萎缩的分子机制 | 感染cagA阳性幽门螺杆菌的胃黏膜主细胞 | 分子生物学 | 胃癌前病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 79 | 2026-05-17 |
Control of Cellular Differentiation Trajectories for Cancer Reversion
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202402132
PMID:39661721
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研究论文 | 提出了单细胞布尔网络推断和控制框架BENEIN，用于识别细胞分化轨迹中的主调控因子，并验证了其通过抑制MYB、HDAC2和FOXA2诱导结直肠癌细胞向正常样肠细胞逆转的能力 | 首次将布尔网络控制理论应用于单细胞转录组数据，系统识别分化轨迹中的主调控因子，并实现癌症逆转 | 方法的普适性需在更多组织类型和癌症类型中验证，且实验验证仅限于结直肠癌模型 | 开发计算框架以识别细胞分化轨迹中的主调控因子，并探索通过调控这些因子实现癌症逆转的可能性 | 人小肠单细胞转录组数据及结直肠癌细胞 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 布尔网络 | 基因表达数据 | 人小肠单细胞转录组数据（样本量未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 80 | 2026-05-17 |
Dissecting tumor transcriptional heterogeneity from single-cell RNA-seq data by generalized binary covariance decomposition
2025-Jan, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01997-z
PMID:39747597
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研究论文 | 通过广义二元协方差分解从单细胞RNA测序数据中解析肿瘤转录异质性 | 提出一种新的统计方法广义二元协方差分解（GBCD），能够在强肿瘤间异质性背景下将转录异质性分解为患者特异性、数据集特异性和疾病亚型相关的共享成分，优于现有方法 | 主要依赖胰腺导管腺癌数据验证，方法在其他癌症类型中的通用性尚需进一步评估 | 开发一种统计方法来解析单细胞RNA测序数据中肿瘤转录异质性的可解释成分 | 胰腺导管腺癌肿瘤样本的转录组数据 | 机器学习 | 胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA测序 | 广义二元协方差分解 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |