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当前共找到 39812 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-05-30 |
spatiAlytica: Viewer-Grounded Multimodal Agentic System for Interactive Spatial Omics Analysis
2026-May-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.29.721735
PMID:42146494
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研究论文 | 提出了一种嵌入Napari查看器的多模态交互式代理系统spatiAlytica，使非编程生物学家能通过自然语言进行迭代、假设驱动的空间组学分析 | 首次将查看器状态序列化、代理记忆、生物概念到数据字段映射、代码生成与调试、空间视觉问答及基于查看器的解释机制相结合，实现了无需编程的空间组学交互分析 | 可能受限于基准测试的覆盖范围和实际生物问题的复杂性，未提及对大规模数据或高噪声数据的鲁棒性验证 | 开发一种非程序员友好的交互式空间组学分析系统，支持自然语言驱动的探索性分析和解释性推理 | 空间转录组学和蛋白质组学数据（包括卡波西肉瘤、结直肠癌和卵巢癌组织样本） | 计算机视觉, 数字病理学 | 卡波西肉瘤, 结直肠癌, 卵巢癌 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | 文本, 图像 | 空间分析编码问题222个、多轮序列工作流问题178个、图像推理问题7350个 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 62 | 2026-05-30 |
Cellular Origins and Context-Dependent Prognostic Effects of Lactate Metabolism Genes Reveal Novel Molecular Subtypes in Gastric Cancer
2026-May-04, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb48050477
PMID:42193082
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研究论文 | 通过乳酸代谢相关基因揭示胃癌新型分子亚型及其细胞起源和背景依赖性预后效应 | 首次通过单细胞RNA-seq整合分析，揭示乳酸代谢关键基因HK2和FABP4在不同细胞类型中的起源，并发现FABP4的预后效应具有背景依赖性，颠覆了传统预后模型固定效应的认知 | 跨平台预后模型验证失败，表明单队列来源的特征具有局限性；需要更多外部队列验证FABP4的细胞起源依赖性功能 | 解析胃癌异质性中乳酸代谢重编程的贡献，重点关注关键基因的细胞来源和背景特异性功能 | 胃癌患者肿瘤样本（TCGA队列375例）及单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 共识聚类 | 基因表达数据 | 375例胃癌患者样本（TCGA） | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 63 | 2026-05-30 |
REACTOR: REgulon Activity analysis and Comparison Tool for single-cell transcriptOmics Research
2026-May-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag203
PMID:42082398
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研究论文 | 介绍REACTOR，一个用于分析单细胞RNA测序数据中转录调控因子及其靶基因（调控子）差异活性的计算工具 | 引入稳健统计检验来检测多个重复样本间不同条件（如疾病组与对照组）的差异调控子活性，扩展了现有调控子分析框架 | 未明确说明，但推测依赖高质量单细胞数据及适当的重复设计 | 开发用于单细胞转录组学中调控子活性比较分析的统计工具 | 单细胞RNA测序数据中的转录调控因子及其靶基因（调控子） | 自然语言处理 | 新冠肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 使用公开COVID-19数据集进行演示（具体数量未在摘要中列出） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 64 | 2026-05-30 |
Artificial Intelligence for Spatial Immunometabolic Analysis of the Tumor Microenvironment: Current Evidence and Future Directions
2026-May-03, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb48050476
PMID:42193081
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综述 | 综述了人工智能在肿瘤微环境空间免疫代谢分析中的当前证据和未来方向 | 系统梳理了基于AI的空间免疫代谢研究，涵盖数字病理学、空间转录组学和多模态数据融合，并提出了多模态基础模型、联邦学习和空间解析靶点发现等新兴趋势 | 数据异质性、模型可解释性、泛化性和生物学验证等挑战仍需解决 | 全面概述基于AI的肿瘤微环境空间免疫代谢研究，探讨现有证据和未来发展方向 | 肿瘤微环境中的空间免疫代谢特征 | 数字病理学 | 肿瘤 | 空间转录组学、代谢组学、多重成像、AI | NA | 图像、空间转录组数据、代谢组数据、多模态数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 65 | 2026-05-30 |
Integrated Evolutionary and Multi-Omic Analysis of STAT Family Activation Across Solid Tumors
2026-May-03, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17050547
PMID:42195004
|
研究论文 | 对STAT家族在实体瘤中的激活进行综合进化与多组学分析 | 首次整合进化分析与多组学数据（转录组、调控子、单细胞及染色质结合）来解析STAT家族在实体瘤中的作用，揭示了STAT1非经典DNA识别模式 | 仅基于公开数据集，染色质结合分析限于干扰素刺激的细胞系，未进行体内验证 | 阐明STAT转录因子家族在实体瘤中的进化保守性及激活机制 | 人类实体瘤样本及正常组织 | 生物信息学 | 实体瘤 | 进化分析、转录组分析、调控子分析、单细胞RNA-seq、ChIP-seq | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据、染色质免疫沉淀测序数据 | TCGA实体瘤样本与GTEx正常组织样本；HNSCC单细胞数据集；HeLa和K562细胞系 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, ChIP-seq | NA | NA |
| 66 | 2026-05-30 |
A Synthetic Lethality-Informed Multi-Omic Framework for Identifying a Five-Gene Diagnostic Signature in Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2026-May-02, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb48050475
PMID:42193080
|
研究论文 | 利用合成致死信息的多组学框架识别慢性阻塞性肺疾病的五基因诊断标志物 | 首次将合成致死相关基因优先排序与多组学整合及机器学习方法相结合，用于识别COPD的诊断标志物 | 未提及 | 为慢性阻塞性肺疾病早期诊断和风险分层识别可靠的分子生物标志物 | 慢性阻塞性肺疾病患者和健康对照者的转录组数据 | 机器学习 | 慢性阻塞性肺疾病 | RNA-seq， 单细胞RNA测序， 免疫浸润分析， 体外实验 | LASSO回归， 随机森林 | 转录组数据 | 训练队列：220例COPD和108例对照；外部验证队列：98例COPD和91例对照 | NA | 单细胞RNA-seq， 批量RNA-seq | NA | NA |
| 67 | 2026-05-30 |
TNBC Spatial Transcriptomic Analysis across Clinical States Reveals Subtype-Specific Networks and Immunosuppressive Niches
2026-May-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-25-0808
PMID:42100798
|
研究论文 | 使用GeoMx空间转录组学分析三阴性乳腺癌在不同临床状态下的亚型特异性网络和免疫抑制微环境 | 提出了免疫空间分子亚型（ISMS）框架，整合分子亚型、免疫浸润和空间结构，揭示了TNBC在疾病进展中的免疫空间可塑性 | 样本量可能有限，且未详细说明空间转录组学技术的分辨率限制或潜在批次效应 | 通过空间转录组学分析揭示三阴性乳腺癌在非转移、原发转移和淋巴结转移过程中的转录和免疫空间变化 | 非转移性原发肿瘤、转移性原发肿瘤和淋巴结转移的三阴性乳腺癌样本 | 数字病理学 | 乳腺癌、三阴性乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 组织切片 | 未明确说明样本数量，但包括非转移性原发肿瘤、转移性原发肿瘤和淋巴结转移样本 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx | GeoMx空间转录组学平台 |
| 68 | 2026-05-30 |
Redundant and distinct mechanisms suppress innate immune activation during SARS-CoV-2 infection
2026-May, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3003808
PMID:42160380
|
研究论文 | 使用SARS-CoV-2重组病毒突变体库，揭示NSP1和NSP15等多个病毒蛋白通过冗余和不同机制抑制宿主先天免疫激活 | 首次在感染性重组病毒背景下比较多个SARS-CoV-2蛋白对先天免疫的抑制作用，特别是发现NSP1和NSP15突变能增强I型干扰素应答、树突细胞成熟及体内病毒减毒 | 体外细胞系（293T-ACE2/TMPRSS2）可能不完全反映生理条件，且未深入探索其他蛋白（如ORF6等）的免疫抑制机制 | 阐明SARS-CoV-2不同蛋白在病毒感染过程中抑制先天免疫激活的冗余和特异性机制 | 12种携带单基因突变的重组SARS-CoV-2病毒（涉及NSP1-16及ORF蛋白）以及感染后的细胞和动物模型 | 分子生物学 | COVID-19 | 重组病毒细菌人工染色体、ISRE荧光素酶报告基因检测、RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据、细胞免疫表型数据 | 12种突变病毒株，感染293T-ACE2/TMPRSS2细胞和Calu-3细胞，K18 hACE2转基因小鼠以及人单核细胞来源树突细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 感染小鼠肺免疫细胞单细胞RNA-seq分析 |
| 69 | 2026-05-30 |
A Head and Neck Cancer Patient-Specific Microphysiological System for Predicting Response to Chemoradiation
2026-Apr-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.28.721391
PMID:42094510
|
研究论文 | 开发了一种头颈癌患者特异性微生理系统，用于预测对放化疗的反应 | 构建了包含患者自身恶性细胞、成纤维细胞、免疫细胞和内皮化管腔的三维血管化头颈癌肿瘤微环境模型，并利用单细胞RNA测序验证其保留了12种转录上不同的细胞群体 | 当前模型在捕捉个别头颈癌肿瘤及微环境的全部复杂性或患者间异质性方面仍有不足 | 开发能预测头颈癌患者对放化疗反应的个体化功能工具 | 头颈癌患者手术切除的肿瘤组织中的恶性细胞、成纤维细胞和免疫细胞 | 机器学习 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 来自头颈癌患者的多个样本（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 70 | 2026-05-30 |
Identification of RPA3 as a Potential Functional Effector of Chromosome 7 Gain in Glioblastoma
2026-Apr-30, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14051014
PMID:42193341
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研究论文 | 本研究鉴定RPA3为胶质母细胞瘤中7号染色体获得性扩增的一个潜在功能效应因子 | 首次识别RPA3作为7号染色体获得性扩增中除经典位点外的剂量敏感候选基因，并证明其在胶质母细胞瘤恶性表型中的功能相关性 | 基于体外细胞实验，缺乏体内动物模型验证及临床试验数据支持 | 鉴定胶质母细胞瘤中7号染色体获得性扩增相关的额外候选基因及其功能 | 胶质母细胞瘤肿瘤样本及U87、U118胶质瘤细胞系 | 机器学习和生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | RNA-seq，拷贝数分析，单细胞RNA-seq，siRNA敲低 | NA | 转录组数据，拷贝数数据，临床数据，单细胞RNA-seq数据 | TCGA-GBM和TCGA-LGG队列，CGGA-693队列，单细胞分析中chr7获得性和正常拷贝肿瘤亚克隆 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 71 | 2026-05-30 |
Somatic Mutation Trajectories Define Prognostically Distinct Subtypes and Shape the Tumor Microenvironment in Gastric Cancer
2026-Apr-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17050536
PMID:42194993
|
研究论文 | 通过体细胞突变轨迹重建将胃癌分为两种预后不同的亚型，并揭示其肿瘤微环境特征 | 首次应用SuStaIn算法从时间顺序角度分析胃癌体细胞突变积累过程，识别出加速路径和渐进路径两种进化轨迹，并关联了转录组和微环境差异 | 药物敏感性预测和基因表达与临床结局的机制联系仅为假设生成性发现，需前瞻性和功能性验证 | 重建胃癌体细胞突变轨迹以定义预后不同的亚型并分析相关的转录组和微环境特征 | 胃癌患者的体细胞突变数据、转录组数据和微环境特征 | 数字病理学 | 胃癌 | SuStaIn算法、基因表达分析、单细胞RNA测序反卷积、药物敏感性预测 | SuStaIn | 基因组突变数据、转录组数据 | 三个独立的外部转录组队列 | NA | NA | NA | NA |
| 72 | 2026-05-30 |
Putative Self-Organizing Human Corneal Organoids Recapitulate Human Corneal Architecture and Cellular Diversity
2026-Apr-29, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering13050518
PMID:42194275
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研究论文 | 开发了一种使用人胚胎干细胞通过改良SEAM方案生成三维角膜类器官模型，该模型能重现人类角膜的多层结构和细胞多样性 | 首次通过自发三维球体培养方法生成具有角膜上皮、基质和内皮分层结构的角膜类器官，单细胞RNA测序揭示18个不同细胞簇，包括三种角膜上皮亚群和两种基质亚群 | 仅约20%的类器官形成透明区域，未来需要提高类器官形成效率和功能成熟度 | 建立能重现人类角膜复杂细胞架构和多样性的三维角膜类器官模型，用于角膜发育、疾病建模和再生医学研究 | 人胚胎干细胞来源的角膜类器官 | 数字病理学 | 角膜疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色 | 三维角膜类器官模型 | 单细胞转录组数据, 免疫荧光图像 | 7-8周分化培养的类器官样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3端测序平台用于分析类器官细胞组成和基因表达模式 |
| 73 | 2026-05-30 |
Integrative Multi-Omics and Machine Learning Analysis Identifies Therapeutic Targets and Drug Repurposing Candidates for Alzheimer's Disease
2026-Apr-27, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14050998
PMID:42193325
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研究论文 | 通过整合多组学数据和机器学习方法，识别阿尔茨海默病的诊断生物标志物和治疗靶点，并筛选药物重利用候选分子 | 首次整合转录组学、单细胞RNA测序、孟德尔随机化和分子对接等多层分析方法，构建定量多组学收敛框架，系统识别免疫相关的治疗靶点及药物重利用候选物 | 所有预测均需在生化及细胞模型中进行实验验证后方可得出临床结论 | 开发整合多组学计算流程，识别阿尔茨海默病的诊断生物标志物并优先排序可药物干预的治疗靶点 | 阿尔茨海默病患者与健康对照的转录组数据、单细胞核RNA测序数据及FDA批准药物库 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 加权基因共表达网络分析、机器学习、单细胞RNA测序、孟德尔随机化、贝叶斯共定位、分子对接、分子动力学模拟 | LASSO, 随机森林, 支持向量机 | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 药物分子结构数据 | 1047个转录组样本（547例AD，500例对照）及48,481个单细胞核 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 74 | 2026-05-30 |
Mechanism of Xiao-ai-fei Honey Ointment, a Traditional Uyghur Multi-Ingredient Medicinal Preparation, Against Cervical Cancer Based on Network Pharmacology and In Vitro Evaluation of Anti-Cancer Activity
2026-Apr-27, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph19050686
PMID:42198359
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研究论文 | 通过网络药理学、单细胞RNA测序及体外实验，揭示了传统维吾尔药复方制剂消炎蜂蜜软膏（XAFHO）对抗宫颈癌的分子机制 | 首次结合网络药理学、单细胞RNA测序和体外实验，系统阐明了XAFHO通过多靶点、多细胞途径抗宫颈癌的作用机制，并鉴定出11个基因的预后模型 | 研究主要依赖数据库分析和体外实验，尚缺乏体内动物实验及临床样本验证 | 探究消炎蜂蜜软膏（XAFHO）抗宫颈癌的潜在分子机制 | 宫颈癌细胞系（HeLa和SiHa）、TCGA及GEO数据库中的宫颈癌转录组数据 | 计算机视觉 | 宫颈癌 | NA | LASSO回归、Cox回归 | 基因表达数据、单细胞RNA-seq数据 | TCGA数据库中的宫颈癌样本（未明确具体数量）及单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 75 | 2026-05-30 |
Age-associated B cells (ABCs) develop from a CNS-localized progenitor pool into a pro-inflammatory phenotype after stroke
2026-Apr-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.02.709112
PMID:41847014
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研究论文 | 该研究鉴定出年龄相关B细胞在卒中后从中枢神经系统局部前体细胞库分化为促炎表型 | 首次发现中枢神经系统内存在独特的B1b前体细胞库，并揭示其向年龄相关B细胞（ABC）转化的轨迹，同时证实小鼠与人类组织中的保守性 | 未明确阐述研究局限性 | 阐明中枢神经系统中B细胞亚群的特征及其在衰老和卒中后的变化 | 老年雄性和雌性小鼠（未损伤和卒中后）的脑部B细胞，以及老年人类脑供体的脑实质组织 | 数字病理学 | 缺血性卒中 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、B细胞受体测序 | NA | NA | 老年小鼠（未损伤和卒中后）及老年人类脑供体组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 76 | 2026-05-30 |
Computational Approaches to Cancer Cell Dormancy: From Detection to Dynamic Modelling
2026-Apr-24, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom16050633
PMID:42193984
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综述 | 综述计算方法在癌症细胞休眠研究中的应用，涵盖从检测到动态建模的各个环节 | 将癌症细胞休眠视为动态、多尺度的系统问题，而非静态细胞类型分类任务，并系统梳理了计算方法在推断休眠细胞身份、异质性、微环境调控、状态转换和再激活动力学方面的应用 | 操作定义碎片化、罕见状态检测困难、跨研究不兼容以及使用快照数据研究时间动态过程 | 探讨计算方法如何应用于癌症细胞休眠的检测、特征描述和动态建模，以推动该领域进展 | 癌症细胞休眠现象及其相关计算方法 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞转录组学、谱系追踪、空间分析、多组学整合分析 | NA | 单细胞数据、多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 77 | 2026-05-30 |
TAF1 Suppresses MHC-I Expression and Correlates with Poor Immunotherapy Response in Small Cell Lung Cancer
2026-Apr-23, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14050973
PMID:42193300
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研究论文 | 通过系统筛选表观遗传调控因子，发现TAF1通过抑制MHC-I表达导致小细胞肺癌免疫治疗效果差 | 首次系统筛选796个表观遗传调控因子，鉴定TAF1为小细胞肺癌免疫治疗抵抗的关键调控因子，揭示了TAF1通过抑制MHC-I表达降低CD8 T细胞浸润的新机制 | 未提及具体限制 | 探究小细胞肺癌对免疫治疗内在抵抗的表观遗传调控机制 | 小细胞肺癌患者肿瘤样本及相关细胞系 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序， 批量RNA测序， 蛋白质组学 | NA | 测序数据 | 20例小细胞肺癌肿瘤的scRNA-seq数据，IMpower133队列的bulk RNA-seq数据，TU-SCLC队列的蛋白质组数据，以及一个独立的39例小细胞肺癌肿瘤的scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序， 批量RNA测序， 蛋白质组学 | NA | NA |
| 78 | 2026-05-30 |
Glo1 promotes glioma progression by modulating Sox2 transcriptional networks in glioma stem-like cells
2026-Apr-20, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag090
PMID:42011505
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组分析发现Glo1在胶质瘤干细胞中富集，并揭示其通过调控Sox2转录网络促进胶质瘤进展的分子机制 | 首次鉴定Glo1作为胶质瘤干细胞的功能性标志物，并通过单细胞转录组学、体内外模型及药理学抑制系统验证其治疗靶点潜力 | 文章未明确说明实验样本量及临床队列验证的局限性 | 阐明Glo1在胶质瘤干细胞中的功能及其作为治疗靶点的可行性 | 胶质瘤干细胞、患者来源异种移植模型及宫内电转模型 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组学、功能基因组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类及小鼠胶质母细胞瘤模型样本（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 79 | 2026-05-30 |
Single-cell transcriptome profiling reveals the heterogeneity of ossification of the posterior longitudinal ligament (OPLL) and its immune microenvironment
2026-Apr-18, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-026-10193-0
PMID:42000969
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research paper | 通过单细胞转录组测序揭示后纵韧带骨化（OPLL）的细胞异质性及其免疫微环境 | 首次构建OPLL病变组织的单细胞转录组图谱，发现软骨细胞谱系向成骨转化的分化轨迹，并揭示SPP1-CD44信号通路在免疫-基质相互作用中的关键作用 | 样本量较小（4,683个细胞）且仅来自颈椎OPLL病变组织，缺乏正常对照和纵向数据验证 | 阐明后纵韧带骨化的细胞异质性、分化轨迹及免疫微环境特征 | 人颈椎后纵韧带骨化病变组织中的细胞 | 单细胞转录组学 | 后纵韧带骨化 | scRNA-seq | NA | 单细胞基因表达数据 | 4,683个细胞来自手术切除的人颈椎OPLL病变 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 80 | 2026-04-19 |
Single-Cell RNA Sequencing Identifies a Distinct Epithelial Subpopulation Driving Resistance to Neoadjuvant Chemoimmunotherapy in Esophageal Squamous Cell Carcinoma
2026-Apr-17, Biological procedures online
IF:3.7Q1
DOI:10.1186/s12575-026-00337-1
PMID:41998494
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |