单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 35858 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-02-03 |
BMP6 as a therapeutic target for preeclampsia: enhancing trophoblast invasion and vascular mimicry
2026-Jan-23, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-025-06040-w
PMID:41577865
|
研究论文 | 本研究探讨了BMP6通过ID1介导的SERPINE2和PlGF上调促进滋养层细胞侵袭和血管拟态，并发现早期补充BMP6可缓解大鼠子痫前期模型的相关表型 | 揭示了BMP6通过ID1-SERPINE2/PlGF轴调控滋养层细胞侵袭的新机制，并首次在体内模型中证明早期补充BMP6对子痫前期具有治疗潜力 | 研究主要基于体外细胞模型和啮齿动物模型，在人类妊娠早期的直接证据尚不充分 | 阐明BMP6在滋养层细胞侵袭和血管拟态中的调控机制，评估其作为子痫前期治疗靶点的潜力 | 人原代滋养层细胞、HTR8/SVneo细胞系、子痫前期患者胎盘组织、Ad Flt1诱导的子痫前期大鼠模型 | 生殖医学与发育生物学 | 子痫前期 | RNA-seq, scRNA-seq, 腺病毒载体技术 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、生理表型数据 | 未明确样本数量，包含人类胎盘组织和大鼠模型 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 62 | 2026-02-03 |
Decoding metabolic reprogramming heterogeneity across bladder cancer stages using single-cell and spatial multi-omics approaches
2026-Jan-21, Computer methods and programs in biomedicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.cmpb.2026.109261
PMID:41621229
|
研究论文 | 本研究利用单细胞和空间多组学方法解码膀胱癌不同阶段的代谢重编程异质性 | 首次结合单细胞测序、空间转录组和批量RNA测序数据，系统分析膀胱癌不同阶段代谢重编程异质性，并识别出核黄素代谢通路中的关键预后生物标志物 | 研究主要基于现有测序数据，实验验证部分相对有限，且样本量可能不足以覆盖所有膀胱癌亚型 | 分析膀胱癌不同阶段的代谢重编程及其对患者生存的影响 | 膀胱癌患者的上皮细胞及其亚群 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序, 空间转录组测序, 批量RNA测序, RT-qPCR, 孟德尔随机化, 共定位分析 | NA | 单细胞测序数据, 空间转录组数据, 批量RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 63 | 2026-02-03 |
Tumor-stroma contributes to immunotherapeutic resistance in non-small cell lung cancer via SEMA3C-mediated immunosuppressive tumor microenvironment
2026-Jan-19, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102679
PMID:41558146
|
研究论文 | 本研究探讨了肿瘤基质比例（TSP）在非小细胞肺癌（NSCLC）中作为免疫检查点阻断（ICB）耐药性独立预后生物标志物的作用，并揭示了SEMA3C通过促进免疫抑制性肿瘤微环境介导此过程的分子机制 | 首次将TSP与NSCLC的ICB耐药性联系起来，并鉴定出SEMA3C作为TSP轴中的关键介质，通过调节癌症相关成纤维细胞功能来重塑免疫抑制性肿瘤微环境 | 研究主要基于TCGA队列和体外实验，需要更多独立队列和体内模型验证TSP和SEMA3C的临床转化价值 | 阐明TSP影响NSCLC临床结局和ICB耐药性的分子机制 | 非小细胞肺癌患者样本、癌症相关成纤维细胞、肿瘤细胞、CD8⁺ T细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | H&E染色、转录组分析、单细胞RNA测序、功能验证实验 | NA | 图像数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 | TCGA-NSCLC队列患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 64 | 2026-02-03 |
Integrated multi-omics analysis of prognostic model and immune microenvironment in intrahepatic cholangiocarcinoma
2026-Jan-19, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102675
PMID:41558145
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA-seq和空间转录组学数据，构建了肝内胆管癌的五基因预后模型，并揭示了免疫抑制性肿瘤微环境中的关键作用机制 | 首次整合单细胞RNA-seq、空间转录组学和机器学习方法，系统解析肝内胆管癌的免疫微环境并构建五基因预后模型，同时通过功能实验验证了MT1X的促癌作用 | 研究样本量有限，需要更大规模的外部验证；空间转录组学数据分辨率可能不足；功能实验主要在细胞水平进行，缺乏动物模型验证 | 阐明肝内胆管癌的免疫微环境特征并构建精准预后模型，为免疫治疗提供新靶点 | 肝内胆管癌患者组织样本及肿瘤微环境中的细胞亚群 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 机器学习 | 机器学习模型 | 单细胞RNA-seq数据, 空间转录组数据, 批量RNA-seq数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 65 | 2026-02-03 |
Silencing CCL5 suppresses ferroptosis to alleviate calcific aortic valve disease through chemokine pathway inhibition
2026-Jan-16, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
|
研究论文 | 本研究探讨了CCL5通过激活趋化因子信号通路诱导铁死亡，从而促进钙化性主动脉瓣疾病进展的机制 | 首次揭示了CCL5在CAVD中通过趋化因子信号通路调控铁死亡的作用机制 | 研究主要基于细胞和动物模型，缺乏临床样本的直接验证 | 探究CCL5在钙化性主动脉瓣疾病进展中的调控功能及机制 | 人主动脉瓣间质细胞、Apoe-/-小鼠 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、生物信息学分析、酶联免疫吸附测定、Western blot | NA | RNA测序数据、病理染色图像、蛋白质印迹数据 | 未明确样本数量，涉及人主动脉瓣间质细胞和Apoe-/-小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 66 | 2026-02-03 |
Soluble guanylate cyclase deficiency drives retinal ganglion cell neurodegeneration with age in female mice through disrupted oxidative metabolism
2026-Jan-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-34243-5
PMID:41513693
|
研究论文 | 本研究探讨了可溶性鸟苷酸环化酶（sGC）缺陷如何通过破坏氧化代谢导致雌性小鼠视网膜神经节细胞随年龄增长而退化 | 揭示了cGMP信号在维持视网膜代谢完整性和视网膜神经节细胞功能中的性别特异性作用，并首次将sGC-cGMP信号通路与雌性年龄相关视网膜神经退行性变联系起来 | 研究仅基于小鼠模型，未在人类样本中验证，且机制细节仍需进一步探索 | 探究sGC在年龄和性别依赖性视网膜神经节细胞功能中的作用及其与神经退行性疾病的关联 | 缺乏sGCα1催化亚基的雌性和雄性小鼠的视网膜神经节细胞 | 神经科学 | 青光眼 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, Western blotting, 线粒体超微结构分析, 视觉敏锐度测量, 视网膜氧化代谢体内测量 | NA | RNA测序数据, 蛋白质印迹数据, 超微结构图像, 生理测量数据 | 雌性和雄性sGCα1缺陷小鼠 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 67 | 2026-02-03 |
scXDR: drug response prediction across single-cell datasets via heterogeneous network transfer learning
2026-Jan-08, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09418-5
PMID:41507436
|
研究论文 | 本研究提出了一种名为scXDR的异质网络迁移学习模型，用于跨单细胞数据集的药物反应预测 | 通过异质网络整合药物、基因和细胞间的特征与关联，进行消息传递、特征与结构对齐、结构重建和药物-细胞评分预测，避免了传统方法依赖批量RNA测序与单细胞RNA测序数据整合的局限性 | 未明确提及模型在处理大规模数据集时的计算效率或对罕见细胞类型的预测能力 | 提高单细胞水平药物反应预测的准确性，为药物开发和精准治疗提供指导 | 药物、基因、细胞（包括个体细胞和细胞群） | 机器学习 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 异质网络迁移学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 68 | 2026-02-03 |
Evaluating genetic ancestry inference from single-cell transcriptomic datasets
2026-Jan-08, HGG advances
DOI:10.1016/j.xhgg.2026.100564
PMID:41508611
|
研究论文 | 本文提出一个评估从单细胞转录组数据推断遗传祖先方法的框架，并应用于人类细胞图谱数据集 | 首次系统评估单细胞转录组数据中遗传祖先推断方法的准确性，并揭示了现有数据集中祖先代表性不平衡的问题 | 仅评估了10个数据集中的401名供体，样本多样性可能有限；未考虑不同测序深度对变异检测的影响 | 评估单细胞转录组数据中遗传祖先推断方法的准确性，促进遗传多样性在单细胞研究中的代表性 | 单细胞转录组数据集中的遗传多态性 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | ADMIXTURE等群体遗传学工具 | 单细胞转录组测序数据 | 来自10个人类细胞图谱数据集的401名供体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 69 | 2026-02-03 |
PAX6 Deficiency Compromises the Ability of Limbal Epithelial Stem Cells to Properly Differentiate Into Mature Corneal Epithelial Cells
2026-Jan-05, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.1.56
PMID:41590604
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了PAX6缺陷小鼠角膜/缘组织的转录组变化，揭示了PAX6缺乏导致缘上皮干细胞功能异常和角膜上皮细胞分化缺陷的分子机制 | 首次在单细胞分辨率下应用scRNA-seq技术，系统性地揭示了PAX6缺乏如何影响缘上皮干细胞向成熟角膜上皮细胞的分化过程，并识别了特定的细胞簇变化 | 研究仅基于小鼠模型，未涉及人类患者样本，且样本量相对较小，可能限制了结果的普适性 | 探究PAX6缺乏在无虹膜相关角膜病变（AAK）中导致缘上皮干细胞功能异常的分子机制 | 野生型和PAX6杂合（Pax6 het）小鼠的角膜/缘组织 | 单细胞转录组学 | 无虹膜相关角膜病变 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），免疫染色 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 野生型和PAX6杂合小鼠的角膜/缘组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 70 | 2026-01-04 |
Exploring molecular mechanisms of radioactive iodine therapy in thyroid cancer using single-cell RNA sequencing data
2026-Jan-03, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04317-x
PMID:41483448
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 71 | 2026-02-03 |
Type I interferon drives dysfunction of a distinct CD8+ HLA-DRB1+ T cell subset in systemic lupus erythematosus
2026-Jan-03, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.01.02.26343348
PMID:41607660
|
研究论文 | 本研究全面表征了系统性红斑狼疮中一个独特的CD8+ HLA-DRB1+ T细胞亚群，揭示了I型干扰素如何驱动其功能失调状态 | 首次全面表征了SLE中一个独特的CD8+ HLA-DRB1+ T细胞亚群，揭示了I型干扰素通过促进耗竭和损害脱颗粒来驱动其功能失调的机制 | 研究主要基于外周血样本，对肾脏浸润细胞的验证依赖于现有数据集分析 | 旨在全面表征系统性红斑狼疮中CD8+ HLA-DRB1+ T细胞的功能和分子特征 | 系统性红斑狼疮患者和健康对照者的外周血CD8+ T细胞 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、TCR测序 | NA | 单细胞转录组数据、TCR序列数据、流式细胞数据 | SLE患者和健康对照者的外周血CD8+ T细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 72 | 2026-02-03 |
Macrophage AMPK activated by oxidative stress drives profibrotic crosstalk with tubular cells to accelerate renal fibrosis after ischemic and reperfusion injury
2026-Jan-03, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2025.104002
PMID:41621245
|
研究论文 | 本研究揭示了巨噬细胞AMPK在缺血再灌注损伤后肾脏纤维化中的关键作用，通过氧化应激激活驱动促纤维化的巨噬细胞-肾小管细胞互作 | 首次发现巨噬细胞AMPK作为氧化应激传感器，通过TWEAK-Fn14信号轴促进PDGFB+ VCAM1+肾小管细胞亚群的促纤维化表型，从而加速AKI向CKD的转变 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证；AMPK激活的具体上游机制尚未完全阐明 | 探究氧化应激在缺血再灌注损伤诱导的急性肾损伤向慢性肾病转变过程中的分子机制 | 巨噬细胞和肾小管上皮细胞 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Lyz2-Cre; Prkaa1-fl/fl条件敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 73 | 2026-02-03 |
Potential Key Genes for Giant Cell Arteritis Revealed Based on Single-Cell Sequencing and Mendelian Randomization Analysis
2026, International archives of allergy and immunology
IF:2.5Q3
DOI:10.1159/000546323
PMID:40349694
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序、表达数量性状位点和全基因组关联研究数据，采用双样本孟德尔随机化方法，识别了与巨细胞动脉炎风险降低相关的三个关键基因RCAN3、RPS6和HLA-DQB1 | 首次结合单细胞RNA测序数据和孟德尔随机化分析来探索巨细胞动脉炎的致病基因，并通过共定位分析验证了基因与疾病之间的因果关系 | 未在文中明确说明样本量或数据来源的具体限制，且研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证 | 识别与巨细胞动脉炎相关的关键基因并探索其潜在致病机制 | CD4+ T细胞中的标志基因与巨细胞动脉炎之间的因果关系 | 生物信息学 | 巨细胞动脉炎 | 单细胞RNA测序, 表达数量性状位点分析, 全基因组关联研究, 孟德尔随机化, 共定位分析 | 孟德尔随机化模型 | 基因表达数据, 遗传变异数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 74 | 2026-02-03 |
Tissue-resident macrophage and dendritic cells drive type I IFN immunity to enteroviruses in the liver
2026-Jan, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013891
PMID:41592119
|
研究论文 | 本研究通过结合表达人FcRn的小鼠模型和单细胞RNA测序，揭示了肝脏中库普弗细胞和树突状细胞亚群是驱动早期I型干扰素应答以抵抗艾柯病毒感染的关键先天免疫细胞 | 首次明确了在艾柯病毒肝脏感染中，库普弗细胞和特定树突状细胞亚群是启动早期I型干扰素应答的主要细胞来源，并证明肝细胞的保护依赖于这些免疫细胞产生的干扰素信号 | 研究主要基于小鼠模型，其免疫反应与人类可能存在差异；未详细探讨III型干扰素在保护中的具体作用机制 | 阐明在艾柯病毒肝脏感染中，负责启动抗病毒I型干扰素应答的特定先天免疫细胞类型及其保护机制 | 表达人FcRn的转基因小鼠、Ifnar1/Ifnlr1基因敲除小鼠、肝细胞条件性Ifnar1敲除小鼠及肝脏中的各类细胞（肝细胞、库普弗细胞、树突状细胞等） | 免疫学 | 病毒感染（艾柯病毒） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、条件性基因敲除小鼠模型、体内感染模型 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及多种基因工程小鼠品系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 75 | 2026-02-03 |
Disturbed flow induces reprogramming of endothelial cells to immune-like and foam cells under hypercholesterolaemia during atherogenesis
2025-Dec-31, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf233
PMID:41288601
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和谱系示踪技术，验证了在动脉粥样硬化形成过程中，紊乱血流与高胆固醇血症共同诱导内皮细胞发生免疫样和泡沫样细胞重编程的“双重打击”假说 | 提出了内皮细胞在紊乱血流和高胆固醇血症共同作用下，可重编程为免疫样细胞（EndIT）和泡沫样细胞（EndFT）的新概念，并通过遗传谱系示踪模型进行了验证 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，虽然分析了人类斑块数据，但仍需更多人类在体研究进一步验证 | 探究紊乱血流与高胆固醇血症在动脉粥样硬化发生中的协同作用机制，特别是对内皮细胞重编程的影响 | 小鼠颈动脉内皮细胞、人类主动脉内皮细胞（HAECs）以及动脉粥样硬化斑块 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），免疫组织化学染色，谱系示踪 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 来自95只小鼠的98,553个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 76 | 2026-02-03 |
Pan cohort immune biomarker of CD8 lymphocyte activation enabling HGSOC outcome prediction and treatment response
2025-Dec-31, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04363-5
PMID:41474480
|
研究论文 | 本研究开发了一个基于CD8+ T细胞活化的10基因免疫预后标志物（CIPS），用于预测晚期高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）患者的生存和治疗反应 | 首次整合多队列转录组数据和机器学习方法，构建了一个跨队列验证的CD8+ T细胞相关免疫预后标志物，并在单细胞水平上解析了其细胞来源和功能 | 研究主要基于回顾性队列数据，需要前瞻性临床试验进一步验证CIPS的临床实用性 | 开发一个稳健的免疫生物标志物，以改善晚期高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）的预后预测和治疗指导 | 晚期高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）患者 | 机器学习 | 卵巢癌 | 单样本基因集富集分析（ssGSEA）、加权基因共表达网络分析（WGCNA）、单细胞RNA-seq分析 | 机器学习集成方法 | 转录组数据、临床数据 | 874名晚期HGSOC患者（来自多个独立队列） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 77 | 2026-02-03 |
Single-cell analysis of B cell dysregulation in pediatric sepsis stratified by disease severity
2025-Dec-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-34126-9
PMID:41476192
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析了儿童脓毒症患者外周血白细胞，揭示了B细胞在疾病严重程度分层中的关键作用及其耗竭机制 | 首次在儿童脓毒症中应用单细胞RNA测序技术，识别并验证了自然杀伤样B细胞（NKB）等B细胞亚群的耗竭和转录重编程，拓宽了人类脓毒症中B细胞表型的认知 | 样本量较小（仅6名脓毒症患者和4名健康对照），且研究集中在儿科群体，可能限制结果的普遍性 | 探究儿童脓毒症中B细胞耗竭的机制及其与疾病严重程度的关系 | 儿童脓毒症患者（包括轻度和重度）及健康对照的外周血白细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 6名儿童脓毒症患者（3名轻度，3名重度）和4名健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 78 | 2026-02-03 |
Single-cell transcriptomics and spatial validation reveal dysfunction of keratinocytes and NK cells driving acne development
2025-Dec-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-34373-w
PMID:41476262
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和空间免疫荧光技术，揭示了健康皮肤、轻度痤疮和重度痤疮中角质形成细胞与自然杀伤（NK）细胞的功能失调是驱动痤疮发展的关键机制 | 提出了“双重免疫-屏障失衡”的创新病理模型，首次系统阐述了角质形成细胞从防御到异常分化、以及NK细胞从激活到耗竭的时序性功能转变在痤疮进展中的核心作用 | 未明确说明样本的具体数量与人口统计学特征，且空间验证主要依赖免疫荧光技术，可能缺乏更高通量的空间多组学数据支撑 | 阐明痤疮发生发展的细胞与分子机制，为早期诊断和精准干预提供理论基础 | 健康皮肤、轻度痤疮和重度痤疮患者的皮肤组织 | 数字病理学 | 皮肤疾病（痤疮） | 单细胞RNA测序，空间免疫荧光 | 伪时间分析，功能富集分析 | 单细胞转录组数据，空间成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 79 | 2026-02-03 |
VAMP5 promotes glioma progression through bioinformatics analysis clinical correlation and functional validation
2025-Dec-30, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04375-1
PMID:41467924
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析、临床关联和功能验证，揭示了VAMP5在胶质瘤进展中的促进作用 | 首次系统性地整合多组学数据（TCGA、GEO、单细胞RNA测序）并结合体外体内实验，全面阐明了VAMP5在胶质瘤中的表达模式、临床意义、功能角色及免疫调节机制，提出其作为新型预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | 研究主要基于公共数据库和细胞系/动物模型，缺乏大规模前瞻性临床队列验证；VAMP5的具体下游信号通路和与免疫微环境相互作用的分子细节仍需进一步探索 | 探究VAMP5在胶质瘤中的表达模式、临床意义及功能作用，以寻找新的诊断、预后和治疗靶点 | 胶质瘤组织、正常脑组织、胶质母细胞瘤（GBM）细胞系、动物模型 | 生物信息学与肿瘤生物学 | 胶质瘤 | 生物信息学分析、实时定量PCR、免疫组织化学、Western blot、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析、通路富集分析、免疫浸润分析、体外功能实验、体内实验 | NA | 基因表达数据、临床病理数据、单细胞测序数据、蛋白质相互作用数据、实验数据 | 来自TCGA和GEO数据库的多个数据集及临床样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 80 | 2026-02-03 |
Integrating multi-omics data and machine learning to identify endocrine disrupting chemicals targeting key ccRCC-related genes
2025-Dec-30, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04138-y
PMID:41467947
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据并应用机器学习方法，识别了与透明细胞肾细胞癌（ccRCC）相关的内分泌干扰化学物及其靶基因 | 首次整合多组学数据与机器学习算法（评估了101种算法）来系统识别ccRCC相关的内分泌干扰化学物及其作用基因，并揭示了这些基因与肿瘤微环境及细胞间通讯的相互作用 | 研究主要基于计算分析和现有数据集，缺乏实验验证；所识别的EDCs与基因的因果关系仍需进一步功能研究证实 | 识别与透明细胞肾细胞癌发病机制相关的内分泌干扰化学物及其靶基因，探索环境因素与遗传易感性的相互作用 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）相关的多组学数据、内分泌干扰化学物、预后相关基因 | 机器学习 | 肾癌 | 多组学数据整合、机器学习算法评估、单细胞RNA测序、bulk RNA测序 | 多种机器学习算法（共评估101种） | 多组学数据（包括RNA测序数据） | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |