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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
61 2026-07-15
Beneficial effects of the AT2 receptor agonist buloxibutid (C21) against acute alveolar epithelial cell inflammation during antiviral responses
2026-Jul, ERJ open research IF:4.3Q1
研究论文 研究AT2受体激动剂buloxibutid在抗病毒反应中对急性肺泡上皮细胞炎症的有益作用 首次在人类肺泡II型细胞中研究AT2受体表达及C21在病毒感染模型中的作用 仅使用了体外模型,缺乏体内实验验证 探究AT2受体激动剂buloxibutid在抗病毒反应中调节肺泡上皮细胞炎症的潜力 人类肺泡II型(ATII)细胞 计算病理学 呼吸系统病毒性肺炎 单细胞RNA测序、RNA测序 NA 基因表达数据、转录组数据 公开的单细胞RNA测序数据集,具体样本数未提及 Illumina 单细胞RNA测序 Illumina NovaSeq 公开的单细胞RNA测序数据集(具体细节未提供)
62 2026-07-15
HNF1B-related disease: developmental origins, molecular mechanisms, and multisystem clinical challenges
2026-Jul, Clinical kidney journal IF:3.9Q1
综述 综述了HNF1B相关疾病的发育起源、分子机制及多系统临床挑战 利用患者来源的iPSC模型和单细胞转录组学揭示早期发育通路和转录网络,以及通过器官样研究推动潜在治疗发现 当前治疗仍以支持性为主,且由于可变表达和与更常见疾病的表型重叠导致漏诊普遍 整合基因组学、发育生物学和靶向监测以改善HNF1B相关疾病的早期诊断和患者预后 HNF1B基因突变或缺失导致的MODY5患者及其多系统表现 机器学习 糖尿病 下一代测序, 拷贝数变异分析, 单细胞转录组学 NA 文本 NA Illumina 单细胞RNA测序 NA NA
63 2026-07-15
Precision omic portrait deciphers the epigenetic variable during cellular identity reshaping of metastatic head and neck squamous cell carcinoma
2026-Jun-30, Science bulletin IF:18.8Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序数据描绘头颈部鳞状细胞癌转移过程中的表观遗传动态变化,发现WDR54作为细胞身份重塑的关键启动因子 首次揭示WDR54通过选择性H3K4me3和H4K16ac修饰启动TGF-β驱动的部分上皮-间质转化程序,从而增强细胞侵袭、迁移及免疫逃逸 未提及 阐明头颈部鳞状细胞癌转移过程中细胞身份可塑性的表观遗传调控机制 头颈部鳞状细胞癌的原发灶、淋巴转移灶和远处转移灶样本 机器学习 头颈部鳞状细胞癌 单细胞RNA测序、CUT&Tag谱分析 NA 单细胞转录组数据 12个原发灶、12个淋巴转移灶和12个远处转移灶共36个样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
64 2026-07-15
C1ORF112 drives lung adenocarcinoma progression through e2f8-mediated transcriptional activation
2026-Jun-30, Journal of thoracic disease IF:2.1Q3
研究论文 本研究通过整合生物信息学与实验方法,系统揭示了C1ORF112在肺腺癌中通过E2F8介导的转录激活驱动肿瘤进展的机制 首次阐明C1ORF112在肺腺癌中的致癌功能及其由E2F8转录调控的分子机制,并利用单细胞RNA测序揭示其在肿瘤微环境中的细胞通讯模式 缺乏前瞻性临床验证和药物敏感性研究 系统研究C1ORF112在肺腺癌中的临床相关性、功能影响及转录调控机制 肺腺癌细胞及肿瘤组织 机器学习 肺癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据, 单细胞转录组数据 TCGA和GEO数据集中的肺腺癌样本 Illumina bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq Illumina NovaSeq TCGA和GEO数据库中的RNA测序数据,包括单细胞RNA测序
65 2026-07-15
Identification of exhausted CD8+ T-cell signatures for prognosis in multiple myeloma by integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing
2026-Jun-30, Translational cancer research IF:1.5Q4
研究论文 通过整合单细胞和批量RNA测序数据,识别多发性骨髓瘤中耗竭CD8+ T细胞相关特征并建立预后模型 首次通过整合单细胞和批量RNA测序构建基于耗竭CD8+ T细胞基因的预后风险评分模型,并验证JUND和NFKBIA作为预后基因与免疫治疗反应的关联 研究依赖于公开数据集,样本量有限;模型预测能力需在更大临床队列中验证 探索多发性骨髓瘤中耗竭CD8+ T细胞相关特征及其预后机制 多发性骨髓瘤患者中的CD8+ T细胞及其耗竭相关基因 机器学习 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序、批量RNA测序 Cox比例风险模型、机器学习算法(如随机森林、支持向量机) 基因表达数据 NA(未明确具体样本数,仅提及下载公开数据集) NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
66 2026-07-15
Single-cell mitophagy patterns dictate intercellular crosstalk in the tumor microenvironment to promote osteosarcoma progression
2026-Jun-30, Translational cancer research IF:1.5Q4
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术系统分析了骨肉瘤肿瘤微环境中的线粒体自噬模式,揭示其通过影响细胞间通讯促进肿瘤进展的机制 首次在单细胞分辨率下系统刻画骨肉瘤肿瘤微环境中线粒体自噬的异质性模式,并阐明其对细胞间通讯和免疫抑制的调控作用 NA 系统表征骨肉瘤肿瘤微环境中的线粒体自噬模式,并探究其对细胞间通讯、肿瘤进展和患者预后的影响 骨肉瘤肿瘤微环境中的多种细胞类型,包括癌症相关成纤维细胞、巨噬细胞、CD8+ T细胞和内皮细胞 单细胞基因组学 骨肉瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
67 2026-07-15
A stromal-derived five-gene signature predicts gastric cancer recurrence through integrated bioinformatics and single-cell analysis
2026-Jun-30, Translational cancer research IF:1.5Q4
研究论文 通过整合生物信息学和单细胞分析,开发了一种基质来源的五基因特征,用于预测胃癌复发 首次利用集成批量转录组、机器学习和单细胞分析方法,开发并验证了基质来源的基因特征,该特征独立于肿瘤突变负荷,强调了基质-肿瘤相互作用在预后评估中的重要性 需要实验验证以确立因果关系,且泛癌分析显示该特征仅对四种癌症类型具有组织特异性预后价值,适用性有限 开发和验证一种基质来源的基因特征,用于预测胃癌复发,并表征其肿瘤微环境和细胞类型特异性 胃癌患者和泛癌队列,包括GSE62254数据集中的279名胃癌患者、TCGA-STAD中的419名患者,以及33种癌症类型的9,328名患者 生物信息学、机器学习 胃癌 批量RNA测序、单细胞RNA测序、加权基因共表达网络分析、机器学习算法 机器学习算法(具体未指定,但使用了六种) 表达数据、单细胞RNA测序数据 训练组196名患者,验证组83名患者,外部验证419名患者,泛癌分析9,328名患者 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
68 2026-07-15
SDF4: a novel prognostic biomarker and therapeutic target in hepatocellular carcinoma revealed by integrated multi‑omics analysis
2026-Jun-30, Translational cancer research IF:1.5Q4
研究论文 通过整合多组学分析揭示SDF4在肝细胞癌中的预后生物标志物和治疗靶点作用 首次系统评估SDF4在肝细胞癌中的表达和预后价值,结合单细胞RNA测序、空间转录组学和分子对接等多种技术探究其机制 研究基于公共数据库和体外实验,缺乏体内实验验证和前瞻性临床研究 阐明SDF4在肝细胞癌中的表达和预后意义,探索其对肿瘤微环境的影响及与药物敏感性的关系 肝细胞癌组织和细胞 机器学习和数字病理学 肝癌 单细胞RNA测序、空间转录组学、免疫组化、分子对接 列线图、细胞轨迹分析、CellChat分析 基因表达数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 包含多个公共数据库的肝细胞癌样本和空间转录组样本 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
69 2026-07-15
Development and validation of a DYX1C1- and GNAI1-based nomogram for predicting relapse in HER2-positive breast cancer treated with trastuzumab
2026-Jun-30, Translational cancer research IF:1.5Q4
研究论文 开发并验证基于DYX1C1和GNAI1的列线图,用于预测接受曲妥珠单抗治疗的HER2阳性乳腺癌患者的复发风险 首次构建基于DYX1C1和GNAI1两个基因的列线图预测模型,并揭示其通过免疫抑制微环境和基质激活促进耐药的机制 单中心回顾性设计、样本量较小(12例免疫组化验证)、未前瞻性验证模型临床实用性 开发可预测曲妥珠单抗治疗后复发的多变量模型并探索生物机制 HER2阳性乳腺癌患者(训练队列n=51,内部验证n=94,外部验证n=127) 机器学习 乳腺癌 WGCNA, scRNA-seq, 免疫组化 列线图(Cox回归) 基因表达数据 272例患者(训练51例、内部验证94例、外部验证127例)及12例免疫组化样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
70 2026-07-15
Construction of a ferroptosis-related prognostic signature and identification of SRSF9 as a key biomarker in lung adenocarcinoma
2026-Jun-30, Translational cancer research IF:1.5Q4
研究论文 通过整合单细胞和批量转录组数据构建铁死亡相关预后模型,并鉴定SRSF9为肺腺癌的关键生物标志物 首次将单细胞RNA测序数据与批量转录组数据结合,构建铁死亡相关基因的预后模型,并实验验证SRSF9在肺腺癌铁死亡中的作用 基于公共数据集构建和验证模型,需要进一步在更大规模的独立队列中验证;SRSF9诱导铁死亡的分子机制尚需深入研究 构建并验证肺腺癌的铁死亡相关预后模型,并鉴定关键生物标志物SRSF9 肺腺癌患者样本及细胞系 机器学习 肺癌 单细胞RNA测序、批量RNA测序 LASSO-Cox回归模型 转录组数据 TCGA-LUAD队列、GSE72094和GSE68465验证队列,以及GSE127465单细胞数据集 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
71 2026-07-15
Prognostic and therapeutic implications of PSMD14 in hepatocellular carcinoma: an integrative analysis of transcriptomic and single-cell profiles
2026-Jun-30, Translational cancer research IF:1.5Q4
研究论文 通过整合转录组和单细胞数据,分析PSMD14在肝细胞癌中的预后和治疗意义 首次系统分析JAMM家族基因在肝细胞癌中的表达和功能,并聚焦于PSMD14作为潜在生物标志物和治疗靶点 需要进一步探索PSMD14的分子机制和治疗应用 研究PSMD14在肝细胞癌中的预后和治疗潜力 肝细胞癌患者样本 数字病理学 肝癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 免疫组化 LASSO-Cox回归分析 转录组数据, 单细胞转录组数据, 临床样本 55份临床样本 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
72 2026-07-15
A senescence-based machine learning model prognosticates and personalizes therapy in cervical cancer
2026-Jun-30, Translational cancer research IF:1.5Q4
研究论文 该研究通过整合单细胞RNA测序、批量转录组学和多组学分析,描绘了宫颈癌中衰老微环境的景观,并构建了基于衰老的机器学习模型用于预后分层和个性化治疗 首次在宫颈癌中系统刻画了细胞衰老在肿瘤微环境中的作用,并基于17个衰老相关基因构建了结合随机生存森林和梯度提升机的机器学习模型,实现了有效的预后预测和个性化治疗推荐 未提及具体局限性 探究宫颈癌肿瘤微环境中细胞衰老的角色及其临床意义,开发预后预测模型和个性化治疗策略 宫颈癌患者样本(TCGA-CESC和GSE44001队列)以及SiHa和HeLa细胞系 机器学习 宫颈癌 单细胞RNA测序,批量转录组学,多组学分析,转录组RNA-seq 随机生存森林,梯度提升机 单细胞RNA测序数据,批量转录组数据,多组学数据 TCGA-CESC和GSE44001队列 NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
73 2026-07-15
Potential role of PPARGC1A in linking ulcerative colitis to colorectal cancer: a novel prognostic biomarker and therapeutic target
2026-Jun-30, Translational cancer research IF:1.5Q4
研究论文 通过多组学整合分析揭示PPARGC1A在溃疡性结肠炎向结直肠癌转化中的潜在作用,作为早期预警和个性化管理的生物标志物和治疗靶点 首次通过多组学整合和单细胞RNA测序验证PPARGC1A在溃疡性结肠炎相关结直肠癌恶性转化过程中持续低表达,作为早期打击因子,并关联免疫抑制微环境和药物敏感性 未提供具体局限性信息 识别溃疡性结肠炎向结直肠癌转化的潜在生物标志物和分子机制 溃疡性结肠炎和结直肠癌患者 机器学习 结直肠癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 模拟基因敲除分析 NA 表达数据, 药物敏感性数据 基于多个数据库的多组学数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
74 2026-07-15
Reanalysis of Public Transcriptomes Reveals Shared Immune Signatures Between Major Depressive Disorder And Dermatomyositis With Single-Cell Context
2026-Jun-26, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 通过整合生物信息学重分析公共单细胞转录组数据,识别重度抑郁症与皮肌炎之间共享的免疫信号特征 首次通过单细胞RNA-seq背景化分析,系统鉴定重度抑郁症与皮肌炎之间共享的转录组免疫信号,并利用机器学习模型筛选诊断特征基因 结果基于公共数据集,需在实际共病队列中进一步验证,且MIF-(CD74+CD44)轴和初始/中央记忆T细胞信号的功能仍需后续研究确认 识别重度抑郁症与皮肌炎之间共享的候选转录组免疫信号,并揭示其免疫相关细胞背景 公共GEO数据集中的皮肌炎和重度抑郁症转录组数据 机器学习 重度抑郁症,皮肌炎 RNA-seq,单细胞RNA-seq WGCNA,机器学习模型(113个),SHAP 基因表达数据,单细胞转录组数据 公共GEO数据集中的皮肌炎相关样本(具体数量未说明) NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
75 2026-07-15
Single-cell and spatial transcriptomic colocalization analysis reveals the roles of histone deacetylation in lung adenocarcinoma progression and microenvironment
2026-Jun-23, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine IF:6.4Q1
研究论文 通过单细胞和空间转录组共定位分析揭示了组蛋白去乙酰化在肺腺癌进展和微环境中的作用 首次整合单细胞RNA测序与空间转录组学并结合分子生物学实验,揭示了FOXA1-HDAC2轴在肺腺癌中的新型调控通路,并建立了7基因预后模型 未明确提及相关局限性 研究组蛋白去乙酰化酶相关基因在肺腺癌中的空间分布及调控网络 肺腺癌患者样本及细胞系 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 分子生物学实验 NA 基因表达数据 使用GSE131907、GSE189487和TCGA-LUAD数据集 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
76 2026-07-15
Neuronal subtype-specific ribosomal protein mRNA expression
2026-06-16, RNA (New York, N.Y.)
研究论文 利用单细胞转录组学分析小鼠大脑皮层和海马体中不同神经元亚型的核糖体蛋白 mRNA 表达 首次全面描绘神经元亚类层面的核糖体蛋白基因表达图谱,揭示兴奋性和抑制性神经元之间以及不同亚类间的表达差异,并提出核糖体蛋白可能具有未被充分认识的调控层 表达模式在衰老和应激数据集中稳定,但表型相关变化有限 探究核糖体蛋白基因在神经元亚型中的表达组织方式 小鼠大脑皮层和海马体中的兴奋性及抑制性神经元亚类 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 (Smart-seq2 和 10x Genomics) NA 单细胞转录组数据 小鼠大脑皮层和海马体的单细胞RNA-seq数据集 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium, Smart-seq2 Smart-seq2和10x Genomics单细胞RNA测序技术
77 2026-07-15
Beyond polarization: single-cell atlas unveils macrophage heterogeneity and neuro-immune crosstalk in bone regeneration
2026-Jun-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析揭示骨再生过程中巨噬细胞的异质性及其与神经系统的交互作用 超越了传统的巨噬细胞极化概念,首次系统揭示了骨再生微环境中巨噬细胞的八个异质性亚群,并发现了神经信号通过G蛋白偶联受体基因调控巨噬细胞功能的机制 未明确说明研究限制 全面解析骨再生过程中巨噬细胞的异质性及其在神经-免疫互作中的角色 骨缺损区域的巨噬细胞 数字病理学 骨再生 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA 基因表达数据 8148个细胞 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
78 2026-07-15
NINJ1-mediated macrophage ferroptosis impairs diabetic wound healing attenuated by Ruan Jian Qing Mai formula
2026-Jun, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1
研究论文 本研究揭示NINJ1介导的巨噬细胞铁死亡损害糖尿病伤口愈合,并验证软坚清脉方的保护作用 首次发现NINJ1-STAT3-铁死亡通路在糖尿病伤口巨噬细胞中的正反馈环路,并证实软坚清脉方通过打断此环路促进愈合 未提及具体局限性,但可推断动物模型与人体临床存在差异,且单细胞测序样本量可能有限 探究巨噬细胞铁死亡在糖尿病足溃疡发病中的作用,并评估软坚清脉方的治疗效果及机制 巨噬细胞、内皮细胞、糖尿病小鼠伤口组织、人伤口组织 数字病理学 糖尿病足溃疡 单细胞RNA测序、HPLC-MS、Western blot、qPCR、流式细胞术 NA 单细胞转录组数据、图像数据 人伤口组织(具体数量未提及)、链脲佐菌素诱导糖尿病小鼠 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'试剂盒用于人伤口组织单细胞测序
79 2026-07-15
Sirt1 deficiency promotes dynamic fibroblast-to-myofibroblast transition in ligamentum flavum hypertrophy via the Smad2/3 pathway
2026-Jun-01, Experimental cell research IF:3.3Q2
研究论文 本研究探讨Sirt1缺乏通过Smad2/3通路促进黄韧带肥大中成纤维细胞向肌成纤维细胞转化的机制 首次揭示Sirt1在调控黄韧带肥大中成纤维细胞转化中的作用及其分子机制 主要基于动物模型和体外实验,临床验证尚不充分 探究Sirt1在黄韧带肥大病理进程中的调控作用及潜在治疗靶点 人黄韧带组织、大鼠黄韧带肥大模型及体外培养的黄韧带细胞 机器学习 腰椎管狭窄 单细胞RNA测序、组织学分析、免疫组化、分子分析、转录组分析 NA 基因表达数据、组织图像 人黄韧带样本及大鼠模型,具体数量未在摘要中提及 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 单细胞RNA测序用于探索黄韧带细胞异质性
80 2026-07-15
Integrated single‑cell and spatial transcriptomics reveal the colorectal cancer microenvironment
2026-Jun, Critical reviews in oncology/hematology
综述 综述整合单细胞测序和空间转录组学在结直肠癌微环境研究中的应用进展 整合单细胞与空间转录组学揭示了结直肠癌微环境中空间组织的肿瘤-基质-免疫网络,包括免疫排斥区、免疫活性微环境和三级淋巴结构相关域,并发现驱动肝转移的上皮细胞标志物和免疫抑制性转移微环境 综述未具体说明自身研究的局限性,但隐含了整合技术在实际应用中可能面临的挑战,如数据整合的复杂性、样本来源和患者异质性等 总结基于单细胞测序和空间转录组学整合技术在结直肠癌研究中的最新进展,探讨其应用前景和挑战,为精准诊断和治疗提供理论框架 结直肠癌肿瘤微环境中的细胞类型,包括肿瘤细胞、基质细胞(如癌症相关成纤维细胞)和免疫细胞(如T细胞、巨噬细胞) 数字病理学 结直肠癌 单细胞测序和空间转录组学 NA 基因表达数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序和空间转录组学 10x Chromium 10x Chromium单细胞和空间转录组平台
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