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当前共找到 43837 篇文献,本页显示第 61 - 80 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
61 2026-09-29
Integrating Next-Generation Reproductive Organoids with Genomics, Multi-Omics and Bioengineering to Understand Human Infertility
2026-Sep-08, Genes IF:2.8Q2
综述 本文综述了生殖类器官模型的研究现状,重点分析了其在生成、表征和应用方面的原创研究,并探讨了结合基因组学、多组学和生物工程技术理解人类不孕不育的潜力 系统整合了下一代生殖类器官与基因组学、多组学及生物工程技术的交叉应用,提出了将生殖类器官作为连接基因组变异与分子调控、细胞表型及组织结构的临床前平台的理念 当前生殖类器官仍是天然组织的简化代表,在生理成熟度、可重复性和标准化方面存在局限,其临床预测价值尚待建立 综述生殖类器官模型在理解人类不孕不育中的应用,探讨其作为功能基因组学、疾病建模、生物标志物发现和治疗筛选平台的前景 卵巢、输卵管、子宫内膜、睾丸和早期胚胎的生殖类器官 数字病理学 不孕不育 单细胞转录组学, 空间转录组学, 多组学, CRISPR/Cas9基因组编辑, 人工智能, 器官芯片 类器官 文献 NA NA 单细胞转录组学, 空间转录组学, 多组学 NA NA
62 2026-09-29
Human Monocytic Models Reveal Genotype-Dependent Inflammatory Programs in VEXAS Syndrome
2026-Sep-07, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 该研究通过对VEXAS综合征患者进行纵向深度表型分析,并结合携带不同UBA1突变的人类单核细胞系模型,揭示了基因型依赖的炎症程序,并发现RIPK3抑制可减轻病理特征 首次建立了携带三种主要UBA1突变(p.Met41Val、p.Met41Thr、p.Met41Leu)的人类单核细胞系模型,系统揭示了基因型依赖的泛素化缺陷梯度及其与炎症表型的关联,并发现RNASE1作为疾病活动标志物及RIPK3作为潜在治疗靶点 样本量较小(13例患者),细胞系模型无法完全模拟体内复杂的疾病微环境,缺乏RIPK3抑制剂的临床试验验证 阐明VEXAS综合征中基因型特异性炎症程序并识别潜在治疗靶点 VEXAS综合征患者外周血样本及携带UBA1突变的人类单核细胞系 机器学习 自身炎症性疾病 bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 转录组分析 NA 文本, 基因表达数据 13例VEXAS综合征患者的79份RNA-seq样本,以及三种UBA1突变的人类单核细胞系 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
63 2026-09-29
scFlowReport: A Reproducible Workflow for Comparative Downstream Biological Analysis of Single-Cell RNA-seq Data
2026-Sep-06, Biomolecules IF:4.8Q1
研究论文 该论文提出了scFlowReport,一个轻量级、配置驱动的工作流,用于对单细胞RNA测序数据进行可重复的比较性下游生物学分析,包括差异表达、功能富集、调控网络推断和细胞间通讯分析。 提出了一种配置驱动的工作流,能够在统一的比较框架下协调多种互补的下游分析(差异表达、过表征和排序功能富集、SCENIC转录因子调控子导出、LIANA细胞间通讯分析),自动生成标准化图表、汇总表格和自包含的静态HTML报告,无需持久化服务器。 摘要中未明确提及该研究的局限性。 为比较性单细胞转录组数据提供系统化、可重复的解释工作流,简化多种下游分析的整合与应用。 已注释的Seurat对象中的单细胞RNA-seq数据,以特应性皮炎(Atopic Dermatitis)公共数据集为应用示例。 机器学习 特应性皮炎 单细胞RNA-seq NA 文本 一个公开可用的特应性皮炎scRNA-seq数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
64 2026-09-29
CNP-miR146a Promotes NRF2-Related Ferroptosis-Protective Myeloid Programs and Immune-Vascular Regeneration in Diabetic Wounds
2026-Sep-04, Pharmaceutics IF:4.9Q1
研究论文 该研究通过单细胞RNA测序分析了CNP-miR146a治疗糖尿病创面后第7天的细胞和转录组反应,揭示了NRF2相关铁死亡保护性髓系程序及免疫-血管再生机制 首次将CNP-miR146a治疗与铁死亡保护性程序、NRF2相关抗氧化通路及免疫-血管通讯网络联系起来,通过单细胞RNA测序揭示了从单核细胞向促再生巨噬细胞的分化轨迹 研究主要基于转录组数据的计算推断(如CellChat配体-受体通讯预测和拟时序分析),需要进一步的功能验证实验来确认铁死亡相关和免疫-血管转录网络作为CNP-miR146a介导糖尿病创面修复的因果机制 探究CNP-miR146a治疗糖尿病创面的细胞和转录组反应,以及创面修复是否与铁死亡保护性程序和免疫-血管通讯相关 糖尿病切除创面模型(接受CNP-miR146a或PBS对照治疗),重点分析术后第7天的创面组织 单细胞转录组学 糖尿病创面 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
65 2026-09-29
Atherosclerotic Cell Fates: A Single-Cell View of ER Stress
2026-Sep-03, Journal of cardiovascular development and disease IF:2.4Q2
综述 本文综述了近期单细胞研究证据,提出动脉粥样硬化中内质网应激的“细胞类型特异性差异应答”模式 提出内质网应激并非在所有细胞类型中均发挥促动脉粥样硬化作用,而是呈现细胞亚群特异性的差异应答模式 作为综述,未提供原始实验数据,主要基于已有单细胞研究证据的综合分析 探讨内质网应激在动脉粥样硬化不同细胞亚群中的作用异质性及其机制 动脉粥样硬化相关细胞亚群,包括单核细胞、巨噬细胞亚群、内皮细胞亚群和平滑肌细胞 单细胞组学 动脉粥样硬化 单细胞RNA测序 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
66 2026-09-29
Integrative Identification of Candidate Protein Targets and Compounds for Dystonia Using Mendelian Randomization, Single-Cell RNA Sequencing, and Network Pharmacology
2026-Sep-03, Genes IF:2.8Q2
研究论文 本文综合运用孟德尔随机化、单细胞RNA测序和网络药理学等方法,识别肌张力障碍的候选蛋白靶点和潜在中药单体化合物 首次将蛋白质组范围孟德尔随机化与单细胞RNA测序及网络药理学相结合,系统识别肌张力障碍的因果蛋白靶点和候选中药单体,并通过分子对接验证结合活性 研究结果主要基于计算预测和分子对接模拟,缺乏实验验证和临床转化证据,中药单体的体内药效和安全性尚未评估 识别肌张力障碍的候选蛋白靶点,并筛选可能用于治疗肌张力障碍的潜在中药单体化合物,为新药研发提供方向 肌张力障碍相关的蛋白质、脑组织单细胞测序数据以及中药单体化合物 机器学习 肌张力障碍 孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、网络药理学、分子对接 NA 文本、基因表达数据 51个与肌张力障碍相关的蛋白质 NA 单细胞RNA-seq NA NA
67 2026-09-29
Targeting p21-High Senescent Kupffer Cells Nanotherapeutically Potentiates Antitumor Immunity in Advanced Hepatocellular Carcinoma with Portal Vein Tumor Thrombus
2026-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 该研究开发了一种仿生纳米递送系统SKEV@AAV,通过靶向p21高表达的衰老Kupffer细胞,逆转其衰老状态并重塑肿瘤微环境,从而增强晚期肝细胞癌合并门静脉癌栓的抗肿瘤免疫 首次揭示p21高表达衰老Kupffer细胞在HCC-PVTT免疫抑制中的关键作用,并开发了由衰老Kupffer细胞来源外泌体包裹AAV载体的仿生纳米递送系统SKEV@AAV,实现精准靶向衰老Kupffer细胞并逆转其衰老状态 摘要中未明确提及研究局限性 靶向衰老Kupffer细胞以增强晚期肝细胞癌合并门静脉癌栓的抗肿瘤免疫治疗效果 晚期肝细胞癌合并门静脉癌栓患者肿瘤微环境中的衰老Kupffer细胞及小鼠原位PVTT模型和脾脏肝转移模型 数字病理学, 机器学习 肝癌 单细胞RNA测序, 纳米递送技术, AAV基因治疗 NA 图像, 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
68 2026-09-29
B-Cell Remodeling and Regulatory Phenotypes During Acute COVID-19 Are Unaffected by Polyclonal Anti-SARS-CoV-2 Antibody XAV-19
2026-Sep, European journal of immunology IF:4.5Q2
研究论文 本研究通过光谱流式细胞术、体外功能实验和单细胞RNA测序,纵向分析了住院COVID-19患者的B细胞重塑及调节性B细胞表型,并评估了多克隆抗SARS-CoV-2抗体XAV-19对此过程的影响 首次系统揭示了急性COVID-19期间调节性B细胞的动态重塑过程,包括PD-L1、CD9、颗粒酶B和IL-10等调节相关标志物的富集,以及干扰素驱动的记忆B细胞特征的出现,并证明XAV-19被动抗体治疗对B细胞稳态无显著影响 摘要中未明确提及研究局限性,但作为免疫学子研究,样本量可能有限,且随访时间可能较短,长期免疫学影响尚不明确 探究SARS-CoV-2感染期间调节性B细胞的动态变化及被动抗体治疗XAV-19对B细胞免疫平衡的影响 住院COVID-19患者 免疫学 COVID-19 光谱流式细胞术, 单细胞RNA测序, 体外功能实验 NA 单细胞转录组数据, 流式细胞术数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
69 2026-09-29
TMEM59 regulates microglial Aβ phagocytosis in a TREM2-dependent manner and acts as a potential therapeutic target for Aβ amyloidosis
2026-Sep, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文研究TMEM59通过TREM2依赖性方式调控小胶质细胞对Aβ的吞噬作用,并探讨其作为Aβ淀粉样变性潜在治疗靶点的价值 首次揭示TMEM59通过稳定TREM2蛋白以TREM2依赖性方式调控小胶质细胞Aβ吞噬,并开发了靶向降解TMEM59的CMATAC肽用于治疗淀粉样变性 摘要中未提及具体研究局限性 探究TMEM59在阿尔茨海默病中对小胶质细胞吞噬功能的分子调控机制,并评估其作为Aβ淀粉样变性治疗靶点的潜力 5xFAD小鼠模型中的小胶质细胞及TMEM59蛋白 机器学习 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
70 2026-09-29
T Cell-Derived IFN-γ Activates Ferroptosis in Lacrimal Luminal Ductal Cells via JAK-STAT Signaling in Sjögren's Disease-Related Dry Eye
2026-Sep-01, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组分析,揭示了干燥综合征相关干眼症中,T细胞来源的IFN-γ通过JAK-STAT信号通路激活泪腺管腔上皮细胞铁死亡的具体机制 首次识别出以CYP2F2为标志的泪腺管腔导管上皮细胞是干燥综合征中主要受损的上皮群体,并阐明了Th1细胞分泌的IFN-γ通过JAK2/STAT1通路诱导该细胞铁死亡的免疫-上皮交互机制 研究主要基于MRL/lpr小鼠模型,其病理机制与人类干燥综合征可能存在差异,需要在人类样本中进一步验证;IFN-γ中和治疗的长期安全性和有效性尚未评估 深入识别干燥综合征中脆弱的泪腺上皮亚群,并阐明免疫-上皮交互在干眼症发病中的作用机制 MRL/lpr小鼠模型中的泪腺管腔导管上皮细胞和浸润的Th1细胞 数字病理学, 机器学习 干燥综合征, 干眼症 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫荧光, 多重免疫组化, 蛋白质印迹, 透射电子显微镜, 流式细胞术 NA 图像, 文本 MRL/lpr小鼠模型(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
71 2026-09-29
DeOPUS: cellular deconvolution via optimized power-transformed unmixing with shrinkage
2026-Sep-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文提出了一种名为DeOPUS的基于参考的细胞解卷积方法,通过分层收缩变换、方差稳定幂变换和基于秩的分位数归一化,从批量RNA-seq数据中稳健估计细胞类型比例。 引入了分层收缩变换(HST)来稳健估计细胞组成,整合了多级自适应先验、方差稳定幂变换和基于秩的分位数归一化,以减轻异常值和高方差技术噪声的影响。 摘要中未明确提及研究的局限性。 开发一种成本效益高的细胞解卷积方法,以准确估计批量RNA-seq数据中的细胞类型比例,解决转录组数据极端动态范围和异方差性带来的挑战。 批量RNA-seq数据中的细胞类型比例估计。 机器学习 NA 批量RNA-seq NA 文本 122个组织和12个器官系统,以及18个具有实验确定细胞类型比例的批量数据集。 NA 批量RNA-seq NA NA
72 2026-09-29
Constructing cell-type-specific gene regulatory networks from cell-cell communication and a global gene regulatory network
2026-Sep-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 提出了一种基于双边自表示矩阵分解的细胞类型特异性基因调控网络推断框架CTN,整合bulk RNA-seq和scRNA-seq数据,重建细胞类型水平的基因调控网络 提出了一种基于双边自表示矩阵分解的调控推断框架CTN,能够整合bulk RNA-seq和scRNA-seq数据,分解全局调控关系和细胞间通讯,从而在细胞类型水平重建基因调控网络,克服了scRNA-seq数据稀疏性和高噪声的挑战 摘要中未明确提及研究的局限性 准确推断细胞类型特异性基因调控网络,以理解细胞异质性、谱系决定和疾病进展机制 造血系统不同谱系的分化过程、肿瘤相关细胞类型、肿瘤微环境 机器学习 肿瘤 bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 双边自表示矩阵分解 基因表达数据 NA NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
73 2026-09-29
Advances in single-cell and spatial multi-omics for plant development and stress responses
2026-Sep, Plant diversity IF:4.6Q1
综述 该综述总结了单细胞和空间多组学技术在植物发育和胁迫响应研究中的实验与计算方法,并讨论了其适用性和局限性 系统梳理了植物单细胞和空间多组学技术,重点关注植物特异性约束(细胞壁结构、组织复杂性、基因组组织)以及计算整合策略(去卷积、空间映射、跨模态表示学习) 植物特异性训练资源有限,参考数据质量依赖性强,数据稀疏性和批次效应问题,非模式植物应用困难,缺乏标准化分析框架和稳健验证策略 总结单细胞和空间多组学在植物发育和胁迫响应中的研究进展,探讨实验和计算方法、适用性及局限性 植物组织、细胞类型和状态、非模式植物 机器学习, 计算生物学 NA 单细胞RNA测序, 单核ATAC测序, 空间转录组学, 空间代谢组学 NA 文本, 图像 NA NA single-cell RNA-seq, single-nucleus ATAC-seq, spatial transcriptomics, spatial metabolomics NA NA
74 2026-09-29
PDGFRα+/Integrin α2+ Fibroblasts Orchestrate Tumor Budding in Oral Squamous Cell Carcinoma via Mechano-Metabolic Symbiosis: E-Cadherin/Integrin α2β1 Adhesion and Mitochondrial Transfer
2026-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 该研究开发了肿瘤出芽类器官模型,并结合单细胞RNA测序和原位RNA测序,揭示了PDGFRα+/整合素α2+癌症相关成纤维细胞通过力学-代谢共生机制驱动口腔鳞状细胞癌肿瘤出芽 首次建立肿瘤出芽类器官模型忠实再现口腔鳞状细胞癌肿瘤-基质界面和出芽动态,发现PDGFRα+/整合素α2+ CAFs通过E-钙黏蛋白/整合素α2β1黏附传递生物力学信号激活YAP信号通路诱导EMT样程序,以及通过隧道纳米管介导的线粒体转移增强氧化磷酸化和生物能量供应,揭示力学-代谢共生驱动肿瘤出芽的新机制 摘要中未明确提及研究局限性 探究驱动口腔鳞状细胞癌肿瘤出芽的基质调控因子和分子机制 口腔鳞状细胞癌肿瘤出芽 数字病理学 口腔鳞状细胞癌 单细胞RNA测序、原位RNA测序 肿瘤出芽类器官模型 图像、文本 NA NA 单细胞RNA测序、原位RNA测序 NA NA
75 2026-09-29
Liver Endothelia Orchestrate MASH-Associated Macrophage Zonation Through FSTL1-ITGA4 Axis
2026-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 该研究揭示了肝脏内皮细胞通过Kit/STAT2/FSTL1/ITGA4轴调控MASH相关巨噬细胞分区分布的机制 首次发现肝窦内皮细胞中Kit的分区丢失通过STAT2磷酸化抑制FSTL1,进而通过FSTL1-ITGA4轴驱动促炎巨噬细胞向小叶中心聚集,揭示了内皮功能障碍驱动空间免疫重组的机制 摘要中未明确提及研究局限性 阐明分区化LSEC Kit如何调控MASH中巨噬细胞的分布 肝窦内皮细胞(LSECs)、巨噬细胞、MASH小鼠模型及人类数据 数字病理学、空间转录组学 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH) 空间转录组学、分区分选、内皮特异性基因敲除 NA 图像、文本 NA NA 空间转录组学 NA NA
76 2026-09-29
ST-ConMa: a multimodal foundation framework for spatial transcriptomics via image-gene contrastive and matching learning
2026-Sep-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 提出了一种基于图像-基因对比与匹配学习的空间转录组学多模态基础模型ST-ConMa 使用跨注意力多模态编码器和匹配目标联合学习图像-基因融合表示,而非分别生成模态特异性嵌入 未明确提及 构建一个可泛化的空间转录组学多模态基础模型,以解决现有模型任务特定和泛化性差的问题 空间转录组学数据中的组织图像和spot级基因表达谱 数字病理学 NA 空间转录组学 多模态基础模型、跨注意力机制 图像、基因表达谱 NA NA 空间转录组学 NA NA
77 2026-09-29
Data-driven identification of cell subtypes for single-cell transcriptomic data with Subtypist
2026-Sep-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 提出了一种名为Subtypist的全数据驱动多尺度迭代算法,用于在单细胞RNA测序数据中识别细胞亚型,无需依赖外部先验参考 Subtypist是一种完全数据驱动的多尺度迭代算法,不依赖固定细胞标签的外部参考,能够发现新的细胞亚型;在模拟和真实数据集上均优于现有方法;成功应用于肝细胞癌、食管鳞状细胞癌和心肌梗死三种疾病场景,揭示了新的生物学意义细胞亚型及其细胞间通讯机制 摘要中未明确提及该研究的局限性 开发一种不依赖外部先验参考的数据驱动方法,用于单细胞转录组数据中细胞亚型的准确识别,以深入理解疾病发生发展机制并指导治疗策略开发 单细胞RNA测序数据中的细胞亚型,应用于肝细胞癌、食管鳞状细胞癌和心肌梗死三种疾病场景 机器学习 肝细胞癌、食管鳞状细胞癌、心肌梗死 单细胞RNA测序 多尺度迭代算法 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
78 2026-09-29
Chemokine-Driven Intercellular Crosstalk in the Osteosarcoma Microenvironment After Neoadjuvant Chemotherapy: A Single-Cell RNA Sequencing Study
2026-Aug-31, Biomedicines IF:3.9Q1
研究论文 该研究通过单细胞RNA测序分析新辅助化疗前后骨肉瘤微环境的细胞异质性和趋化因子介导的细胞间通讯 首次在单细胞分辨率下系统描绘新辅助化疗后骨肉瘤微环境的重塑过程,并鉴定出内皮细胞来源的CXCL2通过CXCR2促进巨噬细胞趋化,揭示趋化因子驱动的化疗耐药机制 样本量较小(12例患者),验证实验仅限于体外transwell和Western blotting,缺乏体内功能验证和更大规模队列的验证 表征新辅助化疗后骨肉瘤肿瘤微环境的细胞异质性,并鉴定驱动化疗耐药的趋化因子介导的细胞间通讯 12例骨肉瘤患者的手术标本,其中6例未经治疗,6例接受新辅助化疗后 单细胞组学 骨肉瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 12例骨肉瘤患者样本,共77,616个细胞(36,214个来自初治患者,41,402个来自新辅助化疗后样本) NA 单细胞RNA测序 NA NA
79 2026-09-29
Single-Cell Transcriptomic Identification of a Proliferative Intermediate State During Early Anagen Hair Follicle Regeneration
2026-Aug-31, Genes IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组分析、调控分析和细胞间通讯分析,鉴定出早期毛囊再生过程中从次级毛芽相关细胞向下部毛囊相关细胞转变的增殖性中间转录状态 首次鉴定出增殖性下部毛囊样细胞(PR-loHF)作为次级毛芽相关细胞向下部毛囊相关细胞转变过程中的转录中间状态,揭示了该中间状态具有独特的细胞周期活性、上皮重塑、细胞外基质组织和发育调控等生物学程序的富集,以及独特的转录因子调控子和细胞间通讯模式 研究主要基于已发表的小鼠背部皮肤单细胞RNA测序数据的再分析,缺乏实验验证;仅聚焦于早期毛囊再生阶段,未涵盖完整的毛囊周期;PR-loHF状态的功能意义和调控机制仍需进一步体内实验验证 表征次级毛芽相关细胞向下部毛囊相关细胞转变过程中的转录变化,鉴定早期毛囊再生过程中的增殖性中间转录状态,并深入理解细胞状态转变和微环境变化 小鼠背部皮肤毛囊上皮细胞,包括次级毛芽相关细胞、增殖性下部毛囊样细胞(PR-loHF)和下部毛囊相关细胞 机器学习 NA 单细胞RNA测序 NA 图像, 文本 小鼠背部皮肤在毛囊周期第0、5、10、15、20、25和30天的组织切片样本,以及已发表的小鼠背部皮肤早期毛囊期单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
80 2026-09-29
Drug Repositioning Based on Single-Cell Transcriptomics Data Identifies Quinidine as a Potential Drug for Treating Osteoporosis
2026-Aug-31, Genes IF:2.8Q2
研究论文 基于单细胞转录组学数据进行药物重定位,鉴定出奎尼丁是治疗骨质疏松症的潜在药物 利用单细胞转录组学数据发现奎尼丁作为治疗糖皮质激素诱导的骨质疏松症的潜在药物 摘要中未提及 识别可重定位用于糖皮质激素诱导的骨质疏松症的药物 骨质疏松症(OP),特别是糖皮质激素诱导的骨质疏松症 机器学习 骨质疏松症 单细胞RNA测序 NA 文本(单细胞转录组学数据) NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
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