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当前共找到 38047 篇文献，本页显示第 521 - 540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2026-03-29 |
Renshen-Baidu-San restores epithelial-immune crosstalk and drives type 2 immune repair in ulcerative colitis: an integrated multi-omics study
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1777808
PMID:41890762
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研究论文 | 本研究通过整合多组学方法，揭示了人参败毒散在溃疡性结肠炎中通过调节代谢途径、恢复上皮-免疫互作并驱动2型免疫修复的治疗机制 | 首次结合血清代谢组学、单细胞RNA测序和结肠类器官实验，系统阐明了人参败毒散通过调节Tuft细胞和T-1细胞亚群、抑制NF-κB-TNF-α信号通路，恢复上皮-免疫串扰并促进2型免疫修复的多重生物学机制 | 研究基于DSS诱导的小鼠溃疡性结肠炎模型，其结论在人类患者中的直接适用性仍需进一步验证 | 阐明人参败毒散治疗溃疡性结肠炎的多种生物学机制 | DSS诱导的溃疡性结肠炎小鼠模型及结肠类器官 | 多组学整合分析 | 溃疡性结肠炎 | 血清代谢组学, 网络药理学, 分子对接, 单细胞RNA测序, 结肠类器官培养, 组织病理学, 免疫组化, 免疫荧光, 定量RT-PCR, ELISA, 流式细胞术 | NA | 代谢组数据, 转录组数据, 图像数据, 蛋白互作数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 522 | 2026-03-29 |
M2-type tumor-associated macrophages promote invasion of canine breast cancer through ADAM9 upregulation
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1777860
PMID:41890767
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研究论文 | 本研究通过犬乳腺肿瘤模型结合人类转录组数据，揭示了ADAM9作为M2型肿瘤相关巨噬细胞促进肿瘤侵袭的关键效应分子 | 首次在跨物种（犬与人类）模型中系统验证ADAM9在M2型TAMs中的特异性富集及其通过ECM重塑和细胞骨架调控促进肿瘤侵袭的机制 | 研究主要基于体外模型和转录组分析，缺乏体内实验的全面验证；犬模型与人类肿瘤的完全等效性仍需进一步确认 | 探究肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）驱动肿瘤侵袭的分子机制，并识别关键效应分子 | 犬乳腺肿瘤细胞、M2型肿瘤相关巨噬细胞、癌症干细胞（CSCs） | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、转录组分析、基因敲低、细胞迁移与侵袭实验 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、体外实验数据 | 未明确样本数量，包含犬乳腺肿瘤模型及公共人类转录组数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 523 | 2026-03-29 |
Cell Differentiation of DPSCs Infected With Different Periodontal Pathogens
2026-Jan, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.70045
PMID:40739838
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探究了两种牙周病原体（牙龈卟啉单胞菌和牙周二氧化碳嗜纤维菌）对人牙髓干细胞亚群分化的不同影响 | 首次在单细胞分辨率下揭示了不同牙周病原体对牙髓干细胞亚群分化的特异性调控作用，并识别出对特定病原体有独特反应的细胞亚群 | 研究样本来源于健康供体，未考虑临床患者个体差异；体外感染模型可能无法完全模拟体内复杂微环境 | 探究牙周病原体感染对牙髓干细胞分化的影响机制 | 人牙髓干细胞 | 单细胞组学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康供体来源的牙髓干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 524 | 2026-03-29 |
Model-based dimensionality reduction for single-cell RNA-seq using generalized bilinear models
2025-12-31, Biostatistics (Oxford, England)
DOI:10.1093/biostatistics/kxaf024
PMID:40795862
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研究论文 | 本文提出了一种名为scGBM的新方法，用于单细胞RNA测序数据的模型降维，通过泊松双线性模型改进标准降维方法 | 开发了scGBM方法，使用泊松双线性模型直接建模计数数据，引入快速估计算法以扩展到百万级细胞数据集，并量化细胞潜在位置的不确定性 | 未明确提及具体局限性，但可能涉及模型假设或计算效率的进一步验证 | 解决单细胞RNA测序数据降维中的问题，如虚假异质性和生物变异性掩盖 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 泊松双线性模型 | 计数矩阵 | 数百万细胞的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 525 | 2026-03-29 |
Consensus Molecular Subtypes (CMS) Classification: a progress towards Subtype-Driven treatments in colorectal cancer
2025-Nov-24, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-025-04117-1
PMID:41276825
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综述 | 本文综述了结直肠癌共识分子分型（CMS）的分类、预后预测作用、识别方法及其在指导个体化治疗中的应用与挑战 | 系统总结了基于基因表达谱、免疫组化（IHC）和基于深度学习的图像分类器（imCMS）等多种CMS识别方法，并探讨了利用单细胞RNA测序解决肿瘤内异质性（ITH）等新兴策略 | 肿瘤内异质性（ITH）和技术障碍阻碍了CMS分类在临床中的广泛采用 | 回顾CMS分类在结直肠癌中的预后和预测作用，评估其指导个体化治疗的潜力，并探讨临床应用的障碍与解决方案 | 结直肠癌（CRC）及其共识分子亚型（CMS1-4） | 数字病理学 | 结直肠癌 | 基因表达谱分析，免疫组化（IHC），单细胞RNA测序，基于计算模型的图像分类（如深度学习） | 深度学习 | 基因表达数据，组织图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 526 | 2026-03-29 |
Lessons learned from spatial transcriptomic analyses in clear-cell renal cell carcinoma
2025-11, Nature reviews. Urology
DOI:10.1038/s41585-024-00980-x
PMID:39789293
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综述 | 本文总结了空间转录组学在透明细胞肾细胞癌研究中的应用和发现 | 首次系统回顾了空间转录组学在透明细胞肾细胞癌中的研究，揭示了肿瘤微环境的空间异性和相互作用 | 目前仅针对透明细胞肾细胞癌这一亚型，且技术应用尚处于早期阶段 | 探讨空间转录组学在肾细胞癌研究中的潜力和应用价值 | 透明细胞肾细胞癌的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 527 | 2026-03-29 |
Gene-regulatory programs that specify age-related differences during thymocyte development
2025-Jul-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115903
PMID:40570375
|
研究论文 | 本研究构建了新生和成年小鼠T细胞发育的转录和染色质可及性图谱，揭示了年龄相关差异的基因调控程序 | 通过整合转录组和染色质可及性数据，结合CRISPR扰动与单细胞RNA测序，鉴定了调控T细胞发育年龄差异的保守转录因子Zbtb20 | 研究仅基于小鼠模型，未在人类样本中验证，且单细胞测序技术可能受限于细胞捕获效率和测序深度 | 探究T细胞发育过程中年龄相关差异的基因调控机制 | 新生和成年小鼠的胸腺细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, 染色质可及性分析, CRISPR扰动 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 新生和成年小鼠的胸腺细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 528 | 2026-03-29 |
SwarmMAP: Swarm Learning for Decentralized Cell Type Annotation in Single Cell Sequencing Data
2025-Jan-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.13.632775
PMID:39868099
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研究论文 | 本文开发了一种名为SwarmMAP的基于群体学习（Swarm Learning）的机器学习方法，用于在单细胞测序数据中以去中心化的方式自动进行细胞类型注释 | 首次将群体学习应用于单细胞测序数据的细胞类型注释，实现了在无需交换原始数据的情况下进行去中心化模型训练，解决了数据隐私和可扩展性问题 | 摘要中未明确提及具体的研究局限性 | 开发一种标准化、自动化且保护隐私的跨数据集细胞类型注释方法 | 人类心脏、肺和乳腺组织的单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 基于Swarm Learning的机器学习模型 | 单细胞转录组数据 | 摘要中未提供具体样本数量，涉及多个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 529 | 2026-03-29 |
KLF4 in smooth muscle cell-derived progenitor cells is essential for angiotensin II-induced cardiac inflammation and fibrosis
2024-Jun-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.04.597485
PMID:38895472
|
研究论文 | 本研究揭示了平滑肌细胞来源的AdvSca1-SM细胞在血管紧张素II诱导的心脏纤维化中向肌成纤维细胞分化的轨迹，并发现转录因子KLF4在此过程中的关键作用 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学方法，首次阐明了冠状动脉相关AdvSca1-SM细胞在心脏纤维化中的促纤维化分化轨迹，并发现KLF4的双重功能 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限；KLF4调控AdvSca1-SM表型的具体分子机制仍需进一步探索 | 探究AdvSca1-SM细胞在血管紧张素II诱导的心脏纤维化中的作用及KLF4的调控机制 | 小鼠血管平滑肌细胞来源的AdvSca1-SM细胞及人类心脏肥厚组织 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 谱系追踪, RNA测序 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 530 | 2026-03-29 |
Generation and Downstream Analysis of Single-Cell and Single-Nuclei Transcriptomes in Brain Organoids
2024-03-29, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66225
PMID:38619271
|
研究论文 | 本文提供了一个关于在脑类器官中生成和分析单细胞及单核转录组的逐步实验指南 | 通过结合单细胞和单核转录组学方法，克服了难以分离细胞类型的限制，使单个细胞的转录组分析在脑类器官研究中普遍适用 | NA | 为脑类器官研究提供单细胞和单核转录组学的实验流程，以促进对大脑发育的细胞过程和分子机制的全面研究 | 脑类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学，单核转录组学，RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，单核RNA-seq | NA | NA |
| 531 | 2026-03-29 |
Spatial High-resolution Analysis of Gene Expression Levels in Tendons
2024-03-08, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/65852
PMID:38526117
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方法论文 | 本文综述了肌腱组织中空间高分辨率基因表达水平的分析方法，重点关注新型原位杂交技术 | 针对富含基质的肌腱组织，提出了单细胞水平的空间转录组学分析方法，解决了低细胞数、低RNA含量和高基质背景的挑战 | NA | 开发并优化肌腱组织中空间基因表达水平的分析方法 | 肌腱组织，特别是年轻和老年动物模型及人类肌腱样本 | 数字病理学 | NA | 原位杂交，空间转录组学 | NA | 图像，RNA空间表达数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 532 | 2026-03-29 |
Proteogenomic and V(D)J Analysis of Human Decidual T Cells Highlights Unique Transcriptional Programming and Clonal Distribution
2023-07-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200061
PMID:37195197
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研究论文 | 本研究利用单细胞多组学技术分析了人类蜕膜T细胞的转录组、蛋白质组和T细胞受体库，揭示了其在母胎界面独特的转录编程和克隆分布 | 首次同时获取单细胞水平的转录组、有限蛋白质组和受体库数据，系统揭示了蜕膜T细胞独特的转录编程特征和克隆多样性降低现象 | 样本量相对有限，蛋白质检测为有限蛋白质组而非全面蛋白质组，功能验证实验不足 | 探究母胎界面免疫耐受机制中T细胞的角色和特性 | 人类蜕膜T细胞和匹配的外周血T细胞 | 单细胞组学 | 生殖免疫 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、有限蛋白质数据、T细胞受体序列数据 | 人类蜕膜和外周血T细胞样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 533 | 2026-03-29 |
Preparation of noninfectious scRNAseq samples from SARS-CoV-2-infected epithelial cells
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0281898
PMID:36827401
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研究论文 | 本文描述了一种从SARS-CoV-2感染细胞中制备非传染性单细胞RNA测序样本的方法，使研究能在BSL2设施中安全进行 | 开发了一种使用甲醇-丙酮固定和灭活SARS-CoV-2的方法，使单细胞RNA测序分析能在较低生物安全级别的设施中进行，扩大了研究社区的可及性 | 方法仅在非洲绿猴肾上皮细胞和原代人肺上皮细胞上测试，可能不适用于所有细胞类型或病毒株，且未评估长期存储对样本质量的影响 | 开发一种安全制备非传染性单细胞RNA测序样本的方法，以促进SARS-CoV-2宿主反应的高通量研究 | SARS-CoV-2感染的非洲绿猴肾上皮细胞（Vero-E6）和原代人肺上皮细胞 | 单细胞测序 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNAseq）、组织培养感染剂量测定（TCID50）、流式细胞术 | NA | RNA序列数据 | 未明确指定样本数量，但涉及两种细胞类型（Vero-E6细胞和原代人肺上皮细胞） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 534 | 2026-03-29 |
Tumors induce de novo steroid biosynthesis in T cells to evade immunity
2020-07-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-17339-6
PMID:32680985
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研究论文 | 本文揭示了肿瘤通过诱导T细胞从头合成类固醇来逃避免疫反应的新机制 | 首次发现并表征了肿瘤诱导的T细胞从头类固醇合成，作为抗肿瘤免疫抑制的一种新机制，并证明抑制该通路可恢复抗肿瘤免疫力 | 研究主要基于小鼠模型，人类T细胞中的类似机制尚需进一步验证 | 探究肿瘤如何通过调控T细胞功能来逃避免疫反应 | T淋巴细胞和肿瘤微环境 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞转录组学 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 535 | 2026-03-29 |
Comparative analysis of single-cell transcriptomics in human and Zebrafish oocytes
2020-Jul-08, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-020-06860-z
PMID:32640983
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA-seq技术比较了人类和斑马鱼卵母细胞的转录组，揭示了二者在基因表达水平上的高度一致性和功能相似性 | 首次直接比较人类和斑马鱼卵母细胞的单细胞转录组，发现同源基因在两者中高度表达且功能类别相似 | 仅基于三个单细胞RNA-seq研究进行比较，样本量有限，且未涵盖所有卵母细胞发育阶段 | 评估斑马鱼作为研究人类卵母细胞的有效模型生物的可行性 | 人类和斑马鱼的卵母细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼卵母细胞单细胞RNA-seq数据及两项人类卵母细胞单细胞RNA-seq研究数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 536 | 2026-03-29 |
Simple Method to Quantify Protein Abundances from 1000 Cells
2020-Jun-30, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.0c01191
PMID:32637829
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研究论文 | 本文介绍了一种从1000个哺乳动物干细胞中量化蛋白质表达水平的简化蛋白质组学工作流程 | 整合并优化了多项近期技术进展，实现了从极少量细胞（低至1000个）中进行蛋白质定量，无需特殊设备，仅需细胞裂解工具 | 方法虽已验证于小鼠胚胎干细胞和体外分化运动神经元，但在其他细胞类型或更复杂组织中的适用性可能有限 | 开发一种从最小输入样本中获取蛋白质组学数据的简单准确方法 | 小鼠胚胎干细胞、体外分化运动神经元以及荧光激活细胞分选纯化的海鞘细胞 | 蛋白质组学 | NA | 化学肽标记 | NA | 蛋白质表达数据 | 低至1000个哺乳动物干细胞 | NA | 蛋白质组学 | NA | NA |
| 537 | 2026-03-28 |
Single-cell landscape of piglet lung response with Actinobacillus pleuropneumoniae
2026-Dec, Virulence
IF:5.5Q1
DOI:10.1080/21505594.2026.2646800
PMID:41843736
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了猪肺在感染胸膜肺炎放线杆菌后的免疫反应和纤维化特征 | 首次在猪肺中应用单细胞RNA测序技术，系统性地描绘了感染胸膜肺炎放线杆菌后的细胞亚群变化、免疫反应机制以及纤维化发展过程 | 研究仅针对猪肺模型，未涉及人类或其他动物模型，且样本数量可能有限 | 阐明胸膜肺炎放线杆菌感染引起的猪肺免疫反应和纤维化机制 | 感染或未感染胸膜肺炎放线杆菌的仔猪肺组织 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确指定样本数量，但涉及感染和未感染仔猪肺组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 538 | 2026-03-28 |
Integrated bioinformatics analysis reveals cross-talking hub genes and therapeutic agents between sepsis and acute myocardial infarction
2026-Dec, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2026.2645276
PMID:41863100
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学分析，识别了脓毒症和急性心肌梗死之间的共享核心基因，并探讨了其作为治疗靶点和药物候选物的潜力 | 首次系统性地识别了脓毒症和急性心肌梗死之间的交叉核心基因（JAK2、MYD88、TIMP1），并验证了槲皮素作为潜在靶向治疗药物的结合亲和力 | 研究主要基于生物信息学分析和体外验证，缺乏临床前或临床试验数据来证实治疗效果的体内有效性 | 识别脓毒症和急性心肌梗死之间的共享核心基因，并探索其作为治疗靶点和药物候选物的潜力 | 脓毒症和急性心肌梗死患者的基因表达数据 | 生物信息学 | 脓毒症和急性心肌梗死 | RNA测序、差异表达基因分析、加权基因共表达网络分析、功能富集分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络构建、分子对接模拟、qPCR验证 | MCC/Degree算法 | 基因表达数据 | NA | NA | RNA测序 | NA | NA |
| 539 | 2026-03-28 |
Cell-type-specific genetic associations in Lewy body dementia identified using single-cell eQTL-based Mendelian randomization
2026-Jun, Archives of gerontology and geriatrics
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.archger.2026.106205
PMID:41855783
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研究论文 | 本研究利用单细胞eQTL进行孟德尔随机化分析，识别了路易体痴呆中细胞类型特异的遗传关联 | 首次将单细胞转录组范围的孟德尔随机化与脑细胞类型特异性eQTL结合，揭示了ANKRD65在兴奋性神经元中表达与路易体痴呆风险的关联 | 研究主要基于遗传推断，需要进一步实验验证功能机制；样本分层可能影响统计效力 | 探索遗传变异通过细胞类型特异性机制影响路易体痴呆易感性的关联 | 路易体痴呆患者及对照人群的脑组织样本 | 生物信息学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组测序，孟德尔随机化，贝叶斯共定位分析 | 逆方差加权模型 | 遗传与转录组数据 | 基于APOE ε4携带状态分层的独立路易体痴呆队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 540 | 2026-03-28 |
Multi-omics analysis reveals AR as a potential prognostic factor and immune-related therapeutic target in gastric cancer
2026-Jun, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2026.102537
PMID:41890218
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研究论文 | 本研究通过多组学技术全面分析了雄激素受体（AR）在胃癌中的表达、预后价值及免疫相关作用 | 首次系统性地分析了AR在多种癌症类型中的肿瘤免疫微环境作用及其对预后和免疫治疗反应的预测价值，特别是在胃癌中作为不良预后风险因子的发现 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证；样本来源和数量未具体说明；未涉及AR靶向治疗的临床前或临床试验 | 探讨AR在肿瘤免疫微环境中的作用及其作为预后生物标志物和免疫治疗靶点的潜力 | 多种癌症类型，重点关注胃癌 | 生物信息学 | 胃癌 | 多组学分析、基因集富集分析、单细胞测序 | NA | 基因组、转录组、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |