单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27621 篇文献，本页显示第 501 - 520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2025-05-04 |
Plasticity in metastatic colorectal cancer
2025-Jan-20, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.12.018
PMID:39837278
|
research paper | 该研究探讨了结直肠癌（CRC）进展过程中癌细胞状态的变化及其对转移和治疗抵抗的影响 | 使用单细胞转录组测序技术绘制了CRC进展过程中癌细胞状态的变化图谱 | 仅关注了CRC的遗传突变和细胞状态变化，未涉及其他可能的机制 | 研究CRC转移和治疗抵抗的细胞学基础 | 结直肠癌细胞 | 癌症研究 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 502 | 2025-05-04 |
Ribosome profiling and single-cell RNA sequencing identify the unfolded protein response as a key regulator of pigeon lactation
2025-Jan-18, Zoological research
IF:4.0Q1
|
研究论文 | 本研究通过核糖体分析和单细胞RNA测序技术，揭示了未折叠蛋白反应在鸽子泌乳过程中的关键调控作用 | 首次在鸽子泌乳过程中发现成纤维细胞来源的BAFF信号激活分泌上皮细胞，模拟B细胞转化并通过未折叠蛋白反应增强蛋白质生产 | 研究仅针对225日龄的雄性鸽子，未考虑年龄和性别差异的影响 | 阐明鸽子嗉囊泌乳的分子机制和细胞动态 | 225日龄未配对非泌乳雄性鸽子(MN)和孵化后第一天开始泌乳的雄性鸽子(ML) | 分子生物学 | NA | RNA测序、核糖体分析、单细胞转录组测序(scRNA-seq)、RNA荧光原位杂交(RNA FISH) | NA | RNA测序数据、单细胞转录组数据 | 两组雄性鸽子样本(具体数量未明确说明) |
| 503 | 2025-05-04 |
Deciphering the toxic effects of polystyrene nanoparticles on erythropoiesis at single-cell resolution
2025-Jan-18, Zoological research
IF:4.0Q1
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术全面评估了聚苯乙烯纳米颗粒对斑马鱼胚胎红细胞生成的影响 | 首次在单细胞分辨率下揭示聚苯乙烯纳米颗粒对斑马鱼红细胞生成的毒性作用 | 研究仅针对斑马鱼胚胎，未涉及其他生物或发育阶段 | 探究聚苯乙烯纳米颗粒对水生生物造血过程的毒性影响 | 斑马鱼胚胎的红细胞生成过程 | 毒理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 斑马鱼胚胎样本 |
| 504 | 2025-05-04 |
Cross-species single-cell transcriptomics reveals neuronal similarities and heterogeneity in amniote pallium
2025-Jan-18, Zoological research
IF:4.0Q1
|
研究论文 | 通过跨物种单细胞转录组学揭示了羊膜动物大脑皮层的神经元相似性和异质性 | 首次利用单核RNA测序技术对多种羊膜动物大脑皮层进行跨物种比较，揭示了转录组保守性和物种特异性差异 | 研究仅基于转录组数据，未考虑蛋白质表达和功能验证 | 探究羊膜动物大脑皮层的进化动态和神经元同源性 | 猕猴、人类、小鼠、斑胸草雀、龟和蜥蜴的大脑皮层 | 神经科学 | NA | 单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过130,000个细胞核 |
| 505 | 2025-05-04 |
Multi-omics analysis and experimental verification reveal testicular fatty acid metabolism disorder in non-obstructive azoospermia
2025-Jan-18, Zoological research
IF:4.0Q1
|
研究论文 | 通过多组学分析和实验验证，揭示了非梗阻性无精子症（NOA）中睾丸脂肪酸代谢紊乱的关键机制 | 首次通过多组学方法（包括微阵列分析、单细胞RNA测序和代谢组学）系统研究了NOA中脂肪酸代谢紊乱，并确定了PPARG作为关键转录因子 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 阐明脂肪酸代谢紊乱与非梗阻性无精子症发病机制的关系 | 非梗阻性无精子症患者的睾丸组织和相关细胞 | 生殖医学 | 男性不育症 | 微阵列分析, scRNA-seq, 代谢组学 | NA | 基因表达数据, 代谢组数据 | 公共数据库中的NOA患者数据（具体数量未说明） |
| 506 | 2025-05-04 |
TrimNN: Characterizing cellular community motifs for studying multicellular topological organization in complex tissues
2025-Jan-17, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5584635/v1
PMID:39877090
|
研究论文 | 介绍了一种名为TrimNN的图基深度学习框架，用于识别和分析复杂组织中多细胞拓扑组织的细胞群落基序 | 提出了一种自下而上的方法，通过图基深度学习框架识别细胞群落基序，区别于传统的自上而下的聚类方法，具有可解释性和普适性 | NA | 研究复杂组织中多细胞拓扑组织的细胞群落基序 | 空间转录组学和蛋白质组学数据中的细胞群落基序 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学和蛋白质组学 | 图基深度学习框架 | 空间组学数据 | NA |
| 507 | 2025-05-04 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Macrophage Dynamics During MASH in Leptin-Deficient Rats
2025-Jan-10, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14020096
PMID:39851524
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示了瘦素缺陷大鼠在代谢功能障碍相关脂肪性肝炎（MASH）过程中巨噬细胞的动态变化 | 首次在大鼠模型中详细描述了MASH发展过程中肝脏巨噬细胞的动态变化，并发现了独特的M1到M2转变模式 | 研究仅基于瘦素缺陷大鼠模型，结果可能不完全适用于其他MASH模型或人类疾病 | 探究MASH发展过程中肝脏巨噬细胞的动态变化及其作用机制 | 瘦素缺陷大鼠的肝脏组织和其中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 16周龄瘦素缺陷大鼠的肝脏组织 |
| 508 | 2025-05-04 |
Immune Gene Expression Profiling in Individuals with Turner Syndrome, Graves' Disease, and a Healthy Female by Single-Cell RNA Sequencing: A Comparative Study
2025-Jan-10, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14020093
PMID:39851522
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较Turner综合征、Graves病和健康女性的免疫基因表达差异 | 首次使用scRNA-seq技术比较Turner综合征患者、健康女性和Graves病患者的抗原特异性CD4(+) T细胞的免疫基因表达差异 | 样本量较小，仅包括一名Turner综合征患者、一名健康女性和一名Graves病患者 | 分析Turner综合征患者与健康女性和Graves病患者在免疫基因表达上的差异 | Turner综合征患者、健康女性和Graves病患者的抗原特异性CD4(+) T细胞 | 基因组学 | Turner综合征, Graves病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 3名个体（1名Turner综合征患者，1名健康女性，1名Graves病患者） |
| 509 | 2025-05-04 |
Multiomic analysis reveals cellular, transcriptomic and epigenetic changes in intestinal pouches of ulcerative colitis patients
2025-Jan-09, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.11.11.23298309
PMID:38014192
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序技术，对溃疡性结肠炎患者的回肠袋进行了细胞类型分辨的转录组和表观遗传图谱分析 | 发现了回肠袋中以前未表征的吸收性和分泌性上皮细胞群，这些细胞表达部分结肠特异性基因，同时保持一些回肠特异性基因的表达 | 样本量较小（患者6人，健康对照6人），可能影响结果的普遍性 | 研究溃疡性结肠炎患者回肠袋的细胞、转录组和表观遗传变化 | 溃疡性结肠炎患者的回肠袋组织 | 生物医学研究 | 溃疡性结肠炎 | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观遗传数据 | 6名患者（4男2女）和6名健康对照（3男3女）的配对活检样本 |
| 510 | 2025-05-04 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals LEF1-Driven Wnt Pathway Activation as a Shared Oncogenic Program in Hepatoblastoma and Medulloblastoma
2025-Jan-09, Current oncology (Toronto, Ont.)
DOI:10.3390/curroncol32010035
PMID:39851951
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了LEF1驱动的Wnt通路激活在肝母细胞瘤和髓母细胞瘤中的共同致癌程序 | 发现了LEF1依赖的胚胎程序在两种儿科肿瘤中的共同转录激活，揭示了Wnt信号通路在肿瘤细胞中的调控机制 | 研究样本量有限，且仅针对两种特定儿科肿瘤 | 探究肝母细胞瘤和髓母细胞瘤中共同的致癌机制 | 肝母细胞瘤和髓母细胞瘤 | 生物信息学 | 肝母细胞瘤, 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 多组学数据分析 | ROC曲线分析 | 转录组数据, 单细胞数据 | PBTA髓母细胞瘤队列和两个独立的髓母细胞瘤转录组队列 |
| 511 | 2025-05-04 |
Cholecystokinin (CCK) Is a Mediator Between Nutritional Intake and Gonadal Development in Teleosts
2025-Jan-08, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14020078
PMID:39851506
|
研究论文 | 本研究探讨了胆囊收缩素（CCK）在鱼类营养摄入与性腺发育之间的中介作用 | 首次发现CCK通过下丘脑-垂体-性腺轴调控鱼类繁殖，并证实CCK能刺激GnRH3表达及FSH合成与分泌 | 研究主要基于草鱼模型，结论在其他鱼类中的普适性有待验证 | 阐明营养摄入影响性腺发育的分子机制 | 草鱼的下丘脑-垂体-性腺轴 | NA | NA | 单细胞RNA测序、原代细胞培养 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量（使用原代培养的垂体细胞和卵巢细胞） |
| 512 | 2025-05-04 |
Comprehensive Analysis Identifies THEMIS2 as a Potential Prognostic and Immunological Biomarker in Glioblastoma
2025-Jan-07, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14020066
PMID:39851494
|
研究论文 | 本研究首次发现THEMIS2作为胶质母细胞瘤中肿瘤相关巨噬细胞介导的免疫抑制的关键调节因子 | 首次识别THEMIS2在胶质母细胞瘤免疫抑制中的关键作用，并探讨其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 未提及具体样本量，且需要进一步实验验证THEMIS2的功能机制 | 探索胶质母细胞瘤免疫逃逸机制并寻找新的生物标志物和治疗靶点 | 胶质母细胞瘤及其肿瘤微环境中的免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 513 | 2025-05-04 |
Spatial differences in gene expression across the dorsal raphe nucleus in a model of early Alzheimer's disease
2025-Jan, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.1177/13872877241299119
PMID:39584353
|
研究论文 | 本研究利用空间基因表达技术探索了早期阿尔茨海默病模型中背侧中缝核（DRN）基因表达的空间差异 | 首次在临床前AD模型中揭示了DRN亚区对AD病理的差异性易感性，并发现长链非编码RNA Map2k3os可能与tau磷酸化调控相关 | 空间转录组技术需要结合其他验证方法以克服其局限性 | 探究5-HT神经元对AD病理易感性或抵抗性的潜在遗传机制 | 过表达人类tau蛋白的小鼠（htau小鼠）的背侧中缝核 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | Visium空间基因表达平台、RNAscope、免疫组化评估 | htau小鼠模型 | 空间转录组数据 | NA |
| 514 | 2025-05-04 |
Single-Cell Insights Into Cellular Response in Abdominal Aortic Occlusion-Induced Hippocampal Injury
2025-Jan, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.70154
PMID:39834143
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术，探究了腹部主动脉闭塞（AAO）模型小鼠海马区的细胞特异性分子病理学变化 | 首次在单细胞水平上揭示了AAO诱导的海马损伤的转录组变化，并识别了五种不同的星形胶质细胞亚型 | 研究仅使用了雄性C57BL/6小鼠，可能限制了结果的普遍性 | 探究腹部主动脉闭塞引起的海马损伤的细胞特异性分子机制 | 雄性C57BL/6小鼠（8周龄）的海马组织 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | AAO小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 62,624个细胞对应7种细胞类型 |
| 515 | 2025-05-04 |
Data-driven model discovery and model selection for noisy biological systems
2025-Jan, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012762
PMID:39836686
|
研究论文 | 提出了一种基于混合动力系统的数据驱动框架，用于模型发现和模型选择，以处理生物系统中的噪声问题 | 结合神经网络和稀疏回归，有效处理高噪声生物数据，并能够整合部分已知的系统知识 | 方法在极端噪声条件下可能仍存在性能下降 | 开发一种能够处理噪声和稀疏数据的生物系统模型发现方法 | 生物系统的复杂动力学 | 机器学习 | NA | 稀疏识别非线性动力学(SINDy), 神经网络 | 混合动力系统, 神经网络 | 单细胞转录组数据 | NA |
| 516 | 2025-05-04 |
Trajectory inference from single-cell genomics data with a process time model
2025-Jan, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012752
PMID:39836699
|
研究论文 | 提出了一种名为Chronocell的方法，通过生物物理过程模型从单细胞转录组数据中推断细胞轨迹和动态信息 | 引入了'过程时间'的概念替代传统的'伪时间'，提供了一个具有生物物理意义的轨迹推断框架 | 过程时间推断可能具有挑战性，数据集质量和模型评估需要特别注意 | 改进单细胞转录组数据中的细胞轨迹推断方法 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序 | Chronocell模型 | 基因表达数据 | 多种数据集（从类聚类到连续分布） |
| 517 | 2025-05-04 |
Exploring Cervical Adenocarcinoma: Epidemiological Insights, Diagnostic and Therapeutic Challenges, and Pathogenetic Mechanisms
2025-Jan, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70620
PMID:39840708
|
review | 本文综述了宫颈腺癌的流行病学特征、诊断与治疗挑战以及最新研究进展 | 强调了宫颈腺癌与鳞状细胞癌在肿瘤微环境特征上的显著异质性，并总结了常见的临床前模型及其优缺点 | 对宫颈腺癌与鳞状细胞癌在发病机制上的异同理解有限 | 探讨宫颈腺癌的流行病学、诊断与治疗挑战及发病机制 | 宫颈腺癌及其与鳞状细胞癌的比较 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文献数据 | NA |
| 518 | 2025-05-04 |
Predicting Outcomes in Esophageal Squamous Cell Carcinoma Using scRNA-Seq and Bulk RNA-Seq: A Model Development and Validation Study
2025-Jan, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70617
PMID:39840762
|
研究论文 | 该研究通过scRNA-seq和bulk RNA-seq数据开发并验证了一个预测食管鳞状细胞癌(ESCC)预后的模型 | 基于葡萄糖代谢相关基因集构建风险预后模型，并鉴定出4个枢纽基因(SERP1、CTSC、RAP2B和SSR4) | 样本量相对有限，需要更多外部验证 | 开发ESCC预后预测模型并探索治疗选择 | 食管鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 食管癌 | scRNA-seq, bulk RNA-seq | 风险预后模型 | 基因表达数据 | GEO数据库8例、TCGA数据库99例、MSKCC中心140例 |
| 519 | 2025-05-04 |
Integrated Analysis of Bulk RNA Sequencing, eQTL, GWAS, and Single-Cell RNA Sequencing Reveals Key Genes in Hepatocellular Carcinoma
2025-Jan, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70359
PMID:39853609
|
research paper | 通过整合分析bulk RNA测序、eQTL、GWAS和单细胞RNA测序数据，揭示了肝细胞癌中的关键基因 | 发现了SERPING1和STEAP3两个基因在肝细胞癌的发生和发展中的关键作用，并揭示了它们在代谢调控和巨噬细胞激活等生物过程中的作用 | 研究依赖于公开数据集，可能存在样本选择偏差，且实验验证仅限于部分基因 | 发现肝细胞癌的新分子靶点用于检测和治疗 | 肝细胞癌（HCC） | digital pathology | liver cancer | bulk RNA测序, eQTL分析, GWAS, 单细胞RNA测序, Western blotting, 免疫组化, 定量PCR | NA | RNA测序数据, 临床数据 | 三个公开的HCC数据集（来自TCGA和GEO） |
| 520 | 2025-05-04 |
A20 as a Potential Therapeutic Target for COVID-19
2025-Jan, Immunity, inflammation and disease
DOI:10.1002/iid3.70127
PMID:39853876
|
review | 本文探讨了A20作为COVID-19潜在治疗靶点的作用及其调控机制 | 提出A20作为调控COVID-19病理过程的关键因子，并探讨其在抗感染和抗炎症中的作用 | 研究主要基于文献综述和单细胞RNA-seq数据分析，缺乏实验验证 | 探索A20在COVID-19病理过程中的调控机制及其作为治疗靶点的潜力 | COVID-19患者和健康个体的单细胞RNA-seq数据 | 医学研究 | COVID-19 | 单细胞RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 来自NCBI GEO数据库的健康个体和不同严重程度COVID-19患者的数据 |