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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2025-11-06 |
Subtype-specific NK cell-TAM interactions drive a novel prognostic signature in HNSCC
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1676878
PMID:41181127
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了头颈鳞状细胞癌中NK细胞与肿瘤相关巨噬细胞亚型特异性相互作用模式及其预后价值 | 首次系统解析HNSCC中NK细胞与TAM的亚型特异性相互作用网络,并构建了基于23个基因的预后特征模型CINT | 样本量相对有限(58例),需要在更大队列中进一步验证 | 探究头颈鳞状细胞癌免疫微环境中NK细胞与TAM的相互作用机制及预后意义 | 头颈鳞状细胞癌组织样本和公共数据库数据 | 肿瘤免疫学 | 头颈鳞状细胞癌 | 免疫组织化学, 单细胞RNA测序, 多组学分析, 免疫荧光 | LASSO Cox回归 | 单细胞RNA测序数据, 公共数据库数据, 免疫组织化学图像, 免疫荧光图像 | 58例HNSCC组织样本,另使用TCGA-HNSC、GSE65858等公共数据库 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 502 | 2025-11-06 |
Gut microbiome as a potential mediator linking sexual behaviors to immune profiles in HIV-negative men who have sex with men: a multi-omics study
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1659556
PMID:41181130
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研究论文 | 通过多组学研究探讨男男性行为者中肠道微生物组如何介导性行为与免疫特征之间的联系 | 首次在HIV阴性MSM人群中整合肠道微生物组与免疫系统多组学数据,揭示性行为通过肠道微生物影响免疫特征的潜在机制 | 研究样本仅限于HIV阴性男男性行为者,结果可能不适用于其他人群 | 探究性行为如何通过肠道微生物组影响男男性行为者的免疫特征 | HIV阴性男男性行为者 | 多组学研究 | HIV易感性 | 16S rRNA基因测序, 批量转录组测序, 单细胞RNA测序, 贝叶斯分析 | PCA, Spearman相关分析, BayesPrism算法, 因果中介分析 | 粪便微生物组数据, 血液转录组数据 | HIV阴性男男性行为者队列 | NA | 16S rRNA测序, 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 503 | 2025-11-06 |
TGF-β-driven T-cell exclusion in ovarian cancer: single-cell and spatial transcriptomic views of immune low-response states
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1698088
PMID:41181126
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综述 | 总结TGF-β驱动的T细胞排斥在卵巢癌中的作用机制及单细胞与空间转录组学视角下的免疫低应答状态 | 整合单细胞RNA/ATAC测序与空间转录组学解析TGF-β信号相关的基质屏障机制,提出结合PD-1疗法与TGF-β轴靶向治疗的精准免疫新策略 | 存在病灶特异性异质性(附件/网膜/腹膜)、检测标准化不足及预测指标稀缺等临床转化挑战 | 探讨TGF-β信号通路在卵巢癌免疫微环境中的作用及精准免疫治疗策略 | 上皮性卵巢癌的肿瘤微环境(成纤维细胞/肿瘤细胞/免疫细胞) | 空间转录组学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 504 | 2025-11-06 |
The effects of cryopreservation on PBMCs transcriptome profile
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1690316
PMID:41181136
|
研究论文 | 本研究评估了优化冷冻保存程序对外周血单个核细胞转录组特征的影响 | 首次使用单细胞RNA测序技术系统评估长期冷冻保存对PBMC转录组的影响 | 仅评估了6个月和12个月两个时间点,未涵盖更短或更长的保存时间 | 评估优化冷冻保存程序对PBMC细胞活性和转录组特征的影响 | 外周血单个核细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序,流式细胞术,台盼蓝染色,碘化丙啶染色 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 冷冻保存6个月和12个月的PBMC样本,与新鲜细胞对比 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 505 | 2025-11-06 |
B cell subpopulations and their role in the pathogenesis of primary Sjögren's syndrome: insights from single-cell RNA sequencing
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1665086
PMID:41181153
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析原发性干燥综合征患者B细胞亚群及其在疾病发病机制中的作用 | 首次在pSS中通过单细胞RNA测序系统鉴定B细胞亚群,揭示I型干扰素信号通路、BCR克隆性改变和异常基因使用在发病机制中的关键作用 | 样本量较小(3例pSS患者和3例健康对照),需要在更大队列中验证发现 | 探讨B细胞在原发性干燥综合征发病机制中的潜在作用 | 原发性干燥综合征患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序,qRT-PCR,GO和KEGG通路富集分析,转录因子分析,拟时序分析,细胞通讯分析,BCR repertoire分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 单细胞测序:3例pSS患者和3例健康对照;qRT-PCR验证:22例pSS患者和22例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 506 | 2025-11-06 |
Comprehensive analysis of single-cell and bulk transcriptomes reveals key B-cell genes and immune microenvironment regulation in bladder cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1600254
PMID:41181151
|
研究论文 | 通过单细胞和批量转录组分析揭示膀胱癌中B细胞关键基因及免疫微环境调控机制 | 首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序系统鉴定膀胱癌B细胞亚型的关键预后基因 | 样本量有限(8例患者肿瘤样本和4例正常样本) | 探索膀胱癌B细胞关键基因及其在肿瘤免疫微环境中的调控作用 | 膀胱癌患者的肿瘤组织和正常组织 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 体外实验验证 | 多组学分析 | 转录组数据 | 8例膀胱癌患者肿瘤样本和4例正常样本,共84,967个细胞(其中10,967个B细胞) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 507 | 2025-11-06 |
Lactylation-Related Gene CALM1 Promotes Aortic Dissection via Immune Microenvironment Remodeling: Insights from Bioinformatics and Clinical Evidence
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S539938
PMID:41181366
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和临床证据揭示了乳酰化相关基因CALM1通过免疫微环境重塑促进主动脉夹层发生 | 首次系统研究乳酰化相关基因在主动脉夹层中的作用,发现CALM1可作为AD诊断的潜在生物标志物 | 仅验证了CALM1在临床样本中的表达差异,PARP1和PTBP1未显示显著差异 | 探讨乳酰化相关基因在主动脉夹层发病机制中的作用 | 主动脉夹层患者和健康个体的主动脉组织 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞测序,生物信息学分析 | NA | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 两个AD相关数据集(GSE 52093和GSE 98770)及临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 508 | 2025-11-06 |
Gastric metastasis of renal cell carcinoma: features, mechanisms, and insights from existing literature
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1656858
PMID:41181710
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综述 | 本文综述肾细胞癌胃转移的临床特征、分子机制及治疗策略 | 整合多组学与单细胞测序技术解析器官特异性转移机制 | 基于回顾性病例系列数据,缺乏前瞻性研究验证 | 探讨肾细胞癌胃转移的病理机制与临床管理策略 | 肾细胞癌胃转移患者 | 肿瘤学 | 肾细胞癌 | 单细胞测序、多组学分析 | NA | 临床病例数据 | 多中心病例系列(发病率0.2%-0.8%) | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 509 | 2025-11-06 |
Integrating single-cell RNA-seq datasets with substantial batch effects
2024-Feb-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.03.565463
PMID:37961672
|
研究论文 | 本文提出一种改进的条件变分自编码器方法,用于整合具有显著批次效应的单细胞RNA测序数据集 | 引入并比较多种正则化约束策略,提出结合VampPrior和循环一致性损失的新模型sysVI | 方法主要针对cVAE框架,对其他整合方法的适用性需要进一步验证 | 开发能够有效处理显著批次效应同时保留生物学变异的单细胞数据整合方法 | 单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 条件变分自编码器(cVAE) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 510 | 2025-11-06 |
ScRNA analysis and ferroptosis-related ceRNA regulatory network investigation in microglia cells at different time points after spinal cord injury
2023-Sep-19, Journal of orthopaedic surgery and research
IF:2.8Q1
DOI:10.1186/s13018-023-04195-5
PMID:37726826
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析脊髓损伤后不同时间点小胶质细胞,并研究铁死亡相关的ceRNA调控网络 | 首次在单细胞水平揭示脊髓损伤后不同时间点小胶质细胞的铁死亡相关ceRNA调控网络,鉴定出关键基因Stmn1和Fgfbr1 | 研究基于小鼠模型数据,尚未进行实验验证 | 探究脊髓损伤后不同时间点小胶质细胞的免疫炎症生物标志物和调控机制 | 小鼠脊髓损伤后3天和14天的小胶质细胞 | 单细胞转录组学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠脊髓损伤后3天和14天的单细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 511 | 2025-11-05 |
Cellular cholesterol metabolism rewiring through SREBP2-LXR-mTOR signaling convergence orchestrates T cell fate and keratinocyte apoptosis in oral lichen planus
2025-Dec-03, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115457
PMID:40957169
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多平台验证揭示了口腔扁平苔藓中T细胞胆固醇代谢异常通过SREBP2-LXR-mTOR信号通路调控T细胞命运和角质形成细胞凋亡的机制 | 首次发现OLP中T细胞胆固醇代谢异常通过SREBP2-LXR轴失衡和mTOR-SREBP2双向串扰调控疾病进程 | 研究主要基于体外细胞实验,需要更多体内实验验证;样本量相对有限 | 探究T细胞胆固醇代谢在口腔扁平苔藓发病机制中的作用 | 口腔扁平苔藓患者的T细胞、Jurkat T细胞系、角质形成细胞 | 单细胞生物学 | 口腔扁平苔藓 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 免疫荧光, 流式细胞术, PCR, 免疫共沉淀 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据, 细胞功能数据 | 口腔扁平苔藓患者组织样本和细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 512 | 2025-11-05 |
SPP1 as a key modulator of M2 macrophage polarization promotes endometriosis progression via activation of the FAK/PI3K/AKT pathway: A bioinformatics and experimental study
2025-Dec-03, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115563
PMID:40967048
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证发现SPP1通过调控M2巨噬细胞极化促进子宫内膜异位症进展 | 首次揭示SPP1作为M2巨噬细胞极化的关键调节因子,并通过FAK/PI3K/AKT信号通路促进子宫内膜异位症发展 | 研究样本量有限,机制研究仍需进一步深入验证 | 探索子宫内膜异位症中巨噬细胞极化的关键调控基因及其作用机制 | 子宫内膜异位症患者组织样本和人子宫内膜基质细胞(ihESCs) | 生物信息学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析,机器学习算法 | LASSO,SVM-RFE,Random Forest | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | GSE6364数据集(具体样本数未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 513 | 2025-11-05 |
Multi-omics analysis of the potential association between ageing and rheumatoid arthritis and screening of potential therapeutic targets
2025-Dec, Artificial cells, nanomedicine, and biotechnology
DOI:10.1080/21691401.2025.2582448
PMID:41185125
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研究论文 | 通过多组学方法探索衰老与类风湿关节炎之间的关联并筛选潜在治疗靶点 | 首次通过整合基因组数据库、转录组数据和单细胞RNA测序系统揭示衰老与RA的分子联系 | 分子机制研究仍需进一步实验验证 | 探索衰老与类风湿关节炎的关联机制并识别治疗靶点 | 类风湿关节炎患者与衰老相关基因 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 多组学分析,单细胞RNA测序,机器学习 | 机器学习算法 | 转录组数据,基因组数据 | 基于GBD数据库1990-2021年55岁及以上人群数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 514 | 2025-11-05 |
Single-Cell Analysis, Spatial Transcriptomics and Molecular Docking Unveil Potential Therapeutic Targets for Carotid Atherosclerosis
2025-Nov-04, Balkan medical journal
IF:1.9Q2
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序、空间转录组学和分子对接技术揭示颈动脉粥样硬化的潜在治疗靶点 | 首次整合单细胞测序、空间转录组学和分子对接技术系统解析颈动脉粥样硬化的细胞亚群特征和潜在治疗靶点 | 数据来源于公共数据库,缺乏实验验证 | 解析颈动脉粥样硬化的细胞亚群特征并发现潜在治疗靶点 | 颈动脉粥样硬化斑块中的细胞亚群 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞测序, 空间转录组学, 分子对接 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 515 | 2025-11-05 |
Research on the mechanism of compound mylabris capsules regulating ferroptosis in lung adenocarcinoma based on bioinformatics and experimental validation
2025-Nov-04, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003735
PMID:41186509
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证探讨复方斑蝥胶囊通过调控铁死亡抑制肺腺癌的作用机制 | 首次报道复方斑蝥胶囊通过调控铁死亡缓解肺腺癌,并鉴定出CA9、EZH2、NQO1和TERT等关键基因 | 研究主要基于公共数据库和体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证 | 探究复方斑蝥胶囊调控肺腺癌细胞铁死亡的分子机制 | 肺腺癌细胞系A549和H1650 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序,分子对接,分子动力学模拟,Lasso回归,Boruta算法,RFE算法 | 机器学习模型 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | TCGA和GEO数据库中肺腺癌相关数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 516 | 2025-11-05 |
The joint impact of elevated homocysteine and type 2 diabetes on non-healing wounds and all-cause mortality: integrated clinical and multi-omics analyses
2025-Nov-04, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003715
PMID:41186525
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研究论文 | 本研究探讨高同型半胱氨酸血症与2型糖尿病对难愈合伤口和全因死亡率的联合影响及其机制 | 首次揭示HHcy和T2D对难愈合伤口的协同作用,发现Hcy通过MIF-CD74/CXCR4轴驱动免疫代谢重编程 | 观察性研究设计无法确定因果关系,样本代表性可能受限 | 探究HHcy和T2D对难愈合伤口和死亡风险的联合影响及分子机制 | 8406名NHANES参与者(1999-2004)及糖尿病足溃疡患者 | 多组学分析 | 糖尿病足溃疡 | 批量转录组测序,单细胞测序,限制性立方样条,中介分析 | 加权逻辑回归,Cox比例风险模型 | 临床数据,转录组数据,单细胞数据 | 8406名NHANES参与者 | NA | 批量RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 517 | 2025-11-05 |
Unveiling gastric stem cell dynamics in gastric atrophy and carcinogenesis: revisiting mechanisms and advancing experimental models - a narrative review
2025-Nov-04, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003733
PMID:41186567
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综述 | 全面评估胃干细胞在萎缩性胃炎和癌前病变中的动态作用,重新审视胃干细胞耗竭与扩张的竞争范式 | 提出胃干细胞在慢性炎症中持续存在并发生克隆扩张的新观点,建立区域癌化效应的概念框架 | 依赖多化学致癌物模型的转化相关性有限,他莫昔芬依赖性谱系追踪系统存在混杂效应 | 阐明胃干细胞在胃萎缩和癌变过程中的动态机制 | 胃干细胞 | 病理学 | 胃癌 | 谱系追踪,空间转录组学,类器官系统 | NA | 实验数据,文献资料 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 518 | 2025-11-05 |
Immune cell quantification of in situ inflammation partitions human lupus nephritis into mechanistic subtypes
2025-Nov-03, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI192669
PMID:40906524
|
研究论文 | 通过免疫细胞定量分析将人类狼疮性肾炎划分为机制亚型 | 使用高维共聚焦显微镜、空间转录组学和计算机视觉技术量化免疫细胞群体,首次发现狼疮性肾炎和肾移植排斥反应中免疫细胞亚群形成相同的独特生态位 | 样本量相对有限(54例活检组织),研究结果需要更大规模验证 | 解析人类狼疮性肾炎的炎症机制和异质性 | 狼疮性肾炎和肾移植排斥反应的肾脏活检组织 | 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | 高维共聚焦显微镜, 空间转录组学, 计算机视觉 | 计算机视觉技术 | 图像, 空间转录组数据 | 54例去标识化肾脏活检组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 519 | 2025-11-05 |
Protoplast technology in woody plants: Current advances and potential applications in genetic improvement
2025-Nov-03, Tree physiology
IF:3.5Q1
DOI:10.1093/treephys/tpaf138
PMID:41182256
|
综述 | 本文综述了木本植物原生质体技术的当前进展及其在遗传改良中的潜在应用 | 系统总结了木本植物原生质体分离方法和应用前景,突出了其在基因编辑和单细胞测序等新兴领域的潜力 | NA | 探讨木本植物原生质体技术在生物技术和遗传改良中的应用价值 | 木本植物原生质体 | 植物生物技术 | NA | 原生质体分离、瞬时表达、基因编辑、单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 520 | 2025-11-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals multiple pathways involving pulmonary immune and epithelial cells through which aryl hydrocarbon receptor activation attenuates acute respiratory distress syndrome
2025-Nov-03, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf295
PMID:41182312
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了芳香烃受体激活通过调节肺免疫和上皮细胞的多条通路来减轻急性呼吸窘迫综合征 | 首次在单细胞水平系统揭示AhR激活通过调节多种细胞类型和信号通路来缓解ARDS的机制 | 研究基于小鼠模型,结果需在人类中验证;仅使用LPS诱导的ARDS模型 | 探究芳香烃受体激活对急性呼吸窘迫综合征的保护作用机制 | LPS诱导的ARDS小鼠模型中的肺组织细胞 | 单细胞生物学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |