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当前共找到 32476 篇文献，本页显示第 481 - 500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2025-11-06 |
Bcl6 expression is associated with a distinct immune landscape and spatial transcriptome in COVID-19
2025-Oct-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.189134
PMID:40924502
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研究论文 | 本研究通过多重成像和空间转录组学分析COVID-19患者肺引流淋巴结，揭示Bcl6表达与免疫景观和空间转录组的关联 | 首次在COVID-19背景下基于Bcl6表达水平对反应性滤泡进行分类，并发现不同Bcl6表达水平与特定免疫细胞亚群和分子通路的关联 | 样本来源于尸检组织，可能无法完全反映活体免疫动态；样本量有限 | 探索病毒感染急性期人类淋巴结中滤泡和生发中心免疫反应的调控机制 | COVID-19患者尸检获取的肺引流淋巴结和膈下淋巴结 | 空间转录组学 | COVID-19 | 多重成像, 空间转录组学 | NA | 图像, 空间转录组数据 | COVID-19尸检淋巴结样本（具体数量未明确说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 482 | 2025-11-06 |
Insights and advancements in molecular biology techniques in ophthalmology
2025-Oct-22, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110706
PMID:41135834
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综述 | 本文综述了眼科领域分子生物学技术的最新进展及其在眼部疾病研究中的应用 | 整合了新一代测序技术、单细胞分析和空间转录组学等前沿方法，实现了眼部疾病的高分辨率分子图谱分析 | NA | 总结分子生物学技术在眼科疾病研究中的最新进展和应用前景 | 眼部疾病及其分子机制 | 分子生物学 | 眼科疾病 | 新一代测序，单细胞分析，空间转录组学，流式细胞术，质谱分析，代谢组学 | NA | 基因组数据，转录组数据，蛋白质组数据，代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 483 | 2025-11-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals oocyte-granulosa crosstalk and regulatory networks driving chicken primordial follicle assembly
2025-Oct-16, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148357
PMID:41109371
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示鸡原始卵泡组装过程中卵母细胞与颗粒细胞的互作机制和调控网络 | 首次构建鸡生殖细胞和颗粒细胞的单细胞转录组图谱，发现WNT4/β-catenin通路在卵泡组装后期的核心调控作用 | NA | 阐明鸡原始卵泡组装的调控机制 | 鸡卵巢生殖细胞和颗粒细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | UMAP, Pseudotime轨迹分析, CellChat | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 484 | 2025-11-06 |
Combined statistical-biophysical modeling links ion channel genes to physiology of cortical neuron types
2025-Oct-10, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2025.101323
PMID:41142913
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研究论文 | 开发了一种结合统计和生物物理模型的混合建模方法，通过基因表达模式预测皮层神经元类型的电生理活动 | 首次将统计模型与基于Hodgkin-Huxley的机制模型相结合，通过可解释的线性稀疏回归模型将基因表达与生物物理模型参数联系起来 | 模型与数据之间存在不匹配问题，需要通过模拟推理来克服 | 建立基因表达与神经元生理特性之间的联系，理解离子通道基因在决定神经放电特性中的机制作用 | 多种皮层细胞类型的神经元 | 计算神经科学 | NA | 单细胞转录组学，多模式Patch-seq数据 | Hodgkin-Huxley模型，线性稀疏回归模型 | 基因表达数据，电生理数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 485 | 2025-11-06 |
Comprehensive multi-omics analysis identifies transferrin receptor as a therapeutic target in esophageal cancer
2025-Oct-09, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148121
PMID:41067362
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研究论文 | 通过多组学方法鉴定转铁蛋白受体作为食管癌的潜在治疗靶点 | 首次通过整合单细胞RNA测序、转录组分析和基因组关联研究，系统揭示TFRC在食管癌免疫逃逸中的关键作用机制 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，需要进一步的体内实验验证 | 识别食管癌的新型生物标志物并探索其在疾病进展中的作用 | 食管癌组织和正常组织样本 | 生物信息学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析,基因组关联研究,多重免疫荧光检测 | NA | 基因表达数据,单细胞测序数据,基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,多组学分析 | NA | NA |
| 486 | 2025-11-06 |
Stage-specific regulation by autophagy-related transcription factors drives hematopoietic stem cell formation
2025-Oct, Autophagy
IF:14.6Q1
DOI:10.1080/15548627.2025.2551671
PMID:40878056
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和metaTF分析揭示了自噬相关转录因子在小鼠造血干细胞发育不同阶段的调控机制 | 首次结合单细胞RNA测序与metaTF分析，系统解析了造血干细胞发育过程中自噬相关转录因子的阶段特异性调控网络 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探索自噬相关转录因子在造血干细胞发育过程中的调控机制 | 小鼠造血干细胞发育过程中的六个连续阶段，包括主动脉-性腺-中肾区域、胎肝和成年骨髓 | 单细胞组学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序, metaTF分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠胚胎期E10.5、E12.5、E14.5及成年期多个发育阶段的造血干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 487 | 2025-11-06 |
RELA Haploinsufficiency Manifesting as an Atypical Phenotype of Crohn's Disease
2025-Oct-01, Inflammatory bowel diseases
IF:4.5Q1
DOI:10.1093/ibd/izaf159
PMID:40876844
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研究论文 | 本研究通过基因测序和免疫分析揭示RELA单倍体不足导致克罗恩病样非典型表型的机制 | 首次将RELA单倍体不足与克罗恩病样胃肠道表现相关联，并通过多组学分析揭示其免疫机制 | 仅研究单一病例，需要更大样本量验证 | 表征由RELA单倍体不足驱动的非典型克罗恩病样表型的临床、基因组和免疫学特征 | 一名17岁男性患者，患有全肠型克罗恩病、肛周瘘管、慢性皮肤黏膜念珠菌病和慢性淋巴细胞减少症 | 医学遗传学 | 克罗恩病 | 全外显子组测序,Sanger测序,蛋白质建模,Western blotting,免疫荧光,核提取物NF-κB激活测定,质谱流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据,蛋白质数据,单细胞转录组数据 | 1例患者及对照样本 | NA | 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 488 | 2025-11-06 |
A Single-Cell Atlas of Transcriptome Changes in the Intestinal Epithelium at the Suckling-to-Weaning Transition in Male Rabbits
2025-Sep-02, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101628
PMID:40907661
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了雄性兔子肠道上皮在哺乳到断奶过渡期的细胞类型特异性转录组变化 | 提供了首个兔子肠道上皮单细胞图谱，发现兔子是研究BEST4+上皮细胞的理想模型（小鼠缺乏此类细胞），并揭示了固体食物摄入对上皮防御系统和细胞分化的重塑作用 | 研究仅针对雄性兔子，未包括雌性样本；研究聚焦于盲肠区域，未涵盖整个肠道 | 识别固体食物摄入诱导的肠道上皮各细胞类型的转录组变化 | 雄性兔子肠道上皮细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 年龄匹配的同窝哺乳期雄性兔子（摄入与未摄入固体食物组） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 489 | 2025-11-06 |
Interleukin-4-mediated Pro-Regenerative Cellular Reprogramming in 3-dimensional Liver Culture
2025-Sep-02, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101626
PMID:40907663
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研究论文 | 本研究利用小鼠三维肝脏切片模型探究了白细胞介素-4在肝脏细胞重编程和再生中的作用 | 首次在保留肝脏复杂细胞相互作用的三维培养系统中揭示IL-4促进肝脏再生的细胞重编程机制 | 研究基于小鼠模型，在人类肝脏中的适用性需要进一步验证 | 探究IL-4在肝脏再生中的细胞重编程作用及治疗潜力 | C57BL/6小鼠的精密切割肝脏切片，包括正常和硫代乙酰胺诱导的病变肝脏 | 单细胞生物学 | 肝坏死/肝纤维化 | 单核RNA测序，免疫组织化学染色，ATP检测 | 三维肝脏切片培养系统 | 单细胞转录组数据，蛋白质表达数据 | 8-10周龄C57BL/6小鼠的肝脏切片，包含正常和疾病模型 | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 490 | 2025-11-06 |
STEAM: Spatial Transcriptomics Evaluation Algorithm and Metric for clustering performance
2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf570
PMID:41171708
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研究论文 | 提出一种用于评估空间转录组学数据聚类性能的计算框架STEAM | 开发了首个专门针对空间转录组学数据的聚类评估算法和指标，通过机器学习分类预测方法评估聚类结果的一致性和可靠性 | NA | 解决空间转录组学数据缺乏真实标签导致的聚类验证难题 | 空间转录组学数据聚类结果 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学，空间蛋白质组学 | 机器学习分类和预测方法 | 空间转录组数据，空间蛋白质组数据 | 多个公共数据集，涵盖多细胞到单细胞分辨率、正常和病变组织 | NA | 空间转录组学，空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 491 | 2025-11-06 |
C3a-C3aR1-Mediated Interactions Between Fibroblast-Like Synoviocytes and Macrophages Promote the Progression of Rheumatoid Arthritis
2025-Jul-14, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.43319
PMID:40654154
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研究论文 | 本研究揭示成纤维样滑膜细胞通过C3a-C3aR1信号通路与巨噬细胞相互作用促进类风湿关节炎进展的机制 | 首次发现FLS与巨噬细胞通过C3a-C3aR1信号形成正反馈环路驱动滑膜炎症 | 研究主要基于小鼠胶原诱导关节炎模型，人类临床验证尚需进一步研究 | 解析类风湿关节炎滑膜中细胞相互作用机制并探索治疗新靶点 | 类风湿关节炎患者滑膜组织和小鼠关节炎模型 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 成像质谱流式技术,单细胞RNA测序 | NA | 图像,基因表达数据 | 类风湿关节炎与骨关节炎滑膜组织比较，胶原诱导关节炎小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 492 | 2025-11-06 |
Macrophage sensitivity to bexmarilimab-induced reprogramming is shaped by the tumor microenvironment
2025-May-15, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-011292
PMID:40379271
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研究论文 | 本研究通过乳腺癌患者来源的外植体培养模型，探索了肿瘤微环境对bexmarilimab诱导的巨噬细胞重编程敏感性的影响 | 首次使用患者来源的外植体培养模型系统评估bexmarilimab的治疗反应，并揭示了肿瘤微环境炎症状态是治疗敏感性的主要决定因素 | 研究基于体外模型，可能无法完全反映体内复杂的肿瘤微环境相互作用 | 探索肿瘤微环境对巨噬细胞重编程治疗bexmarilimab敏感性的影响机制 | 乳腺癌患者肿瘤组织及癌旁正常组织中的肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多重细胞因子分析,条件培养基处理 | 患者来源的外植体培养模型 | RNA测序数据,细胞因子谱数据,空间转录组数据 | 乳腺癌患者肿瘤和癌旁组织样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 493 | 2025-11-06 |
Deconvolution and phylogeny inference of diverse variant types integrating bulk DNA-seq with single-cell RNA-seq
2025, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbaf234
PMID:41169710
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研究论文 | 提出TUSV-int框架，整合bulk DNA-seq和单细胞RNA-seq数据进行去卷积和系统发育推断 | 首次整合bulk DNA-seq和scRNA-seq数据，同时处理SNV、CNA和SV多种变异类型 | scDNA-seq数据成本高且技术挑战大，限制了在大规模队列中的常规应用 | 重建克隆谱系树以研究癌症进化 | 癌症基因组数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 整数线性规划(ILP) | 系统发育推断模型 | DNA测序数据,RNA测序数据 | NA | NA | bulk DNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 494 | 2025-11-06 |
Integrating single-cell transcriptomics and whole-genome CRISPR CAS9 screen identifies a cell cluster associated with tumor dependency in triple-negative breast cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1705923
PMID:41179682
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研究论文 | 本研究整合单细胞转录组学和全基因组CRISPR筛选，识别出三阴性乳腺癌中与肿瘤依赖性相关的细胞亚群 | 首次结合单细胞转录组学与全基因组CRISPR筛选技术，系统识别三阴性乳腺癌肿瘤依赖性相关细胞亚群及其临床意义 | 研究主要基于公共数据库分析，实验验证仅限于体外细胞功能验证 | 识别三阴性乳腺癌的肿瘤依赖性基因和细胞亚群，探索新的治疗靶点 | 三阴性乳腺癌患者样本和细胞系 | 单细胞组学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA-seq, 全基因组CRISPR CAS9筛选, 基因组测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 基因组数据 | 多个公共数据库(TCGA-BRCA, METABRIC, DEPMAP)的样本数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 基因组测序 | NA | NA |
| 495 | 2025-11-06 |
Amelioration of intervertebral disc degeneration using engineered extracellular vesicle-delivered ZDHHC5 via inhibiting PANoptosis
2025 Jan-Dec, Journal of tissue engineering
IF:6.7Q1
DOI:10.1177/20417314251351011
PMID:41179831
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研究论文 | 本研究通过工程化细胞外囊泡递送ZDHHC5抑制PANoptosis来改善椎间盘退变 | 首次发现PANoptosis是椎间盘退变的关键机制，并揭示PTH预处理的细胞外囊泡通过ZDHHC5/YBX1/ZBP1轴调控PANoptosis的新机制 | 细胞外囊泡产量有限且作用机制尚未完全明确 | 开发基于细胞外囊泡的椎间盘退变无细胞治疗策略 | 人脐带间充质干细胞来源的细胞外囊泡 | 细胞治疗 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序,转录组分析 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 496 | 2025-11-06 |
Enhanced ICOS Signaling Between Dendritic Cells and T Cells Characterizes the Immune Landscape of Human Cholangiocarcinoma
2025, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/9981470
PMID:41180156
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研究论文 | 通过整合分析两个独立的单细胞RNA测序数据集，全面绘制了人类胆管癌的细胞景观和细胞间通讯网络 | 首次发现树突状细胞与T细胞间增强的ICOS信号传导是胆管癌的显著特征，并验证了ICOS-ICOSL轴在CD8+T细胞活化中的功能重要性 | NA | 探索胆管癌肿瘤微环境中的细胞相互作用和免疫调控机制 | 人类胆管癌组织样本 | 单细胞分析 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序 | CellChat分析 | 单细胞转录组数据 | 两个独立数据集（具体样本数未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 497 | 2025-11-06 |
Identification of keratinocyte-associated genes for immune characterization and drug response prediction in oral squamous cell carcinoma
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.19953
PMID:41180476
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析识别口腔鳞状细胞癌中角质形成细胞相关基因，并构建诊断模型 | 首次系统分析角质形成细胞在OSCC中的作用机制，发现KRT16、CSTA和CSTB等新型生物标志物 | 研究主要基于公共数据库数据，实验验证样本量有限 | 识别角质形成细胞相关基因用于口腔鳞状细胞癌的免疫特征分析和药物反应预测 | 口腔鳞状细胞癌组织和细胞 | 生物信息学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 加权基因共表达网络分析 | 诊断模型, 列线图 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的OSCC单细胞和批量RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 498 | 2025-11-06 |
PTGDS: As a Specific Biomarker for Septic Cardiomyopathy
2025, Infection and drug resistance
IF:2.9Q2
DOI:10.2147/IDR.S554915
PMID:41180608
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研究论文 | 本研究通过RNA测序筛选脓毒症心肌病的特异性生物标志物，发现PTGDS作为新型诊断标志物 | 首次发现PTGDS作为脓毒症心肌病的特异性生物标志物，并通过单细胞RNA测序确定其在NK细胞和T细胞中的表达定位 | 基于初步概念验证队列，样本量有限 | 筛选脓毒症心肌病的特异性生物标志物，为早期识别和预后评估提供研究靶点 | 20例脓毒症患者和10例健康志愿者的外周血样本 | 生物信息学 | 脓毒症心肌病 | RNA测序, 单细胞RNA测序, PPI分析, GO富集分析, KEGG通路分析, 生存分析, ROC曲线分析 | NA | RNA测序数据, 单细胞RNA测序数据 | 30例样本（20例脓毒症患者，10例健康志愿者） | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 499 | 2025-11-06 |
Single-cell RNA sequencing analysis reveals cell landscape and gene signatures associated with granulomatous lobular mastitis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1624640
PMID:41181111
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析肉芽肿性小叶性乳腺炎的细胞景观和基因特征 | 首次对肉芽肿性小叶性乳腺炎进行单细胞RNA测序研究，鉴定了11种主要细胞群并发现M1巨噬细胞在疾病免疫病理中的核心作用 | 样本量较小（3例患者和3例对照），需要更大规模研究验证发现 | 系统比较GLM与健康乳腺组织的免疫微环境差异，揭示疾病相关细胞亚群和关键失调基因 | 肉芽肿性小叶性乳腺炎患者和健康对照的乳腺组织样本 | 单细胞组学 | 肉芽肿性小叶性乳腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3例GLM患者和3例健康对照的乳腺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 500 | 2025-11-06 |
Correlation of immune cell subsets in the tumor microenvironment and peripheral blood with immunotherapy response in esophageal squamous cell carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1633748
PMID:41181122
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析食管鳞癌肿瘤微环境和外周血中免疫细胞亚群与免疫治疗反应的相关性 | 首次系统揭示TIM3+ CD8+ T细胞在食管鳞癌免疫治疗中的预测价值，并建立了与临床疗效的定量关联 | 样本量有限，且为回顾性研究，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 探索食管鳞癌免疫治疗反应的预测生物标志物 | 食管鳞癌患者肿瘤组织、癌旁组织及外周血样本 | 生物信息学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | Seurat分析 | 基因表达数据, 流式细胞数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |