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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
581 2026-03-27
Plasma PFDN2 suppresses head and neck squamous cell carcinoma progression by restricting CD64 on monocyte-driven inflammatory microenvironments
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过多样本孟德尔随机化分析,发现血浆蛋白PFDN2通过抑制单核细胞上的CD64来限制头颈部鳞状细胞癌的进展 首次通过整合大规模血浆蛋白质组学、免疫细胞表型和HNSC数据,利用孟德尔随机化方法确定了PFDN2-CD64轴在HNSC中的因果保护作用,并综合运用单细胞RNA测序、虚拟敲除模型和分子模拟等多种技术进行验证 孟德尔随机化分析依赖于遗传变异作为工具变量,可能存在多效性或连锁不平衡等混杂因素;研究结论主要基于观察性数据和计算模拟,需要进一步的实验和临床研究验证 探究系统性血浆蛋白对免疫调节和头颈部鳞状细胞癌易感性的因果贡献,并识别潜在的预后生物标志物和治疗靶点 头颈部鳞状细胞癌(HNSC),重点关注血浆蛋白PFDN2和单核细胞上的CD64(FCGR1A) 生物信息学与计算生物学 头颈部鳞状细胞癌 孟德尔随机化分析,单细胞RNA测序,分子对接模拟,分子动力学模拟,免疫荧光染色,组织学评估 scTenifoldKnk虚拟敲除模型,多种反卷积算法 血浆蛋白质组学数据,免疫细胞表型数据,单细胞RNA测序数据,临床组织样本数据 大规模血浆蛋白质组学数据(涉及4907种血浆蛋白),临床HNSC标本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
582 2026-03-25
Transient ER stress cell-autonomously promotes beta cell cycling in mice
2026-May, Diabetologia IF:8.4Q1
研究论文 本研究通过转基因小鼠模型发现,短暂的内质网应激可自主促进小鼠β细胞增殖 揭示了转基因过表达、内质网应激、葡萄糖与β细胞周期激活之间的新联系 研究主要基于小鼠模型,人体β细胞的响应可能不同 探究内分泌胰腺实验性低血管化恢复是否能触发小鼠β细胞增殖 转基因小鼠的胰腺β细胞 细胞生物学 糖尿病 单细胞RNA测序, 定量RT-PCR, 免疫染色 转基因小鼠模型 基因表达数据, 图像数据 未明确说明具体样本数量,涉及转基因小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
583 2026-03-25
FOXE1 promotes the progression of pulp inflammation by activating PANoptosis in dental pulp cells
2026-Apr-17, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究揭示了FOXE1通过激活牙髓细胞中的PANoptosis来促进牙髓炎症进展的机制 首次在牙髓炎症中鉴定出PANoptotic牙髓细胞簇,并发现FOXE1是调控该过程的关键转录因子 未明确FOXE1调控PANoptosis的具体下游信号通路 探究PANoptosis在牙髓炎中的作用及调控机制 牙髓细胞、临床牙髓炎样本、小鼠实验性牙髓炎模型 单细胞组学 牙髓炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 人类临床牙髓炎样本、原代培养牙髓细胞、小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
584 2026-03-25
Single-cell resolution spatial transcriptomic signature of the retrosplenial cortex during memory consolidation
2026-Apr, Molecular psychiatry IF:9.6Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学揭示了学习后压后皮层在空间记忆巩固过程中的分子特征和细胞类型特异性变化 首次在单细胞分辨率下解析了空间记忆巩固过程中压后皮层的转录组特征,并揭示了在阿尔茨海默病小鼠模型中学习诱导的神经元激活减少 研究主要基于小鼠模型,结果向人类转化的普适性有待验证;化学遗传学干预的时间窗口和特异性可能存在局限 探究压后皮层在空间记忆巩固过程中的转录组学变化及其在阿尔茨海默病中的异常 小鼠压后皮层神经元,特别是兴奋性神经元亚型 空间转录组学 阿尔茨海默病及相关痴呆 空间转录组学,化学遗传学,深度学习计算工具 深度学习模型 空间转录组数据,基因表达数据 未明确说明具体样本数量,但涉及正常成年小鼠和ADRD模型小鼠 10x Genomics 空间转录组学 Xenium Xenium空间转录组学平台,用于解析细胞类型和兴奋性神经元层特异性的基因表达变化
585 2026-03-25
Genetic and chemical correction of cystic fibrosis reduces airway susceptibility to SARS-CoV-2
2026-Apr-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
研究论文 本研究利用iPSC衍生的囊性纤维化气道模型,探究CFTR调节剂ETI如何降低CF和非CF气道对SARS-CoV-2感染的易感性 首次在iPSC衍生的CF气道模型中揭示CFTR调节剂ETI通过增强I型干扰素信号和抗病毒基因表达,降低SARS-CoV-2感染和炎症反应 研究主要基于体外iPSC模型,需进一步在体内或临床环境中验证ETI的保护作用 探究CFTR调节剂ETI如何降低CF和非CF气道对SARS-CoV-2感染的易感性 囊性纤维化患者及iPSC衍生的CF和非CF气道上皮细胞 细胞生物学 囊性纤维化 单细胞RNA测序 iPSC衍生的气道上皮模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
586 2026-03-25
Integration of TWAS with single-cell and spatial transcriptomics identifies TLR1 as a susceptibility gene and therapeutic target in the breast cancer tumor microenvironment
2026-Apr, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 本研究通过整合TWAS、单细胞RNA测序和空间转录组学,识别了乳腺癌的易感基因并探讨了其在肿瘤微环境中的作用及作为治疗靶点的潜力 首次将TWAS与单细胞和空间转录组学技术结合,系统性地识别了乳腺癌易感基因,并深入分析了这些基因在肿瘤微环境中的细胞类型特异性表达及相互作用机制 研究主要基于公开数据库的汇总数据,缺乏实验验证;样本来源和种族背景可能有限,影响结果的普适性 识别乳腺癌的遗传易感基因,并探索其在肿瘤微环境中的功能机制及作为治疗靶点的可能性 乳腺癌患者组织样本及公开数据库中的eQTL和GWAS数据 数字病理学 乳腺癌 转录组范围关联研究(TWAS)、单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 基因表达数据、GWAS汇总数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
587 2026-03-25
Postnatal upregulation of cyclooxygenase-2 (COX-2) drives anatomical closure of the ductus arteriosus
2026-Apr-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和转录组分析,揭示了环氧化酶-2(COX-2)在出生后动脉导管解剖闭合中的关键驱动作用 首次在单细胞水平上识别出出生后动脉导管平滑肌细胞的转录变化,并明确COX-2作为氧化应激和血栓素A诱导的关键分子,促进平滑肌细胞增殖和导管闭合 研究主要基于小鼠模型,人体相关性需进一步验证;COX-2抑制实验仅涉及早期出生后阶段,长期效应未评估 阐明出生后动脉导管解剖闭合的分子机制,特别是平滑肌细胞的作用 小鼠动脉导管平滑肌细胞(DASMCs)及出生后动脉导管组织 单细胞生物学 心血管疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq),转录组分析,慢病毒过表达 NA 单细胞转录组数据,基因表达数据 小鼠动脉导管组织及平滑肌细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
588 2026-03-25
Exosomal miR-26a-5p From Urine-Derived Stem Cells Mitigates Renal Fibrosis via Targeting NRAS
2026-Mar-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究揭示了尿液来源干细胞外泌体中的miR-26a-5p通过靶向NRAS基因,抑制MAPK信号通路和机械微环境激活,从而缓解肾纤维化的分子机制 首次发现尿液来源干细胞外泌体中的miR-26a-5p通过靶向NRAS并抑制下游MAPK信号通路及机械信号分子(如PTK2、SRC等),从而减轻肾纤维化 NA 探究尿液来源干细胞外泌体中的miRNA是否能抑制肾纤维化及其分子机制 肾纤维化过程、尿液来源干细胞、外泌体、miR-26a-5p、NRAS基因 分子生物学 慢性肾病 miRNA高通量测序、整合转录组分析、单细胞测序分析、双荧光素酶报告基因检测 NA 测序数据、基因表达数据 NA NA 单细胞测序 NA NA
589 2026-03-25
CCR8 Expression on Regulatory T Cells Reveals Trajectories of Tissue Adaptation and Protects Against Myocardial Infarction-Induced Tissue Damage
2026-Mar-24, Circulation IF:35.5Q1
研究论文 本研究揭示了心肌梗死后心脏内调节性T细胞的组织适应轨迹,并发现CCL1-CCR8轴对于Treg的募集和功能至关重要,从而保护心肌免受损伤 首次描绘了Treg从纵隔淋巴结到心脏的分化轨迹,并确立了CCL1-CCR8轴作为Treg募集和发挥心脏保护功能的关键通路 研究主要基于小鼠模型,人类样本的验证仍需进一步扩大样本量以确认临床普适性 探究心肌梗死后心脏特异性调节性T细胞的发育轨迹、募集机制及其在心脏修复中的作用 小鼠心肌梗死模型、调节性T细胞、CCR8和CCL1基因修饰小鼠、以及心肌梗死患者的血液和心脏组织 免疫学 心血管疾病 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA RNA测序数据 涉及多种基因修饰小鼠模型及人类心肌梗死患者样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
590 2026-03-25
In Situ Needle-Free Injection of Multiretention Micelles for Melanoma Therapy with Multiomics Insights into Tumor Targeting and Immune Modulation
2026-Mar-24, ACS nano IF:15.8Q1
研究论文 本文报道了一种用于黑色素瘤治疗的无针原位注射多滞留纳米胶束平台,并通过多组学分析揭示了其靶向肿瘤和调节免疫的双重作用机制 开发了一种结合热触发局部沉积、pH响应释放和叶酸受体靶向的多滞留纳米胶束,并首次采用无针注射方式递送,同时利用单细胞测序、空间转录组学和蛋白质组学等多组学技术深入解析了其直接抑制肿瘤和重塑免疫微环境的双重作用机制 NA 开发一种新型的黑色素瘤治疗策略,旨在提高紫杉醇的局部暴露、减少全身毒性并增强抗肿瘤效果 黑色素瘤 数字病理学 黑色素瘤 单细胞测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
591 2026-03-25
AutoGERN: Single-Cell RNA-Seq Gene Regulatory Network Inference via Explicit Link Modeling and Adaptive Architectures
2026-Mar-24, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文提出了AutoGERN,一种基于图神经网络(GNN)的框架,专门用于从单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据中推断基因调控网络(GRN) AutoGERN通过显式建模调控信息、学习表达性链接嵌入,并采用双消息传递空间和自适应架构搜索,提高了GRN推断的性能和鲁棒性 未在摘要中明确提及 开发一种能够从scRNA-seq数据中准确推断基因调控网络的方法 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 图神经网络(GNN),多层感知机(MLP) 基因表达数据 多个真实scRNA-seq数据集(未指定具体数量) NA 单细胞RNA-seq NA NA
592 2026-03-25
KIF11 prevents retinal endothelial ferroptosis in familial exudative vitreoretinopathy by inhibiting phosphorylation-driven PRDX1 phase separation
2026-Mar-24, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究阐明了家族性渗出性玻璃体视网膜病变中β-catenin/KIF11/PRDX1轴通过诱导铁死亡导致血管缺陷的分子机制 首次揭示了KIF11通过抑制PRDX1磷酸化驱动的液-液相分离来防止视网膜内皮细胞铁死亡,并提出了靶向铁死亡和抗氧化策略作为潜在疗法 研究主要基于小鼠模型,其结论在人类患者中的直接适用性仍需进一步验证 探究家族性渗出性玻璃体视网膜病变的下游致病机制 视网膜内皮细胞 数字病理学 视网膜病变 bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 多组学研究 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
593 2026-03-25
Integrated single-cell and bulk transcriptomic analysis identifies epithelial cell-related biomarkers and immune subtypes in focal segmental glomerulosclerosis
2026-Mar-24, International urology and nephrology IF:1.8Q3
研究论文 本研究通过整合单细胞和bulk转录组数据,鉴定了局灶节段性肾小球硬化症中上皮细胞相关的生物标志物和免疫亚型 首次整合单细胞和bulk转录组数据系统分析FSGS中上皮细胞相关的分子改变,并构建了具有高诊断准确性的三基因标志物 分析基于公共数据集,需要进一步的实验验证来确认其机制相关性 鉴定FSGS中上皮细胞相关的生物标志物和免疫亚型,以改善诊断和患者分层 局灶节段性肾小球硬化症患者 生物信息学 肾脏疾病 RNA-seq 随机森林, 支持向量机 转录组数据 多个公共数据集(GSE200818, GSE200828, GSE176465, GSE133288, GSE108109) NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
594 2026-03-25
Adipose tissue microvascular is linked to insulin resistance and lipidome alterations in treated HIV
2026-Mar-24, AIDS (London, England)
研究论文 本研究探讨了接受当代抗逆转录病毒治疗的HIV感染者中,皮下脂肪组织微血管重塑与胰岛素抵抗及血浆脂质组改变之间的关联 首次在长期接受当代ART且病毒抑制的HIV感染者中,结合单细胞RNA测序分析脂肪组织细胞组成与无靶向血浆脂质组学,揭示了微血管重塑与胰岛素抵抗相关脂质特征的联系 研究为横断面观察性设计,无法确定因果关系;样本量相对有限(n=127),且女性比例较低(23%) 探究HIV感染者脂肪组织细胞组成如何影响循环脂质,并阐明其与胰岛素抵抗的关联 接受长期当代抗逆转录病毒治疗且病毒抑制的HIV感染者 单细胞组学 HIV感染 单细胞RNA测序,无靶向脂质组学分析 逻辑回归和线性回归模型 单细胞RNA测序数据,血浆脂质组学数据 127名HIV感染者(含59名进行单细胞RNA测序的腹部皮下脂肪组织样本) NA 单细胞RNA-seq NA NA
595 2026-03-25
Cytokine-driven PANoptosis of alveolar macrophages mediated by STAT1 underlies acute lung injury in hypervirulent Klebsiella pneumoniae infection
2026-Mar-24, mBio IF:5.1Q1
研究论文 本研究揭示了高毒力肺炎克雷伯菌感染通过STAT1依赖的PANoptosis导致肺泡巨噬细胞死亡,进而引发急性肺损伤的机制 首次发现高毒力肺炎克雷伯菌感染可诱导肺泡巨噬细胞发生PANoptosis(一种协同的细胞死亡过程),并阐明STAT1转录因子在此过程中的核心调控作用 研究主要基于小鼠模型,人体内的机制验证尚需进一步研究;STAT1信号通路与其他细胞死亡通路的交互作用有待深入探索 探究高毒力肺炎克雷伯菌感染导致急性肺损伤的免疫病理机制 小鼠肺泡巨噬细胞、高毒力肺炎克雷伯菌 免疫学、感染性疾病 急性肺损伤、肺炎、败血症 单细胞RNA测序(scRNA-Seq)、细胞通讯分析 NA 单细胞转录组数据 小鼠模型(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
596 2026-03-25
Novel protein biomarkers for risk stratification and personalized medicine
2026-Mar-24, Nephrology, dialysis, transplantation : official publication of the European Dialysis and Transplant Association - European Renal Association
研究论文 本研究探讨了尿液簇集蛋白和表皮生长因子作为反映肾小管损伤与修复的药效学生物标志物,在慢性肾脏病中分别对应内皮素受体拮抗剂和钠-葡萄糖协同转运蛋白2抑制剂的治疗反应 首次将尿液簇集蛋白和表皮生长因子作为机制导向的药效学生物标志物,分别用于评估内皮素受体拮抗剂和钠-葡萄糖协同转运蛋白2抑制剂在慢性肾脏病中的治疗反应,并揭示了其与不同病因、糖尿病状态及血糖控制的异质性关联 研究基于两个独立的临床试验人群,可能存在队列特异性偏差;生物标志物的长期预后价值及临床转化应用仍需进一步验证 评估尿液簇集蛋白和表皮生长因子作为慢性肾脏病治疗中机制特异性药效学生物标志物的可行性 慢性肾脏病患者 临床医学 慢性肾脏病 单细胞RNA测序 NA 尿液生物标志物测量数据、血清生物标志物数据、单细胞RNA测序数据 来自SONAR和DAPA-CKD两个随机临床试验的人群 NA 单细胞RNA-seq NA NA
597 2026-03-25
spRefine denoises and imputes spatial transcriptomic data with a reference-free framework powered by genomic language model
2026-Mar-23, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 本文提出了一种名为spRefine的深度学习框架,利用基因组语言模型对空间转录组数据进行联合去噪和插补 开发了一个无参考框架,利用基因组语言模型联合处理空间转录组数据的噪声和缺失值问题,并展示了其在数据整合、模型预训练及发现新生物学信号方面的优势 未明确提及具体局限性 解决空间转录组数据中高噪声水平和基因测量缺失的问题,以提高数据质量和下游分析效果 空间转录组数据 计算生物学/生物信息学 NA 空间转录组学 深度学习框架,基因组语言模型 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
598 2026-03-25
Integrated single-cell and spatial mapping coupled with machine learning unveils core stemness landscapes and regulatory drivers in triple-negative breast cancer
2026-Mar-23, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和大规模转录组数据,结合机器学习方法,揭示了三阴性乳腺癌中的核心干性景观和调控驱动因子 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学和机器学习算法,识别高干性细胞群体并构建基于XGBoost的风险预测模型,同时利用虚拟敲除实验验证核心基因在干性维持中的作用 未明确提及样本量或实验验证的局限性,可能缺乏大规模临床队列验证 阐明三阴性乳腺癌中癌症干细胞相关的干性特征与肿瘤进展之间的分子调控机制 三阴性乳腺癌细胞,特别是癌症干细胞群体 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,bulk转录组测序 XGBoost, hdWGCNA, Monocle3, scTour, CellChat, SHAP, scTenifoldKnk 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,bulk转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
599 2026-03-25
DyGFormer:Transformer With Resistance-Distance Bias for Semi-Supervised Cell-Type Identification
2026-Mar-23, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
研究论文 本文提出了一种名为DyGFormer的半监督模型,用于单细胞空间转录组数据中的细胞类型识别,该模型通过结合几何空间先验、自注意力机制和基于电阻距离的位置偏置来提升分类性能 提出了DyGFormer模型,该模型引入了基于电阻距离的相对位置偏置、邻居交互历史编码器以及基于三元组的度量监督,能够自适应学习细胞间连接权重并稳定跨层邻居交互 未在摘要中明确说明 开发一种半监督学习方法,以克服单细胞空间转录组数据中存在的测序噪声、平台异质性、标签覆盖不均和标注预算有限等障碍,实现准确的细胞类型识别 单细胞空间转录组数据 数字病理学 癌症 单细胞空间转录组学 Transformer 空间转录组数据 多个单细胞分辨率空间数据集(如NanoString/CosMx和MERFISH) NanoString, MERFISH 空间转录组学 CosMx, MERFISH NA
600 2026-03-25
Single-cell transcriptomics reveals a new marine parasite: Characterization and distribution of Rozellomyces from the Gulf of Alaska
2026-Mar-23, Mycologia IF:2.6Q2
研究论文 本文通过单细胞转录组学在阿拉斯加湾发现并描述了一种新的海洋寄生虫Rozellomyces,揭示了其在生态系统中的多样性和分布 首次利用单细胞转录组学技术从阿拉斯加湾分离并鉴定出一种新的Rozellomycota门寄生虫,建立了新属,并基于宏数据库分析其地理分布 研究仅基于单一分离株,可能未完全代表该寄生虫的多样性;地理分布分析依赖于数据库中的ASV数据,可能存在偏差 探索海洋生态系统中寄生虫的多样性、分布及其生态角色,特别是针对Rozellomycota门这一研究不足的谱系 从阿拉斯加湾分离的Rozellomycota门寄生虫(新属Rozellomyces)及其宿主硅藻 微生物学 NA 单细胞转录组学,系统基因组学分析(基于238个基因),扩增子序列变异(ASV)分析 NA 转录组数据,序列数据 单一分离株(来自阿拉斯加湾),结合metaPR数据库中的ASV数据 NA NA NA NA
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