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当前共找到 38047 篇文献，本页显示第 441 - 460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2026-03-30 |
Population-level comparisons of gene regulatory networks modeled on high-throughput single-cell transcriptomics data
2024-03, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-024-00597-5
PMID:38438786
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SCORPION的工具，用于从单细胞/核RNA测序数据重建可比较的基因调控网络，以支持群体水平的比较 | SCORPION利用消息传递算法和相同基线先验，克服了数据稀疏性和细胞异质性，在合成数据上优于12种现有基因调控网络重建技术，并能准确识别野生型和转录因子扰动细胞间的调控网络差异 | 未在摘要中明确提及 | 开发一种工具，用于从单细胞转录组学数据重建可比较的基因调控网络，以进行群体水平的比较 | 单细胞/核RNA测序数据，特别是来自结直肠癌和相邻健康组织的200,436个细胞 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 消息传递算法 | 单细胞转录组学数据 | 200,436个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 442 | 2026-03-30 |
Extracting, filtering and simulating cellular barcodes using CellBarcode tools
2024-02, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-024-00595-7
PMID:38374363
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研究论文 | 本文介绍了CellBarcode工具包及其条形码模拟套件CellBarcodeSim，用于从批量或单细胞测序数据中高效、灵活地提取和过滤多种条形码类型 | 开发了支持多种条形码类型和分析策略的通用工具，并提供了条形码模拟功能以优化识别过程 | 未明确提及具体的技术限制或性能边界 | 提高DNA细胞条形码识别的准确性和可重复性 | DNA细胞条形码 | 生物信息学 | NA | PCR和测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞测序, 批量测序 | NA | NA |
| 443 | 2026-03-30 |
ΔNp63 Regulates Homeostasis, Stemness, and Suppression of Inflammation in the Adult Epidermis
2024-01, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.07.005
PMID:37543242
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研究论文 | 本研究揭示了ΔNp63在成年表皮中调控角质形成细胞增殖、自我维持及抑制炎症的关键作用 | 首次阐明ΔNp63在成年表皮稳态中的核心调控功能，发现其缺失会引发银屑病样炎症反应，并鉴定出下游关键效应通路 | 研究主要依赖基因敲除模型，人类表皮中的验证尚不充分；单细胞测序样本量有限 | 探究ΔNp63转录因子在成年表皮稳态维持中的分子机制 | 小鼠表皮角质形成细胞 | 单细胞组学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除动物模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 444 | 2026-03-30 |
Fast intratumor heterogeneity inference from single-cell sequencing data
2022-09, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-022-00298-x
PMID:38177468
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为HUNTRESS的计算方法，用于从单细胞测序数据中推断肿瘤内异质性 | HUNTRESS方法在运行时间上具有线性与二次方的优势，且在合理条件下能高概率计算肿瘤的真实进展历史 | NA | 开发一种快速且准确的算法来推断肿瘤内异质性 | 单细胞测序数据中的基因型矩阵 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因型矩阵 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 445 | 2026-03-30 |
Proteolysis targeting chimeras (PROTACs) are emerging therapeutics for hematologic malignancies
2020-07-27, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-020-00924-z
PMID:32718354
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综述 | 本文综述了蛋白水解靶向嵌合体（PROTACs）作为新兴疗法在血液恶性肿瘤治疗中的应用潜力 | 提出利用人类全组织单细胞RNA测序数据识别造血细胞类型特异性E3连接酶，以开发肿瘤特异性PROTACs，提高治疗安全性 | NA | 总结PROTACs在血液恶性肿瘤治疗中的潜力，并讨论提高其临床安全性的策略 | 蛋白水解靶向嵌合体（PROTACs）及其在血液恶性肿瘤中的应用 | NA | 血液恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 446 | 2026-03-29 |
Tubulointerstitial inflammation in glomerular diseases: mechanistic pathways, prognostic value, and translational therapeutic targets
2026-Dec, Renal failure
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/0886022X.2026.2646426
PMID:41876962
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综述 | 本文系统综述了肾小球疾病中肾小管间质炎症的致病机制、预后意义及其作为转化治疗靶点的潜力 | 倡导从以肾小球为中心的框架转向肾小球-间质系统的视角，并强调了AI增强数字病理学、空间转录组学等新兴技术在精细表征间质免疫-纤维化微环境中的应用 | 指出肾小管间质炎症的独立预后意义在不同疾病和人群中仍不一致，且方法学上的差异（如定义、评分系统和协变量调整）是造成这些不一致的主要原因 | 阐明肾小球疾病中肾小管间质炎症的致病通路、预后价值及作为转化治疗靶点的潜力 | 肾小球疾病中的肾小管间质炎症 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学，成像技术 | NA | 病理图像，转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 447 | 2026-03-29 |
Construction of TLS-related gene signature for predicting prognosis and immunotherapy response in hepatocellular carcinoma
2026-Apr-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000925
PMID:41894176
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研究论文 | 本研究构建了三级淋巴结构相关基因特征（TLSRS），用于预测肝细胞癌患者的预后和免疫治疗反应 | 首次开发了基于三级淋巴结构相关基因的预后和免疫治疗反应预测模型，并利用单细胞、空间转录组学等技术验证了基因与TLS的关联 | 研究基于回顾性数据，需要前瞻性临床验证；基因特征的普适性需在更多独立队列中验证 | 预测肝细胞癌患者的预后和免疫治疗反应，推动精准医疗发展 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 差异基因表达分析、加权相关网络分析、LASSO回归、GSEA、单细胞RNA-seq、空间转录组学、免疫组化、多重免疫荧光 | LASSO回归模型 | 基因表达数据、单细胞数据、空间转录组数据、免疫组化图像 | 未明确指定样本数量，涉及肝细胞癌患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 448 | 2026-03-29 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Chemotherapy-Induced Changes in Osteosarcoma With a Pyroptosis-Related Gene-Based Prognostic Model
2026-Apr, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71110
PMID:41896410
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析化疗诱导的骨肉瘤变化，并基于焦亡相关基因构建了一个预后模型Pyroscore | 首次在单细胞水平上系统分析化疗对骨肉瘤细胞亚群和肿瘤微环境的影响，并开发了基于焦亡相关基因的预后模型Pyroscore，该模型整合了101种机器学习算法进行验证 | 研究未明确说明样本来源和数量细节，且模型验证可能受限于现有数据集 | 探究化疗对骨肉瘤细胞亚群和分子通路的影响，并开发预后模型以改善患者治疗策略 | 骨肉瘤细胞及其微环境中的各种细胞亚群 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法（包括BAK1、CASP1、CASP5、CASP6等基因的整合模型） | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 449 | 2026-03-29 |
Single-nucleus multiomic profiling of the aging mouse substantia nigra reveals conserved gene alterations linked to Parkinson's disease
2026-Mar-27, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.281113.125
PMID:41781332
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研究论文 | 本研究通过对小鼠黑质进行单核多组学测序，揭示了衰老过程中与帕金森病相关的保守基因变化 | 首次使用单核多组学测序技术，在细胞类型特异性水平上描绘了小鼠黑质在整个生命周期中的转录组和表观基因组变化，并整合了多个公共PD单细胞RNA-seq数据集，识别出85个在衰老和PD中一致差异表达的基因 | 研究基于小鼠模型，其结果向人类PD的转化需要进一步验证；样本量相对有限 | 阐明衰老与帕金森病病理之间的具体联系机制 | 小鼠黑质中的细胞 | 单细胞基因组学 | 帕金森病 | 单核多组学测序 | NA | 转录组和表观基因组数据 | 40,125个细胞 | NA | 单核多组学测序，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 450 | 2026-03-29 |
Application of GBD 2021 and multiple omics to reveal the association and potential mechanism between glycated hemoglobin and intervertebral disc degeneration
2026-Mar-27, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05208-w
PMID:41893906
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研究论文 | 本研究整合全球疾病负担数据、孟德尔随机化分析、多组学数据和单细胞转录组学，全面揭示了糖化血红蛋白与椎间盘退变之间的关联及潜在机制 | 首次通过整合全球流行病学数据、孟德尔随机化因果推断、多组学整合分析及单细胞转录组学，系统揭示了HbA1c与IVDD的因果关系，并鉴定了五个关键HbA1c相关基因及其在椎间盘退变中的细胞特异性作用 | 研究主要基于公共数据库和已有测序数据，缺乏实验验证；单细胞分析样本量有限；药物靶向预测需进一步实验确认 | 阐明糖化血红蛋白对椎间盘退变的因果影响，鉴定关键相关基因并探索其分子机制及潜在治疗靶点 | 全球人群糖尿病与腰痛流行病学数据、椎间盘退变相关基因组数据、人髓核组织单细胞转录组数据 | 生物信息学与多组学整合分析 | 椎间盘退变 | 孟德尔随机化分析、全基因组关联研究、RNA测序、单细胞RNA测序、分子对接 | NA | 流行病学数据、基因组数据、转录组数据、单细胞转录组数据 | 全球人群流行病学数据、大型GWAS汇总统计数据、单细胞RNA测序人髓核组织样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 451 | 2026-03-29 |
Analysis and validation of mast cells and enriched genes in colorectal cancer with liver metastasis by multi-omics data
2026-Mar-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04916-2
PMID:41894110
|
研究论文 | 本研究通过多组学数据分析，探讨了肥大细胞在结直肠癌肝转移中的作用，并构建了基于肥大细胞富集基因的预测模型 | 首次结合bulk-seq和scRNA-seq数据，系统分析肥大细胞在结直肠癌肝转移中的比例变化，并鉴定出三个关键基因构建预测模型 | 样本量相对有限（223个样本），且未深入探讨肥大细胞影响肝转移的具体分子机制 | 确定肥大细胞及其富集基因在结直肠癌肝转移中的作用 | 结直肠癌患者组织样本（包括原发灶和肝转移灶） | 生物信息学 | 结直肠癌 | 多组学数据分析、CIBERSORT算法、scRNA-seq、免疫组化 | 预测模型（基于基因表达） | 基因表达数据、单细胞RNA-seq数据、临床数据 | 223个样本（来自四个bulk-seq数据集），外加scRNA-seq数据集和临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 452 | 2026-03-29 |
Hypergraph Representations of Single-Cell RNA Sequencing Data for Improved Cell Clustering
2026-Mar-27, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag148
PMID:41896196
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研究论文 | 本文提出了一种将单细胞RNA测序数据表示为超图的新方法，并开发了两种新的聚类算法，以提高细胞类型识别的准确性 | 首次将单细胞RNA测序数据表示为超图以捕获高阶信息，并提出了两种新的超图随机游走聚类算法（DIPHW和CoMem-DIPHW），其中CoMem-DIPHW整合了单细胞基因表达局部信息和共表达网络全局信息 | 未明确说明算法在超大规模数据集上的计算效率，且主要针对具有弱模块性的数据展示了最大改进 | 改进单细胞RNA测序数据的细胞聚类分析，提高细胞类型分化的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 超图随机游走算法（DIPHW, CoMem-DIPHW） | 基因表达数据 | 多个真实世界数据集（人类胰腺、小鼠胰腺、人类大脑、小鼠大脑组织细胞）以及基于人类肺腺癌细胞系的真实标注数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 453 | 2026-03-29 |
Th17-driven CD8+ T cells in hUC-MSC and CAR T-cell dual immunotherapy for superior anti-tumor efficacy
2026-Mar-27, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08656-7
PMID:41896206
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研究论文 | 本研究开发了一种结合人脐带间充质干细胞与CD19 CAR-T细胞的双重细胞免疫疗法，以增强在高肿瘤负荷条件下的抗肿瘤疗效 | 首次提出并验证了hUC-MSCs与CAR-T细胞联合使用的双重免疫治疗策略，揭示了hUC-MSCs通过诱导Th17分化促进CD8+ NK样细胞毒性T淋巴细胞生成，从而增强CAR-T细胞功能并减轻CRS的新机制 | 研究主要在异种移植模型中进行，尚未在人体临床试验中验证；对hUC-MSCs作用的具体分子机制探索仍需深入 | 提高CAR-T细胞疗法在高肿瘤负荷血液恶性肿瘤中的疗效和安全性 | B细胞淋巴瘤异种移植模型、CD19 CAR-T细胞、人脐带间充质干细胞 | 细胞免疫治疗 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序、转录组分析 | NA | 转录组数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 454 | 2026-03-29 |
Single-bacterial cell insights into mechanisms of ceftriaxone resistance in Neisseria subflava
2026-Mar-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68621-y
PMID:41896210
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了奈瑟菌亚黄种在头孢曲松压力下的适应性机制，包括耐药性增强、生物膜形成和遗传重编程 | 整合实验进化和单细胞转录组学，首次在单细菌细胞水平上解析了奈瑟菌亚黄种从共生体向病原体转变的多维策略 | 研究主要基于实验室进化模型，临床样本验证有限，且未全面探讨其他环境因素对适应性的影响 | 探究抗生素压力如何驱动奈瑟菌亚黄种的适应性进化，以理解共生体向病原体转变的机制 | 奈瑟菌亚黄种（Neisseria subflava） | 微生物学与单细胞分析 | 慢性呼吸道疾病 | 全基因组测序，单细胞转录组学 | NA | 基因组数据，转录组数据 | 实验进化菌株及临床分离株 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 455 | 2026-03-29 |
HIF1 inhibition targets tumoral and myeloid cells, and is a promising therapy for metastatic castration-resistant prostate cancer
2026-Mar-27, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08590-8
PMID:41896221
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学等方法，揭示了缺氧诱导因子HIF1在转移性去势抵抗性前列腺癌中的作用，并证明其抑制是一种有前景的治疗策略 | 结合单细胞和空间转录组学揭示了Pten/Trp53缺失小鼠前列腺肿瘤的缺氧微环境及免疫细胞组成，并首次证明HIF1抑制可通过靶向肿瘤细胞和髓系细胞来克服去势抵抗并消除转移灶 | 研究主要基于小鼠模型，其在人类疾病中的直接转化仍需验证；HIF1抑制对上皮可塑性的影响有限 | 探究转移性去势抵抗性前列腺癌的分子和细胞机制，并评估HIF1抑制作为治疗策略的潜力 | Pten和Trp53失活的小鼠前列腺癌模型及其肝转移灶 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 流式细胞术, 免疫组织化学分析 | NA | 转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 456 | 2026-03-29 |
HarveST uses a heterogeneous graph learning framework to reveal spatial transcriptomics patterns
2026-Mar-27, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09841-2
PMID:41896336
|
研究论文 | 本文提出了一个名为HarveST的异构图学习框架，用于整合空间、转录组和基因-基因相互作用数据，以识别空间转录组学中的空间域和标记基因 | 开发了一个统一的异构图计算模型，结合了自监督学习和部分监督细化策略，并采用带重启的随机游走算法识别空间域特异性可变基因，支持跨连续切片的一致功能域重建 | 未在摘要中明确说明 | 提高空间转录组学数据中空间域识别和标记基因检测的准确性和生物学意义 | 人类皮层组织、小鼠嗅球和肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 肿瘤 | 空间转录组学 | 异构图学习框架 | 空间转录组数据、基因表达数据、空间位置数据 | 未在摘要中明确说明 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 457 | 2026-03-29 |
Single-cell analysis of signalling and transcriptional responses to type I interferons
2026-Mar-27, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-026-00750-3
PMID:41896367
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析，探究了人类免疫细胞对I型干扰素的信号传导和转录反应 | 首次在多种原代细胞类型中，结合质谱流式细胞术和单细胞RNA测序，系统比较了17种不同I型干扰素诱导的细胞特异性反应 | 未发现不同I型干扰素亚型之间存在质的差异反应，且研究主要基于体外刺激模型 | 阐明不同I型干扰素在人类免疫细胞中是否诱导不同的信号传导和转录反应 | 人类外周血单个核细胞（PBMCs） | 单细胞组学 | NA | 质谱流式细胞术, bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质磷酸化数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 458 | 2026-03-29 |
AI-driven body composition atlas reveals its association with NSCLC immunotherapy outcome and molecular background: a multicenter study
2026-Mar-27, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01382-5
PMID:41896593
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研究论文 | 本研究利用深度学习算法从CT图像中自动提取身体成分参数，揭示了其与非小细胞肺癌免疫治疗结果及分子背景的关联 | 首次通过AI驱动的身体成分图谱进行多中心、多维度的综合分析，并提供了生物学解释，揭示了性别差异和位置特异性 | 研究主要基于回顾性队列，前瞻性单细胞RNA-seq队列样本量较小（n=23），且结果可能存在人群特异性 | 探索身体成分参数与NSCLC免疫治疗疗效及分子机制之间的关联 | 非小细胞肺癌患者 | 计算机视觉 | 肺癌 | 深度学习算法、单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | 深度学习 | 图像、RNA-seq数据 | 2,132名NSCLC患者，包括1,919名免疫检查点抑制剂预后队列、190名bulk RNA-seq队列和23名前瞻性单细胞RNA-seq队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 459 | 2026-03-29 |
Fibroblast-like cells accumulate late in human coronary atherosclerosis contributing to necrotic core formation
2026-Mar-26, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvag002
PMID:41553378
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序验证的标记物，利用多重免疫染色和机器学习辅助细胞分类，分析了人类冠状动脉粥样硬化中不同间充质细胞亚型的时空分布及其与坏死核心形成的关系 | 首次在人类冠状动脉粥样硬化中详细绘制了间充质细胞亚型在疾病进展中的时空分布图，并揭示了成纤维样细胞在坏死核心形成中的关键作用 | 研究样本主要来自法医尸检和颈动脉内膜切除术，可能无法完全反映活体动态过程；样本量相对有限（44个动脉段） | 探究人类冠状动脉粥样硬化中不同间充质细胞亚型的积累时机、空间分布及其在疾病进程中的作用 | 人类左前降支动脉和颈动脉粥样硬化斑块样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 多重免疫染色，单细胞RNA测序验证，机器学习辅助细胞分类 | 机器学习辅助分类模型 | 组织切片图像 | 44个动脉段来自38个个体，涵盖正常内膜、适应性内膜增厚、病理性内膜增厚和纤维粥样斑块 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 460 | 2026-03-29 |
Microglia-mediated protection against Alzheimer's disease pathology and detrimental effects in white matter revealed by Ptpn6 deletion
2026-Mar-26, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2026.02.023
PMID:41895269
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研究论文 | 本研究通过删除Ptpn6基因，揭示了小胶质细胞在阿尔茨海默病中的保护作用及其在白质中的潜在有害影响 | 首次在全基因组CRISPR筛选中识别Ptpn6作为巨噬细胞存活的关键调节因子，并展示了其在阿尔茨海默病模型中对小胶质细胞的双重作用 | 研究主要基于TauPS2APP小鼠模型，可能无法完全反映人类阿尔茨海默病的复杂性，且未详细探讨Ptpn6缺失在其他神经退行性疾病中的影响 | 探究Ptpn6基因在小胶质细胞功能中的作用及其对阿尔茨海默病病理的影响 | 小胶质细胞、巨噬细胞、TauPS2APP阿尔茨海默病小鼠模型 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 全基因组CRISPR筛选、单细胞RNA测序 | TauPS2APP小鼠模型 | 基因表达数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |