单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
4661	2025-01-25	CD4+ T cells reactive to a hybrid peptide from insulin-chromogranin A adopt a distinct effector fate and are pathogenic in autoimmune diabetes 2024-10-08, Immunity IF:25.5Q1 DOI:10.1016/j.immuni.2024.07.024 PMID:39214091	研究论文	本文研究了在非肥胖糖尿病（NOD）小鼠中，CD4+ T细胞对胰岛素衍生表位的反应动态和致病性，揭示了胰岛抗原特异性T细胞的多样性和XCR1树突状细胞在其激活中的作用	首次揭示了InsC-ChgA特异性CD4 T细胞在糖尿病中的独特致病性，并展示了抗InsC-ChgA:IAg7抗体预防自发性糖尿病的潜力	研究仅限于NOD小鼠模型，未在人类中进行验证	探讨CD4+ T细胞对胰岛素衍生表位的反应在自身免疫性糖尿病中的作用	非肥胖糖尿病（NOD）小鼠的CD4+ T细胞	免疫学	糖尿病	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NOD小鼠的胰腺CD4+ T细胞
4662	2025-01-25	Cryo-PRO facilitates whole blood cryopreservation for single-cell RNA sequencing of immune cells from clinical samples 2024-Sep-19, medRxiv : the preprint server for health sciences DOI:10.1101/2024.09.18.24313760 PMID:39371152	研究论文	本文介绍了一种名为Cryo-PRO的新方法，用于从冷冻保存的全血中分离外周血单核细胞（PBMCs），以便进行单细胞RNA测序（scRNA-seq），从而减少现场处理时间并促进多中心研究	开发了Cryo-PRO方法，允许现场立即冷冻保存样本，并在中央实验室进行后续PBMC分离，显著减少了现场处理时间	研究样本量较小，仅涉及23名脓毒症患者，且仅在两个招募点进行了验证	提高单细胞RNA测序在临床样本中的可扩展性，特别是在脓毒症等复杂免疫反应疾病的研究中	脓毒症患者的外周血单核细胞（PBMCs）	数字病理学	脓毒症	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	23名脓毒症患者
4663	2025-01-25	Scalable imaging-free spatial genomics through computational reconstruction 2024-Sep-16, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.08.05.606465 PMID:39149311	研究论文	本文介绍了一种无需成像的空间转录组学方法，通过分子扩散模式计算重建空间数据	开发了一种无需成像的空间转录组学方法，利用分子扩散模式计算重建空间数据，提高了空间基因组学的可访问性和可扩展性	需要与实验数据进行比较以验证重建的准确性，且技术尚未在大规模应用中验证	开发一种无需成像的空间转录组学方法，以提高空间基因组学的可访问性和可扩展性	二维条形码阵列上的分子扩散模式	空间基因组学	NA	分子扩散模式、UMAP算法	NA	空间转录组学数据	NA
4664	2025-01-25	LMNA-Related Dilated Cardiomyopathy: Single-Cell Transcriptomics during Patient-Derived iPSC Differentiation Support Cell Type and Lineage-Specific Dysregulation of Gene Expression and Development for Cardiomyocytes and Epicardium-Derived Cells with Lamin A/C Haploinsufficiency 2024-09-03, Cells IF:5.1Q2 DOI:10.3390/cells13171479 PMID:39273049	研究论文	本文研究了与LMNA相关的扩张型心肌病（DCM），通过患者来源的诱导多能干细胞（iPSC）分化过程中的单细胞转录组学分析，支持了心肌细胞和心外膜来源细胞在Lamin A/C单倍体不足情况下的基因表达和发育失调	使用患者来源的iPSC模型，结合单细胞RNA测序技术，揭示了Lamin A/C单倍体不足在不同细胞类型和谱系中的基因表达和通路失调	研究中识别的影响表观遗传和分化的其他因素需要进一步改进模型来深入探讨	探讨LMNA相关扩张型心肌病的分子机制	患者来源的诱导多能干细胞（iPSC）及其分化过程中的心肌细胞和心外膜来源细胞	数字病理学	心血管疾病	单细胞RNA测序	iPSC模型	RNA测序数据	12个样本（4个来自患者，8个来自对照）
4665	2025-01-25	Keratin 8/18a.1 Expression Influences Embryonic Neural Crest Cell Dynamics and Contributes to Postnatal Corneal Regeneration in Zebrafish 2024-09-02, Cells IF:5.1Q2 DOI:10.3390/cells13171473 PMID:39273043	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术研究了斑马鱼早期眼睛发育过程中角蛋白中间丝基因K8和K18a.1的表达及其对神经嵴细胞动态和角膜再生的影响	首次揭示了K8和K18a.1在斑马鱼早期眼睛发育和神经嵴细胞迁移中的重要作用，并发现K18a.1的表达受视黄酸调控	研究主要基于斑马鱼模型，结果在哺乳动物中的适用性尚需进一步验证	探讨神经嵴细胞在眼部发育和再生中的机制	斑马鱼胚胎和成体角膜	发育生物学	眼科疾病	单细胞RNA测序、原位杂交、免疫荧光显微镜	NA	RNA测序数据、显微镜图像	斑马鱼胚胎和成体角膜组织
4666	2025-01-25	circRNAs as Epigenetic Regulators of Integrity in Blood-Brain Barrier Architecture: Mechanisms and Therapeutic Strategies in Multiple Sclerosis 2024-08-06, Cells IF:5.1Q2 DOI:10.3390/cells13161316 PMID:39195206	综述	本文综述了环状RNA（circRNAs）在维持血脑屏障（BBB）完整性中的作用及其在多发性硬化症（MS）中的治疗潜力	揭示了circRNAs通过细胞骨架稳定性维持BBB完整性的新机制，并探讨了其在MS治疗中的潜在应用	目前尚缺乏circRNAs在BBB损伤和功能障碍中的具体作用机制的详细实验验证	探讨circRNAs在维持BBB完整性中的作用及其在多发性硬化症中的治疗潜力	多发性硬化症（MS）患者	神经科学	多发性硬化症	空间转录组学	NA	NA	NA
4667	2025-01-25	Regulatory B Cells Expressing Granzyme B from Tolerant Renal Transplant Patients: Highly Differentiated B Cells with a Unique Pathway with a Specific Regulatory Profile and Strong Interactions with Immune System Cells 2024-07-31, Cells IF:5.1Q2 DOI:10.3390/cells13151287 PMID:39120317	研究论文	本研究旨在确定表达颗粒酶B的调节性B细胞（GZMB B细胞）在肾移植耐受患者的血液中是否富集	首次通过单细胞RNA测序分析揭示了GZMB B细胞在肾移植耐受患者中的独特转录组特征及其与免疫系统细胞的强相互作用	样本量较小（每组3例患者），可能限制结果的普遍性	研究肾移植耐受患者中GZMB B细胞的特性和功能	肾移植患者的血液样本，包括稳定功能患者、药物耐受患者和抗体介导排斥反应患者	免疫学	肾移植	单细胞RNA测序（scRNAseq）	NA	RNA测序数据	9例患者（3例稳定功能患者，3例药物耐受患者，3例抗体介导排斥反应患者）
4668	2025-01-25	Transition of signal requirement in hematopoietic stem cell development from hemogenic endothelial cells 2024-Jul-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2404193121 PMID:39042698	研究论文	本研究探讨了造血干细胞（HSCs）从造血内皮细胞（HECs）发育过程中的信号需求转变	首次在无血清和无饲养层的培养条件下，利用干细胞因子（SCF）和血小板生成素（TPO）诱导胚胎第11.5天的前造血干细胞-I（pre-HSC-I）分化为HSCs	研究中未确定从HECs诱导HSCs所需的最小因子	探索HSCs从HECs发育的分子机制	小鼠胚胎中的造血内皮细胞和前造血干细胞	细胞生物学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	胚胎第10.5天至11.5天的背主动脉及周围组织和胎肝
4669	2025-01-25	Markers of Dermal Fibroblast Subpopulations for Viable Cell Isolation via Cell Sorting: A Comprehensive Review 2024-07-17, Cells IF:5.1Q2 DOI:10.3390/cells13141206 PMID:39056788	综述	本文综述了用于通过细胞分选分离活体细胞的皮肤成纤维细胞亚群的标记物	通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和荧光激活细胞分选（FACS）技术，详细分析了成纤维细胞表面标记物，识别了多种独特的成纤维细胞亚群	NA	研究成纤维细胞表面标记物，以便进行细胞分选和后续功能研究	成纤维细胞	细胞生物学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq），荧光激活细胞分选（FACS）	NA	细胞表面标记物数据	超过三千篇研究文章
4670	2025-01-25	DNA replication in early mammalian embryos is patterned, predisposing lamina-associated regions to fragility 2024-Jun-19, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-49565-7 PMID:38898078	研究论文	本文通过单细胞测序技术揭示了哺乳动物早期胚胎中DNA复制的模式，表明晚期复制区域在受精后的第一个细胞周期中与B区室和核纤层相关联	首次展示了哺乳动物早期胚胎中DNA复制的模式，并揭示了晚期复制区域与染色体断裂的关联	研究主要基于牛和小鼠胚胎，可能不适用于所有哺乳动物	探讨哺乳动物早期胚胎中DNA复制的模式及其对基因组组织的影响	牛和小鼠的早期胚胎	基因组学	NA	单细胞测序	NA	基因组数据	牛和小鼠的早期胚胎样本
4671	2025-01-25	LMNA -Related Dilated Cardiomyopathy: Single-Cell Transcriptomics during Patient-derived iPSC Differentiation Support Cell type and Lineage-specific Dysregulation of Gene Expression and Development for Cardiomyocytes and Epicardium-Derived Cells with Lamin A/C Haploinsufficiency 2024-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.06.12.598335 PMID:38915555	研究论文	本文研究了与LMNA相关的扩张型心肌病（DCM），通过患者来源的诱导多能干细胞（iPSC）分化过程中的单细胞转录组学，支持了心肌细胞和心外膜来源细胞在Lamin A/C单倍体不足情况下的基因表达和发育的细胞类型和谱系特异性失调	使用患者来源的iPSC模型，结合单细胞RNA测序技术，揭示了Lamin A/C单倍体不足对心肌细胞和心外膜来源细胞的基因表达和发育的影响	研究中识别的影响表观遗传和分化的其他因素需要进一步改进方法来深入研究	探讨LMNA相关扩张型心肌病的分子机制	患者来源的诱导多能干细胞（iPSC）及其分化过程中的心肌细胞和心外膜来源细胞	数字病理学	心血管疾病	单细胞RNA测序	iPSC模型	RNA测序数据	12个样本（4个患者样本和8个对照样本）
4672	2025-01-25	Hyperoxia impairs induced pluripotent stem cell-derived endothelial cells and drives an atherosclerosis-like transcriptional phenotype 2024, JVS-vascular science DOI:10.1016/j.jvssci.2024.100193 PMID:38770110	研究论文	本文研究了高氧条件对诱导多能干细胞衍生的内皮细胞（iPSC-ECs）的影响，并探讨了其在血管疾病再生医学中的应用潜力	揭示了高氧条件下iPSC-ECs会发展出内皮-间质表型，并与动脉粥样硬化内皮细胞的转录表型有重叠	生理性4%氧浓度培养条件虽能改善高传代细胞的线粒体功能，但不足以保持其血管生成能力	探讨不同氧浓度对iPSC-ECs的生物能量学、细胞标志物表达、增殖和血管生成能力的影响	诱导多能干细胞衍生的内皮细胞（iPSC-ECs）	再生医学	动脉粥样硬化	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	NA
4673	2025-01-25	SGSM2 in Uveal Melanoma: Implications for Survival, Immune Infiltration, and Drug Sensitivity 2024, Protein and peptide letters IF:1.0Q4 DOI:10.2174/0109298665341953240926041613 PMID:39501960	研究论文	本研究探讨了SGSM2在葡萄膜黑色素瘤（UVM）中的表达及其与生存率、免疫浸润和药物敏感性的关系	首次揭示了SGSM2在UVM中的高表达及其与不良预后的关联，并探讨了其与免疫浸润、免疫检查点基因和药物敏感性的关系	研究主要基于生物信息学分析和实验验证，需要进一步的大样本临床研究来验证这些发现	阐明SGSM2在UVM中的作用及其临床意义	葡萄膜黑色素瘤（UVM）细胞系和患者数据	生物信息学	葡萄膜黑色素瘤	定量实时PCR（qRT-PCR）、单细胞测序	NA	基因表达数据、临床数据	UVM细胞系和TCGA数据库中的UVM患者数据
4674	2025-01-25	Integration of single-cell transcriptomics and bulk transcriptomics to explore prognostic and immunotherapeutic characteristics of nucleotide metabolism in lung adenocarcinoma 2024, Frontiers in genetics IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fgene.2024.1466249 PMID:39845190	研究论文	本研究通过整合单细胞转录组学和批量转录组学数据，探索了核苷酸代谢在肺腺癌中的预后和免疫治疗特性	首次构建了基于核苷酸代谢相关基因的预后风险模型，并验证了其在肺腺癌预后预测和免疫治疗响应中的准确性	研究主要依赖于公共数据库的转录组和临床数据，缺乏多中心验证和更大样本量的独立验证	探索核苷酸代谢在肺腺癌中的预后价值和免疫治疗特性	肺腺癌患者	数字病理学	肺癌	转录组测序	Lasso + Stepcox	转录组数据	来自TCGA和GEO数据库的肺腺癌患者数据
4675	2025-01-25	DNA replication in early mammalian embryos is patterned, predisposing lamina-associated regions to fragility 2023-Dec-26, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.12.25.573304 PMID:38234839	研究论文	本文通过单细胞测序技术揭示了哺乳动物早期胚胎中DNA复制的模式，发现晚期复制区域与核层相关联，并倾向于发生染色体断裂	首次揭示了哺乳动物早期胚胎中DNA复制的模式，并发现晚期复制区域与染色体断裂的关联	研究主要基于牛和小鼠胚胎，未涉及其他哺乳动物或人类胚胎	研究哺乳动物早期胚胎中DNA复制的模式及其对基因组稳定性的影响	牛和小鼠的早期胚胎	基因组学	NA	单细胞测序	NA	基因组数据	牛和小鼠的早期胚胎样本
4676	2025-01-25	Mural cell-derived chemokines provide a protective niche to safeguard vascular macrophages and limit chronic inflammation 2023-10-10, Immunity IF:25.5Q1 DOI:10.1016/j.immuni.2023.08.002 PMID:37652021	研究论文	本文研究了血管巨噬细胞维持机制，揭示了壁细胞通过分泌趋化因子CCL2和MIF保护巨噬细胞存活及其稳态功能，从而限制慢性炎症	发现了壁细胞通过分泌趋化因子CCL2和MIF维持血管巨噬细胞的稳态功能，并揭示了这一机制在动脉粥样硬化中的保护作用	研究主要关注动脉粥样硬化，未涉及其他慢性炎症疾病	研究血管巨噬细胞的维持机制及其在慢性炎症中的作用	血管巨噬细胞和壁细胞（周细胞和平滑肌细胞）	生物医学	动脉粥样硬化	单细胞转录组学、共培养实验、基因敲除实验	NA	图像、基因表达数据	NA
4677	2025-01-25	Endothelial CCRL2 induced by disturbed flow promotes atherosclerosis via chemerin-dependent β2 integrin activation in monocytes 2023-08-07, Cardiovascular research IF:10.2Q1 DOI:10.1093/cvr/cvad085 PMID:37279540	研究论文	本文研究了内皮CCRL2在动脉粥样硬化中的作用及其通过chemerin依赖的β2整合素激活机制	揭示了CCRL2-chemerin-β2整合素轴在动脉粥样硬化中的新机制	研究主要基于小鼠模型，临床相关性需进一步验证	探讨CCRL2及其配体chemerin在动脉粥样硬化中的作用及其机制	内皮细胞、单核细胞、ApoE-/-小鼠	生物医学	心血管疾病	scRNA-seq、Di-E-GSSG测定、邻近连接测定	小鼠模型	基因表达数据、血清数据	ApoE-/-小鼠、急性动脉粥样硬化性卒中患者和健康个体的血清样本
4678	2024-08-07	RNA visualization and single-cell transcriptomics: methods and applications 2023 Jun-Oct, Transcription DOI:10.1080/21541264.2023.2286761 PMID:38047544	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
4679	2025-01-25	Single-Cell RNA sequencing investigation of female-male differences under PAD conditions 2023, Frontiers in cardiovascular medicine IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fcvm.2023.1251141 PMID:37745110	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术探讨了在PAD条件下男女之间的差异，特别是内皮细胞在受到不同机械刺激下的基因表达变化	首次结合d-flow和硬度两个因素，研究其对内皮细胞表型的影响，并探讨了性别在这些过程中的作用	研究主要基于体外实验和动物模型，尚未在人体中进行验证	探索性别对PAD相关促动脉粥样硬化通路的影响	内皮细胞	生物信息学	心血管疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	NA
4680	2025-01-25	Low-ratio somatic NLRC4 mutation causes late-onset autoinflammatory disease 2022-08, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1 DOI:10.1136/annrheumdis-2021-221708 PMID:35428651	研究论文	本文研究了一例以关节炎、反复发热和皮疹为特征的晚发性自身炎症性疾病的遗传基础	发现了一种低比例体细胞NLRC4突变导致晚发性自身炎症性疾病，并揭示了其致病机制及潜在治疗策略	研究仅基于一例患者，样本量较小	探究晚发性自身炎症性疾病的遗传基础及致病机制	一例晚发性自身炎症性疾病患者	基因组学	自身炎症性疾病	全外显子/基因组测序、数字液滴PCR、单细胞RNA测序、细胞内细胞因子染色、定量PCR、免疫组化、Western blotting	NA	基因组数据、单细胞转录组数据	一例患者