单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
441	2025-05-15	Fitness and transcriptional plasticity of human breast cancer single-cell-derived clones 2025-May-12, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2025.115699 PMID:40359107	研究论文	通过单细胞RNA测序和细胞条形码技术，研究人类乳腺癌单细胞克隆的适应性和转录可塑性	结合表达型慢病毒细胞条形码与单细胞RNA测序，首次在体内将单细胞转录组与克隆生长直接关联	仅针对5种乳腺癌模型进行了单细胞转录组分析，样本代表性可能有限	探究乳腺癌克隆适应性和转录可塑性对肿瘤异质性的影响	26例患者来源的乳腺癌异种移植模型中的单细胞衍生克隆	癌症生物学	乳腺癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 慢病毒细胞条形码技术	NA	单细胞转录组数据	26个患者来源模型中的110个异种移植体，超过20,000个单细胞衍生克隆，167,375个单细胞RNA图谱
442	2025-05-15	Phillyrin for sepsis-related acute lung injury: A potential strategy suppressing GSK-3β 2025-May-12, Molecular immunology IF:3.2Q3 DOI:10.1016/j.molimm.2025.04.017 PMID:40359720	研究论文	研究连翘苷（PHN）通过抑制GSK-3β信号通路缓解脓毒症相关急性肺损伤（ALI/ARDS）的机制	首次发现PHN作为GSK-3β抑制剂，通过促进M2巨噬细胞极化和减少中性粒细胞募集来缓解ALI/ARDS	PHN的具体作用机制仍需进一步研究，且临床疗效尚未验证	探究PHN在脓毒症相关ALI/ARDS中的治疗作用及其分子机制	连翘苷（PHN）、GSK-3β信号通路、巨噬细胞极化、中性粒细胞募集	药理学	急性肺损伤/急性呼吸窘迫综合征（ALI/ARDS）	分子对接、分子动力学模拟、孟德尔随机化分析、单细胞测序分析	NA	基因表达数据、蛋白质活性数据	8331个ALI/ARDS相关靶基因，体外和体内实验（斑马鱼和小鼠）
443	2025-05-15	The upregulation of TNKS1 drives the phenotypic switching of vascular smooth muscle cells in aortic dissection through the activation of ferroptosis 2025-May-12, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114722 PMID:40359887	研究论文	本研究探讨了TNKS1在主动脉夹层中对人类主动脉平滑肌细胞表型转换的影响及其通过激活铁死亡的作用机制	首次揭示了TNKS1通过激活铁死亡途径驱动主动脉平滑肌细胞表型转换的新机制	研究主要基于体外实验和动物模型，临床样本验证有限	探究TNKS1在主动脉夹层发病机制中的作用	人类主动脉平滑肌细胞(HASMCs)	心血管疾病研究	主动脉夹层	单细胞RNA测序、Western blot、免疫荧光、RT-q-PCR、划痕实验、Co-IP	NA	基因表达数据、蛋白质相互作用数据	NA
444	2025-05-15	Spatial transcriptomics highlights B cells as key contributors to a complete and durable response to chemo-immunotherapy in a patient with resectable NSCLC 2025-May-11, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2025-011563 PMID:40350207	研究论文	通过空间转录组学、单细胞RNA测序和血清蛋白质组学分析，研究一名可切除NSCLC患者对化疗免疫疗法的完全病理反应和持久无事件生存	揭示了B淋巴细胞在不同成熟状态下的关键作用，并观察到治疗后原发肿瘤中三级淋巴结构的形成	仅基于单个病例的研究，结果可能需要更大样本量验证	探索化疗免疫疗法在可切除NSCLC患者中的治疗效果及其机制	一名可切除NSCLC伴同步脑转移的患者	数字病理学	肺癌	空间转录组学、单细胞RNA测序、血清蛋白质组学	NA	分子表达数据、蛋白质组数据	1名患者（包括治疗前脑转移组织和治疗后原发肺肿瘤组织）
445	2025-05-15	Integrated bioinformatic analysis identifies GADD45B as an immune-related prognostic biomarker in skin cutaneous melanoma 2025-May-11, Hereditas IF:2.1Q3 DOI:10.1186/s41065-025-00437-0 PMID:40350499	研究论文	该研究通过整合多个数据库和实验方法，全面探讨了GADD45B在皮肤黑色素瘤(SKCM)中的功能及其作为免疫相关预后生物标志物的潜力	首次系统研究GADD45B在SKCM中的作用机制，发现其可作为新型免疫检查点并促进M1型巨噬细胞极化	研究主要基于生物信息学分析和体外实验，临床样本验证有待进一步加强	探究GADD45B在皮肤黑色素瘤中的功能及其临床意义	皮肤黑色素瘤细胞系和患者样本	生物信息学	皮肤黑色素瘤	转录组测序、单细胞分析、免疫浸润分析	NA	基因表达数据	26个SKCM相关数据集、30个人类SKCM细胞系转录组数据、29个SKCM细胞系表型特征分析
446	2025-05-15	Mapping the molecular signature of ABA-regulated gene expression in germinating barley embryos 2025-May-10, BMC plant biology IF:4.3Q1 DOI:10.1186/s12870-025-06654-z PMID:40348990	研究论文	本研究通过整合转录组学、代谢组学和空间转录组学技术，揭示了ABA在发芽大麦胚胎中调控基因表达的分子特征	首次在植物组织中成功应用空间转录组学技术，实现了对胚胎不同区域基因表达的精确定位	空间转录组学技术在植物组织中的应用仍存在技术挑战	探究ABA调控大麦种子发芽的分子机制	ABA处理的大麦(Hordeum vulgare)胚胎	植物分子生物学	NA	Visium Spatial Transcriptomics (10× Genomics), RNA-seq	NA	转录组数据, 代谢组数据	六个胚胎区域
447	2025-05-15	Thioredoxin: a key factor in cold tumor formation and a promising biomarker for immunotherapy resistance in NSCLC 2025-May-10, Respiratory research IF:4.7Q1 DOI:10.1186/s12931-025-03259-w PMID:40349025	研究论文	该研究探讨了硫氧还蛋白（TXN）在非小细胞肺癌（NSCLC）中作为免疫治疗耐药性生物标志物的作用及其在冷肿瘤形成中的关键影响	发现TXN在NSCLC患者中高表达并与冷肿瘤特征相关，揭示了TXN通过调节CD40促进肿瘤免疫逃逸的新机制	研究主要基于体外细胞实验和单细胞RNA测序数据，缺乏体内动物模型的验证	探究TXN在NSCLC免疫治疗耐药性中的作用及其分子机制	非小细胞肺癌（NSCLC）患者组织样本及A549和SK-MES-1细胞系	肿瘤免疫学	肺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	NSCLC患者组织样本及两种肺癌细胞系（A549和SK-MES-1）
448	2025-05-15	Abundance of a metabolically active subpopulation in dedifferentiated adipocytes inversely correlates with body mass index 2025-May-08, Molecular metabolism IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.molmet.2025.102161 PMID:40348015	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，识别出人类脂肪细胞中一个具有独特基因表达和功能特征的亚群，该亚群与代谢活性增加相关，并与BMI呈负相关	发现了一个新的脂肪细胞亚群（C7∗），该亚群具有肌肉细胞基因特征和更高的代谢活性，且其丰度与BMI呈负相关	研究样本量较小（11名捐赠者），且机制研究仍需进一步深入	探究脂肪组织中不同亚群的细胞组成和功能特性，及其与代谢疾病（如肥胖）的关联	人类去分化脂肪细胞（DFAT）及其亚群	代谢研究	肥胖	单细胞RNA测序（10x Genomics）、FACS、批量RNA测序	NA	RNA测序数据、临床参数数据	11名人类捐赠者的脂肪细胞样本，以及1759名捐赠者的皮下脂肪组织基因表达数据
449	2025-05-15	Blocking LIF and PD-L1 enhances the antitumor efficacy of SBRT in murine PDAC models 2025-May-07, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2024-010820 PMID:40341024	研究论文	研究探讨了在鼠胰腺导管腺癌模型中，通过阻断LIF和PD-L1增强立体定向体部放疗（SBRT）的抗肿瘤效果	首次展示了LIF和PD-L1同时抑制与SBRT联合治疗的显著协同效应，并深入分析了其免疫调节机制	研究仅在鼠模型中进行，尚未进行人体临床试验	探索胰腺导管腺癌的新型联合治疗方案	鼠胰腺导管腺癌模型	肿瘤免疫治疗	胰腺癌	流式细胞术、Luminex检测、bulk RNA测序、单细胞RNA测序	鼠原位胰腺肿瘤模型	基因表达数据、免疫细胞表型数据	多个鼠胰腺肿瘤模型
450	2025-05-15	NEUROD1 efficiently converts peripheral blood cells into neurons with partial reprogramming by pluripotency factors 2025-May-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2401387122 PMID:40299704	研究论文	本研究介绍了一种优化的方法，通过外周血细胞将体细胞转化为神经元，避免了诱导多能干细胞（iPSC）中间步骤	使用NEUROD1和四种Yamanaka重编程因子的独特组合，在3周内生成谷氨酸能神经元，提供了一种非侵入性、高效、快速且便捷的方法	虽然外周血细胞提供了潜在的替代方案，但其在神经元重编程中的广泛应用仍需进一步验证	开发一种非侵入性、高效、快速且便捷的方法，将外周血细胞转化为神经元，用于神经系统疾病建模和药物发现	外周血细胞	细胞重编程	神经系统疾病	单细胞RNA测序、全基因组亚硫酸氢盐测序、Cre-LoxP系统谱系追踪	NA	基因表达数据、甲基化数据	NA
451	2025-05-15	Induced B cell receptor diversity predicts PD-1 blockade immunotherapy response 2025-May-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2501269122 PMID:40314973	research paper	该研究通过单细胞RNA测序和高清空间转录组学等方法，分析了接受抗PD-1治疗的基底细胞癌患者，发现B细胞受体（BCR）克隆多样性的诱导与PD-1抑制治疗的成功反应相关	揭示了B细胞受体克隆多样性在PD-1阻断免疫治疗反应中的动态作用，并开发了基于基线肿瘤RNA测序的机器学习模型来预测PD-1诱导的BCR克隆多样性	研究样本量有限，且需要进一步验证机器学习模型在其他癌症类型中的普适性	探索PD-1阻断免疫治疗反应的机制，并寻找预测治疗反应的生物标志物	局部晚期或转移性基底细胞癌患者，以及胶质母细胞瘤、黑色素瘤和头颈部鳞状细胞癌患者	digital pathology	basal cell carcinoma, glioblastoma, melanoma, head and neck squamous cell carcinoma	单细胞RNA测序, 高清空间转录组学, 空间免疫受体分析	machine learning model	RNA测序数据, 空间转录组数据	一组局部晚期或转移性基底细胞癌患者，以及更大规模的胶质母细胞瘤、黑色素瘤和头颈部鳞状细胞癌患者队列
452	2025-05-15	Vagus nerve modulates acute-on-chronic liver failure progression via CXCL9 2025-May-05, Chinese medical journal IF:7.5Q1 DOI:10.1097/CM9.0000000000003104 PMID:38945689	research paper	该研究揭示了迷走神经通过调控CXCL9表达在急性-慢性肝衰竭（ACLF）发展中的作用机制	首次发现迷走神经-巨噬细胞-CXCL9轴的神经免疫通讯机制在ACLF发展中的关键作用	研究主要基于小鼠模型和有限的患者样本，临床转化需要进一步验证	阐明迷走神经调控ACLF发展的分子机制	急性-慢性肝衰竭（ACLF）小鼠模型和患者样本	神经免疫学	肝病	蛋白质组学分析、scRNA-seq、流式细胞术、免疫组化/免疫荧光染色、CRISPR/Cas9技术	小鼠ACLF模型	蛋白质组数据、单细胞转录组数据、流式细胞数据、组织图像数据	ACLF小鼠模型和患者样本（具体数量未明确说明）
453	2025-05-15	Comprehensive single-cell profiling of T and B cell subsets in mice reveals impacts on memory immune responses in FMDV infection 2025-May, Virology IF:2.8Q3 DOI:10.1016/j.virol.2025.110496 PMID:40090183	研究论文	通过单细胞RNA测序技术，研究了FMDV感染对小鼠T和B细胞亚群记忆免疫反应的影响	首次全面分析了FMDV感染对记忆免疫细胞亚群的影响，并揭示了Fos相关基因的关键作用	研究仅限于小鼠模型，未在人类或其他动物模型中验证	探究FMDV感染对记忆免疫反应的影响机制	小鼠脾脏中的T和B细胞亚群	免疫学	口蹄疫	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	未明确说明的小鼠脾脏细胞样本
454	2025-05-15	Single-Cell Transcriptomics Identifies a Prominent Role for the MIF-CD74 Axis in Myasthenia Gravis Thymus 2025-May, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation DOI:10.1212/NXI.0000000000200384 PMID:40117520	研究论文	该研究通过单细胞转录组学揭示了MIF-CD74轴在重症肌无力胸腺中的重要作用	首次构建了EOMG患者胸腺淋巴细胞的单细胞转录组图谱，并揭示了MIF-CD74轴在B细胞存活信号传导中的关键作用	样本量较小(仅11例未接受免疫治疗的患者)，且仅针对早期发病的AChR抗体阳性MG患者	探究重症肌无力胸腺中B细胞增殖和存活的分子机制	11例未接受免疫治疗的早期发病AChR抗体阳性重症肌无力患者的胸腺组织	单细胞转录组学	重症肌无力	单细胞转录组测序、多重组织学染色、ELISA	NA	单细胞转录组数据、组织学图像、蛋白质浓度数据	11例EOMG患者的胸腺样本
455	2025-05-15	BDNF-GABA signaling in astrocytes: enhancing neural repair after SCI through MSC therapies 2025-May, Spinal cord IF:2.1Q1 DOI:10.1038/s41393-025-01077-x PMID:40229538	研究论文	本研究通过生物信息学分析探索星形胶质细胞在脊髓损伤（SCI）后的变化，揭示BDNF调控的GABA信号在神经元再生中的关键作用，并评估hUC-MSCs和iPS来源的MSCs在促进神经修复中的潜力	揭示了BDNF调控的GABA信号在星形胶质细胞中对神经元再生的关键作用，并评估了hUC-MSCs和iPS-MSCs通过激活该通路促进神经修复的潜力	研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证	探索SCI后星形胶质细胞的变化及其在神经修复中的作用，评估MSCs治疗的潜力	星形胶质细胞、hUC-MSCs、iPS来源的MSCs	生物信息学	脊髓损伤	scRNA-seq、空间转录组学、bulk RNA-seq、GSEA	NA	转录组数据	来自GEO数据库的scRNA-seq、空间转录组学和bulk RNA-seq数据
456	2025-05-15	Single-cell transcriptomics reveals that human milk feeding shapes neonatal immune cell interleukin signaling pathways in a nonrandomized clinical trial 2025-Apr-26, The American journal of clinical nutrition DOI:10.1016/j.ajcnut.2025.04.024 PMID:40294751	研究论文	通过单细胞转录组学分析，比较母乳喂养和配方奶喂养对新生儿免疫细胞白细胞介素信号通路的影响	首次使用单细胞RNA测序技术，揭示了母乳喂养与配方奶喂养在新生儿免疫细胞基因表达和信号通路上的差异	样本量较小（母乳喂养6例，配方奶喂养3例），且为非随机临床试验	探究母乳喂养与配方奶喂养对新生儿免疫细胞基因表达的影响	健康新生儿的外周血单个核细胞（PBMCs）	免疫学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	母乳喂养婴儿6例，配方奶喂养婴儿3例
457	2025-05-15	USP14-IMP2-CXCL2 axis in tumor-associated macrophages facilitates resistance to anti-PD-1 therapy in gastric cancer by recruiting myeloid-derived suppressor cells 2025-04-23, Oncogene IF:6.9Q1 DOI:10.1038/s41388-025-03425-w PMID:40269263	研究论文	该研究揭示了USP14-IMP2-CXCL2轴在肿瘤相关巨噬细胞中通过招募髓源性抑制细胞促进胃癌抗PD-1治疗耐药性的机制	首次揭示了USP14-IMP2-CXCL2信号轴在TAMs中驱动抗PD-1治疗耐药性的分子机制，并提出通过抑制该轴增强治疗敏感性的新策略	研究主要基于临床样本和动物模型，尚未在更大规模临床试验中验证	探究胃癌抗PD-1治疗耐药性的分子机制并寻找潜在治疗靶点	胃癌患者的肿瘤相关巨噬细胞和髓源性抑制细胞	肿瘤免疫学	胃癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	基因表达数据	来自无法手术胃癌患者的内镜活检样本
458	2025-05-15	A cohort of highly activated CD99- CD72+ B cells promoting autoimmune progression in juvenile systemic lupus erythematosus 2025-Apr-16, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114466 PMID:40090085	研究论文	研究发现了一类在青少年系统性红斑狼疮中高度激活的CD99- CD72+ B细胞亚群，这些细胞表达高水平的TLR7，并促进自身免疫反应	首次在青少年系统性红斑狼疮中鉴定出CD72 BCs这一关键过渡细胞群，揭示了其在自身抗体分泌细胞生成中的作用	研究主要基于青少年SLE患者，结果在成人SLE中的适用性需要进一步验证	探究CD72+ B细胞在系统性红斑狼疮自身免疫反应中的作用机制	青少年系统性红斑狼疮患者的B细胞亚群	免疫学	系统性红斑狼疮	单细胞RNA测序(scRNA-seq)，批量RNA测序(RNA-seq)，多组学整合分析	NA	RNA测序数据	未明确提及具体样本数量，研究对象为青少年SLE患者的B细胞
459	2025-05-15	Integration of Transcriptomic and Single-Cell Data to Uncover Senescence- and Ferroptosis-Associated Biomarkers in Sepsis 2025-Apr-11, Biomedicines IF:3.9Q1 DOI:10.3390/biomedicines13040942 PMID:40299574	research paper	该研究通过整合转录组学和单细胞数据，揭示了脓毒症中与衰老和铁死亡相关的生物标志物	首次结合WGCNA和scRNA-seq技术，识别脓毒症中铁死亡和衰老相关的关键基因，并评估其诊断潜力及药物相互作用	需要进一步的临床验证和精准医学应用研究	探索脓毒症的病理生理机制，并寻找诊断和靶向治疗的生物标志物	脓毒症患者	生物信息学	脓毒症	WGCNA, scRNA-seq, 分子对接	NA	转录组数据, 单细胞RNA测序数据	公共数据集(GSE57065, GSE65682, GSE26378)
460	2025-05-15	Radiotherapy promotes cuproptosis and synergizes with cuproptosis inducers to overcome tumor radioresistance 2025-Apr-10, Cancer cell IF:48.8Q1 DOI:10.1016/j.ccell.2025.03.031 PMID:40215978	研究论文	本研究揭示了放疗通过诱导铜依赖性细胞死亡（铜死亡）来克服肿瘤放射抗性的机制	首次发现放疗可诱导铜死亡，并揭示了铜死亡与放射抗性之间的分子机制	研究主要基于食管癌模型，其他癌症类型的适用性尚需验证	探索放疗诱导铜死亡的机制及其在克服肿瘤放射抗性中的应用	癌细胞、患者肿瘤组织、细胞系和患者来源的异种移植模型	肿瘤学	食管癌	RNA-seq、单细胞RNA-seq	NA	基因表达数据	包括放射抗性食管癌细胞、患者肿瘤组织及异种移植模型