单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 3021 - 3040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3021 | 2025-10-06 |
Novel insights in the regulation of intercalated cell differentiation
2025-Sep-01, Current opinion in nephrology and hypertension
IF:2.2Q2
DOI:10.1097/MNH.0000000000001095
PMID:40466010
|
综述 | 本文综述了肾脏闰细胞分化的分子调控机制及其在维持酸碱平衡中的关键作用 | 新发现Foxp1及其下游转录因子Dmrt2和Hmx2在闰细胞分化中的关键作用，并结合单细胞测序技术揭示了过渡细胞的存在 | NA | 阐明闰细胞分化的分子调控机制及其在酸碱平衡调节中的功能 | 肾脏闰细胞及其分化过程 | NA | 代谢性酸中毒/碱中毒 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 3022 | 2025-10-06 |
Enhancing ovarian cancer prognosis with an artificial intelligence-derived model: Multi-omics integration and therapeutic implications
2025-Sep, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102439
PMID:40580871
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于人工智能的卵巢癌预后指数模型，整合多组学数据并探索其治疗意义 | 首次构建了人工智能衍生的预后指数模型，整合了单细胞和批量RNA测序数据，并发现MFAP4基因作为潜在治疗靶点 | 研究依赖于公共数据库数据，需要进一步的前瞻性临床验证 | 开发精准的卵巢癌预后预测模型并探索其治疗应用 | 卵巢癌患者及其相关分子数据 | 机器学习 | 卵巢癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, DNA甲基化分析 | Cox回归, 机器学习集成算法 | 转录组数据, 临床数据 | 来自TCGA、ICGC和GEO数据库的多数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 3023 | 2025-10-06 |
Identification and validation of synergistic drug strategies targeting macrophage polarization in triple-negative breast cancer via single-cell transcriptomics and deep learning
2025-Sep, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102457
PMID:40580873
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学和深度学习识别并验证针对三阴性乳腺癌中巨噬细胞极化的协同药物策略 | 开发了基于巨噬细胞分化的分类器MMDCSS，并通过计算药理学发现非那雄胺可作为ZBTB20调节剂逆转肿瘤诱导的M2巨噬细胞极化 | 研究样本量相对有限（24例TNBC患者），需要进一步临床验证 | 开发针对三阴性乳腺癌免疫抑制肿瘤微环境的治疗策略 | 三阴性乳腺癌患者和巨噬细胞极化过程 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，深度学习，计算药理学 | 深度学习 | 单细胞转录组数据 | 24例三阴性乳腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3024 | 2025-10-06 |
Machine learning-guided single-cell multiomics uncovers GDF15-driven immunosuppressive niches in NSCLC: A translational framework for overcoming anti-PD-1 resistance
2025-Sep, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102459
PMID:40582068
|
研究论文 | 通过机器学习引导的单细胞多组学分析揭示GDF15驱动的免疫抑制微环境在非小细胞肺癌中的作用，并建立克服抗PD-1耐药性的转化框架 | 开发了加速斜向随机生存森林模型，在预测准确性上优于传统Cox回归和深度学习方法；首次通过单细胞多组学分析发现GDF15是调控免疫抑制肿瘤微环境的关键枢纽 | 功能研究显示GDF15敲低对肿瘤细胞固有增殖无显著影响，样本量相对有限（n=156） | 系统识别免疫检查点阻断疗效的决定因素，建立预测ICB耐药性的生物标志物 | 非小细胞肺癌患者队列（n=156）和黑色素瘤队列（GSE91061），Lewis肺癌细胞系 | 机器学习, 单细胞多组学 | 非小细胞肺癌, 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 机器学习算法比较, 功能验证实验 | 加速斜向随机生存森林, Cox回归, 深度学习 | 单细胞RNA测序数据, 临床生存数据 | 4个NSCLC队列共156例患者，外部验证使用黑色素瘤队列GSE91061 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3025 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals the role of heat shock protein 90AA1 in Müller cell proliferation via the Necroptosis/MAPK pathway in diabetic retinopathy
2025-Sep, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110508
PMID:40617280
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了热休克蛋白90AA1通过坏死性凋亡/MAPK通路调控糖尿病视网膜病变中Müller细胞增殖的作用机制 | 首次在糖尿病视网膜病变中鉴定HSP90AA1作为关键枢纽基因，并阐明其通过坏死性凋亡和MAPK信号通路调控Müller细胞增殖的新机制 | 样本量较小（4例糖尿病患者和2例非糖尿病患者），需要更大规模研究验证 | 探究HSP90AA1在糖尿病视网膜病变中Müller细胞增殖的作用机制 | 糖尿病患者视网膜样本、体内外糖尿病视网膜病变模型 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 4例糖尿病患者和2例非糖尿病患者的视网膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3026 | 2025-10-06 |
In-depth patient-specific analysis of tumor heterogeneity in melanoma brain metastasis: Insights from spatial transcriptomics and multi-region bulk sequencing
2025-Sep, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102468
PMID:40669378
|
研究论文 | 通过整合空间转录组学和多区域批量测序，对黑色素瘤脑转移瘤的肿瘤异质性进行深入分析 | 首次将空间转录组学与多区域批量外显子组、蛋白质组和转录组分析相结合，在患者个体水平上解析黑色素瘤脑转移的肿瘤异质性 | 样本量较小（仅4例患者样本），需要更大规模研究验证发现 | 深入分析黑色素瘤脑转移瘤的肿瘤异质性及其分子特征 | 黑色素瘤脑转移患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学, 批量外显子组测序, 蛋白质组分析, 转录组分析 | NA | 空间转录组数据, 外显子组数据, 蛋白质组数据, 转录组数据 | 4例黑色素瘤脑转移患者样本 | NA | 空间转录组学, 批量外显子组测序, 蛋白质组分析, 转录组分析 | NA | NA |
| 3027 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing and spatial transcriptomics reveal FAS+ T cell and autophagy-related signatures predicting chemoimmunotherapy response in diffuse large B-cell lymphoma patients
2025-Aug, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2849-2
PMID:40374987
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组学技术，揭示了FAS阳性T细胞和自噬相关特征在预测弥漫大B细胞淋巴瘤患者化疗免疫治疗反应中的作用 | 首次结合单细胞测序和空间转录组学技术，识别了FAS阳性T细胞作为DLBCL预后生物标志物，并构建了自噬相关预后模型 | 样本量相对有限，特别是单细胞测序仅包含4例DLBCL患者，需要更大规模验证 | 研究自噬相关基因在弥漫大B细胞淋巴瘤中的预后价值 | 弥漫大B细胞淋巴瘤患者和健康对照 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞测序, 空间转录组学, 蛋白质组学, 抗体芯片 | 预后风险模型 | 转录组数据, 蛋白质组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | 1,409例DLBCL患者, 531例健康对照, 4例单细胞测序, 10例空间转录组学, 110例本地队列蛋白质组数据 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 3028 | 2025-10-06 |
Embryonic mast cells arise from the Cpa3-expressing precursors but not granulocyte-monocyte progenitors
2025-Aug, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2891-1
PMID:40419842
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和遗传命运示踪模型揭示了胚胎皮肤肥大细胞的独特发育路径 | 首次鉴定出表达Cpa3的胚胎肥大细胞前体群体，并证明其发育路径独立于粒细胞-单核细胞祖细胞 | 研究主要关注胚胎期发育，成年期肥大细胞的维持和更新机制仍需进一步探索 | 阐明胚胎来源肥大细胞的发育起源和个体发生过程 | 小鼠胚胎 yolk sac、胎儿肝脏和外周组织中的肥大细胞及其前体 | 发育免疫学 | 过敏性疾病 | 单细胞RNA测序, 遗传命运示踪, 体外分化实验, 体内移植实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 胚胎期11.5至14.5天的小鼠组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3029 | 2025-10-06 |
CCR5-mediated dynamic maintenance of resident memory T cells in the respiratory tract
2025-Aug, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2920-y
PMID:40459692
|
研究论文 | 本研究通过谱系示踪和单细胞分析揭示了呼吸道驻留记忆T细胞通过CCR5介导的肺向引流淋巴结逆行迁移机制维持动态平衡 | 首次发现肺向引流淋巴结的T细胞逆行迁移现象，并鉴定CCR5-CCL5轴在这一过程中的关键作用 | 研究主要聚焦于流感感染模型，在其他病原体或组织中的普适性需要进一步验证 | 探究呼吸道驻留记忆T细胞的维持机制 | 病毒特异性CD8+T细胞 | 免疫学 | 流感感染 | 谱系示踪，单细胞转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3030 | 2025-10-06 |
Combined angiogenic and hypertrophic gene therapy enhances skeletal muscle growth
2025-Aug-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00966.2024
PMID:40622896
|
研究论文 | 本研究通过联合使用肌生成抑制素原肽和血管内皮生长因子B基因疗法，探索促进骨骼肌生理性生长和改善肌肉功能的新策略 | 首次将血管生成和肌肉肥大的基因疗法相结合，克服了单一促肌肉生长疗法导致的毛细血管稀疏等副作用 | 研究主要在健康和小鼠糖尿病模型中进行，尚未在更多疾病模型或大型动物中验证 | 开发能够同时促进肌肉生长和血管生成的联合基因疗法，以克服当前肌肉肥大治疗的局限性 | 健康小鼠和糖尿病小鼠的骨骼肌组织 | 基因治疗 | 肌肉萎缩 | 单细胞RNA测序，腺相关病毒载体基因递送 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 健康小鼠和糖尿病小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3031 | 2025-10-06 |
Human myelocyte and metamyelocyte-stage neutrophils suppress tumor immunity and promote cancer progression
2025-Aug, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-025-01145-0
PMID:40664963
|
研究论文 | 本研究揭示了人类骨髓细胞和晚幼粒细胞阶段中性粒细胞在肿瘤免疫抑制和促进癌症进展中的关键作用 | 首次将人类中性粒细胞分为三个发育阶段，发现MC&MM阶段中性粒细胞具有强免疫抑制特性，并建立了支持人类肿瘤浸润中性粒细胞重建的NCG-Gfi1 HIS小鼠模型 | 研究主要基于小鼠模型，在人类患者中的直接验证仍需进一步研究 | 探索肿瘤浸润中性粒细胞不同发育阶段的免疫调节功能及其在癌症进展中的作用 | 人类和小鼠的中性粒细胞，涵盖17种癌症类型的患者样本 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NCG-Gfi1人类免疫系统小鼠模型 | 基因表达数据 | 涵盖17种癌症类型的患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3032 | 2025-10-06 |
Transcription factors TCF4 and KLF4 respectively control the development of the DC2A and DC2B lineages
2025-Aug, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02208-5
PMID:40702338
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序等技术揭示了转录因子TCF4和KLF4分别调控DC2A和DC2B谱系发育的分子机制 | 首次明确Klf4表达可区分cDC与pDC谱系，并鉴定出两个前体DC2亚群及其特异性发育调控机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类DC细胞发育机制仍需进一步验证 | 阐明常规树突状细胞（cDC）的谱系发育和分类框架 | 小鼠常规树突状细胞（cDC）和浆细胞样树突状细胞（pDC） | 免疫学 | NA | 单细胞测序, 转录因子命运示踪模型, 条件性基因敲除模型, 过继转移 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3033 | 2025-10-06 |
DISSyphilis and the Risk of HIV Infection: A Mendelian Randomization Study
2025-Jul-30, AIDS research and human retroviruses
IF:1.5Q4
DOI:10.1089/AID.2024.0005
PMID:39086230
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化分析评估梅毒与HIV感染之间的因果关系 | 首次使用孟德尔随机化方法证实梅毒与HIV感染之间的直接因果关系，并发现RPAIN基因表达上调可能是促进HIV感染进展的关键因素 | 研究依赖于公开数据库的基因组数据，样本来源和种群代表性可能存在限制 | 评估梅毒对HIV感染的因果效应 | 梅毒和HIV感染相关的基因组数据及基因表达数据 | 生物信息学 | HIV感染 | 孟德尔随机化分析, 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究 | 加权中位数法, MR Egger法, 逆方差加权法 | 基因组数据, 基因表达数据 | 来自全基因组关联研究和GEO数据库的样本数据 | NA | 单细胞RNA测序, 全基因组关联分析 | NA | NA |
| 3034 | 2025-10-06 |
Comprehensive Insights into APOBEC Mutations in Thyroid Cancer: Prognostic and Therapeutic Discoveries
2025-Jul-26, Biological procedures online
IF:3.7Q1
DOI:10.1186/s12575-025-00288-z
PMID:40713522
|
研究论文 | 本研究系统分析了APOBEC家族突变在甲状腺癌中的分布特征、临床意义及治疗潜力 | 首次在多癌种中系统表征APOBEC突变特征，建立了基于机器学习的预后预测模型，并通过体内外实验验证APOBEC2抑制的治疗价值 | 研究主要聚焦于甲状腺癌，其他癌种的分析相对有限 | 探究APOBEC家族成员在癌症中的生物学特征和临床意义 | 甲状腺癌患者样本和动物模型 | 生物信息学 | 甲状腺癌 | 全外显子测序,靶向二代测序,RNA测序,单细胞RNA测序,Western blot,药物敏感性分析 | 机器学习模型 | 基因组数据,转录组数据,蛋白质数据 | 多个甲状腺癌队列 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 3035 | 2025-10-06 |
Extracellular vesicles from ovarian cancer cells induce senescent lipid-laden macrophages to facilitate omental metastasis
2025-Jul-26, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03612-7
PMID:40713812
|
研究论文 | 本研究揭示了卵巢癌细胞通过细胞外囊泡诱导巨噬细胞脂质积累和衰老，从而促进大网膜转移的机制 | 首次发现卵巢癌细胞来源的细胞外囊泡通过CD36介导的脂质摄取驱动巨噬细胞衰老，形成促转移微环境 | 机制研究主要基于体外实验和动物模型，需要更多临床验证 | 探索卵巢癌细胞外囊泡如何调控巨噬细胞和脂肪细胞促进大网膜转移 | 卵巢癌细胞、巨噬细胞、脂肪细胞、大网膜转移灶 | 癌症生物学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组学、蛋白质组学、脂质组学、免疫组织化学、共培养系统 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、脂质组数据、图像数据 | 临床标本和细胞系模型 | NA | 单细胞RNA-seq、蛋白质组学、脂质组学 | NA | NA |
| 3036 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics of ventral forebrain progenitors identifies Evf2 enhancer lncRNA-enhancer gene guidance through direct RNA binding and RNP recruitment domains
2025-Jul-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62205-y
PMID:40715144
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示Evf2增强子lncRNA在小鼠胚胎大脑发育中通过直接RNA结合和RNP招募结构域调控基因表达的机制 | 发现Evf2将chr6划分为短距离激活基因和长距离抑制基因区域，并识别出预测成年表型的癫痫调控基因 | 研究仅限于小鼠胚胎大脑发育阶段，未验证其他发育阶段或物种 | 探究Evf2增强子lncRNA在胚胎大脑发育中的基因调控机制 | 小鼠胚胎腹侧前脑祖细胞 | 单细胞生物学 | 神经系统疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3037 | 2025-10-06 |
In vivo efficacy of NRL knockdown with cell-penetrating siRNA in retinal degeneration
2025-Jul-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-07299-6
PMID:40715177
|
研究论文 | 本研究评估了细胞穿透性不对称小干扰RNA靶向NRL在视网膜退行性疾病中的治疗效果 | 首次使用细胞穿透性不对称小干扰RNA靶向NRL诱导杆状细胞向锥状细胞转分化，为视网膜退行性疾病提供新型治疗策略 | 在视网膜色素变性小鼠模型中功能改善相对有限，可能反映疾病晚期阶段 | 研究NRL基因敲低在视网膜退行性疾病中的治疗潜力 | C57BL/6J野生型小鼠、新生血管性年龄相关性黄斑变性小鼠模型和视网膜色素变性小鼠模型 | 基因治疗 | 视网膜退行性疾病 | 单细胞RNA测序，电生理评估 | NA | 基因表达数据，电生理数据 | 多种小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3038 | 2025-10-06 |
Targeting tumor-associated CCR2+ macrophages to inhibit pancreatic cancer recurrence following irreversible electroporation
2025-Jul-25, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adw2937
PMID:40700478
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析胰腺癌不完全不可逆电穿孔后的肿瘤免疫微环境，开发了靶向CCR2+巨噬细胞的联合疗法抑制肿瘤复发 | 首次揭示不完全不可逆电穿孔诱导CCR2+肿瘤相关巨噬细胞介导的免疫抑制微环境，并开发了巨噬细胞来源的蛋白脂质囊泡联合给药系统 | 研究基于临床前胰腺癌模型，尚未进行人体临床试验验证 | 探索胰腺癌不完全不可逆电穿孔后肿瘤复发的免疫机制并开发新型治疗策略 | 胰腺导管腺癌(PDAC)小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3039 | 2025-10-06 |
Metabolic stress and early cell death in photoreceptor precursor cells following retinal transplantation
2025-Jul-25, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04509-w
PMID:40708039
|
研究论文 | 本研究探讨了视网膜移植后光感受器前体细胞早期死亡机制，发现代谢应激是主要驱动因素 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定出代谢应激是移植后光感受器前体细胞早期死亡的关键驱动因素 | 研究使用异种移植模型，可能与人类同种移植存在差异；样本量有限 | 阐明光感受器前体细胞移植后早期死亡的机制并评估宿主视网膜反应 | 人胚胎干细胞来源的光感受器前体细胞和犬视网膜 | 数字病理学 | 视网膜退行性疾病 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学分析，多模态视网膜成像 | NA | 基因表达数据，图像数据 | 正常和退化的犬视网膜模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3040 | 2025-10-06 |
Neurons derived from NeuroD1-expressing astrocytes transition through transit-amplifying intermediates but lack functional maturity
2025-Jul-25, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adw9296
PMID:40712017
|
研究论文 | 本研究通过谱系追踪和单细胞转录组学揭示了NeuroD1驱动星形胶质细胞向神经元转化的时空限制和功能不成熟性 | 发现NeuroD1诱导的星形胶质细胞向神经元转化需经过过渡扩增中间阶段，且生成的神经元样细胞缺乏成熟神经电生理特性 | NeuroD1转化的神经元缺乏功能性成熟，限制了其在神经回路中的功能整合 | 探究NeuroD1介导的胶质细胞向神经元转化的机制和功能特性 | 转基因小鼠的星形胶质细胞和脊髓及脑部损伤核心区域的细胞 | 神经科学 | 中枢神经系统损伤 | 单细胞转录组学、谱系追踪、转基因技术 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据、电生理数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |