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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 3081 - 3100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3081 | 2025-10-06 |
Pan-cancer analysis of enhancer-induced MIR17HG and validation as a SIRT1-promoting factor in colorectal cancer
2025-Jun-30, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-025-02841-y
PMID:40586938
|
研究论文 | 通过泛癌分析揭示MIR17HG的致癌作用及其在结直肠癌中通过HSF1增强子激活的调控机制 | 首次发现HSF1通过增强子活性驱动MIR17HG过表达，并证实其通过SIRT1促进结直肠癌进展 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证相对有限 | 探索MIR17HG在癌症中的致癌作用及其调控机制 | 多种肿瘤类型及结直肠癌 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 生物信息学分析，单细胞测序，虚拟筛选 | NA | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 23种肿瘤类型和11种肿瘤类型的表达数据 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 3082 | 2025-10-06 |
Epidermal γδ T cells, CD8 T cells and macrophages are increased in number in alopecia areata and express BST2 as part of an interferon-driven antiviral gene signature
2025-Jun-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.26.661822
PMID:40667382
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现斑秃皮肤中表皮γδ T细胞、CD8 T细胞和巨噬细胞数量增加，并表达干扰素驱动的抗病毒基因标记物BST2 | 首次发现表皮γδ T细胞和巨噬细胞参与斑秃发病机制，并确定BST2作为干扰素驱动免疫激活的标志物 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 阐明斑秃发病机制中除CD4和CD8 T细胞外其他免疫细胞的作用 | C3H/HeJ小鼠斑秃模型和人类斑秃皮肤样本 | 免疫学 | 斑秃 | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3083 | 2025-10-06 |
Strain-Specific Tropism and Transcriptional Responses of Enterovirus D68 Infection in Human Spinal Cord Organoids
2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.27.661907
PMID:40666885
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析肠道病毒D68在人类脊髓类器官中的感染特性和宿主转录反应 | 首次在人类脊髓类器官模型中揭示不同EV-D68毒株的细胞嗜性差异和宿主转录反应特征 | 研究基于体外类器官模型，可能与体内真实感染情况存在差异 | 探究EV-D68感染导致急性弛缓性脊髓炎的细胞嗜性和感染动力学机制 | 人类脊髓类器官（hSCOs） | 单细胞生物学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，使用诱导多能干细胞衍生的脊髓类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3084 | 2025-10-06 |
Taurine Transporter SLC6A6 Expression Promotes Mesenchymal Stromal Cell Function
2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.24.661367
PMID:40667251
|
研究论文 | 本研究揭示了牛磺酸转运蛋白SLC6A6在间充质基质细胞功能和成骨分化中的关键作用 | 首次发现SLC6A6在MSCs中富集表达，并证明牛磺酸摄取通过Wnt/β-catenin信号通路和氧化磷酸化调节MSC功能 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究牛磺酸转运蛋白在间充质基质细胞功能维持和成骨分化中的作用机制 | 小鼠和人类原代间充质基质细胞 | 细胞生物学 | 骨骼疾病 | 单细胞RNA测序，RNA测序，shRNA敲低 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据，细胞功能数据 | 小鼠模型和人类原代MSCs | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 3085 | 2025-10-06 |
TET3 facilitates bladder cancer progression through targeted modulation of stemness pathways
2025-Jun-26, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-025-02857-4
PMID:40569530
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研究论文 | 本研究揭示TET3通过调控干细胞特性通路促进膀胱癌进展的分子机制 | 首次在膀胱癌中系统阐明TET3通过调控干细胞特性通路促进肿瘤进展的作用机制 | 未明确TET3调控干细胞特性的具体下游靶点及信号通路细节 | 探究TET3在膀胱癌进展中的作用机制及潜在治疗价值 | 膀胱癌细胞系及动物模型 | 癌症生物学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序，功能实验，体内肿瘤生长分析，组织学分析 | NA | 基因表达数据，组织图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3086 | 2025-10-06 |
Multimodal transcriptomics identifies metallothionein as a novel pathway in primary sclerosing cholangitis
2025-Jun-25, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001432
PMID:40560681
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研究论文 | 本研究通过结合空间转录组学和单核RNA测序技术，在原发性硬化性胆管炎中发现了金属硫蛋白这一新通路 | 首次在PSC中鉴定出金属硫蛋白通路，并通过多组学技术将其定位到纤维化病变边缘的特定肝细胞亚型 | 样本量相对有限，且主要使用移植肝脏样本，可能无法完全代表疾病早期阶段 | 探索原发性硬化性胆管炎的发病机制和潜在治疗靶点 | 人类肝脏移植样本和小鼠模型 | 数字病理学 | 原发性硬化性胆管炎 | 空间转录组学,单核RNA测序,免疫组织化学 | NA | 转录组数据,空间定位数据 | 23例PSC患者和7例疾病对照的肝脏样本，共分析76,664个空间位点和91,891个细胞核 | NA | 空间转录组学,单核RNA测序 | NA | NA |
| 3087 | 2025-10-06 |
A pair-rule-like transcription network coordinates neural tube closure in a proto-vertebrate
2025-Jun-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.18.660479
PMID:40666853
|
研究论文 | 本研究在尾索动物中鉴定了一个调控神经管闭合的转录网络 | 发现了一个类似体节对规则的转录网络调控神经管闭合过程 | 研究仅限于尾索动物模型，在更高等脊椎动物中的保守性需要进一步验证 | 探究神经管闭合过程中转录程序如何协调细胞行为 | 尾索动物的神经管闭合过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，HCR原位杂交 | NA | 基因表达数据，转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3088 | 2025-10-06 |
A scalable, all-optical method for mapping synaptic connectivity with cell-type specificity
2025-Jun-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.25.661552
PMID:40667305
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研究论文 | 开发了一种可扩展的全光学方法，用于绘制具有细胞类型特异性的突触连接图谱 | 结合光学扰动与观察工具和空间转录组学，实现了高灵敏度、高通量且具有细胞类型特异性的长程突触连接检测 | NA | 开发高通量方法以解析哺乳动物大脑中细胞类型特异性连接模式 | 小鼠运动皮层中超过1000个运动皮层神经元 | 神经科学 | NA | 全光学方法、遗传编码电压指示剂、空间转录组学 | NA | 光学成像数据、基因表达数据 | 超过1000个运动皮层神经元 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3089 | 2025-10-06 |
Spatially defined multicellular functional units in colorectal cancer revealed from single cell and spatial transcriptomics
2025-Jun-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2022.10.02.508492
PMID:40667258
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术揭示了结直肠癌中具有空间定义的多细胞功能单元 | 首次结合单细胞RNA测序、Slide-seq空间转录组学和多重RNA分析，构建了健康和异常结肠细胞生态系统的详细空间图谱 | 研究主要基于小鼠模型，虽然与人类数据进行了比较验证，但直接应用于人类临床仍需进一步验证 | 揭示结直肠癌中细胞的空间组织和功能相互作用 | 诱导性遗传结直肠癌小鼠模型和人类结直肠癌样本 | 空间转录组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多重RNA分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | Slide-seq | Slide-seq空间转录组技术 |
| 3090 | 2025-10-06 |
Integrating Artificial Intelligence in Next-Generation Sequencing: Advances, Challenges, and Future Directions
2025-Jun-19, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47060470
PMID:40699869
|
综述 | 探讨人工智能与二代测序技术的融合及其在基因组学研究和临床应用中的变革性影响 | 系统阐述AI在NGS全流程中的增强作用，并前瞻性地讨论AI在第三代测序中的应用及联邦学习等未来方向 | 存在数据异质性、模型可解释性和伦理问题等挑战 | 研究人工智能与二代测序技术的协同整合及其在基因组学领域的应用 | 人工智能技术与二代测序技术的整合方法及应用场景 | 机器学习 | 癌症 | 二代测序，第三代测序，单细胞测序 | CNN, RNN, 混合架构 | 基因组数据，表观基因组数据，转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，表观基因组分析，转录组学 | NA | NA |
| 3091 | 2025-10-06 |
Thymic DC2 are heterogenous and include a novel population of transitional dendritic cells
2025-Jun-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.13.659520
PMID:40666966
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示胸腺DC2细胞的异质性并鉴定新型过渡性树突状细胞群体 | 发现传统认为的DC2实际上包含4种不同细胞谱系，并首次鉴定出CX3CR1+过渡性树突状细胞新群体 | 研究主要基于小鼠模型，人类胸腺细胞异质性仍需验证 | 解析胸腺髓系细胞的起源、发育和稳态维持机制 | 胸腺髓系细胞（特别是DC2亚群） | 单细胞生物学 | 免疫系统疾病 | 单细胞转录组测序 | 谱系定义小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3092 | 2025-10-06 |
High-resolution spatial mapping of cell state and lineage dynamics in vivo with PEtracer
2025-Jun-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.15.659774
PMID:40661400
|
研究论文 | 开发了一种基于prime editing的谱系追踪技术PEtracer，能够在高空间分辨率下同时分析细胞状态和谱系关系 | 开发了兼容单细胞测序和多模态成像的进化谱系追踪技术，能够在保留组织空间结构的同时分析细胞状态和谱系动态 | NA | 绘制发育和疾病过程中细胞命运决定的时空动态图谱 | 小鼠肿瘤转移模型中的肿瘤细胞 | 空间转录组学 | 肿瘤转移 | prime editing, MERFISH空间转录组分析 | NA | 空间转录组数据, 成像数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞测序 | NA | NA |
| 3093 | 2025-10-06 |
Multimodal Spatial Profiling Reveals Immune Suppression and Microenvironment Remodeling in Fallopian Tube Precursors to High-Grade Serous Ovarian Carcinoma
2025-Jun-03, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-24-1366
PMID:39704522
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研究论文 | 通过多模态空间分析揭示输卵管前驱病变向高级别浆液性卵巢癌发展过程中的免疫抑制和微环境重塑机制 | 首次整合高plex成像和空间转录组学技术分析HGSOC发展过程中的人类组织样本，揭示了前驱病变中染色体不稳定、持续性IFN信号传导和免疫失调等分子变化 | 样本数量有限，研究结果需要在更大规模队列中验证 | 阐明输卵管前驱病变向高级别浆液性卵巢癌发展的分子机制 | 人类输卵管组织样本，包括p53特征、浆液性输卵管上皮内癌和侵袭性HGSOC | 数字病理学 | 卵巢癌 | 高plex成像，空间转录组学 | NA | 图像，空间转录组数据 | 不同HGSOC发展阶段的人类组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3094 | 2025-10-06 |
Effect of Chronic Stress on Whole Blood Transcriptome: A Meta-Analysis of Publicly Available Datasets from Rodent Models
2025-Jun-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.30.657043
PMID:40661584
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荟萃分析 | 通过荟萃分析公开数据集研究慢性应激对小鼠全血转录组的影响 | 首次对多个公开数据集进行系统性荟萃分析，结合单细胞RNA测序数据探索细胞类型特异性富集 | 仅纳入三个数据集，样本量有限(n=92)，仅使用小鼠模型 | 研究慢性应激对全血转录组的影响，为神经精神疾病的诊断和治疗提供分子见解 | 8周龄小鼠 | 转录组学 | 神经精神疾病 | 转录组分析，单细胞RNA测序 | 随机效应模型，Limma分析流程 | 基因表达数据 | 92只小鼠(45只非应激组/47只应激组) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | NA | 小鼠外周血单个核细胞单细胞RNA测序数据集 |
| 3095 | 2025-10-06 |
Reconstructing Dynamic Gene Regulatory Networks Using f-Divergence from Time-Series scRNA-Seq Data
2025-May-30, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47060408
PMID:40699807
|
研究论文 | 提出一种基于f-散度的动态基因调控网络推断方法f-DyGRN，用于从时间序列单细胞RNA测序数据重建动态基因调控网络 | 首次将f-散度应用于量化单细胞基因表达的时间变异，结合Granger因果关系模型和移动窗口策略捕捉动态调控变化 | 方法性能依赖于合适的f-散度度量选择，且仅使用THP-1细胞数据进行验证 | 从时间序列单细胞RNA测序数据推断动态基因调控网络 | THP-1人髓系单核细胞白血病细胞的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | f-DyGRN（基于f-散度的动态基因调控网络模型），Granger因果关系模型 | 单细胞RNA测序数据，时间序列数据 | 模拟数据和真实THP-1细胞单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3096 | 2025-10-06 |
Mapping Small Extracellular Vesicle Secretion Potential in Healthy Human Gingiva Using Spatial Transcriptomics
2025-Apr-07, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47040256
PMID:40699655
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研究论文 | 利用空间转录组学技术绘制健康人牙龈组织中小细胞外囊泡分泌潜力的空间分布图谱 | 首次在sEVs生物发生特定背景下对可用牙龈转录组数据进行荟萃分析，揭示了沟内上皮浅层和深层是sEVs相关基因表达最富集的区域 | 研究基于公开转录组数据，未进行实验验证；仅分析了43个已知sEVs生物发生相关基因中的12个 | 探索健康人牙龈组织中不同结构在小细胞外囊泡生物发生中的作用 | 健康人牙龈组织 | 空间转录组学 | 口腔组织再生 | 空间转录组学，基因本体分析 | NA | 转录组数据，空间基因表达数据 | 公开可用的牙龈转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3097 | 2025-10-06 |
Tissue nanotransfection-based endothelial PLCγ2-targeted epigenetic gene editing rescues perfusion and diabetic ischemic wound healing
2025-Mar-05, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.01.034
PMID:39863930
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研究论文 | 本研究通过组织纳米转染技术靶向内皮细胞PLCγ2基因的表观遗传编辑，改善糖尿病缺血性伤口的灌注和愈合 | 首次结合单细胞RNA测序指导的CRISPR-dCas9去甲基化技术与组织纳米转染技术，靶向改善糖尿病伤口内皮细胞功能 | 研究主要关注PLCγ2基因，未探讨其他可能影响糖尿病伤口愈合的基因或通路 | 改善糖尿病缺血性伤口的血管化和愈合效果 | 糖尿病缺血性伤口的内皮细胞 | 基因编辑与再生医学 | 糖尿病并发症 | 单细胞RNA测序, CRISPR-dCas9表观遗传编辑, 组织纳米转染 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据 | 人类伤口边缘样本（五个内皮细胞亚群）和鼠类糖尿病缺血伤口模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3098 | 2025-10-06 |
Unraveling enhanced liver regeneration in ALPPS: Integrating multi-omics profiling and in vivo CRISPR in mouse models
2025-Mar-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000630
PMID:40048448
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学分析和体内CRISPR技术，揭示了ALPPS手术促进肝脏再生的分子机制 | 首次结合多组学分析和体内CRISPR验证，发现Plk1相关30基因特征和miR-30a-3p在ALPPS肝脏再生中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，需要在人类样本中进一步验证 | 阐明ALPPS手术促进肝脏再生的分子机制 | 小鼠肝脏组织、肝细胞 | 多组学分析 | 肝脏疾病 | RNA-seq, microRNA-seq, scRNA-seq, CRISPR-cas9, 双荧光素酶报告系统 | 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据, microRNA数据, 单细胞数据 | PVL和ALPPS小鼠模型，fumarylacetoacetate hydrolase敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, microRNA测序 | NA | NA |
| 3099 | 2025-10-06 |
A Complete Spatial Map of Mouse Retinal Ganglion Cells Reveals Density and Gene Expression Specializations
2025-Feb-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.10.637538
PMID:39990332
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和机器学习技术，绘制了小鼠视网膜神经节细胞亚型的完整空间分布图谱 | 首次揭示了所有视网膜神经节细胞亚型的空间分布特征，发现了基因表达在背腹轴和ART区域内的意外空间变异 | 小鼠与灵长类黄斑区域的基因谱相关性有限，表明物种间中央视觉特化存在差异 | 探索视网膜神经节细胞亚型的空间分布特化和基因表达特征 | 小鼠视网膜神经节细胞 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学, 机器学习, 正面冷冻切片 | 机器学习 | 空间转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3100 | 2025-10-06 |
Promising Nanoparticles-Based Oral Therapy for Effective Inhibition of Hepatocellular Carcinoma with Portal Vein Tumor Thrombus
2025-01-29, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.4c05798
PMID:39808085
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研究论文 | 开发基于碳酸钙@聚多巴胺纳米颗粒的口服给药系统，用于治疗肝细胞癌合并门静脉癌栓 | 利用门静脉独特解剖结构和单细胞RNA测序技术开发口服纳米颗粒系统，将门静脉阻塞挑战转化为药物递送优势 | NA | 开发针对肝细胞癌合并门静脉癌栓的有效口服治疗方法 | 肝细胞癌合并门静脉癌栓患者 | 纳米医学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |