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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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3001 | 2025-10-06 |
Calcified apoptotic vesicles from PROCR+ fibroblasts initiate heterotopic ossification
2024-Apr, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.12425
PMID:38594791
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研究论文 | 本研究首次发现PROCR+成纤维细胞分泌的钙化凋亡囊泡是异位骨化的起始因子 | 首次鉴定钙化凋亡囊泡作为异位骨化的起始因子,并阐明其通过钙富集和胶原结合导致肌腱钙化硬化的机制 | NA | 探究异位骨化的起始因素及其分子机制 | 异位骨化过程中的细胞群体和细胞外基质 | 单细胞转录组学 | 异位骨化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3002 | 2025-10-06 |
Granulocytic myeloid-derived suppressor cell activity during biofilm infection is regulated by a glycolysis/HIF1a axis
2024-Feb-29, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI174051
PMID:38421730
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和代谢分析揭示了糖酵解/HIF1α轴在金黄色葡萄球菌生物膜感染中调控粒细胞性髓源抑制细胞免疫抑制功能的作用机制 | 首次发现糖酵解/HIF1α信号轴通过调控G-MDSCs代谢状态影响生物膜感染的慢性化进程 | 研究主要基于小鼠模型,临床样本验证仍需扩大 | 探究G-MDSCs代谢特征与金黄色葡萄球菌假体关节感染慢性化的关联机制 | 粒细胞性髓源抑制细胞(G-MDSCs)和金黄色葡萄球菌生物膜感染模型 | 免疫代谢学 | 假体关节感染 | 单细胞RNA测序, 生物信息学代谢算法, 条件性基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据 | PJI患者粒细胞样本和小鼠感染模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3003 | 2025-10-06 |
The origin and structural evolution of de novo genes in Drosophila
2024-Jan-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45028-1
PMID:38280868
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研究论文 | 本研究通过基因组比对和计算结构建模系统分析了果蝇谱系特异性从头基因的起源、进化和蛋白质结构演化 | 首次结合高质量全基因组比对和计算结构建模方法,系统研究果蝇谱系特异性从头基因的蛋白质结构演化规律 | 研究主要基于计算预测和序列分析,缺乏实验验证蛋白质结构和功能 | 探究果蝇中从头基因的起源和结构演化机制 | 黑腹果蝇及其近缘种中的555个从头基因候选 | 基因组学 | NA | 全基因组比对,计算结构建模,单细胞RNA-seq,祖先序列重建 | 计算结构模型 | 基因组序列,转录组数据 | 555个从头基因候选 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3004 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing analysis and multiple machine-learning models revealed the cellular crosstalk of dendritic cells and identified FABP5 and KLRB1 as novel biomarkers for psoriasis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1374763
PMID:38596682
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析和多种机器学习模型揭示了树突状细胞在银屑病中的细胞相互作用,并鉴定出FABP5和KLRB1作为新型生物标志物 | 首次发现树突状细胞通过CD70/CD27信号通路调控T细胞在银屑病炎症反应中的作用,并鉴定出FABP5和KLRB1作为新型生物标志物 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限 | 探索银屑病的发病机制并识别有价值的生物标志物 | 银屑病皮肤组织、树突状细胞、T细胞、HaCaT细胞 | 生物信息学 | 银屑病 | 单细胞测序, 机器学习, RT-qPCR, 免疫组织化学, 免疫荧光 | 多种机器学习模型 | 单细胞测序数据, 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3005 | 2025-10-06 |
Deconvolution of synovial myeloid cell subsets across pathotypes and role of COL3A1+ macrophages in rheumatoid arthritis remission
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1307748
PMID:38601143
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据,鉴定滑膜髓系细胞亚群并发现COL3A1+巨噬细胞在类风湿关节炎缓解中的潜在作用 | 首次发现COL3A1+巨噬细胞这一成纤维细胞样M2亚型在髓系病理型中富集,并揭示其通过表达抗炎因子、增强黏附和形成物理屏障缓解关节炎的机制 | 研究样本量有限(81例患者),且部分功能验证仍需进一步实验确认 | 探究单核/巨噬细胞亚群在类风湿关节炎活动中的作用及特定亚型在疾病缓解中的生物学功能 | 类风湿关节炎患者的滑膜组织和髓系细胞亚群 | 单细胞组学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, 多色免疫荧光, 流式细胞术, 免疫组化染色, 黏附实验, RT-qPCR | Liger整合算法, 反卷积分析 | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据, 流式细胞数据, 图像数据 | 81例早期关节炎队列患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
3006 | 2025-10-06 |
Integrative single-cell analysis of LUAD: elucidating immune cell dynamics and prognostic modeling based on exhausted CD8+ T cells
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1366096
PMID:38596689
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析构建了肺腺癌免疫微环境图谱,并基于耗竭CD8+ T细胞建立预后模型 | 首次整合单细胞分析揭示肺腺癌免疫细胞动态特征,基于CD8_Tex-LAYN基因建立预后模型,并发现GALNT2作为潜在治疗靶点 | 样本量相对有限(19例患者),需要在更大队列中验证模型的普适性 | 阐明肺腺癌免疫微环境特征并建立有效的预后预测模型 | 肺腺癌患者肿瘤微环境中的免疫细胞(CD8+ T细胞、CD4+ T细胞、髓系细胞等) | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,RT-PCR,细胞实验 | Cox回归模型 | 单细胞RNA测序数据,临床数据 | 19例肺腺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3007 | 2025-10-06 |
Analysis of cardiac single-cell RNA-sequencing data can be improved by the use of artificial-intelligence-based tools
2023-04-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-32293-1
PMID:37100826
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研究论文 | 本研究开发了一种基于人工智能的单细胞RNA测序数据分析工具包,用于改善心肌再生研究中的细胞类型识别和信号通路分析 | 将三种AI技术(自动编码、稀疏建模和半监督学习)整合到scRNAseq数据分析中,相比传统方法能发现更多生物学差异 | 研究仅使用了来自公共数据库的三个数据集,需要更多独立验证 | 提高单细胞RNA测序数据分析的准确性和深度,以更好地理解心肌再生机制 | 小鼠和猪的心脏细胞,特别是心肌细胞亚群 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 自动编码器, 稀疏建模, 半监督学习 | 基因表达数据 | 三个来自GEO数据库的scRNAseq数据集(包含小鼠和猪心脏细胞) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3008 | 2025-10-06 |
Ensembles of endothelial and mural cells promote angiogenesis in prenatal human brain
2022-09-29, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2022.09.004
PMID:36179668
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研究论文 | 本研究揭示了产前人类大脑中内皮细胞和周细胞协同促进血管生成的新机制 | 首次在人类产前大脑中发现内皮细胞和周细胞亚型组成的功能性集合体,并揭示其通过胶原蛋白、层粘连蛋白和中动蛋白等信号机制促进血管成熟 | 研究主要聚焦于妊娠中期的发育阶段,缺乏对其他发育时期的比较分析 | 探索产前人类大脑血管细胞成熟阶段的分子机制和细胞相互作用 | 产前人类大脑血管系统中的内皮细胞和周细胞 | 单细胞生物学 | NA | 荧光激活细胞分选, 单细胞转录组学, 组织学分析, 超微结构分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 组织图像数据 | 妊娠中期人类大脑样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3009 | 2025-10-06 |
Characterization of stem cell landscape and identification of stemness-related gene ENY2 in colorectal cancer by intergrated transcriptomic analysis
2025-Dec, Global medical genetics
IF:1.2Q4
DOI:10.1016/j.gmg.2025.100067
PMID:40735504
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组分析鉴定结直肠癌干细胞景观并发现干细胞相关基因ENY2 | 首次通过整合多组单细胞数据系统描绘结直肠癌干细胞景观,并发现ENY2作为新的干细胞相关生物标志物 | 样本量较小(仅9个原发结直肠癌样本),ENY2在结直肠癌中的研究有限 | 阐明结直肠癌干细胞异质性及其潜在机制 | 结直肠癌患者肿瘤样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据,基因表达数据 | 9个原发结直肠癌样本 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 单细胞RNA测序平台 |
3010 | 2025-07-31 |
Single-cell transcriptome analysis of in vivo and in vitro human pancreas development
2025-Nov, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101573
PMID:40735693
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
3011 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Critical Role of SEC16B in Lung Metastasis of Osteosarcoma
2025-Aug, FASEB bioAdvances
IF:2.5Q3
DOI:10.1096/fba.2024-00161
PMID:40735296
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示SEC16B在骨肉瘤肺转移中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序识别出与骨肉瘤肺转移密切相关的C1肿瘤细胞亚群,并发现SEC16B基因的下调在肺转移中起关键作用 | 样本量相对有限(6个原发肿瘤样本,2个肺转移样本,4个正常骨组织样本) | 探究骨肉瘤肺转移的分子机制并识别关键调控基因 | 骨肉瘤患者组织样本(原发肿瘤、肺转移灶)和正常骨组织 | 单细胞测序分析 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, qRT-PCR, Transwell实验 | hdWGCNA, CytoTRACE, Scissor, CellphoneDB, CSOmap | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 | 12个单细胞RNA测序样本(6原发+2转移+4正常)+ 8个批量RNA测序样本(4原发+4转移) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
3012 | 2025-10-06 |
High cGAS-STING expression associates with improved efficacy of neoadjuvant chemo-immunotherapy in head and neck squamous cell carcinoma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1584061
PMID:40735041
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研究论文 | 本研究探讨cGAS-STING表达水平与头颈鳞癌新辅助化疗免疫疗法疗效的关联 | 首次在头颈鳞癌患者中证实cGAS-STING表达与NACI疗效的正相关性,并揭示其通过增强T细胞活化和肿瘤-T细胞相互作用发挥作用的机制 | 样本量较小(38例患者),需更大规模研究验证 | 评估cGAS和STING表达作为头颈鳞癌新辅助化疗免疫疗法疗效预测生物标志物的潜力 | 头颈鳞癌患者 | 癌症免疫学 | 头颈鳞癌 | 免疫组织化学, bulk RNA-seq, scRNA-seq | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 单细胞数据 | 38例头颈鳞癌患者 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
3013 | 2025-10-06 |
PM2.5 Induces Cell-Specific Transcriptomic Alterations in the Lungs of Juvenile Mice
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S514437
PMID:40735270
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了PM2.5暴露对幼年小鼠肺部不同细胞类型的特异性转录组影响 | 首次在幼年动物模型中系统揭示PM2.5对肺部不同细胞类型的特异性转录调控机制 | 研究仅基于小鼠模型,需在人类样本中进一步验证 | 探究PM2.5对幼年肺部细胞类型特异性分子机制的影响 | 幼年小鼠肺部细胞 | 单细胞生物学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序,基因本体论分析,KEGG通路分析,苏木精-伊红染色 | NA | 单细胞转录组数据,组织病理学图像 | 幼年小鼠肺部细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3014 | 2025-10-06 |
Disulfidptosis-Related Genes as Novel Biomarkers and Therapeutic Targets in Dilated Cardiomyopathy
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S525114
PMID:40735269
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研究论文 | 本研究通过分析扩张型心肌病中双硫死亡相关基因的表达特征,建立了诊断模型并验证了核心基因的病理作用 | 首次将双硫死亡机制与扩张型心肌病关联,发现19个差异表达基因并建立高精度诊断模型 | 研究样本量有限,机制研究仍需进一步深入验证 | 探索双硫死亡相关基因在扩张型心肌病中的生物标志物和治疗靶点价值 | 扩张型心肌病患者和健康对照的基因表达数据,DCM小鼠模型 | 生物信息学 | 扩张型心肌病 | RNA-seq,单细胞RNA-seq,机器学习 | 支持向量机(SVM) | 基因表达数据 | 多个GEO数据集,包含DCM患者和健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
3015 | 2025-07-31 |
Editorial: Single-cell sequencing of the immune microenvironment in cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1660831
PMID:40735316
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
3016 | 2025-10-06 |
Targeting the KLF5/PI3K/AKT axis as a therapeutic strategy to overcome neoadjuvant chemoresistance in colorectal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1593639
PMID:40735324
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了KLF5/PI3K/AKT轴在结直肠癌新辅助化疗耐药中的关键作用 | 首次在单细胞水平系统解析结直肠癌化疗耐药机制,并建立KLF5调控网络风险评分模型用于预后预测 | NA | 探索结直肠癌新辅助化疗耐药机制并寻找有效治疗策略 | 结直肠癌患者样本和动物模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, InferCNV, 差异表达基因分析, 通路富集分析, 细胞通讯分析, SCENIC, 高通量药物筛选 | 风险评分模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3017 | 2025-10-06 |
An integrated approach for analyzing spatially resolved multi-omics datasets from the same tissue section
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1614288
PMID:40735471
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研究论文 | 开发了一种在相同组织切片上整合空间转录组学和空间蛋白质组学分析的实验与计算框架 | 首次在相同组织切片上实现空间转录组和空间蛋白质组的整合分析,确保组织形态和空间背景的一致性 | 仅在人肺癌样本中进行了验证,尚未在其他疾病类型中测试 | 开发空间多组学整合分析方法,研究肿瘤免疫微环境 | 人肺癌组织样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, H&E染色 | Weave软件 | 空间转录组数据, 空间蛋白质组数据, 图像数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
3018 | 2025-10-06 |
Collection of Growing Bovine Oocytes and Library Preparation for Single-Cell RNA Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4658-8_4
PMID:40736790
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研究论文 | 本文详细介绍了用于单细胞RNA测序分析的生长中牛卵母细胞收集和文库制备的详细实验方案 | 提供了针对牛卵母细胞的单细胞RNA测序标准化实验流程 | NA | 建立牛卵母细胞单细胞RNA测序的实验方法 | 生长中的牛卵母细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
3019 | 2025-10-06 |
PD-1 regulates tumor-infiltrating CD8+ T cells in both a cell-intrinsic and a cell-extrinsic fashion
2025-Oct-06, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230542
PMID:40705010
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研究论文 | 本研究通过诱导性PD-1敲除模型揭示了PD-1在肿瘤微环境中对CD8+ T细胞的双重调控机制 | 首次证明PD-1缺失不仅对敲除细胞自身产生细胞自主效应,还能通过非细胞自主机制增强表达PD-1的CD8+ T细胞功能 | 研究仅使用MC38肿瘤模型,未验证其他肿瘤类型 | 探究PD-1缺失如何影响肿瘤微环境中CD8+ T细胞的功能 | CD8+ T细胞和MC38肿瘤模型 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, TCR测序 | 诱导性基因敲除模型 | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3020 | 2025-10-06 |
Pollutant distribution in vertebrates across scales: Organs, cells, and organelles
2025-Oct-01, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2025.126680
PMID:40532810
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综述 | 系统评述脊椎动物中环境污染物在器官、细胞和亚细胞水平的多尺度分布研究进展 | 首次系统整合污染物在器官-细胞-细胞器多尺度分布的研究框架,特别强调纳米材料与传统污染物的分布差异 | 细胞群体和亚细胞水平的污染物分布研究有限,现有研究主要集中在血液、肠道、肝脏和鳃/肺等少数器官 | 建立污染物多尺度分布与毒性机制之间的联系,推进环境健康风险评估和靶向干预 | 脊椎动物(包括人类) | 环境毒理学 | NA | 单细胞测序、跨尺度成像技术、计算预测模型 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |