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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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3061 | 2025-10-06 |
Immune and Inflammatory Properties of Megakaryocytes
2025-Jul-10, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14141053
PMID:40710306
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综述 | 本综述探讨巨核细胞在健康和疾病状态下的免疫与炎症功能特性 | 揭示了巨核细胞通过单细胞RNA测序发现的具有免疫功能的亚群,这些细胞表达免疫标志物并参与病原体吞噬和抗原呈递 | NA | 系统总结巨核细胞新发现的免疫和炎症功能特性 | 巨核细胞及其免疫亚群 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3062 | 2025-10-06 |
A Meta-Review of Spatial Transcriptomics Analysis Software
2025-Jul-10, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14141060
PMID:40710313
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综述 | 对空间转录组学分析软件进行系统性评估与比较的元综述 | 整合多个基准测试研究结果,首次系统比较不同软件在四个关键分析领域的性能表现 | 未开发新软件或算法,主要基于现有文献进行总结归纳 | 为研究人员选择适合的空间转录组学分析软件提供指导 | 空间转录组学分析软件 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据与空间坐标数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
3063 | 2025-10-06 |
High-precision immune-related plasma proteomics profiling predicts response to immunotherapy in patients with triple-negative breast cancer
2025-Jul-04, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
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研究论文 | 本研究通过高精度血浆蛋白质组学分析预测三阴性乳腺癌患者对免疫治疗的应答 | 首次发现ARG1、NOS3和CD28血浆蛋白与免疫治疗应答相关,并开发了血浆免疫预测评分系统 | 回顾性研究,样本量相对有限 | 开发非侵入性生物标志物预测三阴性乳腺癌患者对免疫治疗的应答 | 195名接受抗PD-1免疫治疗的三阴性乳腺癌患者 | 蛋白质组学 | 乳腺癌 | 高精度蛋白质组学分析,单细胞RNA测序 | NA | 血浆蛋白质组数据,单细胞RNA测序数据 | 195名TNBC患者的配对基线、治疗中和治疗后血浆样本 | NA | 蛋白质组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
3064 | 2025-10-06 |
Large-scale dependency and drug screens to characterize the therapeutic vulnerabilities of multiple myeloma with 1q
2025-Jul-03, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024025102
PMID:40073369
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研究论文 | 通过大规模依赖性筛选和药物筛选系统表征1q+多发性骨髓瘤的治疗脆弱性 | 首次结合单细胞RNA测序和等基因克隆分离技术揭示1q+与MCL1/PI3K抑制剂敏感性的关联机制 | 未明确1q+具体基因驱动机制及临床转化路径 | 开发1q+多发性骨髓瘤的靶向治疗策略 | 携带1q+染色体异常的多发性骨髓瘤患者样本 | 癌症基因组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, 大规模依赖性筛选, 药物筛选 | NA | 基因组测序数据, 药物敏感性数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3065 | 2025-10-06 |
scGGC: a two-stage strategy for single-cell clustering through cellular gene pathway construction
2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf368
PMID:40698866
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研究论文 | 提出一种名为scGGC的两阶段单细胞聚类方法,通过构建细胞基因通路整合图自编码器和生成对抗网络技术 | 构建包含细胞-细胞和细胞-基因关系的邻接矩阵来捕捉复杂相互作用,并通过选择高置信度样本进行对抗神经网络训练来提升聚类性能 | NA | 解决单细胞RNA测序数据聚类分析中的高维度、噪声和稀疏性挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图自编码器, 生成对抗网络 | 基因表达数据 | 九个公开可用的scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3066 | 2025-10-06 |
Applications and techniques of single-cell RNA sequencing across diverse species
2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf354
PMID:40698863
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在不同物种中的应用和技术进展 | 全面总结了scRNA-seq在模式和非模式物种中的跨物种应用潜力,特别是在生态基因组学等新兴领域的应用 | 存在技术和资金障碍,限制了在非模式生物和复杂细胞组成组织中的应用 | 探讨单细胞RNA测序技术的应用范围和技术发展 | 各种物种的单细胞转录组 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3067 | 2025-10-06 |
Path-MGCN: a pathway activity-based multi-view graph convolutional network for determining spatial domains
2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf365
PMID:40698867
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研究论文 | 开发了一种基于通路活性的多视图图卷积网络Path-MGCN,用于空间转录组数据中的空间域识别 | 首次将通路水平功能背景整合到空间域识别中,通过多视图图卷积网络自适应融合空间和功能邻近性信息 | NA | 开发准确且可解释的空间转录组数据分析框架,解析组织异质性 | 人类背外侧前额叶皮层、乳腺癌组织和鼠脑组织 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学,基因集变异分析 | 多视图图卷积网络,注意力机制,零膨胀负二项式解码器 | 空间转录组数据 | 多个数据集(人类背外侧前额叶皮层、乳腺癌和鼠脑组织) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
3068 | 2025-10-06 |
GRANet: a graph residual attention network for gene regulatory network inference
2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf349
PMID:40708222
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研究论文 | 提出一种名为GRANet的图残差注意力网络,用于基因调控网络推断 | 利用残差注意力机制自适应学习复杂基因调控关系,并整合多维生物特征进行更全面的推断 | NA | 改进单细胞水平基因调控网络推断的准确性 | 基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图残差注意力网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3069 | 2025-10-06 |
Multiplexed imaging to reveal tissue dendritic cell spatial localisation and function
2025-Jul, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.14962
PMID:38969618
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综述 | 本文综述了多重成像技术在揭示组织树突状细胞空间定位和功能方面的应用 | 利用新兴的多重成像技术解决传统方法无法提供细胞空间信息的问题,填补了树突状细胞空间定位研究的空白 | 作为综述文章,未包含原始实验数据,主要依赖已有文献进行总结 | 探讨多重成像技术在树突状细胞空间定位和功能研究中的应用 | 组织中的树突状细胞及其亚群 | 数字病理 | NA | 多重成像技术 | NA | 图像数据 | NA | NA | 空间成像技术 | NA | NA |
3070 | 2025-10-06 |
M2 Macrophage-Derived Extracellular Vesicles Reprogram Immature Neutrophils into Anxa1hi Neutrophils to Enhance Inflamed Bone Regeneration
2025-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202416159
PMID:40277454
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研究论文 | 本研究揭示了M2巨噬细胞来源的细胞外囊泡通过重编程未成熟中性粒细胞为Anxa1hi中性粒细胞来增强炎症性骨再生 | 首次发现M2巨噬细胞来源的细胞外囊泡可重编程中性粒细胞成熟轨迹,产生具有修复功能的Anxa1中性粒细胞亚群 | NA | 探索M2巨噬细胞在牙周炎骨再生中的作用机制 | 牙周组织中的巨噬细胞和中性粒细胞 | 单细胞生物学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3071 | 2025-10-06 |
Gas Bubbles from Biodegradable Magnesium Implants Convey Mechanical Cues and Promote Immune Cell Stimulation
2025-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202503123
PMID:40349156
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研究论文 | 本研究探讨镁植入物降解产生的气泡如何通过机械和炎症途径影响组织愈合和免疫细胞反应 | 首次系统揭示镁植入物气泡在多个生物尺度和时间尺度上对邻近组织和细胞行为的机械生物学影响 | 研究仅在大鼠模型中进行,缺乏人类临床数据验证 | 探究可降解镁植入物产生气泡的生物学意义及其对组织修复的影响机制 | 大鼠软组织中镁植入物周围的气泡、组织细胞和免疫细胞 | 生物医学工程 | 植入物相关组织反应 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据、组织形态学数据 | 大鼠植入模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
3072 | 2025-10-06 |
Blood Biomarker-Based Predictive Indicator for Liver Metastasis in Alpha-Fetoprotein-Producing Gastric Cancer and Multi-Omics Tumor Microenvironment Insights
2025-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202503499
PMID:40433893
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研究论文 | 本研究开发了基于血液生物标志物的预测指标ANLiM评分,用于预测甲胎蛋白产生型胃癌的肝转移和免疫治疗反应 | 首次结合AFP和中性粒细胞-淋巴细胞比率开发ANLiM评分,并通过多组学分析揭示肝转移AFPGC的免疫抑制微环境特征 | 回顾性研究设计,样本量相对有限(317例患者) | 开发甲胎蛋白产生型胃癌肝转移的预测指标并探索其肿瘤微环境特征 | 317例甲胎蛋白产生型胃癌患者 | 肿瘤学 | 胃癌 | 多变量逻辑回归模型,全外显子组测序,蛋白质组分析,单细胞RNA测序,多重免疫荧光 | 逻辑回归模型,列线图 | 临床数据,基因组数据,蛋白质组数据,单细胞转录组数据 | 317例患者 | NA | 全外显子组测序,蛋白质组分析,单细胞RNA测序,空间转录omics | NA | NA |
3073 | 2025-10-06 |
A Dual Approach with Organoid and CRISPR Screening Reveals ERCC6 as a Determinant of Cisplatin Resistance in Osteosarcoma
2025-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202500632
PMID:40476445
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研究论文 | 本研究通过骨肉瘤类器官模型和CRISPR筛选技术,揭示了ERCC6基因在骨肉瘤顺铂耐药性中的关键作用机制 | 首次结合患者来源骨肉瘤类器官模型和CRISPR筛选技术,发现ERCC6通过调控BAX基因的可变剪接影响顺铂耐药性 | 研究主要基于体外和动物模型,尚未进行临床验证 | 探究骨肉瘤顺铂耐药性的分子机制 | 骨肉瘤患者来源类器官和骨肉瘤细胞系 | 癌症生物学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, CRISPR筛选, 组织病理学分析 | 类器官模型, 细胞系模型 | 基因表达数据, 测序数据, 病理图像 | 患者来源骨肉瘤类器官和骨肉瘤细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
3074 | 2025-10-06 |
Multipotent lineage potential in B cell acute lymphoblastic leukemia is associated with distinct cellular origins and clinical features
2025-Jul, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-025-00987-2
PMID:40579588
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研究论文 | 通过整合89例B-ALL样本的单细胞转录组测序数据与正常B细胞发育图谱,揭示了B细胞急性淋巴细胞白血病的多能谱系潜能与细胞起源和临床特征的关联 | 首次开发了'多能性评分'系统,发现其与谱系可塑性和较差生存率独立相关,为理解白血病细胞起源提供了机制性解释 | 样本量相对有限(89例),且主要关注B-ALL特定亚型 | 探索B细胞急性淋巴细胞白血病的发育起源及其与谱系可塑性和治疗反应的关系 | B细胞急性淋巴细胞白血病患者样本和正常人类B细胞发育过程 | 单细胞基因组学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 89例B-ALL样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3075 | 2025-10-06 |
Fibroblasts-The emerging therapeutic target of the cardiovascular system?
2025-Jul, Pharmacological reviews
IF:19.3Q1
DOI:10.1016/j.pharmr.2025.100072
PMID:40609323
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综述 | 探讨成纤维细胞在心血管系统中的异质性及其作为新兴治疗靶点的潜力 | 通过单细胞RNA测序揭示成纤维细胞在心血管系统中的异质性和可塑性,提出其超越细胞外基质生产的多样化功能 | 缺乏成纤维细胞亚型的共识命名法,需要大规模荟萃分析和广泛验证研究 | 探索成纤维细胞在心血管系统中的治疗潜力 | 心血管系统中的成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3076 | 2025-10-06 |
Rewriting the dendritic cell code in cancer-from subset identity to immunotherapeutic design
2025-Jul, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.70108
PMID:40667699
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综述 | 本文系统解析树突状细胞在癌症免疫中的功能特化及其被肿瘤微环境重编程的机制,并探讨相关免疫治疗策略 | 整合空间转录组学和单细胞研究最新发现,揭示关键DC-T细胞生态位,提出基于DC亚群特异性的情境感知免疫治疗新范式 | 作为综述文章,未包含原始实验数据,主要基于已有研究进行整合分析 | 阐明树突状细胞在肿瘤免疫中的重编程机制并探索免疫治疗新策略 | 树突状细胞亚群(cDC1、cDC2、pDCs、DC3s、tDCs、moDCs等)及其与肿瘤微环境的相互作用 | 免疫学 | 癌症 | 空间转录组学、单细胞研究 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞研究 | NA | NA |
3077 | 2025-10-06 |
Hantaan virus-derived peptides that stabilize HLA-E could abrogate inhibition of CD56dimNKG2A+ NK cells
2025-Jul, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1012717
PMID:40680069
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研究论文 | 本研究揭示了汉坦病毒来源肽段通过稳定HLA-E分子从而解除CD56dimNKG2A+ NK细胞抑制的机制 | 首次发现汉坦病毒来源的四种表位肽均不能被CD94/NKG2A识别,反而能增强NK细胞的细胞毒性功能 | 研究主要基于体外实验,需要进一步体内验证 | 探讨汉坦病毒感染中NKG2A-HLA-E轴介导的NK细胞应答机制 | 肾综合征出血热患者和汉坦病毒 | 免疫学 | 病毒感染性疾病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,配体-受体结合实验,四聚体染色,细胞毒性实验 | NA | 单细胞RNA测序数据,流式细胞数据,结合亲和力数据 | 肾综合征出血热患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3078 | 2025-10-06 |
Featured Immune Characteristics of Periodontitis and Primary Sjögren's Syndrome Revealed by Single-Cell Transcriptome Analyses
2025-Jul, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70713
PMID:40696268
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示牙周炎和原发性干燥综合征的免疫特征 | 首次在单细胞水平比较牙周炎和原发性干燥综合征的免疫细胞景观,发现两种疾病共有的CD8 naive T细胞耗竭机制 | 数据来源于公共数据库,样本量有限,需要进一步实验验证 | 比较牙周炎和原发性干燥综合征在单细胞水平的免疫特征异同 | 健康对照者、牙周炎患者和原发性干燥综合征患者的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 牙周炎, 原发性干燥综合征 | 单细胞RNA测序 | Seurat, NicheNetr | 单细胞转录组数据 | 来自NCBI和NGDC数据库的PBMC样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3079 | 2025-10-06 |
Extracellular Origins of Cognition: Lessons from Primate Neocortical ECM
2025-Jul, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.13979
PMID:40696865
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评论 | 本文评论了Vilicich等人的研究,该研究通过多模态方法构建了灵长类新皮层发育过程中细胞外基质的分子图谱 | 整合单细胞转录组学、蛋白质组学和免疫组织荧光技术,首次系统绘制发育中灵长类新皮层ECM的空间分布图谱,提出“Exomatrix”概念 | 作为评论性文章,未提供原始实验数据,主要基于对已有研究的解读和分析 | 探讨细胞外基质在神经发育和认知功能形成中的作用 | 人类和非人类灵长类动物发育中的新皮层 | 神经科学 | 神经发育障碍 | 单细胞转录组学, 蛋白质组学, 免疫组织荧光 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组分析, 空间成像 | NA | NA |
3080 | 2025-10-06 |
Genetic Associations of Clonal Hematopoiesis With Cardioembolic Stroke: Insights From Genome-Wide Mendelian Randomization, Bulk RNA, Single-Cell RNA Sequencing
2025-Jul, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.70515
PMID:40702735
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研究论文 | 本研究通过基因组范围孟德尔随机化、转录组学和单细胞RNA测序探讨克隆造血与心源性卒中之间的遗传关联 | 首次通过多组学整合揭示CHIP与心源性卒中的因果关联,并发现PARP1和CD3G作为关键治疗靶点 | 样本量有限,需要进一步实验验证机制 | 探索克隆造血与缺血性卒中之间的因果关系和分子机制 | 缺血性卒中患者队列和克隆造血相关遗传标记 | 生物信息学 | 心血管疾病 | GWAS, RNA-seq, scRNA-seq, 机器学习 | 孟德尔随机化模型, 机器学习模型 | 基因组数据, 转录组数据, 单细胞数据 | GWAS卒中队列数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |