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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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2941 | 2025-10-06 |
Distinct Inflammatory Milieu in Patients With Right Heart Failure
2023-08, Circulation. Heart failure
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研究论文 | 本研究通过分析右心衰竭患者的循环炎症标志物,揭示了其独特的炎症特征并发现CD163和CXCL12可作为预后生物标志物 | 首次系统揭示右心衰竭患者特有的循环炎症特征,发现可溶性CD163和CXCL12作为新型预后生物标志物,并证实这些因子可能来源于肝脏库普弗细胞 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证;机制研究尚不充分,需要进一步实验验证心脏-肝脏轴的具体作用机制 | 阐明右心衰竭患者的循环炎症环境特征及其与预后的关系 | 右心衰竭患者、心功能正常对照者、非典型心衰患者 | 心血管疾病研究 | 右心衰竭 | 多重蛋白检测、单细胞RNA测序、组织成像 | NA | 血液样本、基因表达数据、组织图像 | 三组患者(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序, 多重蛋白检测, 组织成像 | NA | NA |
2942 | 2025-10-06 |
Exploring Influenza A Virus-Induced Lung Injury and Immune Response Based on Humanized Lung-on-Chip
2023-08, Discovery medicine..
IF:2.0Q3
DOI:10.24976/Discov.Med.202335177.55
PMID:37553308
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研究论文 | 本研究通过构建人源化肺芯片模型模拟甲型流感病毒感染过程,分析外周血单核细胞的转录组特征 | 结合肺芯片模型与单细胞RNA测序技术,首次在体外真实模拟肺泡结构功能并系统研究流感病毒感染后的免疫反应机制 | 体外芯片模型可能无法完全模拟体内复杂生理环境,样本规模有限 | 系统分析甲型流感病毒感染后外周血单核细胞的转录组特征及免疫反应机制 | 肺泡上皮细胞、血管内皮细胞、肺泡巨噬细胞和外周血单核细胞(PBMCs) | 单细胞生物学 | 流感 | 单细胞RNA测序,免疫荧光染色 | 肺芯片模型 | 单细胞转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2943 | 2025-10-06 |
High EVI1 and PARP1 expression as favourable prognostic markers in high-grade serous ovarian carcinoma
2023-Jul-31, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-023-01239-6
PMID:37525239
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研究论文 | 本研究探讨EVI1和PARP1蛋白表达作为高级别浆液性卵巢癌预后标志物的价值 | 首次发现EVI1和PARP1共同高表达可识别预后特别良好的患者群体 | 研究基于回顾性队列,需要进一步验证其临床适用性 | 评估EVI1和PARP1在高级别浆液性卵巢癌中的预后意义 | 562名高级别浆液性卵巢癌患者 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 免疫组织化学染色,单细胞测序,拷贝数变异分析 | NA | 组织微阵列图像,基因表达数据,蛋白质表达数据 | 562例高级别浆液性卵巢癌患者组织样本 | NA | 免疫组织化学,单细胞测序 | QuPath | QuPath数字半自动阳性细胞检测 |
2944 | 2025-10-06 |
The expression profiles of signature genes from CD103+LAG3+ tumour-infiltrating lymphocyte subsets predict breast cancer survival
2023-07-24, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-023-02960-1
PMID:37488535
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析鉴定了CD103+LAG3+肿瘤浸润淋巴细胞亚群,并开发了基于CXCL13和BIRC3基因的预后模型来预测乳腺癌患者生存 | 首次识别了CD103+LAG3+ TIL亚群并建立了基于这两个基因的预后模型,能够预测乳腺癌患者的免疫治疗反应和化疗敏感性 | 研究主要基于回顾性数据分析,需要进一步的前瞻性研究验证模型的临床适用性 | 开发乳腺癌预后预测模型并探索肿瘤浸润淋巴细胞亚群在乳腺癌中的作用 | 乳腺癌患者和肿瘤浸润淋巴细胞亚群 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序,多重免疫组织化学,LASSO回归,Cox分析 | 预后预测模型 | 转录组数据,单细胞数据 | 训练队列1089例乳腺癌患者,验证队列3619例乳腺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq,转录组测序 | NA | NA |
2945 | 2025-10-06 |
Distinct Requirements for Adaptor Proteins NCK1 and NCK2 in Mammary Gland Development
2023-07-21, Journal of mammary gland biology and neoplasia
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s10911-023-09541-1
PMID:37479911
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和基因敲除小鼠模型揭示了衔接蛋白NCK1和NCK2在乳腺发育中的不同表达模式和功能需求 | 首次系统比较NCK1和NCK2在乳腺发育中的差异表达和功能,发现两者在细胞类型特异性表达和发育表型上存在显著差异 | 研究仅使用全局基因敲除模型,可能受到代偿机制影响;未深入探讨NCK蛋白在乳腺癌中的具体作用机制 | 探究NCK1和NCK2在乳腺发育过程中的表达分布和功能差异 | 小鼠乳腺组织 | 发育生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,基因敲除 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,组织形态数据 | 不同发育阶段(5、8、12周龄)的基因敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2946 | 2025-10-06 |
Gene regulatory network study of rheumatoid arthritis in single-cell chromatin landscapes of peripheral blood mononuclear cells
2023-Jul-04, Modern rheumatology
IF:1.8Q3
DOI:10.1093/mr/roac072
PMID:35796437
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研究论文 | 通过单细胞ATAC测序技术研究类风湿关节炎患者外周血单核细胞的染色质可及性景观和基因调控网络 | 首次在单细胞分辨率下利用scATAC-seq技术揭示类风湿关节炎的转录调控变异,发现10个关键转录因子及其调控的PTPRC和SPAG9基因 | 样本量较小(7例患者和7例对照),需要进一步验证和功能研究 | 发现参与类风湿关节炎发病机制的转录因子 | 类风湿关节炎患者和健康对照的外周血单核细胞 | 表观遗传学 | 类风湿关节炎 | scATAC-seq, 定量PCR | NA | 表观基因组数据,基因表达数据 | 7例RA患者和7例健康对照的外周血单核细胞 | NA | single-cell ATAC-seq | NA | NA |
2947 | 2025-10-06 |
Pathogenic Roles of Cardiac Fibroblasts in Pediatric Dilated Cardiomyopathy
2023-07-04, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.123.029676
PMID:37345811
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研究论文 | 本研究探讨了儿童扩张型心肌病中心脏成纤维细胞的致病机制 | 首次揭示DCM心脏成纤维细胞通过体液因子和直接细胞接触损害心肌细胞功能,而非通过细胞生理行为改变 | 仅使用4个DCM患者来源的细胞系,样本量较小;研究局限于体外实验 | 阐明心脏成纤维细胞在儿童扩张型心肌病中的病理作用 | 儿童扩张型心肌病患者和健康对照的心脏成纤维细胞 | 心血管疾病研究 | 扩张型心肌病 | RNA测序,单细胞RNA测序,原子力显微镜 | NA | 基因表达数据,细胞力学数据 | 4个DCM患者CF细胞系,3个健康对照CF细胞系 | NA | RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
2948 | 2025-10-06 |
Phylogenomics of novel ploeotid taxa contribute to the backbone of the euglenid tree
2023 Jul-Aug, The Journal of eukaryotic microbiology
IF:2.1Q3
DOI:10.1111/jeu.12973
PMID:36912454
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研究论文 | 本研究通过显微观察和单细胞转录组学对五种ploeotid类眼虫进行系统发育分析 | 建立了新的Karavia类群,发现两个未描述的ploeotid类群在系统发育树中占据关键位置 | 部分类群仍未被多基因系统发育研究采样,某些类群间关系支持度不足 | 解析ploeotid类眼虫的系统发育关系,完善眼虫类生物进化树的主干结构 | 五种ploeotid类眼虫(包括Decastava、Hemiolia、Liburna等) | 系统发育基因组学 | NA | 单细胞转录组学,光学显微镜,多基因系统发育分析 | NA | 转录组数据,显微图像 | 5种ploeotid眼虫 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2949 | 2025-10-06 |
Ubiquitin Ligases Siah1a/2 Control Alveolar Macrophage Functions to Limit Carcinogen-Induced Lung Adenocarcinoma
2023-06-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-0258
PMID:37078793
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研究论文 | 本研究揭示泛素连接酶Siah1a/2通过调控肺泡巨噬细胞功能抑制致癌物诱导的肺腺癌发生 | 首次发现Siah1a/2通过调控肺泡巨噬细胞成熟状态和促纤维化基因特征影响肺腺癌发展 | 研究主要基于小鼠模型,临床样本验证仍需扩展 | 探究Siah1a/2在肺泡巨噬细胞功能调控及肺腺癌发生中的作用机制 | 肺泡巨噬细胞、肺腺癌小鼠模型、LUAD患者样本 | 癌症免疫学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序、基因敲除 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 野生型小鼠、基因敲除小鼠、LUAD患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2950 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals sexual diversity in the human bladder and its prospective impacts on bladder cancer and urinary tract infection
2023-06-05, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-023-01535-6
PMID:37277784
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示人类膀胱中的性别差异及其对膀胱癌和尿路感染的潜在影响 | 首次在单细胞水平系统揭示人类膀胱中不同细胞类型的性别特异性基因表达差异 | 基于已发表的单细胞RNA测序数据进行分析,样本来源和数量可能有限 | 探究膀胱相关疾病中性别差异的分子机制 | 人类正常膀胱组织细胞 | 单细胞转录组学 | 膀胱癌,尿路感染 | 单细胞RNA测序 | Monocle2, scMetabolism, SCENIC | 单细胞转录组数据 | 27,437个细胞通过严格质量控制 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2951 | 2025-10-06 |
Cell-type annotation with accurate unseen cell-type identification using multiple references
2023-06, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011261
PMID:37379341
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研究论文 | 提出一种基于多参考数据的单细胞RNA测序数据自动注释方法mtANN,能够准确识别未见过的细胞类型 | 整合深度学习和集成学习提高预测准确性,引入考虑三个互补方面的新指标来区分未见细胞类型和共享细胞类型,并提供自适应阈值选择方法 | NA | 开发能够自动注释单细胞RNA测序数据并准确识别未见细胞类型的新方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 深度学习, 集成学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2952 | 2025-10-06 |
Analysis of immunogenic cell death in atherosclerosis based on scRNA-seq and bulk RNA-seq data
2023-Jun, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.110130
PMID:37075670
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研究论文 | 基于单细胞和批量RNA测序数据分析动脉粥样硬化中的免疫原性细胞死亡 | 首次在动脉粥样硬化中系统研究免疫原性细胞死亡的作用机制,并识别出8个关键基因作为潜在药物靶点 | 研究数据均来自公共数据库,缺乏实验验证 | 探究免疫原性细胞死亡在动脉粥样硬化发生发展中的作用机制 | 颈动脉粥样硬化斑块细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, KEGG富集分析, CIBERSORT, ESTIMATE, ssGSEA, 随机森林 | 随机森林, 共识聚类分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
2953 | 2025-10-06 |
Profiling the bloodstream form and procyclic form Trypanosoma brucei cell cycle using single-cell transcriptomics
2023-05-11, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.86325
PMID:37166108
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研究论文 | 利用单细胞转录组学分析布氏锥虫血流型和前循环型细胞周期 | 无需细胞分选或同步化即可获得高分辨率细胞周期调控转录组,并开发了适用于冷冻保存样品的单细胞转录组分析方案 | 研究基于非同步化细胞群体,可能影响细胞周期阶段分辨的精确性 | 解析布氏锥虫不同生命周期形式的细胞周期调控机制 | 布氏锥虫血流型和前循环型 | 单细胞组学 | 寄生虫感染 | 单细胞转录组学 | 周期性伪时间推断 | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2954 | 2025-10-06 |
Single-cell multiomic analysis identifies a HOX-PBX gene network regulating the survival of lymphangioleiomyomatosis cells
2023-05-10, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adf8549
PMID:37163604
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研究论文 | 通过单细胞多组学分析发现HOX-PBX基因网络调控淋巴管平滑肌瘤病细胞存活机制 | 首次在肺LAM细胞中发现子宫特异性HOX-PBX转录程序的激活,并证实HOXD11-PBX1二聚化是细胞存活的关键调控机制 | NA | 探索淋巴管平滑肌瘤病的发病机制并寻找新的治疗靶点 | 淋巴管平滑肌瘤病肺组织细胞 | 单细胞多组学 | 淋巴管平滑肌瘤病 | 单细胞RNA测序, 单核ATAC测序 | 基因调控网络分析 | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
2955 | 2025-10-06 |
Distinct Th17 effector cytokines differentially promote microglial and blood-brain barrier inflammatory responses during post-infectious encephalitis
2023-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.10.532135
PMID:37215000
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了A组链球菌感染后Th17效应细胞因子如何差异调节小胶质细胞和血脑屏障的炎症反应 | 首次在单细胞水平揭示IL-17A而非GM-CSF在GAS感染后脑炎中的关键作用,并发现小胶质细胞来源的趋化因子在患者血清中升高 | 研究主要基于小鼠疾病模型,人类临床验证仍需进一步研究 | 探究Th17效应细胞因子在感染后脑炎中对小胶质细胞和血脑屏障炎症反应的调控机制 | 小鼠疾病模型、内皮细胞、小胶质细胞、Th17淋巴细胞 | 神经免疫学 | 感染后脑炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 中和抗体实验 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
2956 | 2025-10-06 |
Integrative Proteomics and N-Glycoproteomics Analyses of Rheumatoid Arthritis Synovium Reveal Immune-Associated Glycopeptides
2023-05, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.mcpro.2023.100540
PMID:37019382
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研究论文 | 通过整合蛋白质组学和N-糖基化蛋白质组学分析类风湿关节炎滑膜组织,揭示免疫相关糖肽特征 | 首次系统描绘类风湿关节炎滑膜组织的N-糖基化蛋白质组图谱,发现特定糖基化位点与免疫细胞浸润的显著相关性 | 样本量未明确说明,分析主要基于生物信息学预测需要实验验证 | 探究类风湿关节炎滑膜组织中蛋白质N-糖基化的特征及其与免疫反应的关系 | 类风湿关节炎患者的滑膜组织样本 | 蛋白质组学 | 类风湿关节炎 | N-糖基化蛋白质组学,生物信息学分析,单细胞转录组数据整合 | NA | 蛋白质组数据,糖基化肽段数据,转录组数据 | NA | NA | 蛋白质组学,糖基化分析,单细胞RNA-seq | DNASTAR | NA |
2957 | 2025-10-06 |
Interference of sympathetic overactivation restores limbal stem/progenitor cells function and accelerates corneal epithelial wound healing in diabetic mice
2023-May, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2023.114523
PMID:36931034
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研究论文 | 本研究揭示了糖尿病角膜病变中交感神经过度激活通过NE-Adrb2-Shh信号通路损害角膜缘干/祖细胞功能和角膜上皮再生的机制 | 首次发现交感神经过度激活在糖尿病角膜病变中的作用机制,并证实通过干扰该通路可恢复角膜缘干/祖细胞功能 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床应用效果需进一步验证 | 探究糖尿病角膜病变中角膜缘干/祖细胞功能障碍的分子机制 | 糖尿病小鼠和人类角膜组织 | 眼科疾病研究 | 糖尿病角膜病变 | 单细胞测序, RT-PCR, 化学遗传学 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 组织学图像 | 糖尿病小鼠模型和人类角膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2958 | 2025-10-06 |
Cardiovascular utility of single cell RNA-Seq
2023-05-01, Current opinion in cardiology
IF:2.0Q3
DOI:10.1097/HCO.0000000000001014
PMID:36728943
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在心血管疾病领域的应用现状与未来前景 | 系统总结了单细胞RNA测序在心脏病学中的创新应用,并展望了在心脏电生理学和心脏肿瘤学等新兴领域的潜在价值 | 当前研究主要集中于结构性或动脉粥样硬化性心脏病,其他心脏疾病领域的研究相对有限 | 探讨单细胞RNA测序技术在心血管疾病诊断、风险分层和治疗靶点发现中的应用潜力 | 心血管疾病相关细胞类型和分子机制 | 自然语言处理 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2959 | 2025-10-06 |
An artificial neural network model to diagnose non-obstructive azoospermia based on RNA-binding protein-related genes
2023-04-24, Aging
DOI:10.18632/aging.204674
PMID:37116198
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研究论文 | 开发基于RNA结合蛋白相关基因的人工神经网络模型用于诊断非梗阻性无精子症 | 首次基于RNA结合蛋白DDX20和NCBP2构建人工神经网络诊断模型,并在多个独立队列中进行验证 | 样本量相对有限,需要在更大规模队列中进一步验证模型的泛化能力 | 研究RNA结合蛋白在非梗阻性无精子症中的功能及诊断价值 | 睾丸组织样本(包括对照和NOA患者) | 机器学习 | 男性不育症 | 生物信息学分析,单细胞RNA测序,机器学习算法 | 人工神经网络,逻辑回归,随机森林,LASSO,SVM-RFE,Boruta | 基因表达数据,转录组数据 | 训练队列58例(对照11,NOA47),验证队列包括3个公共数据集和44例本地医院样本 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq | NA | NA |
2960 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic atlas of lung microvascular regeneration after targeted endothelial cell ablation
2023-04-20, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.80900
PMID:37078698
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示肺微血管再生机制 | 首次发现表达apelin的新型gCap内皮干细胞群在肺微血管再生中的关键作用 | 研究基于转基因小鼠模型,人类临床适用性需进一步验证 | 阐明肺微血管再生的分子机制 | 肺内皮细胞 | 单细胞生物学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 转基因小鼠肺内皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |