单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28099 篇文献，本页显示第 19781 - 19800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 19781 | 2024-08-05 |
Single-cell and spatial multi-omics in the plant sciences: Technical advances, applications, and perspectives
2023-05-08, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2022.100508
PMID:36540021
|
综述 | 本文概述了植物科学中单细胞和空间多组学的技术进展、应用和前景. | 提出了将单细胞转录组学、空间转录组学和空间代谢组学结合以分析植物发育的创新方法. | 没有提及具体的实验数据和案例研究来支持论点. | 研究和概述单细胞和空间多组学在植物科学中的应用和未来发展. | 植物组织中的转录组和代谢组. | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | 转录组数据, 代谢组数据 | NA |
| 19782 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq of Lotus japonicus provide insights into identification and function of root cell types of legume
2023-May, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13435
PMID:36537698
|
研究论文 | 该文章研究了莲池豆根部不同细胞类型的转录组及其功能 | 首次提供了豆科植物根尖的单细胞分辨率转录组 | 研究主要集中在一种豆科植物，可能无法普遍适用于所有豆科植物 | 探讨豆科植物根部不同细胞类型的转录组和功能 | 莲池豆的根尖单细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 超过22000个单细胞 |
| 19783 | 2024-08-05 |
Privacy-preserving integration of multiple institutional data for single-cell type identification with scPrivacy
2023-05, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-022-2224-4
PMID:36543995
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研究论文 | 本研究提出了一个名为scPrivacy的原型，用于在数据隐私保护的情况下实现单细胞类型的自动识别 | 该研究是首个通用的自动化单细胞类型识别原型，能在保护数据隐私的前提下促进单细胞注释 | 该方法的有效性主要依赖于所使用的公共基准数据集 | 研究旨在推动在多机构数据隐私保护下的单细胞类型识别 | 研究对象为来自多个机构的大规模单细胞RNA-seq数据集 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 综合公开可用的基准数据集 |
| 19784 | 2024-08-08 |
scRNA-seq profiling of neonatal and adult thymus-derived CD4+ T cells by a T cell origin-time tracing model
2023-04-20, Journal of molecular cell biology
IF:5.3Q2
DOI:10.1093/jmcb/mjac072
PMID:36542462
|
研究论文 | 本研究通过T细胞起源时间追踪模型，对新生和成年胸腺来源的CD4+ T细胞进行单细胞RNA测序分析，揭示了新生胸腺来源的调节T细胞（Treg）在免疫抑制功能上的增强特性。 | 首次通过单细胞RNA测序技术，详细比较了新生和成年胸腺来源CD4+ T细胞的分子特征和功能差异，特别是在免疫稳态维持方面的能力。 | 研究主要依赖于动物模型，且追踪时间有限，可能未能完全反映长期环境影响下的T细胞动态变化。 | 探讨新生和成年胸腺来源CD4+ T细胞在分子水平和功能上的差异，特别是在免疫稳态维持方面的能力。 | 新生和成年胸腺来源的CD4+ T细胞，特别是调节T细胞（Treg）。 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | T细胞起源时间追踪模型 | RNA | 新生和成年胸腺来源的CD4+ T细胞样本，追踪时间为9周和12天 |
| 19785 | 2024-08-05 |
Novel insights into Hodgkin lymphoma biology by single-cell analysis
2023-04-13, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2022017147
PMID:36548960
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研究论文 | 通过单细胞分析对霍奇金淋巴瘤生物学的新见解 | 使用单细胞技术揭示了霍奇金淋巴瘤肿瘤微环境中细胞间相互作用和异质性的独特特点 | 未提及具体的限制因素 | 深入理解霍奇金淋巴瘤中的免疫生物学 | 霍奇金淋巴瘤及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 霍奇金淋巴瘤 | 单细胞RNA测序和多重成像技术 | NA | 血液样本、新鲜组织和福尔马林固定样本 | NA |
| 19786 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analysis Reveals Transcriptomic Features of Drug-Tolerant Persisters and Stromal Adaptation in a Patient-Derived EGFR-Mutated Lung Adenocarcinoma Xenograft Model
2023-04, Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer
IF:21.0Q1
DOI:10.1016/j.jtho.2022.12.003
PMID:36535627
|
研究论文 | 本研究使用患者来源的EGFR突变肺腺癌异种移植模型，通过单细胞RNA测序分析了药物耐受持久细胞（DTP）和基质适应的转录组特征。 | 首次在患者来源的肺腺癌异种移植模型中进行单细胞RNA测序，揭示了DTP细胞的转录组特征和基质适应的变化。 | 研究仅限于特定的EGFR突变肺腺癌模型，结果的普遍性有待进一步验证。 | 探讨靶向治疗中断后肿瘤复发的原因，特别是药物耐受持久细胞（DTP）的作用。 | 药物耐受持久细胞（DTP）和癌症相关成纤维细胞（CAF）的转录组特征。 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 使用EGFR抑制剂erlotinib治疗5至6周的肿瘤 bearing 小鼠模型 |
| 19787 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing combined with single-cell proteomics identifies the metabolic adaptation of islet cell subpopulations to high-fat diet in mice
2023-04, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-022-05849-5
PMID:36538064
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序结合单细胞蛋白质组学，识别了小鼠胰岛细胞亚群在高脂饮食下的代谢适应性 | 首次结合单细胞RNA测序和蛋白质组学技术，深入解析了胰岛细胞亚群在高脂饮食诱导的葡萄糖不耐受中的代谢适应机制 | NA | 探索肥胖进展和糖尿病发病过程中胰岛细胞亚群的组成变化及其对高脂饮食诱导的胰岛代谢适应机制 | 小鼠胰岛细胞亚群 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 共分析了33,999个细胞 |
| 19788 | 2024-08-08 |
RIPK1 kinase-dependent inflammation and cell death contribute to the pathogenesis of COPD
2023-04, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.01506-2022
PMID:36549711
|
研究论文 | 本文研究了受体相互作用蛋白激酶1（RIPK1）依赖的细胞死亡和炎症在慢性阻塞性肺病（COPD）发病机制中的作用 | 首次详细探讨了RIPK1激酶抑制在实验性COPD模型中的保护作用，并提出其作为一种新型治疗策略的潜力 | NA | 旨在定义RIPK1激酶依赖的细胞死亡和炎症在COPD发病机制中的贡献 | RIPK1在COPD患者肺组织中的表达及其激酶活性抑制的影响 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺病 | 单细胞RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA | 包括人类和鼠类的肺组织样本，以及COPD患者和对照组的肺组织 |
| 19789 | 2024-08-08 |
Protocol to dissociate healthy and infected murine- and hamster-derived lung tissue for single-cell transcriptome analysis
2023-03-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101957
PMID:36542521
|
研究论文 | 本文提供了一种将健康和感染的小鼠及仓鼠肺组织转化为具有代表性的多样性、存活的单细胞悬液的协议，用于单细胞转录组分析 | 本文介绍了一种新的肺组织处理方法，包括血管灌注、肺切除、酶消化和机械分离，以及红细胞裂解和分离细胞计数 | 目前仍需进一步提高肺内皮细胞的比例，同时不损害细胞的存活率 | 研究传染病中的宿主-病原体相互作用 | 小鼠和仓鼠的肺组织 | 数字病理学 | 传染病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 19790 | 2024-08-05 |
Stromal Reprogramming through Dual PDGFRα/β Blockade Boosts the Efficacy of Anti-PD-1 Immunotherapy in Fibrotic Tumors
2023-03-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-1890
PMID:36543251
|
研究论文 | 研究探讨双重PDGFRα/β阻断如何增强抗PD-1免疫疗法在纤维化肿瘤中的疗效 | 揭示了间质重编程在免疫再激活中的影响，并结合免疫疗法提高纤维化癌症患者的治疗潜力 | 未提及具体的临床试验数据和长期效果 | 阐明间质重编程和改进癌症免疫治疗的潜在途径 | 胃癌患者中的间质及其对免疫微环境的影响 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | 组织样本 | 涉及胃癌的纤维化肿瘤异种移植模型 |
| 19791 | 2024-08-05 |
Hepatic TREM2+ macrophages express matrix metalloproteinases to control fibrotic scar formation
2023-03, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.12616
PMID:36529983
|
研究论文 | 本研究探讨了肝脏TREM2+巨噬细胞通过表达基质金属蛋白酶（MMP）来控制纤维化瘢痕形成的机制 | 首次系统地描述了肝脏巨噬细胞的异质性，特别是TREM2+巨噬细胞在肝纤维化中的作用 | 对异质性SAMac群体的表征仍不够全面，需要进一步研究 | 研究肝脏巨噬细胞在肝纤维化中的作用及其潜在治疗途径 | 主要研究TREM2+巨噬细胞及其在肝纤维化过程中的表达特征 | 数字病理学 | 肝硬化 | 单细胞转录组学 | NA | 公共数据库的单细胞转录组数据 | 人类肝硬化样本及饮食诱导的非酒精性脂肪性肝炎模型 |
| 19792 | 2024-08-05 |
Immunohistochemical characterization of bipolar cells in four distantly related avian species
2023-03, The Journal of comparative neurology
IF:2.3Q1
DOI:10.1002/cne.25443
PMID:36550622
|
研究论文 | 该研究系统性测试了12种抗体在鸟类视网膜中标记双极细胞的能力 | 首次提供了不同鸟类双极细胞的免疫组化标记物目录 | 部分标记物不仅标记双极细胞，还标记了其他细胞类型 | 分析各种鸟类视网膜中双极细胞的特征和标记物 | 家鸡、家鸽、普通秃鹰和欧洲知更鸟等四种远缘鸟类 | 数字病理学 | NA | 免疫组化 | NA | 视网膜样本 | 研究涉及四种鸟类的八种最适合的抗体 |
| 19793 | 2024-08-05 |
RIIβ-PKA in GABAergic Neurons of Dorsal Median Hypothalamus Governs White Adipose Browning
2023-02, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202205173
PMID:36529950
|
研究论文 | 本研究探讨了RIIβ-PKA在背侧中间下丘脑GABA能神经元中对白色脂肪组织变褐的调控作用 | 揭示了RIIβ-PKA在背侧中间下丘脑GABA能神经元中调节白色脂肪组织变褐的机制 | 在该研究中没有直接阐明白色脂肪组织变褐是否导致了体重减少 | 研究RIIβ-PKA对白色脂肪组织变褐的影响及其在肥胖和代谢疾病治疗中的潜在应用 | 研究对象为RIIβ缺失小鼠及其在背侧中间下丘脑GABA能神经元中的表现 | 数字病理学 | 肥胖症 | 单细胞测序，转录组测序，电生理研究 | NA | NA | RIIβ-KO小鼠 |
| 19794 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis reveals the chemotherapy-induced cellular reprogramming and novel therapeutic targets in relapsed/refractory acute myeloid leukemia
2023-02, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-022-01789-6
PMID:36543880
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术分析了原发性难治性或短期复发急性髓系白血病患者的骨髓样本，揭示了化疗诱导的细胞重编程及新的治疗靶点 | 发现了化疗过程中增殖性干细胞/祖细胞样细胞向静止干细胞样细胞的表型转变，并确定了CD52和LGALS1的上调 | NA | 揭示急性髓系白血病化疗耐药机制，开发新的治疗策略 | 急性髓系白血病患者的骨髓样本 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 19795 | 2024-08-08 |
Identification of Cell Types and Transcriptome Landscapes of Porcine Epidemic Diarrhea Virus-Infected Porcine Small Intestine Using Single-Cell RNA Sequencing
2023-02-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2101216
PMID:36548460
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研究论文 | 本研究首次使用单细胞RNA测序技术系统分析了感染猪流行性腹泻病毒（PEDV）的猪空肠细胞类型和转录组景观 | 首次使用单细胞RNA测序技术系统分析PEDV感染的猪空肠，并鉴定了一种新的绒毛细胞标记物DNAH11 | NA | 研究PEDV感染后猪空肠不同细胞类型的反应，加深对病毒发病机制的理解 | 猪流行性腹泻病毒（PEDV）感染的猪空肠细胞类型和转录组景观 | 数字病理学 | 猪病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 19796 | 2024-08-05 |
Class switch toward noninflammatory, spike-specific IgG4 antibodies after repeated SARS-CoV-2 mRNA vaccination
2023-01-27, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.ade2798
PMID:36548397
|
研究论文 | 该研究报道了在重复接种SARS-CoV-2 mRNA疫苗后，特异性IgG4抗体的增加. | 该研究发现，在第二次接种几个月后，SARS-CoV-2特异性抗体主要由非炎症性IgG4组成，并且第三次接种进一步增加了IgG4抗体的比例. | 该研究没有探讨亚型IgG4的长期免疫影响及其在不同人群中的表现. | 研究mRNA疫苗接种后特定IgG4抗体的变化及其对疫苗接种策略的影响. | 研究对象为接种SARS-CoV-2 mRNA疫苗后的抗体反应变化. | 免疫学 | NA | 单细胞测序和流式细胞术 | NA | 抗体反应数据 | 在三次免疫接种后分析了与IgG4相关的B细胞频率. |
| 19797 | 2024-08-05 |
spaCI: deciphering spatial cellular communications through adaptive graph model
2023-01-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac563
PMID:36545790
|
研究论文 | 本文提出了一种新颖的自适应图模型spaCI，用于解读细胞间的空间通信 | spaCI结合了细胞的空间位置和基因表达特征，通过注意力机制提高了细胞通信的推断能力 | 在研究中可能未能详细探讨模型的计算效率及其在其他类型数据中的适用性 | 阐明细胞间的通信机制，尤其是在复杂疾病中的作用 | 主要研究对象为小鼠皮层的seqFISH+数据和非小细胞肺癌样本的NanoString CosMx SMI数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞空间转录组学（SCST） | 自适应图模型 | 基因表达数据 | 涉及小鼠皮层和非小细胞肺癌样本的seqFISH+和NanoString CosMx SMI数据 |
| 19798 | 2024-08-05 |
Senescence atlas reveals an aged-like inflamed niche that blunts muscle regeneration
2023-01, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05535-x
PMID:36544018
|
研究论文 | 本研究揭示衰老细胞在骨骼肌再生区中的重要性，并阐明其对再生的抑制作用 | 本研究结合单细胞转录组学和衰老细胞富集分选协议，克服了衰老细胞稀缺的技术限制，提供了在体内分离衰老细胞的技术，并定义了肌肉的衰老蓝图 | 衰老细胞的多样性可能影响研究结果的普遍性 | 旨在探讨衰老细胞如何影响肌肉再生及其相关机制 | 年轻和老鼠损伤肌肉中不同类型的衰老细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 年轻和老鼠中不同类型的损伤肌肉样本 |
| 19799 | 2024-08-05 |
scDrug: From single-cell RNA-seq to drug response prediction
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.11.055
PMID:36544472
|
研究论文 | scDrug是一个生物信息学工作流程，用于从单细胞RNA测序数据生成细胞聚类及预测药物治疗 | 提供了一种集成工具，从单细胞RNA测序分析到药物发现的全过程 | 目前的工具可能在精准性和适用范围上存在限制 | 开发一个综合的bioinformatics工具以进行药物反应预测 | 单细胞RNA测序数据及其在肿瘤微环境中的细胞组成 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 19800 | 2024-08-08 |
The Heterogeneity of Tumour-Associated Macrophages Contributes to the Recurrence and Outcomes of Glioblastoma Patients
2023-Jan, Journal of molecular neuroscience : MN
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12031-022-02081-z
PMID:36542317
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤相关巨噬细胞的异质性对胶质母细胞瘤患者复发和预后的影响 | 通过单细胞RNA测序分析了复发性胶质母细胞瘤中肿瘤相关巨噬细胞的异质性，并建立了一个基于差异表达基因的预后标志物 | NA | 探究肿瘤相关巨噬细胞的异质性是否影响胶质母细胞瘤患者的复发和预后 | 胶质母细胞瘤患者的肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自医院的胶质母细胞瘤组织样本 |