单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27864 篇文献，本页显示第 16261 - 16280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16261 | 2024-08-07 |
Identification and validation of a T cell marker gene-based signature to predict prognosis and immunotherapy response in gastric cancer
2023-12-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-48930-8
PMID:38049463
|
研究论文 | 本研究通过分析GSE183904数据集中的单细胞RNA测序数据，使用R包“Seurat”的“FindAllMarkers”方法识别了322个T细胞标记基因，并基于这些基因构建了一个五基因预测签名，用于预测胃癌患者的预后和免疫治疗反应 | 本研究首次基于T细胞标记基因构建了一个五基因预测签名，用于预测胃癌患者的预后和免疫治疗反应 | NA | 研究旨在识别和验证基于T细胞标记基因的签名，以预测胃癌的预后和免疫治疗反应 | 胃癌患者的预后和免疫治疗反应 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | TCGA数据库中的STAD患者 |
| 16262 | 2024-08-05 |
POSTN Secretion by Extracellular Matrix Cancer-Associated Fibroblasts (eCAFs) Correlates with Poor ICB Response via Macrophage Chemotaxis Activation of Akt Signaling Pathway in Gastric Cancer
2023-Dec-01, Aging and disease
IF:7.0Q1
DOI:10.14336/AD.2023.0503
PMID:37199594
|
研究论文 | 本研究探讨了胃癌中eCAFs分泌的POSTN与免疫检查点抑制（ICB）反应的关系 | 揭示了CAFs分泌的POSTN通过激活巨噬细胞的Akt信号通路来促进巨噬细胞的趋化作用，从而导致ICB抵抗 | 研究仅依赖于TCGA-STAD和真实世界队列的分析，可能存在样本选择偏倚 | 期望阐明eCAFs与胃癌ICB反应之间的关系及其机制 | 主要研究对象为胃癌患者中的POSTN+FAP+外基质癌相关成纤维细胞（eCAFs）和巨噬细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及TCGA-STAD和真实世界胃癌队列的患者样本 |
| 16263 | 2024-08-05 |
IFNγ Transcribed by IRF1 in CD4+ Effector Memory T Cells Promotes Senescence-Associated Pulmonary Fibrosis
2023-Dec-01, Aging and disease
IF:7.0Q1
DOI:10.14336/AD.2023.0320
PMID:37199578
|
研究论文 | 本研究探讨了生理老化肺部中CD4+效应记忆T细胞转录的IFNγ如何促进与衰老相关的肺纤维化的机制 | 揭示了老化T细胞通过IFNγ信号通路促进AT2细胞衰老和肺纤维化的作用机制 | 未提及样本的具体来源及种类，可能影响研究结果的广泛适用性 | 确定影响肺泡II型上皮细胞的老化T细胞机制和亚型 | 年轻和老年小鼠的肺部单细胞转录组分析，重点是CD4+ T细胞 | 数字病理学 | 衰老相关肺纤维化 | 单细胞转录组学 | NA | 细胞 | 年轻和老年小鼠的肺部细胞，具体样本数量未提及 |
| 16264 | 2024-08-07 |
Microglia Exhibit Distinct Heterogeneity Rather than M1/M2 Polarization within the Early Stage of Acute Ischemic Stroke
2023-Dec-01, Aging and disease
IF:7.0Q1
DOI:10.14336/AD.2023.0505
PMID:37199734
|
研究论文 | 本研究通过建立小鼠中大脑动脉闭塞模型，利用单细胞RNA测序技术分析了缺血性中风急性期微胶质细胞的基因表达、细胞亚型和功能变化，揭示了微胶质细胞在急性期的异质性。 | 本研究首次将微胶质细胞在急性缺血性中风早期的异质性进行了详细分类，并发现了多个具有独特功能特征的亚群。 | 研究主要基于小鼠模型，其结果在人类中的适用性需要进一步验证。 | 阐明缺血性中风急性期微胶质细胞的异质性，以促进早期有效的神经保护策略的开发。 | 微胶质细胞在急性缺血性中风早期的异质性和功能变化。 | 数字病理学 | 中风 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 37,614个微胶质细胞 |
| 16265 | 2024-08-07 |
Synovial Tissue Heterogeneity in Japanese Patients With Rheumatoid Arthritis Elucidated Using a Cell-Type Deconvolution Approach
2023-12, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42642
PMID:37390361
|
研究论文 | 本研究使用细胞类型反卷积方法，阐明了日本类风湿性关节炎患者滑膜组织的异质性 | 首次基于免疫细胞组成对东亚类风湿性关节炎患者的滑膜进行分层，并揭示了不同滑膜表型的炎症驱动因素 | 样本仅来自日本的东亚患者，可能限制了研究结果的普遍性 | 旨在通过免疫细胞组成对东亚类风湿性关节炎患者的滑膜进行分层，并深入了解每种滑膜表型的炎症驱动因素 | 日本类风湿性关节炎患者的滑膜组织 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序技术 | NA | 基因表达数据 | 41例 |
| 16266 | 2024-08-07 |
Genome-wide identification and expression analysis of heat shock protein gene family in cassava
2023-Dec, The plant genome
DOI:10.1002/tpg2.20407
PMID:37899677
|
研究论文 | 本研究在木薯基因组中鉴定了225个MeHsp基因，并分析了它们的遗传结构、染色体分布、复制事件以及在不同组织和细胞亚群中的表达模式 | 首次在木薯中系统地鉴定和分析了热休克蛋白基因家族，揭示了MeHsp基因在植物适应环境中的重要作用 | NA | 旨在理解木薯中热休克蛋白基因的功能特性和进化关系 | 木薯中的热休克蛋白基因家族 | NA | NA | 定量实时聚合酶链反应 (qRT-PCR) | NA | 转录组数据 | 225个MeHsp基因 |
| 16267 | 2024-08-07 |
Comprehensive analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing data identifies B cell marker genes signature that predicts prognosis and analysis of immune checkpoints expression in head and neck squamous cell carcinoma
2023-Dec, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e22656
PMID:38125461
|
研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞和批量RNA测序数据，识别出B细胞标记基因签名，该签名能预测头颈鳞状细胞癌的预后及免疫检查点表达 | 首次通过单细胞RNA测序数据筛选出B细胞标记基因，并验证其在头颈鳞状细胞癌中的预后价值及对免疫治疗反应的潜在影响 | 研究仅限于头颈鳞状细胞癌，且免疫检查点表达与预后的统计学差异不显著 | 探索B细胞标记基因签名在头颈鳞状细胞癌中的预后价值及对免疫治疗反应的影响 | 头颈鳞状细胞癌患者的B细胞标记基因及免疫检查点表达 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 145个B细胞标记基因，TCGA数据集及四个独立数据集 |
| 16268 | 2024-08-05 |
Multiparity increases the risk of diabetes by impairing the proliferative capacity of pancreatic β cells
2023-10, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-023-01100-2
PMID:37903900
|
研究论文 | 本研究评估了多次怀孕对母体产后糖尿病风险的影响 | 揭示了多次怀孕如何通过损害胰腺β细胞的增殖能力来增加糖尿病风险 | 缺乏长期跟踪研究数据以验证结果 | 探讨多次怀孕对母体代谢和胰腺β细胞功能的影响 | 人类和小鼠模型中的多次妊娠对代谢的影响 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 生物样本和血浆数据 | 人类样本未具体说明，小鼠样本涉及多次妊娠组和对照组 |
| 16269 | 2024-08-07 |
A novel mutation in intron 1 of Wnt1 causes developmental loss of dopaminergic neurons in midbrain and ASD-like behaviors in rats
2023-Sep, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-023-02223-8
PMID:37658228
|
研究论文 | 本研究通过大规模筛选自闭症谱系障碍（ASD）风险/致病基因，发现Wnt1基因内含子1中的一个同源突变，该突变导致WNT1表达减少，并在人源化大鼠模型中观察到ASD样行为和多巴胺能神经元的丢失。 | 首次证明中脑多巴胺能神经元的发育损失是ASD发病机制的一部分，异常的前体细胞模式是这种发育性多巴胺能神经元损失的细胞基础。 | NA | 探讨自闭症谱系障碍的遗传机制及其潜在的治疗方法。 | Wnt1基因突变对大鼠行为和神经元发育的影响。 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 16270 | 2024-08-07 |
Elevated Galectin-3 Is Associated with Aging, Multiple Sclerosis, and Oxidized Phosphatidylcholine-Induced Neurodegeneration
2023-06-21, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.2312-22.2023
PMID:37208177
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了衰老与多发性硬化症（MS）中Galectin-3（Gal3）的表达及其对神经退行性病变的影响。 | 首次揭示了Gal3在衰老相关微胶质细胞功能障碍中的作用，并探讨了其在MS病变中的潜在危害。 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证Gal3的作用。 | 探讨Gal3在衰老和多发性硬化症中的作用及其对中枢神经系统（CNS）损伤的影响。 | Galectin-3（Gal3）在衰老和多发性硬化症中的表达及其对神经退行性病变的影响。 | 神经科学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 基因表达数据 | 包括年轻和中年小鼠的脊髓白质病变样本，以及来自两名男性和一名女性的MS脑病变样本。 |
| 16271 | 2024-08-05 |
Endothelial cell clonality, heterogeneity and dysfunction in pulmonary arterial hypertension
2023, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2023.1304766
PMID:38126077
|
综述 | 本文总结了内皮细胞亚群及其在肺动脉高压中发展的异常生理表型的机制 | 探讨了内皮细胞的克隆扩展、免疫失调和遗传突变在肺动脉高压发病机制中的作用 | NA | 提供理解参与肺动脉高压发展的独特肺内皮细胞生物学和病理生理学的框架 | 肺动脉高压相关的内皮细胞亚群及其功能特征 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞转录组学 | NA | 文献 | NA |
| 16272 | 2024-08-05 |
Retracted: Single-Cell Sequencing Revealed Pivotal Genes Related to Prognosis of Myocardial Infarction Patients
2023, Computational and mathematical methods in medicine
DOI:10.1155/2023/9895238
PMID:38124937
|
撤回 | 该文章被撤回 | NA | NA | NA | NA | NA | 心血管疾病 | NA | NA | NA | NA |
| 16273 | 2024-08-07 |
Combing Genome-Wide Association Studies and Single-Cell Analysis to Elucidate the Mechanisms of Kidney Disease: Proceedings of the Henry Shavelle Professorship
2023 Jan-Dec, Glomerular diseases
DOI:10.1159/000534678
PMID:38033715
|
综述 | 本文综述了将全基因组关联研究（GWAS）与单细胞组学（包括转录组学）相结合在肾脏疾病研究中的创新方法 | 本文强调了GWAS和scRNA-seq结合在深入理解肾脏疾病中的变革潜力 | NA | 加深对肾脏疾病潜在机制的理解 | 肾脏疾病 | NA | 肾脏疾病 | 全基因组关联研究（GWAS），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据，转录组数据 | NA |
| 16274 | 2024-08-07 |
IDEAS: individual level differential expression analysis for single-cell RNA-seq data
2022-01-24, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02605-1
PMID:35073995
|
研究论文 | 本文提出了一种名为IDEAS的统计方法，用于分析单细胞RNA测序数据中个体间基因表达的差异 | IDEAS方法通过总结每个基因在每个个体中的表达分布，并评估这些个体特定分布在两组个体之间是否存在差异，从而实现个体水平的差异表达分析 | NA | 旨在发现两组个体间差异表达的基因 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 自闭症, COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个个体 |
| 16275 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing in Yeast Using the 10× Genomics Chromium Device
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2257-5_1
PMID:35524108
|
研究论文 | 本文描述了一种使用10× Genomics平台对酵母Saccharomyces cerevisiae进行单细胞RNA测序的简易实施方案 | 引入了Zymolyase酶来消化细胞壁，以便在液滴形成初期有效裂解酵母细胞，同时不影响液滴乳化和后续样本处理 | NA | 研究微生物中单个细胞的生理学特性 | 酵母Saccharomyces cerevisiae | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 16276 | 2024-08-05 |
Computational immunogenomic approaches to predict response to cancer immunotherapies
2024-Jan, Nature reviews. Clinical oncology
DOI:10.1038/s41571-023-00830-6
PMID:37907723
|
综述 | 本文综述了用于分析癌症免疫治疗反应的计算免疫基因组方法 | 提出了新颖的计算方法和机器学习算法，以从基因组和转录组测序数据中提取临床有用的信息 | 未能充分探讨计算方法和测序技术在改善癌症患者管理中的真实潜力和局限性 | 研究计算免疫基因组方法在癌症免疫疗法中的应用与影响 | 主要研究肿瘤、基质及免疫细胞的基因组和转录组数据 | 计算生物学 | 癌症 | 单细胞转录组测序和多组学方法 | 机器学习算法 | 基因组和转录组数据 | 涉及多种癌症类型的大规模基因组数据 |
| 16277 | 2024-08-07 |
Identification of hub genes based on integrated analysis of single-cell and microarray transcriptome in patients with pulmonary arterial hypertension
2023-Dec-18, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09892-3
PMID:38110868
|
研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞和微阵列转录组数据，识别肺动脉高压患者中的关键基因 | 发现了WDR43和GNL2作为肺动脉高压的新分子机制和潜在治疗靶点 | NA | 揭示肺动脉高压的分子机制和潜在治疗靶点 | 肺动脉高压患者 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），微阵列转录组 | NA | 转录组数据 | 3名健康捐赠者和3名肺动脉高压患者的细胞，共计41,472个细胞 |
| 16278 | 2024-08-07 |
Large-scale single-cell RNA sequencing atlases of human immune cells across lifespan: Possibilities and challenges
2023-12, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202250222
PMID:36826421
|
研究论文 | 本文探讨了大规模单细胞RNA测序技术在人类免疫细胞研究中的应用及其面临的挑战 | 介绍了多组学和空间基因组平台在单细胞RNA测序项目中的应用趋势 | 讨论了大规模数据生成、分析和再分析以及数据传播的挑战 | 评估大规模单细胞RNA测序技术在免疫学领域的进展和挑战 | 人类免疫细胞及其在不同生命阶段的功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及人类胎儿和成人造血组织的大规模样本 |
| 16279 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic analysis of gingivo-buccal oral cancer reveals two dominant cellular programs
2023-Dec, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.15979
PMID:37792582
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析龈颊口癌，揭示了两种主导的细胞程序 | 识别了与口腔黏膜下纤维化相关的独特恶性细胞类型和基质细胞群的表型转变 | NA | 研究龈颊口癌中的细胞异质性 | 12名龈颊口癌患者的口腔肿瘤样本，其中3名患者同时存在口腔黏膜下纤维化 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 12名患者 |
| 16280 | 2024-08-07 |
The Notch1 signaling pathway directly modulates the human RANKL-induced osteoclastogenesis
2023-12-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-48615-2
PMID:38040752
|
研究论文 | 本文研究了Notch1信号通路在人类RANKL诱导的破骨细胞生成中的直接调节作用 | 首次报道了Notch1信号通路在人类破骨细胞生成中的作用，并揭示了Notch1与IL-7R信号通路的相互作用 | NA | 探讨Notch1信号通路在人类破骨细胞生成中的作用及其机制 | 人类单核CD14细胞和破骨细胞前体 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和抗体序列（AbSeq）分析 | NA | 细胞表面标记物数据 | 从外周血单核细胞（PBMCs）中直接分离的人类单核CD14细胞 |