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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2026-06-10 |
ST-LDAW: A Topic-Model and Damped Weighted Least-Squares Method for Integrative Deconvolution of Single-Cell and Spatial Transcriptomics
2026-Jun-09, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-026-00850-7
PMID:42262653
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 142 | 2026-06-10 |
Loss of tumor-infiltrating lymphocytes and poor response to immunotherapy in IDH GOF mutant melanoma
2026-Jun-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.195384
PMID:41955022
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研究论文 | 研究IDH功能获得性突变黑色素瘤中肿瘤浸润淋巴细胞缺失及对抗PD1免疫治疗反应不佳的机制 | 首次在人类黑色素瘤中描述IDH功能获得性突变与免疫微环境的关系,揭示了IDH突变通过影响DNA甲基化和免疫排斥导致免疫治疗耐受的新机制 | 具体局限性未在摘要中提及,可能需要进一步验证样本量及因果关系 | 探究IDH功能获得性突变对黑色素瘤免疫治疗反应的影响及其分子机制 | IDH功能获得性突变黑色素瘤患者的肿瘤样本及临床数据 | 机器学习, 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, DNA甲基化测序 | NA | 基因表达数据, 甲基化数据 | 未明确说明样本数量,涉及临床反应分析、单细胞RNA-seq、批量RNA-seq和DNA甲基化数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 143 | 2026-06-10 |
Long-acting IL-7 induces distinct transcriptomic features in peripheral T cells of patients with solid tumors
2026-Jun-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.203629
PMID:42012895
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学分析,研究长效IL-7对实体瘤患者外周T细胞的转录特征影响 | 首次通过单细胞转录组学揭示长效IL-7诱导实体瘤患者外周T细胞的独特转录状态,并发现二次给药后增殖减弱及远端信号通路下调 | 未提及具体局限性 | 探讨长效重组人IL-7(rhIL-7-hyFc)对晚期实体瘤患者外周T细胞的影响及其分子机制 | 晚期实体瘤患者的外周血T细胞 | 数字病理学 | 实体瘤 | 单细胞转录组学, 流式细胞术 | NA | 转录组数据, 流式细胞术数据 | 晚期实体瘤患者外周血样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 144 | 2026-06-10 |
Dissecting the cellular architecture of breast cancer brain metastases reveals prognostically distinct immune landscapes
2026-Jun-08, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2026.03.016
PMID:42049023
|
研究论文 | 对156例乳腺癌脑转移患者的免疫微环境进行多模态分析,揭示了两种与患者生存期延长相关的免疫景观 | 首次通过整合组织细胞术、批量及单核RNA测序、流式细胞术和空间转录组学等多模态方法,系统描绘乳腺癌脑转移的免疫微环境异质性,并识别出两种与生存预后相关的免疫景观,且这些景观无法从配对的原发肿瘤中推导得出 | 未提及明确的局限性 | 探究乳腺癌脑转移的免疫微环境异质性及其对免疫治疗的敏感性 | 156例乳腺癌脑转移患者的组织样本及患者衍生模型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单核RNA测序、空间转录组学、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、空间转录数据 | 156例临床样本 | 10x Genomics, Illumina | 单核RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单核RNA测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 145 | 2026-06-10 |
A conserved re-epithelialization program underlies malignancy in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Jun-08, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2026.03.021
PMID:42066759
|
研究论文 | 利用高分辨率空间转录组学,发现一个保守的再上皮化程序MP10,该程序标记胰腺导管腺癌的侵袭性癌细胞,并在PanIN向PDAC进展过程中激活,揭示了一个类似于伤口边缘角质形成细胞再上皮化的程序及其与肿瘤微环境的相互作用 | 首次识别出与伤口愈合再上皮化程序相似的MP10程序在胰腺癌恶性转化中的关键作用,并阐明其与肿瘤抑制基因和FOSL1转录因子的调控关系,以及形成的伤口样循环促进肿瘤侵袭 | 未说明 | 揭示胰腺导管腺癌从PanIN向PDAC进展的分子机制及保守的再上皮化程序 | 胰腺上皮内瘤变和胰腺导管腺癌细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学 | 未说明 | 空间转录组数据 | 人类PDAC样本及小鼠模型 | 未说明 | 空间转录组学 | 未说明 | 未说明 |
| 146 | 2026-06-10 |
The architecture of salt tolerance: A multi-scale view of sodium transport in plants
2026-Jun-08, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101888
PMID:42116609
|
综述 | 整合古典方法与单细胞RNA测序数据,提供植物钠稳态的多尺度视图,重点分析双子叶与单子叶植物在盐胁迫下的离子调节机制 | 利用公开的单细胞RNA测序数据集生成主要钠转运体SOS1及其钙依赖性调节因子以及高亲和性钾转运体(HKTs)的细胞类型特异性表达谱,揭示双子叶(拟南芥)与单子叶(水稻)在离子调节上的关键差异 | 依赖公开数据集,可能受限于数据质量和物种代表性 | 理解植物如何通过离子感应、膜转运、亚细胞隔离和组织水平分布协调钠离子跨空间域运动以在盐环境中生存 | 植物(拟南芥和水稻) | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 147 | 2026-06-10 |
Endocytic evasion confers resistance to antibody-drug conjugates therapy in cancer
2026-Jun-08, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2026.04.010
PMID:42167230
|
研究论文 | 通过整合配对空间转录组学、人源化小鼠模型和耐药细胞系统,揭示了癌细胞通过内吞逃逸对抗体-药物偶联物产生耐药性的新机制 | 首次发现AKR1C1蛋白通过结合NECTIN4并损害AP2M1依赖性网格蛋白介导的内吞作用,以及通过AKR1C1-WWP2轴促进细胞外囊泡介导的药物外排,从而降低细胞内药物积累,提出了一种靶点高表达但摄取缺陷的耐药状态 | 未提及具体局限性 | 阐明癌细胞对抗体-药物偶联物(ADC)产生原发性或获得性耐药的分子机制,并寻找克服耐药的治疗靶点 | 尿路上皮癌肿瘤样本、人源化小鼠模型、单细胞RNA测序数据、耐药细胞系 | 数字病理学 | 尿路上皮癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、人源化小鼠模型 | NA | 空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 配对治疗前后的肿瘤样本(具体数量未提及) | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 148 | 2026-06-10 |
Exploring the gut-lung axis in post-liver transplant acute lung injury: A multi-omics approach
2026-Jun-08, Acta microbiologica et immunologica Hungarica
IF:1.3Q4
DOI:10.1556/030.2026.02911
PMID:42258310
|
研究论文 | 该混合转化研究整合转录组分析、免疫浸润分析、粪便菌群组成及预测功能分析,探究肝移植后急性肺损伤中肠-肺轴的机制 | 首次通过多组学方法揭示肝移植后急性肺损伤中肠道菌群失调与宿主免疫基因表达及肺部炎症的功能性肠-肺免疫轴联系 | 具体限制未在摘要中明确提及,可能包括样本量有限或因果关系需进一步验证 | 探究肝移植后急性肺损伤中肠道菌群失调与发病机制的功能联系 | 肝移植后急性肺损伤患者与非急性肺损伤患者的粪便样本、血清和支气管肺泡灌洗液 | 机器学习 | 肺部疾病 | RNA-seq, 16S rRNA测序 | LASSO, SVM-RFE, 随机森林 | 转录组数据(bulk和单细胞RNA-seq)、微生物组数据(16S rRNA)、临床样本 | 急性肺损伤与非急性肺损伤肝移植患者样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 16S rRNA测序 | NA | NA |
| 149 | 2026-06-10 |
ILT2 identifies an unexploited pool of intratumoral CD8+ bystander T cells with TCR-independent cytotoxicity in renal cell carcinoma
2026-Jun-08, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-1109
PMID:42258315
|
研究论文 | 揭示肾细胞癌中CD8+ILT2+肿瘤浸润淋巴细胞具有TCR非依赖性细胞毒性,并识别HLA-G/ILT2轴作为免疫抑制通路的新治疗靶点 | 首次鉴定CD8+ILT2+ TILs为一种不同于CD8+PD1+ TILs的独特亚群,具有TCR非依赖性细胞毒性,并阐明其通过激活天然受体NKG2D发挥抗肿瘤活性 | 未明确提及具体局限性,但可能包括体内验证不足、样本量有限或临床转化挑战 | 探究CD8+ILT2+肿瘤浸润淋巴细胞在肾透明细胞癌中的特征、功能及作为免疫治疗靶点的潜力 | 肾透明细胞癌患者的CD8+ILT2+和CD8+PD1+肿瘤浸润淋巴细胞 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 高维光谱流式细胞术、单细胞转录组学、TCR克隆型分析 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞术数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞转录组测序平台 |
| 150 | 2026-06-10 |
Protocol for identifying recirculating thymic regulatory T cells and characterizing the role of Eos in their function using scRNA-seq and TCR-seq
2026-Jun-08, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2026.104620
PMID:42258356
|
研究论文 | 该协议描述了如何识别小鼠胸腺中的再循环调节性T细胞,并利用单细胞RNA测序和TCR测序表征Eos在其功能中的作用 | 提出了一种基于单细胞RNA测序和TCR测序数据识别再循环胸腺调节性T细胞的精细分类方法 | 未提及具体局限性 | 提供一种识别再循环胸腺调节性T细胞并表征Eos在其功能中作用的实验和分析方案 | 小鼠胸腺中的再循环调节性T细胞 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq, TCR-seq | NA | 文本, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 151 | 2026-06-10 |
Polystyrene nanoplastics induce mitochondrial dysfunction and stress responses in human PBMCs
2026-Jun-08, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.120323
PMID:42259119
|
研究论文 | 研究聚苯乙烯纳米塑料对人外周血单核细胞(PBMC)的线粒体功能障碍与应激反应 | 首次综合运用成像、线粒体应激测试、嗜碱性粒细胞激活实验和单细胞RNA测序,揭示了纳米塑料迅速破坏人免疫细胞线粒体功能并激活蛋白毒性应激程序 | 仅使用聚苯乙烯纳米塑料,未涵盖其他类型微纳塑料;实验主要为体外短期暴露,缺乏长期效应评估 | 探讨纳米塑料对人类免疫细胞的直接效应及其机制 | 人外周血单核细胞(PBMC) | 数字病理学 | 免疫失调相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 人PBMC样本(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 152 | 2026-06-10 |
Targeting ATF4 overcomes dual resistance to chemo-immunotherapy in gastric cancer by disrupting the DNA damage response
2026-Jun-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2026-015109
PMID:42259601
|
研究论文 | 通过整合分析揭示ATF4通过上调HSPA9激活DNA损伤反应,导致胃癌对化疗免疫治疗的双重耐药性 | 首次发现转录因子ATF4作为调控胃癌化疗免疫双重耐药的关键因子,并阐明其通过HSPA9-DNA损伤反应轴连接内在化疗耐药与外源性免疫抑制的分子机制 | 未提及具体的局限性 | 阐明胃癌化疗免疫治疗双重耐药的分子机制,并鉴定关键调控因子和潜在治疗靶点 | 胃癌细胞系、患者来源类器官、患者来源异种移植模型及胃癌患者临床队列 | 机器学习 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、批量转录组测序、染色质免疫共沉淀测序、RNA测序、多重免疫荧光 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 多个胃癌队列的单细胞RNA测序和批量转录组数据集;胃癌细胞系、类器官和异种移植模型;临床胃癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 153 | 2026-06-10 |
USP1-mediated lipophagy-lipogenesis axis drives cholangiocarcinoma progression and immune evasion
2026-Jun-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2026-015116
PMID:42259603
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了USP1介导的脂噬-脂生成轴驱动胆管癌进展和免疫逃逸的机制 | 首次阐明USP1通过协调脂噬和脂生成促进长链不饱和脂肪酸积累,并建立代谢-免疫正反馈环,提出靶向USP1可增强免疫治疗效果 | NA | 阐明胆管癌代谢重编程与免疫逃逸的分子联系,为开发肿瘤微环境靶向疗法提供依据 | 胆管癌细胞、肿瘤相关巨噬细胞、细胞毒性T细胞 | 数字病理学 | 胆管癌 | 非靶向代谢组学、二代测序、蛋白质组学、单细胞RNA测序、Olink蛋白质组学、流式细胞术、多重免疫组化 | NA | 多组学数据(代谢组、转录组、蛋白质组) | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 154 | 2026-06-10 |
Mycobacterium tuberculosis IDH-PPARγ interaction suppresses GPX4 to drive macrophage ferroptosis and sustain persistent infection
2026-Jun-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74032-w
PMID:42259813
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研究论文 | 该研究揭示了结核分枝杆菌通过IDH-PPARγ相互作用抑制GPX4表达诱导巨噬细胞铁死亡,从而维持持续性感染的机制 | 首次发现结核分枝杆菌IDH蛋白与PPARγ直接相互作用并抑制其蛋白酶体降解,进而通过NCOR/SMRT复合物抑制GPX4表达诱导铁死亡,为结核病治疗提供了新靶点 | NA | 研究结核分枝杆菌如何操纵巨噬细胞脂质代谢诱导脂质过氧化和铁死亡以维持细菌持久性 | 小鼠巨噬细胞 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序,蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 155 | 2026-06-10 |
Integrative machine learning and multi-omics analysis reveals ATIC as a promoter of hepatocellular carcinoma progression
2026-Jun-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-54816-2
PMID:42259854
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研究论文 | 通过整合机器学习和多组学分析,揭示ATIC作为肝细胞癌进展的促进因子 | 首次基于221个自噬相关基因表达模式,通过共识聚类识别肝细胞癌亚型,并构建包含ATIC、RHEB、TMEM74和PRKCD的四基因预后模型,结合单细胞RNA测序发现ATIC在肿瘤细胞和增殖T细胞中高表达且与自噬活性正相关 | 尚需进一步临床验证和机制研究以确认ATIC在肝细胞癌中的具体作用 | 探索自噬相关基因在肝细胞癌进展和免疫调控中的作用,并构建预后模型 | 肝细胞癌患者及其肿瘤样本 | 机器学习 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | LASSO, 多变量Cox回归 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | TCGA数据库中的肝细胞癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 156 | 2026-06-10 |
CMS4 epithelial-intrinsic glycosyltransferase GALNT5 promotes tumor aggressiveness and correlates with poor survival in colorectal cancer
2026-Jun-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-57104-1
PMID:42259894
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析,定义了结直肠癌CMS4亚型肿瘤上皮细胞特有的糖基转移酶特征,并发现GALNT5促进肿瘤侵袭性并与不良生存相关 | 首次利用单细胞转录组学区分CMS4肿瘤上皮细胞与基质信号,揭示了CMS4亚型中肿瘤细胞内在的糖基转移酶程序,避免了传统批量转录组中基质信号的干扰 | NA | 解析结直肠癌CMS4亚型肿瘤上皮细胞内在的糖基转移酶图谱及其对肿瘤侵袭性的影响 | 结直肠癌CMS4亚型肿瘤上皮细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 431例结直肠癌切除标本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 157 | 2026-06-10 |
Large language model consensus substantially improves the cell type annotation accuracy for scRNA-seq data
2026-Jun-08, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10420-8
PMID:42260142
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研究论文 | 提出mLLMCelltype框架,通过多个大型语言模型的迭代协商实现单细胞RNA测序数据的细胞类型注释,显著提升准确性和可靠性 | 利用多个LLM的集体智能进行结构化协商,克服单一模型偏见和参考数据依赖,提供透明推理链和共识置信度指标 | 未提及 | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的准确性,减少人工标注工作 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 大型语言模型 | 单细胞基因表达数据 | 49个不同数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 158 | 2026-06-10 |
Transcriptional analyses identify pericyte-centered signaling programs altered by sex and brain region in Alzheimer's Disease
2026-Jun-08, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10446-y
PMID:42260160
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研究论文 | 通过单核RNA测序分析,研究了阿尔茨海默病中周细胞转录和信号变化在性别和脑区上的差异 | 首次系统揭示周细胞在AD中性别和脑区特异性的信号传导程序变化,特别是发现雌性AD患者特定脑区中上调的周细胞-内皮TGFβ信号程序及下调的雌激素通路 | 未提及具体局限性,但可能受限于样本量、仅分析两个脑区,以及仍需功能验证推断的细胞间通讯 | 探究阿尔茨海默病中周细胞转录和信号变化在性别和脑区特异性方面的作用机制 | 人类脑组织中的周细胞及相关细胞类型(内皮细胞、星形胶质细胞、小胶质细胞) | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | AD和非AD捐赠者,按性别分层,涵盖中颞叶回和背外侧前额叶皮层两个脑区 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 159 | 2026-06-10 |
The embryonic origins of site-specific arthritis
2026-Jun-08, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-026-02542-2
PMID:42260300
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序、成像和X射线断层扫描,研究人类胎儿手指关节的细胞组成和空间结构,揭示近端指间关节易发炎性关节炎的胚胎起源 | 首次揭示PI16'通用'成纤维细胞在近端指间关节中的富集及其在血管周围和肌腱-韧带界面的定位,为炎症易感性的组织特异性提供胚胎学基础 | 未提及 | 探究炎性关节炎在不同关节位点选择性发病的细胞基础 | 人类胎儿手指关节,特别是近端指间关节和远端指间关节 | 数字病理学 | 关节炎 | 单细胞RNA测序、成像、X射线断层扫描 | NA | 单细胞转录组数据、图像数据 | 人类胎儿手指关节组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 160 | 2026-06-10 |
GPNMB-ECD drives acquired resistance to osimertinib in NSCLC via inducing tumor cell cytoskeletal reorganization
2026-Jun-08, Cellular & molecular biology letters
IF:9.2Q1
DOI:10.1186/s11658-026-00965-1
PMID:42260371
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研究论文 | 揭示GPNMB-ECD通过诱导肿瘤细胞骨架重排驱动非小细胞肺癌对奥希替尼获得性耐药的机制 | 首次发现GPNMB-ECD作为肿瘤微环境中的关键因子,通过SDC4-F-actin-YAP信号轴促进奥希替尼耐药,并验证了抗GPNMB-ECD抗体作为克服耐药的精准治疗策略的可行性 | 具体局限性未在摘要中提及 | 探究GPNMB-ECD在非小细胞肺癌对奥希替尼获得性耐药中的作用及其机制 | 非小细胞肺癌组织和细胞系,以及人源化患者来源异种移植模型(huPDX) | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、免疫组化、ELISA、免疫共沉淀、免疫荧光、透射电镜 | NA | 基因表达数据、图像 | NSCLC患者组织样本和血浆样本,以及细胞系和裸鼠模型(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |