单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
101	2025-09-19	Integrated Single-Cell and Spatial Transcriptomic Analysis Reveals a Pathological Niche Formed by FAP+ Fibroblasts, Immune, and Endothelial Cells in Psoriatic Lesions 2025, Clinical, cosmetic and investigational dermatology DOI:10.2147/CCID.S541106 PMID:40963886	研究论文	通过整合单细胞和空间转录组学分析，揭示银屑病病变中由FAP+成纤维细胞、免疫细胞和内皮细胞形成的病理微环境	首次发现银屑病病变中特异的CD4+组织驻留记忆T细胞亚群和Venous endo2内皮细胞亚群，并揭示它们与FAP+成纤维细胞的空间共定位形成病理微环境	NA	阐明银屑病病变中免疫微环境的细胞和分子机制	银屑病患者的病变皮肤组织	生物医学	银屑病	scRNA-seq, spatial transcriptomics, bulk RNA-seq	NA	转录组数据	NA
102	2025-09-19	Nociceptive Neurons Promote Myeloid-Derived Suppressor Cell Mobilization to Alleviate Post-Stroke Neuroinflammation 2025, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.119474 PMID:40963921	研究论文	研究探讨了痛觉神经元通过释放CGRP调节骨髓免疫反应以缓解脑梗死后神经炎症的机制	首次揭示痛觉神经元在脑梗死后通过CGRP信号促进髓系偏向造血和MDSC动员的抗炎作用，并开发靶向纳米颗粒递送技术克服CGRP的副作用	NA	探究痛觉神经元在脑梗死后免疫调节中的作用及治疗策略	MCAO小鼠模型和卒中患者颅骨骨髓样本	神经免疫学	脑血管疾病	流式细胞术、免疫荧光、单细胞RNA测序、纳米颗粒靶向递送	NA	实验数据、测序数据	小鼠模型和人类卒中患者样本（具体数量未明确说明）
103	2025-09-19	Dimeric CCK2R radiotheranostic tracers synergize with mTOR inhibition for enhanced tumor therapy 2025, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.117021 PMID:40963930	研究论文	本研究开发了一种新型二聚体CCK2R靶向放射性示踪剂，并探索其与mTOR抑制剂联用增强肿瘤治疗的潜力	首次设计并评估了二聚体CCK2R靶向放射性药物，结合mTOR抑制和单细胞RNA测序揭示放射增敏机制	NA	开发新型放射性诊疗药物并增强CCK2R阳性肿瘤的放疗效果	神经内分泌肿瘤（特别是甲状腺髓样癌和小细胞肺癌）	放射医学与分子影像	甲状腺癌，肺癌	PET成像，放射性核素治疗，scRNA-seq	NA	分子影像数据，基因表达数据	NA
104	2025-09-19	Bioinformatics Analysis and Experimental Validation of Lactylation Related Genes in Lung Adenocarcinoma 2025, Cancer management and research IF:2.5Q3 DOI:10.2147/CMAR.S533289 PMID:40964497	研究论文	本研究通过生物信息学分析和实验验证探讨乳酸化修饰在肺腺癌中的表达水平及其相关基因的预后价值	首次系统研究乳酸化修饰在肺腺癌中的功能，并鉴定出五个新的预后相关基因标志物	样本量有限（TCGA n=365），且主要基于生物信息学分析，实验验证仍需扩展	探究乳酸化修饰作为肺腺癌预后标志物和治疗靶点的双重价值	肺腺癌组织和细胞系（H1299）	生物信息学	肺癌	免疫组化、免疫荧光、Western blot、RNA测序	COX回归分析	多组学数据（基因组、转录组）	TCGA数据库365例样本，GEO数据库单细胞RNA测序数据
105	2025-09-19	Research Progress of Natural Killer Cells in Hashimoto's Thyroiditis 2025, ImmunoTargets and therapy IF:6.2Q1 DOI:10.2147/ITT.S545646 PMID:40964505	综述	本文综述了自然杀伤细胞在桥本甲状腺炎发病机制中的双重作用及其潜在治疗靶点价值	通过单细胞RNA测序揭示NK细胞功能异质性，发现NLRP3炎症小体异常激活驱动NK细胞介导的甲状腺滤泡细胞焦亡	NA	探讨自然杀伤细胞在桥本甲状腺炎免疫失衡中的作用机制	桥本甲状腺炎患者及自然杀伤细胞	免疫学	桥本甲状腺炎	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
106	2024-11-22	Author Correction: Single-cell transcriptomics stratifies organoid models of metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease 2024-Dec, The EMBO journal DOI:10.1038/s44318-024-00308-w PMID:39567832	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
107	2025-09-19	Advancing toward a unified eosinophil signature from transcriptional profiling 2024-Nov-27, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2 DOI:10.1093/jleuko/qiae188 PMID:39213186	综述	本文总结了小鼠和人类嗜酸性粒细胞在血液和组织中的转录谱研究进展，并讨论了不同方法的优势和潜在问题	提出建立嗜酸性粒细胞研究的通用技术标准，推动领域发展并实现跨研究比较	嗜酸性粒细胞转录分析受细胞脆弱性和高质量RNA分离难度限制，人类样本研究仍存在知识空白	提高嗜酸性粒细胞相关疾病的诊断精确性和治疗选择	小鼠和人类嗜酸性粒细胞	转录组学	嗜酸性粒细胞相关疾病	单细胞RNA测序、bulk RNA测序、微阵列	NA	RNA序列数据	NA
108	2025-09-19	Sample multiplexing for retinal single-cell RNA sequencing 2024-Nov-15, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2024.111250 PMID:39569377	研究论文	本文建立了一种用于小鼠视网膜神经节细胞的单细胞RNA测序样本多重标记流程，利用胆固醇修饰寡核苷酸进行样本标记	开发了基于胆固醇修饰寡核苷酸的scRNA-seq样本多重标记方法，能够解析样本来源同时保留表型数据	NA	解决稀有细胞群体在单细胞RNA测序中的表征挑战，提高样本识别精度	小鼠视网膜神经节细胞	单细胞测序技术	NA	单细胞RNA测序(scRNA-seq)，胆固醇修饰寡核苷酸标记	NA	单细胞转录组数据	NA
109	2025-09-19	Nerve-associated macrophages control adipose homeostasis across lifespan and restrain age-related inflammation 2024-Oct-13, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.10.12.618004 PMID:39416197	研究论文	本研究通过单细胞测序揭示了脂肪组织中神经相关巨噬细胞（NAMs）在调控脂肪稳态和抑制年龄相关炎症中的关键作用	首次定义了CD169+神经相关巨噬细胞（NAMs）亚群，并证明其通过防止儿茶酚胺抵抗来抑制衰老相关炎症	NA	探究脂肪组织巨噬细胞（ATMs）如何调控年龄相关炎症（inflammaging）	小鼠内脏白色脂肪组织（VAT）中的巨噬细胞亚群	免疫学	老年性疾病	单细胞测序、血管内标记、正交验证	NA	单细胞测序数据	NA
110	2025-09-19	Endothelial-adipocyte Cx43 Mediated Gap Junctions Can Regulate Adiposity 2024-Sep-10, Function (Oxford, England) DOI:10.1093/function/zqae029 PMID:38984993	研究论文	研究内皮细胞与脂肪细胞间Cx43介导的间隙连接在调节肥胖中的作用	首次揭示内皮细胞Cx43通过间隙连接调控脂肪组织功能的具体机制，并发现Ser368磷酸化修饰的关键作用	研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证	探究脂肪毛细血管内皮细胞与脂肪细胞相互作用的机制及其对代谢功能的影响	小鼠模型、人类scRNAseq数据、体外共培养系统	代谢疾病研究	肥胖症	scRNAseq、TEM、遗传敲除、体外共培养	NA	基因表达数据、显微图像、代谢参数	高脂饮食小鼠模型及相应遗传修饰小鼠
111	2025-09-19	Vascular heterogeneity of tight junction Claudins guides organotropic metastasis 2024-Sep, Nature cancer IF:23.5Q1 DOI:10.1038/s43018-024-00813-1 PMID:39289595	研究论文	本研究揭示了血管内皮紧密连接蛋白Claudins的器官特异性异质性在决定乳腺癌器官趋向性转移中的关键作用	发现Ang2介导的Claudin 5抑制促进肺转移，而非Ang2响应的Claudin 2和10阻止肾转移，首次证明血管异质性独立于癌细胞内在机制指导转移	主要关注乳腺癌症模型，其他癌症类型的普适性尚未验证	探究器官特异性转移的机制，特别是乳腺癌向肺而非肾转移的原因	转移性乳腺癌症模型，包括自发和植入模型，以及炎症组织纤维化	癌症生物学	乳腺癌	单细胞测序分析，功能研究，抗体阻断实验	NA	测序数据，功能实验数据	NA
112	2025-09-19	Characterisation of HBV and co-infection with HDV and HIV through spatial transcriptomics 2024-Aug, eGastroenterology DOI:10.1136/egastro-2024-100067 PMID:39149129	研究论文	本研究利用空间转录组学技术分析慢性HBV感染及HDV/HIV共感染患者的肝活检样本，揭示肝内转录景观和免疫应答特征	首次应用NanoString GeoMx平台对HBV共感染肝组织进行空间分辨转录组分析，发现感染类型特异的转录特征和免疫细胞分布	样本量较小（仅3例初治患者），属于原理验证性研究	评估空间转录组学在表征HBV共感染肝内生物学过程的应用价值	慢性HBV感染合并HDV或HIV共感染患者的肝活检组织	空间转录组学	病毒性肝炎	NanoString GeoMx数字空间分析，人类全转录组图谱检测	加权基因共表达网络分析（WGCNA）	空间转录组数据，FFPE组织切片	3例未经治疗的慢性HBV合并HDV/HIV共感染患者
113	2025-09-19	Obesogenic diet disrupts tissue-specific mitochondrial gene signatures in the artery and capillary endothelium 2024-Feb-01, Physiological genomics IF:2.5Q2 DOI:10.1152/physiolgenomics.00109.2023 PMID:37982169	研究论文	本研究探讨了肥胖饮食对动脉和毛细血管内皮中线粒体基因表达的组织特异性影响	揭示了PPAR-γ在肥胖诱导的内皮细胞表型转换中的驱动作用，并通过人类数据验证了发现	NA	理解肥胖如何影响内皮细胞代谢表型，特别是线粒体基因表达	小鼠和人类的内皮细胞，特别是脂肪和肠系膜血管床	分子生物学	肥胖相关代谢疾病	bulk RNA测序, single-cell RNA测序, single-nuclei RNA测序	NA	RNA测序数据	小鼠脂肪和肠系膜血管内皮细胞，以及人类内脏脂肪单核RNA测序数据
114	2025-09-19	Isolation and Single-Cell Transcriptomic Analysis of Murine Regulatory B Cells 2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-3754-8_12 PMID:38622400	研究论文	本章介绍了从狼疮易感MRL/lpr小鼠中分离调节性B细胞（Breg）并进行单细胞RNA测序分析的实验方案	提供了针对狼疮模型小鼠的Breg细胞分离方案，并采用单细胞转录组分析技术深入表征Breg细胞	NA	研究调节性B细胞在自身免疫疾病和癌症免疫中的生物学功能与分子特征	狼疮易感MRL/lpr小鼠的调节性B细胞	NA	自身免疫疾病（狼疮）	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据	NA
115	2025-09-19	Hyperactive mTORC1 in lung mesenchyme induces endothelial cell dysfunction and pulmonary vascular remodeling 2023-12-20, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI172116 PMID:38127441	研究论文	本研究探讨肺间质中过度活跃的mTORC1如何通过旁分泌信号导致内皮细胞功能障碍和肺血管重塑	首次揭示LAM中间质细胞通过旁分泌信号与内皮细胞对话，驱动血管重塑的机制，并建立特异性Tsc2敲除小鼠模型模拟人类疾病	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限；长期效应和临床转化需进一步研究	探究淋巴管平滑肌瘤病（LAM）中肺血管重塑的分子机制	肺间质细胞和内皮细胞，使用Tbx4LME-Cre Tsc2fl/fl基因工程小鼠模型和LAM患者肺组织	分子病理学	肺疾病	单细胞RNA测序（scRNA-Seq），基因敲除模型	NA	转录组数据，组织形态学数据	基因工程小鼠模型（年龄8周至1年）和人类LAM终末期肺移植样本
116	2025-09-19	Retrospective pharmacogenetic study of psoriasis highlights the role of KLK7 in tumour necrosis factor signalling 2023-12-20, The British journal of dermatology DOI:10.1093/bjd/ljad332 PMID:37672660	研究论文	一项回顾性药物遗传学研究，探索银屑病治疗反应相关的遗传通路，并揭示KLK7基因在肿瘤坏死因子信号通路中的作用	发现两个新型遗传标记与治疗反应相关，并首次通过整合多组学数据验证KLK7在抗TNF治疗响应中的生物学机制	回顾性研究设计，样本量相对有限（1942例），自我评估的治疗反应可能存在偏倚	探索银屑病药物反应相关的遗传通路，寻找预测治疗效果的生物标志物	1942例基因分型的银屑病患者	药物遗传学	银屑病	基因分型、表观基因组学、转录组学、免疫组化、单细胞RNA测序	线性回归	遗传数据、临床数据、表达数据	1942例银屑病患者
117	2025-09-19	Single-cell transcriptomics stratifies organoid models of metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease 2023-12-11, The EMBO journal DOI:10.15252/embj.2023113898 PMID:37962490	研究论文	本研究通过单细胞转录组学评估了三种代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD）的人肝类器官模型，比较了它们在炎症和纤维化模拟方面的差异	首次系统评估不同诱导条件（油酸、棕榈酸和TGF-β1）下MASLD类器官模型的翻译潜力，并建立单细胞参考基准	研究仅基于体外类器官模型，尚未进行体内验证或临床相关性研究	评估和分层MASLD肝类器官模型的疾病模拟能力	人肝类器官	数字病理学	代谢功能障碍相关脂肪性肝病	单细胞转录组学分析	类器官模型	单细胞基因表达数据	三种不同诱导条件下的肝类器官模型
118	2025-09-19	GPNMB+ Gal-3+ hepatic parenchymal cells promote immunosuppression and hepatocellular carcinogenesis 2023-12-11, The EMBO journal DOI:10.15252/embj.2023114060 PMID:38009297	研究论文	通过单细胞转录组测序揭示GPNMB+ Gal-3+肝实质细胞在肝细胞癌免疫抑制微环境形成和恶性进展中的关键作用	首次在单细胞层面鉴定出肝细胞癌进展过程中的三种肝实质细胞亚群，并发现GPNMB+ Gal-3+ MT细胞兼具恶性和免疫抑制特性	NA	探究肝细胞癌发生发展过程中特定细胞群体及其在肿瘤免疫微环境形成中的作用	毒素诱导的肝肿瘤大鼠模型和肝细胞癌患者样本	数字病理学	肝细胞癌	单细胞转录组测序	NA	单细胞RNA测序数据	大鼠模型和HCC患者样本（具体数量未明确说明）
119	2025-09-19	Hemorrhage-activated NRF2 in tumor-associated macrophages drives cancer growth, invasion, and immunotherapy resistance 2023-12-07, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI174528 PMID:38060331	研究论文	本研究揭示了肿瘤内出血通过激活NRF2通路促进肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的促癌功能，从而驱动癌症进展和免疫治疗抵抗	首次将肿瘤内出血与NRF2激活的TAMs促癌功能直接关联，并阐明血红素作为关键微环境因子通过NRF2信号轴调控巨噬细胞表型	研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类临床相关性仍需进一步验证	探索肿瘤内出血如何通过调控巨噬细胞功能影响癌症进展和治疗响应	肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）、MC38结肠腺癌细胞系、小鼠模型	肿瘤免疫学	结肠癌	单细胞RNA测序、空间转录组学、3D细胞培养球体功能实验	NA	转录组数据、空间基因表达数据	MC38肿瘤小鼠模型及体外培养系统
120	2025-09-19	IL-27 produced during acute malaria infection regulates Plasmodium-specific memory CD4+ T cells 2023-12-07, EMBO molecular medicine IF:9.0Q1 DOI:10.15252/emmm.202317713 PMID:37855243	研究论文	本研究揭示急性疟疾感染期间产生的IL-27通过抑制独特Th1记忆前体CD4+T细胞的发育来调控免疫应答	发现IL-27在急性感染期靶向CD4+T细胞应答的关键时间窗口，并鉴定出两个具有独特功能特征的CD4+T细胞亚群	研究局限于啮齿类疟原虫感染模型，人类中的适用性需进一步验证	阐明IL-27在疟疾感染中对CD4+T细胞记忆形成的调控机制	疟原虫特异性记忆CD4+T细胞	免疫学	疟疾	单细胞RNA测序，细胞因子中和实验	NA	基因表达数据，流式细胞术数据	使用疟原虫感染的小鼠模型进行研究