单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 33707 篇文献,本页显示第 141 - 160 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
141 2025-12-06
Materiobiology in the omics era
2025-Dec, Materials today. Bio
综述 本文综述了多组学技术在材料生物学中的应用,包括单细胞转录组学、转录组学、RNomics、基因组学、蛋白质组学、代谢组学、脂质组学、糖组学和免疫组学,并讨论了多组学策略如何支持骨类器官的构建 整合多种组学技术揭示细胞与生物材料相互作用的复杂调控机制,为下一代生物材料的理性设计提供理论基础和方法学 NA 探讨多组学技术在材料生物学中的应用,以推动精准和再生医学中的材料创新 细胞与生物材料的相互作用,以及骨类器官作为生理相关模型 材料生物学 NA 单细胞转录组学, 转录组学, RNomics, 基因组学, 蛋白质组学, 代谢组学, 脂质组学, 糖组学, 免疫组学 NA 多组学数据 NA NA 单细胞 RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 NA NA
142 2025-12-06
Immunological dynamics in orthotopic compared with subcutaneous murine models of HPV-positive oropharyngeal cancer
2025-Dec-01, Disease models & mechanisms IF:4.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,比较了HPV阳性口咽鳞状细胞癌的皮下和原位小鼠模型在免疫特征上的差异 首次利用单细胞RNA测序技术系统比较了HPV阳性口咽鳞状细胞癌的皮下和原位小鼠模型的免疫动态,揭示了它们在模拟人类肿瘤不同免疫阶段的适用性 研究仅基于小鼠模型,未直接验证人类样本,且样本规模可能有限 评估HPV阳性口咽鳞状细胞癌小鼠模型在免疫特征上的代表性,以指导临床前免疫治疗研究 HPV阳性口咽鳞状细胞癌的小鼠模型(皮下和原位) 单细胞测序 口咽癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
143 2025-12-06
Considerations for Spatial Omics, Metabolite Analyses, and Tissue-Harvesting Artifacts
2025-Dec, Journal of neurochemistry IF:4.2Q2
评论 本文讨论了空间组学、代谢物分析和组织采集伪影的考虑因素,强调了在空间生物学新兴领域中组织准备的重要性 强调了在空间分子技术应用中,适当组织采集和酶失活方法以避免神经化学降解和伪影生成的创新点 未具体说明实验数据或样本量,主要基于理论讨论,缺乏实证验证 探讨空间生物学中新兴分析技术的应用,并强调组织准备在避免伪影中的关键作用 空间组学技术、代谢物分析、组织采集方法 空间生物学 NA 空间质谱成像、空间转录组学、激光显微切割、单细胞类型分析、NGS NA 空间分子数据、代谢物数据 NA NA 空间质谱成像, 空间转录组学, 单细胞RNA-seq NA NA
144 2025-12-06
BMP4 cocktail promotes utricular progenitor reprogramming and vestibular functional recovery in adult mice
2025-Nov-29, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究探讨了BMP4在小鼠前庭毛细胞再生中的作用,通过激活c-Fos促进非毛细胞重编程,并联合Notch抑制和Wnt激活恢复前庭功能 首次揭示BMP4通过c-Fos激活增强前庭非毛细胞重编程,并联合靶向Notch和Wnt通路的小分子组合促进成年小鼠前庭功能恢复 研究主要基于小鼠模型,临床转化潜力需进一步验证;长期安全性和疗效评估不足 探究BMP4在耳毒性损伤后前庭毛细胞再生中的作用机制 成年C57BL/6J背景小鼠(包括多种转基因品系)的前庭毛细胞和非毛细胞 分子生物学与再生医学 前庭功能障碍 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、CUT&Tag测序、免疫荧光染色、Western blot分析 NA 转录组数据、表观基因组数据、图像数据 P30成年小鼠及P2小鼠球体/外植体组织 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, CUT&Tag NA NA
145 2025-12-06
Single-cell transcriptome analysis elucidates the microenvironmental interactions between colorectal cancer and sarcopenia
2025-Nov-28, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 本研究通过整合分析结直肠癌肿瘤组织和肌肉减少症肌肉组织的单细胞转录组数据,揭示了两种疾病共享细胞类型在不同组织微环境中的功能异质性及其潜在的跨组织调控网络 首次整合结直肠癌(CRC)和肌肉减少症(SP)的单细胞转录组数据,系统解析了跨组织微环境的相互作用,并识别出共享核心细胞类型在不同疾病背景下的功能分化 样本量相对有限(16个CRC样本和17个SP样本),且为观察性研究,需进一步实验验证所识别的信号通路 阐明结直肠癌与肌肉减少症共存的微环境相互作用机制 结直肠癌肿瘤组织和肌肉减少症肌肉组织 单细胞转录组学 结直肠癌, 肌肉减少症 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 单核RNA测序(snRNA-seq) Harmony(批次效应校正), CellChat(细胞通讯建模) 单细胞转录组数据 16个结直肠癌肿瘤组织样本(scRNA-seq)和17个肌肉减少症肌肉组织样本(snRNA-seq) NA 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 NA NA
146 2025-12-06
Identification of ferroptosis-related therapeutic targets and causal risk factors in aortic dissection via multi-omics integration
2025-Nov-28, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 本研究通过多组学整合分析,识别了主动脉夹层中与铁死亡相关的关键基因、调控网络及潜在的因果风险因素 首次将单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析相结合,系统探究铁死亡在主动脉夹层中的作用,并揭示了肠道微生物和血清代谢物与疾病的潜在因果关联 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏前瞻性临床队列验证;孟德尔随机化分析结果需进一步实验证实 阐明铁死亡在主动脉夹层发病机制中的作用,并识别潜在的治疗靶点和风险因素 主动脉夹层患者与对照组的基因表达数据、单细胞转录组数据、肠道微生物组和血清代谢组数据 生物信息学 心血管疾病 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, 全基因组关联研究 LASSO回归, ROC分析 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 基因组关联数据 未明确具体样本数量,数据来源于公共数据库 NA 单细胞RNA-seq, 全基因组关联分析 NA NA
147 2025-12-06
UGP2 is a potential target for breast cancer, based on bioinformatics analysis and in vitro experiments
2025-Nov-26, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过生物信息学分析和体外实验,系统探讨了UGP2在乳腺癌进展中的临床相关性及功能机制 首次系统性地将UGP2表达与乳腺癌(尤其是TNBC亚型)的临床病理特征、预后及肿瘤微环境中的空间分布联系起来,并通过功能实验验证了其促癌作用 研究主要基于公共数据库分析和体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证和更大规模的临床队列验证 探究UGP2在乳腺癌发生发展中的临床意义和生物学功能 乳腺癌患者样本(来自TCGA等数据库及118例临床标本)及乳腺癌细胞系 生物信息学 乳腺癌 生物信息学多组学分析、免疫组化、单细胞RNA测序、siRNA敲低实验 NA 基因表达数据、临床病理数据、单细胞RNA测序数据、体外细胞功能数据 TCGA等公共数据库样本及118例临床乳腺癌标本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
148 2025-12-06
Harnessing dental stem cell-derived synovial cells for IBD therapy: dual modulation of gut immunity and crypt repair
2025-Nov-20, EBioMedicine IF:9.7Q1
研究论文 本研究提出利用人脱落乳牙干细胞(SHEDs)治疗炎症性肠病(IBD)的新策略,揭示了SHEDs在肠道内分化为具有双重治疗功能的静止成纤维样滑膜细胞(QFLSs)的机制 首次发现SHEDs可通过β-catenin非依赖的Wnt/JNK通路分化为TGM2+TFPI2+ QFLSs,并同时通过促进潘氏细胞增殖和扩增免疫抑制性Treg细胞来修复上皮损伤和调节免疫失调 研究主要基于小鼠结肠炎模型和人类组织验证,尚未开展临床试验 开发基于干细胞的新型IBD治疗方法 人脱落乳牙干细胞(SHEDs)、小鼠结肠炎模型(DSS/TNBS)、人类IBD组织 干细胞治疗 炎症性肠病(IBD) 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、类器官共培养 NA 单细胞转录组数据、组织学数据 小鼠模型和人类IBD组织样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
149 2025-12-06
Mature tertiary lymphoid structures support B cell-mediated antitumour immunity and are disrupted by neoadjuvant therapy in rectal cancer: a multicentre, retrospective study
2025-Nov-19, EBioMedicine IF:9.7Q1
研究论文 本研究探讨了成熟三级淋巴结构在直肠癌中的抗肿瘤免疫作用及其受新辅助治疗的影响 揭示了成熟三级淋巴结构与B细胞介导的免疫特征及良好预后的关联,并首次系统分析了新辅助治疗对三级淋巴结构的破坏作用 研究为回顾性设计,样本量有限,且缺乏前瞻性验证 阐明成熟三级淋巴结构在直肠癌肿瘤免疫微环境中的作用及其治疗调控机制 直肠癌患者肿瘤组织样本 数字病理学 直肠癌 bulk RNA-seq, scRNA-seq, scBCR-seq, 免疫组织化学, 多重免疫荧光 NA 基因表达数据, 单细胞数据, 组织图像数据 未治疗队列:bulk RNA-seq (n=123), 免疫组化/多重免疫荧光 (n=161), scRNA-seq (n=10), scBCR-seq (n=10);新辅助治疗队列:bulk RNA-seq (n=19), 免疫组化 (n=125) NA 单细胞RNA测序, 单细胞BCR测序, 批量RNA测序 NA NA
150 2025-12-06
SPINK1-driven cellular heterogeneity and interaction networks in intrahepatic cholangiocarcinoma revealed by integrated multi-omics analysis
2025-Nov-17, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究通过整合多组学分析揭示了SPINK1驱动的细胞异质性及相互作用网络在肝内胆管癌中的作用 发现了SPINK1-CCL20-LAMs轴,该轴协调免疫细胞招募和代谢重编程,揭示了SPINK1通过LAMs建立富含谷氨酰胺的微环境促进肿瘤生长的新机制 NA 剖析肝内胆管癌的细胞异质性和细胞间相互作用,特别关注SPINK1过表达的上皮亚群 人类肝内胆管癌肿瘤及邻近正常组织 数字病理学 肝内胆管癌 单细胞RNA测序, 整合蛋白质组学分析, Transwell实验, 共培养系统, 功能扰动实验 NA 转录组数据, 蛋白质组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
151 2025-12-06
Association of neuronal autoantibodies with overall survival in gastric cancer patients
2025-Nov-13, Cancer research communications IF:2.0Q3
研究论文 本研究探讨了胃癌患者中神经元自身抗体的存在及其与总体生存期的关联 首次在无副肿瘤性神经系统综合征的胃癌患者中检测神经元自身抗体,并揭示其与生存期缩短和肿瘤微环境免疫抑制特征的关联 单中心队列研究,样本量有限,需要进一步机制研究验证 评估胃癌患者神经元自身抗体的临床预后意义 胃癌患者血清样本和肿瘤组织 NA 胃癌 免疫荧光、细胞基础检测、单细胞测序 NA 血清样本、肿瘤组织、单细胞测序数据 323例胃癌患者(144例TBA阳性,179例TBA阴性) NA 单细胞RNA-seq NA NA
152 2025-12-06
Technology-enabled integration of single-cell transcriptomics and microbiome data identifies RNA-targetable host-microbiota networks in colorectal adenoma
2025-Nov-13, SLAS technology IF:2.5Q3
研究论文 本研究开发了一个可重复的计算流程,整合单细胞转录组学和微生物组数据,识别结直肠腺瘤中可RNA靶向的宿主-微生物网络 结合单细胞技术与RNA治疗方法,首次系统性地识别结直肠腺瘤中的宿主-微生物相互作用网络,并转化为RNA治疗靶点 研究依赖于现有公共数据集,可能受样本异质性影响,且实验验证尚未进行 识别结直肠腺瘤中可RNA靶向的宿主-微生物网络,为精准干预提供框架 结直肠腺瘤患者样本 数字病理学 结直肠腺瘤 单细胞RNA测序, 微生物组分析 MaAsLin2, QIIME2/DADA2, Seurat/Harmony 单细胞RNA测序数据, 微生物组数据 426,425个细胞(来自3个数据集), 975个微生物组样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
153 2025-12-06
Clinical and translational study of ivosidenib plus nivolumab in advanced solid tumors harboring IDH1 mutations
2025-Nov-11, The oncologist
研究论文 本研究评估了ivosidenib联合nivolumab在携带IDH1突变的晚期实体瘤患者中的初步活性和安全性 首次在临床试验中探索IDH1抑制剂与抗PD1抗体联合治疗IDH1突变实体瘤的疗效,并结合空间转录组学等先进技术进行转化分析 样本量较小(仅15例患者),临床获益有限,需要更大规模研究验证 评估ivosidenib联合nivolumab在IDH1突变晚期实体瘤中的治疗效果和免疫调节作用 携带IDH1突变的晚期或难治性实体瘤患者 数字病理学 实体瘤 空间转录组学,蛋白质组学,药效动力学分析 NA 临床数据,蛋白质组数据,空间转录组数据 15例患者 NA 空间转录组学 NA NA
154 2025-12-06
Identification of plasma cell infiltration-related gene signatures as a novel prognostic model for clear cell renal cell carcinoma
2025-Nov-11, Clinical and experimental medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究旨在识别调控肾透明细胞癌中浆细胞浸润的关键基因,并构建一个新的预后模型来预测肾透明细胞癌 通过机器学习识别了9个与浆细胞浸润相关的枢纽基因,并基于这些基因构建了一个名为PC评分的预后模型,该模型整合了年龄、分期和PC评分,显示出比单独分期更高的预测价值 NA 识别肾透明细胞癌中浆细胞浸润相关的关键基因,并构建一个预后模型来预测患者风险 肾透明细胞癌患者 机器学习 肾癌 单细胞测序 机器学习 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
155 2025-12-06
Platelet CKB as a potential contributor to serum creatine kinase abnormalities and metastasis in cancer patients
2025-Nov-11, Clinical and experimental medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究探讨了癌症患者血清肌酸激酶-MB活性超过总肌酸酶活性的异常现象,揭示了血小板CKB作为潜在贡献者与癌症转移的关联 首次将血小板CKB与癌症患者血清肌酸激酶异常及转移潜力联系起来,并开发了整合CK-BB和线粒体CK亚型的复合指数CK-Sub 研究主要基于回顾性队列和公共数据集,需要进一步实验验证血小板CKB在癌症转移中的直接功能作用 探究癌症患者血清肌酸激酶-MB活性异常超过总肌酸激酶活性的分子起源及其与肿瘤生物学的相关性 癌症患者(特别是结直肠癌和肺癌患者)的血清、血小板样本以及公共RNA测序数据集 癌症生物学 肺癌 qRT-PCR、血清肌酸激酶同工酶电泳、RNA测序、单细胞RNA测序 NA 血清样本、血小板样本、RNA测序数据、单细胞RNA测序数据 1651名癌症患者的回顾性队列 NA RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
156 2025-12-06
Single-cell multi-omics of ribosome biogenesis-related genes reveals immune microenvironment in psoriasis and constructs a diagnostic model
2025-Nov-11, Clinical and experimental medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过整合批量测序和单细胞测序数据,系统分析了核糖体生物发生相关基因在银屑病中的作用,构建了高精度的诊断模型,并揭示了其与免疫微环境的相互作用 首次系统整合批量测序和单细胞测序转录组数据来表征银屑病中核糖体生物发生相关基因的分子网络,构建了具有临床转化潜力的诊断模型,并阐明了Tregs失衡和STAT1介导的炎症极化的机制基础 未明确说明研究的样本量大小,且诊断模型的临床验证和转化潜力有待进一步研究 阐明核糖体生物发生相关基因在银屑病中的分子网络,构建诊断模型,并研究其与免疫微环境的相互作用 银屑病患者的转录组数据 生物信息学 银屑病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq 机器学习模型 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
157 2025-12-06
Identification and external validation of a prognostic signature based on MAPK-related genes to evaluate survival prognosis and treatment efficacy in lung adenocarcinoma
2025-Nov-11, Clinical and experimental medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过整合多组学数据,构建了一个基于MAPK相关基因的预后模型,用于肺腺癌患者的生存预后评估和治疗疗效预测 首次结合孟德尔随机化分析筛选MAPK相关基因,并利用随机生存森林算法构建多组学预后模型,同时通过单细胞RNA测序揭示了这些基因在内皮细胞中的富集及其在免疫调节和血管生成中的作用 模型主要在公共数据库(如TCGA和GEO)的回顾性数据中进行开发和验证,缺乏前瞻性临床队列的验证 构建一个稳健的MAPK相关基因特征模型,以改善肺腺癌的风险分层和治疗指导 肺腺癌患者 生物信息学 肺腺癌 转录组测序, 孟德尔随机化分析, 随机生存森林算法, 通路富集分析, 药物敏感性预测, 逆转录定量PCR, 单细胞RNA测序 随机生存森林 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 TCGA-LUAD队列及三个独立的GEO队列 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
158 2025-12-06
Tertiary lymphoid organ-associated transcriptomic features predict rejection and outcome in kidney transplantation: integrative analysis and experimental validation
2025-Nov-11, Clinical and experimental medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过整合多组学数据,揭示了三级淋巴器官(TLOs)在肾移植排斥反应和预后中的关键作用,并开发了基于TLO相关特征的诊断和预后模型 首次建立了连接TLO特征与临床结果的多组学框架,并识别出具有诊断和预后效用的TLO相关基因生物标志物 研究主要基于回顾性转录组数据集,需要在更大队列中进行前瞻性验证 表征TLO相关的免疫景观,并研究其与肾移植排斥反应和预后的关联 肾移植患者的移植肾组织 数字病理学 肾移植排斥反应 单细胞RNA测序, 非负矩阵分解, 机器学习算法 ssGSEA, NMF, 多种机器学习算法 转录组数据 多个肾移植队列的批量转录组数据集 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
159 2025-12-06
Exploring the prognostic value of T cell exhaustion and mitochondrial dysfunction related genes in breast cancer through bioinformatics analysis and RT-qPCR validation
2025-Nov-06, Clinical and experimental medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过生物信息学分析和RT-qPCR验证,探索了与T细胞耗竭和线粒体功能障碍相关的基因在乳腺癌中的预后价值 首次整合T细胞耗竭和线粒体功能障碍相关基因构建乳腺癌预后模型,并结合单细胞转录组学分析免疫微环境 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证基因功能机制 识别乳腺癌中与T细胞耗竭和线粒体功能障碍相关的预后基因并构建预后模型 乳腺癌患者肿瘤组织和正常组织的转录组及临床数据 生物信息学 乳腺癌 转录组测序、RT-qPCR、单细胞转录组学分析 回归分析、Cox回归分析、风险评分模型 转录组数据、临床数据 未明确具体样本数量,但涉及公共数据库中的肿瘤和正常样本 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
160 2025-12-06
Base editing and nanoparticle transfection of airway cell types essential for treatment of cystic fibrosis
2025-Nov-06, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用碱基编辑技术和聚合物纳米颗粒转染,纠正了囊性纤维化(CF)患者气道细胞中的致病性剪接位点变异,并实现了CFTR功能的临床意义水平恢复 首次将碱基编辑器RNA与聚合物纳米颗粒(PNPs)非病毒递送平台结合,在CF原代气道细胞中纠正常见致病剪接变异,并通过单细胞RNA测序揭示了编辑后细胞类型特异性转录变化 研究未详细探讨PNPs在体内递送的长期安全性和效率,且对基底细胞亚型编辑后比例下降的机制解释有限 开发一种可扩展的非病毒治疗平台,用于纠正囊性纤维化及其他呼吸系统疾病中呼吸上皮细胞的功能障碍 囊性纤维化患者的气道上皮细胞,包括离子细胞、分泌性杯状细胞和基底祖细胞亚型 基因编辑与细胞治疗 囊性纤维化 碱基编辑,单细胞RNA测序(scRNA-seq),聚合物纳米颗粒(PNPs)转染 NA 单细胞RNA测序数据,功能测定数据 原代CF气道细胞和永生化气道细胞,具体样本数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部