本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2026-10-25 |
Apoptosis of Mdm2-deficient osteocytes enhances osteogenesis through TRPM8-enriched apoptotic vesicles
2026-Aug-03, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-026-00570-0
PMID:42543262
|
研究论文 | 本文报道了在骨细胞中条件性敲除Mdm2导致骨细胞凋亡,但 paradoxically 增加骨量,机制上通过富含TRPM8的凋亡小体促进骨髓间充质干细胞成骨分化 | 首次揭示Mdm2缺失的骨细胞凋亡通过释放富含TRPM8的凋亡小体促进骨形成,而非传统认为的骨丢失,并阐明了TRPM8介导的旁分泌机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;TRPM8的具体下游信号通路有待进一步阐明 | 探究骨细胞凋亡是否也能调控骨形成,并揭示其分子机制 | 条件性敲除Mdm2的小鼠骨细胞、骨髓间充质干细胞(BMSCs)、凋亡小体 | 骨生物学、细胞生物学 | 骨质疏松症、骨代谢疾病 | 单细胞RNA测序、条件性基因敲除、细胞培养、凋亡小体分离与共培养 | 小鼠模型(条件性敲除)、体外细胞模型 | 单细胞转录组数据、图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 142 | 2026-10-25 |
Chronic stress-induced brain-derived small extracellular vesicles promote colorectal cancer through Treg differentiation
2026-08, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70756
PMID:42625444
|
研究论文 | 该研究揭示了慢性应激通过脑源性小细胞外囊泡(BD-sEVs)促进结直肠癌中Treg分化及免疫抑制的机制 | 首次发现慢性应激激活的脑区重塑循环BD-sEVs的miRNA货物,通过miR-342-3p、miR-15a-5p和miR-381-3p上调NOXA,抑制HSP60伴侣活性,触发mtDNA释放并激活cGAS-STING-IFN-I通路,驱动Treg分化,独立于经典MCL-1依赖的凋亡途径 | 研究主要基于小鼠模型和回顾性/前瞻性临床队列,样本量有限(回顾性n=67,前瞻性n=37),且机制细节仍需进一步验证 | 探究心理应激信号从中枢神经系统传递至外周肿瘤免疫微环境的机制,特别是BD-sEVs在神经免疫串扰中的作用 | 结直肠癌小鼠模型(MC38皮下和CT26原位)及结直肠癌患者队列 | 肿瘤免疫学、神经免疫学 | 结直肠癌 | miRNA测序、单细胞RNA测序、多通道流式细胞术、共免疫沉淀、质谱、线粒体功能评估、mtDNA检测 | NA | 文本、图像、数值数据 | 小鼠模型(MC38和CT26)、回顾性队列67例、前瞻性队列37例结直肠癌患者 | NA | miRNA测序、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 143 | 2026-10-25 |
SPP1-driven spatial niche remodelling defines aggressive progression in the basal subtype of upper tract urothelial carcinoma
2026-08, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70782
PMID:42634597
|
研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序与空间转录组学,解析上尿路尿路上皮癌(UTUC)基底亚型的细胞异质性与空间组织,揭示SPP1驱动的空间生态位重塑与侵袭性进展的关系 | 首次在UTUC中结合单细胞与空间转录组解析基底亚型的空间生态位;发现保守的SPP1+肿瘤相关巨噬细胞–FAP+肌成纤维细胞边界程序,并与髓系免疫抑制和细胞外基质重塑相关;通过SPP1敲低实验和日本UTUC队列验证其功能与预后价值 | UTUC为罕见肿瘤,样本量有限;外部验证主要基于膀胱癌数据集;SPP1作为治疗靶点仍需进一步功能与临床验证 | 解析UTUC基底亚型的细胞异质性与空间组织,阐明其与肌层浸润相关的微环境程序,并评估SPP1的亚型区分与预后价值 | 上尿路尿路上皮癌(UTUC)患者肿瘤组织及J82细胞系,并利用外部膀胱癌数据集和日本UTUC队列进行验证 | 数字病理, 空间转录组学, 单细胞组学 | 上尿路尿路上皮癌, 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫荧光, GeoMx空间分析, 基因敲低 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 图像 | NA | 10x Genomics, NanoString | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium, GeoMx | 10x Chromium单细胞RNA测序平台与GeoMx空间转录组平台 |
| 144 | 2026-10-25 |
Exosomal KL-6 surpasses total plasma KL-6 in the diagnosis of Interstitial Lung Disease (ILD)
2026-Jul-28, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-026-03816-x
PMID:42919247
|
研究论文 | 该研究结合单细胞转录组再分析与多中心队列,比较外泌体KL-6与血浆KL-6在结缔组织病相关间质性肺病(CTD-ILD)中的诊断价值 | 首次系统比较外泌体KL-6与血浆KL-6在CTD-ILD诊断中的表现,发现外泌体KL-6在血浆KL-6阴性患者中仍具有优越的诊断准确性,并通过单细胞转录组分析提示KL-6与肺泡II型细胞外泌体标志物的潜在关联 | 样本量相对有限,纵向监测仅纳入10例进展性ILD患者,外泌体KL-6的检测标准化及机制仍需进一步验证 | 评估外泌体KL-6相较于血浆KL-6在CTD-ILD诊断及疾病进展监测中的价值 | 223名受试者,包括167例ILD患者、22例无ILD的CTD患者和34例健康对照,其中10例进展性ILD患者接受纵向监测 | 数字病理学、临床诊断学 | 间质性肺病、结缔组织病相关间质性肺病 | 单细胞转录组测序、外泌体分离与KL-6检测、ROC分析 | NA | 单细胞转录组数据、临床检测数据 | 223名受试者(167例ILD、22例CTD非ILD、34例健康对照),10例进展性ILD患者纵向监测 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 145 | 2026-10-25 |
Characterization of the crotonylation landscape in gastric cancer: a machine learning-derived prognostic signature and the oncogenic role of TIMP1
2026-Jul-28, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-026-01018-6
PMID:42920177
|
研究论文 | 该文整合单细胞RNA测序和bulk转录组学,构建了胃癌巴豆酰化相关机器学习预后特征(CRGS),并实验验证了TIMP1的致癌作用。 | 首次在胃癌中系统刻画巴豆酰化景观,结合单细胞与bulk转录组学,利用WGCNA和机器学习构建预后特征CRGS,并发现和验证TIMP1为关键致癌基因。 | TIMP1的致癌作用仅在体外细胞实验中得到验证,缺乏体内动物模型和临床样本的进一步验证。 | 刻画胃癌中的巴豆酰化景观,构建机器学习预后特征并进行实验验证。 | 胃癌患者样本及胃癌细胞系 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,bulk转录组学,qRT-PCR,克隆形成实验,Transwell迁移/侵袭实验 | 机器学习 | 文本,图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序,bulk转录组学 | NA | NA |
| 146 | 2026-10-25 |
Histology images in spatial transcriptomics: a critical evaluation of their effectiveness in spatial domain detection
2026-Jul-27, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-026-12830-8
PMID:42907765
|
研究论文 | 该文章系统评估了在空间转录组学中整合组织学图像对空间域检测的有效性,发现与仅使用基因表达数据相比,组织学图像并未显著提升空间域检测性能 | 设计了统计检验来系统评估组织学图像作为附加模态对空间域检测质量提升的显著性,并探讨了组织学图像未能提升性能的可能原因 | 研究仅涵盖了所调查的方法,未涵盖所有现有方法;统计检验的结论可能受特定数据集和方法的影响;未提出新的整合方法 | 评估在空间转录组数据分析中,整合组织学图像对空间域检测任务的性能提升效果 | 空间转录组数据集及其对应的组织学图像 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像,基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 147 | 2026-10-25 |
Endothelial cell-specific TGM2 deficiency promotes progression of temporal lobe epilepsy by disrupting S1P metabolism and intercellular communication
2026-Jul-27, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-05077-3
PMID:42920129
|
研究论文 | 该研究系统探究了TGM2在颞叶癫痫中的表达模式、核心功能及分子调控机制,并阐明其临床价值 | 首次揭示内皮细胞特异性TGM2通过调控S1P代谢和细胞间通讯影响颞叶癫痫进展,并证实S1P与RelA的直接结合 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 系统研究TGM2在颞叶癫痫中的表达模式、核心功能及分子调控机制,并阐明其临床价值 | 耐药性颞叶癫痫患者和对照受试者的颞叶皮层组织和血浆样本,以及海人藻酸诱导的癫痫小鼠模型 | 数字病理学 | 癫痫 | 单细胞RNA测序、qPCR、Western blot、ELISA、代谢组学、RNA-seq、核质分离、免疫荧光、分子对接 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 148 | 2026-10-25 |
Ionomics powered single-cell mapping reveals targetable iron dysregulation in endometriosis associated macrophages
2026-Jul-27, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-05095-1
PMID:42920128
|
研究论文 | 通过ICP-MS离子组学分析和单细胞RNA测序,揭示子宫内膜异位症中衰老红细胞来源的铁过载导致巨噬细胞向免疫抑制表型转变 | 首次将离子组学与单细胞转录组学结合,系统刻画子宫内膜异位症微环境的元素图谱,发现铁是患者中最显著升高的元素,并揭示铁过载巨噬细胞的免疫抑制功能及其通过CXCL12-CXCR4轴抑制CD8+ T和NK细胞的作用机制 | 本研究为探索性研究,样本量有限,铁过载与巨噬细胞免疫抑制表型之间的因果关系及HIF-1α/HO-1/GPX4通路机制仍需在更大规模、独立队列中验证 | 刻画子宫内膜异位症微环境的离子组学特征,探索元素失调相关的细胞亚群及其在疾病免疫功能障碍中的作用机制 | 子宫内膜异位症患者的子宫内膜异位囊肿液、子宫内膜异位病灶组织、衰老红细胞诱导的巨噬细胞模型及小鼠模型 | 单细胞组学、离子组学、免疫学 | 子宫内膜异位症 | ICP-MS、scRNA-seq、流式细胞术、普鲁士蓝染色 | NA | 元素浓度数据、单细胞转录组数据、图像 | 63种元素(子宫内膜异位囊肿液样本),具体样本数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 149 | 2026-10-25 |
Unraveling the dual role of fibroblast growth factor 5 (FGF5) in cardiorenal diseases through multi-omics causal inference
2026-Jul-26, Cardiovascular diabetology
IF:8.5Q1
DOI:10.1186/s12933-026-03309-7
PMID:42907830
|
研究论文 | 该研究整合多组学数据,通过孟德尔随机化等方法揭示FGF5在心血管疾病和慢性肾脏病中的双向因果作用 | 首次系统性地将FGF5鉴定为心血管疾病和慢性肾脏病共病的核心多效性蛋白,并揭示其拮抗性多效性效应及组织特异性调控机制 | 研究主要基于遗传因果推断和观察性分析,缺乏实验验证;样本局限于欧洲和东亚人群;FGF5的具体分子机制尚未完全阐明 | 阐明FGF5在心血管疾病和慢性肾脏病共病中的因果作用及多效性机制,为共病治疗提供遗传学证据 | 2719种血浆蛋白、34种年龄相关疾病、欧洲和东亚人群的pQTL队列 | 多组学、遗传流行病学 | 心血管疾病、慢性肾脏病 | pQTL、孟德尔随机化、贝叶斯共定位分析、遗传精细定位、单细胞转录组学 | NA | 遗传数据、蛋白质定量性状数据、单细胞转录组数据 | 四个大规模pQTL队列,涵盖2719种血浆蛋白 | NA | pQTL、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 150 | 2026-10-25 |
Multiomics, multi-species profiling, and animal validation identify mitoxyperilysis as a conserved therapeutic target in metabolic dysfunction-associated steatohepatitis
2026-Jul-24, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-026-00902-4
PMID:42908035
|
研究论文 | 该文整合多组学、跨物种转录组学、机器学习和体内模型,揭示mitoxyperilysis在MASH中的激活及其治疗相关性。 | 首次在MASH中系统定义mitoxyperilysis这一调节性裂解性细胞死亡形式,并发现Bax为关键调控节点、RhoA通过泛素化和功能抑制被调控。 | 摘要未明确说明;主要依赖转录组和计算分析及单一CDAHFD小鼠模型验证,缺乏针对mitoxyperilysis通路的功能性干预实验。 | 解析mitoxyperilysis在代谢功能障碍相关脂肪性肝炎中的激活机制及其治疗价值。 | 小鼠和人类MASH肝脏的单细胞与空间转录组数据,以及小鼠、大鼠、仓鼠、非人灵长类和人类数据集;CDAHFD诱导的MASH小鼠模型。 | 多组学与计算生物学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎 | 单细胞转录组测序, 空间转录组测序, 跨物种转录组学分析, 机器学习, 计算机模拟基因敲除, 体内动物实验 | CellChat, MEBOCOST, AUCell, AddModuleScore, 11种机器学习分类器, scTenifoldKnk | 转录组数据(单细胞和空间), 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 151 | 2026-10-25 |
RBFOX3 is associated with neuronal-like phenotypic transition in recurrent glioblastoma
2026-Jul-24, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-16597-9
PMID:42919159
|
研究论文 | 该研究重新分析配对的原发性和复发性胶质母细胞瘤的纵向bulk RNA-seq数据,并结合单细胞和空间转录组学,揭示了RBFOX3介导的可变剪接失调与复发性胶质母细胞瘤中神经元样表型转变及化疗耐药的关系 | 首次将RBFOX3这一神经元特异性剪接因子与胶质母细胞瘤复发过程中的神经元样肿瘤状态及化疗耐药联系起来,并整合纵向bulk RNA-seq、单细胞转录组和空间转录组多维度数据揭示剪接调控在肿瘤演化中的作用 | 研究主要基于体外细胞系和共培养实验验证,缺乏体内动物模型验证;样本量有限;RBFOX3调控神经元样状态的具体分子机制尚未完全阐明 | 探究可变剪接失调在胶质母细胞瘤复发过程中驱动神经元样表型转变和化疗耐药的机制 | 配对的原发性和复发性胶质母细胞瘤组织样本及胶质母细胞瘤细胞系 | 数字病理学 | 脑癌 | bulk RNA-seq, 单细胞转录组测序, 空间转录组学 | NA | 文本, 图像 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞转录组测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 152 | 2026-10-25 |
A single-cell atlas of intracranial aneurysm progression identifies a dysfunctional VSMC subpopulation associated with rupture risk
2026-07-23, BMC neuroscience
IF:2.4Q3
DOI:10.1186/s12868-026-01029-y
PMID:42897467
|
研究论文 | 该研究通过对小鼠颅内动脉瘤模型进行单细胞RNA测序,构建了从稳定病变到破裂阶段的单细胞图谱,鉴定出与破裂风险相关的功能失调VSMC亚群 | 首次在单细胞分辨率下揭示颅内动脉瘤进展过程中VSMC表型失调与破裂风险的关联,发现代谢特化的VSMC_0亚群选择性丢失,并提出VSMC_0作为信号枢纽与巨噬细胞形成前馈炎症环路 | 主要基于小鼠模型,人类数据验证仅限于bulk RNA-seq和蛋白水平检测,缺乏人类单细胞数据验证 | 在单细胞分辨率下解析颅内动脉瘤从稳定到破裂进展的细胞机制,鉴定与破裂风险相关的细胞亚群和分子事件 | 小鼠颅内动脉瘤模型(假手术、形成期和破裂期)及人类颅内动脉瘤组织 | 单细胞转录组学 | 颅内动脉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、bulk RNA-seq数据、蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 153 | 2026-10-25 |
Multi-omics characterization of IDH-mutant astrocytoma-derived cell lines reveals NOTCH-regulated plastic quiescent astrocyte-like state and insights into progression
2026-Jul-20, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-026-02316-9
PMID:42477819
|
研究论文 | 该研究建立并多组学表征了四株来源于IDH突变型星形细胞瘤的细胞系,揭示了NOTCH调控的塑性静息星形胶质细胞样状态及其与肿瘤进展的关系 | 建立了四株来源于不同级别IDH突变型星形细胞瘤的细胞系,并利用多组学方法揭示了与患者肿瘤一致的三种转录状态;发现高级别细胞系在无生长因子条件下仍保留NPC样群体;分离出CD44+/GLAST+星形胶质细胞样细胞,证明其具有静息状态和显著可塑性;揭示NOTCH信号及DLL3在细胞状态平衡调控中的作用 | 体外细胞系模型可能无法完全反映肿瘤微环境;样本量有限(四株细胞系);未进行大规模临床验证 | 建立IDH突变型星形细胞瘤的体外模型,并解析其细胞状态、谱系动态、异质性及进展机制 | IDH突变型星形细胞瘤患者来源的细胞系(LGG275、LGG336、LGG85、LGG349) | 数字病理学/癌症生物学 | 星形细胞瘤(IDH突变型) | 单细胞RNA测序、转录组学、蛋白质组学 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、单细胞表达数据 | 4株细胞系(LGG275、LGG336、LGG85、LGG349) | NA | 单细胞RNA测序、bulk转录组学、蛋白质组学 | NA | NA |
| 154 | 2026-10-25 |
C1q and immunoglobulins mediate activity-dependent synapse loss in the adult brain
2026-Jul-09, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adv1219
PMID:42424464
|
研究论文 | 该研究揭示了在成年大脑中,神经元过度活跃通过C1q和免疫球蛋白介导活动依赖性的突触丢失 | 首次证明在生理条件下,成年海马中抗体分泌B系细胞与活动依赖性、C1q介导的突触丢失相关,并将神经元过度活跃与C1q介导的突触丢失联系起来 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中验证;机制细节仍需进一步阐明 | 探究成年大脑中C1q沉积于突触的触发因素及其在突触丢失中的作用 | 成年小鼠海马、阿尔茨海默病小鼠模型 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 体内化学遗传学、空间转录组学、活细胞追踪、超分辨率显微镜 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 155 | 2026-10-25 |
Connecting single-cell transcriptomes to projectomes in the mouse visual cortex
2026-Jul-01, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-026-10424-8
PMID:42386969
|
研究论文 | 该研究结合小鼠视觉皮层的Patch-seq数据与全神经元形态数据,建立多模态分类系统,将单细胞转录组与长程轴突投射联系起来 | 首次将Patch-seq转录组数据与全神经元形态数据整合,构建多步分类器预测单个神经元的投射靶点,并发现第5层IT和ET神经元的新多模态细胞类型特征 | 研究仅局限于小鼠视觉皮层,样本量有限,预测投射靶点的准确性有待进一步验证,尚未扩展到全脑或跨物种 | 建立整合转录组、形态学和电生理特征的高维细胞类型分类系统,并将转录组身份与长程轴突投射联系起来 | 小鼠视觉皮层的兴奋性神经元 | 神经科学 | NA | Patch-seq, 单细胞RNA测序 | 多步分类器 | 转录组数据, 形态学图像, 电生理数据 | 1528个兴奋性Patch-seq神经元和341个兴奋性全神经元形态 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 156 | 2026-10-25 |
TIM3 Signaling in Effector T Cells Acts as an Immunometabolic Switch in the Purine Degradation Pathway to Suppress Intestinal Inflammation
2026-Jun-17, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2026.05.027
PMID:42309263
|
研究论文 | 该文结合TIM3缺陷小鼠结肠炎模型与人类IBD样本分析,揭示TIM3信号通过抑制ADA和嘌呤降解通路,调控效应T细胞的免疫代谢状态,从而抑制肠道炎症 | 首次将TIM3信号定位为效应T细胞中调控嘌呤降解通路的免疫代谢开关,发现其通过抑制ADA使效应T细胞维持在耗竭的PD1+状态,并提出Gal-9激活TIM3可作为慢性肠道炎症的潜在治疗策略 | 慢性炎症中TIM3配体Gal-9的可用性不足限制了有效信号传导,且研究主要基于小鼠模型与体外/离体人类样本分析,尚需进一步临床验证 | 阐明免疫检查点受体TIM3在炎症性肠病T细胞信号传导中的作用及其对T细胞代谢和功能活性的调控机制 | TIM3缺陷小鼠的结肠炎模型、炎症性肠病患者及对照者的血液和黏膜T细胞 | 免疫学、免疫代谢 | 炎症性肠病 | 多色流式细胞术、细胞因子谱分析、非靶向代谢组学、单细胞测序 | NA | 流式细胞数据、代谢组数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 157 | 2026-10-25 |
Lifestyle shapes preclinical social and microglial deficits in an Alzheimer's disease mouse model
2026-05, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-025-03368-4
PMID:41388145
|
研究论文 | 该研究利用App敲入阿尔茨海默病小鼠模型和丰富环境范式,追踪至7月龄,揭示临床前阶段的社会行为、神经发生、血浆炎症标志物及小胶质细胞转录组的早期变化 | 采用新型丰富环境范式对App敲入小鼠进行持续追踪,发现临床前阶段已存在渐进性社会行为缺陷,并将成年神经发生与社会参数关联,同时通过单细胞RNA测序揭示丰富环境抑制干扰素响应性小胶质细胞 | 研究基于还原论的小鼠敲入模型,结果向人类AD的转化仍需验证;样本追踪仅至7月龄,未涵盖更晚阶段;社会行为参数的测量可能受多种混杂因素影响 | 探究生活方式因素(丰富环境)对阿尔茨海默病临床前阶段社会行为、神经可塑性、外周免疫及小胶质细胞状态的影响 | App敲入阿尔茨海默病小鼠模型及对照小鼠 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 血浆蛋白 profiling, 行为学追踪, 组织学分析 | NA | 行为数据, 血浆蛋白数据, 单细胞转录组数据, 组织图像 | App敲入小鼠和对照小鼠连续追踪至7月龄,3月龄进行血浆 profiling,海马小胶质细胞进行单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 海马小胶质细胞单细胞RNA测序 |
| 158 | 2026-10-25 |
Protocol for Single-Cell Dissociation, RNA Sequencing, and Isolation of Myoepithelial Cells and Fibroblasts from the Aged Lacrimal and Salivary Glands
2026-04-24, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/70441
PMID:42113735
|
研究方法 | 本文提出了一种优化的、可重复的实验方案,用于从衰老小鼠泪腺和唾液腺中高效解离组织、进行单细胞RNA测序,并通过FACS分选分离肌上皮细胞和成纤维细胞 | 针对衰老泪腺纤维化增加、细胞脆弱和脂质积累导致单细胞悬液制备困难的问题,采用Collagenase IV、Dispase II和DNase I分步酶解策略,结合Accutase和二次DNase I处理,并通过预涂BSA的塑料器皿和控温控速操作减少细胞损伤;同时结合报告小鼠品系和FACS实现特定细胞类型分离 | 该方案主要基于小鼠模型建立,尚未在人类泪腺或其他物种中验证;需要特定报告小鼠品系和FACS设备;未涉及下游scRNA-seq数据分析流程的详细描述 | 建立从衰老小鼠泪腺和唾液腺中制备高质量单细胞悬液并进行细胞类型特异性分离的实验流程,以支持衰老过程中细胞异质性和转录变化的scRNA-seq研究 | 衰老小鼠的泪腺和唾液腺组织,以及年轻小鼠泪腺、结膜和其他外分泌组织 | 单细胞组学 | 干眼症 | scRNA-seq, FACS | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 159 | 2026-10-25 |
Designing 5' UTR sequences improves the capacity of mRNA therapeutics in preclinical models of aging and obesity
2026-04-01, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.12.060
PMID:41485049
|
研究论文 | 该文通过生物信息学分析和实验验证,发现RPL18、RPL35和RPS9的5' UTR序列能提高合成mRNA在衰老和肥胖小鼠模型中的蛋白表达和治疗潜力 | 首次系统性地探索5' UTR序列设计对mRNA治疗潜力的影响,特别是在衰老和肥胖临床前模型中,发现RP mRNA的5' UTR能增强蛋白输出和体液免疫 | 研究主要在小鼠模型中进行,尚未在人体临床试验中验证;仅测试了11个RP mRNA的5' UTR,未全面覆盖所有可能的UTR序列 | 探索5' UTR序列设计如何提高合成mRNA在衰老和肥胖模型中的治疗潜力 | 小鼠衰老模型和高脂饮食诱导的肥胖模型,以及人类和小鼠细胞系 | mRNA治疗 | 衰老, 肥胖 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 核糖体 profiling, CLIP-seq | NA | 序列数据, 表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 160 | 2026-10-25 |
Role of extracellular vesicles derived from HIV-infected T cells and microglial cells in neuroinflammation and neuropathogenesis using a blood-brain barrier and cerebral organoid co-culture model
2026-Mar-22, Journal of neurovirology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s13365-025-01297-0
PMID:41866460
|
研究论文 | 研究HIV感染的T细胞和小胶质细胞来源的细胞外囊泡通过血脑屏障和脑类器官共培养模型对神经炎症和神经病理的作用 | 利用血脑屏障模型与脑类器官共培养体系,揭示HIV相关细胞外囊泡携带HIV RNA(TAR、Nef、Tat)破坏血脑屏障完整性、诱导神经细胞凋亡和神经炎症的机制 | 摘要中未明确说明研究局限性 | 探究HIV相关细胞外囊泡在中枢神经系统病理中的作用机制,特别是对神经炎症和神经认知障碍的贡献 | 潜伏感染HIV-1的T细胞和小胶质细胞来源的细胞外囊泡、血脑屏障模型、人诱导多能干细胞来源的脑类器官、HIV感染者血浆来源的细胞外囊泡 | 神经科学、传染病学 | HIV相关神经认知障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |