单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 26675 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2025-04-05 |
PAGE-based transfer learning from single-cell to bulk sequencing enhances model generalization for sepsis diagnosis
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae661
PMID:39710434
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研究论文 | 本文提出了一种基于单细胞和批量转录组数据融合的scPAGE2方法，用于提高脓毒症诊断模型的泛化能力 | 升级了scPAGE方法，通过迁移学习将单细胞转录组信息有效转移到批量转录组数据中，构建了性能优越的脓毒症诊断模型 | NA | 提高脓毒症诊断模型的泛化能力 | 脓毒症患者的转录组数据 | 生物信息学 | 脓毒症 | scRNA-seq, FACS, 下一代测序, 微阵列 | scPAGE2 | 转录组数据 | 7个数据集，涉及3个转录组平台和FACS数据 |
| 142 | 2025-04-05 |
The peripheral Atf3 + neuronal population is responsible for nerve regeneration at the early stage of nerve injury revealed by single-cell RNA sequencing
2024-Nov-13, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2024169
PMID:39539109
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示早期神经损伤阶段Atf3+神经元群体负责神经再生 | 发现了一种新的CCI诱导的神经元群体（CIP），该群体高表达激活转录因子（Atf3）和再生相关基因（RAGs），并与卫星胶质细胞（SGCs）密切通信 | 研究仅关注早期神经损伤阶段（损伤后3天），未涉及长期再生过程 | 探究周围神经损伤后感觉神经元再生的转录组变化及其分子机制 | 小鼠背根神经节（DRG）细胞 | 神经科学 | 周围神经损伤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 小鼠DRG细胞（具体数量未明确说明） |
| 143 | 2025-04-05 |
Metabolic Labeling and Digital Microfluidic Single-Cell Sequencing for Single Bacterial Genotypic-Phenotypic Analysis
2024-11, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202402177
PMID:39077951
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研究论文 | 本文介绍了一种基于数字微流控的自动化检测方法Digital-GPA，用于单抗生素耐药细菌的全基因组测序，实现基因型和表型分析 | 开发了Digital-GPA方法，能够高效分离和测序荧光D-氨基酸标记的抗生素耐药细菌，提供高质量的单细胞扩增基因组，识别微小和主要突变 | 未提及方法的具体操作复杂度和成本，可能限制其在临床中的广泛应用 | 全面分析抗生素耐药细菌的基因型和表型特征，以更好地理解抗生素耐药性 | 抗生素耐药细菌 | 数字病理学 | 细菌感染 | 数字微流控技术、全基因组测序、荧光D-氨基酸标记 | NA | 基因组数据 | 未明确提及具体样本数量，但涉及临床样本中的耐药病原体 |
| 144 | 2025-04-05 |
Inflammation-induced epigenetic imprinting regulates intestinal stem cells
2024-Oct-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.08.006
PMID:39232559
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research paper | 该研究探讨了炎症如何通过表观遗传印记影响肠道干细胞（ISCs）的代谢和再生能力 | 揭示了炎症通过琥珀酸积累重编程ISCs表观基因组，从而影响其分化和再生能力的机制 | 研究主要基于GI GVHD模型，可能不适用于其他炎症条件 | 探究炎症对肠道干细胞适应性和再生能力的长效影响 | Lgr5标记的肠道干细胞 | 表观遗传学 | 胃肠道移植物抗宿主病 | 单细胞转录组学、类器官培养、代谢组学、表观基因组学 | NA | 转录组数据、代谢数据、表观遗传数据 | 未明确说明样本数量 |
| 145 | 2025-04-05 |
Single-cell sequencing analysis of chronic subdural hematoma cell subpopulations and their potential therapeutic mechanisms
2024-06-01, Brain research bulletin
IF:3.5Q2
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研究论文 | 通过单细胞测序分析慢性硬膜下血肿(CSDH)患者的细胞亚群及其潜在治疗机制 | 首次对手术切除的血肿中的细胞进行全面分类，并探讨其与CSDH复发的相关性 | 研究样本量未明确说明，且机制研究仍需进一步验证 | 分析CSDH患者外周血和血肿部位的细胞亚群及其对疾病的影响 | 慢性硬膜下血肿(CSDH)患者的外周血和手术切除的血肿 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明 |
| 146 | 2025-04-04 |
Neuronal activity modulates the expression of secretagogin, a Ca2+ sensor protein, during mammalian forebrain development
2025-May, Acta physiologica (Oxford, England)
DOI:10.1111/apha.70031
PMID:40165367
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研究论文 | 研究揭示了分泌钙蛋白（secretagogin）在哺乳动物前脑发育过程中受神经元活动调控的表达模式 | 首次系统揭示了secretagogin表达受神经元活动动态调控的特性，并发现其在唐氏综合征胎儿中的表达延迟现象 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类样本分析相对有限 | 阐明secretagogin作为钙传感器蛋白在神经系统中的表达调控机制 | 人类胎儿前脑组织、Scgn-iCre::Ai9转基因小鼠、SH-SY5Y神经母细胞瘤细胞、原代皮层神经元 | 神经科学 | 唐氏综合征 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫组织化学、体外神经元培养 | 动物模型（小鼠）、细胞模型 | 基因表达数据、组织切片图像 | 人类胎儿样本（含唐氏综合征病例）、转基因小鼠群体、体外培养细胞 |
| 147 | 2025-04-04 |
CAF-derived exosomal LINC01711 promotes breast cancer progression by activating the miR-4510/NELFE axis and enhancing glycolysis
2025-Apr-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202402024RRR
PMID:40172996
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研究论文 | 本研究揭示了CAF来源的外泌体通过传递lncRNA LINC01711激活miR-4510/NELFE轴，从而增强乳腺癌细胞的糖酵解作用 | 发现CAF来源的外泌体中高表达的LINC01711通过miR-4510/NELFE轴调控TXN，促进乳腺癌细胞的糖酵解和恶性行为 | 未提及具体样本量或实验验证的局限性 | 探索乳腺癌进展的分子机制及潜在治疗靶点 | 乳腺癌细胞和癌症相关成纤维细胞(CAFs) | 肿瘤微环境研究 | 乳腺癌 | 单细胞测序、降维聚类和细胞注释技术 | NA | 单细胞测序数据 | NA |
| 148 | 2025-04-04 |
Integration of Flow Cytometry and Single-Cell RNA Sequencing Analysis to Explore the Fibroblast Subpopulations in Keloid that Correlate with Recurrence
2025-Apr-03, Advances in wound care
IF:5.8Q1
DOI:10.1089/wound.2024.0262
PMID:40177712
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研究论文 | 本研究通过整合流式细胞术和单细胞RNA测序分析，探索了与瘢痕疙瘩复发相关的成纤维细胞亚群 | 首次鉴定了影响瘢痕疙瘩复发的关键致病性成纤维细胞亚群FB1，并发现CD26+/CD117+/CD34+表型可作为复发预测标志物 | 研究样本来源为公共数据库，缺乏独立验证队列 | 鉴定参与瘢痕疙瘩复发的关键致病性细胞亚群 | 瘢痕疙瘩组织中的成纤维细胞亚群 | 单细胞组学 | 皮肤纤维化疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术(FCM) | 逻辑回归分析 | 单细胞转录组数据、流式细胞数据 | 公共数据库中的瘢痕疙瘩组织样本（具体数量未说明） |
| 149 | 2025-04-04 |
Morphogenic, molecular, and cellular adaptations for unidirectional airflow in the chicken lung
2025-Apr-03, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204346
PMID:40177910
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研究论文 | 本研究通过多尺度3D成像和单细胞转录组学技术，揭示了鸡肺中单向气流的形态发生、分子和细胞适应机制 | 发现了鸡肺中特有的KRT14表达肺泡细胞类型（命名为腔细胞），并揭示了腔细胞、肺泡2型细胞和肺泡1型细胞在辐射状分布中的顺序排列 | 研究仅聚焦于鸡肺发育过程，未与其他鸟类物种进行比较 | 探索鸟类肺脏单向气流的发育适应机制及其与哺乳动物双向气流的差异 | 鸡肺发育过程中的形态发生、分子特征和细胞类型 | 发育生物学 | NA | 多尺度3D成像、单细胞转录组学、Stereo-seq空间转录组学 | NA | 3D成像数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 鸡肺发育关键阶段样本 |
| 150 | 2025-04-04 |
PKCδ Germline Variants and Genetic Deletion in Mice Augment Antitumor Immunity through Regulation of Myeloid Cells
2025-Apr-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0999
PMID:39808445
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研究论文 | 该研究通过分析种系遗传变异与肿瘤免疫基因特征的关联，发现蛋白激酶C delta（PKCδ）作为候选靶点，并通过小鼠实验验证其在增强抗肿瘤免疫中的作用 | 首次将PKCδ种系变异与抗肿瘤免疫联系起来，并揭示了PKCδ通过调节髓系细胞状态影响肿瘤免疫微环境的机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床样本验证仍需扩大样本量 | 探索新的癌症免疫治疗靶点 | PKCδ基因及其在小鼠和人类中的功能 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 小鼠模型和临床样本（具体数量未明确说明） |
| 151 | 2025-04-04 |
Correlative analysis of metallomic gene expression and metal ion content within the mouse hippocampus
2025-Apr-02, Metallomics : integrated biometal science
IF:2.9Q3
DOI:10.1093/mtomcs/mfaf009
PMID:40175292
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研究论文 | 本研究通过多模态方法分析小鼠海马体中金属组基因表达与金属离子含量的相关性 | 结合X射线荧光显微镜元素成像与空间转录组学，揭示了海马体亚区金属组异质性的分子基础 | 研究仅针对小鼠海马体，未涉及其他脑区或物种 | 探究大脑金属稳态的生理需求及富集机制 | 小鼠海马体及其亚区 | 神经科学 | NA | X射线荧光显微镜、空间转录组学 | NA | 元素成像数据、转录组数据 | NA |
| 152 | 2025-04-04 |
Anti-Peptidylarginine-4 Autoantibodies Derived from Patients with Rheumatoid Arthritis Exert Pathogenic Effects by Activating Monocytes and Exacerbating Inflammatory Arthritis
2025-Apr-02, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.43168
PMID:40176290
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research paper | 该研究探讨了类风湿性关节炎(RA)患者中抗PAD4自身抗体通过激活单核细胞和加剧炎症性关节炎的致病机制 | 揭示了抗PAD4抗体通过与单核细胞结合触发炎症级联反应的新机制，促进免疫细胞向关节募集和T细胞激活，最终导致更严重的关节炎 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人体内完全验证这些机制 | 阐明抗PAD4抗体在类风湿性关节炎发病机制中的作用 | 类风湿性关节炎患者和小鼠模型 | 免疫学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序、体外细胞培养 | 胶原诱导性关节炎(CIA)小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、细胞培养数据 | 使用RA患者来源的单克隆抗体和小鼠模型进行研究 |
| 153 | 2025-04-04 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals the Effect of MIF on Myeloid-Derived Suppressor Cells in Multiple Myeloma
2025-Apr-02, International journal of laboratory hematology
IF:2.2Q3
DOI:10.1111/ijlh.14473
PMID:40176414
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research paper | 该研究通过单细胞转录组分析探讨了MIF在多发性骨髓瘤中对髓系来源抑制细胞（MDSCs）的影响 | 首次揭示了MIF在MDSCs中的表达差异及其与多发性骨髓瘤的关联 | 研究样本量有限，且仅基于GSE124310数据集进行分析 | 探索骨髓微环境中MIF与MDSCs之间的关系 | 多发性骨髓瘤患者和正常对照的骨髓样本 | digital pathology | multiple myeloma | scRNA-seq, flow cytometry | NA | RNA-seq数据 | GSE124310数据集中的MM和正常样本 |
| 154 | 2025-04-04 |
Different inflammatory, fibrotic, and immunological signatures between pre-fibrotic and overt primary myelofibrosis
2025-Apr-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2024.285598
PMID:39385733
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析了前纤维化和明显原发性骨髓纤维化（PMF）的炎症、纤维化和免疫学特征差异 | 首次在前纤维化和明显PMF之间识别出14种细胞类型及其亚群的差异，特别是造血干细胞和祖细胞（HSPC）与巨核细胞的炎症/纤维化特征变化 | 未发现PMF进展过程中的决定性亚群 | 探究PMF进展过程中不同造血细胞的功能变化及其在疾病发展中的作用 | 前纤维化PMF、明显PMF及其他骨髓增殖性肿瘤（MPN）患者的骨髓抽吸物 | 数字病理学 | 骨髓纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 前纤维化PMF、明显PMF及其他MPN患者的骨髓样本 |
| 155 | 2024-12-30 |
Correction to: Unveiling the dynamics of B lymphocytes in systemic lupus erythematosus patients treated with belimumab through longitudinal single-cell RNA sequencing
2025-Apr-01, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keae694
PMID:39731783
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 156 | 2025-01-20 |
Unlocking the potential of spatial transcriptomics with custom microfluidic chips
2025-Apr, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2771-9
PMID:39826037
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 157 | 2025-04-04 |
Multi-Omic Insight Into the Molecular Networks in the Pathogenesis of Coronary Artery Disease
2025-Apr, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.124.037203
PMID:40135555
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研究论文 | 通过整合多组学数据，研究冠状动脉疾病（CAD）的分子网络及其发病机制 | 采用基于摘要数据的孟德尔随机化和共定位分析整合基因甲基化、表达和蛋白质水平的多组学数据，揭示了TAGLN2、APOB、GIP等基因与CAD风险的关联 | 研究中未提及样本的具体数量，且可能未完全覆盖所有潜在的因果基因 | 探索冠状动脉疾病（CAD）的分子机制及潜在因果基因 | 冠状动脉疾病（CAD）患者及其相关基因 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 多组学数据分析、孟德尔随机化、共定位分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因甲基化、表达和蛋白质水平数据 | NA |
| 158 | 2025-04-04 |
Machine Learning Unveils Sphingolipid Metabolism's Role in Tumour Microenvironment and Immunotherapy in Lung Cancer
2025-Apr, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70435
PMID:40159631
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研究论文 | 本研究通过机器学习方法揭示了鞘脂代谢在肺癌肿瘤微环境（TME）和免疫治疗中的作用 | 首次结合机器学习算法（Lasso回归和生存SVM）和单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术，系统分析了鞘脂代谢相关基因在肺癌TME中的表达及其与免疫细胞浸润的关系 | 研究主要基于TCGA和GTEx数据库的临床样本，缺乏外部验证队列 | 探究鞘脂代谢在肺癌肿瘤微环境形成和免疫治疗响应中的作用机制 | 肺癌（LUAD和LUSC）患者的肿瘤微环境 | 机器学习 | 肺癌 | 转录组分析、scRNA-seq、Lasso回归、生存SVM | Lasso回归、SVM | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | TCGA和GTEx数据库中的临床样本 |
| 159 | 2025-04-04 |
Transitional CXCL14+ cancer-associated fibroblasts enhance tumour metastasis and confer resistance to EGFR-TKIs, revealing therapeutic vulnerability to filgotinib in lung adenocarcinoma
2025-Apr, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70281
PMID:40162549
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析，识别出一种独特的CXCL14+肌纤维母细胞样癌症相关成纤维细胞（myCAFs）亚群，该亚群在肺腺癌（LUAD）中促进肿瘤转移并导致对EGFR-TKIs的耐药性，同时发现Filgotinib可逆转这种耐药性 | 首次识别出CXCL14+ myCAFs亚群在LUAD中的关键作用，并发现Filgotinib作为逆转EGFR-TKIs耐药性的潜在治疗药物 | 研究主要基于单细胞和空间转录组学数据，临床样本验证仍需进一步扩大 | 探究癌症相关成纤维细胞（CAFs）异质性在肺腺癌（LUAD）肿瘤进展和治疗耐药性中的作用 | 肺腺癌（LUAD）患者和肿瘤微环境中的CXCL14+ myCAFs亚群 | 数字病理学 | 肺癌 | scRNA-seq, 空间转录组学, ELISA, 免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 临床样本数据 | 多个独立LUAD队列的临床组织样本和患者血浆样本 |
| 160 | 2025-04-04 |
Dynamic Alterations in DNA Methylation of CD4+ T Cells and Macrophages in a Murine Model of Tuberculous Pleural Infection Induced by BCG Vaccination
2025-Apr, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70166
PMID:40170749
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研究论文 | 本研究分析了BCG诱导的小鼠结核性胸膜炎模型中CD4+ T细胞和巨噬细胞的DNA甲基化和转录组数据，揭示了免疫细胞在结核性胸膜感染过程中的动态变化和调控特性 | 首次揭示了结核性胸膜感染过程中免疫细胞DNA甲基化的动态变化及其对Th1、Th17和Th22细胞分化的调控作用，并发现C1q在感染过程中的表达增加及其调控机制 | 研究仅基于小鼠模型，结果是否适用于人类结核性胸膜感染尚需进一步验证 | 探究结核性胸膜感染过程中免疫细胞的DNA甲基化动态变化及其调控机制 | BCG诱导的结核性胸膜炎小鼠模型中的CD4+ T细胞和巨噬细胞 | 免疫学 | 结核病 | DNA甲基化分析、转录组测序、单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | DNA甲基化数据、转录组数据 | BCG诱导的结核性胸膜炎小鼠模型在特定时间点（第0、1、7和14天）的胸膜灌洗液样本 |