单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 12121 - 12140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12121 | 2024-08-05 |
Protocol for flow cytometry-assisted single-nucleus RNA sequencing of human and mouse adipose tissue with sample multiplexing
2024-Mar-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102893
PMID:38416649
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研究论文 | 本文介绍了一种针对人类和小鼠脂肪组织的流式细胞术辅助单核RNA测序的协议 | 该研究开发了一种新的工作流程，可以高效处理和标记单个脂肪组织样本的细胞核 | 单细胞RNA测序受到脂肪细胞大小和脆弱性以及商业试剂盒成本的限制 | 提出一种新的脂肪组织样本处理方法以提高测序效率 | 人类和小鼠的脂肪组织样本 | 数字病理学 | NA | 流式细胞术 | NA | RNA | NA |
| 12122 | 2024-08-04 |
Preparation of High-Viability Single-Cell Suspensions from African Turquoise Killifish Brain Tissue
2024-02-01, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.prot107829
PMID:36931736
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research paper | 本研究描述了如何从非洲蓝色杀鱼的脑组织中准备高活性的单细胞悬液 | 本研究创新性地提供了一种从新兴模型生物制备高活性单细胞悬液的协议 | 未提及该方法在其他物种或组织中的适用性 | 本研究的目的是为单细胞测序准备高活性的单细胞悬液 | 非洲蓝色杀鱼的脑组织 | NA | NA | 酶解与机械解离 | NA | NA | 研究成功用于非洲蓝色杀鱼的10× Genomics单细胞测序实验 |
| 12123 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveals a role for pancreatic duct cells as potential mediators of inflammation in diabetes mellitus
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1381319
PMID:38742118
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研究论文 | 本研究揭示了胰管细胞在糖尿病相关炎症中的潜在介导作用 | 首次识别出在炎症环境中胰管细胞亚群表现出独特的促炎症信号 | 研究未明确揭示胰管细胞与其他免疫细胞之间的具体相互作用 | 探索暴露于炎症环境中的原代人胰腺细胞的细胞类型特异性分子反应 | 原代人胰腺细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 12124 | 2024-08-05 |
A Strategy based on Bioinformatics and Machine Learning Algorithms Reveals Potential Mechanisms of Shelian Capsule against Hepatocellular Carcinoma
2024, Current pharmaceutical design
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 这项研究利用生物信息学方法揭示了Shelian胶囊对肝细胞癌的潜在机制 | 通过机器学习算法和网络分析确定了四个特征基因，提供了对Shelian胶囊潜在药理机制的初步见解 | 未在临床环境中直接验证所发现的机制 | 研究Shelian胶囊在治疗肝细胞癌中的潜在机制 | 肝细胞癌相关疾病基因和Shelian胶囊的生物活性成分 | 数字病理学 | 肝癌 | 机器学习算法，生物信息学 | NA | 基因表达数据 | 153种成分和170个候选靶点，494个HCC相关疾病基因 |
| 12125 | 2024-08-05 |
Single cell analysis of short-term dry eye induced changes in cornea immune cell populations
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1362336
PMID:38560382
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研究论文 | 本研究评估了干眼如何改变角膜免疫细胞群体的比例和转录特征 | 通过单细胞RNA测序揭示了干眼条件下角膜免疫细胞的转录谱变化 | 未提及具体的临床试验或长期跟踪研究 | 探究干眼对角膜免疫细胞影响的机制 | 角膜中的免疫细胞群体 | 数字病理学 | 干眼 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 十二种角膜免疫细胞群体 |
| 12126 | 2024-08-04 |
Anterior Pituitary Transcriptomics Following a High-Fat Diet: Impact of Oxidative Stress on Cell Metabolism
2023-Dec-23, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqad191
PMID:38103263
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研究论文 | 本研究探讨高脂饮食对前垂体转录组的影响，特别是氧化压力对细胞代谢的影响。 | 本研究首次比较了男女小鼠在高脂饮食下前垂体细胞对氧化压力的适应能力。 | 未能深入分析高脂饮食对前垂体基因表达长期影响的变化。 | 研究高脂饮食对前垂体功能及其转录组的影响。 | 使用FVB.129P小鼠探讨高脂饮食对男女前垂体细胞的影响。 | 数字病理学 | 肥胖相关病 | 单细胞RNA测序 | NA | 血清激素和细胞转录组数据 | 男性和女性FVB.129P小鼠，每组增加了20克体重 |
| 12127 | 2024-08-04 |
Single-Molecule Spatial Transcriptomics of Human Thoracic Aortic Aneurysms Uncovers Calcification-Related CARTPT-Expressing Smooth Muscle Cells
2023-12, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.319329
PMID:37823268
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研究论文 | 本研究揭示了人类胸主动脉瘤中与钙化相关的CARTPT表达的平滑肌细胞的稀有亚型 | 采用高分辨率单细胞转录组成像技术揭示了胸主动脉瘤组织样本中稀有平滑肌细胞类型 | 主要集中于男性TAA样本，可能限制了对其他人群的普遍适用性 | 揭示人类胸主动脉瘤中平滑肌细胞的异质性及其功能 | 人类胸主动脉瘤组织样本中的平滑肌细胞亚型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单分子空间转录组成像 | NA | 组织样本 | 140个基因的转录本在新鲜冷冻的TAA样本中分析 |
| 12128 | 2024-08-04 |
Mettl14-mediated m6A modification ensures the cell-cycle progression of late-born retinal progenitor cells
2023-06-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112596
PMID:37269288
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研究论文 | 该文章探讨了Mettl14介导的m6A修饰如何确保晚出生视网膜前体细胞的细胞周期进展 | 该研究揭示了m6A甲基化在调节晚出生视网膜前体细胞细胞周期中的重要作用 | 尚未探讨Mettl14缺失对出生前视网膜发育的其他潜在影响 | 旨在揭示神经前体细胞细胞周期进展的调控机制 | 晚出生的视网膜前体细胞 | 数字病理学 | NA | mA测序，单细胞转录组分析 | NA | mRNA | NA |
| 12129 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics of human-skin-equivalent organoids
2023-05-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112511
PMID:37195865
|
研究论文 | 该研究利用单细胞转录组学比较人类皮肤等效类器官和自然皮肤的特征 | 该论文通过重建HSE角质形成细胞的分化轨迹，揭示了HSEs中的独特角质形成细胞状态及其与已知体内分化通路的相似性 | HSEs存在独特的角质形成细胞状态，并且终末分化受损 | 研究人类皮肤等效类器官的生物学特性及其分化过程 | 人类皮肤等效(organoid)培养物、异种移植物和体内表皮 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 12130 | 2024-08-05 |
Monocyte depletion enhances neutrophil influx and proneural to mesenchymal transition in glioblastoma
2023-04-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-37361-8
PMID:37012245
|
研究论文 | 本文探讨了单核细胞耗竭如何增强神经元至间充质转变和中性粒细胞的涌入。 | 研究揭示了单核细胞和中性粒细胞在不同肿瘤类型和基因型中的入侵和功能差异，并强调了同时靶向这两类细胞对癌症治疗的重要性 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能限制了结果对人类癌症的直接应用 | 探讨单核细胞耗竭对胶质母细胞瘤中中性粒细胞行为的影响 | 利用CRISPR/Cas9基因编辑生成缺乏单核细胞趋化因子的小鼠模型 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | CRISPR/Cas9基因编辑 | 小鼠模型 | 单细胞RNA测序 | 使用了基因工程小鼠模型，包括PDGFB驱动的胶质母细胞瘤和肝细胞癌的多个样本 |
| 12131 | 2024-08-04 |
Transcriptional activation of Jun and Fos members of the AP-1 complex is a conserved signature of immune aging that contributes to inflammaging
2023-04, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.13792
PMID:36840360
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研究论文 | 该文章研究了AP-1复合体中Jun和Fos成员的转录激活在免疫衰老中的作用 | 发现AP-1复合体的转录激活在不同小鼠品系和组织中是一个保守的衰老特征 | 研究主要集中在小鼠模型，可能对人类应用的普遍性有限 | 探索免疫衰老中的转录激活机制及其对慢性炎症的影响 | 长寿和短寿小鼠品系的免疫细胞转录组和表观基因组 | 数字病理学 | 老年疾病 | ATAC-seq、单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 年轻和老年小鼠的免疫细胞样本 |
| 12132 | 2024-08-05 |
Renal enhanced CT images reveal the tandem mechanism between tumor cells and immunocytes based on bulk/single-cell RNA sequencing
2023-Mar-18, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-023-01011-5
PMID:36933049
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研究论文 | 这篇文章探讨了代谢重编程在透明细胞肾癌中的作用，尤其是谷氨酰胺代谢对肿瘤微环境的影响 | 文章首次揭示了谷氨酰胺代谢在透明细胞肾癌的免疫微环境形成中的关键作用，并构建了有效的影像基因组模型 | 样本主要来源于公开数据库，可能存在选择偏差，且未能全面覆盖不同的肾癌亚型 | 研究透明细胞肾癌中谷氨酰胺代谢的作用及其对肿瘤微环境和免疫细胞浸润的影响 | 涉及539个透明细胞肾癌样本和59个正常样本的数据分析 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO-Cox回归模型 | 转录组数据 | 539个透明细胞肾癌样本和59个正常样本 |
| 12133 | 2024-08-04 |
Identifying strengths and weaknesses of methods for computational network inference from single-cell RNA-seq data
2023-03-09, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkad004
PMID:36626328
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研究论文 | 本文对十一种近期的网络推断方法在七个已发布的单细胞RNA测序数据集上的性能进行评估 | 扩展的基准研究评估了不同类型的黄金标准网络和评估指标 | 推断网络准确性的改进方法和更好的黄金标准仍然需要 | 研究不同方法在单细胞RNA测序数据上推断转录基因调控网络的有效性 | 评估十一种方法在不同物种（人类、小鼠和酵母）上处理的scRNA-seq数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | SCENIC, PIDC, MERLIN, Correlation | 转录组数据 | 七个已发布的数据集 |
| 12134 | 2024-08-05 |
LDL delivery of microbial small RNAs drives atherosclerosis through macrophage TLR8
2022-12, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-022-01030-7
PMID:36474072
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研究论文 | 本研究表明微生物小RNA（msRNA）通过低密度脂蛋白（LDL）驱动促炎性巨噬细胞极化和细胞因子分泌。 | 确定了LDL-msRNA作为动脉粥样硬化相关炎症的诱因，揭示了LDL在胆固醇运输之外的其他功能。 | NA | 研究微生物小RNA在动脉粥样硬化中通过巨噬细胞TLR8的作用机制。 | 聚焦于巨噬细胞表型及其在动脉粥样硬化病理中的作用。 | 数字病理学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | NA | 小鼠模型中的不同动脉粥样硬化模型 |
| 12135 | 2024-08-05 |
Modular derivation of diverse, regionally discrete human posterior CNS neurons enables discovery of transcriptomic patterns
2022-09-30, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abn7430
PMID:36179024
|
研究论文 | 本文建立了一种模块化的单层分化范式，用于衍生具有区域特异性的多样化人类后中枢神经系统神经元 | 创新性地使用调节D/V信号来导向不同类型的后中枢神经系统神经元，并利用单细胞RNA测序和计算管道发现区域特异性的转录标记 | 研究可能在hPSCs的来源以及特定神经元类型的功能验证方面存在局限 | 旨在通过衍生人类后中枢神经系统神经元来加深对人类神经发育和疾病的理解 | 研究对象为由人类多能干细胞衍生的后中枢神经系统神经元前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 12136 | 2024-08-05 |
Dissociation and inDrops microfluidic encapsulation of human gut tissues for single-cell atlasing studies
2022-09-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101570
PMID:35880121
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研究论文 | 本文详细介绍了人肠组织解离和在inDrops微流体平台上的单细胞RNA测序的步骤 | 创新点在于使用冷激活蛋白酶进行人肠组织解离，并在inDrops平台上进行单细胞封装 | 此方法的适用性尚需进一步验证，尤其是在不同类型的肠组织中 | 研究人肠组织的单细胞RNA测序，以帮助了解细胞的多样性和功能 | 人肠组织中的单个上皮细胞 | 数字病理 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 使用了多种病变和炎症状态的组织样本 |
| 12137 | 2024-08-05 |
Dysfunctional ERG signaling drives pulmonary vascular aging and persistent fibrosis
2022-07-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-31890-4
PMID:35879310
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研究论文 | 本文探讨了老年小鼠肺内皮细胞在肺纤维化恢复或进展过程中的表观遗传和转录分析 | 识别了转录因子ETS相关基因(ERG)作为肺毛细血管稳态和修复的潜在调节因子，并揭示了其在衰老中的功能失调 | 研究主要基于小鼠模型，结果可能无法完全转化到人类 | 探究血管在肺部修复和纤维化中的作用及其衰老的影响 | 年轻和老年小鼠的肺内皮细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 年轻和老年小鼠，具体样本数量未提及 |
| 12138 | 2024-08-05 |
A brain precursor atlas reveals the acquisition of developmental-like states in adult cerebral tumours
2022-07-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-31408-y
PMID:35853870
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研究论文 | 本研究揭示了人类脑肿瘤中细胞类型与神经发育各个阶段的相似性 | 该研究首次建立了小鼠大脑发展过程的单细胞转录组图谱，并与人类脑肿瘤中的单细胞数据进行对比，发现肿瘤细胞表现出与胚胎放射神经前体细胞的表达特征重叠 | 本研究主要基于小鼠模型与人类细胞数据的比较，可能无法完全反映人类脑肿瘤的所有特征 | 本研究旨在阐明人类脑胶质瘤的起源及其细胞类型特征 | 研究对象为鼠类大脑发育过程中的细胞及人类胚胎和儿童胶质肿瘤的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 细胞转录组数据 | 超过100,000个细胞，以及超过100个成人和儿童脑肿瘤样本 |
| 12139 | 2024-08-05 |
Orexin neurons inhibit sleep to promote arousal
2022-07-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-31591-y
PMID:35851580
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研究论文 | 本研究展示了orexin神经元通过间接抑制促进睡眠的神经元来维持觉醒 | 发现了一个新的前馈电路，通过这个电路，orexin和共同释放的谷氨酸作用于并抑制促睡眠的神经元 | 未明确提及 | 探讨orexin神经元在维持觉醒中的作用机制 | orexin神经元及其在觉醒和睡眠之间的调节作用 | 神经科学 | 睡眠障碍 | 体内光遗传学、体外光遗传学电路映射和单细胞转录组学 | NA | 光学数据、转录组数据 | 涉及了多个动物样本，但具体样本数量未提及 |
| 12140 | 2024-08-05 |
Group 3 innate lymphocytes make a distinct contribution to type 17 immunity in bladder defence
2022-Jul-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104660
PMID:35845169
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研究论文 | 该文章探讨了3型天生淋巴细胞在膀胱防御中的17型免疫中的独特贡献 | 发现组3天生淋巴细胞(ILC3s)在膀胱感染后释放IL17，并探讨了ILC3和髓系细胞之间的相互作用 | 对人类膀胱的具体机制分析还不完全 | 旨在深入理解膀胱免疫，特别是17型免疫的调控机制 | 研究对象为小鼠和人类的膀胱样本 | NA | 膀胱感染 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 研究涉及小鼠和人类样本 |