单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 12061 - 12080 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12061 | 2024-08-05 |
FXYD3 facilitates Na+ and liquid absorption across human airway epithelia by increasing the transport capacity of the Na/K ATPase
2022-Oct-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00047.2022
PMID:35993520
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研究论文 | 本研究探讨了FXYD3在增加人类气道上皮Na+和液体吸收中的作用 | 首次确定了FXYD3作为Na/K ATPase的γ亚基在气道上皮细胞中的定位和功能 | 研究仅限于单细胞RNA测序和体外实验，未在体内验证FXYD3的作用 | 探讨FXYD3在气道上皮细胞中对Na+和液体吸收的影响 | 人类气道上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和免疫组化 | NA | 细胞数据 | NA |
| 12062 | 2024-08-05 |
Hippo signaling cofactor, WWTR1, at the crossroads of human trophoblast progenitor self-renewal and differentiation
2022-09-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2204069119
PMID:36037374
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研究论文 | 本文探讨了Hippo信号共因子WWTR1在人类滋养层前体自我更新和分化过程中的关键作用 | 揭示了WWTR1作为人类滋养层命运选择的主调控因子，并明确了其在自我更新和分化中的双重作用 | 对WWTR1在不同妊娠阶段的完全作用及其调控机制仍需进一步研究 | 揭示人类滋养层前体的自我更新与分化之间的分子机制 | 人类滋养层干细胞、初级滋养细胞和人类胎盘样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 多个胎盘样本，包括病理妊娠的胎盘 |
| 12063 | 2024-08-05 |
Neuropeptides and small-molecule amine transmitters: cooperative signaling in the nervous system
2022-Aug-23, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04451-7
PMID:35997826
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综述 | 本文回顾了神经肽和小分子胺类传递物质在神经系统中的协同信号传递 | 提出了神经肽如何与小分子胺类传递物质共同作用于神经传递的具体机制 | 对神经肽和小分子胺类传递物质的部分机制仍未完全阐明 | 探讨神经肽与小分子胺类传递物质在神经传递中的作用 | 关于神经肽及其受体的数据，以及它们在神经元释放后的作用 | 神经生物学 | NA | 药理学和遗传学功能丧失与获得实验 | NA | 数据 | NA |
| 12064 | 2024-08-05 |
Asynchronous excitatory neuron development in an isogenic cortical spheroid model of Down syndrome
2022, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2022.932384
PMID:36161168
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研究论文 | 本研究利用同源的诱导多能干细胞（iPSC）系生成了模型唐氏综合症（DS）对大脑发育影响的皮层球体 | 本研究揭示了三体21染色体对兴奋性神经元发育的特定影响，并识别潜在驱动三体和常态兴奋性神经元发育非同步性的候选基因 | 尚未确定分子过程如何详细影响唐氏综合症中的智力障碍 | 研究唐氏综合症中神经发育变化的机制基础 | 利用同源的诱导多能干细胞系生成的皮层球体 | 数字病理学 | 唐氏综合症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 皮层球体模型 | 转录组数据 | 使用了一对同源的诱导多能干细胞系（trisomic 和 euploid） |
| 12065 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing analysis of vestibular schwannoma reveals functionally distinct macrophage subsets
2024-Jun, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02646-2
PMID:38480935
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研究论文 | 本研究分析了前庭神经瘤中功能上不同的巨噬细胞亚群 | 本研究首次利用单细胞RNA测序技术揭示了前庭神经瘤中巨噬细胞的三种不同亚群及其基因表达特征 | 样本量较小，仅分析了三例前庭神经瘤样本，可能影响结果的广泛性 | 评估前庭神经瘤中巨噬细胞的表型和功能特征 | 前庭神经瘤样本中的巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三例前庭神经瘤样本和十例前庭神经瘤样本的RT-qPCR分析 |
| 12066 | 2024-08-05 |
MUFFIN: a suite of tools for the analysis of functional sequencing data
2024-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqae051
PMID:38745992
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研究论文 | MUFFIN是一个用于分析功能测序数据的Python工具包 | MUFFIN提供了广泛的工具，填补了Python生态系统中缺失的功能，特别是针对非编码区域的分析 | 文章未详细讨论MUFFIN在处理特定种类样本时的局限性 | 开发一个适用于多种基因组测序分析的工具包 | 针对scRNA-seq、ChIP-seq和ATAC-seq数据集进行建模和分析 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 测序数据 | 三个不同的scRNA-seq、ChIP-seq和ATAC-seq数据集 |
| 12067 | 2024-08-05 |
The Treatment of Refractory Vitiligo With Autologous Cultured Epithelium Grafting: A Real-World Retrospective Cohort Study
2024-May-14, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szae009
PMID:38513284
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研究论文 | 本研究评估了一种改良自体培养上皮移植技术在治疗难治性白癜风中的效果 | 提出了一种改良的自体培养上皮移植技术，并首次在大规模真实世界患者中应用 | 本研究为回顾性队列研究，可能存在选择偏倚 | 评估自体培养上皮移植在白癜风治疗中的有效性和影响因素 | 726名接受自体培养上皮移植（ACEG）治疗的白癜风患者 | 数字病理学 | 白癜风 | 自体培养上皮移植（ACEG） | 广义线性混合模型 | 临床数据 | 726名白癜风患者 |
| 12068 | 2024-08-04 |
Identification of hypoxic macrophages in glioblastoma with therapeutic potential for vasculature normalization
2024-May-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.03.013
PMID:38640932
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研究论文 | 本文揭示了缺氧巨噬细胞在神经胶质瘤中对血管正常化的治疗潜力 | 本研究首次通过单细胞转录组学解析缺氧微环境中的肿瘤相关巨噬细胞的异质性，并提出了针对缺氧巨噬细胞的潜在治疗策略 | 研究主要基于患者样本，可能存在个体差异，且对临床应用的长期效果需进一步验证 | 探索缺氧巨噬细胞在胶质瘤血管正常化中的作用及其潜在治疗价值 | 51名患者的单细胞转录组数据，重点分析缺氧肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 神经胶质瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 51名患者 |
| 12069 | 2024-08-05 |
Identification and verification of a novel signature that combines cuproptosis-related genes with ferroptosis-related genes in osteoarthritis using bioinformatics analysis and experimental validation
2024-May-13, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-024-03328-3
PMID:38741149
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研究论文 | 本研究构建了结合铜死亡相关基因和铁死亡相关基因的新标志基因，以探讨骨关节炎的发病机制。 | 创新点在于首次将铜死亡相关基因与铁死亡相关基因结合起来，形成新的标志基因以用于骨关节炎的研究。 | 研究中使用的数据集可能存在选择偏倚，且实验验证样本量较小，可能影响结果的广泛应用。 | 研究骨关节炎的发病机制，并寻找潜在的治疗靶点。 | 本研究主要针对骨关节炎的标志基因进行分析和验证。 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据 | 使用GSE82107数据集进行了验证 |
| 12070 | 2024-08-05 |
Mapping of mitogen and metabolic sensitivity in organoids defines requirements for human hepatocyte growth
2024-May-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48550-4
PMID:38740814
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研究论文 | 本文揭示了人类肝细胞在发育和再生中的增长机制，特别是胎儿和成人肝细胞类器官的生长差异 | 通过转录组和表型方法对肝细胞类器官的生长要求进行了特征化，发现了促进成人肝细胞增殖的潜在策略 | 该研究主要集中于类器官的体外生长，缺乏体内验证 | 探讨人类肝细胞在发育和再生过程中的增殖机制 | 研究对象为人类胎儿肝细胞（FH）和成人初级人类肝细胞（PHH） | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未提供样本数量的具体信息 |
| 12071 | 2024-08-05 |
Tumor cell-intrinsic epigenetic dysregulation shapes cancer-associated fibroblasts heterogeneity to metabolically support pancreatic cancer
2024-May-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.03.005
PMID:38579725
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研究论文 | 本文揭示了肿瘤细胞内源性表观遗传失调如何影响与癌症相关的成纤维细胞的异质性，并通过提供脂质支持胰腺癌的代谢。 | 本研究首次揭示SETD2缺失如何通过调节H3K27Ac增强BMP2信号通路，导致成纤维细胞向脂肪丰富表型分化，从而促进肿瘤进展。 | 研究未深入探讨其他可能影响成纤维细胞异质性的因素，仅集中于肿瘤细胞的表观遗传失调。 | 研究旨在探讨胰腺导管腺癌微环境中成纤维细胞异质性的起源和功能。 | 研究对象为SETD2缺失胰腺肿瘤中的成纤维细胞亚群。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | SETD2缺失的胰腺肿瘤样本中识别出的成纤维细胞亚群 |
| 12072 | 2024-08-05 |
Integrated single-cell and bulk RNA-Seq analysis enhances prognostic accuracy of PD-1/PD-L1 immunotherapy response in lung adenocarcinoma through necroptotic anoikis gene signatures
2024-05-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-61629-8
PMID:38740918
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞与整体RNA测序分析，提升了对肺腺癌PD-1/PD-L1免疫疗法反应的预后准确性 | 提出了与凋亡相关的基因特征HMR、FAM83A和KRT6A，增强了预测肺腺癌患者对免疫治疗反应的能力 | 承认数据集的回顾性性质及样本规模需要更大 | 本研究旨在提高肺腺癌患者在PD-1/PD-L1免疫治疗中的预后评估准确性 | 研究对象是肺腺癌患者及其相关基因 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | RNA数据 | 使用了GSE50081、IMvigor210和GSE78220数据集进行验证 |
| 12073 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA sequencing reveals aberrant sphingolipid metabolism in non-small cell lung cancer impacts tumor-associated macrophages and stimulates angiogenesis via macrophage inhibitory factor signaling
2024-May, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.15283
PMID:38587042
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序揭示了非小细胞肺癌中异常的鞘脂代谢如何影响肿瘤相关巨噬细胞并通过巨噬细胞抑制因子信号刺激血管生成 | 研究首次探讨了鞘脂在肿瘤微环境中的作用，特别是在巨噬细胞极化和血管生成中的影响 | 未详细讨论鞘脂代谢对其他免疫细胞的影响 | 研究鞘脂代谢在非小细胞肺癌中的作用及其对肿瘤微环境的影响 | 主要研究巨噬细胞及其与癌细胞之间的相互作用 | 数字病理 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 利用了多个公开的scRNA-seq数据集 |
| 12074 | 2024-08-04 |
Immune cell-related prognostic risk model and tumor immune environment modulation in esophageal carcinoma based on single-cell and bulk RNA sequencing
2024-May, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.15301
PMID:38587029
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研究论文 | 本文探讨了免疫细胞在食管癌肿瘤免疫微环境中的角色，并建立了预后风险模型 | 利用单细胞测序，识别和表征免疫细胞亚群，构建独立的预后模型 | 未提及 | 研究食管癌患者的肿瘤免疫微环境和预后模型 | 食管癌患者的免疫细胞特征 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq | NA |
| 12075 | 2024-08-05 |
ptx3a+ fibroblast/epicardial cells provide a transient macrophage niche to promote heart regeneration
2024-Apr-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114092
PMID:38607913
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研究论文 | 本文探讨了在再生心脏中参与巨噬细胞修复的细胞间相互作用 | 识别了ptx3a+成纤维细胞/心外膜细胞与巨噬细胞间的强交互，并阐明了其在心脏再生中的重要性 | 未详细研究其他细胞类型对巨噬细胞反应的影响 | 研究巨噬细胞在心脏修复中的微环境 | 关注再生斑马鱼心脏中的巨噬细胞以及其周围的细胞 | 数字病理学 | 心脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 使用了斑马鱼模型进行实验 |
| 12076 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA Sequencing in Organ and Cell Transplantation
2024-Apr-11, Biosensors
DOI:10.3390/bios14040189
PMID:38667182
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综述 | 本文探讨了单细胞RNA测序在器官和细胞移植中的应用及其潜在影响 | 介绍了单细胞RNA测序如何揭示移植组织转录组以及与移植并发症相关的细胞类型和状态 | 文章未详细讨论单细胞RNA测序技术的挑战和局限性 | 研究单细胞RNA测序在器官和干细胞移植中的应用 | 应用单细胞RNA测序分析被移植组织中的供体和受体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 12077 | 2024-08-05 |
Reconstruction Set Test (RESET): A computationally efficient method for single sample gene set testing based on randomized reduced rank reconstruction error
2024-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012084
PMID:38683883
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研究论文 | 本文提出了一种名为重构集测试（RESET）的单样本基因集测试方法 | RESET方法通过随机降秩重构算法提供了一种计算上高效的基因集重要性量化方式 | NA | 研究单样本基因集测试的新方法 | 基因集及其在测量基因值重构中的重要性 | 生物信息学 | NA | 随机降秩重构算法 | NA | scRNA-seq数据 | 真实和模拟的scRNA-seq数据 |
| 12078 | 2024-08-04 |
Predictive biomarkers and initial analysis of maternal immune alterations in postpartum preeclampsia reveal an immune-driven pathology
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1380629
PMID:38745664
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研究论文 | 本文研究了产后高血压（PPPE）中母体免疫变化及预测生物标志物的潜在性 | 发现胎盘CD163+细胞和初始妊娠期血压可作为非侵入性预测PPPE的生物标志物 | 研究样本的规模和多样性可能限制了结论的普遍性 | 理解PPPE诊断时的免疫贡献及周产期生物标志物的预测潜力 | 通过采集PPPE患者和健康对照组的胎盘和血液样本进行比较分析 | 数字病理学 | 产后高血压 | 单细胞转录组学、流式细胞术、细胞内细胞因子染色 | NA | 血液样本、胎盘组织 | 涉及PPPE患者和健康对照组的样本 |
| 12079 | 2024-08-04 |
Identification of PANoptosis-related predictors for prognosis and tumor microenvironment by multiomics analysis in glioma
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.94200
PMID:38577605
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研究论文 | 本研究探讨了PANoptosis相关基因在胶质瘤进展中的功能，并识别了预测胶质瘤预后的相关指标 | 本研究首次识别了与PANoptosis相关的四个预测因子，并建立了PANRG评分模型，与肿瘤微环境的关系得到了探讨 | 本研究的局限性在于样本数量和实验验证的范围可能不足 | 研究PANoptosis相关基因在胶质瘤中的预后预测和新治疗靶点的开发 | 胶质瘤患者的基因数据和临床样本 | 数字病理学 | 胶质瘤 | RNA-seq | LASSO-Cox回归分析 | 基因数据 | 来自TCGA、CGGA和GEO数据库的胶质瘤患者的bulk和单细胞RNA-seq数据 |
| 12080 | 2024-08-05 |
Prognostic and Immune Landscape Analysis of Ubiquitination-related Genes in Hepatocellular Carcinoma: Based on Bulk and Single-cell RNA Sequencing Data
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.93425
PMID:38577593
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研究论文 | 本研究分析了与泛素化相关基因在肝细胞癌中的预后和免疫景观 | 本研究首次基于泛素化相关基因建立了肝细胞癌预测模型，并确定了三个关键生物标志物 | 目前仍缺乏关于泛素化相关基因在肝细胞癌免疫疗法中的实际应用验证 | 探讨泛素化相关基因在肝细胞癌预后和免疫治疗中的作用 | 主要研究肝细胞癌中与泛素化相关的基因及其表达特征 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序，转录组差异表达分析 | 加权基因共表达网络分析，Cox回归，Lasso回归 | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA和GEO的数据集，样本大小未具体提及 |