单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 12101 - 12120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12101 | 2024-08-05 |
Impaired primordial follicle assembly in offspring ovaries from zearalenone-exposed mothers involves reduced mitochondrial activity and altered epigenetics in oocytes
2022-Apr-26, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04288-0
PMID:35469021
|
研究论文 | 本研究探讨了ZEA暴露对新生小鼠卵巢中原始卵泡形成的影响以及其在卵母细胞中的表观遗传学改变 | 揭示了ZEA引起的线粒体活性降低和卵母细胞中表观遗传学改变是导致原始卵泡组装受损的机制 | 未涉及长期ZEA暴露对后代长期生育能力的影响 | 研究ZEA对小鼠卵巢原始卵泡形成和卵母细胞基因表达的影响 | 母鼠及其新生小鼠的卵巢及卵母细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 新生小鼠卵巢样本数量未具体说明 |
| 12102 | 2024-08-05 |
Gene regulatory network from cranial neural crest cells to osteoblast differentiation and calvarial bone development
2022-Feb-27, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04208-2
PMID:35220463
|
综述 | 本文总结了颅神经嵴细胞在骨形成中的基因调控网络及其对颅骨发育的贡献 | 揭示了鼠和人类中颅神经嵴衍生的成骨潜能的潜在基因调控网络的差异 | 虽然讨论了基因调控网络的影响，但是具体的实验数据和样本大小未详述 | 研究颅神经嵴细胞的分化及其在颅骨发育中的作用 | 颅神经嵴细胞及其衍生的成骨细胞和软骨细胞 | 数字病理学 | 临床出生缺陷和疾病 | 单细胞测序 | 基因鼠模型 | NA | NA |
| 12103 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Defines Expression of Kabuki Syndrome-Associated KMT2D Targets and Interacting Partners
2022, Stem cells international
IF:3.8Q2
DOI:10.1155/2022/4969441
PMID:35992033
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研究论文 | 本文研究了Kabuki综合征相关的KMT2D靶基因及其相互作用伙伴的表达 | 首次使用单细胞RNA数据分析KMT2D和KDM6A在小鼠牙髓中的表达特征 | 研究仅限于小鼠模型，可能不完全适用于人类 | 探究KMT2D和KDM6A在间充质干细胞分化过程中的作用 | 小鼠牙髓中的KMT2D和KDM6A基因表达 | 数字病理学 | Kabuki综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 小鼠牙髓样本 |
| 12104 | 2024-08-05 |
SHH and Notch regulate SOX9+ progenitors to govern arcuate POMC neurogenesis
2022, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2022.855288
PMID:36033614
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研究论文 | 本文研究了SHH和Notch信号通路如何调控SOX9+前体细胞以影响POMC神经发生 | 本研究首次揭示了SHH和Notch在调控SOX9+前体细胞及其分化中的作用 | 研究主要基于胚胎小鸡模型，可能在其他物种中存在差异 | 探讨下丘脑神经发生过程中转录因子的动态表达及其调控机制 | 主要研究对象为下丘脑弓状核中的POMC表达神经元及其前体细胞 | 数字病理学 | NA | 免疫组化和多重杂交技术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 胚胎小鸡样本 |
| 12105 | 2024-08-05 |
An update on the phenotypic switching of vascular smooth muscle cells in the pathogenesis of atherosclerosis
2021-Dec-22, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-021-04079-z
PMID:34936041
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综述 | 该文章综述了血管平滑肌细胞在动脉粥样硬化中的表型转变 | 文章强调了血管平滑肌细胞在动脉粥样硬化表型转变中的新发现，包括对转录标志物的下调及多种其他表型的采纳 | 文章未明确阐述血管平滑肌细胞转变的分子机制和过程 | 综述动脉粥样硬化中血管平滑肌细胞表型转变的挑战和需进一步研究的问题 | 血管平滑肌细胞在动脉粥样硬化过程中的表型转变 | 数字病理学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 12106 | 2024-08-05 |
Deciphering neural heterogeneity through cell lineage tracing
2021-Mar, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-020-03689-3
PMID:33151389
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综述 | 本文综述了神经细胞谱系追踪的策略及其对理解神经细胞功能克隆关系的作用 | 结合不同的报告蛋白和转基因小鼠，利用新型基因组编辑工具和单细胞测序技术，显著提高了谱系追踪能力 | 对于谱系追踪的复杂性和挑战性仍未提供明确的解决方案 | 探讨细胞谱系在成人大脑发育中的重要性 | 围绕大脑中的细胞谱系和它们的功能克隆关系进行研究 | 发育神经生物学 | NA | 基因组编辑工具、单细胞测序 | 转基因小鼠 | NA | NA |
| 12107 | 2024-08-05 |
Human airway mast cells proliferate and acquire distinct inflammation-driven phenotypes during type 2 inflammation
2021-02-26, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abb7221
PMID:33637594
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研究论文 | 本研究分析了人类气道肥大细胞在2型炎症过程中的增殖及其特异的以炎症驱动的表型 | 本研究链接了肥大细胞表面表型与其不同转录组之间的关系，揭示了肥大细胞在CRSwNP中的特异性增殖 | 对肥大细胞异质性的机制及其扩展的转录程序尚不完全理解 | 研究肥大细胞在2型过敏性炎症疾病中的作用及其增殖机制 | 人类气道中的肥大细胞，尤其是在慢性鼻窦炎伴有鼻息肉症中的肥大细胞 | 数字病理 | 呼吸道疾病 | 流式细胞术及单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | NA |
| 12108 | 2024-08-05 |
Dissecting the initiation of female meiosis in the mouse at single-cell resolution
2021-Jan, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-020-03533-8
PMID:32367190
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研究论文 | 本文详细分析了小鼠雌性减数分裂的起始过程及其转录组特征 | 本研究通过单细胞RNA测序首次揭示了小鼠雌性减数分裂起始过程中的细胞群体及其转录组动力学，提供了重要的新资源 | 该研究集中于小鼠模型，可能不完全适用于其他物种的生殖生物学 | 揭示小鼠雌性减数分裂的分子机制及细胞群体的转录组特征 | 小鼠胎儿卵巢和生殖脊中的细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 研究中涉及13个转录群体和7个生殖细胞亚群 |
| 12109 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing analysis of the retina under acute high intraocular pressure
2024-Nov-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/1673-5374.389363
PMID:38526288
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研究论文 | 本文分析了在急性高眼压下视网膜的单细胞RNA测序特征 | 首次揭示了高眼压下视网膜的分子变化和细胞间相互作用 | 未提及具体限制 | 探讨高眼压引起的视网膜损伤的分子机制 | 视网膜细胞，特别是视网膜神经节细胞 | 数字病理学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞基因表达数据 | 建立了急性高眼压的大鼠模型 |
| 12110 | 2024-08-04 |
Navigating colorectal cancer prognosis: A Treg-related signature discovered through single-cell and bulk transcriptomic approaches
2024-Jun, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24214
PMID:38459654
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和大规模转录组方法发现了与Treg相关的结直肠癌预后标志 | 本研究结合了单细胞异质性和大规模转录组数据，构建了基于Treg相关特征的预后模型 | 临床应用验证尚需进一步研究，以及样本量的限制可能影响结果的普适性 | 研究结直肠癌的预后及其与调节性T细胞的关系 | 结直肠癌患者的Treg细胞及其相关基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序和大规模转录组分析 | 生存分析模型 | 基因表达数据 | 分析了GSE132465和GSE188711中结直肠癌的单细胞和大规模数据集 |
| 12111 | 2024-08-04 |
Precision unveiled: Synergistic genomic landscapes in breast cancer-Integrating single-cell analysis and decoding drug toxicity for elite prognostication and tailored therapeutics
2024-Jun, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24205
PMID:38450906
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研究论文 | 本研究探索了与T细胞相关的基因与谷氨酰胺代谢之间的关系，以构建乳腺癌患者的预后分级指标 | 创新点在于开发了一种TRG_GM分类器，整合了临床指标，提高了乳腺癌的预后预测能力 | 缺少对多种指标结合的深入探索以揭示不同维度的预后表现 | 研究旨在通过分析基因与代谢的关系，提升乳腺癌的个性化治疗效果 | 研究对象为乳腺癌患者及其相关的生物标志物 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 机器学习，Cox分析，Lasso算法 | NA | 基因组数据，免疫特征数据 | NA |
| 12112 | 2024-08-05 |
Integrative analysis of bulk RNA-seq and scRNA-seq data indicates the prognostic and immunologic values of SERPINH1 in glioma
2024-Jun, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24192
PMID:38506564
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研究论文 | 本文章探讨了SERPINH1在胶质瘤中的预后和免疫学价值 | 本研究首次阐明了SERPINH1在胶质瘤中的表达及其作为独立预后因素的作用 | 仅使用了在线数据库的数据，未报告临床样本的多样性 | 研究SERPINH1在胶质瘤中的潜在价值 | 胶质瘤相关的RNA-seq和scRNA-seq数据 | 数字病理学 | 胶质瘤 | RNA-seq，qRT-PCR，免疫组织化学 | Cox回归分析 | RNA序列数据 | NA |
| 12113 | 2024-08-05 |
Exploring the causal relationship between antihypertensive drugs and glioblastoma by combining drug target Mendelian randomization study, eQTL colocalization, and single-cell RNA sequencing
2024-Jun, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24210
PMID:38450887
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研究论文 | 本研究评估了抗高血压药物对神经胶质母细胞瘤的潜在因果影响 | 本研究首次结合了药物靶点孟德尔随机化研究、eQTL共定位以及单细胞RNA测序，探讨了抗高血压药物与神经胶质母细胞瘤之间的因果关系 | 需要更多的研究来验证这些发现，并进一步揭示血压与神经胶质母细胞瘤之间的复杂关系 | 评估血压和抗高血压药物对神经胶质母细胞瘤的潜在因果影响 | 针对5种抗高血压药物的研究对象，包括β-受体拮抗剂等 | 数字病理学 | 神经胶质瘤 | 单细胞RNA测序、Mendelian随机化分析 | NA | 基因组数据、RNA测序数据 | 欧洲人群的基因组广泛关联研究（GWAS）总结统计信息 |
| 12114 | 2024-08-04 |
Single nucleus and spatial transcriptomic profiling of healthy human hamstring tendon
2024-May-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202300601RRR
PMID:38742770
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研究论文 | 本研究确定了健康人类腘绳肌肌腱中所有细胞类型的转录组和位置 | 首次在健康腘绳肌肌腱中识别了12种不同的细胞类型，包括先前未报告的不同骨骼肌细胞类型、卫星细胞、脂肪细胞和未知的神经系统细胞 | 研究只集中于四名健康供体，样本量有限 | 探讨健康腘绳肌肌腱的分子和细胞基础 | 四名健康供体的腘绳肌肌腱细胞 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | 四名健康供体的10,533个细胞核 |
| 12115 | 2024-08-04 |
Tracking in situ checkpoint inhibitor-bound target T cells in patients with checkpoint-induced colitis
2024-May-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.04.010
PMID:38744246
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研究论文 | 本文通过多模态单细胞和亚细胞空间转录组学跟踪了与检查点抑制剂结合的目标T细胞。 | 本研究揭示了检查点抑制剂诱导的结肠炎中T细胞的特定信号和转录梯度，并识别了因果通路。 | NA | 探讨和追踪检查点抑制剂诱导的T细胞在肠道组织中的行为。 | 主要研究与检查点抑制剂结合的CD4和CD8 T细胞。 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 12116 | 2024-08-05 |
Foxp2 deficiency impairs reproduction by modulating the hypothalamic-pituitary-gonadal axis in zebrafish†
2024-May-09, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioae019
PMID:38288660
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研究论文 | 本研究探讨了Foxp2在斑马鱼生殖中的作用 | 揭示了Foxp2在脊椎动物生殖调节中的新角色 | 研究主要集中在斑马鱼模型上，可能无法完全推广到其他物种 | 研究Foxp2在斑马鱼生殖中的功能 | Foxp2缺失的斑马鱼模型 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 成年雄性和雌性斑马鱼 |
| 12117 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-seq data analysis reveals functionally relevant biomarkers of early brain development and their regulatory footprints in human embryonic stem cells (hESCs)
2024-Mar-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae230
PMID:38739758
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析人类胚胎干细胞中的早期神经发育相关生物标志物及其调控网络 | 该文章揭示了539个差异表达基因及其在早期人脑发育中的功能角色，并构建了基因调控网络 | 研究中所使用的样本主要来自体外分化的胚胎干细胞，可能无法完全代表完整的生物体内发育过程 | 识别早期神经发育中的差异表达基因及其分子机制 | 人类胚胎干细胞在不同发育阶段的差异表达基因 | 数字病理学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 在hESC分化为神经元的体外实验中，共分析了26天（D26）和54天（D54）时的样本 |
| 12118 | 2024-08-05 |
Protocol for flow cytometry-assisted single-nucleus RNA sequencing of human and mouse adipose tissue with sample multiplexing
2024-Mar-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102893
PMID:38416649
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研究论文 | 本文介绍了一种针对人类和小鼠脂肪组织的流式细胞术辅助单核RNA测序的协议 | 该研究开发了一种新的工作流程，可以高效处理和标记单个脂肪组织样本的细胞核 | 单细胞RNA测序受到脂肪细胞大小和脆弱性以及商业试剂盒成本的限制 | 提出一种新的脂肪组织样本处理方法以提高测序效率 | 人类和小鼠的脂肪组织样本 | 数字病理学 | NA | 流式细胞术 | NA | RNA | NA |
| 12119 | 2024-08-04 |
Preparation of High-Viability Single-Cell Suspensions from African Turquoise Killifish Brain Tissue
2024-02-01, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.prot107829
PMID:36931736
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research paper | 本研究描述了如何从非洲蓝色杀鱼的脑组织中准备高活性的单细胞悬液 | 本研究创新性地提供了一种从新兴模型生物制备高活性单细胞悬液的协议 | 未提及该方法在其他物种或组织中的适用性 | 本研究的目的是为单细胞测序准备高活性的单细胞悬液 | 非洲蓝色杀鱼的脑组织 | NA | NA | 酶解与机械解离 | NA | NA | 研究成功用于非洲蓝色杀鱼的10× Genomics单细胞测序实验 |
| 12120 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveals a role for pancreatic duct cells as potential mediators of inflammation in diabetes mellitus
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1381319
PMID:38742118
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研究论文 | 本研究揭示了胰管细胞在糖尿病相关炎症中的潜在介导作用 | 首次识别出在炎症环境中胰管细胞亚群表现出独特的促炎症信号 | 研究未明确揭示胰管细胞与其他免疫细胞之间的具体相互作用 | 探索暴露于炎症环境中的原代人胰腺细胞的细胞类型特异性分子反应 | 原代人胰腺细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |