单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
11601	2024-08-04	Single-cell and genome-wide Mendelian randomization identifies causative genes for gout 2024-Jun-03, Arthritis research & therapy IF:4.4Q1 DOI:10.1186/s13075-024-03348-z PMID:38831441	研究论文	本研究探讨了痛风疾病中基因表达调控的机制及其发病机制	识别了17个与痛风相关的独特遗传位点以及三个与痛风因果关联的蛋白	未在标题和摘要中具体提及研究的限制	研究痛风的发病机制及基因表达调控	基于GWAS、单细胞转录组学和相关数据分析痛风基因	数字病理学	痛风	GWAS, scRNA-seq, eQTL, mQTL, 孟德尔随机化	NA	基因组数据	NA
11602	2024-08-04	Single-cell and spatial transcriptomics reveal alterations in trophoblasts at invasion sites and disturbed myometrial immune microenvironment in placenta accreta spectrum disorders 2024-Jun-03, Biomarker research IF:9.5Q1 DOI:10.1186/s40364-024-00598-6 PMID:38831319	研究论文	本研究揭示了胎盘植入谱系障碍（PAS）中滋养层细胞的变化及子宫肌层免疫微环境的干扰	通过单细胞RNA测序和空间转录组学，首次系统描述了PAS中滋养层细胞的细胞组成和空间组织	样本数量较小，仅包括四名PAS患者，可能影响结论的广泛适用性	探讨胎盘植入谱系障碍的机制，特别是滋养层细胞在其中的作用	来自四名PAS患者和三名健康孕妇的组织样本	数字病理学	胎盘植入谱系障碍	空间转录组学（ST）和单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	组织样本	7个样本（包括4个PAS患者的组织样本和3个健康孕妇的子宫肌层样本）
11603	2024-08-04	Single-cell RNA-seq of in vitro expanded cells from cranial neural crest reveals a rare odontogenic sub-population 2024-Jun, Cell proliferation IF:5.9Q2 DOI:10.1111/cpr.13598 PMID:38196265	研究论文	本文研究了体外扩增的颅神经嵴细胞的单细胞RNA测序，揭示了稀有的成牙亚群体	首次分析了体外培养的颅神经嵴细胞的细胞图谱，并识别了稀有的Alx3+/Barx1+亚群体	仅在小鼠模型中进行实验，可能限制了结果的广泛性	探讨体外培养的颅神经嵴细胞在成牙过程中的细胞异质性	体外培养的小鼠颅神经嵴细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	细胞	包括初级细胞和传代5的细胞
11604	2024-08-05	Neutrophil and macrophage crosstalk might be a potential target for liver regeneration 2024-Jun, FEBS open bio IF:2.8Q3 DOI:10.1002/2211-5463.13803 PMID:38710666	研究论文	该研究探讨了中性粒细胞与巨噬细胞之间的相互作用在肝脏再生中的潜在作用	研究揭示了中性粒细胞在肝脏再生中的关键作用及其与巨噬细胞之间复杂的相互作用	该研究主要基于小鼠模型，可能不完全适用于人类	探讨中性粒细胞在肝脏再生中的角色	小鼠部分肝切除模型中的肝细胞和非实质细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	小鼠模型中的多个样本
11605	2024-08-05	The Transpeptidase Sortase A Binds Nucleic Acids and Mediates Mammalian Cell Labeling 2024-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202305605 PMID:38581131	研究论文	这篇文章探讨了金黄色葡萄球菌的Sortase A与核酸的相互作用及其在哺乳动物细胞标记中的应用	发现Sortase A与核酸的未知相互作用，并利用这一特性开发了CellID技术	未详细阐述Sortase A在其他细胞类型中的普遍适用性	研究Sortase A与核酸的相互作用及其在细胞标记中的应用	金黄色葡萄球菌Sortase A及其与哺乳动物细胞的相互作用	生物技术	NA	CRISPR筛选，scRNA-seq	NA	核酸，细胞表面标记	涉及金黄色葡萄球菌和哺乳动物细胞的多样本
11606	2024-08-05	Impact of benzo[a]pyrene, PCB153 and sex hormones on human ESC-Derived thyroid follicles using single cell transcriptomics 2024-Jun, Environment international IF:10.3Q1 DOI:10.1016/j.envint.2024.108748 PMID:38763096	研究论文	本研究探讨了人类胚胎干细胞衍生的甲状腺小体在不同性别激素环境下对内分泌干扰物的反应	该研究首次应用单细胞转录组学研究了内分泌干扰物在不同激素背景下的影响	研究仅在体外环境中进行，未能模拟完整的生理状态	研究内分泌干扰物如何影响人类甲状腺功能及不同性别激素的作用	人类胚胎干细胞衍生的甲状腺小体	数字病理学	甲状腺疾病	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA
11607	2024-08-05	Insights into the heterogeneity of the tumor microenvironment in lung adenocarcinoma and squamous carcinoma through single-cell transcriptomic analysis: Implications for distinct immunotherapy outcomes 2024-Jun, The journal of gene medicine IF:3.2Q2 DOI:10.1002/jgm.3694 PMID:38847309	研究论文	通过单细胞转录组分析揭示肺腺癌和鳞癌肿瘤微环境的异质性及其对免疫治疗结果的影响	首次通过单细胞RNA测序揭示肺腺癌与鳞癌在肿瘤免疫微环境上的显著差异	研究仅基于38例非小细胞肺癌患者，样本量较小	探讨肺腺癌和鳞癌之间在肿瘤微环境及免疫治疗反应上的差异	38例非小细胞肺癌患者	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	38例非小细胞肺癌患者
11608	2024-08-04	Single-cell metabolomics in rare disease: From technology to disease 2024-May-31, Intractable & rare diseases research IF:1.1Q2 DOI:10.5582/irdr.2023.01073 PMID:38836176	研究论文	该文章探讨了单细胞代谢组学在稀有疾病中的应用和潜力	文章创新性地提出单细胞代谢组学能够彻底改变稀有疾病的诊断、治疗和管理策略	文章未具体说明现有研究的局限性	推动稀有疾病的准确和快速诊断，并促进治疗药物的发展	稀有疾病，特别是代谢类稀有疾病	数字病理学	稀有疾病	单细胞测序技术	NA	NA	NA
11609	2024-08-05	CD47, a novel YAP target gene, contributes to hepatic stellate cell activation and liver fibrosis induced by high-fat diet 2024-May-30, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e31621 PMID:38831842	研究论文	本研究探讨了CD47在高脂饮食诱导的肝星状细胞活化和肝纤维化中的作用	本研究首次揭示了CD47作为YAP的转录靶点，在高脂饮食条件下促进肝星状细胞活化的机制	关于CD47在肝星状细胞中的具体调控机制仍不完全明了	研究CD47在肝星状细胞活化及肝纤维化中的角色及其调控机制	小鼠肝星状细胞及其在高脂饮食条件下的行为	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	小鼠模型
11610	2024-08-04	Harnessing TME depicted by histological images to improve cancer prognosis through a deep learning system 2024-May-21, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101536 PMID:38697103	研究论文	本研究提供了一种强大的深度学习系统，通过组织学图像增强肿瘤微环境(TME)信息以改善癌症预后	提出了整合图像和图形深度学习的模型(IGI-DL)，并开发了基于TME的癌症预后预测模型	研究未涉及空间转录组学(ST)的临床可用性限制	改善癌症预后，尤其是在没有ST数据的患者中	使用组织学图像来预测癌症预后和TME	数字病理学	乳腺癌和结直肠癌	深度学习	IGI-DL模型	组织学图像	使用The Cancer Genome Atlas的乳腺癌和结直肠癌队列，以及外部的Molecular and Cellular Oncology结直肠癌队列
11611	2024-08-04	Targeting PDGF signaling of cancer-associated fibroblasts blocks feedback activation of HIF-1α and tumor progression of clear cell ovarian cancer 2024-May-21, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101532 PMID:38670097	研究论文	该研究探讨了与卵巢透明细胞癌相关的癌症相关成纤维细胞的PDGF信号通路。	该研究揭示了在卵巢透明细胞癌中的化疗抗性机制，并提出了针对CAFs的治疗策略。	该研究主要基于体外和小鼠模型，临床相关性仍需进一步验证。	研究卵巢透明细胞癌的化疗抗性机制及潜在的治疗方法。	卵巢透明细胞癌患者的手术标本及其相关的癌症相关成纤维细胞。	数字病理学	卵巢癌	单细胞分析和空间转录组学	NA	显微镜图像	手术标本分析及共培养实验
11612	2024-08-05	A comprehensive single-cell breast tumor atlas defines epithelial and immune heterogeneity and interactions predicting anti-PD-1 therapy response 2024-May-21, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101511 PMID:38614094	研究论文	我们展示了一个包含236,363个细胞的初级乳腺肿瘤微环境单细胞RNA测序综合图谱	首次通过InteractPrint方法揭示了肿瘤上皮细胞与免疫细胞的相互作用，并能够预测抗PD-1治疗的反应	在这项研究中没有提到样本的时间顺序或长期效果的评估	目标是分析乳腺肿瘤微环境中免疫和肿瘤上皮细胞的异质性	本研究的对象包括来自119个活检样本的肿瘤微环境中的免疫细胞和癌上皮细胞	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序	InteractPrint	细胞数据	119个活检样本
11613	2024-08-05	Monocyte bioenergetics: An immunometabolic perspective in metabolic dysfunction-associated steatohepatitis 2024-May-21, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101564 PMID:38733988	研究论文	本文揭示了代谢功能障碍相关脂肪肝炎患者外周单核细胞的生物能量特征	首次指出在代谢功能障碍相关脂肪肝炎中，外周单核细胞表现出特定的高糖酵解和线粒体呼吸特征	研究主要基于小鼠模型，临床适用性可能受限	探讨单核细胞的生物能量特征在代谢功能障碍相关脂肪肝炎中的作用	代谢功能障碍相关脂肪肝炎患者的外周单核细胞	免疫代谢	代谢功能障碍相关脂肪肝炎	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	小鼠模型	基因表达数据	NA
11614	2024-08-05	Chemoradiotherapy-induced ACKR2+ tumor cells drive CD8+ T cell senescence and cervical cancer recurrence 2024-May-21, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101550 PMID:38723624	研究论文	该文章探讨了化学放疗（CCRT）后宫颈癌复发的机制，发现ACKR2+肿瘤细胞在驱动CD8+ T细胞衰老中的作用	创新点在于识别出了一种特定的CCRT耐药性ACKR2+肿瘤细胞亚群，以及其在CD8+ T细胞衰老与肿瘤复发中的作用	本研究的局限性在于主要依赖回顾性分析，可能存在选择偏倚	研究化学放疗后宫颈癌复发的机制及预测指标	研究对象为宫颈癌患者的肿瘤组织样本，特别关注化学放疗前后的变化	数字病理学	宫颈癌	单细胞RNA测序	NA	组织样本	NA
11615	2024-08-05	IL-7-primed bystander CD8 tumor-infiltrating lymphocytes optimize the antitumor efficacy of T cell engager immunotherapy 2024-May-21, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101567 PMID:38744277	研究论文	本研究探讨了Fc融合IL-7如何优化T细胞接合物免疫疗法的抗肿瘤效果	发现rhIL-7-hyFc能显著增加肿瘤浸润的非反应性旁观者CD8 T细胞，这些细胞在特定的T细胞接合物的作用下可转化为具有肿瘤杀伤能力的细胞	本研究主要集中在固体肿瘤中CD8 T细胞的变化，可能未涵盖其他类型肿瘤或免疫细胞的作用	探讨如何通过IL-7增强T细胞接合物免疫疗法在固体肿瘤中的效果	研究目的是分析IL-7对肿瘤浸润CD8 T细胞的影响及其在免疫疗法中的应用	NA	肿瘤	单细胞转录组分析	NA	细胞	多种固体肿瘤中的CD8肿瘤浸润淋巴细胞
11616	2024-08-05	Aberrant follicular regulatory T cells associate with immunoglobulin hyperproduction in nasal polyps with ectopic lymphoid tissues 2024-Apr, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jaci.2023.11.913 PMID:38072196	研究论文	这篇文章探讨了鼻息肉中异位淋巴组织中的卵泡调节性T细胞（TFR细胞）的存在和功能	研究首次揭示了鼻息肉中TFR细胞的特征和功能缺失，并表明维生素D治疗可以逆转其抑制功能	对TFR细胞在外周病变组织中的作用理解仍然有限	调查鼻息肉中TFR细胞的存在、表型和功能	鼻息肉中的TFR细胞	免疫学	鼻息肉	单细胞RNA测序，免疫荧光染色，流式细胞术，ELISA	NA	细胞数据	从鼻息肉中分离的多种T细胞亚群
11617	2024-08-05	Gene-expression memory-based prediction of cell lineages from scRNA-seq datasets 2024-Mar-29, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-47158-y PMID:38553478	研究论文	该文章介绍了一种基于基因表达记忆的细胞谱系推断工具GEMLI，用于从scRNA-seq数据集中识别细胞谱系	GEMLI能够从缺乏谱系信息的scRNA-seq数据中可靠地识别小到中型细胞谱系，并重建多细胞结构	该方法在技术上复杂，通常受限于时间分辨率	研究细胞分化过程中的遗传信息传递	人类乳腺癌活检样本中的细胞谱系	数字病理学	乳腺癌	scRNA-seq	NA	转录组数据	人类乳腺癌活检样本
11618	2024-08-04	Research progress in isolation and identification of rumen probiotics 2024, Frontiers in cellular and infection microbiology IF:4.6Q1 DOI:10.3389/fcimb.2024.1411482 PMID:38836057	研究论文	本文综述了瘤胃益生菌的分离和鉴定的经典技术及其最新进展	介绍了基于微滴的高通量细胞培养和单细胞测序的新技术及其在微生物培养和鉴定中的应用	大部分潜在益生菌仍未被成功培养，限制了相关研究的深入	旨在提供技术参考以促进瘤胃微生物学领域的发展	主要针对瘤胃益生菌的分离和鉴定技术	数字病理学	NA	高通量培养、单细胞测序	NA	NA	NA
11619	2024-08-05	Revealing molecular and cellular heterogeneity in hypopharyngeal carcinogenesis through single-cell RNA and TCR/BCR sequencing 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1310376 PMID:38720887	研究论文	本文揭示了在低级和高级上皮内瘤变到癌变过程中，头颈部肿瘤HSCC的分子和细胞异质性	通过单细胞RNA和TCR/BCR测序，首次构建了不同疾病阶段的细胞动态转录组图谱，并揭示了主要分子	尚未完全理解在肿瘤形成过程中TME内不同细胞簇的具体变化及其影响	探究HSCC发展过程中的肿瘤微环境动态变化及机制	对来自不同阶段的HSCC组织样本中的60854个细胞进行研究	数字病理学	喉下癌	单细胞RNA测序和TCR/BCR测序	NA	细胞	九个组织样本
11620	2024-08-05	Unraveling metabolic characteristics and clinical implications in gastric cancer through single-cell resolution analysis 2024, Frontiers in molecular biosciences IF:3.9Q2 DOI:10.3389/fmolb.2024.1399679 PMID:38831933	研究论文	本研究通过单细胞分辨率分析揭示了胃癌的代谢特征及其临床意义	利用单细胞RNA测序技术，首次深入探讨了不同细胞类型在胃癌中的代谢路径和调控机制	研究的局限性未在摘要中提及	综合研究胃癌中不同细胞类型的代谢路径及其调控机制	胃癌肿瘤样本和正常样本中的各种细胞类型	数字病理学	胃癌	单细胞RNA测序	无监督聚类	RNA数据	NA