单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 11281 - 11300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11281 | 2024-08-04 |
Integrated analysis of multiple transcriptomic approaches and machine learning integration algorithms reveals high endothelial venules as a prognostic immune-related biomarker in bladder cancer
2024-Jul-30, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112184
PMID:38824904
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研究论文 | 该文章整合了多种转录组分析和机器学习算法，以高内皮静脉作为膀胱癌的预后免疫相关生物标志物 | 首次将高内皮静脉与膀胱癌治疗的免疫反应和预后关联起来，并提出 LDLRAD3 作为 HEV 诱导的重要靶点 | 尚未深入探讨 HEV 在其他类型癌症中的作用和机制 | 探索提高膀胱癌免疫治疗效率的新靶点 | 对膀胱癌患者的高内皮静脉进行分析 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 转录组分析，RNA测序 | 集成机器学习算法 | 转录组数据 | 涉及的样本数量和类型未明确具体说明 |
| 11282 | 2024-08-04 |
Multi-omic profiling reveals potential biomarkers of hepatocellular carcinoma prognosis and therapy response among mitochondria-associated cell death genes in the context of 3P medicine
2024-Jun, The EPMA journal
DOI:10.1007/s13167-024-00362-8
PMID:38841626
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研究论文 | 该研究揭示了与线粒体相关的细胞死亡基因在肝细胞癌预后和治疗反应中的潜在生物标志物 | 构建了一种新的线粒体细胞死亡指数（MCDI），集成了多种机器学习算法以预测肝细胞癌的预后 | 缺乏全面可靠的模型可能影响某些预测和个性化医学策略的效果 | 研究肝细胞癌的预后生物标志物和对免疫治疗及靶向治疗的反应 | 肝细胞癌（LIHC）患者的线粒体相关细胞死亡基因 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RT-qPCR, western blotting, 免疫组化染色 | 机器学习 | 基因组数据 | 在体外临床队列中进行了验证的患者样本 |
| 11283 | 2024-08-05 |
Single-cell landscape reveals the epithelial cell-centric pro-inflammatory immune microenvironment in dry eye development
2024-Jun, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2023.11.008
PMID:38007004
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研究论文 | 本研究揭示了干眼病发展中的以上皮细胞为中心的促炎免疫微环境 | 通过单细胞转录组测序，我们识别出在干眼病急性阶段出现的一种具有纤维母细胞特征的上皮亚型 | 本研究主要基于环境诱导的干眼小鼠模型，可能无法完全反映人类的情况 | 探讨干眼病的免疫学改变与发病机制 | 采用环境诱导的干眼小鼠的结膜组织进行单细胞转录组测序 | 数字病理学 | 干眼病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 使用了环境诱导的干眼小鼠的结膜组织 |
| 11284 | 2024-08-05 |
A multi-organ map of the human immune system across age, sex and ethnicity
2024-Apr-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.08.542671
PMID:38746418
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研究论文 | 本文创建了一个全面的健康人类免疫系统组成和转录的地图，涵盖不同年龄、性别和种族的免疫细胞分布和互动 | 创新点在于使用了新的多层建模方法来追踪免疫衰老并测试性别和种族的差异 | 尚未提及具体的局限性 | 研究目的在于填补关于人免疫系统在不同人群中分布和交互的知识空白 | 研究对象包括来自45个解剖部位的12,981个单细胞RNA测序样本和2900万细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 多层建模 | 细胞 | 12,981个单细胞RNA测序样本，来自45个不同的解剖部位 |
| 11285 | 2024-08-04 |
Characterization of Chemotaxis-Associated Gene Dysregulation in Myeloid Cell Populations in the Lungs during Lipopolysaccharide-Mediated Acute Lung Injury
2023-06-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200822
PMID:37163318
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研究论文 | 本研究探讨了在脂多糖介导的急性肺损伤中的化学趋向因子及其受体对骨髓细胞群体的调节作用 | 揭示了化学趋向因子配体与受体相互作用导致骨髓细胞异质性及细胞招募至肺部的机制 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全代表人类情况 | 研究脂多糖介导的急性肺损伤中化学趋向因子的作用 | C57BL/6J小鼠中的骨髓细胞群体 | 数字病理学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq | C57BL/6J小鼠，未具体说明样本数量 |
| 11286 | 2024-08-05 |
TWO-SIGMA: A novel two-component single cell model-based association method for single-cell RNA-seq data
2021-03, Genetic epidemiology
IF:1.7Q3
DOI:10.1002/gepi.22361
PMID:32989764
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研究论文 | 本文开发了TWO-SIGMA，一种基于单细胞模型的关联方法，用于单细胞RNA-seq数据的差异表达分析 | TWO-SIGMA是唯一一种能够同时具备多项灵活特性的scRNA-seq数据分析方法 | NA | 旨在改进单细胞RNA-seq数据的差异表达分析方法 | 单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | 混合效应回归模型 | 数据计数 | 使用胰腺胰岛单细胞的实证分析 |
| 11287 | 2024-08-05 |
Mapping cell diversity in human sporadic cerebral cavernous malformations
2024-Oct-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2024.148605
PMID:38788816
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研究论文 | 该研究探讨了人类散发性脑血管畸形中的细胞多样性 | 文章通过单细胞RNA测序和ATAC测序深入分析了散发性脑血管畸形的细胞类型及相关基因表达特征 | 未详细阐明散发性脑血管畸形的表型及病理特征的具体机制 | 旨在探讨散发性脑血管畸形的发病机制及其病理特征 | 主要研究散发性脑血管畸形患者及对照组的细胞组成和基因表达 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) 和 ATAC测序 | NA | 组织样本 | 与对照组相比的散发性脑血管畸形样本 |
| 11288 | 2024-08-05 |
Lipidomics and single-cell RNA sequencing reveal lipid and cell dynamics of porcine glycerol-injured skeletal muscle regeneration model
2024-Aug-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2024.122742
PMID:38797365
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研究论文 | 本文研究了猪的甘油损伤骨骼肌再生模型中的脂质和细胞动态 | 揭示了TGF-β/SMAD信号通路在脂肪生成和纤维化中的关键调控作用 | 研究主要集中在猪模型，可能无法完全转化为人类应用 | 探讨骨骼肌损伤和再生过程中脂质代谢和细胞动态的机制 | 使用甘油注射诱导的猪骨骼肌损伤模型进行研究 | 数字病理学 | NA | 脂质组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA | 使用甘油损伤模型的猪样本 |
| 11289 | 2024-08-04 |
Senolytic combination of dasatinib and quercetin attenuates renal damage in diabetic kidney disease
2024-Jul-25, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2024.155705
PMID:38761776
|
研究论文 | 研究表明，达沙替尼与槲皮素的结合可以减轻糖尿病肾病中的肾损伤 | 首次发现达沙替尼和槲皮素通过结合PPARα显著改善糖尿病肾病患者的肾功能和减轻肾损伤 | 机制研究仍存在不确定性，需进一步验证和探索 | 探讨达沙替尼与槲皮素组合对糖尿病肾病的作用及潜在机制 | 使用db/db糖尿病小鼠进行实验，分析其肾功能和纤维化变化 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 生物组织 | 使用了db/db糖尿病小鼠，具体样本数量未提供 |
| 11290 | 2024-08-05 |
A single-cell profile reveals the transcriptional regulation responded for Abelmoschus manihot (L.) treatment in diabetic kidney disease
2024-Jul-25, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2024.155642
PMID:38759315
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研究论文 | 本研究揭示了Abelmoschus manihot在糖尿病肾病治疗中的转录调控机制 | 本研究提供了A. manihot在糖尿病肾病治疗中关键受体和调控网络的新信息 | 研究未描述样本数量以及长时间效果 | 探索A. manihot在糖尿病肾病治疗中的分子机制 | 对C57BL/6和db/db小鼠中的单细胞RNA测序进行分析 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | C57BL/6和db/db小鼠 |
| 11291 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-sequencing reveals the transcriptional landscape of lacrimal gland in GVHD mouse model
2024-Jul, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2024.04.006
PMID:38703817
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了GVHD小鼠模型中泪腺细胞群体的转录组图谱 | 首次识别出Lrg1high上皮细胞，并呈现了GVHD中细胞成分和基因表达模式的显著变化 | 未提供样本的具体数量和其他生物标志物的详细解析 | 研究GVHD小鼠模型中泪腺的整体转录组特征 | GVHD小鼠模型中的泪腺细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 11292 | 2024-08-05 |
DLL1/NOTCH1 signaling pathway maintain angiogenesis in meniscus development and degeneration
2024-Jul, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2024.106589
PMID:38772475
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研究论文 | 本研究探讨了DLL1/NOTCH1信号通路在髌骨发育和退化过程中对血管生成的影响 | 首次揭示了DLL1/NOTCH1信号通路在胎儿和退化髌骨的血管生成中的重要性 | 本研究主要基于组织学分析，缺乏临床试验数据支持 | 研究髌骨组织内内皮细胞和血管的特征，以揭示血管完整性保持与退化的关系 | 人类胚胎和成熟髌骨组织 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 人类胚胎和成熟髌骨 |
| 11293 | 2024-08-05 |
scRNA-seq reveals the diversity of the developing cardiac cell lineage and molecular players in heart rhythm regulation
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110083
PMID:38872974
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研究论文 | 本文利用scRNA-seq delineate了斑马鱼心脏中细胞类型的多样性 | 首次描述了发育心脏中多种细胞谱系和心律调节的新分子参与者 | 未提及具体的样本大小与实验范围 | 揭示发育中心脏的细胞和分子机制 | 斑马鱼心脏中的50,000多个细胞 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 超过50,000个细胞 |
| 11294 | 2024-08-04 |
DCRELM: dual correlation reduction network-based extreme learning machine for single-cell RNA-seq data clustering
2024-06-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-64217-y
PMID:38866896
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研究论文 | 提出了一种基于双重相关降低网络的极限学习机DCRELM，用于单细胞RNA-seq数据的聚类 | DCRELM结合了极限学习机和双重相关降低网络的方法，增强了对高维、噪声和稀疏数据的处理能力 | 未提及具体的限制 | 研究单细胞RNA-seq数据的聚类方法 | 单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | NA | 极限学习机（ELM） | 自编码器 | RNA序列数据 | 未提及具体样本量 |
| 11295 | 2024-08-04 |
Progress of single-cell RNA sequencing combined with spatial transcriptomics in tumour microenvironment and treatment of pancreatic cancer
2024-Jun-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05307-3
PMID:38867230
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综述 | 本文探讨了单细胞RNA测序结合空间转录组学在肿瘤微环境和胰腺癌治疗中的进展 | 结合单细胞RNA测序和空间转录组学的方法为胰腺癌的肿瘤异质性研究提供了新的视角 | 单细胞RNA测序在空间信息分析上存在局限，无法独立处理细胞的物理位置 | 探讨单细胞RNA测序和空间转录组学在胰腺癌微环境及治疗中的应用 | 肿瘤微环境及胰腺癌的单细胞分析 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 11296 | 2024-08-05 |
Comprehensive transcriptomic analysis unveils macrophage-associated genes for establishing an abdominal aortic aneurysm diagnostic model and molecular therapeutic framework
2024-Jun-12, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-024-01900-w
PMID:38867262
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研究论文 | 该研究旨在识别与腹主动脉瘤（AAA）相关的新生物标志物和治疗靶点 | 研究首次揭示了六个巨噬细胞相关的中心基因，这些基因在AAA的诊断中具有良好的效果 | 缺乏大规模临床验证，仅在AAA小鼠模型和临床样本中进行了测试 | 通过转录组分析识别腹主动脉瘤的新生物标志物和治疗靶点 | 关注腹主动脉瘤患者及相应的巨噬细胞亚群体 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、加权基因共表达网络分析（WGCNA）、机器学习算法 | NA | 基因表达数据 | 六个巨噬细胞相关中心基因在临床样本和AAA小鼠模型中的验证 |
| 11297 | 2024-08-05 |
Macrophage and fibroblast trajectory inference and crosstalk analysis during myocardial infarction using integrated single-cell transcriptomic datasets
2024-Jun-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05353-x
PMID:38867219
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研究论文 | 本研究综合分析了心肌梗死后成纤维细胞和巨噬细胞亚群的动态的变化 | 发现了不同时间出现的两种ECM产生的成纤维细胞亚群及其不同的转录特征 | NA | 探究心肌梗死后成纤维细胞与巨噬细胞之间的相互作用 | 心肌梗死后不同类型的成纤维细胞和巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 心脏病 | scRNA-seq, snRNA-seq | NA | 基因数据 | 12个不同研究的数据集 |
| 11298 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome analysis reveals secretin as a hallmark of human enteroendocrine cell maturation
2024-06-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-63699-0
PMID:38866945
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了secretin作为人类肠内分泌细胞成熟的标志。 | 研究质疑了传统的'一个细胞-一个激素'的教条，表明人类肠内分泌细胞中存在多激素共表达的现象。 | 该研究可能只涉及人类和小鼠来源的肠内分泌细胞，可能未涵盖其他物种或细胞类型。 | 研究的目的在于重新审视肠内分泌细胞的分类以及激素表达的特征。 | 研究对象包括来自人类肠道的各种肠内分泌细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | NA |
| 11299 | 2024-08-05 |
Assessing transcriptomic heterogeneity of single-cell RNASeq data by bulk-level gene expression data
2024-Jun-12, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05825-3
PMID:38867193
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研究论文 | 本文提出了一种模型框架，整合了Bulk级别和单细胞RNA测序数据，以解决数据的不足之处。 | 提出了逆向去卷积的框架，同时采用了多种去卷积算法进行Bulk级别数据的分解。 | 研究中对于Bulk级别数据的混合系数未知，且对于零条目的入选标准需要进一步研究。 | 研究的目的是整合不同类型的转录组数据，以更全面地推断转录组异质性。 | 研究对象包括小鼠的单细胞RNASeq数据、自闭症谱系障碍和正常对照、大肠癌和低级别胶质瘤的数据。 | 数字病理学 | 乳腺癌、低级别胶质瘤、自闭症谱系障碍 | RNA测序 | 去卷积算法 | 基因表达数据 | 涉及五个数据集的验证 |
| 11300 | 2024-08-05 |
Linearly Amplified Single-Stranded RNA-Derived Transcriptome Sequencing (LAST-seq)
2024-Jun-05, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.4998
PMID:38873015
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研究论文 | 本文开发了一种新方法LAST-seq，可以直接扩增原始的单链RNA，以提高RNA检测的灵敏度 | LAST-seq无需逆转录和第二链合成，提供高灵敏度的RNA检测，并降低单细胞转录组分析中的技术噪声 | 本文没有提及LAST-seq在临床应用或更大样本规模中的表现 | 研究单细胞转录组分析中RNA的检测灵敏度和转录爆发动力学 | 人类细胞中的转录爆发动力学 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | 单细胞水平 |