单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
11241	2024-08-05	Deconstructing Olfactory Stem Cell Trajectories at Single-Cell Resolution 2017-06-01, Cell stem cell IF:19.8Q1 DOI:10.1016/j.stem.2017.04.003 PMID:28506465	研究论文	本研究详细描述了嗅觉干细胞在产生成熟后代时的轨迹	集成单细胞RNA测序和统计分析与体内谱系追踪，揭示了嗅觉上皮中的细胞命运潜力和分支点	NA	阐明细胞命运决策和组织稳态的机制	嗅觉上皮中的嗅觉干细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	NA	NA
11242	2024-08-04	Advances and applications of biomimetic biomaterials for endogenous skin regeneration 2024-Sep, Bioactive materials IF:18.0Q1 DOI:10.1016/j.bioactmat.2024.04.011 PMID:38883311	综述	文章概述了生物仿生材料在促进自体皮肤再生中的最新进展	提出了新型的生物仿生材料，具备精确的结构、化学成分和生物物理特性	当前应用的生物材料在结构和功能上过于简单，无法精确模拟复杂的组织结构	探讨生物仿生材料在自体皮肤再生中的应用及其进展	关注生物仿生材料如何促进自体皮肤的再生	数字病理学	NA	重编程、柔性电子皮肤、人工智能、单细胞测序和空间转录组	NA	NA	NA
11243	2024-08-04	The art of healing hearts: Mastering advanced RNA therapeutic techniques to shape the evolution of cardiovascular medicine in biomedical science 2024-Aug, Current problems in cardiology IF:3.0Q2 DOI:10.1016/j.cpcardiol.2024.102627 PMID:38723793	综述	本文深入分析了心血管疾病背景下RNA疗法的发展状态	强调了各种针对分子生物学基本法则不同阶段的RNA疗法方法	本文未提及具体实验数据或临床试验结果	探讨新的RNA治疗方法及其在心血管疾病中的应用	心血管疾病中的多种编码和非编码RNA候选者	生物医学	心血管疾病	下一代测序技术，单细胞测序技术	NA	RNA，基因组数据	NA
11244	2024-08-05	Non-canonical Wnt pathway expression in the developing mouse and human retina 2024-Jul, Experimental eye research IF:3.0Q1 DOI:10.1016/j.exer.2024.109947 PMID:38815793	研究论文	本研究分析了非经典Wnt通路在小鼠和人类视网膜发育中的表达情况	识别了在小鼠和人类视网膜发育中具有特定表达的新型配体、受体和介导基因	人类视网膜的发育和突触生成作用较少建立	探讨非经典Wnt信号通路在人类视网膜发育中的作用	小鼠和人类视网膜以及人类视网膜类器官	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA数据	分析了小鼠和人类视网膜及视网膜类器官的多个发展时间点的数据
11245	2024-08-04	Spatial transcriptomics in embryonic mouse diaphragm muscle reveals regional gradients and subdomains of developmental gene expression 2024-Jun-21, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2024.110018 PMID:38883818	研究论文	本文提供了小鼠胚胎横膈肌空间基因表达数据，揭示了肌肉区域的基因特征及其发育过程	首次报告了小鼠胚胎横膈肌的空间基因表达模式	目前缺乏对其他胚胎时期或不同肌肉类型的系统性研究	研究小鼠胚胎横膈肌的发育和神经肌肉连接形成中的基因表达模式	小鼠胚胎横膈肌，特别是在胚胎天数E14.5和E18.5的样本	数字病理学	NA	空间转录组学	NA	基因表达数据	横截面小鼠胚胎样本，具体样本大小未提供
11246	2024-08-05	Resident vascular Sca1+ progenitors differentiate into endothelial cells in vascular remodeling via miR-145-5p/ERG signaling pathway 2024-Jun-21, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2024.110080 PMID:38883819	研究论文	这篇文章研究了血管重塑中Sca1+前体细胞如何通过miR-145-5p/ERG信号通路分化为内皮细胞。	文章创新点在于揭示了Sca1细胞在血管重塑中的分化过程及其受miR-145-5p/ERG通路的负调控。	本研究的局限性在于未完全阐明Sca1细胞的所有潜在起源及机制。	研究的目的是探讨Sca1+前体细胞向内皮细胞分化的机制。	研究对象为小鼠模型中的Sca1+前体细胞及其在血管重塑过程中的作用。	心血管疾病	心血管疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA序列数据	小鼠模型中的Sca1+前体细胞
11247	2024-08-05	Decoding temporal heterogeneity in NSCLC through machine learning and prognostic model construction 2024-Jun-13, World journal of surgical oncology IF:2.5Q1 DOI:10.1186/s12957-024-03435-0 PMID:38872167	研究论文	本研究通过单细胞转录组分析，探讨了非小细胞肺癌（NSCLC）中的时间异质性及其预后模型的构建	首次结合cNMF和XGBoost进行NSCLC细胞功能模块分类及标记基因选择，并建立了基于基因的风险评分模型	研究范围可能受限于所选择的样本数量及其异质性，影响结果的普适性	识别与非小细胞肺癌进展相关的时间异质性生物标志物	93,406个来自22名非小细胞肺癌患者的单细胞转录组数据	数字病理学	肺癌	单细胞转录组分析，XGBoost，cNMF，LASSO回归	XGBoost	转录组数据	93,406个细胞，来自22名患者
11248	2024-08-05	IPF-related new macrophage subpopulations and diagnostic biomarker identification - combine machine learning with single-cell analysis 2024-Jun-13, Respiratory research IF:4.7Q1 DOI:10.1186/s12931-024-02845-8 PMID:38872139	研究论文	本研究分析了特发性肺纤维化(IPF)患者的单细胞转录组测序数据，识别了IPF相关的巨噬细胞亚群并探讨其分子特征和生物功能	首次识别了IPF特有的ATP5-MΦ巨噬细胞亚群及其特征基因，揭示了其与氧化磷酸化和质子跨膜转运的关联	对巨噬细胞的异质性和分子特征的理解仍然有限，临床相关性待进一步验证	探讨IPF患者巨噬细胞的分子特征及其在疾病预后中的价值	特发性肺纤维化患者的肺组织中的巨噬细胞	数字病理学	特发性肺纤维化	单细胞转录组测序(scRNA-seq)	机器学习	基因组数据	IPF患者肺组织中的单细胞样本
11249	2024-08-05	The Contribution of Meckel's Cartilage-Derived Type II Collagen-Positive Cells to the Jawbone Development and Repair 2024-Jun-05, The journal of histochemistry and cytochemistry : official journal of the Histochemistry Society DOI:10.1369/00221554241259059 PMID:38836522	研究论文	本研究探讨了麦克尔软骨来源的II型胶原阳性细胞在下颌骨发育和修复中的贡献	首次揭示了II型胶原阳性细胞在下颌骨形成和再生中的关键作用	研究主要依赖于小鼠模型，可能不完全适用于人类	阐明II型胶原阳性细胞在下颌骨发育和修复过程中的功能	分析小鼠在胚胎第10.5天的单细胞RNA测序数据	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA数据	小鼠样本
11250	2024-08-04	Oxytocin alleviates liver fibrosis via hepatic macrophages 2024-Jun, JHEP reports : innovation in hepatology IF:9.5Q1 DOI:10.1016/j.jhepr.2024.101032 PMID:38882603	研究论文	这项研究探讨了催产素通过肝巨噬细胞缓解肝纤维化的机制	首次揭示了催产素在肝脏中调节巨噬细胞表型的新路径	研究主要集中在小鼠模型，临床应用效果尚需验证	研究催产素在肝纤维化中的作用及其机制	使用小鼠模型来研究肝纤维化和巨噬细胞的表型变化	数字病理学	肝纤维化	单细胞测序	小鼠模型	细胞群体数据	使用若干肝纤维化小鼠模型
11251	2024-08-04	Development of Novel Models of Aggressive Variants of Castration-resistant Prostate Cancer 2024-Jun, European urology oncology IF:8.3Q1 DOI:10.1016/j.euo.2023.10.011 PMID:38433714	研究论文	本研究开发了代表侵袭性去势抵抗性前列腺癌新模型	提出了新的前临床模型，包括患者来源的异种移植（PDX）、PDX衍生的类器官（PDXO）和患者来源的类器官（PDO）	样本量有限，且主要集中于特定的前列腺癌亚型	开发新的预临床模型并为新药评估制定策略	51名转移性前列腺癌患者的肿瘤样本	数字病理学	前列腺癌	全外显子测序（WES）、RNA测序（RNA-seq）和单细胞RNA测序	PDX、PDXO、PDO	基因组数据和药物敏感性数据	51名患者，建立了20个前临床模型（5个NEPC、7个DDR、1个MSI-high PDX，16个PDXO和6个PDO）
11252	2024-08-04	Blocking OLFM4/galectin-3 axis in placental polymorphonuclear myeloid-derived suppressor cells triggers intestinal inflammation in newborns 2024-May-30, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.112058 PMID:38613883	研究论文	该研究报告了胎盘多核脉形骨髓来源抑制细胞与新生儿肠道炎症之间的密切关系	首次揭示了OLFM4/凝集素-3轴在胎盘多核脉形骨髓来源抑制细胞与新生儿肠道炎症之间的重要作用	该研究未能探讨ELF（外源性生长因子）对结果的潜在影响	研究胎盘多核脉形骨髓来源抑制细胞与新生儿肠道炎症的关联	主要研究胎盘多核脉形骨髓来源抑制细胞及其对子代的新生儿肠道炎症的影响	数字病理学	新生儿坏死性肠炎	单细胞转录组学	小鼠模型	基因表达数据	包括缺乏Olfm4的小鼠母体和健康小鼠的胎盘样本
11253	2024-08-05	IFI30 as a key regulator of PDL1 immunotherapy prognosis in breast cancer 2024-May-30, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.112093 PMID:38669947	研究论文	本研究探讨了IFI30在乳腺癌中的作用及其与PD-L1免疫治疗的预测关系	揭示了IFI30在乳腺癌组织中表达上调，并与肿瘤分期和预后显著相关，同时还发现其与免疫相关信号通路的显著关联	本研究的具体机制和IFI30与PD-L1轴之间的关系仍不清晰	研究IFI30在乳腺癌中的作用及其对PD-L1表达和T细胞浸润的影响	乳腺癌组织中的IFI30表达及其与PD-L1的关系	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序、免疫组化	NA	RNA，蛋白质	通过TCGA和GTEx数据库以及自制的乳腺癌组织微阵列进行分析
11254	2024-08-04	LoRA-TV: read depth profile-based clustering of tumor cells in single-cell sequencing 2024-May-23, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1 DOI:10.1093/bib/bbae277 PMID:38877886	研究论文	本研究提出了一种基于单细胞测序数据读深度特征的肿瘤细胞聚类新方法LoRA-TV	LoRA-TV利用低秩优化和鲁棒平滑方法聚合共享的基因组特征，以提高肿瘤细胞聚类性能	NA	研究如何通过单细胞测序揭示肿瘤细胞群体的异质性	肿瘤细胞	数字病理学	NA	单细胞测序	NA	模拟数据和实际数据	NA
11255	2024-08-07	scRNA-seq: oh, the joys 2024-May, Nature methods IF:36.1Q1 DOI:10.1038/s41592-024-02263-0 PMID:38654084	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
11256	2024-08-04	TGFβ-Responsive Stromal Activation Occurs Early in Serrated Colorectal Carcinogenesis 2024-Apr-24, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms25094626 PMID:38731846	研究论文	该研究揭示了TGFβ激活的基质在锯齿状结直肠癌发生中的作用	文章提出了TGFβ依赖的基质激活在锯齿状肿瘤发生早期的关系	未提及具体的实验验证或临床相关性	阐明TGFβ激活的基质在锯齿状癌发生中的贡献	研究对象为39个结直肠癌样本和12个大规模转录组样本，分析其基质细胞的转录特征	数字病理学	结直肠癌	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	39个结直肠癌样本和2014个其他样本
11257	2024-08-05	Changes in seminal plasma microecological dynamics and the mechanistic impact of core metabolite hexadecanamide in asthenozoospermia patients 2024-Apr, iMeta IF:23.7Q1 DOI:10.1002/imt2.166 PMID:38882497	研究论文	本研究探讨了在精液微生态动态变化中核心代谢物十六烷酰胺对弱精子症患者的影响	揭示了精液中六种微生物属与核心代谢物十六烷酰胺之间的显著关联，及其提高精子活力的潜力	尚未清楚微生态与男性不育的直接关系	研究精液微生态动态与弱精子症之间的关系	弱精子症患者，分为正常、轻度、中度和重度四组	数字病理学	男性不育症	16S rDNA测序和多组学分析	NA	精液样本	四组弱精子症患者，具体样本量未提及
11258	2024-08-04	Preliminary Analysis of Aging-Related Genes in Intracerebral Hemorrhage by Integration of Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Technology 2024, International journal of general medicine IF:2.1Q2 DOI:10.2147/IJGM.S457480 PMID:38883702	研究论文	本研究旨在识别与脑内出血相关的潜在老龄化相关基因。	识别了24个特定于脑内出血的老龄化相关基因，提供了老龄化影响脑内出血机制的新见解。	样本量较小，分析结果可能限制于特定数据集。	探索老龄化在脑内出血发病机制中的作用。	四例脑内出血患者的周围血肿组织样本。	数字病理学	脑内出血	RNA测序	NA	基因表达数据	4名脑内出血患者的样本
11259	2024-08-05	Expression and clinical significance of interleukin-6 pathway in cholangiocarcinoma 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1374967 PMID:38881895	研究论文	本研究探讨了IL-6通路在胆管癌中的表达及其临床意义	本研究首次揭示了IL-6通路在胆管癌肿瘤微环境中的表达特征及其与预后的相关性	未发现基因表达与总体生存率及无病生存率直接相关，但关系的进一步机制尚需探讨	研究IL-6通路在胆管癌中的潜在预后价值	胆管癌组织微阵列中的IL-6及相关分子的表达	数字病理学	胆管癌	多重免疫荧光	NA	组织样本	NA
11260	2024-08-05	Identification of an 11-miRNA-regulated and surface-protein genes signature predicts the prognosis of lung adenocarcinoma based on multi-omics study 2024, American journal of translational research IF:1.7Q4 DOI:10.62347/CWMT4815 PMID:38883394	研究论文	本研究开发了一种基于11个miRNA调控的表面蛋白基因的风险评分系统，以预测肺腺癌的预后	研究首次结合多组学分析，识别出与肺腺癌预后相关的特定miRNA及基因	研究结果可能受限于样本的选择和外部验证的准确性	改善肺腺癌患者的预后评估工具	聚焦于肺腺癌相关的miRNA和表面蛋白基因	数字病理学	肺癌	RNA测序	NA	RNA数据	使用了来自TCGA和GEO的数据进行验证