单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 11201 - 11220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11201 | 2024-08-05 |
Knocking down of Xkr8 enhances chemotherapy efficacy through modulating tumor immune microenvironment
2024-Jun, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2024.04.041
PMID:38685385
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研究论文 | 本研究评估了Xkr8敲除对增强化疗效果和调节肿瘤免疫微环境的影响 | 提出了Xkr8与化疗联合的全新策略，以增强抗肿瘤免疫反应并克服化学免疫耐药性 | 在临床相关的正位模型中进行的研究可能限制了结果的广泛适用性 | 探索Xkr8敲除对肿瘤免疫微环境的影响及其在化疗中的潜在应用 | 研究对象为肿瘤细胞和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | 在正位胰腺肿瘤模型中使用了具有临床相关性的样本 |
| 11202 | 2024-08-04 |
KLRB1 defines an activated phenotype of CD4+ T cells and shows significant upregulation in patients with primary Sjögren's syndrome
2024-May-30, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.112072
PMID:38636371
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研究论文 | 本研究探讨KLRB1在CD4+ T细胞中的作用及其在原发性干燥综合症中的重要性 | 发现KLRB1在CD4+ T细胞激活表型中的独特性并与临床疾病指标相关 | 样本量有限，仅包含37名健康对照和44名患者的数据 | 研究KLRB1在原发性干燥综合症中的作用 | 44名原发性干燥综合症患者和37名健康对照的外周血样本 | 数字病理学 | 原发性干燥综合症 | 单细胞RNA测序 | 流式细胞术 | 血液样本 | 共81个样本，包括44名患者和37名健康对照 |
| 11203 | 2024-08-04 |
Deciphering Abnormal Platelet Subpopulations in COVID-19, Sepsis and Systemic Lupus Erythematosus through Machine Learning and Single-Cell Transcriptomics
2024-May-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25115941
PMID:38892129
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研究论文 | 本研究旨在理解激活血小板的转录异质性及其对败血症、新冠肺炎和系统性红斑狼疮等疾病的影响 | 本研究通过单细胞转录组分析和机器学习方法，揭示了血小板亚群在疾病严重性中的差异，并标识出重要的血小板异质性生物标志物 | 本研究的局限性在于对激活血小板转录组异质性的了解仍然有限，未来需进一步验证发现的生物标志物 | 本研究旨在剖析激活血小板的复杂转录谱，以帮助开发针对异常和致病血小板亚型的靶向疗法 | 本研究分析了来自413例患者的47,977个血小板的单细胞转录谱 | 数字病理 | 新冠肺炎, 败血症, 系统性红斑狼疮 | 单细胞转录组, 深度神经网络 (DNN), 极端梯度提升 (XGB), UMAP | NA | 转录组 | 413个样本 |
| 11204 | 2024-08-04 |
Identification of Marker Genes in Infectious Diseases from ScRNA-seq Data Using Interpretable Machine Learning
2024-May-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25115920
PMID:38892107
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研究论文 | 本文提出了一种早期诊断系统，用于区分免疫失调综合征的严重程度 | 通过可解释的机器学习方法识别感染相关的关键基因，能够区分不同感染程度 | 本文未提及样本量及数据来源的具体限制 | 构建用于识别感染严重程度的早期诊断系统 | 重点研究不同免疫细胞和基因在感染中的表达变化 | 机器学习 | 感染性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 11205 | 2024-08-05 |
Sex-Based Mechanisms of Cardiac Development and Function: Applications for Induced-Pluripotent Stem Cell Derived-Cardiomyocytes
2024-May-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25115964
PMID:38892161
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研究论文 | 本文概述了性别在心脏发育和功能中的机制，并探讨了诱导多能干细胞衍生心肌细胞的应用 | 首次全面理解性别特异性心脏差异的机制 | 对性别差异的机制尚未完全阐明 | 研究性别在心脏生理和病理中的作用和机制 | 主要研究男性和女性的心脏发育及其功能的差异 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 诱导多能干细胞, 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 11206 | 2024-08-05 |
scZAG: Integrating ZINB-Based Autoencoder with Adaptive Data Augmentation Graph Contrastive Learning for scRNA-seq Clustering
2024-May-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25115976
PMID:38892162
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研究论文 | 本文提出了一种结合ZINB模型和自适应数据增强图对比学习的深度学习框架，用于单细胞RNA测序的聚类分析 | 创新地结合了ZINB模型去噪和自适应图对比学习，解决了单细胞RNA测序数据的高维稀疏性问题 | 可能未能充分涵盖所有潜在的高维拓扑结构 | 研究单细胞RNA测序数据的聚类分析方法 | 重点研究单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别和聚类 | 计算机视觉 | NA | ZINB模型，图对比学习 | APPNPGCN | 基因表达数据 | 10个常见的单细胞RNA测序数据集 |
| 11207 | 2024-08-04 |
Circadian Rhythm Disruption in Hepatocellular Carcinoma Investigated by Integrated Analysis of Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Data
2024-May-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25115748
PMID:38891936
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研究论文 | 本研究通过整合分析大规模和单细胞RNA测序数据，探讨了肝细胞癌中的生物钟节律失调 | 首次结合大规模RNA转录组分析和单细胞测序，确定与生物钟节律失调相关的基因的表达变化 | 具体的细胞和分子机制尚不清楚 | 研究生物钟节律失调在肝细胞癌发生中的作用及其相关基因 | 肝细胞癌患者的CRD相关基因表达 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 11208 | 2024-08-04 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis Reveals Metabolic Changes in Epithelial Glycosphingolipids and Establishes a Prognostic Risk Model for Pancreatic Cancer
2024-May-24, Diagnostics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/diagnostics14111094
PMID:38893622
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研究论文 | 该研究利用单细胞RNA测序分析揭示了胰腺癌中上皮糖鞘脂代谢的变化，并建立了预后风险模型 | 首次将上皮糖鞘脂代谢与胰腺癌的预后联系起来，建立了基于六基因的预后模型 | 该研究的样本量及其外部验证的数据库可能限制了结果的广泛适用性 | 探索胰腺癌中糖鞘脂代谢的变化及其与患者预后的关系 | 胰腺腺癌组织中的上皮细胞及其代谢特征 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞代谢数据 | 胰腺癌患者的单细胞测序数据，具体样本数量未提供 |
| 11209 | 2024-08-05 |
Unraveling Divergent Transcriptomic Profiles: A Comparative Single-Cell RNA Sequencing Study of Epithelium, Gingiva, and Periodontal Ligament Tissues
2024-May-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25115617
PMID:38891804
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序研究牙周组织的转录组特征 | 首次揭示了牙周组织的层次结构和环境因素对细胞组成的影响 | 样本量较小，仅涉及7个组织样本，可能限制了研究结果的普遍性 | 旨在识别牙周特异性标记以深入了解牙周病理生理 | 主要研究人类牙周韧带、牙龈和上皮组织的细胞组成和基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | 7个组织样本 |
| 11210 | 2024-08-05 |
New Insight into Intestinal Mast Cells Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2024-May-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25115594
PMID:38891782
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综述 | 本综述总结了单细胞转录组学研究如何为肠道肥大细胞的发育及其在健康和疾病中的功能角色提供了见解 | 使用单细胞RNA测序技术揭示的肠道肥大细胞的起源、分化及其表型和功能 | 关于肥大细胞生物学的若干方面尚待澄清 | 探讨肥大细胞的起源、分化及其在不同组织中的功能 | 肠道肥大细胞亚群及其在健康与疾病中的作用 | 数字病理学 | 肿瘤进展 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 11211 | 2024-08-04 |
Identification of apoptosis-immune-related gene signature and construction of diagnostic model for sepsis based on single-cell sequencing and bulk transcriptome analysis
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1389630
PMID:38894720
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研究论文 | 本文探讨了与凋亡免疫相关的基因特征及其在脓毒症诊断模型中的应用 | 本文首次识别了11个凋亡相关基因作为脓毒症的特征诊断标志，并构建了相应的预后模型 | 本研究主要依赖于基因表达数据和小鼠模型，可能限制了在临床应用中的直接转化 | 研究目的在于识别与脓毒症相关的凋亡基因并建立诊断模型 | 研究对象为脓毒症基因表达数据及相应的动物模型 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞测序和大规模转录组分析 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 多项外部数据集和小鼠模型的分析 |
| 11212 | 2024-08-04 |
SinglePointRNA, an user-friendly application implementing single cell RNA-seq analysis software
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0300567
PMID:38889133
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研究论文 | 该文章介绍了SinglePointRNA，这是一个用户友好的单细胞RNA测序分析应用程序 | SinglePointRNA提供了一个图形界面，简化了单细胞RNA-seq数据的分析过程，降低了对用户数学和编程技能的要求 | 该应用程序对复杂分析的先前知识仍然有一定要求，可能不适合所有用户 | 开发一个可访问的工具集，帮助研究者自主进行单细胞RNA-seq数据的详细分析 | 单细胞RNA-seq数据的分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 数据集 | NA |
| 11213 | 2024-08-05 |
Autoimmune uveitis attenuated in diabetic mice through imbalance of Th1/Th17 differentiation via suppression of AP-1 signaling pathway in Th cells
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1347018
PMID:38887289
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研究论文 | 本研究探讨了糖尿病对实验性自身免疫性葡萄膜炎的影响 | 首次揭示了糖尿病小鼠中Th1细胞分化的选择性抑制与AP-1信号通路下调的关系 | 仅使用小鼠模型，可能无法完全反映人类的病理机制 | 研究糖尿病对器官特异性自身免疫疾病的影响 | 使用C57BL/6和Ins2Akita小鼠模型研究炎症和免疫反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | C57BL/6和Akita小鼠模型 |
| 11214 | 2024-08-05 |
Establishment of a prognostic model for hypoxia-associated genes in OPSCC and revelation of intercellular crosstalk
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1371365
PMID:38887298
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研究论文 | 该文章建立了一个与缺氧相关的预后模型，并揭示了细胞间的相互作用 | 提出了将缺氧亚型与免疫微环境和临床特征相结合的新方法 | 样本量和数据来源可能限制了模型的广泛适用性 | 探讨缺氧对口咽鳞状细胞癌（OPSCC）预后的影响 | OPSCC患者的缺氧相关基因 | 数字病理学 | 口咽癌 | scRNA-seq, WGCNA, CIBERSORT | Cox模型, LASSO | 基因组数据 | 来源于GEO的OPSCC整体测序数据 |
| 11215 | 2024-08-05 |
Integrating scRNA-seq and bulk RNA-seq to explore the differentiation mechanism of human nail stem cells mediated by onychofibroblasts
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1416780
PMID:38887517
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研究论文 | 该研究探讨了人类指甲干细胞（NSC）由指甲成纤维细胞（OF）介导的分化机制 | 首次揭示了指甲成纤维细胞在调节指甲干细胞分化中的作用，并确定了BMP4信号通路的关键角色 | 对指甲成纤维细胞细胞特性和转录组学特征的理解仍有限 | 研究人类指甲成纤维细胞的特性及其在指甲干细胞分化中的作用 | 人类指甲成纤维细胞和干细胞 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq和bulk RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 三种来自人类指甲单位的指甲成纤维细胞样本和对照成纤维细胞 |
| 11216 | 2024-08-05 |
Evaluation of nanoscale versus hybrid micro/nano surface topographies for endosseous implants
2024-01-01, Acta biomaterialia
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.actbio.2023.10.030
PMID:37918471
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研究论文 | 我们研究了纳米级钛表面形态对粘附性间充质干细胞和骨髓来源巨噬细胞功能的影响 | 首次利用单细胞RNA测序识别植入表面的早期细胞群体，揭示了纳米级表面对骨形成过程的特异性影响 | 未明确提到样本的来源和数量，可能影响结果的广泛应用 | 研究纳米级表面形态对骨整合过程中细胞和组织水平的影响 | 粘附性间充质干细胞和骨髓来源巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞培养实验和体内实验数据 | NA |
| 11217 | 2024-08-05 |
ScnML models single-cell transcriptome to predict spinal cord neuronal cell status
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1413484
PMID:38894722
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研究论文 | 本研究开发了一种机器学习预测模型ScnML，用于预测脊髓神经细胞的亚群体和标记基因。 | ScnML模型通过XGBoost算法在预测中实现了高度准确性，并发现了新的重要基因，提升了脊髓神经细胞状态预测的潜力。 | 现有实验技术识别脊髓神经细胞发展过程依然存在劳动密集和成本高的问题。 | 准确识别脊髓神经细胞的细胞状态，以促进新治疗和康复策略的发展。 | 脊髓神经细胞的亚群体及标记基因。 | 机器学习 | NA | XGBoost | NA | 转录组数据 | 训练数据集的准确率为94.33%，测试数据集的准确率为94.08%至94.26%不等 |
| 11218 | 2024-08-04 |
Immune mechanisms shape the clonal landscape during early progression of prostate cancer
2023-06-19, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.04.010
PMID:37148881
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研究论文 | 本文探讨了免疫微环境在前列腺癌早期进展中调节肿瘤克隆景观的作用 | 研究展示了肿瘤中的多克隆景观与微环境的关系，并揭示了免疫编辑在克隆生存中的重要性 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类前列腺癌的复杂性 | 探讨免疫微环境如何影响肿瘤内异质性和克隆景观 | 主要研究了前列腺癌小鼠模型中的肿瘤微环境和克隆动态 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组学，基因工程小鼠模型 | NA | NA | 使用了基因工程小鼠模型进行研究 |
| 11219 | 2024-08-05 |
Targeting BMP2 for therapeutic strategies against hepatocellular carcinoma
2024-Aug, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.101970
PMID:38797016
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研究论文 | 本研究探讨了BMP2在肝细胞癌（HCC）生长和转移中的作用 | 文章创新性地结合了单细胞RNA测序和整体RNA测序来分析BMP2在HCC中的关键作用 | NA | 研究BMP2在肝细胞癌进展中的作用，评估其作为治疗靶点的潜力 | 肝细胞癌细胞系Huh-7及其相关的HCC模型 | 数字病理学 | 肝癌 | scRNA-seq和RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 11220 | 2024-08-04 |
Leveraging single-cell sequencing to classify and characterize tumor subgroups in bulk RNA-sequencing data
2024-Jul, Journal of neuro-oncology
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s11060-024-04710-6
PMID:38811523
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研究论文 | 本研究提出了一种名为CLIPPR的算法，用于从大规模转录组数据中分类和特征化肿瘤亚组 | 通过结合单细胞模型、RNA推断的拷贝数变异信号和初始大规模模型，CLIPPR算法展示了其在肿瘤分类方面的优势 | 虽然CLIPPR算法在整体准确性方面表现优越，但在某些情况下仍可能面临分类准确性有限的问题 | 提升癌症亚组的分类准确性，以便实现个性化治疗 | 研究针对脑膜瘤的分类，并包括多达789个样本的肿瘤数据 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | RNA测序 | CLIPPR元模型 | 转录组数据 | 77个样本和约10,000个单细胞，以及789个肿瘤样本和711个TCGA胶质瘤样本 |