单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
10541 2024-08-05
Self-renewing resident cardiac macrophages limit adverse remodeling following myocardial infarction
2019-01, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 本研究表明,常驻心脏巨噬细胞在心肌梗死后的不良重塑中起到重要作用 通过命运追踪、联合动物实验和单细胞转录组学展示心脏巨噬细胞自我更新与血单核细胞输入的关系 本研究未探讨其他类型巨噬细胞在心脏修复中的潜在角色 探讨心脏巨噬细胞在心肌梗死后的功能分化及其自我更新能力 研究对象为心脏的常驻巨噬细胞及其与血单核细胞的相互作用 数字病理学 心血管疾病 单细胞转录组学 Cx3cr1基础系统 细胞 NA
10542 2024-08-05
Paired-cell sequencing enables spatial gene expression mapping of liver endothelial cells
2018-11, Nature biotechnology IF:33.1Q1
研究论文 本研究通过配对细胞测序技术实现肝脏内皮细胞的空间基因表达映射 首创性地结合配对细胞测序与空间基因表达映射,适用于低mRNA含量细胞的区域性分析 主要集中于肝脏内皮细胞,其他非实质性细胞的应用尚待验证 研究肝脏内皮细胞的空间基因表达模式 重点研究小鼠肝细胞与肝脏内皮细胞的配对 数字病理学 NA 配对细胞测序 NA 单细胞RNA测序 小鼠的肝细胞和肝脏内皮细胞对
10543 2024-08-05
Proliferation Drives Aging-Related Functional Decline in a Subpopulation of the Hematopoietic Stem Cell Compartment
2017-05-23, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本文探讨了造血干细胞功能衰退的分子基础,特别是与衰老相关的细胞增殖机制 发现了一群携带p53标志的衰老造血干细胞亚群,揭示了JAK2V617F驱动的增殖与p53介导的功能衰退之间的关系 研究主要集中在老鼠模型上,可能无法完全反映人类的衰老过程 探索造血干细胞老化的分子机制 老化的造血干细胞亚群 数字病理学 与衰老相关的疾病 单细胞转录组技术 NA 基因表达数据 使用了一组衰老小鼠的造血干细胞
10544 2024-08-05
Identification of Regulatory RNA-Binding Proteins Associated with Immune Infiltration in Laryngeal Squamous Cell Carcinoma
2024-Aug-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 本文分析了与喉鳞状细胞癌免疫浸润相关的替代剪接事件和调节RNA结合蛋白 介绍了新的剪接位点使用变异分析软件和科学反卷积算法,以识别重要的免疫细胞和调节RNA结合蛋白 只使用了从公共数据库下载的数据,可能未涵盖所有相关生物样本 识别与人类喉鳞状细胞癌免疫浸润相关的调节RNA结合蛋白 研究对象包括20个喉癌及其旁癌组织样本 数字病理学 喉癌 RNA测序 NA 转录组数据 20个喉癌及旁癌组织样本和117个人喉癌样本
10545 2024-08-05
Dysregulated energy and protein homeostasis and the loss of GABAergic amacrine cells in aging retina
2024-Aug, Experimental eye research IF:3.0Q1
研究论文 本研究阐明了C57BL/6小鼠在衰老过程中的主要视网膜神经元的转录组变化 首次使用单细胞RNA测序技术分析了不同类型视网膜细胞在衰老过程中的独特变化 研究主要集中于C57BL/6小鼠,结果可能不适用于其他品系或物种 探讨衰老过程中视网膜细胞转录组的变化,以理解与衰老相关的视网膜退化机制 1.5-2个月和24-30个月大的C57BL/6小鼠的视网膜细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 两组年龄小鼠(1.5-2个月与24-30个月)
10546 2024-08-04
Paris saponin VII inhibits triple-negative breast cancer by targeting the MEK/ERK/STMN1 signaling axis
2024-Jul-25, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1
研究论文 本研究探讨了Paris saponin VII对三阴性乳腺癌的治疗效果及其潜在机制 首次表明STMN1磷酸化的抑制可能是PSⅦ抗癌作用的机制 尚未进行临床试验验证 阐明PSⅦ对三阴性乳腺癌的治疗作用 研究对象为三阴性乳腺癌细胞及相关基因表达 数字病理学 乳腺癌 分子对接、分子动力学、西方印迹 NA 单细胞测序数据 4T1异种移植模型
10547 2024-08-04
Early human fetal lung atlas reveals the temporal dynamics of epithelial cell plasticity
2024-Jul-13, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 该研究提供了发育中的人类肺脏的单细胞图谱 该研究通过对超过150,000个单细胞进行测序,揭示了人类胎肺的细胞谱系发展动态 该研究可能未涵盖所有潜在的细胞类型和发育阶段 研究人类胎肺的发展及其在发育缺陷和疾病状态下的功能变化 分析19个健康人类假腺性胎肺组织中的细胞发育轨迹 数字病理学 肺癌 单细胞测序和空间转录组学 NA 单细胞数据 19个健康人类胎肺组织样本
10548 2024-08-04
Unraveling the molecular architecture of autoimmune thyroid diseases at spatial resolution
2024-Jul-13, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究利用空间转录组技术探讨自身免疫性甲状腺疾病的分子结构及细胞异质性 首次识别出不同类型的细胞亚群及其在甲状腺中的分布,揭示了与甲状腺疾病相关的特定细胞损伤和纤维母细胞亚群 该研究的样本量和选取标准未明确说明,可能影响结果的普适性 研究自身免疫性甲状腺疾病的分子机制和细胞间相互作用 研究对象为自身免疫性甲状腺疾病患者的甲状腺组织样本 数字病理学 自身免疫性甲状腺疾病 空间转录组技术 NA 甲状腺组织样本 NA
10549 2024-08-05
Differential regulation by CD47 and thrombospondin-1 of extramedullary erythropoiesis in mouse spleen
2024-Jul-09, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究探讨了CD47和血小板蛋白-1在小鼠脾脏外髓造血中的差异调节作用 揭示了CD47在限制外髓造血方面的作用以及血小板蛋白-1对成人小鼠脾脏外髓造血的基线作用 该研究主要基于小鼠模型,是否适用于其他物种尚需进一步验证 研究CD47和血小板蛋白-1在小鼠脾脏外髓造血中的调节机制 小鼠脾脏细胞,特别是缺乏CD47和血小板蛋白-1的小鼠 数字病理学 NA 单细胞转录组和流式细胞术分析 NA 细胞 涉及小鼠脾脏细胞的实验
10550 2024-08-05
Altered tumor microenvironment heterogeneity of penile cancer during progression from non-lymphatic to lymphatic metastasis
2024-Jul, Cancer medicine IF:2.9Q2
研究论文 本研究首次探讨了阴茎癌在从非淋巴转移到淋巴转移过程中肿瘤微环境异质性的变化 研究揭示了阴茎癌微环境中上皮细胞、成纤维细胞和内皮细胞之间的相互作用以及肿瘤进展和淋巴结转移中功能合作的重要性 研究样本量较小,仅涉及六名进行单细胞RNA测序的患者和七名进行整体RNA测序的患者 研究阴茎癌的肿瘤微环境如何随着从非淋巴转移到淋巴转移的进展而变化 六名阴茎癌患者的细胞,分别为四名淋巴转移患者(IV期)和两名非淋巴转移患者(I期) 数字病理学 阴茎癌 单细胞RNA测序和整体RNA测序 NA 细胞 六名患者的46,861个细胞和七名患者的RNA样本
10551 2024-08-05
Single-cell transcriptome profiling highlights the importance of telocyte, kallikrein genes, and alternative splicing in mouse testes aging
2024-06-26, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 该研究通过单细胞转录组分析揭示了小鼠睾丸衰老过程中包头细胞和卡利克林基因的重要性 首次探讨了睾丸包头细胞和卡利克林基因在小鼠睾丸衰老中的作用,及其细胞类型特异性的可变剪接动态 本研究仅基于小鼠模型,未来需要在其他物种中验证结果 深入理解睾丸衰老过程中的转录组变化 年轻和老年小鼠的睾丸单细胞 数字病理 NA 转录组测序 NA 基因表达数据 43323个睾丸单细胞
10552 2024-08-05
Single-cell transcriptional analysis of irradiated skin reveals changes in fibroblast subpopulations and variability in caveolin expression
2024-Jun-26, Radiation oncology (London, England)
研究论文 本研究通过单细胞转录分析揭示了辐射皮肤中成纤维细胞亚群的变化及洞穴蛋白表达的变异性 本研究介绍了洞穴蛋白参与的一个新途径,可能对辐射损伤后的纤维化发展有贡献 当前研究的样本量有限,仅包含六名患者的皮肤样本 研究辐射损伤后皮肤纤维化的细胞机制 对六名接受乳腺重建手术的女性患者的辐射和非辐射皮肤样本进行分析 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 组织样本 6名女性患者的皮肤样本
10553 2024-08-05
Cbl and Cbl-b ubiquitin ligases are essential for intestinal epithelial stem cell maintenance
2024-Jun-21, iScience IF:4.6Q1
研究论文 这篇文章展示了Cbl和Cbl-b泛素连接酶对肠上皮干细胞维持的重要性 揭示了Cbl家族泛素连接酶在调节肠上皮干细胞和分化之间平衡的作用 本研究主要集中在小鼠模型上,缺乏对人类肠上皮干细胞的验证 探讨Cbl和Cbl-b在肠上皮干细胞维持中的功能 Lgr5+肠干细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序、LacZ谱系追踪 NA RNA数据 NA
10554 2024-08-05
SorLA restricts TNFα release from microglia to shape a glioma-supportive brain microenvironment
2024-May, EMBO reports IF:6.5Q1
研究论文 本文探讨了SorLA在胶质瘤相关小胶质细胞和巨噬细胞功能特性中的影响 揭示了SorLA在调节小胶质细胞释放TNFα中的作用,其对胶质瘤微环境及肿瘤进展有重要影响 本研究主要依赖于已发布的scRNA-seq数据和体外模型,可能限制了在临床背景下的直接适用性 研究SorLA如何影响胶质瘤微环境中的小胶质细胞功能 胶质瘤相关小胶质细胞和巨噬细胞(GAMs) 数字病理学 胶质瘤 scRNA-seq 小鼠模型 基因表达数据 NA
10555 2024-08-05
ZEB1 controls a lineage-specific transcriptional program essential for melanoma cell state transitions
2024-May, Oncogene IF:6.9Q1
研究论文 本研究解码了ZEB1转录因子在黑色素瘤细胞状态转变中的关键作用 识别并验证了关键谱系特异基因的ZEB1结合峰,阐明了其在黑色素瘤细胞身份中的重要性 未提及具体实验的局限性 探讨ZEB1在黑色素瘤细胞内肿瘤异质性中的转录调控机制 黑色素瘤细胞模型 数字病理学 黑色素瘤 ChIP-sequencing和RNA-sequencing NA 单细胞空间多重分析及scRNA-Seq分析 人类黑色素瘤样本
10556 2024-08-04
Glutamine metabolism prognostic index predicts tumour microenvironment characteristics and therapeutic efficacy in ovarian cancer
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 本文探讨了谷氨酰胺代谢在卵巢癌肿瘤微环境特征和治疗效果中的预测作用 构建了谷氨酰胺代谢预测指数(GMPI),作为卵巢癌的独立预测因子 尚未全面阐明谷氨酰胺代谢在肿瘤微环境中的总体角色 研究谷氨酰胺代谢在卵巢癌中的作用及其预测患者预后的能力 患者的卵巢癌及其在肿瘤微环境中的特征 数字病理学 卵巢癌 单细胞测序 NA 组织样本 NA
10557 2024-08-05
Combining bulk and scRNA-seq to explore the molecular mechanisms governing the distinct efferocytosis activities of a macrophage subpopulation in PDAC
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 本研究探讨了在胰腺导管腺癌(PDAC)中不同巨噬细胞亚群的吞噬活性所涉及的分子机制。 首次结合大样本和单细胞RNA测序数据,揭示了PDAC中巨噬细胞亚型在吞噬过程中的活性差异及其转录因子的作用。 样本量虽大,但只来自于基因表达公共数据库,缺乏临床数据的交叉验证。 分析巨噬细胞亚群在PDAC中的作用,以提高PDAC患者的预后。 涉及22,124个细胞的PDAC组织样本,分析其在吞噬过程中的活性及转录因子。 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序 NA 细胞类型数据 8个PDAC组织样本,分析了22,124个细胞
10558 2024-08-05
Exploring the current landscape of single-cell RNA sequencing applications in gastric cancer research
2024-04, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
综述 本文探讨了单细胞RNA测序在胃癌研究中的应用现状 研究单细胞RNA测序在揭示肿瘤异质性及识别潜在治疗靶点方面的重要性 肿瘤异质性和技术限制仍然是该领域面临的主要障碍 探讨单细胞RNA测序对胃癌研究的意义及其优缺点 胃癌的细胞群体、稀有细胞及动态转录变化 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序 NA NA NA
10559 2024-08-04
STRN3 promotes tumour growth in hepatocellular carcinoma by inhibiting the hippo pathway
2024-03, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 本研究发现STRN3通过抑制Hippo通路促进肝细胞癌的肿瘤生长 首次揭示了STRN3通过抑制Hippo通路来促进肝细胞癌肿瘤生长的机制 本研究主要基于TCGA和GEO数据库的数据,可能存在数据来源的限制 旨在探究STRN3在肝细胞癌中的功能及其对肿瘤生长的影响 对371名肝癌患者及其肿瘤和正常组织进行了临床相关性分析 数字病理学 肝癌 qRT-PCR, western blotting, CCK8实验, 转移实验, 流式细胞术, 单细胞测序, 免疫组化 NA 细胞组织样本和临床数据 371名肝癌患者及其组织样本
10560 2024-08-04
Single-cell transcriptomic analysis in clear cell renal cell carcinoma: Deciphering the role of APP within the tumour microenvironment
2024-03, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 本研究探讨了淀粉样前体蛋白(APP)在透明细胞肾细胞癌(ccRCC)肿瘤微环境中的角色 首次运用单细胞转录组分析揭示了APP在ccRCC的肿瘤相关巨噬细胞中的表达及其与临床结果的相关性 需要进一步研究来验证这些发现并探讨APP的调控机制及治疗意义 了解淀粉样前体蛋白(APP)在ccRCC肿瘤微环境中的潜在预后生物标志物作用 聚焦于肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)中APP的表达及其与ccRCC患者预后的关系 数字病理学 肾癌 单细胞转录组分析 NA 基因表达谱 NA
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