单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 10481 - 10500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10481 | 2024-08-05 |
Farnesyltransferase inhibition overcomes oncogene-addicted non-small cell lung cancer adaptive resistance to targeted therapies
2024-Jun-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49360-4
PMID:38937474
|
研究论文 | 本研究探讨了磷酸酰基转移酶抑制剂在克服非小细胞肺癌适应性抗药性方面的作用 | 该研究揭示了药物适应的共同路径和早期抗药性细胞的特征，并确定了FTI作为有效的治疗组合 | 研究中对分子事件的动力学和序列了解仍然不足 | 研究如何克服非小细胞肺癌对靶向疗法产生的适应性抗药性 | 包括EGFR、ALK、BRAF和KRAS突变的非小细胞肺癌细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、实时细胞周期动态监测 | NA | 细胞 | 广泛的肿瘤细胞系，包括多种突变类型 |
| 10482 | 2024-08-04 |
The Absence of Intra-Tumoral Tertiary Lymphoid Structures is Associated with a Worse Prognosis and mTOR Signaling Activation in Hepatocellular Carcinoma with Liver Transplantation: A Multicenter Retrospective Study
2024-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202309348
PMID:38498682
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研究论文 | 本研究探讨了肝细胞癌（HCC）患者中肿瘤内三级淋巴结构的缺失如何与更差的预后及mTOR信号通路激活相关 | 首次探讨了通过放射学非侵入性预测肝脏移植后的肝细胞癌中的肿瘤内三级淋巴结构的可能性，并建立了相应的分类器 | 该研究的局限性在于为回顾性研究，可能存在选择偏倚和数据的局限性 | 研究肝细胞癌中肿瘤内三级淋巴结构的存在对预后的影响 | 肝细胞癌患者，尤其是接受肝脏移植的患者 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序 | 分类器 | 肿瘤组织样本 | 最大 cohort，包括多名肝细胞癌患者 |
| 10483 | 2024-08-05 |
miR-124-3p and miR-194-5p regulation of the PI3K/AKT pathway via ROR2 in medulloblastoma progression
2024-Jun, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-024-00762-y
PMID:38632356
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研究论文 | 该文章探讨了miR-124-3p和miR-194-5p通过ROR2调控PI3K/AKT通路在髓母细胞瘤进展中的作用 | 揭示了miR-124-3p和miR-194-5p作为肿瘤抑制因子的作用及其在髓母细胞瘤中的潜在治疗靶点 | 对miRNAs在髓母细胞瘤肿瘤发生中的具体作用尚不明确 | 研究miR-124-3p和miR-194-5p在髓母细胞瘤进展中的调控机制 | 关注miR-124-3p、miR-194-5p及ROR2在髓母细胞瘤组织和细胞系中的表现 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、qRT-PCR、免疫荧光、Western blot | NA | 生物组织样本 | NA |
| 10484 | 2024-08-05 |
Integrating Multi-omics Data for Alzheimer's Disease to Explore Its Biomarkers Via the Hypergraph-Regularized Joint Deep Semi-Non-Negative Matrix Factorization Algorithm
2024-Apr-15, Journal of molecular neuroscience : MN
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12031-024-02211-9
PMID:38619646
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研究论文 | 本文提出了一种超图正则化联合深度半非负矩阵分解算法，以集成与阿尔茨海默病相关的多组学数据 | 本文的创新点在于提出了一种新算法HR-JDSNMF，通过高阶关联挖掘和多层次数据分解来整合多组学数据 | 尽管该方法优于多种其他算法，但可能仍存在在更大规模的真实世界数据上验证结果的限制 | 本研究旨在探讨阿尔茨海默病的多组学生物标志物 | 研究对象包括与阿尔茨海默病相关的基因组学、转录组学和影像数据 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 正电子发射断层扫描（PET）、单核苷酸多态性（SNP）、基因表达 | 深度半非负矩阵分解（JDSNMF） | 基因组数据、转录组数据、影像数据 | 实验数据通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）收集，但具体样本大小未提及 |
| 10485 | 2024-08-04 |
Techniques for Rapidly Sampling Six Crucial Organs in Adult Xenopus
2024-Feb-16, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66489
PMID:38436453
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研究论文 | 本文介绍了一种快速采样成年非洲爪蟾六个重要器官的技术 | 提出了针对成年非洲爪蟾的器官识别和解剖的标准化方法，支持现代定量蛋白组学和单细胞转录组学的需求 | 未明确提到样本保存方法对实验结果的具体影响 | 标准化成年非洲爪蟾的组织采样，促进多实验室的研究 | 成年非洲爪蟾的心室、肝脏、脂肪组织、胰腺、双肾和皮肤 | 数字病理学 | NA | 定量蛋白组学、单细胞转录组学、原位杂交、免疫组化、组织学等 | NA | 组织样本 | NA |
| 10486 | 2024-08-04 |
Isolation and Phenotypic Characterization of Tumor-Infiltrating NK Cells in Skin Carcinoma
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2023_512
PMID:38329617
|
研究论文 | 本研究探讨了皮肤癌中肿瘤浸润性自然杀伤(NK)细胞的分离和表型特征。 | 本研究创新性地展示了肿瘤浸润性和循环NK细胞在转录程序中的显著差异，强调了它们在肿瘤微环境中的特异功能。 | 本研究未提及样本量和方法的具体局限性。 | 本项目旨在建立一种全面的技术，以隔离和深入表征皮肤癌中肿瘤浸润性NK细胞。 | 研究对象为来自人类黑色素瘤转移的NK细胞。 | 数字病理 | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 10487 | 2024-08-04 |
Identification of macrophage-related genes in bladder cancer patients using single-cell sequencing and construction of a prognostic model
2024, American journal of clinical and experimental immunology
IF:1.4Q4
DOI:10.62347/VLDZ7581
PMID:39022795
|
研究论文 | 本研究评估了膀胱癌患者肿瘤微环境中巨噬细胞相关基因的表达并构建了预后模型 | 使用单细胞测序技术识别并分析膀胱癌患者中的巨噬细胞相关基因。 | NA | 评估膀胱癌患者肿瘤微环境中巨噬细胞相关基因的表达并构建预后模型 | 膀胱癌患者的肿瘤微环境中的巨噬细胞相关基因 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 10488 | 2024-08-04 |
Startle: A star homoplasy approach for CRISPR-Cas9 lineage tracing
2023-12-20, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2023.11.005
PMID:38128483
|
研究论文 | 提出了一种新颖的星形同义性进化模型，用于CRISPR-Cas9细胞系追踪 | 开发了专门的星形同义性模型以描述CRISPR-Cas9诱导突变的进化特点 | 未提及具体的应用限制 | 旨在改进CRISPR-Cas9诱导突变的细胞谱系追踪方法 | 研究CRISPR-Cas9诱导突变的细胞系谱系 | 数字病理学 | 肺腺癌 | CRISPR-Cas9 | 星形同义性模型 | 模拟细胞谱系追踪数据，鼠类转移性肺腺癌数据 | NA |
| 10489 | 2024-08-05 |
Adenomyosis: single-cell transcriptomic analysis reveals a paracrine mesenchymal-epithelial interaction involving the WNT/SFRP pathway
2023-05, Fertility and sterility
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.fertnstert.2023.01.041
PMID:36736810
|
研究论文 | 该研究通过单细胞转录组分析评估了腺肌症的细胞和分子景观 | 揭示了腺肌症中与WNT/SFRP通路相关的间充质-上皮相互作用的独特特征 | 样本量较小，仅包括3名患者 | 评估腺肌症的细胞和分子特点 | 分析来自腺肌症、内膜和肌层的匹配组织的单细胞RNA表达 | 数字病理学 | 腺肌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 3名患者的匹配组织样本 |
| 10490 | 2024-08-05 |
Femtosecond laser microdissection for isolation of regenerating C. elegans neurons for single-cell RNA sequencing
2023-04, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-01804-3
PMID:36928074
|
研究论文 | 本文介绍了一种新的单细胞分离方法，以便对再生C. elegans神经元进行单细胞RNA测序 | 提出了飞秒激光微切割技术（fs-LM），可直接从活组织中分离特定再生表型的神经元 | 现有细胞分离技术无法满足特定再生表型神经元的分离需求 | 探讨神经再生的分子机制，以单神经元分辨率理解神经再生 | 再生的C. elegans神经元 | 数字病理学 | NA | 飞秒激光微切割（fs-LM） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 10491 | 2024-08-05 |
CTpathway: a CrossTalk-based pathway enrichment analysis method for cancer research
2022-10-13, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01119-6
PMID:36229842
|
研究论文 | CTpathway是一种基于交叉通路的通路富集分析方法，适用于癌症研究 | CTpathway整合了路径交叉、分子相互作用和网络拓扑等关键路径特征，从而提供了一种新的PEA方法 | 现有的PEA方法未能充分整合必要的路径特征，导致许多风险路径未被调查 | 研究通路富集分析方法以识别癌症的风险路径 | 通过基因差异表达和交叉效应分析风险基因及其富集的风险路径 | 数字病理学 | 癌症 | RNA-seq | NA | 基因表达谱 | 超过8300个表达谱覆盖十种癌症组织和血液样本 |
| 10492 | 2024-08-05 |
Multifunctional barcoding with ClonMapper enables high-resolution study of clonal dynamics during tumor evolution and treatment
2021-07, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-021-00222-8
PMID:34939038
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研究论文 | 本文开发了一个功能化的谱系追踪系统ClonMapper，可以综合表征异质性人群中的数千个克隆。 | ClonMapper整合了DNA条形码与单细胞RNA测序及克隆分离，实现了高分辨率的克隆动态研究。 | NA | 研究肿瘤进展和治疗反应中的复杂克隆动态。 | 慢性淋巴细胞白血病细胞系及其克隆亚群体。 | 数字病理学 | 淋巴癌 | 单细胞RNA测序、DNA条形码技术 | NA | 细胞、RNA | 数千个克隆 |
| 10493 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals multi-step adaptations to endocrine therapy
2019-09-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-11721-9
PMID:31477698
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研究论文 | 该研究揭示了在内分泌治疗过程中肿瘤细胞的多步适应机制 | 提出了一个多步模型来解释内分泌治疗的抗药性发展，并定义了稀有的预适应细胞亚群 | 研究主要集中在单细胞层面，可能无法完全捕捉复杂的肿瘤微环境 | 探索内分泌治疗期间肿瘤细胞的遗传多样性和转录塑性的贡献 | 富含遗传异质性的乳腺癌细胞群体 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 10494 | 2024-08-05 |
Testis single-cell RNA-seq reveals the dynamics of de novo gene transcription and germline mutational bias in Drosophila
2019-08-16, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.47138
PMID:31418408
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研究论文 | 该研究探讨了果蝇睾丸中遗传新奇性表达模式及其细胞类型的动态变化 | 研究首次揭示了特定细胞类型中de novo基因的表达模式及其与生殖细胞替代的关系 | 研究主要集中在果蝇的睾丸，可能无法直接推广至其他物种 | 研究睾丸中的遗传新奇性如何影响生殖功能和进化创新 | 成年果蝇的睾丸细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 成年果蝇睾丸细胞的单细胞样本 |
| 10495 | 2024-08-07 |
Large Particle Fluorescence-Activated Cell Sorting Enables High-Quality Single-Cell RNA Sequencing and Functional Analysis of Adult Cardiomyocytes
2019-08-16, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.119.315493
PMID:31415233
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10496 | 2024-08-05 |
scAlign: a tool for alignment, integration, and rare cell identification from scRNA-seq data
2019-08-14, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-019-1766-4
PMID:31412909
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研究论文 | scAlign是一种用于对scRNA-seq数据进行对齐、集成和稀有细胞识别的工具 | 提出了一种无监督深度学习方法scAlign，可处理部分、重叠或完整的细胞标签集，具备出色的数据集集成性能 | NA | 解决单细胞RNA测序数据的集成及稀有细胞的识别问题 | 单细胞RNA测序数据集 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 深度学习 | 基因表达数据 | NA |
| 10497 | 2024-08-05 |
Multi-Objective Optimized Fuzzy Clustering for Detecting Cell Clusters from Single-Cell Expression Profiles
2019-08-13, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes10080611
PMID:31412637
|
研究论文 | 本文提出了一种多目标优化的模糊聚类方法，用于从单细胞RNA测序数据中检测细胞簇 | 创新点在于结合多目标优化和模糊聚类算法进行细胞簇的识别 | 未提及具体的计算效率和方法的适用范围 | 目标是提高从单细胞RNA测序数据中检测细胞簇的准确性 | 研究对象为小鼠稀有肠道细胞类型的单细胞表达谱 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 模糊c均值聚类 | 表达数据 | 288个细胞，来自23,630个基因特征 |
| 10498 | 2024-08-05 |
Comprehensive Integration of Single-Cell Data
2019-06-13, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2019.05.031
PMID:31178118
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研究论文 | 本文提出一种策略以整合多样的单细胞测量数据，改善细胞身份和功能的理解 | 创新点在于开发了一种'锚定'不同数据集的策略，能够跨越不同的单细胞测量技术和多重细胞模态进行数据整合 | 限制在于所开发方法可能仍需进一步验证和优化以适应更广泛的应用场景 | 探索如何有效整合不同单细胞测量技术的数据以深入理解细胞状态 | 研究对象包括不同的单细胞转录组数据和染色质可及性数据 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq和scATAC-seq | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 10499 | 2024-08-05 |
Single-Cell Multi-omic Integration Compares and Contrasts Features of Brain Cell Identity
2019-06-13, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2019.05.006
PMID:31178122
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研究论文 | 本文开发了LIGER算法，通过整合多种实验和生物背景下的单细胞测量，定义了细胞类型的特征 | 提出了一种新的算法LIGER，能够灵活建模单细胞数据集，并揭示细胞身份的共享和特定特征 | NA | 本研究旨在定义细胞类型并加速细胞类型定义、基因调控和疾病状态的调查 | 研究对象包括人类和小鼠脑细胞的单细胞基因表达和表观基因组特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、DNA甲基化分析 | NA | 基因表达数据 | 四个不同的分析，涉及来自人类和小鼠的大脑细胞 |
| 10500 | 2024-08-05 |
CD49b defines functionally mature Treg cells that survey skin and vascular tissues
2018-11-05, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20181442
PMID:30355617
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研究论文 | 本研究识别了一种表达CD49b的功能成熟的Treg细胞亚群。 | 发现了具有独特组织分布和功能的短暂效应Treg细胞亚群。 | 未阐明不同组织来源的Treg细胞之间的关系的全部情况。 | 阐明功能成熟的Treg细胞亚群的身份和发展。 | CD49b Treg细胞亚群及其在外周组织中的作用。 | 免疫学 | 自体免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |