单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 10501 - 10520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10501 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptome Reveals Cell Type-Specific Molecular Pathology in a 2VO Cerebral Ischemic Mouse Model
2024-Aug, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-023-03755-4
PMID:38180614
|
研究论文 | 本研究利用小鼠双血管阻塞缺血模型分析了海马中特定细胞类型的分子病理 | 首次对2VO模型进行单细胞转录组分析，揭示了不同寻常的少突胶质前体细胞亚型 | 缺乏对其他脑区的细胞类型-specific基因表达的研究 | 研究缺血后海马中细胞类型特异性的分子病理 | 2VO小鼠模型中的海马细胞 | 数字病理 | NA | 单细胞转录组分析 | 2VO模型 | 细胞 | 27,069个细胞对应14种细胞类型 |
| 10502 | 2024-08-05 |
Translational regulation enhances distinction of cell types in the nervous system
2024-Jul-16, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.90713
PMID:39010741
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研究论文 | 这篇文章揭示了转录后调控在神经系统细胞类型区分中的重要性 | 研究首次将转录后调控与细胞类型特异性蛋白表达联系起来，为理解细胞多样性的分子机制提供了新见解 | 研究仅在特定的转基因小鼠模型中进行，可能不适用于所有类型的神经细胞 | 揭示转录后调控对神经系统细胞类型区分的影响 | 研究基因定义的脑细胞的转录组和翻译组 | 数字病理学 | NA | RNA-seq, Ribo-seq | NA | RNA数据 | 基因定义的细胞 |
| 10503 | 2024-08-04 |
Single-cell total-RNA profiling unveils regulatory hubs of transcription factors
2024-Jul-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50291-3
PMID:39009595
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研究论文 | 本文开发了一种基于总RNA的单细胞RNA测序方法snapTotal-seq，并展示其在转录因子调控中的应用 | 创新性地提出了一种同时测量未剪接RNA和剪接RNA的一步总RNA化学方法 | 只对单细胞RNA-seq化学的表现进行了比较，未评估其在其他细胞类型或条件下的适用性 | 本研究旨在通过新的方法深入了解基因调控，特别是在细胞状态转变中的调控机制 | 研究对象包括单细胞中的转录因子及其调控的细胞周期和衰老 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | LASSO回归 | RNA | NA |
| 10504 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics analysis of bullous pemphigoid unveils immune-stromal crosstalk in type 2 inflammatory disease
2024-Jul-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50283-3
PMID:39009587
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研究论文 | 本研究揭示了水疱性皮肤病中免疫-基质间的相互作用。 | 首次识别IL13-IL13RA1配体-受体对作为水疱性皮肤病中免疫-基质互动的重要介质。 | 未提供关于样本数量和具体实验条件的详细信息。 | 全面了解水疱性皮肤病的免疫景观，特别是免疫-基质之间的相互作用。 | 研究T细胞、树突状细胞和成纤维细胞等关键细胞群体。 | 数字病理学 | 水疱性皮肤病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA |
| 10505 | 2024-08-04 |
Endoplasmic reticulum stress promotes hepatocellular carcinoma by modulating immunity: a study based on artificial neural networks and single-cell sequencing
2024-Jul-15, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05460-9
PMID:39010084
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研究论文 | 本研究探讨了内质网应激如何通过调节免疫反应促进肝细胞癌的发展 | 提出了一种新的预测模型，结合多种机器学习算法与人工神经网络，为肝细胞癌的诊断提供新方向 | 采用的数据集和方法可能无法全面覆盖所有与内质网应激相关的基因和免疫机制 | 探讨内质网应激在肝细胞癌发展中的分子机制及早期诊断和治疗靶点 | 研究涉及与内质网应激相关的不同ially表达基因和免疫微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序、机器学习（随机森林和支持向量机）、人工神经网络 | 人工神经网络 | 基因表达数据 | 综合GEO数据集（GSE25097, GSE62232, GSE65372） |
| 10506 | 2024-08-05 |
Generation of musculoskeletal cells from human urine epithelium-derived presomitic mesoderm cells
2024-Jul-15, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-024-01274-w
PMID:39010176
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研究论文 | 本研究探讨了从人尿上皮衍生的前体中胚层细胞生成肌肉骨骼细胞的过程。 | 本研究首次展示了UiPSM细胞的分化潜力，并证明其在移植后能够形成成熟的骨骼肌细胞。 | 研究未详细探讨UiPSM细胞在不同体内环境下的长期表现及其潜在的不良反应。 | 研究UiPSM细胞的分化潜力及其在肌肉骨骼发展中的应用。 | 本研究主要对象为从人尿上皮提取的UiPSM细胞及其衍生的骨骼肌细胞。 | 数字病理学 | 肌肉骨骼疾病 | 生物发光成像，单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞培养，生物成像 | 使用了在MITRG小鼠前胫肌中的UiPSM细胞移植进行评估 |
| 10507 | 2024-08-04 |
Advance and Application of Single-cell Transcriptomics in Auditory Research
2024-Jul, Neuroscience bulletin
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12264-023-01149-z
PMID:38015350
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综述 | 本文章回顾了单细胞转录组学在听觉研究中的应用 | 文章创新性地应用单细胞RNA测序技术揭示听觉器官中细胞的复杂生物机制 | 对于内耳的细胞异质性及其有限的细胞数量的深入研究仍然不足 | 本研究旨在提供听觉器官发展的参考、听力损失的发病机制以及再生疗法的基础 | 研究对象为听觉器官中的不同类型细胞 | 数字病理学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 10508 | 2024-08-04 |
Exploring kidney allograft rejection: A proof-of-concept study using spatial transcriptomics
2024-Jul, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1016/j.ajt.2024.04.015
PMID:38692412
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学研究肾移植排斥反应的潜力 | 结合公共单细胞RNA测序数据，首次应用空间转录组学技术研究肾移植排斥反应 | 关于该技术的发展和未来应用的限制需要考虑 | 研究肾移植排斥反应的分子和细胞机制 | 分析非排斥、T细胞介导的急性排斥、间质纤维化和肾小管萎缩的活检样本 | 数字病理 | NA | 空间转录组学 | NA | 活检样本 | 多种病理状态下的活检样本 |
| 10509 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing advances in research on mesenchymal stem/stromal cells
2024-Jul, Human cell
IF:3.4Q3
DOI:10.1007/s13577-024-01076-9
PMID:38743204
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综述 | 本文回顾了单细胞测序在间充质干细胞研究中的应用及其前景 | 强调了单细胞测序技术在揭示间充质干细胞异质性和分子特征中的重要性 | 未提及具体的局限性 | 审视单细胞测序在间充质干细胞研究中的应用 | 间充质干细胞（MSCs） | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 10510 | 2024-08-04 |
Impact of different tissue dissociation protocols on endothelial cell recovery from developing mouse lungs
2024-Jul, Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology
DOI:10.1002/cyto.a.24843
PMID:38668123
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研究论文 | 本研究评估了不同酶解方法对小鼠肺部内皮细胞分离的影响 | 首次比较了胶原酶A和Dispase在小鼠肺内皮细胞分离中的效用，并发现胶原酶A在内皮细胞回收方面优于Dispase | 研究主要集中在小鼠模型，可能无法直接应用于其他物种 | 探索不同组织解离协议对小鼠肺内皮细胞回收的影响 | 幼年和成年小鼠的肺内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 未提供确切的样本数量，涉及幼年和成年小鼠的肺组织 |
| 10511 | 2024-08-05 |
Expansion of highly interferon-responsive T cells in early-onset Alzheimer's disease
2024-07, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.13892
PMID:38829682
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研究论文 | 本研究探讨了早发阿尔茨海默病（EOAD）中干扰素反应性T细胞的扩展 | 发现早发阿尔茨海默病中抗病毒类干扰素信号关联基因高表达的T细胞显著扩展 | 未提及具体限制 | 研究早发阿尔茨海默病中的免疫反应 | 研究对象包括早发阿尔茨海默病患者及临床正常对照的外周血单核细胞和CD4 T细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和滴度数字PCR（ddPCR） | NA | 基因表达 | 16名EOAD患者和19名CD4 T细胞样本参与者 |
| 10512 | 2024-08-07 |
Decoding the building blocks of cellular processes from single-cell transcriptomics data
2024-Jul, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01967-6
PMID:37735267
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10513 | 2024-08-04 |
Liver cancer from the perspective of single-cell sequencing: a review combined with bibliometric analysis
2024-Jun-24, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-05855-7
PMID:38910204
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综述 | 本研究通过文献计量学分析，全面概述了单细胞测序在肝癌研究中的知识结构和研究热点 | 这项研究是首次综合总结单细胞测序在肝癌应用的研究趋势和发展 | 具体的局限性未在摘要中提及 | 提供单细胞测序在肝癌研究领域的知识结构和研究热点的概述 | 与单细胞测序技术在肝癌研究中的应用相关的文献 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 文献 | 331篇相关出版物 |
| 10514 | 2024-08-05 |
Increased Thyroid DPP4 Expression Is Associated With Inflammatory Process in Patients With Hashimoto Thyroiditis
2024-May-17, The Journal of clinical endocrinology and metabolism
DOI:10.1210/clinem/dgad723
PMID:38127960
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研究论文 | 本研究旨在调查Hashimoto甲状腺炎患者外周血和甲状腺组织中DPP4的表达，并探索其在病理生理过程中的作用 | 首次在Hashimoto甲状腺炎患者的甲状腺中发现DPP4表达显著增加，并主要局限于淋巴细胞 | 样本量较小，且未能探讨DPP4在其他类型甲状腺疾病中的作用 | 研究Hashimoto甲状腺炎患者中DPP4的表达及其在炎症过程中的角色 | 40名未服药的Hashimoto甲状腺炎患者和81名对照个体 | 数字病理学 | Hashimoto甲状腺炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 血液和甲状腺组织样本 | 共121个样本（40名HT患者和81名对照个体） |
| 10515 | 2024-08-04 |
Investigating the characteristics of mild intervertebral disc degeneration at various age stages using single-cell genomics
2024, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2024.1409287
PMID:39015652
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研究论文 | 该研究探讨了不同年龄段轻度椎间盘退变的特征和机制 | 首次从年龄视角研究椎间盘轻度退变的分子机制 | 样本量可能有限，未探索重度退变的影响 | 探讨年轻人与老年人椎间盘退变的潜在机制 | 不同年龄段的椎间盘细胞，分为正常和轻度退变组 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 样本 | 四种类型的椎间盘样本 |
| 10516 | 2024-08-05 |
Ultrasound-Guided Fine Needle Biopsy of Human Axillary Lymph Nodes to Assess B Cell Responses to Vaccination
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3950-4_2
PMID:39017882
|
研究论文 | 本研究探讨了超声引导下细针活检在人类腋窝淋巴结中评估疫苗接种后B细胞反应的应用 | 提出了一种安全有效的活检方法，用于直接研究淋巴结中免疫细胞的动态过程和相互作用 | 由于关键细胞的解剖位置受到保护，直接研究这些细胞的动态过程和相互作用存在挑战 | 研究疫苗接种后腋窝淋巴结中的免疫应答，特别是B细胞的反应 | 腋窝淋巴结中的免疫细胞，重点分析B细胞群体 | 数字病理学 | NA | 流式细胞术免疫表型分析和单细胞RNA测序 | NA | 细胞样本 | NA |
| 10517 | 2024-08-05 |
Mitotic catastrophe heterogeneity: implications for prognosis and immunotherapy in hepatocellular carcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1409448
PMID:39015573
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研究论文 | 本研究探讨了有丝分裂灾难在肝细胞癌中的异质性及其对预后和免疫治疗的影响 | 通过揭示肝细胞癌中的有丝分裂灾难异质性及其与免疫逃避和疗法抵抗的关系，为临床决策提供了新的治疗策略 | 尚未明确有丝分裂灾难异质性与免疫逃避和治疗反应之间的机制 | 研究有丝分裂灾难在肝细胞癌进展中的作用以及其对免疫环境的调控 | 分析肝细胞癌患者的有丝分裂灾难相关基因和免疫特征 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序和空间转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 94名肝细胞癌患者的数据 |
| 10518 | 2024-08-05 |
scOrange-a tool for hands-on training of concepts from single-cell data analytics
2019-07-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz348
PMID:31510695
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研究论文 | 本文提出了一种基于scOrange工具的单细胞数据分析培训方法 | 提出了一种手动培训方式，通过探索性数据分析工具支持单细胞数据分析的教学 | 未提及具体的实际应用案例或评估此方法的有效性 | 旨在提高分子生物学家在单细胞数据分析方面的能力 | 分子生物学家及其在单细胞数据分析中的培训需求 | 数据分析 | NA | 数据挖掘框架 | NA | NA | NA |
| 10519 | 2024-08-05 |
A statistical simulator scDesign for rational scRNA-seq experimental design
2019-07-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz321
PMID:31510652
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研究论文 | 本文介绍了一种灵活且强大的模拟器scDesign，用于优化scRNA-seq实验设计 | scDesign是第一个统计框架，定量评估差异基因表达分析中的scRNA-seq实验设计 | 本研究未提及具体的实验设置和外部验证 | 优化scRNA-seq实验设计以探索转录组信息的深度和广度 | 基于17种细胞类型和6种不同方案的scRNA-seq数据集 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 合成的scRNA-seq数据集 | 17种细胞类型和6种不同方案 |
| 10520 | 2024-08-05 |
Dissecting intratumoral myeloid cell plasticity by single cell RNA-seq
2019-06, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.2113
PMID:31033233
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析肿瘤微环境中髓样细胞的转录动态 | 首次揭示了早期非小细胞肺癌中CD14+ 单核细胞向M2巨噬细胞的分化路径及其转录重编程机制 | 本研究只涉及4名早期非小细胞肺癌患者，样本量有限 | 研究肿瘤微环境中髓样细胞的分化和转录重编程 | 4名早期非小细胞肺癌患者的肿瘤及其相邻正常组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 4名早期非小细胞肺癌患者的11,485个细胞 |