单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 10381 - 10400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10381 | 2024-08-05 |
Single-Cell Profiles of Retinal Ganglion Cells Differing in Resilience to Injury Reveal Neuroprotective Genes
2019-12-18, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2019.11.006
PMID:31784286
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序对小鼠视网膜神经节细胞的选择性抗损伤能力进行了分析 | 该研究首次建立了一套系统框架，以解析不同类型的细胞对损伤的反应，并揭示了用于干预的分子靶标 | 研究主要聚焦于小鼠模型，可能无法完全代表其他物种的情况 | 探讨视网膜神经节细胞对损伤的抗性及相关基因 | 小鼠视网膜神经节细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 46种视网膜神经节细胞类型的样本 |
| 10382 | 2024-08-05 |
scPred: accurate supervised method for cell-type classification from single-cell RNA-seq data
2019-12-12, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-019-1862-5
PMID:31829268
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研究论文 | 本文介绍了scPred，一种从单细胞RNA测序数据中进行细胞类型分类的准确监督方法 | scPred通过无偏特征选择与机器学习概率预测方法的结合，提供了高度准确的单细胞分类 | NA | 研究单细胞的转录特征，以便进行细胞类型分类 | 单细胞RNA测序数据，涉及胰腺组织、单核细胞、结肠肿瘤活检和循环树突状细胞 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | 机器学习 | 基因表达数据 | NA |
| 10383 | 2024-08-05 |
High-throughput dense reconstruction of cell lineages
2019-12, Open biology
IF:4.5Q1
DOI:10.1098/rsob.190229
PMID:31822210
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评论 | 本文汇编了关于高通量细胞谱系重建会议的共识，讨论了新技术的挑战及解决方案 | 探讨了结合单细胞RNA测序的新工具，允许在单细胞分辨率下重建复杂模型生物的谱系 | 会议内容仅为共识，并未提供具体实验数据和结果 | 研究新工具在重建细胞谱系中的应用及其技术挑战 | 高通量细胞谱系重建的新工具和策略 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 10384 | 2024-08-05 |
Single-cell connectomic analysis of adult mammalian lungs
2019-12, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aaw3851
PMID:31840053
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了成年哺乳动物肺部细胞间相互作用 | 揭示了肺泡细胞群体之间的信号传递系统，并确定了各细胞类型在远端肺部的功能角色 | 研究主要集中于成年哺乳动物，未涉及其他发展阶段或物种的肺部细胞交互 | 阐明影响组织稳态的细胞间相互作用机制 | 成年小鼠、大鼠、猪和人类的肺组织 | 数字病理学 | 慢性肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 未明确说明具体样本数量 |
| 10385 | 2024-08-05 |
Genetic Identification of Vagal Sensory Neurons That Control Feeding
2019-11-14, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2019.10.031
PMID:31730854
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研究论文 | 本文揭示了控制进食的迷走神经感觉神经元的遗传特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术明确识别出影响食物摄入的特定迷走神经元及其信号 | 推测其功能的实验主要依赖于外周操作与中央记录，尚需进一步验证 | 探讨迷走神经在调节食物摄入中的具体作用 | 迷走神经相关的感觉神经元及其对进食的影响 | 生物医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 10386 | 2024-08-05 |
Integrative Transcriptomics Reveals Sexually Dimorphic Control of the Cholinergic/Neurokine Interface in Schizophrenia and Bipolar Disorder
2019-10-15, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.09.017
PMID:31618642
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研究论文 | 本研究揭示了在精神分裂症和双相情感障碍中，胆碱能/神经激素界面的性别差异控制 | 提出了一种结合大规模转录组元分析与单细胞测序数据的整合方法 | RNA测序分析通常限于识别最低p值的转录本，未能解决多基因现象 | 旨在探讨精神分裂症和双相情感障碍中性别差异的转录组特征 | 分析精神分裂症和双相情感障碍患者的皮层转录本 | 数字病理学 | 精神分裂症, 双相情感障碍 | RNA测序, 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 来自精神分裂症和双相情感障碍患者的脑组织样本 |
| 10387 | 2024-08-05 |
Benchmark and Parameter Sensitivity Analysis of Single-Cell RNA Sequencing Clustering Methods
2019, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2019.01253
PMID:31921297
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研究论文 | 本文提供了对单细胞RNA测序聚类方法的基准测试和参数敏感性分析 | 探讨了用户选择的参数设置对模型性能的显著影响，并提供了不同使用模式和数据集特点下方法的评估 | 尚未进行大规模研究以调查不同实验背景下选择的参数对结果的影响 | 旨在提供有关单细胞RNA测序聚类方法优缺点的新见解 | 研究不同聚类方法在多种使用模式和参数设置下的表现 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 聚类算法 | 真实和模拟数据集 | 多个数据集，具体样本量不详 |
| 10388 | 2024-08-05 |
LACC1 deficiency leading to juvenile arthritis and anemia
2024-Aug, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110290
PMID:38944365
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研究论文 | 该研究描述了由LACC1缺失引起的青少年关节炎和贫血的病例 | 首次识别了两种新的LACC1基因变体，并评估了其对患者炎症标志物的影响及治疗效果 | 仅基于单例患者的临床数据，样本量较小，需进一步研究验证 | 探讨LACC1突变对青少年关节炎和贫血的影响及其潜在治疗方案 | 一名因LACC1的复合杂合变异而出现多关节炎和贫血的患者 | 数字病理学 | 青少年关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据和血清细胞因子水平 | 1名患者和9名对照患者 |
| 10389 | 2024-08-05 |
NLRP12-associated autoinflammatory disease: A novel causal mutation and bioinformatics analyses
2024-Aug, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110278
PMID:38878806
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研究论文 | 本文报告了一例罕见的NLRP12相关自身炎症疾病及其新发现的突变 | 研究首次描述了A218V突变，并通过生物信息学分析提供了对NLRP12-AID机制的新见解 | 研究中病例数量有限，未进行更广泛的人群验证 | 探讨NLRP12相关自身炎症疾病的机制及其相关突变 | 一名患有NLRP12-AID的患者及其病理特征 | 数字病理学 | NA | 生物信息学分析，F-FDG PET/CT | NA | 单细胞转录组数据 | 1名患者 |
| 10390 | 2024-08-05 |
Determining cellular lineage directed networks in hematopoiesis using single-cell transcriptomic data and volatility-constrained correlation
2024-Aug, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2024.105248
PMID:38871242
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研究论文 | 该研究利用单细胞转录组数据和波动约束相关性方法确定了造血过程中细胞谱系导向网络 | 创新点在于应用波动约束相关性方法预测造血过程中细胞类型之间的因果关系和方向性 | 研究主要基于小鼠骨髓细胞，可能限制其对人类造血过程的普遍适用性 | 旨在揭示造血过程中细胞谱系的网络结构及其因果关系 | 研究对象为小鼠骨髓细胞及其相关的造血细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 小鼠骨髓细胞样本 |
| 10391 | 2024-08-05 |
Integrated analysis reveals a novel 5-fluorouracil resistance-based prognostic signature with promising implications for predicting the efficacy of chemotherapy and immunotherapy in patients with colorectal cancer
2024-Aug, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-01981-2
PMID:38824480
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研究论文 | 本文构建了一种新的5-FU耐药相关预后标志物，以预测结直肠癌患者的化疗和免疫治疗效果 | 建立并验证了5-FU耐药相关标志物5-FRSig模型，并与多个临床特征及治疗效果相关联 | 未提及具体的样本数量和相关数据的全面性 | 构建5-FU耐药相关标志物以预测结直肠癌患者的预后 | 结直肠癌患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序，定量实时聚合酶链反应（RT-qPCR） | 统计回归模型 | 基因组数据 | 多个结直肠癌队列 |
| 10392 | 2024-08-04 |
[Histone demethylase JMJD3 inhibits alveolar bone loss by regulating macrophage polarization in periodontitis]
2024-Jul-22, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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研究论文 | 本研究探讨了组蛋白去甲基化酶JMJD3在牙周炎中对巨噬细胞极化的调节作用及其对牙槽骨流失的影响 | 研究发现JMJD3在牙周炎组织中表达上调，并通过调节巨噬细胞极化在抑制牙槽骨损失中发挥保护作用 | 本研究缺乏长期观察数据，未能充分探讨JMJD3在不同阶段牙周炎中的功能 | 旨在研究JMJD3在牙周炎炎症组织中的表达及其调节机制 | 研究对象为健康人群和牙周炎患者的牙龈样本及小鼠牙周炎模型 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞测序、免疫组化染色、实时荧光定量PCR | 小鼠模型 | 生物样本数据 | 健康和炎症牙周患者各9个牙龈样本 |
| 10393 | 2024-08-05 |
[Deciphering the fate of granulation tissue in the human inflammatory alveolar microenvironment using single-cell RNA sequencing]
2024-Jul-22, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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研究论文 | 本研究探讨了人类牙槽内颗粒组织的细胞组成及其异质性，通过单细胞转录组图谱阐明了炎症微环境中自然分解的潜在结果 | 本研究使用单细胞RNA测序构建了人类牙槽颗粒组织的单细胞图谱，揭示了炎症颗粒组织在不同微环境中的细胞序列变异及其时间空间分布模式 | 样本量相对较小，仅涉及12个牙槽颗粒组织，可能影响结果的普适性 | 研究炎症微环境中颗粒组织的自然分解过程及其细胞组成的变化 | 来自因牙周炎而拔除的牙齿的炎症颗粒组织 | 数字病理学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞、基因表达数据 | 涉及12个牙槽颗粒组织样本 |
| 10394 | 2024-08-04 |
Skeletal stem cells in bone development, homeostasis, and disease
2024-Jul-20, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwae008
PMID:38442300
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综述 | 本文讨论了骨骼干细胞在骨发育、稳态和疾病中的作用 | 揭示了骨骼干细胞不是单一的，而是由不同的干细胞在不同的骨骼部位形成 | 未提及具体的局限性 | 旨在增强对骨骼干细胞多样性和可塑性的理解 | 研究对象为骨骼干细胞在不同条件下的特征 | 数字病理学 | NA | 荧光激活细胞分选、血统追踪、单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 10395 | 2024-08-04 |
Integration tools for scRNA-seq data and spatial transcriptomics sequencing data
2024-Jul-19, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elae002
PMID:38267084
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综述 | 本文汇编了19种整合单细胞RNA测序和空间转录组数据的方法 | 提供了一种全面的参考，帮助研究人员选择适合其特定研究目的的整合方法 | 每种方法有其自身的优缺点和适用范围，研究者需要根据实际情况进行选择 | 旨在帮助研究人员了解和选择适合的整合方法以分析scRNA-seq和空间转录组数据 | 整合单细胞RNA测序数据和空间转录组测序数据 | 数字病理学 | NA | NA | NA | RNA测序数据 | 19种整合方法 |
| 10396 | 2024-08-04 |
Improving cell type identification with Gaussian noise-augmented single-cell RNA-seq contrastive learning
2024-Jul-19, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad059
PMID:38242863
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研究论文 | 本研究提出了一种基于高斯噪声增强的单细胞RNA测序对比学习方法以提高细胞类型识别 | 提出了一种新的高斯噪声增强的对比学习方法(GsRCL)，用于细胞类型识别任务 | 未提及具体的局限性 | 旨在提高单细胞RNA测序数据分析中的细胞类型识别准确性 | 面向具有挑战性的细胞类型识别任务 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 大规模计算评估 |
| 10397 | 2024-08-05 |
Single-cell immune landscape of measurable residual disease in acute myeloid leukemia
2024-Jul-19, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2666-8
PMID:39034351
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研究论文 | 本研究揭示了急性髓性白血病中可测残留疾病的单细胞免疫景观 | 该论文利用单细胞RNA测序技术，创建了一个包含184,231个细胞的全面免疫景观，并发现MRD阳性和阴性CD8 T细胞在细胞毒性基因表达上的差异 | 本研究样本量较小，仅包含32名患者，可能影响结果的广泛适用性 | 研究可测残留疾病在急性髓性白血病中的免疫细胞特征及其转化机制 | 源自20名MRD阳性患者和12名MRD阴性患者的骨髓样本 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 32个样本（20个MRD阳性患者和12个MRD阴性患者） |
| 10398 | 2024-08-05 |
Integrating multi-omics data to analyze the potential pathogenic mechanism of CTSH gene involved in type 1 diabetes in the exocrine pancreas
2024-Jul-19, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad052
PMID:38050341
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研究论文 | 本研究整合多组学数据分析CTSH基因在1型糖尿病外分泌胰腺中的潜在致病机制 | 通过整合eQTL、GWAS和单细胞转录组数据，确定了与1型糖尿病相关的四个潜在致病基因 | 未提及具体的局限性 | 探讨CTSH基因在1型糖尿病发病机制中的作用 | 分析1型糖尿病患者与健康对照的胰腺组织中的基因表达 | 数字病理学 | 1型糖尿病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 包含1型糖尿病患者和健康对照的胰腺组织样本 |
| 10399 | 2024-08-04 |
Identification of Immune Infiltration-related Molecular Features in Ovarian Cancer Patients and Experimental Validation of Immune Response Molecular Mechanisms through Integrated WGCNA, Machine Learning, and Single-cell Sequencing Analysis
2024-Jul-18, Recent patents on anti-cancer drug discovery
IF:2.5Q3
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研究论文 | 本研究通过综合的WGCNA、机器学习和单细胞测序分析，探讨卵巢癌患者的免疫浸润相关分子特征及其免疫响应机制。 | 揭示了AIDPS在卵巢癌患者中的临床意义，并确认抑制RPL31的表达能够显著影响卵巢癌细胞的增殖和迁移。 | 研究主要基于公共数据库数据，实际临床验证需进一步加强。 | 旨在揭开卵巢癌的免疫响应机制，并为免疫基础治疗提供理论基础和治疗策略。 | 卵巢癌患者的免疫浸润相关分子特征 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序、机器学习、加权基因共表达网络分析（WGCNA） | CoxBoost+StepCox | 基因表达数据 | 使用来自公共数据库的相关卵巢癌数据集，具体样本数量未详 |
| 10400 | 2024-08-05 |
Unravelling infiltrating T-cell heterogeneity in kidney renal clear cell carcinoma: Integrative single-cell and spatial transcriptomic profiling
2024-Jun, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18403
PMID:39031800
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研究论文 | 本文系统地探讨了肾透明细胞癌中浸润性T细胞的异质性 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组数据全面表征了浸润性T细胞的特征，并建立了基于ITSG的稳定预后模型 | 尚未提及特定的局限性 | 研究浸润性T细胞在肾透明细胞癌中的作用和异质性 | 浸润性和增殖中的T细胞亚群 | 数字病理学 | 肾透明细胞癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 12种KIRC治疗剂的预后相关数据 |